ES2229327T3 - Promotor procedente del tabaco. - Google Patents
Promotor procedente del tabaco.Info
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A UN MARCAJE DE ADN-T CON UN GEN DE BE -GLUCURONIDASA (GUS) SIN PROMOTOR QUE PRODUCE UNA PLANTA TRANSGENICA DE NICOTIANA TABACUM QUE EXPRESA CONSTITUTIVAMENTE LA ACTIVIDAD GUS. LA FUSION GENETICA HA SIDO CLONADA Y SECUENCIADA. DICHO GEN DE BE -GLUCORONIDASA HA SIDO REINSERTADO EN DICHA PLANTA DE N.TABACUM POR TRANSFORMACION MEDIADA DE AGROBACTERIUM. EL ADN DE N.TABACUM, SITUADO AGUAS ARRIBA DE DICHO GEN GUS, TIENE APROX. 2 KB DE LONGITUD Y NO PRESENTA HOMOLOGIA CON SECUENCIAS CONOCIDAS. DICHO ADN, EL CUAL CONTIENE UN PROMOTOR CONSTITUTIVO, ES UTIL PARA CONTROLAR LA EXPRESION DE GENES EXOGENOS EN PLANTAS TRANSGENICAS DE DIFERENTES ESPECIES DE PLANTAS.
Description
Promotor procedente del tabaco.
La presente invención se refiere a un promotor
identificado de Nicotiana tabacum (tabaco). Esta invención se
refiere además al uso de dicho promotor para controlar la expresión
de ADN exógenos de interés en plantas transgénicas de diversas
especies de plantas.
Las bacterias del género Agrobacterium
tienen la capacidad de transferir segmentos específicos de ADN
(ADN-T) a células de plantas, donde se integran
establemente en los cromosomas nucleares. Los análisis de plantas
que albergan el ADN-T han revelado que este elemento
genético puede integrarse en numerosas localizaciones, y puede
encontrarse ocasionalmente en genes. Una estrategia que se ha
explotado para identificar eventos de integración es transformar
células de plantas con vectores de ADN-T diseñados
especialmente que contienen un gen informador desprovisto de señales
de expresión transcripcional y traduccional de actuación en cis
(concretamente sin promotores) localizado al final del
ADN-T. Tras la integración, se yuxtapondrá el codón
de iniciación del gen sin promotor (gen informador) con las
secuencias de la planta. La consecuencia de la inserción de
ADN-T adyacente a y cadena abajo de elementos
promotores génicos puede ser la activación de la expresión del gen
informador. Los genes híbridos resultantes, designados como fusiones
génicas mediadas por ADN-T, consisten en promotores
de plantas desconocidos y por tanto no caracterizados que residen en
su localización natural en el cromosoma, y la secuencia de
codificación de un gen marcador localizado en el
ADN-T (Fobert et al., 1991, Plant Mol.
Biol.. 17,
837-851).
837-851).
Se ha supuesto generalmente que la activación de
genes marcadores sin promotor o sin potenciador es el resultado de
las inserciones de ADN-T en o inmediatamente
adyacente a genes. El reciente aislamiento de diversos mutantes
insercionales de ADN-T (Koncz et al., 1992,
Plant Mol. Biol. 20, 963-976; revisado
en Feldmann, 1991, Plant. J. 1,
71-82; Van Lijsebettens et al., 1991,
Plant Sci. 80, 27-37; Walden et
al., 1991, Plant J. 1: 281-288;
Yanofsky et al., 1990, Nature 346,
35-39) muestra que ese el caso para al menos algunas
inserciones. Sin embargo, existen otras posibilidades. Una de estas
posibilidades es que la integración del ADN-T active
secuencias reguladoras silenciosas que no están asociadas a genes.
Lindsey et al., (1993, Transgenic Res. 2,
33-47) designaban estas secuencias como
"pseudopromotores" y sugerían que pueden ser responsables de la
activación de genes marcadores en algunas líneas transgénicas.
Fobert et al. (1994, Plant. J. 6,
567-577) han clonado dichas secuencias y las han
designado como "promotores crípticos".
La presente invención se dirige a un promotor
identificado de Nicotiana tabacum (tabaco).
La planta del tabaco transgénica T1275 contenía
un fragmento EcoRI/XbaI de 4,38 kb que contenía el gen
GUS-nos de 2,15 kb sin promotor y 2,23 kb de
ADN de tabaco 5' flanqueante (2225 pb). Este ADN 5' flanqueante no
mostró homología con secuencias conocidas.
Por tanto, esta invención abarca un promotor
caracterizado porque comprende al menos una secuencia contigua de 18
pb de SEC Nº ID 1.
El promotor no pudo detectarse en soja, patata,
girasol, Arabidopsis, B. napus, B. oleracea, maíz,
trigo o pícea negra por análisis de transferencia Southern. La
expresión del fragmento clonado en tabaco transgénico, N.
tabacum c.v. Petit Havana, SRI y B. napus c.v. Westar
transgénico se observó en hoja, tallo, raíz, semilla en desarrollo y
flor. Mediante análisis de la expresión transitoria, se observó
también la actividad GUS en tejido de hoja de soja, alfalfa,
Arabidopsis, tabaco, B. napus, guisante y células
cultivadas en suspensión de avena, maíz, trigo y cebada.
Por tanto, esta invención proporciona también un
promotor que es un promotor constitutivo. Además, este promotor
funciona en diversas especies de plantas cuando se introduce en un
vector de clonación.
La presente invención abarca también un promotor
constitutivo que tiene una secuencia de ADN sustancialmente homóloga
de la SEC Nº ID 1.
El sitio de inicio de la transcripción para el
gen GUS introducido en tabaco transgénico se localizó en el
ADN de la planta cadena arriba del sitio de inserción. Era el mismo
en hoja, tallo, raíz, semillas y flor. Además, el sitio nativo era
silencioso tanto en tabaco no transformado como transgénico.
Por tanto, según la presente invención, se
proporciona un promotor constitutivo de tabaco que es críptico y que
funciona en diversas especies de plantas cuando se introduce en un
vector de clonación.
Esta invención se refiere también a un constructo
de gen quimérico que comprende un ADN de interés para el que se
desea la expresión constitutiva y un promotor constitutivo que
comprende al menos una secuencia contigua de 18 pb de la SEC Nº ID
1.
Esta invención se refiere además a un vector de
clonación que contiene dicho constructo génico quimérico.
Esta invención incluye también una célula de
planta que se ha transformado con dicho gen quimérico, o dicho
vector de clonación. Además, esta invención abarca plantas
transgénicas que contienen dicho gen quimérico o dicho vector de
clonación.
Esta invención se refiere además a cualquier
planta transgénica que contenga un promotor constitutivo que tenga
una secuencia de ADN sustancialmente homóloga de la SEC Nº ID 1,
unido operativamente a una región de ADN que se transcribe a
ARN.
Se incluye también en la presente invención un
procedimiento para conferir la expresión constitutiva de un gen a
una planta, que comprende: unir operativamente un ADN exógeno de
interés para el que se desea la expresión constitutiva con un
promotor constitutivo que comprende al menos una secuencia contigua
de 18 pb de la SEC Nº ID 1 para producir un constructo de gen
quimérico, e introducir el constructo de gen quimérico en una planta
capaz de expresar el constructo de gen quimérico.
Estos y otros rasgos de la invención resultarán
más evidentes a partir de la siguiente descripción en la que se hace
referencia a los dibujos adjuntos, en los que:
La Figura 1 muestra la expresión constitutiva de
GUS en todos los tejidos de la planta T1275, incluyendo
segmentos de hoja (a), secciones transversales de tallo (b), raíces
(c), secciones transversales de flor (d), secciones transversales de
ovario (e), embriones inmaduros (f), embriones maduros (g) y
secciones transversales de semilla (h).
La Figura 2 muestra la actividad GUS
específica, que revela que el nivel de expresión de GUS en
T1275 es comparable a los niveles en plantas que expresan genes 35S
de CamV-GUS-nos en tejidos de hoja.
La Figura 3 es el análisis de transferencia
Southern de ADN de T1275 digerido con EcoRI con una sonda de
la región de codificación del gen GUS (carril 1) y una sonda
de la región de codificación del gen nptII (carril 2), que
revela un solo sitio de inserción de ADN-T en la
planta T1275.
La Figura 4 muestra la fusión génica de
GUS clonado de pT1275. La flecha indica el sitio de inicio
del ARNm de GUS en la secuencia de ADN de planta.
La Figura 5 muestra el mapa de restricción de la
secuencia de ADN de planta aislado. La flecha indica el sitio de
inicio del ARNm de GUS en la secuencia de ADN de planta.
La Figura 6 muestra que la actividad GUS
específica varía en hojas de plantas de tabaco individuales
regeneradas crecidas en invernadero seleccionadas al azar (Figura
6A) y está generalmente correlacionada con el nivel de ARNm de
GUS acumulado medido mediante el ensayo de protección de
ARNasa y la densitometría de autorradiogramas (Figura 6B).
La Figura 7 muestra que los transcriptos
correspondientes a la secuencia de la planta nativa in situ
no se acumulan (3) en hojas de plantas de tabaco no transformado
(carril U) o transgénico (carril T25); mientras que los transcriptos
correspondientes a la misma secuencia de planta condensada con el
gen GUS en el ADN-T insertado en la planta
transgénica T25 (carril T25) están presentes en el fragmento
protegido indicado (2). Se presenta la sonda no digerida (1) en el
carril P como control.
La presente invención se refiere a secuencias
reguladoras de genes de plantas. Específicamente, esta invención se
refiere a un promotor, identificado por marcaje de
ADN-T con un gen de
\beta-glucuronidasa sin promotor (GUS),
para generar una planta N. tabacum transgénica que expresa la
actividad GUS constitutivamente.
Esta invención se dirige también a un promotor
que comprende una secuencia nucleotídica de al menos 18 pares de
bases contiguas de la SEC Nº ID 1. También son útiles
oligonucleótidos de 18 pb o más en la construcción de promotores
heterólogos que comprenden fragmentos del promotor como se define en
la SEC Nº ID 1.
El uso de dichos promotores heterólogos está bien
establecido en la bibliografía. Por ejemplo, se han duplicado o
combinado fragmentos de elementos específicos en el promotor 35S de
CaMV con otros fragmentos de promotor para producir promotores
quiméricos con las propiedades deseadas (por ejemplo, documentos US
5.491.288, 5.424.200, 5.322.938, 5.196.525, 5.164.316). Además, los
oligonucleótidos de 18 pb o más largos son útiles como sondas o
cebadores de PCR en la identificación o amplificación de secuencias
de ADN o ARN relacionadas en otros tejidos u organismos.
En el contexto de esta descripción, el término
"promotor" o "región promotora" designa una secuencia de
ADN, habitualmente cadena arriba (5') de la secuencia de
codificación de un gen estructural, que controla la expresión de la
región de codificación al proporcionar el reconocimiento de la ARN
polimerasa y/o otros factores necesarios para que la transcripción
se inicie en un sitio particular.
Existen generalmente dos tipos de promotores,
promotores inducibles y constitutivos. Un promotor inducible es un
promotor que es capaz de activar directa o indirectamente la
transcripción de una o más secuencias de ADN o genes en respuesta a
un inductor. En ausencia de un inductor, las secuencias de ADN o
genes no se transcribirán. Típicamente, el factor proteína, que se
une específicamente a un promotor inducible para activar la
transcripción, está presente en una forma inactiva que se convierte
después directa o indirectamente en la forma activa por el inductor.
El inductor puede ser un agente químico tal como una proteína,
metabolito, regulador del crecimiento, herbicida o compuesto
fenólico, o un estrés fisiológico impuesto directamente mediante
calor, frío, sales o elementos tóxicos o indirectamente mediante la
acción de un patógeno o agente patológico tal como un virus. Puede
exponerse una célula de planta que contiene un promotor inducible a
un inductor aplicando externamente el inductor a la célula o planta,
tal como mediante pulverización, riego, calentamiento o
procedimientos similares.
Un promotor constitutivo dirige la expresión de
un gen a lo largo de las diversas partes de una planta y
continuamente a lo largo del desarrollo de la planta.
Los ejemplos de promotores constitutivos
conocidos incluyen aquellos asociados al transcripto 35S de CaMV
(Odell et al., 1985, Nature, 313:
810-812), los genes de actina 1 (Zhang et
al., 1991, Plant Cell, 3:
1155-1165) y triosafosfato isomerasa 1 (Xu et
al., 1994, Plant Physiol., 106:
459-467) de arroz, el gen de ubiquitina 1 de maíz
(Cornejo et al., 1993, Plant Mol. Biol. 29:
637-646), los genes de ubiquitina 1 y 6 de
Arabidopsis (Holtrof et al., 1995, Plant Mol.
Biol. 29: 637-646), y el gen 4A del
factor de iniciación traduccional del tabaco (Mandel et al.,
1995, Plant. Mol. Biol., 29:
995-1004). La presente invención está dirigida a una
secuencia de ADN que contiene un promotor capaz de dirigir la
expresión de un gen. Preferiblemente, el promotor es un promotor
constitutivo aislado de N. tabacum.
El término "constitutivo" como se utiliza en
la presente memoria no indica necesariamente que un gen se expresa
al mismo nivel en todos los tipos celulares, sino que el gen se
expresa en un amplio intervalo de tipos celulares, aunque se observa
a menudo cierta variación en su abundancia.
La presente invención se dirige adicionalmente a
un constructo de gen quimérico que contiene un ADN de interés unido
operativamente al promotor de la presente invención. Puede
utilizarse cualquier gen exógeno y manipularse según la presente
invención para dar como resultado la expresión de dicho gen exógeno.
Un ADN de interés puede incluir, pero sin limitación, un gen que
codifica una proteína, un ADN que se transcribe para producir ARN
sin sentido o un producto transcripto que funciona de alguna manera
que media la expresión de otros ADN, por ejemplo que da como
resultado la coexpresión de otros ADN o similar.
El constructo de gen quimérico de la presente
invención puede comprender adicionalmente una región 3' no
traducida. Una región 3' no traducida designa aquella porción de un
gen que comprende un segmento de ADN que contiene una señal de
poliadenilación y cualquier otra señal reguladora capaz de efectuar
el procesamiento de ARNm o la expresión génica. La señal de
poliadenilación se caracteriza habitualmente efectuando la adición
de trazas de ácido poliadenílico al extremo 3' del precursor de
ARNm. Las señales de poliadenilación se reconocen habitualmente
mediante la presencia de homología con la forma canónica
5'-AATAAA-3', aunque las variaciones
no son infrecuentes.
Son ejemplos de regiones 3' adecuadas las
regiones 3' no traducidas transcritas que contienen una señal de
poliadenilación de genes de plásmido inductor de tumor (Ti) de
Agrobacterium, tales como el gen nopalina sintasa (gen
Nos) y genes de plantas tales como los genes de proteína de
almacenamiento de soja y la subunidad pequeña del gen de
ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa
(ssRUBISCO). La región 3' no traducida del gen estructural del
presente constructo puede utilizarse por lo tanto para construir
genes quiméricos para expresión en plantas.
El constructo de gen quimérico de la presente
invención puede incluir también potenciadores adicionales, tanto
potenciadores de la traducción como de la transcripción, según sea
necesario. Estas regiones potenciadoras son bien conocidas para
expertos en la técnica, y pueden incluir el codón de iniciación ATG
y secuencias adyacentes. El codón de iniciación debe estar en fase
con el marco de lectura de la secuencia de codificación para
asegurar la traducción de la secuencia completa. Las señales de
control de la traducción y los codones de iniciación pueden ser de
una variedad de orígenes, tanto naturales como sintéticos. Las
regiones de iniciación traduccional pueden proporcionarse por la
fuente de la región de iniciación transcripcional o por el gen
estructural. La secuencia puede derivar también del promotor
seleccionado para expresar el gen, y puede modificarse especialmente
de modo que aumente la traducción del ARNm.
Para ayudar a la identificación de células de
planta transformadas, los constructos de esta invención pueden
manipularse adicionalmente para incluir marcadores detectables de
plantas. Los marcadores detectables útiles incluyen enzimas que
proporcionan resistencia a un antibiótico tal como gentamicina,
higromicina, kanamicina y similares. De forma similar, son útiles
enzimas que proporcionan la producción de un compuesto identificable
por el cambio de color tal como GUS
(\beta-glucuronidasa) o por luminiscencia, tal
como luciferasa.
Se consideran también parte de esta invención
plantas transgénicas que contienen el constructo de gen quimérico
que comprende el promotor de la presente invención. Son conocidos en
la técnica procedimientos de regeneración de plantas enteras a
partir de células de plantas, y el procedimiento de obtención de las
plantas transformadas y regeneradas no es crítico para esta
invención. En general, las células de plantas transformadas se
cultivan en un medio apropiado que puede contener agentes selectivos
tales como antibióticos, en el que se utilizan los marcadores
detectables para facilitar la identificación de células de planta
transformadas. Una vez se forma el callo, puede fomentarse la
formación de brotes empleando las hormonas de plantas apropiadas
según procedimientos conocidos, y transferirse los brotes a medio de
enraizamiento para la regeneración de las plantas. Las plantas
pueden utilizarse después para establecer generaciones repetitivas,
a partir de semillas o utilizando técnicas de propagación
vegetativa.
Los constructos de la presente invención pueden
introducirse en células de plantas utilizando plásmidos Ti,
plásmidos Ri, vectores de virus de plantas, transformación directa
de ADN, microinyección, electroporación, etc. Para revisiones de
dichas técnicas, véanse por ejemplo Weissbach y Weissbach,
"Methods for Plant Molecular Biology", Academy Press, Nueva
York VIII, pág. 421-463 (1988); y Geierson y Corey,
Plant Molecular Biology, 2ª ed. (1988). La presente invención
incluye además un vector adecuado que comprende el constructo de gen
quimérico.
Cuando se designan secuencias específicas en la
presente invención, se entiende que estas secuencias incluyen en su
alcance secuencias que son "sustancialmente homólogas" de
dichas secuencias específicas. Las secuencias son "sustancialmente
homólogas" cuando al menos aproximadamente un 70%,
preferiblemente al menos aproximadamente un 80% y lo más
preferiblemente al menos aproximadamente un 90% de los nucleótidos
coinciden en una longitud definida de la molécula. Las secuencias
que son "sustancialmente homólogas" incluyen cualquier
sustitución, deleción o adición en la secuencia. Las secuencias de
ADN que son sustancialmente homólogas pueden identificarse en
experimentos de hibridación Southern, por ejemplo en condiciones
estrictas de hibridación (véase Maniatis et al., en
"Molecular Cloning (A Laboratory Manual)", Cold Spring Harbor
Laboratory (1982), pág. 387 a 389).
Las secuencias específicas, designadas en la
presente invención, incluyen también secuencias que son
"funcionalmente equivalentes" a dichas secuencias específicas.
En la presente invención, las secuencias funcionalmente equivalentes
designan secuencias que, aunque no idénticas a las secuencias
específicas, proporcionan la misma o sustancialmente la misma
función. Las secuencias de ADN que son funcionalmente equivalentes
incluyen cualquier sustitución, deleción o adición en la secuencia.
Con referencia a la presente invención, las secuencias
funcionalmente equivalentes dirigirán constitutivamente la expresión
de un gen exógeno.
Aunque esta invención se describe con detalle con
referencia particular a las realizaciones preferidas de la misma,
dichas realizaciones se ofrecen para ilustrar pero no limitar la
invención.
Se realizó la transferencia de constructos
binarios a Agrobacterium y la transformación de discos de
hojas de N. tabacum SR1 como se describe en Fobert et
al., (1991, Plant. Mol. Biol. 17,
837-851). Se mantuvo el tejido de planta en sulfato
de kanamicina 100 \mug/ml (Sigma) a lo largo del cultivo in
vitro.
A partir de las plantas transgénicas producidas
se eligió uno de éstas, T1275, para estudio detallado debido a su
alto nivel de expresión constitutiva de GUS.
Se realizaron ensayos fluorogénicos e
histológicos de GUS según Jefferson (Plant Mol. Biol.
Rep., 1987, 5, 387-405), modificado en
Fobert et al., (Plant Mol. Biol. 1991, 17,
837-851). Para el examen inicial, se recogieron
hojas de plántulas crecidas in vitro. Después, se recogieron
nueve tejidos diferentes: hoja (L), tallo (S), raíz (R), antera (A),
pétalo (P), ovario (O), sépalo (Se), semillas de 10 días después de
la antesis (S1) y semillas de 20 días después de la antesis (S2) de
plantas crecidas en invernadero, y se analizaron. Para un análisis
cuantitativo detallado de la actividad GUS, se recogieron
tejidos de hoja, tallo y raíz de progenie F1 resistente a kanamicina
crecida in vitro. Se recogieron tejidos florales en las
etapas de desarrollo 8-10 (Koltunow et al.,
1990, Plant Cell 2, 1201-1224) de las
plantas transgénicas originales. Se marcaron también flores y se
recogieron semillas en desarrollo de cápsulas a 12 y 20 dpa. En
todos los casos, el tejido se pesó, se congeló inmediatamente en
nitrógeno líquido y se almacenó a -80ºC.
Los tejidos analizados mediante ensayo
histológico estaban en las mismas etapas de desarrollo que los
enumerados anteriormente. Se analizaron diferentes secciones
cortadas a mano para cada órgano. Para cada planta, se realizaron
los ensayos histológicos en al menos dos ocasiones diferentes para
asegurar la reproducibilidad. Excepto por los órganos florales, se
ensayaron todos los tejidos en tampón fosfato según Jefferson (1987,
Plant Mol. Biol. Rep. 5, 387-405), con
X-Gluc 1 mM (Sigma) como sustrato. Se ensayaron las
flores en el mismo tampón que contenía 20% (v/v) de metanol (Kosugi
et al., 1990, Plant. Sci. 70,
133-140).
Se encontró actividad GUS en la planta
T1275 en todos los tejidos. La Figura 1 muestra la expresión
constitutiva de GUS mediante tinción histoquímica con
X-Gluc de T1275, incluyendo hoja (a), tallo (b),
raíz (c), flor (d), ovario (e), embriones (f y g) y semilla (h).
Se confirmó la expresión constitutiva de
GUS con el ensayo fluorogénico más sensible de tejido de
planta de la planta transformada T1275. Estos resultados se muestran
en la Figura 2. La expresión de GUS fue evidente en todos los
tipos de tejido, incluyendo hoja (L), tallo (S), raíz (R), antera
(A), pistilo (P), ovario (O), sépalo (Se), semillas a 10 dpa (S1) y
a 20 dpa (S2). Además, el nivel de expresión de GUS es
comparable al nivel de expresión en plantas transformadas que
contienen el promotor constitutivo 35S de CaMV en una fusión
GUS-nos. Como se reseñó en Fobert et
al., (1991, Plant Molecular Biology 17:
837-851), la actividad GUS en plantas
transformadas que contenían pBI121 (Clontech), que contiene un gen
quimérico 35S de CaMV-GUS-nos, era del orden
de 18.770 \pm 2.450 (pmol de MU por minuto por mg de
proteína).
El ADN-T contiene un gen de
resistencia a la kanamicina. Se esterilizó la superficie de semillas
de plantas transgénicas autopolinizadas con etanol al 70% durante 1
min y blanqueador Javex sin diluir (hipoclorito de sodio al 6%)
durante 25 min. Se lavaron después las semillas varias veces con
agua destilada estéril, se secaron a flujo laminar y se dispusieron
en placas Petri que contenían medio MS0 suplementado con kanamicina
100 \mug/ml como se describe en Miki et al. (1993,
"Methods in Plant Molecular Biology and Biotechnology", Eds.
B.R. Glick y J.E: Tompson, CRC Press, Boca Ratón,
67-88). Se contaron al menos 90 plántulas para cada
transformante. Se contó el número de plántulas verdes (resistentes a
la kanamicina) y blanqueadas (sensibles a la kanamicina) después de
4-6 semanas, y se analizaron utilizando el ensayo
Chi^{2} a un nivel de significancia de p<0,05.
Los resultados del análisis genético se muestran
a continuación en la tabla 1, que muestra los loci de
ADN-T segregados en forma de un solo locus de
inserción.
Se analizó el ADN-T en la planta
transgénica T1275 utilizando una sonda de la región de codificación
del gen GUS o una sonda de la región de codificación del gen
nptII.
Se aisló ADN genómico de hojas liofilizadas
utilizando el protocolo de Sanders et al. (1987, Nucleic Acid
Res. 15, 1543-1558). Se digirieron 10 \mug
de ADN de T1275 durante varias horas con EcoRI utilizando el
tampón suministrado por el fabricante apropiado suplementado con
espermidina 2,5 mM. Después de electroforesis mediante un gel de
TAE-agarosa al 0,8%, se realizó el análisis de
transferencia Southern utilizando protocolos estándar. Puesto que el
ADN-T del constructo que contiene el constructo
promotor constitutivo-GUS-nos contiene sólo
un único sitio de reconocimiento de EcoRI, los fragmentos de
hibridación están compuestos tanto por secuencias de
ADN-T como de ADN flanqueante de tabaco. La longitud
del fragmento variará dependiendo de la localización del sitio
EcoRI más cercano. Utilizando el gen GUS como sonda
(Figura 3-carril 1), se detectará el fragmento del
sitio EcoRI más cercano en el ADN de la planta. Con T1275, se
localizó uno de dichos fragmentos. Utilizando la región de
codificación de nptII como sonda (Figura 3, carril 2), que
hibrida con secuencias en el lado opuesto al sitio EcoRI, fue
evidente de nuevo sólo una banda de hibridación. Como puede
observarse en la Figura 3, no aparecieron redistribuciones
importantes en el ADN-T.
Se aisló ADN genómico de hojas según Hattori
et al. (1987, Anal. Biochem. 165,
70-74). Se digirieron 10 \mug de ADN total de
T1275 con EcoRI y XbaI según las instrucciones del
fabricante. Se fraccionó por tamaños el ADN digerido en un gel de
agarosa al 0,7%. Se aislaron los fragmentos de ADN de
aproximadamente 4 a 6 kb del gel utilizando el kit
Elu-Quick (Schleicher y Schuell) y se ligaron a
brazos lambda GEM-2 previamente digeridos con
EcoRI y XbaI y tratados con fosfatasa. Se
transfirieron aproximadamente 40.000 placas a una membrana de nailon
(Hybond, Amersham) y se examinaron con el inserto GUS de 2 kb
marcado con ^{32}P aislado de pBI121 esencialmente como se
describe en Rutledge et al., (1991, Mol. Gen. Genet.
229, 31-40). Se aislaron los clones
positivos. Se aisló el fragmento XbaI-EcoRI (véase el
mapa de restricción de la Figura 4 y la Figura 5) del fago lambda,
se clonó en pTZ19R previamente digerido con XbaI y
EcoRI y se trató con fosfatasa intestinal de ternero.
La secuencia de ADN de planta en el clon no se ha
reseñado anteriormente en bases de datos de secuencias. No se
observa entre diversas especies, ya que las transferencias Southern
no revelaron bandas que hibridasen con el fragmento en soja, patata,
girasol, Arabidopsis, B. napus, B. oleracea, maíz,
trigo o pícea negra (datos no mostrados). En tabaco, las
transferencias Southern no revelaron evidencias de grandes
redistribuciones en o cadena arriba del sitio de inserción de
ADN-T (datos no mostrados).
Para el análisis de la expresión transitoria de
la actividad GUS mediada por biolística (Sandford et
al., 1983, Methods Enzymol. 217:
483-509), se subclonó el fragmento
XbaI-EcoRI en pUC19 y se detectó la actividad
GUS mediante tinción con X-Gluc como se
describe anteriormente. Se examinó en tejido de hoja de plantas
crecidas en invernadero o en cultivos de suspensión celular el
número de puntos azules que se tiñeron. Como se muestra en la Tabla
2, el gen promotor T1275-GUS era activo en cada una de las
diversas especies examinadas.
* Número de puntos azules:
1-10(+), 10-100(++),
100-400(+++).
Se aisló el fragmento de 4,2 kb que contenía
aproximadamente 2,2 kb del promotor de T1275 condensado con el gen
GUS y nos 3' mediante digestión de
pTZ-T1275 con HindIII y EcoRI. Se ligó
el fragmento aislado con el vector pRD400 (Datla et al.,
1992, Gene, 211: 383-384) previamente
digerido con HindIII y EcoRI, y se trató con fosfatasa
intestinal de ternero. Se realizaron la transferencia del vector
binario a Agrobacterium tumefaciens y la transformación del
disco de hoja de N. tabacum SR1 como se describen
anteriormente. Se examinó la actividad GUS en diversos
órganos de muchas líneas transgénicas independientes. Se examinó el
ARNm de GUS en el mismo órgano mediante el ensayo de
protección de ARNasa (Melton et al., 1984, Nucleic Acids
Res. 121: 7035-7056) utilizando una sonda que
cartografió el extremo 5' del ARNm tanto en tejidos no transformados
como transgénicos. Se aisló el ARN de tejidos molidos congelados
utilizando el reactivo TRIZOL (Life Technologies) como se describe
por el fabricante. Para cada ensayo, se hibridaron
10-30 \mug de ARN total con una sonda de ARN sin
sentido correspondiente a 600 bases de la secuencia de planta T1275
y 400 bases del gen GUS. Se realizaron los ensayos utilizando
el kit RPAII (Ambion CA) como se describe por el fabricante. Se
separaron los fragmentos protegidos en gel desnaturalizante Long
Ranger con acrilamida al 5% (J.J. Baker, N.J.), que se secó y expuso
a película Kodak X-RP.
El análisis de hojas de plantas crecidas en
invernadero seleccionadas aleatoriamente regeneradas del cultivo
reveló un amplio intervalo de actividades GUS específicas
(Figura 6A). Las plantas transformadas con PBI 121 (CLONETECH) que
contienen el gen 35S-GUS-nos proporcionaron
niveles de actividad específica comparables (datos no mostrados).
Generalmente, el nivel de ARNm de GUS en las hojas (Figura
6B) se correlacionaba con las actividades GUS específicas.
Además, la presencia de una sola banda de aproximadamente 600 bases
en todas las muestras indicaba que el sitio de inicio de la
transcripción de GUS se localizaba aproximadamente 180 bases
cadena arriba del sitio de inserción del ADN-T en la
secuencia de ADN de planta.
Para el análisis de la expresión de GUS en
diferentes órganos, se examinaron con detalle líneas derivadas de la
progenie de las líneas anteriores. La Tabla 3 muestra las
actividades GUS específicas en una de estas plantas. Se
expresa en hoja, tallo, raíz, semillas en desarrollo y órganos
florales, sépalos, pétalos, anteras, pistilos y ovarios a niveles
variables, confirmando la expresión constitutiva. La introducción
del mismo vector en B. napus reveló también la expresión de
actividad GUS en estos órganos (datos no mostrados),
indicando que la expresión constitutiva no era específica del
tabaco. El examen de ARNm de GUS en los órganos del tabaco
mostró que los sitios de inicio de la transcripción eran los mismos
en todos, y el nivel de ARNm era similar excepto en capullos de
flores en que era inferior (Tabla 3).
Los ensayos realizados con ARN de hojas, tallo,
raíz, semillas en desarrollo y flores de tabaco no transformado no
revelaron un fragmento protegido utilizando la misma sonda que
anteriormente (Figura 7). Por lo tanto, se supone que el sitio de
inserción es transcripcionalmente silencioso en el tabaco no
transformado y se activa mediante la inserción de
ADN-T. La región cadena arriba del sitio de
inserción es por lo tanto otro ejemplo de un promotor críptico de
planta (Fobert et al., 1994, Plant J. 6:
568-577).
* No
realizado
Todas las publicaciones científicas y documentos
de patentes se incorporan a la presente memoria como referencia.
La presente invención se ha descrito con respecto
a realizaciones preferidas. Sin embargo, resultará obvio para
expertos en la técnica que pueden hacerse una serie de variaciones y
modificaciones sin apartarse del alcance de la invención como se
describe en las siguientes reivindicaciones.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: SU MAJESTAD EN NOMBRE DE CANADÁ, REPRESENTADA POR EL MINISTRO DE AGRICULTURA Y AGROALIMENTACIÓN DE CANADÁ
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: Central Experimental Farm
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Ottawa
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Ontario
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Canadá
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): K1A 0C6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: PIERRRE FOBERT
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 707 Tobin Terrace
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Saskatoon
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Saskatchewan
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Canadá
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): S7N 4P4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: VENKATRAN N. IYER
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 2595 Maquinna ROad
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Kelowna
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: Columbia Británica
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: Canadá
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL (ZIP): V1W 2R9
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Promotor de tabaco
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 1
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- FORMA DE LECTURA INFORMÁTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: PC compatible con IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, versión nº 1.30 (OEP)
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC Nº ID 1:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 2224 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC Nº ID 1:
Claims (22)
1. Un promotor aislado que comprende una
secuencia nucleotídica que comprende al menos una secuencia contigua
de 18 pb de la SEC Nº ID 1.
2. El promotor aislado de la reivindicación 1,
que comprende un fragmento de ADN caracterizado por el mapa
de restricción de la Figura 5, de XbaI a SalI.
3. El promotor aislado de la reivindicación 1, en
el que dicho promotor es un promotor constitutivo.
4. El promotor aislado de la reivindicación 1, en
el que dicho promotor es un promotor críptico.
5. El promotor constitutivo aislado de la
reivindicación 3, en el que dicho promotor tiene una secuencia
nucleotídica coincidente con al menos un 70%, preferiblemente un
80%, y lo más preferiblemente un 90% de los nucleótidos de la SEC Nº
ID 1.
6. El promotor constitutivo aislado de la
reivindicación 3, en el que dicho promotor tiene una secuencia
nucleotídica funcionalmente equivalente a la SEC Nº ID 1, que dirige
constitutivamente la expresión de un gen exógeno.
7. Una molécula de ADN aislada que comprende la
secuencia nucleotídica de la SEC Nº ID 1.
8. Un constructo de gen quimérico que comprende
un ADN de interés para el que se desea la expresión constitutiva, y
dicho promotor constitutivo según la reivindicación 3.
9. El constructo de gen quimérico según la
reivindicación 8, en el que dicho promotor constitutivo tiene una
secuencia nucleotídica coincidente con al menos un 70%,
preferiblemente un 80% y lo más preferiblemente un 90% de los
nucleótidos de la SEC Nº ID 1.
10. Un constructo de gen quimérico que comprende
la molécula de ADN aislada de la reivindicación 7.
11. Un vector que comprende el constructo de gen
quimérico de la reivindicación 9.
12. Un vector que comprende el constructo de gen
quimérico de la reivindicación 10.
13. Un procedimiento para conferir la expresión
constitutiva de un gen en una planta, que comprende: unir
operativamente un ADN de interés, para el que se desea la expresión
constitutiva, con un promotor constitutivo del tabaco, comprendiendo
dicho promotor constitutivo al menos una secuencia contigua de 18 pb
de la SEC Nº ID 1, para producir un constructo de gen quimérico, e
introducir el constructo de gen quimérico en una planta capaz de
expresar el constructo de gen quimérico.
14. El procedimiento según la reivindicación 13,
en el que dicho promotor constitutivo tiene una secuencia
nucleotídica coincidente con al menos un 70%, preferiblemente un 80%
y lo más preferiblemente un 90% de los nucleótidos de la SEC Nº ID
1.
15. Una célula de planta transgénica que contiene
el constructo de gen quimérico de la reivindicación 8.
16. La célula de planta transgénica según la
reivindicación 15, en la que dicho promotor constitutivo tiene una
secuencia nucleotídica coincidente con al menos un 70%,
preferiblemente un 80% y lo más preferiblemente un 90% de los
nucleótidos de la SEC Nº ID 1.
17. Una célula de planta transgénica que contiene
el constructo quimérico de la reivindicación 10.
18. Una célula de planta transgénica según la
reivindicación 16, seleccionada del grupo constituido por tabaco,
N. tabacum, B. napus, soja, alfalfa, Arabidopsis,
maíz, trigo y cebada.
19. Una planta transgénica que contiene el
constructo de gen quimérico de la reivindicación 8.
20. La planta transgénica según la reivindicación
19, en la que dicho promotor constitutivo tiene una secuencia
nucleotídica coincidente con al menos un 70%, preferiblemente un 80%
y lo más preferiblemente un 90% de los nucleótidos de la SEC Nº ID
1.
21. Una planta transgénica que contiene el
constructo de gen quimérico de la reivindicación 10.
22. La planta transgénica según la reivindicación
21, seleccionada del grupo constituido por tabaco, B. napus,
soja, alfalfa, Arabidopsis, maíz, trigo y cebada.
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