CN1712527A - 大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因与应用 - Google Patents

大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因与应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因与应用,本发明所提供的大豆二酰甘油酰基转移酶,是序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列或与序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列具有至少95%的同源性且具有与SEQ ID №:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质,或将SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质。本发明基因的克隆及功能鉴定对改良作物油脂成分、特别是对于改良大豆油脂成分,培育含优质油脂大豆品种具有重要理论和现实意义。

Description

大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因与应用
技术领域
本发明涉及植物基因工程领域中与油脂代谢相关的大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因与应用。
背景技术
人类饮食中71%的油脂来自于植物。在世界上几种主要产油作物中,大豆总产油量约占30%,居世界植物油产量的第一位,棕榈油及油菜子油分别为第二及第三(如表1所示)。
                    表1世界上主要植物油的生产
  种类   生产量(百万吨)   占总产量百分比   相对顺序
  大豆(Soybean)   15.50   29.1   1
  棕榈(Palm)   8.52   16.0   2
  油菜籽(Rapeseed)   7.03   13.2   3
  向日葵(Sunflower)   7.00   13.1   4
  棉花籽(Cottonseed)   3.31   6.2   5
  椰子(Coconut)   2.71   5.1   6
  花生(Peanut)   2.69   5.0   7
  橄榄(Olive)   1.63   3.1   8
目前,我国栽培大豆的品质不高。东北2341份大豆品种资源的油份含量为19.15%±2.03%。255个育成品种的油份含量为20.33%±1.18%。而美国西部大豆油份含量一般在21.5%左右,东部也在21%左右,较东北大豆高0.5-1.5个百分点。提高含油量是大豆品质改善所追求的目标之一。由于含油量是多基因控制的数量性状,使大豆含油量的提高具有一定的难度。
自然界中存在多种不同结构的脂肪酸,例如种子三酰甘油中就发现有300余种脂肪酸,它们的链长从8个碳到22个碳不等,双键数目和位置也各不相同。大豆油脂的用途和经济价值是由它们的脂肪酸组成决定。目前生产的植物油所含脂肪酸的90%是软脂酸、硬脂酸、油酸、亚麻酸、亚油酸和芥酸,特定脂肪酸所占的比例不高。因此,有必要对脂肪酸组成进行调整以提供新的更有价值的高品质油脂。
作为储藏脂类,三酰甘油(TAG)在大豆荚中被大量合成,它是食用豆油的主要成分。大豆中TAG的合成途径称为Kennedy Pathway。该途径以脂酰CoA为原料,在二酰甘油乙酰转移酶(Diacylglycerol acyltransferase,DAGAT)的催化下由DAG(二酰甘油)合成TAG,此代谢步骤是该途径的最后一步,DAGAT也是该代谢途径中最关键的酶。有关研究发现DAGAT定位于内质网膜上。
发明内容
本发明的目的是提供与大豆油脂代谢相关的一种大豆二酰甘油酰基转移酶及其编码基因。
一种大豆二酰甘油酰基转移酶,是序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列或与序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列具有至少95%的同源性且具有与SEQ ID №:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质,或将SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质。
序列表中序列2氨基酸残基序列是由498个氨基酸残基组成的蛋白质,与拟南芥、水稻、烟草和油菜的同类蛋白比较发现MBOAT(membrane bound O-acyl transferase)活性中心在C端,序列2中自氮端到碳端第206-485位氨基酸残基。
GmDAGAT的编码基因,是下列核苷酸序列之一:
1)序列表中的SEQ ID №:1;
2)编码序列表中SEQ ID №:2蛋白质序列的多核苷酸;
3)与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。
序列表中序列1的DNA序列由1646个碱基组成,该基因的读码框为自5’端第50位到第1546位碱基,包含1497个碱基对,在3’端有100个碱基对非翻译区。
利用任何一种可以引导外源基因在植物中表达的载体,将本发明所提供的GmDAGAT的编码基因导入植物,可获得改良油脂成份的转基因植株。使用本发明的基因构建植物表达载体时,在其转录起始核苷酸前可加上任何一种增强启动子或诱导型启动子。为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选,可对所使用的载体进行加工,如加入植物可选择性标记(GUS基因、萤光素酶基因等)或具有抗性的抗生素标记物(庆大霉素,卡那霉素等)。从转基因植物的安全性考虑,可不加任何选择性标记基因,直接以逆境筛选转化植株。携带有本发明GmDAGAT的表达载体可通过使用Ti质粒、Ri质粒、植物病毒载体、直接DNA转化、微注射、电导、农杆菌介导等常规生物学方法转化植物细胞或组织,并将转化的植物组织培育成植株。被转化的植物宿主既可以是单子叶植物,也可以是双子叶植物,如:水稻、小麦、玉米、黄瓜、番茄、杨树、草坪草、苜宿等。
GmDAGAT是可以影响优质含量这一性状的多基因之一,GmDAGAT的活性高低同大豆含油量、油脂积累速率成正相关。因此该基因的克隆及功能鉴定对改良作物油脂成份、特别是对于改良大豆油脂成份,培育含优质油脂大豆品种具有重要理论和现实意义。对改良大豆油脂成份、培育含优质油脂大豆品种具有重要理论和现实意义。
下面结合附图及实施例对本发明做进一步说明。
附图说明
图1GmDGAGT基因在大豆不同组织中的表达特性
图2GmDGAGT基因在不同大豆品种及栽培和野生品种间的多态性分析
具体实施方式
实施例l、大豆GmDAGAT编码基因的筛选及其cDNA的克隆
科学家们1998年根据胆固醇乙酰转移酶(ACAT)的序列得到两个高同源性的鼠EST克隆,从而克隆第一个DAGAT基因。随后根据这一序列相继得到:酵母、拟南芥、人、油菜、烟草等的DAGAT基因。
本研究中,根据拟南芥DAGAT序列在Genebank中检索,结果得到2个大豆EST序列,据此设计引物:
DAGAT P1 5’TCA ACC TCT GTA TAG TAG TC 3’
DAGAT P2 5’GAA CAG GCA TAT TCC ACA TC 3’
从栽培大豆8904豆荚cDNA中克隆得到860bp的DAGAT部分编码序列。
为了得到全长cDNA序列,据此序列设计RACE引物:
DAGAT 5’RACE Primer 5’GGA AAT ACC ACA AGA GAA AGA CAA CAC 3’
DAGAT 5’RACE NUP 5’CCA GTC TCT CAA TGA CTT TGA GC 3’
DAGAT 3’RACE Primer 5’TTA CGC CAT CGA GAG AGT TCT GAA GC 3’
DAGAT 3’RACE NUP 5’GAG CTT CTT CGA TTT GGT GAT CGT G 3’
利用ClONETECH SMART RACE cDNA Amplification Kit反转录大豆8904豆荚总RNA。PCR得到DAGAT 5’、3’端DNA片段,克隆T载体,测序。获得DAGAT 5’3’端cDNA碱基序列。
设计引物:P1 5’GTT AGT AAA CAC GCT CGC TCG GTC 3’
          P2 5’CTG CCA TGG TAG ATG AAA GTA CTC GTG 3’。
PCR栽培大豆8904豆荚cDNA,获得1646bp的栽培大豆GmDAGAT全长cDNA序列,为序列表中的序列1,其ORF从第50bp→1546bp,编码序列表中序列2蛋白质。
实施例2大豆DGAGT基因GmDGAGT的组织表达特性
应用RT-PCR技术测定了不同组织中DGAGT基因的表达特性。分别提取了嫩叶、老叶、花及开花后10、20和30天的总RNA,以Tublin为内对照,进行RT-PCR分析,结果如图1所示,从图中可以看出,GmDGAGT在花、老叶、开花20天后均有表达,而在嫩叶及花后10天的果实中没有表达,表明GmDAGAT的表达情况与大豆种子发育、成熟密切相关。
实施例3 GmDGAGT基因在不同大豆品种及栽培和野生大豆间的多态性分析
基于“等位基因挖掘法”的原理,以GmDGAGT核苷酸序列为探针,与分别用EcoRI,Pst I,Taq I,Hind III,Dra I酶完全酶解的不同品种的大豆基因组DNA杂交,以研究此基因在不同品种间的差异。结果发现不同栽培品种、不同酶切的杂交结果完全相同。
再以它为探针杂交与栽培大豆亲缘关系较远的半野生、野生大豆基因组DNA,发现不同品种的野生大豆杂交结果存在很大的差异,而不同品种的半野生大豆杂交结果相同。
进一步从栽培、半野生、野生大豆基因组中PCR DAGAT部分基因组DNA,测序发现栽培、半野生大豆DAGAT基因组DNA碱基序列完全相同,而野生大豆与他们存在一定差异,与Southern结果相同(如图2所示)。
通过RACE获得1.5Kb的大豆DAGAT全长编码序列。由此设计引物,PCR野生大豆cDNA得到全长野生大豆DAGAT序列。比较二者序列发现存在一定的差异。
实施例4、GmDGAGT的功能检验
为了检验GmDAGAT合成TAG的能力,按照常规方法将全长的GmDAGAT cDNA序列构建酵母表达载体,转化入酵母细胞,筛选含有GmDAGAT表达载体的阳性克隆。
对筛选出的阳性克隆诱导表达,分析确定TAG高表达的诱导时间,采用Hara和Radin的正己烷/异丙醇萃取法提取样品中的总脂肪。利用气相色谱分析TAG在总脂中的含量,与转化空表达载体的酵母细胞中TAG的含量作对照,从而得出转化酵母细胞的GmDAGAT合成TAG的量。实验结果表明,转化GmDAGAT入酵母细胞后,酵母细胞的TAG含量可得到大幅度提高。
                                   序列表
<160>2
<210>1
<211>1646
<212>DNA
<213>大豆属大豆(Glycine max(L.)Merrill)
<400>1
ttatgcacat acaaactatg atatgagagc acttaccaaa tcagttgaaa agggagaagc     780
tctgcccgat actctgaaca tggactatcc ttacaatgta agcttcaaga gcttagcata     840
tttcctggtt gcccctacat tatgttacca gccaagctat cctcgcacac cttatattcg     900
aaagggttgg ctgtttcgcc aacttgtcaa gctgataata tttacaggag ttatgggatt     960
tataatagaa caatacatta atcccattgt acaaaattca cagcatcctc tcaagggaaa    1020
ccttccttac gccatcgaga gagttctgaa gctttctgtt ccaaatttat atgtgcggct    1080
ctgcatgttc tattgctttt tccacctttg gttaaatata ttggcagagc ttcttcgatt    1140
tggtgatcgt gaattctacc aggattggtg gaatgccaaa actgttgaag attattggag    1200
gatgtggaat atgcctgttc acaaatggat gatccgccac ctatattttc catgtttaag    1260
gcacggtata ccaaaggccg ttgctctttt aattgccttc ctggtttctg ctttattcca    1320
tgagctgtgc atcgctgttc cttgccacat attcaagttg tgggctttcg gtggaattat    1380
gtttcaggtt cctttggtct tcatcactaa ttatctgcaa aataaattca gaaactcgat    1440
ggttggaaat atgatttttt ggttcatatt cagtattctt ggtcaaccta tgtgcgtact    1500
gctatattac catgacttaa tgaataggaa aggcaaactt gactgaaggt gcacgtggat    1560
aagcttttct gtttttggag tgtataattg atgtcgatat gttgatcaat attggtttcc    1620
acgagtactt tcatctacca tggcag                                         1646
<210>2
<211>498
<212>PRT
<213>大豆属大豆(Glycine max(L.)Merrill)
<400>2
Met Ala Ile Ser Asp Glu Pro Glu Thr Val Ala Thr Ala Leu Asn His
1               5                   10                  15
Ser Ser Leu Arg Arg Arg Pro Thr Ala Ala Gly Leu Phe Asn Ser Pro
            20                  25                  30
Glu Thr Thr Thr Asp Ser Ser Gly Asp Asp Leu Ala Lys Asp Ser Gly
        35                  40                  45
Ser Asp Asp Ser Ile Ser Ser Asp Ala Ala Asn Ser Gln Pro Gln Gln
    50                  55                  60
Lys Gln Asp Thr Asp Phe Ser Val Leu Lys Phe Ala Tyr Cys Pro Ser
65                  70                  75                  80
Val Pro Ala His Arg Lys Val Lys Glu Ser Pro Leu Ser Ser Asp Thr
                85                  90                  95
Ile Phe Arg Gln Ser His Ala Gly Leu Phe Asn Leu Cys Ile Val Val
            100                 105                 110
Leu Val Ala Val Asn Ser Arg Leu Ile Ile Glu Asn Leu Met Lys Tyr
        115                 120                 125
Gly Trp Leu Ile Lys Ser Gly Phe Trp Phe Ser Ser Lys Ser Leu Arg
    130                 135                 140
Asp Trp Pro Leu Phe Met Cys Cys Leu Ser Leu Val Val Phe Pro Phe
145                 150                 155                 160
Ala Ala Phe Ile Val Glu Lys Leu Ala Gln Gln Lys Cys Ile Pro Glu
                165                 170                 175
Pro Val Val Val Val Leu His Ile Ile Ile Thr Ser Ala Ser Leu Phe
            180                 185                 190
Tyr Pro Val Leu Val Ile Leu Arg Cys Asp Ser Ala Phe Leu Ser Gly
        195                 200                 205
Val Thr Leu Met Leu Phe Ala Cys Val Val Trp Leu Lys Leu Val Ser
    210                 215                 220
Tyr Ala His Thr Asn Tyr Asp Met Arg Ala Leu Thr Lys Ser Val Glu
225                 230                 235                 240
Lys Gly Glu Ala Leu Pro Asp Thr Leu Asn Met Asp Tyr Pro Tyr Asn
                245                 250                 255
Val Ser Phe Lys Ser Leu Ala Tyr Phe Leu Val Ala Pro Thr Leu Cys
            260                 265                 270
Tyr Gln Pro Ser Tyr Pro Arg Thr Pro Tyr Ile Arg Lys Gly Trp Leu
        275                 280                 285
Phe Arg Gln Leu Val Lys Leu Ile Ile Phe Thr Gly Val Met Gly Phe
    290                 295                 300
Ile Ile Glu Gln Tyr Ile Asn Pro Ile Val Gln Asn Ser Gln His Pro
305                 310                 315                 320
Leu Lys Gly Asn Leu Pro Tyr Ala Ile Glu Arg Val Leu Lys Leu Ser
                325                 330                 335
Val Pro Asn Leu Tyr Val Arg Leu Cys Met Phe Tyr Cys Phe Phe His
            340                 345                 350
Leu Trp Leu Asn Ile Leu Ala Glu Leu Leu Arg Phe Gly Asp Arg Glu
        355                 360                 365
Phe Tyr Gln Asp Trp Trp Asn Ala Lys Thr Val Glu Asp Tyr Trp Arg
    370                 375                 380
Met Trp Asn Met Pro Val His Lys Trp Met Ile Arg His Leu Tyr Phe
385                 390                 395                 400
Pro Cys Leu Arg His Gly Ile Pro Lys Ala Val Ala Leu Leu Ile Ala
                405                 410                 415
Phe Leu Val Ser Ala Leu Phe His Glu Leu Cys Ile Ala Val Pro Cys
            420                 425                 430
His Ile Phe Lys Leu Trp Ala Phe Gly Gly Ile Met Phe Gln Val Pro
        435                 440                 445
Leu Val Phe Ile Thr Asn Tyr Leu Gln Asn Lys Phe Arg Asn Ser Met
    450                 455                 460
Val Gly Asn Met Ile Phe Trp Phe Ile Phe Ser Ile Leu Gly Gln Pro
465                 470                 475                 480
Met Cys Val Leu Leu Tyr Tyr His Asp Leu Met Asn Arg Lys Gly Lys
                485                 490                 495
Leu Asp

Claims (8)

1、一种大豆二酰甘油酰基转移酶,是序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列或与序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列具有至少95%的同源性且具有与SEQ ID№:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质,或将SEQ ID №:2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID №:2相同活性的由SEQ ID №:2衍生的蛋白质。
2、根据权利要求1所述的大豆二酰甘油酰基转移酶,其特征在于:所述大豆二酰甘油酰基转移酶是具有序列表中SEQ ID №:2的氨基酸残基序列的蛋白质。
3、大豆二酰甘油酰基转移酶的编码基因,它是下列核苷酸序列之一:
1)序列表中的SEQ ID №:1;
2)编码序列表中SEQ ID №:2蛋白质序列的多核苷酸;
3)与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。
4、根据权利要求3所述的基因,其特征在于:所述基因为具有序列表中SEQ ID №:1碱基序列的DNA片段。
5、含有权利要求3所述基因的表达载体和细胞系。
6、权利要求3所述基因在植物育种中的应用。
7、根据权利要求6所述的基因,其特征在于:所述植物为双子叶植物或单子叶植物。
8、根据权利要求7所述的基因,其特征在于:所述植物为大豆。
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