CZ357599A3 - Syntetický peptid použitelný v biologických testech pro detekci infekcí způsobených viry HIV-1 SKUPINY O - Google Patents
Syntetický peptid použitelný v biologických testech pro detekci infekcí způsobených viry HIV-1 SKUPINY O Download PDFInfo
- Publication number
- CZ357599A3 CZ357599A3 CZ19993575A CZ357599A CZ357599A3 CZ 357599 A3 CZ357599 A3 CZ 357599A3 CZ 19993575 A CZ19993575 A CZ 19993575A CZ 357599 A CZ357599 A CZ 357599A CZ 357599 A3 CZ357599 A3 CZ 357599A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- leu
- ser
- peptide
- arg
- asn
- Prior art date
Links
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 title claims abstract description 241
- 241000713772 Human immunodeficiency virus 1 Species 0.000 title claims abstract description 20
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 title abstract description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 title description 8
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims abstract description 17
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 11
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 104
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 74
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 74
- BCAVNDNYOGTQMQ-AAEUAGOBSA-N Ser-Trp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(O)=O BCAVNDNYOGTQMQ-AAEUAGOBSA-N 0.000 claims description 44
- 108010069495 cysteinyltyrosine Proteins 0.000 claims description 37
- TUIOUEWKFFVNLH-DCAQKATOSA-N Leu-Val-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O TUIOUEWKFFVNLH-DCAQKATOSA-N 0.000 claims description 33
- WQOHKVRQDLNDIL-YJRXYDGGSA-N Tyr-Thr-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WQOHKVRQDLNDIL-YJRXYDGGSA-N 0.000 claims description 31
- GRQCSEWEPIHLBI-JQWIXIFHSA-N Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 GRQCSEWEPIHLBI-JQWIXIFHSA-N 0.000 claims description 26
- RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O RXGLHDWAZQECBI-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 24
- CIVXDCMSSFGWAL-YUMQZZPRSA-N Cys-Lys-Gly Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N CIVXDCMSSFGWAL-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims description 22
- CEZSLNCYQUFOSL-BQBZGAKWSA-N Cys-Arg-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(O)=O CEZSLNCYQUFOSL-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims description 20
- IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IAJFFZORSWOZPQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 20
- MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O MEJHFIOYJHTWMK-VOAKCMCISA-N 0.000 claims description 18
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 claims description 17
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 17
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 claims description 17
- CJDZKZFMAXGUOJ-IHRRRGAJSA-N Val-Cys-Tyr Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N CJDZKZFMAXGUOJ-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 14
- MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N (2S)-2-Amino-3-hydroxypropansäure Chemical compound OC[C@H](N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 11
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- CCDFBRZVTDDJNM-GUBZILKMSA-N Ala-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CCDFBRZVTDDJNM-GUBZILKMSA-N 0.000 claims description 10
- OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N Gly-Arg-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CCCN=C(N)N OVSKVOOUFAKODB-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 9
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 8
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 claims description 8
- HOMFINRJHIIZNJ-HOCLYGCPSA-N Leu-Trp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(O)=O HOMFINRJHIIZNJ-HOCLYGCPSA-N 0.000 claims description 8
- 125000001931 aliphatic group Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 8
- YZACQYVWLCQWBT-BQBZGAKWSA-N Gly-Cys-Arg Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O YZACQYVWLCQWBT-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims description 7
- 241000560056 HIV-1 group O Species 0.000 claims description 7
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 7
- IEZVHOULSUULHD-XGEHTFHBSA-N Thr-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O IEZVHOULSUULHD-XGEHTFHBSA-N 0.000 claims description 7
- IXEGQBJZDIRRIV-QEJZJMRPSA-N Trp-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IXEGQBJZDIRRIV-QEJZJMRPSA-N 0.000 claims description 7
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N Arg-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UHFUZWSZQKMDSX-DCAQKATOSA-N 0.000 claims description 6
- LGQZOQRDEUIZJY-YUMQZZPRSA-N Gly-Cys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)CN)C(O)=O LGQZOQRDEUIZJY-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims description 6
- ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N Leu-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O ZFNLIDNJUWNIJL-WDCWCFNPSA-N 0.000 claims description 6
- QJUWBDPGGYVRHY-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N QJUWBDPGGYVRHY-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims description 6
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 108010038745 tryptophylglycine Proteins 0.000 claims description 6
- HQIZDMIGUJOSNI-IUCAKERBSA-N Arg-Gly-Arg Chemical compound N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O HQIZDMIGUJOSNI-IUCAKERBSA-N 0.000 claims description 5
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 5
- PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims description 5
- GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N Lys-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O GQZMPWBZQALKJO-UWVGGRQHSA-N 0.000 claims description 5
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 5
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 claims description 5
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 5
- BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N Ala-Val-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N BOKLLPVAQDSLHC-FXQIFTODSA-N 0.000 claims description 4
- 101100505161 Caenorhabditis elegans mel-32 gene Proteins 0.000 claims description 4
- VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N Gly-Lys-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VBOBNHSVQKKTOT-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims description 4
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 claims description 4
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 4
- LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N Ser-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO LDEBVRIURYMKQS-WISUUJSJSA-N 0.000 claims description 4
- UKINEYBQXPMOJO-UBHSHLNASA-N Trp-Asn-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N UKINEYBQXPMOJO-UBHSHLNASA-N 0.000 claims description 4
- 125000004057 biotinyl group Chemical group [H]N1C(=O)N([H])[C@]2([H])[C@@]([H])(SC([H])([H])[C@]12[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 4
- 125000002485 formyl group Chemical class [H]C(*)=O 0.000 claims description 4
- 125000004435 hydrogen atom Chemical class [H]* 0.000 claims description 4
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N ornithyl group Chemical group N[C@@H](CCCN)C(=O)O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 4
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 claims description 4
- 125000000341 threoninyl group Chemical group [H]OC([H])(C([H])([H])[H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims description 4
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims description 4
- 125000004191 (C1-C6) alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 3
- YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N Glu-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O YQAQQKPWFOBSMU-WDCWCFNPSA-N 0.000 claims description 3
- 208000031886 HIV Infections Diseases 0.000 claims description 3
- 241000713340 Human immunodeficiency virus 2 Species 0.000 claims description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 3
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims description 3
- NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N Lys-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NKKFVJRLCCUJNA-QWRGUYRKSA-N 0.000 claims description 3
- SVWQEIRZHHNBIO-WHFBIAKZSA-N Ser-Gly-Cys Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O SVWQEIRZHHNBIO-WHFBIAKZSA-N 0.000 claims description 3
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 claims description 3
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 3
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 3
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims description 3
- 125000000613 asparagine group Chemical group N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims description 3
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 claims description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 claims description 3
- 230000003053 immunization Effects 0.000 claims description 3
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 3
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 3
- JEXPNDORFYHJTM-IHRRRGAJSA-N Arg-Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JEXPNDORFYHJTM-IHRRRGAJSA-N 0.000 claims description 2
- XHTUGJCAEYOZOR-UBHSHLNASA-N Asn-Ser-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O XHTUGJCAEYOZOR-UBHSHLNASA-N 0.000 claims description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 claims description 2
- SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N L-2-aminopentanoic acid Chemical group CCC[C@H](N)C(O)=O SNDPXSYFESPGGJ-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 2
- LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N L-norleucine Chemical compound CCCC[C@H]([NH3+])C([O-])=O LRQKBLKVPFOOQJ-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 2
- HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N Ser-Ala-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HRNQLKCLPVKZNE-CIUDSAMLSA-N 0.000 claims description 2
- GVIGVIOEYBOTCB-XIRDDKMYSA-N Ser-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 GVIGVIOEYBOTCB-XIRDDKMYSA-N 0.000 claims description 2
- TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N acetyl Chemical compound C[C]=O TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 claims description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 2
- 125000003342 alkenyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 claims description 2
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims description 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims description 2
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 2
- 238000002649 immunization Methods 0.000 claims description 2
- MFFOYNGMOYFPBD-DCAQKATOSA-N Asn-Arg-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MFFOYNGMOYFPBD-DCAQKATOSA-N 0.000 claims 1
- MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N Asn-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MKJBPDLENBUHQU-CIUDSAMLSA-N 0.000 claims 1
- GHUVBPIYQYXXEF-SRVKXCTJSA-N Cys-Cys-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 GHUVBPIYQYXXEF-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims 1
- DZSICRGTVPDCRN-YUMQZZPRSA-N Cys-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CS)N DZSICRGTVPDCRN-YUMQZZPRSA-N 0.000 claims 1
- JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N Gly-Arg-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JXYMPBCYRKWJEE-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims 1
- TWYOYAKMLHWMOJ-ZPFDUUQYSA-N Ile-Leu-Asn Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O TWYOYAKMLHWMOJ-ZPFDUUQYSA-N 0.000 claims 1
- WKSHBPRUIRGWRZ-KCTSRDHCSA-N Ile-Trp-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)NCC(=O)O)N WKSHBPRUIRGWRZ-KCTSRDHCSA-N 0.000 claims 1
- QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N L-lysyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 claims 1
- PIHFVNPEAHFNLN-KKUMJFAQSA-N Leu-Cys-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)O)N PIHFVNPEAHFNLN-KKUMJFAQSA-N 0.000 claims 1
- XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N Leu-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C XOWMDXHFSBCAKQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 claims 1
- VHFFQUSNFFIZBT-CIUDSAMLSA-N Lys-Ala-Cys Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N VHFFQUSNFFIZBT-CIUDSAMLSA-N 0.000 claims 1
- LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N Tyr-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LUMQYLVYUIRHHU-YJRXYDGGSA-N 0.000 claims 1
- ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N Val-Val-Cys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O ZHWZDZFWBXWPDW-GUBZILKMSA-N 0.000 claims 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 claims 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 abstract description 81
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 abstract description 8
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 50
- BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 1,3-diisopropylcarbodiimide Chemical compound CC(C)N=C=NC(C)C BDNKZNFMNDZQMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 50
- NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N hydroxybenzotriazole Substances O=C1C=CC=C2NNN=C12 NPZTUJOABDZTLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 49
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 19
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 16
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 15
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 15
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 11
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 10
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 101800001690 Transmembrane protein gp41 Proteins 0.000 description 9
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 8
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 7
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L thimerosal Chemical compound [Na+].CC[Hg]SC1=CC=CC=C1C([O-])=O RTKIYNMVFMVABJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 6
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 6
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 6
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 6
- VXDXZGYXHIADHF-YJRXYDGGSA-N Cys-Tyr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VXDXZGYXHIADHF-YJRXYDGGSA-N 0.000 description 5
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 5
- -1 p16 Proteins 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- ILXAOQAXSHVHTM-UHFFFAOYSA-M sodium;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;chloride Chemical compound [Na+].[Cl-].OCC(N)(CO)CO ILXAOQAXSHVHTM-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 5
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229920000361 Poly(styrene)-block-poly(ethylene glycol) Polymers 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 4
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 4
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 4
- 238000007363 ring formation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000000405 serological effect Effects 0.000 description 4
- DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 1,1-ethanedithiol Chemical compound CC(S)S DHBXNPKRAUYBTH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FSPQNLYOFCXUCE-BPUTZDHNSA-N Arg-Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N FSPQNLYOFCXUCE-BPUTZDHNSA-N 0.000 description 3
- 241000725303 Human immunodeficiency virus Species 0.000 description 3
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 3
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 3
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 3
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 3
- 239000012452 mother liquor Substances 0.000 description 3
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 3
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 3
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 3
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 235000020183 skimmed milk Nutrition 0.000 description 3
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 3
- HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N thioanisole Chemical compound CSC1=CC=CC=C1 HNKJADCVZUBCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- 208000030507 AIDS Diseases 0.000 description 2
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N H-Lys-Trp-OH Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 RVKIPWVMZANZLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 2
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N Lys-Ala-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN IRNSXVOWSXSULE-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N Phenolsulfonephthalein Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1C1(C=2C=CC(O)=CC=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 BELBBZDIHDAJOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N Piperidine Chemical compound C1CCNCC1 NQRYJNQNLNOLGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000270295 Serpentes Species 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MHCLIYHJRXZBGJ-AAEUAGOBSA-N Trp-Gly-Cys Chemical compound N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C12)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O MHCLIYHJRXZBGJ-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 2
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 2
- 244000309466 calf Species 0.000 description 2
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 2
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 2
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000001175 peptic effect Effects 0.000 description 2
- 229960003531 phenolsulfonphthalein Drugs 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 2
- 230000002335 preservative effect Effects 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 108010072986 threonyl-seryl-lysine Proteins 0.000 description 2
- GEYOCULIXLDCMW-UHFFFAOYSA-N 1,2-phenylenediamine Chemical compound NC1=CC=CC=C1N GEYOCULIXLDCMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VDCIPFYVCICPEC-FXQIFTODSA-N Asn-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VDCIPFYVCICPEC-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PQAIOUVVZCOLJK-FXQIFTODSA-N Asn-Gln-Gln Chemical compound C(CC(=O)N)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N PQAIOUVVZCOLJK-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N Asn-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GFFRWIJAFFMQGM-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- NUCUBYIUPVYGPP-XIRDDKMYSA-N Asn-Leu-Trp Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](Cc1c[nH]c2ccccc12)C(O)=O NUCUBYIUPVYGPP-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N Cys-Tyr Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 DSTWKJOBKSMVCV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- FLQAKQOBSPFGKG-CIUDSAMLSA-N Glu-Cys-Arg Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N FLQAKQOBSPFGKG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QQLBPVKLJBAXBS-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QQLBPVKLJBAXBS-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N Glu-Leu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MWMJCGBSIORNCD-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N Hydrogen peroxide Chemical compound OO MHAJPDPJQMAIIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- LSPYFSHXDAYVDI-SRVKXCTJSA-N Leu-Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C LSPYFSHXDAYVDI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ORWTWZXGDBYVCP-BJDJZHNGSA-N Leu-Ile-Cys Chemical compound SC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C ORWTWZXGDBYVCP-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N Lys-Asn-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O DNEJSAIMVANNPA-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DZQYZKPINJLLEN-KKUMJFAQSA-N Lys-Cys-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCCCN)N)O DZQYZKPINJLLEN-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- BVRNWWHJYNPJDG-XIRDDKMYSA-N Lys-Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N BVRNWWHJYNPJDG-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 1
- 208000005074 Retroviridae Infections Diseases 0.000 description 1
- LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N Ser-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N LGIMRDKGABDMBN-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 235000004338 Syringa vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- 244000297179 Syringa vulgaris Species 0.000 description 1
- IQPWNQRRAJHOKV-KATARQTJSA-N Thr-Ser-Lys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IQPWNQRRAJHOKV-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N Trp-Asn-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N IUFQHOCOKQIOMC-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 239000012964 benzotriazole Substances 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 238000001311 chemical methods and process Methods 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- AQEFLFZSWDEAIP-UHFFFAOYSA-N di-tert-butyl ether Chemical compound CC(C)(C)OC(C)(C)C AQEFLFZSWDEAIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 108700004025 env Genes Proteins 0.000 description 1
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 description 1
- 108700004026 gag Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 239000012212 insulator Substances 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- JPMIIZHYYWMHDT-UHFFFAOYSA-N octhilinone Chemical compound CCCCCCCCN1SC=CC1=O JPMIIZHYYWMHDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 108700004029 pol Genes Proteins 0.000 description 1
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 1
- 238000010532 solid phase synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODVKSTFPQDVPJZ-UHFFFAOYSA-N urinastatin Chemical compound C1C=CCCC11COC(C=2OC=CC=2)OC1 ODVKSTFPQDVPJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
- C07K14/08—RNA viruses
- C07K14/15—Retroviridae, e.g. bovine leukaemia virus, feline leukaemia virus human T-cell leukaemia-lymphoma virus
- C07K14/155—Lentiviridae, e.g. human immunodeficiency virus [HIV], visna-maedi virus or equine infectious anaemia virus
- C07K14/16—HIV-1 ; HIV-2
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/005—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N7/00—Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2740/00—Reverse transcribing RNA viruses
- C12N2740/00011—Details
- C12N2740/10011—Retroviridae
- C12N2740/16011—Human Immunodeficiency Virus, HIV
- C12N2740/16111—Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
- C12N2740/16122—New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Virology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Public Health (AREA)
- AIDS & HIV (AREA)
- Hematology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Description
Syntetický peptid použitelný v biologických testech pro detekci infekcí způsobených viry HIV-1 skupiny 0
Oblast techniky
Vynález se týká syntetických peptidů použitelných v biologických testech pro detekci infekcí způsobených viry HIV 1 skupiny 0, způsobů přípravy těchto peptidů, kitů obsahujících tyto peptidy a biologických zkoušek za použití těchto peptidů, farmaceutických prostředků, které tyto peptidy obsahují a biologických zkoušek, prováděných za použití těchto pept i dů.
Dosavadní stav techniky
Retroviry HIV-1 skupiny 0 jsou známy. Evropský patentový spis číslo 0 345375 a zveřejněná evropská přihláška vynálezu číslo EP 0657532 popisují izoláty ANT 70 a ANT 70 NA izolované od kamerunských nemocných jedinců. Uvedené spisy se zvláště týkají antigenů sloučenin antigenních obsahujících lyzáty nebo proteiny z těchto izolátů, nukleových kyselin odpovídajících genomickým ARN, způsobů hybridizace za získání těchto nukleových kyseliny, způsobů přípravy shora uvedených izolátů a způsobů přípravy proteinů p12, p16, p25, gp41 , gp120 těchto ret rovi rů.
Zveřejněná evropská přihláška vynálezu číslo EP 0591914 popisuje izolát MVP 5180/91. Tento izolát, charakterizovaný způsobem Western Blot, jako předchozí izolát, uvádí rozdíly ve vztahu k izolátům retroviru HIV-1, již známým. Zveřejněná evropská přihláška vynálezu číslo EP 0591914 popisuje přesně sekvenci ADN izolátů MVP 5180/91 a vyznačuje přesně umístění genů gag, pol a env. V této přihlášce vynálezu EP 0591914 se také popisují syntetické peptidy smyčky V3 a imunodominantní oblast (gp41). Tyto oblasti se hodí pro biologické zkoušky, • · f ·
- 2 zvláště pro detekci in vitro protilátek HIV-1 skupiny O.
Zveřejněná evropská přihláška vynálezu číslo EP 0673948 popisuje syntetické nebo rekombinované peptidy sestávající z 15 až 50 aminokyselin (AA) se sekvencí
-VWGIRQLRARLQALETLIQNQQRLNLWGXKGKLIXYTSVKWNTSWSGRkde znamená X zbytek cysteinu nebo šeřinu. Těchto peptidů se používá v diagnostice pro detekci infekcí způsobovaných určitými izoláty retroviru HIV-1 skupiny O.
Rovněž je známa zveřejněná evropská přihláška vynálezu číslo EP O 727483, která popisuje izolát MVP 2901/94, který je rovněž součástí retroviru z rodiny HIV-1 skupiny O. Tato přihláška vynálezu popisuje určité antigeny mající peptidové dobře vymezené sekvence. Tyto peptidové sekvence odpovídají části sekvence gp120 a části sekvence gp41 (imunodominantní oblasti) izolátu MVP 2901/94.
Zveřejněná přihláška vynálezu WO 96/12809 popisuje dva nové izoláty příslušející do rodiny HIV-1 skupiny 0. Jde o izoláty VAU a DUR. Jsou popsány určité peptidové sekvence pocházející ze dvou popisovaných virů, vhodné k detekci protilátek rozeznávajících peptidové sekvence HIV-1 VAU a DUR.
Zveřejněná přihláška vynálezu WO 96/32293 popisuje dva antigeny pocházející ze sekvence izolátu ANT 70. Jde o antigen nazvaný MDL061 a antigen MDLO56 imunodominantní oblasti gp41. Uvádí se, že k detekci 100 % vzorků jedné omezené kolekce sér nemocných, infikovaných virem HIV-1 skupiny 0, je třeba použít sloučenin obsahujících tyto dva peptidy, jelikož každý izolovaný peptid neumožňuje sám o sobě získat uspokojivé výsledky.
Ve skutečnosti je téměř nemožné, vzhledem ke genetické variabilitě, kterou se vyznačují izoláty viru skupiny 0, zaru3 čit serologické vystopování jedinců kontaminovaných zavedením antigenů pocházejících z jednoho a téhož izolátu. To znamená, že není možno získat reagencie, které zaručují 100% citlivost. Skupina 0 tak představuje především významný problém; jde o nepřiměřenost některých sérologických reagencií k rozeznání jedinců kontaminovaných obzvlášt divergentními skupinami nebo podskupinami. To přesně je případ HIV-1 skupiny O.
Zveřejněná přihláška vynálezu WO 96/40763 také trvá na velké divergenci skupiny 0. Popisují se peptidy, které začleňují do přírodní sekvence HIV-1 typu B některé drobné modifikace (náhradu jedné nebo dvou aminokyselin). Uvádějí se hybridní peptidy schopné reagovat s protilátkami proti skupině 0.
Ve zveřejněné přihlášce vynálezu WO 96/27013 se popisuje řada nových virů HIV skupiny 0, označovaných BCF 01, BCF 02, BCF 03, BCF 06, BCF 07, BCF 08, BCF 09, BCF 11, BCF 12, BCF 13 a BCF 14 a řada peptidů dominantní oblasti odpovídajících gp41 pojmenovaných ESS/BCF02, FAN/BCF01, L0B/BCF06, MAN/BCF07, NKO/ BCF08, P0C/BCF03, NAN/BCF11, BCF09, BCF12, BCF13, BCF14. Určitý počet těchto peptidů je špatně zpracovatelný při dignostice vzhledem k jejich slabé rozpustnosti, zejména peptid BCF13.
Zcela neočekávatelně se nyní zjistilo, že určité syntetické peptidy jsou diagnosticky hodnotněji reaktivní a umoňují dostatečným způsobem identifikovat memocmé nakažené retrovirem HIV-1 skupiny 0. Tyto peptidy sestávají z rozmanitých sekvencí seskupených kolem velmi Zachovalých krátkých sekvencí, obsažených v izolátech retroviru HIV-1 skupiny O. Peptidy podle vynálezu umožňují dosahovat lepších výsledků, než jakých se dosahovalo se syntetickými peptidovými nosiči imunodominantních epitopů gp41 (env) určitých izolátů HIV-1 skupiny 0,
V dalším textu je k pojmenování aminokyselin použito tří— písmenových kódů.
Podstata vynálezu
Podstatou vynálezu jsou syntetické peptidy obecného vzorce I
A-Z>TrpGlyCys-0-CysTyrThrSer-n (I) kde znamená delta skupinu biotiny1ovou, biocytinylovou, atom vodíku, skupinu acetylovou (CH3CO)-, alifatický řetězec, obsahující popřípadě jednu nebo dvě skupiny thiolové, aldehydové nebo aminoskupiny, alifatický řetězec, kterým je s výhodou řetězec alkylový s 1 až 6 atomy uhlíku, nebo řetězec alkenylový se 2 až 6 atomy uhlíku nebo řetězec aminoalkylkarbonylový se 2 až 6 atomy uhlíku,
Z znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce II až X
| -HrSer-Ez- | CD |
| -Ser-Z2- | (III) |
| -Ξι-Ser- | (IV) |
| (V) | |
| -Gln-E2- | (VI) |
| -Ξι-Gln- | (Vil) |
| -Ei-Asn-E2- | (Vlil) |
| -Asn-E2- | (IX) |
| Ξι-Asn- | (X) |
kde
-2, znamená peptidovou sekvenci 0 až 9 aminokyselin, ./¾ znamená peptidovou sekvenci 0 až 5 aminokyselin,
-Θ znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce XI:
-(AAi )-(AAz)-(AA3)-(AA4 )-(AAs)- (XI) kde znamená (AA1 ) lysinový, argininový nebo ornithinový zbytek, • · · · φ · · ··· ··· (ΑΑ2) glycinový nebo asparaginový zbytek (AAe) lysinový, argininový nebo ornithinový zbytek (AA4) leucinový, alaninový, isoleucinový nebo glutaminový zbytek (AAs ) i soleucinový, valinový, leucinový, threoninový, norleucinový nebo norvalinový zbytek, za předpokladu, že (AA-ι), (AA2), (AA3), (AA4 ) a (AA5 ) netvoří nikdy seskupení peptidových sekvencí -Lys Gly Lys Leu Ile a Lys Gl.y Lys Leu Val-,
-Ω vázaný na skupinu -CO- šeřinu znamená
- hydroxylovou skupinu (-0H) nebo aminoskupinu (-NH2),
- alkoxylovou skupinu s 1 až 6 atomy uhlíku,
- peptidovou skupinu obecného vzorce XII
-Val-Σ-Ψ (XII) kde Σ znamená sekvenci obecného vzorce XIII nebo obecného vzorce XIV
-(AAe)-Trp Asn-(AA7)-(ΑΑβ) (XIII)
-(AAe-Trp His-(AA? )-(AAs) (XIV) kde znamená (AAe) aminokyselinu jinou než lysin, (AA7) aminokyselinu, (AAe) serinový nebo threoninový zbytek a Ψ fixovaný na zbytek -CO- volné aminokyseliny AAs znamená skupinu OH, NH2 nebo alkoxyskupinu s 1 až 6 atomy uhlíku,
- peptidovou sekvenci obecného vzorce XV
-Val-ψ' (xv) kde fixovaný na zbytek -CO- val inu má stejný význam jako u obecného vzorce XII,
-nebo jednu,z peptidových sekvenci obecného vzorce XVI až XVIII • · • φ» φφφ φ φ φ φ · • φ φφφφ • · φ φφφφφφ φ φ · ♦
ΦΦΦΦ ·
-Z-TrpGlyCys-G-CysTyrThrSer-T (XVI)
Val-L-Z-TrpGlyCys-©-CysTyrThrSerVal-S-T (XVII)
Vai-Z-TrpGlyCys-Q-CysTyrThrSerVal-T (XVIII) kde Z a Θ mají shora u obecného vzorce I uvedený význam a Σ má význam uvedený u obecného vzorce XII a ψ fixovaný na zbytek -CO- šeřinu, na zbytek -CO- aminokyseliny AAe'nebo na zbytek -CO- val inu má stejný význam jako u obecného vzorce XII.
Když Ω představuje peptidovou sekvenci jednoho z obecných vzorců XVI až XVIII, stává se peptid obecného vzorce I dimerem, jehož tvar se může měnit ve 26 až 66 aminokyselinách. Když Ω nepředstavuje peptidovou sekvenci jednoho z obecných vzorců XVI až XVIII, jsou peptidy obecného vzorce I monomerního typu a jejich forma se může měnit ve 13 až 33 aminokyselinách .
Peptidy podle vynálezu mohou být bud ve formě lineární, nebo ve formě cyklické prostřednictvím intercysteinových disulfidových můstků.
Přednost se dává sloučeninám obecného vzorce I, kde znamená (AAs) zbytek valinový, leucinový nebo threoninový, a pokud znamená Ω znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce XII, znamená (AAe) bud glutaminový nebo argininový zbytek.
Přednost se dává sloučeninám obecného vzorce I, kde znamená
- delta biotinylovou skupinu, atom vodíku nebo alifatický řetězec, který může obsahovat jednu nebo dvě thiolové, aldehydové nebo aminové skupiny, přičemž alifatický řetězec je s výhodou alkylový s 1 až 6 atomy uhlíku, nebo aminoalkylkarbonylový se 2 až 6 atomy uhlíku, • · · • ·
| • · • · | • | • | ·· |
| • | • | • · · · | |
| • | • · | • | • · ·· · |
| • | • | • | • · |
| • · · · | • · · |
- Z peptidovou sekvenci obecného vzorce II nebo V, kde znamená peptidovou sekvenci se dvěma aminokyselinami a aminokyselinu nebo sekvenci obecného vzorce IV, kde znamená tři aminokyseliny, nebo peptidovou sekvenci obecného vzorce VIII, kde znamená peptidovou sekvenci devíti, osmi nebo tří aminokyselin a peptidickou sekvenci pěti aminokyselin,
| Θ pepti | dovou | sekvenci vzore | |||
| -Lys | G1 | y | Arg | Leu | Val-, |
| -Arg | G1 | y | Lys | AI a | Val-, |
| -Arg | G1 | y | Arg | Leu | Val-, nebo |
| -Arg | G1 | y | Arg | AI a | Val - a |
- Ω hydroxylovopu skupinu, peptidovou sekvenci XV nebo jednu z následujících sekvencí, které odpovídají peptidové sekvenci vzorce XII:
- Val Arg Trp Asn Glu Thr-Ψ,
- Val Gin Trp Asn Glu Thr-Ψ
- Val Gin Trp Asn Ser Thr-Ψ.
S výhodou Z znamená peptidovou sekvenci vzorce
-Leu Leu Ser Ser-Leu Leu Asn Ser-Leu Leu Din Ser-Arg Leu Asn Ser-
| -Ala | Leu | Glu | Thr | Leu | Leu | Gin | Asn | Gin | G1 | n | Leu | Leu | Asn | Ser- |
| -Ala | Leu | Glu | Thr | Leu | Leu | Gin | Asn | Gin | G1 | n | Leu | Leu | Asn | Leu- |
| -Ala | Leu | Glu | Thr | Leu | Leu | Gin | Asn | Gin | G1 | n | Leu | Leu | Asn | 11 e- |
| -Leu | Asn | Gin | Gin | Arg | Leu | Asn | Ser- | - nebo | ||||||
| -Arg | AI a | Leu | Glu | Thr | Leu | Leu | Asn | Gin | G1 | n | Arg | Leu | Leu | Asn Sei—. |
Vynález se týká také syntetických peptidů zahrnujících 20 až 50 aminokyselin a odpovídajících obecnému vzorce la:
delt a-Za-T rpGlyCys-8-CysTyrThrSer-na (la) kde znamená Za skupinu vzorce Ila až Xa:
| H1a-Ser-H2a | (Ha) |
| -Ser-S2a | (Hla) |
| -21a-Ser | (IVa) |
| Sia-Gln-H2a | (Va) |
| -Gln-~2a | (Via) |
| H1a-Gln- | (Vila) |
| Hia-Asn-H2a | (Vlila) |
| -Asn-~2a | (IXa) |
| 'ia~Asn | (Xa) |
kde znamená
-H1a peptidovou sekvenci jedné až pěti aminokyselin 'H2a >ednu aminokyselinu
Qa peptidovou sekvenci obecného vzorce XII, obecného vzorce (I), nebo peptidovou sekvenci obecného vzorce XVIIa;
Val-Z-Za-TrpGlyCys-0-CysTyrThrSerVal-L-T (XVI la) kde Za má význam uvedený u obecného vzorce Ia a delta, 6, Σ a Ψ mají stejný význam jako u obecného vzorce I.
Přednost se dává peptidům obecného vzorce I nebo Ia zahrnujícím jednu z následujících sekvencí (tyto peptidy mohou být monomerního nebo dimerního typu, jak shora uvedeno). V dalším textu je k pojmenování aminokyselin použito třípí směnových kódů. Sekvence č. 1
-LLSLWGCRGKAVCYTSVQWNETnebo •Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Glu Thr22
Sekvence č. 2
-LLSLWGCRGRLVCYTSVQWNETnebo
-Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20
Glu Thr22 •· · ϊ ···· ··· ··· ····
Sekvence č. 3
-LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNETnebo
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Glu Thr22
Sekvence č. 4
-LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNSTnebo .
-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Ser Thr22
Sekvence č. 5
-LLQSWGCKGRLVCYTSVQWNSTnebo
-Leu Leu Gin Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Ser Thr22
Sekvence č. 6
-LLNSWGCRGKAVCYTSVQWNETnebo
-Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
10 15 20
Glu Thr22
Sekvence č. 7
-LLSLWGCRGRAVCYTSVQWNETnebo
-Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20 • Glu Thr22 ;Sekvence č. 8
-LLSSWGCRGRLVCYTSVQWNETnebo
-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Glu Thr22
Sekvence č. 9
-LLSSWGCKGRLVCYTSnebo
-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser15 10 15
Sekvence δ. 10
-LLNSWGCKGRLVCYTSnebo
-Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser15 10 15
Sekvence δ. 11
-ALETLLQNQQLLNSWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo
-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly 15 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30
1
Sekvence č. 12
-ALETLLQNQQLLNIWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo
-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn lle Trp Gly Cys Arg Gly 15 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30
Sekvence č. 13
-ALETLLQNQQLLDLWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo
-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asp Leu Trp Gly Cys Arg Gly 15 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30
Sekvence č. 14
-LNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSVnebo
-Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr 1 5 10 15
Thr Ser Val20
Sekvence č. 15
-RALETLLNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSVnebo
- Arg Ala Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys 1 5 10 15
Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val20 25 • · ··· ··· > · · · · · ·
Sekvence č. 16
-RLNSWGCKGRLVCYTSVnebo
- Arg Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val15 10 15
Obzváště výhodnými jsou následující syntetické peptidy:
PePt &, 1 (2B): SEQ ID N° 1 LLSLWGCRGKAVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Ser' Leu Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
5 10 15 20
Glu Thr p^Pti£_č. 2 (35) · SEQ ,D No 2
LLSLWGCRGRLVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
Glu Thr 22 ' gpÍiq č · 3 (4B): SEQ ID N° 3 LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
5 10 15 .20
Glu Thr
Peptid č. 4(5B):-SEQ ID N° 4
LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNST nebo to * ·
• · · · to · · ·
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Ser Thr 22
Peptid č. 5(6B): SEQ IP N° 5
LLQSWGCKGRLVCYTSVQWNST.
nebo
Leu Leu Gin Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr SerVal Gin Trp Asn
5 10 15 20
Ser Thr ,
Peptid č. 6: SEQ ID N° 6
LLNSWGCRGKAVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
10 15 20
Glu Thr 22
Peptidč. 7 : SEQ ID N° 7 LLSLWGCRGRAVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20
Glu Thr
Pegt . 8 (7B) SEQ ID N° 8 LLSSWGCRGRLVCYTSVQWNET nebo
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn
5 10 15 20
Glu Thr 22 v
e · i Ϊ • · · » ·
Pept id_č. 9 (12B): SEQ ID N° 9
LLSSWGCKGRLVCYTS nebo
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1 5 10 15
Pept i d č. 1Q (14B): SEQ ID N° 10
LLNSWGCKGRLVCYTS nebo
Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1 5 10 15
Pept i d č. 11 (18B): SEQ ID N° 11
ALETLLQNQQLLNSWGCRGRLVCYTSVRWNET nebo
Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly 1 5 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr 20 25 30
Peptid č. 12(19BV. SEQ 1DN°12
ALETLLQNQQLLNIWGCRGRLVCYTSVRWNET nebo
Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn lle Trp Gly Cys Arg Gly 15 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr 20 25 30
Pept i d Č. 13 (20B): SEQ ID N° 13 ALETLLQNQQLLDLWGCRGRLVCYTSVRWNET nebo r · · • · «ί • · • · · • · • · · < · · « ·· · • ·
144.
-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asp Leu Trp Gly Cys Árg Gly 15 10 15
Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr
25 30
Peptid č. 14 (21B): SEQ ID N° 14
LNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSV.
nebo
Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr 15 10 15
Thr Ser Val PePtid č. i5(22BV. SEQ IDN° 15
RALETLLNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSV nebo
Arg Ala Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys
10 15
Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val 20 25
Pept i d č 16 (23B): SEQ ID N° 16
RLNSWGCKGRLVCYTSV nebo
Arg Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val 15 10 15
5 • · Λ» 4 « 9 *4 · · » » · · ♦ ·* · * ······· • · · » · ···· ··· ··« «··,
Syntetické peptidy obecného vzorce I podle vynálezu se získají syntesou v pevné fázi klasickými způsoby popsanými v literatuře (R.B. Merrifield J.Amer.Chem.Soc. 85, str. 2149 až 2154, 1963); R.C. Sheppard Peptides 1971, Nsvadba H. (vydavatel) North Holland Amsterdam str. 111; E. Atherton a R.L.
Sheppard Solid phase peptide synthesis, a practical approach
IRL PRESS (1989), Oxford University Press, str. 25 až 34. Jako automatického syntetizátoru je možno použít syntetizátoru 9050 Plus Pep Synthetizer Millipore nebo rovnocenného zařízení.
Pevný nosič, kterého se při syntese používá, má odpovídat použité chemické technice. Například pro syntesu na syntetizátoru 9050 Plus Pep Synthetizer se doporučuje pryskyřice přizpůsobená technice ve vznosu; těmto kriteriím vyhovují pryskyřice PEG PS. Nosiče jsou tvořeny mezerníkem (spacer) na bázi polyethylenglykolu (PEG) mmezi funkčními skupinami polystyrénových kuliček a místem styku s první aminokyselinou.
Poloha tohoto místa styku se může měnit podle funkce zvoleného C-zakončení. V tomto případě se používá různých pryskyřic PEG-PS.
Výchozí pryskyřice a použité aminokyseliny jako surovina jsou obchodně dostupné (PerSeptive-Biosystem, nebo Néosystem).
K syntese peptidů se používá chránících skupin s následujícími řetězci:
Aminokyselina Chránící skupina ________ _ J t
pentamethyl-2,2,4,6,7-di hydrobenzofuran-5- J sulfonyl (Pbf) J i
trityl (Trt) j tntyl (Trt) nebo acetamidomethyl (Acm) ether terc.-butylu (tBu) terc.-buty1oxykarbony1 (Boc) argi ni n asparagin,glutamin cystein serin, threonin tyrosin lysin, tryptofan • ·
6 • > · * · 9 ·
Λ · * · · · · • · · »»·»···· « · · · *
Dočasnou ochranou primární a aminoskupiny použitých aminokyselin je skupina 9-f1uorenylmethyloxykarbonylová (Fmoc) Chránící skupinu je možno odstranit 20% roztokem piperidinu v dimethylformamidu.
Ke kopulaci se používá s výhodou nadbytku diisopropy1kai— bodiimidu (DIPCDI) a hydroxy-1-benzotriazolu (HOB).
Po syntese se pryskyřice promyje organickými rozpouštědly (postupně dimethylformamidem a dichlormethanem) vysuší se ve vakuu, načež se zpracuje roztokem na bázi kyseliny trifluoroctové (TFA) ochlazené na teplotu 0 °C a obsahující vhodné zachycovače (scavengers). Použít lze například reakčního činidla K obsahujícího 82 % trif1uoroctové kyseliny, 5 % fenolu, 5 % vody, 5 % thioanisolu a 3 % ethandithiolu.
Po titraci pryskyřice se syntetické peptidy vysrážejí a propláchnou se etherem.
Syntetické peptidy se pak čistí kapalinovou chromatografií v inverzní fázi a jejich čistota se stanoví hmotovou spektrometrií. Jako pevné fáze je možno použít například fáze Bondapak C-18. Peptidy se eluují lineárním gradientem mezi dvěma pufrovými roztoky, prvním v podstatě vodným (například vodná 0,1% TFA) a druhým spíše organickým (například směsí obsahující 60 % acetonitrilu, 39,92 % vody a 0,08 % TFA). čisté frakce se shromáždí, zkoncentrují se ve vakuu a lyofilizují se,
K cyklizaci se vyčištěné syntetické peptidy rozpustí v roztoku octanu amonného (10 nM), hodnota pH se naštvi na
8,5 přísadou 1M amoniaku. Roztok se intenzivně míchá. Cykliza·· • · • 4
7 * ·· • · ♦ · ♦ * » · · • 4« ce je ukončena po 18 hodinách. Hodnota pH se pak sníží na 6 přidáním kyseliny octové. Cyklizované peptidy se lyofilizují, čistí se kapalinovou chromatografii v inverzní fázi jak shora popsáno.
Imunoreaktivita peptidů podle vynálezu se hodnotí pomocí séra nemocných jedinců převážně z Kamerunu, infikovaných retroviry HIV-1 skupiny 0. Různé provedené zkoušky ukázaly, že peptidy podle vynálezu samotné nebo ve spojení (peptidové prostředky) umožňují 100% detekci sér infikovaných virem HIV-1 skupiny 0.
Syntetické peptidy podle vynálezu nacházejí tudíž uplatnění v imunologických testech k vypátrání infekcí způsobených retrovirem HIV-1 skupiny 0. Je rovněž možno použít souboru několika syntetických peptidů obecného vzorce I. Tyto soubory, které mohou obsahovat dva nebo několik peptidů obecného vzorce I, jsou také předmětem vynálezu. Přednost se dává souborům obsahujícím peptidy č. 1 (2B) a č. 3 (4B).
Stejně je možno použít syntetckých peptidů obecného vzorce I podle vynálezu ve spojení s rekombinovanými peptidy (rekombinantními proteiny) HIV-1 skupiny 0, které lze získat klasickými způsoby a majícími sekvence popsané v příkladu přihlášky vynálezu číslo EP 0 591 914. Také tyto sloučeniny spadají do rámce vynálezu.
Syntetických peptidů podle vynálezu je možno použít také ve spojení s jinými syntetickými nebo rekombinovanými HIV-1 (rekobi nant ní proteiny). HIV-2 peptidy popsanými například v následujících patentových spisech: EP 0 387 914, EP 0 239 425, EP 0 220 273 nebo EP 0 267 802.
Prostředky obsahující jeden nebo několik syntetických peptidů obecného vzorce I a několik syntetických nebo rekombinovaných HIV-1 nebo HIV-2, nacházejí uplatnění v diagnostice k vypátrání nemocných infikovaných různými retroviry HIV. Také ·
• ·
Q.J. frč??
tyto prostředky spadají do rozsahu vynálezu.
Vynález se týká také způsobů imunizačního dávkování používajících několika syntetických peptidů obecného vzorce I samotných nebo ve spojení s rekombinovanými peptidy kupíny 0 nebo syntetických peptidů nebo rekombinovaných V444—4·//ZK-/ a/nebo VHř-£ .
Vynález se týká také kitů k zavádění imunitních dávek, které zahrnují peptid obecného vzorce I nebo prostředek obsahující alespoň jeden peptid obecného vzorce I.
Vynález objasňují, nijak však neomezují následující příklady praktického provedení.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1
Příprava sloučeniny podle vynálezu: peptid číslo 2 (3B)
LLSLWGCRGRLVCYTSVQWNET nebo Leu Le(J Sef Leu Trp G|y Cys Afg Q|y A(.g Vai Cys Tyr Th(_ Vg| G!n Trp Asn 1 5 10 15 20
Glu Thr
Tento peptid se syntetizuje v pevné fázi. Použitý způsob, který zavedl v roce 1963 Merifield (J .Am.Chem.Soc. 85, str. 2149 až 2154 (1963), je založen na fixování první aminokyseliny na pevném polymerním nosiči (pryskyřici) jeho kyselou skupinou a v prodloužení peptidické sekvence od první aminokyseliny, přičemž peptid zůstává během syntesy zakotven na pryskyřici.
K syntese peptidů č.2 se použije jako syntetizátoru 9050 Plus Pep Synthetizer a jako pryskyřice Fmoc Thr (OtBu) PEG PS.
• · • · «· · · · · « · · · « · · Φ * ·
Φ φ · Φ · · · · • · · · Φ ·»···· • · * · ·
Jednotlivé kroky syntesy vyplývají z následující tabulky I, (ve sloupci I je uveden zbytek aminokyseliny, ve sloupci II skupina chránící aminoskupinu NH2, ve sloupci III skupina chránící postranní skupinu, ve sloupci IV způsob'kopulace a ve sloupci V počet ekvivalentů a doba kopulace, eq znamená ekvivalent )
Tabulka I
| I | II | III | IV | V |
| Glu | Fmoc | OtBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Asn | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Trp | Fmoc | Boc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Gin | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Val | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Ser | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Thr | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| - ....... | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Cys | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Val | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Arg | Fmoc | Pbf | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Gly | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Arg | Fmoc | Pbf | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Cys | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Gly | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Trp | Fmoc | Boc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Ser | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min | |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 30 min |
·· . . 1
Po ukončení syntesy se pryskyřice promyje postupně dimet- [ hylformamidem a dichlormethanem a vysuší se ve vakuu. 1 ·
• * · ·» ·· í · 9 9 » » · »
999 9 9 9
Pryskyřice se pak zpracuje reakčním činidlem K (82 % trifluoroctové kyseliny, 5 % fenolu, 5 % vody, 5 % thioanisolu a 3 % ethandithiolu). Peptid číslo 2 (3B) se izoluje vysrážením pomocí diethyloxidu a promyje se stejným rozpouštědlem. Získá se tak 140 mg peptidů číslo 2 (3B).
Peptid číslo 2 (3B) se čistí kapalinovou chromatografií v inverzní fázi. Jako pevné fáze se použije fáze Bondapak C-18. Peptid se eluuje gradientem mezi dvěma pufrovými roztoky, prvním v podstatě vodným (například vodným 0,1% TFA) a druhým spíše organickým (například směsí obsahující 60 % acetonitrilu, 39,92 % vody a 0,08 % TFA). čisté frakce se shromáždí, zkoncentrují se ve vakuu a lyofilizují se.
K cyklizaci se takto získaný vyčištěný syntetický peptid rozpustí v roztoku octanu amonného (10 mM), hodnota pH se nastaví na 8,5 přísadou 1M amoniaku. Roztok se intenzivně míchá. Cyklizace je ukončena po 18 hodinách. Hodnota pH se pak sníží na 6 přidáním kyseliny octové. Cyklizovaný peptid se lyofilizuje, čistí se kapalinovou chromatografi i v inverzní fázi, jak shora popsáno.
Příprava sloučeniny podle vynálezu: peptid číslo 15 (22B)
Peptid se syntetizuje jako peptid číslo 2 (3B), avšak s použitím pryskyřice FmocPAL PEG-PS.
Jednotlivé kroky syntesy vyplývají z následující tabulky II. (ve sloupci I je uveden zbytek aminokyseliny, ve sloupci II skupina chránící aminoskupinu NH2, ve sloupci III skupina chránící postranní skupinu, ve sloupci IV způsob kopulace a ve sloupci V počet ekvivalentů a doba kopulace, eq znamená ekvivalent )
Tabulka II
| I | II | III | IV | v |
| Val | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn | |
| Ser | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Thr | Fmoc | - tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Tyr | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Cys | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Val | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Arg | Fmoc | Pbf | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Gly | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Lys | Fmoc | Boc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Cys | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Gly | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn | |
| Trp | Fmoc | Boc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Ser | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Asn | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn | |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn | |
| Arg | Fmoc | Pbf | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Gin | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Gin | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Asn | Fmoc | Trt | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Thr | Fmoc | tBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
| Glu | Fmoc | OtBu | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn |
| Leu | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq - 45 mn | |
| Ala | Fmoc | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn | |
| Arg | Fmoc | Pbf | DIPCDI/HOBt | 5 eq- 45 mn |
• 4 • · » · ·· ·· <1 « · » <· · « » 4 · 9 9
9 · · ·** · « · 9 9 99999999
9 9 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 99 9 9 99
Po ukončeni syntesy se pryskyřice promyje dimethylformamidem, pak dichlormethanem a vysuší se ve vakuu. Pryskyřice se pak zpracuje reakčním činidlem K (82 % trif1uoroctové kyseliny, 5 % fenolu, 5 % vody, 5 % thioanisolu a 3 % ethandithiolu). Peptid číslo 7 (22B) se izoluje vysrážením pomocí diethyloxidu a promyje se stejným rozpouštědlem. Získá se 140 mg peptidu číslo 15 (22B). Peptid číslo 15 (22B) se čistí kapalinovou chromatografi i v inverzní fázi, pak se cyklizuje, lyofilizuje a, čistí jak popsáno shora u peptidu číslo 2 (3B).
Obdobným způsobem a za použití pryskyřic a vhodných aminokyselin se připravují ostatní sloučeniny podle vynálezu.
Tabulka III udává molekulové hmotnosti určitých peptidů obecného vzorce I v necyklizované formě podle hmotové spektromet ri i.
Tabulka III
Peptid číslo Molekulová hmotnost (daltony)
| 1 (2B) | 2512 |
| 2 (3B) | 2583 |
| 3 (4B) | 2528 |
| 4(5B) | 2586 |
| 5 (6B) | 2527 |
| 9(12B) | 1772 |
| 10 (14B) | 1799 |
| 11 (18B) | 3752 |
| 12 (19B) | 3778 |
| 13 (20B) | 3780 |
| 14 (21B) | 2538 |
| 15 (22B) | 3222 |
| 16 (23B) | 1941 |
¢,,/.
Příklad 2
Vyhodnocení imunoreakt i ví t y matickým testem: test číslo peptidů podle vynálezu 1 imunoenzyPoužitými séry ESS, DUR, VAU a HAD jsou séra nemocných Francouzů infikovaných retroviry HIV-1 skupiny O. Ostatní vzorky sér nemocných infikovaných retrovirem HIV-1 skupiny 0 se získaly ze střediska Centre Pasteur de Yaoundé v Kamerunu a byly serotypovány skupinou O podle sérologického algoritmu popsaného v literatute (AIDS 11, str. 445 až 453, 1977). Negativní séra HIV (n=48) byla získána od zdravých dobrovolníků.
Použité peptidy se rozpustí ve vodě v koncentraci 1 mg/ml (matečný roztok). K senzibi1 izaci pevné fáze (povlaku) se do každého důlku mikrotitrační destičky Microtiter™ (NUNC) vnese 110 μΐ roztoku vždy 2 pg/ml každého peptidu (získaného zředěním mateřského roztoku roztokem uhličitanového pufru (0,1M). Po inkubaci přes noc při teplotě okolí se mikrodestičky promyjí napřed pufrem Tris NaCl pH 7,4 obsahujícím 0,1 % Tweenu” 20 a 0,001 % merthiolátu sodného, nasytí se roztokem PBS obsahujícím 0,5 % Regilaitu™ (sušené odstředěné mléko). Po odpaření nasyceného roztoku, se destičky udržují ohříváním na teplotě 50 °C po dobu 10 minut. Vzorky sér se zředí na 1/5 roztokem odstředěného mléka (citrátový pufr s přísadou 0,01 % fenolové červěně, 0,25 % chloroformu a 0,25 % Kat honu”) vneseného do důlků destiček a podrobí se inkubaci 30 minut při teplotě 40 °C.
Po promytí roztokem pufru Tris NaCl pH 7,4, obsahujícím 0,1 % Tweenu”20 a 0,001 % merthiolátu sodného, se přidá 100 μΐ roztoku konjugovaných kozích protilátek 1gG a lidských IgM za označení peroxidázou křenu, obsahujících jako konzervační látku 0,01 % merthiolátu sodného, v roztoku citrátového pufru s přísadou 30 % glycerolu a 25 % normálního telecího zárodeč24 ·· » · ·« ·· ·· ·<·♦ ♦·«· ♦ ♦ » · * · · » · · » • ·» * ·»··»··· • · · · · « ···· ·»· ··· *··· ·* ·♦ č-j. n m ného séra do každého důlku destičkek, načež se destičky inkubují 30 minut při 40 °C. Po promytí roztokem pufru Tris NaCl pH 7,4, obsahujícím 0,1 % TweenuR 20 a 0,001 % merthiolátu sodného, se získá vybarvení přísadou do každého důlku 100 μΐ 0-fenylendiaminu v roztoku peroxidu vodíku. Mikrodestičky se pak inkubují 30 minut ve tmě při teplotě okolí. Barevná reakce se ukončí přísadou 100 μΐ 4N kyseliny sírové. Absorbance (A) se stanoví při 490 a 620 nm.
Relativní absorbance (A490-A620) odečtená v každém důlku je úměrná imunoreaktivitě každého peptidu a indikuje schopnost každého peptidu reagovat se zkoušeným biologickým vzorkem. Prahová hodnota (cut-off) se stanoví jako absorbance rovná 0,15. Odpovídá průměru hodnot negativních (n=48) plus 12 odchylných typů. Reaktivita peptidů podle vynálezu (peptidu číslo 3 (4B), peptidu číslo 2 (3B) a peptidu číslo 1 (2B) všech v cyklizované formě) se porovnává s reaktivitou dvou syntetických peptidů majících jako sekvenci část sekvence přírodní obálky (env) izolátu VAL) (ret rov i rus V4++—í skupiny 0) a nesoucí imunodominantní epitop gp41.
Tyto dva peptidy mají následující sekvenci:
Leu Leu Asn Leu Trp Gly Cys Lys Asn Arg Ala lle Cys Tyr Thr Ser Val Lys Trp Asn 1 5 10 15 20
Lys Thr 22
VAU 35 AA
Arg Leu Leu Ala Leu Glu Thr Phe lle Glu Glu Asn Glu Leu Leu Asn Leu Trp Gly Cys 1 5 10 15 20
Lys Asn Arg Ala lle Cys Tyr Thr Ser Val Lys Trp Asn Lys Thr 25 30 35
Peptidy pro tuto studii se užívají vždy v cyklické formě.
• 4
Φ · * Φ • Φ
Φ ·
Φ φ »···
ΦΦ ΦΦ Φ Φ Φ Φ φ Φ Φ Φ
ΦΦΦ ΦΦΦ
Φ Φ
ΦΦ ΦΦ
Výsledky jsou uvedeny v tabulce IV. (N° znamená číslo vzorku.)
Tabulka IV
| SÉRUM | ABSORBANCE | ||||
| Peptid . N° 3 (4B) | Peptid n° 2 (3B) | Peptid . N° 1 (2B) | VAU 22 AA | VAU 35 AA | |
| ESS* | >** | > | 2,494 | > | > |
| DUR* | > | > | > | 0,118 | | 0,872 |
| HAD | > | 0,518 | 0,041 | 0,789 | 0,871 |
| VAU* | 1,342 | > | > | > | > |
| 3935 | > | 0,893 | 0,307 | 0,138 | 0,227 |
| 6891 | > | 0,614 | 0,062 | 0,359 | 0,496 |
| 6512* | 0,746 | 0,785 | > | 0,120 | 0,174 |
| 1105* | 1,421 | 1,031 | > | 0,099 | 0,129 |
| 4021* | 0,430 | 0,119 | > | 0,050 | 1,957 |
| 5969* | > | 0,282 | > | 2,491 | > |
| 2700 | > | 0,274 | > | > | > |
| 5453 | 0,555 | 0,081 | > | 1,267 | 1,482 |
| 5931 | > | > | > | 0,202 | 2,225 |
| 3136 | > | 0,992 | 0,302 | > | > |
| 3653 | 1,352 | > | 0,044 | 1,441 | 1,322 |
| 2352 | > | > | 0,205 | > | > |
| 3016 | > | > | 0,243 | > | > |
| 3302 | > | > | 0,386 | > | > |
| 2294 | > | > | 0,447 | > | > |
| 3771 | > | > | 0,544 | > | > |
| 1581 | > | > | > | 1,112 | 0,894 |
| 5373 | > | > | > | 1,359 | 0,856 |
| 7443 | > | > | > | 0,920 | 0,574 |
| 3637 | > | > | > | 0,779 | 1,647 |
| 6295* | 1,718 | 1,063 | > | 0,972 | > |
| 6689* | 0,710 | > | > | > | > |
| 1754 | > | > | 1,263 | 1,948 | |
| 4489* | > | > | > | 1,318 | 1,718 |
| 4364 | > | > | 1,382 | > | > |
| 3884* | > | > | 1,839 | > | > |
| 3529 | > | > | 1,803 | > | > |
| 3482 | 2,402 | > | 1,473 | > | > |
| 1702 | > | > | 1,162 | > | > |
| 6487 | > | 1,017 | 2,687 | 2,889 | 2,,891 |
| 5164 | > | > | > | > | > |
| 5766* | > | > | > | > | > |
| 3945 | > | > | > | > | > |
♦ toto toto ·· • to 4 · to toto to to « · to to · to to ··· to to to • · toto • toto···· ·· ··
| SÉRUM | ABSORBANCE | ||||
| • | Peptid, · N° 3 (4B) | Peptidy n° 2 (3B) | Peptid N° 1 (2B) | VAU-22 AA | VAU 35 AA |
| 4434 | > | > | > | 2,273 | > |
| 4288* | > | > | 2,802 | 2,337 | Ν.Τ.*** |
| 6782 | > | 2,091 | 2,462 | 2,190 | 2,214 |
| 2313 | > | > | > | > | > |
| 2312 | > | > | > | > | |
| 1062 | > | > | > | > | > |
| 402 | > | > | > | > | > |
| 134 | > | > | > | > | > |
| 7120 | > | > | > | > | > |
| 7212 | > | > | > | > | > |
| 6976* | > | > | > | > | > |
| 3600* | > | > | 2,743 | > | > |
| 3236 | > | > | > | > | > |
| 3235 | > | > | > | > | > |
| 2551 | > | > | > | > | > |
| 5270* | > | > | > | > | > |
| 5210 | > | > | > | > | > |
| 5149* | > | > | > | > | > |
| 4477 | > | > | > | 2,511 | > |
| 3891 | > | > | 2,780 | > | > |
| 3627* | > | > | 2,910 | > | > |
| 7258* | > | > | 2,477 | > | > |
| 7007 | 2,136 | 2,334 | > | > | 2,151 |
| 6697 | > | > | > | > | > |
| 6998 | > | > | > | > | > |
| 6627 | > | > | > | > | > |
| 6198* | > | > | > | > | > |
| 6165 | > | > | 2,714 | > | > |
| 7439 | > | > | > | > | > |
| 7297* | > | > | > | > | > |
| 6111 | > | > | > | > | > |
| 625 | > | > | > | > | 2,885 |
* sérotyp/genotyp ** > = signál přvyšující kapacitu čtení spektrometru *** nezkoušeno ·* *« • * < · • * » • · · • · 9 ·· 9999
9 9 9
9 9 9
Z tabulky IV je zřejmé, že peptid číslo 3 (4B) představuje nejlepší užitkové vlastnosti se zřetelem na užitkové vlastnosti ostatních peptidů. Tento peptid umožňuje nejlepší rozlišení sér nemocných lidí infikovaných retrovirem HIV-1 skupiny 0 oproti dvěma peptidům majícím část sekvence izolátu VAU odpovídajícího imunodominantnímu epitopu gp41. Kromě toho jsou peptidy číslo 2 (3B) a číslo 1 (2B) podle vynálezu více imunoreaktivní než peptid VAU 22 AA, který má stejný počet ami nokyseli n.
Příklad 3
Vyhodnocení imunoenzymatických testů imunoreakti víty peptidů podle vynálezu: test číslo 2
Vzorky sér nemocných lidí infikovaných retrovirem HIV-1 skupiny 0 byly získány ze střediska Centre Pasteur de Yaoundé v Kamerunu a byly serotypovány skupinou O podle sérologického algoritmu popsaného v AIDS 11, str. 445 až 453 (1977)). Jeden genotypovaný vzorek (Maryland) pocházel ze Spojených států. Vzorky byly předběžně zředěny v negativním lidském séru na ředění uvedená v tabulce V k získání postačujícího objemu k testům imunoreaktivity.
Použité syntetické peptidy se rozpustí ve vodě na koncentraci 1 mg/ml (mateřský roztok). K etapě sensibi1 izace pevné fáze (coating) se postupuje stejně jako podle příkladu 2.
Vzorky sér se zředí na 1/5 roztokem odstředěného mléka (citrátový pufr s přísadou 0,01 % fenolové červeně, 0,25 % chloroformu a 0,25 % Kathonu”) vneseného do důlků destiček a podrobí se inkubaci po dobu 30 minut při teplotě 40 °C.
Po promytí roztokem pufru Tris NaCl pH 7,4, obsahujícím 0,1 % Tweenu” 20 a 0,001 % merthiolátu sodného, se přidá 100 ·♦ ♦ · · ♦ 99 9 9 999 99 9 99
99
9 9
9 9
999 999 « · • 9 9 9 ρ/ μΐ roztoku konjugovaných kozích protilátek IgG a lidských lgM za označení peroxidázou křenu, obsahující jako konzervační látku 0,01 % merthiolátu sodného, v roztoku citrátového pufru s přísadou 30 % glycerolu a 25% normálního telecího zárodečného séra do každého důlku destiček, načež se destičky inkubují 30 minut při teplotě 40 °C.
Po promytí roztokem pufru Tris NaCl pH 7,4, obsahujícím 0,1 % TweenuR 20 a 0,001 % merthiolátu sodného, se získá vybarvení jako podle příkladu 2.
Relativní absorbance (A49O-A62O) odečtená v každém důlku je úměrná imunoreaktivitě každého peptidu a indikuje schopnost každého peptidu reagovat se zkoušeným biologickým vzorkem .
Reaktivita peptidů podle vynálezu (peptidu číslo 10 (14B), peptidu číslo 12 (19B), peptidu číslo 14 (21B) a peptidu číslo 16 (23B) všech v cyklizované formě) se porovnává s reaktivitou tří homologů syntetických peptidů ma j í cí ch ^a^ko sekvenci část sekvence přírodní obálky (env) ret rovi ru -VIH-4 skupiny O. Těmito peptidy jsou dva peptidy odvozené z izolátu VAU - peptid VAU 22 AA a peptid VAU 35 AA a peptid MVP 5180 (označený MVP 5180 v tabulce V). Peptidy VAU 22 AA a VAU 35 AA, (jejichž struktura je vyznačena v příkladu 2) a peptid MVP 5180 odpovídají imunodominantnímu epitopu gp41 .
Všechny tyto peptidy jsou použity v cyklizované formě. Sekvence peptidu MVP 5180 je následující:
MVP 5180
Arg Leu Gin Ala Leu Glu Thr Leu Ile Gin Asn Gin Gin Arg Leu Asn Leu Trp Gly Cys 1 5 10 15 20
Lys Gly Lys Leu Ile Cys Tyr Thr Ser Val Lys Trp Asn Thr Ser
30 35
Výsledky této studie jsou uvedeny v tabulce V. (N° znamená číslo vzorku.) • ♦ ·
Tabulka V
| SÉRUM | P | EPTID ‘ | |||||||
| N° 10 | N° 11 | N° 12 | N° 14 | N° 15 | Ne 16 | MVP 5180 | VAU 35 AA | VAU 22 AA | |
| ABSO | RBANCE (DO) | ||||||||
| 4280 1/50 | 0,022 | 0,686 | 0,201 | 0,286 | 0,689 | 0,033 | 0,382 | 0,013 | 0,021 |
| NGO • 1/50 | 0,067 | 0,335 | 0,193 | 0,157 | 0,315 | 0,110 | 0,184 | 0,055 | 0,040 |
| NJEM 1/100 | 0,032 | 0,811 | 0,391 | 0,277 | 0,939 | 0,025 | 0,146 | 0,159 | 0,024 |
| M BASSI 1/100 | 1,217 | 1,150 | 0,747 | 2,134 | 2,010 | 2,683 | 0,248 | 0,120 | 0,257 |
| WANG .1/50 | 0,698 | 0,234 | 0,124 | 2,397 | 2,680 | 1,290 | 0,075 | 0,025 | 0,041 |
| 258 OUDI .1/100 | 0,587 | 0,373 | 0,226 | 0,764 | 1,184 | 1,692 | 0,116 | 0,058 | 0,100 |
| DO15 1/100 | 1,613 | 0,859 | 1,286 | 3,357 | 3,693 | 3,038 | 0,673 | 0,036 | 0,075 |
| DJOU 1/100 | 1,268 | 0,482 | 0,419 | 1,998 | 2,088 | 2,166 | 0,203 | 0,022 | 0,042 |
| 3600 1/100 | 0,482 | 0,360 | 0,249 | 0,716 | 0,801 | 0,933 | 0,206 | 0,025 | 0,058 |
| 3613 . 1/400 | 1,108 | 0,837 | 0,773 | 1,508 | 1,627 | 1,679 | 0,478 | 0,250 | 0,396 |
| 6111 . 1/100 | 0,596 | 0,348 | 0,202 | 0,850 | 1,207 | 1,009 | 0,226 | 0,087 | 0,180 |
| 625 . 1/50 | 0,838 | 0,338 | 0,264 | 2,045 | 2,122 | 1,791 | 0,202 | 0,069 | 0,165 |
| Maryiand . 1/400 | 0,524 | 0,370 | 0,285 | 0,734 | 0,844 | 1,229 | 0,241 | 0,054 | 0,168 |
| 3653 • 1/10 | 0,347 | 0,337 | 0,247 | 0,072 | 0,380 | 0,406 | 0,401 | 0,021 | 0,310 |
* Pevná fáze-:“ peptid 2 pg/ml
U každého testovaného peptidu se vzorky dělí do čtyř tříd (a,b,c,d) odpovídajících různým hodnotám relativní absorbance odečtené při vlnových délkách A492 a A62O:
| v | pří pádě | a: | DO | <0,100 | ||
| v | pří pádě | b: | o, | 100 | <D0 | <0,500 |
| v | pří pádě | c : | o, | 500 | <00 | <1,ΟΟΟ |
| v | pří pádě | d: | DO | >1 , | OOO |
i • · • · • » · · • · · · ·· · ··· • « • · ·♦ což umožňuje hodnotit imunoakti vitu peptidů. Nejvíce imunoreaktivními jsou peptidy, jejichž největší počet vzorků je ve třídách odpovídajících nejvyšší absorbanci. Výsledky obsahuje tabulka VI (N° znamená číslo vzorku.)
Tabulka VI
| CLASSE | P | EPTIDES * | |||||||
| N° 10 | N° 11 | N° 12 | N° 14 | N° 15 | N° 16 | MVP 5180 | VAU 35 AA | VAU 22 AA | |
| Nombre ďéchantillons | |||||||||
| a | 3 | 0 | 0 | 1 | 0 | 2 | 1 | 11 | 7 |
| b | 2 | 9 | 11 | 3 | 2 | 2 | 12 | 3 | 7 |
| c | 5 | 4 | 2 | 4 | 4 | 1 | 1 | 0 | 0 |
| d | 4 | 1 | 1 | 6 | 8 | 9 | 0 | 0 | 0 |
Pevná fáze*: peptid 2 pg/ml
Výsledky ukazují, že všechny testované peptidy podle vynálezu vykazují lepší imunoreaktivní účinnost než peptidy odpovídající dosavadnímu stavu techniky, které pocházejí z přírodních izolantů (MVP 5180, VAU). Jako nejvíce imunoreaktivní se jeví peptidy podle vynálezu číslo 15 (22B), číslo 14 (21B) a číslo 16 (23B).
Příklad 4
Vyhodnocení imunoreakti vity prostředků obsahujících peptidy podle vynálezu imunoenzymatickými testy
Při této studii se postupuje podle stejně jako podle přikladu 2 a je použito stejných sér. Použité mikrodestičky jsou sensibi1 izovány jednak cyklizovaným peptidem číslo 1 (2B), cyklizovaným peptidem číslo 3 (4B), jednak prostředkem obsahujícím oba peptidy (1:1 p/p). Do každého důlku se vnese 100 pl roztoku obsahujícího 2 pg/ml peptidu číslo 1 (2B) nebo 100 pl ~ 31- *»*· *· ····· • φ 0 0 0 0 000000
0 0-0 0 0 roztoku obsahujícího 2 pg/ml peptidů číslo 3 (4B) nebo 100 μΐ roztoku obsahujícího 1 pg/ml peptidů číslo 1 (2B) a 1 pg/ml peptidů číslo 3 (48).
Výsledky jsou v tabulce VII. (N° znamená číslo vzorku.)
Tabulka V(|
| SÉRUM , | ABSORBANCE | ||
| Peptid . n° 1 (2B) (2 pg/ml) | Peptid n°3(4B) (2 pg/ml) | Peptic n° 1 (2B) (1pg/ml) + Peptic n° 3 (4B) (1 uq /ml) | |
| 3529 | 1,803 | >* | > |
| 1105 | > | 1,421 | > |
| 3891 | 2,780 | > . | > |
| 3235 | > | > | > |
| 2700 | >, | > | > |
| 5931 | > | > | > |
| 3935 | 0,307 | > | > |
| 7443 | > | > | > |
| 1062 | > | > | > |
| 1754 | > | > | > |
| 3136 | 0,302 | > | > |
| 6891 | 0,062 | > | > |
| 5149 | > | > | > |
| 5270 | > | > | > |
| 2551 | > | > | > |
| 3600 | 2,743 | > | > |
| 6976 | > | > | > |
| 4489 | > | > | > |
| 6165 | 2,714 | > | > |
| 6198 | > | > | > |
| 6627 | > | > | > |
| 6998 | > | > | > |
| 6697 | > | > | > |
| 7258 | 2,477 | > | > |
| 3627 | 2,910 | > | > |
| 4477 | > | > | > |
| 3771 | 0,544 | > | > |
| 1702 | 1,016 | > | > |
| 2294 | 0,447 | > | > |
| 2352 | 0,^05 | > | > |
| 3016 | 0,243 | > | > |
| 3302 | 0,386 | > | > |
·· 99 • · · * • · · · ··« ···
9
9 99
| 3482 | 1,473 | > | > |
| 3653 | 0,044 | 1,322 | 1,105 |
| 4364 | 1,382 | > | > |
| 3637 | > | > | > |
| 4288 | 2,802 | > | > |
| 5969 | > | > | > |
| 258 | > | > | > |
| 6111 | > | > | > |
| 625 | > | > | > |
| 6853 | > | 2,769 | > |
| 3136 | 0,302 | > | > |
| 6689 | > | 0,710 | > |
| 6295 | > | 1,718 | > |
| 4021 | > | 0,430 | 2,381 |
| 3884 | 1,839 | > | > |
| 6512 | > | 0,746 | > |
| 6487 | 2,687 | > | > |
| ESS | 2,494 | > | > |
| HAD | .0,041 | > | > |
| DUR | > | > | > |
* > = signál přvyšující kapacitu čtení spektrometru
Výsledky uvedené v tabulce VII ukazují, že je-li v diagnostice použito prostředků s peptidy podle vynálezu, docílí se detekce všech sér nemocných infikovaných retrovirem VIH-1 skupiny 0.
♦ · · t » · » » • · · · ········
Seznam sekvencí (1) Všeobecná informace (1) Původ:
(A) Jméno: Pasteur Sanofi Diagnostics (B) Ulice: 3 boulevard Raymond Poincarě (C) Město: Marnes la Coquette (D) Stát: Francie (E) Pošta: 92430 (F) Telefon: 0153774000 (G) Fax: 0153774133 (ii) Název vynálezu: Syntetické peptidy použitelné v biologických testech pro detekci infekcí způsobených viry VJ-II -% skupiny 0.
(iii) Počet sekvencí: 16 (iv) čitelná forma pro objednatele:
(A) Nosič: floppy disk (B) Objednatel: IBM PC compatible (C) Systém exploatace: PC-DOS/MS-DOS (D) LOGICIEL: Patentln Release # 1,0, verze # 1,25 (OEB) (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 1:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.1
Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tvr Thr Ser 1 5 10 * 15
Val Gin Trp Asn Glu Thr 20 • · ·» e· • * · · • 9 9 9 • 999 999 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 2:
(1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.2
Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser ' 5 10 15
Val Gin. Trp Asn Glu Thr (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 3:
(1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) .Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.3
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 15 10 15
Val Gin Trp Asn Glu Thr 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 4:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.4 •4 4 4 44
4 4 4 4 4 · · 4 4
4 4 4 4 444 • 4 4
4444 4 4 44 β ·
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 15 10 15
Val Gin Trp Asn Ser Thr 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 5:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ:, aminokyselina
| (ii ) | Typ mo | Jekuly: peptid | ||||
| (Xi ) | Popis | sekvence: SEQ | ID | č.5 | ||
| Leu | Leu Gin | Ser Trp Gly Cys | Lys | Gly | Arg Leu Val Cys | Tyr Thr Ser |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||
| Val | Gin Trp | Asn Ser Thr | ||||
| (2) | Informa | ce o sekvenci | SEQ | ID | č. 6: |
(1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid . (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.6 » Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser
5 10 15
Val Gin Trp Asn Glu Thr 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 7:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin
• r · · ·· t · · · β • 9 · · * • < ··« ·»· • ♦ Φ • · · · * ** (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.7
Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Ala Val Cys Tyr Thr Ser 1 .5 io 15
Val Gin Tpp Asn Glu Thr 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 8:
(1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.8
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1 5 10 i5
Val Gin Trp Asn Glu Thr 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 9:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.9
Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr 1 5 10
(2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 10:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 16 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.1O
Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1'5 1° 15 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 11:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 32 aminokyselin (B) Typ: aminokyselina (ii) Typ molekuly: peptid
| (xi ) | Popis | sek | ven< | ce: | SEQ | ID | č.1 | 1 | ||||||
| Ala | Leu Glu | Thr | Leu | Leu | Gin | Asn | Gin | Gin | Leu | Leu | Asn | Ser | Trp | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | |||||||||||
| Cys | Arg Gly | Arg | Leu | Val | Cys | Tyr | Thr | Ser | Val | Arg | Trp | Asn | Glu | Thr |
| 20 | 25 | 30 |
(2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 12: (i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 32 aminokyselin (B) Typ: aminokyseliny (ii) (ii) Typ molekuly: peptid «··· ·
9 • * (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.12
| Ala | Leu Glu | Thr | Leu Leu | Gin | Asn | Gin | Gin | Leu | Leu | Asn | lle | Trp | Gly |
| 1 | 5 | 10 | 15 | ||||||||||
| Cys | Arg Gly | Arg | Leu Val | Cys | Tyr | Thr | Ser | Val | Arg | Trp | Asn | Glu | Thr |
| 20 | 25 | 30 | |||||||||||
| 2) | Informa' | ce c | > sekvenci | SEQ | ID | č. | 13: |
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 32 aminokyselin (B) Typ: aminokyseliny (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.13
| Ala 1 | Leu Glu | Thr | Leu 5 | Leu | Gin | Asn | Gin | Gin 10 | Leu | Leu | Asp | Leu | Trp 15 | Gly |
| Cys | Arg Gly | Arg 20 | Leu | Val | Cys | Tyr | Thr 25 | Ser | Val | Arg | Trp | Asn 30 | Glu | Thr |
(2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 14:
(1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 22 aminokyselin (B) Typ: aminokyseliny (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.14
Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu 10 15
Val Cys Tyr Thr Ser Val 20 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 15:
• · · » · · • ·· · · · · (1) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 28 aminokyselin (B) Typ: aminokyseliny (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.15
Arg Ala Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp 1-5 10 15
Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val 20 25 (2) Informace o sekvenci SEQ ID č. 16:
(i) Charakteristika sekvence:
(A) Délka: 17 aminokyselin (B) Typ: aminokyseliny (ii) Typ molekuly: peptid (xi) Popis sekvence: SEQ ID č.16
Arg Leu Asn Ser Trp.Gly Cys Lys Gly Ara Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1 5 10' 15
Val
Průmyslová využitelnost
Syntetické peptidy pro výrobu kitů pro biologické testy k detekci infekcí způsobených viry VIH 1 skupiny O.
Claims (14)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Syntetický peptid monomerní se 13 až 33 anminokyseli námi nebo dimerní se 26 až 66 aminokyselinami, lineární nebo cyklický s intercysteinovými sírovými můstky obecného vzorce II A-Z-TrpGlyCys-0-CysTyrThrSer-Q kde znamená delta skupinu biotiny1ovou, biocytinylovou, atom vodíku, skupinu acetylovou (CH3CO)-, alifatický řetězec, obsahující popřípadě jednu nebo dvě skupiny thiolové, aldehydové nebo aminoskupiny, alifatický řetězec, kterým je s výhodou řetězec alkylový s 1 až 6 atomy uhlíku, nebo řetězec alkenylový se 2 až 6 atomy uhlíku nebo řetězec aminoalkylkarbonylový se 2 až 6 atomy uhlíku,Z znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce II až X
t··SβΓ,Ξ.2- (Π) -Ser-Ξ2- (III) -Ξ1-Ser- (IV) -HrGln-E2- (V) -ΘΙη-Ξ2- (VI) -Ξ-ι-Gln- (VII) -Ξ-ι-Αεη-Ξζ- (Vlil) -Asn-H2- (IX) Ξι-Asn- (X) kde znamená peptidovou sekvenci O až 9 aminokyselin, “Ξ2 znamená peptidovou sekvenci O až 5 aminokyselin,Θ znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce XI:~(AAi )-(AA2)-(AAs)-(AA4)-(AAs)- (XI) kde znamená (ΑΑι ) lysinový, argininový nebo ornithinový zbytek, (AA2) glycinový nebo asparaginový zbytek (AA3) lysinový, argininový nebo ornithinový zbytek (AA4) leucinový, alaninový, isoleucinový nebo glutaminový zbytek (AAs) isoleucinový, valinový, leucinový, threoninový, norleucinový nebo norvalinový zbytek, za předpokladu, že (AAi), (AA2), (AAs), (AA4 ) a (AAs) netvoří nikdy seskupení peptidových sekvencí -Lys Gly Lys Leu Ile a Lys Gly Lys Leu Val-,Ω vázaný na skupinu -CO- šeřinu znamená- hydroxylovou skupinu (-0H) nebo aminoskupinu (-NH2),- alkoxylovou skupinu s 1 až 6 atomy uhlíku,- peptidovou skupinu obecného vzorce XII-Val-Σ-Ψ (XII) kde Σ znamená sekvenci obecného vzorce XIII nebo obecného vzorce XIV-(AAs)-Trp Asn-(AA7)-(AAs) (XIII)-(AAs-Trp His-(AA7)-(AAs) (XIV) kde znamená (AAe) aminokyselinu jinou než lysin, (AA7) aminokyselinu, (AAs) serinový nebo threoninový zbytek a Ψ fixovaný na zbytek -CO- volné aminokyseliny AAs znamená skupinu OH, NH2 nebo alkoxyskupinu s 1 až 6 atomy uhlíku,- peptidovou sekvenci obecného vzorce XV-Val-Ψ (xv) kde ψ fixovaný na zbytek -CO- valinu má stejný význam jako u obecného vzorce XII,-nebo jednu z peptidových sekvencí obecného vzorce XVI až XVIII « · · ·« · · · ·-Z-TrpGlyCys-0-CysTyrThrSer^ (XVI) : Val-I-Z-TrpGlyCys-0-CysTyrThrSerVat-S-4' (XVII) s Val-Z-TrpGlyCys-0-CysTyrThrSerVal-'P (XVIII) kde Z a 6 mají shora u obecného vzorce I uvedený význam a Σ má význam uvedený u obecného vzorce XII a ψ fixovaný na zbytek -CO- šeřinu, na zbytek -CO- aminokyseliny AAa'nebo na zbytek -CO- val inu má stejný význam jakou obecného vzorce XII. - 2. Syntetický peptid podle nároku 1, obecného vzorce I, kde znamená (AAs) valinový, leucinový, threoninový zbytek a když Ω znamená peptidovou sekvenci obecného vzorce XII nebo XIV, znamená (ΑΑβ) bud glutaminový nebo argininový zbytek.
- 3. Syntetický peptid podle nároku 1, obecného vzorce I, kde znamená- delta biotinylovou skupinu, atom vodíku nebo alifatický řetězec, který může obsahovat jednu nebo dvě thiolové, aldehydové nebo aminové skupiny, přičemž alifatický řetězec je s výhodou alkylový s 1 až 6 atomy uhlíku, nebo aminoalkylkarbonylový se 2 až 6 atomy uhlíku,- Z peptidovou sekvenci obecného vzorce II nebo V, kde znamená peptidovou sekvenci se dvěma aminokyselinami a aminokyselinu nebo sekvenci obecného vzorce IV, kde znamená tři aminokyseliny, nebo peptidovou sekvenci obecného vzorce Vili, kde znamená peptidovou sekvenci devíti, osmi nebo tří aminokyselin a peptidickou sekvenci pěti aminokyselin,
- Θ pepti dovou sekvenci vzorce -Lys G1 y Arg Leu Val-, -Arg G1 y Lys Ala Val-, -Arg G1 y Arg Leu Val-, nebo -Arg G1 y Arg Ala Val- a - Ω hydroxylovopu skupinu, peptidovou sekvenci XV nebo jednu z následujících sekvencí, které odpovídají peptidové sekvenci vzorce XII-Va}- Val Arg Trp Asn Glu Thr-Ψ,,-Va^-Val Gin Trp Asn Glu Thr-Ψ nebo -Váli - Val Gin Trp Asn Ser Thr-Ψ.. - 4. Syntetický peptid podle nároku 1 až 3, obecného vzorce I kde znamenáZ peptidpvou sekvenci vzorce-Leu Leu Ser Ser-Leu Leu Asn Ser-
-Leu Leu Din Ser· -Arg Leu Asn Ser- -Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin G1 n Leu Leu Asn Ser- -AI a Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin G1 n Leu Leu Asn Leu- -AI a Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin G1 n Leu Leu Asn Ile- -Leu Asn Gin Gin Arg Leu Asn Ser- - nebo -Arg AI a Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin G1 n Arg Leu Leu Asn Ser- - 5. Syntetický peptid podle náro,ku 1 s 20 až 50 aminokyselinami obecnému vzorce Ia delt a-Za-T rpGlyCys-0-CysTyrThrSer-Pa (I a) kde znamenáZa skupinu vzorce Ha až Xa:
S1a-Ser-H2a (Ha) -Ser-~2a (Hla) -E1a-Ser (IVa) E1a-Gln-E2a (Va) -Gln-H2a (Via) H1a-Gln- (Vila) E1a-Asn-H2a (Vlila) -Asn-H2a (IXa) -H1a-Asn (Xa) kde znamená-Hia peptidovou sekvenci jedné až pěti aminokyselin -c2a jednu aminokyselinuQa peptidovou sekvenci obecného vzorce XII, definovanou u obecného vzorce I nebo peptidovou sekvenci obecného vzorce XVIIa νθΙ-Σ^-ΤΓρΟΙγΟνβ-Θ-ΟγδΤγΓΤΚΓεβΓνθΙ-Σ-Ψ (XVIIa)k.de Za má význam uvedený u obecného vzorce Ia a delta, θ, Σ a ψ mají stejný význam jako u obecného vzorce I. - 6. Syntetický peptid podle nároku 1 až 5 mající jednu z následujících sekvencíSekvence č. 1-LLSLWGCRGKAVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu Thr22 ; Sekvence č. 2-LLSLWGCRGRLVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu Thr22Sekvence č. 3-LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn1 5 10 15 20Glu Thr22Sekvence č. 4-LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNSTnebo-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 15 10 15 20Ser Thr22Sekvence č. 5-LLQSWGCKGRLVCYTSVQWNSTnebo-Leu Leu Gin Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Va! Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 ' 5 10 15 20Ser Thr22Sekvence č. 6-LLNSWGCRGKAVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu Thr22Sekvence č. 7-LLSLWGCRGRAVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 .20Glu Thr22Sekvence č. 8-LLSSWGCRGRLVCYTSVQWNETnebo-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu Thr22 • · • · · · · » · · · · · • · · · ···· • · · · · · ·*···· • · · · · ·· ··· ··· ···· *· ··Sekvence č. 9-LLSSWGCKGRLVCYTSnebo-Leu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser15 10 15Sekvence č, io-LLNSWGCKGRLVCYTSnebo-Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser. 15 10 15 » Sekvence č. 11-ALETLLQNQQLLNSWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly 1 5 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30Sekvence č. 12-ALETLLQNQQLLNIWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn lle Trp Gly Cys Arg Gly' 15 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30Sekvence č. 13 * -ALETLLQNQQLLDLWGCRGRLVCYTSVRWNETnebo « -Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asp Leu Trp Gly Cys Arg Gly 1-5 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30Sekvence č. 14-LNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSVnebo ··· • ·-Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr 5 10 15Thr Ser Val20Sekvence č. 15-RALETLLNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSVnebo- Arg Ala Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys15 10 15Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val20 25Sekvence č. 16-RLNSWGCKGRLVCYTSVnebo- Arg Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val1 5 10 15
- 7. Syntetický peptid podle nároku 1 až 6 mající jednu z ná sledujících sekvencíPeptid č. 1 (2B)LLSLWGCRGKAVCYTSVQWNET neboLeu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn15 10 15 20Glu Thr 22Peptid č. 2 (3B)LLSLWGCRGRLVCYTSVQWNET nebo ·♦Leu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu ThrPeptid č. 3 (4B)LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNET neboLeu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu ThrPeptid č. 4 (5B)LLSSWGCKGRLVCYTSVQWNST neboLeu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn15 10 15 20Ser Thr 22Peptid č. 5 (6B)LLQSWGCKGRLVCYTSVQWNST neboLeu Leu Gin Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn1 5 10 15 20Ser Thr : 22Peptid č. 6LLNSWGCRGKAVCYTSVQWNET neboLeu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly Lys Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu ThrPeptid č. 7LLSLWGCRGRAVCYTSVQWNET neboLeu Leu Ser Leu Trp Gly Cys Arg Gly Arg Ala Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn 1 5 10 15 20Glu ThrPeptid č. 8 (7B)LLSSWGCRGRLVCYTSVQWNET neboLeu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Arg Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Gin Trp Asn15 10 15 20Glu Thr 22Pept id č. 9 (12B)LLSSWGCKGRLVCYTS neboLeu Leu Ser Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser 1 5 10 15Peptid č. 10 (14B)LLNSWGCKGRLVCYTS neboLeu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser15 10 15Pept i d č. 11 (1 BB)ALETLLQNQQLLNSWGCRGRLVCYTSVRWNET neboAla Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Arg Gly1 5 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30Peptid č. 12 (19B)ALETLLQNQQLLNIWGCRGRLVCYTSVRWNET neboAla Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asn Ile Trp Gly Cys Arg Gly15 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr 20 25 30Pept i d č. 13 (2OB)ALETLLQNQQLLDLWGCRGRLVCYTSVRWNET nebo-Ala Leu Glu Thr Leu Leu Gin Asn Gin Gin Leu Leu Asp Leu Trp Gly Cys Arg Gly 1 5 10 15Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val Arg Trp Asn Glu Thr20 25 30Peptid č. 14 (21B)LNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSV neboLeu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr1 5 10 15Thr Ser ValPeptid č. 15 (228)RALETLLNQQRLLNSWGCKGRLVCYTSV neboArg Ala Leu Glu Thr Leu Leu Asn Gin Gin Arg Leu Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys15 10 15Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val20 25Peptid č. 16 (23B)RLNSWGCKGRLVCYTSV neboArg Leu Asn Ser Trp Gly Cys Lys Gly Arg Leu Val Cys Tyr Thr Ser Val 1 5 io 15 ♦ 0 0 « »99 »· ** 00 00 • »0 0 0 0 0 0 • * » 0 0 0 0 • 0 00000· ·* 0 0 0 0»0· 000» ·· 00 pis jrp/ C-J- WZ&T
- 8. Prostředek vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden syntetický peptid podle nároku 1 až 7.
- 9. Prostředek podle nároku 8, vyznačující se t í m, že obsahuje peptid číslo 3 (4B) a peptid číslo 1 (2B).
- 10. Prostředek vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden syntetický peptid obecného vzorce I podle nároku 1 a alespoň jeden rekombinovaný peptid HIV-1 skupiny O.
- 11. Prostředek vyznačující se tím, že obsahuje alespoň jeden syntetický peptid obecného vzorce I podle nároku 1 a alespoň jeden syntetický nebo rekombinovaný peptid HIV-1 a/nebo HIV-2.
- 12. Způsob imunizace, že zavádí alespoň jeden podle nároku 1 až 7.vyznačující se tím, syntetický peptid obecného vzorce I
- 13. Způsob imunizace, vyznačující se tím, |e se zavádí prostředek podle nároku 8 až 11.
- 14. Diagnostický že obsahuje alespoň podle nároku 1 až 7 kit, vyznačuj ící se jeden syntetický peptid obecného nebo prostředek podle nároku 8 až tím,
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| FR9704356A FR2761993B1 (fr) | 1997-04-09 | 1997-04-09 | Peptides synthetiques utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 groupe 0 |
| FR9802212A FR2775287B1 (fr) | 1998-02-24 | 1998-02-24 | Peptides synthetiques consensus utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 du groupe o |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ357599A3 true CZ357599A3 (cs) | 2000-06-14 |
| CZ300927B6 CZ300927B6 (cs) | 2009-09-16 |
Family
ID=26233456
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ0357599A CZ300927B6 (cs) | 1997-04-09 | 1998-04-06 | Syntetický peptid monomerního typu, prostredek, který ho obsahuje, zpusob imunologické in vitro kvantifikace a diagnostický kit pro použití v biologických testech pro identifikaci infekcí zpusobených viry HIV |
Country Status (20)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US7053175B1 (cs) |
| EP (1) | EP0973802B1 (cs) |
| JP (1) | JP3560987B2 (cs) |
| KR (1) | KR100451312B1 (cs) |
| CN (1) | CN1215082C (cs) |
| AT (1) | ATE343590T1 (cs) |
| AU (1) | AU740231B2 (cs) |
| BR (1) | BRPI9809078B8 (cs) |
| CA (1) | CA2286344C (cs) |
| CZ (1) | CZ300927B6 (cs) |
| DE (1) | DE69836265T2 (cs) |
| ES (1) | ES2275305T3 (cs) |
| IL (2) | IL132166A0 (cs) |
| NO (1) | NO329149B1 (cs) |
| NZ (1) | NZ500015A (cs) |
| PL (1) | PL194863B1 (cs) |
| PT (1) | PT973802E (cs) |
| RU (1) | RU2184742C2 (cs) |
| TR (1) | TR199902757T2 (cs) |
| WO (1) | WO1998045323A1 (cs) |
Families Citing this family (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| KR100451312B1 (ko) * | 1997-04-09 | 2004-10-06 | 바이오-라드 파스퇴르 | 그룹 오 에이취아이브이-1 바이러스에 기인하는 감염의 검출을 위한 생물학적 시험에 사용가능한 합성 펩티드 |
| CA2676762C (en) * | 1998-11-30 | 2015-12-29 | Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. | Peptides for the detection of hiv-1 group o |
| FR2874017B1 (fr) | 2004-08-06 | 2006-11-24 | Bio Rad Pasteur Sa | Peptides vih-1 modifies et leur utilisation en detection d'anticorps anti-vih |
| EP3276350B1 (en) | 2012-06-22 | 2020-08-05 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | Human factor xiii as a normalization control for immunoassays |
| CN112481246B (zh) * | 2020-12-16 | 2022-03-29 | 熊猫乳品集团股份有限公司 | 一种生物活性多肽fspankkltpkky及其制备方法和应用 |
Family Cites Families (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5204259A (en) | 1988-05-06 | 1993-04-20 | Pharmacia Genetic Engineering, Inc. | Methods and systems for producing HIV antigens |
| DE59309207D1 (de) | 1992-10-06 | 1999-01-21 | Dade Behring Marburg Gmbh | Retrovirus aus der HIV-Gruppe und dessen Verwendung |
| DE4405810A1 (de) | 1994-02-23 | 1995-08-24 | Behringwerke Ag | Von einem Retrovirus aus der HIV-Gruppe abgeleitete Peptide und deren Verwendung |
| GB9410044D0 (en) | 1994-05-19 | 1994-07-06 | Int Murex Tech Corp | Assay |
| DE4430998A1 (de) | 1994-07-25 | 1996-02-01 | Boehringer Mannheim Gmbh | Metallchelat-markierte Peptide |
| ES2293643T5 (es) * | 1994-10-20 | 2012-02-02 | Institut Pasteur | Secuencias nucleotídicas de antígenos retrovíricos vih-1 del grupo (o subgrupo) o. |
| DE19505262C2 (de) | 1995-02-16 | 1998-06-18 | Behring Diagnostics Gmbh | Retrovirus aus der HIV-Gruppe und dessen Verwendung |
| FR2731013B1 (fr) * | 1995-02-27 | 1997-05-16 | Inst Nat Sante Rech Med | Vih-1 de groupe o, fragments desdits virus, ainsi que leurs applications |
| AU5100696A (en) * | 1995-03-02 | 1996-09-18 | Akzo Nobel N.V. | Specific hiv-1 group o antigens |
| US5569553A (en) | 1995-03-08 | 1996-10-29 | Wilson Greatbatch Ltd. | Battery design for achieving end-of-life indication during electrical discharge |
| DE19622088A1 (de) | 1996-05-31 | 1997-12-04 | Boehringer Mannheim Gmbh | Anti-HIV-Antikörper als Kontrollproben |
| KR100451312B1 (ko) * | 1997-04-09 | 2004-10-06 | 바이오-라드 파스퇴르 | 그룹 오 에이취아이브이-1 바이러스에 기인하는 감염의 검출을 위한 생물학적 시험에 사용가능한 합성 펩티드 |
| CA2296442A1 (en) | 1997-07-18 | 1999-01-28 | Innogenetics N.V. | Hiv-1 group o antigens and uses thereof |
-
1998
- 1998-04-06 KR KR10-1999-7009296A patent/KR100451312B1/ko not_active IP Right Cessation
- 1998-04-06 ES ES98920571T patent/ES2275305T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 WO PCT/FR1998/000691 patent/WO1998045323A1/fr active IP Right Grant
- 1998-04-06 US US09/147,362 patent/US7053175B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 BR BRPI9809078A patent/BRPI9809078B8/pt not_active IP Right Cessation
- 1998-04-06 TR TR1999/02757T patent/TR199902757T2/xx unknown
- 1998-04-06 DE DE69836265T patent/DE69836265T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 CN CNB988052024A patent/CN1215082C/zh not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 PT PT98920571T patent/PT973802E/pt unknown
- 1998-04-06 CA CA2286344A patent/CA2286344C/fr not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 CZ CZ0357599A patent/CZ300927B6/cs unknown
- 1998-04-06 IL IL13216698A patent/IL132166A0/xx active IP Right Grant
- 1998-04-06 AU AU73386/98A patent/AU740231B2/en not_active Expired
- 1998-04-06 RU RU99123443/04A patent/RU2184742C2/ru active
- 1998-04-06 NZ NZ500015A patent/NZ500015A/en not_active IP Right Cessation
- 1998-04-06 AT AT98920571T patent/ATE343590T1/de not_active IP Right Cessation
- 1998-04-06 JP JP54245598A patent/JP3560987B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1998-04-06 PL PL336115A patent/PL194863B1/pl unknown
- 1998-04-06 EP EP98920571A patent/EP0973802B1/fr not_active Expired - Lifetime
-
1999
- 1999-09-30 IL IL132166A patent/IL132166A/en not_active IP Right Cessation
- 1999-10-08 NO NO19994929A patent/NO329149B1/no not_active IP Right Cessation
-
2006
- 2006-04-13 US US11/402,876 patent/US7838001B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR910002374B1 (ko) | Aids 관련질병의 검출을 위한 합성항원 | |
| RU1802871C (ru) | Способ определени антител к Н @ V - 1 | |
| JPS62277400A (ja) | Ｈｔｌｖ−３エンベロ−プ蛋白質 | |
| CS256960B1 (en) | Peptides with properties of antigenic determinants and method of their production | |
| EP0538283B2 (en) | Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting hiv antibodies | |
| US7838001B2 (en) | Synthetic peptides useful in biological essays for detecting infections caused by group O HIV-1 viruses | |
| EP0326490B1 (en) | Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies | |
| HUT61323A (en) | And treating htlv-1 peptides and antibodies against them for diagnosting htlv-1 infection and for vaccination against it | |
| MXPA99009106A (en) | Synthetic peptides useful in biological assays for detecting infections caused by group o hiv-1 viruses | |
| US6210874B1 (en) | Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies | |
| US6214537B1 (en) | Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies | |
| US6218102B1 (en) | Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies | |
| CA2676762C (en) | Peptides for the detection of hiv-1 group o | |
| KR100242241B1 (ko) | 인간 면역 결핍 바이러스(hiv) 양성 혈청과 반응성이 높은 펩티드 | |
| FR2761993A1 (fr) | Peptides synthetiques utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 groupe 0 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |