NO329149B1 - Syntetiske peptider, blandinger, immunoassaymetode og diagnostiseringssett - Google Patents

Syntetiske peptider, blandinger, immunoassaymetode og diagnostiseringssett Download PDF

Info

Publication number
NO329149B1
NO329149B1 NO19994929A NO994929A NO329149B1 NO 329149 B1 NO329149 B1 NO 329149B1 NO 19994929 A NO19994929 A NO 19994929A NO 994929 A NO994929 A NO 994929A NO 329149 B1 NO329149 B1 NO 329149B1
Authority
NO
Norway
Prior art keywords
peptides
peptide
radical
seq
group
Prior art date
Application number
NO19994929A
Other languages
English (en)
Other versions
NO994929L (no
NO994929D0 (no
Inventor
Denis Marie Bernard Chenebaux
Jean-Francois Hubert Delagneau
St Phane Jean Xavier Gadelle
Francois Yves Unier
Original Assignee
Bio Rad Pasteur
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=26233456&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=NO329149(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Priority claimed from FR9704356A external-priority patent/FR2761993B1/fr
Priority claimed from FR9802212A external-priority patent/FR2775287B1/fr
Application filed by Bio Rad Pasteur filed Critical Bio Rad Pasteur
Publication of NO994929D0 publication Critical patent/NO994929D0/no
Publication of NO994929L publication Critical patent/NO994929L/no
Publication of NO329149B1 publication Critical patent/NO329149B1/no

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • C07K14/08RNA viruses
    • C07K14/15Retroviridae, e.g. bovine leukaemia virus, feline leukaemia virus human T-cell leukaemia-lymphoma virus
    • C07K14/155Lentiviridae, e.g. human immunodeficiency virus [HIV], visna-maedi virus or equine infectious anaemia virus
    • C07K14/16HIV-1 ; HIV-2
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/005Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/16011Human Immunodeficiency Virus, HIV
    • C12N2740/16111Human Immunodeficiency Virus, HIV concerning HIV env
    • C12N2740/16122New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Description

Foreliggende oppfinnelse vedrører syntetiske peptider, blandinger, immunoassaymetode og diagnostiseringssett.
Oppfinnelsen vedrører følgelig syntetiske peptider som kan benyttes i biologiske tester til påvisning av infeksjoner som følge av gruppe 0 HIV-1 virus, blandinger og sett som inneholder slike peptider.
Gruppe 0 HIV-1 retrovirus er tidligere kjent. Tidligere patent EP 0.345.375 og patentsøknad EP 0.657.532 beskriver ANT 70 og ANT 70 NA-isolater isolert fra pasienter fra Kamerun. Disse dokumentene beskriver mer nøyaktig antigener og antigenblandinger som inneholder lysater eller proteiner av disse isolatene, nukleinsyrene som tilsvarer det genomiske RNA, hybridiseringsmetoder hvor disse nukleinsyrene benyttes, metoder for de ovenfor angitte isolater, så vel som fremgangsmåter for fremstilling av p12-, p16-, p25-, gp41- og gp121-proteiner av disse retrovirus.
Søknad EP 0.591.914 beskriver MVP 5180/91-isolatet. Dette isolat, karakterisert ved western-blotting, oppviser i likhet med det tidligere isolat, forskjeller med hensyn til HIV-1 retrovirusisolatene som lenge har vært kjent. Søknad
EP 0.591.914 beskriver nøyaktig DNA-sekvensene av MVP 5180/91-isolatet og angir nøyaktig lokaliseringen av gag-, pol- og env-genene. Søknad EP 0.591.914 beskriver dessuten syntetiske peptider av V3-sløyfen, så vel som den immundominante region (gp41). De er egnet for biologiske tester, særlig for in vitro påvisning av gruppe 0 HIV-1 antistoff.
Søknad EP 0.673.948 beskriver syntetiske eller rekombinante peptider bestående av 15 til 50 aminosyrer (AA) og som omfatter sekvensen
-VWGIRQLRARLQALETLIQNQQRLNLWGXKGKLIXYTSVKWNTSWSGR-
hvor X utgjør enten en cysteinrest eller en serinrest. Disse peptidene er egnet innen det diagnostiske felt til påvisning av infeksjoner som skyldes visse gruppe 0 HIV-1 retrovirusisolater.
Søknad EP 0.727.483, som også er kjent, beskriver MVP 2901/94-isolatet som også utgjør del av de retrovirus som tilhører gruppen 0 HIV-1-familien. Denne søknaden beskriver visse antigener som har veldefinerte peptidsekvenser. Disse peptidsekvensene tilsvarer deler av sekvensen av gp120 og deler av gp41 (immundominant region) av MVP2901/94-isolatet.
Søknad WO 96/12809 beskriver to nye isolater som tilhører gruppen 0 HIV-1-familien. De er VAU- og DUR-isolatene. Denne søknaden beskriver visse peptidsekvenser avledet fra de to ovenfor nevnte virus som er anvendelige for påvisning av antistoffer som gjenkjenner HIV-1 VAU- eller DUR-peptidsekvensene.
Søknad WO 96/32293 beskriver to antigener avledet fra sekvensen av
ANT 70-isolatet. De er antigenet betegnet MDL061 og antigenet MDL056 av den immundominante region av gp41.1 henhold til denne oppfinnelse er det for å påvise 100% av prøvene av et begrenset utvalg sera fra pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 virus, nødvendig å benytte blandinger som inneholder disse to peptidene, siden hvert isolert peptid ikke alene gjør det mulig å oppnå tilfredsstillende resultater.
WO 96/27013 beskriver gruppe O HIV-1, fragmenter av slike viruser og anvendelse derav. WO 95/32293 beskriver analyse for HIV-1 gruppe O ved anvendelse av minst et GP41 peptid.
Det er faktisk umulig ut fra den genetiske variabilitet som isolatene av
gruppe 0 virus viser, å garantere serologisk screening av infiserte individer ved å benytte antigener avledet fra ett og samme isolat. Dette betyr at det ikke er mulig å oppnå reagenser som garanterer 100% følsomhet. 0-gruppen skaper dermed for første gang, et vesentlig problem, idet det ikke er mulig for enkelte serologiske reagenser å gjenkjenne individer infisert med særlig avvikende grupper eller subtyper. Dette er akkurat tilfellet for gruppe 0 HIV-1 virus.
Søknad WO 96/40763 understreker også den store divergens i 0-gruppen. Søknaden beskriver peptider som i en naturlig HIV-1 type B-sekvens inkorporerer noen få mindre modifikasjoner (erstatning av én eller to aminosyrer). Ifølge denne søknaden er disse hybridpeptidene i stand til å reagere med antigruppe 0-antistoffer.
Søknad WO 96/27013 beskriver en rekke nye gruppe 0 HIV-1 virus betegnet BCF 01, BCF 02, BCF 03, BCF 06, BCF 07, BCF 08, BCF 09, BCF11, BCF12, BCF13 og BCF14, så vel som en rekke peptider av den tilsvarende gp41 dominante region som betegnes ESS/BCF02, FAN/BCF01, LOB/BCF06, MAN/BCF07, NKO/BCF08, POC/BCF03, NAN/BCF11, BCF09, BCF12, BCF13 og BCF14. Flere av disse peptidene er vanskelige å håndtere diagnostisk på grunn av deres lave løselighet, spesielt peptidet BCF13.
Det har nå uventet vist seg at enkelte syntetiske peptider er diagnostiske reagenser av overlegen kvalitet som gjør det mulig å tilfredsstillende foreta screening av pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus. Disse peptidene er sammensatt av variable sekvenser koordinert omkring høyt konserverte korte sekvenser som forekommer i isolater av gruppe 0 HIV-1 retrovirus. Peptidene ifølge oppfinnelsen gjør det mulig å oppnå resultater som er ganske overlegne i forhold til de oppnådd med syntetiske peptider som bærer immundominante epitoper av gp41 (env) av visse gruppe 0 HIV-1 isolater.
For i det følgende å navngi aminosyrene, vil tre-bokstavsnomenklaturen bli benyttet.
Det syntetiske peptidet ifølge oppfinnelsen er kjennetegnet ved at det inkluderer eller består av én av sekvensene SEKV ID NR: 2, 3, 10, 11, 12, 14, 15, 16.
Det syntetiske peptidet er videre kjennetegnet ved at det består av en av sekvensene SEKV ID NR: 2, 3, 10, 11, 12, 14, 15 og 16.
Peptidene med de følgende sekvensene er angitt i henhold til én- og tre-bokstavnomenklaturen:
Foreliggende oppfinnelse vedrører videre blanding kjennetegnet ved at den inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2. Det er videre beskrevet blanding kjennetegnet ved at den inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2 og én eller flere gruppe O HIV-1-rekombinante peptider. Foreliggende oppfinnelse vedrører også blanding som inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2 og én eller flere HIV-1 og HIV-2-rekombinante peptider eller syntetiske peptider. Oppfinnelsen beskriver videre immunoassaymetode som gjør bruk av ett eller flere syntetiske peptider ifølge et hvilket som helst av kraavene 1 eller 2. Immunoassaymetoden ifølge foreliggende oppfinnelse gjør bruk av en blanding ifølge et hvilket som helst av kravene 3 til 5. Foreliggende oppfinnelse vedrører også et diagnostiseringssett kjennetegnet ved at det inkluderer minst ett syntetisk peptid, ifølge krav 1 eller 2, eller en blanding ifølge et hvilket som helst av kravene 3 til 5.
De syntetiske peptidene som er gjenstand for foreliggende oppfinnelse, kan oppnås ved fastfast-syntese i henhold til konvensjonelle metoder: R.B. Merrifield, J. Amer. Chem. Soc. (1963), 85, s. 2149-2154; R.C. Sheppard, i «Peptides 1971», Nesvadba, H. (red.) North Holland, Amsterdam, s. 111; E. Atherton & R.L Sheppard, i «Solid phase peptide synthesis, a practical approach», IRL PRESS, (1989), Oxford University Press, s. 25-34. Som automatisk syntesemaskin er det mulig å benytte syntesemaskinen «9050 Plus Pep Synthesizer» fra Millipore eller en tilsvarende syntesemaskin.
Den faste bæreren som benyttes for syntesen bør være forenelig med den anvendte teknikk og kjemi. For en syntese på syntesemaskinen «9050 Plus Pep. Synthesizer» er det for eksempel anbefalt å benytte en harpiks egnet for den såkalte «continuous flow»-teknikk. Disse kriterier oppfylles av PEG PS harpiksene. Disse bærerne består av en arm («spacer») basert på polyetylenglykol (PEG) anbragt mellom polystyrenkulenes funksjonelle gruppe og tilkoblingspunktet for den første aminosyre. Naturen av dette forankringspunkt kan variere med hvilken C-terminal funksjonell gruppe som velges. I foreliggende tilfelle ble det benyttet forskjellige PEG-PS harpikser.
Utgangsharpikset og aminosyrene benyttet som råmaterialer, er produkter som er kommersielt tilgjengelige (PerSeptive-Biosystem eller Neosystem).
For peptidsyntesen kan følgende beskyttelsesgrupper for sidekjedene benyttes:
Den temporære beskyttelse av den primære funksjonelle amingruppe i aminosyrenes a-stilling som benyttes, er 9-fluorenylmetyloksykarbonyl (Fmoc) gruppen. Avbeskyttelsen foretas med en 20% løsning av piperidin i dimetylformamid.
For koblingen benyttes fortrinnsvis et overskudd av diisopropylkarbodiimid (DIPCDI) og 1-hydroksybenzotriazol (HOBt).
Etter syntese vaskes harpiksen med organiske løsningsmidler (dimetylformamid og deretter med diklormetan), tørkes under vakuum og behandles deretter med en løsning på trifluoreddiksyrebasis (TFA) avkjølt til 0°C og som inneholder passende «oppfangere». For eksempel kan K-reagenset som inneholder 82% trifluoreddiksyre, 5% fenol, 5% vann, 5% tioanisol og 3% etanditiol, benyttes.
Etter frafiltrering av harpiksen utfelles de syntetiske peptidene og renses med eter.
De syntetiske peptidene renses deretter ved omvendt-fase væskekromatografi og renheten bestemmes ved massespektrometri. Som fastfase er det for eksempel mulig å benytte Bondapak C-18 fasen. Peptidene elueres ved å etablere en lineær gradient mellom to bufferløsninger, hvorav den første i det vesentlige er vandig (for eksempel vann-TFA 0,1%) og den andre er mer organisk (for eksempel en blanding inneholdende 60% acetonitril, 39,92% vann og 0,08% TFA). De oppsamlede fraksjoner kombineres, konsentreres under vakuum og frysetørkes.
For cykliseringen løses de rensede syntetiske peptidene i en ammonium-acetatløsning (10 mM). pH justeres til 8,5 ved tilsetning av 1M ammoniumhydroksyd. Løsningen omrøres kraftig. Cykliseringen er fullført etter 18 timer. Deretter reduseres pH til 6 ved tilsetning av eddiksyre. De cykliserte peptidene frysetørkes og renses deretter ved omvendt-fase væskekromatografi som beskrevet ovenfor.
Immunreaktiviteten av peptidene ifølge oppfinnelsen ble evaluert ved hjelp av sera fra pasienter hovedsakelig av Kamerunsk opprinnelse, infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus. De forskjellige foretatte tester viste at peptidene ifølge oppfinnelsen, alene eller i kombinasjon (blanding av peptider) gjør det mulig å påvise 100% av sera infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus.
De syntetiske peptidene ifølge oppfinnelsen finner derfor anvendelse i immunologiske tester for screening av infeksjoner som følge av gruppe 0 HIV-1 retrovirus. Det er også mulig å benytte kombinasjoner av flere syntetiske peptider.
De syntetiske peptidene ifølge oppfinnelsen kan også benyttes i kombinasjon med andre HIV-2 og/eller HIV-1 rekombinante (rekombinante proteiner) eller syntetiske peptider, så som de peptidene som er beskrevet i patentsøknader eller patenter EP 0.387.914, EP 0.239.425, EP 0.220.273 eller EP 0.267.802.
De følgende eksempler illustrerer oppfinnelsen.
EKSEMPEL 1:
Fremstilling av en forbindelse ifølge oppfinnelsen: PEPTID Nr. 2 (3B)
Dette peptidet ble syntetisert på en fast fase. Teknikken utviklet i 1963 av Merrifield (J. Am. Chem. Soc. (1963) 85, s. 2149-2154) består i å feste den første aminosyre til en polymer fast bærer (harpiks) ved hjelp av dens funksjonelle syregruppe og forlenge peptidsekvensen fra denne første aminosyre, idet peptidet som syntetiseres forblir forankret til harpiksen.
For syntesen av peptid Nr. 2 ble det som syntesemaskin benyttet «9050 Plus Pep Synthesizer» og som harpiks, harpikset Fmoc Thr (OtBu) PEG PS.
De forskjellige syntesetrinn er sammenfattet i Tabell I nedenfor:
Etter avsluttet syntese ble harpiksen vasket med dimetylformamid og deretter med diklormetan og tørket under vakuum.
Deretter ble harpiksen behandlet med K-reagenset (82% trifluoreddiksyre; 5% fenol; 5% vann; 5% tioanisol; 3% etanditiol). Peptid Nr. 2 (3B), isolert ved utfelling med dietyleter, ble deretter renset med det samme løsningsmiddel. 140 mg av peptid Nr. 2 (3B) ble derved oppnådd.
Peptid Nr. 2 (3B) ble deretter renset ved omvendt-fase væskekromatografi. Bondapak C-18 fasen ble benyttet som fastfase. Peptidene elueres ved å etablere en lineær gradient mellom to bufferløsninger, hvorav den første i det vesentlige er vandig (for eksempel vann-TFA 0,1%) og den andre er mer organisk (for eksempel en blanding inneholdende 60% acetonitril, 39,92% vann og 0,08% TFA). De oppsamlede fraksjoner ble kombinert, konsentrert under vakuum og frysetørket.
For cykliseringen ble de således oppnådde rensede syntetiske peptidene løst i en ammoniumacetatløsning (10 mM). pH ble justert til 8,5 ved tilsetning av 1M ammoniumhydroksyd. Løsningen ble omrørt kraftig. Cykliseringen var fullført etter 18 timer. Deretter ble pH redusert til 6 ved tilsetning av eddiksyre. De cykliserte peptidene ble frysetørket og deretter renset ved omvendt-fase væskekromatografi som beskrevet ovenfor.
Fremstilling av en forbindelse ifølge oppfinnelsen: PEPTID Nr. 15 (22B)
Dette peptid ble syntetisert som peptid Nr. 2 (3B), men med
FmocPAL PEG-PS som harpiks.
De forskjellige syntesetrinn er sammenfattet nedenfor i Tabell II.
Etter avsluttet syntese ble harpiksen vasket med dimetylformamid og deretter med diklormetan og tørket under vakuum.
Deretter ble harpiksen behandlet med K-reagenset (82% trifluoreddiksyre; 5% fenol; 5% vann; 5% tioanisol; 3% etanditiol). Peptid Nr. 7 (22B), isolert ved utfelling med dietyleter, ble deretter renset med det samme løsningsmiddel. 140 mg av peptid Nr. 15 (22B) ble derved oppnådd.
Peptid Nr. 15 (22B) ble deretter renset ved omvendt-fase væskekromatografi og deretter cyklisert, frysetrøket og renset som beskrevet ovenfor for peptid Nr. 2 (3B).
På samme måte og ved bruk av passende harpikser og aminosyrer, ble de øvrige forbindelsene ifølge oppfinnelsen syntetisert.
Tabell III angir molekylvekten av enkelte peptider med formel (I) i ikke-cyklisert form, fastslått ved massespektrometri.
EKSEMPEL 2:
Evaluering av immunreaktiviteten av peptidene ifølge oppfinnelsen ved hjelp av den immunenzymatiske test: Test Nr. 1
De anvendte sera ESS, DUR, VAU og HAD er sera fra franske pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus. De andre serumprøvene fra pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus ble anskaffet fra Yaoundé Pasteur Centre i Kamerun og ble tilordnet serotypegruppe 0 ifølge den serologiske algoritmen beskrevet i AIDS
(1977), 11, s. 445-453.
De HIV-negative sera (n=48) ble tatt fra friske forsøkspersoner.
De anvendte syntetiske peptidene ble løst i vann i en konsentrasjon på
1 mg/mL (stamløsning). For sensibiliseringstrinnet av den faste fase (belegging), ble 110 (iL av en løsning på 2 fig/mL av hvert peptid (oppnådd ved å fortynne stamløsningen med 0,1M karbonat-bufferløsning) tilsatt til hver brønn i mikrotiterplatene Microtiter™ (NUNC). Etter inkubering ved romtemperatur over natten ble mikroplatene først vasket med en Tris-NaCI-bufferløsning, pH 7,4, inneholdende 0,1% Tween® 20 og 0,001% natrium-mertiolat og deretter mettet med en PBS-løsning inneholdende 0,5% Régilait™ (tørket skummet melk). Etter avsugning av metningsløsningen ble platene oppvarmet til 50°C i 10 minutter.
Serumprøvene ble fortynnet 1/5 med en skummetmelk-løsning (citratbuffer supplert med 0,01% fenolrødt, 0,25% kloroform og 0,25% Kathon®), avsatt i brønnene i platen og inkubert ved 40°C i 30 minutter.
Etter vasking med en Tris-NaCI-bufferløsning, pH 7,4, inneholdende 0,1% Tween® 20 og 0,001% natrium-mertiolat, ble 100 \ iL av en løsning av konjugat bestående av pepperrot-peroksydase-merket anti-human-IgG og IgM-geit-antistoffer, som inneholdt som konserveringsmiddel 0,01% natrium-mertiolat, løst i en citratbufferløsning supplert med 30% glycerol og 25% normalt føtalt kalveserum, tilsatt til hver brønn, hvoretter platene ble inkubert i 30 minutter ved 40°C.
Etter vasking med en Tris-NaCI-bufferløsning, pH 7,4, inneholdende 0,1% Tween® 20 og 0,001% natrium-mertiolat, ble farven fremkalt ved til hver brønn å tilsette 100 ^L o-fenylendiamin løst i hydrogen-peroksyd. Mikroplatene ble deretter inkubert i 30 minutter ved romtemperatur og i mørke. Farvereaksjonen ble deretter stanset ved tilsetning av 100 \ ± 4N svovelsyre. Absorbansen (A) ble bestemt ved 490 og 620 nm.
Den relative absorbans-avlesning (A490-A620) i hver brønn er proporsjonal med immunreaktiviteten av hvert peptid. Den indikerer hvert peptids evne til å reagere med den biologiske prøve som testen foretas med. Grenseverdien (cut-off) ble bestemt til en absorbansverdi på 0,15. Den tilsvarer gjennomsnittet av de negative verdiene (n=48) pluss 12 standardavvik.
Reaktiviteten av peptidene ifølge oppfinnelsen (peptid Nr. 3 (4B), peptid Nr. 2 (3B) og peptid Nr. 1 (2B), alle i cyklisert form), ble sammenlignet med reaktiviteten av to syntetiske peptider hvis sekvens hadde en del av den naturlige sekvens av envelope (env) av VAU-isolatet (gruppe 0 HIV-1 retrovirus) og som omfattet en immundominant epitop av gp41.
Disse to peptidene hadde følgende sekvens:
For denne undersøkelsen ble disse peptidene benyttet i cyklisert form. Resultatene av undersøkelsen er angitt i Tabell IV.
Resultatene i Tabell IV viser at peptid Nr. 3(4B) gir best resultat med hensyn til det som er angitt for de andre peptidene. Dette peptid skjelner best mellom sera fra pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus sammenlignet med de to peptidene som har en del av sekvensen av det VAU-isolat som tilsvarer den immundominante epitop av gp41. Peptid Nr. 2 (3B) og Nr. 1 (2B) er dessuten mer immunreaktive enn VAU 22AA peptidet som omfatter det samme antall aminosyrer.
EKSEMPEL 3:
Evaluering av immunreaktiviteten av peptidene ifølge oppfinnelsen ved hjelp av en immunenzymatisk test, Test Nr. 2.
Serumprøver fra pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus ble anskaffet fra Yaoundé Pasteur Centre i Kamerun og ble tilordnet serotype gruppe 0 ifølge den serologiske algoritme beskrevet i AIDS (1977), 11, s. 445-453. En genotypet prøve (Maryland) ble anskaffet fra USA. Disse prøver ble på forhånd fortynnet i negativt humant serum i de fortynninger som er angitt i Tabell V for å oppnå et tilstrekkelig volum for de ulike immunreaktivitetstestene.
De anvendte syntetiske peptidene ble løst i vann i en konsentrasjon på
1 mg/mL (stamløsning). For sensibiliseringstrinnet av den faste fase (belegging), ble fremgangsmåten beskrevet i Eksempel 2 benyttet.
Serumprøvene ble fortynnet 1/5 med en skummetmelk-løsning (citratbuffer supplert med 0,01% fenolrødt, 0,25% kloroform og 0,25% Kathon®), avsatt i platebrønnene og inkubert i 30 minutter ved 40°C.
Etter vasking med en Tris-NaCI-bufferløsning, pH 7,4, inneholdende 0,1% Tween® 20 og 0,001% natrium-mertiolat, ble 100 nL av en løsning av konjugat bestående av pepperrot-peroksydase-merket anti-human-IgG og IgM-geit-antistoffer, som inneholdt som konserveringsmiddel 0,01% natrium-mertiolat, løst i en citratbufferløsning supplert med 30% glycerol og 25% normalt føtalt kalveserum, tilsatt til hver platebrønn, hvoretter platene ble inkubert i 30 minutter ved 40°C.
Etter vasking med en Tris-NaCI-bufferløsning, pH 7,4, inneholdende 0,1% Tween® 20 og 0,001% natrium-mertiolat, ble farven fremkalt som beskrevet i Eksempel 2.
Den relative absorbans-avlesning (OD) (A490-A620) i hver brønn er proporsjonal med immunreaktiviteten av hvert peptid. Den indikerer hvert peptids evne til å reagere med den biologiske prøve som testen foretas med.
Reaktiviteten av peptidene ifølge oppfinnelsen, peptidene Nr. 10 (14B), Nr. 11 (18B), Nr. 12 (19B), Nr. 14 (21B), Nr. 15 (22B), Nr. 16 (23B), alle i cyklisert form, ble sammenlignet med reaktiviteten av tre homologe syntetiske peptider hvis sekvens hadde en del av den naturlige sekvens av envelope (env) av et gruppe 0 HIV-1 retrovirus. Disse peptidene er to peptider avledet fra VAU-isolatet - peptidet VAU 22 AA og peptidet VAU 35 AA - og peptidet MVP 5180 (betegnet «MVP 5180» i Tabell V). Peptidene VAU 22AA og VAU 35 AA (hvis struktur er angitt i Eksempel 2) og peptidet MVP 5180 omfatter en immundominant epitop av gp41.
Alle disse peptidene ble benyttet i cyklisert form. Sekvensen av MVP 5180 peptidet er følgende:
Resultatene av denne undersøkelse er angitt i Tabell V
For hvert undersøkt peptid ble prøvene ordnet i fire klasser (a, b, c og d) tilsvarende ulike nivåer av relativ absorbans avlest ved bølgelengdene A492-A620:
■ fora: OD < 0,100,
■ forb: 0,100 < OD < 0,500, ■ fore: 0,500 < OD < 1,000,
■ ford: OD > 1,000
som gjør det mulig å vurdere peptidenes immunreaktivitetsgrad. De mest immunreaktive peptidene er de som har det høyeste antall prøver i de klasser som tilsvarer de høyeste absorbansverdier.
Resultatene er angitt i Tabell VI.
Det fremgår av resultatene at alle undersøkte peptider ifølge oppfinnelsen gir en bedre immunreaktivitet enn de tidligere kjente referansepeptider, som skriver seg fra naturlige isolater (MVP 5180, VAU). Peptidene Nr. 15 (22B), Nr. 14 (21B) og Nr. 16 (23B) ifølge oppfinnelsen viser seg å være de mest immunreaktive.
EKSEMPEL 4:
Evaluering av imunreaktiviteten av blandinger inneholdende peptider ifølge oppfinnelsen ved hjelp av en immunenzymatisk test
Denne test ble foretatt i henhold til fremgangsmåten beskrevet i Eksempel 2, og de samme sera ble benyttet. De anvendte mikroplatene ble sensibilisert enten med peptid Nr. 1 (2B) cyklisert, eller med peptid Nr. 3 (4B) cyklisert, eller med en blanding inneholdende disse to peptidene (1:1 vektdeler). I hver brønn ble det avsatt enten 100 \ iL av en løsning inneholdende 2 ug/mL av peptid Nr. 1 (2B), eller 100 \ iL av en løsning inneholdende 2 ng/mL av peptid Nr. 3 (4B) eller 100 \ iL av en løsning inneholdende 1 ug/mL av peptid Nr. 1 (2B) og 1 ug/mL av peptid Nr. 3 (4B). Resultatene av denne test er angitt i Tabell VII.
Tabell VII viser at blandingene av peptidene ifølge oppfinnelsen, når de benyttes diagnostisk, tillater påvisning av alle sera fra pasienter infisert med gruppe 0 HIV-1 retrovirus.

Claims (8)

1. Syntetisk peptid, karakterisert ved at det inkluderer eller består av én av sekvensene SEKV ID NR: 2, 3,10,11,12, 14, 15, 16.
2. Syntetisk peptid ifølge krav 1,karakterisert ved at det består av en av sekvensene SEKV ID NR: 2, 3, 10, 11, 12, 14,15 og 16.
3. Blanding, karakterisert ved at den inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2.
4. Blanding, karakterisert ved at den inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2 og én eller flere gruppe O HIV-1 - rekombinante peptider.
5. Blanding, karakterisert ved at den inneholder én eller flere syntetiske peptider ifølge krav 1 eller 2 og én eller flere HIV-1 og HIV-2-rekombinante peptider eller syntetiske peptider.
6. Immunoassaymetode, karakterisert ved at den gjør bruk av ett eller flere syntetiske peptider ifølge et hvilket som helst av kravene 1 eller 2.
7. Immunoassaymetode, karakterisert ved at den gjør bruk av en blanding ifølge et hvilket som helst av kravene 3 til 5.
8. Diagnostiseringssett, karakterisert ved at det inkluderer minst ett syntetiske peptid, ifølge krav 1 eller 2, eller en blanding ifølge et hvilket som helst av kravene 3 til 5.
NO19994929A 1997-04-09 1999-10-08 Syntetiske peptider, blandinger, immunoassaymetode og diagnostiseringssett NO329149B1 (no)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9704356A FR2761993B1 (fr) 1997-04-09 1997-04-09 Peptides synthetiques utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 groupe 0
FR9802212A FR2775287B1 (fr) 1998-02-24 1998-02-24 Peptides synthetiques consensus utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih 1 du groupe o
PCT/FR1998/000691 WO1998045323A1 (fr) 1997-04-09 1998-04-06 Peptides synthetiques utilisables dans les essais biologiques pour la detection des infections dues aux virus vih-1 du groupe o

Publications (3)

Publication Number Publication Date
NO994929D0 NO994929D0 (no) 1999-10-08
NO994929L NO994929L (no) 1999-12-08
NO329149B1 true NO329149B1 (no) 2010-08-30

Family

ID=26233456

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
NO19994929A NO329149B1 (no) 1997-04-09 1999-10-08 Syntetiske peptider, blandinger, immunoassaymetode og diagnostiseringssett

Country Status (20)

Country Link
US (2) US7053175B1 (no)
EP (1) EP0973802B1 (no)
JP (1) JP3560987B2 (no)
KR (1) KR100451312B1 (no)
CN (1) CN1215082C (no)
AT (1) ATE343590T1 (no)
AU (1) AU740231B2 (no)
BR (1) BRPI9809078B8 (no)
CA (1) CA2286344C (no)
CZ (1) CZ300927B6 (no)
DE (1) DE69836265T2 (no)
ES (1) ES2275305T3 (no)
IL (2) IL132166A0 (no)
NO (1) NO329149B1 (no)
NZ (1) NZ500015A (no)
PL (1) PL194863B1 (no)
PT (1) PT973802E (no)
RU (1) RU2184742C2 (no)
TR (1) TR199902757T2 (no)
WO (1) WO1998045323A1 (no)

Families Citing this family (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2275305T3 (es) * 1997-04-09 2007-06-01 Bio-Rad Pasteur Peptidos sinteticos utilizables en los ensayos biologicos para la deteccion de infecciones debidas a los virus vih-1 del grupo o.
CA2290217C (en) * 1998-11-30 2010-01-12 Ortho-Clinical Diagnostics, Inc. Peptides for the detection of hiv-1 group o
FR2874017B1 (fr) * 2004-08-06 2006-11-24 Bio Rad Pasteur Sa Peptides vih-1 modifies et leur utilisation en detection d'anticorps anti-vih
WO2013192445A1 (en) * 2012-06-22 2013-12-27 Bio-Rad Laboratories, Inc. Human factor xiii as a normalization control for immunoassays
CN112481246B (zh) * 2020-12-16 2022-03-29 熊猫乳品集团股份有限公司 一种生物活性多肽fspankkltpkky及其制备方法和应用

Family Cites Families (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5204259A (en) 1988-05-06 1993-04-20 Pharmacia Genetic Engineering, Inc. Methods and systems for producing HIV antigens
JP3277045B2 (ja) 1992-10-06 2002-04-22 デイド・ベーリング・マルブルク・ゲゼルシヤフト・ミツト・ベシユレンクテル・ハフツング Hiv−グループのレトロウイルスおよびその使用
DE4405810A1 (de) 1994-02-23 1995-08-24 Behringwerke Ag Von einem Retrovirus aus der HIV-Gruppe abgeleitete Peptide und deren Verwendung
GB9410044D0 (en) 1994-05-19 1994-07-06 Int Murex Tech Corp Assay
DE4430972A1 (de) 1994-07-25 1996-02-01 Boehringer Mannheim Gmbh Bestimmung von spezifischem Immunglobulin unter Verwendung multipler Antigene
ES2293643T5 (es) * 1994-10-20 2012-02-02 Institut Pasteur Secuencias nucleotídicas de antígenos retrovíricos vih-1 del grupo (o subgrupo) o.
DE19505262C2 (de) 1995-02-16 1998-06-18 Behring Diagnostics Gmbh Retrovirus aus der HIV-Gruppe und dessen Verwendung
FR2731013B1 (fr) * 1995-02-27 1997-05-16 Inst Nat Sante Rech Med Vih-1 de groupe o, fragments desdits virus, ainsi que leurs applications
AU5100696A (en) * 1995-03-02 1996-09-18 Akzo Nobel N.V. Specific hiv-1 group o antigens
US5569553A (en) 1995-03-08 1996-10-29 Wilson Greatbatch Ltd. Battery design for achieving end-of-life indication during electrical discharge
DE19622088A1 (de) 1996-05-31 1997-12-04 Boehringer Mannheim Gmbh Anti-HIV-Antikörper als Kontrollproben
ES2275305T3 (es) * 1997-04-09 2007-06-01 Bio-Rad Pasteur Peptidos sinteticos utilizables en los ensayos biologicos para la deteccion de infecciones debidas a los virus vih-1 del grupo o.
US6511801B1 (en) 1997-07-18 2003-01-28 Innogenetics, N.V. HIV-1 group O antigens and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
TR199902757T2 (xx) 2000-02-21
RU2184742C2 (ru) 2002-07-10
ATE343590T1 (de) 2006-11-15
DE69836265D1 (de) 2006-12-07
NO994929L (no) 1999-12-08
IL132166A (en) 2006-12-10
CZ300927B6 (cs) 2009-09-16
BR9809078B1 (pt) 2012-12-11
JP2001519800A (ja) 2001-10-23
CZ357599A3 (cs) 2000-06-14
CN1256695A (zh) 2000-06-14
ES2275305T3 (es) 2007-06-01
CA2286344C (fr) 2012-08-07
PL336115A1 (en) 2000-06-05
NZ500015A (en) 2001-06-29
JP3560987B2 (ja) 2004-09-02
NO994929D0 (no) 1999-10-08
BRPI9809078B8 (pt) 2021-05-25
AU7338698A (en) 1998-10-30
CN1215082C (zh) 2005-08-17
EP0973802B1 (fr) 2006-10-25
KR100451312B1 (ko) 2004-10-06
DE69836265T2 (de) 2007-05-31
KR20010006216A (ko) 2001-01-26
AU740231B2 (en) 2001-11-01
EP0973802A1 (fr) 2000-01-26
US7838001B2 (en) 2010-11-23
US20060234213A1 (en) 2006-10-19
US7053175B1 (en) 2006-05-30
IL132166A0 (en) 2001-03-19
PL194863B1 (pl) 2007-07-31
BR9809078A (pt) 2000-08-01
CA2286344A1 (fr) 1998-10-15
WO1998045323A1 (fr) 1998-10-15
PT973802E (pt) 2007-01-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US4833072A (en) Antigentic peptides and process for their preparation
Oldstone et al. Mapping the anatomy of the immunodominant domain of the human immunodeficiency virus gp41 transmembrane protein: peptide conformation analysis using monoclonal antibodies and proton nuclear magnetic resonance spectroscopy
US7838001B2 (en) Synthetic peptides useful in biological essays for detecting infections caused by group O HIV-1 viruses
EP0538283B1 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting hiv antibodies
JP2650217B2 (ja) Htlv―1感染の診断、治療及び予防接種のためのペプチド
EP0326490B1 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies
AU636145B2 (en) New human parvovirus peptides with disulfide bridge for immunization or diagnosis
CN109836478A (zh) 非洲猪瘟病毒p11.5蛋白特异性多克隆抗体的制备方法及应用
JP2002511853A (ja) Hiv抗体の検出方法及びそれに使用する抗原
US6214537B1 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies
AU617201B2 (en) Novel protein and coding sequence for detection and differentiation of siv and hiv-2 group of viruses
CA2676762C (en) Peptides for the detection of hiv-1 group o
US6218102B1 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies
US6210874B1 (en) Synthetic peptides and mixtures thereof for detecting HIV antibodies
MXPA99009106A (en) Synthetic peptides useful in biological assays for detecting infections caused by group o hiv-1 viruses

Legal Events

Date Code Title Description
MK1K Patent expired