ES2233960T3 - Copolimeros cationicos de vinilamina y alcohol vinilico para la administracion de oligonucleotidos. - Google Patents

Copolimeros cationicos de vinilamina y alcohol vinilico para la administracion de oligonucleotidos.

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ES2233960T3 ES96902128T ES96902128T ES2233960T3 ES 2233960 T3 ES2233960 T3 ES 2233960T3 ES 96902128 T ES96902128 T ES 96902128T ES 96902128 T ES96902128 T ES 96902128T ES 2233960 T3 ES2233960 T3 ES 2233960T3
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Abstract

LA PRESENTE INVENCION, SE REFIERE A UN METODO MEJORADO PARA LA LIBERACION DE OLIGONUCLEOTIDOS EN EL CITOPLASMA, UTILIZANDO COPOLIMEROS CATIONICOS BASADOS EN ALCOHOL DE VINILO CON BAJOS NIVELES DE VINIL AMINA (PVAVAMS). SE PROPORCIONAN ASIMISMO COMPOSICIONES MEJORADAS PARA SER UTILIZADAS EN DICHO METODO.

Description

Copolímeros catiónicos de vinilamina y alcohol vinílico para la administración de oligonucleótidos.
La invención se refiere a un método mejorado para la liberación citoplásmica de oligonucleótidos y a composiciones mejoradas para uso con un método de este tipo.
Antecedentes de la invención
Los oligonucleótidos son moduladores potentes de las propiedades celulares a nivel del ADN o ARN. Los oligonucleótidos pueden diseñarse para emparejarse base por base a un segmento específico de ADN (oligonucleótidos formadores de tripletes) o ARN (oligonucleótidos antisentido) y, después de unirse al ácido nucleico deseado, influir en la transcripción y/o traducción con consecuencias bioquímicas y funcionales previsibles aguas abajo, es decir inhiben la expresión génica. Todavía no se conoce el mecanismo exacto por el cual actúan los oligonucleótidos para inhibir la expresión génica en todos los casos. Avances recientes en técnicas de síntesis orgánica y purificación han facilitado la factibilidad de diseño y síntesis de los oligonucleótidos.
Puesto que los oligonucleótidos están diseñados para unirse específicamente a secuencias emparejadas, poseen un alto grado de especificidad, y tienen numerosas potenciales aplicaciones terapéuticas. Por ejemplo, los dos problemas más comunes asociados con el uso de agentes anticáncer y antivirales son la resistencia a los fármacos y niveles inaceptables de toxicidad. Éstos se pueden, en potencia, superar mediante el uso de oligonucleótidos con un alto grado de especificad porque: (1) genes que no contienen la secuencia diana teóricamente no se ven afectados por los oligonucleótidos, lo que reduce la probabilidad de toxicidad, y (2) solo una mutación puntual dentro del sitio de unión del oligonucleótido y no fuera de él puede conducir a una resistencia a los fármacos. Por lo tanto, los oligonucleótidos se consideran representantes de una clase de potentes agentes anticáncer y antivirales.
La biodisponibilidad intracelular ineficaz de oligonucleótidos, es decir la cantidad de oligonucleótido intacto que está disponible de forma que puede interactuar con la diana deseada, ha supuesto un obstáculo importante en el desarrollo de oligonucleótidos como agentes terapéuticos. Factores claves que contribuyen a la biodisponibilidad intracelular ineficaz son una mala estabilidad, unión no específica, y deficiente absorción celular y tisular.
Mucho esfuerzo se ha dirigido al diseño de derivados de oligonucleótidos con propiedades mejoradas. Modificaciones en el nucleósido, el esqueleto de azúcares, el extremo, o la estereoquímica comprenden las cuatro categorías principales de derivatización; véase Uhlmann y Peyman, Chem. Rev., 90: 543-584 (1990). Además, se están investigando varias estrategias de suministro que podrían salvar algunos de estos problemas; véase Akhtar y Juliano, Trends in Cell Biology, 2: 139-144 (1992) y las referencias citadas en la misma.
El mecanismo de absorción celular no se comprende del todo. Por ejemplo, no está claro si la absorción de los oligonucleótidos ocurre a través de un mecanismo de transporte en la membrana celular descrito previamente, o a través de una vía única; véase Wu-Pong, Pharmaceutical Tech., Págs. 102-112 (Oct. 1994). Además, parece que el mecanismo de absorción puede ser del tipo celular y/o del tipo de oligonucleótido. Íd. La evidencia actual apunta a que los oligonucleótidos penetran en las células predominantemente por endocitosis. La endocitosis se clasifica típicamente como endocitosis mediada por receptores (EMR), endocitosis por adsorción (EA) o endocitosis en fase fluida (EFF).
Después de la endocitosis, los oligonucleótidos tienen que escapar de sus compartimientos endosomales para poder ejercer sus efectos en el núcleo o el citoplasma. El mecanismo exacto y el alcance de la transferencia de oligonucleótidos desde los endosomas a dianas del citoplasma y/o del núcleo todavía no se ha determinado. Mecanismos posibles son difusión sencilla, desestabilización transitoria de la membrana, o una fuga sencilla durante un proceso de fusión en el cual los endosomas se fusionan con otras vesículas tales como lisosomas. Para que los oligonucleótidos absorbidos por endocitosis sean de utilidad, su eflujo de compartimientos endosomales tiene que mejorarse.
Se han propuesto diversos métodos de síntesis en la bibliografía para mejorar la biodisponibilidad intracelular. Un enfoque descrito es la fijación covalente de ligandos de receptores celulares específicos para iniciar la absorción celular por endocitosis mediada por receptores; véase Vestweber y Schatz, Nature, 338: 170-172 (1989). La modificación covalente de oligonucleótidos generalmente implica el uso de policationes y representa un proceso laborioso que requiere una síntesis y purificación separadas para cada oligonucleótido ensayado. Se ha descrito el uso de policationes tales como poli-L-lisina en estudios de transfección génica; véase Felgner, Advanced Drug Delivery Reviews, 5: 163-187 (1990). Sin embargo, a diferencia de la transfección génica, en la cual se necesitan relativamente pocas copias de ADN, el uso de oligonucleótidos como un agente terapéutico requeriría altos niveles de ADN, y modificación covalente utilizando policationes tales como poli-L-lisina podría resultar tóxico para las células.
El documento BE-A-751299 (KakenyaKu KaKo KK) describe una composición de una poliamina básica y un ADN para el uso en las lesiones de reabsorción provocadas por radiación.
El documento WO-A-94/18834 (Virginia Tech Intellectual Properties) describe un segmento de ADN que forma un complejo con un policatión tal como polilisina o poliarginina para inserción en el genoma de un animal receptor.
El enfoque más común que se está investigando es el uso de vesículas de fosfolípidos (liposomas) para suministrar oligonucleótidos a células; véase Akhtar et al., Nucleic Acids Res., 19: 5551-5559 (1991). Además de proteger los oligonucleótidos frente a una degradación enzimática, los liposomas ofrecen el potencial de controlar y mantener su liberación. Íd. El eflujo de oligonucleótidos a partir de liposomas parece ser lento y sostenible durante un periodo de varios días, lo que sugiere que pueden ser útiles en el suministro de oligonucleótidos frente a dianas que tienen una reposición lenta. Íd. Sin embargo, como en el caso de otros policationes, lípidos catiónicos y liposomas (por ejemplo, Lipofectin®) generalmente son tóxicos para las células y suministran el ADN de forma ineficaz en presencia de suero; véase Leonnetti et al., P.N.A.S. USA, 87: 2448-2451 (1990).
Existen publicaciones extensas sobre la síntesis y el uso de copolímeros, basados en alcohol vinílico con niveles variables de amina vinílica en la industria del papel; véase la Publicación de Patente Europea 337310; la Publicación de Patente Europea 339371; la Publicación de Patente Europea 617166; las Patentes Estadounidenses 4.774.285, 4.880.497. 4978.427 y 5.270.379, y como floculantes; véase la Patente Estadounidense 3.715.336. No se conoce informes hasta la fecha relacionados con el uso de copolímeros de alcohol vinilo/amina vinílica para la terapia celular.
Las modificaciones de oligonucleótidos y/o sistemas de suministro de los mismos descritos en la bibliografía han conducido a una mejorada eficacia de la absorción celular de oligonucleótidos; sin embargo, todavía no han permitido que se desarrolle el potencial completo de la tecnología de oligonucleótidos. Por lo tanto, existe la necesidad de desarrollar métodos mejorados para aumentar la biodisponibilidad intracelular de oligonucleótidos. Es un objeto de la presente invención proporcionar dichos métodos. Es un objeto adicional de la invención proporcionar composiciones para el uso en dichos métodos.
Compendio de la invención
La presente invención se refiere, más concretamente, a un método mejorado para el suministro citoplásmico de oligonucleótidos y a composiciones mejoradas para uso en dichos métodos. La presente invención surgió de estudios en los cuales copolímeros basados en alcohol vinílico y amina vinílica (PAVYAVs) se utilizaron para suministrar polianiones (aquí, oligonucleótidos) en células. De modo sorprendente, los PAVYAVs proporcionan un sistema eficaz para conseguir el suministro nuclear de oligonucleótidos en células, en la presencia de suero y con una toxicidad baja.
Según la presente invención, se proporciona una composición que comprende un copolímero de la fórmula general I,
(I)-(CH2-HCOH-)x-(CH2-HCNR1R2R3)y-Az-
donde R1, R2 y R3 son, independientemente, hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo, o R1 = R2 = hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo y R3 es un par de electrones solitario
A es el residuo de un monómero vinílico
x, y y z son números enteros que representan el número de monómeros incorporados y donde x + y + z = 1000
en donde x = 25-99.5% en moles, y = 0.5-75% en moles, y z<50% en moles, combinada con un oligonucleótido, en donde la relación en moles de "y" a unidades de anión es 0,1-100, opcionalmente en un vehículo farmacéuticamente aceptable.
Las composiciones de la presente invención comprenden la combinación de PAVYAVs, con un contenido variable de amina vinílica en % en moles con respecto a un oligonucleótido, tal que la relación molar de amina vinílica polimerizada a unidades de anión de oligonucleótido está entre 0,1-100. Preferiblemente, la relación molar es 0,2-30. Se prefiere más una fracción en moles de 0,2-15.
Los métodos de la presente invención comprenden la administración in vitro de composiciones de PAVYAV/ oligonucleótido a las células, tal que el oligonucleótido se transporte dentro de las células.
Los PAVYAVS utilizados por los métodos de la presente invención se preparan utilizando monómeros vinílicos hidrófobos e hidrófilos susceptibles a la polimerización y tienen un contenido en amina vinílica de 0,5-75% en moles. Preferiblemente, los PAVYAVs se preparan utilizando polímeros precursores de acetato vinílico/formamida vinílica y alcohol vinílico/formamida vinílica y tienen un contenido en amina vinílica de 4-20% en moles. En la realización más preferida, el PAVYAV tiene un contenido de 6-15% en moles de amina vinílica.
Los polianiones aquí descritos son generalmente de un tamaño macromolecular. Sin embargo, también se describen materiales de bajo peso molecular que tienen la capacidad de formar complejos con PAVYAVs, es decir contienen regiones de carácter aniónico (unidades aniónicas). El polianión es un oligonucleótido o un polinucleótido. En una realización preferida de la invención, el polianión es un oligonucleótido antisentido.
Descripción detallada de la invención
Copolímeros de la presente invención comprenden el alcohol vinílico (AV) y amina vinílica (AMV) de la fórmula general I,
(I)-(CH2-HCOH-)x-(CH2-HCNR1R2R3)y-Az-
donde R1, R2 y R3 son, independientemente, hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo, o R1 = R2 = hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo y R3 es un par de electrones solitario
A es el residuo de un monómero vinílico
x, y,
y z son números enteros que representan el número de monómeros incorporados y donde x + y + z = 1000
Con el fin de describir la presente invención, los copolímeros de la fórmula I serán denominados "PAVYAVs". La frase "residuo de un monómero vinílico" se define como la unidad de monómero después de la polimerización, y debe señalarse que el PAVYAV final puede contener cantidades menores de unidades residuales y fragmentos de iniciador.
En los PAVYAVs de la presente invención, se prefiere que R1=R2=R3=hidrógeno y R3 sea un par de electrones solitarios, y además, que x=25-99.5% en moles, y = 0,5-5% en moles, y z<50% en moles. Más preferido es que x=80-96% en moles, y = 4-20% en moles, y z \leq16% en moles. Lo más preferido es que x=87-94% en moles, y = 6-13% en moles, y z \leq10% en moles. Para los fines de la presente invención, "% en moles" se define como el porcentaje de las unidades molares totales en el polímero.
En general, el proceso de síntesis de polímeros de PAVYAV dianas de la presente invención consiste en realizar una serie de hidrólisis en un polímero precursor. El polímero precursor se forma por la copolimerización de un monómero precursor de alcohol vinílico tal como acetato vinílico (AcV) y un monómero precursor de amina vinílica tal como formamida N-vinílica (FNV). La polimerización por radicales libres se lleva a cabo con métodos conocidos en el estado de la técnica; véase, por ejemplo, Vinyl and Related Polymers por C.E. Schildknecht, 1952, editado por John Wiley & Sons, Inc. El acetato se hidroliza con una cantidad catalítica (\sim 3% en moles) de base, tal como NaOH metanólico, y la formamida se hidroliza con una cantidad levemente por encima de la estequiométrica de bien o NaOH. Tales procesos de polimerización se describen en detalle en la bibliografía; véase la Publicación de Patente Europea 0339371 A2 (Pinschmidt y Lai), y las referencias citadas en la misma. Una persona experta en la técnica reconocerá variaciones en el método de preparación de los presentes polímeros.
Monómeros vinílicos apropiados para la polimerización incluyen monómeros convencionales hidrófobos e hidrófilos. Monómeros apropiados hidrófobos incluyen, sin limitación, acrilatos y metacrilatos de alquilo C_{1} a C_{18}, acrilamidas y metacrilamidas de alquilo C_{3} a C_{18}, acrilonitrilo, metacrilonitrilo, alquanoatos C_{1} a C_{18} vinílicos, alquenos C_{2} a C_{18}, haloalquenos C_{2} a C_{18}, estireno, alquil C_{1} a C_{6}- alquil éteres vinílicos, en donde la parte alquilo tiene 1 a 6 átomos de carbono, acrilatos y metacrilatos de perfluoroalquil C_{3} a C_{12-}etil-tiocarbonilaminoetilo, acrilatos y metacrilatos de fluoroalquilo, C_{3} a C_{12}, acriloxi- y metacriloxi- aquilo-siloxanos, N-vinil-carbazol, ésteres alquílicos C_{1}-C_{12} de ácidos maleico, fumárico, itacónico y mesacónico, y similares.
Ejemplos de monómeros hidrófobos apropiados incluyen acrilato de metilo, acrilato de etilo, acrilato de propilo, acrilato de isopropilo, acrilato de ciclohexilo, acrilato de 2-etilhexilo, metacrilato de metilo, metacrilato de propilo, acetato vinílico, propionato de vinilo, valerato de vinilo, estireno, cloropreno, cloruro de vinilo, cloruro de vinilideno, acrilonitrilo, 1-buteno, butadieno, metacrilonitrilo, viniltolueno, vinil-etil-éter, metacrilato de perfluorohexiletiltiocarbonilaminoetilo, 3-metacriloxipropilpentametildisiloxano, y bis(metacriloxipropil)tetrametildisiloxano.
Monómeros hidrófilos apropiados incluyen, sin limitación, acrilatos y metacrilatos de alquilo inferior sustituidos con hidroxi, formamida N-vinílica, acrilamida, metacrilamida, acrilamida y metacrilamida de alquilo inferior C_{1}-C_{2}, acrilatos y metacrilatos etoxilados, acrilamida y metacrilamide de alquilo inferior sustituidos con hidroxi, éteres vinílicos de alquilo inferior sustituidos con hidroxi, estireno-sulfonato sódico, ácido 2-acrilamido-2-metilpropansulfónico, N-vinilpirrol, N-vinil-succinimida, N-vinil- pirrolidina, 2 y 4-vinil- piridina, ácido acrílico, ácido metacrílico, amino (incluido amonio cuaternario), acrilatos o metacrilatos de monoalquilo inferior-amino o dialquilo inferior amino, alcohol alílico, y similares.
Los copolímeros de la presente invención también son susceptibles a modificaciones menores con anhídridos, epóxidos, isocianatos, carbonilos reactivos, haloalquilcarbonilos, ésteres, aziridinas, aceptores de Michael, cloruros de ácidos, haluros de alquilo inferior y similares. Ejemplos de reactivos modificadores incluyen anhídrido succínico, anhídrido maleico, anhídrido citracónico, ácido yodoacético, polioxietileno o derivados de hidratos de carbono tal como ésteres activos, maleimidas, sulfonas de vinilo y similares.
Las longitudes de los oligonucleótidos de la presente invención pueden variar en cierto grado, pero generalmente tienen una longitud de aproximadamente 10 hasta aproximadamente 30 nucleótidos. Por razones de practicidad comercial, se prefiere que el oligonucleótido tenga una longitud de aproximadamente 14 hasta aproximadamente 20 nucleótidos, ya que nucleótidos de mayor tamaño, en el intervalo de 10 a 30, pueden hibridarse de forma no específica a otras secuencias no diana si el oligonucleótido es demasiado largo (es decir, sustancialmente más largo de 20 nucleótidos).
Composiciones preferidas incluidas en la presente invención comprenden PAVYAVs en combinación con oligonucleótidos antisentido. No se conoce la naturaleza de la interacción, pero se supone que es de índole electroestática. Las composiciones se pueden caracterizar de la siguiente forma: el PAVYAV sirve de "vehículo" y el oligonucleótido de "pasajero", y la combinación de PAVYAV y oligonucleótido es un "sistema o complejo de vehículo y pasajero no covalente". La fracción de PAVYAV a oligonucleótido en las composiciones está basada en las unidades que contienen amina a unidades fosfato y varía de 0,001 a 1000, preferiblemente de 0,01-500, más preferiblemente de 0,1-100, más preferiblemente de 0,2-30, y la fracción más preferida es de 2-15.
Se considera que los PAVYAVs de la presente invención pueden usarse para el suministro de polinucleótidos y oligonucleótidos a células. Dichas composiciones pueden proporcionar los métodos de uso en un entorno clínico, por ejemplo, la inhibición de la proliferación de células musculares lisas, el tratamiento de trastornos de proliferación celular, la inflamación, y el tratamiento de enfermedades virales. También se consideran las mezclas de las composiciones de la presente invención con un vehículo, farmacéuticamente diluyente, conservante, solubilizador, adyuvantes y/o agentes emulsionantes farmacéuticamente aceptables; véase Remington's Pharmaceutical Sciences 18ª, Edición (1990, Mack Publishing Co., Easton, PA 19042) páginas 1435-1712.
El Ejemplo 1 que figura continuación demuestra los métodos de preparación de los componentes de las composiciones de la presente invención. El Ejemplo 2 demuestra la preparación y el uso de las presentes composiciones (y métodos). Como queda demostrado en los estudios de absorción celular, las presentes composiciones de PAVYAV facilitan la absorción celular de oligonucleótidos antisentido.
Ejemplo 1
Este ejemplo demuestra (i) la síntesis de oligonucleótidos, (ii) el marcaje fluorescente de los oligonucleótidos para uso como marcadores en los estudios de absorción celular en el Ejemplo 2 y (iii) la preparación de diversos copolímeros.
I. Síntesis de los oligonucleótidos
Los oligonucleótidos utilizados en los siguientes ejemplos se sintetizaron con un sintetizador de ADN de Applied Biosystems Inc. (Foster City, California), modelo 394. Enlaces de fosforotioato modificados se introdujeron por oxidación del enlace fosfito formado durante la síntesis de oligonucleótidos con ^{3}H-1,2-benzoditiol-3-1,1-dióxido (reactivo de Beaucage, Glen Research, Sterling Virginia) en vez de la oxidación estándar con yodo. Los cuatro fosforamiditos nucleósidos comunes (es decir, adenosina, timidina, guanosina y citidina) y deoxinosina fosforamidito se adquirieron de Applied Biosystems Inc. Todos los fosfodiésteres sin modificar y los oligonucleótidos modificados que contenían tioato se desprotegieron con tratamiento con amoniaco concentrado a 55ºC durante 12 h. Los oligonucleótidos se purificaron por cromatografía de exclusión de gel y precipitación con etanol y se liofilizaron hasta sequedad.
Los oligonucleótidos usados en los siguientes ejemplos se modificaron completamente con enlaces fosforotioato y se muestran a continuación:
OLIGO 1 GCT GTG GGG CGG CTC CTG
OLIGO 2 CGC CGT CGC GGC GGT TGG
El oligonucleótido 1 es un oligonucleótido 18-mero fosforotioato modificado que tiene una composición de bases semejante a la secuencia humana anti-c-myb antisentido. El oligonucleótido 2 es un oligonucleótido 18-mero fosforotioato modificado sin ninguna diana antisentido conocida.
II. Marcaje de los oligonucleótidos
La fluoresceína se incorporó en los oligonucleótidos en el extremo 5' utilizando fluoresceína amidita adquirida de Glen Research (Sterling Virginia) que se utilizó según las indicaciones del fabricante.
III. Preparación del copolímero
El texto que se presenta a continuación ilustra la preparación y caracterización de los polímeros diana de PVAYAV preparados a partir de la hidrólisis de polímeros precursores de acetato vinílico/formamida vinílica y alcohol vinílico/formamida vinílica. Los PAVYAVs preparados tenían un contenido variable en amina vinílica. El contenido en amina vinílica de los PAVYAVs se determinó por titulación potenciométrica.
1. Preparación de los PAVYAVs
Las preparaciones se ilustrarán en un procedimiento de tres etapas: la Etapa 1 implica la síntesis del polímero precursor de acetato vinílico/formamida vinílica; la etapa 2 implica la síntesis del polímero precursor de alcohol vinílico/formamida vinílica; y la etapa 3 implica la síntesis del copolímero PAVYAV diana. Los PAVYAVs preparados tenían un contenido variable en amina vinílica (la relación de formamida N-vinílica a acetato vinílico refleja la variación del contenido de amina al de alcohol).
2. Caracterización de los PAVYAVs
El contenido en amina vinílica en el PAVYAV se midió por titulación potenciométrica de una cantidad pesada de polímero (\sim0,5 g) disuelto en 100 mL de agua. Cuando el PAVYAV estaba en forma de una base libre (por ejemplo, cuando se había utilizado la hidrólisis de base acuosa de formamida), el pH inicial estaba generalmente por encima de 10, y se llevó a \sim1,99 con HCl, luego se aumentó a \sim12,01 con NaOH. Para sales hidrocloruro generadas por hidrólisis ácida no acuosa de la formamida, el pH inicial de 4 o inferior se aumentó a \sim12,01 con NaOH, luego se redujo a \sim1,99 con HCl. Las curvas de ambas titulaciones para cada solución se compararon y mostraron una buena concordancia para la respuesta de pH a mEq de titulante. Después de la inspección de una representación gráfica de \DeltapH/\DeltamEq, además de la propia curva de titulación, el mEq de amina se determinó y se calcularon el porcentaje en peso y el porcentaje en moles de amina.
Preparación A
Etapa 1
El reactor (500 mL matraz con camisa de 4 bocas equipado con un agitador de la parte de cabeza con palas de teflón condensador, termómetro y conductos de alimentación de tubos de teflon) contiene 1,42 g de formamida N-vinílica (FNV), 84,28 g de acetato vinílico (AcV) (Polysciences) y 67 g de metanol. La alimentación contiene 5,33 g de FNV y 36,55 g de AcV. La polimerización se lleva a cabo a 60ºC bajo nitrógeno utilizando 0,51 g peroxineodecanoato de terc-butilo (AKZO Chemicals Inc.). La alimentación se suministra a una velocidad de aproximadamente 7 a 15 mL/h durante un periodo de 3 horas y se añade metanol periódicamente para restaurar el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 14,8 mg de metil-éter-hidroquinona (MEHQ) (Polysciences). El exceso de AcV se repara por destilación azeotrópica con metanol.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (29 g) se mezcla rápidamente con 1,6 g de NaOH al 50% (0,02 moles) en 150 mL de MeOH. La hidrólisis se lleva a cabo a 40ºC durante 30 minutos. El precipitado del polímero de AcV/FNV resultante se lava con MeOH y se seca a 60ºC al vacío. El rendimiento es de 11,3 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (8 g) se suspende en 72 mL de metanol y se mezcla con 1,32 mL de HCl 12N (0,0158 moles) en 16 mL de metanol. La hidrólisis se lleva a cabo a 60ºC durante 2 horas. El polímero de AcV/FNV resultante se lava con metanol y se seca a 50ºC al vacío. El rendimiento es de 8,08 g y el contenido en amina es 4,6% en moles.
Preparación B
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación A con las siguientes modificaciones en la Etapa 1: el reactor contiene 3,55 g de FVN, 81,7 g de AcV, 100 mL de metanol y 0,49 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 12,5 g de FVN y 27,9 g de AcV; se añade una cantidad adicional de 0,263 g de peroxineodecanoato terc-butilo 2 ½ 2,5 horas después de la primera adición. Adicionalmente, se añade metanol periódicamente para restaurar el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 15,7 mg de MEHQ después de 4 horas de polimerización y, en este momento, permanecen 8,5 mL de alimentación.
Etapa 2
El polímero precursor de AcV/FNV (41 g) en 230 mL de metanol se mezcla rápidamente con 1,04 g de NaOH al 50% y se hidroliza a 40ºC durante 30 minutos. El precipitado del polímero de AcV/FNV se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento es de 23,64 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (10 g) se disuelve en 40 g de H_{2}O, se añaden 2,515 g de NaOH al 50% y la mezcla se calienta a 80ºC durante 8 horas. El producto se dializa exhaustivamente (Spectrapor, 3500 MWCO) frente a agua desionizada y 80% de esta solución se liofiliza para proporcionar un material blanco a modo de algodón. El rendimiento del polímero de AV/FVM es de 5,67 g y el contenido en amina es 13,9% en moles.
\newpage
Preparación C
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación A, con las siguientes modificaciones en la Etapa 1: el reactor contiene 2,48 g de FVN, 83 g de AcV, 120 mL de metanol y 0,51 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 9,12 g de FVN y 31,95 g de AcV. Se añade metanol periódicamente para mantener el volumen. Se añade una cantidad adicional de peroxineodecanoato de terc-butilo 2 horas después de la adición inicial. La polimerización se interrumpe con la adición de 20 mg de MEHQ después de 3 horas y 40 minutos de polimerización.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (12,5% en sólidos) en aproximadamente 200 mL de metanol se mezcla rápidamente con 0,759 g de NaOH al 50% y se calienta hasta 40ºC durante 25 minutos. El precipitado del polímero de AcV/FNV se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento es de 14,8 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (13,0 g) se suspende en 117 mL de metanol. A esto se añade, gota a gota, 3,02 mL de HCl 12N (0,0362 moles) en 26 mL de metanol. La mezcla se calienta a 60ºC durante 2 horas. Después de lavar y liofilizar, el rendimiento del AcV/FVM resultante es de 8,5 g y el contenido en amina es 8,6% en moles.
Preparación D
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación B, con las siguientes modificaciones en la Etapa 1: el reactor contiene 3,55 g de FVN, 81,70 g de AcV, 100 mL de metanol y 0,49 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 12,55 g de FVN y 27,90 g de AcV. Adicionalmente, se añade metanol periódicamente para restaurar el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 21,6 mg de MEHQ después de 4 ^{1}/_{2} horas de polimerización.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (aproximadamente 34 g) en aproximadamente 200 mL de metanol se mezcla rápidamente con 0,847 g de NaOH al 50% (0,0106 moles) a 40ºC durante 25 minutos. El polímero se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento de polímero de AcV/FNV es de 22,7 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FVN (20 g) se mezcla con 80 g de agua y 5,0 g de NaOH al 50% y se calienta a 80ºC durante 6 horas. Después de dializar y liofilizar, el rendimiento del AcV/FVN resultante es de 12,38 g, y el contenido en amina es 10,4% en moles.
Preparación E
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación A con las siguientes modificaciones en la Etapa 1: el reactor contiene 3,05 g de FVN, 82,3 g de AcV, 100 mL de metanol y 0,6 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 11,08 g de FVN y 29,58 g de AcV. Se añade metanol periódicamente para mantener el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 19,4 mg de MEHQ después de 4¼ horas de polimerización.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (aproximadamente 52 g) en 250 mL de metanol se mezcla rápidamente con 1,28 g de NaOH al 50% (0,016 moles) a 40ºC durante 25 minutos. El polímero se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento de polímero de AcV/FNV es de 29,97 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (18 g) se suspende en 180 mL de metanol. A la suspensión se añaden, gota a gota, 4,2 mL de HCl 12N en 36 mL de metanol. La mezcla se calienta a 60ºC durante 2 horas. Después de filtrar, lavar y secar a 50ºC al vacío, el material se disuelve en \sim4 litros de agua y a continuación la mitad del material se liofiliza. El rendimiento del AcV/FNV resultante es de 6 g, y el contenido en amina es 10,4% en moles.
Preparación F
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación C, con las siguientes modificaciones en la Etapa 1 para reducir el peso molecular con respecto a la Preparación C: el reactor contiene 0,62 g de FVN, 20,87 g de AcV, 169 mL de metanol y 0,5 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 2,28 g de FVN, 7,99 g de AcV y 32,7 mL de metanol. Se añade metanol periódicamente para mantener el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 23 mg de MEHQ después de 4 horas de polimerización.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (aproximadamente 17 g) en aproximadamente 108 mL de metanol se mezcla rápidamente con 0,447 g de NaOH al 50% (0,056 moles) a 40ºC durante aproximadamente 20 horas. El polímero se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento de polímero de AcV/FVN es de 4,04 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (3,7 g) se suspende en 33,3 mL de metanol. A esto, se añade, gota a gota, 0,85 mL de HCl 12N en 7,32 mL de metanol. La mezcla se calienta a 60ºC durante 2 ½ horas. Después de filtrar, lavar y secar a 50ºC al vacío, el rendimiento del AV/FVM resultante es de 1,86 g, y el contenido en amina es 8,8% en moles.
Preparación G
Este polímero se prepara de forma similar a la Preparación F con las siguientesmodificaciones en la Etapa 1 para reducir el peso molecular con respecto a la Preparación C: el reactor contiene 2,48 g de FVN, 83,00 g de AcV, 200 mL de metanol y 0,51 g de peroxineodecanoato de terc-butilo; la alimentación contiene 9,12 g de FVN y 31,95 g de AcV. Se añade metanol periódicamente para mantener el volumen. La polimerización se interrumpe con la adición de 22 mg de MEHQ después de 2 ¾ horas de polimerización. El volumen final que queda en la alimentación es 14,5 mL.
Etapa 2
El polímero de AcV/FNV (aproximadamente 47 g) en aproximadamente 225 mL de metanol se mezcla rápidamente con 1,23 g de NaOH al 50% a 40ºC durante aproximadamente 30 minutos. El polímero se lava con metanol y se seca a 45ºC al vacío. El rendimiento de polímero de AcV/FVN es de 27,58 g.
Etapa 3
El polímero de AcV/FNV (10 g) se suspende en 90 mL de metanol y se le añaden 2,3 mL de HCl 12N en 20 mL de metanol. La mezcla se calienta a 60ºC durante 2 horas. Después de filtrar, lavar y secar a 50ºC al vacío, el rendimiento de AcV/FVM resultante es de 8,2 g, y el contenido en amina es 8,6% en moles.
Ejemplo 2
Este ejemplo describe la preparación de composiciones de PAVYAV/oligonucleótidos y experimentos de absorción celular utilizando las composiciones.
I. Preparación de las composiciones
Los oligonucleótidos utilizados en este ejemplo son los descritos en el Ejemplo 1. Los PAVYAVs utilizados en este ejemplo tenían un contenido en amina vinílica variable y se prepararon y caracterizaron de forma similar a los preparados en el Ejemplo 1. Las composiciones de PAVYAV/oligonucleótido se prepararon mezclando una solución de polímero (1-10% p/v en agua) y oligonucleótido fluoresceinado 1 mM (18-mero, en agua) con el medio en un volumen total de 1 mL. En la mayoría de los experimentos, se utiliza medio mínimo (DMEM), pero, el medio CHO con 5% de suero puede sustituirse con resultados similares. En el diseño de los tratamientos, la concentración de oligonucleótido se mantuvo en 10 \muM (180 \muM en fosfatos nucleósidos) y el polímero se añadió en tal cantidad que el nivel total de amina polimérica alcanzó un múltiplo dado de los fosfatos (véase la Tabla I). Las composiciones de PAVYAV/oligonucleótidos se prepararon con una antelación de 25 minutos y se calentaron en la incubadora a 37ºC y bajo 10% de CO_{2}.
II. Experimentos de absorción celular
Cultivos adherentes de células CHO D^{-} se mantuvieron en 25 mL de medio en matraces T75 de cultivo celular en la incubadora a 37ºC y bajo 10% de CO_{2}. El medio de cultivo consistía en medio Eagle modificado por Dulbecco (MEMD, tal como se describe en el catálogo de Gibco, catálogo nº 11965-050), suplementado con suero bovino fetal al 5% (Hyclone nº 1905-AA, inactivado por 30 minutos de tratamiento térmico en un baño de agua a 60ºC), 1% de suplemento HT "100X" (Gibco 11067-014) y 1% de MEM "100X" aminoácidos no esenciales (Gibco 14190-144).
Las células se inocularon para experimentos en el momento de paso, cuando las células habían alcanzado confluencia. Se llevó a cabo una tripsinización para recoger las células de la superficie del matraz. La solución de tripsina era una dilución "10X" de tripsina-EDTA en el PBS de Dulbecco (Gibco 14190-144), tal que la concentración final era 1,5X (por ejemplo, 100 mL de tripsina se mezclaron con 567 mL de PBS -ésta dilución se llevó a cabo anteriormente y se sometió a una filtración estéril- se aliquotó a recipientes estériles y se almacenó a -20ºC. La solución de tripsina se descongeló y calentó, y se filtró de nuevo justo antes de usarse). Para recuperar las células, se reparó el medio por aspiración y cualquier medio residual (que contenía un inhibidor de tripsina) se lavó con dos lavados rápidos de 8-10 mL con solución de tripsina, seguido de una incubación durante 5 minutos de las células con 5 mL de solución de tripsina. Las células liberadas se resuspendieron para proporcionar un concentrado "5X". Típicamente, los subcultivos tuvieron una dilución de 1/10 ó 1/20 (por ejemplo, para un subcultivo de 25 mL a 1/10, se utilizaron 0,5 mL de suspensión celular). Para los experimentos, las células se inocularon en placas de cultivo fisularde 6 pocillos (Falcon nº 3046) a razón de 5 mL por pocillo. Una dilución de 1/10 generalmente estaba lista para el día siguiente, mientras que una de 1/20 estaba lista en dos días.
En general, las células tenían una confluencia de 30-50% en el momento del experimento. Los tratamientos se llevaron a cabo reparando por aspiración el medio viejo y añadiendo la solución de tratamiento que contenía el PAVYAV/oligonucleótido. Las soluciones de tratamiento pueden contener suero. Se tuvo cuidado para que las células no se secaran. Después de incubar las células durante una hora, las soluciones de tratamiento se separaron por aspiración para eliminarlas y los pocillos se lavaron 5 veces con MEMD, 2 mL por lavado, luego medio completo se añadió a los pocillos para la "persecución".
Las células vivas se examinaron bajo un microscopio invertido con dispositivosfluorescentes NIKON® Diaphot y una cámara Polaroid®. Se visualizó primero un campo dado con contraste de fase, luego se redujo la intensidad de la luz visible para visualizar el campo fluorescente correspondiente. Si se observó absorción nuclear, se volvió a la imagen de fase de la célula para evaluar la salud y la integridad de la célula. Se puntuó la absorción como se indica abajo:
\underline{Puntuación}
\underline{Localización \ de \ la \ fluorescencia}
0
Poca o ninguna fluorescencia asociada a las células
1
Generalmente asociada a la superficie, algo de fluorescencia endosomal
2
Pesada, tanto superficial como endosomal
3
Lisa y citoplásmica difusa y de la célula entera
4
Inicialmente superficial y endosomal; hasta un 5% de los núcleos teñidos después de unas pocas horas de "persecución"
5
Inicialmente superficial y endosomal con función nuclear del 10% o inferior; 30-40% de los núcleos teñidos después de unas horas
6
Inicialmente el 80% o superior de los núcleos teñidos
D
Sin puntuación, las células desintegraron al principio de la persecución
Los resultados de los experimentos de absorción se recogen en la Tabla 1.
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(Tabla pasa a página siguiente)
TABLA 1
1
Este ejemplo ilustra que se puede conseguir una mejora en la absorción celular con una liberación nuclear sustancial y baja toxicidad mediante el uso de PAVYAVs. En ausencia de PAVYAV, la mayoría de las células son no fluorescentes, mientras que en presencia del homopolímero de amina vinílica, las células se desintegran en fragmentos fluorescentes. En general, niveles más altos de amina conducen a citotoxicidad mientras que niveles más bajos conducen a una distribución endosomal/lisosomal. Para el suministro citoplásmico o nuclear, hay una tendencia de una relación de amina a unidad aniónica más alta a un % en moles en el PAVYAV de amina más baja: por ejemplo, a un % en moles de amina de 10,4, un múltiplo preferido de amina a unidad aniónica es 4,9, mientras que a un % en moles de amina de 8,8, un múltiplo preferido es 9,5.

Claims (12)

1. Una composición que comprende un copolímero de la fórmula general I,
(I)-(CH2-HCOH-)x-(CH2-HCNR1R2R3)y-Az-
en donde R1, R2 y R3 son, independientemente, hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo, o R1 = R2 = hidrógeno, alquilo inferior ó 2-hidroxialquilo y R3 es un par de electrones solitario
A es el residuo de un monómero vinílico
x, y y z son números enteros que representan el número de monómeros incorporados y donde x + y + z = 1000
en donde x = 25-99,5% en moles, y = 0,5-75% en moles, y z <50% en moles, combinada con un oligonucleótido, en donde la relación molar de "y" a unidades de anión es 0,1-100, opcionalmente en un vehículo farmacéuticamente aceptable.
2. Una composición según la reivindicación 1, en donde x=80-96% en moles, y = 4-20% en moles, y z \leq16% en moles.
3. Una composición según la reivindicación 1, en donde x=85-94% en moles, y = 6-15% en moles, y z \leq9% en moles.
4. Una composición según la reivindicación 1, 2 ó 3, en donde la relación en moles de "y" a unidades aniónicas es 0,2-30.
5. Una composición según la reivindicación 1, 2 ó 3, en donde la relación en moles de "y" a unidades aniónicas es 2-15.
6. Una composición según la reivindicación 1, 2 ó 3, en donde R1 = R2 = R3 = hidrógeno, y en donde A es un residuo de acetato vinílico y formamida vinílica.
7. Una composición según la reivindicación 1, 2 ó 3, en donde R1 = R2 = R3 = hidrógeno, en donde R3 es un par de electrones solitario, y en donde A es un residuo de acetato vinílico y formamida vinílica.
8. Una composición según las reivindicaciones 6 ó 7, en donde dicho oligonucleótido comprende un esqueleto de fosfato.
9. Una composición según la reivindicación 8, en donde dicho oligonucleótido es un oligonucleótido antisentido.
10. Una composición según la reivindicación 9, en donde la longitud de dicho oligonucleótido antisentido es de 10 a 30 nucleótidos.
11. Una composición según la reivindicación 10, en donde la longitud de dicho oligonucleótido antisentido es de 18 nucleótidos.
12. Un método in vitro para influir en la absorción celular de un oligonucleótido que comprende la administración de la composición de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 11 a las células tal que el oligonucleótido se transporte dentro de las células.
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