CZ161699A3 - Polynukleotid kódující rezistenci nebo toleranci k herbicidům, rostlina obsahující tento polynukleotid a způsob selektivního hubení plevelů - Google Patents
Polynukleotid kódující rezistenci nebo toleranci k herbicidům, rostlina obsahující tento polynukleotid a způsob selektivního hubení plevelů Download PDFInfo
- Publication number
- CZ161699A3 CZ161699A3 CZ991616A CZ161699A CZ161699A3 CZ 161699 A3 CZ161699 A3 CZ 161699A3 CZ 991616 A CZ991616 A CZ 991616A CZ 161699 A CZ161699 A CZ 161699A CZ 161699 A3 CZ161699 A3 CZ 161699A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- polynucleotide
- herbicide
- crop
- plants
- encoding
- Prior art date
Links
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 title claims abstract description 181
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 title claims abstract description 69
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 title claims abstract description 69
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 title claims abstract description 68
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 title claims description 186
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 48
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims abstract description 155
- 230000002363 herbicidal effect Effects 0.000 claims abstract description 126
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims abstract description 72
- 108010070675 Glutathione transferase Proteins 0.000 claims abstract description 46
- 102000005720 Glutathione transferase Human genes 0.000 claims abstract description 46
- 108010082527 phosphinothricin N-acetyltransferase Proteins 0.000 claims abstract description 17
- 102000019197 Superoxide Dismutase Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 108010012715 Superoxide dismutase Proteins 0.000 claims abstract description 13
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 claims abstract description 7
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 claims abstract description 7
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 claims abstract description 7
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 claims abstract description 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 58
- 239000005562 Glyphosate Substances 0.000 claims description 43
- XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N glyphosate Chemical compound OC(=O)CNCP(O)(O)=O XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 43
- 229940097068 glyphosate Drugs 0.000 claims description 43
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 41
- 244000061176 Nicotiana tabacum Species 0.000 claims description 39
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 claims description 39
- 101710160338 2-Hydroxyacid oxidase 1 Proteins 0.000 claims description 34
- 102100038837 2-Hydroxyacid oxidase 1 Human genes 0.000 claims description 32
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 32
- IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N Phosphinothricin Natural products CP(O)(=O)CCC(N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 29
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 29
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 27
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 27
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 25
- 239000005561 Glufosinate Substances 0.000 claims description 23
- 240000008042 Zea mays Species 0.000 claims description 21
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 21
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 claims description 19
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 claims description 10
- -1 phenoxyprionate Chemical compound 0.000 claims description 10
- FZERHIULMFGESH-UHFFFAOYSA-N N-phenylacetamide Chemical compound CC(=O)NC1=CC=CC=C1 FZERHIULMFGESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 claims description 7
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 claims description 7
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 claims description 7
- 150000003931 anilides Chemical class 0.000 claims description 7
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 claims description 7
- USIUVYZYUHIAEV-UHFFFAOYSA-N diphenyl ether Chemical compound C=1C=CC=CC=1OC1=CC=CC=C1 USIUVYZYUHIAEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 claims description 6
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 claims description 6
- 235000021536 Sugar beet Nutrition 0.000 claims description 6
- IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N glufosinate-P Chemical compound CP(O)(=O)CC[C@H](N)C(O)=O IAJOBQBIJHVGMQ-BYPYZUCNSA-N 0.000 claims description 6
- 238000013519 translation Methods 0.000 claims description 6
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 claims description 5
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 5
- 235000021307 Triticum Nutrition 0.000 claims description 4
- 244000098338 Triticum aestivum Species 0.000 claims description 4
- 235000005824 Zea mays ssp. parviglumis Nutrition 0.000 claims description 4
- 229960001413 acetanilide Drugs 0.000 claims description 4
- 210000003763 chloroplast Anatomy 0.000 claims description 4
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 claims description 4
- 239000000835 fiber Substances 0.000 claims description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims description 4
- OYIKARCXOQLFHF-UHFFFAOYSA-N isoxaflutole Chemical compound CS(=O)(=O)C1=CC(C(F)(F)F)=CC=C1C(=O)C1=C(C2CC2)ON=C1 OYIKARCXOQLFHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 4
- UPMXNNIRAGDFEH-UHFFFAOYSA-N 3,5-dibromo-4-hydroxybenzonitrile Chemical compound OC1=C(Br)C=C(C#N)C=C1Br UPMXNNIRAGDFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- CTSLUCNDVMMDHG-UHFFFAOYSA-N 5-bromo-3-(butan-2-yl)-6-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione Chemical compound CCC(C)N1C(=O)NC(C)=C(Br)C1=O CTSLUCNDVMMDHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 235000006008 Brassica napus var napus Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000005489 Bromoxynil Substances 0.000 claims description 3
- AOQMRUTZEYVDIL-UHFFFAOYSA-N Flupoxam Chemical compound C=1C=C(Cl)C(COCC(F)(F)C(F)(F)F)=CC=1N1N=C(C(=O)N)N=C1C1=CC=CC=C1 AOQMRUTZEYVDIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229940100389 Sulfonylurea Drugs 0.000 claims description 3
- GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M Thiocarbamate Chemical compound NC([S-])=O GNVMUORYQLCPJZ-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 3
- MXWJVTOOROXGIU-UHFFFAOYSA-N atrazine Chemical compound CCNC1=NC(Cl)=NC(NC(C)C)=N1 MXWJVTOOROXGIU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 3
- YROXIXLRRCOBKF-UHFFFAOYSA-N sulfonylurea Chemical class OC(=N)N=S(=O)=O YROXIXLRRCOBKF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000003918 triazines Chemical class 0.000 claims description 3
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 claims description 3
- JXBKZAYVMSNKHA-UHFFFAOYSA-N 1h-tetrazol-1-ium-5-olate Chemical compound OC=1N=NNN=1 JXBKZAYVMSNKHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- YHKBGVDUSSWOAB-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-3-{2-chloro-5-[4-(difluoromethyl)-3-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-1-yl]-4-fluorophenyl}propanoic acid Chemical compound O=C1N(C(F)F)C(C)=NN1C1=CC(CC(Cl)C(O)=O)=C(Cl)C=C1F YHKBGVDUSSWOAB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- CAAMSDWKXXPUJR-UHFFFAOYSA-N 3,5-dihydro-4H-imidazol-4-one Chemical class O=C1CNC=N1 CAAMSDWKXXPUJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 claims description 2
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 claims description 2
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 claims description 2
- 241000207199 Citrus Species 0.000 claims description 2
- 240000000560 Citrus x paradisi Species 0.000 claims description 2
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 claims description 2
- 241000252867 Cupriavidus metallidurans Species 0.000 claims description 2
- 239000005504 Dicamba Substances 0.000 claims description 2
- 244000299507 Gossypium hirsutum Species 0.000 claims description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 claims description 2
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 claims description 2
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000011430 Malus pumila Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000015103 Malus silvestris Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000005583 Metribuzin Substances 0.000 claims description 2
- 240000005561 Musa balbisiana Species 0.000 claims description 2
- 235000018290 Musa x paradisiaca Nutrition 0.000 claims description 2
- 239000005586 Nicosulfuron Substances 0.000 claims description 2
- XGJQGEQHHDEVEW-UHFFFAOYSA-N P(=O)(=O)S(=O)(=O)O Chemical class P(=O)(=O)S(=O)(=O)O XGJQGEQHHDEVEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000005595 Picloram Substances 0.000 claims description 2
- 240000004713 Pisum sativum Species 0.000 claims description 2
- 235000010582 Pisum sativum Nutrition 0.000 claims description 2
- 241000219000 Populus Species 0.000 claims description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 claims description 2
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 claims description 2
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 claims description 2
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 claims description 2
- CSPPKDPQLUUTND-NBVRZTHBSA-N Sethoxydim Chemical compound CCO\N=C(/CCC)C1=C(O)CC(CC(C)SCC)CC1=O CSPPKDPQLUUTND-NBVRZTHBSA-N 0.000 claims description 2
- 244000061456 Solanum tuberosum Species 0.000 claims description 2
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 claims description 2
- 240000003829 Sorghum propinquum Species 0.000 claims description 2
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 claims description 2
- 150000008061 acetanilides Chemical class 0.000 claims description 2
- 150000001408 amides Chemical class 0.000 claims description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 claims description 2
- OTSAMNSACVKIOJ-UHFFFAOYSA-N azane;carbamoyl(ethoxy)phosphinic acid Chemical compound [NH4+].CCOP([O-])(=O)C(N)=O OTSAMNSACVKIOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 claims description 2
- GINJFDRNADDBIN-FXQIFTODSA-N bilanafos Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCP(C)(O)=O GINJFDRNADDBIN-FXQIFTODSA-N 0.000 claims description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 claims description 2
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 claims description 2
- RIUXZHMCCFLRBI-UHFFFAOYSA-N chlorimuron Chemical compound COC1=CC(Cl)=NC(NC(=O)NS(=O)(=O)C=2C(=CC=CC=2)C(O)=O)=N1 RIUXZHMCCFLRBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- VJYIFXVZLXQVHO-UHFFFAOYSA-N chlorsulfuron Chemical compound COC1=NC(C)=NC(NC(=O)NS(=O)(=O)C=2C(=CC=CC=2)Cl)=N1 VJYIFXVZLXQVHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- IWEDIXLBFLAXBO-UHFFFAOYSA-N dicamba Chemical compound COC1=C(Cl)C=CC(Cl)=C1C(O)=O IWEDIXLBFLAXBO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 238000001035 drying Methods 0.000 claims description 2
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 claims description 2
- BGZZWXTVIYUUEY-UHFFFAOYSA-N fomesafen Chemical compound C1=C([N+]([O-])=O)C(C(=O)NS(=O)(=O)C)=CC(OC=2C(=CC(=CC=2)C(F)(F)F)Cl)=C1 BGZZWXTVIYUUEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 claims description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 2
- 239000002917 insecticide Substances 0.000 claims description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 2
- FOXFZRUHNHCZPX-UHFFFAOYSA-N metribuzin Chemical compound CSC1=NN=C(C(C)(C)C)C(=O)N1N FOXFZRUHNHCZPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- LZGUHMNOBNWABZ-UHFFFAOYSA-N n-nitro-n-phenylnitramide Chemical compound [O-][N+](=O)N([N+]([O-])=O)C1=CC=CC=C1 LZGUHMNOBNWABZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000005645 nematicide Substances 0.000 claims description 2
- RTCOGUMHFFWOJV-UHFFFAOYSA-N nicosulfuron Chemical compound COC1=CC(OC)=NC(NC(=O)NS(=O)(=O)C=2C(=CC=CN=2)C(=O)N(C)C)=N1 RTCOGUMHFFWOJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- NVGOPFQZYCNLDU-UHFFFAOYSA-N norflurazon Chemical compound O=C1C(Cl)=C(NC)C=NN1C1=CC=CC(C(F)(F)F)=C1 NVGOPFQZYCNLDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 210000003463 organelle Anatomy 0.000 claims description 2
- WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N oxadiazole Chemical compound C1=CON=N1 WCPAKWJPBJAGKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- NQQVFXUMIDALNH-UHFFFAOYSA-N picloram Chemical compound NC1=C(Cl)C(Cl)=NC(C(O)=O)=C1Cl NQQVFXUMIDALNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 210000002706 plastid Anatomy 0.000 claims description 2
- 229920000768 polyamine Polymers 0.000 claims description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 2
- PQTBTIFWAXVEPB-UHFFFAOYSA-N sulcotrione Chemical compound ClC1=CC(S(=O)(=O)C)=CC=C1C(=O)C1C(=O)CCCC1=O PQTBTIFWAXVEPB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 102100033279 Prostaglandin-H2 D-isomerase Human genes 0.000 claims 7
- JYEUMXHLPRZUAT-UHFFFAOYSA-N 1,2,3-triazine Chemical compound C1=CN=NN=C1 JYEUMXHLPRZUAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 5
- FIKAKWIAUPDISJ-UHFFFAOYSA-L paraquat dichloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].C1=C[N+](C)=CC=C1C1=CC=[N+](C)C=C1 FIKAKWIAUPDISJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims 3
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 claims 2
- 239000004365 Protease Substances 0.000 claims 2
- 102100037486 Reverse transcriptase/ribonuclease H Human genes 0.000 claims 2
- 101100339555 Zymoseptoria tritici HPPD gene Proteins 0.000 claims 2
- MPPOHAUSNPTFAJ-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[(6-chloro-1,3-benzoxazol-2-yl)oxy]phenoxy]propanoic acid Chemical compound C1=CC(OC(C)C(O)=O)=CC=C1OC1=NC2=CC=C(Cl)C=C2O1 MPPOHAUSNPTFAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- ABOOPXYCKNFDNJ-UHFFFAOYSA-N 2-{4-[(6-chloroquinoxalin-2-yl)oxy]phenoxy}propanoic acid Chemical compound C1=CC(OC(C)C(O)=O)=CC=C1OC1=CN=C(C=C(Cl)C=C2)C2=N1 ABOOPXYCKNFDNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- KKADPXVIOXHVKN-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxyphenylpyruvic acid Chemical compound OC(=O)C(=O)CC1=CC=C(O)C=C1 KKADPXVIOXHVKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- HHZMCYNIZCNDEN-UHFFFAOYSA-N 5-oxo-2h-tetrazole-1-carboxamide Chemical class NC(=O)N1N=NNC1=O HHZMCYNIZCNDEN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 101710186015 Acetyltransferase Pat Proteins 0.000 claims 1
- 235000014698 Brassica juncea var multisecta Nutrition 0.000 claims 1
- 240000000385 Brassica napus var. napus Species 0.000 claims 1
- 235000006618 Brassica rapa subsp oleifera Nutrition 0.000 claims 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 claims 1
- 108010000755 Bromoxynil nitrilase Proteins 0.000 claims 1
- 244000025254 Cannabis sativa Species 0.000 claims 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 claims 1
- 108010078791 Carrier Proteins Proteins 0.000 claims 1
- 108010015742 Cytochrome P-450 Enzyme System Proteins 0.000 claims 1
- 102000003849 Cytochrome P450 Human genes 0.000 claims 1
- 108700016256 Dihydropteroate synthases Proteins 0.000 claims 1
- 239000005630 Diquat Substances 0.000 claims 1
- 244000020551 Helianthus annuus Species 0.000 claims 1
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 claims 1
- 240000007049 Juglans regia Species 0.000 claims 1
- 235000009496 Juglans regia Nutrition 0.000 claims 1
- 240000008415 Lactuca sativa Species 0.000 claims 1
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 claims 1
- 235000004431 Linum usitatissimum Nutrition 0.000 claims 1
- 240000006240 Linum usitatissimum Species 0.000 claims 1
- 244000081841 Malus domestica Species 0.000 claims 1
- 240000004658 Medicago sativa Species 0.000 claims 1
- 235000017587 Medicago sativa ssp. sativa Nutrition 0.000 claims 1
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 claims 1
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 claims 1
- 235000008331 Pinus X rigitaeda Nutrition 0.000 claims 1
- 241000018646 Pinus brutia Species 0.000 claims 1
- 235000011613 Pinus brutia Nutrition 0.000 claims 1
- 244000082988 Secale cereale Species 0.000 claims 1
- 239000005618 Sulcotrione Substances 0.000 claims 1
- 235000002096 Vicia faba var. equina Nutrition 0.000 claims 1
- 241001520823 Zoysia Species 0.000 claims 1
- 108040004627 acetyl-CoA synthetase acetyltransferase activity proteins Proteins 0.000 claims 1
- 239000003443 antiviral agent Substances 0.000 claims 1
- 235000020971 citrus fruits Nutrition 0.000 claims 1
- 101150095418 crop gene Proteins 0.000 claims 1
- OILAIQUEIWYQPH-UHFFFAOYSA-N cyclohexane-1,2-dione Chemical class O=C1CCCCC1=O OILAIQUEIWYQPH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- SYJFEGQWDCRVNX-UHFFFAOYSA-N diquat Chemical compound C1=CC=[N+]2CC[N+]3=CC=CC=C3C2=C1 SYJFEGQWDCRVNX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 235000005489 dwarf bean Nutrition 0.000 claims 1
- 244000013123 dwarf bean Species 0.000 claims 1
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 claims 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims 1
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 claims 1
- 101150090317 tfdA gene Proteins 0.000 claims 1
- 150000003558 thiocarbamic acid derivatives Chemical class 0.000 claims 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims 1
- 235000020234 walnut Nutrition 0.000 claims 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical group 0.000 description 57
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 56
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 56
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 55
- 241000282322 Panthera Species 0.000 description 47
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 37
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 34
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 32
- 101001034477 Zea mays Glutathione S-transferase 4 Proteins 0.000 description 26
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 25
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 24
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 22
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 18
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 18
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 17
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 16
- XCSGPAVHZFQHGE-UHFFFAOYSA-N alachlor Chemical compound CCC1=CC=CC(CC)=C1N(COC)C(=O)CCl XCSGPAVHZFQHGE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 16
- VTNQPKFIQCLBDU-UHFFFAOYSA-N Acetochlor Chemical compound CCOCN(C(=O)CCl)C1=C(C)C=CC=C1CC VTNQPKFIQCLBDU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 235000016383 Zea mays subsp huehuetenangensis Nutrition 0.000 description 15
- 229930027917 kanamycin Natural products 0.000 description 15
- 229960000318 kanamycin Drugs 0.000 description 15
- SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N kanamycin Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N SBUJHOSQTJFQJX-NOAMYHISSA-N 0.000 description 15
- 229930182823 kanamycin A Natural products 0.000 description 15
- 235000009973 maize Nutrition 0.000 description 15
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 13
- WVQBLGZPHOPPFO-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-N-(2-ethyl-6-methylphenyl)-N-(1-methoxypropan-2-yl)acetamide Chemical compound CCC1=CC=CC(C)=C1N(C(C)COC)C(=O)CCl WVQBLGZPHOPPFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 12
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 11
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 11
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 10
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 10
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 10
- 239000011536 extraction buffer Substances 0.000 description 10
- 239000000047 product Substances 0.000 description 10
- 108010028143 Dioxygenases Proteins 0.000 description 9
- 102000016680 Dioxygenases Human genes 0.000 description 9
- 101100298295 Drosophila melanogaster flfl gene Proteins 0.000 description 9
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 9
- 229940071106 ethylenediaminetetraacetate Drugs 0.000 description 9
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 9
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 9
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 9
- 239000006870 ms-medium Substances 0.000 description 9
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 9
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 9
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 8
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 8
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 8
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 8
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 8
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 102000000452 Acetyl-CoA carboxylase Human genes 0.000 description 7
- 108010016219 Acetyl-CoA carboxylase Proteins 0.000 description 7
- RMWAOBGCZZSJHE-UMNHJUIQSA-N Glu-Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RMWAOBGCZZSJHE-UMNHJUIQSA-N 0.000 description 7
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 7
- 241001233957 eudicotyledons Species 0.000 description 7
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 7
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 7
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101150066516 GST gene Proteins 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 6
- 239000002361 compost Substances 0.000 description 6
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 6
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 6
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 6
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 5
- 241000589155 Agrobacterium tumefaciens Species 0.000 description 5
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 5
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 5
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 5
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 5
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N acetyl-CoA Chemical compound O[C@@H]1[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)[C@@H](O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)C)O[C@H]1N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1 ZSLZBFCDCINBPY-ZSJPKINUSA-N 0.000 description 5
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 5
- 239000001058 brown pigment Substances 0.000 description 5
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 5
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 5
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 5
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 5
- 101150113864 pat gene Proteins 0.000 description 5
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 5
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- 238000009010 Bradford assay Methods 0.000 description 4
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 206010020649 Hyperkeratosis Diseases 0.000 description 4
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 4
- 241000192581 Synechocystis sp. Species 0.000 description 4
- 241000723873 Tobacco mosaic virus Species 0.000 description 4
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 4
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 4
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 4
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 4
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 4
- IANUJLZYFUDJIH-UHFFFAOYSA-N flufenacet Chemical compound C=1C=C(F)C=CC=1N(C(C)C)C(=O)COC1=NN=C(C(F)(F)F)S1 IANUJLZYFUDJIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OQZCSNDVOWYALR-UHFFFAOYSA-N flurochloridone Chemical compound FC(F)(F)C1=CC=CC(N2C(C(Cl)C(CCl)C2)=O)=C1 OQZCSNDVOWYALR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- ZEKANFGSDXODPD-UHFFFAOYSA-N glyphosate-isopropylammonium Chemical compound CC(C)N.OC(=O)CNCP(O)(O)=O ZEKANFGSDXODPD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 4
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 4
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 4
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 4
- 229920000136 polysorbate Polymers 0.000 description 4
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 4
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 4
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N Asp-His Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N Asp-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 3
- GUVLYNGULCJVDO-UHFFFAOYSA-N EPTC Chemical compound CCCN(CCC)C(=O)SCC GUVLYNGULCJVDO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 3
- 108010068086 Polyubiquitin Proteins 0.000 description 3
- 102100037935 Polyubiquitin-C Human genes 0.000 description 3
- RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N Ser-Arg Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 3
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 3
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 3
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 3
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 3
- 230000034994 death Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 3
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 3
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 3
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 3
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 3
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 3
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 3
- ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 2-amino-4-[hydroxy(methyl)phosphoryl]butanoic acid;azane Chemical compound [NH4+].CP(O)(=O)CCC(N)C([O-])=O ZBMRKNMTMPPMMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VONWPEXRCLHKRJ-UHFFFAOYSA-N 2-chloro-n-phenylacetamide Chemical compound ClCC(=O)NC1=CC=CC=C1 VONWPEXRCLHKRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100122189 Arabidopsis thaliana GLO5 gene Proteins 0.000 description 2
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N JGDGLDNAQJJGJI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N Asp-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 101150111720 EPSPS gene Proteins 0.000 description 2
- 239000005531 Flufenacet Substances 0.000 description 2
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- 101150012639 HPPD gene Proteins 0.000 description 2
- JHVCZQFWRLHUQR-DCAQKATOSA-N His-Arg-Cys Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N JHVCZQFWRLHUQR-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- BZKDJRSZWLPJNI-SRVKXCTJSA-N His-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BZKDJRSZWLPJNI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N His-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 2
- GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N Leupeptin Natural products CC(C)CC(NC(C)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N Met-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- NWBJYWHLCVSVIJ-UHFFFAOYSA-N N-benzyladenine Chemical compound N=1C=NC=2NC=NC=2C=1NCC1=CC=CC=C1 NWBJYWHLCVSVIJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000208133 Nicotiana plumbaginifolia Species 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 231100000674 Phytotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- 108020001991 Protoporphyrinogen Oxidase Proteins 0.000 description 2
- 102000005135 Protoporphyrinogen oxidase Human genes 0.000 description 2
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 2
- 241000589540 Pseudomonas fluorescens Species 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N Ser-Thr-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O VLMIUSLQONKLDV-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 2
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 2
- NQVDGKYAUHTCME-QTKMDUPCSA-N Thr-His-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O NQVDGKYAUHTCME-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 2
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 2
- YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N Thr-Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O YRJOLUDFVAUXLI-GSSVUCPTSA-N 0.000 description 2
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N Val-Thr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 2
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 229960003669 carbenicillin Drugs 0.000 description 2
- FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N carbenicillin Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)C(C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FPPNZSSZRUTDAP-UWFZAAFLSA-N 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 2
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 101150005884 ctp1 gene Proteins 0.000 description 2
- JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N cyclohexanone Chemical compound O=C1CCCCC1 JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 2
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 2
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 2
- 101150054900 gus gene Proteins 0.000 description 2
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N isoxazole Chemical compound C=1C=NOC=1 CTAPFRYPJLPFDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N leupeptin Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(C)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C=O)CCCN=C(N)N GDBQQVLCIARPGH-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- 108010052968 leupeptin Proteins 0.000 description 2
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 2
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 2
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 2
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 2
- 230000001338 necrotic effect Effects 0.000 description 2
- GQYBCIHRWMPOOF-UHFFFAOYSA-N p-hydroxyphenylpyruvic acid Natural products OC(=O)C(O)=CC1=CC=C(O)C=C1 GQYBCIHRWMPOOF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 2
- 239000000419 plant extract Substances 0.000 description 2
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 235000013809 polyvinylpolypyrrolidone Nutrition 0.000 description 2
- 229920000523 polyvinylpolypyrrolidone Polymers 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 210000001938 protoplast Anatomy 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 239000012266 salt solution Substances 0.000 description 2
- 239000004576 sand Substances 0.000 description 2
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 2
- 238000005204 segregation Methods 0.000 description 2
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 2
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 2
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N tris acetate Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 2
- HTSGKJQDMSTCGS-UHFFFAOYSA-N 1,4-bis(4-chlorophenyl)-2-(4-methylphenyl)sulfonylbutane-1,4-dione Chemical compound C1=CC(C)=CC=C1S(=O)(=O)C(C(=O)C=1C=CC(Cl)=CC=1)CC(=O)C1=CC=C(Cl)C=C1 HTSGKJQDMSTCGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WNWOTMKHOLCHRJ-UHFFFAOYSA-N 1,4-dihydrotriazol-5-one Chemical compound O=C1CN=NN1 WNWOTMKHOLCHRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QMNWYGTWTXOQTP-UHFFFAOYSA-N 1h-triazin-6-one Chemical compound O=C1C=CN=NN1 QMNWYGTWTXOQTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KJSVAEGLTPBKAA-UHFFFAOYSA-N 2,2-dichloro-n-phenylacetamide Chemical compound ClC(Cl)C(=O)NC1=CC=CC=C1 KJSVAEGLTPBKAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005631 2,4-Dichlorophenoxyacetic acid Substances 0.000 description 1
- NUPJIGQFXCQJBK-UHFFFAOYSA-N 2-(4-isopropyl-4-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl)-5-(methoxymethyl)nicotinic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC(COC)=CN=C1C1=NC(C)(C(C)C)C(=O)N1 NUPJIGQFXCQJBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CABMTIJINOIHOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-methyl-5-oxo-4-(propan-2-yl)-4,5-dihydro-1H-imidazol-2-yl]quinoline-3-carboxylic acid Chemical compound N1C(=O)C(C(C)C)(C)N=C1C1=NC2=CC=CC=C2C=C1C(O)=O CABMTIJINOIHOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AWXGSYPUMWKTBR-UHFFFAOYSA-N 4-carbazol-9-yl-n,n-bis(4-carbazol-9-ylphenyl)aniline Chemical compound C12=CC=CC=C2C2=CC=CC=C2N1C1=CC=C(N(C=2C=CC(=CC=2)N2C3=CC=CC=C3C3=CC=CC=C32)C=2C=CC(=CC=2)N2C3=CC=CC=C3C3=CC=CC=C32)C=C1 AWXGSYPUMWKTBR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HWOWEGAQDKKHDR-UHFFFAOYSA-N 4-hydroxy-6-(pyridin-3-yl)-2H-pyran-2-one Chemical compound O1C(=O)C=C(O)C=C1C1=CC=CN=C1 HWOWEGAQDKKHDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010068327 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Proteins 0.000 description 1
- 102100028626 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase Human genes 0.000 description 1
- NYRMIJKDBAQCHC-UHFFFAOYSA-N 5-(methylamino)-2-phenyl-4-[3-(trifluoromethyl)phenyl]furan-3(2H)-one Chemical compound O1C(NC)=C(C=2C=C(C=CC=2)C(F)(F)F)C(=O)C1C1=CC=CC=C1 NYRMIJKDBAQCHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 5-methoxy-2-{[(4-methoxy-3,5-dimethylpyridin-2-yl)methyl]sulfinyl}-1H-benzimidazole Chemical compound N=1C2=CC(OC)=CC=C2NC=1S(=O)CC1=NC=C(C)C(OC)=C1C SUBDBMMJDZJVOS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010000700 Acetolactate synthase Proteins 0.000 description 1
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DKJPOZOEBONHFS-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O DKJPOZOEBONHFS-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-N Ala-Asp Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- LMFXXZPPZDCPTA-ZKWXMUAHSA-N Ala-Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N LMFXXZPPZDCPTA-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N Ala-Lys Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DCVYRWFAMZFSDA-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 1
- 101001015570 Arabidopsis thaliana Glycolate oxidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101100135609 Arabidopsis thaliana PAP10 gene Proteins 0.000 description 1
- WVRUNFYJIHNFKD-WDSKDSINSA-N Arg-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N WVRUNFYJIHNFKD-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N Arg-Asp Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- VXXHDZKEQNGXNU-QXEWZRGKSA-N Arg-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VXXHDZKEQNGXNU-QXEWZRGKSA-N 0.000 description 1
- ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- JOADBFCFJGNIKF-GUBZILKMSA-N Arg-Met-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JOADBFCFJGNIKF-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OMKZPCPZEFMBIT-SRVKXCTJSA-N Arg-Met-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O OMKZPCPZEFMBIT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N Arg-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N Asn-His Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N Asn-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O AYOAHKWVQLNPDM-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N Asn-Tyr Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 FYRVDDJMNISIKJ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- ZCKYZTGLXIEOKS-CIUDSAMLSA-N Asp-Asp-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N ZCKYZTGLXIEOKS-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- FKBFDTRILNZGAI-IMJSIDKUSA-N Asp-Cys Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O FKBFDTRILNZGAI-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 235000021537 Beetroot Nutrition 0.000 description 1
- 101000740587 Botryotinia fuckeliana Presilphiperfolan-8-beta-ol synthase Proteins 0.000 description 1
- 102100025903 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 Human genes 0.000 description 1
- 101100378101 Caenorhabditis briggsae ace-4 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000701489 Cauliflower mosaic virus Species 0.000 description 1
- LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M Cetrimonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 241000736839 Chara Species 0.000 description 1
- 239000005496 Chlorsulfuron Substances 0.000 description 1
- 241000270281 Coluber constrictor Species 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N Cys-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N XLLSMEFANRROJE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YWEHYKGJWHPGPY-XGEHTFHBSA-N Cys-Thr-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O YWEHYKGJWHPGPY-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- JLZCAZJGWNRXCI-XKBZYTNZSA-N Cys-Thr-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JLZCAZJGWNRXCI-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 239000005507 Diflufenican Substances 0.000 description 1
- 101100536354 Drosophila melanogaster tant gene Proteins 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-JNEQICEOSA-N Ecdysone Natural products O=C1[C@H]2[C@@](C)([C@@H]3C([C@@]4(O)[C@@](C)([C@H]([C@H]([C@@H](O)CCC(O)(C)C)C)CC4)CC3)=C1)C[C@H](O)[C@H](O)C2 UPEZCKBFRMILAV-JNEQICEOSA-N 0.000 description 1
- 102100027723 Endogenous retrovirus group K member 6 Rec protein Human genes 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N Ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- 241000206602 Eukaryota Species 0.000 description 1
- RXCPQSJAVKGONC-UHFFFAOYSA-N Flumetsulam Chemical compound N1=C2N=C(C)C=CN2N=C1S(=O)(=O)NC1=C(F)C=CC=C1F RXCPQSJAVKGONC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HHMCAJWVGYGUEF-UHFFFAOYSA-N Fluorodifen Chemical compound C1=CC([N+](=O)[O-])=CC=C1OC1=CC=C(C(F)(F)F)C=C1[N+]([O-])=O HHMCAJWVGYGUEF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005559 Flurtamone Substances 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NUSWUSKZRCGFEX-FXQIFTODSA-N Glu-Glu-Cys Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O NUSWUSKZRCGFEX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N Glu-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LRPXYSGPOBVBEH-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- WVTIBGWZUMJBFY-GUBZILKMSA-N Glu-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WVTIBGWZUMJBFY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- ZCOJVESMNGBGLF-GRLWGSQLSA-N Glu-Ile-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O ZCOJVESMNGBGLF-GRLWGSQLSA-N 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N Glu-Phe Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 1
- 108090000079 Glucocorticoid Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100033417 Glucocorticoid receptor Human genes 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N Gly-Leu-Thr Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LHYJCVCQPWRMKZ-WEDXCCLWSA-N 0.000 description 1
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N Gly-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)CN)CC1=CC=CC=C1 IGOYNRWLWHWAQO-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- ONSARSFSJHTMFJ-STQMWFEESA-N Gly-Trp-Ser Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ONSARSFSJHTMFJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N Gly-Tyr Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N Glycyl-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- LXKOADMMGWXPJQ-UHFFFAOYSA-N Halosulfuron Chemical compound COC1=CC(OC)=NC(NC(=O)NS(=O)(=O)C=2N(N=C(Cl)C=2C(O)=O)C)=N1 LXKOADMMGWXPJQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N His-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SKYULSWNBYAQMG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SYPULFZAGBBIOM-GVXVVHGQSA-N His-Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N SYPULFZAGBBIOM-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- 101001031589 Homo sapiens 2-Hydroxyacid oxidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 101001076874 Homo sapiens C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 Proteins 0.000 description 1
- 101000581802 Homo sapiens Lithostathine-1-alpha Proteins 0.000 description 1
- 101001128156 Homo sapiens Nanos homolog 3 Proteins 0.000 description 1
- 101001124309 Homo sapiens Nitric oxide synthase, endothelial Proteins 0.000 description 1
- 101000837344 Homo sapiens T-cell leukemia translocation-altered gene protein Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 206010021033 Hypomenorrhoea Diseases 0.000 description 1
- 239000005566 Imazamox Substances 0.000 description 1
- 239000005981 Imazaquin Substances 0.000 description 1
- 239000005570 Isoxaben Substances 0.000 description 1
- HKBNQXMLSMKLJV-BQBZGAKWSA-N L-gamma-glutamyl-L-cysteinyl-beta-alanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCCC(O)=O HKBNQXMLSMKLJV-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 101710138460 Leaf protein Proteins 0.000 description 1
- BAJIJEGGUYXZGC-CIUDSAMLSA-N Leu-Asn-Cys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N BAJIJEGGUYXZGC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O DLFAACQHIRSQGG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GBDMISNMNXVTNV-XIRDDKMYSA-N Leu-Asp-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O GBDMISNMNXVTNV-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N Leu-Glu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN HQUXQAMSWFIRET-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- LAPSXOAUPNOINL-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O LAPSXOAUPNOINL-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- PPQRKXHCLYCBSP-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Met Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N PPQRKXHCLYCBSP-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 102100027361 Lithostathine-1-alpha Human genes 0.000 description 1
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- YTJFXEDRUOQGSP-DCAQKATOSA-N Lys-Pro-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YTJFXEDRUOQGSP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241000220225 Malus Species 0.000 description 1
- KQBJYJXPZBNEIK-DCAQKATOSA-N Met-Glu-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N KQBJYJXPZBNEIK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 239000005582 Metosulam Substances 0.000 description 1
- VGHPMIFEKOFHHQ-UHFFFAOYSA-N Metosulam Chemical compound N1=C2N=C(OC)C=C(OC)N2N=C1S(=O)(=O)NC1=C(Cl)C=CC(C)=C1Cl VGHPMIFEKOFHHQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001410 Microfiber Polymers 0.000 description 1
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N N-alpha-L-glutamyl-L-phenylalanine Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 102100031893 Nanos homolog 3 Human genes 0.000 description 1
- 101100205189 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-5 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000208125 Nicotiana Species 0.000 description 1
- 244000061322 Nicotiana alata Species 0.000 description 1
- 108010033272 Nitrilase Proteins 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 241000588696 Pantoea ananatis Species 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 1
- 240000007377 Petunia x hybrida Species 0.000 description 1
- 244000046052 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 1
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 1
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 1
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N Pro-Met-Gly Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 WIPAMEKBSHNFQE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- WWXNZNWZNZPDIF-SRVKXCTJSA-N Pro-Val-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 WWXNZNWZNZPDIF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 108010079005 RDV peptide Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 108010003581 Ribulose-bisphosphate carboxylase Proteins 0.000 description 1
- 239000005616 Rimsulfuron Substances 0.000 description 1
- 101001059240 Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) Site-specific recombinase Flp Proteins 0.000 description 1
- 241001274197 Scatophagus argus Species 0.000 description 1
- 241000209056 Secale Species 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ala-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YQHZVYJAGWMHES-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N Ser-Gly-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O AEGUWTFAQQWVLC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- ZOPISOXXPQNOCO-SVSWQMSJSA-N Ser-Ile-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N ZOPISOXXPQNOCO-SVSWQMSJSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO SBMNPABNWKXNBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N Ser-Phe-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O FBLNYDYPCLFTSP-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PPCZVWHJWJFTFN-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N Ser-Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XQJCEKXQUJQNNK-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N Ser-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O OLKICIBQRVSQMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M Sodium bisulfite Chemical compound [Na+].OS([O-])=O DWAQJAXMDSEUJJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfisoxazole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100028692 T-cell leukemia translocation-altered gene protein Human genes 0.000 description 1
- WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N Thr-Arg-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O)CCCN=C(N)N WFUAUEQXPVNAEF-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- VIBXMCZWVUOZLA-OLHMAJIHSA-N Thr-Asn-Asn Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N)O VIBXMCZWVUOZLA-OLHMAJIHSA-N 0.000 description 1
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 1
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 1
- MSIYNSBKKVMGFO-BHNWBGBOSA-N Thr-Gly-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)NCC(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N)O MSIYNSBKKVMGFO-BHNWBGBOSA-N 0.000 description 1
- WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N Thr-His Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N 0.000 description 1
- HPQHHRLWSAMMKG-KATARQTJSA-N Thr-Lys-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O HPQHHRLWSAMMKG-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- WNQJTLATMXYSEL-OEAJRASXSA-N Thr-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O WNQJTLATMXYSEL-OEAJRASXSA-N 0.000 description 1
- OGOYMQWIWHGTGH-KZVJFYERSA-N Thr-Val-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OGOYMQWIWHGTGH-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- 241000656145 Thyrsites atun Species 0.000 description 1
- 240000007313 Tilia cordata Species 0.000 description 1
- 241000963752 Tobacco mottle virus Species 0.000 description 1
- LOOCQRRBKZTPKO-AVGNSLFASA-N Tyr-Glu-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 LOOCQRRBKZTPKO-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N Tyr-Gly-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O CTDPLKMBVALCGN-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- PGEFRHBWGOJPJT-KKUMJFAQSA-N Tyr-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PGEFRHBWGOJPJT-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N Tyr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 108090000848 Ubiquitin Proteins 0.000 description 1
- 102000044159 Ubiquitin Human genes 0.000 description 1
- 108091023045 Untranslated Region Proteins 0.000 description 1
- LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N Uric Acid Chemical compound N1C(=O)NC(=O)C2=C1NC(=O)N2 LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QGFPYRPIUXBYGR-YDHLFZDLSA-N Val-Asn-Phe Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)N QGFPYRPIUXBYGR-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- OBTCMSPFOITUIJ-FSPLSTOPSA-N Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O OBTCMSPFOITUIJ-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 1
- BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N Val-His Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- KNYHAWKHFQRYOX-PYJNHQTQSA-N Val-Ile-His Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N KNYHAWKHFQRYOX-PYJNHQTQSA-N 0.000 description 1
- FEXILLGKGGTLRI-NHCYSSNCSA-N Val-Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N FEXILLGKGGTLRI-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N Valyl-Serine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940100228 acetyl coenzyme a Drugs 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 108020002494 acetyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000005421 acetyltransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 239000008186 active pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000003905 agrochemical Substances 0.000 description 1
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 101150111557 ale gene Proteins 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-UHFFFAOYSA-N alpha-Ecdysone Natural products C1C(O)C(O)CC2(C)C(CCC3(C(C(C(O)CCC(C)(C)O)C)CCC33O)C)C3=CC(=O)C21 UPEZCKBFRMILAV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N alpha-L-glutamyl-L-glutamic acid Natural products OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 description 1
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 description 1
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000000376 autoradiography Methods 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- PPWBRCCBKOWDNB-UHFFFAOYSA-N bensulfuron Chemical compound COC1=CC(OC)=NC(NC(=O)NS(=O)(=O)CC=2C(=CC=CC=2)C(O)=O)=N1 PPWBRCCBKOWDNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IFVTZJHWGZSXFD-UHFFFAOYSA-N biphenylene Chemical group C1=CC=C2C3=CC=CC=C3C2=C1 IFVTZJHWGZSXFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004061 bleaching Methods 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 238000009835 boiling Methods 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 235000021466 carotenoid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001747 carotenoids Chemical class 0.000 description 1
- 230000034303 cell budding Effects 0.000 description 1
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 108010031100 chloroplast transit peptides Proteins 0.000 description 1
- 239000004927 clay Substances 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 238000003967 crop rotation Methods 0.000 description 1
- 239000000287 crude extract Substances 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- SSJJWVREPZVNBF-DGXVIIAXSA-N dG10 Chemical compound C1=NC(C(NC(N)=N2)=O)=C2N1[C@H](O[C@@H]1COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)COP(O)(=O)O[C@@H]2[C@H](O[C@H](C2)N2C3=C(C(NC(N)=N3)=O)N=C2)CO)C[C@@H]1OP(O)(=O)OC[C@@H](O1)[C@@H](O)C[C@@H]1N1C(N=C(NC2=O)N)=C2N=C1 SSJJWVREPZVNBF-DGXVIIAXSA-N 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 239000008367 deionised water Substances 0.000 description 1
- 229910021641 deionized water Inorganic materials 0.000 description 1
- 101150106284 deoR gene Proteins 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 1
- UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N dexamethasone Chemical compound C1CC2=CC(=O)C=C[C@]2(C)[C@]2(F)[C@@H]1[C@@H]1C[C@@H](C)[C@@](C(=O)CO)(O)[C@@]1(C)C[C@@H]2O UREBDLICKHMUKA-CXSFZGCWSA-N 0.000 description 1
- 229960003957 dexamethasone Drugs 0.000 description 1
- WYEHFWKAOXOVJD-UHFFFAOYSA-N diflufenican Chemical compound FC1=CC(F)=CC=C1NC(=O)C1=CC=CN=C1OC1=CC=CC(C(F)(F)F)=C1 WYEHFWKAOXOVJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 1
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 description 1
- UPEZCKBFRMILAV-JMZLNJERSA-N ecdysone Chemical compound C1[C@@H](O)[C@@H](O)C[C@]2(C)[C@@H](CC[C@@]3([C@@H]([C@@H]([C@H](O)CCC(C)(C)O)C)CC[C@]33O)C)C3=CC(=O)[C@@H]21 UPEZCKBFRMILAV-JMZLNJERSA-N 0.000 description 1
- 238000005868 electrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 1
- NLFBCYMMUAKCPC-KQQUZDAGSA-N ethyl (e)-3-[3-amino-2-cyano-1-[(e)-3-ethoxy-3-oxoprop-1-enyl]sulfanyl-3-oxoprop-1-enyl]sulfanylprop-2-enoate Chemical compound CCOC(=O)\C=C\SC(=C(C#N)C(N)=O)S\C=C\C(=O)OCC NLFBCYMMUAKCPC-KQQUZDAGSA-N 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005437 etoperidone Drugs 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000005562 fading Methods 0.000 description 1
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 1
- 244000053095 fungal pathogen Species 0.000 description 1
- HKBNQXMLSMKLJV-UHFFFAOYSA-N gamma-L-glutamyl-L-cysteinyl-beta-alanine Natural products OC(=O)C(N)CCC(=O)NC(CS)C(=O)NCCC(O)=O HKBNQXMLSMKLJV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 229960003180 glutathione Drugs 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N glycyl-L-tyrosine hemihydrate Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XBGGUPMXALFZOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010077435 glycyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 1
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 1
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 1
- 108700020537 homoglutathione Proteins 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000000749 insecticidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- PMHURSZHKKJGBM-UHFFFAOYSA-N isoxaben Chemical compound O1N=C(C(C)(CC)CC)C=C1NC(=O)C1=C(OC)C=CC=C1OC PMHURSZHKKJGBM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 230000003902 lesion Effects 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010087711 leukotriene-C4 synthase Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000001320 lysogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 1
- UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L magnesium acetate Chemical compound [Mg+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O UEGPKNKPLBYCNK-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000011654 magnesium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000011285 magnesium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 229940069446 magnesium acetate Drugs 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003658 microfiber Substances 0.000 description 1
- 210000003470 mitochondria Anatomy 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 1
- OUBCNLGXQFSTLU-UHFFFAOYSA-N nitisinone Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC(C(F)(F)F)=CC=C1C(=O)C1C(=O)CCCC1=O OUBCNLGXQFSTLU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 1
- 230000001590 oxidative effect Effects 0.000 description 1
- 235000015927 pasta Nutrition 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 150000002989 phenols Chemical class 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 108010001545 phytoene dehydrogenase Proteins 0.000 description 1
- 230000000885 phytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008654 plant damage Effects 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 239000002985 plastic film Substances 0.000 description 1
- 229920006255 plastic film Polymers 0.000 description 1
- 230000010152 pollination Effects 0.000 description 1
- 229920001983 poloxamer Polymers 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 1
- 230000003252 repetitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 1
- MEFOUWRMVYJCQC-UHFFFAOYSA-N rimsulfuron Chemical compound CCS(=O)(=O)C1=CC=CN=C1S(=O)(=O)NC(=O)NC1=NC(OC)=CC(OC)=N1 MEFOUWRMVYJCQC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002786 root growth Effects 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 235000010267 sodium hydrogen sulphite Nutrition 0.000 description 1
- 239000012064 sodium phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- JOVLEOXYYWEEEW-UHFFFAOYSA-M sodium;1-amino-8-hydroxy-4-sulfonaphthalene-2-sulfonate Chemical compound [Na+].C1=CC(O)=C2C(N)=C(S([O-])(=O)=O)C=C(S(O)(=O)=O)C2=C1 JOVLEOXYYWEEEW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- GOLXNESZZPUPJE-UHFFFAOYSA-N spiromesifen Chemical compound CC1=CC(C)=CC(C)=C1C(C(O1)=O)=C(OC(=O)CC(C)(C)C)C11CCCC1 GOLXNESZZPUPJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 239000012192 staining solution Substances 0.000 description 1
- 230000005082 stem growth Effects 0.000 description 1
- 210000001562 sternum Anatomy 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- UEUXEKPTXMALOB-UHFFFAOYSA-J tetrasodium;2-[2-[bis(carboxylatomethyl)amino]ethyl-(carboxylatomethyl)amino]acetate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC([O-])=O)CC([O-])=O UEUXEKPTXMALOB-UHFFFAOYSA-J 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 230000017260 vegetative to reproductive phase transition of meristem Effects 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/001—Oxidoreductases (1.) acting on the CH-CH group of donors (1.3)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
- C12N15/8275—Glyphosate
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
- C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
- C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
- C12N15/8271—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
- C12N15/8274—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for herbicide resistance
- C12N15/8277—Phosphinotricin
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0012—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0069—Oxidoreductases (1.) acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, i.e. oxygenases (1.13)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0071—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
- C12N9/0077—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14) with a reduced iron-sulfur protein as one donor (1.14.15)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0089—Oxidoreductases (1.) acting on superoxide as acceptor (1.15)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1025—Acyltransferases (2.3)
- C12N9/1029—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
- C12N9/1088—Glutathione transferase (2.5.1.18)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1085—Transferases (2.) transferring alkyl or aryl groups other than methyl groups (2.5)
- C12N9/1092—3-Phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase (2.5.1.19), i.e. 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/78—Hydrolases (3) acting on carbon to nitrogen bonds other than peptide bonds (3.5)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/88—Lyases (4.)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Botany (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Catching Or Destruction (AREA)
Description
Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká technologie rekombinantní DNA, a konkrétně přípravy transgenních rostlin, které vykazují podstatnou rezistenci nebo podstatnou toleranci k herbicidům ve srovnání s obdobnými netransgenními rostlinami.
Dosavadní stav techniky
Taková křivka že je vynesena
Rostliny, které jsou podstatně tolerantní k herbicidu, když mu jsou vystaveny, mají křivku závislosti odpovědi na dávce posunutou doprava ve srovnání s netolerantními rostlinami vystavenými stejným podmínkám závislosti odpovědi na dávce vypadá tak, dávka na ose x a na ose y je vyneseno procento uhynutí nebo herbicidní účinek. Tolerantní rostliny vyžadují více herbicidu než obdobné netolerantní rostliny k dosažení stejného herbicidního účinku. Rostliny, které jsou podstatně rezistentní k herbicidu vykazují pouze malé, pokud vůbec, nekrotické, lytické nebo chlorotické léze, když jsou vystaveny herbicidu v takové koncentraci a míře, která je dle. typických agrochemických opatření využívána k hubení plevelů na poli. Rostliny, které jsou rezistentní k herbicidu, jsou k němu také tolerantní. V rámci předkládané přihlášky je třeba chápat termíny rezistentní a tolerantní jako tolerantní a/nebo rezistentní.
·» ···· ·· ···· ·· ·· ··· ··· ···· • · ··· · · ··· · · · · * ············ ······ · · ·· ··· ·· ··· ·· ··
Předkládaný vynález poskytuje | : polynukieotid, který |
obsahuje alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině- nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvnímu herbicidu, a druhý úsek kódující druhý protein obdobně schopný udělit rostlině rezistenci
k druhému herbicidu, a to za podmíní | ek, že (i) polynukieotid |
nokóduje řúzní protein obsahující | pouze 5-enolpyruvyl-3- |
fosfošikimátsvntetázu (EPSPS) a | glutathicn-S-trans ferázu |
(GSTi, kii) polynukieotid neobsahuj | ie couze úsekv kódu i i o i |
superoxidismutázu (SOD) a glutatň | -. i o n -o -1 r a n s t e r a z u (G o Τ i |
a (iii) polynukieotid neobsahuje pc | juze úseky kódující GST |
fosfinocricinacetylcransferázu (PAT). |
Ve výhodném provedení předkládai | liGMC VVnaicZU ]θ ΘΧΌΓΘ36 |
každého z úseků obsažených v polynukc | -60tÍd.U Γ1Ξ6Π5. p ΓΟΓΓ/Ο tO Γ ΘΓΠ. |
a terminátorem aktivním v rostlir | lách. Takové promotory |
a terminátory jsou odborníkovi známy, a ten je může vybrat
podle konkrétní potřeby. Tak např. k | vhodným promotorům patří |
promotory 35 S CAMV nebo- FMV, a tak | é ubichitinové promotory |
z Arabiacpsis nebo- kukuřice. Výhodně | se použijí konscicuzivní |
promotorv. To eliminuje potřebu exter | mí indukce a znamená to, |
že rostlina je pak trvale toierant | mí nebo rezistentní ke |
každému z odpovídajících herbicidů. | |
DNA kódující geny rezistence | k herbicidu může být |
vložena do rostlinného transformační | ho vektoru, kde je její |
exprese řízena indukovatelným promotorem, čímž se do transgenní - rostliny vnese indukovatelná rezistence
k herbicidu. K takovým promotorům | patří např. chemicky |
indukovatelný promotor známý jako | promotor G-27, pomocí |
kterého lze zapnout rezistenci aci | ikací vhodného induktoru |
(jako je např. chemická zabezpečovací látka, safener). Za »· ···· ·· ···· ·· · · · · · * ···· · ···· · · ·.
»· ··· ·· ··· ·· ·« múze ovt vvnoana scnccno;
excrirv
1Δ1 L první hodiny.
popřípadě zvýšit rezistenci potřeba. Např. oři střídání plodin moh plodiny růst v následujícím roce, kdy je poh druhou plodinu. Herbicid je pa!neindukovaných a tedy citlivých
Indukce exprese genů rezistence k herbicidu pouze tehdy, když je rezistence k herbicidu potřeba (tj. právě před použitím herbicidu) může být za určitých okolností také metabolicky mnohem účinnější, neboť rostliny tak produkují polypeptidy rezistence pouze když je to potřeba. K vhodný™! redukovatelným promozorúm dále patří promotor indukovazelný tetracykiinem, bakteriální represorový/operátcrový systém genu iac, glukokortikoidový receptor společně s dexamethasonem, promotory indukovatelné mědí nebo kyselinou salicylovou, promotory založené na ekdysonovém receptorů, které byly popsány/ v mezinárodní patentové přihlášce PCT/G39o/0ii95, a také tzv. promotor genu Ale, který/ byl popsán v mezinárodní patentové publikaci WO93/21334.
Ve zvláště výhodném provedení předkládaného' vynálezu alespoň jeden z úseků obsahuje
'./τ', ot r
Odborníkovi κ pre-emergenznimu heroicicu a alespoň ysoen iuje rezistenci k post-emergenznímu herbicidu.
a postjsou definice terminu pre-emergentni a jasné, ale pro přesnost uvádíme, že prezde znamená aplikaci v období před tím, než se výhonky/ klíčících semen objeví nad povrchem půdy, tyj. před tím, než je jakákoliv část rostliny viditelná na povrchu. Post-emergentní znamená aplikaci v-období, kdy jsou semenáčky již viditelné nad povrchem půdy.
Pre-emergentní herbicidy/ je možné vybrat ze skupiny/ obsahující dinitroanilinové herbicidy, bromacil, flupoxam, » · · · · · · · · • · · · · · ···· · · · · • ·· ·· · ··· • · · · » ··· ·· ·· ene yiClUi 2/, i- -L
N-karbamcyltetraz norflurazon, PP201772, atrazin a jiné triaziny, iminothiadozol, diflufenioon, sulfonylmočovinu, imidazolinon, thiokarbamát, traizin, uráčil, močovinu, triketon, isoxazol, actánilid, oxadiazol, fosfosulfonátové herbicidy popsané v EP A 511 826, triazinon, sulfonanilid, amid, oxyacetamidy jako jsou herbicidy typu fluthiamidu, anilidu a trazolinonu. Jako přiklad triketonových herbicidů je možno uvést:
2-(2-nitro-4-trifluorcmetyibenzoyl)-cyklchexan-1, 3-dion,
2-(2-ohlor-4-metansulfcnyibenzoyl)-cykiohexan-1, 3-dion,
2-(2-2nicro-4-metansuifonylbenzoyi)-cykiohexan-1, 3-dion, 5-cykiopropyl-4-(2-metyisulfonyl-4-trifluorometylbenzoyl)isoxazol apod. Aby nebyly žádné pochybnosti, termín triketonové herbicidy označuje jakoukoliv sloučeninu schopnou inhibovat 4-hydroxyfenylpvruvátdioxygenázu (HPPD). V textu předkládaného vynálezu jsou termíny 4-hydroxyfenylqyruvát-dioxygenáza nebo dioxygenáza kyseliny 4-hydroxyfenyl-pyrohroznové (4—HPPD) a o-hvdroxvfenvlqyruvátdioxvgenáza nebo dioxyoenáza kyseliny p-hydroxyfenylhroznové (p-OHPP) užívány jako svnonvma.
pupaGných v EP A 612 735, sulcatrion obsahující c asulam, ben cyklohexandi quižalotop fluormetron, chlorimuron, sulfometron, metosulam, nicosulfuroň karfentrazon ergentní herbicidy mohou být vybrány ze skupiny glyphosat a jeho soli, glufosinát, difenyiéter, tazon, bialafos, bromacil, setoxydim a další ony, dikamba, fosamin, flupoxam, fenoxyprionát, a další aryloxyfenoxypropanoáty, picloram, atrazin a další triaziny, metribuzin, chlorsulfuron, flumetsulam, halosulfuroň, imazaquin, imazetapyr, isoxaben, imazamox, pyrithrobac, rimsulfuron, bensulfuron, , fomesafen, fluroglykofen, KIH9201, ET751,
ZA1296
ICIA0051
RP201772 fluorchloridon • ·
.at, bromoxynil a fencxaprop. nohto herbicidů, k nimž uděluje vvriá 1 θ z υ. rezistenci (nebo ke edkiádaného vynálezu rezistentní glyphosat a difenylězer nebo (ii) glyphosat a/nebo a/nebo triazolinonového aívpnosat a/nebo glufosinát, (iv’ erbicidy / neoc iv±asce vynoone Kcmsinsc poiynukieooid. předkládán kterým jscu rostliny podl nebo tolerantní) jscu:
herbicidy acetani1idového typu, glufosinát a herbicid anilidového rýpu, (iii) triketony glyphosat a/nebo glufosinát a a anilidového typu, (v) glypnosa inhibitor PDS (jako jsou např. sloučeniny podle v
II t i í l V vn rán'
Ό V 0 v y C Z (GOX), fos fionotri dioxygenázu kódované uvedenými úseky polynuklectidu mohou ze skucinv obsahující glvphosatoxidoreduktázu
5-enoipyruvyl-3-fosfosikimátsyntetátu (EPSPS;, lacetyltransferázu (PAT), hydroxyfenylpyruváoIPPD), glutathion-S-transferázu (GST), cvtcchrom
P450, acetylkoenzym-A-karboxylázu (ACC) , acetolaktátsynzázu panu;, protoporryrinogenoxidazu (prctox), syntázu, transportní proceiny polyaminů, (SOD), bromcxynilnitrilázu (BXX), fyrc orodukt cenu črdA získateiného dihydropreroát superoxiddismutázu desaturázu (PDS;, mutované moti z iκov a n e variano proteinů. Produkt genu tfcA je dioxygenáza, kte “ v — -J :
uvedených je schopna z — i oxidovat odpovídající fenol. Enzym II. třídy, jak je popsán v Evropském patentu č. 545 OSO. Alternativně a/nebo dodatečně může být mutován tak, aby obsahoval substituce aminokyselin v určitých pozicích, o kterých se ví, že vedou ke zvýšené rezistenci ke glvphosatu (a jeho agrochemicky přijatelným solím). Tak např. EPSPS může •/šermy, jako je napr. 2,4-D, na EPS PS může být tzv. EPS PS mít alespoň aminokyselinoví v i κ v
To, Gly a • · · « • · » · · 4 η ,·’ ·ρ (-Ρ τ 7 η ie sekvencí id.
3, 1/3 a 2 / /měněny ná/ • · · · » · · · » · · · • · · · · · • · • · · ·
í 1 i | Thr174 - | Ile | |
(11) | Prol73 - | Ser | |
(111 | ) Glyi73 - | Ala | |
( 1 v) | Ala264 - | Thr | |
přič | emž (i) Thr | 174 | leží |
Me t, | (i i) Pro 1 | 73 1 | e ž í v |
i n r, | (iii) Gly | 173 | leží |
.Ala | a (iv) Ala | 2 64 | Ί „ as X iSZi |
Giv. | Navíc kon | c o v v | zbyt/ |
C-lu- | Aru-Pro-AAl- | -ΆΑ2- | -Leu-Vl· |
v souvislé sekvenci Pro-Leu-Ala-LeuGly, ležící v sekvenčním motivu -AA3-AA4-Le-AA5-AA6-AA7-G1y v úseku enzymu EPSPS odpovídajícím pozicím 192 až 232 podle sekvence id. č. 9, může být nahrazen buďto· A-sp nebo· Asn.
V jednom provedení předkládaného vynálezu úsek polynukleotidu kódující enzym HPPD má sekvenci uvedenou zde jako sekvence id. 1 nebo 3, případně je komplemetární k jedné nich, pokud st inuuouz e .oce mezi ou v solném roztoku síly 0,3 pufrovaném citrátem obsahujícím 0,1% SDS a ρο opláchnutí v solném roztoku sliv 0,3 oufrovaném um u jo ve s rej no ;ě stál seivenci uvedenou zae oakc vvence nebo 3.
Pokud testovací sekvence a sekvence podle předkládaného vynálezu jsou dvouřetězcové, má testovací sekvence hodnotu TM (teplotu tání) v rozmezí 15 °C od TM sekvence id. č. 1. V případě, že testovací sekvence a sekvence id. č. 1 (nebo testovací sekvence a sekvence id. č. 3) jsou smíchány dohromady a denaturovány současně, hodnoty jejich TM leží v rozmezí 5 °C. Výhodněji je hybridizace provedena za relativně stringentních (přísných) podmínek, které jsou ι· ··*· ·· ···· ·· ·« • · · · · ··· • Λ·· · · · · · · · ·
2 s io o ď o o | testovací | senvence nebo se | kvence po | |
vynálezu | se první | váže na nosič a | hybridi z | |
ή o C r O V á d r 3 | po urči | tou dobu | v teplotě mezi | 6 0 a 6 5 |
, Ί our rc ' rr;
ím ím oc
U,íí tht a nosíc je pak opláchnut v somem roztoku síly 0,1 pilířovaném citrátem při stejné teplotě. Pokud se hybridizace účastní fragment sekvence podle předkládaného vynálezu, pak mohou být podmínky hybridizace méně stringentní, jak je odborníkovi zřejmé.
Pnknd poiynukleotid obsahuje gen HPPD udělující herbicidům, rostlinný materiál se vystaví působení tri ketonového selektován na základě barevných r; n f- y o vym transformovaný tímto genem herbicidu a pak je vizuálně rozdílů mezi transformovaným a netransrormovanym matei který byl vystaven stejnému herbicidu. Netransformovaný materiál vybledne (zbělá) ' a zůstane bílý, je-li podroben selekčnímu procesu, zatímco transformovaný materiál vybledne, a±e pozceji zase zezeiena, Poiynukleotid podle vynálezu obsahuje další ú szistenci nebo· nocovaní něco zůstane rovno dalšího u;
: -i. t V A π η η í
rovedení předkl | ádaného | |
protein | schopný | udělit |
hmyzu, | usychání | a/nebo |
známy a p; :h uringi ensi s rrotemy ří k nim arovými useny jsou occornikov např. ebdotoxm delta z Bacillus obalové proteiny virů.
Poiynukleotid předkládaného vynálezu může obsahovat 5'-koncové sekvence sousedící s uvedenými úseky, kteréžto sekvence kódují (i) peptid schopný směrovat translační produkty úseků do plastidú jako např. chloroplastů, mitochodrií, jiných organel nebo buněčné stěny a/nebo (ii) netranslatované sekvence zesilující translaci. Vhodné uzzove tranziíni pepzzay, .cí rezistenci k herbicidu (oo sítem trans kricce; je crsss o ro ti β i nu kódovaného letící Dezcrostrecine cicwns enzym ΞΡ5Ρ5 nebo GOX. sekvencí oosaženou v známé netransiatovane sekvence zesilující trans 5-konec uvedeného úseku kódujícího protein. Takové zesilující sekvence jsou odborníkovi známy, patří sem např. sekvence odvozené z TMV známé jako omega, omega prime, a také sekvence, které lze odvodit z 5'-koncových úseků sekvencí kódujících virové tabáku a dalších nukleotidové sekvence m planta muže ovt vnoane nořte n sekvence kódující známé proteiny schocné udělovat . ci i I2:
ρχ xziynuxzeo tiau muže oyo zvýšena v.
- ,- π 1 . , C ' í
proteiny | např. viru | s kvr |
.ledem na | požadavek | exp |
ianta může | být vhodné | ITlC d ί |
sou coivnuxiuvedené výše, které jsou modifikovány tak, že jsou odstraněny motivy nestability mRNA a/nebo náhodná sestřihová místa nebe jsou užity kodony přednostně užívané rostlinami, takže exprese takto modifikovaných polynukleotidů v rostlinách vede k produkci podstatně podobných proteinů s podstatně podobnou aktivitou/funkcí těm proteinům, které jsou získány expresí nemodifikovaných polynukleotidů v organismu, ve kterém jsou úseky nemodifikovaného polynukleotidu kódující protein endogenními, za předpokladu, že jestliže takto modifikovaný po ± ynu a e o t i o. oosanuje koceny precnostně užívané rost_mami, stupen identity mezi úseky kódujícími protein v modifikovaném polynukleotidu a obdobnými úseky kódujícími protein endogenně obsaženými v dané rostlině a kódujícími v podstatě identický protein je menší než asi 70%.
Předmětem vynálezu je dále vektor obsahující uvedený polynukleotid.
···· ·· ··« • · · · • · · · • · · · • · « · · · · • · • · • · • · · · • · ··· · · ·♦
LÍT
--A který byl transíormová
p.a herbicidům, a které byly regenerovány z mazeriálu, pc-lynukleotidem nebo vektorem podle předkládaného vynálezu.
Způsoby transformace jsou odborníkovi známy a patří k nim transformace zorostředkcvaná mikročásticemi, teríum, transformace insLormace zoros' zo ros tředkovana protoplastú (případně v přítomnosti polyetylénglykolu), ;onikace rostlinného pletiva, buněk nebo protoplastú médiu rm poiynutie využívajícím techniky mtkrovláker iransformace elktrcporací a pod. jedle předkládaného vynálezu p technické olodinv produkujíc vlákno, jolynukleotidu d řipadně zdusí ' ; károtou ls formo váné Li o viny, zeleninu, rostli
Ί intážové plodiny a stromy. Zvláště výhodné rostliny )ja, bavlník, tabák, rutrovr ;pa, řepka olejka
Ί .<-> >—> c ! τ ,·—· ,-', -~· —n V·', v- v· —> -i τ τ z-> —' -ί— 2 ,-· 1<- (—· —> i A -f~
-i- _ _ i CUUJjLi / J_ CL J U ~ / V u J utoA-C./ O dXG u kukuřice, pšenice, čirok, žito, banánovník, ječmen, oves, lvv, picni trávy, cukrová třtina, hrách, fazol, topol, jabloň, grapefruit, citrusovník rostlin.
Předkládaný vynález déle poskytuje rostlinný materiál, který obsahuje sekvence nukleové kyseliny obsahující úseky kódující alespoň dva proteiny schopné udělit danému materiálu rezistenci k alespoň dvěma herbicidům , a to za podmínek, že (i) materiál neobsahuje polynukleotid kódující fúzní protein obsahující pouze 5-enolpyruvyl-3-fosfošikimátsyntetázu (EPSPS) a giutathion-S-transferázu (GST), (ii) materiál neobsahuje polynukleotid obsahující pouze úseky kódující • · ···· · · • · · · · • · · · · · · • · · · ♦ · • · • « • « • · · <
/ d.
regenerovat do celých norfologicky normálních řertrinícn rostlin. V materiálu podle výhodného provedení předkládaného vynáiezu alespoň jeden z úseků kóduje protein udělující rezistenci k pre-emergencnímu herbicidu a alespoň jeden z úseku kóduze protein udělující rezistenci k postbv~ očíscsinv v rostlinách (nsbo šeších částech) v ctú: křížení první rostliny, která obsahuje polynukleotid první protein schopný udělit rezistenci k orvními herbicidu,, s druhou rostlinou, která obsahuje poiynukleotid kódující druhv protein udělující rezistenci k druhému herbicidu také přec r n - l ct t- .ο» Τ' p v této přihlášce;. Výhodné kombinace genů sbicidúm jsou (i) gen HPPD a gen EPSPS nebo a PAT, (iii) gen GST a gen EPSPS/GCX, (Vili d calúc a/nebe 5 OS hnebo GOX, íviiii gen zrdA EPSPS a/nebo GOX v každé z těchto genů rezistence zpnus a ger
Kromě toho kombinací muže být jeden nebo více k herbicidu nahrazen genem pro SOD, protox a/nebo ALS. Takové rostliny jsou v této přihlášce uváděny jako rostliny podle vynálezu.
;im pre
V p n 1 ' use-' zoauj-Cl· první pletivu, které ho· k prvními herbicidu, b selektivního hubení na a plevel, přičemž požynuxieoz 10 oosahující alespoň první protein schopny/ udělit rostlině nebo obsahují, rezistenci nebo toleranci a druhy/ úsek kódující druhý protein vynalezu je zpi terém roste plc scnopny ucelit odeone obsahují, rezistenci nebo istlině nebo pletivu, které no úeranci k druhému herbicidu, a to za podmínek, obsahuj ící (i) polynukíeotid nekóduje fúzní protein pouze ϊηοlovruvv1-3-fo s fo š i kimáts vnt e t á zu !P3?S) a glutathion-S-transferázu (( /obsahuje pouze úseky kódující •sanuje pouze úseky kódující G3T
ÚST) , (ii) polynukíeotid superoxidismutázu (SOD) polynukíeotid linou cukrová geny udělující rezistenci nebo toleranci k herbicidu,
Kter obsahuje, nejsou pouze EPSrS
DZVT řepa, geny, nebí ín! polynukíeotid obsahující alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvními herbicidu, a polynukíeotid kódující druhý protein schopný udělit obdobně ros oline toleranci é ho i du, o pletivu, k t k druhému herb (i) polynukíeotid nekóduje fúz> j — e n o i o y r u v y/1 — 3 -1 o s z o s i k i m a i s y/n z razsDDm íppt obsahují, rezistenci nebo a to za podmínek, že protein obsahující pouze zu (EPSPS) a glutathion-Szu (GST), (ii! polynukíeotid neobsahuje pouze úseky superoxidismutázu (SODi a gluzathion-S-transferázu (GST), (iii! poly/nukleotid neobsahuje pouze úseky kódující GST a fosfinotricinacetyltransferázu (PAT) a (iv) že pokud je plodinou cukrová řepa, geny udělující rezistenci nebo toleranci k herbicidu, které obsahuje, nejsou pouze EPSPS a PAT, přičemž způsob zahrnuje aplikaci alespoň jednoho ·· ···· ·· ···· • · · · · · · z uvedených herbicidů na pole v množství c plevelů bez podstatného účinku na plodinu.
Geny udělující rezistenci k herbicíc na samostatných polynukleotidech v r.
ecnem rostimv výhodném způsobu rostl enzymy EFSPS a/nebo GOX aplikaci glyphosatových v množství dostatečném k podstatnému účinku na podle vynálezu plodiny a/nebo GOX a fosfinotr:
ina/plodina obsahuje geny kódující a enzym HPPO, přičemž způsob obsahuje a trikeconovýcn herbicidů na pole k hubení plevelů aniž by došlo plodiny. V dalším provedení způsobu obsahují geny kódující enzymy EPSPS .cinacetyltransferázu, přičemž způsob obsahuje aplikaci glyphosatu a glufosinatu na pole. V dalším provedení způsobu podle vynálezu plodiny obsahují geny kódující enzymy EPSPS a/nebo GCX a fosfrnotricinacecvl•J U _l z. C til z Z 'j. z C U υ Ό b 3.U z. Ί 3 a tri betonových herbicidů n, podle vynálezu plodin'.
glyphosacu a glufosinatu a V dalším provedení způsobu t z u a glui_athion-o-i
OGo 5. ftu. j 1 geny kódující enzymy EPSPS a/nebo GOX a/nebc· fosfinotricinierázu, přičemž způsob obsahuje aplikaci glyphosatu a/nebo glufosinatu a anilidových herbicidů, jako je např. acetochlor, na pole.
V dalším provedení způsobu podle vynálezu plodiny obsahují geny kódující enzymy ACC a PG.T a/nebo EPSPS, přičemž
ΖΌ US OC OOSUUUjs 3. pil· KU Cl PcrDicidU zypU tlUlZitOpU a glyphosacu a/nebo glufosinatu na pole.
V dalším provedení způsobu podle vynálezu plodiny obsahují geny kódující produkt genu cbcZO. (případně s optimalizovanými kodony) získatelný z Alcaligenes eutrophus a enzymy EPSPS a/nebo GOX a/nebo PG.T a/nebp PDS, přičemž způsob obsahuje aplikaci 2,4D a glyphosatu a/nebo glufosinatu a/nebo herbicidního inhibitoru fytoendesaturázy na pole. Kromě toho v každé z těchto kombinací může být jeden ·· ····
0000 • · 00
00 nebo několik genů rezistence k herbicidu nahrazen genem pro SOD, protox a/nebo ALS .
Ve zvláště výhodném provedení způsobu podle vynálezu pesticidně účinné množství jednoho nebo několika insekticidu, fungicidu, baktericidú, nematicidú nebo antivirových látek je aplikováno na pole buďto před nebo po aplikaci jednoho nebo několika herbicidů.
Před k1á danv oa 1 e jsou podstatně rezistentní vůči dvěma nebo více herbicidům, kterýžto způsob spočívá v tom, že obsahuje kroky, kdy:
(i) rostlinný materiál se transformuje polynukleotidem nebo vektorem podle vynálezu, (ii) takto transformovaný materiál se selektuje a (iii) takto selektovaný materiál se regeneruje do morfologicky normálních fertilních rostlin.
Rostliny podle vynálezu se mohou případně získat způsobem, který zahrnuté transformaci prvního ro:
rostlin, které poskytuje způsob přípravy tolerantní nebo podstatně
Γίισ.ϋ.θΐ’ΐα.ΐ'ίΐ S S Κ V 6 Π CI 11G. 6 j. U j i C i druhý rostlinný materiál s v
rezistenci k transformovaného mater a vzázemné cpvlení tec izistenci k prvnímu herbicidu ransřormuze sekvencí udělužící druhému
1 11 Jn
1C 5 5.ΠΌ. j 1 C ί ΓΠυ. 003. 0760336 Cfcliv’ herbicidu, regeneraci takto celých fertilních rostlin rostlin, které vede k potomstvu prvním unemu herbicidu. Případně první a/nebo druhý rostlinný materiál může být předem transformován polynukleotidem obsahujIcím úseky kódující jeden nebo několik proteinů udělujících rezistenci k herbicidu, insekticidních proteinů, proteinů s protihoubovým nebo protivirovým účinkem a/nebo proteinů schopných udělit rostlině lepší odolnost proti usychání.
Předkládaný vynález dále poskytuje použití polynukleotidu nebo vektoru podle vynálezu pro přípravu ····
9 9 » 9 · ·· ·· ···· ·· pletiva a/nebo celých morfologicky normálních fertilních rostlin, které jsou podstatně tolerantní nebo oodstatně rezistentní jsdncns nebo několika herbicidům. Předkládaní vvnález dále poskytuje použití polynukleotídu nebe vekzoru podle vynálezu pro přípravu herbicidního cíle pro velkokapacitní in vitro sereening potenciálních herbicidu. Úseky polynukletidu kódující protein mohou bít heterclogně exprimovaný v E. Celí nebo kvasinkách.
Předmětem předkládané vynálezu 'je dále rostlinné pletivo transformované poiynukleotidem obsahujícím sekvenci uvedenou zde jako sekvence id. č. 1 a kódující dioxygenázu. To může být jediný gen rezistence k herbicidu v materiálu. Materiál pak může být odborníkovi známými způsoby regenerován na morfologicky normální ferzilní rostlinu. Ve zvláště výhodném provedeni transformovaného pletivo podle vynálezu, polynukleotid kódující protein s podstatně podobnou aktivitou proteinu kódovaného sekvencí id. č. i je komplementární se sekvencí, která když je inkubována při teplotě 60 až 65 °C 0,3násobné síly při stejné teplotě 0,3násobné síly
v | cit | r á | Γ ottj | puf | rováném | solném roztoku |
ob | sah | uj | ícím | 0, 1 | % SDS | a poté opláchnuta |
v | cit | rá | t em | puf | rovaném | solném roztoku |
ob | sah | uj | ícím | a i ± | t enc ó O | stále ještě hybri |
id | . č | ρ |
jesi
Předkládaný' vynález budí pomocí následujícího popisu dc sekvencí.
pcirconeii vvsv;
Ky a seznamem
Sekvence id. č. 1 ukazuje sekvenci DNA, která byla izolována ze Synechocystis sp. a která kóduje enzym (uvedený
99
9 <
• · • ··· ·· «··· • · · • · ··· • · · · • · · ·· ··· • · · • · · · · • · · · ·· • · ·
994
999 ·· ·· jako sekvence id. č. 2), který má aktivitu dioxygenázv kyseliny p-hydroxyfenylpyrohroznové.
izolována z Pseudozior.as ssp. 37/79, ve které nukleotidy 1217 až 2290 kódují enzym (uvedený jako sekvence id. č. 4), který má aktivitu dioxygenázv c-hvdroxvfenvloyruvátu.
Sekvenc ednu termu svnteticxvc n ri moro o ó k 3 z v n 3 Η Ρ Ρ P - P 4
OR s minimální redundancí (vi a HPPD-REV1 dále), které byly použity pro izolac id. č. 3 z bakteriálního genomu.
Sekvence id. č. 7 a 8 jsou také syntetické PCR primery, které byly použity pro modifikaci sekvence id. č. -3 tak, aby mohla být vložena do vektoru pro- transformaci rostlin.
Sekvence id. č. 9 ukazuje aminokyselinovou sekvenci enzymu EPSPS (včetně chloroclastovéhc sicnálního oeotidu;
Z DS ZUiíl 3
Sekvence id. č polylinkery, které j; vytvářet konstrukty, k herbicidům.
<7 ai n jsou primery tta něco iou vloženy do plazmidů, aby bylo možné které obsahují více genů rezistence
Poois obrázků
Obr. 1 je je schematický diagram klonu obsahujícího sekvenci id. č. 3, kde byly identifikovány tři otevřené čtecí rámce: první začíná nukleotidem 15 a končí nukleotidem. 963, druhý začíná nukleotidem 215 a končí nukleotidem 1066 a třetí začíná nukleotidem 1217 a končí nukleotidem 2290 dle sekvence id. č. 3. Obrázek také ukazuje restrikční místa obsažená v sekvenci, která jsou manipulována pomocí primerů uvedených zde jako sekvence id. č. 7 a 8.
schematicky znázorňuje přípravu expresní kazety obsahující 4-HPPD, kde fragmern
DNA z obr. 1 j· upraven oan i ίσοvan oc pomocí PCR a naštěpen Ncol a Kpnl ípMJBl; caké naštěpeného Ncol a Kpnl.
Obr. 3 je schéma úprav provedených na binárním rostlinném transformačním vektoru pBin!9, aby obsahoval
4-HPPD le oor . z .
sxorssm kazet
Obr. 4 je schematický diagram klonu obsahujícího sekvenci id. č. 1.
Obr. 5 znázorňuje obsahující 4-HPPD, kde přípravu rostlinné expresní kazety pomocí PCR upravený fragment DNA uvedený na obr. 4 je naštěpen enzymy Ncol a Kpní, pak linován do vektoru (pMJBl) také naštěpeného Ncol a Kpnl.
je schematicky konstrukci plazmidovéhc ého pro transformaci Acrcbacterium tmtisfscisn: mapv plazmidú pJRlRi a pGSAT-27Bin.
Ob r. 6 vektoru, pou: a také ukazuj
Obr. 7 ukazuje akzivizu GST ve transformovaném tabáku po aplikaci 4 herbicidů.
Obr. 8 je graf srovnání poškození rostlin divokého typu a rostlin linie GST-27 po ošetření metolachlorem v dávce 1400 g/ha po 3 týdnech.
Obr. 9 je mapa plazmidu pDV3-puc.
Obr . | 10 | je | mapa | plazmidu | pDV6-Bin. | ||
Obr . | 11 | j θ | mapa | plazmidu | pU3-l, který | obsahuje fragme | at |
i f j n | q -y q b. | Q | promotoru získaného pomocí | PCR z kukuřic | ~ / | ||
1 Γ U CL | gmen | velikosti 2 kb byl klonován | do plazmidu piJC | 19 | |||
Síc | 3 PO | j ú | byla | sekvencována pro ov | ěření přítomnos | ti | |
-toru | |||||||
Obr. | 12 | je | mapa | plazmidu | pIE98. | ||
Obr . | 13 | je | mapa | plazmidu | pIGPAT. | ||
Obr. | 14 | je | mapa | plazmidu | pCATlO. | ||
Obr. | 15 | je | mapa | plazmidu | pCATll. |
Cc^ je mapa plazmidu pťGe .
zcbrazuie část olazmidu pl
ČVl
Příklady • · · · · • · · · • · · · • · ··· · » · • · · ·· ·· ···· ·♦ ··· • « · · · ···« · · ··· • · · · · • · · · » · ··· · o ···
Klonování genu 4-HPPD z Pseudomonas spp., transformace genu do rostlinného materiálu a příprava rostlin rezistentních k triketonovým herbicidům
Amine kyše1inová z Pseudcrcnas fluorescens PJ-8' sekvence 4-KPPD purifikovaného pěstovaného na tyrosinu jaro vycucnem
J- B i. echem. 1:
P yiy navrze n y těchto uhlíku, je zn c o ; . Na Za.ciadě teto servence minimálně redundantní primery pro PCR, a po:
nekomolentní, primerů byl ampnrikovan velký, ale fragment genu 4-HPPD z genomové DNA různých bakteriálních kmenů :Pseudcmonas fluorescens PJ-874) . Odborníkovi je znám význam cermínu minimálně redundantní primery, v dále uvedené sekvenci ie redundance naznačena hranatými závorkami.
Jaro čden p ř í k 1 ad ka ždéhc z příslušných primerů 5'-konci a 3'-konci cenu okali zaci na 4-HPPD)jsou zde uvedeny sekvence id. č. 3 a 4.
(sekvence id. č. 5), což je 17-mer, je yselin 4 až 9 publikované primer č. 2 (sekvence id. č. 6), coz je také 1/—mer, je zarozen na znalosti aminokyselinových zbytků 334 až 339. Primer č. 1 (HPPD-P4) má sekvenci:
(odpovídán reich cl mei c . i založen na znalosti sekvence proteinové sekvence (viz výše)
5'TANT/C] GA[G/A]AA[T/C] CC [T/C/G/A]ATGGG • · · · · · » · · » · · · · • · · > · · · · 1 « » · · · I <
•9 ·*· ·· ··· a primer 2 (HPPD-REV1) má sekvenci:
5'GC[T/C]TT[G/A] .AA[G/A]TT[T/C/G/A]CC[T/C1TC.
100 ng genomové DNA. z Pseadcmonas flucrsscsns PJ-3' připraveno podle standardního protokolu a smích 100 pmol každého primerů. Směs pak s ia<
polymerázou byla amplifi kována v PCr l dalšími standardními reagencierai v podmínkách syntézy a disociace DNA.: 94 °C po
5 C po 2 minuty :
Amplifi kovaný fragment obsahoval úsek obsahující 3 kodony z 5'-konce a asi 30 kodonů z 3'-konce kódujícího úseku genu 4-HPPD. Produkt PCR s tupými konci byl standardním způsobem ligován do (housekeeping) vektoru pGEM3Z-f(+).
Částečné sekvencování potvrdilo,
1,5 minuty, o po minouv.
fragmnet PCR j specifický pro 4-HPPD. DTrčené
G G S 3. G. G V 3 někol i k
Z Fs 3 G d G G O G 3 3 G _L U C2ΖΘ G C Θ G S P J ” 8 4-HPPD dává negativní signál p s rostlinou genomovou hvbridizace a orcmývár aminokyselinové sekvence vnalostí proui sekvenci enzymu Tento částečný fragmnec Souuhernově hybridizaci
NA za málo přísných podmínek Fraument EccRI/EcoRI velikcsui
900 bp byl vystřižen ze středu předtím klonovaného částečného genu a tento fragment byl použit, jako sonda. Byla provedena Soutnernova hybridizace genomové DÍLA našcěpené různými enzymy s tímto radioaktivně značeným fragmentem.
DNA naštěpená Bell poskytla jediný pozitivní pás velikosti přibližně 2,5 kb, který je dostatečně velký na to, aby obsahoval celý gen i se sousedními netranslauovanými úseky. Genomové DNA. byla naštěpena Bcil a rozdělena elektroforézou na preparativním ágarózovém gelu. Oblast obsahující fragmenty velikosti 2 až 3 kb naštěpené DNA. byla vyříznuta a DNA z ní byla extrahována elektroelucí. takto získaná DNA byla klonována do místa BamHI (které je kompatibilní s Bell) v plazmidu pbTC18. Otisky kolonií pak • · I • · · · · byly testovány se sondou, kterou byl uvedený fragment velikosti 900 bp, a 12 pozitivních kolonií bylo izolováno. Minipreparací izolovaná DNA z těchto· kolonií .byla naštěpena EcoRI s cílem najít diagnostický pás velikosti 900 bp. Ze 12 testovaných kolonií 7 vytvářelo hnědý pigment když . byly pěstovány přes noc na médiu LB pro minipreparací, 5 z nich bylo· pozitivních na fragment 900 bp, ostatních 5 bylo negativních a nevytvářelo hnědý pigment. Vytváření hnědého pigmentu je spojeno s heteroiogní expresí genu 4-HPPD.
Restrikční analýza uKázala, že klonovaný inzert dlouhý 2,5 kb s úsekem asi 1,2 kb upstream od genu 4-HPPD a asi 400 bp úsekem downstream. Konce genu byly šekvencovány pomocí vhodných primerů a také primerů pro pUClS. Toto sekvencování prokázalo, že gen byl intaktní a exisfovar v obou orienzacicn vznlem v pUClS.
SDS-PAGE elektorcréza lyzátu bakzeri přítomnost nového proteinu velikosti asi 40 kDa, což správně _m mis cum oopovíct z buněk, v tomto případě byl řeco1 pro 4-HPPD. Tento pás byl přítomen v ext které měly gen vložený v první orientaci, protein exprimován z promoto: vektoru. Žádný pás nebyl viditelný u lyzátů z buněk, kde gen byl v opačné orientaci, ačkoliv oba klony produkovaly hnědý pigment, což by napovídalo existenci aktivního proteinu v obou typech buněk. Rekombinantní protein velikosti 40 kDa převládá v rozpustné spíše než nerozpustné proteinové frakci. Klony, ve kterých je gen ve druhé orientaci, byly šekvencovány pomocí automatického sekvenátoru DNA a byla tak identifikována sekvence id. č. 3. Sekvence pak byla upravena tak, že do ní bylo vloženo několik restrikčních míst, aby se umožnilo její vložení do vektoru vhodného pro transformaci • ·· · rostlin. Oligonukleotidy použité pro tyto úpravy, uvedené zde jako sekvence id. č. 7 a 9, jsou primer č. 3 (HPPDSYN1):
Exprese genu 4-HPPD z Pseudomonas v transgenním tabáku
DNA fragment upravený pomocí PCR byl naštěpen enzymy Ncol a KpnI, pak byl ligován do vektoru (pMJBl) také naštěpeného Ncol a KpnI. Vektor pMJBl je plazmid odvozený z plazmidů pUC19 obsahující dvojitý promotor CaMV 35S, zesilovač (enhancer) TMV omega a transkripční terminátor NOS. Schéma výsledného plazmidů je uvedeno na obr. 2. Všechny manipulace s DNA byly provedeny standardním, odborníkovi v oboru molekulární biologie známým, způsobem.
Byla izolována celková DNA a expresní kazera 4-HPPD (tj. v rozsahu od 2x35S až. po nos 3'-terminátor) byla vystřižena částečným štěpením EcoRI a pak úplným štěpením HindlII. Tento postup byl zvolen proto, aby se zabránilo1 rozštěpení EcoRI místa uvnitř genu 4-HPPD. Po preparativní elektroforéze na agarózovém gelu byl požadovaný fragment izolován elektroelucí.
Expresní kazeta 4-HPPD pak byla ligována do vektoru p3in!9 naštěpeného HindlII a EcoRI. Výsledný plazmid je schematicky znázorněn na obr. 3.
DNA byla izolována a použita pro transformaci Agrobacterium tumefaciens LBA4404 na rezistenci ke kanamycinu opět standardními metodami v oboru. Prostřednictvím Agrobacterium tumefaciens pak byly standardním postupem transformovány listové terčiky/proužky Nicotiana plumbaginifolia cv. Samsun. Transformované výhonky byly regenerovány z kalusů rezistentních ke kanamycinu. Výhonky · 9 9· · · ·»· • «99
9 9 9 » 9 9 « » 9 9 «
9 9 9 9 4 «
«4 9 9 ikořeněny v agarovém médiu MS s kanamycinem. Přeživší :akořeněné rostlinky byly přesazeny a znovu zakořeněny, což i
na.kcnea ocsxvtío as
SO trans formovaných rostlinek tabáku sice s již existujícími primery EDIT;.
V PCR bylo pozitivních 60 rostlin.
Explantáty (tj. list se segmentem stonku obsahujícím axilární pučen) byly umístěny na MS agar (+3% sacharóza) obsahující různé koncentrace ZA1206 (triketonový herbicid) od 0,02 do 2 ppm. Netransformované rostliny tabáku úplně zbělely na koncentraci 0,02 ppm.. Přitom při prodloužené expozici herbicidu se nikdy nezotavily. V tomto konkrétním pokusu zbělely pouze výhonky, které se vyvinuly list explantátů zůstal zelený.
0 tl Γ5.Π.5 ”C nT.C V2.P vch <3.
rostlin tolerovalo koncentraci ŽA1 než koncentrace způsobující p up e nu, p uvc bni
0, 1 ppm (asi svmptomv u x vyssi divokých, tu .
netrans rormovanycn
Zakořenily normál im oez jaxycnxoliv známek zoelen fenotvcově usou k nerozeznání netransformovaných rostlin. Skupina transformovaných rostlin byla tolerantní ke koncentraci 0,2 ppm a několik trans formo váných rostlin tolerovalo· dokonce koncentraci 0,5 až i ppm. Tyto rostliny opět vypadaly normálně a dobře zabořenou v přítomnosti herbicidu. Některé transformované rostliny na počátku zbělely po vystavení herbicidu při výše zmíněných vysokých koncentrácích, ale po prodloužené expozici herbicidu progresivně zelenaly a výrazně se zotavovaly.
Skupina zmíněných k herbicidu rezistentních rostlin byla ošetřena známými herbicidem Isoxaflutolem (tj. 5-cyklopropy-4(2-metylsulfo.nyl-4-trif iuormetylbenzoyl)isoxazol neboli RPA 210772) . Tyto rostliny jsou dokonce více rezistentní k tomuto herbicidu než k původnímu ZA1296, což jasně ukazuje, • e « · · · • · ·
4 4 4 4
4 * · · Λ « 4 4 « · · · ·
4 4
4 « • « · 4 Λ
4 ·4
O?
že rostliny jsou křížově rezis’ inhibitorů 4-HPPD.
k několika třídám
Přiklad
Klonovaní genu 4-HPPD ze oynecnacystis sp. ao materiálu a regenerace materiálu na rostliny k triktonovému herbicidu
G e n o m Svrischccyscis sp P C C ό tí 0 z b v l s e x v e n c o v a n . Ad y o y i o možné vnést do něho vhodná restrikční místa pro usnadnění vložení do vektoru pro rostlinnou transformaci, bylo ze Synechocystis sp připraveno 100 ng genomové DNxA standardním postupem a bylo smícháno se 100 pmol dvou primerů vhodných pro PCR amplifikaci (v 35 cyklech) sekvence, uvedené zde jako rostlinného rezistentní ssKvem výhodně id. č. 1, s ooravncu soužitím termostabiln ' oroof )NA o c 1 vme ráz v reaaino activ dalších standardních reaaencií v oodmínkách vhodných oro
disociaci | 3. S y Π Lc ZU | DNA, | přičemž typické byly | následuj ící |
podmínky: | 94 °C po 1, | 5 mir | zuty, 5 5 °C po 2 minuty | a 74 °C po |
3 minuty. | Amplifikoval | zý fr | agment obsahuje kódujíc | í úsek genu |
4-HPPD. | Produkt PCR | y ± | klonován (s tupými | konci) do |
standardu | ího vektoru | j a ke | je např. pGEM3Z-f(e) | . Arytváření |
hnědého -pigmentu je spojeno s heteroiogní expresí genu 4-HPPD (Denoya et al. 1994, J. Bacteriol. 176: 5312-5319).
SDS-PAGE eiektroforéza lyzátů bakteriálních buněk ukázala, že buňky obsahovaly nový protein s očekávanou molekulovou hmotností genového -produktu 4-HPPD. Ve výhodném provedení vynálezu je rekombinantní protein buďto přítomen spíše v rozpustné než nerozpustné proteinové frakci nebo je upraven tak, aby v ní byl přítomen. Klon se podrobil automatickému sekvencování DNA, aby se potvrdilo, že nejsou přítomny žádné artefakty vnesené PCR.
·· · · · Λ * · · · · ’ • * · · · · * 9 9 9 9 · 9 9 9 9 • · · · · · <
Heterologní exprese genu 4-HPPD Synechocvscis sp. PCC6803 v E. coli
DNA fragment upravený pomocí PCR byl naštěpen vhodnými nzymy Ncol a celu (jako vhodně naštěoeného. Vše enzmymy jako napr. expresního ve ktoru pETi rak oroveden
KpnI, pak byl ligován do jsou např. vektory série onv mamoulace s DNA oviv standardním, odborníkovi v oboru -molekulární biologie znám jmi, způsobem.
Vhodný hostitelský kmen jako např. BL21(DE3) nebo jmý lysogenní kmen typu DE3 nesoucí gen 4-HPPD exprimuje množství HPPD dostatečné k tomu, aby byl vhodný k provádění vysokokapacitníno sereeningu pro identifikaci alternativního inhibitoru
4-HPPD.
HPPD purifikovaný z takového transformovaného hostitelského kmene se může vvužít oro
D O 1VHUK-cOtiaí ra pr kóduj í ί-HPPD .
Heterologní exprese genu 4-HPPD Synechocystis sp. PCC6303 v transgenních rostlinách
DNA. fragment upravený pomocí PCR byl naštěpen např. enzymy jako Ncol a Koni, pak byl ligován do vhodného udržovacího vektoru jako např. pMJBl, pro vytvoření expresní kazety příslušný v rostlině aktivní promotor a terminátor.
Vektor pMJBl je plazmid odvozený z plazmidů pDTC19 obsahující dvojitý promotor CaMV 35S, zesilovač (enhancer) TMV omega a transkripční terminátor NOS. Schéma výsledného plazmidů je uvedeno na obr. 4.
Expresní kazeta 4-HPPD pBinl9 naštěpeného HindlII pak byl ngovana oo vextoru coRI. Výsledný plazmid je schematicky znázorněn na obr. 5.
ňgrobacterium tumafaciens LBA4404 na rezistenci ke kanamycinu
DNA byla izolována a použita pro transformaci
9 9
9
9 9 9 • · · · · 4
S · · » 9 9 99 opět standardními metodami známými v oboru. Prostřednictvím Agrobacteríurn. tumefaciens pak byly standardním postupem transformovány rajče a brambor. Transformované výhonky byly regenerovány z kalusů rezistentních ke kanamycinu. Výhonky byly zakořeněny v agarovém médiu MS s kanamycinem. Přeživší zakořeněné rostlinky byly přesazeny a znovu zakořeněny, což nakonec poskytlo asi 80 transformovaných rostlinek tabáku rezistentních ke kanamycinu. Přítomnost genu 4-HPPD byla ověřena pomocí PCR (a sice s již existujícími primery EDIT). Značný počet PCR pozitivních rostlin byl odebrán pro další anaiyzy.
Explantáty (tj. list se segmentem stonku obsahujícím axilární pupen) byly umístěny na MS agar (+3% sacharóza) obsahující různé koncentrace ZA1206 (triketonový herbicid) od
0,02 do 2 ppm. Netransformované koncentraci 0,02 ppm. Přitom herbicidu se nikdy nezotavily. zbělely pouze výhonky, které se rostliny úplně zbělely na při prodloužené expozici V tomto konkrétním pokusu vyvinuly z pupenu, původní
Přibližně 30 transformovaných a v PCR pozitivních rostlin tolerovalo koncentraci ZA1296 0,1 ppm. (asi 5x vyšší než koncentrace způsobující symptomy u divokých, tj. netransformovaných, rostlin) bez jakýchkoliv známek bělení. Zakořenily normálně a fenotypově jsou k nerozeznání od netransformovaných rostlin. Skupina transformovaných rostlin byla tolerantní ke koncentraci 0,2 ppm a několik transformovaných rostlin tolerovalo dokonce koncentraci 0,5 až 1 ppm. tyto rostliny opět vypadaly normálně a dobře zakořeňovaly v přítomnosti herbicidu. Některé transformované rostliny na počátku zbělely po vystavení herbicidu při výše zmíněných vysokých koncentracích, ale po prodloužené expozici herbicidu progresivně zelenaly a výrazně se zotavovaly.
Skupina zmíněných k herbicidu rezistentních rostlin byla ošetřena známým herbicidem Isoxarlutoiem (tj. 5-cyklopropy-4(2-metylsulfonyl-4-tri ilucrmetylbenzoyl) isoxazol neboli RPA 210772). Tyto rostliny jsou rezistentní k tomuto herbicidu, což jasně ukazuje, že rostliny jsou křížově třídám inhib;
-HPPD.
Přiklad z
Klonování genu GST do rostlinného materiálu a regenerace rostlin rezistentních k herbicidům anilidového a difenyléterového typu byla pěstován pr A Q H u / -7 nos tuny žabáku Nicotiana plumbaginifolia cv. na médiu dle Murashige a Skoog (MS médium: MS soli 4,6 g/1 doplněné 3 % sacharózy a 0,S % bactoagaru, iny, explantáty pro· zakořeňovací pokusy semena byly pěstovány v kultivační místnosti př;
°C se lohodinovou světelnou periodou. Při skleníku byly rostliny přeneseny do kompostu kompost č. 3, Minster Brand Products).
pěstovaní v; (John Inne;
Bakteriální kmeny
E. coli kmen DH5a (GIBCO BRL.) byl: F”, (lacZYAargF)U169, deoR, recAl, endAl, hsdPNl (rK~, mKT), sccEíí, “zhi-cyrbiaQ relAl. Agrobacterium tumefaciens použitý pro transformaci rostlin tabáku byl kmen LBA 4404.
Plazmidy
DNA z GST-27 byla vložena do fagemidu pBluescript® II
SK( + ) velikosti 2,961 kb a označena pIJ21-3A (Jepson et al .
» 0 * · « a
k · * •0 0000 00 0000 • 0 0 · · · « ···· 0 0000 ·· 0 0 0 0 00 0 0 0 0 · · ·· «00 0· ·0·
26 | |||
1994) . pJRlRi | je plazmid | velikosti | 12 |
obsahuje bakte | riální gen | rezistence | ke |
dvě repetitivn | i sekvence | velikosti | 25 |
kb. Plazmid pJRlRi ί ς p :< v e Ϊ-DNA obsahuje markerový gen ý promotorem NOS. Exprese a CaMV 35S oromotorem.
a pravou i Rr sekvence kóc
Kam ri
Stanaaroy (marxery) veuixostu kb žebříček od firmy Bethesda Research Laboratories
Life Technologies, lne. byl použit jako markér velikostí při kontrole štěpení a produktů PCR (polymerázové řetězové reakce) na agarózovém gelu. Pro westernové analýzy byl na polyakrylamidový gel nanesen markér molekulové hmotnosti proteinů Rainbow (Amersham), což vše je odborníkovi známo.
Ostatní chsmikálie
A.k 11 vn i , i jako acetochlor, alachlor a metoíachior byiy produkty firmy ZENECA. A.grochemicals (UK) , Jeallot's Hill Research Station. Technické sloučeniny byly rozpuštěny v etanolu a testovány pomocí HPLC, zakořeňovacích s ioucenunv testu a testu Kurcen:
viz caíe .
Konstrukce plazmidů
Plazmid pIJ21-3A. obsahující DÍLA genu GST-27 byl naštěpen restrikčním enzymeme EcoRI (TA.) pufru. Naštěpení bylo EcoRI fracmenty byly (Pharmacia) v Ix Tris-acetátovém
3.(J3.1?óZOVeiuL CfΘ 1U . (Pharmacia)! místa ověřeno na 0,E povány do Smál plazmidů pJRlRi (obr. 6) po zaplnění přesahujících konců Klenowovcu DNA poiymerázou (Pharamcza) . Ošetření enzymem telecí alklickou fosfatázou (CA.P) zabránilo znovuspojení (selfligaci) pJRlRi před ligováním genu GST. Kompetentní bakterie E. coli (DH5a) byly transformovány plazmidem metodou teplotního šoku a pak byly pěstovány na agarových plotnách s kanamycynem. Pozitivní kolonie byly testovány buďto pomocí PCR nebo hbridizací přes noc ve 42 cC s radioaktivně značenou sondou ( a-~-P dNTP) . Teplota tání (Tm) sondy br nu bázi A nebo - _ . _ Reakce pan probíhala při nejnižší teplo ocívmerázou (Amoli-Taa DNA Polymer součtem 2 °C pro }
Z;
určena oro Kazdou G nebo ím-o o s íaq e, Perkin Elmer Cetus) codie orotokoli vodce.
: dminkv
PCR s 3 5 cykly byl y nastaveny následovně: denaturace DNA při 94 °C 43 sekund, nasednutí primerů oři nejnižší Tm po 1 minutu a prodlužování při 72 °C po 2,5 minuny. Před prvním cyklem byla reakce zahájena při 35 °C.
Bylo vybráno 8 pozitivních kolonií a ty byly pěstovány při 3’ přes noc v třepané kultuře v LB-médiu uícracenzriruu;
iO 009 rpm na cradientu a puriči kován CsCl.
Orientace inzertu v pJRlRi byla ověřena sekvencovánim úseku mezi 35S promotorem a genem GST Sangerovou metodou pomocí Sequenase® (verze 2.0, United Scates Biochemical, Corporation) podle protokolu (pGST-27Bin) (viz obr. 6) byl
Agrobactsrium tumefaciens metodou mrznutí/tání, publikovali Hostlers et al. 1987.
v ý robce. Vý s i e dn ý vnesen do kmenu piazmio
LBA d 4 g4
Transformace listů pomocí Agrobacterium tumefaciens
Transformace pGST-27Bin do tabáku byla provedena postupem, který publikoval Bevan 1984. Pro transformaci byly užity 3 až 4 týdny staré sterilní kultury tabáku (Nicotiana tabaccum cv. Samsun) pěstované na médiu MS. Listy byly po den inkubovány na médiu NBM (tj . médum MS doplněné 1 mg/1 benzylaminopurinem (6-BAP), 0,1 mg/1 naftalenoctovou
0· 0 0«
2S kyselinou (NAA)) s kanamycinem. Toto médium podporuje růst výhonků z listu. Další den byly okraje listu odříznuty a list rozřezán na kousky. Tyto kousky pak byly společně inkubovány se suspenzí buněk Agrobacteriura tumeřaciens (kmen LBA4404) transformovaných plazmidem pJRlRi s inzertem (pGST-273in). Pak byly kousky opět vráceny na médium NBM. Po dvou dnech se explantáty převedly do kultivačních nádob obsahujících NBM médium s karbenicilinem (500 mg/1) a kanamycinem (100 mg/1).
kr ;ku listu přenesen
Po pěti týdnech byl 1 výhonek z každého na NBM médium s karbenicilinem (200 mg/1) a. kanamycinem (100 mg/1) . Po dalších 2 až 3 týdnech byly výhonky s kořeny přeneseny do čerstvého média. Dva kousky z každého výhonku bylo umístěno do samostatných kultivačních nádobek. .Jeden byi udržován jako zásobní tkáňová kultura a druhý byl po zakořenění přesazen do půdy ve skleníku. Do skleníku tak bylo přeneseno- 4 2 nezávisíte
COT-Ot.
Extrakce listové DNA. pro PCR
Přítomnost transgenu v předpokládaných transformovaných rostlinách (trans formantech) se ověřovala pomocí PCR. Ze 3 až 4 týdny starých rostlin pěstovaných ve sterilních podmínkách se odebraly vzorky listů, Listové terčíky o průměru 5 mm byly rozdrceny 30 sekund ve 200 pil extrakčního pufru (0,5% dodecylsulfát sodný(SDS), 250mM NaCl, lOOmMI Tris-HCl, pH 8) . Vzorky byly 5 minut stočeny při 13 000 rpm a pak bylo přidáno i tn ou lu isoorooa anolu ke žernu h ií fáze. Vzc byly ponechány na ledu 10 minut a pak stočeny 10 minut při
000 rpm a ponechány oschnout. Pak byly resuspendovány ve
100 μί deionizované vody a 15 μί vzorku pak bylo užito pro
PCR. PCR byla provedena ve stejných podmínkách jak popsali
Jepson et al. (1991) . Rostliny transformované DNA GST-27 byly • ft · analyzovány pomocí primem GST ii/7 (AAGAAAGGTGGCGCAGTT, sekvence id. č. 10) specifického pro 3'-konec úseku GST-27 a primerů NOS3 (CATCGCAAGACCGGCAACAG, sekvence id. č. 11) soecifického oro NGS terminátor. 39 ze 42 primárních istormant poskytlo v PCR produkt velikosti 310 bp.
Analýza westernovými přenosem
Pro ověření heterolcgní exprese GST-27 v tabáku byla provedena analýza westernovým přenosem. 120 mg listového starých rostlin pěstovaných z 3 až 4 týdny v sterilních podmínkách bylo polyvinyipyrolidonu (PVP), rozdrceno ve 4 C v 0,06 g který absorboval fenolické sloučeniny, a 0,5 ml extrakčního pufru (1M Tris-HCl, 0,5M EDTA. (etylendiamintetraacetát), 5mM DTT (dithiotreitol), pH 7,8) . Pak bylo přidáno dalších 200 μΐ extrakčního pufru. Vzorky byly promíchány a stočeny 15 minut ve 4°C. Supernatant byl odstraněn, koncentrace proteinu byla stanovena Bradfordovým testem pomocí BSA jako standardu. Vzorky byly až do dalšího· upotřebení uloženy v -70 °C.
Vzorky 5 ,u.g proteinu s 33% (objem.) Laemmiiho barvicího roztoku (97,5¾ 10 % (hmo t./ob j em)
1,5 % ovronin a
Tris-HCl,
Laemmiiho pufr (62,6mM sacharózy, 2% (hmot./objem) SDS, pH 1% merkaptoetanol) byly naneseny na SDSpolyakrylamidový gel (17,7%, 30:0,174 akrylamid:bisakrylamid) po 2 minutách vaření. Proteinové extrakty byly separovány elektrcforézou v pufru (14,4% (hmot./objem) glycin,
1% (hmot./objem) SDS, 3% (hmot./objem) TrisBase)
Pak byl' nit roce ruio;
vou memor· (Hybcnd-C, Amersham) pomocí elektroblotovacíno zařízení (Biorad Unit) v pufru (14,4% (hmot./objem) glycin, 3% (hmot./objem) TrisBase,
0,2% (hmot./ob j em) SDS, 20% (objem. ) metanol) při 40 mV přes noc. Zda bylo naneseno stejné množství proteinu ve všech • · ·« vzorcích bylo kontrolováno barvením. čerstvě přenesených vzorků na membráně v roztoku 0,05% CPTS (sodná sůl měďftalckyanincetrasulfonové kyseliny) a 12mM HCl. Membrána pak byla odbarvena oplachováním 2x až 3x ve 12mM HCl a nadbytek barvy bvl odstraněn promvváním v roztoku 0,5'M NaHCO; po 5 až minus a rak b y i v b 1 o k o v á n y Tris-HCl, S nou vodou. Membrány p;
1, soro
BSA.
i TBS-Tween (hmot./objem) NaCl, 5% Tween 20 urát), pH 7,6) obsahujícím 5% hodinu v byly promývány 2 minut (hmot./obj em) póly x yetylen(hmot./obj em) v TBS-Tween s 2% (hmot./objem) BSA. Nepřímá imunodetekce byla provedena s ovčím antisérem GST-27 v ředění 1:2000 jako první protilátkou a králičím anti-ovčím antisérem v ředění 1:1000 jako druhou protilátkou, spojenou s křenovou peroxidázou bytek antiséra byl opláchnut
Detekce
Jakýkoliv nad (hmot./objem) chemiluminiscence) (Amersham).
ΌΓΟΙΐΐνν έΓιΙΓΓι ΙΠβ-!ΐΌ2ΓέΠ*/ V
Stanovení úrovně exprese genu GST bylo provedeno pomocí laserového densitometru LKB (Pharmacia). Westernová analýza (HRP s 2%
BSA.
se provádě mo-i ween pomocí ECL 'enhanced postupem dle výrobce odstraněno dodatečným
2222-020 Ultroscan XL vedla k identifikaci δ pro ce mu,
ich trans formant | pozitivních | v | PCR, které nevykazovaly |
expresi GST-27. | Zbýváj ících | 31 | trans formant vykazovalo |
exprese, která | byla v rožne | zí | od sotva detekovátelné |
velmi vysokou | v rozsahu 1 | % | celkového rozpustného |
u, c o z b y 1 o | stanoveno | s | rovnáním se signálem |
anvm u vzorku čistého GST li | 2 | kukuřice. |
Analýza Southernovým přenosem
Vzorec integrace transgenu byl ověřován Southernovou analýzou. Z rostlin tabáku pěstovaných ve skleníku bylo ·· · · • · · · · odebráno 2,5 g pletiva z listu, ' které bylo umístěno do plastického sáčku obsahujícího extrakční pufr (0,35M sorbit, O,1M Tris-HCl, 0,005M EDTA, 0,02M disiřičitan sodný, pH 7,5) a vymačkáno protažením strojkem na těstoviny. Takto získané extrakty pak byly stočeny 5 minut při 60 00 rpm při teplotě místnosti. Po slití supernatantu byl
300 μΐ extrakčního pufru a 300 Lil pufru (2-d (hmot./objem) CTAB, 0,2M
2M NaCl, pH 7,5). Pak se přidalo 120 μί 5% sarkosvlu a vzorky byly vloženy na 15 minut do vodní lázně s teplotou 65 °C.
Extrakty pak byly po přidání 600 ml směsi chloroform:isoamylalkohol 24:1 stočeny 5 minut při 6000 rpm. 700 μί isopropanolu pak bylo přidáno ke stejnému objemu iJA jaoerneno fyzovaomo Tris-HCl, 0,05M EDTA,
supernatancu a | točeno dalších 1 | 0 minut | při 13 000 rpm. Pelet |
byl opláchnut | 70% etánolem a | usušen | na vzduchu. Pak byl |
ponechán přes | noc rozpouštět ve | 4°V ve | 3 0 μί TE (iQmM Tris- |
HCI, ImM EDTA) | a resuspendován. | Vzor kyz | bylyz až do upotřebení |
uchovávány při 20 °C.
Celková liscova DNm z extraucu rostlm obsahujicicn gen GST-27 byla štěpena 6 hodin ve 37 °C restrikčními enzymy Sací a Xbal v pufru lx Phor-one-al1 (20mM Tris-octan, 20 mM octan hořečnatý, lOOmM octan draselný, Pharmacia) . DNA pak byla rozdělena na 0,8% agarózovém gelu, denaturována 30 minut za současného jemného třepání v 0,5M NaOH a 1, 5M NaCl a pak byl gel neutralizován 75 minut třepáním v 0,5M Tris-HCl a 1, 5M NaCl. DNA byla přenesena r.a nylonovou membránu
Hybond-N (Amersham) Domočí kacilárního ořenosu ve 20x :SC (3M NaCl, 0,3M citrát sodný)
DNA cvia rixovana na memoranu jtrtagene) a pečení kombinací UV záření (UV Strataiinker, minut při 80 °C. Sondy byly/ vystřiženy pomocí EcoRI z plazmidu použitého pro transformaci Agrobacierium tumefaciers obsahujícícho gen GST-27. Sonda byla označena • · · · · · • · • · · · • · · ·· · ·· ····
a-'“P dNTP' (3000 Ci/mM) pomocí soupravy Prime-a-Gen ÍP | romega) | ||
postupem náhodných | primerů podle | Feinberga a Vogel | sterna. |
Pozitivní kontrola | byla připravena | štěpením plJ21-3A | enzymy |
Sací a EcoRI. | |||
Prehybridizace | probíhala v 5x | SSPE (0,9M NaCl, | 0, 0 5M |
fosofrečnan sodný, | 0,005 EDTA, | pH 7,7), 0,5* | b L·' O f |
1* (hmot./objem) Marvel (sušené mléko v prášku), 200 ug/mi DMA lososího spermatu denaturovaná 3 až 4 hodiny v 65 °C. Hybridizace probíhala ve stejném pufru s vynechanou poslední složkou. Membrány pak byly promývány 30 minut v 65 °C ve 3x SSC, 0,5% SDS a dvakrát 20 minut v lx SSC, 0,1% SDS před tím, než byla provedena autoradiografie v -70 °C.
Analýza HPLC
Pro ověření toho, zda transgenní rostliny exprimující GST-27 mají GST aktivitu proti herbicidovým substrátům, byly provedeny testy in vitrc pomocí HPLC. Ze 3 až 4 měsíce starých kvetoucích rostlin tabáku pěstovaných ve skleníku byl odebrán 1 g listového pletiva, rozdrcen v kapalném dusíku a 7 ml extrakčního pufru (50mM glycyiglycin, 0,5mM EDTA, ImM DTT, pK 7,5) . Extrakty byly přeneseny do centr!fugační zkumavky obsahující 0,1 g PVP a pak centr!fugovány 30 minut při 16 500 rpm ve 4°C. 2,5 ml supernatantu bylo naneseno na kolonku (PD10) se Sephadexem G-25 (Pharmacia) a eluováno 3,5 ml pufru s fosforečnanem sodným (50mM, pH 7,0) obsahujícím ImM EDTA a ImM DTT. Stanovení proteinu bylo provedeno Bradfordovou metodou s BSA jako standardem. Extrakty byly rozděleny na alikvotní části a uschovány až do upotřebení při -70 °C.
Analýzy HPLC byly prováděny na kolonách Spherisorb
5μ ODS2 (25 cm x 4,6 mm vnitřní průměr, výrobce Hichrom) směsí acetonitril: 1% vodná kyselina fosforečná 65:35 jako
m.' rvi ·· ···· • · · · • · · ·· · ml/min. Sloučeniny byly detektorem UV detektorem LC-βΑ Schimadzu (vlnová délka 200 nm).
Reakce byly prováděny v 0,8ml HPLC viálkách při teplotě místnosti (20 až 25 °C) . 15 až 94 % (objem.) rostlinného e přidalo k fosfátovému pufru (pH7) s SmM i nebo homogiusat hionem a 2 až 20 ppm příslušné sloučeniny (2 ppm fluordifenu nebo 20 ppm acetochloru, a metolachloru). Kontroly byly připraveny se oměry až na to, že rostlinné extrakty byly stej nymi nahrazeny fosfátovým pufrem.
Reakce byla zahájena přidáním herbicidu použitého jako substrát. Reaktivita sloučeniny byla sledována po dobu 9 až 19 hodin. Specifický retenční čas a plochy vrcholů byly počítány pomocí programu JCL 6000 systém chromatography data chromatomraíickvch da paokage pro zpracování
Jonesova cnromatocrariei .
‘ro Kazaou sloučeninu se měřila plocha vrcholu HPLC vs. časový pi ní ž i:
iových bodů. Poloos rychlostní konstanta získány z exponenciálníh proložení gované plochy vrcholů vs. čas. Tato data byla zpracovávána programovým, balíkem FIT verze 2.01.
Pomocí tohoto postupu popsaného výše byla hodnocena akrivita GST transformovaných rostlin proti různým herbicidům jako substrátu. Testované herbicidy byly 3 dichloracteanilidy pseuao;
bodů kcri rocníor, alachlor metolachlor) di fenyléter fluordifen) . Tyto látky jsou známy tím, že jsou konjugovány s glutatnionem, zvláště prováděly v přícomnosti dichloracetanilidy. Extrakce se PVPP a při nízké teplotě, aby se omezila denaturace proteinů. Studie stability GST ukázala,že aktivita GST kukuřice se snížila o 73 % v hrubém extraktu, když byl uchován při -20 °C. Proto byly extrakty rozděleny do alikvotních částí a až do upotřebení uchovávány při -70 °C.
• ·
každý vzorek byl rozmražen pouze jednou, a to přes noc a na ledu. Všechny testy byly provedeny do 2 týdnu od přípravy extraktů.
Koncentrace herbicidu v HPLC viálkách byla nastavena podle jejich rozpustnosti. Acetochlor, alachlor a metolachlor byly testovány při 2Q ppm a fluordiřen při 2 ppm. Test probíhal 9 až 19 hodin v závislosti na reaktivitě herbicidu. Metolachlor byl testován delší dobu, protože má v cěohto podmínkách vysoký poločas. Detekce sloučenin se prováděla UV detektorem při 200 nm. Specifický retenční čas a plochy vrcholů byly měřeny pro každý herbicid. Aktivita G5T se určovala na základě 7 až 11 časových bodů. Enzymatická konjugace následovala po exponenciálním snížení křivky.
Snížení plochy vrcholu u testovaného herbicidu bylo použito k výpočtu aktivity GST. Byly také vypočítány hodnoty poločasu a rychlostní konstantv prvního řádu.
Bylo testováno pět linií tabáku včetně divokého typu 'npfTďtivní konC roku meidliVlii KUUclOiai , i 17. Tvto linie linie GST-27 označované 5, 6, 12 yly vybrány na základě výsledků westernové analýzy ukazujících na jejich vysokou expresi. Aby se zabránilo rychlé konjugaci ještě před vlastní sledováním, byl herbicid přidán jako poslední. GST-27 linie č.17 byla testována také na konjugaci acetochloru a homoglutathionu. Výsledky jsou uvedeny na obr. 7 a ukazují, že rostliny exprimující GST-27 mají chloracetanilidovým herbicidům in vitro.
Stručně lze shrnout, že transgenní .n GST-27 a ryto rostliny j :lativní aktivity aktivitu proti rostliny tabáku tuC Σ Ω. Θ 00—1313 Π3 in vitro expnmuj i pro základě jejich pro ci herbicidovému substrátu.
000 • ·
Analýzy -in vivo - zakořeňovací testy
U linií GST-27 byla prokázána významná aktivita proti nejméně 3 chloracetani1idúm. .Avšak většina herbicidů této třídy je známa tím, že inhibuje prodlužování kořenů. Bylo proto rozhodnuto provést zakořeňovací testy pro acetochlor, alachlor a metolachlor.
Byla připravena pilotní studie k tomu, aby se zjistily acncen l ivl
5, 10, 20, 40 a 100 ppm. Dvě transformované linie (GST-27 č. 6 a 17)a .tabák divokého typu byly testovány s alachlorem. Linie 6 a 17 byly vybrány proto, že představují rostliny s nejnižší a nejvyšší expresí, jak lze soudit -na základě westernové analýzy. Tři explantáty, setávající z listu a kousku výhonku, byly přeneseny na médium MS doplněné herbicidem. Růst kořenů byl pozorován po 2 týdny (obr. 3) .
typu již od koncentrace 1 ppm, neboť listy jsou menší a žlutější. Se zvyšující se koncentrací je účinek zřetelnější a snižuje se počet nových listů. Od koncentrace 10 ppm nové listy. Naoroti tomu rostliny u transf nevytvai zrnovaných i vuoec . i n i i je ucmex neroiciou pozcz teprve od koncentrace 20 ppm oro linii 2 od ppm pro linii 6. V rozmezí těchto koncentrací jsou listy menší a jejich počet je snížen, ale jsou stále zelené. Za druhé, rostliny divokého typu vytvářejí alespoň nějaké kořeny do koncentrace 5 ppm, ale už v rozmezí 0 až 5 ppm se dramaticky snižuje jejich délka. Pokud jde o linie 2 a 6, ty vytvářejí kořeny až do koncentrace 10 ppm (linie 2) a 20 ppm (5) , přičemž se snižuje jejich délka. Za těchto podmínek po 2 týdnech sledování lze pozorovat, že koncentrace omezující zakořeňování leží mezi 20 a 40 ppm pro nejlepší linii testovanou v tomto stadiu pokusu.
• fc fcfcfcfc • · · • · · · · • · · • · · • β fcfcfc ·· fcfcfc · ·· ·· • fcfc · · · · • · · · * · fcfc · • · · · ······ • · · . · ·
9· fcfcfc ··
Následující pokus byl připraven pro rostliny divokého uypu (kontrola), 4 linie GST-27 (linie č. 5, 6, 12 a 17; .
Tyto rostliny byly testovány na acetochloru, alachloru a metolachloru v koncentracích 0, 10, 20 a 40 ppm pro acetochlor a metolachlor, a 0, 10, 40 a 100 ppm pro alachlor.
Tyto koncentrace byly vybrány proto, že při analýze HPLC rostliny vykazovaly nejnižší aktivitu proti acetochloru a me tolaehloru. Jinak pokus probíhal ve stejných podmínkách; 3 explantáty pro každou linii a pro každou koncentraci byly přeneseny na médium MS s herbicidem. Pozorování kořenů probíhalo po 3 týdny od zahájení pokusu.
Co se týče pilotní studie, odpověď explantátú v každé nádobě byla obecně uniformní. Na acetochloru explantáty divokého typu nejevily žádné zakořeňování ani nevytvářely nové listy v přítomnosti herbicidu. Ale linie 6 a 17 vytvořily několik kořenů a také malé listy při koncentracícn 10 a 20 ppm. Linie 5 a 12 nebyly tak rezistentní jako předchozí dvě linie. Na alachloru explantáty divokého typu nevytvářely při testovaných koncentracích žádné kořeny, ale při koncentraci 20 ppm vytvořily několik listů. Linie 6 a 17 vytvářely kořeny až do koncentrace 40 ppm, přičemž kořeny byly zcela neovlivněny herbicidem. Počet kořenů se zdál nižší s rostoucí koncentrací herbicidu. Pro tyto linie byla za daných podmínek koncentrace omezující zakořeňování mezi 40 a 100 ppm po 3 týdnech. Linie 9 a 16 nevytvářely žádné kořeny a jen velmi malé lístky na 20 a 40 ppm herbicidu. Na metolachloru rostliny tabáku divokého typu vytvářely pouze několik malých kořínků v koncentraci 10 a 20 ppm. Linie 6 a 17 vytvářely krátké kořeny, ale ne tolik kolik vytvářely na alachloru. Pro tento herbicid byla koncentrace omezující zakořeňování mezi 20 a 40 ppm pro linii 6 a více než 40 ppm pro Imi 17.
·· ··«» ·♦ ···· • · • ··· • · · • · · ·· ···
Ošetření rostlin herbicidem
Pro demonstraci toho, že transgenní rostliny exprimující GST-27 nesou rezistenci k působeni herbicidu, byly ve skleníku provedeny pokusy s pre-emergentmím a postemergentním ošetřením herbicidem.
Pre-emergentní testy byly zahájeny vysetím asi 50 semen od každé linie pro každou tescovanou koncentraci herbicidu do písku (25 % prosáté hlíny, 75 % hrubého písku, pomalu se
Koncentr via pr:
1 V tť ku. tr í i d
i. Herbicid
0,3 00 a 3 50 g/ha) formulovaný
5%
JF5969 (905, 6 g/Icyklohexanon, 33,33 g/1 synperonic NPE 1300 a 16,7 g/1 Tween 85) byl aplikován pomocí rozprašovače na plata s osivem. Osivo bylo ponecháno ve skleníku a klíčení bylo hodnoceno po 3 týdnech. Výsledky pro alachlor ukázaly, že transgenní rostliny jsou rezistentní k pre-emergentní aplikaci herbicidu. Podobné výsledky byly získány pro acetochlor, metoiachlor a EPTC (12 000 g /ha).
Post-emergentní testy byly provedeny vysetím 28 semen Dro . každou, linii a cro každý herbicid do kompostové oudy. Po 16 dnech byly tabákové rostlinky (asi 1 cm vysoké) postříkány alachlorem formulovaným, v 5i JF5969 pomocí postřikovače.
Poškození rostlin bylo hodnocen·:
ován v
PO xaci a sice byla hodnocena velikost rostliny, výskyt nekróz, stav vzrostného vrcholu a morfologie listů ve srovnání s neošetřenou kontrolou. Ve výsledném hodnocení skóre 100 % znamená, že rostlina je herbicidem zcela zahubena, a skóre 0 % znamená, že rostlina je podobná neošetřené kontrole. Post-emergentní výsledky pro alachlor ukázaly, že- transgenní rostliny jsou rezistentní k tomuto herbicidu. Míra poškození rostlin divokého typu a segregující linie GST-27 po aplikaci metolachloru v dávce 1400 g/ha je graficky znázorněna na obr. 9. Obdobné studie byly provedeny neroi du postřikem, ·· a··· ·· ···· > . a a a aaa a a aaaa » a a aa ··· a a a aaa aa aa i a < a > a a a a a aaa aaa a a aa a* také s žcscocíiiorea v aavc výsledkům.
2000 cj / a vealy k
Příklad
Klonování genu rezistence ke glyphosatu do materiálu a příprava r·; Přehled kazet a s' jstlin rezistentních ke glyphosatu /ecifických konstruktů pro transřormac costiin je uv ;p Al 536330.
in na oorazci
Evropské patentové přihlášce obsahuj ící kontrolní plazmid (GOX) fúzovaný vektor č. 1 pro dvouděložné rostliny
č. 1 je konstitutivní gen glyphosatoxidázy s chloroplastovou (CTP) transitní sekvencí 1 genu pro Rubisco z Arabidopsis tkaliana řízený zesíleným promotorem CaMV 353. Konstrukt obsahuje translační kóduzící sekvence
zesilovač | (enhancer) | Omega |
CTP. Ve | ktor č. 1 | u z i v a |
•GCX je | synteti zovár | i o o d 1 e |
álezu WO | 92/00377 s | tím, že |
1 místa | pro Ncol | v místě |
xonce terminátor NOS. Konstruk sekvence popsané v přihlá jsou doplněna další re: translačního počátku ATG a místo KpnI na 3'-konci. Vniuřní místa Sphl a Ncol byla během syntézy odstraněna, aniž by došlo ke změně izolována jako sekvence proteinu. Sekvence CTP-GOX byla Ncol-Kpnl fragment a ligována užitím standardních, v oboru známých, technik do plazmidů pMJBl naštěpeného Ncol a KpnI, což je plazmid založený na plazmidů pIBT211 obsahující CaMV 353 promotor se zdvojeným enhancerem napojený na zesilovací translační sekvenci z viru mozaiky tabáku, kzerá nahrazuje netranslatovanou 5'-koncovou vedoucí sekvenci viru skvrnitosti tabáku, a je ukončený terminátorem
NOS .
« · · · · · • · · · • · • ·
Kazeta obsahující konstrukt zesílený promotor CaMV 35S
Omecra - CTP-GOX - Nos byla izolován;
ar;
fragment' HindiII-EcoRI a ligována transformačního vektoru odvozeného HindlII a EcoRI.
do plazmidu pjRlRi, z pBini 9, naštěpeného
Vektor č. 2 pro dvouděložné rostlin
Gen
UP ť )PSPS nv s chloroplastovým transitním peptidem z petúnie byl připraven podle sekvence popsané v přihlášce vynálezu WO92,/04449 s místem Ncol v počátku translace ATG. Vniřní místo Sphl je umlčeno, aniž by došlo ke změně sekvence proteinu. Fragment obsahující syntetickou sekvenci CTP-EPSP5 byl izolován jako NcoI-SacI fragment a byl ligován do pMJBl. Sekvence byla
Véna do plazmidu tak.
ii exprese ie řízena zesnenvm.
promotorem CaMV 35S a terminátorem NOS s Omega fragmentem umístěnými na 5'-konci protein kódujícího úseku, a byla izolována jako EcoRI-HindlI fragment, který pak byl klonován do pJRlRi, čímž vznikl vektor č. 2.
Vektor č. 3 pro dvouděložná rostliny
Kontrolní vektor s geny EPSPS a GOX byl konstruován tak, že se vektor č. 2 pro dvouděložné rostliny naštěpil EcoRI a vložil se do něho linker (spojovací člen) EcoRI-Sphl-EcoRI. tento vektor se pak štěpil Sphl, aby se uvolnila kazeta (3), která byla klována do místa Sphl vektoru č. 1 směrem k 5'-konci od promotoru, čímž vznikl vektor pDV3puc (obr. 9). Kódující úseky, včetně promotorů a terminátorů odvozených z vektorů č. 1 a 2 pak byly vystřiženy z pDV3puc jako HindiII-EcoRI fragment a klonovány do oJRlRi.
Plazmid pDV3 v binárním vektoru pjRlRi byl vnesen do zprostředkované tabáku prostřednictvím transformace
Agrobactaríum tumafacíers v oboru známým způsobem. Z kalusu z takto transformovaného materiálu bylo získáno 270 výhonku a z nich 77 zakořenilo. Pro potvrzení přítomnosti genů EPSPS a GOX v zakořeněných výhoncích byly extrakty DNA z rostlin transformovaných pDV3 analyzovány pomocí PCR s následujícími primery:
3'-konec genu EPSPS:
'TCO CA.
5'-konec aenu GOX:
;ps:
12,
AAT C AAG G T AA.C CTT G AA.T:
sekvence id. č. 13, GOX1)
Reakce PCR poskytla pás velikosti 1,1 kb, pokud byly oba geny přítomny. Pro potvrzení funkčnosti genu tolerance ke glyphosatu v pDV3 byly explantáty přeneseny na MS médium obsahující 0,01mM a 0,05mM glyphosat. Rostliny byly hodnoceny
ΌΟ dvou rvanecn ;a oreneseni meaium a -a.
Rezistentní linie, které úspěšně rostly na médiu obsahujícím herbicid, byly analyzovány pomocí westernového přenosu užitím králičího antiséra proti purifikovaným GOX a EPSPS.
Z kaž | dé | primární trar | isformanry byla | θ X ~ r* y b o V 3 Π 3 11 S r 0 V 3 |
DNA. a po už | i y | a v PCR reakci | pro potvrzení | přítomnosti vektoru. |
Westernov | A Π | anaiyza o v1a | provedena na | každé pDV3 rostlině |
pozitivní | V | PCR, aby se | potvrdila hete | rolcgní exprese GOX |
a EPSPS, | 3 | sice metodou | popsanou již | v předchozím textu. |
Rostliny | S | vysokou hladinou exprese | byly samosprášeny |
a semena pak byla podrobena screeningu na kanamycinových plotnách. Rostliny s jediným. lokusem byly uchovány pro přípravu homozygotů. Údaje potvrzující, ze rostlinv transformované konstruktem pDV3 jsou rezistentní ke glyphosatu, jsou uvedeny v příkladu 8.
• · ·
9 9···
4 4 · · · • · · · » · 4 44 4
4 4 4 4 4 ·
4 4 4 4 ·
4 44 4 * * ···
Příklad 5
Příprava rostlin rezistentních k herbicidům anilidového a glypnosatu
Pyl heterozygotnícn a homozygotních linií tabáku exprimujicich GOX a EPSPS byl přenesen na homozygotní linií žabáku exprimující GST-27. Semena vzniklá z tohoto křížení byla vyseta a listový materiál byl pak použit na weszernovou analýzu, jak bylo již dříve popsáno. Proteinové extrakty z rostlin pozitivních ve westernové analýze pak byly testovány protilátkami GOX/EPSPS, aby se selektovala linie exprimující jak GS'T-27, GOX tak i EPSPS. Tyto linie pak byly užity pro pre-emergentní postřiky acetochlorem, alachlorem a metolachlorem a EPTC. Následně byly rostliny stříkány post-emergentně formulovaným?, g]yphosatem.
typu
Příklad 6
Příprava rostlin, anilidového zak i ocvlením kzeré jsou glyphcsaZov;
rezistentní k herbicidům o typu, způsobem bez kř(
Vekzor pDV3puc byl štěpen EcoRI, extrahován chloroformem a precipitován. Linker delta EcoRI-HindiII-EcoRI MK0L3 (5 dáATTACGGAAGCTTCCGT 3' , sekvence id. č. 14) byl· zahřát na 73 °C a ponechán chladnout na teplotu místnosti, aby došlo k samospojení. Spojený (tj. dvouřetězcový) linker byl ligován do pDV3puc naštěpeného EcoRI. Domnělé rekombinanty byly testovány s koncově značeným oligonukleotidem MK0L3. Plazmidová DNA byla izolována z pozitivně hybridi zujících kolonií. Restrikční štěpení HindlII vedlo k uvolnění fragmentu velikosti 5,4 kb obsahujícího konstrukt 0mega-CTP2EPSPS-NOS, jehož exprese je řízena CaMV 35S promotorem, fc · • fcfcfc ehož expre;
byl klonován do plazmidů a defosforylovaného CÍP.
pomocí sondy z inzertu.
10) byl ověřen vhodným • · fcfcfc • r ··· · ·« • ♦ « • fc fc* a konstrukt Omega-CTPl-GOX-NOS,
35S promotorem. Tento fragment pGST-27Bin naštěpeného HindlII Rekombinanty byly selektovány
Výsledný vektor pDV6-Bin (obr. sekvencováním. Výsledný plazmid byl transformován do tabáku prostřednictvím Agrobacterium tumefaciens známým způsobem. Po transformaci bylo získáno 270 výhonků, z nichž 80 zakořenilo.
Z každé primární trans formanty byla extrahována listová DNA a použita v PCR reakci pro potvrzení přítomnosti protein kódujícího úseku vektoru. Pro PCR byly užity primery uvedené výše (sekvence id. č. 12 a 13) . P;
potvrzení funkčno st i transgenu byly primární trans formanty pDV6 hodnoceny na médiu obsahujícím 0, 0, OlmNI a 0,05mM glypnosat a 10 ppm a 40 ppm alachloru. Značný počet transgenních rostlin úspěšně rostl na obou médiích v podmínkách, kdy kontrola divokého typu nerostla. Westernová” analýza byla provedena na každé pDV3 rostlině pozitivní v PCR, aby se potvrdila heterologní exprese GOX, EPSPS a GST-27, extu. Tyto líni;
S mg tou popsanou p a k b y1y užity pro p r e YLL — im emergentní postřiky acetcchiorem, alachlorem a metolachlorem a EPTC. Následně byly rostliny stříkány post-emergentně formulovaný glvphosatem.
Tabulka i uvedená dále ukazuje údaje o pre- a postherbicidním ošetření rostlin pDV6, tj.rostlin exprimujících jak gen rezistence ke glyphosatu tak i GST. Horní část tabulky ukazuje dávky, ve kterých byl herbicid aplikován preemergentně a následný pokračující stav bez post-emergentní aplikace herbicidu. Dolní polovina tabulky ukazuje poškození způsobené po aplikaci glyphosatu v dávce 800 g/ha. Spodní tabulka ukazuje opakovaná skóre poškození vlivem postemergentní aplikace glyphosatu na rostlinách, které nebyly
4?
vystaveny pre-emergentnímu ošetřeni. Vsecnna opanovaní na rostlinách divokého typu dávala shodné výsledky, zatímco výsledky opakování s transgenními rostlinami odrážely skutečnost, že šlo o segregující populaci, tj. azygctní rostliny, které neexprimcvaly transgen, byly schopny projít testem post-emergentního postřiku.
Průměrné hodnoty pro post-emergentní aplikaci herbicidu
emergenoní | Pre-emergentní aplikace | % fytotoxicity | ||||
uátka | DgV“ ka | Látka | Dávka | pDV6 X o | pDV6 č . 7 1 | Divo ký syp |
Žádná | Žádná | - | 0 | j | n v | |
-Acetochlor | 50 | 0 | 0 | - | ||
Metolachlor | 300 | 0 | 0 | - | ||
Alachlor | 4 00 | 0 | 0 | - | ||
Diae t en am a ó | 5 0 | 0 | 0 | - | ||
C' / k l· G á t | 5 0 0 0 | 0 | 0 | - | ||
EDTC | 50 0 0 | 0 | 0 | - | ||
Bayer FOE 5043 | 5 0 | 0 | 0 | - | ||
T e t r a z o 1 i no n | 200 | - | 0 | |||
glyphošat | 8 0 0 | Žádná | - | 13,75 | 4 3,75 | 36, 25 |
360 g/i | -Acetochlor | 50 | 0 | 0 | - | |
Metolachlor | 300 | 0 | 0 | - | ||
Alachlor | 400 | 0 | 0 | - | ||
Dimetenamid | 50 | 0 | 0 | - | ||
Cykloát | 5000 | 0 | 0 | - | ||
EPTC | 5000 | 0 | 0 | - | ||
Bayer EOE 5043 | 50 | 0 | p | |||
Tetrazolinon | 2 00 | - | 0 | - |
• · 9 · φ · · 999 99« • ··· · · *
9·Φ ·· ··· ·· ··
pQS t — 6ΓΠ.ΘΓCí6ΓΪtni aplikace | Pre-emergentní aplikace | |||||
Látka | Dávka | Látka | 3. | b | c | d |
glyphosat | 800 | Žádná | 75 | 0 | 0 | 0 |
100 | 0 | 0 | 95 | |||
90 | 90 | 90 | 75 |
FOE5043 ie oxyacetamid známý iako' fluthiamid.
Příklad 7
Příprava kukuřice rezistentní i glyphošatového typu
Vektor pro transformaci k herbicidům anilidového jednoděložných rostlin (kukuřice, pšenice), který obsahuje gen GST-27 udělující rezistenci k pre-emergentním herbicidům, a fosfinotricinacetyltransferázu (PAT) emergentnímu herbicidu udělující rezistenci k pos· giurosmatu, bvl przoraven následujícím způsobem: 1. krok: pilBl
-a 2 ivextor odvozeny ubichitznovy promotor a intron z kukuřice) byl naštěpen (viz obr. 11) HindlII. Do takto vzniklé mezery byl vložen linker (5 'AGCTTGTACA.CCGGTGTACA3 ' , sekvence id.č. 15) . Výsledkem byl rekombinantní vektor označený pTJB2 .
2. krok: cDNA pro GST-27 byla vystřižena z pIJ21-3A pomocí KpnI a BamHI a klonována do pUB2 naštěpeného KpnI
Hindi11-AgeI-HindiI:
z pUC obsahující amHI, čímž vznikl pUB3.
3. krok: Linker Kpnl-Pacl-Kpnl (5CGGACAATTAATTGTCCGGTAC3', dvouřetězcovou DNA) a pak klonován do pUB3 naštěpeného KpnI, čímž se vytvořil pUB4.
sekvence id. č.
16' byl sám spojen (tj . vytvořil • · • · · · • · · · ·· · · · ·· ·· • · · • · · • · · · · · » · «· ··
4. krok: Terminátor NOS byly izolován jako Smál fragment z pIE937 (obr. 12) a s tupými konci klonován bo pUB4 naštěpeného EcoRV, čímž vznikl pUB5. Orientace terminátoru NOS v pUB5 byla potvrzena štěpením pomocí EoRI a BamHI. Všechna místa spojů byla sekvencována pro potvrzení správného vložení jednotlivých složek konstruktu.
5. krok: Kazeta ubichitin-GST-27-NGS přítomná v pUB5 byla vyjmuta štěpením Agel a PacI a klonována do ampicilin minus vektoru pIGPAT (obr. 13), který obsahuje gen PAT řízený promotorem 35S CaMV. Rekombinanty se detekovaly hybridizací kolonií s EcoRI cDNA. inzertem z pIJ21-3A. Rekombinanty byly orientovány pomocí štěpení Ncol a byl tak vytvořen vektor pCATlO (obr. 14).
6. krok: Kazeta 35S-PA.T-NOS byla odstraněna štěpením A.scI a kazeta AscI ubichitin-P.AT-NOS z pPUN14 byla vložena, čímž vznikl pC.ATll (obr. 15) . pCATll byl transformován do pšenice a kukuřice odborníkovi známými metodami pomocí mikrovláken a ostřelování mikročásticemi. Buňky pak byly přeneseny do média obsahujícího bialofos pro selekci kalusů, které exprimují gen PAT. Kalusy rostoucí ne médiu obsahujícím tento herbicid pak byly testovány pomocí PCR ušitím následujících primerů (sekvence id. č. 33 a 34) pro potvrzení přítomnosti genu GST-27 v kalusu:
5'CCAACAAGGTGGCGCAGTTCA 3'(sekvence id.č. 33) 'CATCGCAAG.ACCGGCAA.CAG 3' (sekvence id. č.34).
Kalusy obsahující expresní kazetu GST-27 byly přeneseny na regenerační médium, kde byly získány rostliny kukuřice. Transformované rostliny kukuřice byly ověřeny, a sice westernovou analýzou celkového proteinu, že konstitutivně exprimují vysokou hladinu genu GST. Pyl těchto rostlin byl přenesen na elitní inbrední linii kukuřice a z tohoto křížení byla získána semena. Pro potvrzení zvýšené tolerance rostlin • · ·· · · > · ·
I · · · · k herbicidu acetochloru byla uvedená semena vyseta do půdy, do které bylo aplikováno mezi 2000 a 8000 g/ha herbicidu. Po vyklíčení a po 7 dnech růstu jsou vzorky semenáčků hodnoceny, jaká mají (pokud vůbec) poškození v důsledku herbicidu ve srovnání se semenáčky z vyrostlých z netransgenního osiva za stejných podmínek. Transgenní semenáčky a netransgenní kontrolní semenáčky pěstované v půdě ošetřené herbicidem a příslušnou zabezpečovací látkou vykazují velmi malé poškození, pokud vůbec, zatímco netransgenní semenáčky pěstované v půdě obsahující herbicid bez zabezpečovací látky vykazují velmi podstatné poškození. Semenáčky, které přežily první aplikaci herbicidu, byly ponechány růst dalších 20 dnů a pak na ně byla postřikem aplikována komerční směs glufosinátu v různých koncentracích obsahujících od 0,1 do 1 % aktivní látky. ' Semenáčky obsahující gen PAT (jehož exprese byla určena metodou, kterou publikovali DeSiock, M. et al., EMBO J.6(9) 2513-2513, 1987) byly buďto zcela rezistentní ke glufosinátu nebo byly relativně tolerantní k herbicidu, což záviselo na aplikované koncentraci, ve srovnání se semenáčky,· které neobsahovaly uvedený gen.
Příklad 8
Příprava rostlin (jednoděložných i dvouděložných) rezistentních ke glvphosatu i ke glufosinauu
Tento příklad ukazuje přípravu rostlin, které jsou rezistentní jak ke glyphosatu tak i ke glufosinátu. Tato vícečetná rezistence k herbicidům je výsledkem křížení první rostliny, která byla geneticky upravena tak, že je rezistentní ke glufosinátu, s druhou rostlinou, která byla geneticky upravena tak, že je rezistentní ke glyphosatu.
• · · 0
0 0 0 I 0 0 * » 0 0 «
000 00« «
00
Příorava konstruktu dPGo nesoucího rezistenci ke alufcs inatu
Vekzor pPG6, založený na vektoru Binl9 odvozený z vektoru pBml9RiPAT, obsahuje kazetu obsahující promotor CaMV 35S řídící gen GUS . mezi promotor a gen GUS je vložen druhý intron genu ST-LS1. Tato sekvence je dlouhá 189 bp, má obsah A/T 80 % a obsahuje typická setřihová místa a stop-kodony ve všech třech čtecích rámcích. Přítomnost intronu zabraňuje expresi GUS v Agrcbacterium tumefaciens, neboť u eukaryot nedochází k sestřihu. Obsahuje také kazezu nesoucí promotor CaMV 355 řídící expresi PAT genu. Mapa pPG6 je ukázána na obr. 16.
Konstrukty nesoucí rezistenci ke glyphosatu
Vektory vhodné pro dvouděložné rostliny byly již výš:
popsány v příkladu 4.
Vektor č.l pro jednoděložné rostliny
Vektor č.l vhodný pro jednoděložné rostliny je plazmid odvozený z plazmidů pUC, který obsahuje jak CTP1 GCX tak i CTP2 EPSPS, v obou případech řízené polyubichitinovým promotorem z kukuřice zesíleným polyubichitinovým intronem 1 z kukuřice. Obsahuje také kazetu nesoucí rezistenci k fos f motricinu.
Plazmid č. 1: Vektor pUBl byl naštěpen Koni a byl do něho vložen linker KpnI-Notl-KpnI (5'catttgcggccgcaaatggta 3', sekvence id. č. 17). Linker EcoRI-Notl-EcoRI (5'AATTCATTTGCGGCCGCAAATG 3', sekvence id. č. 18) byl vložen do EcoRI místa plazmidů DVl-pUC. Výsledný plazmid byl naštěpen Ncol a 5'-přesahující konec byl zaplněn pomocí Klenowova fragmentu DNA. polymerázy I. Lineární vektor byl pak štěpen Notl a fragment Notl s tupými konci byl izolován, tento fragment obsahující sekvence CTP1-GOX a NOS byl ligován • · · · · · • · ···· • · • · · · · a • ···· · ·· · • · · · · · · · · ··« do modifikovaného pUBl naštěpeného Smál a Notl. Linker HindiII-Notl-HindlII (5'AGCTTGCAGCGGCCGCTGCA 3', sekvence id. č. 19) byl vložen do plazmidu a vznikl tak plazmid č. 1.
Plazmid č. 2: Do EcoRI místa plazmidu DV2-pUC (byl izolován i druhý klon neobsahující výše uvedený linker, umožňující tuto klonovací strategii) byl vložen linker EcoRINotl-EcoRI (5'AATTCATTTGCGGCCGCAAATG 3', sekvence id. č. 20). Výsledný plazmid bylnaštěpen Ncola a 5'-přesahující konec byl zaplněn pomocí Klenowova fragmentu DNA polymerázy I. Lineární vektor byl pak štěpen Notl a výsledný fragmenc byl klonován do stejného vektoru (modifikovaný pUBl), který již byl popsán výše, čímž vznikl plazmid č. 2. Kazeta se selektovatelným markérem PAT obsahující promotor CaMV 35S, intron Adhl, gen fosfinotricinacetyltransferázy (PAT) a terminátor nos byla vystřižena z pIE108 a klonována do místa HindlII plazmidu č. 2, čímž vznikla kazeta č. 2. Diagnostická restrikční analýza byla použita k ověření toho, že kazeta PAT je ve stejné orientaci jako kazeta CTP2 EPSPS.
Kazeta nesoucí polyubichitinový promotor a intron, CTP1 GOX a terminátor nos byla vystřižena z plazmidu č. 1 jako fragmenc Notl a ligová do kazety č. 2 naštěpené Notl, čímž vznikl vektor č. 1, nazvaný pMVl (obr. 17), vhodný pro jednoděložr.é rostliny.
Transformace tabáku
Plazmidy pro transformaci dvouděložných rostlin byly vneseny do kmenu LBA4404 Agrobactsrium tumefaciens metodou mrznutí/tání, kterou publikovali Holsters et al.(1978). Rostliny tabáku Nicotiana tabaccum cv. Samsun byly transformovány metodou listových terčíků, kterou popsali Bevan et al. (1984) . Výhonky byly regenerovány na médiu obsahujícím 100 mg/1 kanamycinu. Po zakořenění a selekci byly
• · ·· · · ·· ·· • · · · · · · • ···· · · · · • · · · · ······ • · · · · ·· · · · · · · · rostliny přeneseny do skleníku a dále pěstovány ve světelném režimu 16 hodin světlo/8 hodin tma. Trans formanty pPG6 byly označeny jako linie 35S-PAT.
Transformace kukuřice
Transformace kukuřice byla provedena metodou ostřelování mikročásticemi, kterou popsali Klein et al.(1988). Selekce transformovaného materiálu probíhala na 1 mg/1 bialofosu.
Analýzy rostlin
Polymerázová řetězová reakce (PCR)
Tato analýza byla provedena na všech liniích tabáku,které zakořeňovaly ve tkáňové kultuře a také na všech kalusech kukuřice. DNA. pro tento účel byla extrahována způsobem odborníkovi známým. Primární trans formanty byly analyzovány pomocí následujících oligonuklěotidů:
pDVi | TMVI + G0X1 | GOX3 + nosí |
pDV2 | TMVi + EPSPS i | EPSPS1 + nos i |
pDV3 | EPSPS3 + G0X3 | |
P PG 6 | 35S BARJAP2R | |
pMVl | G0X4 + GGX5 | EPSPS4 + EPSPS5 35S + BARJAP2R |
Sekvence těchco oligonuklěotidů jsou následující:
TMVI | 5 | -CTCGAXTATTTTTACAACAATTACCAAC (sekvence | id. | č. 21) |
C-OXi | 5 | -AATCAAGGTAACCTTGAATCCA (sekvence id. č | . 22 | ) |
GOX3 | 5 | -ACCACCAACGGTGTTCTTGCTGTTGA (sekvence id. č | . 23) | |
no s i | 5 | -GCATTACATGTTAATTATTACATGCTT (sekvence | id. | č. 24) |
EPSPSi | 5 | -GTGATACGAGTTTCACCGCTAGCGAGAC (sekvence | id. | č. 25) |
EPSPS3 | 5 | -TACCTTGCGTGGACCAAAGACTCC (sekvence id. | č. | 26) |
EPSPS4 | 5 | -ATGGCTTCCGCTCAAGTGAAGTCC (sekvence id. | č. | 27) |
EPSPS5 | 5 | -CGAGACCCATAACGAGGAAGCTCA (sekvence id. | č. | 28) |
GOX4 | 5 | -ATTGCGTGATTTCGATCCTAACTT (sekvence id. | č. | 29) |
• · · · · · · • · · ♦ · · • · · · · ·· ··· ♦· • · ··
GOX5 | 5 | gporos vovogsvrgrogToypQT paVwcp | ce | id. | Č . 3 0 ) |
35S | u | -GGTGGAGCACGACACACTTGTCTA (sekven | c s | id. | č 31 ) |
BARJAP2R | 5 | -GTCTCAATGTAATGGTTA (sekvence id. | č | 32 |
Rostliny pozitivní v PCR byly vybrány pro další analýzy.
Selekce na giyphosatu
Pro tabák ve tkáňové kultuře na médiu obsahujícím glyphosat byla zkonstruována křivka úhynu. To bylo provedeno tak, že stonkový segment dlouhý asi 6 mm nesoucí jednu listovou uzlinu byl vložen do média MS obsahujícího různé koncentrace glyphosatisopropylaminu. Pro každou koncentraci bylo užito 4 až 5 segmentů. Po dvou týdnech byly vyhodnoceny výsledky, které jsou uvedeny v tabulce 2.
Tabulka 2
Křivka úhynu tabáku divokého typu na giyphosatu
Koncentrace isopropylaminglyphosatu (mM) | Růst explantátů |
0 | Dobrý růst stonku, 4-5 nových listů, kořeny - 5 cm |
0, 0 0 5 | Žádný orgán nerostl |
0,011 | zz |
0,0275 | zz |
0, 055 | // |
0, 1 | tr |
Primární trans formanty pDVl, 2 a 3 byly selektovány růstem na médiu obsahujícím 0,01 a 0,05mM glyphosatisopropyiaminové soli. Výsledky jsou uvedeny v následující tabulce 3.
flfl ···· • · · • · · · · • · · · • fl · • fl ··· • fl ··· • · · • · flflfl • · • · flfl · · · • fl ·· • · · • · · • flfl · · · • · ·· flfl
Tabulka 3
Selekce linií tolerantních ke glyphosatu ve tkáňové kultuře
pDVl | pDV2 | pDV3 | |
Testovány s herbicidem | 50 | 25 | 50 |
Tolerantní linie | 25 | 18 | 20 |
Selekce na PAT
Regenerované kalusy byly testovány tak, pěstovánv na 1 mct/1 bialořosu.
Westernová analýza
Nadměrná exprese proteinů GOX a EPSPS a příprava protilátek byly provedeny metodami odborníkovi známými. Primární transformanty tabáku byly testovány následujícím způsobem: přibližně 100 mg PVPP se dalo na dno mikrozkumavky Eppendorf. Listové pletivo (4 listové terčíky vyříznuté víčkem zkumavky) bylo vloženo do 0,5 ml extrakčního pufru (50mM Tris-HCl, pH7,8, ImM sodná sůl EDTA, 3mM DTT) se 2 μΐ lOOmM PMSF. Vzorky místnosti pomocí elektrického sekund, pak byl nerozdrcený materiál stlačen zpět do zkumavky a drcení mohlo pokračovat dalších 10 až 15 seh.und, přidaly zyfy rozdrceny v chladové drtiče. Drcení probíhalo dokud materiál nebyl zcela homogenní. Zkumavky pak byly stočeny 15 minut v chladové místnosti, supernatanty přeneseny do čistých zkumavek a až do upotřebení uschovány zamražené při -70 °C. Koncentrace proteinů byla stanovena Bradfordovou metodou. 25 μg proteinu bylo rozděleno na SDS-PAGE elektroforéze a přeneseno blokovací technikou přes noc při 40 mA na membránu Hybond-N. Flitr byl vyjmut z blokovacího zařízení a vložen do 100 ml roztoku lx Tris-sůl, 51 Marvel (sušené mléko) a inkuboval se za současného třepání při • · ·4 4 4 • 4 4 4 4 4 • · 4 4 4 • ··· · ···· • 4 4 4 4 <
44 » 4 4 4 » 4 4 4
444 444
4 • · 44 ·· 444 teplotě místnosti po 45 minut. Pak byl filtr opláchnut třepáním při teplotě místnosti v lx Tris-sůl, 0,1* Tween 20, první promytí 5 minut a druhé promytí 20 minut. Membrána se pak ínkubovaía 2 hodiny při teplotě místnosti nebo přes noc při teplotě 4°C s primární protilátkou. Pak byla membrána promývána při teplotě místnosti v lx T-S, 1% Tween 10 minut až i hodinu. Druhá protilátka (konjugát anti-králičího IgG a peroxidázy) byla použita v ředění 1:10000 a byla inkubována s membránou 1 hodinu při teplotě místnosti. Promývání bylo stejné jako předchozí. Detekce byla provedena pomocí detekční soupravy ECL Amersham. Výsledky westernové analýzy ukázaly celé rozmezí úrovně exprese u linií pDVl a pDV2. Úroveň exprese GOX a EPSPS u linie pDV3 jevila jen malou variabilitu v případě exprese GOX, ale zvýšenou variabilitu v množství EPSPS . Pro další analýzy byly vybrány linie exprimující oba geny.
Kalusy kukuřice byly analyzována stejným. způsobem, kalusy exprimující GOX a EPSPS byly regenerovány na celé rostliny a listové pletivo pak bylo testováno na expresi obou genů.
Test aktivity fosfinotricinacetyltransferázy
Aktivi
PAT bvla měřena Domoci radioaktivně o, macenezo acetvíkoenzymu A (AcetvlCoA).
V listovýc:
extrakt;
při této metodě díky aktivitě PAT značená icetylová skupina přenesena na substrát fosfinotricin (PPT) .
Acetylovaný PPT a i4C migrují odlišně na destičce TLC a lze je připraven listový lOx T50E10 pufr (TE), vizualizovat autoradiograficky. Byl extrakční pufr následujícího složení:
tj. 50 ml 1M Tris-HCl, pH 7,5, 4 ml 0,5M EDTA a 46 ml vody.
Leupeptin byl rozpuštěn v lx TE v koncentraci 15 mg/ml.
Zásobní roztok PMSF o koncentraci 30 mg/ml byl připraven v metanolu. Zásobní' roztok BSA byl 30 mg/ml v TE a použitý ·· ···· ·· ·· • · · · · · • ··· · · · · • · · ··· ··· • · · · • · ··· ·· ·· ·· ···· • · · • · · · «
DTT byl 1M. PPT byl užit jako lmM roztok v TE. Aktivita značeného AcetylCoA byla 58,1 Ci/mmol (Am.ersham) . Extrakční pufr byl připraven smícháním 4315 μΐ dvojitě destilované vody, 500 μΐ ΙΟχ TE, 50 μΐ zásobního roztoku leupeptinu, 25 μΐ zásobního roztoku PMSF, 100 μΐ zásobního roztoku ESA a 10 μι zásobního roztoku DTT (celkový objem 5000 pil) . Listové vzorky odebrané pomocí víčka zkumavky jakožto řezadia byly přeneseny do mikrozkumavky Eppendorf. Vzorky (3 listové terčíky) byly rozdrceny ve 100 μΐ extrakčního pufru pomocí elektrického drtiče v chladové místnosti. Vzorky pak byly 10 minut točeny a 50 μΐ bylo odebráno do čisté zkumavky na ledu. Až do použití byly vzorky skladovány při -70 °C. Pro kvantifikaci proteinů ve vzorcích byla užita Bradfordova metoda. Substrátový roztok byl připraven smícháním 5 objemů značeného AcetylCoA se 3 objemy lmM roztoku PPT. Ke vzorku obsahujícímu přibližně 25 μρ celkového listového proteinu (přibližně 2 μρ/μΐ) se přidaly 2 μΐ substrátového roztoku a směs se inkubovala 30 minut při 37 °C, pak se přemístila na led a tím se zastavila reakce. Vzorky velikosti 6 μΐ se pak nanesly na silikagelovou destičku pro TLC (Sigma T-6770). Vertikální chromatografie byla provedena ve směsi 3:2 isopropanolu a 25% amoniaku po 3 hodiny. Destičky pak byly zabaleny do plastové fólie a exponovány přes noc na film Kodak XAR-5. U všech 26 primárních transformant byla hodnocena aktivita PAT touto analytickou metodou. Následující tabulka 4 uvádí podrobně výsledky této analýzy.
Tabulka 4
Přehledné údaje o aktivitě PAT
A.ktivita PAT | Linie pPG6 |
Vysoká | 1,9,11,12,14,21,22,24,25,27,28,30,32 |
Střední | 5,7,10,15,19,20 |
Nízká | 6,2,8 |
·· ··«·
0· 0000 » 0 0 » *000
0 0 0 · 0 0 0 ··
Test potíráním listu herbicidem
Primární trans formanty 35S-PAT s celým rozsahem aktivity
PAT společně s kontrolními rostlinami byly testovány tak, že jednotlivé listy byly potřeny látkou Challenge. Obě strany označených listů byly potřeny 1% nebo 0,2% roztokem zásobního roztoku (150 g/1) . Po 48 hodinách a po 1 týdnu byly listy hodnoceny a byly odebrány vzorky pro testování aktivity PAT. Výsledky potírání listů herbicidem ukazuje tabulka 5.
Tabulka 5
Výsledky potírání listů herbicidem
Exprese | Rostlinná linie | 0,2% | 0,2% | i 1 | 1% |
4 8 h | 1 týden | 48 h | 1 týden | ||
Vysoká | 2 4,1,14 | bez poškození | bez poškození | bez poškození | bez poškození |
Nízká | 6, 10 | bez poškození | odumřelý | odumřelý | odumřelý |
Divoký tvp | odumřelý | odumřelý | o dumř e1ý | odumřelý |
Test postřikem herbicidu
Glufosinát (Challenge nebo Basta)
Pro rostliny tabáku divokého typu byla připravena křivka závislosti odpovědi na dávce Challenge. Pro každou aplikaci bylo užito 5 rostlin a hodnocení bylo provedeno po 14 dnech. Po té, co byla k dispozici tato křivka, byl proveden test postřikem- Chellenge s vybranými liniemi 35SPAT při použití stejných dávek. Tabulka 6 ukazuje tyto údaje pro dvě linie č.12 a 27. Transgenní rostliny nejevily při těchto dávkách žádné poškození.
4444
4··· • · · • 4 4 4 4 • · • ·
444
44 • · · · · · · • · 4·· · · · · · 4 4 44444· · 4 · · ··· ·· ··
Τ 3 Ό '3 3 Κ 3. Ό
Výsledky testu postřikem na primární trans formanty 35S
dávka Basta | divoký typ | 35SPATČ.12 | 35SPATČ.27 |
% poškození | % poškození | % poškození | |
200 g/ha | 30 | 0 | 0 |
400 g/ha | 40 | 0 | 0 |
600 g/ha | 40 | 0 | 0 |
900 g/ha | 80 | 0 | 0 |
Křivka úhynu byla připravena pro účinek glyphosatu na tabák divokého typu. Rostliny tabáku divokého typu pěstované ve tkáňové kultuře byly subkultivovány odebráním segmentů stonku a přenesením do čerstvého média, čímž bylo získáno 20 nových rostlin. Ty byly pěstovány jeden měsíc ve tkáňové kultuře a pak byly přeneseny do květináčů (7,6 cm) s kompostem John Innes č. 3. Zpočátku byly pro ochranu přikryty vinou. Po odkrytí byly ponechány aklimatizovat 4 dny před tím, než byl aplikován postřik. Po postřiku bylo veškeré zalévání prováděno jen do podložních misek, tj. žádná voda se nedotkla listů po 5 dnů. Hodnocení proběhlo 8 dnů a 28 dnů po aplikaci. Tabulka 7 ukazuje průměrné procento poškození (každé ošetření bylo ve třech opakováních) v celém rozsahu použitých koncentrací.
Po té, co byla zkonstruována křivka úhynu pro glyphosat, byla řada linií pDVl, 2 a 3 podrobena také postřikovému testu s příslušnými dávkami glyphosatu. Tabulka 3 ukazuje výsledky pro pDV3, přičemž výsledky pro pPVl a pDV2 byly velmi podobné těmto uvedeným pro pDV3.
·· ···· • ft *·· · • · · • · ftftft • · · · • · · ·· ♦ ·* • · · • · · · · • * · · • · · • ft ftftft • ft ·· « · · · • · · · *>·· ··· • · • ft ftft
Tabulka Ί
Závislost odpovědi na dávce pro glyphosat aplikovaný na tabák divokého typu
Ap 1 i ka -ce č. | Sloučenina | Dávka g/ha | Adj uvans | Tabák divokého typu |
1 | Roundup Ultra (USA) | 100 | „Frigate | 73 |
2 | 480 g/1 isopropylamin- | 200 | (K30512) | 90 |
3 | glvphosatu | 4 00 | 99 | |
4 | (a.e. 36 0- g/1) | 800 | 100 | |
5 | LDJW010017 | 12 0 0 | 100 | |
6 | 1600 | 100 |
Tabulka 8
Odpověď na dávku u primárních transformant pDV3 ošetřených glyphošatem
1 | 2 | 3 | . 4 | 5 | 6 | 7 | |
Dávka g/ha | 12,33 | 37 | 100 | 300 | 1000 | 3000 | 9000 |
Divoký typ | 2 | 3 | 20 | 80 | 93 | ||
pDV3 č.11 | - | - | 0 | 0 | 25 | 70 | 80 |
č . 14 | - | - | 7 | 22 | 13 | 33 | 76 |
č.19 | - | - | 0 | Q | 0 | 35 | 8 0 |
č.21 | - | - | 0 | 5 | 0 | 24 | 78 |
Č.31 | - | - | 12 | 0 | 4 | 26 | 78 |
č. 34 | - | - | 0 | 0 | 6 | 30 | 63 |
č. 36 | - | - | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
č . 37 | - | - | 0 | 0 | 9 | 24 | 72 |
č .43 | - | - | 0 | 0 | 0 | 6 | 73 |
Č. 44 | - | - | 0 | 40 | 45 | 78 | 85 |
č. 4 5 | - | - | 0 | 0 | 3 | 9 | 70 |
č. 47 | - | - | 5 | 0 | 0 | 11 | 72 |
Č. 60 | - | - | 0 | 0 | 0 | 19 | 63 |
č. 64 | - | - | 0 | 5 | 0 | 12 | 63 |
• •«to • to ·· ···· • to • · · · · · • · ··· · · ··· • · · · · · · • · ·· · · ·· ··· ·· ··· ·· • ·· · • ·· · to·· ··· • · ·· ··
Segregační analýza
Semena z každé z primárních transformant (pPGo, pDVl, pDV2 a pDV3) byla sterilizována v 10% Domestosu po 10 minut. Po několikerém opláchnutí destilovanou vodou bylo 100 semen pro každou samosprášenou trans formantu vyseto na médium 0,5x MS (2,3 g/1 MS soli, 1,5% sacharóza, 0,8% baktoagar, pH 5,9) obsahující 100 mg/1 kanamycinu. Semenáčky byly hodnoceny po třech týdnech růstu ve 26 °C a světelném režimu 16 hodin světlo/8 hodin tma. Linie segregující v poměru 3:1 nesly pravděpodobně vložený jeden transgen. V případě linií pPG6 linie č. 12, 20 a 27 segregovaly v požadovaném poměru. Linie pDV3 č. 14, 19, 21, 31, 34, 43 a 45 segregovaly v požadovaném poměru.
Příprava homozygotních linií
Ze segregačních testů bylo 10 semenáčků, které nevybledly (heterozygotních nebo homozygotních) přeneseno na čerstvé médium v nádobkách a pěstováno další dva až tři týdny. Po této době byly přeneseny do kompostu JI č.3 ve 31 nádobách a pěstovány až do vykvetení. Semena pak byla znovu testována na médiu 0,5x MS obsahujícím kanamycin pro identifikaci homozygotních linií.
Křížení linií tabáku
Homozygotní linie obsahující pDVl, pDV2 a pDV3, tj . explantáty exprimující geny GOX, EPSPS a GOX/EP3PS byly použity k opylení homozygotní linie pPG6 č.27 exprimující gen PAT. Linie pPG6 byla užita také jako samčí linie.
Analýza transgenních linií kukuřice
Regenerované kalusy byly testovány pomocí PCR s oligonukleotidy popsanými výše, tj. 35S-AlcR, AicA-GOXl
a vnitřními oligonukleotidy pro GOX a EPSPS. Na kalusech pozitivních v PCR byla provedena také westernová analýza, aby bylo možné selektovat kalusy exprimující GOX a EPSPS. Tyto kalusy pak byly regenerovány a výsledné rostliny byly znovu testovány v PCR. Rostliny pak byly zpětně kříženy a také samosprášeny.
Analýza potomstva u tabáku
Exprese GOX, EPSPS a PAT
Všechno potomstvo bylo homozygotní pro oba geny. Semena z každého křížení a od každého rodičovského homozygota byla vyseta a listové pletivo pak bylo odebráno a podrobeno řadě analýz. Proteinové extrakty byly analyzovány westernovým. přenosem a aktivita PAT byla měřena jak již bylo popsáno dříve. Bylo zjištěno, že hladiny exprese GOX a EPSPS a aktivita PAT si byly navzájem velmi podobné v rámci konkrétního křížení a také se podobaly hodnotám homozygotního rodiče. Rostliny pak byly hodnoceny z hlediska vzhledu, výšky, životaschopnosti, růstu atd.
.Aplikace herbicidů
Byly připra’ | vény tři rozsáhlé experimenty: | |
1 . | 35S-PAT, pDVl | , pDVl-PAT |
2 . | 35S-PAT, pDV2 | , pDV2-PAT |
3 . | 35S-PAT, pDV3 | , pDV3-PAT |
Na. | linie 35S-P.AT | byl aplikován rozsah koncentrací |
ufosinatu konkrétní DV byly a byla ošetřeny dávka, kdy byl identifikován v různých okamžicích. Linie tem v rozsahu koncentrací poškození. Linie DV-PAT pak byly a byla stanovena stupeň poškození, ošetřeny glyphosa identifikována míra směsí obou herbicidů s různým poměrem a byla vyhodnocena míra
99 • 9
9 9 9 ·
9 99 9 9 9 9 9
9 9 9 9
9 9 9
9 9 99 9 9 999 poškození. Každá z populací byla ošetřena ve stadiu 5 až 6 listu (5 opakování pro každé ošetření).
Rezistence k napadení patogenem
Linie 35S-PAT, DVÍ, 2 a 3 a DV-PAT exprimující vysoké hladiny každého proteinu a projevující dobrou toleranci k herbicidu byly vystaveny řadě houbových patogenů a pak byla vyhodnocena a porovnána míra infekce.
Analýza potomstva u kukuřice
Semena z křížení primárních transformant byla užita k získání rostlin, ze kterých byly vybrány linie s nejlepší expresí. To bylo provedeno pomocí westernové analýzy hladin exprese GOX a EPSPS a měřením aktivity PA.T, jak bylo již dříve popsáno. Byly také provedeny obdobné pokusy pro stanoveni tolerance k herbicidům glyphosatu a glufosinátu, ať už aplikovanými jednotlivě nebo v různých směsích.
Příklad 9
Příprava rostlin tolerantních k pre-emergentním herbicidům způsobujícím blednutí, tj . fluorochloridonu, norfluorazonu, fluridor.u, flurtamonu a diflufenicanu a ke glyphosatu
Inhibitory desaturázy fytoenu (PDS), tj. fluorochloridon a norfluorazon, představují skupinu herbicidů, které blokují syntézu karotenoidů a vytvářejí proto symptomy blednutí. Gen PDFS (crtl) byl klonován z Erwinia uredovora, nezelené patogenní bakterie způsobující nekrózy, a exprimován v transgenním tabáku (a rajčeti) pomocí plazmidů obsahujícího promotor CaMV 35S a chloroplastový trazitní peptid (pYPIET4)(Misawwa et al., 1993). Homozygotní semena z linie tabáku ET4-208, která nadměrně exprimuje gen crtl byla • · • · · · • · · · » · · · · » · · · · · · · 1 »····* * ’ • fl ··· ·· *·· ·· ·· získána stejně jako rostliny rajčete obsahující konstrukt.
Testy rezistence k herbicidu
Byly testovány sloučeniny podle vzorců I, II a III (uvedené dále). Semena transgenních a kontrolních rajčat (cv. Ailsa Craig) byla vyseta do nádob (7,6 cm) s JIP3, vždy tři semena v nádobě. Každá sloučenina byla formulována ve 4% JF5969 (kromě sloučeniny I, což je komerční prostředek) a postřik v dávce 200 1/ha byl aplikován postřikovačem. Test byl vyhodnocován 13., 20. a 27. den po ošetření (DAT). Existuje zde jasná závislost na dávce u všech ošetření na rajčeti divokého typu, kdy nejvyšší dávky jevily 87 až 100 % fytotoxicitu. Transgenní rajčata jsou vysoce tolerantní ke všem testovaným inhibitorům PDS, přinejmenším až do 1 kg/ha u sloučenin II a III a až do 9 kg/ha u sloučeniny I (víz tab. 9). Obdobné výsledky byly získány pro transgenní tabák.
Pyl z linie DV3 č. 433 (linie rezistentní ke glyphosatu obsahující geny EPSPS a GOX, viz příklad 4) byl obvyklými způsobem přenesen na homozygotní linii ET4-208 a naopak. Semena byla sklizena a použita v testech s herbicidy podobně jak bylo popsáno výše. Semena tabáku byla vyseta do řádek v malých jednotkách den před ošetřením. Každá sloučenina byla formulována ve 4% JF5969 (kromě prostředku Racer, který je komerčně dostupný) a postřik v dávce 200 1/ha byl na jednotky aplikován řádkovým postřikovačem. Test byl vyhodnocován 13., které byly b yiy ρο (7,6 cm) aplikován Hodnocení
20. a 27. den po ošetření (DAT). Semenáčky, tolerantní k herbicidům způsobujícím blednutí, posledním hodnocení přeneseny do nových nádob s kompostem John Innes 111. Po dvou týdnech byl glyphosatový herbicid v dávkách 500 a 800 g/ha. účinku proběhlo 14 a 28 dní po aplikaci (DAT)
Výsledné • · · 0 * · • 0 00 • · « · « • · · · · · · I rostliny byly rezistentní k oběma třídám, a rezistence se dědila Mendelovským způsobem.
herbicidů
T 3. L· u l· k 3. 9
Rytotoxicita 27. den po ošetření (27 DAT)
Ra j če | |||
Látka | Dávka (g/ha) | Divoký typ | Transgenní |
Sloučenina II | 37 | 3,3 | gg|jÍilB|g |
111 | 13, 3 | 3, 3 | |
333 | 20 | 0 | |
1000 | 100 | 3, 3 | |
3000 | 0 | ||
Sloučenina III | 37 | 0 | |
111 | 8, 3 | 0 | |
333 | 56, 7 | 0 | |
1000 | 100 | 10 | |
3000 | 3,3 | ||
Sloučenina I | 333 | 0 | 0 |
1000 | 23, 3 | 0 | |
3000 | 100 | 0 | |
9000 | 100 | 0 |
Sloučenina podle vzorce I:
o
Cl (I) ♦ · * · « ·
♦ · ··♦· I · · » · · · « ·· · · » « · ’ « · · » · ·····< • · » · < 4 9 4 94 94 «· (III)
Příklad 10
Příprava rosclin tolerantních k triketonúm, acetanilidúm a glvphosatu
Pyl z pDV6 Č.71G a pDV3č.l9J byl přenesen na homozygotní linii tolerantní k triketonúm a naopak. Semena z těchto křížení byla sklizena a použita v pokusech s herbicidy. Semena tabáku získaná z křížení DV6/HPPD byla vyseta do řádků v malých jednotkách den před ošetřením. Některé jednotky pak byly ostřeny acetochlorem (75 g/ha), jiné alachlorem (300 g/ha) a další ZA1296 (100 a 300 g/ha) . Hodnocení účinku probíhalo 21. den po aplikaci herbicidu (21 DAT). Výsledky ···· > · · · · » · · » · « ·· «·· ·· ·· » · · « F · · « • · · · · « hodnocení jsou uvedeny v následující tabulce, kde je uvedena fytotoxický účinek 21. den.
Divoký typ | Divoký typ | DV6/HPPD | DV6/KPPD | ||
Látka | Dávka (g/ha) | opakování 3 | opakování b | opakování a | opakování b |
Acetochlor | 75 | 40 | 100 | 0 | 0 |
A.lachlor | 300 | 80 | 90 | 0 | 0 |
ZA1296 | 100 | 90 | 95 | 10 | 0 |
300 | 100 | 100 | 0 | 0 |
Semenáčky, které přežily ošetření ZA129S v dávce 300 g/ha byly ošetřeny postřikem glyphosatu v dávce 800 g/ha a projevily toleranci i k této aplikaci.
• fe ·· » · · <
» · · ’ • « · · · ·
• < fe · ·
SEZNAM SEKVENCÍ (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) (B) (C) (D) | DÉLKA: 1020 párů baží TYP: nukleová kyselina TYP VLÁKNA: dvojité | ||
TOPOLOGIE: | lineární | ||
ii) | TYP | MOLEKULY: | DNA |
iii) | HYPOTETICKÁ: | ne |
(iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: Synechocystis sp. PCC6803 (ix) ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1..1020 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 1:
ATG Met τ. | GAA Glu | TTC Phe | GAC Asp | TAT Tyr 5 | CTT Leu | CAT His | TTA Leu | TAC Tyr | GTT Val 10 | GAC Asp | GAT Asp | TAT Tyr | CAG Gin | TCA Ser 15 | GCT Ala | 48 |
CAT | CGT | TGT | TAT | CAA | CGT | TGG | GGT | TTC | ACT | TGC | GTA | AAT | AAA | ATT | 96 | |
His | Arg | Cys | Tyr | Gin | Arg | Gin | Trp | Gly | Phe | Thr | Cys | Val | Asn | Lys | Ile | |
20 | 25 | 30 | ||||||||||||||
ATT | ACT | GAC | CGA | GGA | ATT | ACT | GGC | ATC | TAC | CAA | CAG | GGG | CAA | ATA | CTT | 144 |
Ile | Thr | Aso | Gin | Gly | Ile | Thr | Gly | Ile | Tyr | Gin | Gin | Gly | Gin | Ile | Leu | |
35 | 40 | 45 | ||||||||||||||
CTG | CTA | ATT | TGG | GCA | TCG | GAA | TCT | AGT | TTG | AGT | AGA | TAT | GCC | GAC | TAT | 192 |
Leu | Leu | Ile | Ser | Ala | Ser | Glu | Ser | Ser | Leu | Ser | Arg | Tyr | Ala | Asp | Tyr | |
50 | 55 | 60 | ||||||||||||||
CTC | CAG | AAA | CAT | CCC | CCC | GGC | GTA | GGT | GAA | GTG | GCT | TGG | CAG | GTG | GCC | 240 |
Leu | Gin | Lys | His | Pro | Pro | Gly | Val | Gly | Glu | Val | Ala | Trp | Gin | Val | Ala | |
65 | 70 | 75 | 80 | |||||||||||||
AAT | TGG | CAA | AAA | ATT | CAG | CAT | CAA | TTA | TCA | GAA | TTA | CAG | ATA | GAA | ACC | 238 |
Asn | Trp | Gin | Lys | Ile | Gin | His | Gin | Leu | Ser | Glu | Leu | Gin | Ile | Glu | Thr | |
85 | 90 | 95 |
ACA | CCA GTT ATT | CAT | CCT CTG | ACT | AAA |
Thr | Pro Val Ile | His | Pro Leu | Thr | Lys |
100 | 105 | ||||
CTC | i Gaj GGA GA. í | GTG | CAC CAT | AGC | ATT |
Leu | Trp Glv Asp | Val | His His | Ser | Ile |
115 | 120 | ||||
AAT | CAG AA7 AAA | ACA | TTG CAT | GGT | GTT |
Asn | Gin Asn Lys | Thr | Leu His | Gly | Val |
130 | 135 | ||||
GTG | G i G CTA AAC | ATT | GCC G'_C | GAT | CAA |
Val | Val Leu Asn | τ 2. s | Ala Ala | Asp | Gin |
145 | 150 | ||||
TAT | CAA CAG GTG | TTT | GGG TGG | TGG | GTG |
Tyr | Gin Gin Val | Phe | Gly Trp | Ser | Val |
165 | |||||
ACG | CCC CAT TCT | GCT | CTG TAT | AGC | GAA |
Thr | Pro His Ser | Gly | Leu Tyr | Ser | Glu |
ISO | 185 | ||||
AAA | GTC CAA TTT | AAC | CTC AAT | TGT | CCC |
Lys | Val Gin Phe | Asn | Leu Asn | cys | Pro |
195 | 200 | ||||
CAA | ACT TTT TA | GCC | AAT AAC | CAT | GGG |
Gin | Thr Phe Leu | Ala | A.sn Asn | His | Gly |
210 | 215 | ||||
TCC ACT ACG | AGT | ATT ACG | CGA | ACT | |
Phe | Ser Thr Thr | Ser | Ile Thr | Arg | Thr |
225 | 230 | ||||
GGC | GTA AAT TTT | TTA | AAA ATC | CCC | ACT |
Gly | Val Asn Phe | Leu | Lys Ile | Pro | Thr |
245 | |||||
AAC | AGT AGC TAT | TTT | AAT TAT | GCA | AG |
Asn | Ser Ser Tyr | Phe | Asn Tyr | Ala | Ser |
260 | 265 | ||||
TGC | CTA GAA ATT | TTG | CTG GAT | GAT | CAA |
Cys | Leu Glu Ile | Leu | Leu Asp | Asp | Gin |
275 | 280 | ||||
CTG | CTA CAA ATT | TTT | AGT CAG | CCT | TGC |
Leu | Leu Gin Ile | Phe | Ser Gin | Pro | Cys |
290 | 295 | ||||
TGG | GAA ATT ATT | GAA | CGC CGC | CAC | CGG |
Trp | Glu Ile Ile | Glu | Arg Arg | His | Arg |
305 | 310 | ||||
AAC | TTT CAA GCT | CTC | TAT GAA | GCG | GTG |
Asn | Phe Gin Ala | Leu | Tyr Glu- | Ala | Val |
325 | |||||
GAA | GTG CCA TAA | ||||
Glu | Val Pro |
65 | • · • · • · • · • fc • fc | • fcfc · • • fcfc • • • · · | • « • · • · fcfc · • · • · | • fcfc · · · • · • fcfc · • · fcfc fc fcfcfc ·· |
GCA GAA | GGA TTA ACT | TTT | TTG | 336 |
Ala Glu | Gly Leu Thr 110 | Phe | Leu | |
TAT CCT | .GTT CGT TCT | GAG | CTA | 384 |
Tyr Pro | Val Arg Ser 125 | Glu | Leu | |
GGT TTA | ACG ACC ATC | GAC | CAT | 432 |
Gly Leu | Thr Thr Ile 140 | Asp | His | |
TTT ACC | CAG GCT TCC | CAA | TGG | 480 |
Phe Thr 155 | Gin Ala Ser | Gin | Trp 160 | |
CAG CAG | AGT TTT ACT | GTC | AAT | 528 |
Gin Gin 170 | Ser Phe Thr | Val 175 | Asn | |
GCC CTG | GCC AGT. GCC | AAT | GGG | 576 |
Ala Leu | Ala Ser Ala 190 | Asn | Gly | |
ACC AAT | AAC AGT TCC | CAA | ATT | 624 |
Thr Asn | Asn Ser Ser 205 | Gin | Ile | |
G<. i GGT | ATT CAA CA | GTC | GGT | 672 |
Ala Gly | Ile Gin His 220 | Val | Ala | |
GTG GCT | CAT CTG CGG | GAA | AGG | 720 |
Val Ala 235 | His Leu Arg | Glu | Arg 240 | |
GGC TAT | TAT CAA CAG | CAA | AGA | 768 |
Gly Tyr 250 | Tyr Gin Gin | Gin 255 | Arg | |
TTG GAT | TGG GAT ACC | TTA | CAG | 816 |
Leu Asp | Trp Asp Thr 270 | Leu | Gin | |
GAT AAT | ACG GGG GAG | CGA | TTA | 864 |
Asp Asn | Thr Gly Glu 285 | Arg | Leu | |
TAT GGA | GTA GGC ACT | CTA | TTT | 912 |
Tyr Gly | Val Gly Thr 300 | Leu | Phe | |
GCA AAA | GGA TT GGT | CAA | GGA | 960 |
Ala Lys 315 | Gly Phe Gly | Gin | Gly 320 | |
GAG ACT | TTA GAA AAA | CAG | TTA | 1008 |
Glu Thr 330 | Leu Glu Lys | Gin 335 | Leu | 1020 |
• · · · • · · · · · • · · « ······ • · · · · β« · · · ·.· ··
(2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 2:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 339 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 2:
Met 1 | Glu | Phe | Asp | Tyr 5 | Leu | His | Leu | Tyr | Val 10 | Asp | Asp | Tyr | Gin | Ser 15 | Ala |
His | Arg | Cys | Tyr | Gin | Arg | Gin | Trp | Gly | Phe | Thr | Cys | Val | Asn | Lys | Ile |
20 | 25 | 30 | |||||||||||||
Ile | Thr | A.s o | Gin | Gly | Ile | Thr | Gly | Ile | Tyr | Gin | Gin | Gly | Gin | Ile | Leu |
35 | 4 0 | 45 | |||||||||||||
Leu | Leu | Ile | Ser | Ala | Ser | Glu | Ser | Ser | Leu | Ser | Arg | Tyr | Ala | Asp | Tyr |
50 | 55 | 60 | |||||||||||||
Leu | Gl.n | Lys | His | Pro | Pro | Gly | Val | Gly | Glu | Val | Ala | Trp | Gin | Val | Ala |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||||
Asn | Trp | Gin | Lys | Ile | Gin | His | Gin | Leu | Ser | Glu | Leu | Gin | Ile | Glu | Thr |
85 | 90 | 95 | |||||||||||||
Thr | Pro | Val | Ile | His | Pro | Leu | Thr | Lys | Ala | Glu | Gly | Leu | Thr | Phe | Leu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||||
Leu | Trp | Gly | Asp | Val | His | His | Ser | Ile | Tyr | Pro | Val | Arg | Ser | Glu | Leu |
115 | 120 | 125 | |||||||||||||
Asn | Gl.n | Asn | Lys | Thr | Leu | His | Gly | Val | Gly | Leu | Thr | Thr | Ile | Asp | His |
130 | 135 | 140 | |||||||||||||
Val | Val | Leu | Asn | Ile | Ala | Ala | Asp | Gin | Phe | Thr | Gin | Ala | Ser | Gin | Trp |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||||
Tyr | Gin | Gin | Val | Phe | Gly | Trp | Ser | Val | Gin | Gin | Ser | Phe | Thr | Val | Asn |
165 | 170 | 175 | |||||||||||||
Thr | Pro | His | Ser | Gly | Leu | Tyr | Ser | Glu | Ala | Leu | Ala | Ser | Ala | Asn | Giv |
180 | 185 | 190 | |||||||||||||
Lys | Val | Gin | Phe | Asn | Leu | Asn | Cys | Pro | Thr | Asn | Asn | Ser | Ser | Gin | Ile |
195 | 200 | 205 | |||||||||||||
Gin | Thr | Phe | Leu | Ala | Asn | Asn | His | Gly | Ala | Gly | Ile | Gin | His | Val | Ala |
210 | 215 | 220 | |||||||||||||
Phe | Ser | Thr | Thr | Ser | Ile | Thr | Arg | Thr | Val | Ala | His | Leu | Arg | Glu | Arg |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||||
Gly | Val | Asn | Phe | Leu | Lys | Ile | Pro | Thr | Gly | Tyr | Tyr | ' Gin Gin Gin Ar- |
245 250 255 ttt ttt
Asn | Ser | Ser | Tyr | Phe | Asn | Tyr | Ala | Ser | Leu | Asp | Trp | Asp | Thr | Leu | Gin |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Cys | Leu | Glu 275 | Ile | Leu | Leu | Asp | Asd 280 | Gin | Asp | Asn | Thr | Gly 285 | Glu | Arg | Leu |
Leu | Leu | Gin | Ile | Phe | Ser | Gin | Pro | Cys | Tyr | Gly | Val | Gly | Thr | Leu | Phe |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Trp | Glu | Ile | Ile | Glu | Arg | Arg | His | Arg | Ala | Lys | Gly | Phe | Gly | Gin | Gly |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Asn | PSe | Gin | Ala | Leu | Tyr | Glu | Ala | Val | Glu | Thr | Leu | Glu | Lys | Gin | Leu |
325 | 330 | 335 |
Glu Val Pro (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A.) DÉLKA: 2582 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: dvojité (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: cDNA (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: Pseudomonas fluorescens (ix) ZNAKY:
(A) JMÉNO/OZNAČENÍ: CDS (B) POZICE: 1217..2290 (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 3:
ATTAGTCGAA | GAATATGCCC | ATCCTGTCGC | CTGTCGAGCA | ACTGCTAATG | CAACCTCCGT | 60 |
CTGATCGCCT | CACCTACCTG | AAGCTGGCCG | CTGTGACCAT | GATTTGGGGT | GGCACTTTTG | 120 |
TCGCCGGACG | TTACCTGACC | AATCAAGTCG | ACCCGCTGCT | GGCCGCCAGC | CTGCGGTTTA | 180 |
TCCTGGCCAG | CCTGGCGCTG | CTGCTGTTTA | TGCTGTGTGC | ACGCATCCCG | CTGGCGCGGC | 240 |
CACGTCCCCG | GCAACTGCTG | CATCTGGCGG | TGCTGGGGTT | TTTCGGGATC | TTTTTCTACA | 300 |
A.CCTGTGTTT | TTTCTACGGC | CTGCAGTACA | TCAACGCCTC | GCGCGCTTCG | TTGATCGTGG | 360 |
CGTTGAATCC | GGCGGTGATC | GGCCTGGCTT | CCTGGTGGTT | GTTCAAAGAG | CGCCTCGGCA | 420 |
CTGCCAGGGT | GCTGGGTATC | GCGTTGTGCC | TGGCCGGCGC | TGCGACGGTG | ATCGTCAGTC | 480 |
GCAACCCGCA | GTTGCTGCAA | GGTGCATCGA | GTACCTGGCA | GGGCGACCTG | CTGGTGTTCG | 540 |
GCTGTGTGCT | GGGGTGGGGG | ATTTACTCGT | TGTTTTCCCG | CGCATTGAAT | CAAAGCCTGG | 600 |
GGCCGTTGCA | AACGGTCACC | TGGTCAGTGC | TGCTGGGCAC | CCTGATGCTG | ACGGCTGTCA | 660 |
CCGCGCTCGC | CGGGCGCTTC | ACGCTTGCAG | GGCTTGGCAG | CCTGCACCTG | CCGCAGGTTG | 720 |
TGAGCCTGTT | GTATTTGGGC | GTGCTCGGCT | CCGCGCTGGC | GTACATCGGC | TATTACGATG | 780 |
GCATCCGGCG | TATCGGCGCG | ACCCGCGCAG | GCGTGTTTAT | CGCGCTGAAC | CCGCTGACGG | 840 |
CGGTGATCTG | CGGCGCGCTG | CTGCTTGGCG | AACAGCTAAC | GTTACCCATG | GCGCTCGGCG | 900 |
GCGCGGTGAT | CCTGTTGGGC | ATCTATCTGT | GCAACAAACC | CCTTGCGCAG | CCCAGCGCAA | 960 |
TAGGGATTTG | ATGAGAGTGC | GGACAAATAC | TGTTACGCTG | TGTAGAATCG | ATTTACGCAT | 1020 |
ACAAGAATAT | GGACTTGCGC | TCACGCAAGC | CTCGGCCGTC | AGAGACTGAT | GTAATCATGA | 1080 |
AGCTACTCGG | CTCCCCCCTG | ATCTTTGGTG | ACTTCCTCGC | GCGCAGCGTG | CGGGGTCTCT | 1140 |
CGTGCGCGCC | ACCCTGCAAC | CTCATCCTTG | CCTGTAATTG | ACTGCTTGCT | ACTTACAAGA | 1200 |
ATGATGAGGT | GCCGAA ATG Met 1 | GCC GAC CAA Ala Asp Gin | . TAC GAA AAC CCA ATG GGC CTG , Tyr Glu Asn Pro Met Gly Leu 5 10 | 1249 |
ATG Met | GGC Gl y | TTT GAA | TTT Phe | ATT Ile | GAA Glu | TTC Phe | GCA Ala 20 | TCG Ser | CCG Pro | ACT Thr | CCG Pro | GGC Gly 25 | ACC Thr | CTG Leu | 1297 | |
Phe | Glu 15 | |||||||||||||||
GAG | CCG | ATC | TTC | GAG | ATC | ATG | GGC | TTC | ACC | AAA | GTC | GCG | ACC | CAC | CGC | 1345 |
Glu | Pro | Ile | Phe | Glu | Ile | Met | Gly | Phe | Thr | Lys | Val | Ala | Thr | His | Arg | |
30 | 35 | 40 | ||||||||||||||
TCC | AAG | AAT | GTG | CAC | CTG | TAC | CGC | CAG | GGC | GAG | ATC | AAC | CTG | ATC | CTC | 1393 |
Ser | Lvs | Asn | Val | His | Leu | Tyr | Arg | Gin | Gly | Glu | Ile | Asn | Leu | Ile | Leu | |
4 5 | 50 | 55 | ||||||||||||||
AAC | AAC | CAG | CCC | GAC | AGC | CTG | GCC | TCG | TAC | TTC | GCC | GCC | GAA | CAC | GGC | 1441 |
Asn | Asn | Gin | Pro | Asp | Ser | Leu | Ala | Ser | Tyr | Phe | Ala | Ala | Glu | His | Gly | |
60 | 65 | 70 | 75 | |||||||||||||
CCT | TCG | GTG | TGC | GGC | ATG | GCG | TTC | CGG | GTC | AAA | GAC | TCG | CAG | CAG | GCT | 1489 |
Pro | Ser | Val | Cys | Gly | Met | Al a | Phe | Arg | Val | Lys | Asp | Ser | Gin | Gin | Ala | |
* | 80 | 85 | 90 | |||||||||||||
TAC | AAC | CGC | GCG | TTG | GAA | CTG | GGC | GCC | CAG | CCG | ATT | CAT | ATC | GAA | ACC | 1537 |
Tyr | Asn | Arg | Ala | Leu | Glu | Leu | Gly | Ala | Gin | Pro | Ile | His | Ile | Glu | Thr | |
95 | 100 | 105 | ||||||||||||||
GGC | CCG | ATG | GAA | CTC | AAC | CTG | CCG | GCC | ATC | AAG | GGC | ATC | GGC | GGT | GCG | 1585 |
Gly | Pro | Met | Glu | Leu | Asn | Leu | Pro | Ala | Ile | Lys | Gly | Ile | Gly | Gly | Ala | |
110 | 115 | 120 | ||||||||||||||
CCG | CTG | TAC | CTG | ATC | GAC | CGC | TTC | GGT | GAA | GGC | AGC | TCG | ATA | TAT | GAC | 1633 |
Pro | Leu | Tyr | Leu | Ile | Asp | Arg | Phe | Gly | Glu | Gly | Ser | Ser | Ile | Tyr | Asp | |
125 | 130 | 135 | ||||||||||||||
ATC | GAC | TTC | GTG | TAC | CTC | GAA | GGT | GTC | GAC | CGC | AAC | CCG | GTA | GGC | GCG | 1681 |
Ile | Asp | Phe | Val | Tyr | Leu | Glu | Gly | Val | Asp | Arg | Asn | Pro | Val | Gly | Ala | |
140 | 145 | 150 | 155 |
• · « • · « • · · · · ι k · ··· » · « » · · • · · · ·
GGC Gly | CTC Leu | AAG Lys | GTC Val | ATC Ile 160 | GAC Asp | CAC His | CTG Leu | ACC Thr | CAC His 165 | AAC Asn | GTG Val | TAT Tyr | CGC Arg | GGC Gly 170 | CGC Arg | 1729 |
ATG | GCC | TAC | TGG | GCC | AAC | TTC | TAC | GAG | AAA | CTG | TTC | AAC | TTC | CGT | GAA | 1777 |
Met | Ala | Tyr | TrD 17 5 | Ala | Asn | Phe | Tyr | Glu 180 | Lys | Leu | Phe | Asn | Phe 185 | Arg | Giu | |
GCA | CGC | TAC | TTC | GAT | ATC | AAG | GGC | GAA | TAC | ACC | GGC | CTT | AGG | TCC | AAG | 1825 |
Ala | Arg | Tyr | Phe | Asp | Ile | Lys | Gly | Glu | Tyr | Thr | Gly | Leu | Thr | Ser | Lys | |
190 | 195 | 200 | ||||||||||||||
GCC | ATG | AGT | GCC | CCG | GAC | GGC | ATG | ATC | CGC | ATC | CCG | CTG | AAC | GAG | GAA | 1873 |
Ala | Met | Ser | Ala | Pro | Asp | Gly | Met | Ile | Arg | Ile | Pro | Leu | Asn | Glu | Glu | |
205 | 210 | 215 | ||||||||||||||
TCG | TCC | AAG | GGC | GCC | GGC | CAG | ATC | GAA | GAG | TTC | CTG | ATG | CAG | TTC | AAC | 1921 |
Ser | Ser | Lys | Gly | Ala | Gly | Gin | Ile | Glu | Glu | Phe | Leu | Met | Gin | Phe | Asn | |
220 | 225 | 230 | 235 | |||||||||||||
GAG | GGC | ATC | CAG | CAC | GTG | GCG | TTC | CTC | ACC | GAA | GAC | CTG | GTC | AAG | 1969 | |
Gly | Glu | Gly | Ile | Gin | His | Val | Ala | Phe | Leu | Thr | Glu | Asp | Leu | Val | Lys | |
240 | 245 | 250 | ||||||||||||||
ACC | TGG | GAT | GCG | TTG | AAG | AAG | ATC | GGC | ATG | CGC | TTC | ATG | ACC | GCG | CCG | 2017 |
Thr | Trp | Asp | Ala | Leu | Lys | Lys | Ile | Gly | Met | Arg | Phe | Met | Thr | Ala | Pro | |
255 | 260 | 265 | ||||||||||||||
CCG | GAC | ACC | TAC | TAC | GAA | ATG | CTC | GA.A | GGC | CGC | CTG | CCA | AAC | CAC | GGC | 20 65 |
Pro | Asp | Thr | Tyr | Tyr | Glu | Met | Leu | Glu | Gly | Arg | Leu | Pro | Asn | His | Gly | |
270 | 275 | 280 | ||||||||||||||
GAG | CCG | GTG | GAC | CAA | CTG | CAG | GCG | CGC | GGT | ATT | TTG | CTG | GAC | GGC | TCC | 2113 |
Glu | Pro | Val | Asp | Gin | Leu | Gin | Ala | Arg | Gly | Ile | Leu | Leu | Asp | Gly | Ser | |
285 | 290 | 295 | ||||||||||||||
TCG | ATC | GAG | GGC | GAC | AAG | CGC | CTG | CTG | CTG | CAG | ATC | TTC | TCG | GAA | ACC | 2161 |
Ser | Ile | Glu | Gly | Asp | Lys | Arg | Leu | Leu | Leu | Gin | Ile | Phe | Ser | Glu | Thr | |
300 | 305 | 310 | 315 | |||||||||||||
CTG | ATG | GGC | CCG | GTG | TTC | TTC | GAA | TTC | ATC | CAG | CGC | AAA | GGC | GAC | GAT | 2209 |
Leu | Met | Gly | Pro | Val | Phe | Pne | Glu | Phe | Ile | Gin | Arg | Lys | Gly | Asp | Asp | |
320 | 325 | 330 | ||||||||||||||
GGG | TTT | GGC | GAG | GGC | AAC | TTC | AAG | GCG | CTG | TTC | GAG | TCG | ATC | GAG | CGC | 2257 |
Gly | Phe | Gly | Glu | Gly | Asn | Phe | Lys | Ala | Leu | Phe | Glu | Ser | Ile | Glu | Arg | |
335 | 340 | 345 | ||||||||||||||
GAC | CAG | GTA | CGT | CGC | GGT | GTA | CTG | ACC | ACC | GAC | TAAGCGTCAG CAACAAAAAA | 2310 | ||||
Asp | Gin | Val | Arg | Arg | Gly | Val | Leu | Thr | Thr | Asp | ||||||
350 | 355 |
AGCCCGGCGA GAAGGTTTTC AGCCGGGCTT TTTAGTGCCT GCACGTTTTA AGCTTTGCGC 2370
TGACGCACCA AATGTTTGAA GCCTTCATAC ACCAGCACCA TCACGGCCAG CCAGATCGGG 2430
ATATACGTCA GCCATTGCCC GCCCTTGATG CCTTCGCCCA ACAACAAGGC CACAAAGAGC 2490
AGTAATACCG GCTCCACATA GCTGAGCAAC CCGAACAGGC TAAAGGCCAA TAAACGGCTG 2550
GCGATGATGT AGCTCACCAG CGCTGAAGCA CT 2582 • ·· ·· • · · • · · « • · ··· · · ’ • · · » · · ·· • · · · • · (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 358 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 4:
Met | Ala | Asp | Gin | Tyr | Glu | Asn | Pro | Met | Gly | Leu | Met Gly | Phe | Glu Phe |
1 | 5 | 10 | . 15 | ||||||||||
Ile | Glu | Phe | Ala | Ser | Pro | Thr | Pro | Gly | Thr | Leu | Glu Pro | Ile | Phe Glu |
20 | 25 | 30 | |||||||||||
Ile | Met | Gly | Phe | Thr | Lys | Val | Ala | Thr | His | Arg | Ser Lys | Asn | Val His |
35 | 40 | 45 | |||||||||||
Leu | Tyr | Arg | Gin | Gly | Glu | Ile | Asn | Leu· | Ile | Leu | Asn Asn | Gin | Pro Asp |
50 | 55 | 60 | |||||||||||
Ser | Leu | Ala | Ser | Tyr | Phe | Ala | Ala | Glu | His | Gly | Pro Ser | Val | Cvs Gly |
65 | 70 | — | 75 | 80 | |||||||||
Met | Ala | Phe | Arg | Val | Lys | Asp | Ser | Gin | Gin | Ala | Tyr Asn | Arg | Ala Leu |
85 | 90 | 95 | |||||||||||
Glu | Leu | Gly | Ala | Gin | Pro | Ile | His | Ile | Glu | Thr | Gly Pro | Met | Glu Leu |
100 | 105 | 110 | |||||||||||
Asn | Leu | Pro | Ala | Ile | Lys | Gly | Ile | Gly | Gly | Ala | Pro Leu | Tyr | Leu Ile |
115 | 120 | 125 | |||||||||||
Asp | Arg | Phe | Gly | Glu | Gly | Ser | Ser | Ile | Tyr | Asp | Ile Asp | Phe | Val Tyr |
130 | 135 | 140 | |||||||||||
Leu | Glu | Gly | Val | Asp | Arg | Asn | Pro | Val | Gly | Ala | Gly Leu | Lys | Val Ile |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||
Asp | His | Leu | Thr | His | Asn | Val | Tyr | Arg | Gly | Arg | Met Ala | Tyr | Trp Ala |
165 | 170 | 175 | |||||||||||
Asn | Phe | Tyr | Glu | Lys | Leu | Phe | Asn | Phe | Arg | Glu | Ala Arg | Tyr | Phe Asp |
180 | 185 | 190 | |||||||||||
Ile | Lys | Gly | Glu | Tyr | Thr | Gly | Leu | Thr | Ser | Lys | Ala Met | Ser | Al a Pro |
195 | 200 | 205 | |||||||||||
Asp | Gly | Met | Ile | Arg | Ile | Pro | Leu | Asn | Glu | Glu | Ser Ser | Lys | Gly Ala |
210 | 215 | 220 | |||||||||||
Gly | Gin | Ile | Glu | Glu | Phe | Leu | Met | Gin | Phe | Asn | Gly Glu | Gly | Ile Gin |
225 | 230' | 235 | 240 |
His | Val | Ala | Phe | Leu | Thr | Glu | Asp | Leu | Val | Lys | Thr | Trp | Asp | Ala | Leu |
245 | 250 | 255 | |||||||||||||
Lys | Lys | Ile | Gly | Met | Arg | Phe | Met | Thr | Ala | Pro | Pro | Asp | Thr | Tyr | Tyr |
260 | 265 | 270 | |||||||||||||
Glu | Met | Leu | Glu | Gly | Arg | Leu | Pro | Asn | His | Gly | Glu | Pro | Val | Asp | Gin |
275 | 280 | 285 | |||||||||||||
Leu | Gin | Ala | Arg | Gly | Ile | Leu | Leu | Asp | Gly | Ser | Ser | Ile | Glu | Gly | Asp |
290 | 295 | 300 | |||||||||||||
Lys | Arg | Leu | Leu | Leu | Gin | Ile | Phe | Ser | Glu | Thr | Leu | Met | Gly | Pro | Val |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||||
Phe | Phe | Glu | Phe | Ile | Gin | Arg | Lys | Gly | Asp | Asp | Gly | Phe | Gly | Glu | Gly |
325 | 330 | 335 | |||||||||||||
Asn | Phe | Lys | Ala | Leu | Phe | Glu | Ser | Ile | Glu | Arg | Asp | Gin | Val | Arg | Arg |
340 | 345 | 350 | |||||||||||||
Gly | Val | Leu | Thr | Thr | Asp |
355 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 5:
(i) CHARAKTERIŠTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 17 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 5:
TATGAGAATC CTATGGG ····
(2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 6:
(i) CHARA.KTERI ŠTIKA. SEKVENCE:
(A) DÉLKA.: 17 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTA.CE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 6:
GCTTTGAAGT TTCCCTC (2) INFOBMLACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 7:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA.: 4 6 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 7:
GTTAGGTACC AGTCTAGACT GACCATGGCC GACCAATACG AAAACC ···· ft · · • ft ·· (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 8:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 43 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis. = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 8:
TAGCGGTACC TGATCACCCG GGTTATTAGT CGGTGGTCAG TAC 43 (2) INFOPMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 9:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 516 aminokyselin (B) TYP: aminokyselina (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: protein (xí) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 9:
Met 1 | Ala | Gin | Ile | A.sn 5 | A.sn | Met | Ala | Gin | Gly 10 | Ile | Gin | Thr | Leu | Asn 15 | Pro |
Asn | Ser | Asn | Phe 20 | His | Lys | Pro | Gin | Val 25 | Pro | Lys | Ser | Ser | Ser 30 | Phe | Leu |
Val | Phe | Gly 35 | Ser | Lys | Lys | Len | Lys 40 | Asn | Ser | Ala | Asn | Ser 45 | Met | Leu | Val |
····
Leu Lys 50 | Lys | Asp.Ser | Ile | Phe 55 | Met | Gin.Lys | Phe | Cys 60 | Ser | Phe | Arg | Ile | |
Ser Ala | Ser | Val | Ala | Thr | Ala | Gin | Lys Pro | Ser | Glu | Ile | Val | Leu | Gin |
65 | 70 | 75 | 80 | ||||||||||
Pro Ile | Lys | Glu | Ile | Ser | Gly | Thr | Val Lvs | Leu | Pro | Gly | Ser | Lys | Ser |
85 | 90 | 95 | |||||||||||
Leu Ser | Asn | Arg | Ile | Leu | Leu | Leu | Ala Ala | Leu | Ser | Glu | Gly | Thr | Thr |
100 | 105 | 110 | |||||||||||
Val Val | As o | Asn | Leu | Leu | Ser | Ser | Asp Asp | Ile | His | Tyr | Met | Leu | Gly |
115 | 120 | 125 | |||||||||||
Ala Leu | Lys | Thr | Leu | Gly | Leu | His | Val Glu | Glu | Asp | Ser | Ala | Asn | Gin |
130 | 135 | 140 | |||||||||||
Arg Ala | Val | Val | Glu | Gly | Cys | Gly | Gly Leu | Phe | Pro | Val | Gly | Lys | Glu |
145 | 150 | 155 | 160 | ||||||||||
Ser Lys | Glu | Glu | Ile | Gin | Leu | Phe | Leu Gly | Asn | Ala | Gly | Thr | Ala | Met |
165 | 170 | 175 | |||||||||||
Arg Pro | Leu | Thr | Ala | Ala | Val | Thr | Val Ala | Gly | Gly | Asn | Ser | Arg | Tyr |
180 | 185 | 190 | |||||||||||
Val Leu | Aso | Gly | Val | Pro | Arg | Met | Arg Glu | Arg | Pro | Ile | Ser | Asp | Leu |
195 | 200 | 205 | |||||||||||
Val Asp | Gly | Leu | Lys | Gin | Leu | Gly | Ala Glu | Val | Asp | Cys | Phe | Leu | Gly |
210 | 215 | 220 | |||||||||||
Thr Lys | Cys | Pro | Pro | Val | Arg | Ile | Val Ser | Lys | Gly | Gly | Leu | Pro | Gly |
225 | 230 | 235 | 240 | ||||||||||
Gly Lys | Val | Lys | Leu | Ser | Gly | Ser | Ile Ser | Ser | Gin | Tyr | Leu | Thr | Ala |
245 | 250 | 255 | |||||||||||
Leu Leu | Met | Ala | Ala | Pro | Leu | Ala | Leu Gly | Asp | Val | Glu | Ile | Glu | Ile |
260 | 265 | 270 | |||||||||||
Ile Asp | Lys | Leu | Ile | Ser | Val | Pro | Tyr Val | Glu | Met | Thr | Leu | Lys ( | Leu |
275 | 280 | 285 | |||||||||||
Met Glu | Arg | Phe | Gly | Ile | Ser | Val | Glu His | Ser | Ser | Ser | Trp | Asp | Arg |
290 | 295 | 300 | |||||||||||
Phe Phe | Val | Arg | Gly | Gly | Gin | Lys | Tyr Lys | Ser | Pro | Gly | Lys | Ala | Phe |
305 | 310 | 315 | 320 | ||||||||||
Val Glu | Gly | Asp | Ala | Ser | Ser | Ala | Ser Tyr | Phe | Leu | Ala | Gly | Ala | Ala |
325 | 330. | 335 | |||||||||||
Val Thr | Gly | Gly | Thr | Ile | Thr | Val | Glu Gly | Cys | Gly | Thr | Asn | Ser | Leu |
340 | 345 | 350 | |||||||||||
Gin Gly | Asd | Val | Lys | Phe | Ala | Glu | Val Leu | Glu | Lys | Met | Gly | Ala | Glu |
355 | 360 | 365 | |||||||||||
Val Thr | Trp | Thr | Glu | Asn | Ser | Val | Thr Val | Lys | Gly | Pro | Pro | Arg | Ser |
375 380 • 9
9999 •9 9·9« » · 9 » 9 9 9 9
999
9 99 9
Ser 385 | Ser Gly Arg | Lys | His 390 | Leu | Arg Ala | Ile | Asp 395 | Val | Asn | Met | Asn | Lys 400 | ||
Met | Pro | Asp | Val | Ala 405 | Met | Thr | Leu Ala | Val 410 | Val | Ala | Leu | Tyr | Ala 415 | Asp |
Gly | Pro | Thr | Ala 420 | Ile | Arg | Asp | Val Ala 425 | Ser | Trp | Arg | Val | Lys 430 | Glu | Thr |
Glu | Arg | Met | Ile | Ala | Ile | Cys | Thr Glu | Leu | Arg | Lys | Leu | Gly | Ala | Thr |
435 | 440 | 445 |
Val | Glu 450 | Glu | Gly | Pro | Asp | Tyr 4 55 | Cys | Ile | Ile | Thr | Pro 460 | Pro | Glu | Lys | Leu |
Asn 465 | Val | Thr | Asp | Ile | Aso 4 70 | Thr | Tyr | Asp | Asp | His 475 | Arg | Met | Ala | Met | Ala 430 |
Phe | Ser | Len | Ala | Ala 485 | Cys | Ala | Asp | Val | Pro 490 | Val | Thr | Ile | Asn | Asp 495 | Pro |
Gly | Cys | Thr | Arg 500 | Lys | Thr | Phe | Pro | Asn 505 | Tyr | Phe | Asp | Val | Leu 510 | Gin | Gin |
Tyr Ser Lys His 515 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 10:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 17 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 10:
AACAAGGTGG CGCAGTT ···· • · ♦
0 ··<
0 ·
0 00 ·»»
00 0 0 0 0
0 0 ·
000 000 0 0
0« 0« (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 11:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 20 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 11:
CATCGCAAGA CCGGCAACAG 20 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 12:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 19 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (n) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 12:
GATCGCTACT AGCTTCCCA ···· • · · • · ··· • « · · · • · · ·· ··· • « · • · ··· *» · » • · · ·· ··· ···* ·· ·· • · · 4 • · · 4 «·· ··· • · ·· ·»
2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 13:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTAjCE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 13:
AATCAAGGTA ACCTTGAATC CA 2 2 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 14:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 18 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 14:
AATTACGGAA GCTTCCGT ·· ···« ·· ··*· ·· · · ··· · · · ···· • · ··· · · ··· · · · · • C 9 9 9 9 99 999999
9 9 9 9 9 9 9
999 99 999 99 99 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 15:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 20 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA.: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 15:
AGCTTGTACA CCGGTGTACA 2 0 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 16:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 16:
CGGACAATTA ATTGTCCGGT AC • · · · · · • · • ···· · ···· · ·· * φ · ··· · · · ······ • · e · · · · · • · ·· · ·· ··· ·· ·· (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 17:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYF: nukleová kyselina (C) TYP VLÁUCNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(Á) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 17;
CATTTGCGGC CGCAAATGGT AC 22 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 18:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. 0. 18:
AATTCATTTG CGGCCGCAAA TG
80 | flfl · · · · fl · · • · · · * • · fl · • · · • » · · | • · flflfl· flfl · · • · · ♦ · fl · • ···· · flfl · • < ·· ··· ··· • · fl flfl ·· flflfl flfl ·· | |
INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM | ČÍSLEM | 19 : | |
(i) | CHARAKTERISΤIPDA SEKVENCE : (A) DÉLKA: 20 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární | ||
(11) | TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer | ||
(iii | ) HYPOTETICKÁ: ne | ||
(iv) | OPAČNÁ ORIENTACE: ne | ||
(vi) | PŮVODNÍ ZDROJ: (A) ORGANISMUS: primer | ||
(xi) | POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. | 19 : | |
AGCTTGCAGC GGCCGCTGCA | 20 | ||
INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM | ČÍSLEM | 20 : | |
(i) | CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: (A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární | ||
(ii) | TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer | ||
(111 | ) HYPOTETICKÁ: ne | ||
(iv) | OPAČNÁ ORIENTACE: ne | ||
(Vi) | PŮVODNÍ ZDROJ: (A) ORGANISMUS: primer | ||
(xi) | POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. | 20: |
AATTCATTTG CGGCCGCAAA TG • 9 9 9 9 9
• · · 9 · 9 • · · • · 9 · · • · 4 • 4 · • « · · · • · « 4 » · · 4 » · · 4
9 4 99<
(2) INFOFRLACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 21:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA,: 28 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi)·POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 21:
CTCGAGTATT TTTACAACAA TTACCAAC 2 8 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 22:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 22 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁ2KNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (n) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /'popis = „primer (m) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 22:
AATCAAGGTA ACCTTGAATC CA • ·
ΒΒΒΒ t« · · • Β • Β
Β Β BBB · · ··· · · · · ·· · Β · B BB BBB BBB
BB ΒΒΒ Β Β B
BB BBB BB BBB BB BB (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 23:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 26 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 23:
ACCACCAACG GTGTTCTTGC TGTTGA (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 24:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 27 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (ni) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 24:
GCATTACATG TTAATTATTA CATGCTT • β · · • · • · ··· · · ··· · · « · . · a < · · ·· ······ ······ · · • · · · a ·· ··· «· · a (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 25:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 28 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNO.: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 25:
GTGATACGAG TTTCACCGCT AGCGAGAC 28 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 26:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A.) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 26:
TACCTTGCGT GGACCAAAGA CTCC
4 • · • · · · · « • · · ··· · · · 0 • ···· · · ··· · · · 0
0··· · · ··· *00 ······ · · • * · · 0 «0 · <· * · · · 0 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 27:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 27:
ATGGCTTCCG CTCAAGTGAA GTCC 24 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 28:
(i) CHARAKTERISTIKA. SEKVENCE:
(A) DÉLKA.: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne ívi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 28:
CGAGACCCAT AACGAGGAAG CTCA
4 • · • · · · • · • · · «·· · · · · • « · ·· · ···· · · · · • · ··· · · * ······ ····«· · · • · ··· · · · ·· · · · · (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 29:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA.: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA.: j e dno du c h é (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A.) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ.: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 29:
ATTGCGTGAT TTCGATCCTA ACTT 24 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKA.ČNÍM ČÍSLEM 30:
(i) CPLARAKTERIŠTIKA. SEKVENCE :
(A) DÉLKA: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A.) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A.) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 30:
GAGAGATGTC GATAGAGGTC TTCT
4 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 31:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 24 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer (iii) HYPOTETICKÁ: ne (iv) OPAČNÁ. ORIENTACE: ne (vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANISMUS: primer (xi) POPIS SEKVENCE: SEKVENCE S ID. Č. 31:
GGTGGAGCAC GACACACTTG TCTA 2 4 (2) INFORMACE PRO SEKVENCI S IDENTIFIKAČNÍM ČÍSLEM 32:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 18 párů baží (B) TYP: nukleová kyselina (C) TYP VLÁKNA: jednoduché (D) TOPOLOGIE: lineární (ii) TYP MOLEKULY: jiná nukleová kyselina (A) POPIS: /popis = „primer
Iii) | 1 HYPOTETICKÁ.: ne | |
iv) | OPAČNÁ ORIENTACE | : ne |
vi ) ' | PŮVODNÍ ZDROJ: (A) ORGANISMUS: | primer |
xi) | POPIS SEKVENCE: | SEKVENCE S ID |
GTCTCAATGT AATGGTTA
Claims (26)
- l·. Polynukleotid, který obsahuje alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvnímu herbicidu, a druhý úsek kódující druhý protein obdobně schopný udělit rostlině rezistenci k druhému herbicidu, a to za podmínek, že (I) polynukleotid nekóduje fůzní protein obsahující pouze 5-enolpyruvyl-3-fosfošikimátsyntetázu (EPSPS) a glutathion-S-transferázu (GST), (II) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující a glutathion-S-transferázu (GST) neobsahuje pouze úseky kódující acetyltransferázu (PAT).superoxiddismutázu (SOD) a (III) polynukleotid GST a fosfinotricin^oiynukieotid podJ naroxu kde ;re:A. CL A < A tt i i V z ussku ]e řízena promotorem aktivní v rostlině.terminátorem, které jsou
- 3. Polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde první herbicid je post-emergentní herbicid a druhý herbicid je pre-emergentní herbicid.
- 4. Polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde proteiny jsou vybrány ze skupiny obsahující glyphosatoxidoreduktázu, 5-enolpyruvyl-3-fosfošikímá-syntetázu, fosfionotricinacetyltransferázu, hydroxyfenylpyruvatdroxygenazu, glutathion-S-transferázu, cytochrom P450, acetylkoenzym-A-karboxylázu, acetolaktátsyntázu, protoporfyrinogenoxidázu, dihydropteroátsyntázu, polyaminové transportní proteiny, superoxiddismutázu, bromoxynilnitrilázu, fytoendesaturázu, produkt genu tfdA získatelného • · • · · ··· z Alcaligenes eutrophus, a známé mutované nebo jinak modifikované varianty uvedených proteinů.Lokoliv z nároků 1 až 4, protein schopný poskytnout k hmyzu, vysýchání a/nebo infekcím.
- 5. Polynukleotid podle kteréh který dále obsahuje úsek kódující rostlině rezistenci nebo toleranci houbovým, bakteriálním nebo virovým
- 6. Polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků, který obsahuje 5'-koncové sekvence souvisle sousedící s uvedenými úseky, kteréžto sekvence kódují (I) peptid schopný směrovat translační produkty úseků do plastidů jako např. chloroplastů, mitocnondrií, jiných organel nebe buněčné stěny a/nebo (II) netranslatované sekvence zesilující translaci .
- 7. Polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků, který je modifikován tak, že jsou odstraněny motivy nestability mRNA a/nebo náhodná sestřihová místa, nebo jsou užity kodony přednostně užívané rostlinami, takže exprese takto modifikovaných polynukleotidů v rostlinách vede k produkci podstatně podobných proteinů s podstatně podobnou aktivitou/funkcí těm proteinům, které jsou získány expresí nemodifikovaných polynukleotidů v organismu, ve kterém jsou úseky nemodifikovaného polynukleotidů kóduj.ící protein endogenními, a to za předpokladu, jestliže takto modifikovaný polynukleotid obsahuje kodony přednostně užívané rostlinami, stupeň identity mezi úseky kódujícími protein v modifikovaném polynukleotidů a obdobnými úseky kódujícími protein endogenně obsaženými v dané rostlině a kódujícími v podstatě identický protein je menší než asi 70%.• · · · · · • · • · · · • · • · > · « « · · <» · · <·* ·♦· ·· • · · · • « • fl » ···
- 8. Polynukleotid podle kteréhokoliv z nároků 3 až 7, kde pre-emergentní herbicidy je možné vybrat obsahující dinitroanilinové herbicidy, ze skupiny difenyléter, sulfonylmočovinu, fosfosulfonáty, oxyacetamidy, tetrazclinony a N-karbamoyltetrazolinony, imidazolinony, thiokarbamát, triazin, triazolopyrrmidiny, uráčil, fenylmočovinu, triketon, isoxazoi,acetanilid, oxadiazol, triazicnon, sulfonanilid, amid, anilid, RP201772, flurocnloridon, norflurazon a herbicidy tatrazolinonovéno typu, a post-emergentní herbicidy jsou vybrány ze skupiny obsahující glyphosat a jeho soli, glufosinát, asulam, bentazon, bialafos, bromacil, sethoxydim a další cyklohexandiony, dicamba, fosamin, flupoxam, fenoxyprionát, quizalofop a další aryloxvfenoxypropanoáty, picloram, fluormetron, atrazin a další triaziny, metribuzin, chlorimuron, chlorsulfuron, flumetsuiam, halosulfuron, sulfometron, imazaquin, isoxaben, imazamox, metosulam, pyrithrobac, bensuifuron, nicosulfuroň, imazethapyr, rímsulfuron, fluroglycofen, KIH92Q1, ET751, carfentrazon, ZA1296, sulcotrion, paraquat, diquat, bromoxynil a fenoxaprop.fomesafen,
- 9. Polynukleotid podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde pre-emergentní herbicid je vybrán ze skupiny obsahující acetanilidy, triketony, inhibitory PDS, thiokarbamáty, tetrazolinony, a post-emergentní herbicid je vybrán ze skupiny obsahující glyphosat, glufosinát, paraquat a bialaphos.
- 10. Vektor, který obsahuje polynukleotid podle kteréhokoliv z nároků 1 až.9.• · · · · · • 44 4 4 444 4 4 • 4 ···4· ··
- 11. Rostlina, která obsahuje polynukleotid obsahující alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvními herbicidu, a polynukleotid obsahující druhý úsek kódující druhý protein schopný udělit obdobně rezistenci nebo toleranci k druhému herbicidu, a to za podmínek, ;anunící že (I) poiynukleorid nekóduje fúzní protein pouze 5-enolpyruvyl-3-fos foš ikimátsyntetázu (EPSPS) a glutathion-S-transferázu (GST), (II) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující superoxidismutázu (SOD) a glutathion-S-transferázu (GST), (III) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující GST a fosfinotricinacetyltransferázu (PAT), a (IV) že pokud je plodinou cukrová řepa, geny udělující rezistenci nebo toleranci k herbicidu, které obsahuje, nejsou pouze geny EPSPS a PAT.
- 12. Rostlina podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde první herbicid je pre-emrgentní herbicid a druhý herbicid je post-emergentní herbicid.
- 13. Rostliny včetně jejich částí, semen a jejich potomstva, které jsou rezistentní k alespoň dvěma herbicidům, a které byly získány z materiálu, který byl transformován polynukleotidem podle kteréhokoliv z nároků 1 až 9 nebo vektorem podle nároku 10.Rostliny podle kteréhokoliv z předchozích nároků vybrané ze skupiny obsahující obiloviny, plodiny pěstované pro vlákno, ovocné plantážové plodiny a stromy.olej niny, plodiny, technické zeleniny, • · • * ··· · ·· ·· • a · ··
- 15. Rostliny podle kteréhokoliv z nároků 11 až 14, které jsou vybrány ze skupiny, do které patří sója, bavlník, tabák, cukrová řepa, řepka olejka, kanola, len, slunečnice, brambor, rajče, vojtěška, salát hlávkový, kukuřice, pšenice, čirok, žito, banánovník, ječmen, oves, trávníkové trávy, picni trávy, cukrová třtina, hrách, polní fazol, rýže, borovice, topol, jabloň, grapefruit, citrusovník a ořech, a také potomstvo, semena nebo části takových rostlin.
- 16. Způsob selektivního hubení plevelů na poli s plevelem a plodinou vyznačující se tím, že plodina obsahuje polynukleotid obsahující alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvními herbicidu, a druhý úsek kódující druhý protein schopný uděliz obdobně rezistenci nebo toleranci k druhému herbicidu, a to za podmínek, že (I) polynukleotid nekóduje fúzní protein obsahující pouze 5-enolpyruvyl-3fosfošikimátsyntetázu (EPSPS) a glutathion-S-transferázu (GST), (II) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující superoxidismutázu (SOD) a glutathion-S-transferázu (GST), (III) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující GST a fosfinotricinacetyl-transferázu (PAT), a (IV) že pokud je plodinou cukrová řepa, geny udělující rezistenci nebo toleranci k herbicidu, které obsahuje, nejsou pouze geny EPSPS a PAT, nebo (II) polynukleotid obsahující alespoň první úsek kódující první protein schopný udělit rostlině nebo pletivu, které ho obsahují, rezistenci nebo toleranci k prvními herbicidu, a polynukleotid kódující druhý protein schopný udělit obdobně rezistenci nebo toleranci k druhému herbicidu, a to za podmínek, že (I) polynukleotid nekóduje fúzní protein obsahující pouze 5-enolpyruvyl-392 fosfošikimátsyntetázu (EPSPS) a glutathion-S-transferázu (GST), (II) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující superoxidismutázu (SOD) a glutathion-S-transferázu (GST), (III) polynukleotid neobsahuje pouze úseky kódující GST a fosfinotricinacetyltransferázu (PAT) a (IV) že pokud je plodinou cukrová řepa, geny udělující rezistenci nebo toleranci k herbicidu, které obsahuje, nejsou pouze EPSPS a PAT, přičemž se na pole aplikuje alespoň jeden z'uvedených herbicidů v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 17. Způsob podle předchozího nároku 16 vyznačující se tím, že plodina obsahuje gen kódující enzym EPSPS a gen kódující enzym GST, přičemž se na pole aplikuje glyphosat a acetanilid v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
18. Způsob podle nároku 16 vyzná č u j í c í s e tím, že plodina obsahuje gen kóduj ící enzym HPPD a gen kódující enzym PAT, přičemž se na pole aplikuje t .riketon a glufosinát v bez podstatného množství dostat ovlivnění plodiny. ečném k vyhubení ple velu 19. Způsob podle nároku 16 vvzna č u j í c í s e t í m, že plodina obsahuje gen kóduj ící enzym PAT a gen kódující enzym GST, přičemž se na pole aplikuje glufosinát a acetanilid, thiokarbamát a/nebo tetrazolinon v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny. - 20. Způsob podle nároku 16 vyznačující se t í m, že plodina obsahuje gen kódující enzym EPSPS a/nebo4 44 444 4 4 • 44 4 · 4 4 4 4 · • 4 ··· · 4 444 4 4 4 444 4444 44 444 44444444· 4444 444 *4 444 44 44 enzym GOX a gen kódující enzym HPPD, přičemž se na pole aplikuje glyphosat a triketon v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 21. Způsob podle nároku 16 vyznačující se tím, že plodina obsahuje gen kódující enzym PDS a gen kódující enzym EPSPS a/nebo enzym GOX, přičemž se na pole aplikuje inhibitor PDS a glyphosat v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 22. Způsob podle nároku 16 vyznačující se tím, že plodina obsahuje gen kódující enzym EPSPS a/nebo enzym GOX a gen kódující enzym PAT, přičemž se na pole aplikuje glyphosat a glufosinat v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny, a to za podmínky, že plodina není cukrová řepa.
- 23. Způsob podle nároku 16 vyznačující se tím, že plodina obsahuje gen kódující enzym PDS a gen kódující enzym PA3T, přičemž se na pole aplikuje inhibitor PDS a glufosinat v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 24. Způsob podle nároku 16 vyznačující se tím, že plodina obsahuje gen kódující enzym PDS a gen kódující enzym GST, přičemž se na pole aplikuje inhibitor PDS a acetani1idový herbicid v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 25. Způsob podle kteréhokoliv z nároků 17 až 24 vyznačující se tím, že plodina dále obsahuje gen kódující ALS, SOD nebo BNX, přičemž se na pole aplikuje ·· ···· • 9 ··· · • fcfc · · · • · • fc ·· sulfonylmočovina, paraquat nebo bromoxynilový herbicid v množství dostatečném k vyhubení plevelů bez podstatného ovlivnění plodiny.
- 26. Způsob podle vyznačuj ící kteréhokoliv se tím, z nároků 16 az že se dále na pole aplikuje pesticidně účinné množství jednoho nebo několika insekticidů, fungicidů, antivirových prostředků.baktericidů, nematicidů nebo jsou poastatne
- 27. Způsob přípravy rostlin, které tolerantní nebo podstatně rezistentní vůči dvěma nebo více herbicidům, vyznačující se tím, že obsahuje kroky, kdy:(I) rostlinný materiál pod’ nároku 10, (II) takto transformovaný materiál se selektuje a (III) takto selektovaný materiál se regeneruje do celých morfologicky normálních fertilních rostlin.se transformuje polynukieotidem ί až 9 nebo vektorem podle
- 28. Použití polynukleotidu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 9 nebo vektoru podle nároku 10 pro přípravu rostlinného pletiva a/nebo celých morfologicky normálních fertilních rostlin (I),které jsou podstatně tolerantní nebo podstatně rezistentní ke dvěma nebo více herbicidům.
- 29. Použití polynukleotidu podle kteréhokoliv z nároků 1 až 9 nebo vektoru podle nároku 10 pro přípravu herbicidového cíle pro vysokokapacitní in vitro screening potenciálních herbicidů.• · ·· ····I · ··· » · 4 » · 4 ·· ··· • · • ··· ·· fc··· ·· > · · * » · · · • « · · · · « · ·· ··
- 30. Použití podle předchozího nároku, kde úseky polynukleotidu kódující proteiny jsou heterologně exprimovány v E. coli nebo kvasinkách.
Applications Claiming Priority (4)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9623248.3A GB9623248D0 (en) | 1996-11-07 | 1996-11-07 | Herbicide resistant plants |
GBGB9625957.7A GB9625957D0 (en) | 1996-12-13 | 1996-12-13 | Improvements in or relating to organic compounds |
GBGB9703855.8A GB9703855D0 (en) | 1997-02-25 | 1997-02-25 | Improvements in or relating to organic compounds |
PCT/GB1997/002996 WO1998020144A2 (en) | 1996-11-07 | 1997-10-31 | Herbicide resistant plants |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CZ161699A3 true CZ161699A3 (cs) | 1999-08-11 |
Family
ID=27268575
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CZ991616A CZ161699A3 (cs) | 1996-11-07 | 1997-10-31 | Polynukleotid kódující rezistenci nebo toleranci k herbicidům, rostlina obsahující tento polynukleotid a způsob selektivního hubení plevelů |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
EP (2) | EP0946737A2 (cs) |
JP (1) | JP2001503625A (cs) |
KR (1) | KR20000053140A (cs) |
CN (1) | CN1236394A (cs) |
AU (1) | AU4789597A (cs) |
BG (1) | BG103462A (cs) |
BR (1) | BR9712695A (cs) |
CA (1) | CA2269666A1 (cs) |
CZ (1) | CZ161699A3 (cs) |
IL (1) | IL129707A0 (cs) |
NZ (1) | NZ335101A (cs) |
PL (1) | PL333131A1 (cs) |
SK (1) | SK60999A3 (cs) |
WO (1) | WO1998020144A2 (cs) |
Families Citing this family (56)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6069115A (en) * | 1997-11-12 | 2000-05-30 | Rhone-Poulenc Agrochimie | Method of controlling weeds in transgenic crops |
JP2002520024A (ja) * | 1998-07-10 | 2002-07-09 | カルジーン エルエルシー | 植物色素体における除草剤耐性遺伝子の発現 |
US6492578B1 (en) * | 1998-07-10 | 2002-12-10 | Calgene Llc | Expression of herbicide tolerance genes in plant plastids |
PT1104243E (pt) | 1998-08-13 | 2013-05-07 | Bayer Cropscience Ag | Herbicidas para culturas de milho tolerantes ou resistentes |
DE19836700A1 (de) | 1998-08-13 | 2000-02-17 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Herbizide Mittel für tolerante oder resistente Getreidekulturen |
DE19836660A1 (de) | 1998-08-13 | 2000-02-17 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Herbizide Mittel für tolerante oder resistente Sojakulturen |
DE19836684A1 (de) | 1998-08-13 | 2000-02-17 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Herbizide Mittel für tolerante oder resistente Reiskulturen |
DE19836659A1 (de) | 1998-08-13 | 2000-02-17 | Hoechst Schering Agrevo Gmbh | Herbizide Mittel für tolerante oder resistente Baumwollkulturen |
WO2000012732A2 (en) * | 1998-08-28 | 2000-03-09 | Pioneer Hi-Bred International, Inc. | Organelle targeting sequences |
AU2924800A (en) * | 1999-03-03 | 2000-09-21 | Syngenta Limited | Use of glutathione-s-transferase to increase stress tolerance in plants |
US20020079846A1 (en) * | 2000-01-18 | 2002-06-27 | Facchini Peter James | Novel glutathione-S-transferase nucleic acids and polypeptides and methods of use thereof |
IL153601A0 (en) * | 2000-06-27 | 2003-07-06 | Basf Ag | Cyanobacterial nucleic acid fragments encoding proteins useful for controlling plant traits via nuclear or plastome transformation |
US7083967B1 (en) | 2000-06-27 | 2006-08-01 | Basf Corporation | Cyanobacterial nucleic acid fragments encoding proteins useful for controlling plant traits via nuclear or plastome transformation |
ES2538471T3 (es) | 2000-12-07 | 2015-06-22 | Syngenta Limited | Hidroxi fenil piruvato dioxigenasas (HPPD) derivadas de plantas y resistentes frente a herbicidas tricetónicos, y plantas transgénicas que contienen estas dioxigenasas |
JP4779283B2 (ja) * | 2001-10-19 | 2011-09-28 | 住友化学株式会社 | 雑草防除剤代謝蛋白質、その遺伝子およびその利用 |
ATE536409T1 (de) | 2001-10-19 | 2011-12-15 | Sumitomo Chemical Co | Unkrautbekämpfungsstoffwechselproteine, gene dafür und ihre verwendung |
EP2278017B1 (en) | 2002-02-26 | 2015-03-25 | Syngenta Limited | A method of selectively producing male or female sterile plants |
CN1330762C (zh) * | 2002-05-10 | 2007-08-08 | 北京大学 | 新的草甘膦耐受型5-烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合酶及其编码基因 |
EP2308977B2 (en) | 2004-04-30 | 2017-04-26 | Dow AgroSciences LLC | Novel herbicide resistance gene |
JP4720223B2 (ja) * | 2004-05-18 | 2011-07-13 | 住友化学株式会社 | 除草活性化合物耐性植物 |
CN103361316B (zh) | 2005-10-28 | 2017-05-17 | 美国陶氏益农公司 | 新除草剂抗性基因 |
US20070154963A1 (en) * | 2005-12-30 | 2007-07-05 | Danying Cai | Method to determine whether a compound is a cellular GSTpi inhibitor |
BRPI0712484B1 (pt) | 2006-06-06 | 2017-06-06 | Monsanto Technology Llc | método para seleção de células transformadas |
US7855326B2 (en) | 2006-06-06 | 2010-12-21 | Monsanto Technology Llc | Methods for weed control using plants having dicamba-degrading enzymatic activity |
US7838729B2 (en) * | 2007-02-26 | 2010-11-23 | Monsanto Technology Llc | Chloroplast transit peptides for efficient targeting of DMO and uses thereof |
EP3290520B1 (en) | 2007-03-09 | 2021-07-14 | Monsanto Technology LLC | Preparation and use of plant embryo explants for transformation |
CN101668419B (zh) * | 2007-04-04 | 2016-03-23 | 巴斯福植物科学有限公司 | Ahas突变体 |
MX2009012120A (es) * | 2007-05-09 | 2010-02-12 | Dow Agrosciences Llc | Genes novedosos con resistencia a herbicidas. |
WO2008150473A2 (en) * | 2007-05-30 | 2008-12-11 | Syngenta Participations Ag | Cytochrome p450 genes conferring herbicide resistance |
ES2619279T3 (es) | 2009-01-22 | 2017-06-26 | Syngenta Participations Ag. | Polipéptidos de Hidroxifenilpiruvato Dioxigenasa mutantes y métodos de uso |
US9347046B2 (en) | 2009-01-22 | 2016-05-24 | Syngenta Participations Ag | Hydroxyphenylpyruvate dioxygenase polypeptides and methods of use |
US9175305B2 (en) | 2009-01-22 | 2015-11-03 | Syngenta Participations Ag | Mutant hydroxyphenylpyruvate dioxygenase polypeptides and methods of use |
CN102762725A (zh) * | 2009-12-23 | 2012-10-31 | 拜尔知识产权有限公司 | 耐受hppd抑制剂型除草剂的植物 |
UY33141A (es) * | 2009-12-23 | 2011-07-29 | Bayer Cropscience Ag | Plantas tolerantes a herbicidas inhibidores de las hppd |
UY33140A (es) * | 2009-12-23 | 2011-07-29 | Bayer Cropscience Ag | Plantas tolerantes a herbicidas inhibidores de las hppd |
EA201290616A1 (ru) * | 2010-01-07 | 2013-02-28 | Басф Агро Б.В., Арнхем (Нл), Цвайгнидерлассунг Веденсвиль | Устойчивые к гербициду растения |
KR20140021581A (ko) | 2011-03-07 | 2014-02-20 | 스미또모 가가꾸 가부시끼가이샤 | 논벼 경작에서의 잡초들의 제어 방법 |
CN102776158B (zh) * | 2012-06-14 | 2013-10-23 | 重庆市农业科学院 | 一种抗草甘膦EPSP合成酶GmEPSPS-2及其编码基因与应用 |
BR112015005674B1 (pt) * | 2012-09-14 | 2022-09-06 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Polipeptídeos recombinantes para conferir tolerância à herbicidas |
BR112016020889B1 (pt) | 2014-03-11 | 2022-10-04 | BASF Agricultural Solutions Seed US LLC | Molécula de ácido nucleico recombinante, célula hospedeira bacteriana, proteína hppd recombinante, uso do ácido nucleico recombinante e produto de base |
BR112016028069A2 (pt) * | 2014-06-06 | 2017-10-24 | Univ Cornell | composições e processos para impedimento de alimentação por psilídeos |
AU2015288157A1 (en) * | 2014-07-11 | 2017-01-19 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Compositions and methods for producing plants resistant to glyphosate herbicide |
CN104611304B (zh) * | 2014-12-22 | 2017-05-17 | 北京大北农生物技术有限公司 | 除草剂耐受性蛋白质、其编码基因及用途 |
CN104878094B (zh) * | 2015-04-30 | 2019-01-15 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9888的核酸序列及其检测方法 |
CN104878096B (zh) * | 2015-04-30 | 2019-01-15 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9868的核酸序列及其检测方法 |
CN104830845B (zh) * | 2015-04-30 | 2018-10-30 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9878的核酸序列及其检测方法 |
CN104878095B (zh) * | 2015-04-30 | 2018-10-26 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9858的核酸序列及其检测方法 |
CN104878090B (zh) * | 2015-04-30 | 2019-01-15 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9877的核酸序列及其检测方法 |
CN104830846B (zh) * | 2015-04-30 | 2018-10-30 | 北京大北农科技集团股份有限公司 | 用于检测除草剂耐受性玉米植物dbn9898的核酸序列及其检测方法 |
JP6873979B2 (ja) | 2015-09-11 | 2021-05-19 | バイエル・クロップサイエンス・アクチェンゲゼルシャフト | Hppd変異体および使用方法 |
CN105603047A (zh) * | 2015-12-31 | 2016-05-25 | 中国烟草总公司郑州烟草研究院 | 一种适用于植物全蛋白提取液的GSTs活性分析方法 |
WO2017184727A1 (en) | 2016-04-21 | 2017-10-26 | Bayer Cropscience Lp | Tal-effector mediated herbicide tolerance |
US11708565B2 (en) | 2017-03-07 | 2023-07-25 | BASF Agricultural Solutions Seesi US LLC | HPPD variants and methods of use |
WO2019083810A1 (en) | 2017-10-24 | 2019-05-02 | Basf Se | IMPROVING HERBICIDE TOLERANCE FOR 4-HYDROXYPHENYLPYRUVATE DIOXYGENASE (HPPD) INHIBITORS BY NEGATIVE REGULATION OF HPPD EXPRESSION IN SOYBEANS |
US20210032651A1 (en) | 2017-10-24 | 2021-02-04 | Basf Se | Improvement of herbicide tolerance to hppd inhibitors by down-regulation of putative 4-hydroxyphenylpyruvate reductases in soybean |
WO2019233349A1 (zh) | 2018-06-04 | 2019-12-12 | 青岛清原化合物有限公司 | 突变型对羟苯基丙酮酸双氧化酶、其编码核酸以及应用 |
Family Cites Families (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US7705215B1 (en) * | 1990-04-17 | 2010-04-27 | Dekalb Genetics Corporation | Methods and compositions for the production of stably transformed, fertile monocot plants and cells thereof |
DE4003045A1 (de) * | 1990-02-02 | 1991-08-08 | Hoechst Ag | Virus/herbizidresistenz-gene, verfahren zu ihrer herstellung und ihre verwendung |
DK0536330T3 (da) * | 1990-06-25 | 2002-04-22 | Monsanto Technology Llc | Glyphosattolerante planter |
JP3173785B2 (ja) * | 1990-08-31 | 2001-06-04 | モンサント カンパニー | グリホセート耐性5―エノールピルビルシキミ酸―3―ホスフェートシンターゼ |
US5290926A (en) * | 1990-09-14 | 1994-03-01 | Ciba-Geigy Corporation | Isolated DNA Encoding plant histidinol dehydrogenase |
HU216644B (hu) * | 1991-03-12 | 1999-07-28 | Hoechst Ag. | Eljárás ariloxi-fenoxi-alkánkarbonsav típusú herbiciddekel szemben rezisztens kukorica előállítására |
US5491076A (en) * | 1993-11-01 | 1996-02-13 | The Texas A&M University System | Expression of foreign genes using a replicating polyprotein producing virus vector |
US5767373A (en) * | 1994-06-16 | 1998-06-16 | Novartis Finance Corporation | Manipulation of protoporphyrinogen oxidase enzyme activity in eukaryotic organisms |
US5631152A (en) * | 1994-10-26 | 1997-05-20 | Monsanto Company | Rapid and efficient regeneration of transgenic plants |
GB9515941D0 (en) * | 1995-08-03 | 1995-10-04 | Zeneca Ltd | DNA constructs |
DE69636637T2 (de) * | 1995-04-20 | 2007-08-23 | Basf Ag | Auf basis ihrer struktur entworfene herbizid-resistente produkte |
FR2751347B1 (fr) * | 1996-07-16 | 2001-12-07 | Rhone Poulenc Agrochimie | Gene chimere a plusieurs genes de tolerance herbicide, cellule vegetale et plante tolerantes a plusieurs herbicides |
-
1997
- 1997-10-31 CN CN97199541A patent/CN1236394A/zh active Pending
- 1997-10-31 NZ NZ335101A patent/NZ335101A/xx unknown
- 1997-10-31 EP EP97910550A patent/EP0946737A2/en not_active Withdrawn
- 1997-10-31 AU AU47895/97A patent/AU4789597A/en not_active Abandoned
- 1997-10-31 PL PL97333131A patent/PL333131A1/xx unknown
- 1997-10-31 WO PCT/GB1997/002996 patent/WO1998020144A2/en not_active Application Discontinuation
- 1997-10-31 KR KR1019990704072A patent/KR20000053140A/ko not_active Application Discontinuation
- 1997-10-31 CA CA002269666A patent/CA2269666A1/en not_active Abandoned
- 1997-10-31 EP EP06000993A patent/EP1728868A2/en not_active Withdrawn
- 1997-10-31 BR BR9712695-0A patent/BR9712695A/pt unknown
- 1997-10-31 SK SK609-99A patent/SK60999A3/sk unknown
- 1997-10-31 JP JP52113198A patent/JP2001503625A/ja active Pending
- 1997-10-31 CZ CZ991616A patent/CZ161699A3/cs unknown
- 1997-10-31 IL IL12970797A patent/IL129707A0/xx unknown
-
1999
- 1999-06-03 BG BG103462A patent/BG103462A/xx unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
SK60999A3 (en) | 1999-10-08 |
BR9712695A (pt) | 1999-10-19 |
CA2269666A1 (en) | 1998-05-14 |
JP2001503625A (ja) | 2001-03-21 |
EP0946737A2 (en) | 1999-10-06 |
EP1728868A2 (en) | 2006-12-06 |
BG103462A (en) | 2000-01-31 |
NZ335101A (en) | 2000-11-24 |
KR20000053140A (ko) | 2000-08-25 |
CN1236394A (zh) | 1999-11-24 |
IL129707A0 (en) | 2000-02-29 |
WO1998020144A2 (en) | 1998-05-14 |
PL333131A1 (en) | 1999-11-22 |
AU4789597A (en) | 1998-05-29 |
WO1998020144A3 (en) | 1998-07-16 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CZ161699A3 (cs) | Polynukleotid kódující rezistenci nebo toleranci k herbicidům, rostlina obsahující tento polynukleotid a způsob selektivního hubení plevelů | |
US20090229006A1 (en) | Herbicide resistant plants | |
JP7118047B2 (ja) | 植物における遺伝子発現のための方法及び組成物 | |
EP1173582B1 (en) | Herbicide resistant plants | |
AU2007329208B2 (en) | Novel selectable marker genes | |
PL190393B1 (pl) | Konstrukt chimerowy zawierający gen chimerowy elementarny, wektor, komórka roślinna, roślina, sposób nadawania oporności na herbicydy roślinom, sposób uzyskiwania roślin o tolerancji na wiele herbicydów oraz sposób działania herbicydem na rośliny | |
CZ29198A3 (cs) | Genová expresní kazeta poskytující indukovatelnou rezistenci k herbicidu | |
HRP960245A2 (en) | Dna sequence of a gene of hydroxy-phenyl pyruvate dioxygenase and production of plants containing a gene of hydroxy-phenyl pyruvate dioxygenase and which are tolerant to certain herbicides | |
JP2010526535A (ja) | 新規な除草剤抵抗性遺伝子 | |
WO2000066746A1 (en) | Herbicide resistant plants | |
EP1173581A1 (en) | Herbicide resistant plants | |
RU2628504C2 (ru) | Способы повышения урожайности резистентных к 2,4-d сельскохозяйственных культур | |
CA2321965A1 (en) | Method of producing plants which are tolerant or resistant to herbicides | |
AU2004203646A1 (en) | Herbicide resistant plants | |
MXPA99004200A (en) | Herbicide resistant plants | |
US20160295862A1 (en) | Methods of improving the yield of 2,4-d resistant crop plants | |
ZA200108766B (en) | Herbicide resistant plants. | |
ZA200108769B (en) | Herbicide resistant plants. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD00 | Pending as of 2000-06-30 in czech republic |