ES2276474T3 - Peptidos metilados, homologos del smd, que reaccionan con los anticuerpos de los sueros de seres vivos afectados con lupus eritematoso sistemico. - Google Patents
Peptidos metilados, homologos del smd, que reaccionan con los anticuerpos de los sueros de seres vivos afectados con lupus eritematoso sistemico. Download PDFInfo
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A UN PROCEDIMIENTO PARA OBTENER CIERTOS PEPTIDOS QUE CONTIENEN ARGININAS METILADAS, QUE VAN SEGUIDAS POR UN RESIDUO DE GLICINA, Y QUE CONSTITUYEN DETERMINANTES INMUNOGENICOS DE ANTICUERPOS PRESENTES EN LOS SUEROS DE PACIENTES CON LUPUS ERYTHEMATOSUS SISTEMICO, O EL VIRUS DE EPSTEIN - BARR, Y CARACTERIZADO PORQUE LA METILACION ES REQUISITO PREVIO PARA LA REACCION CON DICHOS ANTICUERPOS. LA INVENCION SE REFIERE IGUALMENTE AL USO DE LOS CITADOS PEPTIDOS PARA EL DIAGNOSTICO Y EL TRATAMIENTO DEL LUPUS ERYTHEMATOSUS SISTEMICO Y ENFERMEDADES RELACIONADAS, ASI COMO DE ENFERMEDADES EN LAS QUE ESTE IMPLICADO EL VIRUS DE EPSTEIN - BARR.
Description
Péptidos metilados, homólogos del SmD, que
reaccionan con los anticuerpos de los sueros de seres vivos
afectados con lupus eritematoso sistémico.
La presente invención se refiere a un método
para producir ciertos péptidos que contienen argininas metiladas
que son seguidas por un residuo de glicina y que constituyen
determinantes inmunogénicos de los anticuerpos presentes en los
sueros de pacientes con lupus eritematoso sistémico, donde la
metilación es un requisito previo para la reacción con dichos
anticuerpos. La invención también se refiere al uso de dichos
péptidos para el diagnóstico del lupus eritematoso sistémico.
El lupus eritematoso sistémico es una enfermedad
autoinmune, en la cual el paciente desarrolla anticuerpos que
reaccionan con muchos tejidos de su propio cuerpo. Los anticuerpos
dominantes son dirigidos contra componentes del núcleo celular, con
epítopes que pueden ser encontrados en el ADN, y en proteínas que
constituyen pequeñas partículas de ribonucleoproteínas
(snRNPs).
La primera prueba de laboratorio diseñada para
esta enfermedad fue la prueba celular de LE (lupus eritematoso).
Esta prueba tiene que ser repetida muchas veces, antes de que
resulte en una reacción positiva en aproximadamente 90% de las
personas con lupus eritematoso sistémico. La prueba celular de LE,
tampoco, es específica para el lupus, y puede ser positiva en hasta
el 20% de las personas con artritis reumatoide, en algunos pacientes
con otras condiciones reumáticas como el síndrome de Sjögren o
esclerodermia, en pacientes con hepatopatías, y en personas que
toman medicamentos como hidralacina y procainamida. La prueba ANA,
que detecta anticuerpos contra antígenos nucleares, es más
específica para el lupus que la prueba LE, y es positiva en muchos
pacientes que padecen de lupus eritematoso sistémico. Al igual que
ocurre con la prueba de LE, una ANA positiva no es diagnóstico de
lupus debido a que la prueba también puede ser positiva en personas
con esclerodermia, dermatomiositis, artritis reumatoide, síndrome
de Sjögren, en pacientes tratados con ciertos medicamentos, o en
pacientes padeciendo de mononucleosis infecciosa, hepatopatías,
malaria, etc.
Por estas razones y debido a que las pruebas
añadidas son costosas, han sido desarrolladas nuevas pruebas que
son muy útiles en el diagnóstico del SLE. Estas incluyen la prueba
de anticuerpo anti-ADN, la prueba de anticuerpo
anti-Sm, la prueba de anticuerpo
anti-RNP, la prueba de anticuerpo
anti-Ro, y las pruebas que miden los niveles de
complemento del suero. Con frecuencia, el diagnóstico correcto
dependerá de la interpretación de muchas pruebas y síntomas
separados.
El antígeno Sm es una estructura macromolecular
compleja que consiste en 8 proteínas (B, B', D1, D2, D3, E, F, G)
asociadas a las series U de pequeñas moléculas de ARN. El SmBB' y el
SmD son considerados los principales componentes antigénicos del
complejo (para consulta vea S.O. Hoch. 1989). Sin embargo el SmBB'
muestra reactividad cruzada con los anticuerpos
anti-RNP, por consiguiente el SmD es considerado el
autoantígeno más específico para Sm (W.J. van Venrooij y
otros, 1991).
El ADNc del SmD ha sido aislado a partir de una
biblioteca de linfocitos B humanos con sondas de oligonucleótidos
sintéticos, diseñadas sobre la base de la secuencia N terminal del
SmD (Rokeach y otros, 1988). Posteriormente, fue mostrado que el
producto de transcripción in vitro podría ser
inmunoprecipitado por IgG anti-Sm. Desde entonces
la proteína D ha sido caracterizada bien como un doblete denominado
D y D' (Andersen y otros, 1990) o como tres polipéptidos
denominados D1 (16 kDa), D2 (16.5 kDa) y D3 (18 kDa) (Lehmeier y
otros, 1990), siendo D1 idéntica al SmD clonado por Rokeach y otros
(1988). La secuencia de D2 y D3 es sustancialmente diferente de
D1.
Durante años, diferentes grupos de investigación
han informado sobre el uso del SmD recombinante y de péptidos
derivados del SmD y han publicado datos contradictorios. Rokeach y
otros (1992a) expresaron SmD1 en E. coli y en S.
cerivisiae, pero en contraste con la reactividad del SmD natural
de las células HeLa, la mayoría de los sueros
anti-SmD de pacientes limita el SmD1 recombinante a
un nivel no significativamente mayor que el del suero humano
normal. No obstante, el mismo grupo (Rokeach y otros, 1992b) ha
realizado el mapeo del epítope basado en múltiples funciones entre
el gen TrpE y los fragmentos de la secuencia que codifica el SmD,
expresados en E. coli. Surgieron dos patrones de reactividad
anti-Sm: epítopes discontinuos fueron encontrados
dispersos por todo el antígeno, y un epítope dominante fue
localizado en el término C, desde el aminoácido 87 hasta el 119
(Rokeach y otros, 1992b). Hiepe y otros describieron péptidos SmD
comprendiendo 35-45 AA que son capaces de aglutinar
auto-anticuerpos debido a la formación de un epítope
conformacional (EP 0776906 A). Usando péptidos sintéticos, Barakat
y otros (1990) demostraron que el término N (péptido
1-20) y el péptido 44-67 podrían
ser usados como una sonda valiosa para el diagnóstico del SLE a
pesar de que sus resultados no coincidieron con la reactividad
anti-SmD obtenida por el ensayo tradicional (patente
EP-B-0491014). Usando una estrategia
similar, Sabbatini y otros (1993a) han identificado un
epítope dominante en la región C terminal del SmD1
(aa95-aa119) que confirma los resultados de Rokeach
y otros (1992b), pero oponiéndose a los resultados obtenidos
por Barakat y otros (1990). El trabajo más reciente sobre el
mapeo del epítope del SmD1 por medio de péptidos sintéticos (James
y otros 1994) mostró que 8 de 9 sueros SmD positivos
(positivos a la precipitina) son reactivos con los octapéptidos
92-112l que abarcan la secuencia. Un epítope
adicional, claramente reactivo con 7 de
9
sueros SmD positivos fue colocado en la región del aminoácido
82-90. Finalmente, un epítope similar al del SmD
fue identificado recientemente por Rivkin y otros (1994) y consiste
en una repetición (homóloga al término C) del dipéptido
(Gly-Arg)_{9}. En contraste con la
especificidad al SLE de los anticuerpos anti-Sm, el
epítope definido es reconocido también por pacientes con otras
enfermedades autoinmunes (artritis reumatoide, esclerodermia,
síndrome de Sjögren). La proteína de fusión
\beta-galactosidasa en E. coli del epítope
mencionado anteriormente fue reactiva con 35% de los sueros del
SLE, pero solo 6 de esos 32 sueros positivos fueron reactivos con
la proteína SmD natural indicando que la proteína de fusión es menos
específica que la proteína SmD natural. Viceversa, solo cuatro de
los ocho sueros de SmD reaccionaron con la proteína de fusión. Sin
embargo, debería ser señalado que el SmD fue expresado también como
una proteína de fusión \beta-galactosidasa
completa en E. coli (Wagatsuma y otros 1993), pero que ese
antígeno SmD recombinante no fue reconocido por los sueros de los
pacientes, a pesar de que todos los sueros reconocieron el antígeno
Sm natural de 16 kDa en el Western blot.
En conclusión, ninguno de los péptidos
sintéticos descritos ni la proteína recombinante completa o partes
de la molécula resultaron en una inmunoreactividad idéntica a la
reactividad obtenida con el SmD natural.
Es un objetivo de la presente invención
proporcionar péptidos que tienen una gran reactividad para los
anticuerpos presentes en sueros de pacientes con lupus eritematoso
sistémico.
Otro objetivo de la presente invención es
proporcionar métodos para obtener dichos péptidos.
Otro objetivo de la presente invención es
proporcionar métodos de generación de anticuerpos específicamente
reactivos con péptidos de dichos péptidos, imitando así a dichos
péptidos.
Otro objetivo de la presente invención es
proporcionar métodos para generar anticuerpos
anti-idiotipo específicamente reactivos con los
anticuerpos antes mencionados.
Otro objetivo de la presente invención es
proporcionar un kit diagnóstico para el lupus eritematoso
sistémico.
Todos estos objetivos de la presente invención
son alcanzados por las siguientes realizaciones de la presente
invención.
De acuerdo con su realización principal la
presente invención se refiere a péptidos que contienen menos de 50
aminoácidos, que comprenden al menos un dímero del tipo XG, donde la
X representa un residuo de arginina metilada, y que es capaz de
reaccionar con anticuerpos, con dicha metilación siendo crucial para
la reacción entre dicho péptido y dichos anticuerpos, y donde
dichos anticuerpos están presentes en sueros de pacientes con lupus
eritematoso sistémico, o mononucleosis infecciosa, recurrente o
crónica, o ciertos cánceres que están relacionados con la infección
con virus de Epstein-Barr, tal como el linfoma de
Burkitt o el carcinoma nasofaríngeo.
De acuerdo con otra realización la presente
invención también se refiere a un péptido y/o una estructura química
que comprende cualquiera de los péptidos mencionados anteriormente,
fusionado a una molécula de enlace. La presente invención se
refiere también a péptidos que comprenden y/o consisten en
repeticiones tándem de al menos dos de cualquiera de los péptidos
mencionados anteriormente, o péptidos ramificados que comprenden al
menos uno de los péptidos mencionados anteriormente.
De acuerdo con una realización más específica la
presente invención se refiere a un método para producir cualquiera
de los péptidos mencionados anteriormente, por síntesis química
clásica, donde las argininas metiladas son sustituidas por residuos
de argininas no metiladas en ciertos pasos durante la síntesis
química. La presente invención se refiere también a métodos para
producir cualquiera de los péptidos mencionados anteriormente,
donde la secuencia primaria de aminoácido es producida por síntesis
química clásica, y donde los residuos de arginina que preceden a
los residuos de glicina son metilados posteriormente contactando
dichos péptidos con una proteína arginina metiltransferasa. La
presente invención también se refiere a un método para la producción
de cualquiera de los péptidos mencionados anteriormente que
comprende los siguientes pasos: (i) transformar un hospedero
celular apropiado con un vector recombinante en el que es insertado
un ácido polinucleico que comprende la secuencia que codifica para
dicho péptido bajo el control de los elementos reguladores
apropiados de forma tal que dicho péptido o una proteína que
comprende dicho péptido sea expresado y/o segregado, (ii) cultivar
dicho hospedero celular transformado en condiciones que permitan la
expresión de dicha proteína o dicho péptido y que permitan una
metilación parcial u óptima de las argininas presentes en dicho
péptido, y (iii) cosechar dicho péptido. La presente invención
también se refiere a un método para producir cualquiera de los
péptidos mencionados anteriormente que comprende los siguientes
pasos: (i) transformar un hospedero celular apropiado con un vector
recombinante en el que es insertado un ácido polinucleico que
comprende la secuencia que codifica para dicho péptido bajo el
control de los elementos reguladores apropiados de forma tal que
dicho péptido o una proteína que comprende dicho péptido sea
expresado y/o segregado, (ii) cultivar dicho hospedero celular
transformado en condiciones que permitan la expresión de dicha
proteína o dicho péptido, (iii) cosechar dicha proteína o dicho
péptido, y (iv) metilar los residuos de arginina de dicha proteína o
de dicho péptido contactando con una proteína arginina
metiltransferasa. De acuerdo con una realización más específica la
presente invención también se refiere a cualquiera de los métodos
mencionados anteriormente, donde dicha célula hospedera es un
hospedero bacteriano o levadura o cualquier otra célula hospedera
eucariota la cual es transformada preferiblemente con un
báculovirus recombinante.
De acuerdo con una realización preferida la
presente invención también se refiere a un anticuerpo desarrollado
después de la inmunización con cualquiera de los péptidos
mencionados anteriormente, con dicho anticuerpo siendo
específicamente reactivo con las formas metiladas de dicho péptido,
y con dicho anticuerpo siendo preferiblemente un anticuerpo
monoclonal. La presente invención también se refiere a un anticuerpo
anti-idiotipo desarrollado después de la
inmunización con cualquier anticuerpo como es definido
anteriormente, con dicho anticuerpo anti-idiotipo
siendo específicamente reactivo con dicho anticuerpo, imitando así
la forma metilatada de cualquier péptido mencionado anteriormente,
y con dicho anticuerpo siendo preferiblemente un anticuerpo
monoclonal.
De acuerdo con una realización más específica la
presente invención también se refiere a una molécula de inmunotoxina
que comprende y/o que consiste en una molécula de reconocimiento
celular siendo un péptido como el definido anteriormente, o un
anticuerpo como el definido anteriormente, unido covalentemente a la
molécula de toxina o un fragmento activo de la misma.
La presente invención también se refiere a un
kit diagnóstico para ser usado en la detección del lupus eritematoso
sistémico, donde dicho kit comprende al menos uno de los péptidos o
anticuerpos mencionados anteriormente, y con dicho péptido o
anticuerpo estando posiblemente unido a un soporte sólido. Más
preferiblemente dicho kit está comprendiendo un rango de dichos
péptidos o dichos anticuerpos, posiblemente en combinación con SmD1
o SmD3 o Sm69 natural metilada y SmD1 o SmD3 o Sm69 recombinante no
metilada, donde dichos péptidos son añadidos en lugares específicos
en un substrato sólido. Más preferiblemente dicho soporte sólido es
una banda membranosa y dichos polilpéptidos son acoplados a la
membrana en forma de líneas paralelas. Tiene que ser entendido que
ciertos péptidos, o anticuerpos como los definidos con anterioridad,
alternativamente, no están unidos a un soporte sólido sino que son
proporcionados en la solución aglutinante para ser usados como
competidores y/o para bloquear otros anticuerpos que están
presentes en los sueros de pacientes con enfermedades autoinmunes
que no sean el SLE, disminuyendo o eliminando así la posible
reacción cruzada y/o unión inespecífica.
Hemos demostrado por primera vez que
modificaciones secundarias bien definidas (en su mayoría
N^{G},N^{G}-dimetilarginina) están
presentes en los residuos de Arg del péptido C terminal, que están
seguidos por un residuo de glicina. Además, hemos obtenido
evidencias de que el péptido C terminal solo puede mostrar una
inmunoreactividad casi idéntica a la inmunoreactividad del SmD
natural, si estos residuos de arginina son metilados. Estas
dimetilargininas presentes en las nueve posiciones Arg del término
C, han sido demostradas por primera vez en la molécula del SmD1
natural. En el SmD2 no fue recuperada dimetilarginina mientras en
el término C del SmD3 los cuatro motivos RG en el término C fueron
encontrados nuevamente siendo dimetilados.
El aminoácido
N^{G},N^{G}-dimetilarginina es el
resultado de una modificación post-translacional
que parece ocurrir predominantemente en las proteínas de unión al
ARN (Najbauer, 1933). Estas proteínas nucleares son modificadas
enzimáticamente por una proteína nuclear metilasa l
(S-adenosil-metionina:
proteína-arginina
N-metiltransferasa, E.C.2.1.1.23; Rajpurohit, y
otros, 1994). La especificidad estructural de esta enzima parece ser
un péptido que contiene arginina con glicina en la posición de
flanqueo C como fue mostrado mediante la evaluación de substrato
con péptidos sintéticos (Rawal, 1995). No obstante, en el mismo
estudio fue demostrado que la molécula completa también desempeña
un papel importante aunque muy desconocido en el proceso de
metilación. De manera interesante, este proceso de metilación
celular puede ser imitado in vitro con metilasa 1 purificada
como fue ilustrado con la proteína de RNP nuclear heterogénea
recombinante A1 (Rajpurohit, y otros 1994).
A partir de nuestros resultados, podemos de esta
forma concluir que en la inmunoreactividad del SmD, están
involucrados al menos 2 epítopes. Uno de los epítopes aparentemente
está presente en la molécula del SmD1 recombinante y no puede ser
asignado a un epítope linear (mapeo del epítope del SmD1
recombinante de E. coli, datos no mostrados). Esto concuerda
con el epítope discontinuo descrito por Rokeach y otros (1992b). El
epítope localizado en el término C por mapeo del epítope con
fragmentos de fusión de E. coli (Rokeach y otros, 1992b;
Rivkin y otros, 1994) y con péptidos sintéticos (Sabbatini y otros,
1993a; James y otros, 1994) bien podría ser explicado por el
trabajo de Rivkin y otros (1994). El último grupo ha demostrado que
una repetición del dipéptido (Gly-Arg)_{9}
es reconocido por el 35% de los sueros de pacientes de SLE pero
también por el 15% de los sueros de otras enfermedades autoinmunes.
Este resultado contrasta con la alta especificidad al SLE de los
anticuerpos anti-Sm. De hecho, la especificidad del
péptido SmD1 no modificado C terminal no ha sido completamente
investigada por Rokeach (1992b) ni por James y otros (1994). Solo
Sabbatini (1993a) describió una cierta especificidad a la
enfermedad para el péptido sintético C terminal. Por un lado, Rivkin
ha mostrado que de 32 sueros positivos para el péptido
(Gly-Arg)_{9}, solo 6 sueros son positivos
con el SmD natural. Por otro lado, de los sueros SmD positivos
identificados en Western blot, solo la mitad de ellos son reactivos
con el péptido no modificado C terminal (Rivkin: 4/8; Rokeach 9/19:
Sabbatini: 5/9). Basado en estos resultados puede ser concluido que
la inmunoreactividad del péptido no modificado C terminal no se
corresponde bien con el SmD natural y es menos específico al SLE
que el SmD natural. En contraste, nuestros resultados muestran que
15 de los 17 sueros SmD positivos son inmunoreactivos con el péptido
dimetilado C terminal mientras solo un suero reacciona con el
péptido no modificado C terminal. Los 2 sueros que no reconocen el
péptido dimetilado C terminal son inmunoreactivos con el SmD
recombinante total y son aparentemente monoespecíficos al epítope
discontinuo.
En conclusión, el SmD1 natural contiene nueve
argininas dimetiladas en el término C y esta modificación desempeña
un papel crucial en la inmunoreactividad específica al SLE de los
antígenos SmD.
De acuerdo con su realización principal la
presente invención se refiere a péptidos que contienen residuos de
arginina que están seguidos inmediatamente por un residuo de
glicina, y donde al menos un residuo de arginina es metilado o
dimetilado en un aminogrupo terminal del grupo guanidino del residuo
de arginina, y donde esta metilación es un requisito previo para
que el pétptido sea reconocido por anticuerpos, que caracterizan
ciertas enfermedades. Los anticuerpos que están reaccionando
específicamente con este tipo de péptidos pueden ser encontrados en
los sueros de pacientes con lupus eritematoso sistémico.
Son descritos péptidos que imitan
inmunológicamente a los determinantes inmunogénicos de proteínas del
organismo reconocidas por el sistema inmune en pacientes que
padecen de lupus eritematoso. Un aspecto importante de tales
péptidos es el hecho de que las argininas seguidas por una glicina
son metiladas. Ha sido demostrado que un péptido (SmD1) contiene un
tramo de 9 residuos consecutivos de
arginina-glicina, donde cada arginina es metilada y
donde esa metilación es necesaria para el reconocimiento específico
por parte de los anticuerpos presentes en los sueros de pacientes
que padecen de lupus eritematoso. Ha sido demostrado que un segundo
péptido (SmD3) contiene residuos aislados de
arginina-glicina, donde la arginina es metilada.
También, ha sido demostrado que un tercer péptido (Sm69) contiene
varios dominios caracterizados por varios residuos de
arginina-glicina, donde la arginina es dimetilada.
Por lo tanto se prevé que la presencia de una arginina dimetilada,
seguida por una glicina puede ser suficiente para el reconocimiento
específico por parte de algunos anticuerpos presentes en los sueros
de pacientes con lupus eritematoso. Por consiguiente la invención se
refiere a aquellos péptidos donde al menos un residuo de arginina
es seguido por una glicina, donde el residuo de arginina es
metilado, y donde esta metilación es necesaria para el
reconocimiento específico por parte de anticuerpos.
El término "péptido" como es usado a lo
largo de la especificación y las reivindicaciones se refiere a un
polímero de aminoácidos y no se refiere a una longitud específica
del producto; por tanto, oligopéptidos, polipéptidos y proteínas
están incluidos dentro de la definición de "péptido". Este
término tampoco se refiere a o excluye las modificaciones
post-expresión del péptido, por ejemplo,
glicosilaciones, acetilaciones, fosforilaciones y similares.
Incluidos en la definición están, por ejemplo, péptidos que
contienen uno o más análogos de un aminoácido (incluyendo, por
ejemplo, aminoácidos no naturales, PNA, etc.), polipéptidos con
enlaces sustituidos, así como otras modificaciones conocidas en el
arte, tanto que ocurren de forma natural como que ocurren de forma
no natural.
Siempre que sea usada la expresión "péptido
que contiene menos de 50 aminoácidos", esta debería ser
interpretada en un sentido amplio, como un medio para circunscribir
una versión esencialmente truncada de las proteínas inmunoreactivas
completas que todavía comprende el dominio altamente reactivo
caracterizado por la presencia de residuos de arginina metilada.
Estos péptidos tienen una longitud de preferiblemente 40, 30, 25, 20
ó menos aminoácidos. La presente invención también se refiere a
péptidos que tienen una longitud de 50, 60 ó más aminoácidos sin
comprender toda la longitud de la proteína natural. Es por un
propósito práctico de la síntesis de péptidos que son definidos
péptidos que contienen menos de 50 aminoácidos.
Con "determinante inmunogénico" es
entendido, aquellos agrupamientos químicos comprendiendo una
secuencia de aminoácido primaria, y modificaciones secundarias de
los residuos de aminoácidos en cierta disposición tridimensional,
que en su conjunto determinan la reactividad específica del antígeno
completo para un anticuerpo desarrollado. Tal anticuerpo también
puede reconocer diferentes agrupamientos químicos, que son entonces
calificados para "imitar inmunológicamente" al determinante
inmunogénico.
Cuando se dice que las modificaciones
secundarias de un péptido son "necesarias" o "cruciales",
o son un "requisito previo" para reaccionar con un anticuerpo,
la ausencia de dichas modificaciones secundarias resultará en un
péptido cuya constante de disociación para la interacción con dicho
anticuerpo será al menos dos órdenes de magnitud mayor que la
constante de disociación para la interacción entre dicho anticuerpo
y el péptido donde están presentes las modificaciones secundarias,
preferiblemente tres órdenes de magnitud mayor, y más
preferiblemente cuatro órdenes de magnitud mayor.
El término "reacción crazada" se refiere a
la reacción de un antígeno con anticuerpos desarrollados contra
otro antígeno o anticuerpos que son encontrados en sueros de
pacientes con diferentes enfermedades.
El término "arginina metilada" como es
usado a lo largo de la especificación y las reivindicaciones
subsiguiente es usado en un sentido amplio y se refiere a cualquier
forma metilada. Más preferiblemente el término metilada se refiere
a una forma dimetilada de la arginina en la cual un grupo amino del
grupo guanidino del residuo de arginina es sustituido por uno o dos
grupos metilo. El término "metilación" se refiere al proceso
que resulta en dichas formas de arginina.
De acuerdo con una realización más específica la
presente invención se refiere a aquellos péptidos que contienen
residuos de arginina metilada que están precediendo residuos de
glicina, donde dicha metilación es crucial para la interacción de
gran afinidad con anticuerpos que son encontrados en sueros de
pacientes con enfermedades autoinmunes como el lupus eritematoso
sistémico.
La presente invención también se refiere a
aquellos péptidos donde los dobletes
arginina-glicina son repetidos, al menos una vez, y
más preferiblemente 3 ó 4 ó 5 ó 6 ó 7 u 8 veces, y aún más
preferiblemente 9 veces, como es el caso con el antígeno
antinuclear SmD-1 natural, y donde al menos un
residuo de arginina que precede un residuo de glicina es metilado,
preferiblemente dimetilado, con dicha metilación siendo necesaria
para la reacción específica con anticuerpos, por ejemplo con
anticuerpos encontrados en sueros de pacientes con SLE.
En una realización más específica, la presente
invención se refiere a un péptido que está caracterizado por la
secuencia de aminoácido GRGRGRGRGRGRGRGRGRG (SEQ ID NO 16)
donde al menos una y preferiblemente cada arginina es metilada,
preferiblemente dimetilada y aún más preferiblemente dimetilada de
una manera asimétrica, imitando así al determinante immunogénico
principal de la parte C terminal del antígeno antinuclear SmD1.
En una realización más específica, la presente
invención se refiere a un péptido que está caracterizado por la
secuencia de aminoácido
DVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR (SEQ ID NO 17) donde
al menos una y preferiblemente cada arginina que precede una
glicina, es metilada, preferiblemente dimetilada y aún más
preferiblemente dimetilada de una manera asimétrica, imitando así al
determinante inmunigénico principal de la parte C terminal del
antígeno antinuclear SmD1.
En una realización más específica, la presente
invención se refiere a un péptido que está caracterizado por la
secuencia del aminoácido ARGRGRGMGRG (SEQ ID NO 18) donde al
menos una y preferiblemente cada arginina es metilada,
preferiblemente dimetilada y aún más preferiblemente dimetilada de
una manera asimétrica, imitando así al determinante inmunigénico
principal de la parte C terminal del antígeno antinuclear SmD3.
En una realización más específica, la presente
invención también se refiere a un péptido que está caracterizado
por la secuencia del aminoácido KAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR (SEQ
ID NO 19) donde al menos una y preferiblemente cada arginina que
precede a una glicina es metilada, preferiblemente dimetilada y aún
más preferiblemente dimetilada de una manera asimétrica, imitando
así al determinante inmunigénico principal y sus bordes de la parte
C terminal del antígeno antinuclear SmD3.
De acuerdo con una realización más específica,
la presente invención también se refiere a un péptido que comprende
o consiste en la secuencia de aminoácidos
GGQQDRGGRGRGGGGGYNRSSGGYEPRGRGGGTGGTGGMGGSDRGG (SEQ ID
NO 20) o GGQQDRGGRGRGGGGGYN (SEQ ID NO 21) o
SGGYEPRGRGGGRGGRGGMGGSDRGG (SEQ ID NO 22) o
DFNRGGGNGRGGRGRGG (SEQ ID NO 23) o
DFNRGGGNGRGGRGRGGPMGRGGYGGGGS (SEQ ID NO 24) o
GGYDRGGYRGRGGDRGGFRGGRGGGDRGGFG (SEQ ID NO 25) o
GDDRRGRGGYDRGG (SEQ ID NO 26) o
GGYRGRGGDRGGFRGGRGGGDRGGFG (SEQ ID NO 27) donde al menos una
y preferiblemente cada arginina que precede a una glicina es
metilada, preferiblemente dimetilada y aún más preferiblemente
dimetilada de una manera asimétrica, imitando así al determinante
inmunogénico principal y a sus bordes de la parte C terminal del
antígeno antinuclear Sm69.
De acuerdo con una realización más específica,
la presente invención se refiere a un péptido que comprende o
consiste en la secuencia de aminoácidos DNHGRGRGRGRGRGGG
(SEQ DI NO 28) o GGRGRGGSGGRGRGG (SEQ DI NO 29) o
ERARGRGRGRGE (SEQ ID NO 30) donde al menos una y
preferiblemente cada arginina que precede a una glicina es metilada,
preferiblemente dimetilada y aún más preferiblemente dimetilada de
una manera asimétrica.
La presente invención también se refiere a
estructuras moleculares en las que al menos una parte representa un
péptido o anticuerpo como es definido anteriormente. Tales
estructuras moleculares pueden resultar de la fusión de péptidos de
la presente invención con péptidos y/o proteínas y/u otras moléculas
que están caracterizadas además porque las mismas específicamente
interactúan con otros péptidos y/o proteínas y/o estructuras
moleculares, permitiendo el marcado y/o la unión del polipéptido
y/o de la proteína fusionada a tipos específicos de tejidos o de
células o que permiten la purificación de dichas estructuras
moleculares debido a la presencia de por ejemplo 4, ó 5 ó 6
residuos consecutivos de histidina, o
- son citotóxicas para células T y/o células B
tales como la toxina del cólera, o
- permiten el etiquetado por medio de un
marcador radioactivo o fluorescente o enzimático o inmunogold.
También puede ser deseable en ciertas instancias
unir dos o más péptidos en una estructura péptida, o crear péptidos
ramificados. Una ventaja de esta disposición es bien conocida en el
arte y se refiere al diagnóstico. Cuando los anticuerpos son usados
en un ensayo para detectar los antígenos presentes, repeticiones
tándem o péptidos ramificados de los antígenos pueden aumentar la
cantidad de antígenos inmovilizados presentados a los anticuerpos e
incrementar así la sensibilidad del ensayo. La sensibilidad puede
ser aumentada exponencialmente cuando los antígenos inmovilizados
son usados junto con una concentración específica de esos antígenos
en una forma soluble, induciendo así la formación de
inmunoprecipitados antígenos entrelazados. Una segunda ventaja se
refiere a la terapia. La deposición de complejos autoinmunes
auto-antígenos en varios tejidos es un paso
importante hacia la adquisición de una condición patológica.
Usualmente es aceptado que la causa principal de dicha deposición
es la insuficiente depuración de la sangre por el hígado de los
complejos inmuno-antígenos debido al pequeño tamaño
de dichos complejos. La administración de las repeticiones tándem o
de las formas ramificadas de dichos péptidos podría aumentar el
tamaño de los complejos inmuno-antígenos formados, e
incrementar así la depuración y de esta forma disminuir la
deposición de dichos complejos.
La presente invención también se refiere a las
formas circularizadas de dichos péptidos, siendo la ventaja bien
conocida en el arte, y refiriéndose a una afinidad incrementada de
un péptido conformacionalmente limitado en comparación con las
formas enrolladas de manera más aleatoria de los péptidos
lineares.
Con el objetivo de ajustar las características
negativas eventuales de los péptidos reivindicados, tales como
degradación rápida, solubilidad, efectos citotóxicos y así
sucesivamente, la persona experta será capaz de diseñar
sustituciones de aminoácidos conservativas así como no
conservativas, o sustituciones con aminoácidos no naturales, PNA
etc… Usualmente estas serán responsables de menos del 35% de una
secuencia específica. Tales péptidos también incluyen péptidos con
enlaces sustituidos, así como otras modificaciones conocidas en el
arte, tanto que ocurren de forma natural como las que ocurren de
forma no natural. Puede ser adecuado en casos donde los péptidos
SmD u otros péptidos antigénicos de la presente invención son
altamente polimórficos, variar uno o más de los aminoácidos de
manera tal que se imiten mejor los diferentes epítopes de varias
cepas virales, o que sean reconocidos por anticuerpos en los sueros
de pacientes con SLE u otras enfermedades autoinmunes.
La presente invención también se refiere a
cualquiera de los análogos de los péptidos de la presente
invención.
El término "análogo" como es usado a lo
largo de la descripción o de las reivindicaciones para describir las
proteínas o los péptidos de la invención presente, incluye
cualquier proteína o péptido que tiene una secuencia de residuo de
aminoácido sustancialmente idéntica a una secuencia específicamente
mostrada aquí en la cual uno o más residuos han sido
conservativamente sustituidos con un residuo biológicamente
equivalente. Los ejemplos de sustituciones conservativas incluyen
la sustitución de residuo hidrofóbico tal como isoleucina, valina,
leucina o metionina por otro, la sustitución de un residuo
hidrofílico por otro tal como entre arginina y lisina, entre
glutamina y asparaginas, entre glicina y serina, la sustitución de
un residuo básico tal como lisina, arginina o histidina por otro, o
la sustitución de un residuo ácido, tal como ácido aspártico o ácido
glutámico por otro. Ejemplos de mutaciones permisibles de acuerdo
con la presente invención pueden ser encontrados en la Tabla 4.
Aminoácidos | \hskip4cm | Grupos sinónimos |
Ser (S) | Ser, Thr, Gly, Asn | |
Arg (R) | Arg, His, Lys, Glu, Gin | |
Leu (L) | Leu, Ile, Met, Phe, Val, Tyr | |
Pro (P) | Pro, Ala, Thr, Gly | |
Thr (T) | Thr, Pro, Ser, Ala, Gly, His, Gln | |
Ala (A) | Ala, Pro, Gly, Thr | |
Val (V) | Val, Met, Ile, Tyr, Phe, Leu, Val | |
Gly (G) | Gly, Ala, Thr, Pro, Ser | |
IIe (I) | Ile, Met, Leu, Phe, Val, Ile, Tyr | |
Phe (F) | Phe, Met, Tyr, Ile, Leu, Trp, Val | |
Tyr (Y) | Tyr, Phe, Trp, Met, Ile, Val, Leu | |
Cys (C) | Cys, Ser, Thr, Met | |
His (H) | His, Gln, Arg, Lys, Glu, Thr | |
Gln (Q) | Gln, Glu, His, Lys, Asn, Thr, Arg | |
Asn (N) | Asn, Asp, Ser, Gln | |
Lys (K) | Lys, Arg, Glu, Gln, His | |
Asp (D) | Asp, Asn, Glu, Gln | |
Glu (E) | Glu, Gln, Asp, Lys, Asn, His, Arg | |
Met (M) | Met, Ile, Leu, Phe, Val |
La frase "sustitución conservativa" también
incluye el uso de residuos derivados químicamente en lugar de un
residuo no derivado siempre que la proteína o el péptido resultante
sean biológicamente equivalentes a la proteína o el péptido de la
invención.
"Derivados químicos" se refiere a una
proteína o un péptido que tiene uno o más residuos derivados
químicamente por reacción de un grupo lateral funcional o de
péptidos con enlaces sustituidos, así como otras modificaciones
conocidas en el arte, tanto que ocurren de forma natural como las
que ocurren de forma no natural. Los ejemplos de moléculas
derivadas, incluyen pero no se limitan a, aquellas moléculas en las
que han sido derivados grupos aminos libres para formar
hidrocloruro de amina, grupos sulfonilo p-tolueno,
grupos carbonbenzoxi, grupos t-butiloxicarbonilo,
grupos cloroacetilo o grupos formilo. Los grupos carboxilo libres
pueden ser derivados para formar sales, ésteres de metilo y etilo y
otros tipos de ésteres o hidrazidas. Los grupos hidroxilo libres
pueden ser derivados para formar derivados O-acilo u
O-alquilo. El nitrógeno imidazol de histidina puede
ser derivado para formar N-imbencilhistidina.
También incluidos como derivados químicos están aquellas proteínas
o péptidos que contienen uno o más derivados de aminoácidos que
ocurren de forma natural de los veinte aminoácidos estándares. Por
ejemplo: 4-hidroxipolina puede ser sustituida por
prolina; 5-hidroxilisina puede ser sustituida por
lisina; 3-metilhistidina puede ser sustituida por
histidina; homoserina puede ser sustituida por serina; y carnitina
puede ser sustituida por lisina. Los péptidos de la presente
invención pueden incluir también cualquier proteína o péptido que
tiene una o más adiciones y/o supresiones o residuos relacionados
con la secuencia de un péptido cuya secuencia es mostrada aquí,
siempre que el péptido sea biológicamente equivalente a las
proteínas o los péptidos de la invención.
Además, grupos de aminoácidos o grupos químicos
adicionales pueden ser añadidos al término amino o carboxilo con el
fin de crear un "brazo de enlace" a través del cual los
péptidos pueden ser unidos convenientemente a un portador. El brazo
de enlace será al menos un aminoácido y podrán ser tantos como hasta
60 aminoácidos pero lo frecuente será de 1 a 10 aminoácidos. La
naturaleza de la unión a una fase sólida o a un portador puede ser
no covalente así como covalente. Los posibles arreglos de esta
naturaleza están bien descritos en el arte. Aminoácidos naturales
tales como la histidina, la cisteína, la lisina, la tirosina, el
ácido glutámico, o el ácido aspártico pueden ser añadidos al
término amino o al término carboxilo para proporcionar grupos
funcionales para el acoplamiento a una fase sólida o a un portador.
Sin embargo, otros grupos químicos tales como, por ejemplo, la
biotina y el ácido tioglicólico, pueden ser añadidos a los términos
lo cual dotará a los péptidos de las propiedades químicas o físicas
deseadas. Los términos de los péptidos también pueden ser
modificados, por ejemplo, mediante acetilación de N terminal o
amidación del terminal carboxy. En cada instancia, el péptido será
preferiblemente tan pequeño como sea posible mientras sigue
manteniendo sustancialmente toda la sensibilidad del péptido más
grande.
Los péptidos de la invención, y particularmente
los fragmentos, pueden ser preparados por síntesis química clásica.
La síntesis puede ser llevada a cabo en solución homogénea o en fase
sólida. Por ejemplo, la técnica de síntesis en solución homogénea
que puede ser usada es la descrita por Houbenweyl en el libro
titulado "Methode der organischen chemie" (Método de la
química orgánica) editado por E. Wunsh, vol. 15-I y
II. THIEME, Stuttgart 1974. Los polipéptidos de la invención
también pueden ser preparados en fase sólida de acuerdo con los
métodos descritos por Atherton y Shepard en su libro titulado
"Solid phase peptide synthesis" (IRL Press, Oxford, 1989). Las
formas metiladas de los péptidos reivindicados pueden ser obtenidas
sustituyendo los derivados de la arginina metilada por los
derivados de la arginina normal durante la síntesis química clásica,
o contactando los péptidos no metilados después de la síntesis con
una enzima de la proteína arginina metil-transferasa
de cualquier origen eucariótico.
Los polipétidos de acuerdo con esta invención
también pueden ser preparados por medio de técnicas de ADN
recombinante como fue descrito por Maniatis y otros, Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, Nueva York, Cold Spring Harbor
Laboratory, 1982) mediante la inserción de una secuencia de ácido
polinucleico que codifica los péptidos reivindicados o parte de los
péptidos reivindicados en un vector apropiado y que transforma un
hospedero adecuado con dicho vector. Este vector de expresión
recombinante comprende un ácido polinucleico o una parte del mismo
como es definido anteriormente, enlazado operativamente a elementos
de control de transcripción y traducción procariota, eucariota o
viral. Además esta secuencia puede estar enlazada operativamente a
secuencias que permiten la secreción de los péptidos reivindicados.
El término "vector" puede comprender un plásmido, un cósmido,
un fago o un virus o un organismo transgénico. Particularmente
útiles pueden ser el BCG o los vectores adenovirales, así como los
virus recombinantes avipox.
Los péptidos recombinantes pueden ser metilados
in vitro, contactando los péptidos expresados y/u segregados
con una proteína arginina metil-transferasa de
cualquier origen eucariótico, o in vivo seleccionando el
hospedero apropiado, como levadura, o cualquier célula eucariótica,
y más preferiblemente usando el sistema de transformación del
báculovirus.
La presente invención no excluye la opción de
usar proteínas adicionales como las proteínas BTG1 y TIS21 que han
demostrado ser esenciales para la metilación in vivo (como
una proteína co-expresada) o ser requeridas para la
metilación óptima in vitro (Lin y otros, 1996), o
cualesquiera otras proteínas, péptidos o sustancias químicas que
pueden optimizar el nivel de metilación.
También cualquiera de los métodos de
purificación conocidos para los péptidos recombinantes puede ser
usados para la producción de los péptidos recombinantes de la
presente invención.
La presente invención también se refiere a un
vector de expresión recombinante que comprende un ácido polinucleico
o una parte del mismo como fue definido anteriormente, enlazado
operativamente a elementos de control de transcripción y traducción
procariota, eucariota o viral.
En general, dicho vector recombinante
comprenderá una secuencia del vector, una secuencia del promotor
procariota o eucariota o viral apropiada seguida por una secuencia
de nucleótidos que codifica un péptido como fue definido
anteriormente, con dicho vector recombinante permitiendo la
expresión y/o secreción de uno cualquiera de los polipéptidos como
fue definido anteriormente en un hospedero procariota, o eucariota o
en mamíferos vivos al ser inyectado como ADN desnudo.
También cualquiera de los métodos de
purificación conocidos para las proteínas recombinantes puede ser
utilizado para la producción de los polipéptidos recombinantes de
la presente invención.
El término "vector" puede comprender un
plásmido, un cósmido, un fago, o un virus o un animal transgénico.
Particularmente útil para el desarrollo de vacunas puede ser el BCG
o los vectores adenovirales, así como virus recombinantes de
avipox.
La presente invención también se refiere a un
método para la producción de polipétidos recombinantes como fue
definido anteriormente, comprendiendo:
- -
- Transformación de un hospedero celular apropiado con un vector recombinante, en el cual un ácido polinucleico o parte del mismo de acuerdo a como fue definido anteriormente ha sido insertado bajo el control de elementos reguladores apropiados,
- -
- cultivar dicho hospedero celular transformado bajo condiciones que permitan la expresión y/o secreción de dicha inserción, y,
- -
- cosechar dicho polipéptido.
El término "expresado de manera
recombinante" usado en el contexto de la presente invención se
refiere al hecho de que las proteínas de la presente invención son
producidas por métodos de expresión recombinante siendo este en
procariotas, o eucariotas inferiores o superiores como será abordado
en detalles más adelante.
El término "eucariota inferior" se refiere
a células hospederas como la levadura, los hongos y similares. Las
eucariotas inferiores son por lo general (pero no necesariamente)
unicelulares. Las eucariotas inferiores preferidas son las
levaduras, particularmente especies dentro de Saccharomyces,
Schizosaccharomyces, Kluveromyces, Pichia (por ejemplo,
Pichia pastoris), Hansenula (por ejemplo Hansenula
polimorfa), Yarowia, Schwaniomyces, Schizosaccharomyces,
Zygosaccharomyces y similares. Saccharomyces cerevisiae, S.
carlsbergensis y K. lactis son los hospederos de
levaduras más comúnmente utilizados, y son hospederos fúngicos
convenientes.
El término "procariotas" se refiere a los
hospederos tales como E. coli, Lactobacillus, Lactococcus,
Salmonella, Streptococcus, Bacillus subtilis o
Streptomyces. Estos hospederos también están contemplados
dentro de la presente invención.
El término "eucariota superior" se refiere
a células hospederas derivadas de animales superiores, tales como
mamíferos, reptiles, insectos, y similares. Las células hospederas
eucariotas superiores preferidas actualmente son derivadas del
hámster chino (por ejemplo CHO), del mono (por ejemplo COS y células
Vero), del riñón del hámster recién nacido (BHK), del riñón de
cerdo (PK15), de las células 13 de riñón de conejo (K13), de la
línea celular 143 B del osteosarcoma humano, de la línea celular
humana HeLa y de las líneas celulares del hepatoma humano como Hep
G2, y de las líneas celulares de insectos (por ejemplo Spodoptera
frugiperda). Las células hospederas pueden ser proporcionadas
en cultivos en frascos o suspensión, cultivos de tejido, cultivos
de órganos y similares. Alternativamente las células hospederas
pueden ser también animales transgénicos.
El término "polinucleotido recombinante" o
"ácido nucleico" concibe un polinucleotido o ácido nucleico de
origen genómico, ADNc, semisintético, o sintético que, en virtud de
su origen o manipulación: (1) no está asociado a todo o a una parte
de un polinucleotido al cual está asociado en la naturaleza, (2)
está enlazado a un polinucleotido que no sea al que está enlazado
en la naturaleza, o (3) no ocurre en la naturaleza.
El término "células hospederas
recombinantes", "células hospederas", "células",
"líneas celulares", "cultivos celulares", y otros tales
términos que denotan microorganismos o líneas celulares eucariotas
superiores cultivadas como entidades unicelulares se refiere a
células que pueden ser o han sido, usadas como recipientes para un
vector recombinante u otros polinucleotidos de transferencia, e
incluye la descendencia de la célula original que ha sido
transfectada. Es entendido que la descendencia de una célula
parental simple puede no ser necesariamente totalmente idéntica en
morfología o en el complemento genómico o del ADN total al genitor
original debido a mutación natural, accidental o deliberada.
El término "replicón" es cualquier elemento
genético, por ejemplo, un plásmido, un cromosoma, un virus, un
cósmido, etc., que se comporta como una unidad autónoma de
replicación de polinucleótidos dentro de una célula; es decir,
capaz de replicarse por su propia cuenta.
El término "vector" es un replicón que
comprende además secuencias que proporcionan replicación y/o
expresión de un marco de lectura abierta deseado.
El término "secuencia de control" se
refiere a secuencias de polinucleótidos que son necesarias para
efectuar la expresión de las secuencias codificadoras a las cuales
están ligadas. La naturaleza de tales secuencias de control
difieren en dependencia del organismo hospedero; en procariotas,
tales secuencias de control incluyen usualmente el promotor, el
sitio de unión del ribosoma, los sitios de empalme y los
terminadores; en eucariotas, usualmente, tales secuencias de
control incluyen los promotores, los sitios de empalme, los
terminadores y, en algunos casos, los potenciadores. El término
"secuencias de control" está concebido para incluir, como
mínimo, todos los componentes cuya presencia es necesaria para la
expresión, y puede incluir también componentes adicionales cuya
presencia es ventajosa, por ejemplo, secuencias líderes que rigen la
secreción.
El término "promotor" es una secuencia de
nucleótidos que está compuesta por secuencias de consenso que
permiten la unión de la ARN polimerasa con el ADN molde de manera
tal que la producción de mARN se inicie en el sitio normal de
iniciación de la transcripción para el gen estructural
adyacente.
La expresión "operativamente enlazado" se
refiere a una yuxtaposición donde los componentes así descritos
están en una relación que les permite funcionar en su manera
prevista. Una secuencia de control "operativamente enlazada" a
una secuencia codificadora esta ligada de tal forma que la expresión
de la secuencia codificadora es lograda bajo condiciones
compatibles con las secuencias de control.
Los ácidos polinucleicos que codifican los
péptidos de la presente invención y que están insertados en la
secuencia del vector pueden ser unidos a una secuencia señal. Dicha
secuencia señal puede ser la de cualquier fuente, por ejemplo la
secuencia líder de la IgG o del activador plasminógeno tisular (tpa)
para la expresión en células de mamíferos, o la secuencia del
factor de apareamiento \alpha para la expresión dentro de células
de levadura.
Una variedad de vectores puede ser usada para
obtener los péptidos de la presente invención. Las eucariotas
inferiores como las levaduras y las cepas mutantes de glicosilación
son normalmente transformadas con plásmidos, o son transformadas
con un virus recombinante. Los vectores pueden replicarse dentro del
hospedero independientemente, o pueden integrarse al genoma de la
célula hospedera.
Las eucariotas superiores pueden ser
transformadas con vectores, o pueden ser infectadas con un virus
recombinante, por ejemplo un virus recombinante de vaccinia. Las
técnicas y los vectores para la inserción de ADN foráneo dentro del
virus de la vaccinia son bien conocidos en el arte, y utilizan, por
ejemplo recombinación homóloga. Una amplia variedad de secuencias
promotoras virales, posiblemente secuencias terminadoras y
secuencias de adición poli(A), posiblemente secuencias
potenciadoras y posiblemente secuencias amplificadoras, todas
requeridas para la expresión de mamíferos, están disponibles en el
arte. La vaccinia es particularmente preferida debido a que la
vaccinia detiene la expresión de las proteínas de la célula
hospedera. La vaccinia es también muy preferida ya que permite la
expresión de los péptidos f.i. de la presente invención en células o
individuos que están inmunizados con el virus vivo de la vaccinia
recombinante. Para la vacunación de humanos el Virus Modificado de
Ankara (AMV) y el avipox son vectores particularmente útiles.
También son conocidos vectores de transferencia
de expresión de insectos derivados del báculovirus virus de la
polihedrosis nuclear de Autographa californica (AcNPV), que
es un vector de expresión viral colaborador independiente. Los
vectores de expresión de este sistema usan usualmente el promotor
fuerte del gen de la polihedrina viral para activar la expresión de
genes heterólogos. Diferentes vectores así como métodos para la
introducción del ADN heterólogo dentro del sitio deseado del
báculovirus están a disposición del experto en el arte para la
expresión del báculovirus. También son conocidas en el arte
diferentes señales para la modificación
post-translacional reconocida por las células de
insectos.
La presente invención también se refiere a una
célula hospedera transformada con un vector recombinante como fue
definido anteriormente.
La presente invención también se refiere a
anticuerpos que son desarrollados específicamente contra los
péptidos de la presente invención, preferiblemente contra aquellos
péptidos donde las argininas que preceden un residuo de glicina son
metiladas. Estos anticuerpos pueden ser policlonales o monoclonales.
Para preparar anticuerpos un animal hospedero es inmunizado usando
los péptidos de la presente invención en un portador
farmacéuticamente aceptable, donde al menos una de las argininas
que precede al residuo de glicina de dichos péptidos es metilada.
Los portadores farmacéuticamente aceptables incluyen cualquier
portador que no induzca por sí mismo la producción de anticuerpos
nocivos para el individuo que recibe la composición. Los portadores
adecuados son por lo general macromoléculas grandes, metabolizadas
lentamente tales como las proteínas, los polisacáridos, los ácidos
polilácticos, los ácidos poliglicólicos, los aminoácidos
poliméricos, los aminoácidos copoliméros; y partículas inactivas de
virus. Estos portadores son bien conocidos por aquellos con
habilidades ordinarias en el arte.
Los adyuvantes preferidos para potenciar la
efectividad de la composición incluyen, pero no se limitan a:
hidróxido de aluminio (alum),
N-acetil-muramil-L-teronil-D-isoglutamina
(thr-MDP) como se encuentra en la Patente U.S. No.
4,606,918,
N-acetil-normuramil-L-alanil-D-isoglutamina
(nor-MDP),
N-acetilmuramil-L-analil-D-isoglutaminil-L-alanina-2-(1'-2'-dipalmitoil-sn-glicero-3-hidroxifosforiloxi)-etilamina
(MTP-PE) y RIBI, que contiene tres componentes
extraídos de bacterias, monofosforil lípido A, dimicolato de
trehalosa, y esqueleto de pared celular (MPL+TDM+CWS) en una
emulsión escualeno/Tween 80 al 2%. Cualquiera de los 3 componentes
MPL, TDM o CWS también puede ser usado solo o combinado 2 por 2.
Adicionalmente, pueden ser usados adyuvantes como Stimulon
(Cambridge Bioscience, Worcester, MA) o SAF-1
(Syntex). Además, el Adyuvante de Freund Completo (CFA) y el
Adyuvante de Freund Incompleto (IFA) pueden ser usados para
aplicaciones no humanas y con fines de investigación.
Las composiciones inmunogénicas por lo general
contendrán vehículos farmacéuticamente aceptables, tales como agua,
solución salina, glicerina, etanol, etc. Adicionalmente, sustancias
auxiliares, tales como agentes humectantes o emulsionantes,
sustancias amortiguadoras de pH, preservantes, y similares, pueden
ser incluidos en tales vehículos.
Por lo general, las composiciones inmunogénicas
son preparadas como inyectables, ya sea como soluciones líquidas o
como suspensiones; también pueden ser preparadas formas sólidas
adecuadas para la solución en, o la suspensión en, vehículos
líquidos antes de la inyección. La preparación también puede ser
emulsionada o encapsulada en liposomas para potenciar el efecto
adyuvante. Las proteínas también pueden ser incorporadas a Complejos
de Estimulación Inmune conjuntamente con saponinas, por ejemplo
Quil A (ISCOMS).
Las composiciones inmunogénicas usadas para
desarrollar los anticuerpos comprenden una "cantidad
suficiente" o "una cantidad inmunológicamente efectiva" de
los péptidos de la presente invención, así como cualquier otro de
los componentes mencionados anteriormente, según sea necesario.
"Cantidad inmunológicamente efectiva", significa que la
administración de esa cantidad a un individuo, ya sea en una dosis
única o como parte de una serie, es efectiva para provocar una
respuesta inmune y para desarrollar los anticuerpos, como fue
definido anteriormente. Esta cantidad varía en dependencia de la
salud y la condición física del individuo, el grupo taxonómico del
individuo a ser tratado (por ejemplo primate no humano, primate,
conejo, etc.), la capacidad del sistema inmunológico de cada
individuo para sintetizar los anticuerpos, la inmunogenicidad del
péptido antigénico, y su modo de administración, y otros factores
relevantes. Es esperado que la cantidad esté presente en un rango
relativamente amplio que pueda ser determinado a través de ensayos
de rutina. Usualmente, la cantidad variará de 0.01 a 1000
\mug/dosis, más particularmente de 0.1 a 100 \mug/dosis.
Las composiciones inmunogénicas son
convencionalmente administradas por vía parenteral, usualmente por
inyección, por ejemplo, de manera subcutánea o intramuscular. Las
formulaciones adicionales adecuadas para otros métodos de
administración incluyen formulaciones orales y supositorios. El
tratamiento de dosificación puede ser un cronograma de dosis única
o un cronograma de dosis múltiples. La vacuna puede ser administrada
junto con otros agentes inmunoreguladores.
El suero o plasma hospedero es recolectado
siguiendo un intervalo de tiempo apropiado para proporcionar una
composición que comprende anticuerpos que reaccionan con los
péptidos de la presente invención. La fracción de gammaglobulina o
los anticuerpos IgG pueden ser obtenidos, por ejemplo, mediante el
uso de sulfato de amonio saturado o DEAE Sephadex, u otras técnicas
conocidas por aquellos expertos en el arte. Los anticuerpos están
sustancialmente libres de muchos de los efectos colaterales adversos
que pueden estar asociados a otros agentes antivirales tales como
medicamentos, para el tratamiento de la mononucleosis infecciosa,
crónica, o recurrente. Tales anticuerpos también pueden ser usados
para diagnosticar ciertas enfermedades, tales como linfoma de
Burkitt, donde ha estado implicado el virus
Epstein-Barr.
El término "inmunogénico" se refiere a la
capacidad de una sustancia para provocar una respuesta humoral y/o
celular, ya sea sola o al ser enlazada a un portador, en presencia o
ausencia de un adyuvante.
Los anticuerpos de la invención reivindicada
también pueden ser monoclonales que son preparados con dicho
anticuerpo siendo específicamente reactivos con cualquiera de dichos
péptidos, y con dicho anticuerpo siendo preferiblemente un
anticuerpo monoclonal.
Los anticuerpos monoclonales de la invención
pueden ser producidos por cualquier hibridoma responsable de ser
formado de acuerdo con los métodos clásicos a partir de las células
esplénicas de un animal, particularmente de un ratón o una rata,
inmunizado contra los péptidos reivindicados de la presente
invención por una parte, y de células de una línea celular de
mieloma por otra, y a ser seleccionada por la capacidad del
hibridoma de producir los anticuerpos monoclonales que reconocen
las formas metiladas de los péptidos que han sido inicialmente
usados para la inmunización de los animales.
Los anticuerpos involucrados en la invención
pueden ser identificados con una etiqueta apropiada del tipo
enzimático, fluorescente, o radioactivo.
Los anticuerpos monoclonales de acuerdo con esta
realización preferida de la invención pueden ser versiones
humanizadas de anticuerpos monoclonales de ratón hechas por medio de
tecnología de ADN recombinante, a partir de partes del ratón y/o de
secuencias de ADN genómico humano que codifica para las cadenas H y
L o a partir de clones de ADNc que codifican para las cadenas H y
L.
Alternativamente los anticuerpos monoclonales de
acuerdo con esta realización preferida de la invención pueden ser
anticuerpos monoclonales humanos. Estos anticuerpos de acuerdo con
la presente realización de la invención también pueden ser
derivados de linfoncitos de sangre periférica humana de pacientes
con SLE o cualquier otra enfermedad autoinmune o con mononucleosis
infecciosa, o recurrente o crónica. Tales anticuerpos monoclonales
humanos son preparados, por ejemplo, mediante repoblación de
linfoncitos de la sangre periférica humana (PBL) en ratones con
inmunodeficiencia combinada severa (SCID) (para una consulta
reciente, vea Duchosal y otros, 1992) o mediante exploración por
selección de linfocitos transformados del virus Epstein Barr de
individuos infectados o vacunados para detectar la presencia de
células B reactivas por medio de los antígenos de la presente
invención.
La presente invención también se refiere a los
anticuerpos anti-idiotipo que son desarrollados a
partir de la inmunización con un anticuerpo como fue definido
anteriormente y que específicamente reacciona con dichos
anticuerpos, imitando así los péptidos de la presente invención. Los
métodos para la producción de los anticuerpos monoclonales
anti-idiotipo, que son bien conocidos en el arte,
han sido descritos, por ejemplo, por Gheuens y MacFarlin
(1982).
La presente invención también se refiere a
versiones truncadas o versiones de una cadena simple de los
anticuerpos y anticuerpos anti-idiotipos como fue
definido anteriormente, que han conservado su especificidad original
para reaccionar con los antígenos.
\newpage
La presente invención también se refiere a
proteínas o péptidos que imitan los anticuerpos como fue definido
anteriormente tales como microproteínas que pueden ser obtenidas por
despliegue en fago o el dominio altamente variable de un anticuerpo
recombinante como el obtenido por exploración por selección después
de la clonación del repertorio.
La presente invención también se refiere a un
método para detectar anticuerpos que específicamente reaccionan con
los péptidos o anticuerpos anti-idiotipo de la
presente invención, presentes en una muestra biológica, que
comprende:
- (i)
- contactar la muestra biológica a ser analizada para detectar la presencia de dichos anticuerpos con un péptido o anticuerpo anti-idiotipo como es definido anteriormente,
- (ii)
- detectar el complejo inmunológico formado entre dichos anticuerpos y dicho péptido o anticuerpo anti-idiotipo.
La presente invención también se refiere a un
método inverso para detectar los péptidos y/o los anticuerpos
anti-idiotipo de la presente invención con
anticuerpos presentes en una muestra biológica que específicamente
reacciona con formas metiladas de dichos péptidos y/o anticuerpos
anti-idiotipo que imitan tales péptidos, que
comprende:
- (i)
- contactar la muestra biológica a ser analizada para detectar la presencia de dichos péptidos o anticuerpos anti-idiotipo con los anticuerpos como fue definido anteriormente,
- (ii)
- detectar el complejo inmunológico formado entre dichos anticuerpos y dicho péptido o anticuerpo anti-idiotipo.
Los métodos como fue definido anteriormente,
pueden ser usados en el diagnóstico de enfermedades autoinmunes
como un lupus eritematoso sistémico.
De acuerdo con una realización específica, la
presente invención se refiere al desarrollo de una técnica de
diagnóstico que permite la diferenciación entre aquellas
enfermedades autoinmunes en las que los anticuerpos característicos
a menudo reaccionan de forma cruzada con el mismo antígeno,
resultado así en un diagnóstico difícil y lento. Tal técnica de
diagnóstico puede ser obtenida mediante el uso simultáneo de
diferentes antígenos, metilados y no metilados, y al menos dos
epítopes, una forma metilada y una no metilada de cualquiera de los
anticuerpos anti-idiotipos y/o péptidos
reivindicados de la presente invención.
La presente invención también se refiere a un
kit diagnóstico para ser usado en la detección de la presencia de
dichos anticuerpos, dicho kit comprendiendo al menos un péptido o un
anticuerpo anti-idiotipo o una microproteína como
fue definido anteriormente, con dicho péptido o anticuerpo
anti-idiotipo o microproteína estando
preferiblemente unido a un soporte sólido.
La presente invención también se refiere a un
kit diagnóstico para determinar el tipo de enfermedad autoinmune,
dicho kit comprendiendo al menos un péptido o un anticuerpo
anti-idiotipo o una microproteína como fue definido
anteriormente, con dicho péptido o anticuerpo
anti-idiotipo o microproteína estando
preferiblemente unido a un soporte sólido.
La presente invención también se refiere a un
kit diagnóstico como fue definido anteriormente, dicho kit
comprendiendo un rango de dichos péptidos y/o anticuerpos
anti-idiotipo o microproteína que están unidos a
ubicaciones específicas en un substrato sólido.
La presente invención también se refiere a un
kit diagnóstico como fue definido anteriormente, donde dicho
soporte sólido es una banda membranosa y dichos péptidos y/o
anticuerpos anti-idiotipo o microproteínas son
acoplados a la membrana en forma de líneas paralelas.
Los métodos de inmunoensayo de acuerdo con la
presente invención pueden utilizar por ejemplo antígenos
oligoméricos simples o específicos, antígenos diméricos, así como
combinaciones de antígenos oligoméricos simples o específicos. Los
péptidos de la presente invención pueden ser empleados virtualmente
en cualquier formato de ensayo que emplee un antígeno conocido para
detectar anticuerpos que caracterizan una cierta enfermedad o
infección. Un rasgo común de todos esos ensayos es que el péptido o
el anticuerpo anti-idiotipo o la microproteína
antigénicos son contactados con el componente corporal que se
sospecha que contiene los anticuerpos en condiciones que permiten
al antígeno unirse a cualquier anticuerpo presente en el componente.
Tales condiciones usualmente serán la temperatura fisiológica, el
pH y la resistencia iónica usando un exceso de antígeno. La
incubación del antígeno con el espécimen es seguida por la
detección de complejos inmunes compuestos del antígeno.
El diseño de los inmunoensayos está sujeto a un
gran número de variación, y muchos formatos son conocidos en el
arte. Los protocolos pueden, por ejemplo, usar soportes sólidos, o
inmunoprecipitación. La mayoría de los ensayos involucran el uso de
anticuerpos o péptidos etiquetados; las etiquetas pueden ser, por
ejemplo, moléculas enzimáticas, fluorescentes, quimioluminiscentes,
radioactivas, o coloreadas. También son conocidos ensayos que
amplifican las señales a partir del complejo inmune; ejemplos de los
cuales son los ensayos que utilizan biotina y avidina o
estreptavidina, e inmunoensayos etiquetados con enzimas y mediados,
tales como los ensayos ELISA.
El inmunoensayo puede ser, sin limitación, en un
formato heterogéneo u homogéneo, y de un tipo estándar o
competitivo. En un formato heterogéneo, el péptido o anticuerpo
anti-idiotipo o la microproteína está usualmente
unido a un soporte o matriz sólida para facilitar la separación de
la muestra del péptido o del anticuerpo
anti-idiotipo o de la microproteína después de la
incubación. Ejemplos de soportes sólidos que pueden ser usados son
la nitrocelulosa (por ejemplo, en forma de membrana o de pozo de
microtítulo), el cloruro de polivinilo (por ejemplo, en hojas o
pozos de microtítulo), el látex de poliestireno (por ejemplo, en
perlas o placas de microtítulo, fluoruro de polivinilo (conocido
como Immunolon^{TM}), el papel diazotado, las membranas de
nailon, las perlas activadas, y las perlas de Proteína A. Por
ejemplo, placas de microtítulo Dynatech Immunolon^{TM} 1 o
Immunolon^{TM} 2 o perlas de poliestireno de 0.25 pulgadas (Bolas
de Plástico de Precisión) pueden ser usadas en el formato
heterogéneo. El soporte sólido que contiene los péptidos antigénicos
o los anticuerpos anti-idiotipo o las
microproteínas es usualmente lavado después de separarlo de la
muestra de prueba, y antes de detectar los anticuerpos unidos.
Ambos formatos estándar y competitivo son conocidos en el arte.
En un formato homogéneo, la muestra de prueba es
incubada con la combinación de antígenos en solución. Por ejemplo,
esto puede ser bajo condiciones que precipitarán cualquiera de los
complejos antígeno-anticuerpo o anticuerpo
anti-idiotipo-anticuerpo o
microproteína-anticuerpo que son formados. Ambos
formatos estándar y competitivo para esos ensayos son conocidos en
el arte. Por ejemplo, para caracterizar el SLE o lupus eritematoso
sistémico en el formato estándar, es monitoreada directamente la
cantidad de anticuerpos SLE en los complejos
antígeno-anticuerpo. Esto puede ser realizado
determinando si un segundo tipo de anticuerpos etiquetados
anti-xenogenéticos (por ejemplo
anti-humano) que reconocen un epítope en el primer
tipo de anticuerpos SLE se unirá debido a la formación del
complejo. En un formato competitivo, la cantidad de anticuerpos SLE
en la muestra es deducida monitoreando el efecto competitivo en la
unión de una cantidad conocida del anticuerpo etiquetado (u otro
ligando que compite) en el complejo. La detección de los anticuerpos
SLE para el diagnóstico del SLE es usada como una ilustración.
Siempre que el término "anticuerpos SLE" es empleado a lo largo
de la descripción, esto no debería ser considerado como limitante.
De la misma forma, las otras enfermedades autoinmunes son
diagnosticadas mediante la detección de otros anticuerpos, y la
mononucleosis es diagnosticada mediante la detección de los
anticuerpos anti virus Epstein-Barr.
Los complejos formados que comprenden el
anticuerpo SLE (o en el caso de ensayos competitivos, la cantidad
de anticuerpos que compiten) son detectados por cualquiera de un
número de técnicas conocidas, dependiendo del formato. Por ejemplo,
los anticuerpos SLE no etiquetados en el complejo pueden ser
detectados usando un conjugado de anti-Ig
xenogenético acomplejado con una etiqueta (por ejemplo una etiqueta
de enzima).
En un formato de ensayo de inmunoprecipitación o
aglutinación la reacción entre los antígenos SLE y el anticuerpo
SLE forman una red que se precipita de la solución o suspensión y
forma una capa o película visible de precipitado. Si no está
presente el anticuerpo SLE en el espécimen de prueba, no se forma
ningún precipitado visible.
Actualmente, existen tres tipos específicos de
ensayos de aglutinación de partículas (PA). Estos ensayos son
usados para la detección de anticuerpos para varios antígenos al ser
impregnados en un soporte. Un tipo de este ensayo es el ensayo de
hemoaglutinación usando células de sangre roja (RBCs) que son
sintetizadas adsorbiendo pasivamente el antígeno (o el anticuerpo)
hacia la RBC. La adición de anticuerpos antígenos específicos
presentes en el componente corporal, si lo hay, provoca que las RBCs
impregnadas con el antígeno purificado se aglutinen.
Para eliminar reacciones potenciales no
específicas en el ensayo de la hemoaglutinación, pueden ser usados
dos portadores artificiales en lugar de la RBC en la PA. Los más
comunes de estos son las partículas de látex. Sin embargo, también
pueden ser usadas partículas de gelatina. Los ensayos utilizando
cualquiera de estos portadores están basados en la aglutinación
pasiva de las partículas impregnadas con antígenos purificados.
Los péptidos antigénicos de la presente
invención usualmente serán presentados en forma de un kit para ser
usado en estos inmunoensayos. El kit normalmente contendrá en
recipientes separados el péptido antigénico o el anticuerpo
anti-idiotipo, las formulaciones (positivas y/o
negativas) del anticuerpo control, el anticuerpo etiquetado cuando
el formato de ensayo requiere el mismo y los reactivos que generan
la señal (por ejemplo sustrato de enzima) si la etiqueta no genera
directamente una señal. El péptido antigénico o el anticuerpo
anti-idiotipo puede estar ya unido a la matriz
sólida o separado con reactivos para unirlo a la matriz.
Instrucciones (por ejemplo, escritas, grabadas,
CD-ROM, etc.) para llevar a cabo el ensayo
normalmente serán incluidas en el kit.
La fase sólida seleccionada puede incluir perlas
poliméricas o de vidrio, nitrocelulosa, micropartículas, micropozos
de una bandeja de reacción, tubos de ensayo y perlas magnéticas. El
compuesto que genera la señal puede incluir una enzima, un compuesto
luminiscente, un cromógeno, un elemento radioactivo y un compuesto
quimioluminiscente. Los ejemplos de enzimas incluyen la fosfatasa
alcalina, la peroxidasa del rábano y la beta galactosidasa. Los
ejemplos de compuestos potenciadores incluyen la biotina, la
antibiotina y la avidina. Los ejemplos compuestos potenciadores que
unen miembros incluyen la biotina, la antibiotina y la avidina.
Para bloquear los efectos de las sustancias similares al factor
reumatoide, la muestra de prueba está sujeta a condiciones
suficientes para bloquear el efecto de las sustancias similares al
factor reumatoide. Estas condiciones comprenden contactar la muestra
de prueba con una cantidad de por ejemplo anti-IgG
humana para formar una mezcla, e incubar la mezcla durante un tiempo
y en condiciones suficientes para formar un producto de mezcla de
reacción sustancialmente libre de la sustancia similar al factor
reumatoide.
La presente invención se refiere particularmente
a un formato de inmunoensayo en el que varios péptidos de la
invención son acoplados a una membrana en forma de líneas paralelas.
Este formato de ensayo es particularmente ventajoso para permitir
una discriminación entre las enfermedades autoinmunes separadas. Los
antígenos que son inmovilizados en la membrana estarán
preferiblemente en forma metilada y no metilada de
poli(Arg-Gly), combinada con SmD1 y/o SmD3
y/o Sm69 naturales y así metiladas, y SmD1 y/o SmD3 y/o Sm69
recombinante no metilada.
Figura 1: Perfil HPLC del hidrolizado
Endo-Lys.
Figura 2: Immunopunto de fracciones de HPLC con
sueros de 5 pacientes y 1 suero de control.
Figura 3: Immunopunto del péptido C terminal
(C-term mod) y sin dimetilarginina
(C-term nt mod), y de la proteína (báculo SmD, coli
SmD) recombinante y natural (nativa). Las bandas fueron incubadas
con suero anti-SmD (+) positivo y un suero de
control (-).El teñido de la proteína total (Aurodina) fue realizada
en la tercera banda.
Figura 4: LIA con el péptido C terminal (dimetil
arginina) modificado (fracción 15 del hidrolizado
EndoLys-C, línea 1 en la banda), y el péptido C
terminal no modificado (fracción 8 del hidrolizado
EndoLys-C, línea 2 en la banda), ambos aplicados en
iguales cantidades (60 ng). Adicionalmente, 7, 15 y 30 ng del SmD1
recombinante de células de insectos infectados con báculovirus o
E. coli (resp. 4,5,6 y 7,8,9) así como 15 y 30 ng de una
mezcla del SmD (nativo) purificado en gel fueron aplicados a las
bandas. El teñido de la proteína total (Aurodina) fue realizada en
la primera banda. Las bandas fueron incubadas con (A) un panel de
sueros anti-SmD positivos seleccionados por
INNO-LIA ANA a partir de sueros ANF positivos, (B)
un panel de sueros anti-SmD positivos seleccionados
por INNO-LIA ANA a partir de un cohorte de pacientes
de SLE diagnosticados de acuerdo con los criterios de la ACR, (C)
sueros seleccionados a partir de pacientes MCTD (panel de control) y
(D) sueros seleccionados a partir de sueros ANF negativos (panel de
control). No fue observada reactividad con sueros de los paneles de
control.
Sueros Sm positivos fueron obtenidos del
Departamento de Reumatología de la clínica de la Universidad en
Ghent, Bélgica (Dr. De Keyser y Dr. Veys). Esos sueros fueron
identificados mediante la técnica de blot por difusión en microgel
(MDB) usando extracto del timo de conejo (Zeus, Bayer, Raritan, USA)
como sustrato (De Keyser y otros, 1990). La Sm positividad fue
definida por una inmunoreacción positiva en la misma posición de
peso molecular (aproximadamente 14 kDa) que el suero de referencia
\alpha-SmD.
Las partículas de snRNP son purificadas a partir
de extractos nucleares de HeLa mediante cromatografía de
inmuno-afinidad (R. Lührmann, Marburg,
Alemania).
Las partículas de snRNP son recibidas en 20 mM
Hepes/KOH, pH 7.9 - 250 a 420 mM de NaCl - glicerol
5% - MgCl_{2} 1.5 M - 0.2 mM de EDTA - 0.5 mM de DTE - 0.5 mM de PMSF. El SmD es aislado a partir de esas partículas como fue descrito por Lehmeier y otros (1990) con algunas modificaciones. De forma resumida, en un primer paso, los snRNP son concentrados en un concentrador centricon (30K centriperp, Amicon) para un volumen total de 5-10 mg/ml. Posteriormente, los snRNP son disueltos en tampón de muestra Laemmli, separados en un gel de preparación Laemmli al 15% (1 cm de grosor, 14 cm de pozo; carga de proteína 3 mg) y teñido con Azul Brillante Coomassie.
5% - MgCl_{2} 1.5 M - 0.2 mM de EDTA - 0.5 mM de DTE - 0.5 mM de PMSF. El SmD es aislado a partir de esas partículas como fue descrito por Lehmeier y otros (1990) con algunas modificaciones. De forma resumida, en un primer paso, los snRNP son concentrados en un concentrador centricon (30K centriperp, Amicon) para un volumen total de 5-10 mg/ml. Posteriormente, los snRNP son disueltos en tampón de muestra Laemmli, separados en un gel de preparación Laemmli al 15% (1 cm de grosor, 14 cm de pozo; carga de proteína 3 mg) y teñido con Azul Brillante Coomassie.
La banda del SmD de 14 kDa (conteniendo SmD1,
SmD2 y SmD3) es cortada del gel, enjuagada en agua y cortada en
cubos de 1 mm^{3}. Las proteínas son extraídas del gel de
poliacrilamida en el dispositivo BioRad de acuerdo con las
instrucciones del fabricante. Los CoomassieBB y SDS residuales son
eliminados de las proteínas electro-extraídas
mediante extracción del par iónico (precipitación de la proteína
secada con acetona/ácido acídico/trietilamina/agua: 85/5/5/5). La
bolita es disuelta en ureum 6M, de ácido acético (glacial) 0.1 M y
neutralizada inmediatamente con Tris-HCL 1.5 M.
La concentración de la proteína es determinada
por el método MicroBCA (Pierce, EE.UU.), es obtenido un rendimiento
promedio de 80 \mug SmD/mg snRNP.
La secuencia que codifica el SmD1 (357 bp) fue
aislada de un clone de ADNc comprado a Organon Technika como un
fragmento PCR de 367 bp usando pfu polimerasa (Tm: 55ºC).
Este fragmento PCR fue cortado con BamHI y XbaI e insertado en el
vector pIGFHIII de expresión del corte de BamHI/XbaI. Este vector de
expresión fue transformado en la cepa de expresión de E. coli
SG4044(pcl857). La inducción de esta combinación vector/cepa
a 37ºC mostró una fuerte señal de \pm18 kDa en geles teñidos con
CBB y en Western blot. Una vez realizado el análisis de localización
la proteína probó estar presente en la fracción soluble. No pudo
ser observada ninguna disolución proteolítica significativa. Las
células bacterianas derivadas de un cultivo de tres litros fueron
suspendidas en buffer de lisis (10 mM de Tris- 100 mM de KCl pH 6.8)
hasta 3 veces la cantidad de células húmedas. Previo a la lisis
mediante una prensa de French, fueron adicionados ácido
\varepsilon-aminocaprónico, DTT, y PMSF a la
concentración de 25 mM, 1 mM y 2 mM respectivamente. La suspensión
de las células fue forzada dos veces a través de la prensa de
French y la presión fue mantenida a 14000 psi. Antes de la
centrifugación, el lisado fue diluido con buffer de lisis (5 veces
el peso de la célula húmeda) y fue centrifugado durante 20 minutos a
27000 g a 4ºC. Guanidina HCl fue añadida al sobrenadante a una
concentración final de 4.5 M. La proteína de fusión recombinante,
que contiene una etiqueta His, fue purificada en un solo paso
mediante cromatografía de afinidad por iones metálicos
(Ni-IMAC sefarosa). La cromatografía fue realizada a
temperatura ambiente. La columna fue cargada con un volumen de 1
columna de NiCl_{2} (5 mg/ml), lavada con agua y equilibrada con
un buffer A (Guanidina HCl 6 M, fosfato de sodio 0.1 M, TritonX100
al 0.05%, pH 6.5). Las proteínas fueron cargadas en sefarosa
quelante de Ni^{2+} Pharmacia, Suecia; aproximadamente 18 mg de
proteína/ml de gel) y la columna fue lavada con 4 volúmenes de lecho
del buffer A. El SmD1 fue extraído con un gradiente lineal del
buffer B (Guanidina
HCl 6 M, fosfato de sodio 0.1 M, TritonX100 al 0.05%, pH 3.5) y la proteína extraída entre 70% y 90% del buffer B.
HCl 6 M, fosfato de sodio 0.1 M, TritonX100 al 0.05%, pH 3.5) y la proteína extraída entre 70% y 90% del buffer B.
El gen de ADNc que codifica para la proteína de
fusión mTNF-His6-hSmD fue aislado
del plásmido de expresión bacteriano pIGFHIIIhSmD (vea el ejemplo
3) como un fragmento DraI-XbaI de 520 bp, e
insertado en el plásmido pVL1393 de transferencia del báculo
abierto de BamHI (llenado en)-XbaI, resultando en el
plásmido de transferencia recombinante pVLTNFH6hSmD (vea la Fig.
2). El gen de fusión está aquí bajo control transcripcional del
promotor fuerte de polihedrina del báculovirus. El vector de
transferencia del báculo pVmTNFH6hSmD1 fue usado para generar
báculovirus mTNF-His6-hSmD1
recombinante siguiendo el enfoque de transfección de baculogold
(Pharmingen, San Diego, EE.UU.). La infección de las células de
Spodoptera frugiperda (Sf9) con el virus recombinante resultó
en la expresión de una proteína de 18 kDa que fue reconocida en el
Western blot por un anticuerpo monoclonal específico para el SmD
(Progen, Heidelberg, Alemania, datos no mostrados). No fue factible
el empleo del lisado de la célula para probar la especificidad de
diferentes sueros humanos debido a que una reacción muy inespecífica
de fondo de los sueros humanos con las proteínas báculovirales
enmascaró el posible reconocimiento del SmD específico. La proteína
de fusión del SmD fue purificada por tanto mediante purificación con
Ni-IMAC como se describió previamente con una
adaptación: después de la prensa de French, el lisado de la célula
fue precipitado y redisuelto en el buffer A (vea el ejemplo 3).
El SmD natural electro-extraído
de extractos nucleares de HeLa inmovilizados en una membrana PVDF en
un dispositivo ProSpin (Perkin Elmer, California, EE.UU.) fue
sometido a una digestión endoLys-C para obtener
datos detallados de la secuencia de péptidos internos. La membrana
fue incubada con 100 mM de Tris pH 8.2, TritonX-100
hidrogenado al 1%, 1 mM de K_{3}-EDTA,
acetonitrilo al 10% y 0.5 \mug de enzima. La digestión fue
realizada durante toda la noche a 37ºC. La mezcla de péptido fue
separada en una columna de C4 Vydac HPLC (usando un gradiente de
solvente B al 10-70%: acetonitrilo al 70%/TFA al
0.1%) y una tasa de flujo de 0.2 ml/min. Los picos del péptido
extraído fueron recuperados manualmente. En el péptido
25-mer C terminal del SmD1 se secuenciaron nueve
residuos de dimetilarginina, solo las dos últimas argininas eran no
modificadas. La posición de N^{G},
N^{G}-dimetilarginina en el cromatograma de la
secuencia fue confirmado mediante la aplicación del aminoácido puro
modificado (Sigma, San Luis, EE.UU.) como estándar. Esta
modificación estuvo ausente en el SmD1 recombinante de E.
coli (revelado en el curso del secuenciamiento de los péptidos
generados por endo-GluC) implicando que la
modificación, resultante de la acción de la metiltransferasa, no
ocurre en E. coli.
Esta conclusión fue confirmada mediante el
análisis de masa del SmD1 recombinante de E. coli. Esta
proteína, que es extraída en un solo pico cuando se realiza la
cromatografía de fase inversa, fue analizada mediante electrospray
en un espectrómetro de masa de cuatro polos Bio-Q
equipado con una fuente iónica de electrospray (Fisons). El \mul
de la solución de muestra que contiene 20 pmol en acetonitrilo al
50% - ácido acético al 1% fue analizado. Fue realizada la
calibración de las lecturas con 50 pmol de mioglobina de corazón de
caballo. La muestra contenía 3 masas: 17,435 Da, 17,305 Da, y 16,992
Da que corresponden respectivamente a la proteína de tamaño
completo, la proteína sin la metionina N terminal, y la proteína que
carece del Met N terminal y la Arg-Arg C terminal.
A partir de estos resultados, se puede concluir que el SmD1
recombinante de E. coli purificado es la molécula intacta,
no modificada y que la carencia de inmunoreactividad específica del
SmD1 recombinante no es debida a la pérdida del término C.
El análisis de masa del SmD1 recombinante
báculoviral mostró un resultado heterogéneo: uno de los mayores
picos de masa (17,297 Da) pudiera ser asignado a la proteína no
modificada que carece de metionina N terminal mientras dentro de
los picos menores las masas de 17,629 y 17,711 podrían ser asignadas
tentativamente a la presencia de 7 y 10 dimetilargininas.
La proteína de fusión del báculo SmD1 fue
disuelta con EndoGlu-C como sigue: 300 \mug de
proteína precipitada con TCA fueron disueltos en 50 \mul de 100
mM de buffer de acetato de NH_{4} pH 4.3. La enzima
EndoGlu-C (Boehringer, Mannheim, Alemania) fue
añadida en una proporción de 1/100 y la mezcla fue incubada durante
toda la noche a 26ºC. El hidrolizado fue posteriormente secado al
vacío (SpeedVac), redisuelto en TFA al 0.1% - ácido acético al 20% y
los péptidos fueron separados en una columna HPLC de fase inversa
(C_{4}-Vydac). Los picos del péptido fueron
recuperados manualmente. Fue seguido un enfoque similar para una
digestion EndoLys-C (Boehringer, Mannheim,
Alemania) del báculo SmD1 con las siguientes modificaciones: la
proteína es disuelta en 50 \mul de 100 mM de
Tris-HCl, pH 8, acetonitrilo al 10%, 10 mM de
K_{3}EDTA, y la enzima es agregada en una proporción de
1/120.
Las fracciones de HPLC fueron secadas al vacío y
disueltas en acetonitrilo al 10%, 50 mM de buffer carbonatado pH
9.6. De cada fracción se motearon 2 \mul en una membrana de nailon
ABC (Pall, NY). Después de moteadas, las membranas fueron
bloqueadas durante 1 hora en caseína al 0.5% en PBS a lo cual fue
añadido 0.25 glicina al 0.1%. Posteriormente, las membranas son
incubadas durante toda la noche con suero (1/100) en caseína al
0.5% en PBS suplementado con Triton X705 y 2.03 g/L de
MgCl_{2}.6H_{2}O. Las membranas fueron lavadas tres veces
durante 3 minutos en PBS, Tween20 al 0.05% e incubadas con
anti-IgG humana (1/8000) conjugado con fosfatasa
alcalina. La reacción inmune fue visualizada mediante la adición de
NBT/BCIP en una solución de 1/500.
Las fracciones derivadas de
endoGlu-C fueron incubadas con un suero positivo y
un suero de control. Fue revelada una fuerte inmunoreacción con la
fracción 17. El secuenciamiento de la fracción 15 mostró que esta
fracción contenía el péptido C terminal en el cual el motivo RG
está dimetilado. El análisis de masa de la fracción 8 mostró que
esta fracción contenía el péptido C terminal sin las argininas
modificadas. El análisis de las fracciones ubicadas entre 8 y 17
indicó que esas fracciones contienen el péptido C terminal en el
cual los 5 motivos RG finales son dimetilados mientras los 4
primeros motivos RG son parcialmente monometilados. Esto puede ser
concluido a partir de una diferencia de masa de 14 entre las
fracciones.
Las fracciones derivadas de
EndoLys-C (Fig. 1) fueron incubadas separadamente
con 6 sueros positivos y un suero de control. En 5 de los 6 sueros
positivos, una señal significativamente superior que el suero de
control fue limitada a la fracción 15 lo cual fue identificado
tanto por secuenciamiento como por análisis de masa como el péptido
C terminal con dimetilarginas. Una vez más, el análisis de masa
indicó que las fracciones 8 a 14 corresponden a las formas no
metiladas y menos metiladas del péptido C terminal.
Estos resultados fueron confirmados aislando de
manera selectiva el péptido no modificado y el modificado de un
hidrolizado endoLys-C de preparación del SmD1
báculo. En la Figura 1 puede ser apreciado que la fracción 8 con el
péptido SmD1 no modificado contenía menos material que la fracción
15 con el péptido dimetilado. Por consiguiente es posible que la
reactividad exclusiva del péptido modificado fuera debido a las
diferentes cantidades de péptido modificado y no modificado que son
transferidas en el experimento dot-blot (Fig. 2).
Para excluir tales variaciones cuantitativas, los péptidos fueron
analizados en un experimento dot-spot como fue
descrito. Sin embargo, en este experimento fueron aplicadas iguales
cantidades (basadas en la determinación de la proteína BCA) de
ambos péptidos, péptido modificado y no modificado. Para la
comparación, el SmD natural total, el SmD1 de E. coli
recombinante y el báculoviral fueron aplicados en cantidades
comparables en el inmunopunto (Fig. 3). Finalmente los péptidos
fueron aplicados en un experimento de inmunoensayo lineal (Polet y
otros, Clinical Chemistry, 37, 1991) (Fig. 4). De nuevo iguales
cantidades (60 ng) de péptidos SmD1 modificados y no modificados
fueron aplicadas a una membrana de nailon. La cantidad de péptido
unida fue visualizada mediante teñido coloidal de la proteína
(Aurodye, Amersham, Buckinghanshire, Reino Unido; Fig. 4).
Adicionalmente, 30, 15 y 7 ng del SmD1 recombinante de células de
insectos infectados con báculovirus o E. coli así como una
mezcla de SmD1, SmD2 y SmD3 purificados en gel fueron aplicados a
las bandas. Estas fueron probadas después con 21 sueros
anti-Sm de pacientes que eran inmunoreactivos a una
mezcla de SmD1, SmD2 y SmD3 de HeLa. Seis (29%) de esos sueros
anti-Sm de los pacientes dieron señales
significativas con el péptido modificado D1, mientras el péptido no
modificado no reaccionó con ninguno de los 21 sueros probados. Un
conjunto independiente de sueros brasileños anti-Sm
(n=93) mostró un tasa de reactividad similar con el péptido
modificado (4/14 sueros anti-Sm; 29%). Estos
experimentos sustentan nuestra hipótesis de que hay al menos 2
epítopes involucrados en la inmunoreactividad del SmD natural: un
epítope está presente en la molécula del SmD total recombinante de
E. coli mientras un epítope adicional está ubicado en el
término C (90-119) de la molécula del SmD1. La
presencia de dimetilargininas en este péptido es crucial para el
reconocimiento por parte de los sueros de los pacientes.
Andersen, J., Feeney, R.J. y
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(1) GENERAL INFORMATION:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- APPLICANT:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME: INNOGENETICS N.V.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- STREET: INDUSTRIEPARK ZWIJNAARDE 7, BOX 4
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CITY: GHENT
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- COUNTRY: BELGIUM
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- POSTAL CODE (ZIP): B-9052
\vskip0.500000\baselineskip
- (G)
- TELEPHONE: 00 32 2 241 07 11
\vskip0.500000\baselineskip
- (H)
- TELEFAX: 00 32 2 241 07 99
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TITLE OF INVENTION: METHYLATED, SMD HOMOGOGOUS PEPTIDES, REACTIVE WITH THE ANTI- BODIES FROM SERA OF LIVING BEINGS AFFECTED WITH SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS.
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NUMBER OF SEQUENCES: 30
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- COMPUTER READABLE FORM:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- MEDIUM TYPE: Floppy disk
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- COMPUTER: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- OPERATING SYSTEM: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release #1.0, Version #1.30 (EPO)
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- CURRENT APPLICATION DATA: APPLICATION NUMBER: PCT/EP98/05518
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 19 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..19
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly
Xaa Gly Xaa Gly Xaa}
\sac{Gly Xaa Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 11 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..11
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Met Gly Xaa
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 17 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..17
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ala Gln Val Ala Ala Xaa Gly Xaa Gly Xaa
Gly Met Gly Xaa Gly}
\sac{Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 38 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..38
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Val Glu Pro Lys Val Lys Ser Lys Lys Arg
Glu Ala Val Ala Gly}
\sac{Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly
Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly}
\sac{Xaa Gly Gly Pro Arg Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 16 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..16
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Asn His Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa
Gly Xaa Gly Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 15 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION: 1..15
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Xaa Gly Xaa Gly Gly Ser Gly Gly Xaa
Gly Xaa Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 12 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION: 1..12
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Arg Ala Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly Xaa Gly
Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 46 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..46
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Gln Gln Asp Xaa Gly Gly Xaa Gly Xaa
Gly Gly Gly Gly Gly}
\sac{Tyr Asn Xaa Ser Ser Gly Gly Tyr Glu Pro
Xaa Gly Xaa Gly Gly Gly}
\sac{Xaa Gly Gly Xaa Gly Gly Met Gly Gly Ser
Asp Xaa Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 18 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION: 1..18
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Gln Gln Asp Xaa Gly Gly Xaa Gly Xaa
Gly Gly Gly Gly Gly}
\sac{Tyr Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 26 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..26
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Gly Gly Tyr Glu Pro Xaa Gly Xaa Gly Gly
Gly Xaa Gly Gly Xaa}
\sac{Gly Gly Met Gly Gly Ser Asp Xaa Gly
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 17 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..17
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Phe Asn Xaa Gly Gly Gly Asn Gly Xaa Gly
Gly Xaa Gly Xaa Gly}
\sac{Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 29 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..29
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Phe Asn Xaa Gly Gly Gly Asn Gly Xaa Gly
Gly Xaa Gly Xaa Gly}
\sac{Gly Pro Met Gly Xaa Gly Gly Tyr Gly Gly
Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 38 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..38
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Asp Asp Xaa Xaa Gly Xaa Gly Gly Tyr Asp
Xaa Gly Gly Tyr Xaa}
\sac{Gly Xaa Gly Gly Asp Xaa Gly Gly Phe Xaa
Gly Gly Xaa Gly Gly Gly}
\sac{Asp Xaa Gly Gly Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 14 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..14
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Asp Asp Xaa Xaa Gly Xaa Gly Gly Tyr Asp
Xaa Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 26 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- FEATURE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NAME/KEY: Modified-site
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCATION:1..26
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- OTHER INFORMATION:/product= "X stands for a mono- or dimethylated arg"
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Tyr Xaa Gly Xaa Gly Gly Asp Xaa Gly
Gly Phe Xaa Gly Gly}
\sac{Xaa Gly Gly Gly Asp Xaa Gly Gly Phe
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 19 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly
Arg Gly Arg Gly Arg}
\sac{Gly Arg Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 38 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Val Glu Pro Lys Val Lys Ser Lys Lys Arg
Glu Ala Val Ala Gly}
\sac{Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly
Arg Gly Arg Gly Arg Gly}
\sac{Arg Gly Gly Pro Arg Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH:1 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Arg Gly Arg Gly Arg Gly Met Gly Arg
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 23 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ala Gln Val Ala Ala Arg Gly Arg Gly Arg
Gly Met Gly Arg Gly}
\sac{Asn Ile Phe Gln Lys Arg Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 46 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Gln Gln Asp Arg Gly Gly Arg Gly Arg
Gly Gly Gly Gly Gly}
\sac{Tyr Asn Arg Ser Ser Gly Gly Tyr Glu Pro
Arg Gly Arg Gly Gly Gly}
\sac{Arg Gly Gly Arg Gly Gly Met Gly Gly Ser
Asp Arg Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 18 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Gln Gln Asp Arg Gly Gly Arg Gly Arg
Gly Gly Gly Gly Gly}
\sac{Tyr Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 26 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Gly Gly Tyr Glu Pro Arg Gly Arg Gly Gly
Gly Arg Gly Gly Arg}
\sac{Gly Gly Met Gly Gly Ser Asp Arg Gly
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 17 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Phe Asn Arg Gly Gly Gly Asn Gly Arg Gly
Gly Arg Gly Arg Gly}
\sac{Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 29 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Phe Asn Arg Gly Gly Gly Asn Gly Arg Gly
Gly Arg Gly Arg Gly}
\sac{Gly Pro Met Gly Arg Gly Gly Tyr Gly Gly
Gly Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 38 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Asp Asp Arg Arg Gly Arg Gly Gly Tyr Asp
Arg Gly Gly Tyr Arg}
\sac{Gly Arg Gly Gly Asp Arg Gly Gly Phe Arg
Gly Gly Arg Gly Gly Gly}
\sac{Asp Arg Gly Gly Phe Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 14 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Asp Asp Arg Arg Gly Arg Gly Gly Tyr Asp
Arg Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 26 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Tyr Arg Gly Arg Gly Gly Asp Arg Gly
Gly Phe Arg Gly Gly}
\sac{Arg Gly Gly Gly Asp Arg Gly Gly Phe
Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 16 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Asn His Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg
Gly Arg Gly Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 15 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Gly Arg Gly Arg Gly Gly Ser Gly Gly Arg
Gly Arg Gly Gly}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SEQUENCE CHARACTERISTICS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LENGTH: 12 amino acids
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TYPE: amino acid
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- STRANDEDNESS: single
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGY: linear
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- MOLECULE TYPE: protein
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HYPOTHETICAL: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENSE: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Arg Ala Arg Gly Arg Gly Arg Gly Arg Gly
Glu}
Claims (22)
1. Péptido que contiene menos de 50
aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo XG, donde X
representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en el grupo de
la cadena lateral N-guanidino, dicho péptido siendo
capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos específicos del
lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación siendo crucial
para la reacción entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera
que un péptido que carece de tal modificación tendrá una constante
de disociación para la interacción con un anticuerpo específico del
lupus eritematoso sistémico al menos cien veces mayor que la de un
péptido metilado que tiene la misma secuencia primaria y dicho
péptido no es seleccionado del grupo que consistente en
- (i)
- GKGXLL, GXGXGXG, SSSQXG o GNFGGGXGGGFGG y X es N^{G}-monometilado o N^{G}-N^{G}-dimetilado; o
- (ii)
- GXGL, GKGXGL, GKGXHL, GKGXFL, GDGXGL o CGKGXGLC cíclico y X es N^{G}-monometilado.
2. Péptido de acuerdo con la reivindicación 1
que comprende la secuencia de aminoácido GXGXGXGXGXGXGX
GXGXG (SEQ ID NO 1) o, AXGXGXGMGXG (SEQ ID NO 2) o, KAQVAAXGXGXGMGXGN (SEQ ID N 3) o, DVEPKVKSKKREAVAGXGXGXGXGXGXGXGXGXGGPRR (SEQ ID NO 4)o, DNHGXGXGXGXGXGGG (SEQ ID NO 5) o, GGXGXGGSGGXGXGG (SEQ ID NO 6) o, ERAXGXGXGXGE (SEQ ID NO 7) o, GGQQDXG
GXGXGGGGGYNXSSGGYEPXGXGGGXGGXGGMGGSDXGG (SEQ ID NO 8) o, GGQQDXGGXGXGGGGG
YN (SEQ ID NO 9) o, SGGYEPXGXGGGXGGXGGMGGSDXGG (SEQ ID NO 10) o, DFNXGGGNGXGGXGXG
G (SEQ ID NO 11) o, DFNXGGGNGXGGXGXGGPMGXGGYGGGGS (SEQ ID NO 12) o, GDDXXGXGGYDXG
GYXGXGGDXGGFXGGXGGGDXGGFG (SEQ ID NO 13)o, GDDXXGXGGYDXGG (SEQ ID NO 14) o, GGYX
GXGGDXGGFXGGXGGGDXGGFG (SEQ ID NO 15)
GXGXG (SEQ ID NO 1) o, AXGXGXGMGXG (SEQ ID NO 2) o, KAQVAAXGXGXGMGXGN (SEQ ID N 3) o, DVEPKVKSKKREAVAGXGXGXGXGXGXGXGXGXGGPRR (SEQ ID NO 4)o, DNHGXGXGXGXGXGGG (SEQ ID NO 5) o, GGXGXGGSGGXGXGG (SEQ ID NO 6) o, ERAXGXGXGXGE (SEQ ID NO 7) o, GGQQDXG
GXGXGGGGGYNXSSGGYEPXGXGGGXGGXGGMGGSDXGG (SEQ ID NO 8) o, GGQQDXGGXGXGGGGG
YN (SEQ ID NO 9) o, SGGYEPXGXGGGXGGXGGMGGSDXGG (SEQ ID NO 10) o, DFNXGGGNGXGGXGXG
G (SEQ ID NO 11) o, DFNXGGGNGXGGXGXGGPMGXGGYGGGGS (SEQ ID NO 12) o, GDDXXGXGGYDXG
GYXGXGGDXGGFXGGXGGGDXGGFG (SEQ ID NO 13)o, GDDXXGXGGYDXGG (SEQ ID NO 14) o, GGYX
GXGGDXGGFXGGXGGGDXGGFG (SEQ ID NO 15)
3. Péptido y/o estructura química que comprende
cualquiera de los péptidos de acuerdo con las reivindicaciones 1 o
2, fusionado con una molécula de enlace.
4. Péptido circularizado que comprende al menos
uno de los péptidos de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a la 3.
5. Péptido que comprende y/o que consiste en
repeticiones tándem de al menos dos de cualquiera de los péptidos
de las reivindicaciones 1 a la 4.
6. Péptido ramificado que comprende al menos
uno de los péptidos de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 1 a la 5.
7. Método para producir un péptido de acuerdo
con cualquiera de las reivindicaciones 1 a la 6, donde la secuencia
de aminoácidos primaria es producida por síntesis química clásica, y
donde los residuos de arginina que preceden los residuos de glicina
son posteriormente metilados contactando dichos péptidos con una
proteína arginina metiltransferasa.
8. Método para producir un péptido que contiene
menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo
XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en
el grupo de la cadena lateral N-guanidino, dicho
péptido siendo capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos
específicos del lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación
siendo crucial para la reacción entre dicho péptido y dicho
anticuerpo de manera que un péptido que carece de tal modificación
tendrá una constante de disociación para la interacción con un
anticuerpo específico del lupus eritematoso sistémico al menos cien
veces mayor que la de un péptido metilado que tiene la misma
secuencia primaria, caracterizado porque dicho péptido es
producido mediante síntesis química clásica y dicha arginina
metilada es sustituida por un residuo de arginina no metilada
durante la síntesis química.
9. Método para producir un péptido que contiene
menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo
XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en
el grupo de la cadena lateral N-guanidino, dicho
péptido siendo capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos
específicos del lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación
siendo crucial para la reacción entre dicho péptido y dicho
anticuerpo de manera que un péptido que carece de tal modificación
tendrá una constante de disociación para la interacción con un
anticuerpo específico del lupus eritematoso sistémico al menos cien
veces mayor que la de un péptido metilado que tiene la misma
secuencia primaria,
dicho método comprendiendo los siguientes
pasos:
- -
- transformar una célula hospedera eucariota con un vector recombinante en la cual un ácido polinucleico es insertado que comprende la secuencia que codifica para dicho péptido bajo el control de los elementos reguladores apropiados de forma tal que dicho péptido o una proteína que comprende dicho péptido es expresada y/o segregada,
\newpage
- -
- cultivar dicha célula hospedera transformada bajo condiciones que permitan la expresión de dicha proteína o péptido y que permitan una mutilación parcial u óptima de las argininas presentes en dicho péptido,
- -
- cosechar dicho péptido.
10. Método para producir un péptido que contiene
menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo
XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en
el grupo de la cadena lateral N-guanidino,
dicho péptido siendo capaz de reaccionar
específicamente con anticuerpos específicos del lupus eritematoso
sistémico, con dicha metilación siendo crucial para la reacción
entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera que un péptido que
carece de tal modificación tendrá una constante de disociación para
la interacción con un anticuerpo específico del lupus eritematoso
sistémico al menos cien veces mayor que la de un péptido metilado
que tiene la misma secuencia primaria,
dicho método comprendiendo los siguientes
pasos:
- -
- transformar una célula hospedera eucariota con un vector recombinante en la cual un ácido polinucleico es insertado que comprende la secuencia que codifica para dicho péptido bajo el control de los elementos reguladores apropiados, de forma tal que dicho péptido o una proteína que comprende dicho péptido es expresada y/o segregada,
- -
- cultivar dicha célula hospedera transformada bajo condiciones que permitan la expresión de dicha proteína o de dicho péptido,
- -
- cosechar dicha proteína o dicho péptido,
- -
- metilar los residuos de arginina de dicha proteína o de dicho péptido contactando con una proteína arginina metiltransferasa.
11. Método de acuerdo con cualquiera de las
reivindicaciones 9 o 10, donde dicha célula hospedera es levadura o
cualquier otra célula hospedera eucariota la cual es preferiblemente
transformada con un báculovirus recombinante.
12. Un anticuerpo desarrollado después de la
inmunización con un péptido que contiene menos de 50 aminoácidos,
que comprende al menos un dímero del tipo XG, donde X representa un
residuo de arginina, mono o dimetilada en el grupo de la cadena
lateral N-guanidino, dicho péptido siendo capaz de
reaccionar específicamente con anticuerpos específicos del lupus
eritematoso sistémico, con dicha metilación siendo crucial para la
reacción entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera que un
péptido que carece de tal modificación tendrá una constante de
disociación para la interacción con un anticuerpo específico del
lupus eritematoso sistémico al menos cien veces mayor que la de un
péptido metilado que tiene la misma secuencia primaria, con dicho
anticuerpo siendo específicamente reactivo con las formas metiladas
de dicho péptido.
13. Un anticuerpo de acuerdo con la
reivindicación 12, donde dicho anticuerpo es un anticuerpo
monoclonal.
14. Anticuerpo anti-idiotipo
desarrollado después de la inmunización con un anticuerpo de acuerdo
con la reivindicación 12, con dicho anticuerpo
anti-idiotipo siendo específicamente reactivo con el
anticuerpo de la reivindicación 12, imitando así el péptido
metilado.
15. Anticuerpo anti-idiotipo de
acuerdo con la reivindicación 14, donde dicho anticuerpo es un
anticuerpo monoclonal.
16. Una molécula de inmunotoxina que comprende
y/o que consiste en molécula de reconocimiento celular siendo
- -
- un péptido que contiene menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en el grupo de la cadena lateral N-guanidino, dicho péptido siendo capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos específicos del lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación siendo crucial para la reacción entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera que un péptido que carece de tal modificación tendrá una constante de disociación para la interacción con un anticuerpo específico del lupus eritematoso sistémico al menos cien veces mayor que la de un péptido metilado que tiene la misma secuencia primaria, o
- -
- un anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 12 ó 13, o
- -
- un anticuerpo anti-idiotipo de acuerdo con la reivindicación 14 ó 15,
donde dicha molécula de
reconocimiento celular está unida covalentemente a una molécula de
toxina o a un fragmento activo de la
misma.
17. Uso de
- -
- un péptido que contiene menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en el grupo de la cadena lateral N-guanidino, dicho péptido siendo capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos específicos del lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación siendo crucial para la reacción entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera que un péptido que carece de tal modificación tendrá una constante de disociación para la interacción con un anticuerpo específico del lupus eritematoso sistémico al menos cien veces mayor que la de un péptido metilado que tiene la misma secuencia primaria, o
- -
- un anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 12 ó 13, o
- -
- un anticuerpo anti-idiotipo de acuerdo con la reivindicación 14 ó 15,
o una composición del mismo para la
preparación de un kit diagnóstico para la detección del lupus
eritematoso
sistémico.
18. Un kit diagnóstico para la detección del
lupus eritematoso sistémico, dicho kit comprendiendo
- -
- al menos un péptido que contiene menos de 50 aminoácidos, que comprende al menos un dímero del tipo XG, donde X representa un residuo de arginina, mono o dimetilada en el grupo de la cadena lateral N-guanidino, dicho péptido siendo capaz de reaccionar específicamente con anticuerpos específicos del lupus eritematoso sistémico, con dicha metilación siendo crucial para la reacción entre dicho péptido y dicho anticuerpo de manera que un péptido que carece de tal modificación tendrá una constante de disociación para la interacción con un anticuerpo específico del lupus eritematoso sistémico al menos cien veces mayor que la de un péptido metilado que tiene la misma secuencia primaria, o
- -
- un anticuerpo de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 12 ó 13, o
- -
- un anticuerpo anti-idiotipo de acuerdo con la reivindicación 14 ó 15,
19. Un kit diagnóstico de acuerdo con la
reivindicación 18, donde dicho péptido o anticuerpo está unido a un
soporte sólido.
20. Un kit diagnóstico de acuerdo con la
reivindicación 19, dicho kit comprendiendo un rango de dichos
péptidos o dichos anticuerpos, posiblemente en combinación con el
SmD1 o SmD3 metilado nativo y el SmD1 o SmD3 recombinante no
metilado, donde dichos péptidos son unidos a ubicaciones específicas
en un substrato sólido.
21. Un kit diagnóstico de acuerdo con la
reivindicación 20, donde dicho soporte sólido es una banda
membranosa y dichos polipéptidos o anticuerpos están acoplados a la
membrana en forma de líneas paralelas.
22. Un kit diagnóstico de acuerdo con las
reivindicaciones 18 a la 21 donde ciertos péptidos no son unidos a
un soporte sólido sino que son proporcionados en una solución
aglutinante para ser usados como competidores y/o para bloquear
otros anticuerpos que estén presentes en los sueros de los pacientes
con enfermedad autoinmune que no sea el SLE, disminuyendo o
eliminando así la posible reacción cruzada y/o unión
inespecífica.
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