DK1922415T3 - Anvendelse af både rd9 og is6110 som nukleinsyretargets til diagnose af tuberkulose, og tilvejebringelse af multiplex-egnede is6110- og rd9-targets - Google Patents

Anvendelse af både rd9 og is6110 som nukleinsyretargets til diagnose af tuberkulose, og tilvejebringelse af multiplex-egnede is6110- og rd9-targets Download PDF

Info

Publication number
DK1922415T3
DK1922415T3 DK05784765.9T DK05784765T DK1922415T3 DK 1922415 T3 DK1922415 T3 DK 1922415T3 DK 05784765 T DK05784765 T DK 05784765T DK 1922415 T3 DK1922415 T3 DK 1922415T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
seq
sequence
tuberculosis
mycobacterium
mtbc
Prior art date
Application number
DK05784765.9T
Other languages
English (en)
Inventor
Chantal Savoye
Gervais Clarebout
Original Assignee
Bio Rad Innovations
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Bio Rad Innovations filed Critical Bio Rad Innovations
Application granted granted Critical
Publication of DK1922415T3 publication Critical patent/DK1922415T3/da

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/166—Oligonucleotides used as internal standards, controls or normalisation probes

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (43)

1. Sæt af primere, som omfatter mindst to par af primere, der er egnede til specifik og sensitiv detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) og/eller til specifik og sensitiv adskillelse af Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra andre stammer af MtbC på den anden side, hvor de to par af primere har sådanne sekvenser, at de kan anvendes i multiplex i et enkelt amplifikationsforløb og samtidig tillade specifik og sensitiv detektion og adskillelse, hvor de to par af primere er et IS6110-primerpar, bestående af en IS6110-fremadprimer og en IS6110-tilbageprimer, og et RD9-primerpar, bestående af en RD9-fremadprimer og en RD9-tilbageprimer, hvor RD9-fremadprimeren er et 5'-terminalt fragment på 10 til 18 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:8, hvor det 5'-terminale fragment begynder fra det allerførste 5'-nukleotid af SEQ ID NO:8, hvor RD9-tilbageprimeren er et 5'-terminalt fragment på 10 til 18 nukleotider af den sekvens, som er fuldt komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8, hvor det 5'-terminale fragment begynder fra det allerførste 5'-nukleotid af den komplementære sekvens, hvor IS6110-fremadprimeren er et 5'-terminalt fragment på 10 til 18 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:2, hvor det 5'-terminale fragment begynder fra det allerførste 5'-nukleotid af SEQ ID NO:2, hvor IS6110-tilbageprimeren er et 5'-terminalt fragment på 10 til 18 nukleotider af den sekvens, som er fuldt komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2, hvor det 5'-terminale fragment begynder fra det allerførste 5'-nukleotid af den komplementære sekvens.
2. Sæt af primere ifølge krav 1, kendetegnet ved, at RD9-fremadprimeren omfatter sekvensen af SEQ ID NO:11.
3. Sæt af primere ifølge krav 1, kendetegnet ved, at RD9-tilbageprimeren omfatter sekvensen af SEQ ID NO:12.
4. Sæt af primere ifølge krav 1, kendetegnet ved, at IS6110-fremadprimeren omfatter sekvensen af SEQ ID NO:5.
5. Sæt af primere ifølge krav 1, kendetegnet ved, at IS6110-tilbageprimeren omfatter sekvensen af SEQ ID NO:6.
6. Sæt af to polynukleotider, hvor den ene af de to polynukleotider er et fragment af RD9, hvor den anden er et fragment af IS6110, hvor RD9-fragmentet består af sekvensen af SEQ ID NO:8 eller af den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8, og hvor IS6110-fragmentet består af sekvensen af SEQ ID NO:2 eller af den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2.
7. Amplifikationssammensætning, der omfatter sættet af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5, og mindst et af følgende to amplikoner: - et IS6110-amplikon, som har en størrelse i området fra 190 til 210 nukleotider, og som har mindst 95 % sekvensidentitet med sekvensen af SEQ ID NO:2 eller med den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2; - et RD9-amplikon, som har en størrelse i området fra 160 til 185 nukleotider, og som har mindst 95 % sekvensidentitet med sekvensen af SEQ ID NO:8 eller den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8.
8. Amplifikationssammensætning ifølge krav 7, der omfatter mindst et af følgende to amplikoner: - et IS6110-amplikon, som har en størrelse i området fra 199 til 203 nukleotider, og som har mindst 98 % sekvensidentitet med sekvensen af SEQ ID NO:2 eller med den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2; - et RD9-amplikon, som har en størrelse i området fra 170 til 174 nukleotider, og som har mindst 98 % sekvensidentitet med sekvensen af SEQ ID NO:8 eller med den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8.
9. Amplifikationssammensætning ifølge krav 7 eller 8, som omfatter IS6110-amplikonet og RD9-amplikonet.
10. Anvendelse af en probe til detektion af et amplikon, som fremstilles in vitro ved hjælp af sættet af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5, hvor proben er: i) sekvensen af SEQ ID NO:8 eller den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8 eller et fragment på mindst 15 nukleotider og på mindre end 29 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:8 eller af den komplementære sekvens, eller ii) sekvensen af SEQ ID NO:2 eller den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2, eller et fragment på mindst 15 nukleotider og på mindre end 29 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:2 eller den komplementære sekvens.
11. Anvendelse ifølge krav 10, hvor amplikonet er indeholdt i en amplifikationssammensætning omfattende sættet af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5.
12. Anvendelse ifølge krav 10 eller 11, hvor amplikonet er indeholdt i amplifikationssammensætningen ifølge et hvilket som helst af kravene 7-9.
13. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 10-12, hvor amplikondetektionen anvendes til in vitro diagnose af tuberkulose eller til detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis kompleks (MtbC) i en biologisk prøve.
14. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 10-13, hvor proben er et fragment af sekvensen, der er komplementær til SEQ ID NO:8, hvor fragmentet omfatter sekvensen af SEQ ID NO:9.
15. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 10-13, hvor proben er et fragment af SEQ ID NO:2, hvor fragmentet omfatter sekvensen af SEQ ID NO:3.
16. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 10-15, hvor proben yderligere omfatter mindst én beacon-arm.
17. Anvendelse ifølge krav 16, hvor proben er sekvensen af SEQ ID NO:10.
18. Anvendelse ifølge krav 16, hvor proben er sekvensen af SEQ ID NO:4.
19. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 10-18, hvor proben yderligere omfatter en fluorofor ved dens 5'-ende og/eller en quencher ved dens 3'-ende.
20. Anvendelse af mindst to prober til in vitro diagnose af tuberkulose eller til detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) i en biologisk prøve eller til at skelne Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra de andre stammer af MtbC på den anden side, hvor én af de mindst to prober er: i) sekvensen af SEQ ID NO:8 eller den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8, eller et fragment på mindst 15 nukleotider og på mindre end 29 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:8 eller af den komplementære sekvens, og hvor den anden af de mindst to prober er: ii) sekvensen af SEQ ID NO:2 eller den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2, eller et fragment på mindst 15 nukleotider og på mindre end 29 nukleotider af sekvensen af SEQ ID NO:2 eller den komplementære sekvens.
21. Anvendelse ifølge krav 20, hvor proben som defineret i krav 20 i) er et fragment af den sekvens, som er komplementær til SEQ ID NO:8, hvor fragmentet omfatter sekvensen af SEQ ID NO:9.
22. Anvendelse ifølge krav 20 eller 21, hvor proben som defineret i krav 20 ii) er et fragment af SEQ ID NO:2, der omfatter sekvensen af SEQ ID NO:3.
23. Anvendelsen ifølge et hvilket som helst af kravene 20-22, hvor hver af de mindst to prober yderligere omfatter mindst én beacon-arm.
24. Anvendelse ifølge et hvilket som helst af kravene 20-23, hvor hver af de mindst to prober yderligere omfatter en fluorofor ved dens 5'-ende og/eller en quencher ved dens 3'-ende.
25. PCR-sæt, bestående af mindst én probe, hvis sekvens er som defineret i et hvilket som helst af kravene 10-19, og af sættet af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5.
26. Kit til specifik og sensitiv detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) og/eller til specifik og sensitiv adskillelse af Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra de andre stammer af MtbC på den anden side, kendetegnet ved, at det omfatter: - mindst ét sæt af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5 og/eller - mindst ét sæt af to polynukleotider ifølge krav 6.
27. Kit til in vitro diagnose af tuberkulose, kendetegnet ved, at det omfatter mindst ét blandt følgende elementer: - mindst ét Sæt af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5, - mindst ét sæt af to polynukleotider ifølge krav 6.
28. Kit ifølge krav 26 eller 27, som yderligere omfatter mindst én probe, hvis sekvens er som defineret i et hvilket som helst af kravene 10-19.
29. Kit ifølge et hvilket som helst af kravene 26-28, som yderligere omfatter et oligonukleotid eller polynukleotid, der er egnet til anvendelse som en intern kontrol (IC) i specifik og sensitiv detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) og/eller til specifik og sensitiv adskillelse af Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra andre stammer af MtbC på den anden side, kendetegnet ved, at IC oligonukleotidet eller polynukleotidet omfatter: a. to primer-bindingssteds-sekvenser, hvor den ene af de to primer-bindingssteds-sekvenser, som er placeret i 5' relativt til den anden af de to primer-bindingssteds-sekvenser, er identisk med et medlem af et primerpar udvalgt fra de to primerpar som defineret i et hvilket som helst af kravene 1- 5, og den anden af de to primer-bindingssteds-sekvenser er fuldt komplementær til det andet medlem af det samme udvalgte primerpar og b. en sekvens, der ikke er relateret til mykobakterie, som er placeret mellem de to primer-bindingssteds-sekvenser; og/eller IC proben af SEQ ID NO:14.
30. Kit ifølge krav 29, hvor sekvensen af IC oligonukleotidet er sekvensen af SEQ ID NO:13.
31. Kit ifølge et hvilket som helst af kravene 26 til 30, kendetegnet ved, at det yderligere omfatter en lysebuffer til nukleinsyreekstraktion.
32. Kit ifølge krav 31, kendetegnet ved, at lysebufferen indeholder en anionisk harpiks, der binder divalente ioner.
33. Fremgangsmåde til detektering af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) i en biologisk prøve og/eller til adskillelse af Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra andre stammer af MtbC på den anden side, kendetegnet ved, at den omfatter detektion af to nukleinsyre-targetsekvenser ved PCR under anvendelse af de to par af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5 som amplifikationsprimere, hvor den ene af de to targetsekvenser er IS6110 eller et fragment deraf, og den anden targetsekvens er RD9 eller et fragment deraf, hvor detektion af tilstedeværelse af RD9-targetet og af tilstedeværelse eller fravær af IS6110-targetet er indikativ for tilstedeværelse i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et, som er enten M. tuberculosis eller M. canetti, hvor detektion af fravær af RD9-targetet og af tilstedeværelse af IS6110-targetet er indikativ for tilstedeværelse i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et, som ikke er M. tuberculosis, hvor detektion af fravær af RD9-targetet og fravær af IS6110-targetet er indikativ for fravær i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et.
34. Fremgangsmåde ifølge krav 33, kendetegnet ved, at RD9-targetsekvensen består af sekvensen af SEQ ID N0:8 eller af den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:8 over hele længden af SEQ ID NO:8, og IS6110-targetsekvensen består af sekvensen af SEQ ID NO:2 eller af den sekvens, som er fuldstændig komplementær til SEQ ID NO:2 over hele længden af SEQ ID NO:2.
35. Fremgangsmåde ifølge krav 33 eller 34, kendetegnet ved, at detektion af tilstedeværelse af RD9-targetet og fravær af IS6110-targetet er indikativ for tilstedeværelse i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et, som er enten M. canetti eller en ancestral M. tuberculosis stamme.
36. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33-35, kendetegnet ved, at detektion af tilstedeværelse af RD9-targetet og af tilstedeværelse af IS6110-targetet er indikativ for tilstedeværelse i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et, som er enten M. canetti eller en moderne type M. tuberculosis stamme.
37. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33-36, kendetegnet ved, at detektion af fravær af RD9-targetet og af tilstedeværelse af IS6110-targetet er indikativ for tilstedeværelse i den biologiske prøve af en mykobakterie, der tilhører MtbC’et, som er M. bovis, M. africanum, M. caprae, M. microti eller M. pinnipedii.
38. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33-37, kendetegnet ved, at PCR’en er implementeret i multiplex.
39. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33-38, kendetegnet ved, at PCR’en er implementeret under anvendelse af mindst én probe, hvis sekvens er defineret i et hvilket som helst af kravene 10-19, som detektionsprobe.
40. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33-39, hvorved amplifikationssammensætningen, fremstillet ved hjælp af PCR, omfatter et amplikon fremstillet ved hjælp af ét af de to par af primere og/eller et amplikon fremstillet ved hjælp af det andet af de to primerpar.
41. Fremgangsmåde ifølge et hvilket som helst af kravene 33 til 40, hvorved amplifikationssammensætningen, fremstillet ved PCR, omfatter én af eller begge de to amplikoner som defineret i et hvilket som helst af kravene 7-9.
42. In vitro fremgangsmåde til diagnose af tuberkulose, kendetegnet ved, at tilstedeværelse eller fravær af en mykobakterie af MtbC’et i en biologisk prøve og/eller tilstedeværelse eller fravær af en M. tuberculosis eller M. canetti stamme i en biologisk prøve og/eller tilstedeværelse eller fravær af en mykobakterie af MtbC’et, som ikke er M. tuberculosis, i en biologisk prøve, bestemmes ved implementering af fremgangsmåden ifølge et hvilket som helst af kravene 33-41 på den biologiske prøve.
43. Anvendelse af: - mindst ét sæt af primere ifølge et hvilket som helst af kravene 1-5, og/eller - mindst ét sæt af to polynukleotider ifølge krav 6, i in vitro diagnose af tuberkulose eller til detektion af en mykobakterie af Mycobacterium tuberculosis komplekset (MtbC) i en biologisk prøve eller til adskillelse af Mycobacterium tuberculosis og Mycobacterium canetti på den ene side fra andre stammer af MtbC på den anden side.
DK05784765.9T 2005-09-05 2005-09-05 Anvendelse af både rd9 og is6110 som nukleinsyretargets til diagnose af tuberkulose, og tilvejebringelse af multiplex-egnede is6110- og rd9-targets DK1922415T3 (da)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/EP2005/010290 WO2007028414A1 (en) 2005-09-05 2005-09-05 Use of both rd9 and is6110 as nucleic acid targets for the diagnosis of tuberculosis, and provision of multiplex-compliant is6110 and rd9 targets

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK1922415T3 true DK1922415T3 (da) 2014-03-10

Family

ID=36293489

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK05784765.9T DK1922415T3 (da) 2005-09-05 2005-09-05 Anvendelse af både rd9 og is6110 som nukleinsyretargets til diagnose af tuberkulose, og tilvejebringelse af multiplex-egnede is6110- og rd9-targets

Country Status (9)

Country Link
US (1) US20080206776A1 (da)
EP (2) EP2270233A1 (da)
JP (1) JP5254016B2 (da)
AU (1) AU2005336287B2 (da)
CA (1) CA2621622A1 (da)
DK (1) DK1922415T3 (da)
ES (1) ES2446517T3 (da)
PT (1) PT1922415E (da)
WO (1) WO2007028414A1 (da)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2709356C (en) * 2007-12-21 2019-08-06 Biomerieux Sa Detection of methicillin-resistant staphylococcus aureus
SG176989A1 (en) * 2009-07-03 2012-02-28 Agency Science Tech & Res Method and/or primers for the detection of mycobacterium tuberculosis
KR101458781B1 (ko) * 2009-08-26 2014-11-07 주식회사 엘지생명과학 결핵균군 및 마이코박테리아 속 구분 검출용 조성물 및 이를 이용한 실시간 다중 중합효소 연쇄반응에 의한 결핵균 및 마이코박테리아 속의 동시 분석 방법
JP5590438B2 (ja) * 2010-01-29 2014-09-17 東洋紡株式会社 内部コントロール組成物
WO2012002598A1 (ko) * 2010-07-02 2012-01-05 (주)바이오니아 결핵 진단용 프라이머, 프로브, 이를 포함하는 키트 및 상기 키트를 이용한 결핵 진단 방법
US20120052495A1 (en) * 2010-08-30 2012-03-01 Samsung Techwin Co., Ltd. Oligonucleotides for detecting listeria monocytogenes and use thereof
CN110195117A (zh) * 2018-02-27 2019-09-03 台达电子工业股份有限公司 检测分枝杆菌的方法及其试剂盒
RU2689801C1 (ru) * 2018-06-04 2019-05-29 федеральное государственное бюджетное учреждение "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт фтизиопульмонологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации Способ детекции штаммов Mycobacterium bovis BCG в формате реального времени
KR102388060B1 (ko) * 2021-07-09 2022-04-19 주식회사 코젠바이오텍 결핵균 및 베이징 계통 결핵균의 감별을 위한 조성물 및 이를 이용한 결핵균 검출 방법

Family Cites Families (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69026716T2 (de) * 1989-09-06 1996-11-14 Pasteur Institut Nukleinsäurefragmente von einem genom eines geeigneten mykobakteriums, ihre verwendung zur diagnose von mykobakterieninfektionen sowie diese fragmente enthaltende plasmide
US5776693A (en) 1990-06-08 1998-07-07 Institut Pasteur Specific detection of the mycobacterium tuberculosis
FR2663033B1 (fr) 1990-06-08 1992-09-04 Pasteur Institut Detection specifique du mycobacterium tuberculosis.
US5631130A (en) * 1994-05-13 1997-05-20 Abbott Laboratories Materials and methods for the detection of Mycobacterium tuberculosis
AU690118B2 (en) * 1994-05-16 1998-04-23 De Staat Der Nederlanden Vertegenwoordigd Door De Minister Van Welzijn, Volksgezonheid En Cultuur Detection and differentiation of (mycobacterium tuberculosis) complex bacteria by direct variant repeat oligotyping
FR2733515B1 (fr) * 1995-04-27 1997-09-05 Cis Bio Int Tampon, procede et methode d'evaluation des conditions optimales, d'amplification de sequences cibles d'acide nucleique, et leurs applications
US5811269A (en) * 1996-04-30 1998-09-22 Becton, Dickinson And Company Detection of mycobacteria by multiplex nucleic acid amplification
SE9703532D0 (sv) * 1997-09-30 1997-09-30 Pharmacia Biotech Ab A process for the purification of plasmid DNA
US6294328B1 (en) * 1998-06-24 2001-09-25 The Institute For Genomic Research DNA sequences for strain analysis in Mycobacterium tuberculosis
US6291190B1 (en) * 1998-08-25 2001-09-18 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Molecular differences between species of the M. tuberculosis complex
FR2791067B1 (fr) 1999-03-16 2003-01-31 Pasteur Institut Sequence deletees chez m.bovis bcg/m.ou m.tuberculosis, procede de detection des mycobacteries utilisant ces sequences et vaccins
KR20020021775A (ko) 1999-03-17 2002-03-22 위민즈 앤드 칠드런즈호스피틀 사포신 및 기타 마커를 사용하는 리소좀 축적 질환의 진단방법
EP1190044A2 (en) * 1999-06-16 2002-03-27 The John Hopkins University Characterization of the yeast transcriptome
DK1338657T3 (da) * 2002-02-25 2007-07-30 Pasteur Institut Specifikt fra genomet af Mycobacterium tuberculosis-deleterede sekvenser og anvendelse heraf i diagnostik og som vacciner
US8298758B2 (en) * 2003-12-26 2012-10-30 Prima Meat Packers, Ltd. Method of multiplex microorganism detection

Also Published As

Publication number Publication date
AU2005336287B2 (en) 2012-02-02
ES2446517T3 (es) 2014-03-10
EP1922415B1 (en) 2013-12-25
EP2270233A1 (en) 2011-01-05
JP5254016B2 (ja) 2013-08-07
AU2005336287A1 (en) 2007-03-15
US20080206776A1 (en) 2008-08-28
WO2007028414A1 (en) 2007-03-15
EP1922415A1 (en) 2008-05-21
PT1922415E (pt) 2014-02-25
CA2621622A1 (en) 2007-03-15
JP2009506782A (ja) 2009-02-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK1922415T3 (da) Anvendelse af både rd9 og is6110 som nukleinsyretargets til diagnose af tuberkulose, og tilvejebringelse af multiplex-egnede is6110- og rd9-targets
JP2814422B2 (ja) 複数核酸増幅によるミコバクテリアの検出
CN102329880B (zh) 结核菌检测用的引物和探针以及使用它们检测人型结核菌的方法
AU2006209416B2 (en) Method of quantitatively analysing microorganism targeting rRNA
EP3286323B1 (en) Multiplex detection of bacterial vaginosis
JP5518471B2 (ja) 性感染病の原因である３つの細菌種のリアルタイムマルチプレックス検出
WO2002052043A1 (fr) Procede de detection d'un micro-organisme pathogene
WO2008025570A1 (en) Detection of salmonella by real-time multiplex pcr
WO2005083122A2 (en) Method for detecting a microorganism in a fecal specimen
KR100388548B1 (ko) 알이피 13 이 12 반복서열의 피시알 증폭을 이용한결핵균의 검출방법
JP3151415B2 (ja) 鳥型結核菌複合種の増幅および検出
Gill et al. Enzyme-linked immunosorbent assay of nucleic acid sequence-based amplification for molecular detection of M. tuberculosis
US10030276B1 (en) Detection of Mycobacterium tuberculosis complex nucleic acids
Ellingson et al. Comparison of PCR prescreening to two cultivation procedures with PCR confirmation for detection of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis in US Department of Agriculture fecal check test samples
KR101425149B1 (ko) 원-튜브 네스티드 실시간 피시알을 이용한 개선된 결핵균 진단방법
JP2966478B2 (ja) ミコバクテリア属微生物の検出方法
JP2013055947A (ja) 結核の診断のための核酸標的としてのｒｄ９およびｉｓ６１１０の使用、ならびにマルチプレックス−コンプライアントｉｓ６１１０およびｒｄ９標的の提供
EP1404869B1 (en) Detection of microorganisms using inducible genes
US7332597B2 (en) Primers and probe to identify mycobacterium tuberculosis complex
WO2009140198A2 (en) Pathogen detection and screening
EP3822370A1 (en) Method of determining the presence of a hyper-virulent clostridioides difficile strain of the b1/nap1/027 group in a sample
JP2902054B2 (ja) ヒト型結核菌の検出方法
Aytekin Identification of mycobacterial species by sequence specific polymerase chain reaction