CN1543569A - 识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体 - Google Patents

Abstract

提供了与凝血酶阳性的葡萄球菌细菌，例如溶血葡萄球菌发生交叉反应的多克隆和单克隆抗体，所述的抗体能够识别凝固酶阳性的和凝固酶阴性的葡萄球菌细菌的表面蛋白质。从基于金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌之间共有的特性分离的表面蛋白质可以制备抗体，这些重组表面蛋白质可用于制备本发明的抗体。还提供了利用这些蛋白质和抗体用于治疗或抵抗各种各样的葡萄球菌的感染的疫苗和方法。

Description

识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的 表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体

相关申请

本申请要求享受2001年6月15日递交的美国临时申请系列号60/298,098的利益。

发明领域

总的来说，本发明涉及来自金黄色葡萄球菌的表面蛋白质及其活性的区域例如它们的A功能域，它具有凝固酶阴性的葡萄球菌例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌上的同源蛋白质，以及识别上述的蛋白质的抗体，具体地说，涉及分离的单克隆和多克隆抗体，它们识别来自金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌的特定的蛋白质，以及抗金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌的交叉反应，因此可用于疫苗，以及用于预防或治疗各种各样的由葡萄球菌的细菌引起的感染的方法。

发明背景

对于大多数引起动物和人类的传染病的微生物，在宿主中成功地形成集落是一个必需的过程。微生物的粘附是最后导致疾病的一系列事件的第一个重要步骤。借助细菌表面的特定的adhesins，通过粘附到宿主组织或血清限定的移植入的生物材料，例如导管，人工的关节，血管的移植片，病原微生物在宿主中形成集落。MSCRAMMs(识别粘附的基质分子的微生物表面成分)是细胞表面adhesins的一个家族，它们识别和特定地结合到宿主的细胞外的基质的不同的组分。一旦细菌成功地粘附并且在宿主组织中形成集落，他们的生理机能被急剧改变并且分泌受损害的成分例如毒素和水解蛋白质的酶。此外，粘连的细菌常常产生生物膜并且很快地变得对大多数的抗生素的杀戮效果更具抗性。

金黄色葡萄球菌产生从皮肤上的损害例如伤口感染，脓疱病，疖到包括肺炎，脓毒性的关节炎，脓毒病，心内膜炎的威胁生命的状况以及生物材料相关的传染病的范围的感染谱。已知金黄色葡萄球菌表达不同的MSCRAMMs的全部技能，它们独立地或者协调地促进微生物的粘附到特定的宿主组织组分。另外，葡萄球菌细菌的另一个类型被识别为凝固酶阴性的细菌，包括例如已知同样地表示MSCRAMMs的表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌，也对各种各样的细菌的感染和有关的疾病负有责任。关于这一点，通常MSCRAMMs由抗体，多克隆和单克隆抗体，对免疫学的攻击提供出色的靶。

然而，由于抗体本性非常特异的，就不同类型的葡萄球菌而言，例如一方面金黄色葡萄球菌(凝固酶阳性)和另一方面表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌(凝固酶-阴性的)，研制显示不同的类型的细菌之间年的交叉反应性的抗体，仍然是值得注意的问题。这样的交叉的反应的抗体是特别令人想望的，因为他们具有使人类和动物患者致免疫的潜在性和提供抵抗由两种类型的葡萄球菌的细菌，即凝固酶阳性的细菌例如金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的细菌，例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌引起的感染潜在性。因此这样的抗体在预防或治疗各种各样的由葡萄球菌的细菌引起的感染中非常地有效。

发明概述

因此，本发明的目的之一提供识别来自凝固酶阳性的细菌例如金黄色葡萄球菌的MSCRAMMs以及来自凝固酶阴性的细菌，例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌的MSCRAMMs的单克隆抗体。

本发明的还有一个目的是识别和分离来自葡萄球菌的细菌的MSCRAMMs，以及他们的活性的区域例如A区域，该区域可用于产生与凝固酶阳性的和凝固酶阴性的葡萄球菌发生交叉反应的单克隆和多克隆抗体。

本发明的另一个目的提供可以识别来自凝固酶阴性的葡萄球菌的表面蛋白质例如DgsK蛋白质的A区域，同时识别来自金黄色葡萄球菌的表面蛋白质例如SasA蛋白质的分离的抗体。

本发明的又一方面是利用本发明的分离的蛋白质，A区域和抗体生产用于治疗或预防葡萄球菌的感染的疫苗，以及提供了其中将本发明的疫苗和抗体可用于预防或治疗葡萄球菌的感染的方法。

这些和其他的目的通过本发明实现，所述的发明包括识别和分离一种类型的葡萄球菌的细菌例如凝固酶阴性的或凝固酶阳性的葡萄球菌的表面蛋白质，它导致产生识别两种类型的葡萄球菌的表面蛋白质的交叉的反应性的抗体，并且因此将抗体用于治疗或预防各种各样葡萄球菌的感染的疫苗和方法。本发明还涉及从这些表面蛋白质产生多克隆和单克隆抗体，以及它们用于预防或治疗葡萄球菌的感染。

对本领域内技术人员而言，根据阅读本说明书和/或在此处记载的参考文献，这些具体的实施方案和在公开的发明的精神和范围之内的其他的供替代的选择和改变是显而易见的，所有引用的文献都被并入本文。

附图简述

附图1是本发明的in silico预测的蛋白质的一级的结构图。

附图2显示本发明的开放读框表达的N-末端His标记的纯化的重组的蛋白质的考马斯亮蓝染色凝胶。

附图3A-3C显示分别用抗-KesK抗体(附图3A)，抗-KnkA抗体(附图3B)和抗DsqA抗体(附图3C)探测时金黄色葡萄球菌的细胞壁提取物的Western印迹。

附图4A-4B显示表达金黄色葡萄球菌的MSCRAMM称为KnkA(附图4A)和KesK(附图4B)的乳酸乳球菌的点印迹和Western免疫印迹。

附图5A-5D代表用康复的人血清体内检测表达本发明重组LPXTG蛋白质，包括RrKn和RrKN2(附图5A)，Kesk1和Kesk2A(附图5B)，KnkA(附图5C)和DsqA2(附图5D)的探测情况。

附图6显示证实抗金黄色葡萄球菌SasA的兔多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应的Western印迹分析结果。

优选的实施方案的详细描述

根据本发明，提供了来自凝固酶阳性的葡萄球菌的细菌例如金黄色葡萄球菌以及凝固酶阴性的葡萄球菌的细菌例如表皮葡萄球菌和溶血葡萄球菌，的特定的表面蛋白质，包括其活性片段例如这些蛋白质或可以产生识别完整的蛋白质的抗体的其他的表位区域的A区域。根据本发明，基于MSCRAMMs(识别粘附基质分子的微生物表面成分)的一些共有的特征实施候选肽序列和蛋白质的鉴定和分离，在大多数情况下，这些特征共价地固定到细胞壁肽葡聚糖。这些表面蛋白质具有下列的共有的特征可用于确定和分离本发明的序列，即：(i)Sec-依赖性分泌必需的N-末端信号肽(长度大约40个残基)，(ii)一个富含脯氨酸和甘氨酸残基或由丝氨酸和门冬氨酸盐二肽重复组成点的跨壁功能域；(iii)蛋白质共价固定到肽葡聚糖中的五个甘氨酸交联桥必需的LPXTG基序，(iv)一个疏水的跨膜功能区，跟随其后的(v)几个带正电荷的残基。

根据本发明，按照以上所述的特性，通过开发金黄色葡萄球菌的完整的基因组，识别了至少八个新的开放读框编码的蛋白质，具有分泌和固定象征MSCRAMMs的基序(即的携带N-末端信号肽和跟随疏水的功能区之后的C-末端LPXTG基序和一个带正电的尾部)。表1阐明所识别的蛋白质的一览表，包括在金黄色葡萄球菌基因组中的分布，蛋白质的大小和C-末端细胞壁排序序列。

                        表1

名称	分布	大小	C-末端
				EkeS	ENCSJM	2189aa	LPNTGSEEMDLPLKELALITGAALLARRRSKKEKES
DsqA	ENCSJM	-1363-2283aa	LPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVGLGLMKRKKKKDENDQDDSQA
				KesK	ENCSJM	-909aa	LPKTGETTSSQSWWGLYALLGMLALFIPKFRKESK
KrkN2	ENCSJM	-278aa	LPKTGLTSVDNFISTVAFATLALLGSLSLLLFKRKESK
				KrkN	ENCSJM	-661aa	LPQTGEESNKDMTLPLMALIALSSIVAFVLPRKRKN
RkaS	ENCSJM	-801aa	LPKTGTNQSSSPEAMFVLLAGIGLIATVRRRKAS
				RrkN	NCSJM	1629aa	LPKTGLESTQKGLIFSSIIGIAGLMLLARRRKN
KnkA	NCSJM	629aa	LPKAGETIKEHWLPISVIVGAMGVLMIWLSRRNKLKNKA

缩写：eMRSA-16；N，8325；C，COL；S，MSSA；J，N315，M，Mu50。

8个蛋白质中的6个存在于已经被测序的所有六个葡萄球菌的基因组中，剩余的2个存在于5/6的这些基因组中。

根据本发明，获得上述的蛋白质的氨基酸和编码它的核酸序列，如下所述：Ekes MRSA-SEQ ID NO：1(DNA序列)；EkeS～MRSA-SEQ ID NO：2(蛋白质序列)；DsqA(8325)-SEQ IDNO：3(DNA序列)；DsqA(8325)-SEQ ID NO：4(蛋白质序列)；KesK1(8325)-SEQ ID NO：5(DNA序列)；KesK1(8325)-SEQ IDNO：6(蛋白质序列)；KrkN2(8325)--SEQ ID NO：7(DNA序列)；KrkN2(8325)-SEQ ID NO：8(蛋白质序列)；KrkN(8325)-SEQ IDNO：9(DNA序列)；KrkN(8325)-SEQ ID NO：10(蛋白质序列)；RkaS(COL)-SEQ ID NO：11(DNA序列)；RkaS(COL)-SEQ IDNO：12(蛋白质序列)；RrkN(8325)-SEQ ID NO：13(DNA序列)；RrkN(8325)-SEQ ID NO：14(蛋白质序列)；KnkA(8325)-SEQ IDNO：15(DNA序列)；KnkA(8325)-SEQII7 NO：16(蛋白质序列)。

根据本发明，可以从上述的蛋白质或他们的活性区域例如A区域产生分离的抗体以便能够识别上述的蛋白质和/或上述的功能区。这些抗体可以是单克隆的或多克隆的。如果需要多克隆抗体，可以本领域内熟知的许多常规方法的任何一种制备。一种典型的方法是，可以将需要的表面蛋白质或其活性的区域注射到合适的宿主动物，例如，小鼠或兔子，在合适的时间期间之后，可以从该宿主动物分离和回收想要的抗体。对于单克隆抗体，根据本发明，可以许多合适的方法包括例如熟知的Kohler和Milstein，Nature 256：495-497(1975)方法，本领域内已知的任何其他方法，例如美国专利Nos.6,331,415；5,981,216；5,807,715；和4,816,567；欧洲专利申请519,596；和PCT公开WO 00/71585公开的方法制备，所有这些专利文献都通过在此引述而合并于本文。这些方法包括其制备如以本领域内熟知的方式进行嵌合，人性化，或人的单克隆抗体。仍然进一步地，可以从一个单链，例如轻或重链制备，以及还可以从保持完整的抗体的结合特性(例如，特异性和/或亲合力)的抗体的活性的片段制备单克隆抗体。活性的片段是指具有与完全抗体相同的结合特异性的抗体片段，所述完全抗体结合到来自不同的类型的葡萄球菌细菌(即凝固酶阴性的，或凝固酶阳性的)的特定的表面蛋白质或其同系物。本文术语″抗体″包括所述的片段。另外，也可以利用本发明的单克隆或多克隆抗体制备抗血清，可以本领域内熟知的许多合适方式制备。

如上所述，可以本领域内熟知的许多合适的方式制备本发明的抗分离的表面蛋白质和/或其活性的区域的抗体，例如上述所述的完全建立的Kohler和Milstein方法，可用于产生单克隆抗体。例如，在这样的一种方法的预备的步骤中使用，可以在长时间的时期用本发明的纯化的重组MSCRAMM或其活性的部分长期给小鼠每一周腹膜内注射一次，随后测试从免疫接种的老鼠获得的血液以测定与纯化的蛋白质的反应性。在识别老鼠与该蛋白质的反应性之后，将从小鼠脾脏分离的淋巴细胞与小鼠脊髓细胞融合以产生抗本发明的表面蛋白质的抗体阳性的杂交瘤，然后分离和培养，随后纯化和使之形成同位型。

为了产生本发明的单克隆抗体，优选的是利用本发明的重组制备的MSCRAMM′s来制备，利用本领域内熟知的许多标准方法可以制备这些重组子并且分离。例如，一种这样的方法使用了大肠杆菌表达载体pQE-30作为克隆和表达重组蛋白质和肽的表达载体。在一个优选的方法中，利用PCR，从上面描述的序列扩增识别为DgsK或SasA的表面蛋白质的A区域，再克隆到大肠杆菌表达载体PQE-30(Qiagen)，以允许表达一种含有六个组氨酸残基的重组融合蛋白质。  随后将该载体转化到大肠杆菌ATCC55151，在15-升发酵罐中生长到光密度(OD600)为0.7，用0.2mM异丙基-1β-D半乳糖苷(IPTG)诱导4小时。利用AGTechnologies中空纤维组件(孔大小0.45um)收集细胞，将细胞浆在-80C冷冻。利用2次穿过French Press，1100psi，将细胞在1×PBS(10mL缓冲液/1克的细胞浆)裂解。将裂解的细胞17,000rpm旋转30分钟以除去细胞碎片。将上清液经过装备了0.1M NiCI₂的5-毫升Hi俘获Cheating(Pharmacia)柱。在上样之后，用5个柱体积的10mM Tris，pH 8.0，100mM NaCI(缓冲液A)洗涤柱子。利用超过30个柱体积的0-100％梯度的10mM Tris，pH 8.0，100mM NaCI，200mM咪唑(Buffer B)洗脱蛋白质。SdrGN1N2N3或SdrGN2N3在-13％Buffer B(～26mM咪唑)被洗脱。监测280nm处的吸光率。在1×PBS中透析含有SdrGN1 N2N3或SdrGN2N3的馏分。

接著，然后将各个蛋白质经过一个内毒素除去方案。在该方案中所使用的缓冲液通过一个5-毫升Mono-Q琼脂糖(Pharmacia)柱而没有内毒素。将蛋白质平衡地分到4×15毫升试管中。各个试管的体积用缓冲液A加到9毫升。将1毫升的10％Triton X-114加入到各个试管中，在4℃旋转保温1小时。将试管置于37℃水浴中以使相位分离。将试管以2,000rpm旋转10分钟，收集各个试管的上面的含水的相，用去污剂反复提取。将2次提取的含水相合并，传递过带有0.1M NiCl2的5-mL IDAcheating(Sigma)柱，以除去剩余的洗涤剂。用9个柱体积的Buffer A洗涤该柱，然后用3个柱体积的Buffer B洗脱该蛋白质。将洗脱液通过5-毫升的Detoxigel(Sigma)柱，收集流出物，再上样到柱。收集第二次过柱的流出物，在1×PBS中透析。分析纯化的产物的浓度，纯度和内毒素水平，然后给小鼠给药。

在该优选的方法，以下面的方式从上面识别的重组蛋白质可以制备本发明的单克隆抗体。在该方法中，将大肠杆菌表达的和纯化的重组SasA和DsgK蛋白质用于制备一组鼠的单克隆抗体，而将小鼠血清用作为多克隆抗体的来源。简单地说，一组Balb/C或SJL小鼠接收了一系列皮下的免疫接种1-10mg溶液蛋白质或与下面表2描述的佐剂混合的蛋白质。

                     表2免疫接种方案

RIMMS

注射        天数        数量(微克)        途径        佐剂

#1          0           5                 皮下        FCA/RIBI

#2          2           1                 皮下        FCA/RIBI

#3          4           1                 皮下        FCA/RIBI

#4          7           1                 皮下        FCA/RIBI

#5          9           1                 皮下        FCA/RIBI

常规注射    天数        数量(微克)        途径        佐剂

原始        0           5                 皮下        FCA

加强#1      14          1                 腹膜内      RIBI

加强#2      28          1                 腹膜内      RIBI

加强#3      42          1                 腹膜内      RIBI

在杀死时(RIMMS)或加强后几天收集(常规的)血清，在ELISA测定中测定抗MSCRAMM蛋白质或对完整的细胞(表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌)的效价。在最后的加强之后3天，去除脾脏或淋巴结，挑开成单细胞悬浮液，收集淋巴细胞。然后将淋巴细胞与P3X63Ag8.653骨髓瘤细胞系(ATCC & CRL-1580)融合。根据Current Protocols in Immunology(第2章，第2单元)中的生产单克隆抗体的方案进行细胞融合，随后涂覆平板和喂养，所述文献都通过在此引述而合并于本文。

然后利用标准的ELISA分析方法，从融合产生的任何克隆中筛选特异的抗-SasA抗体的产生。扩增阳性的克隆，进一步通过流式血细胞计数测试完整的细菌的细胞结合测定中的活性以及Biacore分析中SasA的结合。在整个Biacore分析中，流速保持在10毫升/分钟不变。在注射SasA或DgsK之前，借助于RAM-Fc结合，将测试抗体吸附到芯片。在时间0，将浓度为30mg/ml的SasA或DgsK注射过芯片3分钟，随后解离2分钟。对该阶段的分析测定Mab/SasA和DgsK相互作用的相对关系和解离常数。

接著，对上面提到的抗体与完整细菌的结合情况进行测试。在该测试中，用兔子IgG(50mg/ml)封闭之后，收集，洗涤细菌的样品金黄色葡萄球菌Newman，金黄色葡萄球菌60，金黄色葡萄球菌397(Sal6)，金黄色葡萄球菌Wood，金黄色葡萄球菌8325-4，甲氧苯青霉素抗性的金黄色葡萄球菌MRSA 16，表皮葡萄球菌ATCC 35984，表皮葡萄球菌HB，表皮葡萄球菌CN-899和溶血葡萄球菌ATCC 43253，用浓度为2pg/ml的Mab或仅用PBS(对照)保温。在用抗体保温之后，将用作为检测抗体的山羊-F(ab′)2-抗-小鼠-F(ab′)2-FITC用于孵育细菌的细胞。在抗体标记之后，用FACS管径流式细胞计数器抽吸细菌的细胞以分析荧光射出(刺激：488，发射：570)。对于各个细菌的菌株，收集和检测10,000个样品。这些资料显示抗金黄色SasA的抗体能够识别凝固酶阴性的葡萄球菌的表面的同源的蛋白质。该资料支持Western印迹分析，表明抗金黄色葡萄球菌SasA的兔子多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自于从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应(参见附图6和下表3)。

                                     表3多克隆血清反应性

	Newman	67-0	397(SAL6)	Wood46	8325-4	MRSA16	ATCC3598	HB	CN-899	ATCC4325
																		4			3
常规小鼠血清	-	-	-	-	-	-	-	-	-
											小鼠抗SasA	+	+	+/-	-	+	+	+	+	+	+

虽然利用重组形式的本发明的表面蛋白质生产抗体是优选的，但是该抗体可以从这些蛋白质天然分离的和纯化形式或其活性区域例如A区域制备抗体，以类似于上面所述的方式利用这些蛋白质或活性的区域可以产生单克隆抗体或多克隆抗体以获得这样的抗体。仍然其他的常规的方法，利用重组或天然的纯化蛋白质或其活性区域，可用于产生本发明的抗体，正如本领域内技术人员可以识别的。

正如本领域内技术人员可以认识到的，本发明的抗体也可以配制成可用于人或动物患者给药的合适的药学的组合物，以便治疗或预防葡萄球菌的细菌引起的感染。含有本发明的抗体的药物组合物，或其有效的片段，可以与本领域内常用的合适的药物介质，赋形剂或载体结合配制，包括例如盐水，葡萄糖，水，甘油，乙醇，其他的治疗化合物和其结合使用。本领域内技术人员应该认识到，所使用的特定的介质，赋形剂或载体将依据患者和患者的状况而改变，如本领域内技术人员将会认识到的各种各样的给药方式适用于本发明的组合物。在本申请中公开的以药物组合物给药的合适的方式包括，但不限于，局部的，口部的，肛门的，阴道的，静脉内的，腹膜内的，肌内的，皮下的，鼻内的和真皮内的给药。

对于局部的给药，将组合物配制成软膏，乳膏，凝胶，洗液，滴剂(例如眼药水和耳朵滴剂)，或溶液(例如漱口剂)。可以将组合物埋植于伤口或外科的敷料，缝合线和气溶胶。该组合物可以含有常规的添加剂。例如防腐剂，溶剂以促进渗透和润滑药。局部的制剂也可以含有常规的载体例如乳膏或油膏基底，乙醇或油酰醇。另外，通常也可以将抗体组合物，和涉及其他MSCRAMM的组合物，疫苗，方法和应用的其他的信息用于本发明，涉及前面提到的MSCRAMM和它们的活性的区域和其抗体，这些其它的MSCRAMM公开于例如美国专利5,175,096；5,320,951；5,416,021；5,440,014；5,571,514；5,652,217；5,707,702；5,789,549；5,840,846；5,980,908；6,086,895；6,008,341；6,177,084；5,851,794和6,288,214；所有这些专利都通过在此引述而合并于本文。

本发明的抗体组合物也可以与其量可有效地加强致免疫的应答的合适的佐剂一起给药。例如，合适的佐剂可以包括广泛用于人的明矾(磷酸铝或氢氧化铝)，和其他的佐剂例如皂甙和其纯化的组分Quil A，弗氏完全佐剂，RIBBI佐剂，和其它用于研究和兽医应用的佐剂，还有其他以化学方法定义的制剂例如muramyl二肽，一磷酰脂类A，磷脂轭合物例如Goodman-Snitkoff等人在J.Immunol.147：410-415(1991)描述的，该文献通过在此引述而合并于本文，蛋白脂质体内的偶合物的形成胶囊如Miller等人，J.Exp.Med.176：1739-1744(1992)，该文献通过在此引述而合并于本文，脂类载体中蛋白质形成胶囊如NovasomeTM脂类载体(Micro Vescular System，Inc.，Nashua，NH)也可以使用。

在任何情况下，本发明的识别蛋白质或如上文提出的它们的活性的区域的抗体组合物可用于预防或治疗葡萄球菌的感染的方法，可用于抑制葡萄球菌的细菌与宿主组织和/或细胞的结合。根据本发明，提供了预防或治疗葡萄球菌的感染的方法，包括以有效量的抗体给本文提出的表面蛋白或其活性的亚区域以便治疗或预防葡萄球菌的感染。另外，这些单克隆抗体可用于损害葡萄球菌的细菌与宿主细胞的结合。

因此，根据本发明，将本发明的抗体以如上所述的任何常规的方法(例如，局部的，非肠道的，肌内的，等)给药，因此当将有效量的抗体组合物给人或动物患者给药时，提供了一种治疗或预防人类或动物患者的葡萄球菌的感染的非常地有用的方法。有效量是指足以阻止细菌粘合，抑制葡萄球菌的细菌结合到宿主细胞从而可用于治疗或阻止葡萄球菌的感染的使用水平，例如抗体效价的水平。如本领域内普通技术人员认识到的，有效地治疗或预防葡萄球菌的感染所必需的抗体效价的水平将依据患者的特性和健康状况，和/或预存在的葡萄球菌的感染的严重程度。

除了用于治疗或预防葡萄球菌的感染的方法中，本发明的抗体也可用于葡萄球菌的蛋白质的特定的检测或作为研究工具。本文所述的术语″抗体″包括单克隆，多克隆，嵌合，单链，双特异性，simianize，和人性化的或灵长目化的抗体以及Fab片段，例如保持抗体与上面详细说明的表面蛋白质的抗体的结合特异性的那些片段，包括Fab免疫球蛋白表达文库的产物。因此，本发明涉及单链的使用例如抗体的可变的重和轻链。这些类型的抗体或抗体片段的制备是本领域内技术人员熟知的。在本发明中，抗表面蛋白质或上面所述的它们的活性的区域的抗体可以制备，分离和/或纯化，然后用于治疗或免受葡萄球菌的感染。

上面描述的任何抗体可直接用可检测的标签进行标记以识别葡萄球菌细菌和对其定性。免疫测定中使用的标记物通常是本领域内技术人员已知的，并且包括酶，放射性同位素，荧光，发光的和产色的物质，包括有色的颗粒例如胶态的金或胶乳珠子。合适的免疫测定包括酶联免疫吸附(ELISA)。

或者，通过与具有免疫球蛋白亲合力的标记的物质可以间接标记该抗体。该抗体可以与第二物质偶合，用已标记的第三物质进行检测，该第三物质与偶合到抗体的第二物质具有亲和力。例如，可以将抗体结合到生物素，利用标记的抗生物素蛋白或链生抗生物素蛋白可以检测抗体-生物素偶合物。类似地，可以将该抗体偶合到半肝素，利用标记的抗半肝素抗体检测抗体-半肝素偶合物。这些和其他标记抗体和分析偶合物的其他方法是本领域内技术人员熟知的。

根据本发明，还提供了被设计为治疗或保护其抵抗葡萄球菌感染的主动或被动免疫接种疫苗，可以利用许多本领域内熟知的常规疫苗制备方法从以上提出的表面蛋白质或活性区域制备这些疫苗。对于典型的疫苗，将致免疫量的合适的表面蛋白或其活性片段与合适的药物学可接受载体，媒介物或赋形剂结合，合适的是可以以有效地免疫接种人或动物患者的疫苗的量给药。本领域技术人员认识到致免疫量是指能够在人或动物患者中产生免疫应答的蛋白质或活性片段或其亚片段的量。

除了借助于将免疫量的本发明的蛋白质或活性片段导入或给药产生的抗体的活性疫苗以外，也可以将本发明的分离的抗体或活性片段用于研制抗钩环感染的被动免疫接种的疫苗。在这样的情况下，可以将如上所述的抗体组合物，即有效量的抗体和药物学可接受的载体，媒介物或赋形剂以适当方式给药到人或动物患者。

因此，本发明的蛋白质或其活性片段可用作为活性疫苗，本发明的抗体可用作为被动疫苗，可用于提供合适的抗体以治疗或予防葡萄球菌感染。本领域内技术人员将会认识到，可以将一秒包装以适用于许多方式给药，例如非肠道的(即肌内的，透皮的或皮下的)给药或鼻咽的(即鼻内的)给药。一种这样的方式是将疫苗通过肌内注射到例如三角肌，但是，给药的特定方式将依赖于待治疗的细菌感染的特性和患者的状况。优选的是将该疫苗与药物学可接受的载体，媒介物或赋形剂结合以有助于给药，通常该载体是有或没有防腐剂的水，或缓冲盐水。该疫苗可以是在给药时重悬浮的冻干形式或溶液形式。

另外，在某些情况下，如必要可以将本发明的抗体进行修饰，以对给药患者的致免疫性降低，例如，如果该患者是人。通过将杂交瘤衍生的抗体的complimentarity表位移植到如Jones等人，Nature 321：522-525(1986)或Tempest等人/Biotechnology 9：266-273(1991)描述的人单克隆抗体而将抗体“人性化”或通过将免疫球蛋白可变区中的表面接触的鼠骨架残基改变为模拟同源的人骨架配体如由Padlan，Molecular Imm.28：489-498(1991)描述而进行″胶合″，这些文献都通过在此引述而合并于本文。甚至于进一步地，如果需要，本发明的单克隆抗体可以与合适的抗生素结合给药以进一步加强所述组合物抗击细菌感染的能力。

除了治疗人或动物患者以外，本发明的组合物也可以用于停止或予防医学装置或其他生物材料例如移植片的感染。待用抗体，蛋白质和活性片段包被的医学装置或聚合物生物材料包括，但不限于钩环，缝合线，复位心脏瓣膜，心脏的协助装置，硬的和软的接触透镜，眼内的透镜植入片(前的室或后的室)，其他的植入片例如角膜的镶嵌物，kerato-修补物，血管的斯滕特氏印模，epikeratophalia装置，绿内障分流术，视网膜的钩环，巩膜的扣子，牙齿的修补物，thyroplastic装置，laryngoplastic装置，血管的移植片，软的和硬的组织修补物，包括但不限于，泵，电的装置包括刺激器和记录器，听觉的修复术，起搏器，人工的喉，牙齿的植入片，乳房的植入片，阴茎的植入片，cranio/脸的腱，人工的关节，腱，纽带，menisci，和磁盘，人工的骨骼，人工器官包括人工胰腺，人工心脏，人工的肢，和心脏瓣膜，斯滕特氏印模，金属丝，导向装置丝，静脉内的和中央的静脉的导管，激光和气球血管成形术装置，血管的和心脏装置(管子，导管，气球)，室的协助，血透析组合物，血氧合器，尿道的/输尿管的/泌尿的装置(Foley导管，斯滕特氏印模，管和气球)，导气管导管(气管内的和气管造口术管和胶管管头)，肠内的喂养管(包括nasogastric，胃内的和空肠的管)，伤口排水管，用于引流体腔的管例如胸膜的，腹膜的，颅侧的和心包的cavities，血袋，测试管，血收集管，vacutainers，注射器，针，吸移管，吸量管尖端，和血造管。

本领域内技术人员将会明白，本文所用的术语″被包被″或″包被″是指将抗体或活性片段或其衍生的药物组合物应用到装置的表面，优选的是与葡萄球菌细菌感染接触的外表面。该装置的表面不必完全被蛋白质，抗体或活性片段所覆盖。

本发明抗体给药的优选剂量是有效地抑制或治疗葡萄球菌感染的量，易于认识到该量将大大依赖于感染的特性和患者的状况。如上所述，用于本发明的抗体或药物制剂的“有效量”是指无毒但足以产生需要的予防或治疗效果的剂量。正如上文指出的，所需要的抗体或特定试剂的精确量将随患者而变化，取决于患者的种类，年龄，和总的状态，待治疗的状况的严重程度，所使用的特定的载体或赋形剂和给药方式等等。因此，特定抗体组合物的“有效量″将基于特定的环境而变化，普通技术人员利用唯一的常规试验可以测定各种应用情况下合适的有效量。可以将该剂量调节到适应于以该组合物给药的个体，并且随患者的年龄，重量，代谢而变化。该组合物还可以含有稳定剂或药物学可接受的防腐剂，例如硫汞撒(乙基(2-mercaptobenzoate-S)汞钠盐)(Sigma Chemical Company，St.Louis，MO)。

当与合适的标记物或其他合适的可检测的生物分子或化学物质一起使用时，本文描述单克隆抗体可用于体内或体外诊断葡萄球菌感染或检测葡萄球菌细菌的目的。通过这样的抗体的使用也有助于试验室研究。各种类型的标记物和将标记物偶合到本发明的抗体的方法是本领域内技术人员熟知的，例如下面列出的一种方法。

例如，可以将抗体偶合到(直接或通过螯合剂)放射性标记物例如，但不限于³²P，³H，1^4C，³⁵S，¹²⁵I，或¹³¹I。通过例如闪烁计数，γ射线分光光度计放射自显影的方法可以检测标记物。也可以使用生物发光标记物，例如萤火虫荧光素衍生物。采用常规方法生物发光物质可以共价结合到该蛋白质，当酶例如荧光酶催化引起生物发光的与ATP的反应以散发光子时，可以检测标记物蛋白质。也可以将荧光团用于标记蛋白质。荧光团的例子包括荧光和衍生物，藻红蛋白，allo-藻蓝蛋白，藻蓝蛋白，硷性蕊香红，和德克萨斯红。通常荧光团可以通过荧光检测器进行检测。

通过对如上所述的抗体进行标记和根据本领域内技术人员熟知的方法例如免疫荧光显微镜，利用如Warren等人(Mol.Cell.Biol.，7：1326-1337，1987)描述的程序，对标记物进行检测可以测定细胞中配体的定位。

如上所述，本发明的单克隆抗体，或活性部分或其片段特别适用于干扰负责感染的葡萄球菌病原体和哺乳动物宿主之间的起始物理相互作用，这种对物理相互作用的干扰可用于治疗患者和in-dwelling医学装置予防或降低细菌感染以使它们在使用时更安全。

在本发明的另一个实施例中，提供了一种可用于分离和识别葡萄球菌细菌感染的试剂盒，包括在单个容器中的合适形式，例如冻干的本发明的抗体，然后通过加入怀疑含有葡萄球菌细菌的含水的样品而变成活性。这样的试剂盒通常包括用于储存合适形式抗体和合适的免疫检测试剂的合适的容器，所述的免疫检测试剂允许识别结合到本发明的表面蛋白质或抗体的复合物。通常，这些试剂盒含有本发明的抗体和识别当来自患者的样品导入到该抗体时识别结合的抗体的工具。例如，合适的免疫检测试剂可以包括合适的可检测的信号或标记物，例如生物素或产生可检测的颜色的酶等，可以连接到抗体或用于其他合适的方式中标记物以便当抗体结合到抗原时提供可检测的结果。

简单地说，识别和结合到本发明的表面蛋白质的本发明的抗体或其活性片段可用于治疗各种各样的人和动物患者的葡萄球菌感染，以及用于医疗或其他in-dwelling装置。根据本发明，由于这些蛋白质的特性，以及它们含有与其他类型的葡萄球菌细菌的蛋白质共有的表位，即来自凝血酶阴性葡萄球菌的蛋白质将产生识别来自金黄色葡萄球菌的同源蛋白的抗体或者相反，本发明的抗体将显示交叉反应性和应该有效地抗击广谱的葡萄球菌感染。因此，本发明提供了用于治疗或抵抗广谱葡萄球菌感染的方法和改善的方法中的组合物。

实施例

提供下面的实施例，举例说明本发明的优选的实施方式的各个方面。本领域内技术人员应该认识到实施例中公开的技术允许代表发明人发现的技术以实施本发明，因此可以认为构成了实施本发明的优选的方式。但是，本领域内技术人员应该认识到，在本发明公开的基础上，可以在公开的特定的实施方式中进行许多改变，仍然可获得类似的结构而不脱离本发明的精神和范围。

实施例1.金黄色葡萄球菌的MSCRAMM′s的分离和测序

已知金黄色葡萄球菌表达一类表面结合的蛋白质，所述的蛋白质通过允许细菌避免宿主防御和通过作为adhesins对致病性起重要作用。已知这些蛋白质是MSCRAMMs(识别粘附的基质的分子的微生物表面成分)，在大多数情况下，可以共价结合到细胞壁肽葡聚糖。它们有几个共同的特征：(i)Sec-依赖性分秘所需要的N-末端信号肽(长度约40个残基)，(ii)富含脯氨酸和甘氨酸残基或由丝氨酸和天冬酰胺二肽重复区组成的跨膜区，(iii)该蛋白质与肽葡聚糖中的五甘氨酸桥键共价结合需要的LPXTG基序，(iv)疏水的跨膜区，以及其后的(v)几个带正电荷的残基。

通过开发金黄色葡萄球菌的整个基因组序列，鉴别8个编码具有分秘和锚基基序指示MSCRAMMs的蛋白质的新的开放读框(即携带N-末端的信号肽和C-末端LPXTG基序，随后跟随一个疏水的功能域和一个带正电荷的尾部)。下面的表说明了所识别的蛋白质名录，包括他们在基因组中的分布，他们的蛋白质大小，和挑选C-末端细胞壁的序列。

名称	分布	大小	C-末端
				EkeS	ENCSJM	2189aa	LPNTGSEEMDLPLKELALITGAALLARRRSKKEKES
DsqA	ENCSJM	-1363-2283aa	LPDTGDSIKQNGLLGGVMTLLVGLGLMKRKKKKDENDQDDSQA
				KesK	ENCSJM	-909aa	LPKTGETTSSQSWWGLYALLGMLALFIPKFRKESK
KrkN2	ENCSJM	-278aa	LPKTGLTSVDNFISTVAFATLALLGSLSLLLFKRKESK

KrkN	ENCSJM	-661aa	LPQTGEESNKDMTLPLMALIALSSIVAFVLPRKRKN
				RkaS	ENCSJM	-801aa	LPKTGTNQSSSPEAMFVLLAGIGLIATVRRRKAS
RrkN	NCSJM	1629aa	LPKTGLESTQKGLIFSSIIGIAGLMLLARRRKN
				KnkA	NCSJM	629aa	LPKAGETIKEHWLPISVIVGAMGVLMIWLSRRNKLKNKA

缩写：eMRSA-16；N，8325；C，COL；S，MSSA；J，N315，M，Mu50。

8个蛋白质中的6个存在于已经被测序的所有六个葡萄球菌的基因组中，剩余的2个存在于5/6的这些基因组中。

下面是DNA和蛋白质序列的名录：

Ekes MRSA(SEQ ID NO：1)

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DsqA(8325)(SEQ ID NO：3)

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一级结构分析：

将生物信息方法(bioinformatic approach)用于一级结构和功能预测(附图1)。蛋白质RrkN和DsqA具有与先前描述的MSCRAMMs相似的结构组织。RrkN的结构类似于分别为金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的Pls/Aap蛋白质。它在N-末端含有200个残基的区域显示与Pis和Aap有40％相同。该蛋白质的C-末端突出地由128个残基重复区域组成，菌株与菌株之间重复区的数量是变化的。这些重复也存在于Pis和Aap。推定的sar同源区和fnbpA和fnbpB正好位于基因组上RrkN的上游。

DsqA的结构的组织相似于蛋白质的Sdr家族。它含有典型的A区域，其后跟随TYYFTDVK基序，该基序类似于在所有Sdr蛋白质中存在的保守的TYTFTVYVD基序。该基序的功能至今没有被测定。2个88个残基的重复区域居留在该蛋白质的中心，其后跟随类似于在所Sdr蛋白质中存在的SD-重复基序的C-末端SX-重复基序。该重复区的大小随菌株变化。在基因组上DsqA邻接secY和secA。DsqA同系物(＞90％同一性)也存在于表皮葡萄球菌。

KnkA的序列中不含有重复区域。次级的结构预测分析显示该蛋白质主要地由α-螺旋。

RkaS的序列中不含有重复区域。BLAST分析显示它类似于5′核苷酸酶UDP-糖水解酶。编码RkaS的基因正好地位于fromoryx的上游，mec元件的插入位点。

KesK在该蛋白质的N-末端含有二个140个残基的重复区域，有38％相同。水疗法绘制图分析(Kyte和Doolittle，1982)显示在该蛋白质的中心点有一个大的亲水的区域(残基500-560)。

EkeS在该蛋白质的N-末端含有二个300个残基的重复区域，有38％相同。Blast分析显示该蛋白质的N-末端(残基1-1268，携带两种重复)与FmtB有49％等同，所述的FmtBan是具有17个串联的重复的LPXTG蛋白质。FmtB被推测间接参与甲氧苯青霉素抗性，因为fmt8的灭活去除了甲氧苯青霉素抗性。这似乎是由于通过增加细胞壁前体葡萄糖胺-1-磷酸盐的产生可以减轻对细胞壁组成的影响如甲氧苯青霉素敏感性(Komatsuzawa等人，2000)。

KrkN和KrkN2在基因组上互相邻接。

表达分析：

由于与蛋白质数据库之序列没有同源性，不能预知这些蛋白质中每一个的推定的功能，因此以分子的近似值为依据。利用Qiagen pQE-30表达系统，四个开放读框的独特的区域可以在大肠杆菌中表达为重组his-标记的融合蛋白质。附图2表示纯化的N-末端his-标记的融合蛋白的考马斯亮蓝染色的SDS-PAGE凝胶。将重组蛋白质RrkN1，DsqA2，KesK1和KnkA用于在兔子中产生抗体。金黄色葡萄球菌细胞壁提取物的Western印迹分析显示KesK，KnkA和DsqA被表达并且细胞壁相关(附图3)。菌株eMRSA-16代表aknkA-阴性的菌株，因为它缺乏knkA基因。65kDa的免疫反应谱带与菌株8325-4的指数和静止的时期细胞的细胞壁提取物起反应(附图3，B)。菌株eMRSA-16中没有该谱带暗示它代表了knkA的基因产物。

在指数和静止期的培养物中，利用抗-KesK抗体进行的菌株8325-4的细胞壁成分的Western免疫印迹识别了150kDa免疫反应谱带。表达质粒(pKS80)上全长KesK的表达获得的从乳酸乳球菌的细胞壁成分释放的类似大小的免疫反应蛋白质暗示该150kDa谱带代表kesK基因产物(数据未显示)。需要金黄色葡萄球菌的kesK敲出突变体来证实细胞壁释放的KesK蛋白质的大小。

利用抗-DsqA抗体，金黄色葡萄球菌菌株MSSA和eMRSA-16的细胞壁成分的Western免疫印迹结果识别了一个130kDa免疫反应谱带。在静止期细胞中表达水平更高。

在乳酸乳球菌中异源表达：

以前已经将金黄色葡萄球菌的的表面蛋白质在乳酸乳球菌(L.lactis)中的异源表达用作为研究蛋白质功能的工具(Sinha等人，2000)。在该研究中，也将该替代系统用于在乳酸乳球菌表面表达各个in silico-预知的MSCRAMMs以查出功能。已经将KesK和KnkA克隆到乳酸乳球菌，并且通过点印迹显示是在表面表达的(附图4)。阴性的对照中没有观察到交叉反应(pKS80质粒没有插入物)，显示这是一个特异反应。通过用溶菌酶和mutanolysin消化产生了携带pKS-KnkA和pKS-KesK的乳酸乳球菌的细胞壁和原生质体成分，并且用于分别利用抗-KnkA和抗-KesK的抗体进行的Western印迹研究。与在金黄色葡萄球菌中观察到的不同，在乳酸乳球菌细胞壁成分中没有检测到KnkA，但是发现与原生质体成分相关。KnkA的固定用基序不同于一致LPXTG序列，其中含有一个丙氨酸残基而不是苏氨酸(即LPKAG)(表1)。最近已经公开了金黄色葡萄球菌含有二个sortase基因，srtA和srtB(Pallen，2001)。由第二个sortase基因加工LPXTG基序的变异形式是可能的，乳酸乳球菌中没有该基因。这也可以解释在原生质体成分中观察到的KnkA蛋白质大小的轻微的增加，而细胞壁分类拣选信号没有被裂解。

在乳酸乳球菌的细胞壁成分中探测到KesK，但是迁移的分子量小于从金黄色葡萄球菌细胞壁释放的KesK蛋白质。在乳酸乳球菌表面表达的大多数MSCRAMMs被证明在细胞壁提取程序中发生蛋白水解(Louise O′Brien，个人通讯)。因此，从乳酸乳球菌表面释放KesK蛋白质表示截短形式的KesK是可能的。已经证明用溶菌酶和mutanolysin缩短消化时间以限制蛋白水解的程度。

in silico-预测的MSCRAMMs体内表达：

在ELISA分析中对来自金黄色葡萄球菌感染痊愈的33个患者的康复的人-时期血清进行测试，以检测其识别纯化的N-末端his-标记的融合蛋白质的能力。将从儿童和健康的供血者采掘的血清用作为阴性的对照。将阳性的反应其值作为等同于或高于阴性的对照的二倍。附图5A-5D阐明在27-42％患者中识别了所有的蛋白质，这暗示这些蛋白质在体内表达并且在宿主感染期间是致免疫的。

引证文献

Komatsuzawa，H.，Ohta，K.，Sugai，M.，Fujiwara，T.，Glanzmann，P.，Berger-Bachi，B.，Suginaka，H.(2000)编码细胞壁相关的蛋白质的fmt B基因的Tn551-介导的插入失活消除了金黄色葡萄球菌的甲氧苯青霉素抗性。J.Antimicrob.Chemother.45：421-31。

Sinha，B.，Francois，P.，Que，Y.A.，Hussain，M.，Heilmann，C.，Moreillon，P.，Lew，D.，Krause，K.H.，Peters，G.，Herrmann，M.(2000)异源表达的金黄色葡萄球菌粘连蛋白结合蛋白质足以侵入宿主细胞Infect.Immun.68：6871-6878。

Pallen，M.J.，Lam，A.C.，Antonio，M.，Dunbar，K.(2000)sortases的阻碍-一种丰富的反应物？Trends.Microbiol.9：97-101。

                    实施例2

从金黄色葡萄球菌和从凝固酶阴性的葡萄球菌分离交叉反应的蛋白质并且进行测序

最近已经证明表皮葡萄球菌含有结构上与金黄色葡萄球菌MSCRAMM蛋白质相关的表面蛋白质(US09/386,962)。从金黄色葡萄球菌中分离一个蛋白质特别有利，因为它与表皮葡萄球菌紧密同源。该蛋白质被称为DsqA或SasA(金黄色葡萄球菌)和DgsK(表皮葡萄球菌)。它们的特征是包括一个大约500个氨基酸残基的典型的″A″区域，其后跟随约有40％相同有，各为88个残基的二个B重复区，和一个独特的SXSX二肽重复区，该区域的长度随菌株而变化。金黄色葡萄球菌的DsqA/SasA的A区域内含有一个180残基的区域，该区域与金黄色葡萄球菌蛋白质的RrkN，Pls和表皮葡萄球菌蛋白质Aap的A区域内的一个相似的大小的区域有40％一致性。DsqA/SasA和DgsK蛋白质的A区域在氨基酸水平上有46％的一致性，BB重复区是50％一致性。所包括的主动和被动免疫接种策略；疫苗，识别金黄色葡萄球菌和凝固酶阴性的葡萄球菌的蛋白质的多克隆抗体和单克隆抗体是本发明的主题。

与凝固酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌发生交叉反应的抗体的特异性例子：

凝固酶阴性的葡萄球菌DgsK A-区域：

氨基酸序列(SEQID NO：17)

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金黄色葡萄球菌SasA A-区域：

氨基酸序列(SEQ ID NO：18)

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Aap蛋白质的完整序列和它的编码DNA(指示有A区域存在)显示如下：

表皮葡萄球菌Aap蛋白质(加下划线的为A-区域)(SEQ IDNO：19)

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EPGKPAEPGTPAEPGKPAESGKPVEPGTPAQSGAPEQPNRSMHSTDNKNQLPD

TGENRQANEGTLVGSLLAIVGSLFIFGRRKKGNEK

表皮葡萄球菌aap DNA(SEQ ID NO：20)

atgggcaaac gtagacaagg tcctattaat aaaaaagtgg

attttttacc taacaaatta aacaagtatt ctataagaaa attcactgtt ggtacggcct

caatattact tggttcgaca cttatttttg gaagtagtag ccatgaagcg aaagctgcag

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gtacgccagc agaaccaggt aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac

cagcggaatc aggtaaacca gtggaaccag gtacgccagc acaatcaggt gcaccagaac

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tcatatttgg tcgtcgtaaa aaaggtaatg aaaaataatt tcatataaaa actttctgcc

attaa

从A-区域到表皮葡萄球菌Aap(氨基酸55-600)(SEQ IDNO：21)

⁵⁵EKQVDPITQANQNDSSERSLENTNQPTVNNEAPQMSSTLQAEEGSNAEAPQSE

PTKAEEGGNAEAAQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAAQSEPTKTEE

GSNVKAAQSEPTKAEEGSNAEAPQSEPTKTEEGSNAKAAQSEPTKAEEGGNAEA

AQSEPTKTEEGSNAEAPQSEPTKAEEGGNAEAPQSEPTKTEEGGNAEAPNVPTIK

ANSDNDTQTQFSEAPTRNDLARKEDIPAVSKNEELQSSQPNTDSKIEPTTSEPVNL

NYSSPFMSLLSMPADSSSNNTKNTIDIPPTTVKGRDNYDFYGRVDIESNPTDLNAT

NLTRYNYGQPPGTTTAGAVQFKNQVSFDKDFDFNIRVANNRQSNTTGADGWGF

MFSKKDGDDFLKNGGILREKGTPSAAGFRIDTGYYNNDPLDKIQKQAGQGYRGYG

TFVKNDSQGNTSKVGSGTPSTDFLNYADNTTNDLDGKFHGQKLNNVNLKYNASN

QTFTATYAGKTWTATLSELGLSPTDSYNFLVTSSQYGNGNSGTYASGVMRADLD

GA⁶⁰⁰

蛋白质的生产和纯化

利用PCR，从上面描述的序列扩增识别为DgsK或SasA的表面蛋白质的A区域，再克隆到大肠杆菌表达载体PQE-30(Qiagen)，以允许表达一种含有六个组氨酸残基的重组融合蛋白质。随后将该载体转化到大肠杆菌ATCC 55151，在15-升发酵罐中生长到光密度(OD600)为0.7，用0.2mM异丙基-1β-D半乳糖苷(IPTG)诱导4小时。利用AG Technologies中空纤维组件(孔大小0.45um)收集细胞，将细胞浆在-80C冷冻。利用2次穿过French Press，1100psi，将细胞在1×PBS(10mL缓冲液/1克的细胞浆)裂解。将裂解的细胞17,000rpm旋转30分钟以除去细胞碎片。将上清液经过装备了0.1M NiCI₂的5-mL Hi俘获Cheating(Pharmacia)柱。在上样之后，用5个柱体积的10mM Tris，pH 8.0，100mM NaCI(缓冲液A)洗涤柱子。利用超过30个柱体积的0-100％梯度的10mM Tris，pH 8.0，100mM NaCI，200mM咪唑(Buffer B)洗脱蛋白质。SdrGN1N2N3或SdrGN2N3在～13％Buffer B(～26mM咪唑)被洗脱。监测280nm处的吸光率。在1×PBS中透析含有SdrGN1N2N3或SdrGN2N3的馏分。

然后将各个蛋白质经过一个内毒素除去方案。在该方案中所使用的缓冲液通过一个5-mL Mono-Q琼脂糖(Pharmacia)柱而没有内毒素。将蛋白质平衡地分到4×15毫升试管中。各个试管的体积用缓冲液A加到9毫升。将1毫升的10％Triton X-114加入到各个试管中，在4℃旋转保温1小时。将试管置于37℃水浴中以使相位分离。将试管以2,000rpm旋转10分钟，收集各个试管的上面的含水的相，用去污剂反复提取。将2次提取的含水相合并，传递过带有0.1M NiCl₂的5-毫升IDA cheating(Sigma)柱，以除去剩余的洗涤剂。用9个柱体积的Buffer A洗涤该柱，然后用3个柱体积的Buffer B洗脱该蛋白质。将洗脱液通过5-毫升的Detoxigel(Sigma)柱，收集流出物，再上样到柱。收集第二次过柱的流出物，在1×PBS中透析。分析纯化的产物的浓度，纯度和内毒素水平，然后给小鼠给药。

单克隆抗体的生产

将大肠杆菌表达的和纯化的重组SasA和DsgK蛋白质用于制备一组鼠的单克隆抗体，而将小鼠血清用作为多克隆抗体的来源。简单地说，一组Balb/C或SJL小鼠接收了一系列皮下的免疫接种1-10mg溶液蛋白质或与下面表描述的佐剂混合的蛋白质。

免疫接种方案

RIMMS

注射        天数        数量(微克)        途径        佐剂

#1          0           5                 皮下        FCA/RIBI

#2          2           1                 皮下        FCA/RIBI

#3          4           1                 皮下        FCA/RIBI

#4          7           1                 皮下        FCA/RIBI

#5          9           1                 皮下        FCA/RIBI

常规注射      天数        数量(微克)        途径        佐剂

原始          0           5                 皮下        FCA

加强#1        14          1                 腹膜内      RIBI

加强#2        28          1                 腹膜内      RIBI

加强#3        42          1                 腹膜内      RIBI

在杀死时(RIMMS)或加强后几天收集(常规的)血清，在ELISA测定中测定抗MSCRAMM蛋白质或对完整的细胞(表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌)的效价。在最后的加强之后3天，去除脾脏或淋巴结，挑开成单细胞悬浮液，收集淋巴细胞。然后将淋巴细胞与P3X63Ag8.653骨髓瘤细胞系(ATCC &CRL-1580)融合。根据Current Protocols in Immunology(第2章，第2单元)中的生产单克隆抗体的方案进行细胞融合，随后涂覆平板和喂养。

然后利用标准的ELISA分析方法，从融合产生的任何克隆中筛选特异的抗-SasA抗体的产生。扩增阳性的克隆，进一步通过流式血细胞计数测试完整的细菌的细胞结合测定中的活性以及Biacore分析中SasA的结合。

Biacore分析

在整个分析中，流速保持在10毫升/分钟不变。在注射SasA或DgsK之前，借助于RAM-Fc结合，将测试抗体吸附到芯片。在时间0，将浓度为30mg/ml的SasA或DgsK注射过芯片3分钟，随后解离2分钟。该阶段的分析测定了Mab/SasA或DgsK相互作用的相对关系和分离动力学。

与完整细菌的结合

用兔子IgG(50mg/ml)封闭之后，收集，洗涤细菌的样品金黄色葡萄球菌Newman，金黄色葡萄球菌60，金黄色葡萄球菌397(Sal6)，金黄色葡萄球菌Wood，金黄色葡萄球菌8325-4，甲氧苯青霉素抗性的金黄色葡萄球菌MRSA 16，表皮葡萄球菌ATCC 35984，表皮葡萄球菌HB，表皮葡萄球菌CN-899和溶血葡萄球菌ATCC 43253，用浓度为2pg/ml的Mab或仅用PBS(对照)保温。在用抗体保温之后，将用作为检测抗体的山羊-F(ab′)2-抗-小鼠-F(ab′)2-FITC用于孵育细菌的细胞。在抗体标记之后，用FACS caliber流式细胞计数器抽吸细菌的细胞以分析荧光射出(刺激：488，发射：570)。对于各个细菌的菌株，收集和检测10,000个样品。这些资料显示抗金黄色SasA的抗体能够识别凝固酶阴性的葡萄球菌的表面的同源的蛋白质。该资料支持Western印迹分析，表明抗金黄色葡萄球菌SasA的兔子多克隆抗体与从表皮葡萄球菌HB细胞表面释放的蛋白质以及来自于从表皮葡萄球菌克隆的DsgK的重组A-区域发生交叉反应(参见附图6和下表)。

                                     多克隆血清反应性

	Newman	67-0	397(SAL6)	Wood46	8325-4	MRSA16	ATCC3598	HB	CN-899	ATCC4325
																		4			3
常规小鼠血清	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
											小鼠抗SasA	+	+	+/-	-	+	+	+	+	+	+

                              序列表

<110>蒂莫西·J·福斯特等人

<120>识别凝血酶阴性的葡萄球菌和金黄色葡萄球菌的表面蛋白的交叉反应性单克隆抗体和多克隆抗体

<130>P07263US01/BAS

<140>US 10/172,502

<141>2002-06-17

<150>US 60/298,098

<151>2001-06-15

<160>29

<170>Patent In version 3.1

<210>1

<211>6609

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>1

acaacacagc agagaataga caaccaggag gaaaacgaaa tgaatttgtt aaagaaaaat     60

aaatatagta ttagaaaata taaagtaggg atattctcta ctttaatcgg gacagtttta    120

ttactttcaa acccaaatgg tgcacaagct ttaactacgg atcataatgt gcaaggtggt    180

tcaaatcaag cattacctgg caactcacaa aatacaaatg ccgatactaa tcgagacata    240

gtaaatgatt cgcaaaatac tcctaatgca catgcaacag acaatacatc aacaaatcaa    300

gcattgacta atcatcaaaa cgttgatgtg gcaaatcaag tcgggcctgc tccaatacag    360

cctagcgcgt cgcctgcgca aaataataat aattctaatg ctaattcaac agcaacagag    420

ccagcggcga atacaaataa taatttagca tcaaataaca atacattaaa cgtgcctaat    480

aatacagata acaatgattc agcgcgtcat ctgactttaa aagaaattca agaagatgtt    540

cgtcattcgt ctgataagcc agagttagtt gcgattgctg aagaagcatc taatagaccg    600

aaaaagagaa gcagacgtgc tgcgccaaca gatcctaatg caacaccagc agatccaacg    660

gctacaccag cagatccaac ggcaggaaat ggtagtgcac cagttgcaat tacagcgcca    720

tacacgccaa caactgatcc caatgccaat aatataggac aaaatgcacc taacgaagtg    780

ctttcatttg atgataacaa cattagacca agtacgaacc gttctgtgcc tacagtaact    840

gttgttgata atttaccagg ctacacactg attaatggtg gtaaagtagg ggtgtttagt    900

catgcaatgg taagaacgag catgtttgat tcaggagatg ccaagaacta tcaagcgcaa    960

ggcaatgtaa ttgcattggg tcgtattaga ggaaatgata caaatgatca tggcgatttt   1020

aatggtatcg agaaaacatt aacagtaaat ccgaattctg aattaatctt tgaatttaat   1080

actatgacta ctaaaaacta tcaaggtatg acaaatttaa tcattaaaaa tgctgataac   1140

gatactgtta ttggtgaaaa agtagttgct tatggtccga tttggcgctt attaaaagta   1200

cctgaaaatg ttagtcatct aaaaattcaa tttgtaccta aaaatgacgc aataacagat   1260

gcacgtggta tttatcaatt acgagatgga tataaatact atgactttgt agactcaatc   1320

ggtcttcatt ctgggtcaca tgtctatgtt gaaagacgta caatggagcc aacagcaaca   1380

aataataaag aatttacagt tacaacgtca ttaaagaata atggtaactt tggcgcttca   1440

ttcaatacag atgattttgt atataaaatt caattacctg aaggtgttga atatgtaaat   1500

aattcattga ctaaagattt tcctagcggt aattcaggtg ttgatattaa tgatatgaat   1560

gtgacgtatg acgcagcaaa tcgaattatt acaattaaaa gtactggtgg aggtacaggg   1620

aattcgccgg cacgactaat gcctgataaa atattggatt tgaagtataa gctacgtgtg   1680

aacaatgtgc caacaccaag aacagtaaca tttaacgata cattaacgta taaaacatat   1740

tcacaagatt ttattaattc acctgctgaa agtcatactg taagtacaaa tccatataca   1800

attgatatca tcatgaataa agacgcattg caagccgaag tcgatagacg aattcaacaa   1860

gcggattata catttgcatc attagatatt tttaatgatc ttaaaagacg cgcacaaaca   1920

attttagatg aaaaccgtaa caatgtacct ttaaacaaaa gagtttctca agcagatatc   1980

gattcattag caaatcagat gcaacatacg ttaattcgca gtgttgacgc tgaaaatgcc   2040

gttaatagaa aagttgatga catggaagat ttagttaacc aaaatgatga actgacagat   2100

gaagaaaaac aagcagcgat tcaagtcatc gaggaacata aaaatgaaat tattgggaat   2160

attggtgacc aaacgactga tgatggcgtt actagaatta aagatcaagg tatacagact   2220

ttaagtggag acactgcaac accagttgtt aaaccaaatg ctaaacaagc tatacgtgat   2280

aaagcagcga aacaaagaga aattatcaat cacacgccag atgctactca agatgaaatt   2340

caagatgcat taaatcaatt aacaacggat gaaacagatg ctattgataa tgttacgaat   2400

gctactacca atgctgatgt tgaaacagct aaaaataatg gtattaatac aattggtgca   2460

gttgcgccac aagtgacaca caaacaagct gcaagagatg caattaatca agcgacagca   2520

acgaaacgac aacaaataaa tagcaataga gaagcaacac aagaagagaa aaatgcagca   2580

ttgaatgaat taacgcaagc cacgaaccac gcattagaac aaatcaatca agcgacaacc   2640

aatgatgatg tagatactgc caaaggtgat ggtctgaatg ccattaatcc tattgcgcct   2700

gtaactgttg tcaagcaagc agcaagagat gccgtatcac atgatgcaca acagcatatc   2760

gcagagatca atgcaaatcc tgatgcgact caagaagaaa gacaagcagc aatagagaaa   2820

gtaaatgctg ctgtagctgt tgcgaatact aatatattaa atgctaatac caatgctgat   2880

gttgagcaag taaagacaaa tgcaattcaa ggtatacaag ccattgaacc agctacaaag   2940

gttaaaacag atgctaaaaa cgctattgat caaagtgcgg aaacgcaaca taatgcgata   3000

tttaataata atgatgcgac cttagaagag caacaagcag cacaacaatt gcttgatcaa   3060

gctgtagcca cagcgaagca aaatattaat gcagcagata cgaatcaaga agttgcacaa   3120

gcaaaagatc agggcacaca aaatatagtt gtgattcaac cggcaacaca agttaaaacg   3180

gatgcacgca atgctgtaaa tgaaaaagcg cgagaggcga taacaaatat caatgctaca   3240

cctggcgcga ctcgagaaga gaaacaagaa gcgataaatc gtgtcaatac acttaaaaat   3300

agagcattaa atgatattgg tgtgacgtct actactgcga tggtcaatag tattagagac   3360

gatgcagtca atcaaatcgg tgcagttcaa ccgcatgtaa cgaagaaaca aactgctaca   3420

ggtgtattaa cggacttagc aactgcaaaa aaacaagaaa ttaatcaaaa tacaaatgca   3480

accactgaag aaaagcaagt agcattaaat caagtagacc aagatttagc aacggcaatt   3540

aataatataa atcaagctga tactaatgca gaagtagatc aagcacaaca attaggtaca   3600

aaagcaatta atgcgattca gccaaatatt gtaaaaaaac ctgcagcatt agcacaaacc   3660

aatcagcatt atagtgctaa attagttgaa atcaatgcta caccagatgc aacagatgat   3720

gagaaaaatg ctgcgatcaa tactttaaat caagacagac aacaagctat tgaaagtatt   3780

aaacaagcaa atacaaatgc ggaagtagac caagctgcga cagtggcaga gaataatatc   3840

gatgctgttc aagttgacgt tgtaaaaaaa caagcagcgc gagataaaat cactgctgaa   3900

gtagcgaagc gtattgaagc ggttaaacaa acacctaatg caactgacga agaaaagcag   3960

gctgcagtta atcaaatcaa tcaacttaaa gatcaagcgt ttaatcaaat taatcaaaac   4020

caaacaaatg atcaggtaga cgcaactaca aatcaagcga ttaatgctat agataatgtt   4080

gaagctgaag tagtaattaa accaaaggca attgcagata ttgaaaaagc tgttaaagaa   4140

aagcaacagc aaattgataa tagtcttgat tcaacagata atgagaaaga agttgcttta   4200

caagcattag ctaaagaaaa agaaaaagca cttgcagcta ttgaccaagc tcaaacgaat   4260

agtcaggtga atcaagcggc aacaaatggt gtatcagcga ttaaaattat tcaacctgaa   4320

acaaaaatta aaccagcagc acgtgaaaaa atcaatcaaa aagcgaatga attacgtgcg   4380

caaattaatc aagataaaga agcgacagca gaagaaagac aagcggcgtt agataaaatc   4440

aatgatttag ttgctaaagc tatgacaaat atcacgaatg atagaacaaa tcagcaagtt   4500

aatgactcaa caaatcaagc gcttgacgac attgcattag tgacgcctga ccatattgtt   4560

agagcagctg ctagagatgc agttaagcaa caatatgaag ctaaaaagca cgaaattgag   4620

caagcggaac atgcgactga tgaagaaaaa caagttgctt taaatcaatt agcgaataat   4680

gaaaaacgtg cattacaaaa cattaatcaa gcaatagcga ataatgatgt gaaacgtgtt   4740

gaatcaaatg gtattgctac gttaaaaggc gtagaaccgc acattgtggt taaacctgaa   4800

gctcaagaag ccataaaagc gagcgcagat aaccaagtag aatctataaa agatacacca   4860

catgctacga cagatgaatt agatgaagca aaccaacaaa taaacgacac acttaaacaa   4920

ggtcaacaag atatagacaa tacgacacaa gatgcagctg tcaatgatgt tagaaaccaa   4980

acgattaagg caatcgaaca aattaaaccg aaagttagac gcaaacgtgc agcgttggat   5040

aacattgatg aaagtaataa taatcaactc gatgcaatac gaaatacgct agatacaacg   5100

caagatgaac gaaatgttgc tattgctgcg ttaaataaaa ttgttaatgc aattaaaaat   5160

gatattgcac aaaacaaaac gaatgcagaa gtggatcaaa ctgaggctga tggtaacaac   5220

aacatcaaag tgattttacc taaagttcaa gttaaaccag cagcgcgtca atctgtcagc   5280

gcaaaagctg aagctcaaaa tgcacttatt gatcaaagtg atttatctac cgaagaagaa   5340

agattagctg ctaaacattt agtagaacaa gcacttaatc aagctattga tcagatcaat   5400

cacgcagata agactgcgca agttaatcaa aatagtatcg atgctcaaaa tattatttca   5460

aaaattaaac cagcgacaac agttaaagca acagcattac aacaaattca aaatatcgct   5520

acaaataaaa ttaatttaat taaagcaaat aacgaagcga cagatgaaga acaaaatgct   5580

gcaatagtac aagttgaaaa agagttaatt aaagctaaac aacaaattgc tggtgcagtg   5640

actaatgctg atgtggcata tttattgcat gatgggaaaa acgaaattcg tgaaatcgaa   5700

cctgttatta ataaaaaagc aactgcgcga gaacaattaa caacattatt caacgataag   5760

aaacaagcaa ttgaagcgaa tgttcaagca acagtagaag aaagaaatag tattttagca   5820

cagttacaaa acatttatga cactgctatt ggacaaattg atcaagatcg tagcaatgca   5880

caagttgata aaacagcaac attaaatcta caaacaatac atgatttaga cgtacatcct   5940

attaaaaagc cagatgctga aaaaacgatt aatgatgatc ttgcacgtgt tacacattta   6000

gtgcaaaatt atcgaaaagt aagtgatcgt aataaggctg atgcattaaa agctataact   6060

gcattaaaat tacaaatgga tgaagaatta aaaacagcac gcactaatgc tgatgttgat   6120

gcagttttaa aacgatttaa tgttgcatta ggcgatatag aagcagtaat tactgaaaaa   6180

gaaaatagct tactgcgcat tgataacatt gctcaacaaa catatgcgaa attcaaagcg   6240

atcgcaacac cagaacaatt agctaaagta aaagcattaa ttgatcaata tgttgcagat   6300

ggcaatagaa tggttgatga agatgcgaca ttaaatgaca tcaaaaaaga tacgcaactc   6360

attattgatg aaattttagc aattaattta cctgctgaag tgataaaagc gtcaccaaaa   6420

gtggggcaac ctgctccaaa agtttgtacg cctattaaaa aagaagataa acaagaagtg   6480

cgaaaagttg taaaagaact tccaaatact ggttctgaag aaatggattt accattaaaa   6540

gaattagcac taattacagg cgcagcatta ttagctagaa gacgttctaa aaaagaaaaa   6600

gaatcataa                                                           6609

<210>2

<211>2189

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>2

Met Asn Leu Leu Lys Lys Asn Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Tyr Lys Val

1                 5                         10                    15

Gly Ile Phe Ser Thr Leu Ile Gly Thr Val Leu Leu Leu Ser Asn Pro

             20                         25                    30

Asn Gly Ala Gln Ala Leu Thr Thr Asp His Asn Val Gln Gly Gly Ser

         35                      40                     45

Asn Gln Ala Leu Pro Gly Asn Ser Gln Asn Thr Asn Ala Asp Thr Asn

    50                      55                     60

Arg Asp Ile Val Asn Asp Ser Gln Asn Thr Pro Asn Ala His Ala Thr

65                      70                     75                  80

Asp Asn Thr Ser Thr Asn Gln Ala Leu Thr Asn His Gln Asn Val Asp

                  85                     90                    95

Val Ala Asn Gln Val Gly Pro Ala Pro Ile Gln Pro Ser Ala Ser Pro

              100                      105                     110

Ala Gln Asn Asn Asn Asn Ser Asn Ala Asn Ser Thr Ala Thr Glu Pro

         115                    120                     125

Ala Ala Asn Thr Asn Asn Asn Leu Ala Ser Asn Asn Asn Thr Leu Asn

    130                    135                     140

Val Pro Asn Asn Thr Asp Asn Asn Asp Ser Ala Arg His Leu Thr Leu

145                    150                    155                   160

Lys Glu Ile Gln Glu Asp Val Arg His Ser Ser Asp Lys Pro Glu Leu

                    165                     170                 175

Val Ala Ile Ala Glu Glu Ala Ser Asn Arg Pro Lys Lys Arg Ser Arg

                180                    185                     190

Arg Ala Ala Pro Thr Asp Pro Asn Ala Thr Pro Ala Asp Pro Thr Ala

         195                     200                     205

Thr Pro Ala Asp Pro Thr Ala Gly Asn Gly Ser Ala Pro Val Ala Ile

     210                    215                     220

Thr Ala Pro Tyr Thr Pro Thr Thr Asp Pro Asn Ala Asn Asn Ile Gly

225                     230                    235                 240

Gln Asn Ala Pro Asn Glu Val Leu Ser Phe Asp Asp Asn Asn Ile Arg

                  245                     250                    255

Pro Ser Thr Asn Arg Ser Val Pro Thr Val Thr Val Val Asp Asn Leu

              260                     265                     270

Pro Gly Tyr Thr Leu Ile Asn Gly Gly Lys Val Gly Val Phe Ser His

         275                     280                      285

Ala Met Val Arg Thr Ser Met Phe Asp Ser Gly Asp Ala Lys Asn Tyr

     290                    295                    300

Gln Ala Gln Gly Asn Val Ile Ala Leu Gly Arg Ile Arg Gly Asn Asp

305                     310                      315                320

Thr Asn Asp His Gly Asp Phe Asn Gly Ile Glu Lys Thr Leu Thr Val

                  325                     330                    335

Asn Pro Asn Ser Glu Leu Ile Phe Glu Phe Asn Thr Met Thr Thr Lys

             340                      345                    350

Asn Tyr Gln Gly Met Thr Asn Leu Ile Ile Lys Asn Ala Asp Asn Asp

         355                     360                      365

Thr Val Ile Gly Glu Lys Val Val Ala Tyr Gly Pro Ile Trp Arg Leu

    370                       375                     380

Leu Lys Val Pro Glu Asn Val Ser His Leu Lys Ile Gln Phe Val Pro

385                     390                      395                 400

Lys Asn Asp Ala Ile Thr Asp Ala Arg Gly Ile Tyr Gln Leu Arg Asp

                    405                     410                  415

Gly Tyr Lys Tyr Tyr Asp Phe Val Asp Ser Ile Gly Leu His Ser Gly

              420                      425                    430

Ser His Val Tyr Val Glu Arg Arg Thr Met Glu Pro Thr Ala Thr Asn

          435                     440                    445

Asn Lys Glu Phe Thr Val Thr Thr Ser Leu Lys Asn Asn Gly Asn Phe

    450                      455                     460

Gly Ala Ser Phe Asn Thr Asp Asp Phe Val Tyr Lys Ile Gln Leu Pro

465                     470                    475                   480

Glu Gly Val Glu Tyr Val Asn Asn Ser Leu Thr Lys Asp Phe Pro Ser

                   485                    490                    495

Gly Asn Ser Gly Val Asp Ile Asn Asp Met Asn Val Thr Tyr Asp Ala

              500                      505                     510

Ala Asn Arg Ile Ile Thr Ile Lys Ser Thr Gly Gly Gly Thr Gly Asn

         515                        520                   525

Ser Pro Ala Arg Leu Met Pro Asp Lys Ile Leu Asp Leu Lys Tyr Lys

     530                     535                    540

Leu Arg Val Asn Asn Val Pro Thr Pro Arg Thr Val Thr Phe Asn Asp

545                    550                    555                   560

Thr Leu Thr Tyr Lys Thr Tyr Ser Gln Asp Phe Ile Asn Ser Pro Ala

                  565                     570                    575

Glu Ser His Thr Val Ser Thr Asn Pro Tyr Thr Ile Asp Ile Ile Met

             580                      585                      590

Asn Lys Asp Ala Leu Gln Ala Glu Val Asp Arg Arg Ile Gln Gln Ala

        595                     600                      605

Asp Tyr Thr Phe Ala Ser Leu Asp Ile Phe Asn Asp Leu Lys Arg Arg

    610                     615                     620

Ala Gln Thr Ile Leu Asp Glu Asn Arg Asn Asn Val Pro Leu Asn Lys

625                     630                    635                  640

Arg Val Ser Gln Ala Asp Ile Asp Ser Leu Ala Asn Gln Met Gln His

                  645                      650                   655

Thr Leu Ile Arg Ser Val Asp Ala Glu Asn Ala Val Asn Arg Lys Val

              660                     665                     670

Asp Asp Met Glu Asp Leu Val Asn Gln Asn Asp Glu Leu Thr Asp Glu

        675                       680                  685

Glu Lys Gln Ala Ala Ile Gln Val Ile Glu Glu His Lys Asn Glu Ile

    690                      695                     700

Ile Gly Asn Ile Gly Asp Gln Thr Thr Asp Asp Gly Val Thr Arg Ile

705                     710                     715                 720

Lys Asp Gln Gly Ile Gln Thr Leu Ser Gly Asp Thr Ala Thr Pro Val

                   725                    730                    735

Val Lys Pro Asn Ala Lys Gln Ala Ile Arg Asp Lys Ala Ala Lys Gln

              740                     745                      750

Arg Glu Ile Ile Asn His Thr Pro Asp Ala Thr Gln Asp Glu Ile Gln

         755                      760                     765

Asp Ala Leu Asn Gln Leu Thr Thr Asp Glu Thr Asp Ala Ile Asp Asn

    770                    775                    780

Val Thr Asn Ala Thr Thr Asn Ala Asp Val Glu Thr Ala Lys Asn Asn

785                     790                    795                   800

Gly Ile Asn Thr Ile Gly Ala Val Ala Pro Gln Val Thr His Lys Gln

                    805                     810                   815

Ala Ala Arg Asp Ala Ile Asn Gln Ala Thr Ala Thr Lys Arg Gln Gln

              820                      825                    830

Ile Asn Ser Asn Arg Glu Ala Thr Gln Glu Glu Lys Asn Ala Ala Leu

         835                      840                     845

Asn Glu Leu Thr Gln Ala Thr Asn His Ala Leu Glu Gln Ile Asn Gln

    850                     855                    860

Ala Thr Thr Asn Asp Asp Val Asp Thr Ala Lys Gly Asp Gly Leu Asn

865                    870                     875                     880

Ala Ile Asn Pro Ile Ala Pro Val Thr Val Val Lys Gln Ala Ala Arg

                    885                      890                   895

Asp Ala Val Ser His Asp Ala Gln Gln His Ile Ala Glu Ile Asn Ala

              900                     905                     910

Asn Pro Asp Ala Thr Gln Glu Glu Arg Gln Ala Ala Ile Glu Lys Val

        915                     920                      925

Tyr Ala Ala Val Ala Val Ala Asn Thr Asn Ile Leu Asn Ala Asn Thr

     930                     935                     940

Asn Ala Asp Val Glu Gln Val Lys Thr Asn Ala Ile Gln Gly Ile Gln

945                    950                      955                960

Ala Ile Glu Pro Ala Thr Lys Val Lys Thr Asp Ala Lys Asn Ala Ile

                    965                     970                 975

Asp Gln Ser Ala Glu Thr Gln His Asn Ala Ile Phe Asn Asn Asn Asp

             980                     985                     990

Ala Thr Leu Glu Glu Gln Gln Ala Ala Gln Gln Leu Leu Asp Gln Ala

         995               1000                   1005

Val Ala Thr Ala Lys Gln Asn Ile Asn Ala Ala Asp Thr Asn Gln

     1010                  1015                   1020

Glu Val Ala Gln Ala Lys Asp Gln Gly Thr Gln Asn Ile Val Val

     1025                  1030                   1035

Ile Gln Pro Ala Thr Gln Val Lys Thr Asp Ala Arg Asn Ala Val

     1040                  1045                   1050

Asn Glu Lys Ala Arg Glu Ala Ile Thr Asn Ile Asn Ala Thr Pro

     1055                  1060                   1065

Gly Ala Thr Arg Glu Glu Lys Gln Glu Ala Ile Asn Arg Val Asn

     1070                  1075                   1080

Thr Leu Lys Asn Arg Ala Leu Asn Asp Ile Gly Val Thr Ser Thr

     1085                  1090                   1095

Thr Ala Met Val Asn Ser Ile Arg Asp Asp Ala Val Asn Gln Ile

     1100                  1105                   1110

Gly Ala Val Gln Pro His Val Thr Lys Lys Gln Thr Ala Thr Gly

     1115                  1120                   1125

Val Leu Thr Asp Leu Ala Thr Ala Lys Lys Gln Glu Ile Asn Gln

     1130                  1135                   1140

Asn Thr Asn Ala Thr Thr Glu Glu Lys Gln Val Ala Leu Asn Gln

     1145                  1150                   1155

Val Asp Gln Asp Leu Ala Thr Ala Ile Asn Asn Ile Asn Gln Ala

     1160                  1165                   1170

Asp Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Ala Gln Gln Leu Gly Thr Lys

     1175                  1180                   1185

Ala Ile Asn Ala Ile Gln Pro Asn Ile Val Lys Lys Pro Ala Ala

     1190                  1195                   1200

Leu Ala Gln Thr Asn Gln His Tyr Ser Ala Lys Leu Val Glu Ile

     1205                 1210                  1215

Asn Ala Thr Pro Asp Ala Thr Asp Asp Glu Lys Asn Ala Ala Ile

     1220                 1225                  1230

Asn Thr Leu Asn Gln Asp Arg Gln Gln Ala Ile Glu Ser Ile Lys

     1235                 1240                  1245

Gln Ala Asn Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Ala Ala Thr Val Ala

     1250                 1255                  1260

Glu Asn Asn Ile Asp Ala Val Gln Val Asp Val Val Lys Lys Gln

     1265                 1270                  1275

Ala Ala Arg Asp Lys Ile Thr Ala Glu Val Ala Lys Arg Ile Glu

     1280                 1285                  1290

Ala Val Lys Gln Thr Pro Asn Ala Thr Asp Glu Glu Lys Gln Ala

     1295                 1300                  1305

Ala Val Asn Gln Ile Asn Gln Leu Lys Asp Gln Ala Phe Asn Gln

     1310                 1315                  1320

Ile Asn Gln Asn Gln Thr Asn Asp Gln Val Asp Ala Thr Thr Asn

     1325                 1330                  1335

Gln Ala Ile Asn Ala Ile Asp Asn Val Glu Ala Glu Val Val Ile

     1340                 1345                  1350

Lys Pro Lys Ala Ile Ala Asp Ile Glu Lys Ala Val Lys Glu Lys

     1355                 1360                  1365

Gln Gln Gln Ile Asp Asn Ser Leu Asp Ser Thr Asp Asn Glu Lys

     1370                 1375                  1380

Glu Val Ala Leu Gln Ala Leu Ala Lys Glu Lys Glu Lys Ala Leu

     1385                 1390                  1395

Ala Ala Ile Asp Gln Ala Gln Thr Asn Ser Gln Val Asn Gln Ala

     1400                  1405                 1410

Ala Thr Asn Gly Val Ser Ala Ile Lys Ile Ile Gln Pro Glu Thr

     1415                  1420                    1425

Lys Ile Lys Pro Ala Ala Arg Glu Lys Ile Asn Gln Lys Ala Asn

     1430                  1435                    1440

Glu Leu Arg Ala Gln Ile Asn Gln Asp Lys Glu Ala Thr Ala Glu

     1445                  1450                    1455

Glu Arg Gln Ala Ala Leu Asp Lys Ile Asn Asp Leu Val Ala Lys

     1460                  1465                    1470

Ala Met Thr Asn Ile Thr Asn Asp Arg Thr Asn Gln Gln Val Asn

     1475                  1480                    1485

Asp Ser Thr Asn Gln Ala Leu Asp Asp Ile Ala Leu Val Thr Pro

     1490                  1495                    1500

Asp His Ile Val Arg Ala Ala Ala Arg Asp Ala Val Lys Gln Gln

    1505                   1510                    1515

Tyr Glu Ala Lys Lys His Glu Ile Glu Gln Ala Glu His Ala Thr

     1520                  1525                    1530

Asp Glu Glu Lys Gln Val Ala Leu Asn Gln Leu Ala Asn Asn Glu

     1535                  1540                    1545

Lys Arg Ala Leu Gln Asn Ile Asn Gln Ala Ile Ala Asn Asn Asp

     1550                  1555                    1560

Val Lys Arg Val Glu Ser Asn Gly Ile Ala Thr Leu Lys Gly Val

     1565                  1570                    1575

Glu Pro His Ile Val Val Lys Pro Glu Ala Gln Glu Ala Ile Lys

     1580                  1585                    1590

Ala Ser Ala Asp Asn Gln Val Glu Ser Ile Lys Asp Thr Pro His

     1595                  1600                    1605

Ala Thr Thr Asp Glu Leu Asp Glu Ala Asn Gln Gln Ile Asn Asp

     1610                  1615                    1620

Thr Leu Lys Gln Gly Gln Gln Asp Ile Asp Asn Thr Thr Gln Asp

     1625                 1630                  1635

Ala Ala Val Asn Asp Val Arg Asn Gln Thr Ile Lys Ala Ile Glu

     1640                 1645                  1650

Gln Ile Lys Pro Lys Val Arg Arg Lys Arg Ala Ala Leu Asp Asn

     1655                 1660                  1665

Ile Asp Glu Ser Asn Asn Asn Gln Leu Asp Ala Ile Arg Asn Thr

     1670                 1675                  1680

Leu Asp Thr Thr Gln Asp Glu Arg Asn Val Ala Ile Ala Ala Leu

     1685                 1690                  1695

Asn Lys Ile Val Asn Ala Ile Lys Asn Asp Ile Ala Gln Asn Lys

     1700                 1705                  1710

Thr Asn Ala Glu Val Asp Gln Thr Glu Ala Asp Gly Asn Asn Asn

     1715                 1720                  1725

Ile Lys Val Ile Leu Pro Lys Val Gln Val Lys Pro Ala Ala Arg

     1730                 1735                  1740

Gln Ser Val Ser Ala Lys Ala Glu Ala Gln Asn Ala Leu Ile Asp

     1745                  1750                 1755

Gln Ser Asp Leu Ser Thr Glu Glu Glu Arg Leu Ala Ala Lys His

     1760                 1765                  1770

Leu Val Glu Gln Ala Leu Asn Gln Ala Ile Asp Gln Ile Asn His

    1775                  1780                   1785

Ala Asp Lys Thr Ala Gln Val Asn Gln Asn Ser Ile Asp Ala Gln

     1790                 1795                  1800

Asn Ile Ile Ser Lys Ile Lys Pro Ala Thr Thr Val Lys Ala Thr

     1805                 1810                   1815

Ala Leu Gln Gln Ile Gln Asn Ile Ala Thr Asn Lys Ile Asn Leu

     1820                 1825                   1830

Ile Lys Ala Asn Asn Glu Ala Thr Asp Glu Glu Gln Asn Ala Ala

     1835                  1840                   1845

Ile Val Gln Val Glu Lys Glu Leu Ile Lys Ala Lys Gln Gln Ile

     1850                  1855                   1860

Ala Gly Ala Val Thr Asn Ala Asp Val Ala Tyr Leu Leu His Asp

     1865                  1870                   1875

Gly Lys Asn Glu Ile Arg Glu Ile Glu Pro Val Ile Asn Lys Lys

     1880                  1885                   1890

Ala Thr Ala Arg Glu Gln Leu Thr Thr Leu Phe Asn Asp Lys Lys

     1895                  1900                   1905

Gln Ala Ile Glu Ala Asn Val Gln Ala Thr Val Glu Glu Arg Asn

     1910                  1915                   1920

Ser Ile Leu Ala Gln Leu Gln Asn Ile Tyr Asp Thr Ala Ile Gly

     1925                  1930                   1935

Gln Ile Asp Gln Asp Arg Ser Asn Ala Gln Val Asp Lys Thr Ala

     1940                  1945                   1950

Thr Leu Asn Leu Gln Thr Ile His Asp Leu Asp Val His Pro Ile

     1955                  1960                   1965

Lys Lys Pro Asp Ala Glu Lys Thr Ile Asn Asp Asp Leu Ala Arg

     1970                  1975                   1980

Val Thr His Leu Val Gln Asn Tyr Arg Lys Val Ser Asp Arg Asn

     1985                  1990                   1995

Lys Ala Asp Ala Leu Lys Ala Ile Thr Ala Leu Lys Leu Gln Met

     2000                  2005                   2010

Asp Glu Glu Leu Lys Thr Ala Arg Thr Asn Ala Asp Val Asp Ala

     2015                  2020                   2025

Val Leu Lys Arg Phe Asn Val Ala Leu Gly Asp Ile Glu Ala Val

     2030                  2035                   2040

Ile Thr Glu Lys Glu Asn Ser Leu Leu Arg Ile Asp Asn Ile Ala

     2045                  2050                    2055

Gln Gln Thr Tyr Ala Lys Phe Lys Ala Ile Ala Thr Pro Glu Gln

     2060                  2065                    2070

Leu Ala Lys Val Lys Ala Leu Ile Asp Gln Tyr Val Ala Asp Gly

     2075                  2080                    2085

Asn Arg Met Val Asp Glu Asp Ala Thr Leu Asn Asp Ile Lys Lys

     2090                  2095                    2100

Asp Thr Gln Leu Ile Ile Asp Glu Ile Leu Ala Ile Lys Leu Pro

    2105                   2110                    2115

Ala Glu Val Ile Lys Ala Ser Pro Lys Val Gly Gln Pro Ala Pro

     2120                  2125                    2130

Lys Val Cys Thr Pro Ile Lys Lys Glu Asp Lys Gln Glu Val Arg

     2135                  2140                    2145

Lys Val Val Lys Glu Leu Pro Asn Thr Gly Ser Glu Glu Met Asp

     2150                  2155                    2160

Leu Pro Leu Lys Glu Leu Ala Leu Ile Thr Gly Ala Ala Leu Leu

     2165                  2170                    2175

Ala Arg Arg Arg Ser Lys Lys Glu Lys Glu Ser

     2180                  2185

<210>3

<211>6852

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>3

tctaatgaat gtaaagataa tacaaggagt tattacatga gtaaaagaca gaaagcattt     60

catgacagct tagcaaacga aaaaacaaga gtaagacttt ataaatctgg aaaaaattgg    120

gtaaaatccg gaattaaaga aatagaaatg ttcaaaatta tggggctacc atttattagt    180

catagtttag tgagtcaaga taatcaaagc attagtaaaa aaatgacggg atacggactg    240

aaaactacgg cggttattgg tggtgcattc acggtaaata tgttgcatga ccagcaagct    300

tttgcggctt ctgatgcacc attaacttct gaattaaaca cacaaagtga aacagtaggt    360

aatcaaaact caacgacaat cgaagcatca acatcaacag ccgattccac aagtgtaacg    420

aaaaatagta gttcggtaca aacatcaaat agtgacacag tctcaagtga aaagtctgaa    480

aaggtcactt cgacaactaa tagtacaagc aatcaacaag agaaattgac atctacatca    540

gaatcaacat cctcaaagaa tactacatca agttctgata ctaaatctgt agcttcaact    600

tcaagtacag aacaaccaat taatacatca acaaatcaaa gtactgcatc aaataacact    660

tcacaaagca caacgccatc ttcggtcaac ttaaacaaaa ctagcacaac gtcaactagc    720

accgcaccag taaaacttcg aactttcagt cgcttagcta tgtcaacatt tgcgtcagca    780

gcgacgacaa ccgcagtaac tgctaataca attacagtta ataaagataa cttaaaacaa    840

tatatgacaa cgtcaggtaa tgctacctat gatcaaagta ccggtattgt gacgttaaca    900

caggatgcat acagccaaaa aggtgctatt acattaggaa cacgtattga ctctaataag    960

agttttcatt tttctggaaa agtaaattta ggtaacaaat atgaagggca tggaaatggt   1020

ggagatggta tcggttttgc cttttcacca ggtgtattag gtgaaacagg gttaaacggt   1080

gccgcagtag gtattggtgg cttaagtaac gcatttggct tcaaattgga tacgtatcac   1140

aatacatcta aaccaaattc agctgcaaag gcgaatgctg acccatctaa tgtagctggt   1200

ggaggtgcgt ttggtgcatt tgtaacaaca gatagttatg gtgttgcgac aacgtataca   1260

tcaagttcaa cagctgataa tgctgcgaag ttaaatgttc aacctacaaa taacacgttc   1320

caagattttg atattaacta taatggtgat acaaaggtta tgactgtcaa atatgcaggt   1380

caaacatgga cacgtaatat ttcagattgg attgcgaaaa gtggtacgac caacttttca   1440

ttatcaatga cagcctcaac aggtggcgcg acaaatttac aacaagtaca atttggaaca   1500

ttcgaatata cagagtctgc tgttacacaa gtgagatacg ttgatgtaac aacaggtaaa   1560

gatattattc caccaaaaac atattcagga aatgttgatc aagtcgtgac aatcgataat   1620

cagcaatctg cattgactgc taaaggatat aactacacgt ccgtcgatag ttcatatgcg   1680

tcaacttata atgatacaaa taaaactgta aaaatgacga atgctggaca atcagtgaca   1740

tattatttta ctgatgtaaa agcaccaact gtaactgtag gcaatcaaac catagaagtg   1800

ggtaaaacaa tgaatcctat tgtattgact acaacggata atggtactgg gactgtgaca   1860

aatacagtta caggattacc aagcggatta agttacgata gtgcaacgaa ttcaatcatt   1920

gggacaccaa caaaaattgg tcaatcaaca gtgacagttg tgtctactga ccaagcaaat   1980

aacaaatcga cgacaacttt tacaataaat gttgtggata cgacagcacc aacagtgaca   2040

ccaataggag atcaatcatc agaagtgtat tcaccaatat ccccgattaa aattgctacg   2100

caagataaca gtggaaatgc ggtgacgaat acagtgactg gattgccatc cggactaaca   2160

tttgatagta caaataatac tattagtggt acaccaacaa acattggtac aagtactata   2220

tcaatcgttt ctacagatgc gagcggtaac aaaacgacga caacttttaa atatgaagta   2280

acaagaaata gcatgagtga ttccgtatca acatcaggaa gtacacaaca atctcaaagt   2340

gtgtcaacaa gtaaagctga ctcacaaagt gcatcaacga gtacatcagg atcgattgtg   2400

gtatctacat cagctagtac ctcgaaatcg acaagtgtaa gcctatctga ttctgtgagt   2460

gcatctaagt cattaagcac atctgaaagt aatagtgtat caagctcaac aagcacaagt   2520

ttagtgaatt cacaaagtgt atcatcaagc atgtcggatt cagctagtaa atcaacatca   2580

ttaagcgatt ctatttcaaa ctctagcagt actgaaaaat ccgaaagtct atcaacaagt   2640

acatctgatt cattgcgtac atcaacatca ctcagtgact cattaagtat gagtacatca   2700

ggaagcttgt ctaagtcaca aagcttatca acgagtatat cagggtcgtc tagtacatca   2760

gcatcattaa gtgacagtac atcgaatgca attagtacat caacatcatt gagcgagtca   2820

gctagcacct cggactctat cagtatttca aatagcatag ccaactctca aagtgcgtca   2880

acaagcaaat cagattcaca aagtacatca atatcattaa gtacaagtga ttcaaaatcg   2940

atgagtacat cagaatcatt gagcgattcg acgagcacaa gtggttctgt ttctggatca   3000

ctaagcatag cagcatcaca aagtgtctca acaagtacat cagactcgat gagtacttca   3060

gagatagtaa gtgactctat cagtacaagt gggtcattat ctgcatcaga cagtaaatca   3120

atgtccgtaa gtagttcaat gagcacgtct cagtcaggta gtacatcaga atcattaagt   3180

gattcacaaa gtacatctga ttctgatagt aagtcattat cacaaagtac tagtcaatca   3240

ggttcaacaa gtacatcaac gtcgacaagt gcttcagtac gtacttcgga atcacaaagt   3300

acgtctggtt caatgagtgc aagtcaatcc gattcaatga gcatatcaac gtcgtttagt   3360

gattcaacga gtgatagcaa atcagcatca actgcatcaa gtgaatcaat atcacaaagt   3420

gcttctacga gcacatctgg ttcggtaagt acttcgacat cgttaagtac aagtaattca   3480

gaacgtacat caacatctat gagtgattcc acaagcttaa gtacatcaga gtctgattca   3540

ataagtgaat caacgtcaac gagcgactct ataagtgaag caatatctgc ttcagagagc   3600

acgtttatat cattaagtga atcaaatagt actagcgatt cagaatcaca aagtgcatct   3660

gcctttttaa gtgaatcatt aagtgaaagt acgtctgaat caacatcaga gtcagtgagt   3720

agttcgacaa gtgagagtac gtcattatca gacagtacat cagaatctgg tagcacatca   3780

acatcattaa gtaattcaac aagtggtagt acgtccattt caacatcgac aagtatcagt   3840

gaatcaacgt caacgtttaa gagcgagagt gtttcaacat cactgagtat gtcaacgagt   3900

acaagtttgt ctgactctac aagtttgtca acatcattaa gtgattccac aagtgatagt   3960

aagtctgatt cattaagtac atcaatgtcg acaagtgatt caatcagtac aagtaaatct   4020

gattccatta gtacatccac atcattaagt ggttctacaa gtgaaagtga atccgactca   4080

acatcatcaa gtgaaagtaa atccgattca acatcaatga gcataagtat gtctcaatca   4140

acatcaggaa gtacaagtac gtcaacgagt acaagtttgt ctgactcaac gagtacatca   4200

ttgtcactaa gtgcctcaat gaatcaaagc ggagtagact caaactcagc aagccaaagt   4260

gcctcaaact caacaagtac aagcacgagc gaatccgatt cacaaagcac atcatcatat   4320

acaagtcagt caacaagcca aagtgaatcc acatcgacat caacgtcact aagcgattca   4380

acaagtatat ctaaaagtac gagtcaatca ggttcggtaa gcacatcagc gtcattaagt   4440

ggttcagaga gtgaatctga ttcacaaagt atctcaacaa gtgcaagtga gtcaacatca   4500

gaaagtgcgt caacatcact cagtgactca acaagtacaa gtaactcagg atcagcaagt   4560

acgtcaacat cgctcagtaa ctcagcaagc gcaagtgaat ccgatttgtc gtcaacatct   4620

ttaagtgatt caacatctgc gtcaatgcaa agcagtgaat ccgattcaca aagcacatca   4680

gcatcattaa gtgattcgct aagtacatca acttcaaacc gcatgtcgac cattgcaagt   4740

ttatctacat cggtaagtac atcagagtct ggctcaacat cagaaagtac aagtgaatcc   4800

gattcaacat caacatcatt aagcgattca caaagcacat caagaagtac aagtgcatca   4860

ggatcagcaa gtacatcaac atcaacaagt gactctcgta gtacatcagc ttcaactagt   4920

acttcgatgc gtacaagtac tagtgattca caaagtatgt cgctttcgac aagtacatca   4980

acaagtatga gtgattcaac gtcattatct gatagtgtta gtgattcaac atcagactca   5040

acaagtgcga gtacatctgg ttcgatgagt gtgtctatat cgttaagtga ttcgacaagt   5100

acatcaacat cggctagtga agtaatgagc gcaagcatat ctgattcaca aagtatgtca   5160

gaatctgtaa atgattcaga aagtgtaagt gaatctaatt ctgaaagtga ctctaaatcg   5220

atgagtggct caacaagtgt cagtgattct ggctcattga gcgtctcaac gtcattaaga   5280

aaatcagaaa gtgtaagcga gtcaagttca ttgagttgct cacaatcgat gagcgattca   5340

gtaagcacaa gcgattcgtc atcattaagt gtatcgacgt cactaagaag ttcagaaagc   5400

gtgagtgaat ctgattcatt aagtgattca aaatcaacaa gtggttcgac ttcaacaagt   5460

acatctggtt cattgagtac ctcaacatca ttaagtggtt cagaaagcgt aagcgagtct   5520

acctcgctaa gtgattcaat atcaatgagt gattctacta gtacaagtga ctccgactca   5580

ttaagtggat caatatcttt aagtggttcc acaagtctta gcacttcgga ttcattaagt   5640

gattcaaaat cattgagtag ctcgcaaagt atgagtggat cagaatcaac gtcaacaagt   5700

gtgagcgatt cgcagtcaag ctcaacaagt aatagtcaat ttgactctat gagcatcagt   5760

gcatcagaaa gcgactcaat gtctacaagt gattcgtcta gcatcagtgg atcaaattca   5820

acgagtacat cactttcaac atctgactca atgagcggaa gcgtatcagt ttcaacatcg   5880

acaagtttaa gtgactcaat atcaggttca acaagtgtaa gtgactcgag ctcaacaagc   5940

acatctacat cattaagtga ttcaatgtca caaagccagt caacaagtac aagtgcatct   6000

ggttccttaa gtacatcgat atcaacatca atgtcaatga gtgctagtac atcgtcatca   6060

caaagcacat cggtgtcgac atcattatca acatcagaca gtatcagtga ttctacttca   6120

ataagtatca gtggttcaca aagtacagta gaatcagaat ctacaagtga ttcaacttct   6180

atcagtgact cagaatcatt gagtacatca gattcagact cgacatcgac aagtacatcg   6240

gactcaacaa gtggttcaac ttcaacaagc atatctgaat cattaagtac gtctggttca   6300

ggttcaacga gcgtatctga ctcaacatca atgagtgaat ctaattcatc gagtgtttca   6360

atgtcacaag acaaatccga ctcaacatca attagtgact cagaatcagt gtcaacaagc   6420

acatcaacgt cattgagcac atccgattcg acaagcacat ccgaatcact gagtacatct   6480

atgtctggtt cacaaagcat ttctgactca acatcaacaa gtatgtccgg ctcaacaagt   6540

acatctgaat ctaactcaat gcatccgtca gactcaatga gtatgcatca tactcacagc   6600

acgagcacat ctcgcttatc aagtgaagca acaacgagca cgagtgaatc tcagtctaca   6660

ttaagtgcaa catctgaagt gactaaacat aatggcacac cagcacaaag tgaaaaaaga   6720

ttgccagata caggtgactc aataaaacaa aatggattac taggtggcgt tatgacatta   6780

ttagttggtt taggtttaat gaagagaaag aaaaagaaag atgaaaatga tcaagatgat   6840

tctcaagcat aa                                                       6852

<210>4

<211>2283

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>4

Ser Asn Glu Cys Lys Asp Asn Thr Arg Ser Tyr Tyr Met Ser Lys Arg

1                 5                   10                         15

Gln Lys Ala Phe His Asp Ser Leu Ala Asn Glu Lys Thr Arg Val Arg

              20                      25                     30

Leu Tyr Lys Ser Gly Lys Asn Trp Val Lys Ser Gly Ile Lys Glu Ile

         35                      40                       45

Glu Met Phe Lys Ile Met Gly Leu Pro Phe Ile Ser His Ser Leu Val

    50                      55                       60

Ser Gln Asp Asn Gln Ser Ile Ser Lys Lys Met Thr Gly Tyr Gly Leu

65                      70                      75                     80

Lys Thr Thr Ala Val Ile Gly Gly Ala Phe Thr Val Asn Met Leu His

                    85                      90                   95

Asp Gln Gln Ala Phe Ala Ala Ser Asp Ala Pro Leu Thr Ser Glu Leu

             100                     105                     110

Asn Thr Gln Ser Glu Thr Val Gly Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Glu

         115                     120                    125

Ala Ser Thr Ser Thr Ala Asp Ser Thr Ser Val Thr Lys Asn Ser Ser

     130                     135                     140

Ser Val Gln Thr Ser Asn Ser Asp Thr Val Ser Ser Glu Lys Ser Glu

145                     150                     155                  160

Lys Val Thr Ser Thr Thr Asn Ser Thr Ser Asn Gln Gln Glu Lys Leu

                    165                    170                    175

Thr Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ser Ser Lys Asn Thr Thr Ser Ser Ser

              180                      185                     190

Asp Thr Lys Ser Val Ala Ser Thr Ser Ser Thr Glu Gln Pro Ile Asn

         195                      200                      205

Thr Ser Thr Asn Gln Ser Thr Ala Ser Asn Asn Thr Ser Gln Ser Thr

     210                    215                     220

Thr Pro Ser Ser Val Asn Leu Asn Lys Thr Ser Thr Thr Ser Thr Ser

225                     230                     235                   240

Thr Ala Pro Val Lys Leu Arg Thr Phe Ser Arg Leu Ala Met Ser Thr

                    245                    250                    255

Phe Ala Ser Ala Ala Thr Thr Thr Ala Val Thr Ala Asn Thr Ile Thr

              260                     265                      270

Val Asn Lys Asp Asn Leu Lys Gln Tyr Met Thr Thr Ser Gly Asn Ala

         275                     280                     285

Thr Tyr Asp Gln Ser Thr Gly Ile Val Thr Leu Thr Gln Asp Ala Tyr

     290                     295                     300

Ser Gln Lys Gly Ala Ile Thr Leu Gly Thr Arg Ile Asp Ser Asn Lys

305                      310                     315                  320

Ser Phe His Phe Ser Gly Lys Val Asn Leu Gly Asn Lys Tyr Glu Gly

                   325                    330                     335

His Gly Asn Gly Gly Asp Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro Gly Val

              340                     345                     350

Leu Gly Glu Thr Gly Leu Asn Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly Gly Leu

         355                    360                      365

Ser Asn Ala Phe Gly Phe Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr Ser Lys

     370                    375                     380

Pro Asn Ser Ala Ala Lys Ala Asn Ala Asp Pro Ser Asn Val Ala Gly

385                     390                     395                   400

Gly Gly Ala Phe Gly Ala Phe Val Thr Thr Asp Ser Tyr Gly Val Ala

                  405                     410                     415

Thr Thr Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Ala Asp Asn Ala Ala Lys Leu Asn

              420                      425                    430

Val Gln Pro Thr Asn Asn Thr Phe Gln Asp Phe Asp Ile Asn Tyr Asn

         435                    440                     445

Gly Asp Thr Lys Val Met Thr Val Lys Tyr Ala Gly Gln Thr Trp Thr

     450                    455                     460

Arg Asn Ile Ser Asp Trp Ile Ala Lys Ser Gly Thr Thr Asn Phe Ser

465                     470                      475                  480

Leu Ser Met Thr Ala Ser Thr Gly Gly Ala Thr Asn Leu Gln Gln Val

                   485                     490                     495

Gln Phe Gly Thr Phe Glu Tyr Thr Glu Ser Ala Val Thr Gln Val Arg

             500                     505                      510

Tyr Val Asp Val Thr Thr Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Tyr

          515                     520                       525

Ser Gly Asn Val Asp Gln Val Val Thr Ile Asp Asn Gln Gln Ser Ala

     530                    535                      540

Leu Thr Ala Lys Gly Tyr Asn Tyr Thr Ser Val Asp Ser Ser Tyr Ala

545                     550                     555                   560

Ser Thr Tyr Asn Asp Thr Asn Lys Thr Val Lys Met Thr Asn Ala Gly

                   565                    570                      575

Gln Ser Val Thr Tyr Tyr Phe Thr Asp Val Lys Ala Pro Thr Val Thr

              580                     585                      590

Val Gly Asn Gln Thr Ile Glu Val Gly Lys Thr Met Asn Pro Ile Val

          595                     600                    605

Leu Thr Thr Thr Asp Asn Gly Thr Gly Thr Val Thr Asn Thr Val Thr

    610                     615                     620

Gly Leu Pro Ser Gly Leu Ser Tyr Asp Ser Ala Thr Asn Ser Ile Ile

625                     630                     635                   640

Gly Thr Pro Thr Lys Ile Gly Gln Ser Thr Val Thr Val Val Ser Thr

                    645                     650                   655

Asp Gln Ala Asn Asn Lys Ser Thr Thr Thr Phe Thr Ile Asn Val Val

                 660                 665                      670

Asp Thr Thr Ala Pro Thr Val Thr Pro Ile Gly Asp Gln Ser Ser Glu

         675                     680                      685

Val Tyr Ser Pro Ile Ser Pro Ile Lys Ile Ala Thr Gln Asp Asn Ser

     690                        695                   700

Gly Asn Ala Val Thr Asn Thr Val Thr Gly Leu Pro Ser Gly Leu Thr

705                     710                     715                   720

Phe Asp Ser Thr Asn Asn Thr Ile Ser Gly Thr Pro Thr Asn IIe Gly

                  725                      730                     735

Thr Ser Thr Ile Ser Ile Val Ser Thr Asp Ala Ser Gly Asn Lys Thr

                740                     745                    750

Thr Thr Thr Phe Lys Tyr Glu Val Thr Arg Asn Ser Met Ser Asp Ser

         755                     760                     765

Val Ser Thr Ser Gly Ser Thr Gln Gln Ser Gln Ser Val Ser Thr Ser

     770                     775                     780

Lys Ala Asp Ser Gln Ser Ala Ser Thr Ser Thr Ser Gly Ser Ile Val

785                     790                     795                   800

Val Ser Thr Ser Ala Ser Thr Ser Lys Ser Thr Ser Val Ser Leu Ser

                    805                     810                    815

Asp Ser Val Ser Ala Ser Lys Ser Leu Ser Thr Ser Glu Ser Asn Ser

               820                     825                     830

Val Ser Ser Ser Thr Ser Thr Ser Leu Val Asn Ser Gln Ser Val Ser

          835                     840                     845

Ser Ser Met Ser Asp Ser Ala Ser Lys Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser

     850                     855                     860

Ile Ser Asn Ser Ser Ser Thr Glu Lys Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser

865                      870                     875                  880

Thr Ser Asp Ser Leu Arg Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Leu Ser

                  885                     890                      895

Met Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Lys Ser Gln Ser Leu Ser Thr Ser

              900                     905                     910

Ile Ser Gly Ser Ser Ser Thr Ser Ala Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

          915                       920                   925

Asn Ala Ile Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Glu Ser Ala Ser Thr Ser

    930                      935                     940

Asp Ser Ile Ser Ile Ser Asn Ser Ile Ala Asn Ser Gln Ser Ala Ser

945                      950                      955                 960

Thr Ser Lys Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ile Ser Leu Ser Thr Ser

                   965                       970                   975

Asp Ser Lys Ser Met Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

              980                     985                     990

Thr Ser Gly Ser Val Ser Gly Ser Leu Ser Ile Ala Ala Ser Gln Ser

         995                    1000                     1005

Val Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Met Ser Thr Ser Glu Ile Val

     1010                  1015                   1020

Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Ala Ser Asp Ser

     1025                  1030                   1035

Lys Ser Met Ser Val Ser Ser Ser Met Ser Thr Ser Gln Ser Gly

     1040                  1045                   1050

Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Asp Ser

     1055                  1060                   1065

Asp Ser Lys Ser Leu Ser Gln Ser Thr Ser Gln Ser Gly Ser Thr

     1070                  1075                   1080

Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Ala Ser Val Arg Thr Ser Glu Ser

     1085                  1090                    1095

Gln Ser Thr Ser Gly Ser Met Ser Ala Ser Gln Ser Asp Ser Met

     1100                  1105                    1110

Ser Ile Ser Thr Ser Phe Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Lys Ser

     1115                  1120                    1125

Ala Ser Thr Ala Ser Ser Glu Ser Ile Ser Gln Ser Ala Ser Thr

     1130                  1135                    1140

Ser Thr Ser Gly Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser

     1145                  1150                    1155

Asn Ser Glu Arg Thr Ser Thr Ser Met Ser Asp Ser Thr Ser Leu

     1160                  1165                    1170

Ser Thr Ser Glu Ser Asp Ser Ile Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser

     1175                  1180                    1185

Asp Ser Ile Ser Glu Ala Ile Ser Ala Ser Glu Ser Thr Phe Ile

     1190                  1195                    1200

Ser Leu Ser Glu Ser Asn Ser Thr Ser Asp Ser Glu Ser Gln Ser

     1205                  1210                    1215

Ala Ser Ala Phe Leu Ser Glu Ser Leu Ser Glu Ser Thr Ser Glu

     1220                  1225                    1230

Ser Thr Ser Glu Ser Val Ser Ser Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ser

     1235                  1240                    1245

Leu Ser Asp Ser Thr Ser Glu Ser Gly Ser Thr Ser Thr Ser Leu

     1250                  1255                    1260

Ser Asn Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser Ile Ser Thr Ser Thr Ser

     1265                  1270                    1275

Ile Ser Glu Ser Thr Ser Thr Phe Lys Ser Glu Ser Val Ser Thr

     1280                  1285                    1290

Ser Leu Ser Met Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

     1295                  1300                    1305

Leu Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Lys Ser Asp

     1310                  1315                    1320

Ser Leu Ser Thr Ser Met Ser Thr Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser

     1325                  1330                    1335

Lys Ser Asp Ser Ile Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Gly Ser Thr

     1340                  1345                    1350

Ser Glu Ser Glu Ser Asp Ser Thr Ser Ser Ser Glu Ser Lys Ser

     1355                  1360                    1365

Asp Ser Thr Ser Met Ser Ile Ser Met Ser Gln Ser Thr Ser Gly

     1370                  1375                    1380

Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser

     1385                  1390                    1395

Thr Ser Leu Ser Leu Ser Ala Ser Met Asn Gln Ser Gly Val Asp

     1400                  1405                    1410

Ser Asn Ser Ala Ser Gln Ser Ala Ser Asn Ser Thr Ser Thr Ser

     1415                  1420                    1425

Thr Ser Glu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ser Tyr Thr Ser Gln

     1430                  1435                    1440

Ser Thr Ser Gln Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser

     1445                  1450                    1455

Asp Ser Thr Ser Ile Ser Lys Ser Thr Ser Gln Ser Gly Ser Val

     1460                  1465                    1470

Ser Thr Ser Ala Ser Leu Ser Gly Ser Glu Ser Glu Ser Asp Ser

     1475                  1480                    1485

Gln Ser Ile Ser Thr Ser Ala Ser Glu Ser Thr Ser Glu Ser Ala

     1490                  1495                    1500

Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Asn Ser Gly Ser

     1505                  1510                    1515

Ala Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asn Ser Ala Ser Ala Ser Glu

     1520                  1525                   1530

Ser Asp Leu Ser Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Thr Ser Ala Ser

     1535                  1540                   1545

Met Gln Ser Ser Glu Ser Asp Ser Gln Ser Thr Ser Ala Ser Leu

     1550                  1555                   1560

Ser Asp Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Asn Arg Met Ser Thr Ile

     1565                  1570                   1575

Ala Ser Leu Ser Thr Ser Val Ser Thr Ser Glu Ser Gly Ser Thr

     1580                  1585                   1590

Ser Glu Ser Thr Ser Glu Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser

     1595                  1600                   1605

Asp Ser Gln Ser Thr Ser Arg Ser Thr Ser Ala Ser Gly Ser Ala

     1610                  1615                   1620

Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Arg Ser Thr Ser Ala Ser

     1625                  1630                   1635

Thr Ser Thr Ser Met Arg Thr Ser Thr Ser Asp Ser Gln Ser Met

     1640                  1645                   1650

Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Met Ser Asp Ser Thr Ser

     1655                  1660                   1665

Leu Ser Asp Ser Val Ser Asp Ser Thr Ser Asp Ser Thr Ser Ala

     1670                  1675                   1680

Ser Thr Ser Gly Ser Met Ser Val Ser Ile Ser Leu Ser Asp Ser

     1685                  1690                   1695

Thr Ser Thr Ser Thr Ser Ala Ser Glu Val Met Ser Ala Ser Ile

     1700                  1705                   1710

Ser Asp Ser Gln Ser Met Ser Glu Ser Val Asn Asp Ser Glu Ser

     1715                  1720                   1725

Val Ser Glu Ser Asn Ser Glu Ser Asp Ser Lys Ser Met Ser Gly

     1730                  1735                    1740

Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Gly Ser Leu Ser Val Ser Thr Ser

     1745                  1750                    1755

Leu Arg Lys Ser Glu Ser Val Ser Glu Ser Ser Ser Leu Ser Cys

     1760                  1765                    1770

Ser Gln Ser Met Ser Asp Ser Val Ser Thr Ser Asp Ser Ser Ser

     1775                  1780                    1785

Leu Ser Val Ser Thr Ser Leu Arg Ser Ser Glu Ser Val Ser Glu

     1790                  1795                    1800

Ser Asp Ser Leu Ser Asp Ser Lys Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser

     1805                  1810                    1815

Thr Ser Thr Ser Gly Ser Leu Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Gly

     1820                  1825                    1830

Ser Glu Ser Val Ser Glu Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Ile Ser

     1835                  1840                    1845

Met Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Asp Ser Leu Ser Gly

     1850                  1855                    1860

Ser Ile Ser Leu Ser Gly Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser

      1865                  1870                   1875

Leu Ser Asp Ser Lys Ser Leu Ser Ser Ser Gln Ser Met Ser Gly

     1880                  1885                    1890

Ser Glu Ser Thr Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Gln Ser Ser Ser

     1895                  1900                    1905

Thr Ser Asn Ser Gln Phe Asp Ser Met Ser Ile Ser Ala Ser Glu

     1910                  1915                    1920

Ser Asp Ser Met Ser Thr Ser Asp Ser Ser Ser Ile Ser Gly Ser

     1925                  1930                    1935

Asn Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser Met Ser Gly

     1940                  1945                   1950

Ser Val Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Asp Ser Ile Ser

     1955                  1960                   1965

Gly Ser Thr Ser Val Ser Asp Ser Ser Ser Thr Ser Thr Ser Thr

     1970                  1975                   1980

Ser Leu Ser Asp Ser Met Ser Gln Ser Gln Ser Th  Ser Thr Ser

     1985                  1990                   1995

Ala Ser Gly Ser Leu Ser Thr Ser Ile Ser Thr Ser Met Ser Met

     2000                  2005                   2010

Ser Ala Ser Thr Ser Ser Ser Gln Ser Thr Ser Val Ser Thr Ser

     2015                  2020                   2025

Leu Ser Thr Ser Asp Ser Ile Ser Asp Ser Thr Ser Ile Ser Ile

     2030                  2035                   2040

Ser Gly Ser Gln Ser Thr Val Glu Ser Glu Ser Thr Ser Asp Ser

     2045                  2050                    2055

Thr Ser Ile Ser Asp Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Asp Ser Asp

     2060                  2065                    2070

Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Asp Ser Thr Ser Gly Ser Thr Ser

     2075                  2080                    2085

Thr Ser Ile Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Gly Ser Gly Ser Thr

     2090                   2095                    2100

Ser Val Ser Asp Ser Thr Ser Met Ser Glu Ser Asn Ser Ser Ser

     2105                  2110                     2115

Val Ser Met Ser Gln Asp Lys Ser Asp Ser Thr Ser Ile Ser Asp

     2120                  2125                     2130

Ser Glu Ser Val Ser Thr Ser Thr Ser Thr Ser Leu Ser Thr Ser

     2135                  2140                     2145

Asp Ser Thr Ser Thr Ser Glu Ser Leu Ser Thr Ser Met Ser Gly

     2150                  2155                   2160

Ser Gln Ser Ile Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Met Ser Gly Ser

     2165                  2170                   2175

Thr Ser Thr Ser Glu Ser Asn Ser Met His Pro Ser Asp Ser Met

     2180                  2185                   2190

Ser Met His His Thr His Ser Thr Ser Thr Ser Arg Leu Ser Ser

     2195                  2200                   2205

Glu Ala Thr Thr Ser Thr Ser Glu Ser Gln Ser Thr Leu Ser Ala

     2210                  2215                   2220

Thr Ser Glu Val Thr Lys His Asn Gly Thr Pro Ala Gln Ser Glu

     2225                  2230                   2235

Lys Arg Leu Pro Asp Thr Gly Asp Ser Ile Lys Gln Asn Gly Leu

     2240                  2245                   2250

Leu Gly Gly Val Met Thr Leu Leu Val Gly Leu Gly Leu Met Lys

     2255                 2260                    2265

Arg Lys Lys Lys Lys Asp Glu Asn Asp Gln Asp Asp Ser Gln Ala

     2270                 2275                    2280

<210>5

<211>2730

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>5

ttattatcaa ttaaatataa tcttatagga gttgttaaca acatgaacaa acatcaccca     60

aaattaaggt ctttctattc tattagaaaa tcaactctag gcgttgcatc ggtcattgtc    120

agtacactat ttttaattac ttctcaacat caagcacaag cagcagaaaa tacaaatact    180

tcagataaaa tctcggaaaa tcaaaataat aatgcaacta caactcagcc acctaaggat    240

acaaatcaaa cacaacctgc tacgcaacca gcaaacactg cgaaaaacta tcctgcagcg    300

gatgaatcac ttaaagatgc aattaaagat cctgcattag aaaataaaga acatgatata    360

ggtccaagag aacaagtcaa tttccagtta ttagataaaa acaatgaaac gcagtactat    420

cactttttca gcatcaaaga tccagcagat gtgtattaca ctaaaaagaa agcagaagtt    480

gaattagaca tcaatactgc ttcaacatgg aagaagtttg aagtctatga aaacaatcaa    540

aaattgccag tgagacttgt atcatatagt cctgtaccag aagaccatgc ctatattcga    600

ttcccagttt cagatggcac acaagaattg aaaattgttt cttcgactca aattgatgat    660

ggagaagaaa caaattatga ttatactaaa ttagtatttg ctaaacctat ttataacgat    720

ccttcacttg taaaatcaga tacaaatgat gcagtagtaa cgaatgatca atcaagttca    780

gtcgcaagta atcaaacaaa cacgaataca tctaatcaaa atatatcaac gatcaacaat    840

gctaataatc aaccgcaggc aacgaccaat atgagtcaac ctgcacaacc aaaatcgtca    900

acgaatgcag atcaagcgtc aagccaacca gctcatgaaa caaattctaa tggtaatact    960

aacgataaaa cgaatgagtc aagtaatcag tcggatgtta atcaacagta tccaccagca   1020

gatgaatcac tacaagatgc aattaaaaac ccggctatca tcgataaaga acatacagct   1080

gataattggc gaccaattga ttttcaaatg aaaaatgata aaggtgaaag acagttctat   1140

cattatgcta gtactgttga accagcaact gtcattttta caaaaacagg accaataatt   1200

gaattaggtt taaagacagc ttcaacatgg aagaaatttg aagtttatga aggtgacaaa   1260

aagttaccag tcgaattagt atcatatgat tctgataaag attatgccta tattcgtttc   1320

ccagtatcta atggtacgag agaagttaaa attgtgtcat ctattgaata tggtgagaac   1380

atccatgaag actatgatta tacgctaatg gtctttgcac agcctattac taataaccca   1440

gacgactatg tggatgaaga aacatacaat ttacaaaaat tattagctcc gtatcacaaa   1500

gctaaaacgt tagaaagaca agtttatgaa ttagaaaaat tacaagagaa attgccagaa   1560

aaatataagg cggaatataa aaagaaatta gatcaaacta gagtagagtt agctgatcaa   1620

gttaaatcag cagtgacgga atttgaaaat gttacaccta caaatgatca attaacagat   1680

ttacaagaag cgcattttgt tgtttttgaa agtgaagaaa atagtgagtc agttatggac   1740

ggctttgttg aacatccatt ctatacagca actttaaatg gtcaaaa ta tgtagtgatg   1800

aaaacaaagg atgacagtta ctggaaagat ttaattgtag aaggtaaacg tgtcactact   1860

gtttctaaag atcctaaaaa taattctaga acgctgattt tcccatatat acctgacaaa   1920

gcagtttaca atgcgattgt taaagtcgtt gtggcaaaca ttggttatga aggtcaatat   1980

catgtcagaa ttataaatca ggatatcaat acaaaagatg atgatacatc acaaaataac   2040

acgagtgaac cgctaaatgt acaaacagga caagaaggta aggttgctga tacagatgta   2100

gctgaaaata gcagcactgc aacaaatcct aaagatgcgt ctgataaagc agatgtgata   2160

gaaccagagt ctgacgtggt taaagatgct gataataata ttgataaaga tgtgcaacat   2220

gatgttgatc atttatccga tatgtcggat aataatcact tcgataaata tgatttaaaa   2280

gaaatggata ctcaaattgc caaagatact gatagaaatg tggataaaga tgccgataat   2340

agcgttggta tgtcatctaa tgtcgatact gataaagact ctaataaaaa taaagacaaa   2400

gtcatacagc tgaatcatat tgccgataaa aataatcata ctggaaaagc agcaaagctt   2460

gacgtagtga aacaaaatta taataataca gacaaagtta ctgacaaaaa aacaactgaa   2520

catctgccga gtgatattca taaaactgta gataaaacag tgaaaacaaa agaaaaagcc   2580

ggcacaccat cgaaagaaaa caaacttagt caatctaaaa tgctaccaaa aactggagaa   2640

acaacttcaa gccaatcatg gtggggctta tatgcgttat taggtatgtt agctttattc   2700

attcctaaat tcagaaaaga atctaaataa                                    2730

<210>6

<211>909

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>6

Leu Leu Ser Ile Lys Tyr Asn Leu Ile Gly Val Val Asn Asn Met Asn

1                   5                    10                          15

Lys His His Pro Lys Leu Arg Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys Ser Thr

               20                     25                       30

Leu Gly Val Ala Ser Val Ile Val Ser Thr Leu Phe Leu Ile Thr Ser

         35                        40                      45

Gln His Gln Ala Gln Ala Ala Glu Asn Thr Asn Thr Ser Asp Lys Ile

     50                     55                      60

Ser Glu Asn Gln Asn Asn Asn Ala Thr Thr Thr Gln Pro Pro Lys Asp

65                     70                     75                    80

Thr Asn Gln Thr Gln Pro Ala Thr Gln Pro Ala Asn Thr Ala Lys Asn

                  85                      90                     95

Tyr Pro Ala Ala Asp Glu Ser Leu Lys Asp Ala Ile Lys Asp Pro Ala

               100                    105                    110

Leu Glu Asn Lys Glu His Asp Ile Gly Pro Arg Glu Gln Val Asn Phe

         115                     120                    125

Gln Leu Leu Asp Lys Asn Asn Glu Thr Gln Tyr Tyr His Phe Phe Ser

    130                   135                      140

Ile Lys Asp Pro Ala Asp Val Tyr Tyr Thr Lys Lys Lys Ala Glu Val

145                     150                      155                  160

Glu Leu Asp Ile Asn Thr Ala Ser Thr Trp Lys Lys Phe Glu Val Tyr

                   165                     170                   175

Glu Asn Asn Gln Lys Leu Pro Val Arg Leu Val Ser Tyr Ser Pro Val

             180                     185                      190

Pro Glu Asp His Ala Tyr Ile Arg Phe Pro Val Ser Asp Gly Thr Gln

         195                      200                     205

Glu Leu Lys Ile Val Ser Ser Thr Gln Ile Asp Asp Gly Glu Glu Thr

     210                      215                     220

Asn Tyr Asp Tyr Thr Lys Leu Val Phe Ala Lys Pro Ile Tyr Asn Asp

225                    230                     235                   240

Pro Ser Leu Val Lys Ser Asp Thr Asn Asp Ala Val Val Thr Asn Asp

                    245                    250                    255

Gln Ser Ser Ser Val Ala Ser Asn Gln Thr Asn Thr Asn Thr Ser Asn

               260                     265                    270

Gln Asn Ile Ser Thr Ile Asn Asn Ala Asn Asn Gln Pro Gln Ala Thr

          275                      280                    285

Thr Asn Met Ser Gln Pro Ala Gln Pro Lys Ser Ser Thr Asn Ala Asp

     290                    295                     300

Gln Ala Ser Ser Gln Pro Ala His Glu Thr Asn Ser Asn Gly Asn Thr

305                     310                     315                  320

Asn Asp Lys Thr Asn Glu Ser Ser Asn Gln Ser Asp Val Asn Gln Gln

                  325                     330                    335

Tyr Pro Pro Ala Asp Glu Ser Leu Gln Asp Ala Ile Lys Asn Pro Ala

              340                     345                     350

Ile Ile Asp Lys Glu His Thr Ala Asp Asn Trp Arg Pro Ile Asp Phe

           355                     360                     365

Gln Met Lys Asn Asp Lys Gly Glu Arg Gln Phe Tyr His Tyr Ala Ser

     370                   375                     380

Thr Val Glu Pro Ala Thr Val Ile Phe Thr Lys Thr Gly Pro Ile Ile

385                     390                     395                   400

Glu Leu Gly Leu Lys Thr Ala Ser Thr Trp Lys Lys Phe Glu Val Tyr

                   405                     410                   415

Glu Gly Asp Lys Lys Leu Pro Val Glu Leu Val Ser Tyr Asp Ser Asp

              420                     425                    430

Lys Asp Tyr Ala Tyr Ile Arg Phe Pro Val Ser Asn Gly Thr Arg Glu

         435                      440                     445

Val Lys Ile Val Ser Ser Ile Glu Tyr Gly Glu Asn Ile His Glu Asp

     450                       455                      460

Tyr Asp Tyr Thr Leu Met Val Phe Ala Gln Pro Ile Thr Asn Asn Pro

465                    470                      475                  480

Asp Asp Tyr Val Asp Glu Glu Thr Tyr Asn Leu Gln Lys Leu Leu Ala

                  485                     490                   495

Pro Tyr His Lys Ala Lys Thr Leu Glu Arg Gln Val Tyr Glu Leu Glu

              500                     505                     510

Lys Leu Gln Glu Lys Leu Pro Glu Lys Tyr Lys Ala Glu Tyr Lys Lys

         515                     520                     525

Lys Leu Asp Gln Thr Arg Val Glu Leu Ala Asp Gln Val Lys Ser Ala

     530                     535                   540

Val Thr Glu Phe Glu Asn Val Thr Pro Thr Asn Asp Gln Leu Thr Asp

545                    550                     555                    560

Leu Gln Glu Ala His Phe Val Val Phe Glu Ser Glu Glu Asn Ser Glu

                  565                     570                      575

Ser Val Met Asp Gly Phe Val Glu His Pro Phe Tyr Thr Ala Thr Leu

              580                     585                    590

Asn Gly Gln Lys Tyr Val Val Met Lys Thr Lys Asp Asp Ser Tyr Trp

         595                     600                     605

Lys Asp Leu Ile Val Glu Gly Lys Arg Val Thr Thr Val Ser Lys Asp

    610                      615                     620

Pro Lys Asn Asn Ser Arg Thr Leu Ile Phe Pro Tyr Ile Pro Asp Lys

625                    630                      635                   640

Ala Val Tyr Asn Ala Ile Val Lys Val Val Val Ala Asn Ile Gly Tyr

                   645                       650                  655

Glu Gly Gln Tyr His Val Arg Ile Ile Asn Gln Asp Ile Asn Thr Lys

              660                      665                      670

Asp Asp Asp Thr Ser Gln Asn Asn Thr Ser Glu Pro Leu Asn Val Gln

          675                  680                     685

Thr Gly Gln Glu Gly Lys Val Ala Asp Thr Asp Val Ala Glu Asn Ser

     690                    695                     700

Ser Thr Ala Thr Asn Pro Lys Asp Ala Ser Asp Lys Ala Asp Val Ile

705                     710                     715                   720

Glu Pro Glu Ser Asp Val Val Lys Asp Ala Asp Asn Asn Ile Asp Lys

                  725                     730                     735

Asp Val Gln His Asp Val Asp His Leu Ser Asp Met Ser Asp Asn Asn

              740                     745                   750

His Phe Asp Lys Tyr Asp Leu Lys Glu Met Asp Thr Gln Ile Ala Lys

         755                     760                    765

Asp Thr Asp Arg Asn Val Asp Lys Asp Ala Asp Asn Ser Val Gly Met

    770                     775                    780

Ser Ser Asn Val Asp Thr Asp Lys Asp Ser Asn Lys Asn Lys Asp Lys

785                     790                    795                    800

Val Ile Gln Leu Asn His Ile Ala Asp Lys Asn Asn His Thr Gly Lys

                    805                 810                       815

Ala Ala Lys Leu Asp Val Val Lys Gln Asn Tyr Asn Asn Thr Asp Lys

              820                     825                    830

Val Thr Asp Lys Lys Thr Thr Glu His Leu Pro Ser Asp Ile His Lys

          835                    840                     845

Thr Val Asp Lys Thr Val Lys Thr Lys Glu Lys Ala Gly Thr Pro Ser

     850                     855                     860

Lys Glu Asn Lys Leu Ser Gln Ser Lys Met Leu Pro Lys Thr Gly Glu

865                    870                    875                     880

Thr Thr Ser Ser Gln Ser Trp Trp Gly Leu Tyr Ala Leu Leu Gly Met

                    885                   890                   895

Leu Ala Leu Phe Ile Pro Lys Phe Arg Lys Glu Ser Lys

             900                      905

<210>7

<211>1065

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>7

gaggaaaaca acatgacaaa acattattta aacagtaagt atcaatcaga acaacgttca     60

tcagctatga aaaagattac aatgggtaca gcatctatca ttttaggttc ccttgtatac    120

ataggcgcag acagccaaca agtcaatgcg gcaacagaag ctacgaacgc aactaataat    180

caaagcacac aagtttctca agcaacatca caaccaatta atttccaagt gcaaaaagat    240

ggctcttcag agaagtcaca catggatgac tatatgcaac accctggtaa agtaattaaa    300

caaaataata aatattattt ccaaaccgtg ttaaacaatg catcattctg gaaagaatac    360

aaattttaca atgcaaacaa tcaagaatta gcaacaactg ttgttaacga taataaaaaa    420

gcggatacta gaacaatcaa tgttgcagtt gaacctggat ataagagctt aactactaaa    480

gtacatattg tcgtgccaca aattaattac aatcatagat atactacgca tttggaattt    540

gaaaaagcaa ttcctacatt agctgacgca gcaaaaccaa acaatgttaa accggttcaa    600

ccaaaaccag ctcaacctaa aacacctact gagcaaacta aaccagttca acctaaagtt    660

gaaaaagtta aacctactgt aactacaaca agcaaagttg aagacaatca ctctactaaa    720

gttgtaagta ctgacacaac aaaagatcaa actaaaacac aaactgctca tacagttaaa    780

acagcacaaa ctgctcaaga acaaaataaa gttcaaacac ctgttaaaga tgttgcaaca    840

gcgaaatctg aaagcaacaa tcaagctgta agtgataata aatcacaaca aactaacaaa    900

gttacaaaac ataacgaaac gcctaaacaa gcatctaaag ctaaagaatt accaaaaact    960

ggtttaactt cagttgataa ctttattagc acagttgcct tcgcaacact tgccctttta    1020

ggttcattat ctttattact tttcaaaaga aaagaatcta aataa                    1065

<210>8

<211>354

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>8

Glu Glu Asn Asn Met Thr Lys His Tyr Leu Asn Ser Lys Tyr Gln Ser

1                5                       10                      15

Glu Gln Arg Ser Ser Ala Met Lys Lys Ile Thr Met Gly Thr Ala Ser

              20                      25                      30

Ile Ile Leu Gly Ser Leu Val Tyr Ile Gly Ala Asp Ser Gln Gln Val

          35                        40                     45

Asn Ala Ala Thr Glu Ala Thr Asn Ala Thr Asn Asn Gln Ser Thr Gln

    50                      55                     60

Val Ser Gln Ala Thr Ser Gln Pro Ile Asn Phe Gln Val Gln Lys Asp

65                      70                      75                     80

Gly Ser Ser Glu Lys Ser His Met Asp Asp Tyr Met Gln His Pro Gly

                   85                     90                      95

Lys Val Ile Lys Gln Asn Asn Lys Tyr Tyr Phe Gln Thr Val Leu Asn

                100                    105                    110

Asn Ala Ser Phe Trp Lys Glu Tyr Lys Phe Tyr Asn Ala Asn Asn Gln

         115                     120                     125

Glu Leu Ala Thr Thr Val Val Asn Asp Asn Lys Lys Ala Asp Thr Arg

     130                     135                    140

Thr Ile Asn Val Ala Val Glu Pro Gly Tyr Lys Ser Leu Thr Thr Lys

145                      150                     155                  160

Val His Ile Val Val Pro Gln Ile Asn Tyr Asn His Arg Tyr Thr Thr

                     165                     170                  175

His Leu Glu Phe Glu Lys Ala Ile Pro Thr Leu Ala Asp Ala Ala Lys

             180                      185                     190

Pro Asn Asn Val Lys Pro Val Gln Pro Lys Pro Ala Gln Pro Lys Thr

         195                     200                     205

Pro Thr Glu Gln Thr Lys Pro Val Gln Pro Lys Val Glu Lys Val Lys

     210                     215                     220

Pro Thr Val Thr Thr Thr Ser Lys Val Glu Asp Asn His Ser Thr Lys

225                     230                     235                   240

Val Val Ser Thr Asp Thr Thr Lys Asp Gln Thr Lys Thr Gln Thr Ala

                    245                    250                    255

His Thr Val Lys Thr Ala Gln Thr Ala Gln Glu Gln Asn Lys Val Gln

               260                    265                     270

Thr Pro Val Lys Asp Val Ala Thr Ala Lys Ser Glu Ser Asn Asn Gln

         275                      280                     285

Ala Val Ser Asp Asn Lys Ser Gln Gln Thr Asn Lys Val Thr Lys His

     290                    295                     300

Asn Glu Thr Pro Lys Gln Ala Ser Lys Ala Lys Glu Leu Pro Lys Thr

305                    310                     315                    320

Gly Leu Thr Ser Val Asp Asn Phe Ile Ser Thr Val Ala Phe Ala Thr

                   325                      330                  335

Leu Ala Leu Leu Gly Ser Leu Ser Leu Leu Leu Phe Lys Arg Lys Glu

             340                     345                    350

Ser Lys

<210>9

<211>1965

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>9

tatacaatta ggagttgttt ctacaacatg aacaaacagc aaaaagaatt taaatcattt     60

tattcaatta gaaagtcatc actaggcgtt gcatctgtag caattagtac acttttatta    120

ttaatgtcaa atggcgaagc acaagcagca gctgaagaaa caggtggtac aaatacagaa    180

gcacaaccaa aaactgaagc agttgcaagt ccaacaacaa catctgaaaa agctccagaa    240

actaaaccag tagctaatgc tgtctcagta tctaataaag aagttgaggc ccctacttct    300

gaaacaaaag aagctaaaga agttaaagaa gttaaagccc ctaaggaaac aaaagaagtt    360

aaaccagcag caaaagccac taacaataca tatcctattt tgaatcagga acttagagaa    420

gcgattaaaa accctgcaat aaaagacaaa gatcatagcg caccaaactc tcgtccaatt    480

gattttgaaa tgaaaaagaa agatggaact caacagtttt atcattatgc aagttctgtt    540

aaacctgcta gagttatttt cactgattca aaaccagaaa ttgaattagg attacaatca    600

ggtcaatttt ggagaaaatt tgaagtttat gaaggtgaca aaaagttgcc aattaaatta    660

gtatcatacg atactgttaa agattatgct tacattcgct tctctgtatc aaacggaaca    720

aaagctgtta aaattgttag ttcaacacac ttcaataaca aagaagaaaa atacgattac    780

acattaatgg aattcgcaca accaatttat aacagtgcag ataaattcaa aactgaagaa    840

gattataaag ctgaaaaatt attagcgcca tataaaaaag cgaaaacact agaaagacaa    900

gtttatgaat taaataaaat tcaagataaa cttcctgaaa aattaaaggc tgagtacaag    960

aagaaattag aggatacaaa gaaagcttta gatgagcaag tgaaatcagc tattactgaa   1020

ttcc aaatg tacaaccaac aaatgaaaaa atgactgatt tacaagatac aaaatatgtt   1080

gtttatgaaa gtgttgagaa taacgaatct atgatggata cttttgttaa acaccctatt   1140

aaaacaggta tgcttaacgg caaaaaatat atggtcatgg aaactactaa tgacgattac   1200

tggaaagatt tcatggttga aggtcaacgt gttagaacta taagcaaaga tgctaaaaat   1260

aatactagaa caattatttt cccatatgtt gaaggtaaaa ctctatatga tgctatcgtt   1320

aaagttcacg taaaaacgat tgattatgat ggacaatacc atgtcagaat cgttgataaa   1380

gaagcattta caaaagccaa taccgataaa tctaacaaaa aagaacaaca agataactca   1440

gctaagaagg aagctactcc agctacgcct agcaaaccaa caccatcacc tgttgaaaaa   1500

gaatcacaaa aacaagacag ccaaaaagat gacaataaac aattaccaag tgttgaaaaa   1560

gaaaatgacg catctagtga gtcaggtaaa gacaaaacgc ctgctacaaa accaactaaa   1620

ggtgaagtag aatcaagtag tacaactcca actaaggtag tatctacgac tcaaaatgtt   1680

gcaaaaccaa caactgcttc atcaaaaaca acaaaagatg ttgttcaaac ttcagcaggt   1740

tctagcgaag caaaagatag tgctccatta caaaaagcaa acattaaaaa cacaaatgat   1800

ggacacactc aaagccaaaa caataaaaat acacaagaaa ataaagcaaa atcattacca   1860

caaactggtg aagaatcaaa taaagatatg acattaccat taatggcatt attagcttta   1920

agtagcatcg ttgcattcgt attacctaga aaacgtaaaa actaa                   1965

<210>10

<211>654

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>10

Tyr Thr Ile Arg Ser Cys Phe Tyr Asn Met Asn Lys Gln Gln Lys Glu

1                   5                     10                      15

Phe Lys Ser Phe Tyr Ser Ile Arg Lys Ser Ser Leu Gly Val Ala Ser

              20                       25                      30

Val Ala Ile Ser Thr Leu Leu Leu Leu Met Ser Asn Gly Glu Ala Gln

          35                      40                     45

Ala Ala Ala Glu Glu Thr Gly Gly Thr Asn Thr Glu Ala Gln Pro Lys

     50                     55                      60

Thr Glu Ala Val Ala Ser Pro Thr Thr Thr Ser Glu Lys Ala Pro Glu

65                      70                      75                  80

Thr Lys Pro Val Ala Asn Ala Val Ser Val Ser Asn Lys Glu Val Glu

                    85                      90                    95

Ala Pro Thr Ser Glu Thr Lys Glu Ala Lys Glu Val Lys Glu Val Lys

              100                     105                     110

Ala Pro Lys Glu Thr Lys Glu Val Lys Pro Ala Ala Lys Ala Thr Asn

         115                     120                     125

Asn Thr Tyr Pro Ile Leu Asn Gln Glu Leu Arg Glu Ala Ile Lys Asn

    130                     135                     140

Pro Ala Ile Lys Asp Lys Asp His Ser Ala Pro Asn Ser Arg Pro Ile

145                      150                     155                  160

Asp Phe Glu Met Lys Lys Lys Asp Gly Thr Gln Gln Phe Tyr His Tyr

                     165                     170                  175

Ala Ser Ser Val Lys Pro Ala Arg Val Ile Phe Thr Asp Ser Lys Pro

               180                      185                    190

Glu Ile Glu Leu Gly Leu Gln Ser Gly Gln Phe Trp Arg Lys Phe Glu

          195                    200                     205

Val Tyr Glu Gly Asp Lys Lys Leu Pro Ile Lys Leu Val Ser Tyr Asp

     210                    215                      220

Thr Val Lys Asp Tyr Ala Tyr Ile Arg Phe Ser Val Ser Asn Gly Thr

225                     230                      235                  240

Lys Ala Val Lys Ile Val Ser Ser Thr His Phe Asn Asn Lys Glu Glu

                    245                      250                  255

Lys Tyr Asp Tyr Thr Leu Met Glu Phe Ala Gln Pro Ile Tyr Asn Ser

              260                    265                      270

Ala Asp Lys Phe Lys Thr Glu Glu Asp Tyr Lys Ala Glu Lys Leu Leu

         275                     280                    285

Ala Pro Tyr Lys Lys Ala Lys Thr Leu Glu Arg Gln Val Tyr Glu Leu

     290                     295                     300

Asn Lys Ile Gln Asp Lys Leu Pro Glu Lys Leu Lys Ala Glu Tyr Lys

305                     310                     315                   320

Lys Lys Leu Glu Asp Thr Lys Lys Ala Leu Asp Glu Gln Val Lys Ser

                  325                     330                     335

Ala Ile Thr Glu Phe Gln Asn Val Gln Pro Thr Asn Glu Lys Met Thr

               340                    345                    350

Asp Leu Gln Asp Thr Lys Tyr Val Val Tyr Glu Ser Val Glu Asn Asn

         355                     360                     365

Glu Ser Met Met Asp Thr Phe Val Lys His Pro Ile Lys Thr Gly Met

     370                   375                       380

Leu Asn Gly Lys Lys Tyr Met Val Met Glu Thr Thr Asn Asp Asp Tyr

385                    390                    395                     400

Trp Lys Asp Phe Met Val Glu Gly Gln Arg Val Arg Thr Ile Ser Lys

                  405                     410                     415

Asp Ala Lys Asn Asn Thr Arg Thr Ile Ile Phe Pro Tyr Val Glu Gly

             420                       425                     430

Lys Thr Leu Tyr Asp Ala Ile Val Lys Val His Val Lys Thr Ile Asp

         435                      440                       445

Tyr Asp Gly Gln Tyr His Val Arg Ile Val Asp Lys Glu Ala Phe Thr

     450                     455                     460

Lys Ala Asn Thr Asp Lys Ser Asn Lys Lys Glu Gln Gln Asp Asn Ser

465                     470                       475                 480

Ala Lys Lys Glu Ala Thr Pro Ala Thr Pro Ser Lys Pro Thr Pro Ser

                   485                      490                   495

Pro Val Glu Lys Glu Ser Gln Lys Gln Asp Ser Gln Lys Asp Asp Asn

              500                     505                    510

Lys Gln Leu Pro Ser Val Glu Lys Glu Asn Asp Ala Ser Ser Glu Ser

         515                     520                     525

Gly Lys Asp Lys Thr Pro Ala Thr Lys Pro Thr Lys Gly Glu Val Glu

     530                    535                     540

Ser Ser Ser Thr Thr Pro Thr Lys Val Val Ser Thr Thr Gln Asn Val

545                     550                      555                  560

Ala Lys Pro Thr Thr Ala Ser Ser Lys Thr Thr Lys Asp Val Val Gln

                    565                     570                   575

Thr Ser Ala Gly Ser Ser Glu Ala Lys Asp Ser Ala Pro Leu Gln Lys

               580                    585                     590

Ala Asn Ile Lys Asn Thr Asn Asp Gly His Thr Gln Ser Gln Asn Asn

          595                    600                     605

Lys Asn Thr Gln Glu Asn Lys Ala Lys Ser Leu Pro Gln Thr Gly Glu

     610                    615                     620

Glu Ser Asn Lys Asp Met Thr Leu Pro Leu Met Ala Leu Leu Ala Leu

625                     630                   635                      640

Ser Ser Ile Val Ala Phe Val Leu Pro Arg Lys Arg Lys Asn

                    645                     650

<210>11

<211>2406

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>11

tttataaata atttacataa aatcaatcat tttaatataa ggattatgat aatatattgg     60

tgtatgacag ttaatggagg gaacgaaatg aaagctttat tacttaaaac aagtgtatgg    120

ctcgttttgc tttttagtgt aatgggatta tggcaagtct cgaacgcggc tgagcagcat    180

acaccaatga aagcacatgc agtaacaacg atagacaaag caacaacaga taagcaacaa    240

gtaccgccaa caaaggaagc ggctcatcat tctggcaaag aagcggcaac caacgtatca    300

gcatcagcgc agggaacagc tgatgataca aacagcaaag taacatccaa cgcaccatct    360

aacaaaccat ctacagtagt ttcaacaaaa gtaaacgaaa cacgcgacgt agatacacaa    420

caagcctcaa cacaaaaacc aactcacaca gcaacgttca aattatcaaa tgctaaaaca    480

gcatcacttt caccacgaat gtttgctgct aatgcaccac aaacaacaac acataaaata    540

ttacatacaa atgatatcca tggccgacta gccgaagaaa aagggcgtgt catcggtatg    600

gctaaattaa aaacagtaaa agaacaagaa aagcctgatt taatgttaga cgcaggagac    660

gccttccaag gtttaccact ttcaaaccag tctaaaggtg aagaaatggc taaagcaatg    720

aatgcagtag gttatgatgc tatggcagtc ggtaaccatg aatttgactt tggatacgat    780

cagttgaaaa agttagaggg tatgttagac ttcccgatgc taagtactaa cgtttataaa    840

gatggaaaac gcgcgtttaa gccttcaacg attgtaacaa aaaatggtat tcgttatgga    900

attattggtg taacgacacc agaaacaaag acgaaaacaa gacctgaagg cattaaaggc    960

gttgaattta gagatccatt acaaagtgtg acagcggaaa tgatgcgtat ttataaagac   1020

gtagatacat ttgttgttat atcacattta ggaattgatc cttcaacaca agaaacatgg   1080

cgtggtgatt acttagtgaa acaattaagt caaaatccac aattgaagaa acgtattaca   1140

gttattgatg gtcattcaca tacagtactt caaaatggtc aaatttataa caatgatgca   1200

ttggcacaaa caggtacagc acttgcgaat atcggtaaga ttacatttaa ttatcgcaat   1260

ggagaggtat cgaatattaa accgtcattg attaatgtta aagacgttga aaatgtaaca   1320

ccgaacaaag cattagctga acaaattaat caagctgatc aaacatttag agcacaaact   1380

gcagaggtaa ttattccaaa caataccatt gatttcaaag gagaaagaga tgacgttaga   1440

acgcgtgaaa caaatttagg aaacgcgatt gcagatgcta tggaagcgta tggcgttaag   1500

aatttctcta aaaagactga ctttgccgtg acaaatggtg gaggtattcg tgcctctatc   1560

gcaaaaggta aggtgacacg ctatgattta atctcagtat taccatttgg aaatacgatt   1620

gcgcaaattg atgtaaaagg ttcagacgtc tggacggctt tcgaacatag tttaggcgca   1680

ccaacaacac aaaaggacgg taagacagtg ttaacagcga atggcggttt actacatatc   1740

tctgattcaa tccgtgttta ctatgatata aataaaccgt ctggcaaacg aattaatgct   1800

attcaaattt taaataaaga gacaggtaag tttgaaaata ttgatttaaa acgtgtatat   1860

cacgtaacga tgaatgactt cacagcatca ggtggcgacg gatatagtat gttcggtggt   1920

cctagagaag aaggtatttc attagatcaa gtactagcaa gttatttaaa aacagctaac   1980

ttagctaagt atgatacgac agaaccacaa cgtatgttat taggtaaacc agcagtaagt   2040

gaacaaccag ctaaaggaca acaaggtagc aaaggtagta agtctggtaa agatacacaa   2100

ccaattggtg acgacaaagt gatggatcca gcgaaaaaac cagctccagg taaagttgta   2160

ttgttgctag cgcatagagg aactgttagt agcggtacag aaggttctgg tcgcacaata   2220

gaaggagcta ctgtatcaag caagagtggg aaacaattgg ctagaatgtc agtgcctaaa   2280

ggtagcgcgc atgagaaaca gttaccaaaa actggaacta atcaaagttc aagcccagaa   2340

gcgatgtttg tattattagc aggtataggt ttaatcgcga ctgtacgacg tagaaaagct   2400

agctaa                                                              2406

<210>12

<211>801

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>12

Phe Ile Asn Asn Leu His Lys Ile Asn His Phe Asn Ile Arg Ile Met

1                 5                         10                     15

Ile Ile Tyr Trp Cys Met Thr Val Asn Gly Gly Asn Glu Met Lys Ala

                20                      25                    30

Leu Leu Leu Lys Thr Ser Val Trp Leu Val Leu Leu Phe Ser Val Met

         35                      40                      45

Gly Leu Trp Gln Val Ser Asn Ala Ala Glu Gln His Thr Pro Met Lys

     50                     55                      60

Ala His Ala Val Thr Thr Ile Asp Lys Ala Thr Thr Asp Lys Gln Gln

65                       70                      75                    80

Val Pro Pro Thr Lys Glu Ala Ala His His Ser Gly Lys Glu Ala Ala

                    85                      90                    95

Thr Asn Val Ser Ala Ser Ala Gln Gly Thr Ala Asp Asp Thr Asn Ser

              100                     105                    110

Lys Val Thr Ser Asn Ala Pro Ser Asn Lys Pro Ser Thr Val Val Ser

         115                      120                     125

Thr Lys Val Asn Glu Thr Arg Asp Val Asp Thr Gln Gln Ala Ser Thr

     130                    135                     140

Gln Lys Pro Thr His Thr Ala Thr Phe Lys Leu Ser Asn Ala Lys Thr

145                     150                     155                   160

Ala Ser Leu Ser Pro Arg Met Phe Ala Ala Asn Ala Pro Gln Thr Thr

                    165                   170                     175

Thr His Lys Ile Leu His Thr Asn Asp Ile His Gly Arg Leu Ala Glu

                180                     185                   190

Glu Lys Gly Arg Val Ile Gly Met Ala Lys Leu Lys Thr Val Lys Glu

         195                      200                     205

Gln Glu Lys Pro Asp Leu Met Leu Asp Ala Gly Asp Ala Phe Gln Gly

    210                     215                    220

Leu Pro Leu Ser Asn Gln Ser Lys Gly Glu Glu Met Ala Lys Ala Met

225                    230                    235                     240

Asn Ala Val Gly Tyr Asp Ala Met Ala Val Gly Asn His Glu Phe Asp

                   245                    250                     255

Phe Gly Tyr Asp Gln Leu Lys Lys Leu Glu Gly Met Leu Asp Phe Pro

              260                    265                    270

Met Leu Ser Thr Asn Val Tyr Lys Asp Gly Lys Arg Ala Phe Lys Pro

         275                     280                     285

Ser Thr Ile Val Thr Lys Asn Gly Ile Arg Tyr Gly Ile Ile Gly Val

     290                     295                        300

Thr Thr Pro Glu Thr Lys Thr Lys Thr Arg Pro Glu Gly Ile Lys Gly

305                     310                     315                   320

Val Glu Phe Arg Asp Pro Leu Gln Ser Val Thr Ala Glu Met Met Arg

                  325                     330                     335

Ile Tyr Lys Asp Val Asp Thr Phe Val Val Ile Ser His Leu Gly Ile

               340                      345                    350

Asp Pro Ser Thr Gln Glu Thr Trp Arg Gly Asp Tyr Leu Val Lys Gln

         355                     360                     365

Leu Ser Gln Asn Pro Gln Leu Lys Lys Arg Ile Thr Val Ile Asp Gly

     370                    375                      380

His Ser His Thr Val Leu Gln Asn Gly Gln Ile Tyr Asn Asn Asp Ala

385                     390                     395                   400

Leu Ala Gln Thr Gly Thr Ala Leu Ala Asn Ile Gly Lys Ile Thr Phe

                  405                      410                    415

Asn Tyr Arg Asn Gly Glu Val Ser Asn Ile Lys Pro Ser Leu Ile Asn

             420                      425                      430

Val Lys Asp Val Glu Asn Val Thr Pro Asn Lys Ala Leu Ala Glu Gln

         435                     440                     445

Ile Asn Gln Ala Asp Gln Thr Phe Arg Ala Gln Thr Ala Glu Val Ile

     450                    455                     460

Ile Pro Asn Asn Thr Ile Asp Phe Lys Gly Glu Arg Asp Asp Val Arg

465                      470                   475                   480

Thr Arg Glu Thr Asn Leu Gly Asn Ala Ile Ala Asp Ala Met Glu Ala

                  485                     490                    495

Tyr Gly Val Lys Asn Phe Ser Lys Lys Thr Asp Phe Ala Val Thr Asn

              500                     505                     510

Gly Gly Gly Ile Arg Ala Ser Ile Ala Lys Gly Lys Val Thr Arg Tyr

         515                       520                     525

Asp Leu Ile Ser Val Leu Pro Phe Gly Asn Thr Ile Ala Gln Ile Asp

    530                      535                     540

Val Lys Gly Ser Asp Val Trp Thr Ala Phe Glu His Ser Leu Gly Ala

545                     550                     555                   560

Pro Thr Thr Gln Lys Asp Gly Lys Thr Val Leu Thr Ala Asn Gly Gly

                   565                    570                     575

Leu Leu His Ile Ser Asp Ser Ile Arg Val Tyr Tyr Asp Ile Asn Lys

               580                      585                    590

Pro Ser Gly Lys Arg Ile Asn Ala Ile Gln Ile Leu Asn Lys Glu Thr

         595                       600                     605

Gly Lys Phe Glu Asn Ile Asp Leu Lys Arg Val Tyr His Val Thr Met

    610                     615                     620

Asn Asp Phe Thr Ala Ser Gly Gly Asp Gly Tyr Ser Met Phe Gly Gly

625                    630                     635                    640

Pro Arg Glu Glu Gly Ile Ser Leu Asp Gln Val Leu Ala Ser Tyr Leu

                   645                     650                   655

Lys Thr Ala Asn Leu Ala Lys Tyr Asp Thr Thr Glu Pro Gln Arg Met

              660                     665                    670

Leu Leu Gly Lys Pro Ala Val Ser Glu Gln Pro Ala Lys Gly Gln Gln

         675                     680                     685

Gly Ser Lys Gly Ser Lys Ser Gly Lys Asp Thr Gln Pro Ile Gly Asp

     690                     695                     700

Asp Lys Val Met Asp Pro Ala Lys Lys Pro Ala Pro Gly Lys Val Val

705                     710                    715                    720

Leu Leu Leu Ala His Arg Gly Thr Val Ser Ser Gly Thr Glu Gly Ser

                   725                     730                     735

Gly Arg Thr Ile Glu Gly Ala Thr Val Ser Ser Lys Ser Gly Lys Gln

               740                     745                     750

Leu Ala Arg Met Ser Val Pro Lys Gly Ser Ala His Glu Lys Gln Leu

         755                     760                     765

Pro Lys Thr Gly Thr Asn Gln Ser Ser Ser Pro Glu Ala Met Phe Val

     770                    775                     780

Leu Leu Ala Gly Ile Gly Leu Ile Ala Thr Val Arg Arg Arg Lys Ala

785                     790                  795                      800

Ser

<210>13

<211>4914

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>13

agtggaaaat atggaaaaag gagtatgcaa atgagagata agaaaggacc ggtaaataaa     60

agagtagatt ttctatcaaa taaattgaat aaatattcaa taagaaaatt tacagttgga    120

acagcatcta ttttaattgg ctcactaatg tatttgggaa ctcaacaaga ggcagaagca    180

gctgaaaaca atattgagaa tccaactaca ttaaaagata atgtccaatc aaaagaagtg    240

aagattgaag aagtaacaaa caaagacact gcaccacagg gtgtagaagc taaatctgaa    300

gtaacttcaa acaaagacac aatcgaacat gaaccatcag taaaagctga agatatatca    360

aaaaaggagg atacaccaaa agaagtagct gatgttgctg aagttcagcc gaaatcgtca    420

gtcactcata acgcagagac acctaaggtt agaaaagctc gttctgttga tgaaggctct    480

tttgatatta caagagattc taaaaatgta gttgaatcta ccccaattac aattcaaggt    540

aaagaacatt ttgaaggtta cggaagtgtt gatatacaaa aaaaaccaac agatttaggg    600

gtatcagagg taaccaggtt taatgttggt aatgaaagta atggtttgat aggagcttta    660

caattaaaaa ataaaataga ttttagtaag gatttcaatt ttaaagttag agtggcaaat    720

aaccatcaat caaataccac aggtgctgat ggttgggggt tcttatttag taaaggaaat    780

gcagaagaat atttaactaa tggtggaatc cttggggata aaggtctggt aaattcaggc    840

ggatttaaaa ttgatactgg atacatttat acaagttcca tggacaaaac tgaaaagcaa    900

gctggacaag gttatagagg atacggagct tttgtgtaaa atgacagttc tggtaattca    960

caaatggttg gagaaaatat tgataaatca aaaactaatt ttttaaacta tgcggacaat   1020

tcaactaata catcagatgg aaagtttcat gggcaacgtt taaatgatgt catcttaact   1080

tatgttgctt caactggtaa aatgagagca gaatatgctg gtaaaacttg ggagacttca   1140

ataacagatt taggtttatc taaaaatcag gcatataatt tcttaattac atctagtcaa   1200

agatggggcc ttaatcaagg gataaatgca aatggctgga tgagaactga cttgaaaggt   1260

tcagagttta cttttacacc agaagcgcca aaaacaataa cagaattaga aaaaaaagtt   1320

gaagagattc cattcaagaa agaacgtaaa tttaatccgg atttagcacc agggacagaa   1380

aaagtaacaa gagaaggaca aaaaggtgag aagacaataa cgacaccaac actaaaaaat   1440

ccattaactg gagtaattat tagtaaaggt gaaccaaaag aagagattac aaaagatccg   1500

attaatgaat taacagaata cggacctgaa acaatagcgc caggtcatcg agacgaattt   1560

gatccgaagt taccaacagg agagaaagag gaagttccag gtaaaccagg aattaagaat   1620

ccagaaacag gagacgtagt tagaccgccg gtcgatagcg taacaaaata tggacctgta   1680

aaaggagact cgattgtaga aaaagaagag attccattcg agaaagaacg taaatttaat   1740

cctgatttag caccagggac agaaaaagta acaagagaag gacaaaaagg tgagaagaca   1800

ataacgacgc caacactaaa aaatccatta actggagaaa ttattagtaa aggtgaatcg   1860

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acaccaggtc atcgagacga atttgatccg aagttaccaa caggagagaa agaggaagtt   1980

ccaggtaaac caggaattaa gaatccagaa acaggagatg tagttagacc accggtcgat   2040

agcgtaacaa aatatggacc tgtaaaagga gactcgattg tagaaaaaga agagattcca   2100

ttcgagaaag aacgtaaatt taatcctgat ttagcaccag ggacagaaaa agtaacaaga   2160

gaaggacaaa aaggtgagaa gacaataacg acaccaacac taaaaaatcc attaactgga   2220

gtaattatta gtaaaggtga accaaaagaa gaaatcacaa aagatccgat taatgaatta   2280

acagaatacg gaccagaaac gataacacca ggtcatcgag acgaatttga tccgaagtta   2340

ccaacaggag agaaagaaga agttccaggt aaaccaggaa ttaagaatcc agaaacagga   2400

gacgtagtta gaccaccggt cgatagcgta acaaaatatg gacctgtaaa aggagactcg   2460

attgtagaaa aagaagagat tccattcaag aaagaacgta aatttaatcc ggatttagca   2520

ccagggacag aaaaagtaac aagagaagga caaaaaggtg agaagacaat aacgacgcca   2580

acactaaaaa atccattaac tggagaaatt attagtaaag gtgaatcgaa agaagaaatc   2640

acaaaagatc cgattaatga attaacagaa tacggaccag aaacgataac accaggtcat   2700

cgagacgaat ttgatccgaa gttaccaaca ggagagaaag aggaagttcc aggtaaacca   2760

ggaattaaga atccagaaac aggagatgta gttagaccac cggtcgatag cgtaacaaaa   2820

tatggacctg taaaaggaga ctcgattgta gaaaaagaag agattccatt cgagaaagaa   2880

cgtaaattta atcctgattt agcaccaggg acagaaaaag taacaagaga aggacaaaaa   2940

ggtgagaaga caataacgac gccaacacta aaaaatccat taactggaga aattattagt   3000

aaaggtgaat cgaaagaaga aatcacaaaa gatccgatta atgaattaac agaatacgga   3060

ccagaaacga taacaccagg tcatcgagac gaatttgatc cgaagttacc aacaggagag   3120

aaagaggaag ttccaggtaa accaggaatt aagaatccag aaacaggaga cgtagttaga   3180

ccaccggtcg atagcgtaac aaaatatgga cctgtaaaag gagactcgat tgtagaaaaa   3240

gaagaaattc cattcaagaa agaacgtaaa tttaatcctg atttagcacc agggacagaa   3300

aaagtaacaa gagaaggaca aaaaggtgag aagacaataa cgacgccaac actaaaaaat   3360

ccattaactg gagaaattat tagtaaaggt gaatcgaaag aagaaatcac aaaagatccg   3420

attaatgaat taacagaata cggaccagaa acgataacac caggtcatcg agacgaattt   3480

gatccgaagt taccaacagg agagaaagag gaagttccag gtaaaccagg aattaagaat   3540

ccagaaacag gagatgtagt tagaccaccg gtcgatagcg taacaaaata tggacctgta   3600

aaaggagact cgattgtaga aaaagaagaa attccattcg agaaagaacg taaatttaat   3660

cctgatttag caccagggac agaaaaagta acaagagaag gacaaaaagg tgagaagaca   3720

ataacgacgc caacactaaa aaatccatta actggagaaa ttattagtaa aggtgaatcg   3780

aaagaagaaa tcacaaaaga tccgattaat gaattaacag aatacggacc agaaacgata   3840

acaccaggtc atcgagacga atttgatccg aagttaccaa caggagagaa agaggaagtt   3900

ccaggtaaac caggaattaa gaatccagaa acaggagatg tagttagacc accggtcgat   3960

agcgtaacaa aatatggacc tgtaaaagga gactcgattg tagaaaaaga agaaattcca   4020

ttcgagaaag aacgtaaatt taatcctgat ttagcaccag ggacagaaaa agtaacaaga   4080

gaaggacaaa aaggtgagaa gacaataacg acgccaacac taaaaaatcc attaactgga   4140

gaaattatta gtaaaggtga atcgaaagaa gaaatcacaa aagatccagt taatgaatta   4200

acagaattcg gtggcgagaa aataccgcaa ggtcataaag atatctttga tccaaactta   4260

ccaacagatc aaacggaaaa agtaccaggt aaaccaggaa tcaagaatcc agacacagga   4320

aaagtgatcg aagagccagt ggatgatgtg attaaacacg gaccaaaaac gggtacacca   4380

gaaacaaaaa cagtagagat accgtttgaa acaaaacgtg agtttaatcc aaaattacaa   4440

cctggtgaag agcgagtgaa acaagaagga caaccaggaa gtaagacaat cacaacacca   4500

atcacagtga acccattaac aggtgaaaaa gttggcgagg gtcaaccaac agaagagatc   4560

acaaaacaac cagtagataa gattgtagag ttcggtggag agaaaccaaa agatccaaaa   4620

ggacctgaaa acccagagaa gccgagcaga ccaactcatc caagtggccc agtaaatcct   4680

aacaatccag gattatcgaa agacagagca aaaccaaatg gcccagttca ttcaatggat   4740

aaaaatgata aagttaaaaa atctaaaatt gctaaagaat cagtagctaa tcaagagaaa   4800

aaacgagcag aattaccaaa aacaggttta gaaagcacgc aaaaaggttt gatctttagt   4860

agtataattg gaattgctgg attaatgtta ttggctcgta gaagaaagaa ttaa         4914

<210>14

<211>1637

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>14

Ser Gly Lys Tyr Gly Lys Arg Ser Met Gln Met Arg Asp Lys Lys Gly

1                  5                      10                     15

Pro Val Asn Lys Arg Val Asp Phe Leu Ser Asn Lys Leu Asn Lys Tyr

              20                      25                     30

Ser Ile Arg Lys Phe Thr Val Gly Thr Ala Ser Ile Leu Ile Gly Ser

          35                      40                        45

Leu Met Tyr Leu Gly Thr Gln Gln Glu Ala Glu Ala Ala Glu Asn Asn

    50                      55                     60

Ile Glu Asn Pro Thr Thr Leu Lys Asp Asn Val Gln Ser Lys Glu Val

65                      70                      75                     80

Lys Ile Glu Glu Val Thr Asn Lys Asp Thr Ala Pro Gln Gly Val Glu

                    85                      90                     95

Ala Lys Ser Glu Val Thr Ser Asn Lys Asp Thr Ile Glu His Glu Pro

              100                     105                     110

Ser Val Lys Ala Glu Asp Ile Ser Lys Lys Glu Asp Thr Pro Lys Glu

          115                     120                     125

Val Ala Asp Val Ala Glu Val Gln Pro Lys Ser Ser Val Thr His Asn

     130                     135                     140

Ala Glu Thr Pro Lys Val Arg Lys Ala Arg Ser Val Asp Glu Gly Ser

145                     150                     155                   160

Phe Asp Ile Thr Arg Asp Ser Lys Asn Val Val Glu Ser Thr Pro Ile

                    165                     170                    175

Thr Ile Gln Gly Lys Glu His Phe Glu Gly Tyr Gly Ser Val Asp Ile

               180                    185                      190

Gln Lys Lys Pro Thr Asp Leu Gly Val Ser Glu Val Thr Arg Phe Asn

         195                     200                     205

Val Gly Asn Glu Ser Asn Gly Leu Ile Gly Ala Leu Gln Leu Lys Asn

     210                    215                     220

Lys Ile Asp Phe Ser Lys Asp Phe Asn Phe Lys Val Arg Val Ala Asn

225                     230                    235                    240

Asn His Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly Trp Gly Phe Leu Phe

                  245                     250                    255

Ser Lys Gly Asn Ala Glu Glu Tyr Leu Thr Asn Gly Gly Ile Leu Gly

              260                    265                     270

Asp Lys Gly Leu Val Asn Ser Gly Gly Phe Lys Ile Asp Thr Gly Tyr

         275                     280                     285

Ile Tyr Thr Ser Ser Met Asp Lys Thr Glu Lys Gln Ala Gly Gln Gly

     290                     295                     300

Tyr Arg Gly Tyr Gly Ala Phe Val Lys Asn Asp Ser Ser Gly Asn Ser

305                     310                     315                   320

Gln Met Val Gly Glu Asn Ile Asp Lys Ser Lys Thr Asn Phe Leu Asn

                  325                      330                    335

Tyr Ala Asp Asn Ser Thr Asn Thr Ser Asp Gly Lys Phe His Gly Gln

              340                     345                    350

Arg Leu Asn Asp Val Ile Leu Thr Tyr Val Ala Ser Thr Gly Lys Met

         355                     360                     365

Arg Ala Glu Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Glu Thr Ser Ile Thr Asp Leu

     370                     375                     380

Gly Leu Ser Lys Asn Gln Ala Tyr Asn Phe Leu Ile Thr Ser Ser Gln

385                    390                      395                   400

Arg Trp Gly Leu Asn Gln Gly Ile Asn Ala Asn Gly Trp Met Arg Thr

                  405                     410                    415

Asp Leu Lys Gly Ser Glu Phe Thr Phe Thr Pro Glu Ala Pro Lys Thr

             420                     425                     430

Ile Thr Glu Leu Glu Lys Lys Val Glu Glu Ile Pro Phe Lys Lys Glu

          435                     440                     445

Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

     450                   455                     460

Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

465                    470                      475                   480

Pro Leu Thr Gly Val Ile Ile Ser Lys Gly Glu Pro Lys Glu Glu Ile

                    485                      490                    495

Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

             500                      505                     510

Ala Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

         515                     520                    525

Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

     530                     535                     540

Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

545                     550                     555                   560

Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

                    565                      570                  575

Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

             580                     585                     590

Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

         595                     600                     605

Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

     610                      615                     620

Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

625                     630                     635                   640

Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

                   645                    650                     655

Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

              660                      665                    670

Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

         675                     680                      685

Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

     690                     695                     700

Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

705                    710                     715                    720

Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

                  725                      730                    735

Pro Leu Thr Gly Val Ile Ile Ser Lys Gly Glu Pro Lys Glu Glu Ile

              740                      745                     750

Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

         755                     760                     765

Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

     770                    775                     780

Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

785                     790                     795                   800

Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

                   805                      810                   815

Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Lys Lys Glu

              820                     825                      830

Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

         835                    840                     845

Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

    850                     855                      860

Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

865                     870                      875                  880

Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile

                    885                    890                    895

Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu

              900                    905                     910

Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly

         915                     920                     925

Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val

    930                      935                     940

Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu

945                      950                     955                  960

Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg

                  965                    970                      975

Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

             980                      985                    990

Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile

         995                     1000                   1005

Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr

     1010                  1015                  1020

Ile Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr

     1025                  1030                  1035

Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro

     1040                  1045                  1050

Glu Thr Gly Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys

     1055                  1060                  1065

Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile

     1070                  1075                  1080

Pro Phe Lys Lys Glu Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly

     1085                  1090                  1095

Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile

     1100                  1105                  1110

Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser

     1115                  1120                  1125

Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu

     1130                  1135                  1140

Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu Thr Ile Thr Pro Gly His Arg Asp

    1145                  1150                   1155

Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro Thr Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro

    1160                  1165                   1170

Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Glu Thr Gly Asp Val Val Arg

    1175                  1180                   1185

Pro Pro Val Asp Ser Val Thr Lys Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp

    1190                  1195                   1200

Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu Ile Pro Phe Glu Lys Glu Arg Lys

    1205                  1210                   1215

Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu

    1220                  1225                   1230

Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn

    1235                  1240                   1245

Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu

    1250                  1255                   1260

Ile Thr Lys Asp Pro Ile Asn Glu Leu Thr Glu Tyr Gly Pro Glu

    1265                  1270                   1275

Thr Ile Thr Pro Gly His Arg Asp Glu Phe Asp Pro Lys Leu Pro

    1280                  1285                   1290

Thr Gly Glu Lys Glu Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn

    1295                  1300                   1305

Pro Glu Thr Gly Asp Val Val Arg Pro Pro Val Asp Ser Val Thr

    1310                  1315                   1320

Lys Tyr Gly Pro Val Lys Gly Asp Ser Ile Val Glu Lys Glu Glu

    1325                  1330                   1335

Ile Pro Phe Glu Lys Glu Arg Lys Phe Asn Pro Asp Leu Ala Pro

    1340                  1345                   1350

Gly Thr Glu Lys Val Thr Arg Glu Gly Gln Lys Gly Glu Lys Thr

     1355                  1360                  1365

Ile Thr Thr Pro Thr Leu Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Ile Ile

     1370                  1375                  1380

Ser Lys Gly Glu Ser Lys Glu Glu Ile Thr Lys Asp Pro Val Asn

     1385                  1390                  1395

Glu Leu Thr Glu Phe Gly Gly Glu Lys Ile Pro Gln Gly His Lys

     1400                  1405                  1410

Asp Ile Phe Asp Pro Asn Leu Pro Thr Asp Gln Thr Glu Lys Val

     1415                  1420                  1425

Pro Gly Lys Pro Gly Ile Lys Asn Pro Asp Thr Gly Lys Val Ile

     1430                  1435                  1440

Glu Glu Pro Val Asp Asp Val Ile Lys His Gly Pro Lys Thr Gly

     1445                  1450                  1455

Thr Pro Glu Thr Lys Thr Val Glu Ile Pro Phe Glu Thr Lys Arg

     1460                  1465                  1470

Glu Phe Asn Pro Lys Leu Gln Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys Gln

     1475                  1480                  1485

Glu Gly Gln Pro Gly Ser Lys Thr Ile Thr Thr Pro Ile Thr Val

     1490                  1495                  1500

Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Gln Pro Thr Glu

     1505                  1510                  1515

Glu Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Lys Ile Val Glu Phe Gly Gly

     1520                  1525                  1530

Glu Lys Pro Lys Asp Pro Lys Gly Pro Glu Asn Pro Glu Lys Pro

     1535                  1540                  1545

Ser Arg Pro Thr His Pro Ser Gly Pro Val Asn Pro Asn Asn Pro

     1550                  1555                  1560

Gly Leu Ser Lys Asp Arg Ala Lys Pro Asn Gly Pro Val His Ser

    1565                  1570                   1575

Met Asp Lys Asn Asp Lys Val Lys Lys Ser Lys Ile Ala Lys Glu

    1580                  1585                   1590

Ser Val Ala Asn Gln Glu Lys Lys Arg Ala Glu Leu Pro Lys Thr

    1595                  1600                   1605

Gly Leu Glu Ser Thr Gln Lys Gly Leu Ile Phe Ser Ser Ile Ile

    1610                  1615                   1620

Gly Ile Ala Gly Leu Met Leu Leu Ala Arg Arg Arg Lys Asn

    1625                  1630                   1635

<210>15

<211>1923

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>15

ggaaggagta tgttgatggc taaatatcga gggaaaccgt ttcaattata tgtaaagtta     60

tcgtgttcga caatgatggc gacaagtatc attttaacga atatcttgcc gtacgatgcc    120

caagctgcat ctgaaaagga tactgaaatt acaaaagaga tattatctaa gcaagattta    180

ttagacaaag ttgacaaggc aattcgtcaa attgagcaat taaaacagtt atcggcttca    240

tctaaagaac attataaagc acaactaaat gaagcgaaaa cagcatcgca aatagatgaa    300

atcataaaac gagctaatga gttggatagc aaagacaata aaagttctca cactgaaatg    360

aacggtcaaa gtgatataga cagtaaatta gatcaattgc ttaaagattt aaatgaggtt    420

tcttcaaatg ttgatagggg tcaacaaagt ggcgaggacg atcttaatgc aatgaaaaat    480

gatatgtcac aaacggctac aacaaaacat ggagaaaaag atgataaaaa tgatgaagca    540

atggtaaata aggcgttaga agacctagac catttgaatc agcaaataca caaatcgaaa    600

gatgcatcga aagatacatc ggaagatcca gcagtgtcta caacagataa taatcatgaa    660

gtagctaaaa cgccaaataa tgatggttct ggacatgttg tgttaaataa attcctttca    720

aatgaagaga atcaaagcca tagtaatcga ctcactgata aattacaagg aagcgataaa    780

attaatcatg ctatgattga aaaattagct aaaagtaatg cctcaacgca acattacaca    840

tatcataaac tgaatacgtt acaatcttta gatcaacgta ttgcaaatac gcaacttcct    900

aaaaatcaaa aatcagactt aatgagcgaa gtaaataaga cgaaagagcg tataaaaagt    960

caacgaaata ttattttgga agaacttgca cgtactgatg ataaaaagta tgctacacaa   1020

agcattttag aaagtatatt taataaagac gaggcagtta aaattctaaa agatatacgt   1080

gttgatggta aaacagatca acaaattgca gatcaaatta ctcgtcatat tgatcaatta   1140

tctctgacaa cgagtgatga tttattaacg tcattgattg atcaatcaca agataagtcg   1200

ctattgattt ctcaaatttt acaaacgaaa ttaggaaaag ctgaagcaga taaattggct   1260

aaagattgga cgaataaagg attatcaaat cgccaaatcg ttgaccaatt gaagaaacat   1320

tttgcatcaa ctggcgacac gtcttcagat gatatattaa aagcaatttt gaataatgcc   1380

aaagataaaa aacaagcaat tgaaacgatt ttagcaacac gtatagaaag acaaaaggca   1440

aaattactgg cagatttaat tactaaaata gaaacagatc aaaataaaat ttttaattta   1500

gttaaatcgg cattgaatgg taaagcggat gatttattga atttacaaaa gagactcaat   1560

caaacgaaaa aagatataga ttatatttta tcaccaatag taaatcgtcc aagtttacta   1620

gatcgattga ataaaaatgg gaaaacgaca gatttaaata agttagcaaa tttaatgaat   1680

caaggatcag atttattaga cagtattcca gatataccca caccaaagcc agaaaagacg   1740

ttaacacttg gtaaaggtaa tggattgtta agtggattat taaatgctga tggtaatgta   1800

tctttgccta aagcggggga aacgataaaa gaacattggt tgccgatatc tgtaattgtt   1860

ggtgcaatgg gtgtactaat gatttggtta tcacgacgca ataagttgaa aaataaagca   1920

taa                                                                 1923

<210>16

<211>640

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>16

Gly Arg Ser Met Leu Met Ala Lys Tyr Arg Gly Lys Pro Phe Gln Leu

1                 5                       10                      15

Tyr Val Lys Leu Ser Cys Ser Thr Met Met Ala Thr Ser Ile Ile Leu

               20                    25                        30

Thr Asn Ile Leu Pro Tyr Asp Ala Gln Ala Ala Ser Glu Lys Asp Thr

          35                     40                      45

Glu Ile Thr Lys Glu Ile Leu Ser Lys Gln Asp Leu Leu Asp Lys Val

     50                       55                     60

Asp Lys Ala Ile Arg Gln Ile Glu Gln Leu Lys Gln Leu Ser Ala Ser

65                      70                      75                     80

Ser Lys Glu His Tyr Lys Ala Gln Leu Asn Glu Ala Lys Thr Ala Ser

                    85                    90                      95

Gln Ile Asp Glu Ile Ile Lys Arg Ala Asn Glu Leu Asp Ser Lys Asp

              100                       105                    110

Asn Lys Ser Ser His Thr Glu Met Asn Gly Gln Ser Asp Ile Asp Ser

         115                     120                     125

Lys Leu Asp Gln Leu Leu Lys Asp Leu Asn Glu Val Ser Ser Asn Val

     130                    135                    140

Asp Arg Gly Gln Gln Ser Gly Glu Asp Asp Leu Asn Ala Met Lys Asn

145                    150                   155                      160

Asp Met Ser Gln Thr Ala Thr Thr Lys His Gly Glu Lys Asp Asp Lys

                  165                     170                    175

Asn Asp Glu Ala Met Val Asn Lys Ala Leu Glu Asp Leu Asp His Leu

             180                     185                    190

Asn Gln Gln Ile His Lys Ser Lys Asp Ala Ser Lys Asp Thr Ser Glu

         195                     200                     205

Asp Pro Ala Val Ser Thr Thr Asp Asn Asn His Glu Val Ala Lys Thr

     210                     215                    220

Pro Asn Asn Asp Gly Ser Gly His Val Val Leu Asn Lys Phe Leu Ser

225                    230                     235                    240

Asn Glu Glu Asn Gln Ser His Ser Asn Arg Leu Thr Asp Lys Leu Gln

                 245                     250                     255

Gly Ser Asp Lys Ile Asn His Ala Met Ile Glu Lys Leu Ala Lys Ser

             260                       265                    270

Asn Ala Ser Thr Gln His Tyr Thr Tyr His Lys Leu Asn Thr Leu Gln

         275                     280                     285

Ser Leu Asp Gln Arg Ile Ala Asn Thr Gln Leu Pro Lys Asn Gln Lys

     290                    295                     300

Ser Asp Leu Met Ser Glu Val Asn Lys Thr Lys Glu Arg Ile Lys Ser

305                    310                    315                     320

Gln Arg Asn Ile Ile Leu Glu Glu Leu Ala Arg Thr Asp Asp Lys Lys

                    325                     330                   335

Tyr Ala Thr Gln Ser Ile Leu Glu Ser Ile Phe Asn Lys Asp Glu Ala

              340                       345                    350

Val Lys Ile Leu Lys Asp Ile Arg Val Asp Gly Lys Thr Asp Gln Gln

           355                     360                    365

Ile Ala Asp Gln Ile Thr Arg His Ile Asp Gln Leu Ser Leu Thr Thr

     370                     375                      380

Ser Asp Asp Leu Leu Thr Ser Leu Ile Asp Gln Ser Gln Asp Lys Ser

385                    390                      395                   400

Leu Leu Ile Ser Gln Ile Leu Gln Thr Lys Leu Gly Lys Ala Glu Ala

                    405                    410                   415

Asp Lys Leu Ala Lys Asp Trp Thr Asn Lys Gly Leu Ser Asn Arg Gln

              420                     425                    430

Ile Val Asp Gln Leu Lys Lys His Phe Ala Ser Thr Gly Asp Thr Ser

          435                     440                     445

Ser Asp Asp Ile Leu Lys Ala Ile Leu Asn Asn Ala Lys Asp Lys Lys

     450                     455                     460

Gln Ala Ile Glu Thr Ile Leu Ala Thr Arg Ile Glu Arg Gln Lys Ala

465                     470                     475                 480

Lys Leu Leu Ala Asp Leu Ile Thr Lys Ile Glu Thr Asp Gln Asn Lys

                  485                       490                  495

Ile Phe Asn Leu Val Lys Ser Ala Leu Asn Gly Lys Ala Asp Asp Leu

              500                     505                    510

Leu Asn Leu Gln Lys Arg Leu Asn Gln Thr Lys Lys Asp Ile Asp Tyr

         515                    520                     525

Ile Leu Ser Pro Ile Val Asn Arg Pro Ser Leu Leu Asp Arg Leu Asn

     530                      535                     540

Lys Asn Gly Lys Thr Thr Asp Leu Asn Lys Leu Ala Asn Leu Met Asn

545                     550                   555                     560

Gln Gly Ser Asp Leu Leu Asp Ser Ile Pro Asp Ile Pro Thr Pro Lys

                  565                     570                     575

Pro Glu Lys Thr Leu Thr Leu Gly Lys Gly Asn Gly Leu Leu Ser Gly

              580                     585                    590

Leu Leu Asn Ala Asp Gly Asn Val Ser Leu Pro Lys Ala Gly Glu Thr

         595                    600                     605

Ile Lys Glu His Trp Leu Pro Ile Ser Val Ile Val Gly Ala Met Gly

     610                      615                       620

Val Leu Met Ile Trp Leu Ser Arg Arg Asn Lys Leu Lys Asn Lys Ala

625                     630                     635                   640

<210>17

<211>522

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>17

Ala Ser Glu Thr Pro Ile Thr Ser Glu Ile Ser Ser Asn Ser Glu Thr

1                  5                     10                       15

Val Ala Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Lys Asn Ser Gln Lys Glu Thr

              20                      25                      30

Val Asn Ser Thr Ser Leu Glu Ser Asn His Ser Asn Ser Thr Asn Lys

          35                      40                     45

Gln Met Ser Ser Glu Val Thr Asn Thr Ala Gln Ser Ser Glu Lys Ala

     50                      55                      60

Gly Ile Ser Gln Gln Ser Ser Glu Thr Ser Asn Gln Ser Ser Lys Leu

65                       70                      75                    80

Asn Thr Tyr Ala Ser Thr Asp His Val Glu Ser Thr Thr Ile Asn Asn

                  85                      90                      95

Asp Asn Thr Ala Gln Gln Asp Gln Asn Lys Ser Ser Asn Val Thr Ser

             100                    105                      110

Lys Ser Thr Gln Ser Asn Thr Ser Ser Ser Glu Lys Asn Ile Ser Ser

         115                     120                      125

Asn Leu Thr Gln Ser Ile Glu Thr Lys Ala Thr Asp Ser Leu Ala Thr

    130                      135                     140

Ser Glu Ala Arg Thr Ser Thr Asn Gln Ile Ser Asn Leu Thr Ser Thr

145                     150                     155                   160

Ser Thr Ser Asn Gln Ser Ser Pro Thr Ser Phe Ala Asn Leu Arg Thr

                  165                       170                  175

Phe Ser Arg Phe Thr Val Leu Asn Thr Met Ala Ala Pro Thr Thr Thr

              180                    185                     190

Ser Thr Thr Thr Thr Ser Ser Leu Thr Ser Asn Ser Val Val Val Asn

         195                      200                     205

Lys Asp Asn Phe Asn Glu His Met Asn Leu Ser Gly Ser Ala Thr Tyr

     210                    215                    220

Asp Pro Lys Thr Gly Ile Ala Thr Leu Thr Pro Asp Ala Tyr Ser Gln

225                     230                     235                   240

Lys Gly Ala Ile Ser Leu Asn Thr Arg Leu Asp Ser Asn Arg Ser Phe

                    245                    250                   255

Arg Phe Ile Gly Lys Val Asn Leu Gly Asn Arg Tyr Glu Gly Tyr Ser

              260                     265                   270

Pro Asp Gly Val Ala Gly Gly Asp Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro

         275                     280                     285

Gly Pro Leu Gly Gln Ile Gly Lys Glu Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly

     290                     295                     300

Gly Leu Asn Asn Ala Phe Gly Phe Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr

305                    310                     315                     320

Ser Thr Pro Arg Ser Asp Ala Lys Ala Lys Ala Asp Pro Arg Asn Val

                   325                     330                   335

Gly Gly Gly Gly Ala Phe Gly Ala Phe Val Ser Thr Asp Arg Asn Gly

              340                     345                    350

Met Ala Thr Thr Glu Glu Ser Thr Ala Ala Lys Leu Asn Val Gln Pro

         355                     360                     365

Thr Asp Asn Ser Phe Gln Asp Phe Val Ile Asp Tyr Asn Gly Asp Thr

    370                     375                     380

Lys Val Met Thr Val Thr Tyr Ala Gly Gln Thr Phe Thr Arg Asn Leu

385                     390                     395                   400

Thr Asp Trp Ile Lys Asn Ser Gly Gly Thr Thr Phe Ser Leu Ser Met

                    405                     410                   415

Thr Ala Ser Thr Gly Gly Ala Lys Asn Leu Gln Gln Val Gln Phe Gly

               420                    425                    430

Thr Phe Glu Tyr Thr Glu Ser Ala Val Ala Lys Val Arg Tyr Val Asp

         435                     440                      445

Ala Asn Thr Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Ile Ala Gly Glu

     450                      455                      460

Val Asp Gly Thr Val Asn Ile Asp Lys Gln Leu Asn Asn Phe Lys Asn

465                     470                     475                   480

Leu Gly Tyr Ser Tyr Val Gly Thr Asp Ala Leu Lys Ala Pro Asn Tyr

                    485                    490                    495

Thr Glu Thr Ser Gly Thr Pro Thr Leu Lys Leu Thr Asn Ser Ser Gln

              500                     505                     510

Thr Val Ile Tyr Lys Phe Lys Asp Val Gln

          515                     520

<210>18

<211>485

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>18

Ala Ser Asp Ala Pro Leu Thr Ser Glu Leu Asn Thr Gln Ser Glu Thr

1                  5                      10                      15

Val Gly Asn Gln Asn Ser Thr Thr Ile Glu Ala Ser Thr Ser Thr Ala

              20                      25                       30

Asp Ser Thr Ser Val Thr Lys Asn Ser Ser Ser Val Gln Thr Ser Asn

         35                      40                       45

Ser Asp Thr Val Ser Ser Glu Lys Ser Glu Lys Val Thr Ser Thr Thr

     50                      55                      60

Asn Ser Thr Ser Asn Gln Gln Glu Lys Leu Thr Ser Thr Ser Glu Ser

65                  70                        75                  80

Thr Ser Ser Lys Asn Thr Thr Ser Ser Ser Asp Thr Lys Ser Val Ala

                   85                      90                   95

Ser Thr Ser Ser Thr Glu Gln Pro Ile Asn Thr Ser Thr Asn Gln Ser

               100                     105                    110

Thr Ala Ser Asn Asn Thr Ser Gln Ser Thr Thr Pro Ser Ser Val Asn

         115                     120                     125

Leu Asn Lys Thr Ser Thr Thr Ser Thr Ser Thr Ala Pro Val Lys Leu

     130                     135                     140

Arg Thr Phe Ser Arg Leu Ala Met Ser Thr Phe Ala Ser Ala Ala Thr

145                    150                     155                    160

Thr Thr Ala Val Thr Ala Asn Thr Ile Thr Val Asn Lys Asp Asn Leu

                    165                     170                   175

Lys Gln Tyr Met Thr Thr Ser Gly Asn Ala Thr Tyr Asp Gln Ser Thr

              180                     185                    190

Gly Ile Val Thr Leu Thr Gln Asp Ala Tyr Ser Gln Lys Gly Ala Ile

          195                     200                     205

Thr Leu Gly Thr Arg Ile Asp Ser Asn Lys Ser Phe His Phe Ser Gly

    210                      215                     220

Lys Val Asn Leu Gly Asn Lys Tyr Glu Gly His Gly Asn Gly Gly Asp

225                    230                     235                    240

Gly Ile Gly Phe Ala Phe Ser Pro Gly Val Leu Gly Glu Thr Gly Leu

                    245                     250                  255

Asn Gly Ala Ala Val Gly Ile Gly Gly Leu Ser Asn Ala Phe Gly Phe

              260                     265                    270

Lys Leu Asp Thr Tyr His Asn Thr Ser Lys Pro Asn Ser Ala Ala Lys

         275                     280                     285

Ala Asn Ala Asp Pro Ser Asn Val Ala Gly Gly Gly Ala Phe Gly Ala

     290                    295                     300

Phe Val Thr Thr Asp Ser Tyr Gly Val Ala Thr Thr Tyr Thr Ser Ser

305                     310                     315                   320

Ser Thr Ala Asp Asn Ala Ala Lys Leu Asn Val Gln Pro Thr Asn Asn

                   325                    330                     335

Thr Phe Gln Asp Phe Asp Ile Asn Tyr Asn Gly Asp Thr Lys Val Met

              340                    345                     350

Thr Val Lys Tyr Ala Gly Gln Thr Trp Thr Arg Asn Ile Ser Asp Trp

          355                    360                     365

Ile Ala Lys Ser Gly Thr Thr Asn Phe Ser Leu Ser Met Thr Ala Ser

     370                    375                     380

Thr Gly Gly Ala Thr Asn Leu Gln Gln Val Gln Phe Gly Thr Phe Glu

385                    390                     395                    400

Tyr Thr Glu Ser Ala Val Thr Gln Val Arg Tyr Val Asp Val Thr Thr

                    405                     410                   415

Gly Lys Asp Ile Ile Pro Pro Lys Thr Tyr Ser Gly Asn Val Asp Gln

                420                     425                    430

Val Val Thr Ile Asp Asn Gln Gln Ser Ala Leu Thr Ala Lys Gly Tyr

           435                     440                    445

Asn Tyr Thr Ser Val Asp Ser Ser Tyr Ala Ser Thr Tyr Asn Asp Thr

    450                      455                     460

Asn Lys Thr Val Lys Met Thr Asn Ala Gly Gln Ser Val Thr Tyr Tyr

465                     470                    475                    480

Phe Thr Asp Val Val

                  485

<210>19

<211>1245

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>19

Met Gly Lys Arg Arg Gln Gly Pro Ile Asn Lys Lys Val Asp Phe Leu

1                 5                       10                      15

Pro Asn Lys Leu Asn Lys Tyr Ser Ile Arg Lys Phe Thr Val Gly Thr

              20                      25                      30

Ala Ser Ile Leu Leu Gly Ser Thr Leu Ile Phe Gly Ser Ser Ser His

          35                      40                       45

Glu Ala Lys Ala Ala Glu Glu Lys Gln Val Asp Pro Ile Thr Gln Ala

     50                      55                      60

Asn Gln Asn Asp Ser Ser Glu Arg Ser Leu Glu Asn Thr Asn Gln Pro

65                    70                      75                   80

Thr Val Asn Asn Glu Ala Pro Gln Met Ser Ser Thr Leu Gln Ala Glu

                  85                      90                      95

Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

              100                     105                     110

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

         115                     120                     125

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

    130                     135                     140

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

145                    150                     155                    160

Glu Gly Ser Asn Val Lys Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

                   165                     170                    175

Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

              180                     185                     190

Glu Gly Ser Asn Ala Lys Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

         195                     200                     205

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

     210                    215                     220

Glu Gly Ser Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu

225                     230                     235                   240

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu

                  245                     250                    255

Glu Gly Gly Asn Ala Glu Ala Pro Asn Val Pro Thr Ile Lys Ala Asn

             260                     265                      270

Ser Asp Asn Asp Thr Gln Thr Gln Phe Ser Glu Ala Pro Thr Arg Asn

         275                    280                     285

Asp Leu Ala Arg Lys Glu Asp Ile Pro Ala Val Ser Lys Asn Glu Glu

    290                     295                      300

Leu Gln Ser Ser Gln Pro Asn Thr Asp Ser Lys Ile Glu Pro Thr Thr

305                     310                     315                   320

Ser Glu Pro Val Asn Leu Asn Tyr Ser Ser Pro Phe Met Ser Leu Leu

                   325                     330                     335

Ser Met Pro Ala Asp Ser Ser Ser Asn Asn Thr Lys Asn Thr Ile Asp

              340                     345                     350

Ile Pro Pro Thr Thr Val Lys Gly Arg Asp Asn Tyr Asp Phe Tyr Gly

          355                     360                     365

Arg Val Asp Ile Glu Ser Asn Pro Thr Asp Leu Asn Ala Thr Asn Leu

    370                      375                    380

Thr Arg Tyr Asn Tyr Gly Gln Pro Pro Gly Thr Thr Thr Ala Gly Ala

385                     390                     395                   400

Val Gln Phe Lys Asn Gln Val Ser Phe Asp Lys Asp Phe Asp Phe Asn

                  405                     410                    415

Ile Arg Val Ala Asn Asn Arg Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly

                420                   425                    430

Trp Gly Phe Met Phe Ser Lys Lys Asp Gly Asp Asp Phe Leu Lys Asn

         435                     440                   445

Gly Gly Ile Leu Arg Glu Lys Gly Thr Pro Ser Ala Ala Gly Phe Arg

     450                     455                     460

Ile Asp Thr Gly Tyr Tyr Asn Asn Asp Pro Leu Asp Lys Ile Gln Lys

465                      470                   475                    480

Gln Ala Gly Gln Gly Tyr Arg Gly Tyr Gly Thr Phe Val Lys Asn Asp

                  485                     490                    495

Ser Gln Gly Asn Thr Ser Lys Val Gly Ser Gly Thr Pro Ser Thr Asp

              500                     505                     510

Phe Leu Asn Tyr Ala Asp Asn Thr Thr Asn Asp Leu Asp Gly Lys Phe

         515                    520                   525

His Gly Gln Lys Leu Asn Asn Val Asn Leu Lys Tyr Asn Ala Ser Asn

    530                     535                     540

Gln Thr Phe Thr Ala Thr Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Thr Ala Thr Leu

545                     550                     555                   560

Ser Glu Leu Gly Leu Ser Pro Thr Asp Ser Tyr Asn Phe Leu Val Thr

                   565                     570                    575

Ser Ser Gln Tyr Gly Asn Gly Asn Ser Gly Thr Tyr Ala Ser Gly Val

              580                     585                     590

Met Arg Ala Asp Leu Asp Gly Ala Thr Leu Thr Tyr Thr Pro Lys Ala

         595                    600                     605

Val Asp Gly Asp Pro Ile Ile Ser Thr Lys Glu Ile Pro Phe Asn Lys

     610                      615                      620

Lys Arg Glu Phe Asp Pro Asn Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val Val

625                    630                    635                   640

Gln Lys Gly Glu Pro Gly Ile Glu Thr Thr Thr Thr Pro Thr Tyr Val

                  645                     650                    655

Asn Pro Asn Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

             660                     665                     670

Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val His Tyr Gly Gly Glu Glu

          675                     680                     685

Ile Lys Pro Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Lys Gly

     690                     695                     700

Ser Gln Thr Thr Gln Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Asp Thr

705                     710                     715                   720

Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

                   725                     730                    735

Val Asp Gly Asp Pro Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

              740                      745                    750

Lys Arg Glu Phe Asn Pro Asp Leu Lys Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys

         755                     760                   765

Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Thr Lys

    770                     775                      780

Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

785                    790                    795                     800

Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Thr Glu Tyr Gly Gly Glu Glu

                    805                     810                  815

Ile Lys Pro Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Lys Gly

               820                    825                    830

Ser Gln Glu Asp Val Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Gly Thr

         835                     840                     845

Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

     850                     855                     860

Val Asp Gly Asp Pro Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

865                     870                     875                   880

Lys Arg Glu Phe Asn Pro Asp Leu Lys Pro Gly Glu Glu Arg Val Lys

                  885                    890                     895

Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr Thr Lys

              900                     905                     910

Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Glu Pro Thr Glu Lys

         915                     920                    925

Ile Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val His Tyr Gly Gly Glu Gln

     930                     935                      940

Ile Pro Gln Gly His Lys Asp Glu Phe Asp Pro Asn Ala Pro Val Asp

945                      950                   955                 960

Ser Lys Thr Glu Val Pro Gly Lys Pro Gly Val Lys Asn Pro Asp Thr

                    965                     970                 975

Gly Glu Val Val Thr Pro Pro Val Asp Asp Val Thr Lys Tyr Gly Pro

              980                     985                     990

Val Asp Gly Asp Ser Ile Thr Ser Thr Glu Glu Ile Pro Phe Asp Lys

         995                    1000                    1005

Lys Arg Glu Phe Asp Pro Asn Leu Ala Pro Gly Thr Glu Lys Val

     1010                 1015                  1020

Val Gln Lys Gly Glu Pro Gly Thr Lys Thr Ile Thr Thr Pro Thr

     1025                 1030                  1035

Thr Lys Asn Pro Leu Thr Gly Glu Lys Val Gly Glu Gly Lys Ser

     1040                 1045                  1050

Thr Glu Lys Val Thr Lys Gln Pro Val Asp Glu Ile Val Glu Tyr

     1055                 1060                  1065

Gly Pro Thr Lys Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Lys

     1070                 1075                  1080

Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu

     1085                 1090                  1095

Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Lys

     1100                 1105                  1110

Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu

     1115                 1120                  1125

Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Thr

     1130                 1135                  1140

Pro Ala Glu Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu

     1145                  1150                 1155

Pro Gly Lys Pro Ala Glu Pro Gly Thr Pro Ala Glu Pro Gly Lys

     1160                  1165                 1170

Pro Ala Glu Ser Gly Lys Pro Val Glu Pro Gly Thr Pro Ala Gln

     1175                  1180                 1185

Ser Gly Ala Pro Glu Gln Pro Asn Arg Ser Met His Ser Thr Asp

     1190                 1195                  1200

Asn Lys Asn Gln Leu Pro Asp Thr Gly Glu Asn Arg Gln Ala Asn

     1205                 1210                  1215

Glu Gly Thr Leu Val Gly Ser Leu Leu Ala Ile Val Gly Ser Leu

    1220                  1225                  1230

Phe Ile Phe Gly Arg Arg Lys Lys Gly Asn Glu Lys

    1235                  1240                  1245

<210>20

<211>3765

<212>DNA

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>20

atgggcaaac gtagacaagg tcctattaat aaaaaagtgg attttttacc taacaaatta     60

aacaagtatt ctataagaaa attcactgtt ggtacggcct caatattact tggttcgaca    120

cttatttttg gaagtagtag ccatgaagcg aaagctgcag aagaaaaaca agttgatcca    180

attacacaag ctaatcaaaa tgatagtagt gaaagatcac ttgaaaacac aaatcaacct    240

actgtaaaca atgaagcacc acagatgtct tctacattgc aagcagaaga aggaagcaat    300

gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag gcagaagaag gaggcaatgc agaagcagct    360

caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag aagcacctca atctgagcca    420

acgaaggcag aagaaggagg caatgcagaa gcagctcaat ctgagccaac gaagacagaa    480

gaaggaagca acgtaaaagc agctcaatct gagccaacga aggcagaaga aggaagcaat    540

gcagaagcac ctcaatctga gccaacgaag acagaagaag gaagcaacgc aaaagcagct    600

caatctgagc caacgaaggc agaagaagga ggcaatgcag aagcagctca atctgagcca    660

acgaagacag aagaaggaag caatgcagaa gcacctcaat ctgagccaac gaaggcagaa    720

gaaggaggca atgcagaagc acctcaatct gagccaacga agacagaaga aggaggcaat    780

gcagaagcac cgaatgttcc aactatcaaa gctaattcag ataatgatac acaaacacaa    840

ttttcagaag cccctacaag aaatgaccta gctagaaaag aagatatccc tgctgtttct    900

aaaaacgagg aattacaatc atcacaacca aacactgaca gtaaaataga acctacaact    960

tcagaacctg tgaatttaaa ttatagttct ccgtttatgt ccttattaag catgcctgct   1020

gatagttcat ccaataacac taaaaataca atagatatac cgccaactac ggttaaaggt   1080

agagataatt acgattttta cggtagagta gatatcgaaa gtaatcctac agatttaaat   1140

gcgacaaatt taacgagata taattatgga cagccacctg gtacaacaac agctggtgca   1200

gttcaattta aaaatcaagt tagttttgat aaagatttcg actttaacat tagagtagca   1260

aacaatcgtc aaagtaatac aactggtgca gatggttggg gctttatgtt cagcaagaaa   1320

gatggggatg atttcctaaa aaacggtggt atcttacgtg aaaaaggtac acctagtgca   1380

gctggtttca gaattgatac aggatattat aataacgatc cattagataa aatacagaaa   1440

caagctggtc aaggctatag agggtatggg acatttgtta aaaatgactc ccaaggtaat   1500

acttctaaag taggatcagg tactccatca acagattttc ttaactacgc agataatact   1560

actaatgatt tagatggtaa attccatggt caaaaattaa ataatgttaa tttgaaatat   1620

aatgcttcaa atcaaacttt tacagctact tatgctggta aaacttggac ggctacgtta   1680

tctgaattag gattgagtcc aactgatagt tacaattttt tagttacatc aagtcaatat   1740

ggaaatggta atagtggtac atacgcaagt ggcgttatga gagctgattt agatggtgca   1800

acattgacat acactcctaa agcagtcgat ggagatccaa ttatatcaac taaggaaata   1860

ccatttaata agaaacgtga atttgatcca aacttagccc caggtacaga aaaagtagtc   1920

caaaaaggtg aaccaggaat tgaaacaaca acaacaccaa cttatgtcaa tcctaataca   1980

ggagaaaaag ttggcgaagg tgaaccaaca gaaaaaataa caaaacaacc agtggatgaa   2040

atcgttcatt atggtggcga agaaatcaag ccaggccata aggatgaatt tgatccaaat   2100

gcaccgaaag gtagtcaaac aacgcaacca ggtaagccgg gggttaaaaa tcctgataca   2160

ggcgaagtag ttactccacc tgtggatgat gtgacaaaat atggtccagt tgatggagat   2220

ccgatcacgt caacggaaga aattccattc gacaagaaac gtgaattcaa tcctgattta   2280

aaaccaggtg aagagcgtgt taaacaaaaa ggtgaaccag gaacaaaaac aattacaaca   2340

ccaacaacta agaacccatt aacaggggaa aaagttggcg aaggtgaacc aacagaaaaa   2400

ataacaaaac aaccagtaga tgaaatcaca gaatatggtg gcgaagaaat caagccaggc   2460

cataaggatg aatttgatcc aaatgcaccg aaaggtagcc aagaggacgt tccaggtaaa   2520

ccaggagtta aaaaccctgg aacaggcgaa gtagtcacac caccagtgga tgatgtgaca   2580

aaatatggtc cagttgatgg agatccgatc acgtcaacgg aagaaattcc attcgacaag   2640

aaacgtgaat tcaatcctga tttaaaacca ggtgaagagc gcgttaaaca gaaaggtgaa   2700

ccaggaacaa aaacaattac aacgccaaca actaagaacc cattaacagg agaaaaagtt   2760

ggcgaaggtg aaccaacaga aaaaataaca aaacaaccag tggatgagat tgttcattat   2820

ggtggtgaac aaataccaca aggtcataaa gatgaatttg atccaaatgc acctgtagat   2880

agtaaaactg aagttccagg taaaccagga gttaaaaatc ctgatacagg tgaagttgtt   2940

accccaccag tggatgatgt gacaaaatat ggtccagttg atggagattc gattacgtca   3000

acggaagaaa ttccgtttga taaaaaacgc gaatttgatc caaacttagc gccaggtaca   3060

gagaaagtcg ttcaaaaagg tgaaccagga acaaaaacaa ttacaacgcc aacaactaag   3120

aacccattaa caggagaaaa agttggcgaa ggtaaatcaa cagaaaaagt cactaaacaa   3180

cctgttgacg aaattgttga gtatggtcca acaaaagcag aaccaggtaa accagcggaa   3240

ccaggtaaac cagcggaacc aggtaaacca gcggaaccag gtacgccagc agaaccaggt   3300

aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac cagcggaacc aggtaaacca   3360

gcggaaccag gtaaaccagc ggaaccaggt aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa   3420

ccaggtacgc cagcagaacc aggtaaacca gcggaaccag gtacgccagc agaaccaggt   3480

aaaccagcgg aaccaggtac gccagcagaa ccaggtaaac cagcggaatc aggtaaacca   3540

gtggaaccag gtacgccagc acaatcaggt gcaccagaac aaccaaatag atcaatgcat   3600

tcaacagata ataaaaatca attacctgat acaggtgaaa atcgtcaagc taatgaggga   3660

actttagtcg gatctctatt agcaattgtc ggatcattgt tcatatttgg tcgtcgtaaa   3720

aaaggtaatg aaaaataatt tcatataaaa actttctgcc attaa                   3765

<210>21

<211>546

<212>PRT

<213>Staphylococcus epidermidis

<400>21

Glu Lys Gln Val Asp Pro Ile Thr Gln Ala Asn Gln Asn Asp Ser Ser

1                  5                       10                      15

Glu Arg Ser Leu Glu Asn Thr Asn Gln Pro Thr Val Asn Asn Glu Ala

              20                     25                     30

Pro Gln Met Ser Ser Thr Leu Gln Ala Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

         35                      40                     45

Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

     50                      55                     60

Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

65                      70                     75                      80

Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

                   85                      90                      95

Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Val Lys

              100                     105                    110

Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

         115                     120                     125

Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Ala Lys

     130                     135                    140

Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

145                     150                     155                    160

Ala Ala Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Ser Asn Ala Glu

                    165                    170                     175

Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Ala Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

              180                     185                    190

Ala Pro Gln Ser Glu Pro Thr Lys Thr Glu Glu Gly Gly Asn Ala Glu

         195                     200                    205

Ala Pro Asn Val Pro Thr Ile Lys Ala Asn Ser Asp Asn Asp Thr Gln

     210                     215                     220

Thr Gln Phe Ser Glu Ala Pro Thr Arg Asn Asp Leu Ala Arg Lys Glu

225                     230                   235                      240

Asp Ile Pro Ala Val Ser Lys Asn Glu Glu Leu Gln Ser Ser Gln Pro

                    245                    250                     255

Asn Thr Asp Ser Lys Ile Glu Pro Thr Thr Ser Glu Pro Val Asn Leu

              260                      265                    270

Asn Tyr Ser Ser Pro Phe Met Ser Leu Leu Ser Met Pro Ala Asp Ser

         275                     280                     285

Ser Ser Asn Asn Thr Lys Asn Thr Ile Asp Ile Pro Pro Thr Thr Val

     290                    295                      300

Lys Gly Arg Asp Asn Tyr Asp Phe Tyr Gly Arg Val Asp Ile Glu Ser

305                    310                    315                      320

Asn Pro Thr Asp Leu Asn Ala Thr Asn Leu Thr Arg Tyr Asn Tyr Gly

                  325                    330                       335

Gln Pro Pro Gly Thr Thr Thr Ala Gly Ala Val Gln Phe Lys Asn Gln

              340                     345                    350

Val Ser Phe Asp Lys Asp Phe Asp Phe Asn Ile Arg Val Ala Asn Asn

          355                    360                     365

Arg Gln Ser Asn Thr Thr Gly Ala Asp Gly Trp Gly Phe Met Phe Ser

    370                     375                    380

Lys Lys Asp Gly Asp Asp Phe Leu Lys Asn Gly Gly Ile Leu Arg Glu

385                    390                    395                  400

Lys Gly Thr Pro Ser Ala Ala Gly Phe Arg Ile Asp Thr Gly Tyr Tyr

                  405                       410                 415

Asn Asn Asp Pro Leu Asp Lys Ile Gln Lys Gln Ala Gly Gln Gly Tyr

             420                     425                     430

Arg Gly Tyr Gly Thr Phe Val Lys Asn Asp Ser Gln Gly Asn Thr Ser

         435                     440                    445

Lys Val Gly Ser Gly Thr Pro Ser Thr Asp Phe Leu Asn Tyr Ala Asp

     450                     455                     460

Asn Thr Thr Asn Asp Leu Asp Gly Lys Phe His Gly Gln Lys Leu Asn

465                   470                     475                      480

Asn Val Asn Leu Lys Tyr Asn Ala Ser Asn Gln Thr Phe Thr Ala Thr

                  485                     490                   495

Tyr Ala Gly Lys Thr Trp Thr Ala Thr Leu Ser Glu Leu Gly Leu Ser

              500                     505                    510

Pro Thr Asp Ser Tyr Asn Phe Leu Val Thr Ser Ser Gln Tyr Gly Asn

         515                     520                     525

Gly Asn Ser Gly Thr Tyr Ala Ser Gly Val Met Arg Ala Asp Leu Asp

     530                     535                     540

Gly Ala

545

<210>22

<211>36

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>22

Leu Pro Asn Thr Gly Ser Glu Glu Met Asp Leu Pro Leu Lys Glu Leu

1                 5                      10                      15

Ala Leu IIe Thr Gly Ala Ala Leu Leu Ala Arg Arg Arg Ser Lys Lys

              20                      25                      30

Glu Lys Glu Ser

         35

<210>23

<211>43

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>23

Leu Pro Asp Thr Gly Asp Ser Ile Lys Gln Asn Gly Leu Leu Gly Gly

1                 5                       10                      15

Val Met Thr Leu Leu Val Gly Leu Gly Leu Met Lys Arg Lys Lys Lys

             20                      25                      30

Lys Asp Glu Asn Asp Gln Asp Asp Ser Gln Ala

         35                     40

<210>24

<211>35

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>24

Leu Pro Lys Thr Gly Glu Thr Thr Ser Ser Gln Ser Trp Trp Gly Leu

1                  5                      10                     15

Tyr Ala Leu Leu Gly Met Leu Ala Leu Phe Ile Pro Lys Phe Arg Lys

              20                     25                      30

Glu Ser Lys

         35

<210>25

<211>38

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>25

Leu Pro Lys Thr Gly Leu Thr Ser Val Asp Asn Phe Ile Ser Thr Val

1                  5                      10                      15

Ala Phe Ala Thr Leu Ala Leu Leu Gly Ser Leu Ser Leu Leu Leu Phe

              20                     25                      30

Lys Arg Lys Glu Ser Lys

         35

<210>26

<211>36

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>26

Leu Pro Gln Thr Gly Glu Glu Ser Asn Lys Asp Met Thr Leu Pro Leu

1                 5                       10                     15

Met Ala Leu Ile Ala Leu Ser Ser Ile Val Ala Phe Val Leu Pro Arg

              20                        25                    30

Lys Arg Lys Asn

         35

<210>27

<211>34

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>27

Leu Pro Lys Thr Gly Thr Asn Gln Ser Ser Ser Pro Glu Ala Met Phe

1                  5                      10                     15

Val Leu Leu Ala Gly Ile Gly Leu Ile Ala Thr Val Arg Arg Arg Lys

              20                       25                     30

Ala Ser

<210>28

<211>33

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>28

Leu Pro Lys Thr Gly Leu Glu Ser Thr Gln Lys Gly Leu Ile Phe Ser

1                  5                      10                      15

Ser Ile Ile Gly Ile Ala Gly Leu Met Leu Leu Ala Arg Arg Arg Lys

                20                      25                     30

Asn

<210>29

<211>39

<212>PRT

<213>Staphylococcus aureus

<400>29

Leu Pro Lys Ala Gly Glu Thr Ile Lys Glu His Trp Leu Pro Ile Ser

1                  5                        10                       15

Val Ile Val Gly Ala Met Gly Val Leu Met Ile Trp Leu Ser Arg Arg

                20                     25                      30

Asn Lys Leu Lys Asn Lys Ala

         35

Claims (22)

1.一种分离的抗体，其与葡萄球菌的表面蛋白质结合，所述蛋白质选自于下列组：SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21。

2.根据权利要求1所述的抗体，其中抗体针对所述表面蛋白质的A区域。

3.根据权利要求1所述的抗体，其中抗体用于治疗或预防人类或动物的金黄色葡萄球菌感染。

4.根据权利要求1所述的抗体，其中抗体适用于人类或动物的非肠道的，口部的，鼻内的，皮下的，aerosolized或静脉内的给药。

5.根据权利要求1所述的抗体，其中所述的抗体是单克隆抗体。

6.根据权利要求1所述的抗体，其中所述的抗体是多克隆抗体。

7.根据权利要求5所述的抗体，其中单克隆抗体是一种选自于下列组的类型：鼠的，嵌合的，人性化的，和人的单克隆抗体。

8.根据权利要求5所述的抗体，其中抗体是一种单链单克隆抗体。

9.根据权利要求1所述的抗体，它包括具有类似于一种抗体的结合特异性的抗体片段，所述的抗体结合到具有选自于下列组：SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21的序列的葡萄球菌的表面蛋白质。

10.根据权利要求1所述的抗体，它针对具有选自于下列组：SEQID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21的氨基酸序列的蛋白质。

11.根据权利要求1所述的抗体，其中所述的表面蛋白质具有由选自于下列组的核酸序列SEQ ID NOS.1、3、5、7、9、11、13、15、20和编码Aap蛋白质的A区域或其简并序列的核酸序列编码的一个氨基酸序列的核酸序列。

12.含有权利要求1的抗体的分离的抗血清。

13.一种诊断试剂盒，包括权利要求1的抗体和用于检测该抗体引起的结合的工具。

14.根据权利要求13所述的诊断试剂盒，其中所述的用于检测结合的工具包括连接到所述的抗体的一种可检测标记物。

15.一种用于诊断金黄色葡萄球菌感染的方法，包括将权利要求1的抗体加入到被怀疑感染了金黄色葡萄球菌的样品中，测定抗体是否已经结合到该样品。

16.一种用于治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的药物组合物，包括有效量的权利要求1的抗体和药学的可接受的介质，载体或赋形剂。

17.一种治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的方法，包括将有效量的权利要求1的抗体给人或动物患者给药。

18.一种诱导免疫应答的方法，包括以致免疫量的选自于下列组：SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21的氨基酸序列的分离的蛋白质给人类或动物给药。

19.根据权利要求1所述的分离的抗体，它具有结合到由SEQ IDNOS.1、3、5、7、9、11、13、15、20的核酸序列和编码Aap蛋白质的A区域的核酸序列或其简并序列编码的氨基酸序列的能力。

20.一种来自DsqA蛋白质的A区域的分离的活性片段。

21.根据权利要求1所述的分离的抗体，进一步包括生理学上的可接受的抗生素。

22.一种用于治疗或预防金黄色葡萄球菌感染的疫苗，包括选自于下列组SEQ ID NOS.2、4、6、8、10、12、14、16、17、18、19和21的蛋白质序列，和一种药学的可接受的介质，载体或赋形剂，所述的蛋白质的量可有效地激发免疫应答。

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