DK2670846T3 - Fremgangsmåder til udvikling af terpensyntasevarianter - Google Patents
Fremgangsmåder til udvikling af terpensyntasevarianter Download PDFInfo
- Publication number
- DK2670846T3 DK2670846T3 DK12742056.0T DK12742056T DK2670846T3 DK 2670846 T3 DK2670846 T3 DK 2670846T3 DK 12742056 T DK12742056 T DK 12742056T DK 2670846 T3 DK2670846 T3 DK 2670846T3
- Authority
- DK
- Denmark
- Prior art keywords
- synthase
- terpene
- terpene synthase
- test
- control
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/25—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving enzymes not classifiable in groups C12Q1/26 - C12Q1/66
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/527—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving lyase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y402/00—Carbon-oxygen lyases (4.2)
- C12Y402/03—Carbon-oxygen lyases (4.2) acting on phosphates (4.2.3)
- C12Y402/03047—Beta-farnesene synthase (4.2.3.47)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Claims (14)
1. Fremgangsmåde til testning af en terpensyntasevariant for forbedret in wVo-ydeevne, hvilken fremgangsmåde omfatter følgende trin: (a) opdeling af en population af værtsceller i en kontrolpopulation og en testpopulation; (b) ekspression i kontrolpopulationen af en kontrolterpensyntase og en sammenligningsterpensyntase, hvor kontrolterpensyntasen kan omdanne et polyprenyldiphosphat til en første terpen, og hvor sammenligningsterpensyntasen kan omdanne polyprenyldiphosphatet til en anden terpen; (c) ekspression i testpopulationen af en testterpensyntase og sammenligningsterpensyntasen, hvor testterpensyntasen er en variant af kontrolterpensyntasen og kan omdanne polyprenyldiphosphatet til den første terpen, og hvor sammenligningsterpensyntasen udtrykkes i samme niveauer i testpopulationen og i kontrolpopulationen; og (d) måling af et forhold mellem den første terpen og den anden terpen både i testpopulationen og i kontrolpopulationen.
2. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor testpopulationen identificeres som omfattende en terpensyntasevariant med forbedret in wVo-ydeevne i sammenligning med kontrolterpensyntasen via en stigning i forholdet mellem den første terpen og den anden terpen i testpopulationen i sammenligning med det i kontrolpopulationen.
3. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor kontrolterpensyntasen og testterpensyntasen er: (i) sesquiterpensyntaser, og polyprenyldiphosphatet er farnesyldiphosphat (FPP); eller (ii) monoterpensyntaser, og polyprenyldiphosphatet er geranyldiphosphat (GPP).
4. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor sammenligningsterpensyntasen er en trichodiensyntase.
5. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor kontrol- og testterpensyntaserne er syntaser med farnesensyntaseaktivitet.
6. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor værtscellen omfatter et eller flere heterologe enzymer fra MEV-reaktionsvejen valgt fra gruppen bestående af ERG8, ERG10, ERG12, ERG13, ERG19 og HMG1.
7. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor testterpensyntasen afviger fra kontrolterpensyntasen med 1 til 10 aminosyrer.
8. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor testterpensyntasen udtrykkes i samme niveau i testpopulationen som det, kontrolterpensyntasen udtrykkes i i kontrolpopulationen.
9. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor kontrolterpensyntasen og testterpensyntasen er identiske, men udtrykkes i forskellige niveauer i kontrolpopulationen og testpopulationen.
10. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor populationen af værtsceller er en population af gærceller eller en population afE. coli-celler.
11. Fremgangsmåde ifølge krav 2, hvor forholdet mellem den første terpen og den anden terpen er mindst 1:3.
12. Sammensætning, som omfatter to celle-subpopulationer, som en fælles population af værtsceller er blevet opdelt i, hvor: (a) den første subpopulation omfatter en kontrolterpensyntase og en sammenligningsterpensyntase, hvor kontrolterpensyntasen omdanner et polyprenyldiphosphat til en første terpen, og hvor sammenligningssesquiterpensyntasen omdanner polyprenyldiphosphatet til en anden terpen; og (b) den anden subpopulation omfatter en testterpensyntase og sammenligningsterpensyntasen, hvor testterpensyntasen omdanner polyprenyldiphosphatet til den første terpen, hvor testterpensyntasen er en variant af kontrolterpensyntasen, og hvor sammenligningsterpensyntasen udtrykkes i samme niveauer i den første subpopulation og i den anden subpopulation.
13. Sammensætning ifølge krav 12, hvor forholdet mellem den første terpen og den anden terpen er større i den anden subpopulation i sammenligning med det i den første subpopulation.
14. Fremgangsmåde ifølge krav 1 eller sammensætning ifølge krav 12, hvor den første terpen eller den anden terpen er valgt fra gruppen bestående af β-farnesen, α-farnesen, trichodien, patchoulol, amorphadien, valencen, farnesol, nerolidol, nootkaton, limonen og myrcen.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201161438948P | 2011-02-02 | 2011-02-02 | |
| PCT/US2012/023446 WO2012106405A1 (en) | 2011-02-02 | 2012-02-01 | Methods of developing terpene synthase variants |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| DK2670846T3 true DK2670846T3 (da) | 2015-12-07 |
Family
ID=46577676
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| DK12742056.0T DK2670846T3 (da) | 2011-02-02 | 2012-02-01 | Fremgangsmåder til udvikling af terpensyntasevarianter |
Country Status (12)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US8236512B1 (da) |
| EP (1) | EP2670846B1 (da) |
| JP (1) | JP5580488B2 (da) |
| KR (1) | KR101420991B1 (da) |
| CN (1) | CN103608454B (da) |
| AU (1) | AU2012212292B2 (da) |
| CA (1) | CA2826554C (da) |
| DK (1) | DK2670846T3 (da) |
| MX (1) | MX346518B (da) |
| SG (1) | SG192195A1 (da) |
| WO (1) | WO2012106405A1 (da) |
| ZA (1) | ZA201305797B (da) |
Families Citing this family (23)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7442785B2 (en) | 2003-07-24 | 2008-10-28 | The University Of Kentucky Research Foundation | Sesquiterpene synthase gene and protein |
| AU2013347891A1 (en) * | 2012-11-21 | 2015-06-11 | Joshua BLAKESLEE | Engineering plants to produce farnesene and other terpenoids |
| PL2970934T3 (pl) | 2013-03-14 | 2018-01-31 | Evolva Inc | Polipeptydy syntazy walencenu, kodujące cząsteczki kwasu nukleinowego oraz ich zastosowania |
| CA3003163A1 (en) | 2015-10-29 | 2017-05-04 | Senomyx, Inc. | High intensity sweeteners |
| CN106011178B (zh) * | 2016-07-14 | 2019-02-26 | 珀莱雅化妆品股份有限公司 | 一种利用糖高粱秆和甘蔗废渣发酵制备β-法呢烯的方法 |
| CN106635853B (zh) * | 2016-12-28 | 2019-12-27 | 中国中医科学院中药研究所 | 产甘草次酸的重组酿酒酵母、其构建方法以及用途 |
| CN108624610B (zh) * | 2017-03-23 | 2022-01-07 | 中国科学院分子植物科学卓越创新中心 | 拟南芥三烯甲素及其制备方法 |
| US11060124B2 (en) | 2017-05-03 | 2021-07-13 | Firmenich Incorporated | Methods for making high intensity sweeteners |
| KR101971678B1 (ko) * | 2017-10-18 | 2019-04-23 | 한국생명공학연구원 | 신규한 세스퀴테르펜 신타아제 및 이를 이용한 세스퀴테르펜 생산방법 |
| CN109722403B (zh) * | 2017-10-30 | 2020-12-04 | 中国石油化工股份有限公司 | 一种利用纤维素制备金合欢烯的工程菌株及方法 |
| KR102022242B1 (ko) * | 2018-02-12 | 2019-09-18 | 대한민국 | 겨울 우산 버섯 유래 테르펜 합성효소 유전자 및 상기 유전자가 삽입된 돌연변이 효모의 형질전환체 |
| KR101971976B1 (ko) * | 2018-02-12 | 2019-04-25 | 대한민국 | 겨울 우산 버섯 유래 테르펜 합성효소 유전자 및 상기 유전자가 삽입된 효모의 형질전환체 |
| KR20200121331A (ko) | 2018-02-14 | 2020-10-23 | 징코 바이오웍스, 인크. | 키메라 테르펜 합성효소 |
| JP2022502068A (ja) | 2018-10-15 | 2022-01-11 | アミリス， インコーポレイテッド | レバウジオシドの高効率産生のためのＳｔｅｖｉａ ｒｅｂａｕｄｉａｎａのカウレン酸ヒドロキシラーゼバリアント |
| US11066663B2 (en) | 2018-10-31 | 2021-07-20 | Zymergen Inc. | Multiplexed deterministic assembly of DNA libraries |
| CN109666668B (zh) * | 2019-01-24 | 2022-04-15 | 天津大学 | 一种小萼苔倍半萜合成酶MTa及其基因序列 |
| EP3914700A2 (en) | 2019-01-24 | 2021-12-01 | Amyris, Inc. | Extended gpio (egpio) |
| CN109837266B (zh) * | 2019-01-24 | 2021-12-31 | 天津大学 | 一种小萼苔倍半萜合成酶MTc及其基因序列 |
| US12065685B1 (en) | 2019-05-13 | 2024-08-20 | Amyris, Inc. | UDP-glycosyltransferase variants and uses thereof |
| KR102176556B1 (ko) * | 2019-07-31 | 2020-11-09 | 한국화학연구원 | 스쿠알렌 생산이 증대된 균주 및 이를 이용한 스쿠알렌 생산방법 |
| NL2030206B1 (en) * | 2021-10-25 | 2023-05-16 | Sestina Bio Llc | Heterologous expression of enzymes for increased b-farnesene production |
| CN114181964B (zh) * | 2021-11-02 | 2023-06-09 | 云南大学 | 一种表达盒组合、重组载体和重组酿酒酵母及其应用 |
| WO2024147836A1 (en) | 2023-01-03 | 2024-07-11 | Amyris, Inc. | Host cells capable of producing sequiterpenoids and methods of use thereof |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20020035058A1 (en) * | 1996-05-15 | 2002-03-21 | The University Of Sheffield | Isopentenyl pyrophosphate isomerase (IPI) and/or prenyl transferase inhibitors |
| EP1670952A4 (en) | 2003-09-29 | 2009-05-20 | Univ California | METHODS OF IDENTIFYING A GENE PRODUCT WITH BIOLOGICAL SYNTHESIS |
| WO2006014837A1 (en) * | 2004-07-27 | 2006-02-09 | The Regents Of The University Of California | Genetically modified host cells and use of same for producing isoprenoid compounds |
| US20090053797A1 (en) * | 2005-08-19 | 2009-02-26 | Yoichiro Shiba | Genetically modified host cells and use of same for producing isoprenoid compounds |
| CA2670280A1 (en) | 2006-11-21 | 2008-11-06 | Amyris Biotechnologies, Inc. | Jet fuel compositions and methods of making and using same |
| SG165884A1 (en) | 2008-04-23 | 2010-11-29 | Goodyear Tire & Rubber | Isoprene synthase variants for improved microbial production of isoprene |
-
2012
- 2012-02-01 CA CA2826554A patent/CA2826554C/en active Active
- 2012-02-01 CN CN201280011458.6A patent/CN103608454B/zh active Active
- 2012-02-01 WO PCT/US2012/023446 patent/WO2012106405A1/en active Application Filing
- 2012-02-01 DK DK12742056.0T patent/DK2670846T3/da active
- 2012-02-01 KR KR1020137023002A patent/KR101420991B1/ko active IP Right Grant
- 2012-02-01 JP JP2013552590A patent/JP5580488B2/ja active Active
- 2012-02-01 MX MX2013008903A patent/MX346518B/es active IP Right Grant
- 2012-02-01 EP EP12742056.0A patent/EP2670846B1/en active Active
- 2012-02-01 US US13/363,588 patent/US8236512B1/en active Active
- 2012-02-01 SG SG2013057518A patent/SG192195A1/en unknown
- 2012-02-01 AU AU2012212292A patent/AU2012212292B2/en active Active
- 2012-07-05 US US13/542,491 patent/US20120270260A1/en not_active Abandoned
-
2013
- 2013-07-31 ZA ZA2013/05797A patent/ZA201305797B/en unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| US20120196315A1 (en) | 2012-08-02 |
| US20120270260A1 (en) | 2012-10-25 |
| MX346518B (es) | 2017-03-23 |
| KR20130110226A (ko) | 2013-10-08 |
| MX2013008903A (es) | 2013-12-06 |
| EP2670846B1 (en) | 2015-08-19 |
| CA2826554C (en) | 2015-03-31 |
| JP2014505481A (ja) | 2014-03-06 |
| SG192195A1 (en) | 2013-09-30 |
| AU2012212292A1 (en) | 2013-08-15 |
| EP2670846A1 (en) | 2013-12-11 |
| AU2012212292B2 (en) | 2014-02-06 |
| ZA201305797B (en) | 2014-04-30 |
| CN103608454B (zh) | 2015-05-20 |
| JP5580488B2 (ja) | 2014-08-27 |
| CA2826554A1 (en) | 2012-08-09 |
| EP2670846A4 (en) | 2014-01-01 |
| WO2012106405A1 (en) | 2012-08-09 |
| KR101420991B1 (ko) | 2014-08-12 |
| CN103608454A (zh) | 2014-02-26 |
| US8236512B1 (en) | 2012-08-07 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DK2670846T3 (da) | Fremgangsmåder til udvikling af terpensyntasevarianter | |
| DK2855662T3 (da) | Rekombinante mikroorganismer og anvendelser deraf | |
| KR20210149060A (ko) | Tn7-유사 트랜스포존을 사용한 rna-유도된 dna 통합 | |
| CA2834053C (en) | Yeast strains engineered to produce ethanol from glycerol | |
| KR20120136349A (ko) | 고가의 화학적 생성물의 미생물 생산, 및 관련 조성물, 방법 및 시스템 | |
| KR20140015136A (ko) | 3-히드록시프로피온산 및 다른 생성물의 제조 방법 | |
| CA2763792C (en) | Expression cassettes derived from maize | |
| KR20130027063A (ko) | Ｆｅ-ｓ 클러스터 요구성 단백질의 활성 향상 | |
| ES2379368T3 (es) | Método para aumentar la producción de compuestos isoprenoides | |
| CN101939434B (zh) | 用于在大豆中提高种子贮藏油脂的生成和改变脂肪酸谱的来自解脂耶氏酵母的dgat基因 | |
| KR20130117753A (ko) | 포스포케톨라아제를 포함하는 재조합 숙주 세포 | |
| IL236992A (en) | Genetically modified cyanobacteria that produce ethanol | |
| KR20140113997A (ko) | 부탄올 생성을 위한 유전자 스위치 | |
| BRPI0806354A2 (pt) | plantas oleaginosas transgências, sementes, óleos, produtos alimentìcios ou análogos a alimento, produtos alimentìcios medicinais ou análogos alimentìcios medicinais, produtos farmacêuticos, bebidas fórmulas para bebês, suplementos nutricionais, rações para animais domésticos, alimentos para aquacultura, rações animais, produtos de sementes inteiras, produtos de óleos misturados, produtos, subprodutos e subprodutos parcialmente processados | |
| TW201111512A (en) | Improved isoprene production using the DXP and MVA pathway | |
| KR20150014953A (ko) | 케톨-산 리덕토아이소머라아제 효소 및 사용 방법 | |
| KR20110020234A (ko) | 이소프렌의 미생물에 의한 개선된 생성을 위한 이소프렌 신타아제 변이체 | |
| KR20220012327A (ko) | 피토칸나비노이드 및 피토칸나비노이드 전구체의 생산을 위한 방법 및 세포 | |
| KR102705104B1 (ko) | Cas9 변이체 및 사용 방법 | |
| KR20140092759A (ko) | 숙주 세포 및 아이소부탄올의 제조 방법 | |
| KR20100037031A (ko) | 유전자 녹아웃 중온성 및 호열성 생물체, 및 이의 사용 방법 | |
| DK2768848T3 (da) | Midler og fremgangsmåder til ekspression og sekretion af peptider og proteiner | |
| KR20230111189A (ko) | 재프로그램 가능한 iscb 뉴클레아제 및 이의 용도 | |
| JP2024037919A (ja) | モルフィナンアルカロイドおよび誘導体を生成する方法 | |
| WO2012097091A2 (en) | Engineered microorganisms with enhanced fermentation activity |