ES2279524T3 - Promotor de un gen especifico de la corteza radicular. - Google Patents

Promotor de un gen especifico de la corteza radicular. Download PDF

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Wen Song
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Abstract

SE DESCRIBE UNA MOLECULA DE ADN AISLADA QUE INCLUYE UNA SECUENCIA PROMOTORA DE ADN QUE DIRIGE LA TRANSCRIPCION ESPECIFICA DEL CORTEX DE RAIZ DE UN SEGMENTO DE ADN HETEROLOGO CORRIENTE ABAJO EN UNA CELULA VEGETAL. UN CONSTRUCTO DE ADN INCLUYE UN MODULO DE EXPRESION QUE INCLUYE, EN LA DIRECCION 5 A 3 , UN PROMOTOR DE LA PRESENTE INVENCION Y UN SEGMENTO DE ADN HETEROLOGO COLOCADO CORRIENTE ABAJO DEL PROMOTOR Y ASOCIADO DE FORMA OPERATIVA A ESTE. SE DESCRIBEN PLANTAS TRANSFORMADAS, TALES COMO PLANTAS DE TABACO, QUE INCLUYEN CELULAS VEGETALES TRANSFORMADAS QUE CONTIENEN UN CONSTRUCTO DE ADN HETEROLOGO QUE INCLUYE UN MODULO DE EXPRESION COMO SE HA DESCRITO ANTERIORMENTE.

Description

Promotor de un gen específico de la corteza radicular.
Campo de la invención
Esta invención se refiere a promotores de genes específicos de tejido y, especialmente, se refiere a un promotor que se activa en la corteza radicular de las plantas.
Antecedentes de la invención
Un promotor es una secuencia de ADN que flanquea un gen transcrito y al cual debe unirse la ARN polimerasa si ésta tiene que transcribir a ARN mensajero al gen al que flanquea. Un promotor puede estar formado por varios elementos reguladores diferentes que afectan a un gen estructural, asociado de forma operativa con el promotor de diferentes formas. Por ejemplo, un gen regulador puede potenciar o reprimir la expresión de un gen estructural asociado, someter a ese gen a regulación durante el desarrollo o contribuir a la regulación específica de tejido de ese gen. Las modificaciones de los promotores pueden posibilitar patrones opcionales de expresión génica, usando procedimientos de ADN recombinante. Véase, por ejemplo, Old y Primrose, Principles of Gene Manipulation (4ª edición, 1989).
Un ejemplo de un promotor vegetal es el promotor que se encuentra flanqueando el gen de la subunidad pequeña de la ribulosa 1,5-bifosfato carboxilasa en Petunia. Véase la Patente de EE.UU. Nº 4.962.028. Otro ejemplo es el promotor que comprende la región flanqueante 5' del gen Em de trigo. Véase la Solicitud EPO Nº 335.528. Incluso otro ejemplo es el elemento regulador inducible por estrés descrito en la Solicitud EPO Nº 0.330.479.
A pesar de su importante papel en el desarrollo de la planta, se han realizado relativamente pocos trabajos sobre la regulación de la expresión génica en raíces. En parte, la deficiencia es el resultado de una escasez de funciones bioquímicas específicas de la raíz fácilmente identificables, cuyos genes puedan clonarse y estudiarse fácilmente. Evans y col., Mol. Gen. Genet. 214, 153-157 (1988), intentaron sin éxito aislar clones de ADNc específico de la raíz a partir del guisante, y concluyeron que las especies de ARNm específico de raíz (si existen) están sólo presentes a muy baja cantidad en la población de ARNm de la raíz. Fuller y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 2594-2598 (1983), han clonado y caracterizado varios genes específicos de nódulo radicular. Las comparaciones de las secuencias 5' de ADN del inicio de la transcripción revelan un octanucleótido repetido presente en los tres genes examinados. Desafortunadamente, la falta de sistemas de transformación/regeneración eficaces en la mayoría de Leguminaceae ha dificultado el análisis funcional de estas secuencias que actúan en cis. Bogusz y col., Nature 331, 178-180 (1988), aislaron un gen de hemoglobina expresado específicamente en raíces de plantas no noduladas por su homología con el gen de la hemoglobina de especies noduladas estrechamente relacionadas. Keller y Lamb, Genes & Dev. 3, 1639-1646 (1989), aislaron un gen que codificaba un glucoproteína rica en hidroxiprolina de la pared celular expresada durante el inicio de la raíz lateral. Lerner y Raikhel, Plant Physiol. 91, 124-129 (1989), describieron recientemente la clonación y caracterización de una lectina específica de la raíz de cebada.
Muchos patógenos y plagas de plantas dañan las raíces de la planta, causando graves daños y pérdidas en la cosecha. El tejido radicular que se daña con más frecuencia es la corteza radicular, una capa compuesta principalmente de parénquima de almacenamiento que queda bajo la capa epidérmica y rodea el cilindro vascular central de la raíz. La corteza radicular puede contener adicionalmente esclerénquima, células secretoras, conductos de resina y otras estructuras y tipos celulares. Las células de la corteza radicular muestran semejanzas morfológicas y de desarrollo con las células corticales del brote aéreo.
Para transmitir características útiles a plantas mediante la expresión de genes extraños usando técnicas de ingeniería genética, serán necesarios diversos promotores específicos de tejido para permitir que se expresen de forma selectiva nuevas características en los tejidos apropiados de la planta. La presente invención se basa en nuestras investigaciones continuadas en relación con este problema.
Resumen de la invención
La presente invención se basa en la identificación del promotor RD2 del tabaco (TobRD2), que dirige la expresión específica de la corteza radicular de los genes asociados. Un primer aspecto de la presente invención es una molécula de ADN aislada que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal, teniendo la molécula de ADN aislada una secuencia seleccionada entre el grupo constituido por (a) las SEQ NOs: 1-9 proporcionadas en este documento y (b) las secuencias de ADN que hibridan con cualquiera de las SEQ ID NOs: 1-9 en condiciones rigurosas y que dirigen la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal.
La presente invención puede ser un casete de expresión que consta de un promotor RD2 de tabaco y un segmento de ADN heterólogo colocado antes del extremo 3' del promotor y asociado con éste de forma operativa.
Un aspecto adicional de la presente invención es un casete de expresión que comprende un promotor y un segmento de ADN heterólogo específicos de la corteza radicular, la secuencia del promotor específico de la corteza radicular seleccionada entre las SEQ ID NOs: 1-9 proporcionadas en este documento y las secuencias de ADN que hibridan con cualquiera de las SEQ ID NOs: 1-9 en condiciones rigurosas y que dirigen la transcripción específica de la corteza radicular.
Aspectos adicionales de la presente invención son células vegetales que contienen los casetes de expresión descritos anteriormente, procedimientos para producir plantas transformadas a partir de estas células vegetales y las plantas transformadas que comprenden estas células vegetales transformadas.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1A muestra la localización in situ de las transcripciones de RD2 del tabaco en un corte transversal de la raíz de tabaco de una plántula de siete días.
La Figura 1B muestra la localización in situ de las transcripciones de RD2 de tabaco en un corte longitudinal de la raíz de tabaco de una plántula de siete días.
La Figura 2 es una secuencia de 2.010 pares de bases (SEQ ID NO: 1) de la región 5' de TobRD2.
La Figura 3 es un esquema que muestra las construcciones de promotor TobRD2/glucuronidasa (GUS) usadas para analizar la capacidad del promotor RD2 para dirigir la expresión génica específica de la corteza radicular.
La Figura 4 es una gráfica de barras que resume la actividad \beta-glucuronidasa (GUS) en las raíces (barras rellenas), hojas (barras rayadas) y tallos (barras punteadas) de plantas transformadas con las construcciones del gen indicador quimérico, como se muestran en la Tabla 1. La gráfica muestra la actividad entre las plantas transformadas con las construcciones génicas utilizando diferentes promotores (CaMV35S; \Delta2.00; \Delta1.50; \Delta1.40; \Delta1.25; \Delta0.80; \Delta0.70; \Delta0.60; \Delta0.30) y utilizando el vector pBI101.3 solo como control. La actividad GUS se midió en pmoles de MU/\mug proteína/min.
La Figura 5A es una gráfica de barras que resume la actividad \beta-glucuronidasa (GUS) relativa en raíces y hojas de plantas de tabaco transformadas con construcciones del gen indicador quimérico usando diferentes promotores (CaMV35S; \Delta2.00; \Delta1.50; \Delta1.40; \Delta1.25; \Delta0.80; \Delta0.70; \Delta0.60; \Delta0.30) y utilizando el vector pBI101.3 solo como control, como se muestra en la Tabla 1. La actividad GUS se midió en pmoles de MU/\mug proteína/min y la actividad relativa mostrada es la actividad en raíces/actividad en hojas.
La Figura 5B es una gráfica de barras que resume la actividad \beta-glucuronidasa (GUS) relativa en raíces y tallos de plantas transformadas con construcciones del gen indicador quimérico usando diferentes promotores (CaMV35S; \Delta2.00; \Delta1.50; \Delta1.40; \Delta1.25; \Delta0.80; \Delta0.70; \Delta0.60; \Delta0.30) y utilizando el vector pBI101.3 solo como control, como se muestra en la Tabla 1. La actividad GUS se midió en pmoles de MU/\mug proteína/min y la actividad relativa mostrada es la actividad en raíces/actividad en tallos.
La Figura 6A es una micrografía que muestra la localización histoquímica de la actividad GUS en un corte transversal de la raíz de una planta de tabaco transformada con un gen indicador (GUS) dirigido por el promotor \Delta2.0.
La Figura 6B es una micrografía que muestra la localización histoquímica de la actividad GUS en la punta de una raíz de una planta de tabaco transformada con un gen indicador (GUS) dirigido por el promotor \Delta2.0.
Descripción detallada de la invención
Las secuencias de nucleótidos se presentan en este documento sólo como cadenas sencillas, en la dirección 5' a 3', de izquierda a derecha. Los nucleótidos se representan en este documento en la forma recomendada por la Comisión de Nomenclatura Bioquímica de la IUPAC-IUB.
Las plantas transgénicas que expresan péptidos que inhiben o matan una plaga o patógeno en particular proporcionan un procedimiento para reducir daños y pérdidas en la cosecha. Por ejemplo, la expresión de la proteína de Bacillus thuringiensis en maíz transgénico proporciona resistencia al barrenador europeo del maíz. Sin embargo, la expresión de transgenes en todos los tejidos de una planta (expresión constitutiva) es desventajosa ya que puede exponer a organismos no diana a la proteína transgénica y, además, aumentar la presión selectiva para el desarrollo de patógenos y plagas que son resistentes a la proteína transgénica. Los altos niveles de expresión del transgén en toda la planta también pueden afectar negativamente al crecimiento y rendimiento de la planta. Una estrategia alternativa es expresar un péptido tóxico sólo en el órgano o tejido afectado por una plaga o patógeno en particular. La implementación de esta estrategia contra plagas y patógenos que atacan a las raíces de la planta se ha visto entorpecida por la falta de promotores caracterizados específicos de la raíz.
La transcripción de un gen se inicia cuando se forma un complejo estable entre la enzima ARN polimerasa y un promotor génico. Los promotores se encuentran al inicio de todas las unidades de transcripción, tienen aproximadamente 100 pares de bases de longitud y se localizan inmediatamente antes del extremo 5' sitio de inicio de la transcripción. Véase, por ejemplo, Maniatis y col., Science 236:1238 (1987). Los promotores varían en cuanto a su "potencia", es decir, en su capacidad para iniciar la transcripción de forma segura y eficaz. Se piensa que la holoenzima ARN polimerasa abarca una región de aproximadamente 50 bases inmediatamente antes del extremo 5' de la región transcrita. En algunos casos la potencia de inicio de la transcripción puede incrementarse mediante proteínas auxiliares que se unen a sitios adyacentes a la región del promotor que está inmediatamente antes del extremo 5' del ADN transcrito. Véase, por ejemplo, Singer y Berg, Genes and Genomes, 140-145, University Science Books, Mill Valley, CA (1991).
Ejemplos específicos de promotores específicos de la corteza radicular de la presente invención son las moléculas de ADN que tienen una secuencia que se corresponde con una cualquiera de las mostradas en las SEQ ID NOs: 1-9, todas las cuales se discuten con más detalle a continuación. Será aparente que pueden prepararse otros fragmentos de secuencia de la región que flanquea el extremo 5' de RD2 de tabaco, más largos o más cortos que las secuencias mencionadas anteriores, o con menos adiciones, deleciones o sustituciones realizadas en ellas, que también lleven el promotor específico de la corteza radicular TobRD2, todos los cuales se incluyen dentro de la presente invención. Un aspecto adicional de la presente invención incluye los promotores aislados de otros genes del tabaco, o de otras plantas distintas al tabaco como se muestra más adelante, que son homólogos al promotor RD2 del tabaco y que son capaces de dirigir la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo situado después del extremo 3' en una célula vegetal.
Según se usa en este documento, un promotor TobRD2 se refiere a una molécula de ADN que tiene una secuencia idéntica, o sustancialmente homóloga, a un segmento continuo del ADN que se encuentra en el extremo 5' de la región transcrita del gen RD2 del tabaco. La SEQ ID NO: 1 dada en este documento proporciona la secuencia de la región de 2 kb que se encuentra inmediatamente 5' del inicio de la transcripción del gen RD2 del tabaco. Los promotores TobRD2 incluyen la región de al menos 100 pares de bases, la región de 150 pares de bases o, preferiblemente, la región de 200 pares de bases inmediatamente 5' de la región trascrita de TobRD2, y dirige la expresión específica de la corteza radicular.
Según se usa en este documento, las regiones que son "sustancialmente homólogas" son al menos el 75%, y más preferiblemente son el 80%, 85%, 90% o incluso el 95% homólogas.
Según se usa en este documento, un promotor específico de la corteza radicular es un promotor que dirige preferentemente la expresión de un gen asociado de forma operativa en el tejido de la corteza radicular, según la comparación con la expresión en el tejido de la hoja o del tallo, u otros tejidos de la raíz.
Las secuencias del promotor específico de la corteza radicular procedentes de otras plantas incluyen aquellas que son al menos aproximadamente el 75 por ciento homólogas (y más preferiblemente el 80%, 85%, 90% o incluso el 95% homólogas) al segmento de aproximadamente 100 bases del promotor RD2 de tabaco inmediatamente antes del extremo 5' de la región de ADN transcrita y que son capaces de dirigir la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN situado después del extremo 3' en una célula vegetal. Los promotores específicos de la corteza radicular de otras plantas incluyen aquellos que son al menos el 75 por ciento homólogos (y más preferiblemente el 80%, 85%, 90% o incluso el 95% homólogos) a las porciones continuas del promotor TobRD2 según se define en este documento por las SEQ ID NO: 1-9, y que son capaces de dirigir la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo situado después del extremo 3' en una célula vegetal.
Las condiciones de hibridación muy rigurosas que permitirán a las secuencias de ADN homólogas hibridar con una secuencia de ADN como las proporcionadas en este documento son bien conocidas en la técnica. Por ejemplo, la hibridación de estas secuencias con el ADN descrito en este documento puede realizarse en formamida al 25%, SSC X5, solución de Denhardt X5, con 100 \mug/ml de ADN de cadena sencilla y sulfato de dextrano al 5% a 42°C, con condiciones de lavado de formamida al 25%, SSC X5, SDS al 0,1% a 42°C durante 15 minutos, para permitir la hibridación de secuencias con aproximadamente el 60% de homología. Condiciones más rigurosas están representadas por una rigurosidad de lavado de NaCl 0,3 M, citrato sódico 0,03 M, SDS al 0,1% a 60°C o incluso a 70°C usando un ensayo de hibridación in situ convencional. (Véase Sambrook y col., Molecular Cloning. A Laboratory Manual (2ª edición 1989) (Cold Spring Harbor Laboratory)). En general, las secuencias de ADN de una planta que codifica promotores específicos de la corteza radicular y que hibridan con la secuencia de ADN que codifica los promotores específicos de corteza radicular RD2 de tabaco descritos en este documento serán al menos el 75%, 80%, 85%, 90%, o incluso el 95% homólogos o más con las secuencias de ADN que codifican los promotores RD2 de tabaco específicos de corteza radicular descritos en este documento.
Los promotores específicos de la corteza radicular de la presente invención son útiles para dirigir la expresión específica de tejido de transgenes en plantas transformadas. Esta expresión de transgenes específica de tejido es útil para proporcionar resistencia frente a daños causados por plagas y patógenos que atacan a las raíces de las plantas. Además, puesto que la corteza radicular es el principal órgano de absorción para el almacenamiento de fotosintato, mediante estos promotores puede dirigirse la expresión de transgenes diseñados para alterar los hidratos de carbono almacenados. Los genes exógenos de especial interés para la expresión específica de la corteza radicular incluyen aquellos que codifican las proteínas que se unen a metales pesados (tal como metalotioneína); proteínas que proporcionan resistencia a plagas y patógenos transmitidos por el suelo; proteínas que confieren resistencia al calor, a la sal (salinidad) y a la sequía; proteínas para la desalinización y proteínas que metabolizan los compuestos almacenados por la planta en formas o productos alternativos preferidos.
Los promotores específicos de tejido también pueden usarse también para convertir pro-pesticidas en formas activas en los sitios seleccionados del tejido. Hsu y col. Pestic. Sci., 44, 9 (1995) describieron el uso de un gen quimérico que comprendía el promotor específico de raíz, TobRB7 y el gen de la enzima \beta-glucuronidasa, para convertir preferiblemente un pro-pesticida en una forma activa en las raíces. El pro-pesticida inactivo (un glucurónido de hidroximetiloxamilo) se aplicaba al follaje y después era transportado a través del floema de la planta hasta las raíces, donde se convertía en una forma nematocida activa mediante la glucuronidasa.
Adicionalmente, los promotores específicos de la corteza radicular son útiles con fines histológicos para identificar o teñir tejido de la corteza radicular usando un gen indicador, tal como la \beta-glucuronidasa.
La expresión "asociado de forma operativa", como se usa en este documento, se refiere a secuencias de ADN contenidas en una única molécula de ADN con la que se asocia, de modo que la función de una se ve afectada por la otra. De este modo, un promotor se asocia de forma operativa con un gen cuando es capaz de afectar a la expresión de dicho gen (es decir, el gen está bajo el control transcripcional del promotor). El promotor se dice que está "antes del extremo 5'" del gen, que a su vez se dice que esta "después del extremo 3'" del promotor.
Las construcciones de ADN, o los "casetes de expresión", de la presente invención incluyen, 5'-3' en la dirección de la transcripción, un promotor de la presente invención, un segmento de ADN heterólogo asociado de forma operativa con el promotor y, opcionalmente, regiones de terminación de la transcripción y de la traducción, tales como una señal de terminación o una región de poliadenilación. Todas estas regiones reguladoras deben ser capaces de funcionar en la célula transformada. La región de terminación del extremo 3' puede proceder del mismo gen del que procede la región de inicio de la transcripción o de un gen diferente.
Las plantas pueden dividirse en aquellas que carecen de clorofila (tales como los hongos) y aquellas que contienen clorofila (tales como algas verdes, musgos); y adicionalmente se dividen en aquellas que contienen clorofila y tienen tejido vascular (tales como helechos, gimnospermas, coníferas, monocotiledóneas y dicotiledóneas). El úlitmo grupo de plantas incluye aquellas que pueden presentar raíces, tallos y hojas. Según se usa en este documento, el término "planta" abarca a todos aquellos organismos descritos anteriormente. Según se usa en este documento, la expresión "ADN natural vegetal" significa ADN aislado de plantas no alteradas genéticamente o sin transformar (por ejemplo, variedades de plantas que se producen mediante cultivo selectivo).
Según se usa en este documento, la expresión gen heterólogo o segmento de ADN heterólogo significa un gen (o segmento de ADN) que se usa para transformar una célula mediante técnicas de ingeniería genética y que no se puede dar de forma natural en la célula. Los genes estructurales son aquellas porciones de genes que comprenden un segmento de ADN que codifica una proteína, polipéptido o porción de ellos, que incluyen posiblemente un sitio de unión al ribosoma y/o un codón de inicio de la traducción, pero que carece de un promotor. El término también puede referirse a copias de un gen estructural que se encuentra de forma natural en la célula, pero introducido de forma artificial. Los genes estructurales pueden codificar una proteína que no se encuentra normalmente en la célula vegetal en la que se introduce el gen o en combinación con el promotor al cual está asociado de forma operativa. Los genes que pueden estar asociados de forma operativa con un promotor de la presente invención para su expresión en una especie vegetal pueden proceder de un gen cromosómico, ADNc, un gen sintético o combinaciones de ellos. Según se usa en este documento, la expresión segmento de ADN heterólogo también incluye segmentos de ADN que codifican productos no proteicos, tales como ribozimas o ARN complementarios. Los ARN complementarios son bien conocidos (véase, por ejemplo, la Patente de EE.UU. Nº 4.801.540 (Calgene, Inc.)).
Los genes de interés para su uso con la presente invención en plantas incluyen aquellos que afectan a una amplia variedad de propiedades fenotípicas o no fenotípicas. Entre las propiedades fenotípicas son proteínas, tales como enzimas, que proporciona resistencia a diversos tipos de estrés ambiental, que incluyen, pero sin limitaciones, el estrés causado por deshidratación (resultado del calor, salinidad o sequía), herbicidas, metales tóxicos, oligoelementos, plagas y patógenos. La resistencia puede deberse a un cambio en el sitio diana, al aumento de la cantidad de una proteína diana en la célula hospedadora, al aumento de las cantidades de una o más enzimas implicas en la ruta biosintética de un producto que protege al hospedador frente al estrés y similares. Los genes estructurales pueden obtenerse de procariotas o de eucariotas, de bacterias, hongos (por ejemplo, de levaduras, virus, plantas y mamíferos) o pueden sintetizarse en su totalidad o en parte. Ejemplos de genes incluyen el gen de resistencia a glifosfato, 3-enolpiruvil-fosfosiquimato sintetasa, nitrilasa, los genes de la ruta de biosíntesis de la prolina y glutamina y
metalotioneínas.
Los genes estructurales asociados de forma operativa con el promotor de la presente invención pueden ser aquellos que codifican una proteína tóxica para insectos, tal como la proteína cristal de Bacillus thuringiensis tóxica para insectos. En la Patente de EE.UU. Nº 4.853.331 se describe una secuencia de ADN que codifica una toxina de B. thuringiensis tóxica para Coleoptera y variaciones de esta secuencia en las que se retiene la codificación de toxicidad (véase también las Patentes de EE.UU. N^{os} 4.918.006 y 4.910.136) (las descripciones de todas las referencias de Patentes de EE.UU. citadas en este documento se incorporan en él en su totalidad por referencia). En la Solicitud PCT WO 90/02804 se describe una secuencia génica de B. thuringiensis que hace a una especie de planta tóxica para Lepidoptera. La Solicitud PCT WO 89/04868 describe plantas transgénicas transformadas con un vector que promueve la expresión de una proteína cristal de B. thuringiensis, cuya secuencia puede emplearse en conexión con la presente invención. La Solicitud PCT WO 90/06999 describe el ADN que codifica una toxina proteína cristal de B. thuringiensis activa frente a Lepidoptera. Otra secuencia génica que codifica una proteína cristal insecticida se describe en la Patente de EE.UU. Nº 4.918.006. Ejemplos de secuencias génicas que codifican otras toxinas para insectos son secuencias génicas que codifican una quitinasa (por ejemplo, EC3.2.1.14), como se describe en la Patente de EE.UU. Nº 4.940.840 y en la Solicitud PCT Nº WO 90/07001. Un gen que codifica una proteína de poro inducible por nematodo útil para producir plantas transgénicas resistentes a nematodos de raíz se describe en la solicitud de Patente de EE.UU. Nº 08/007.998. Las cepas de B. thuringiensis que produce toxinas polipeptídicas activas frente a nematodos se describen en las Patentes de EE.UU. N^{os} 4.948.734 y 5.093.120 (Edwards y col.).
Cuando el producto de expresión del gen se tiene que localizar en un compartimento celular que no sea el citoplasma, el gen estructural puede construirse de modo que incluya regiones que codifiquen secuencias particulares de aminoácidos que tienen como resultado la translocación del producto a un sitio en particular, tal como la membrana plasmática celular, o su secreción en el espacio periplásmico o en el entorno externo de la célula. En la bibliografía se describen diversas secuencias líderes secretoras de integración en membrana y secuencias de translocación para dirigir el producto de expresión peptídico a un sitio en particular. Véase, por ejemplo, Cashmore y col., Biotechnology (1985) 3:803-808, Wickner y Lodish, Science (1985) 230:400-407.
Se puede proporcionar el casete de expresión como una construcción de ADN que también tiene al menos un sistema de replicación. Por comodidad, es frecuente tener un sistema de replicación funcional en Escherichia coli, tal como ColE1, pSC101, pACY184 o similares. De esta manera, en cada estadio después de cada manipulación, la construcción resultante se puede clonar, secuenciar y determinar si la manipulación ha sido correcta. Además, o en lugar del sistema de replicación de E. coli, puede emplearse una amplia gama de sistemas de replicación de hospedadores, tal como los sistemas de replicación de plásmidos con incompatibilidad P-1, por ejemplo, pRK290. Además del sistema de replicación, puede estar presente al menos un marcador, que puede ser útil en uno o más hospedadores, o diferentes marcadores para hospedadores individuales. Es decir, puede emplearse un marcador para la selección en un hospedador procariota mientras que puede emplearse otro marcador para la selección en un hospedador eucariota, especialmente el hospedador vegetal. Los marcadores pueden proporcionar protección frente a un biocida, tal como antibióticos, toxinas, metales pesados o similares; puede proporcionar complementación transmitiendo fototrofia a un hospedador autotrófico; o puede proporcionar un fenotipo visible a través de la producción de un nuevo compuesto en la planta. Ejemplos de genes que pueden emplearse incluyen la neomicina fosfotransferasa (NPTII), la higromicina fosfotransferasa (HPT), la cloranfenicol acetil transferasa (CAT), nitralasa y el gen de resistencia a gentamicina. Para la selección de hospedadores vegetales, ejemplos no limitantes de marcadores adecuados son la beta-glucuronidasa (GUS) (que proporciona la producción de una coloración azul índigo), luciferasa (que proporciona la producción de luz visible), NPTII (que proporciona resistencia a kanamicina o resistencia a G418), HPT (que proporciona resistencia a higromicina) y el gen aroA mutado (que proporciona resistencia a
glifosato).
Los diversos fragmentos que comprenden las diversas construcciones, casetes de expresión, marcadores y similares pueden introducirse consecutivamente mediante escisión con enzimas de restricción de un sistema de replicación apropiado e inserción de la construcción o fragmento en particular en el sitio disponible. Después del ligamiento y clonación, la construcción del ADN puede aislarse para una manipulación adicional. Todas estas técnicas se ilustran ampliamente en la bibliografía. Véase, por ejemplo, Maniatis y col., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y. (1982).
Un vector es una construcción de ADN que se puede replicar. Los vectores que pueden usarse para transformar tejidos vegetales con construcciones de ADN de la presente invención, incluyen tanto vectores de Agrobacterium y vectores balísticos, así como vectores adecuados para la transformación mediada por ADN. Las células de Agrobacterium tumefaciens que contienen una construcción de ADN de la presente invención, en las que la construcción de ADN comprende un plásmido Ti, son útiles en procedimientos para producir plantas transformadas. Las células vegetales se infectan con Agrobacterium tumefaciens para producir una célula vegetal transformada y, a continuación, se regenera una planta a partir de la célula vegetal transformada.
Se conocen numerosos sistemas de vectores de Agrobacterium útiles para realizar la presente invención. Por ejemplo, la Patente de EE.UU. Nº 4.459.355 describe un procedimiento para transformar plantas susceptibles, incluyendo dicotiledóneas, con una cepa de Agrobacterium que contiene el plásmido Ti. La transformación de plantas leñosas con un vector de Agrobacterium se describe en la Patente de EE.UU. Nº 4.795.855. Además, la Patente de EE.UU. Nº 4.940.838 de Schilperoort y col. describe un vector binario de Agrobacterium (es decir, uno en el que el Agrobacterium contiene un plásmido que tiene la región vir de un plásmido Ti, pero no la región T-ADN, y un segundo plásmido que tiene la región T-ADN, pero no la región vir) útil para realizar la presente invención.
Las micropartículas que llevan una construcción de ADN de la presente invención, cuya micropartícula es adecuada para la transformación balística de una célula vegetal, también son útiles para producir plantas transformadas de la presente invención. La micropartícula es introducida en una célula vegetal para producir una célula vegetal transformada y a partir de la célula vegetal transformada se regenera una planta. Puede usarse cualquier metodología de transformación balística de células adecuada para poner en práctica la presente invención. En la Patente de EE.UU. Nº 4.945.050 de Sanford y Wolf se describen ejemplos de aparatos y procedimientos y en la publicación de la Solicitud de Patente de Agracetus Nº 0.270.356, titulada "Pollen-mediated Plant Transformation". Cuando se usen procedimientos de transformación balística, el casete de expresión puede incorporarse en un plásmido capaz de replicarse en la célula que se va a transformar. Ejemplos de micropartículas adecuadas para el uso en estos sistemas incluyen esferas de oro de 1 a 5 \mum. La construcción de ADN puede depositarse sobre la micropartícula mediante cualquier técnica adecuada, tal como mediante precipitación.
Una célula hospedadora transformada es una célula que se ha transformado o trransfectado con construcciones que contienen una secuencia de ADN, como se describe en este documento, usando técnicas de ADN recombinante. Las especies de plantas pueden transformarse con la construcción de ADN de la presente invención mediante la transformación mediada por ADN de protoplastos de células vegetales y la posterior regeneración de la planta a partir de los protoplastos transformados de acuerdo con procedimientos bien conocidos en la técnica.
Las secuencias de promotor descritas en este documento pueden expresarse para expresar una secuencia de ADN heterólogo en cualquier especie de planta capaz de utilizar el promotor (es decir, cualquier especie de planta cuya ARN polimerasa se una a las secuencias de promotor descritas en este documento). Ejemplos de especies de plantas adecuadas para la transformación con las construcciones de ADN de la presente invención incluyen tanto monocotiledóneas como dicotiledóneas e incluyen, pero sin limitaciones, tabaco, soja, patata, algodón, remolacha azucarera, girasol, zanahoria, apio, lino, col y otras plantas crucíferas, pimiento, tomate, cítricos, judía, fresa, lechuga, maíz, alfalfa, avena, trigo, arroz, cebada, sorgo y colza. De este modo, una categoría ilustrativa de plantas que pueden transformarse con las construcciones de ADN de la presente invención son las dicotiledóneas, y una categoría más particular de plantas que pueden transformarse usando las construcciones de ADN de la presente invención son los miembros de la familia Solanaceae.
Cualquier tejido vegetal capaz de la posterior propagación clonal, mediante organogénesis o embriogénesis, puede transformarse con un vector de la presente invención. El término "organogénesis", como se usa en este documento, significa un proceso por el cual se desarrollan secuencialmente brotes y raíces a partir de centros meristemáticos; el término "embriogénesis", como se usa en este documento, significa un proceso por el cual los brotes y raíces se desarrollan juntos de forma concertada (no secuencialmente), a partir de células somáticas o de gametos. El tejido en particular elegido variará dependiendo de los sistemas de propagación clonal disponibles, y más adecuados, para la especie en particular que se va a transformar. Ejemplos de dianas tisulares incluyen discos foliares, polen, embriones, cotiledones, hipocótilos, megagametofitos, tejido de callo, tejido meristemático existente (por ejemplo, meristemos apicales, yemas axilares y meristemos radiculares) y tejido de meristemo inducido (por ejemplo, meristemo de cotiledón y meristemo del hipocotilo).
Los Ejemplos que siguen se proporcionan para ilustrar diversas realizaciones específicas de la presente invención y no se deben interpretar como una limitación de la invención.
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Ejemplo 1
Aislamiento de genes RD2 específicos del genoma de la corteza radicular
Se construyó una biblioteca genómica de tabaco (Nicotiana tabacum) de ADN aislado de plántulas de tabaco en el vector EMBL 3 SP6/T7 lambda (ClonTech, Palo Alto, CA). Se usó el ADNc de TobRD2 (Conkling y col., Plant Phys. 93, 1203 (1990)) como sonda para aislar clones genómica que contenían los genes RD2 del tabaco a partir de la biblioteca primaria. Se analizaron un total de 1,2 x 10^{7} fagos recombinantes en células bacterianas K802. Las placas se transfirieron a membranas de nailon (Magnagraph) y el ADN se inmovilizó mediante autoclavado (10 minutos, ciclo de gravedad). Todas las hibridaciones se realizaron a 65°C en solución acuosa (SSCx5 [cloruro sódico 750 mM, citrato sódico 75 mM], solución de DenhardtX5 [Ficoll, BSA, polivinilpirrolidona al 0,1% cada uno], SDS al 0,5%, 100 mg/ml de ADN de esperma de salmón desnaturalizado) durante 16 horas. Los filtros se lavaron en SSCX0,2 y SDS al 0,1% a 60°C.
Se identificaron trece clones genómicos que hibridaban con la sonda del ADNc de TobRD2 a partir de la selección de los 1,2 x 10^{7} fagos recombinantes. Estos clones se aislaron y caracterizaron posteriormente mediante mapeo de restricción. Se construyeron mapas mediante el procedimiento de mapeo rápido de Rachwitz y col., Gene, 30:195 (1984). Un clon, homólogo del ADNc de TobRD2 se secuenció en su totalidad y se identificó su promotor. Alineando el ADNc de TobRD2 y el clon genómico, se identificó la región del extremo 5' de la región traducida del clon genómico. Se examinó la secuencia de esta región sin traducir y se identificó la caja TATAA del probable promotor. En los promotores vegetales, la caja TATAA típicamente esta en los nucleótidos -35 a -29 del punto de inicio de la transcripción. Usando experimentos de extensión del cebador, se identificó el extremo 5' de
transcripción.
En la Figura 2 (SEQ ID NO: 1) se proporciona una región de 2.010 pares de bases antes del extremo 5' de la región transcrita del ADNc de TobRD2. Esta secuencia incluye la región predicha de inicio de la transcripción (en el nucleótido 2.000) y la caja TATAA del promotor (nucleótidos 1.971-1.975).
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Ejemplo 2
Secuenciación del ácido nucleico
Los fragmentos de restricción de los clones genómicos aislados (Ejemplo 1) se subclonaron en vectores bluescript (pBS KS II+ o pBS SKII+; Stratagene, La Jolla, CA). Se obtuvieron de cada clon y de ambas cadenas de ADN series de deleción unidireccional mediante digestión con exonucleasa III y nucleasa S1 (Henikoff, Gene 28, 351 (1984). La secuencia de ADN se determinó por el procedimiento didesoxi de terminación de cadena (Sanger y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74, 5463 (1977)) usando la enzima Sequenase (U.S. Biochemicals, Cleveland, OH). En todos los casos, se secuenciaron ambas cadenas de ADN.
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Ejemplo 3
Hibridaciones in situ
Para determinar la distribución especial de las transcripciones del ARNm de TobRD2 en los diversos tejidos de la raíz, se realizaron hibridaciones in situ en plantas no transformadas. Las hibridaciones in situ de la cadena complementaria de TobRD2 con el ARNm de TobRD2 en el tejido de la raíz se realizaron usando técnicas como las descritas en Meyerowitz, Plant Mol. Biol. Rep. 5, 242 (1987) y Smith y col., Plant Mol. Biol. Rep. 5, 237 (1987). Raíces de plántulas de tabaco (Nicotiana tabacum) de siete días se fijaron en glutaraldehído tamponado con fosfato, se incluyeron en Paraplast Plus (Monoject Inc. St. Louis, MO) y se hicieron cortes de 8 mm para obtener secciones transversales así como longitudinales. Se usaron como sondas las transcripciones de TobRD2 complementarias, sintetizadas in vitro en presencia de ^{35}S-ATP. El ARN marcado se hidrolizó mediante tratamiento alcalino para producir longitudes de 100 a 200 bases antes del uso.
Las hibridaciones se realizaron en formamida al 50% durante 16 horas a 42°C, con ARN marcado con aproximadamente 5 x 10^{6} cuentas por minutos (cpm) por mililitros de solución de hibridación. Tras la exposición, las preparaciones se desarrollaron y visualizaron en un microscopio de campo claro y oscuro.
Como se muestra en las Figuras 1A y 1B, la señal de hibridación se localiza en la capa cortical de las células de las raíces. La comparación de ambas imágenes en campo claro y oscuro de los mismos cortes localizaban las transcripciones de TobRD2 en las células parenquimatosas de la corteza radicular. No había señales de hibridación visibles en la epidermis ni en el cilindro vascular.
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Ejemplo 4
Construcción del gen quimérico
Se construyó una serie de deleciones del promotor mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Los moldes fueron las diversas deleciones de las regiones flanqueantes 5' del clon genómico de TobRD2 que se habían generado mediante digestiones con exonucleasa III/nucleasa S1 (Ejemplo 2).
Todos los moldes se amplificaron usando el mismo conjunto de cebadores oligonucleotídicos. Un cebador era un cebador sentido del bacteriófago M13 modificado (véase, por ejemplo, Sanger y col. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74, 5463 (1977)); el extremo 5' del oligonucleótido contenía la secuencia de reconocimiento de HindIII, junto con una secuencia 5' adicional que permite una escisión más eficaz por la enzima de restricción. El otro cebador se diseñó para que tuviera un sitio BamHI (junto con nucleótidos adicionales para una escisión eficaz) en su extremo 5' y era homólogo a la secuencia de 16 nucleótidos de la TobRD2 que se encuentra a 22 bases del extremo 5' del codón de inicio ATG (es decir, el cebador era homólogo a las bases 1.973-1.988 de la SEQ ID NO: 1).
La reacción de amplificación por PCR contenía el ADN plasmídico molde (5-10 ng); tampón de reacción (KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM, pH 9,0 [a 25°C], Triton X-100 0,1%, MgCl 1,5 mM); dATP, dGTP, dTTP y dCTP, 0,25 mM cada uno; 40 ng de cada cebador; 1,25 unidades de la Taq ADN polimerasa (Promega, Madison, WS).
El ciclo de PCR desnaturalizaba los moldes a 94°C durante 1 minuto, hibridaba los cebadores a 46°C durante 1 minuto y permitía que la elongación de la cadena se produjera a 72°C durante 5 minutos. Este ciclo se repitió 40 veces y el último ciclo de elongación se prolongó durante 10 minutos. Las amplificaciones por PCR se realizaron en un termociclador programable (PTC-100, M.J. Research).
Los productos amplificados se digirieron con HindIII y BamHI, y se clonaron en los sitios HindII y BamHI del vector binario de Agrobacterium pBI 101.3 (R. Jefferson y col., EMBO J. 6, 3901-3907 (1987)). Este vector contiene un gen indicador \beta-glucuronidasa (GUS) y un marcador susceptible de ser seleccionado nptII flanqueado por las secuencias límites del T-ADN.
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Ejemplo 5
Transformación de la planta: Procedimientos
Las construcciones del gen indicador quimérico se introdujeron en un hospedador de Agrobacterium portador de un plásmido Ti desarmado (LBA4404) capaz de proporcionar (en posición trans) las funciones vir requeridas para la transferencia de T-ADN y la integración en el genoma de la planta, esencialmente como describen An y col., en S. Belvin y R. Schilperoot, editores., Plant Molecular Bioloqy Manual, Martinus Nijhoff, Dordrecht, Holanda, pág. A3-1-19 (1988). Las construcciones se introdujeron en el hospedador a través del apareamiento triparental o electroporación de células de Agrobacterium electrocompetentes, que son conocidas por los expertos en la materia. Los discos de transformación de las hojas de tabaco (SR1) y la regeneración de la planta se realizaron como se describe en An y col. Plant. Physiol. 81, 301-305 (1986). Se seleccionaron plantas resistentes a la kanamicina para un análisis
adicional.
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Ejemplo 6
Ensayos de GUS en plantas transgénicas: Procedimientos
La tinción histoquímica se realizó en raíces, tallos y hojas escindidas de plantas transformadas. Los tejidos de explante se incubaron en 5-bromo-4-cloro-3-indolil-B-D-glucuronido (X-Gluc) 1 mM, tampón fosfato sódico (pH 7,0) 25 mM, DMSO al 0,5% a 37°C durante una noche después de una breve infiltración al vacío del sustrato. Los tejidos que expresan la actividad GUS escinden este sustrato y, por tanto, se tiñen de azul.
Los ensayos fluorimétricos de GUS se realizaron como describen Jefferson y col., EMBO J. 6, 3901-3907 (1987) para cuantificar el nivel de expresión de GUS. Los extractos celulares de las raíces, hojas y tallos se incubaron en presencia de 4-metilumbeliferil-B-D-glucuronido (MUG) 1 mM a 37°C. Las muestras se tomaron a intervalos de 0, 5, 10, 15 y 20 minutos. La reacción enzimática se detuvo mediante la adición de carbonato sódico 0,2 M. El fluorímetro se calibró con MUG 10 nM y 100 nM. La concentración de proteína en la muestras se determinó según el procedimiento de Bradford, Anal. Biochem. 72, 248 (1976).
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Ejemplo 7
La construcción génica quimérica es capaz de dirigir la expresión génica específico de tejido
Para determinar si la secuencia de 2.010 pares de bases del gen TobRD2 (SEQ ID NO: 1) abarcaba elementos promotores que dirijan la expresión específicamente en las células parenquimatosas de la corteza radicular, se construyeron genes quiméricos Se amplificó, mediante la reacción en cadena de la polimerasa, una región de 1.988 pares de bases (SEQ ID NO: 2) y se clonó el extremo 5' del gen indicador GUS (como se describe anteriormente). El gen quimérico se introdujo en el tabaco (como se describe anteriormente) y se analizó la capacidad de las plantas transgénicas para expresar GUS (como se describe anteriormente).
Los resultados del análisis de 9 transformantes individuales (es decir, cada transformante era el producto de un suceso de transformación independiente) se muestran en la Tabla 1, líneas 25-33 (transformantes 325II1 - 325IV5). Se encontró que el promotor \Delta2.0 (SEQ ID NO: 2) dirigía la expresión génica a niveles elevados (aproximadamente 4 veces superior a los del promotor CaMV35S, normalmente calificado como promotor "potente") (Figura 4). La expresión del indicador no podía detectarse en hojas o en tallos a niveles mayores que el control (véanse las Figura 4, 5A y 5B, que muestran las actividades medias tomadas de la Tabla 1). La actividad GUS se limitaba básicamente a la raíz y, como se muestra en la Figura 6, estaba específicamente limitada a la corteza radicular. La planta mostrada en la Figura 6 se transformó usando GUS dirigido por el promotor \Delta2.0, en pBI101.3.
Los múltiples discos foliares transformados individuales se colocaron en placas de Petri. La nomenclatura de los transformantes de la Tabla 1 indica el promotor/la placa de petri numerada/ y el número del transformante independiente. De este modo, 325II1 se refiere a un transformante que usa el promotor \Delta2.0, en la placa de Petri II y del disco foliar 1; mientras que 101.I1 se refiere a una transformación que usa pBI101.3 (GUS sin promotor usado como control) y para el transformante número 1 en la placa de Petri I. En la Tabla 1, el prefijo 121 se refiere al uso de pBI121 (promotor CaMV35S con GUS); 325 se refiere al promotor \Delta2.0 (SEQ ID NO: 2) con GUS; 484 se refiere al promotor \Delta1.4 (SEQ ID NO: 3) con GUS; 421 se refiere al promotor \Delta1.3 (SEQ ID NO: 4) con GUS; 428 se refiere al promotor \Delta1.0 (SEQ ID NO: 5) con GUS; 490 se refiere al promotor \Delta0.7 (SEQ ID NO: 6) con GUS; 491 se refiere al promotor \Delta0.6 (SEQ ID NO: 7) con GUS; 492 se refiere al promotor \Delta0.5 (SEQ ID NO: 8) con GUS; 495 se refiere al promotor \Delta0.2 (SEQ ID NO: 9) con GUS. "R-GUS" se refiere a la actividad GUS en tejidos de la raíz; "L-GUS" se refiere a la actividad GUS en los tejidos de la hoja y "S-GUS" se refiere a la actividad GUS en los tejidos del tallo. R/L proporciona la actividad GUS relativa en raíces/hojas; R/S proporciona la actividad GUS relativa en raíces/tallos. La actividad GUS se proporciona en pmoles de MU/\mug de proteína/min.
1
2
3
4
5
6
7
Ejemplo 8 Efecto de las deleciones del promotor 5' en la expresión de la actividad del gen indicador
Los siguientes experimentos se realizaron esencialmente de la misma forma que se describe en el Ejemplo 7, anterior, excepto porque la longitud de la región flanqueante de TobRD2 empleado como promotor se variaba para explorar cómo afectaban las diversas porciones de la región flaqueante a la expresión de GUS.
Se generaron una serie de siete mutaciones anidadas de deleción de 5' en la región antes del extremo 5' de la secuencia de 2.010 pares de bases de TobRD2 (SEQ ID NO: 1) para su uso como secuencias promotoras. Estos mutantes de deleción se muestran gráficamente en la Figura 3 y se denominan como \Delta2.0 (SEQ ID NO: 2); \Delta1.4 (SEQ ID NO: 3); \Delta1.3 (SEQ ID NO: 4); \Delta1.0 (SEQ ID NO: 5); \Delta0.7 (SEQ ID NO: 6); \Delta0.6 (SEQ ID NO: 7); \Delta0.5 (SEQ ID NO: 8) y \Delta0.2 (SEQ ID NO: 9).
Las construcciones de genes quiméricos según se describen en el Ejemplo 3 y que contenían el promotor \Delta2.00 (SEQ ID NO: 2) o un promotor truncado (SEQ ID NOs: 3-9) se introdujeron en tabaco mediante una transformación mediada por Agrobacterium de discos foliares (como se describe en el Ejemplo 4). El vector pBI101.3 de Agrobacterium se uso solo como control y el promotor CaMV35S se usó para proporcionar un patrón de referencia. Se ensayó la actividad GUS en las raíces, hojas y tallos de plantas regeneradas (Tabla 1; Fig. 4).
La Figura 4 proporciona una representación gráfica de la actividad GUS en raíces, hojas y tallos usando el promotor TobRD2 de longitud completa, las series de deleción del promotor, el promotor del virus del mosaico de la coliflor (CaMV35S) y el vector pBI101.3 como control. Como se muestra en la Figura 4, se encontró que seis de los promotores ensayados conferían niveles elevados de expresión específica de la corteza radicular: \Delta2.00 (SEQ ID NO: 2); \Delta1.4 (SEQ ID NO: 3); \Delta1.3 (SEQ ID NO: 4); \Delta1.0 (SEQ ID NO: 5); \Delta0.7 (SEQ ID NO: 6); \Delta0.6 (SEQ ID NO: 7). La Figura 4 muestra los datos promedio de la Tabla 1.
Como se muestra adicionalmente en la Figura 4, la pérdida de una región de aproximadamente 50 pares de bases de longitud (en comparación con \Delta0.6 (SEQ ID NO: 7) y \Delta0.5 (SEQ ID NO: 8)) disminuye dramáticamente el nivel de expresión de GUS. Sin embargo, los resultados muestran que el nivel de expresión de GUS en los tejidos de la raíz proporcionada por el promotor \Delta0.5 (SEQ ID NO: 8) era equivalente a la producida por el promotor CaMV35S. La expresión GUS en la corteza radicular proporcionada por el promotor \Delta0.2 (SEQ ID NO: 9) era aproximadamente la mitad de la proporcionada por el promotor CaMV35S.
Las Figura 5A y 5B además ilustra la naturaleza específica de órgano de la expresión del gen indicador usando los promotores TobRD2. En todos los casos analizados, la actividad GUS se expresaba estrictamente en las raíces y se detectada una actividad insignificante, si es que se daba alguna, en los tallos o en las hojas de las mismas plantas de tabaco transformadas. Mientras que el nivel de actividad GUS medida en las raíces transformadas con los promotores \Delta0.60 y \Delta0.30 era equivalente o menor al proporcionado por el promotor CaMV35S (Figura 4), las Figuras 5A y 5B ilustran que la expresión dirigida por los promotores \Delta0.60 y \Delta0.30 era específica de raíz, con una actividad insignificante en tallos y hojas, a diferencia de la expresión dirigida por el promotor CaMV35S.
Los Ejemplos precedentes ilustran la presente invención y no deberán interpretarse como limitantes de la misma.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
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(i)
SOLICITANTE: Conkling, Mark A.
\hskip3,9cm Mendu, Nandini
\hskip3,9cm Song, Wen
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(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Promotor de gen específico de la corteza radicular
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(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 9
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(iv)
DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: Kenneth D. Sibley; Bell. Seltzer, Park y Gibson
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Post Office Drawer 34009
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(C)
CIUDAD: Charlotte
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(D)
ESTADO: Carolina del Norte
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(E)
PAÍS: EE.UU.
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM compatible con PC
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
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(D)
SOFTWARE: Patent In Release Nº 1.0. Versión Nº 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN SOBRE EL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Sibley, Kenneth D.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 31.665
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 5051-294
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: 919-420-2200
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: 919-881-3175
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2.010 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
8
9
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1.988 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
10
11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1.372 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
12
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1.294 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
13
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1.030 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
14
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 722 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 574 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 523 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 220 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CATENARIEDAD: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
18

Claims (29)

1. Una molécula de ADN aislada que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal, teniendo dicho ADN aislado una secuencia seleccionada entre el grupo constituido por:
(a) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 y SEQ ID NO: 9 proporcionadas en este documento, y
(b) secuencias de ADN que hibridan con el ADN aislado que tiene una secuencia del apartado (a) anterior, en condiciones representadas por un lavado riguroso de NaCl 0,3 M, citrato sódico 0,03 M, SDS al 0,1% a 60°C y que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal.
2. Una construcción de ADN que comprende un casete de expresión, comprendiendo dicha construcción, en la dirección 5' a 3', un promotor específico de la corteza radicular y un segmento de ADN heterólogo colocado después del extremo 3' de dicho promotor y asociado de forma operativa con éste, en la que dicho promotor específico de la corteza radicular tiene una secuencia seleccionada entre el grupo constituido por:
(a) SEQ ID NO:1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 y SEQ ID NO: 9 proporcionadas en este documento y
(b) secuencias de ADN que hibridan con el ADN aislado que tiene una secuencia del apartado (a) anterior, en condiciones representadas por un lavado riguroso de NaCl 0,3 M, citrato sódico 0,03 M, SDS al 0,1% a 60°C y que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal.
3. Una construcción de ADN según la reivindicación 2, en la que dicha construcción además comprende un plásmido.
4. Una construcción de ADN según la reivindicación 2, en la que dicho segmento de ADN heterólogo es un gen que codifica una proteína insecticida.
5. Una construcción de ADN según la reivindicación 3, en la que dicho segmento de ADN heterólogo es un gen que codifica una proteína cristal de Bacillus thuringiensis tóxica para insectos.
6. Una célula vegetal que contiene una construcción de ADN según la reivindicación 2.
7. Un procedimiento para producir una planta transformada que comprende la regeneración de una planta a partir de una célula vegetal según la reivindicación 6.
8. Una célula de Agrobacterium tumefaciens que contiene una construcción de ADN según la reivindicación 2, y en la que dicha construcción de ADN además comprende un plásmido Ti.
9. Un procedimiento para producir una planta transformada que comprende infectar a una célula vegetal con Agrobacterium tumefaciens según la reivindicación 8 para producir una célula vegetal transformada y regenerar, a continuación, una planta a partir de dicha célula vegetal transformada.
10. Una micropartícula portadora de una construcción de ADN según la reivindicación 2, en la que dicha micropartícula es adecuada para la transformación balística de una célula vegetal.
11. Un procedimiento para producir una planta transformada, que comprende introducir una micropartícula según la reivindicación 10 en una célula vegetal para producir una célula vegetal transformada y regenerar, a continuación, una planta a partir de dicha célula vegetal transformada.
12. Un protoplasto de una célula vegetal que comprende una construcción de ADN según la reivindicación 2.
13. Un procedimiento para producir una planta transformada, que comprende regenerar una planta a partir de un protoplasto de una célula vegetal según la reivindicación 12.
14. Una planta transformada que comprende células vegetales transformadas, conteniendo dichas células vegetales transformadas una construcción de ADN heterólogo, cuya construcción comprende en dirección 5' a 3', un promotor específico de la corteza radicular y un segmento de ADN heterólogo colocado después del extremo 3' de dicho promotor y asociado de forma operativa con éste, dirigiendo dicho promotor la transcripción específica de la corteza radicular de dicho segmento de ADN heterólogo, en la que dicho promotor tiene una secuencia seleccionada entre el grupo constituido por:
(a) SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 y SEQ ID NO: 9, proporcionadas en este documento, y
(b) secuencias de ADN que hibridan con ADN aislado que tiene una de las secuencias del apartado (a) anterior, en condiciones representadas por un lavado rigurosos de NaCl 0,3 M, citrato sódico 0,03 M, SDS al 0,1% a 60°C y que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal.
15. Una planta transformada según la reivindicación 14, siendo dicha planta una dicotiledónea.
16. Una planta transformada según la reivindicación 14, siendo dicha planta una monocotiledónea.
17. Una planta transformada según la reivindicación 14, siendo dicha planta una planta de tabaco (Nicotiana tabacum).
18. Una molécula de ADN aislada compuesta esencialmente de un promotor que dirige la transcripción específica de la corteza radicular de un segmento de ADN heterólogo después del extremo 3' en una célula vegetal y que tiene una secuencia seleccionada entre el grupo constituido por las SEQ ID NOs: 1-9 proporcionadas en este documento.
19. Una construcción de ADN que comprenden un casete de expresión en dirección 5' a 3', un promotor según la reivindicación 18 y un segmento de ADN heterólogo colocado después del extremo 3' de dicho promotor y asociado de forma operativa con éste.
20. Una planta transformada que comprende células vegetales transformadas, conteniendo dichas células vegetales transformadas una construcción de ADN según la reivindicación 19.
21. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 1.
22. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 2.
23. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 3.
24. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 4.
25. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 5.
26. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 6.
27. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 7.
28. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 8.
29. Una molécula de ADN aislada que comprende la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 9.
ES96925447T 1995-07-28 1996-07-24 Promotor de un gen especifico de la corteza radicular. Expired - Lifetime ES2279524T3 (es)

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