CS231161B2 - Method of separating of nucleid acid mixtures - Google Patents
Method of separating of nucleid acid mixtures Download PDFInfo
- Publication number
- CS231161B2 CS231161B2 CS781289A CS128978A CS231161B2 CS 231161 B2 CS231161 B2 CS 231161B2 CS 781289 A CS781289 A CS 781289A CS 128978 A CS128978 A CS 128978A CS 231161 B2 CS231161 B2 CS 231161B2
- Authority
- CS
- Czechoslovakia
- Prior art keywords
- nucleic acids
- anion
- group
- stranded
- polymeric
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 18
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 18
- 239000002253 acid Substances 0.000 title claims description 13
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 25
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 25
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 25
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 claims description 7
- 239000008139 complexing agent Substances 0.000 claims description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 claims description 3
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 claims description 2
- -1 alkali metal salt Chemical class 0.000 claims description 2
- 239000008055 phosphate buffer solution Substances 0.000 claims description 2
- 239000012266 salt solution Substances 0.000 claims description 2
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 claims 3
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims 3
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 claims 2
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims 2
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims 2
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 claims 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims 2
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 claims 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 1
- 239000002250 absorbent Substances 0.000 claims 1
- 230000002745 absorbent Effects 0.000 claims 1
- 239000012445 acidic reagent Substances 0.000 claims 1
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 claims 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 claims 1
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 claims 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 claims 1
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Substances N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims 1
- QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N nitrogen group Chemical group [N] QJGQUHMNIGDVPM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 abstract description 7
- 238000000926 separation method Methods 0.000 abstract description 7
- 239000000463 material Substances 0.000 abstract description 6
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 abstract description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 abstract description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 abstract description 2
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 abstract description 2
- PXFBZOLANLWPMH-UHFFFAOYSA-N 16-Epiaffinine Natural products C1C(C2=CC=CC=C2N2)=C2C(=O)CC2C(=CC)CN(C)C1C2CO PXFBZOLANLWPMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract 2
- 239000000975 dye Substances 0.000 abstract 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 17
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 7
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 5
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 4
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 3
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 3
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 2
- 238000005192 partition Methods 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 108010077544 Chromatin Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N Formic acid Chemical class OC=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229910052792 caesium Inorganic materials 0.000 description 1
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 210000003483 chromatin Anatomy 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- LLHRMWHYJGLIEV-UHFFFAOYSA-N desoxy Chemical group COC1=CC(CCN)=CC(OC)=C1C LLHRMWHYJGLIEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 238000011835 investigation Methods 0.000 description 1
- 101150025632 iolJ gene Proteins 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J20/00—Solid sorbent compositions or filter aid compositions; Sorbents for chromatography; Processes for preparing, regenerating or reactivating thereof
- B01J20/30—Processes for preparing, regenerating, or reactivating
- B01J20/32—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating
- B01J20/3231—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating characterised by the coating or impregnating layer
- B01J20/3242—Layers with a functional group, e.g. an affinity material, a ligand, a reactant or a complexing group
- B01J20/3244—Non-macromolecular compounds
- B01J20/3246—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure
- B01J20/3248—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure the functional group or the linking, spacer or anchoring group as a whole comprising at least one type of heteroatom selected from a nitrogen, oxygen or sulfur, these atoms not being part of the carrier as such
- B01J20/3255—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure the functional group or the linking, spacer or anchoring group as a whole comprising at least one type of heteroatom selected from a nitrogen, oxygen or sulfur, these atoms not being part of the carrier as such comprising a cyclic structure containing at least one of the heteroatoms nitrogen, oxygen or sulfur, e.g. heterocyclic or heteroaromatic structures
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01D—SEPARATION
- B01D15/00—Separating processes involving the treatment of liquids with solid sorbents; Apparatus therefor
- B01D15/08—Selective adsorption, e.g. chromatography
- B01D15/26—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism
- B01D15/38—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism involving specific interaction not covered by one or more of groups B01D15/265 and B01D15/30 - B01D15/36, e.g. affinity, ligand exchange or chiral chromatography
- B01D15/3804—Affinity chromatography
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J20/00—Solid sorbent compositions or filter aid compositions; Sorbents for chromatography; Processes for preparing, regenerating or reactivating thereof
- B01J20/30—Processes for preparing, regenerating, or reactivating
- B01J20/32—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating
- B01J20/3214—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating characterised by the method for obtaining this coating or impregnating
- B01J20/3217—Resulting in a chemical bond between the coating or impregnating layer and the carrier, support or substrate, e.g. a covalent bond
- B01J20/3219—Resulting in a chemical bond between the coating or impregnating layer and the carrier, support or substrate, e.g. a covalent bond involving a particular spacer or linking group, e.g. for attaching an active group
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
- B01J20/00—Solid sorbent compositions or filter aid compositions; Sorbents for chromatography; Processes for preparing, regenerating or reactivating thereof
- B01J20/30—Processes for preparing, regenerating, or reactivating
- B01J20/32—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating
- B01J20/3231—Impregnating or coating ; Solid sorbent compositions obtained from processes involving impregnating or coating characterised by the coating or impregnating layer
- B01J20/3242—Layers with a functional group, e.g. an affinity material, a ligand, a reactant or a complexing group
- B01J20/3244—Non-macromolecular compounds
- B01J20/3246—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure
- B01J20/3248—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure the functional group or the linking, spacer or anchoring group as a whole comprising at least one type of heteroatom selected from a nitrogen, oxygen or sulfur, these atoms not being part of the carrier as such
- B01J20/3253—Non-macromolecular compounds having a well defined chemical structure the functional group or the linking, spacer or anchoring group as a whole comprising at least one type of heteroatom selected from a nitrogen, oxygen or sulfur, these atoms not being part of the carrier as such comprising a cyclic structure not containing any of the heteroatoms nitrogen, oxygen or sulfur, e.g. aromatic structures
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D219/00—Heterocyclic compounds containing acridine or hydrogenated acridine ring systems
- C07D219/04—Heterocyclic compounds containing acridine or hydrogenated acridine ring systems with hetero atoms or with carbon atoms having three bonds to hetero atoms with at the most one bond to halogen, e.g. ester or nitrile radicals, directly attached to carbon atoms of the ring system
- C07D219/08—Nitrogen atoms
- C07D219/10—Nitrogen atoms attached in position 9
- C07D219/12—Amino-alkylamino radicals attached in position 9
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07D—HETEROCYCLIC COMPOUNDS
- C07D221/00—Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one nitrogen atom as the only ring hetero atom, not provided for by groups C07D211/00 - C07D219/00
- C07D221/02—Heterocyclic compounds containing six-membered rings having one nitrogen atom as the only ring hetero atom, not provided for by groups C07D211/00 - C07D219/00 condensed with carbocyclic rings or ring systems
- C07D221/04—Ortho- or peri-condensed ring systems
- C07D221/06—Ring systems of three rings
- C07D221/10—Aza-phenanthrenes
- C07D221/12—Phenanthridines
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08F—MACROMOLECULAR COMPOUNDS OBTAINED BY REACTIONS ONLY INVOLVING CARBON-TO-CARBON UNSATURATED BONDS
- C08F265/00—Macromolecular compounds obtained by polymerising monomers on to polymers of unsaturated monocarboxylic acids or derivatives thereof as defined in group C08F20/00
- C08F265/10—Macromolecular compounds obtained by polymerising monomers on to polymers of unsaturated monocarboxylic acids or derivatives thereof as defined in group C08F20/00 on to polymers of amides or imides
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
- C12N15/1006—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1003—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor
- C12N15/1006—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers
- C12N15/101—Extracting or separating nucleic acids from biological samples, e.g. pure separation or isolation methods; Conditions, buffers or apparatuses therefor by means of a solid support carrier, e.g. particles, polymers by chromatography, e.g. electrophoresis, ion-exchange, reverse phase
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Solid-Sorbent Or Filter-Aiding Compositions (AREA)
- Treatment Of Liquids With Adsorbents In General (AREA)
- Addition Polymer Or Copolymer, Post-Treatments, Or Chemical Modifications (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Macromonomer-Based Addition Polymer (AREA)
- Graft Or Block Polymers (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
Description
(54) Způsob dělení směsí nukleových kyselin
Vynález se týká způsobu dělení smmsí nukleových kyselin například jednovláknových a/nebo dvouvláknových nukleových kyselin, zejména směsí desoxyribonukleových kyselin afinitní chrommtooraaií, jehož podstata spočívá v tom, že se směs, která se má dělit, nanese na chrommtografický sloupec s absorpčním činidlem, které obsahuje polymerní nosič, na který je přímo nebo přes polymerní nískomo• lekulární skupinu, s mooekkuární hmoonnotí až do 4 OOO, působlci prostorový odstup, kovalentnl váženo bazicky a/nebo strukturně specifické komplexotvorné činidlo pro nukleové kyseliny, načež se eluuje za pouHtí elučních gradientů, elučnín činidlem, například vodným roztokem soli alkalického kovu nebo roztokem fosforennanového pufru.
flQ
Obr.
231 161
Vynález se týká způsobu dělení nukleových kyselin, například jednovláknových a/nebo dvouvláknových nukleových kyselin, zejména pak směsi desoxyribonukleových kyselin afinitní chromattoraaií.
Izolace jednotlivých genů nebo souboru stejrých genů v opakovaném uspořádání a genomu eukaryotických buněk je prakticky velice důležitá nejenom z čistě vědeckého hlediska, nýbrž i z hlediska genové technologie. Takové izolace byly možné jenom tehdy, jestliže se složení bází genu nebo skupiny genů svými spacery tj. skupinami s mooeloilární hmotností až asi do 4 000, působícími prostorový odstup, lišilo alespoň o 6 až 7 % od průměrného složení bází celkového genomu. Jako dělící způsob' se většinou používalo gradientově odstřelování na základě hustoty cesiových iontů s přísadami specifickými k bázím desoxyribonukleových kyselin /DNA/ jako například s přísadami iontů stříbra, rtuti nebo platily nebo aktinomrciolJ netropsi-nu nebo barviva Hooehst 33258, což je 2-/4-hydroxyfenny/-5[5-/N-mathyl--'-pPppΓrtinor///1,3/-benzotiiao0l2-yť]-/1,3/-benzodial. Tyto způsoby mmají jenom omezenou kapacitu, jsou drahé a náročné na čas.
Rozvoj mmateiálů pro afinitní chromategrrtií biopolymerů v uplynulých létech velice zjednoduší izolaci velkého počtu biopolymérů a vůbec poprvé umoonni jejich přípravu v čistém stavu. Při těchto způsobech se vychází obvykle z nosiče, který se po chemické aktivaci uvádí do reakce s látkou, která váže co nejsppcciičtěji biopolymer, který má být izolován. Na základě této specifičnosti lze v ideálním případě hledaný biopolymér selektivně absorbovat ze soOsí podobných sloučenin na chrommeo^afický m8aeeiál a posléze za vhodných podmínek desorbovat v čistém stavy (P. C^u^a^;recanas a C. B. Anfinsen, Arnn. Rev. Biochem. , 40 /1971/, 259 až 278).
Přes množtví příkladů úspěšného pouHtí této metody, nepoddalo · se dosud vyvinout pro četné biopolyméry žádný chromaografický mat^i^í^á:ll který by umožni podobné selektivní a programovatelné dělení rovněž pro smmsi nukleových kyselin. Vysoce rozlišující frakcionace sm^í^í nukleových kyselin v gramovém množív! je však předpokladem pro požadovanou izolaci jednotlivých genů nebo souborů stejných genů.
U dosavadních způsobů dělení nukleových kyselin o nízké mooekulové hmotnos!, například přenosových nukleových kyselin se dosahuje dělení v různé druhy na •adsorpčních činidlech, která ^ι^ηι^ί vlastnosti iontoměničů s lipofilními interakcemi (R. M. Kosaři a V. Shankar, Journal of C^hroras^a^t^o^^raphy 98 /1974// 449 až 475). Při tom se v poddíatě využívá m^oE^not,í interakcí nosiče s neobvyklými bázemi nukleových kyselin, které se vyskytují v různých přenosových ribonukleových kyselinách v různém mnossví.
Protože ribonukleové a iesoxyriboolkleové kyseliny o vyšší molekulové hmoonnosi neobsahují obvykle žádné neobvyklé báze, mohou metody jejich dělení spočívat pouze v následujících rozlišovacích znacích:
poměrů jedn^^^ových nukleových kyselin ku dvouvláknovým rozdílů ve složení bází rozdílů ve sledu bází rozdílů v ootekklároích hmoonostech rozdílů v terciárních strukturách
Všech těchto zpaků se skutečně využívá v dnešních obvykle používaných frakcionačních metodách (R. M. Koohsai, Chromategraf. Rev. 22 /1970/ 127 až 155).
U n^;júč^n^í^;^Íší mmtody, u frakcionaoe v solném gradientu na ultratiseřeiivce, vedou rozdíly ve složení bází, rozdíly ve sledu bází a rozdíly v oo0ekklárních hmoonootech k rozdílům ve vznosu pro jedno tlivý druh desoxyiribonukl€^ové kyseliny, jež lze ještě · zvětšit přídavkem látek specifických k bázím. Ostrooti dělení ubývá s ubývvaící moť^l^í^ut^irní hmtzicotí kapacity se vzrůstající molelojlární hmotností. Při absorpční chromatografií na hydoxyapatitu dochází ke frakcionací v podstatě podle poměrů jednovláknových nukleovýeh kyselin ke dvouvlátaDVým a jenom v malé míře podle rozdílů ve složení bází, zatímco nukleové kyseliny s větším obsahem guaninu a cytosinu jsou desorbovány již při o něco nižší konccnoraci solí než složky s větším obsahem adeninu a thyminu (W. Pakroppa a W. Muier, Proč. Nat. Acad. Sci. USA 71/3/ /1974/ 699 až 703).
Zcela analogicky lze frukcilnovat dvouvláknové nukleové kyseliny taká na specifických absorpčních činidlech bílklvinu-křeloβlLnu (například m^e^t^^^y.séi^ový albu^i^i^’-kjřem^e:Lna) na základě rozdílů ve složení bází, přičemž druhy desoxyribonukleových kyselin bohatší quaninem a cytosinem jsou opět vymývány nejdříve (J. D. ManOdH a A. D. Hárshey, Aioaytieal Biochemistry 1 /1960/ 66 až 77, N. Sunka a Ta'ai-Ying Cheng, J. Mol. Biol. 4 /1962/ 161 až 172).
Vlastní mechanismus působení těchto spíše náhodou objevených uěotraCních činidel není znám. Proto nemohla být malá dělící ostrost těchto ma<^e^r.álů i přes veškerou snahu dodnes podstatně zlepšena. Teprve v posledních létech byly při systematickém výzkumu četných látek, které tvoří kommlexy s nukleovými kyselinami, nalezeny látky, které se zdály být vhodné k cílené syntéze miat^e^iálů pro afinitní chroImUolraUii (W. a D. M. Crothers,
Eur. J. Bioehem. 54 /1975/ 267 až 277, W. Muller, H. Bunemann a N. Daatagupta, Eir, J. Břehem. 54 /1975/ 279 až 291 a W. tiUer a F. Gautter, Eur. J. Bioehem. 54 /1975/ 385 až 394).
Jaké výhody přináší p^užtí takovýchto dobře prostudovaných látek při dělení směsí nukleových kyselin,mohla být demonotrováno již na příkladech kumi-novaného pouužtí hydroxyapaaitu a ethidtmlbrooidu jako přísady specifické k bázím k dělení oupeгhelikálníeh a he^Likáloích deslxyrSbonuklelvých kyselin (W. Pukroaau, W. . Goebel a W. MH(^r, Α^^ΗηρΙ o 7 /1975/ 372 až 383) a hydroxytaaUitu v s deriváty feoylneutrální červeně jako kommplXotvorných činidel specifických k bázím při dělení dvouvláknlvýeh druhů desoxyrSbonuklelvých kyselin (W. Pakrlppa a W. МйПег, Proč. Nat. Acad. Sci. USA 71 /3/ /1974/ 699 až 703).
Rozlišovací schopnost těchto uvedených metod je srovnatelná s purativnm gradientem na základě hustoty chloridu cézného, tj. frakce deolxyrSbonukleové kyseliny s rozdíly v /G + CZ-obsahu/ přičemž G znamená guanin a C eytozin/, lze vzájemně rozdělit. Přes vysokou kapacitu má způsob tu nevýhodu, že směsi desoxtrSbonukleových kyselin se střední molekkltáгní hmoltюltí slo^0 převyšují 20 x 10^ se již dobře nezpracovávají a že l speciální htdroxytuautt, používaný jako ads^^pčn:! činidlo, musí být připravován.
Již delší dobu je známo, že směsi nukleovýeh kyselin lze démt za určitých podmínek v systému poltethtlenrltkol-ěextrun jednak na ribonukleové kyseliny /RNA/ a jedn^^koové desoxyrSbonuklelvé kyseliny /DNA/ a jednak ve dvouvlákenné deslxyrSblnukleové kyseliny /DNA/. Při tom dochází stále k obohacování dvouvláknové desoxyrSblnukleové kyseliny v lehčí polyethylenglykllové fázi, to znamená, že má vyšší rozdělovači koeficient než jednovláknové nukleové kyseliny. AAsooutní hodnoty rozdělovačích koeficientů lze sice měnot o 3 až 4 d^j^:ít^ky, avšak frakcilnuce v tomto systému se nedaří.
Úkol vynálezu spočívá v tom připravit taková adsorpční činidla, se kterými lze doGeiit při vysoké kapacitě dělení specifické k bázím a specifické ke struktuře a zejména 'dělení směsí jednovláknových a/nebo dvouvláknovýeh a/nebo vysoce stočených a/nebo lineárních nukleových kyselin, zejména směsí deooxyrSbonukleových Ik/selin /DNA/.
Pod pojmem afinitní specifičnost se rozumí především strukturní specifičnost'a speс^Шо^О k bázím.
Nyní se ukázalo, že uvedený úkol lze řešit pomocí adsorpčního činidla, které obsahuje polymerní nosič, na který je vázán přímo nebo přes další meeiskupiny, в výhodou kovalentně zbytek afinní k biopolymeru, popřípadě skupina specifická k bázím a/nebo skupina strukturně specifická.
Claims (1)
- Předmětem vynálezu je způsob dělení směsí nukleových kyselin například jednovláknových a/nebo dvouvláknových nukleových kyselin, zejména pak desoKyribonukleových kyselin efinitní chjrd^aaoorafiiL, jehož poddtata spočívá v tom, že se směs, která se má dělit, nanese na chroimaoé^afický sloupec s adsorpčním činidlem, které obsahuje polymerní nosič, na který je přímo nebo přes polymerní nízkoeoCekklární skupinu s mooelkAlární hmoonootí do 4 000, působící prostorový odstup, kovalentně vázáno bazicky a/nebo strukturně specifické komplexotvorné činidlo pro nukleové kyseliny, načež se eluuje za pomoci elučních gradientů elučním činidlem například vodným roztokem soli alkalického kovu nebo roztokem fosforečnanového pufru.Jako absorpční činidlo se používá polymerní nosič, například polybisakrylamid, na který je naroubována polymerní nízkceoCeUlární skupina, působící prostorový odstup, tvořená ^polymerem alespoň dvou rnonoomrů, z nichž jeden nese bázický a/nebo strukturně specifické íceplexotvoroé činidlo.Polymerní nosič nese jako bázický a/nebo strukturně specifické kcmpPexotvcroé·činidlo pro nukleové kyseliny zbytek barviva obecného vzorce I nebo II (II), kde znamenn;)!X skupinu CH- nebo atom dusíkuΪ atom kyslíku, síry nebo skupinu NH- nebo skupinu obecného vzorce kde β' znamená nezávisle na sobě atomy vodíku nebo methylovou sku^n^ pR atom vodku nebo methylovou skupinu,R3 . atom vodku mmehylovou skupinu,R4 atom vodku nebo nmehylovou sUpinu aAW anion, například chloridový anion, ptrchlcгáCový anion nebo oxylátový anion nebo zbytek iottríalárnkhc barviva, obsahujícího plenární pdycyklický, například bicyklický, tricyklický nebo tetracyklický kondenzovaný kruhový systém, který popřípadě obsahuje heteroatomy jako dusík, kyslík nebo síru.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CS801880A CS242863B2 (cs) | 1977-03-02 | 1978-03-01 | Způsob výroby nových sloučenin typu akryloylaminobarviv |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| DE2709094A DE2709094C2 (de) | 1977-03-02 | 1977-03-02 | Adsorbens für die affinitätsspezifische Trennung von Nukleinsäuren, Verfahren zu seiner Herstellung und seine Verwendung |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CS7801289A2 CS7801289A2 (en) | 1984-02-13 |
| CS231161B2 true CS231161B2 (en) | 1984-10-15 |
Family
ID=6002605
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CS781289A CS231161B2 (en) | 1977-03-02 | 1978-03-01 | Method of separating of nucleid acid mixtures |
| CS781289A CS231169B2 (en) | 1977-03-02 | 1978-03-01 | Processing method of adsorbing agent for affinitive separation of nucleic acids |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CS781289A CS231169B2 (en) | 1977-03-02 | 1978-03-01 | Processing method of adsorbing agent for affinitive separation of nucleic acids |
Country Status (14)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US4335226A (cs) |
| JP (1) | JPS53131294A (cs) |
| AT (1) | AT364734B (cs) |
| CA (1) | CA1122208A (cs) |
| CH (1) | CH651222A5 (cs) |
| CS (2) | CS231161B2 (cs) |
| DE (1) | DE2709094C2 (cs) |
| DK (1) | DK150536C (cs) |
| FR (1) | FR2416721A1 (cs) |
| GB (2) | GB1597891A (cs) |
| HU (1) | HU182462B (cs) |
| IT (1) | IT1095439B (cs) |
| NL (1) | NL7802022A (cs) |
| SE (1) | SE7802249L (cs) |
Families Citing this family (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2534486B1 (fr) * | 1982-10-15 | 1987-11-20 | Commissariat Energie Atomique | Support particulaire greffe en surface, son procede de preparation et adsorbants pour chromatographie d'affinite incorporant ce support, ainsi que leur utilisation, notamment en biologie |
| US4665184A (en) * | 1983-10-12 | 1987-05-12 | California Institute Of Technology | Bifunctional molecules having a DNA intercalator or DNA groove binder linked to ethylene diamine tetraacetic acid |
| DE3407814A1 (de) * | 1984-03-02 | 1985-09-12 | Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V., 3400 Göttingen | Phasentraeger fuer die verteilungschromatographie von makromolekuelen, verfahren zu ihrer herstellung und ihre verwendung |
| US5489387A (en) * | 1984-03-29 | 1996-02-06 | Daicel Chemical Industries, Ltd. | Separation agent comprising acyl- or carbamoyl-substituted polysaccharide |
| US5562614A (en) * | 1993-11-22 | 1996-10-08 | Advanced Cardiovascular Systems, Inc. | Programmable manifold system for automatic fluid delivery |
| US5229002A (en) * | 1984-03-29 | 1993-07-20 | Daicel Chemical Industries, Ltd. | Separation agent comprising acyl- or carbamoyl-substituted polysaccharide |
| US5368737A (en) * | 1984-03-29 | 1994-11-29 | Daicel Chemical Industries, Ltd. | Separation agent comprising acyl-or carbamoyl-substituted polysaccharide |
| JPS60226829A (ja) * | 1984-03-29 | 1985-11-12 | Daicel Chem Ind Ltd | 多糖誘導体より成る分離剤 |
| DE3619303A1 (de) * | 1986-06-07 | 1987-12-10 | Merck Patent Gmbh | Optisch aktive adsorbentien |
| DE3811042A1 (de) * | 1988-03-31 | 1989-10-19 | Merck Patent Gmbh | Ionenaustauscher |
| US5342785A (en) * | 1988-07-05 | 1994-08-30 | Tanabe Seiyaku Co., Ltd. | Method for determining pyrogen content |
| US4957620A (en) * | 1988-11-15 | 1990-09-18 | Hoechst Celanese Corporation | Liquid chromatography using microporous hollow fibers |
| JP2925753B2 (ja) * | 1990-02-23 | 1999-07-28 | ダイセル化学工業株式会社 | 光学異性体の分離方法 |
| EP0708919B1 (de) * | 1993-07-16 | 1998-09-16 | MERCK PATENT GmbH | Trennmaterialien für die hydrophobe chromatographie |
| DE4333674A1 (de) * | 1993-10-02 | 1995-04-06 | Merck Patent Gmbh | Nukleotidhaltiges Sorbens für die Affinitätschromatographie |
| DE4333821A1 (de) * | 1993-10-04 | 1995-04-06 | Merck Patent Gmbh | Ionenaustauscher |
| DE4334353A1 (de) * | 1993-10-08 | 1995-04-13 | Merck Patent Gmbh | Verfahren und Träger für die Gelpermeationschromatographie |
| JP3249408B2 (ja) | 1996-10-25 | 2002-01-21 | 昭和シェル石油株式会社 | 薄膜太陽電池の薄膜光吸収層の製造方法及び製造装置 |
| US7214410B2 (en) * | 2002-10-04 | 2007-05-08 | Shipley Company, L.L.C. | Process for selecting solvents for forming films of ferroelectric polymers |
| RU2257200C1 (ru) * | 2004-05-12 | 2005-07-27 | Кутушов Михаил Владимирович | Лекарственное средство |
| JP5253380B2 (ja) * | 2006-04-18 | 2013-07-31 | ダウ・コーニング・コーポレイション | テルル化カドミウムベース光起電力デバイスおよびその調製方法 |
| ATE441942T1 (de) * | 2006-04-18 | 2009-09-15 | Dow Corning | Fotovoltaische anordnung auf kupfer-indium- diselenidbasis und herstellungsverfahren dafür |
| KR20090003334A (ko) * | 2006-04-18 | 2009-01-09 | 다우 코닝 코포레이션 | 구리 인듐 디셀레나이드-기재 광전지 장치 및 그의 제조 방법 |
| KR101839380B1 (ko) * | 2010-09-22 | 2018-03-16 | 가부시키가이샤 가네카 | 핵산의 검출 방법 및 디바이스, 키트 |
| CA2811369C (en) * | 2010-09-29 | 2019-09-03 | Intervet International B.V. | N-heteroaryl compounds |
| TWI538235B (zh) | 2011-04-19 | 2016-06-11 | 弗里松股份有限公司 | 薄膜光伏打裝置及製造方法 |
| WO2014113112A1 (en) * | 2013-01-15 | 2014-07-24 | Conocophillips Company | Fluorescent tags for detection of swellable polymers |
| CN105593276B (zh) * | 2013-10-03 | 2020-03-27 | 3M创新有限公司 | 具有增强的结合容量的配体官能化基材 |
Family Cites Families (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US3640983A (en) * | 1966-11-09 | 1972-02-08 | Shojiro Horiguchi | Method of making coupler-bonded-polymers and chromogen-bonded-polymers nd polymers made thereby |
| US3983001A (en) * | 1972-05-10 | 1976-09-28 | Ceskoslovenska Akademie Ved | Isolation of biologically active compounds by affinity chromatography |
| NL7411909A (nl) * | 1973-09-10 | 1975-03-12 | Research Corp | Werkwijze voor het bereiden van een samenstel- ling op basis van een kleurstof, werkwijze voor het isoleren van albumine. |
| US4017476A (en) * | 1974-03-15 | 1977-04-12 | Mobil Oil Corporation | Preparation of finely divided styrene-divinylbenzene organic pigments |
| FR2268022B1 (cs) * | 1974-04-22 | 1977-06-24 | Rhone Poulenc Ind | |
| US4046750A (en) * | 1974-09-30 | 1977-09-06 | California Institute Of Technology | Ionene modified small polymeric beads |
| LU73094A1 (cs) * | 1975-07-29 | 1977-03-24 | ||
| US4035316A (en) * | 1975-11-24 | 1977-07-12 | California Institute Of Technology | Cell specific, variable density, polymer microspheres |
| US4213860A (en) * | 1976-06-30 | 1980-07-22 | Board of Regents, State of Florida for and on behalf of the University of Florida | Affinity chromatography and substrate useful therefor |
| US4194877A (en) * | 1977-11-28 | 1980-03-25 | United States Of America | Dye-containing polymer composition |
-
1977
- 1977-03-02 DE DE2709094A patent/DE2709094C2/de not_active Expired
-
1978
- 1978-02-23 NL NL7802022A patent/NL7802022A/xx not_active Application Discontinuation
- 1978-02-24 IT IT20640/78A patent/IT1095439B/it active
- 1978-02-24 US US05/880,914 patent/US4335226A/en not_active Expired - Lifetime
- 1978-02-27 CH CH2106/78A patent/CH651222A5/de not_active IP Right Cessation
- 1978-02-27 GB GB7673/78A patent/GB1597891A/en not_active Expired
- 1978-02-27 GB GB30076/79A patent/GB1597892A/en not_active Expired
- 1978-02-27 CA CA000297732A patent/CA1122208A/en not_active Expired
- 1978-02-28 DK DK090878A patent/DK150536C/da not_active IP Right Cessation
- 1978-02-28 SE SE7802249A patent/SE7802249L/xx unknown
- 1978-03-01 CS CS781289A patent/CS231161B2/cs unknown
- 1978-03-01 FR FR7805823A patent/FR2416721A1/fr active Granted
- 1978-03-01 CS CS781289A patent/CS231169B2/cs unknown
- 1978-03-01 HU HU78BO1702A patent/HU182462B/hu unknown
- 1978-03-01 AT AT0146078A patent/AT364734B/de not_active IP Right Cessation
- 1978-03-02 JP JP2403078A patent/JPS53131294A/ja active Granted
-
1981
- 1981-10-07 US US06/309,543 patent/US4394487A/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| FR2416721B1 (cs) | 1983-01-21 |
| IT7820640A0 (it) | 1978-02-24 |
| CS231169B2 (en) | 1984-10-15 |
| DK150536C (da) | 1987-10-19 |
| DK150536B (da) | 1987-03-23 |
| ATA146078A (de) | 1981-04-15 |
| SE7802249L (sv) | 1978-09-03 |
| CA1122208A (en) | 1982-04-20 |
| CH651222A5 (de) | 1985-09-13 |
| US4335226A (en) | 1982-06-15 |
| US4394487A (en) | 1983-07-19 |
| DK90878A (da) | 1978-09-03 |
| GB1597891A (en) | 1981-09-16 |
| JPS53131294A (en) | 1978-11-15 |
| HU182462B (en) | 1984-01-30 |
| IT1095439B (it) | 1985-08-10 |
| FR2416721A1 (fr) | 1979-09-07 |
| CS188180A2 (en) | 1984-02-13 |
| NL7802022A (nl) | 1978-09-05 |
| AT364734B (de) | 1981-11-10 |
| CS7801289A2 (en) | 1984-02-13 |
| DE2709094A1 (de) | 1978-09-07 |
| GB1597892A (en) | 1981-09-16 |
| DE2709094C2 (de) | 1984-11-22 |
| JPS6219892B2 (cs) | 1987-05-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CS231161B2 (en) | Method of separating of nucleid acid mixtures | |
| Kadonaga et al. | Affinity purification of sequence-specific DNA binding proteins. | |
| Zimmermann et al. | Synthetic oligonucleotide separations by mixed-mode reversed-phase/weak anion-exchange liquid chromatography | |
| US5811538A (en) | Process for the purification of oligomers | |
| ATE284891T1 (de) | Isolierung von einzelsträngigen nukleinsäuren | |
| EP0804448B1 (en) | Method for the purification of short nucleic acids | |
| JPS6172797A (ja) | 合成オリゴヌクレオチド類の精製方法 | |
| Davey et al. | Hydrophobic interaction of human, mouse, and rabbit interferons with immobilized hydrocarbons. | |
| US4207200A (en) | Soluble complex former for the affinity specific separation of macromolecular substances, its preparation and its use | |
| EP1192172B1 (en) | High affinity, low molecular weight displacers for oligonucleotide purification | |
| Asmus et al. | Preparation and chromatographic evaluation of chemically bonded ion-exchange stationary phases: I. Strong anion-exchanger | |
| Deshmukh et al. | Purification of antisense oligonucleotides | |
| Bunček et al. | Unusual chromatographic behavior of oligonucleotide sequence isomers on two different anion exchange HPLC columns | |
| DE60305075T2 (de) | Isolierung von antisense-oligonukleotiden | |
| EP0322677B1 (en) | Carrier for DNA-hybridization | |
| Sutton et al. | Dialysis of pyrimidine oligodeoxynucleotides | |
| Müller | New phase supports for partition chromatography of biopolymers | |
| US20090221808A1 (en) | Process for the Preparation of Nucleic Acid Duplexes | |
| Kothari et al. | RNA fractionation of hydroxyapatite columns | |
| JPS59198990A (ja) | ペプチド性抗生物質k582m−a及びk582m−bの分離方法 | |
| Edwardson et al. | Purification of homo-and hetero-oligonucleotides using high-performance charge-transfer chromatography | |
| Flanagan et al. | Affinity Partitioning of Receptor-Rich Membrane Fractions and Their Purification | |
| JPH05192175A (ja) | ジアデノシンポリリン酸溶液の製法 | |
| Shukla | Rational design of low-molecular-weight displacers for biomolecule purification | |
| JPH10165183A (ja) | メトトレキセート結合性dna |