ES2279542T3 - Mutantes de hbv y metodos para deteccion de los mismos. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE EN GENERAL A VARIANTES VIRALES QUE PRESENTAN UNA SENSIBILIDAD REDUCIDA FRENTE A AGENTES ESPECIFICOS Y/O UNA INTERACTIVIDAD REDUCIDA CON REACTIVOS INMUNOLOGICOS. MAS ESPECIFICAMENTE, LA INVENCION SE REFIERE A VARIANTES DE LA HEPATITIS B QUE PRESENTAN RESISTENCIA COMPLETA O PARCIAL A ANALOGOS DE NUCLEOSIDOS Y/O INTERACTIVIDAD REDUCIDA CON ANTICUERPOS FRENTE A COMPONENTES VIRALES SUPERFICIALES. LA PRSENTE INVENCION SE REFIERE ASIMISMO A ENSAYOS PARA DETECTAR DICHAS VARIANTES VIRALES, LOS CUALES SON UTILES PARA EL CONTROL DE TRATAMIENTOS TERAPEUTICOS ANTIVIRALES.
Description
Mutantes de HBV y métodos para detección de los
mismos.
La presente invención se refiere en general a
variantes virales que exhiben sensibilidad reducida a agentes
particulares. Más particularmente, la presente invención está
dirigida a variantes de la Hepatitis B que exhiben resistencia
completa o parcial a análogos de nucleósidos. La presente invención
contempla adicionalmente ensayos para detectar dichas variantes
virales, ensayos que son útiles en la monitorización de regímenes
terapéuticos anti-virales.
Detalles bibliográficos de las publicaciones a
las que se hace referencia numéricamente en esta memoria descriptiva
se recogen al final de la descripción. Los Números de Identidad de
Secuencia (SEQ ID NOs.) para las secuencias de nucleótidos y
aminoácidos a que se hace referencia en la memoria descriptiva se
definen de acuerdo con la bibliografía.
A lo largo de esta memoria descriptiva, a no ser
que el contexto requiera otra cosa, debe entenderse que el término
"comprenden", o variaciones tales como "comprende" o
"que comprende" o el término "incluye", o variaciones del
mismo, implican la inclusión de un elemento o entidad completa
indicado o grupo de elementos o entidades completas, pero no la
exclusión de ningún otro elemento o entidad completa o grupo de
elementos o entidades completas. A este respecto, en la
interpretación del alcance de las reivindicaciones, una realización
en la cual se añaden una o más características a cualquiera de las
reivindicaciones debe considerarse que está dentro del alcance de
la invención, dado que las características esenciales de la
invención tal como se reivindican están incluidas en dicha
realización.
Mutaciones específicas en una secuencia de
aminoácidos se representan en esta memoria como
"Xaa_{1}nXaa_{2}" donde Xaa_{1} es el residuo de
aminoácido original antes de la mutación, n es el número de residuo
y Xaa_{2} es el aminoácido mutante. La abreviatura "Xaa"
puede ser el código de aminoácidos de tres letras o de una sola
letra. Los residuos de aminoácidos para la
DNA-polimerasa del virus de la Hepatitis B se
enumeran de tal modo que el residuo metionina en el motivo Tyr Met
Asp Asp (YMDD) es el residuo número 550. En el documento de
prioridad, Solicitud de Patente Australiana No. PO3519, presentado
el 8 de Noviembre de 1996, la misma metionina se designaba residuo
530. Los residuos de aminoácidos para la
DNA-polimerasa a que se hace referencia en esta
memoria descriptiva se han re-numerado de acuerdo
con ello.
El Virus de la Hepatitis B (HBV) puede causar
condiciones de enfermedad debilitante y puede conducir a
insuficiencia hepática aguda. El HBV es un virus de DNA que se
replica por la vía de un RNA intermedio y utiliza trascripción
inversa en su estrategia de replicación (1). El genoma del HBV es de
naturaleza compleja, teniendo una estructura de DNA parcialmente
bicatenario que se solapa con marcos de lectura abiertos que
codifican genes de superficie, de núcleo, de polimerasa y X. La
naturaleza compleja del genoma de HBV se representa en la Figura
1.
La presencia de una
DNA-polimerasa de HBV ha conducido a la proposición
de que análogos de nucleósidos podrían actuar como agentes
anti-virales eficaces. Ejemplos de análogos de
nucleósidos que se encuentran actualmente en ensayo son penciclovir
y su forma oral famciclovir (2, 3, 4, 5) y lamivudina (6, 7). Existe
potencial para que tales agentes se utilicen en el tratamiento de
la infección HBV crónica.
Se ha demostrado recientemente que penciclovir
exhibe una potente actividad inhibidora contra la síntesis de DNA
de HBV del pato in vitro, y se ha demostrado que inhibe la
actividad de la
DNA-polimerasa-transcriptasa
inversa de HBV in vitro (8, 9). Análogamente, se ha
demostrado que famciclovir oral inhibe la replicación
intra-hepática del virus de la HBV del pato in
vivo (10). En el hombre, se ha demostrado que famciclovir reduce
la replicación de DNA de HBV en un paciente con hepatitis B grave
después de trasplante hepático ortotópico (OLT) (11). Se ha
demostrado que penciclovir induce mutaciones en la región B de la
polimerasa de HBV (18). 3TC está asociado con mutaciones en el
motivo YMDD altamente conservado de la polimerasa de HBV (16).
En el trabajo que condujo a la presente
invención, se utilizó terapia antiviral con análogos de nucleósidos
para controlar la recurrencia grave post-OLT de la
infección HBV (12). La terapia a largo plazo es preceptiva en los
casos en que los pacientes sufren inmunosupresión y la tasa de
replicación del HBV es muy alta. Sin embargo, en tales condiciones,
como en el caso de cualquier quimioterapia a largo plazo de agentes
infecciosos, existe potencial para el desarrollo de resistencia o
sensibilidad reducida a los agentes terapéuticos empleados.
De acuerdo con la presente invención, los
inventores han identificado variantes de HBV con mutaciones en el
gen de la DNA-polimerasa de HBV que reducen en
grados variables la sensibilidad de HBV a análogos de nucleósidos.
La identificación de estas variantes de HBV es importante para el
desarrollo de ensayos con objeto de monitorizar los regímenes
terapéuticos con análogos de nucleósidos y escrutar en busca de
agentes que puedan enmascarar los efectos de la mutación.
Adicionalmente, dado que el genoma de HBV comprende una serie de
marcos de lectura abiertos solapantes, una mutación de nucleótido
en un marco de lectura abierto puede afectar a los productos de
traducción en otro marco de lectura abierto.
De acuerdo con ello, la presente invención está
dirigida a una variante de un virus HBV aislado que se replica por
la vía de un RNA intermedio en donde dicha variante comprende una
mutación de nucleótido en un gen que codifica una
DNA-polimerasa dando como resultado al menos una
sustitución del aminoácido Leu a Met en dicha
DNA-polimerasa de la posición 526.
La mutación de la DNA-polimerasa
da como resultado una sensibilidad reducida de la HBV a un análogo
de nucleósido.
Las regiones de la polimerasa de HBV exhiben
semejanza de aminoácidos con otras DNA-polimerasas
dependientes de RNA y polimerasas dependientes de RNA (13). En esta
memoria descriptiva, se hace referencia a las regiones conservadas
definidas por Poch et al. (13) como dominios B y C.
Preferiblemente, la mutación da como resultado
una secuencia de aminoácidos alterada en el dominio B de la
DNA-polimerasa de HBV.
Se proporciona una variante de HBV que comprende
una mutación en la secuencia de nucleótidos que codifica una
DNA-polimerasa dando como resultado una sustitución
del aminoácido Leu a Met en dicha DNA-polimerasa en
su dominio B de la posición 526 y en donde dicha variante exhibe
sensibilidad reducida a un análogo de nucleósido.
Los análogos de nucleósido contemplados por la
presente invención incluyen penciclovir y su forma oral famciclovir
así como lamivudina (3TC).
Se considera que el dominio B comprende los
residuos de aminoácido 505 a 529 de la
DNA-polimerasa de HBV. Esta secuencia se representa
como sigue:
| S/A H PI I/V LGFRK I/L PMG V/G GLSPFLLAQF | (SEQ ID NO 24) |
La referencia al dominio B incluye referencia a
regiones proximales que incluyen hasta aproximadamente 20
aminoácidos a cada lado del dominio. Preferiblemente, la mutación se
encuentra en uno o más de los aminoácidos siguientes:
\dotable{\tabskip\tabcolsep#\hfil\+#\hfil\tabskip0ptplus1fil\dddarstrut\cr}{
Q/K T Y/F G R/W KLHL Y/L S/A HPI I/V LGFRK I/L PMG V/G
GLSPFLLAQFTSAI C/LS \+ (SEQ ID NO
25)\cr}
El dominio C comprende los aminoácidos 546 a 556
como sigue:
| A/V F S/A YMDD V/L/M VLG | (SEQ ID NO 26) |
Éste incluye el dominio YMDD (SEQ ID NO 30) en
el cual el residuo metionina se considera como residuo 550
(considerado formalmente como residuo número 530). La numeración de
los residuos en esta memoria descriptiva se ha ajustado de acuerdo
con el nuevo sistema de numeración donde la metionina de YMDD es
550.
La referencia al dominio C incluye regiones
proximales de hasta 20 aminoácidos a cada lado del dominio.
El término "resistencia" se utiliza en su
sentido más general e incluye resistencia total o resistencia
parcial o sensibilidad reducida a un análogo de nucleósido.
Preferiblemente, las variantes se encuentran en
forma aislada de tal modo que las mismas han sufrido al menos un
paso de purificación fuera del fluido corporal existente
naturalmente. Alternativamente, las variantes pueden mantenerse en
fluido corporal aislado o pueden encontrarse en forma de DNA. La
presente invención contempla también clones moleculares infecciosos
que comprenden el genoma o partes del mismo de una variante de
HBV.
La mutación en la DNA-polimerasa
de HBV es GluLeu526Met con un motivo YMDD no mutado en el dominio
C.
La identificación del tanto por ciento variante
de la presente invención permite la generación de una serie de
ensayos para detectar dichas variantes. La detección de tales
variantes puede ser importante en la identificación de variantes
resistentes para determinar la forma apropiada de quimioterapia y/o
monitorizar protocolos de vacunación.
De acuerdo con ello, otro aspecto de la presente
invención contempla un método para determinar el potencial para que
un HBV exhiba sensibilidad reducida a un análogo de nucleósido,
comprendiendo dicho método aislar DNA o el mRNA correspondiente de
dicho HBV y escrutar en busca de una mutación en la secuencia de
nucleótidos que codifica DNA-polimerasa de HBV
dando como resultado al menos una sustitución del aminoácido Leu a
Met, en el dominio B de dicha DNA-polimerasa en la
posición 526, en donde la presencia de dicha mutación es una
indicación de la probabilidad de resistencia a dicho análogo de
nucleósido.
El ensayo determina una mutación que da como
resultado una sustitución Leu526Met Glu.
El DNA o el RNA correspondiente puede ensayarse
o, alternativamente, la DNA-polimerasa o el antígeno
de superficie puede escrutarse con respecto a la mutación.
\newpage
La detección de acuerdo con este aspecto de la
invención puede ser cualquier medio de detección basado en ácido
nucleico, por ejemplo técnicas de hibridación de ácido nucleico o la
reacción en cadena de la polimerasa (PCR). La invención abarca
adicionalmente el uso de diferentes formatos de ensayo de dichos
medios de detección basados en ácido nucleico, que incluyen
polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP),
polimorfismo de longitud de fragmentos amplificados (AFLP),
polimorfismo de cadenas monocatenario (SSCP), amplificación y
detección de desapareamientos (AMD), reacción en cadena de
polimerasa de secuencias repetidas intercaladas
(IRS-PCR), reacción en cadena de polimerasa inversa
(iPCR) y reacción en cadena de polimerasa con trascripción inversa
(RT-PCR), entre otros.
La presente invención se extiende a una gama de
ensayos basados inmunológicamente para detectar
DNA-polimerasa de HBV variante. Estos ensayos están
basados en anticuerpos dirigidos hacia la
DNA-polimerasa del HBV existente naturalmente que
no interaccionan, o no lo hacen sustancialmente, con la
DNA-polimerasa del HBV variante. Alternativamente,
se utilizan anticuerpos para una DNA-polimerasa de
HBV variante, que no interaccionan, o no lo hacen sustancialmente,
con la DNA-polimerasa del HBV existente
naturalmente.
Pueden utilizarse anticuerpos monoclonales o
policlonales, aunque se prefieren los anticuerpos monoclonales dado
que los mismos pueden producirse en gran cantidad y en una forma
homogénea. Están disponibles una extensa gama de técnicas de
inmunoensayo, tales como las descritas en las patentes U.S. Núms.
4.016.043, 4.424.279 y 4.018.653.
La detección de variantes de aminoácidos de
DNA-polimerasa se realiza convenientemente haciendo
referencia a la secuencia de aminoácidos de consenso que se muestra
en la Figura 4. Los polimorfismos mostrados representan las
variaciones que aparecen en diversas bases de datos para cepas de
HBV patógenas activas. Donde una variante de HBV comprende un
aminoácido diferente que la representada, entonces se considera que
dicho aislado es una variante de HBV supuesta que tiene una
actividad de DNA-polimerasa alterada.
De acuerdo con ello, otro aspecto de la presente
invención contempla un método para determinar si un aislado de HBV
codifica una DNA-polimerasa variante, comprendiendo
dicho método determinar la secuencia de aminoácidos de su
DNA-polimerasa en la posición 526 directamente o por
la vía de una secuencia de nucleótidos y comparar la misma con la
secuencia de aminoácidos siguiente:
\vskip1.000000\baselineskip
donde la presencia de un aminoácido
diferente de la secuencia de consenso indica una variante de HBV
supuesta.
La presente invención contempla adicionalmente
agentes que enmascaran la mutación de resistencia a los análogos de
nucleósidos. Tales agentes serán particularmente útiles en el
tratamiento a largo plazo por análogos de nucleósidos. Los agentes
pueden ser DNA o RNA o moléculas químicas proteináceas o no
proteináceas. El escrutinio de productos naturales tales como
plantas, coral y microorganismos se contempla también como una
fuente potencialmente útil de agentes de enmascaramiento. Los
agentes pueden encontrarse en forma aislada o en la forma de una
composición farmacéutica, y pueden administrarse sucesiva o
simultáneamente con el análogo de nucleósido.
La presente invención se extiende a kits para
ensayos de HBV variante. Tales kits pueden contener, por ejemplo,
los reactivos de la PCR o de otras tecnologías de hibridación de
ácido nucleico, o reactivos para técnicas de detección basadas
inmunológicamente.
La presente invención se describe adicionalmente
por las figuras y ejemplos no limitantes siguientes.
En las figuras:
Figura 1 es una representación diagramática
que muestra el genoma de HBV de DNA parcialmente bicatenario que
exhibe los marcos de lectura abiertos solapantes que codifican los
genes de superficie (S), núcleo (C), polimerasa (P) y X.
Figura 2 es una representación gráfica que
muestra el perfil de bioquímica del suero (ALT) y virológico (DNA
de HBV) en el paciente de trasplante y las respuestas que siguen a
la introducción de diversos programas de tratamiento antiviral. Se
describen en detalle en los ejemplos los tratamientos GCV+PFF, GCV y
FCV[I] y FCV[II]. El tratamiento GCV+PFF es la
combinación famciclovir más foscamet (12), el tratamiento GCV es
terapia de mantenimiento con ganciclovir parenteral, y el
tratamiento FVC[I] y FCV[II] es terapia oral con
famciclovir a una dosis de 250 mg o 500 mg dos veces al día,
respectivamente. El día que comenzó cada terapia se muestra entre
corchetes. Las respuestas de ALT (\bullet -- \bullet) y DNA de
HBV (\Box -- \Box) se representan gráficamente en función del
tiempo desde el comienzo de la terapia antiviral hasta 6 meses
después de la OLT. Se muestran los cinco puntos clave para el
análisis de la secuencia pre-tratamiento (PRE-) y
los días 87, 600, 816 y 1319 después del tratamiento antiviral.
Figura 3 es una representación que muestra la
alineación de aminoácidos de los motivos de la secuencia de
DNA-polimerasa dependiente de RNA de HBV,
pre-tratamiento con famciclovir y 370 días después
del tratamiento (terapia antiviral total de 816 días), con el virus
de la hepatitis de la marmota (WHV), el virus de la
inmunodeficiencia humana (HIV), y las regiones comparables con la
DNA-polimerasa del virus del herpes símplex (HSV)
(13, 14) (SEQ ID Nos 31-35 y
50-57). Los residuos conservados asparagina (D) y
glicina (G) dentro de los motivos de polimerasa se muestran en
negrilla y los cambios de aminoácidos encontrados después del
tratamiento con famciclovir se muestran en negrilla y subrayados.
Se muestra la localización de los residuos de aminoácidos mutados en
la polimerasa de HBV. El residuo glicina subrayado y en negrilla
(G) en la polimerasa de HSV cambia a una cisteína (C) durante el
tratamiento con penciclovir (15).
Figura 4 es una representación que muestra las
regiones conservadas de los dominios A a E (subrayados) de HBV. M
en YMDD se designa como aminoácido número 550. * indica más de tres
posibilidades de aminoácidos en esta posición de la secuencia de
consenso (SEQ ID NO 29).
Figura 5 es una representación que muestra la
alineación de aminoácidos de los motivos de la secuencia de
DNA-polimerasa dependiente de RNA del HBV, indicando
los cambios de aminoácidos que se han seleccionado en presencia de
famciclovir y 3TC (SEQ ID Nos 36-41 y
45-49). La secuencia de consenso de HBV se derivó de
las secuencias publicadas en Genebank/Entrez. Los residuos
conservados asparagina (D) y glicina (G) en los motivos de
polimerasa se muestran en negrilla. Los cambios de aminoácidos
encontrados después del tratamiento con famciclovir se muestran en
tipo negrilla verde y subrayados y después de 3TC se muestran en
tipo negrilla azul y están subrayados. Se muestra la secuencia de
aminoácidos del HBV aislado del paciente A y el paciente B, durante
el tratamiento con famciclovir y del Paciente C que no respondía a
famciclovir y se trató posteriormente con 3TC y en el cual se
seleccionó una mutación de resistencia. Los cambios de 3TC
publicados detectados por Ling et al. (16) se muestran en
3TC 1.
Figura 6 es una representación que muestra la
secuencia de nucleótidos (SEQ ID NO 17) de una variante de HBV y
las secuencias correspondientes de aminoácidos para la
DNA-polimerasa de HBV y el antígeno de superficie
de HBV que muestran en negrilla las mutaciones RIW499 en la
polimerasa y D144E y G145R en el antígeno de superficie.
Los inventores secuenciaron la polimerasa de HBV
y los marcos de lectura abiertos X de una serie de aislados de un
paciente que recibió terapia antiviral durante casi 4 años después
de recurrencia posterior al trasplante hepático de la infección por
HBV (Figura 2).
El paciente (varón, de 42 años de edad) fue
trasplantado debido a insuficiencia hepática en etapa final debida a
infección crónica por HBV. El curso inicial después del trasplante
no presentaba características interesantes, pero a los 5 meses se
registró evidencia de infección recurrente y niveles muy altos de
replicación viral y deterioro de la función hepática (12). El cuadro
histológico era consistente con hepatitis colestática fibrosante. Se
inició el tratamiento antiviral aproximadamente 6 meses
post-OLT. Inicialmente, el paciente recibió
famciclovir intravenoso (iv) (GCV; 10 mg/kg/día) en combinación con
foscarnet iv (PFF; 50-125 mg/kg/día; dependiendo la
dosis de la función renal) (12). Este es el tratamiento de GCV+PFF
descrito en la Figura 2, que se mantuvo durante 86 días. El
mantenimiento de GCV iv (3,3-6,7 mg/kg/día) tres
veces por semana se inició el día 87 del tratamiento antiviral (GCV
en la Figura 2). Se inició famciclovir oral (250 mg, 2 veces al día)
el día 446 de la terapia (FCV[I] en la Figura 2) que se
incrementó a 500 mg dos veces al día (FCV[II] en la Figura 2)
el día 500. El paciente se encuentra actualmente en este régimen de
tratamiento. Los detalles clínicos y virológicos de este paciente
precedentes a la terapia con famciclovir han sido publicados
(12).
Se recogieron rutinariamente muestras de suero y
se guardaron a -70ºC. Se obtuvo consentimiento informado del
paciente para utilizar estas muestras para propósitos de
investigación. La Figura 2 muestra los niveles de
alanina-amino-transferasa (ALT) y
DNA de HBV a lo largo de todo el curso del tratamiento antiviral.
Las 5 muestras seleccionadas para estudios adicionales abarcan un
periodo de casi 4 años.
El paciente B fue retrasplantado por pérdida del
aloinjerto relacionado con el HBV asociada a mutantes
pre-núcleo 14 meses después del trasplante de hígado
inicial. El tratamiento antiviral con GCV (7,5 mg/kg/día) se
administró durante 10 meses y cesó posteriormente. Esto fue seguido
por la administración de terapia oral con famciclovir (500 mg 3
veces al día).
El gen de la polimerasa de HBV entero del
paciente B se secuenció a partir de una muestra de HBV en suero
tomada después del trasplante al cabo de 850 días de terapia con
FCV. Las regiones que abarcaban los dominios catalíticos de la
polimerasa de HBV se secuenciaron a partir de una muestra de suero
previa al trasplante y antes del tratamiento con FCV.
Este paciente no respondía a famciclovir y se
trató después con lamivudina (3TC) (6,7) en la cual se seleccionó
una mutación de resistencia.
Este paciente se trata con famciclovir en el
cual se selecciona una mutación de resistencia.
Se midieron el antígeno de superficie de la
Hepatitis B (HbsAg), el antígeno e de la Hepatitis B (HbeAg),
anti-HBe, IgG e IgM específicas del antígeno de
núcleo de la Hepatitis B (HbcAg), IgM específica de Hepatitis A,
antígeno y anticuerpo de la Hepatitis delta, y anticuerpo
anti-virus de la Hepatitis C, utilizando
inmunoensayos disponibles comercialmente (Abbott Laboratories,
North Chicago, IL). Únicamente los marcadores de HBV eran
positivos. Se midieron y cuantificaron los niveles de DNA viral de
la Hepatitis B utilizando un ensayo de hibridación de captura de
acuerdo con las instrucciones del fabricante (Digene Diagnostics
Inc., Beltsville, MD). Este paciente estaba infectado con un
mutante de HBV pre-núcleo pre-OLT
(12) y su estatus no cambió después de la OLT.
1. Extracción del DNA de los sueros: Se
mezclaron partes alícuotas de 50 \mul de sueros con 150 \mul de
TE (10 mmol/l_Tris-HCl (pH 7,5), 2 mol/l de EDTA),
1% p/v de dodecil-sulfato de sodio y 1 mg/ml de
pronasa y se incubó a 37ºC durante 2 horas. El DNA se desproteinizó
con fenol/cloroformo, se precipitó con isopropanol y se disolvió en
25 \mul de agua exenta de nucleasa.
2. Amplificación de la polimerasa viral y
los genes X por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR):
los oligonucleótidos fueron sintetizados por Bresatec, Adelaide,
Australia. Para amplificación del gen de polimerasa, el iniciador de
sentido era 5'-GGA GTG TGG ATT CGC ACT
CC-3' [SEQ ID NO 1] (nucleótidos [nt] -40 a -21) y
el iniciador antisentido era 5'-GCT CCA AAT TCT TTA
TA-3' [SEQ ID NO 2] (nt 2831 a 2847). Para
amplificación del gen X, el iniciador de sentido era
5'-CCT TTA CCC CGT TGC CCG GC-3'
[SEQ ID NO 3] (nt 2045 a 2074) y el iniciador antisentido
5'-GCT CCA AAT TCT TTA TA-3' [SEQ ID
NO 4] (nt 2831 a 2847). Todos los nt se enumeran desde el comienzo
del gen de la polimerasa. Cada reacción se llevó a cabo utilizando 5
\mul del DNA extraído como molde, 1,5 U de polimerasa Taq
(Perkin Elmer Cetus, Norwalk, CT), 1 \mumol/l de iniciadores de
sentido y antisentido, 200 \mumol/l de cada uno de los
desoxinucleósido-trifosfatos, 50 mmol/l de KCl, 3,5
mmol/l de MgCl_{2}, 10 mmol/l de Tris-HCl (pH 8,3)
y 0,1% p/v de gelatina. La amplificación se realizó por 40 ciclos de
desnaturalización (94ºC durante 1 min), reasociación (55ºC durante 1
min) y extensión (72ºC durante 1,5 min), seguidas por una extensión
final de 7 min (Perkin Elmer Cetus, Norwalk, CT). El producto PCR se
analizó por electroforesis en gel a través de 1,5% p/v de agarosa y
se visualizó por irradiación UV después de tinción con bromuro de
etidio.
3. Secuenciación de los genes de polimerasa
y X de DNA de HBV: El producto amplificado específico se
purificó utilizando Geneclean II (BIO 101 Inc., La Jolla, CA) y se
secuenció directamente utilizando la versión 2.0 de Sequenase
(United States Biochemical Corp., Cleveland, OH). Los iniciadores
PCR se utilizaron como iniciadores de secuenciación y se
sintetizaron adicionalmente iniciadores internos para secuenciar las
regiones internas de los productos PCR. Se utilizaron los
iniciadores internos y de secuenciación siguientes: 5'- GCC GCG TCG
CAG AAG ATC TCA AT -3' [SEQ ID NO:5] (nt 104-126),
5'- GGT TCT ATC CTA ACC TTA CC -3' [SEQ ID NO:6] (nt
341-360), 5'- GCC TCA TTT TGT GGG TCA CCA TA -3'
[SEQ ID NO:7] (nt 496-518), 5'- TGG GGG TGG AGC CCT
CAG GCT -3' [SEQ ID NO:8] (nt 731-751), 5'- CAC AAC
ATT CCA CCA AGC TC -3' [SEQ ID NO:9] (nt 879-899),
5'- AAA TTC_GCA GTC CCC AAC -3' [SEQ ID NO:10] (nt
1183-1195), 5'- GTT TCC CTC TTC TTG CTG T -3' [SEQ
ID NO:11](nt 1429-1447), 5'- TTT TCT TTT GTC TTT GGG
TAT -3' [SEQ ID NO:12] (nt 1683-1703)
5'-CCA ACT TAC AAG GCC TTT CTG-3'
[SEQ ID NO:13] (nt 1978-1999),
5'-CAT CGT TTC CAT GGC TGC TAG GC-3'
[SEQ ID NO:14] (nt 2239-2262).
Debido a la pequeña cantidad de DNA de HBV en
las muestras, la región que abarcaba los nt 1429 a 1703 del gen de
polimerasa de HBV se amplificó por PCR utilizando los iniciadores
5'-GTT TCC CTC TTC TTG CTG T-3' [SEQ
ID NO 15] (nt 1429-1447) y 5'-ATA
CCC AAA GAC AAA AGA AAA-3' [SEQ ID NO 16] (nt
1703-1683), antes de la clonación. El DNA se
purificó con Geneclean II y se ligó utilizando
DNA-ligasa T4 (New England Biolabs, Beverly, MA) a
un plásmido pUC18 desfosforilado digerido con SmaI (Pharmacia
Biotech, NJ). Los clones secuenciaron directamente como el caso
anterior.
Se aplicaron muestras de suero (100 \mul) a un
cojín de 20% p/v de sacarosa en TNE (20 mmol/l de
Tris-HCl de pH 7,4, 150 mmol/l de NaCl 1 mmol/l de
EDTA) y se centrifugaron a 200.000 g durante 3 h a 10ºC utilizando
un rotor SW41 en una ultracentrífuga Beckman modelo L8. El pelet se
resuspendió en 50 mmol/l de TRIS-HCl de pH 7,5 que
contenía 1,5% v/v de Triton-X100, 100 mmol/l de KCl
y 0,01% v/v de 2-mercaptoetanol y se dejó en reposo
durante una noche a 4ºC. Se ensayaron partes alícuotas pequeñas de
la suspensión respecto a actividad de
DNA-polimerasa endógena de HBV esencialmente como ha
sido descrito por Price et al. (16). Cada ensayo se realizó
en un volumen total de 30 \mul que contenían 20 \mul del HBV
parcialmente purificado y (concentraciones finales) 30 mmol/l de
Tris-HCl de pH 7,5, 30 mmol/l de MgCl_{2}, 10
\mumol/l de cada uno de dATP, dTTP y dGTP, y 0,01 \muM de
[\alpha-^{32}P]-dCTP (3.000
Ci/mmol) (Dupont NEN, Boston, MA). Para ensayar la sensibilidad al
penciclovir-trifosfato (PCV-TP), se
realizaron ensayos apareados sobre cada muestra, con un exceso (100
\mumol/l) de penciclovir-trifosfato incluido en la
mezcla de reacción en un solo ensayo de cada par. Después de 2 h a
37ºC, se pararon las reacciones por aplicación en forma de gota de
partes alícuotas de 20 \mul de cada mezcla de reacción sobre
discos de fibra de vidrio de 25 mm de diámetro (Advantex, Tokio,
Japón) que se habían impregnado previamente en ácido tricloroacético
(TCA) al 10% p/v. Los discos se secaron antes de lavarlos en TCA al
10% p/v enfriado en hielo que contenía 10 mmol/l de pirofosfato de
sodio. Siguieron 3 lavados adicionales durante 10 min en TCA al 5%
v/v frío. Los discos lavados se enjuagaron finalmente en etanol
absoluto, se secaron al aire, y se sometieron a recuento de
radiactividad. La inhibición de la actividad de
DNA-polimerasa de HBV por PCV-TP se
expresó como la diferencia porcentual en actividad en la mezcla de
ensayo que contenía PCV-TP comparada con el control
equiparable. Debido a las cantidades limitadas de muestra, no fue
posible estandarizar la actividad enzimática o realizar ensayos
duplicados. A pesar de la variabilidad inherente del ensayo, era
evidente una disminución general en función del tiempo en la
sensibilidad de la DNA-polimerasa de HBV al
PCV-TP (véase la Tabla 1).
Después del comienzo de la estrategia del
tratamiento antiviral GCV + PFF, el nivel de DNA de HBV
post-OLT disminuyó desde más de 100.000 pg/ml a
10.800 pg/ml el día 87 (Figura 2). Esta reducción en la viremia
estaba asociada con mejora clínica, bioquímica e histológica (12).
El mantenimiento de la terapia con famciclovir (tratamiento GCV)
dio como resultado niveles fluctuantes de DNA de HBV a lo largo de
los 359 días subsiguientes, observándose dos picos de DNA de HBV.
El cambio a famciclovir oral el día 446 estaba asociado también con
un aumento en DNA de HBV, pero éste era probablemente el resultado
de una dosificación insuficiente (FCV [I] en la Figura 2) en lugar
de una ruptura en el tratamiento. Después del aumento de dosis a FCV
[II] el día 500, se produjo una disminución en el DNA de HBV. Sin
embargo, el nivel de DNA de HBV aumentó gradualmente a lo largo del
tiempo desde 3.000 pg/ml el día 600 (154 días de famciclovir) a
8.800 pg/ml el día 816 (370 días de famciclovir), alcanzándose un
pico de 29.000 pg/ml el día 1302 (856 días de famciclovir), y
estabilizándose luego a alrededor de 12.000 pg/ml el día 1329 (883
días de famciclovir). Un ensayo Student de los niveles de DNA
durante el periodo de tratamiento desde los días 816 a 1329, reveló
un aumento estadísticamente significativo. Había un aumento de 1,5
a 2 veces en los niveles de ALT en el mismo intervalo de tiempo
(Figura 2) y ausencia de cambios en el estatus clínico.
Los genes X y de polimerasa de HBV se
secuenciaron en cinco momentos puntuales (Figura 2). Durante casi 4
años de la terapia antiviral, no se registró cambio alguno en el gen
X en comparación con la secuencia anterior al tratamiento. Sin
embargo, se detectaron cambios en 5 nt en el gen de polimerasa entre
las muestras del día 816 y el día 1329 (Tabla 1). Estos cambios se
detectaron en amplificaciones PCR separadas independientes;
adicionalmente, las mutaciones fueron detectadas por secuenciación
de ambas cadenas y es por consiguiente improbable que sean
resultado de errores generados en la PCR. Los cambios de nt en el
gen de polimerasa se detectaron por primera vez después de 816 días
de tratamiento, cuando el paciente había sido tratado con
famciclovir durante 370 días. Sin embargo, solamente dos cambios de
nt, en las posiciones 1498 y 1519 dieron como resultado cambios de
aminoácidos, Val 519-Leu y Leu
526-Met, respectivamente. Estos dos cambios de nt
aparecieron simultáneamente. Al cabo de 816 días, se detectaron
tres nt diferentes (C, G, T) en la posición 1498 (todos los cuales
daban como resultado un cambio de Val a Leu). Después de 1329 días
de tratamiento, la timidina era la especie dominante en el nt 1498.
Los cambios de aminoácidos a los 816 y 1329 días
post-tratamiento coincidían con una sensibilidad
reducida de DNA-polimerasa de HBV en suero a
PCV-TP (Tabla 1). Estos cambios de nt no se
encontraron en 6 pacientes con infección por HBV recurrente
post-OLT que no estaban sometidos a terapia con
FCV.
La región que abarcaba las mutaciones de nt que
daban lugar a cambios de aminoácidos respecto a la muestra tomada a
los 1329 días se clonó y secuenció. Se detectaron tres
cuasi-especies. El setenta y cinco por ciento (15/20) de los
clones contenían las dos mutaciones 1498 y 1519 que se presentaban
juntas. Se detectaron secuencias previas al tratamiento no mutadas
en 3/20 de los clones. Una mutación adicional en el nt 1511, que
daría como resultado un cambio de prolina a leucina en la posición
523, se detectó en 2/20 de los clones. Esta mutación no se detectó
con las dos mutaciones dominantes, 1498 (Val
519-Leu) y 1519 (Leu 526-Met), ni se
detectó por secuenciación PCR directa, lo que indicaba que la misma
ocurre probablemente con una frecuencia baja. El DNA viral de la
muestra obtenida a los 600 días (150 días de tratamiento FCV) se
clonó y secuenció también; sin embargo, únicamente se detectaron
las secuencias pre-tratamiento.
Los cambios de aminoácidos en HBV aislado de los
pacientes B y C se muestran en la Figura 5, y los del paciente D se
muestran en la Figura 6. En la Figura 5, el paciente A es el mismo
que se representa en la Figura 3. El paciente B estaba siendo
sometido a tratamiento con famciclovir de larga duración (> 850
días). El cambio de aminoácidos seleccionado durante el tratamiento
con famciclovir se muestra como HBV (paciente B) en la Figura 5. El
paciente C no respondía a famciclovir y se trató posteriormente con
3TC (lamivudina [6,7]). El HBV aislado durante el tratamiento FCV
del paciente C, se muestra como HBV (paciente
C-FCV). La totalidad de las mutaciones de
resistencia a 3TC que se desarrollaron durante el tratamiento con
3TC se muestran como HBV (paciente C-3TC). El
análisis de la secuencia mostraba una mutación (sustitución
Thr-Ser) en el gen de la polimerasa de HBV próxima
al dominio C pero no se detectó mutación inicial alguna en el motivo
YMDD. Una mutación de Met 550 a Ile en el motivo YMDD se detectó a
partir del HBV aislado 32 días (333 días después del tratamiento)
después de aislar el HBV que contenía la sustitución
Thr-Ser.
Los expertos en la técnica apreciarán que la
invención descrita en esta memoria es susceptible de variaciones y
modificaciones distintas de las descritas específicamente. Debe
entenderse que la invención incluye la totalidad de dichas
variantes y modificaciones. La invención incluye también todos los
pasos, características, composiciones y compuestos citados o
indicados en esta memoria descriptiva, individual o colectivamente,
y cualesquiera y la totalidad de las combinaciones de cualesquiera
dos o más de dichos pasos o características.
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
1. Summers J, Mason W. Cell
(1982) 29: 403-415.
2. Vere Hodge RA Antiviral Chem
Chemother (1993) 4: 67-84.
3. Boyd MR et al. Antiviral Chem
Chemother. (1987) 32: 358-363.
4. Kruger T et al. Hepatology
(1994) 22: 219A.
5. Main J et al. J. Viral
Hepatitis (1996) 3: 211-215.
6. Severini A et al. Antimicrobial
Agents Chemother (1995) 39:
1430-1435.
7. Dienstag JL et al. New
England J Med (1995) 333:
1657-1661.
8. Shaw T, et al. Antimicrobiol Agents
Chemother (1994) 38: 719-723.
9. Shaw T, et al.
Hepatology (1996) 24: en prensa.
10. Tsiquaye KN, et al. J. Med
Virol (1994) 42: 306-310.
11. Boker KHW, et al.
Transplantation (1994) 57:
1706-1708.
12. Angus P, et al. J. Gastroenterol
Hepatol (1993) 8: 353-357.
13. Poch 0, et al. EMBO J.
(1989) 8: 3867-3874.
14. Delarue M, et al. Protein
Engineering (1990) 3: 461-467.
15. Chiou HC, et al. Antiviral Chem
Chemother (1995) 6: 281-288.
16. Ling R; et al. Hepatology
(1996) 24: 711-713.
17. Price PM, et al.
Hepatology (1992) 16: 8-13.
18. Aye et al. Hepatology
(1996) 24: No. 4, P2, 285A.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: (distinto de EE.UU.) WESTER HEALTH CARE NETWORK (EE.UU. solamente): LOCARNINI, SA, BARTHOLMEUSZ, A I, De MAN, R.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: VARIANTES VIRALES Y MÉTODOS PARA DETECCIÓN DE LAS MISMAS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 20
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Davies Collison Cave
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- Calle: 1 LITTLE COLLINS STREET
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Melbourne
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Victoria
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Australia
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 3000
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOPORTE LÓGICO: PatentIn Release #1.0, Version #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: Internacional (PCT)
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 15-Agosto-1997
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE SOLICITUDES ANTERIORES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: AU provisional
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 08-Noviembre-1996
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE PROCURADOR/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: HUGHES DR, E JOHN L
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- REFERENCIA/NÚMERO DE EXPEDIENTE: EJH/AF
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: +61 3 9254 2777
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: +61 3 9254 2770
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEO ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGA GTG TGG ATT CGC ACT CC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA,
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCT CCA AAT TCT TTA TA
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA.
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCT TTA CCC CGT TGC CCG GC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCT CCA AAT TCT TTA TA
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCC GCG TCG CAG AAG ATC TCA AT
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGT TCT ATC CTA ACC TTA CC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:
7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCC TCA TTT TGT GGG TCA CCA TA
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:
8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGG GGG TGG AGC CCT CAG GCT
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:
9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAC AAC ATT CCA CCA AGC TC
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO:
10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAAA TTC GCA GTC CCC AAC
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTT TCC CTC TTC TTG CTG T
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTT TCT TTT GTC TTT GGG TAT
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCA ACT TAC AAG GCC TTT CTG
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCAT CGT TTC CAT GGC TGC TAG GC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGTT TCC CTC TTC TTG CTG T
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATA CCC AAA GAC AAA AGA AAA
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 550 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- PECULIARIDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 1..549
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 183 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 550 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASE DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- PECULIARIDAD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 2..550
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 183 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<110> WESTERN HEALTH CARE NETWORK.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> VIRAL VARIANTS AND METHODS FOR
DETECTING SAME.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 104PCT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140> PCT/AU97/00520
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
1997-08-15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> PO 3519
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
1996-11-08
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggagtgtgga ttcgcactcc
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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<213> Virus de la hepatitis B
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<213> Virus de la hepatitis B
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<213> Virus de la hepatitis B
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<213> Virus de la hepatitis B
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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<211> 17
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
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<211> 23
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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\hfill23
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<212> DNA
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<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
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\hfill21
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<211> 20
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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<400> 9
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill20
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<211> 18
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill18
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
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<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill19
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill21
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\vskip0.400000\baselineskip
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaacttaca aggcctttct g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcatcgtttcc atggctgcta ggc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtttccctct tcttgctgt
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatacccaaag acaaaagaaa a
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 550
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(549)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 183
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\hskip0,8cm10
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 550
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2)..(472)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (476)..(508)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (512)..(526)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (530)..(550)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 157
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Leu Thr Lys Gln Lys Asp Gly Val Ile
Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Ser Trp Val Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de b hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Glu Val Gly Glu His Cys}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa His Pro Ile Xaa Leu Gly Phe Arg Lys Xaa
Pro Met Gly Xaa Gly}
\sac{Leu Ser Pro Phe Leu Leu Ala Gln Phe}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Gln o Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Arg o Trp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (10)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (25)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (40)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cys o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Thr Xaa Gly Xaa Lys Leu His Leu Xaa Xaa
His Pro Ile Xaa Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Xaa Pro Met Gly Xaa Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Leu}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Xaa Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Phe Xaa Tyr Met Asp Asp Xaa Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Phe o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (19)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Pro o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (22)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cys o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa His Pro Ile Xaa Leu Gly Xaa Arg Lys Xaa
Pro Met Gly Xaa Gly}
\sac{Leu Ser Xaa Phe Leu Xaa Ala Gln Phe Thr
Ser Ala Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Met o Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Lys o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (14)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Thr
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Phe Xaa Tyr Xaa Asp Asp Xaa Val Leu Gly
Ala Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 181
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (2)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Asp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (17)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Pro
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (35)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Asp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (44)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Thr o Asn
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (46)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Arg o Asn
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (47)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Ile
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANT
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (48)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = más de 3 aminoácidos
diferentes posibles
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (50)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Tyr o His
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (52)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = His o Tyr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (53)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Gly o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (54)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = más de 3 aminoácidos
diferentes posibles
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (55)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = más de 3 aminoácidos
diferentes posibles
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (56)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = más de 3 aminoácidos
diferentes posibles
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (57)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asp o Asn
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (60)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asp o Asn
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (61)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Tyr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (65)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Gln
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (71)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (75)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Lys o Gln
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (77)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (79)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Arg o Trp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (84)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (85)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (89)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (95)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (99)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (114)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cys o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (115)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Ser
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (116)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (117)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Thr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (118)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Arg o Cys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (122)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Phe o Pro
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (125)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (126)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (128)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (133)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (138)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Lys o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (139)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Thr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (140)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (141)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Gln o Glu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (143)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Ser o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (145)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (147)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Phe o Tyr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (148)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Thr o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (149)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Ser
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (150)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Ile
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (151)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Thr o Cys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (152)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Ser
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (153)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Phe o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (156)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Asp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (157)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (164)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Asn o Gln
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (179)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Ile
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\hskip2,5cm15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Met Asp Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Val Phe Ala Tyr Met Asp Asp Leu Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Tyr Gln Tyr Met Asp Asp Leu Tyr Val
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Thr Ile Gly Arg Glu Met Leu Leu Ala Thr
Arg Glu Tyr Val His}
\sac{Ala Arg Trp Ala Ala Phe Glu Gln Leu Leu
Ala Asp Phe Pro Glu Ala}
\sac{Ala}
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Ile Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Ile Pro Met Gly Leu Gly
Leu Ser Leu Phe Leu Met}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Ile Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Ile Pro Met Gly Val Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Met}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Ile Leu}
\sac{Gly Leu Arg Lys Ile Pro Met Gly Val Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Met}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Val Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Ile Pro Met Gly Val Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Leu}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Leu Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu Gly
Ala Lys Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa His Pro Ile Xaa Leu Gly Phe Arg Lys Xaa
Pro Met Gly Xaa Gly}
\sac{Leu Ser Pro Phe Leu Leu Ala Gln Phe Thr
Ser Ala Ile Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Gln o Lys
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Phe
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Arg o Trp o Glu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (10)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Tyr o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (18)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Phe o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (25)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Val o Glu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Pro o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (39)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (40)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cys o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Thr Xaa Gly Xaa Lys Leu His Leu Xaa Xaa
His Pro Ile Xaa Leu}
\sac{Gly Xaa Arg Lys Xaa Pro Met Gly Xaa Gly
Leu Ser Xaa Phe Leu Xaa}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Met o Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Lys o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (14)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Thr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Phe Xaa Tyr Xaa Asp Asp Xaa Val Leu Gly
Ala Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ile o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (15)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Gly
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Cys o Leu
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa His Pro Ile Xaa Leu Gly Phe Arg Lys Xaa
Pro Met Gly Xaa Gly}
\sac{Leu Ser Pro Phe Leu Leu Ala Gln Phe Thr
Ser Ala Ile Xaa Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ala o Val
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (3)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Ala
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (8)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Leu o Met
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (13)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Lys o Arg
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (14)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Ser o Thr
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Phe Xaa Tyr Met Asp Asp Xaa Val Leu Gly
Ala Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
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<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu
Gly}
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<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> VARIANTE
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Xaa = Val o Ile
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
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\sa{Ala Phe Ser Tyr Xaa Asp Asp Val Val Leu
Gly}
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<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Phe Ser Tyr Met Asp Asp Val Val Leu
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
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<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Asp Leu Ser Trp Leu Ser Leu Asp Val Ser
Ala Ala Phe Tyr His}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 51
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
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<212> PRT
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<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 51
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Asp Leu Ser Trp Leu Ser Leu Asp Val Ser
Ala Ala Phe Tyr His}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
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<212> PRT
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<213> Virus de la hepatitis B
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<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Thr Asp Leu Gln Trp Leu Ser Leu Asp Val Ser
Ala Ala Phe Tyr His}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Lys Lys Ser Val Thr Val Leu Asp Val Gly
Asp Ala Tyr Phe Ser}
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Ile Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Ile Pro Met Gly Val Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Leu}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Cys Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210>55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Virus de la hepatitis B
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 55
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\sa{Gln Thr Phe Gly Arg Lys Leu His Leu Tyr Ser
His Pro Ile Ile Leu}
\sac{Gly Phe Arg Lys Ile Pro Met Gly Leu Gly
Leu Ser Leu Phe Leu Met}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Ile Cys Ser}
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<213> Virus de la hepatitis B
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<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Thr Tyr Gly Arg Lys Leu His Leu Leu Ala
His Pro Phe Ile Met}
\sac{Gly Phe Arg Lys Leu Phe Met Gly Val Gly
Leu Ser Pro Phe Leu Leu}
\sac{Ala Gln Phe Thr Ser Ala Leu Ala Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
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<212> PRT
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<213> Virus de la hepatitis B
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Tyr Gln Tyr Asn Val Leu Pro Gln Gly Trp
Lys Gly Ser Pro Ala}
\sac{Ile Phe Gln Ser Ser Met Thr Lys Ile Leu
Glu}
Claims (9)
1. Un mutante de HBV aislado que comprende una
mutación en el gen que codifica la DNA-polimerasa de
HBV que da como resultado una sensibilidad reducida a un análogo de
nucleósido de HBV con relación al HBV de tipo salvaje, en donde
dicha mutación da como resultado una sustitución de aminoácidos
Leu526Met en el residuo de aminoácido 526 en el dominio B de la
polimerasa de HBV de tipo salvaje, y dicho mutante codifica un
motivo YMDD sin mutar en el dominio C.
2. Un polinucleótido aislado que codifica una
DNA-polimerasa de HBV mutante que da como resultado
una sensibilidad reducida a un análogo de nucleósido de HBV con
relación al HBV de tipo salvaje y que comprende una mutación que da
como resultado una sustitución de aminoácidos Leu526Met en el
residuo de aminoácido 526 en el dominio B de la polimerasa de HBV
de tipo salvaje, y dicho mutante codifica un motivo YMDD sin mutar
en el dominio C.
3. Una polimerasa de HBV mutante aislada
codificada por un polinucleótido de acuerdo con la reivindicación
2.
4. El mutante, el polinucleótido o la polimerasa
de acuerdo con la reivindicación 1 a 3, en donde dicho análogo de
nucleósido se selecciona del grupo constituido por famciclovir,
penciclovir y lamivudina.
5. Un método para determinar el potencial para
que un HBV exhiba, con relación a un HBV de tipo salvaje aislado,
sensibilidad reducida a un análogo de nucleósido de HBV,
comprendiendo dicho método aislar DNA o mRNA correspondiente de
dicho HBV y escrutar en relación con una mutación en el gen de la
polimerasa de HBV en donde dicha mutación da como resultado una
sustitución de aminoácidos Leu526Met en el residuo de aminoácido 526
en el dominio B de la polimerasa de HBV de tipo salvaje, y en donde
la presencia de dicha mutación es una indicación del potencial de
sensibilidad reducida de dicho HBV a dicho agente antiviral.
6. El método de acuerdo con la reivindicación 5,
en donde dicho análogo de nucleósido se selecciona del grupo
constituido por lamivudina, famciclovir y penciclovir.
7. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 5 a 6, en donde el escrutinio para una mutación
comprende secuenciar dicho DNA de HBV aislado o el mRNA
correspondiente.
8. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 5 a 6, en donde el escrutinio para una mutación
comprende un método PCR o método basado en PCR.
9. El método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 5 a 6, en donde el escrutinio para una mutación
comprende un método de hibridación.
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| JP2008534020A (ja) | 2005-04-08 | 2008-08-28 | メルボルン ヘルス | 抗ウイルス性のヌクレオシド剤に耐性を示すｂ型肝炎ウイルスのバリアントおよびその応用法 |
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| AU2009325069B2 (en) * | 2008-12-11 | 2015-03-19 | Pacific Biosciences Of California, Inc. | Classification of nucleic acid templates |
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| AUPQ810900A0 (en) * | 2000-06-09 | 2000-07-06 | Austin and Repatriation Medical Centre, The | Viral variants and methods of using same |
| US7405039B2 (en) * | 2002-02-07 | 2008-07-29 | Austin Health | Viral variants with altered susceptibility to nucleoside analogs and uses thereof |
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