CN117897489A - 控制nadh:醌氧化还原酶表达的重组微生物,以及通过使用重组微生物生产o-磷酸丝氨酸、半胱氨酸及其衍生物的方法 - Google Patents

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Abstract

本申请涉及控制NADH:醌氧化还原酶表达的重组微生物,以及通过使用重组微生物生产O‑磷酸丝氨酸、半胱氨酸及半胱氨酸衍生物的方法。

Description

控制NADH:醌氧化还原酶表达的重组微生物,以及通过使用重 组微生物生产O-磷酸丝氨酸、半胱氨酸及其衍生物的方法
技术领域
本申请涉及调控NADH:醌氧化还原酶表达的重组微生物,以及使用重组微生物生产O-磷酸丝氨酸、半胱氨酸及半胱氨酸衍生物的方法。
背景技术
L-半胱氨酸为在所有活有机体中在硫代谢中具有重要作用的氨基酸。它用在合成诸如头发角蛋白等的蛋白质、谷胱甘肽、生物素、甲硫氨酸及其他含硫代谢物,并且也作为辅酶A生物合成的前体。使用微生物生产L-半胱氨酸的已知方法包括:1)使用微生物生物转化D,L-2-氨基噻唑啉-4-羧酸为L-半胱氨酸的方法,2)使用大肠杆菌(E.coli)通过直接发酵生产L-半胱氨酸的方法(EP 0885962 B;Wada,M.and Takagi,H.,Appl.Microbiol.Biochem.,73:48-54,2006),以及3)使用微生物通过发酵生产O-磷酸丝氨酸,以及在O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶的催化作用下,通过O-磷酸丝氨酸与硫化物反应将O-磷酸丝氨酸转化为L-半胱氨酸的方法(US2012-0190081 A1)。
特别地,对通过方法3)以高产率生产半胱氨酸,应以过量生产前体O-磷酸丝氨酸。
发明内容
【技术问题】
本申请的技术问题为提供调控NADH:醌氧化还原酶表达的重组微生物,以及使用重组微生物生产O-磷酸丝氨酸、半胱氨酸及半胱氨酸衍生物的方法。
【技术方案】
本申请的一个目的是提供具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性和O-磷酸丝氨酸生产能力的埃希氏菌属(Escherichia)的重组微生物。
本申请的另一目的是提供生产O-磷酸丝氨酸的方法,其包括:在培养基中培养本申请的生产O-磷酸丝氨酸的微生物。
本申请的又一目的是提供生产半胱氨酸或其衍生物的方法,其包括:
a)在培养基中培养具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产O-磷酸丝氨酸的微生物以生产O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基;以及
b)在O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶(O-phosphoserine sulfhydrylase)(OPSS)或表达O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶的微生物的存在下,使步骤a)中生产的O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基与硫化物反应。
【有利效果】
本申请的具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产OPS的微生物能够以高效率生产OPS。
具体实施方式
以下将详细描述本申请。同时,本文公开的每个描述及实施方式可以应用在每个其他描述及实施方式。换言之,本文公开的各种要素的所有组合均落入本申请的范围内。进一步地,本申请的范围不受以下描述的具体说明的限制。此外,本说明书全文中引用了许多论文及专利文件。所引用的论文及专利文献的内容通过引用以其整体并入本文,并且本申请所属技术领域的水平以及本申请的内容将被更清楚地描述。
本申请的一个方面提供具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产O-磷酸丝氨酸的微生物。
如本文所用,术语“O-磷酸丝氨酸”(下称“OPS”)是指丝氨酸的磷酸酯,其作为许多蛋白质的构成成分。特别地,OPS是L-半胱氨酸的前体并且可通过在OPS硫化氢解酶(下称“OPSS”)的催化作用下与硫化物反应转化为半胱氨酸,但不限于此(US 2012-0190081A1)。
如本文所用,术语“NADH:醌氧化还原酶”(下称“Nuo”)是指通过在微生物的电子传输链中氧化NADH以还原细胞膜中的醌的酶。酶蛋白质也可命名为NADH脱氢酶-1(NDH-1)。编码该蛋白质的基因可以是例如,nuoABCEFGHIJKLMN基因簇,但不限于此。nuoABCEFGHIJKLMN基因簇构成nuo操纵子,并且其表达可由操纵子前面的启动子和核糖体结合位点中的多核苷酸来调控。本申请中,“nuoABCEFGHIJKLMN基因”可与“编码NADH:醌氧化还原酶的基因”、“nuoABCEFGHIJKLMN基因”、“nuo操纵子”和“nuo基因”互换使用。
本申请中,“操纵子”是指DNA的功能单元,该功能单元包括其表达受到一个表达调控序列,特别是一个启动子调控的一组基因。由该操纵子转录的mRNA可为多顺反子mRNA,其中单一mRNA分子编码一个或多个蛋白质,或可为单顺反子mRNA,其中单一mRNA分子编码一个蛋白质。
Nuo是13个亚基蛋白(NuoA、NuoB、NuoC、NuoE、NuoF、NuoG、NuoH、Nuol、NuoJ、NuoK、NuoL、NuoM、NuoN)的复合体。两类操纵子,nuoABCEFGHIJKL和nuoMN,在每种亚基蛋白的翻译中用作模板。nuo操纵子的结构可在EcoCyc(www.biocyc.org)(登陆号EG12082)中找到。已知nuo操纵子包括结构基因及表达调控区。nuo操纵子的“表达调控区”是指存在于构成nuo操纵子的结构基因的上游并且因而可调控该结构基因表达的区域。nuo操纵子的表达调控区可包括启动子(nuoA启动子和/或nuoM启动子),其不包括结构基因和操纵子,并且可具体地包括启动子。
nuo操纵子可包括编码与SEQ ID NO:26至SEQ ID NO:38的氨基酸序列具有70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%或更多同源性或同一性的氨基酸序列的核苷酸序列。具体地,nuo操纵子可包括编码SEQ ID NO:26至38的氨基酸序列或与其同源或同一的氨基酸序列并且表现相应功能的结构基因;以及调控结构基因序列表达的表达调控区。SEQ ID NO:26至38的序列可在已知数据库NCBI Genbank中确认。
具体地,nuo操纵子可以是具有SEQ ID NO:1的核苷酸序列和/或对SEQ ID NO:1具有70%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%或更多同源性或同一性的核苷酸序列。此外,显然地,其中部分序列被缺失、修饰、取代或添加的任意核苷酸序列也可落入本申请的范围内,只要核苷酸序列具有该同源性或同一性并且表现与nuo操纵子的功能相对应的功能即可。
如本文所用,术语“同源性和同一性”是指两个给定的氨基酸序列或核苷酸序列之间的相关性程度,并且以百分比表示。术语同源性和同一性经常可彼此互换使用。
保守多核苷酸或多肽的序列同源性或同一性可通过标准的比对算法测定并且可与通过正在使用的软件所建立的默认间隙罚分一起使用。基本上,一般预期在中度或高度严格条件下,同源性或同一性序列与全长序列的全部或至少约50%、60%、70%、80%或90%杂交。还考虑在杂交多核苷酸中含有简并密码子代替密码子的多核苷酸。
确定多肽或多核苷酸序列的同源性或同一性可通过,例如根据文献的BLAST算法(参见Karlin和Altschul,Pro.Natl.Acad.Sci.USA,90,5873(1993))或Pearson的FASTA(参见Methods Enzymol.,183,63,1990)。已开发基于算法BLAST的称为BLASTN或BLASTX的软件(参见:http://www.ncbi.nlm.nih.gov)。进一步地,任何氨基酸或多核苷酸序列彼此是否具有同源性、相似性或单一性,其可通过在所限定的严格条件下的Southern杂交试验中比较序列,并且限定的合适的杂交条件在本领域的技术内,并且可通过本领域技术人员公知的方法来确定(例如,J.Sambrook等人Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2ndEdition,Cold Spring Harbor Laboratory press,Cold Spring Harbor,New York,1989;F.M.Ausubel等人,Current Protocols in Molecular Biology)。
只要本申请的微生物可生产OPS,本申请的微生物不受其类型限制,并且可为任何原核或真核微生物,具体地为原核微生物。原核微生物可包括属于埃希氏菌属、欧文氏菌(Erwinia)属、沙雷氏菌(Serratia)属、普罗维登斯菌(Providencia)属、棒状杆菌(Corynebacterium)属和短杆菌(Brevibacterium)属的微生物菌株,具体地为属于埃希氏菌属的微生物,并且更具体地为大肠杆菌(Escherichia coli),但不限于此。特别地,在属于埃希氏菌属的微生物的情况下,OPS和L-丝氨酸可通过为L-丝氨酸生物合成途径的酶的SerA、SerC和SerB生产(Ahmed Zahoor,Computational and structural biotechnologyjournal,Vol.3,2012October;Wendisch V.F.等人,Curr OpinMicrobiol.2006Jun;9(3):268-74;Peters-Wendisch P.等人,Appl Environ Microbiol.2005Nov;7 1(II):7 139-44)。
本申请的“生产O-磷酸丝氨酸的微生物”是指具有天然生产O-磷酸丝氨酸能力的微生物,或其中对不具有生产O-磷酸丝氨酸能力的亲本菌株赋予O-磷酸丝氨酸生产能力的微生物。具体地,微生物可为因天然或人工基因修饰而具有增强的Nuo活性的生产O-磷酸丝氨酸的微生物。为了本申请的目的,生产O-磷酸丝氨酸的微生物可以是通过本申请公开的方法增强Nuo活性的能够生产O-磷酸丝氨酸的微生物。本申请中,“生产O-磷酸丝氨酸的微生物”可与“O-磷酸丝氨酸生产微生物”或“具有O-磷酸丝氨酸生产能力的微生物”互换使用。
在一个实施方式中,本申请的生产O-磷酸丝氨酸的微生物可以是其中Nuo活性被增强的基因修饰微生物或重组微生物,从而增加期望的O-磷酸丝氨酸生产能力,但不限于此。
如本文所用,术语蛋白质的“活性的增强”是指与其内源活性相比蛋白质活性增加。“内源活性”是指当性状因天然或人工因素通过基因修饰而改变时,转化前的亲本菌株或未经修饰的微生物原始拥有的特定蛋白质活性,并且可与“修饰前活性”互换使用。与其内源活性相比蛋白质活性“增加”是指与转化前的亲本菌株或未经修饰的微生物原始拥有的特定蛋白质活性相比,蛋白质活性增强。例如,亲本菌株可为大肠杆菌ATCC27325。作为另一实例,亲本菌株可以是包括修饰以增加OPS生产能力的菌株,例如,CA07-0012(KCCM11212P;US2012-0190081 A)或CA07-4821,但不限于此。
“活性的增强”可通过引入外源蛋白质或通过增强内源蛋白质活性而实现,并且可具体地通过增强内源蛋白质活性而实现。蛋白质活性的增强可通过蛋白质活性水平、表达量水平或由蛋白质生产的产物量的增加来确认。
可通过本领域公知的多种方法应用活性的增强,方法不受限制,只要其与修饰前微生物的活性相比,方法可增强靶蛋白的活性即可。具体地,可使用本领域技术人员公知的基因工程和/或蛋白质工程,其为分子生物学常见方法,但方法不限于此(例如Sitnicka等人Functional Analysis of Genes.Advances in Cell Biology.2010,Vol.2.1-16,Sambrook等人Molecular Cloning 2012,等)。
本申请中,针对活性增强靶向的蛋白质,即靶蛋白,可以是Nuo,但不限于该蛋白质,只要其为“通过消耗NADH形成质子驱动力的蛋白质”或“消耗NADH的蛋白质”并且两种蛋白质都通过nuo操纵子编码。
本申请的Nuo活性的增强可包括构成Nuo蛋白质复合体的亚基蛋白质的一个或多个的活性增强。
具体地,本申请的蛋白质的活性增强可通过下述方式实现:
1)增加编码蛋白质的基因的细胞内拷贝数;
2)修饰染色体上的编码蛋白质的基因的表达调控区;
3)修饰编码蛋白质的基因转录物的起始密码子或5’-UTR的编码核苷酸序列;
4)修饰氨基酸序列使得蛋白质活性增强;
5)修饰编码蛋白质的多核苷酸序列使得蛋白质活性增强(例如,修饰编码蛋白质的基因序列以编码经修饰为增强活性的蛋白质);
6)引入表现蛋白质活性的外源多核苷酸或多核苷酸的密码子优化的变体多核苷酸;
7)编码蛋白质的多核苷酸的密码子优化;
8)分析蛋白质的三级结构并且从而选择和修饰暴露位点,或对其化学修饰;或
9)选自上述1)至8)的两种或更多种的组合,但不限于此。
具体地,增加编码蛋白质的基因的细胞内拷贝数的方法1)可通过本领域已知的任何方法实现,例如,通过引入载体至宿主细胞中,载体可操作地连接至编码蛋白质的基因并且能与宿主细胞无关地复制和发挥作用。此外,该方法可通过引入载体至宿主细胞中进行,载体可操作地连接至基因并且能将基因插入至宿主细胞的染色体中,但不限于此。
如本文所用,术语“载体”是指含有编码靶蛋白的多核苷酸序列的DNA构建体,该多核苷酸序列可操作地连接至适当的调控序列,从而能在适当的宿主细胞中表达靶蛋白。表达调控序列可包括能起始转录的启动子、用于调控转录的任何操纵子序列、编码适当的mRNA核糖体结合位点的序列以及用于调控转录和翻译终止的序列。转化进入适当的宿主细胞后,载体可独立于宿主基因组复制或发挥作用,或可整合至宿主的基因组中。
只要载体可复制,本申请中使用的载体无特别限制,并且可使用本领域已知的任何载体。一般使用载体的实例可包括天然或重组的质粒、黏粒、病毒和噬菌体。例如,作为噬菌体载体或黏粒载体,可使用pWE15、M13、MBL3、MBL4、IXII、ASHII、APII、t10、t11、Charon4A和Charon21A等;以及作为质粒载体,可使用基于pBR、pUC、pBluescriptII、pGEM、pTZ、pCL、pSK、pSKH和pET等的那些。具体地,可使用pCL、pSK、pSKH130、pDZ、pACYC177、pACYC184、pECCG117、pUC19、pBR322、pMW118、pCC1BAC载体等。
将多核苷酸插入至染色体中可通过本领域已知的任何方法进行,例如,同源重组,但不限于此。
如本文所用,术语“转化”是指将含有编码靶蛋白的多核苷酸的重组载体引入至宿主细胞中,从而由多核苷酸编码的蛋白质可在宿主细胞中表达。只要经转化的多核苷酸可在宿主细胞中表达,则经转化的多核苷酸整合至宿主细胞的染色体中并且位于染色体中还是染色体外并不重要,并且二种情况都包括在内。用于转化载体的方法包括将核酸引入细胞中的任何方法,并且可根据宿主细胞通过选择本领域已知的适当标准技术进行。例如,转化可经由电穿孔、磷酸钙(CaPO4)沉淀、氯化钙(CaCl2)沉淀、显微注射、聚乙二醇(PEG)技术、DEAE-葡聚糖技术、阳离子脂质体技术、乙酸锂-DMSO技术等进行,但方法不限于此。
进一步地,如本文所用,术语“可操作地连接”指多核苷酸序列功能性地连接至起始和介导本申请的编码靶蛋白的多核苷酸转录的启动子序列或表达调控区。可操作的连接可使用本领域已知的基因重组技术制备,以及位点特异性DNA裂解和连接可使用本领域已知的裂解和连接酶等制备,但不限于此。
修饰染色体上编码蛋白质的基因的表达调控序列的方法2)可通过本领域已知的任何方法实现,例如,通过核酸序列的缺失、插入、非保守或保守取代或其组合,诱导序列上的修饰,以进一步增强表达调控序列的活性,或通过以具有更强活性的核酸序列置换序列或插入序列。表达调控序列可包括但不特别限于启动子、操纵子序列、编码核糖体结合位点的序列以及调控转录和翻译的终止的序列等。方法可具体地包括在原始启动子下游插入强异源性启动子,但不限于此。
已知的强启动子的实例可包括CJ1至CJ7启动子(US 7662943 B2)、lac启动子、trp启动子、trc启动子、tac启动子、λ噬菌体PR启动子、PL启动子、tet启动子和rmf启动子等,但不限于此,并且可包括用与其内源性活性相比更强的启动子的所有取代。
修饰编码蛋白质的基因转录物的起始密码子或5’-UTR的核苷酸序列的方法3)可通过本领域已知的任何方法实现,例如,通过以与其内源性起始密码子相比具有更高的蛋白质表达率的另一起始密码子取代蛋白质的内源性起始密码子,但不限于此。
修饰氨基酸序列或多核苷酸序列的方法4)和5)可通过本领域已知的任何方法实现,例如,通过在多核苷酸序列的缺失、插入、非保守或保守取代或其组合,诱导序列上的修饰,以进一步增强多核苷酸序列的活性,或者通过用修饰成具有更强活性的多核苷酸序列置换该序列。置换可通过将基因经由同源重组插入至染色体中来具体进行,但不限于此。
本文使用的载体可进一步包括选择标记以确认插入至染色体中。选择标记是用于选择用载体转化的细胞,即,用于确认待引入的基因的插入,并且可使用提供可选择性表型如耐药性、营养缺陷型、对细胞毒性剂的耐受性或表面蛋白表达的标记,但选择标记不限于此。仅表达选择标记的细胞能在经选择剂处理的环境中存活或显示不同表型,并且因此转化的细胞可以被选择。
引入具有蛋白质活性的外源多核苷酸的方法6)可通过本领域已知的任何方法实现,例如,通过将编码与蛋白质表现出相同或相似活性的蛋白质的外源多核苷酸或其密码子优化的变体多核苷酸引入宿主细胞中。可以不受限制地使用外源多核苷酸,无论其来源或序列如何,只要其表现与蛋白质相同或相似活性。另外,引入的外源多核苷酸可通过优化其密码子而引入至宿主细胞中,从而在宿主细胞中实现优化的转录和翻译。可通过本领域技术人员合适地选择本领域已知的转化方法进行引入,以及宿主细胞中引入的多核苷酸的表达使该得能够生产蛋白质,从而增加其活性。
编码蛋白质的多核苷酸的密码子优化的方法7)可通过内源性多核苷酸的密码子优化以增加宿主细胞内的转录或翻译,或通过优化其密码子以使得外源多核苷酸的优化的转录和翻译可在宿主细胞内实现来实现。
分析蛋白质的三级结构并且从而选择和修饰暴露位点或对其化学修饰的方法8)可被实现,例如,通过比较待分析的多肽的序列信息与数据库(在该数据库中储存已知蛋白质的序列信息),以根据序列相似性程度确定候选模板蛋白质,并且因此基于该信息确认结构,以从而选择和转化或修饰待修饰或化学修饰的暴露位点。
在一个实施方式中,蛋白质活性的增强可通过上述1)至2)中的任何一种或多种实现。
在上述实施方式中的任何一个中,本申请的NADH:醌氧化还原酶活性的增强可以是nuo操纵子表达的增强。在上述实施方式中的任何一个中,NADH:醌氧化还原酶活性的增强可包括在编码其的基因的上游具有增强活性的基因表达调控序列。具体地,编码NADH:醌氧化还原酶的基因的上游可以是nuoA基因的上游。在一个实施方式中,通过修饰存在于编码Nuo蛋白质复合体的nuo操纵子中的一种表达调控序列,NADH:醌氧化还原酶活性的增强可以是存在于该操纵子中的一个或多个结构基因例如,2个或更多个、3个或更多个或全部结构基因序列表达的增强。具体地,表达调控序列的修饰可以是nuo操纵子的内源性启动子和nuoA基因之间另外插入具有增强活性的基因表达调控序列;例如,基因表达调控序列可以是启动子,但不限于此。
蛋白质活性的这种增强可意味相对于野生型或修饰前微生物中表达的蛋白质活性或浓度,蛋白质的活性或浓度增加,或由蛋白质生产的产品的量增加,但不限于此。
如本文所用,术语“修饰前菌株”或“修饰前微生物”不排除含有在微生物中可自然发生的突变的菌株,并且可意指其天然型菌株,或由自然或人工因素引起的基因修饰所造成的性状改变前的菌株。本申请中,性状的修饰可为Nuo活性的增强。“修饰前菌株”或“修饰前微生物”可与“非突变体菌株”、“非修饰菌株”、“非突变体微生物”、“非修饰微生物”或“参考微生物”互换使用。
本申请的微生物进一步增强生产OPS的能力和/或将OPS分泌至细胞外的能力;或可包括增强OPS分解的能力和/或流入能力的修饰。
增强生产OPS的能力和/或将OPS输出至细胞外的能力,或增强OPS分解和/或流入能力的修饰的实例可包括磷酸丝氨酸磷酸酶(SerB)的活性弱化、磷酸丝氨酸分泌蛋白质(YhhS)的活性增强或这些修饰的组合,但不限于此。
如本文所用,术语多肽的“减弱”是综合概念,其包括与其内源性活性相比活性降低或无活性。减弱可与术语诸如失活、缺陷、下调、减少、降低、弱化等术语互换使用。
减弱也可包括其中由于编码多肽的多核苷酸的突变,与微生物原始所具有多肽的活性相比,多肽活性本身减少或移除的情况;其中由于编码多肽的多核苷酸基因表达的抑制或翻译成多肽的抑制等,与天然菌株相比,细胞内多肽活性和/或浓度(表达水平)的总体水平减少的情况;其中多核苷酸是根本不表达的情况;和/或其中即使表达多核苷酸时,也未观察到多肽活性的情况。如本文所用,术语“内源活性”是指当性状经由天然或人工因素引起的基因修饰而改变时,转化前的亲本菌株、野生型或非修饰微生物原始拥有的特定多肽活性,并且可与“修饰前活性”互换使用。多肽活性与其内源活性相比,“失活、缺陷、减少、下调、降低或弱化”的表述,是指与转化前的亲本菌株或非修饰微生物原始拥有的特定多肽活性相比,该多肽活性减少。
多肽活性的减弱可通过本领域已知的任何方法进行,但方法不限于此,且可通过应用本领域已知的多种方法(例如,Nakashima N等人,Bacterial cellular engineeringby genome editing and gene silencing.Int J Mol Sci.2014;15(2):2773-2793,Sambrook等人.Molecular Cloning 2012,等)实现。
具体地,本申请的多肽活性的减弱可通过以下实现:
1)缺失编码多肽的基因的一部分或全部;
2)修饰表达调控区(表达调控序列)使得编码多肽的基因表达减少;
3)修饰构成多肽的氨基酸序列,使得多肽活性被移除或减弱(例如,氨基酸序列上一个或多个氨基酸的缺失/取代/添加);
4)修饰编码多肽的基因序列,使得多肽活性被移除或减弱(例如,在多肽基因的核苷酸序列上一个或多个核苷酸的缺失/取代/添加,以编码多肽,该多肽已被修饰以移除或减弱多肽活性);
5)修饰编码多肽的基因转录物的起始密码子或5’-UTR的编码核苷酸序列;
6)引入反义寡核苷酸(例如,反义RNA),其互补结合编码多肽的基因转录物;
7)在编码多肽的基因的SD序列前端添加与Shin-Dalgamo(SD)序列互补的序列以形成二级结构,从而抑制核糖体附接;
8)逆转录工程化(RTE),其在编码多肽的基因序列的开放阅读框(ORF)的3’端添加将被逆转录的启动子;或
9)选自上述方法1)至8)中的两个或多个的组合,但不特别限于此。
例如,
缺失编码多肽的基因的一部分或全部的方法1)可通过缺失染色体内编码内源性靶多肽的多核苷酸的全部,或通过用具有部分缺失的核苷酸的多核苷酸或用标记基因置换多核苷酸而实现。
修饰表达调控区(表达调控序列)的方法2)可通过缺失、插入、非保守取代或保守取代或其组合诱导表达调控区(表达调控序列)上的修饰;或通过用具有较弱活性的序列置换序列而实现。表达调控区可包括启动子、操纵子序列、编码核糖体结合位点的序列以及用于调控转录和翻译终止的序列,但不限于此。
进一步地,修饰编码多肽的基因转录物的起始密码子或5’-UTR的编码核苷酸序列的方法5)可通过,例如,用编码与内源性起始密码子相比具有较低的多肽表达率的另一起始密码子的核苷酸序列取代该核苷酸序列而实现,但不限于此。
修饰氨基酸序列或多核苷酸序列的方法3)及4)可通过多肽的氨基酸序列或编码多肽的多核苷酸序列的缺失、插入、非保守或保守取代或其组合诱导序列上的修饰以减弱多肽活性,或通过用修饰为具有较弱活性的氨基酸序列或多核苷酸序列,或修饰为不具有活性的氨基酸序列或多核苷酸序列置换该序列而实现,但不限于此。例如,可通过对多核苷酸序列中引入突变以形成终止密码子来抑制或减弱基因表达,但不限于此。
引入反义寡核苷酸(例如,反义RNA(该反义寡核苷酸互补结合编码多肽的基因转录物)的方法6)可在文献[Weintraub,H.等人,Antisense-RNA as a molecular tool forgenetic analysis,Reviews-Trends in Genetics,Vol.1(1)1986]中找到。
在编码多肽的基因的SD序列前端添加与Shine-Dalgamo(SD)序列互补的序列以形成二级结构,从而抑制核糖体附接的方法7)可通过抑制mRNA翻译或减低其速度而实现。
逆转录工程化(RTE)(其在编码多肽的基因序列的开放阅读框(ORF)的3’端添加将被逆转录的启动子)的方法8)可通过形成与编码多肽的基因转录物互补的反义核苷酸以减弱活性而实现。
本申请的SerB具有转化OPS为L-丝氨酸的活性,并且因此被修饰以减弱SerB活性的微生物具有在其中累积OPS的性质,因此可用于生产OPS。本申请的SerB可以是具有或包括SEQ ID NO:2表示的氨基酸序列的蛋白质,或可以是由SEQ ID NO:2表示的氨基酸序列组成或基本上由其组成的蛋白质,但不限于此。此外,本申请的SerB可具有或包括与SEQ IDNO:2表示的氨基酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的序列同源性或同一性的氨基酸序列,只要其显示SerB活性。另外,本申请的SerB可由与SEQ ID NO:2表示的氨基酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的序列同源性或同一性的氨基酸序列组成或基本上由其组成,但不限于此。此外,编码SerB的多核苷酸可具有或包括编码SEQ ID NO:2表示的氨基酸序列的SEQ ID NO:3的核苷酸序列。进一步,编码SerB的多核苷酸可由编码SEQ ID NO:2表示的氨基酸序列的核苷酸序列组成或基本上由其组成。本申请的编码SerB的多核苷酸可在不改变SerB蛋白质的氨基酸序列的范围内,因密码子简并性或考虑待表达SerB蛋白质的有机体中优选的密码子,在编码区中进行各种修饰。本申请的编码SerB的多核苷酸可具有或包括与SEQ ID NO:3的核苷酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的并且少于100%的同源性或同一性的核苷酸序列。此外,本申请的编码SerB的多核苷酸可由与SEQ ID NO:3的核苷酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的并且少于100%的同源性或同一性的核苷酸序列组成或基本上由其组成,但不限于此。
本申请的YhhS具有输出OPS的活性,并且因此被修饰以增强YhhS活性的微生物具有输出OPS的性质,因此可有用于生产OPS。本申请的YhhS可以是具有或包括SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列的蛋白质,或可以是由SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列组成或基本上由其组成的蛋白质,但不限于此。此外,本申请的YhhS可具有或包括与SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的序列同源性或同一性的氨基酸序列,只要其显示YhhS活性。此外,本申请的YhhS可由与SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的同源性或同一性的氨基酸序列组成或基本上由其组成,但不限于此。此外,编码YhhS的多核苷酸可具有或包括编码SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列的核苷酸序列。进一步,编码YhhS的多核苷酸可由编码SEQ ID NO:4表示的氨基酸序列的核苷酸序列组成或基本上由其组成。本申请的编码YhhS的多核苷酸可在不改变YhhS蛋白质的氨基酸序列的范围内,因密码子简并性或考虑待表达YhhS蛋白质的有机体中优选的密码子,在编码区中进行各种修饰。本申请的编码YhhS的多核苷酸可具有或包括与SEQ ID NO:5的核苷酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的并且少于100%的同源性或同一性的核苷酸序列。此外,本申请的编码YhhS的多核苷酸可由与SEQ ID NO:5的核苷酸序列具有70%、80%、90%、95%或99%或更高的并且少于100%的同源性或同一性的核苷酸序列组成或基本上由其组成,但不限于此。
在一个实施方式中,包括修饰以增强生产OPS的能力和/或输出OPS至细胞外的能力;或以增强OPS分解和/或流入能力的微生物可为CA07-0012(KCCM 11212P;US 2012-0190081A)或CA07-4821,但不限于此。关于生产OPS微生物的内容,除上述那些之外,还可使用KR专利第1381048号或US公开第2012-0190081号的公开内容作为本申请的参考。
本申请的另一方面提供用于生产OPS的方法,其包括在培养基中培养具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产OPS的微生物。
微生物如上所述。
如本文所用,术语“培养”是指微生物在适当控制的环境条件下生长。本申请的培养过程可在本领域已知的适当培养基和培养条件中进行。该培养过程可由本领域技术人员根据待选择的菌株容易地调整。具体地,培养可为分批培养、连续培养和补料分批培养,但不限于此。
在培养微生物中,培养基可进一步含有甘氨酸或丝氨酸。甘氨酸可以以纯的甘氨酸、含甘氨酸的酵母提取物或胰胨的形式提供。在培养基中待含有的甘氨酸的浓度一般为0.1g/L至10g/L,并且具体地为0.5g/L至3g/L。此外,丝氨酸可以以纯的丝氨酸、含丝氨酸的酵母提取物或胰胨的形式提供。在培养基中待含有的丝氨酸的浓度一般为0.1g/L至5g/L,并且具体地为0.1g/L至1g/L。
在培基中待含有的碳源的实例可包括糖和碳水化合物(如葡萄糖、蔗糖、乳糖、果糖、麦芽糖、淀粉和纤维素);油和脂肪(如大豆油、葵花油、蓖麻油和椰子油);脂肪酸(如棕榈酸、硬脂酸和亚油酸);醇(如甘油和乙醇);以及有机酸(如乙酸)。这些碳源可单独使用或组合使用,但不限于此。
在培基中待含有的氮源的实例可包括有机氮源(如蛋白胨、酵母提取物、肉汁、麦芽提取物、玉米浆和豆粉);以及无机氮源(如尿素、硫酸铵、氯化铵、磷酸铵、碳酸铵和硝酸铵)。这些氮源可单独使用或组合使用,但不限于此。
在培基中待含有的磷源的实例可包括磷酸二氢钾、磷酸氢二钾和对应的含钠盐,但不限于此。
此外,培养基可包括金属盐(如硫酸镁或硫酸铁),以及可进一步含有氨基酸、维生素和合适的前体。这些培养基或前体可以以分批培养或连续培养形式添加至培养物,但不限于此。
培养物的pH可通过以合适的方式在培养期间添加化合物(如氢氧化铵、氢氧化钾、氨、磷酸和硫酸)来调节。此外,可使用诸如脂肪酸聚乙二醇酯的消泡剂在培养期间预防气泡形成。进一步,可对培养物注入氧气或含氧的气体以维持培养物的有氧状态;或可注入氮气、氢气或二氧化碳,或可不注入气体,以维持厌氧或微厌氧状态。培养物的温度可为25℃至40℃的范围,具体地由30℃至35℃。培养可持续直到可获得有用的材料的生产,并且具体地由10小时至100小时,但不限于这些示例性实例。
本申请可在本申请方法的培养步骤前进一步包括制备培养基的步骤,但不限于此。
方法可进一步包括从培养基或微生物回收OPS的步骤。可在培养步骤之后进一步地包括回收步骤。
在本申请的回收OPS的方法中,可根据培养方法使用本领域已知的适当方法从培养溶液收集期望的OPS。例如,可以使用方法(如离心、过滤、离子交换层析、结晶和HPLC),并且可使用本领域已知的合适方法从培养基或微生物回收期望的OPS。
进一步,回收步骤可进一步地包括纯化过程,纯化过程可使用本领域已知的适当方法进行。因此,回收的OPS可以处于纯化状态或在含有OPS的微生物发酵液体培养基中。此外,OPS的回收可通过在培养步骤之前和之后以及回收步骤之前和之后添加本领域已知的适当方法而有效地进行。
本申请的又一方面提供生产半胱氨酸或其衍生物的方法,其包括:
a)在培养基中培养具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产O-磷酸丝氨酸的微生物以生产O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基;以及
b)在O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶(OPSS)或表达该酶的微生物的存在下,使步骤a)中生产的O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基与硫化物反应。
步骤a)及b)不一定受顺序所限制,即连续进行或顺序地进行,并且这些步骤之间可没有时间间隔,以及这些步骤可同时进行,或以数秒、数分钟、数小时、数日的间隔进行。
具体地,方法可以是用于生产半胱氨酸或其衍生物的方法:其包括在培养基中培养具有增强的Nuo活性的生产OPS的微生物以生产OPS或含有OPS的培养基;以及在O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶(OPSS)或表达该酶的微生物的存在下,将步骤a)中生产的O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基与硫化物反应。NADH:醌氧化还原酶活性的增强和生产O-磷酸丝氨酸的微生物如上所述。
如本文所用,术语“衍生物”是指通过化学性修饰任何化合物中的一部分所获得的类似化合物。该术语通常是指其中氢原子或特定原子团被另一原子或原子团取代的化合物。
如本文所用,术语“半胱氨酸衍生物”是指其中半胱氨酸中的氢原子或特定原子团被另一原子或原子团取代的化合物。例如,半胱氨酸衍生物可具有其中半胱氨酸中的胺基(-NH2)的氮原子或硫醇基(-SH)的硫原子具有附接至其的另一原子或原子团的形式,并且半胱氨酸衍生物的实例可包括NAC(N-乙酰半胱氨酸)、SCMC(S-羧甲基半胱氨酸)、Boc-CyS(Me)-OH、(R)-S-(2-氨基-2-羧乙基)-L-高半胱氨酸、(R)-2-氨基-3-磺基丙酸、D-2-胺基-4-(乙硫基)丁酸、3-亚磺基-L-丙氨酸、Fmoc-Cys(Boc-甲基)-OH、硒基-L-半胱氨酸、S-(2-噻唑基)-L-半胱氨酸、S-(2-噻吩基)-L-半胱氨酸、S-(4-甲苯基)-L-半胱氨酸等,但不限于此。
只要根据本申请的方法生产半胱氨酸,转化为半胱氨酸衍生物可通过本领域已知的方法容易地转化为各种半胱氨酸衍生物。
具体地,生产半胱氨酸衍生物的方法可进一步包括将步骤b)中生产的半胱氨酸转化为半胱氨酸衍生物。例如,半胱氨酸可通过与乙酰化剂的反应合成为N-乙酰半胱氨酸(NAC),或其可通过在碱性条件下与卤代乙酸的反应合成为S-羧甲基半胱氨酸(SCMC),但不限于此。
这些半胱氨酸衍生物主要用作用于镇咳剂、止咳剂以及支气管炎、支气管哮喘、咽喉炎等的治疗剂的药物原料,但不限于此。
如本文所用,术语“O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶(OPSS)”是指将OPS由硫醇基(-SH基)转化为半胱氨酸的反应进行催化的酶。该酶可能已首先在敏捷气热菌(Aeropyrumpernix)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)、耻垢分枝杆菌(Mycobacteriumsmegmatics)及阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)中发现(Mino K.and Ishikawa K.,FEBS Letters,551:133-138,2003;Burns K.E.等人,J.Am.Chem.Soc.,127:11602-11603,2005)。此外,OPSS不仅可包括野生型OPSS蛋白,也包括变体蛋白,该变体蛋白包括编码OPSS的多核苷酸序列的一部分的缺失、取代或添加,其显示出等于或高于野生型OPSS蛋白的生物活性的活性,并且也可包括在US2012-0190081 A1和US 9127324 B2中所公开的所有OPSS蛋白及其变体。
在本申请中使用的硫化物可以是不仅以本领域中一般使用的固体形式提供的任何硫化物,而且由于pH、压力和溶解度的差异而以液体或气体形式提供的任何硫化物,因此可以不受限制地转化为例如硫化物(S2-)或硫代硫酸盐(S2O3 2-)形式的硫醇(SH)基团。具体地,硫化物可以包括Na2S、NaSH、H2S、(NH4)2S、NaSH和Na2S2O3,其可以向OPS提供硫醇基,但不限于此。在反应中,将单个硫醇基团提供给单个反应性OPS基团以产生单个半胱氨酸或其衍生物。在该反应中,基于OPS的摩尔浓度,以0.1至3摩尔当量,并且具体地1至2摩尔当量的量具体地添加硫化物,但不限于此。
本申请的再一方面提供生产OPS的微生物的生产方法,其包括:修饰埃希氏菌属的微生物以增强NADH:醌氧化还原酶的活性。
本申请的又一目标提供具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的微生物的生产O-磷酸丝氨酸、半胱氨酸或其衍生物的用途。
NADH:醌氧化还原酶、其活性增强、微生物等如上所述。
实施例
将通过实施例更详细地描述本申请。然而,对在本申请所属领域的技术人员来说明显的是这些实施例仅提供用于示例的目的,并且本发明的范围不意于限制于这些实施例或被这些实施例所限制。
实施例1:具有突变的Nuo表达调控区的菌株的OPS生产能力的评估
作为先前研究的结果,发现在生产OPS的宿主菌株中的nuoA、rmf和idi基因的平均转录水平分别为8986、32205和631,并且各培养段的具体值示于表1中。
[表1]
确认rmf转录水平的平均值是nuoA转录水平的平均值的3.6倍,并且idi转录水平的平均值是nuoA转录水平的平均值的0.07倍。这些结果表明,与nuoA的启动子相比,rmf基因的启动子是强启动子并且idi基因的启动子是弱启动子。
因此,尝试比较当通过将具有不同活性的rmf启动子和idi启动子插入到生产OPS的微生物内的nuo操纵子(SEQ ID NO:1)中以调控NADH:醌氧化还原酶表达时的微生物的OPS生产能力。
1-1:用于增强Nuo表达调控区的质粒的构建
基于大肠杆菌ATCC27325染色体DNA作为模板,使用具有SEQ ID NO:14和15的核苷酸序列的引物对获得nuo基因野生型启动子上游区中的基因片段,并且使用具有SEQ IDNO:18和19的核苷酸序列的引物对获得启动子下游区中的基因片段。此外,基于大肠杆菌ATCC27325染色体DNA作为模板,使用具有SEQ ID NO:16和17的核苷酸序列的引物对获得rmf基因启动子区。
为了获得片段,使用SolgTMPfu-X DNA聚合酶进行PCR,并且在95℃下变性2分钟,接着在95℃下变性30秒、在60℃下退火30分钟和在72℃下聚合60秒的30个循环,然后在72℃下聚合5分钟的PCR扩增条件下进行PCR。
通过上述过程获得的nuo启动子的上游片段和下游片段以及rmf启动子片段使用融合克隆试剂盒(in-fusion cloning kit)(Clontech Laboratories,Inc.)经采用限制酶EcoRV裂解的用于染色体转化的pSKH130载体(SEQ ID NO:39,US公开号2020-0048619)进行克隆,以获得重组质粒,并且将其命名为pSKH130_Prmf-nuoA。
1-2:用于减弱Nuo表达调控区的质粒的构建
基于大肠杆菌ATCC27325染色体DNA作为模板,使用具有SEQ ID NO:14和20的核苷酸序列的引物对获得nuo基因野生型启动子上游区中的基因片段,并且使用具有SEQ IDNO:23和19的核苷酸序列的引物对获得启动子下游区中的基因片段。此外,基于大肠杆菌ATCC27325染色体DNA作为模板,使用具有SEQ ID NO:21和22的核苷酸序列的引物对获得idi基因启动子区。
在如实施例1-1中相同的PCR条件下进行PCR以获得片段,并且使用片段以与实施例1-1相同的方式进行克隆以获得重组质粒。将这命名为pSKH130_Pidi-nuoA。
实施例1-1和1-2中使用的引物序列示于表2中。
[表2]
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1-3:Nuo表达调控区突变菌株的构建
实施例1-1中制备的pSKH130_Prmf-nuoA通过电穿孔(Appl.Microbiol.Biotechnol.(1999)52:541-545)转化至具有OPS生产能力的CA07-0012(KCCM 11212P,U.S.公开号2012-0190081)中并且经历二次交换,从而获得其中rmf基因的启动子核苷酸序列被插入在nuo基因的野生型启动子核苷酸序列末端处的CA07-4826菌株。
具体地,pSKH130载体含有PI蛋白质(pir基因)-依赖性R6K复制子、SacB(果聚糖蔗糖酶)基因和卡那霉素耐受基因。在一次交换使用R6K和卡那霉素获得所期望的菌株后,从含有蔗糖的培养基移出抗生素以制备菌株。
在CA07-4826中,使用SEQ ID NO:24和25的引物对通过PCR和基因组测序来确认rmf启动子核苷酸序列的插入。
以照相同方式,实施例1-2中制备的pSKH130_Pidi-nuoA通过电穿孔(Appl.Microbiol.Biotechnol.(1999)52:541–545)转化并且经历二次交换,从而获得其中idi基因的启动子核苷酸序列被插入在nuo基因的野生型启动子核苷酸序列末端处的CA07-4827菌株。在CA07-4827中,使用SEQ ID NO:24和25的引物对通过PCR和基因组测序来确认idi启动子核苷酸序列的插入。使用的引物序列示于表3中。
[表3]
1-4:使用效价培养基的nuo操纵子增强和减弱菌株的OPS生产能力的比较
为了评估实施例1-3中制备的两种菌株CA07-4826和CA07-4827以及对照CA07-0012的OPS生产能力,使用下述培养基(表4)进行评估。
[表4]
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具体地,将每种菌株铺板在固体LB培养基上并且在33℃培养箱中培养过夜。将在固体LB培养基中培养过夜的菌株接种在下表3中示出的25mL效价培养基中,然后在33℃下以200rpm速率在培养箱中培养48小时。生产的OPS浓度示于表5中。
[表5]
菌株名称 OPS(g/L)
CA07-0012 1.95
CA07-4826 2.20
CA07-4827 0.40
其中nuo操纵子通过rmf启动子增强的CA07-4826与亲本菌株相比显示约12.8%的OPS生产能力改善,并且其中nuo操纵子通过idi启动子减弱的CA07-4827与亲本菌株相比显示约79.5%的OPS生产能力降低。
实施例2:具有增强的OPS生产能力的菌株中根据nuo操纵子增强的OPS生产能力的 评估
尝试确认在具有增强的OPS输出能力的菌株中,当Nuo操纵子增强时,OPS生产能力是否进一步增加。为此,在用具有OPS输出能力的蛋白质YhhS(SEQ ID NO:4,美国专利号10323262B2)增强的菌株中,当nuo操纵子进一步增强时,评估OPS生产能力。
2-1:用于在OPS生产菌株中增强YhhS的质粒的构建
基于大肠杆菌ATCC27325染色体DNA作为模板,使用具有SEQ ID NO:6和7的核苷酸序列的引物对获得yhhS基因野生型启动子上游区中的基因片段,并且使用具有SEQ ID NO:8和9的核苷酸序列的引物对获得yhhS基因野生型启动子下游区中的基因片段。此外,基于pCL_Ptrc-gfp(US2017-0247727 Al)作为模板,使用SEQ ID NO:8和9的引物对获得trc启动子(Ptrc)。使用的引物序列示于下表6中。
[表6]
为了获得片段,使用SolgTMPfu-X DNA聚合酶进行PCR,并且在95℃下变性2分钟,接着在95℃下变性30秒、在60℃下退火30分钟和在72℃下聚合60秒的30个循环,然后在72℃下聚合5分钟的PCR扩增条件下进行PCR。
通过上述过程获得的yhhS启动子的上游片段和下游片段以及trc启动子片段使用融合克隆试剂盒(Clontech Laboratories,Inc.)经采用限制酶EcoRV裂解的用于染色体转化的载体进行克隆,以获得重组质粒,并且将其命名为pSKH130_Ptrc-yhhS。
2-2:YhhS增强的菌株的构建
实施例2-1中制备的pSKH130_Ptrc-yhhS通过电穿孔(Appl.Microbiol.Biotechnol.(1999)52:541-545)转化至CA07-0012中并且经历二次交换,从而获得其中trc启动子核苷酸序列被插入在yhhS基因野生型启动子核苷酸序列末端处的CA07-4821菌株。在CA07-4821菌株中,使用SEQ ID NO:12和13(表7)的引物对通过PCR和基因组测序来确认trc启动子核苷酸序列的插入。
[表7]
2-3:使用效价培养基的YhhS-增强菌株的OPS生产能力的评估
为了评估实施例2-2中制备的菌株CA07-4821及其亲本菌株CA07-0012的OPS生产能力,使用培养基(表4)以与实施例1-4相同方式进行评估。
结果,确认CA07-4821与CA07-0012相比显示约26.7%的OPS生产能力改善,并且结果示于表8中。
[表8]
2-4:具有增强的YhhS和nuo操纵子的菌株的构建
实施例1-1中制备的pSKH130_Prmf-nuoA通过电穿孔(Appl.Microbiol.Biotechnol.(1999)52:541–545)转化至实施例2-3中制备的CA07-4821中并且经历二次交换,从而获得其中rmf基因启动子核苷酸序列被插入在nuo基因野生型启动子核苷酸序列末端处的CA07-4828菌株。
在CA07-4828中,使用SEQ ID NO:24和25的引物对通过PCR和基因组测序来确认rmf启动子核苷酸序列的插入。
2-5:使用效价培养基具有增强的Yhhs和nuo操纵子的菌株的OPS生产能力的评估
为了评估CA07-4828的OPS生产能力,使用CA07-4821作为对照,以与实施例1-4相同方式进行评估,并且结果示于表9中。
[表9]
菌株名称 OPS(g/L)
CA07-4821 2.47
CA07-4828 2.53
在其中YhhS和nuo操纵子被同时增强的CA07-4828的情况下,与其中仅有YhhS被增强的CA07-4821相比,OPS生产能力改善约2.4%。因此,确认甚至在具有增强的OPS生产能力的菌株中,nuo操纵子的增强进一步增加OPS生产能力。
根据以上内容,本申请所属领域中的技术人员将能够理解,本申请在不改变本申请的技术概念或本质特征的情况下,可以以其他具体形式实施。在这方面,本文所公开的示例性实施方式仅用于示例目的并且不应被解释为限制本申请的范围。相反地,本申请意在不仅涵盖示性例实施方式,也涵盖可包括在由所附权利要求限定的本申请的精神和范围内的各种替代、修改、等同物和其他实施方式。
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> nuo 操纵子
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(630)
<223> nuoA 启动子
<220>
<221> misc_feature
<222> (631)..(633)
<223> nuoA 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (1090)..(1092)
<223> nuoB 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (1846)..(1848)
<223> nuoC 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (3651)..(3653)
<223> nuoE 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (4148)..(4150)
<223> nuoF 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (5532)..(5534)
<223> nuoG 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (8261)..(8263)
<223> nuoH 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (9253)..(9255)
<223> nuoI 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (9807)..(9809)
<223> nuoJ 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (10358)..(10360)
<223> nuoK 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (10657)..(10659)
<223> nuoL 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (12662)..(12664)
<223> nuoM 起始密码子
<220>
<221> misc_feature
<222> (14378)..(14380)
<223> nuoN 起始密码子
<400> 1
tcgacggacg atagataatt cctgagacaa tagtgtaaaa aacgagccgc tgggggtgtt 60
ttaaacccca gcggcttttt tttagtaaaa atccttcatc gcatagtgca gaacgtacaa 120
aactgttcat ttttcaacca ccagagattc acgtcccgaa cgcacaaata atcgcctgaa 180
aaaaatcacc tgctacaatg atgttaaaaa atacgtaaat ttgttgctgc gtttttgtta 240
tggaatgaca aaagcgtgtc acagatcaag aaaatactct cttttggggg gaggaatcga 300
cacaaattcc tgtcaaaata gacccgtatt ttttccattg cttcacaacg gacacgattc 360
aacaacatct aattatcctg gagtcgtcaa ggatctgggg tgaaagggca ttaaatgcta 420
atggtgttga tattatgtaa actaatgtga agaaactttt gttaaagttg acaaaaggtt 480
atagaaagga gtaaaaaacc acatcaatta gctgtataaa agaatttcta cagtgattgt 540
aaggtttttt ttattcctcc ccatgaatcg atgtggcgtc catctgccgt gaagagcagt 600
gaatctggcg ctacttttga tgagtaagca atgagtatgt caacatccac tgaagtcatc 660
gctcatcact gggcattcgc tatctttctt atcgttgcca ttggcctgtg ttgcctgatg 720
ctggtaggcg gttggttttt aggcggtcgc gcacgcgcga ggtcgaaaaa cgtgccgttt 780
gaatccggta tcgactcggt cggctccgcc cgcttacgcc tgtccgccaa gttttatctg 840
gtggccatgt tcttcgttat cttcgacgtt gaagcgctgt atctgttcgc atggtcaacc 900
tctatccgcg aaagcggctg ggtaggcttt gtggaagctg caatttttat ttttgtgtta 960
ctggcaggtc tggtttatct ggtgcgtatt ggcgcgctgg actggacgcc cgcgcgttca 1020
cgccgcgagc gtatgaaccc ggaaacgaac agtatcgcta atcgtcaacg ctaaccgcga 1080
ggcattaaga tggattatac gctcacccgc atagatccca acggtgagaa cgaccgttac 1140
cccctgcaaa agcaggagat cgtaaccgac cctctggagc aagaagttaa caaaaacgtg 1200
tttatgggca agctcaatga catggttaac tggggtcgta aaaactcaat ttggccgtat 1260
aacttcggtc tttcctgctg ttacgttgag atggtgactt cgtttaccgc ggtgcatgac 1320
gtggcgcgtt ttggcgcaga agtattgcgt gcttcgccgc gtcaggctga cctgatggtg 1380
gttgcaggaa cctgctttac caaaatggca ccggttattc agcgtctgta tgaccagatg 1440
ctggaaccaa aatgggttat ctcaatgggt gcctgtgcca actctggtgg tatgtacgat 1500
atttattccg ttgtgcaggg cgtcgataaa ttcatcccgg ttgatgtgta tatcccgggc 1560
tgcccgccgc gtcctgaagc gtacatgcag gcactgatgc tgttgcagga atctatcggc 1620
aaagaacgtc gtccgctctc ctgggtggtt ggcgatcagg gcgtttatcg cgccaatatg 1680
caatcagagc gcgaacgcaa gcgcggtgaa cgcattgccg taactaacct gcgtacacct 1740
gacgagattt aatttgcgcc tgtcggcaaa gggatttttc ttcgcttatt cctaaatcta 1800
tttcgcgaag cttactgcgc cgacagtcac cacggaccat ttgcaatggt gaacaatatg 1860
accgacttaa ccgcgcaaga acccgcctgg cagacccgcg atcatcttga tgatccggtg 1920
attggcgaac tgcgcaaccg ttttgggccg gatgccttta ctgttcaggc gactcgcacc 1980
ggggttcccg ttgtgtggat caagcgtgaa caattactgg aagttggcga tttcttaaag 2040
aaactgccga aaccttacgt catgctgttt gacttacacg gcatggacga acgtctgcgc 2100
acacaccgcg aagggttacc tgccgcggat ttttccgttt tctaccatct gatttctatc 2160
gatcgtaacc gcgacatcat gctgaaggtg gcgctggcag aaaacgacct gcacgtaccg 2220
accttcacca aactgttccc gaacgctaac tggtatgagc gtgaaacctg ggatctgttt 2280
ggcattactt tcgacggtca cccgaacctg cgacgcatca tgatgccgca aacctggaaa 2340
ggtcacccgc tgcgtaaaga ttatccggcg cgcgctaccg aattctcgcc gtttgagctg 2400
accaaagcca aacaggatct ggagatggaa gccctgacct tcaaaccgga agagtggggg 2460
atgaagcgcg gcaccgaaaa cgaggacttc atgttcctca acctcggtcc gaaccacccg 2520
tcggcgcacg gggctttccg tatcgttttg caactcgatg gcgaagagat tgtcgactgc 2580
gtaccagaca tcggttacca ccaccgtggt gcggagaaaa tgggcgaacg ccagtcctgg 2640
cacagctaca ttccgtatac tgaccgtatc gaatacctcg gcggctgcgt taacgaaatg 2700
ccttacgtgc tggcggtaga gaaactggcc gggatcaccg tgccggatcg cgttaacgtc 2760
attcgcgtta tgctctccga actgttccgc atcaacagtc acctgctgta tatctcgacc 2820
tttattcagg acgtcggcgc aatgacgcca gtgttcttcg cctttaccga tcgtcagaaa 2880
atttacgatc tggtggaagc aatcactggt ttccgtatgc acccggcgtg gttccgtatt 2940
ggcggcgtag cgcacgacct gccgcgcggc tgggatcgcc tgctgcgtga gttcctcgac 3000
tggatgccga aacgtctggc gtcttacgag aaagcggcgc tgcaaaacac cattctgaaa 3060
ggtcgttccc agggcgttgc cgcctatggc gcgaaagagg cgctggagtg gggcaccact 3120
ggcgcgggcc tgcgtgctac cgggatcgac ttcgacgtgc gtaaggcgcg tccttattct 3180
ggctatgaaa acttcgactt tgaaatcccg gtgggtggtg gcgtttctga ctgctacacc 3240
cgcgtaatgc ttaaagtgga agagctgcgc cagagtctgc gcattcttga gcagtgcctc 3300
aacaacatgc cggaaggccc gttcaaagcg gatcacccgc tgaccacgcc gccgccgaaa 3360
gagcgcacgc tgcaacatat cgaaaccctg atcacccact tcctgcaagt gtcgtggggt 3420
ccggtgatgc ctgccaatga atctttccag atgattgagg cgaccaaagg gatcaacagt 3480
tactacctga ccagcgacgg cagcaccatg agttaccgca cccgtgttcg taccccgagc 3540
tttgcgcatt tgcagcaaat tccggcggcg atccgcggca gcctggtgtc tgacctgatt 3600
gtttatctgg gcagtatcga ttttgttatg tcagatgtgg accgctaatt atgcacgaga 3660
atcaacaacc acaaaccgag gcttttgagc tgagtgcggc agagcgtgaa gcgatcgagc 3720
acgagatgca ccactacgaa gacccgcgtg cggcgtccat tgaagcgctg aaaatcgttc 3780
agaagcagcg tggctgggtg ccggatggtg cgatccacgc gatcgccgat gtgctgggta 3840
ttccggcaag cgacgtcgaa ggtgtggcaa cgttctacag tcagatcttc cgccagccgg 3900
ttggtcgcca tgtgatccgt tattgtgaca gcgtggtctg tcatatcaac ggttatcagg 3960
gtattcaggc ggcgctcgag aaaaagctga acatcaaacc agggcaaacg acatttgatg 4020
gccgctttac gctgctgcca acttgctgcc tggggaactg tgataaaggg ccaaacatga 4080
tgatcgatga ggacactcac gcgcatctga ccccggaagc gatccctgaa ctgctggagc 4140
ggtataaatg aaaaacatta tccgtactcc cgaaacgcat ccgctgacct ggcgtctgcg 4200
cgatgacaaa cagccagtgt ggctggacga ataccgcagc aaaaacggtt acgaaggcgc 4260
gcgtaaggcg ctgaccgggc tgtctccgga cgaaatcgtt aatcaggtaa aagacgctgg 4320
tctgaaaggg cgcggcggcg cgggcttctc gactggcctg aaatggagcc tgatgccgaa 4380
agacgaatcc atgaacatcc gttacctgct gtgtaatgcc gatgaaatgg agccgggcac 4440
ctataaagac cgcctgttga tggagcaact gccgcacctg ctggtggaag gtatgctcat 4500
ctccgcgttt gcgctgaaag cttaccgtgg ctacatcttc ctgcgtggcg aatatatcga 4560
agcggcagtt aatctgcgcc gtgccattgc cgaagccacc gaagcgggtc tgcttggcaa 4620
aaacattatg ggaacaggtt tcgatttcga actgttcgtc cataccgggg cagggcgcta 4680
catctgcggg gaagaaacag cgttaatcaa ctccctggaa ggacgtcgtg ctaacccacg 4740
ctcgaagcca cccttcccgg caacctccgg cgcatggggt aaaccgacct gtgtcaacaa 4800
cgtcgaaacc ctgtgtaacg ttccggcgat cctcgctaac ggcgtggagt ggtatcagaa 4860
catctcgaaa agtaaagatg ctggcaccaa gctgatgggc ttctccggtc gggtgaaaaa 4920
tccgggactg tgggaactgc cgttcggcac caccgcacgc gagatcctcg aagattacgc 4980
cggtggtatg cgtgatggtc tgaaatttaa agcctggcag ccaggcggcg cggggactga 5040
cttcctgacc gaagcgcacc ttgatctgcc gatggaattc gaaagtatcg gtaaagcggg 5100
cagccgtctg ggtacggcgc tggcgatggc ggttgaccat gagatcaaca tggtgtcgct 5160
ggtgcgtaac ctggaagagt ttttcgcccg tgagtcctgc ggctggtgta cgccgtgccg 5220
cgacggtctg ccgtggagcg tgaaaattct gcgtgcgctg gagcgtggtg aaggtcagcc 5280
gggcgatatc gaaacacttg agcaactgtg tcgattctta ggcccgggta aaactttctg 5340
tgcccacgca cctggtgcag tggagccgtt acagagcgcc atcaaatatt tccgcgaaga 5400
atttgaggcg ggaatcaaac agccgttcag caatacccat ttgattaatg ggattcagcc 5460
gaacctgctg aaagagcgct ggtaaccgaa tttcgattaa cgctcagtct ctgactgaga 5520
aaactggaag catgctaatg gctacaattc atgtagacgg caaagaatac gaggtcaacg 5580
gagcggacaa cctgctggaa gcttgtctgt ctctgggcct tgatattcct tacttttgct 5640
ggcatccggc gctgggaagt gtcggtgctt gccgccagtg tgcggtgaag caataccaaa 5700
acgcggaaga cacgcgtggt cgcctggtga tgtcctgtat gacaccggct tccgatggca 5760
cctttatttc cattgacgac gaagaagcga aacagttccg tgaaagcgtg gtcgagtggt 5820
tgatgaccaa ccacccgcac gactgtccgg tatgtgaaga gggcggtaac tgccatcttc 5880
aggatatgac tgtgatgacc ggacacagct tccgtcgcta ccgtttcacc aaacgtaccc 5940
accgtaatca ggatttgggg ccattcatct ctcacgaaat gaaccgctgc atcgcctgct 6000
accgctgtgt gcgttactac aaagattacg ctgacggtac agatctgggc gtttacggtg 6060
cgcacgacaa cgtctacttc ggtcgcccgg aagacggcac gctggaaagc gaattttccg 6120
gtaacctggt cgaaatttgc ccgaccggcg tatttaccga caaaacgcac tccgagcgtt 6180
acaaccgtaa atgggatatg cagtttgcgc cgagcatctg ccagcaatgt tccatcggct 6240
gtaacatcag ccccggtgaa cgttacggcg aactgcgtcg tatcgaaaac cgttacaacg 6300
gtacggtaaa ccactacttc ctctgcgacc gtggtcgttt cggttacggt tacgtcaacc 6360
tgaaggatcg tccgcgtcag ccagtacagc gtcgtggcga tgatttcatt accctcaacg 6420
ccgaacaggc aatgcagggc gcggcagata ttctgcgtca gtcgaagaaa gtgatcggta 6480
ttggttctcc gcgtgccagc gtggaaagca actttgcgct gcgtgaactg gtgggcgaag 6540
aaaacttcta caccggtatc gctcacggtg agcaggaacg tctgcaactg gcgctgaaag 6600
tgctgcgtga aggcggcatt tatactccgg ctctgcgcga aatcgaatct tacgatgcgg 6660
tactggtgct gggcgaagac gttacccaga ccggcgcgcg cgtcgcgctg gcagtgcgtc 6720
aggctgtgaa aggtaaagcg cgcgaaatgg cggcagcaca gaaagtggct gactggcaga 6780
ttgcggcaat cctcaacatc ggtcaacgtg cgaagcatcc gctgtttgtt accaacgttg 6840
atgacacccg tctggatgat atcgcggcgt ggacttaccg cgcaccggtt gaagatcagg 6900
cgcgtttagg ttttgccatc gcccatgcgc tggataactc tgcaccagcg gttgacggta 6960
tcgaacctga gctgcaaagc aaaatcgacg tcatcgtgca ggcactggca ggtgcgaaga 7020
aaccgttgat tatctccggg acgaacgccg gtagcttaga ggtgattcag gcggcggcta 7080
acgtcgcgaa agccctgaaa ggtcgcggcg ctgacgtcgg tatcaccatg attgcccgtt 7140
ccgtcaacag catggggctg ggcattatgg gtggcggttc gcttgaagaa gcgttaaccg 7200
aactggaaac cggacgcgcc gacgcggtgg tggtgttgga aaacgatctg catcgtcacg 7260
cttctgctat ccgcgtgaat gctgcgctgg ctaaagcacc gctggtgatg gtggttgatc 7320
atcaacgcac agcgattatg gaaaacgccc atctggtact ttctgctgcc agctttgctg 7380
aaagcgacgg tacggtgatc aacaacgaag gccgcgccca acgtttcttc caggtttacg 7440
atcctgctta ttacgacagc aaaactgtca tgctggaaag ctggcgctgg ttacactcgc 7500
tgcacagcac cctgctgagc cgtgaagtgg actggacgca gctcgaccat gtgattgacg 7560
ctgttgtggc gaaaatcccg gaactggcag gtatcaaaga tgctgcgccg gatgcgacat 7620
tccgtattcg tgggcagaaa ctggcccgtg aaccgcaccg ttacagcggt cgtaccgcca 7680
tgcgcgccaa tatcagcgtt catgagccgc gtcagccgca ggatattgac accatgttca 7740
ccttctcgat ggaaggtaac aaccagccga ctgcgcaccg ttcgcaagtg ccgtttgcct 7800
gggcgccggg ctggaactcc ccgcaggcgt ggaacaaatt ccaggacgaa gtgggcggca 7860
aactgcgctt tggcgatccg ggcgtgcgtc tgtttgaaac cagcgaaaat ggtctggatt 7920
acttcaccag cgtaccggca cgcttccagc cgcaggacgg gaaatggcgt atcgcgccgt 7980
attaccacct gtttggcagc gatgaattgt cacagcgtgc tccggtcttc cagagccgta 8040
tgccgcagcc gtacatcaaa ctcaacccag cggatgccgc gaagttgggt gtgaacgcag 8100
gtacacgcgt ctcctttagt tacgatggca acacggtcac gctgccggtt gaaatcgccg 8160
aaggactgac ggcagggcag gtgggcttgc cgatgggtat gtccggcatt gctccggtgc 8220
tggctggcgc gcatcttgag gatctcaagg aggcacaaca atgagttgga tatcaccgga 8280
actgattgag atcctgctga ccatcctcaa agcggtggtg atcctgctgg tggttgtcac 8340
ctgcggggca ttcatgagct ttggcgaacg tcgcctgctg ggtctgttcc agaaccgtta 8400
cggacctaac cgtgttggct ggggcggttc gctccagctg gttgcggaca tgatcaaaat 8460
gttctttaaa gaagactgga tcccgaaatt ctcggatcgc gtcatcttta ccctggcacc 8520
gatgattgcc tttacctcgc tgctgctggc ctttgcgatt gtgccagtca gtccgggttg 8580
ggtggttgcc gacctgaaca tcgggatttt gttcttcctg atgatggcag gtctggcggt 8640
ttacgcggtg ctgtttgcgg gctggtcaag taacaacaaa tactcgttgc tgggtgcgat 8700
gcgtgcttct gcgcagaccc tgagctacga agtgttcctc gggctttcct tgatgggcgt 8760
ggtggcgcag gccggttcat tcaacatgac cgacatcgtc aacagccagg cgcatgtgtg 8820
gaacgttatc ccgcaattct ttggttttat tacctttgcc atcgcgggcg tggcggtatg 8880
tcaccgtcac ccgtttgacc agccggaagc cgagcaggaa ctggcggatg gttaccacat 8940
tgaatattcc ggtatgaagt tcggtctgtt cttcgtgggt gagtacatcg ggattgtgac 9000
catctctgca ttgatggtga cgctgttctt cggtggctgg caaggcccgt tgttaccgcc 9060
attcatctgg ttcgcgctga aaaccgcgtt ctttatgatg atgttcattt tgattcgtgc 9120
gtcgttaccg cgtccgcgtt atgaccaggt aatgtccttc ggctggaaaa tctgcctgcc 9180
gctgacgctg atcaacttgc tggtaacggc ggctgtcatt ctctggcagg cgcaataagg 9240
ggcaataaga ccatgacctt aaaagaattg ttagtaggtt tcggcaccca ggttcgtagt 9300
atctggatga tcggcctgca cgcgttcgcc aaacgcgaaa cgcgaatgta cccggaagag 9360
ccggtctatc tgccgccccg ttatcgtggt cgtatcgttc tgacccgcga cccggacggc 9420
gaagagcgtt gcgtagcctg taacctctgc gcggtagcct gcccggtcgg ctgtatctcg 9480
ctgcaaaaag cagaaaccaa agacggtcgc tggtacccgg aatttttccg catcaacttc 9540
tcacgctgca ttttctgtgg tctgtgcgaa gaagcctgtc cgaccacggc gattcagtta 9600
accccggatt tcgaaatggg ggaatacaag cgccaggatc tggtttacga gaaagaggat 9660
ctgctgatct ccggtccggg caaatacccg gaatataact tctaccggat ggcaggtatg 9720
gcaatcgacg gcaaagataa gggcgaagca gagaacgaag ccaagcctat cgacgtcaag 9780
agcctgttac cgtaaggaga ggggcaatgg agttcgcttt ttatatctgt ggcctgatag 9840
ccatacttgc gaccttgcga gtgatcaccc ataccaatcc ggtacacgca ctgctgtacc 9900
tgattatttc gctgctggcg atttccgggg tgttcttctc actgggcgct tacttcgccg 9960
gtgcgctgga aattatcgtc tacgcgggtg ccattatggt gctgttcgtg ttcgtggtga 10020
tgatgctcaa cctgggcggt tcagaaatcg aacaggaacg ccagtggctg aaaccgcagg 10080
tgtggattgg tccggcaatt ttgtcggcca tcatgctggt ggtgattgtt tacgccatcc 10140
tcggtgttaa cgatcagggt atcgacggta cgccaatcag tgctaaagca gtgggtatta 10200
cgctgttcgg gccttacgta ctggcggtgg aactggcttc tatgctgctg ctcgcaggtc 10260
tggttgtggc cttccacgtc ggtcgtgaag agcgtgcggg tgaagtgctg agcaatcgta 10320
aagacgacag cgcgaaaaga aaaacggagg agcacgcatg atccccttac aacatggact 10380
gatcctcgcg gcaatcttat tcgttcttgg cttaaccggt ctggttatcc gtcgcaatct 10440
gctgtttatg ttgattggtc tggaaatcat gattaacgcc tccgcgctgg ccttcgtggt 10500
cgccggaagc tactggggcc agaccgacgg tcaggtgatg tacattctcg ccatcagcct 10560
cgcggcggca gaagcgagta tcggccttgc gctgctgctg caacttcacc gtcgtcgcca 10620
gaacctgaac atcgattcag taagtgagat gcgcggatga acatgcttgc cttaaccatt 10680
attttgccat tgattggctt cgtcctgctg gcattctccc gtgggcgctg gtctgaaaac 10740
gtctcggcga tcgtcggcgt aggctctgtg ggcctggcgg cgctggtaac cgcctttatc 10800
ggcgttgatt tcttcgctaa cggcgagcag acatacagcc agccgctgtg gacgtggatg 10860
tcggtaggcg actttaacat cggttttaac ctggtgctgg acggcctgtc gctgaccatg 10920
ctctcggtgg tcactggtgt gggtttcctt attcacatgt acgcctcctg gtatatgcgc 10980
ggtgaagagg gctactctcg cttcttcgct tacaccaacc tgttcatcgc cagcatggtg 11040
gttctggtgc ttgccgacaa cctgctgctg atgtacctcg gctgggaagg cgtgggcctg 11100
tgctcctatc tgctgatcgg gttctattac accgatccga agaatggcgc agcggcaatg 11160
aaagcgttcg tcgtgacccg tgtgggtgac gtgttcctcg ctttcgcact gttcattctt 11220
tacaacgaac tgggcaccct gaacttccgc gaaatggtgg aactggcacc agcgcacttt 11280
gctgacggca ataacatgct gatgtgggcg acgctgatgc tgctgggcgg tgcggtcggt 11340
aaatctgcgc agttgccgtt gcagacatgg cttgccgacg cgatggcggg cccgacgcct 11400
gtctccgcgc tgatccacgc cgcaaccatg gtaaccgcgg gtgtctacct gatcgcccgt 11460
acccacggcc tgttcctgat gacgccggaa gttctgcatc tggtgggtat tgtcggggcg 11520
gttacgctgc tgctggccgg ttttgccgcg ctggtacaga ccgacatcaa acgtgttctc 11580
gcttactcta ccatgagcca gattggctac atgttcctcg cgcttggcgt gcaggcatgg 11640
gatgcggcga ttttccactt gatgacccac gcgttcttta aagcgctgct gttcctggca 11700
tccggttccg tcattctggc ctgccatcac gaacagaaca tcttcaagat gggcggtctg 11760
cgtaaatcta ttccgctggt ttatctctgc ttcctggtgg gcggcgcagc actgtcggca 11820
ctaccgctgg tcactgcggg cttcttcagt aaggatgaga tcctcgcggg tgcgatggcg 11880
aatggtcata tcaatctgat ggtggcaggt ctggtcggtg cgtttatgac ctcgctctac 11940
accttccgta tgattttcat cgtcttccac ggaaaagaac aaattcacgc tcacgccgtg 12000
aaaggggtaa ctcacagcct gccgctgatt gtgctgctga tcctttccac cttcgttggc 12060
gcactgattg taccgccgct gcagggcgtg cttccgcaaa cgacggaact ggcgcacggc 12120
agcatgttga ccctggaaat tacctctggc gtggtcgcgg tggtcggcat tctgctggca 12180
gcctggctgt ggctgggtaa acgtactctg gtgacctcca tcgccaacag tgcgccgggc 12240
cgtctgctgg gcacctggtg gtacaacgcc tggggatttg actggctgta tgacaaagtg 12300
ttcgtcaagc cgttcctggg tattgcctgg ttgctgaaac gcgatccgct gaactcaatg 12360
atgaacatcc cggctgtcct ttcccgcttt gcaggtaaag gtctgctgtt aagtgagaac 12420
ggctatctgc gctggtatgt ggcatccatg agcatcggtg cggtcgtggt gctggcactg 12480
ttgatggtac tgcgttgagt taaggattgt gggattgccc ctgggcatat aagaacgtag 12540
gtcggataag ccgccttcgc ggtgcatccg acactacccc cagtccgaag agaattttct 12600
gtcgtgagaa ttcgttgaaa atccggtcct gacgggactt ttacaaggaa taaagatcgc 12660
catgttacta ccctggctaa tattaattcc ctttattggc ggcttcctgt gctggcagac 12720
cgaacgcttt ggcgtcaagg tgccacgctg gatcgcgctg atcaccatgg gattgacgct 12780
ggcgctgtcg ctgcaactgt ggttgcaggg cggttattca ctgacgcaat ccgccggaat 12840
tccgcagtgg cagtctgaat tcgacatgcc gtggatcccg cgttttggta tctctattca 12900
tctcgccatt gacgggctgt cgctgctgat ggtcgtgctg accggtctgc tcggtgtgct 12960
ggcggtacta tgttcgtgga aagagatcga aaaatatcag ggcttcttcc acctcaacct 13020
gatgtggatc ctgggcggcg ttatcggcgt gttccttgcc atcgacatgt tcctgttctt 13080
cttcttctgg gaaatgatgc tggtgccgat gtacttcctg atcgcactgt gggggcataa 13140
agcctctgac ggtaaaacgc gtatcacggc ggcaaccaag ttcttcattt acacccaggc 13200
gagtggcctg gtgatgttga ttgccatcct ggcgctggtt tttgttcact acaatgcgac 13260
cggcgtctgg accttcaact atgaagagct gctgaatacg ccaatgtcca gtggtgtgga 13320
atacctgtta atgctgggct tcttcatcgc cttcgcagtc aaaatgccgg tggttccgct 13380
gcatggctgg ctgccggatg cgcactccca ggctccgacc gccggttccg ttgacctcgc 13440
ggggatcttg ctgaaaactg ccgcttacgg tttgctgcgt ttctccctgc cgctgttccc 13500
gaacgcgtcg gcagagttcg cgccaattgc tatgtggctg ggtgttatcg gcatcttcta 13560
cggtgcgtgg atggccttcg cccagaccga tatcaaacgt ctgatcgcct acacctcggt 13620
ttcccacatg ggcttcgtgc tgattgctat ctacaccggc agccagttgg cctaccaggg 13680
cgcggtaatc cagatgattg cgcacggttt gtcggcggcg ggtctgttta ttctttgtgg 13740
tcagctttat gaacgtatcc atacccgcga catgcgcatg atgggcggtc tgtggagcaa 13800
gatgaaatgg ctgccagcac tgtcgctgtt ctttgcggtg gcaacgcttg ggatgcctgg 13860
caccggtaac ttcgtcggcg aatttatgat tctgttcggc agcttccagg ttgtaccggt 13920
gattaccgtt atctctacct ttgggctggt ctttgcatct gtttattcgc tggcgatgtt 13980
acatcgcgct tacttcggta aagcgaaaag ccagattgcc agccaggaac tgccagggat 14040
gtcgctgcgt gagctgttta tgatcctgtt gctggtggtg ctgctggtac tgctgggctt 14100
ctatccgcag ccgattctgg atacctcgca ctccgcgatt ggcaatatcc agcagtggtt 14160
tgttaattcc gttactacta caaggccgta aatcgccatg acaataactc cacaaaacct 14220
gatcgcactg ctaccgttgc tgatcgtcgg cttgacggtg gtggttgtga tgctctccat 14280
tgcgtggcga cgcaatcatt tcctcaacgc tacgctctcg gttattgggc ttaacgcggc 14340
gctggtttcg ctctggtttg ttggccaggc gggcgctatg gacgttacgc cgctgatgcg 14400
cgttgatggt ttcgccatgc tttacaccgg gctggtattg ttggcgagcc tcgccacctg 14460
tactttcgcc tacccgtggc ttgaaggcta taacgacaac aaggatgagt tctacctgtt 14520
ggtgttaatt gccgcgctgg gcgggatcct gctggcgaat gccaaccatc tggcgtctct 14580
gttcctcggt atcgaactga tctctttgcc gctgtttggc ctggtcggtt acgctttccg 14640
ccagaaacgt tcactggaag ccagtatcaa atacaccatc ctttctgccg cagcgtcttc 14700
tttcctgctg tttggtatgg cgctggtgta tgcgcagtct ggcgacctgt cgtttgtcgc 14760
gttgggtaaa aaccttggcg acggtatgct caacgagccg ctgttgctgg caggtttcgg 14820
cctgatgatt gttggcctcg gcttcaaact ctctctggtg ccgttccacc tgtggacgcc 14880
agacgtatac cagggcgcgc ctgcgccggt ttccactttc ctggcgacgg cgagcaaaat 14940
cgctatcttc ggtgtggtga tgcgtctgtt cctctacgca ccggtgggtg acagcgaagc 15000
gattcgcgtg gtgctggcga ttatcgcctt tgcctccatc atcttcggta acctgatggc 15060
gctgagccag accaatatca aacgtctgct cggttactca tctatctctc acctcggcta 15120
tctgctggta gcgctgattg cgctgcaaac cggcgagatg tcgatggaag cggtaggggt 15180
ttacctggcc ggttatctgt tcagcagcct cggcgcgttc ggcgtggtca gcctgatgtc 15240
cagcccgtat cgtggcccgg atgctgattc cctgttctct taccgcggtc tgttctggca 15300
tcgtccgatc ctcgcggcag tgatgacggt gatgatgctg tctctggccg gtatcccgat 15360
gacgctgggc tttatcggta agttctacgt gctggcggtc ggtgtccagg cacacttgtg 15420
gtggctggtg ggtgccgtgg ttgtcggttc ggcaatcggc ctctactact acctgcgcgt 15480
ggcggtgagc ctgtatcttc acgccccgga acaaccgggt cgcgatgcac catcaaactg 15540
gcagtacagc gcgggcggta tcgttgtgct gatctctgca ctgttggtac tggtgctggg 15600
tgtatggcca caaccgctga ttagcattgt gcgtttggca atgccgctga tgtaa 15655
<210> 2
<211> 322
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> SerB
<400> 2
Met Pro Asn Ile Thr Trp Cys Asp Leu Pro Glu Asp Val Ser Leu Trp
1 5 10 15
Pro Gly Leu Pro Leu Ser Leu Ser Gly Asp Glu Val Met Pro Leu Asp
20 25 30
Tyr His Ala Gly Arg Ser Gly Trp Leu Leu Tyr Gly Arg Gly Leu Asp
35 40 45
Lys Gln Arg Leu Thr Gln Tyr Gln Ser Lys Leu Gly Ala Ala Met Val
50 55 60
Ile Val Ala Ala Trp Cys Val Glu Asp Tyr Gln Val Ile Arg Leu Ala
65 70 75 80
Gly Ser Leu Thr Ala Arg Ala Thr Arg Leu Ala His Glu Ala Gln Leu
85 90 95
Asp Val Ala Pro Leu Gly Lys Ile Pro His Leu Arg Thr Pro Gly Leu
100 105 110
Leu Val Met Asp Met Asp Ser Thr Ala Ile Gln Ile Glu Cys Ile Asp
115 120 125
Glu Ile Ala Lys Leu Ala Gly Thr Gly Glu Met Val Ala Glu Val Thr
130 135 140
Glu Arg Ala Met Arg Gly Glu Leu Asp Phe Thr Ala Ser Leu Arg Ser
145 150 155 160
Arg Val Ala Thr Leu Lys Gly Ala Asp Ala Asn Ile Leu Gln Gln Val
165 170 175
Arg Glu Asn Leu Pro Leu Met Pro Gly Leu Thr Gln Leu Val Leu Lys
180 185 190
Leu Glu Thr Leu Gly Trp Lys Val Ala Ile Ala Ser Gly Gly Phe Thr
195 200 205
Phe Phe Ala Glu Tyr Leu Arg Asp Lys Leu Arg Leu Thr Ala Val Val
210 215 220
Ala Asn Glu Leu Glu Ile Met Asp Gly Lys Phe Thr Gly Asn Val Ile
225 230 235 240
Gly Asp Ile Val Asp Ala Gln Tyr Lys Ala Lys Thr Leu Thr Arg Leu
245 250 255
Ala Gln Glu Tyr Glu Ile Pro Leu Ala Gln Thr Val Ala Ile Gly Asp
260 265 270
Gly Ala Asn Asp Leu Pro Met Ile Lys Ala Ala Gly Leu Gly Ile Ala
275 280 285
Tyr His Ala Lys Pro Lys Val Asn Glu Lys Ala Glu Val Thr Ile Arg
290 295 300
His Ala Asp Leu Met Gly Val Phe Cys Ile Leu Ser Gly Ser Leu Asn
305 310 315 320
Gln Lys
<210> 3
<211> 969
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> serB
<400> 3
atgcctaaca ttacctggtg cgacctgcct gaagatgtct ctttatggcc gggtctgcct 60
ctttcattaa gtggtgatga agtgatgcca ctggattacc acgcaggtcg tagcggctgg 120
ctgctgtatg gtcgtgggct ggataaacaa cgtctgaccc aataccagag caaactgggt 180
gcggcgatgg tgattgttgc cgcctggtgc gtggaagatt atcaggtgat tcgtctggca 240
ggttcactca ccgcacgggc tacacgcctg gcccacgaag cgcagctgga tgtcgccccg 300
ctggggaaaa tcccgcacct gcgcacgccg ggtttgctgg tgatggatat ggactccacc 360
gccatccaga ttgaatgtat tgatgaaatt gccaaactgg ccggaacggg cgagatggtg 420
gcggaagtaa ccgaacgggc gatgcgcggc gaactcgatt ttaccgccag cctgcgcagc 480
cgtgtggcga cgctgaaagg cgctgacgcc aatattctgc aacaggtgcg tgaaaatctg 540
ccgctgatgc caggcttaac gcaactggtg ctcaagctgg aaacgctggg ctggaaagtg 600
gcgattgcct ccggcggctt tactttcttt gctgaatacc tgcgcgacaa gctgcgcctg 660
accgccgtgg tagccaatga actggagatc atggacggta aatttaccgg caatgtgatc 720
ggcgacatcg tagacgcgca gtacaaagcg aaaactctga ctcgcctcgc gcaggagtat 780
gaaatcccgc tggcgcagac cgtggcgatt ggcgatggag ccaatgacct gccgatgatc 840
aaagcggcag ggctggggat tgcctaccat gccaagccaa aagtgaatga aaaggcggaa 900
gtcaccatcc gtcacgctga cctgatgggg gtattctgca tcctctcagg cagcctgaat 960
cagaagtaa 969
<210> 4
<211> 405
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> YhhS
<400> 4
Met Pro Glu Pro Val Ala Glu Pro Ala Leu Asn Gly Leu Arg Leu Asn
1 5 10 15
Leu Arg Ile Val Ser Ile Val Met Phe Asn Phe Ala Ser Tyr Leu Thr
20 25 30
Ile Gly Leu Pro Leu Ala Val Leu Pro Gly Tyr Val His Asp Val Met
35 40 45
Gly Phe Ser Ala Phe Trp Ala Gly Leu Val Ile Ser Leu Gln Tyr Phe
50 55 60
Ala Thr Leu Leu Ser Arg Pro His Ala Gly Arg Tyr Ala Asp Ser Leu
65 70 75 80
Gly Pro Lys Lys Ile Val Val Phe Gly Leu Cys Gly Cys Phe Leu Ser
85 90 95
Gly Leu Gly Tyr Leu Thr Ala Gly Leu Thr Ala Ser Leu Pro Val Ile
100 105 110
Ser Leu Leu Leu Leu Cys Leu Gly Arg Val Ile Leu Gly Ile Gly Gln
115 120 125
Ser Phe Ala Gly Thr Gly Ser Thr Leu Trp Gly Val Gly Val Val Gly
130 135 140
Ser Leu His Ile Gly Arg Val Ile Ser Trp Asn Gly Ile Val Thr Tyr
145 150 155 160
Gly Ala Met Ala Met Gly Ala Pro Leu Gly Val Val Phe Tyr His Trp
165 170 175
Gly Gly Leu Gln Ala Leu Ala Leu Ile Ile Met Gly Val Ala Leu Val
180 185 190
Ala Ile Leu Leu Ala Ile Pro Arg Pro Thr Val Lys Ala Ser Lys Gly
195 200 205
Lys Pro Leu Pro Phe Arg Ala Val Leu Gly Arg Val Trp Leu Tyr Gly
210 215 220
Met Ala Leu Ala Leu Ala Ser Ala Gly Phe Gly Val Ile Ala Thr Phe
225 230 235 240
Ile Thr Leu Phe Tyr Asp Ala Lys Gly Trp Asp Gly Ala Ala Phe Ala
245 250 255
Leu Thr Leu Phe Ser Cys Ala Phe Val Gly Thr Arg Leu Leu Phe Pro
260 265 270
Asn Gly Ile Asn Arg Ile Gly Gly Leu Asn Val Ala Met Ile Cys Phe
275 280 285
Ser Val Glu Ile Ile Gly Leu Leu Leu Val Gly Val Ala Thr Met Pro
290 295 300
Trp Met Ala Lys Ile Gly Val Leu Leu Ala Gly Ala Gly Phe Ser Leu
305 310 315 320
Val Phe Pro Ala Leu Gly Val Val Ala Val Lys Ala Val Pro Gln Gln
325 330 335
Asn Gln Gly Ala Ala Leu Ala Thr Tyr Thr Val Phe Met Asp Leu Ser
340 345 350
Leu Gly Val Thr Gly Pro Leu Ala Gly Leu Val Met Ser Trp Ala Gly
355 360 365
Val Pro Val Ile Tyr Leu Ala Ala Ala Gly Leu Val Ala Ile Ala Leu
370 375 380
Leu Leu Thr Trp Arg Leu Lys Lys Arg Pro Pro Glu His Val Pro Glu
385 390 395 400
Ala Ala Ser Ser Ser
405
<210> 5
<211> 1218
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhS
<400> 5
atgcccgaac ccgtagccga acccgcgcta aacggattgc gcctgaattt gcgcattgtc 60
tctatagtca tgtttaactt cgccagctac ctcaccatcg ggttgccgct cgctgtatta 120
ccgggctatg tccatgatgt gatgggcttt agcgccttct gggcaggatt ggttatcagc 180
ctgcaatatt tcgccacctt gctgagccgc cctcatgccg gacgttacgc cgattcgctg 240
ggacccaaaa agattgtcgt cttcggttta tgcggctgct ttttgagcgg tctggggtat 300
ctgacggcag gattaaccgc cagtctgcct gtcatcagcc tgttattact ttgcctgggg 360
cgcgtcatcc ttgggattgg gcaaagtttt gccggaacgg gatcgaccct atggggcgtt 420
ggcgtggttg gctcgctgca tatcgggcgg gtgatttcgt ggaacggcat tgtcacttac 480
ggggcgatgg cgatgggtgc gccgttaggc gtcgtgtttt atcactgggg cggcttgcag 540
gcgttagcgt taatcattat gggcgtggcg ctggtggcca ttttgttggc gatcccgcgt 600
ccgacggtaa aagccagtaa aggcaaaccg ctgccgtttc gcgcggtgct tgggcgcgtc 660
tggctgtacg gtatggcgct ggcactggct tccgccggat ttggcgtcat cgccaccttt 720
atcacgctgt tttatgacgc taaaggttgg gacggtgcgg ctttcgcgct gacgctgttt 780
agctgtgcgt ttgtcggtac gcgtttgtta ttccctaacg gcattaaccg tatcggtggc 840
ttaaacgtag cgatgatttg ctttagcgtt gagataatcg gcctgctact ggttggcgtg 900
gcgactatgc cgtggatggc gaaaatcggc gtcttactgg cgggggccgg gttttcgctg 960
gtgttcccgg cattgggtgt agtggcggta aaagcggttc cgcagcaaaa tcagggggcg 1020
gcgctggcaa cttacaccgt atttatggat ttatcgcttg gcgtgactgg accactggct 1080
gggctggtga tgagctgggc gggcgtaccg gtgatttatc tggcggcggc gggactggtc 1140
gcaatcgcgt tattactgac gtggcgatta aaaaaacggc ctccggaaca cgtccctgag 1200
gccgcctcat catcttaa 1218
<210> 6
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhS UP F
<400> 6
ctgcaggaat tcgatgaagg taaccacttt ttccg 35
<210> 7
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhS UP R
<400> 7
gagttgcagc aagcggagga tcaccacatt tttac 35
<210> 8
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Ptrc F
<400> 8
aatgtggtga tcctccgctt gctgcaactc tctca 35
<210> 9
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Ptrc R
<400> 9
tacgggttcg ggcatgatag ctctcctgtg tgaaa 35
<210> 10
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhS Down F
<400> 10
cacaggagag ctatcatgcc cgaacccgta gccga 35
<210> 11
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhS Down R
<400> 11
gtcgactagc gtgatagcgg tttgccttta ctggc 35
<210> 12
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhSP Conf F
<400> 12
agttgagcaa aaacgccagt 20
<210> 13
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> yhhSP Conf R
<400> 13
gccataccgt acagccagac 20
<210> 14
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> UP F1
<400> 14
ctgcaggaat tcgatcaacc accagagatt cacgt 35
<210> 15
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> UP R1
<400> 15
gcttcctgac tccagtgctt actcatcaaa agtag 35
<210> 16
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Prmf F
<400> 16
tttgatgagt aagcactgga gtcaggaagc cgctt 35
<210> 17
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Prmf R
<400> 17
tgttgacata ctcatgcctc gtttccctca tactg 35
<210> 18
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Down F1
<400> 18
tgagggaaac gaggcatgag tatgtcaaca tccac 35
<210> 19
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Down R1
<400> 19
acggtgagaa cgaccgttac atcacgctag tcgac 35
<210> 20
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> UP R2
<400> 20
tcatttttct tcagctgctt actcatcaaa agtag 35
<210> 21
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pidi F
<400> 21
tttgatgagt aagcagctga agaaaaatga gcatg 35
<210> 22
<211> 39
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pidi R
<400> 22
tgttgacata ctcataattt ctcacatgta attctgatc 39
<210> 23
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Down F2
<400> 23
tacatgtgag aaattatgag tatgtcaaca tccac 35
<210> 24
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoP Conf F
<400> 24
gagagctacc ataatccgtg 20
<210> 25
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoP Conf R
<400> 25
catctcaacg taacagcagg 20
<210> 26
<211> 147
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoA
<400> 26
Met Ser Met Ser Thr Ser Thr Glu Val Ile Ala His His Trp Ala Phe
1 5 10 15
Ala Ile Phe Leu Ile Val Ala Ile Gly Leu Cys Cys Leu Met Leu Val
20 25 30
Gly Gly Trp Phe Leu Gly Gly Arg Ala Arg Ala Arg Ser Lys Asn Val
35 40 45
Pro Phe Glu Ser Gly Ile Asp Ser Val Gly Ser Ala Arg Leu Arg Leu
50 55 60
Ser Ala Lys Phe Tyr Leu Val Ala Met Phe Phe Val Ile Phe Asp Val
65 70 75 80
Glu Ala Leu Tyr Leu Phe Ala Trp Ser Thr Ser Ile Arg Glu Ser Gly
85 90 95
Trp Val Gly Phe Val Glu Ala Ala Ile Phe Ile Phe Val Leu Leu Ala
100 105 110
Gly Leu Val Tyr Leu Val Arg Ile Gly Ala Leu Asp Trp Thr Pro Ala
115 120 125
Arg Ser Arg Arg Glu Arg Met Asn Pro Glu Thr Asn Ser Ile Ala Asn
130 135 140
Arg Gln Arg
145
<210> 27
<211> 220
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoB
<400> 27
Met Asp Tyr Thr Leu Thr Arg Ile Asp Pro Asn Gly Glu Asn Asp Arg
1 5 10 15
Tyr Pro Leu Gln Lys Gln Glu Ile Val Thr Asp Pro Leu Glu Gln Glu
20 25 30
Val Asn Lys Asn Val Phe Met Gly Lys Leu Asn Asp Met Val Asn Trp
35 40 45
Gly Arg Lys Asn Ser Ile Trp Pro Tyr Asn Phe Gly Leu Ser Cys Cys
50 55 60
Tyr Val Glu Met Val Thr Ser Phe Thr Ala Val His Asp Val Ala Arg
65 70 75 80
Phe Gly Ala Glu Val Leu Arg Ala Ser Pro Arg Gln Ala Asp Leu Met
85 90 95
Val Val Ala Gly Thr Cys Phe Thr Lys Met Ala Pro Val Ile Gln Arg
100 105 110
Leu Tyr Asp Gln Met Leu Glu Pro Lys Trp Val Ile Ser Met Gly Ala
115 120 125
Cys Ala Asn Ser Gly Gly Met Tyr Asp Ile Tyr Ser Val Val Gln Gly
130 135 140
Val Asp Lys Phe Ile Pro Val Asp Val Tyr Ile Pro Gly Cys Pro Pro
145 150 155 160
Arg Pro Glu Ala Tyr Met Gln Ala Leu Met Leu Leu Gln Glu Ser Ile
165 170 175
Gly Lys Glu Arg Arg Pro Leu Ser Trp Val Val Gly Asp Gln Gly Val
180 185 190
Tyr Arg Ala Asn Met Gln Ser Glu Arg Glu Arg Lys Arg Gly Glu Arg
195 200 205
Ile Ala Val Thr Asn Leu Arg Thr Pro Asp Glu Ile
210 215 220
<210> 28
<211> 600
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoC
<400> 28
Met Val Asn Asn Met Thr Asp Leu Thr Ala Gln Glu Pro Ala Trp Gln
1 5 10 15
Thr Arg Asp His Leu Asp Asp Pro Val Ile Gly Glu Leu Arg Asn Arg
20 25 30
Phe Gly Pro Asp Ala Phe Thr Val Gln Ala Thr Arg Thr Gly Val Pro
35 40 45
Val Val Trp Ile Lys Arg Glu Gln Leu Leu Glu Val Gly Asp Phe Leu
50 55 60
Lys Lys Leu Pro Lys Pro Tyr Val Met Leu Phe Asp Leu His Gly Met
65 70 75 80
Asp Glu Arg Leu Arg Thr His Arg Glu Gly Leu Pro Ala Ala Asp Phe
85 90 95
Ser Val Phe Tyr His Leu Ile Ser Ile Asp Arg Asn Arg Asp Ile Met
100 105 110
Leu Lys Val Ala Leu Ala Glu Asn Asp Leu His Val Pro Thr Phe Thr
115 120 125
Lys Leu Phe Pro Asn Ala Asn Trp Tyr Glu Arg Glu Thr Trp Asp Leu
130 135 140
Phe Gly Ile Thr Phe Asp Gly His Pro Asn Leu Arg Arg Ile Met Met
145 150 155 160
Pro Gln Thr Trp Lys Gly His Pro Leu Arg Lys Asp Tyr Pro Ala Arg
165 170 175
Ala Thr Glu Phe Ser Pro Phe Glu Leu Thr Lys Ala Lys Gln Asp Leu
180 185 190
Glu Met Glu Ala Leu Thr Phe Lys Pro Glu Glu Trp Gly Met Lys Arg
195 200 205
Gly Thr Glu Asn Glu Asp Phe Met Phe Leu Asn Leu Gly Pro Asn His
210 215 220
Pro Ser Ala His Gly Ala Phe Arg Ile Val Leu Gln Leu Asp Gly Glu
225 230 235 240
Glu Ile Val Asp Cys Val Pro Asp Ile Gly Tyr His His Arg Gly Ala
245 250 255
Glu Lys Met Gly Glu Arg Gln Ser Trp His Ser Tyr Ile Pro Tyr Thr
260 265 270
Asp Arg Ile Glu Tyr Leu Gly Gly Cys Val Asn Glu Met Pro Tyr Val
275 280 285
Leu Ala Val Glu Lys Leu Ala Gly Ile Thr Val Pro Asp Arg Val Asn
290 295 300
Val Ile Arg Val Met Leu Ser Glu Leu Phe Arg Ile Asn Ser His Leu
305 310 315 320
Leu Tyr Ile Ser Thr Phe Ile Gln Asp Val Gly Ala Met Thr Pro Val
325 330 335
Phe Phe Ala Phe Thr Asp Arg Gln Lys Ile Tyr Asp Leu Val Glu Ala
340 345 350
Ile Thr Gly Phe Arg Met His Pro Ala Trp Phe Arg Ile Gly Gly Val
355 360 365
Ala His Asp Leu Pro Arg Gly Trp Asp Arg Leu Leu Arg Glu Phe Leu
370 375 380
Asp Trp Met Pro Lys Arg Leu Ala Ser Tyr Glu Lys Ala Ala Leu Gln
385 390 395 400
Asn Thr Ile Leu Lys Gly Arg Ser Gln Gly Val Ala Ala Tyr Gly Ala
405 410 415
Lys Glu Ala Leu Glu Trp Gly Thr Thr Gly Ala Gly Leu Arg Ala Thr
420 425 430
Gly Ile Asp Phe Asp Val Arg Lys Ala Arg Pro Tyr Ser Gly Tyr Glu
435 440 445
Asn Phe Asp Phe Glu Ile Pro Val Gly Gly Gly Val Ser Asp Cys Tyr
450 455 460
Thr Arg Val Met Leu Lys Val Glu Glu Leu Arg Gln Ser Leu Arg Ile
465 470 475 480
Leu Glu Gln Cys Leu Asn Asn Met Pro Glu Gly Pro Phe Lys Ala Asp
485 490 495
His Pro Leu Thr Thr Pro Pro Pro Lys Glu Arg Thr Leu Gln His Ile
500 505 510
Glu Thr Leu Ile Thr His Phe Leu Gln Val Ser Trp Gly Pro Val Met
515 520 525
Pro Ala Asn Glu Ser Phe Gln Met Ile Glu Ala Thr Lys Gly Ile Asn
530 535 540
Ser Tyr Tyr Leu Thr Ser Asp Gly Ser Thr Met Ser Tyr Arg Thr Arg
545 550 555 560
Val Arg Thr Pro Ser Phe Ala His Leu Gln Gln Ile Pro Ala Ala Ile
565 570 575
Arg Gly Ser Leu Val Ser Asp Leu Ile Val Tyr Leu Gly Ser Ile Asp
580 585 590
Phe Val Met Ser Asp Val Asp Arg
595 600
<210> 29
<211> 166
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoE
<400> 29
Met His Glu Asn Gln Gln Pro Gln Thr Glu Ala Phe Glu Leu Ser Ala
1 5 10 15
Ala Glu Arg Glu Ala Ile Glu His Glu Met His His Tyr Glu Asp Pro
20 25 30
Arg Ala Ala Ser Ile Glu Ala Leu Lys Ile Val Gln Lys Gln Arg Gly
35 40 45
Trp Val Pro Asp Gly Ala Ile His Ala Ile Ala Asp Val Leu Gly Ile
50 55 60
Pro Ala Ser Asp Val Glu Gly Val Ala Thr Phe Tyr Ser Gln Ile Phe
65 70 75 80
Arg Gln Pro Val Gly Arg His Val Ile Arg Tyr Cys Asp Ser Val Val
85 90 95
Cys His Ile Asn Gly Tyr Gln Gly Ile Gln Ala Ala Leu Glu Lys Lys
100 105 110
Leu Asn Ile Lys Pro Gly Gln Thr Thr Phe Asp Gly Arg Phe Thr Leu
115 120 125
Leu Pro Thr Cys Cys Leu Gly Asn Cys Asp Lys Gly Pro Asn Met Met
130 135 140
Ile Asp Glu Asp Thr His Ala His Leu Thr Pro Glu Ala Ile Pro Glu
145 150 155 160
Leu Leu Glu Arg Tyr Lys
165
<210> 30
<211> 445
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoF
<400> 30
Met Lys Asn Ile Ile Arg Thr Pro Glu Thr His Pro Leu Thr Trp Arg
1 5 10 15
Leu Arg Asp Asp Lys Gln Pro Val Trp Leu Asp Glu Tyr Arg Ser Lys
20 25 30
Asn Gly Tyr Glu Gly Ala Arg Lys Ala Leu Thr Gly Leu Ser Pro Asp
35 40 45
Glu Ile Val Asn Gln Val Lys Asp Ala Gly Leu Lys Gly Arg Gly Gly
50 55 60
Ala Gly Phe Ser Thr Gly Leu Lys Trp Ser Leu Met Pro Lys Asp Glu
65 70 75 80
Ser Met Asn Ile Arg Tyr Leu Leu Cys Asn Ala Asp Glu Met Glu Pro
85 90 95
Gly Thr Tyr Lys Asp Arg Leu Leu Met Glu Gln Leu Pro His Leu Leu
100 105 110
Val Glu Gly Met Leu Ile Ser Ala Phe Ala Leu Lys Ala Tyr Arg Gly
115 120 125
Tyr Ile Phe Leu Arg Gly Glu Tyr Ile Glu Ala Ala Val Asn Leu Arg
130 135 140
Arg Ala Ile Ala Glu Ala Thr Glu Ala Gly Leu Leu Gly Lys Asn Ile
145 150 155 160
Met Gly Thr Gly Phe Asp Phe Glu Leu Phe Val His Thr Gly Ala Gly
165 170 175
Arg Tyr Ile Cys Gly Glu Glu Thr Ala Leu Ile Asn Ser Leu Glu Gly
180 185 190
Arg Arg Ala Asn Pro Arg Ser Lys Pro Pro Phe Pro Ala Thr Ser Gly
195 200 205
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210 215 220
Val Pro Ala Ile Leu Ala Asn Gly Val Glu Trp Tyr Gln Asn Ile Ser
225 230 235 240
Lys Ser Lys Asp Ala Gly Thr Lys Leu Met Gly Phe Ser Gly Arg Val
245 250 255
Lys Asn Pro Gly Leu Trp Glu Leu Pro Phe Gly Thr Thr Ala Arg Glu
260 265 270
Ile Leu Glu Asp Tyr Ala Gly Gly Met Arg Asp Gly Leu Lys Phe Lys
275 280 285
Ala Trp Gln Pro Gly Gly Ala Gly Thr Asp Phe Leu Thr Glu Ala His
290 295 300
Leu Asp Leu Pro Met Glu Phe Glu Ser Ile Gly Lys Ala Gly Ser Arg
305 310 315 320
Leu Gly Thr Ala Leu Ala Met Ala Val Asp His Glu Ile Asn Met Val
325 330 335
Ser Leu Val Arg Asn Leu Glu Glu Phe Phe Ala Arg Glu Ser Cys Gly
340 345 350
Trp Cys Thr Pro Cys Arg Asp Gly Leu Pro Trp Ser Val Lys Ile Leu
355 360 365
Arg Ala Leu Glu Arg Gly Glu Gly Gln Pro Gly Asp Ile Glu Thr Leu
370 375 380
Glu Gln Leu Cys Arg Phe Leu Gly Pro Gly Lys Thr Phe Cys Ala His
385 390 395 400
Ala Pro Gly Ala Val Glu Pro Leu Gln Ser Ala Ile Lys Tyr Phe Arg
405 410 415
Glu Glu Phe Glu Ala Gly Ile Lys Gln Pro Phe Ser Asn Thr His Leu
420 425 430
Ile Asn Gly Ile Gln Pro Asn Leu Leu Lys Glu Arg Trp
435 440 445
<210> 31
<211> 910
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoG
<400> 31
Met Leu Met Ala Thr Ile His Val Asp Gly Lys Glu Tyr Glu Val Asn
1 5 10 15
Gly Ala Asp Asn Leu Leu Glu Ala Cys Leu Ser Leu Gly Leu Asp Ile
20 25 30
Pro Tyr Phe Cys Trp His Pro Ala Leu Gly Ser Val Gly Ala Cys Arg
35 40 45
Gln Cys Ala Val Lys Gln Tyr Gln Asn Ala Glu Asp Thr Arg Gly Arg
50 55 60
Leu Val Met Ser Cys Met Thr Pro Ala Ser Asp Gly Thr Phe Ile Ser
65 70 75 80
Ile Asp Asp Glu Glu Ala Lys Gln Phe Arg Glu Ser Val Val Glu Trp
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100 105 110
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115 120 125
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130 135 140
Phe Ile Ser His Glu Met Asn Arg Cys Ile Ala Cys Tyr Arg Cys Val
145 150 155 160
Arg Tyr Tyr Lys Asp Tyr Ala Asp Gly Thr Asp Leu Gly Val Tyr Gly
165 170 175
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Ser Glu Phe Ser Gly Asn Leu Val Glu Ile Cys Pro Thr Gly Val Phe
195 200 205
Thr Asp Lys Thr His Ser Glu Arg Tyr Asn Arg Lys Trp Asp Met Gln
210 215 220
Phe Ala Pro Ser Ile Cys Gln Gln Cys Ser Ile Gly Cys Asn Ile Ser
225 230 235 240
Pro Gly Glu Arg Tyr Gly Glu Leu Arg Arg Ile Glu Asn Arg Tyr Asn
245 250 255
Gly Thr Val Asn His Tyr Phe Leu Cys Asp Arg Gly Arg Phe Gly Tyr
260 265 270
Gly Tyr Val Asn Leu Lys Asp Arg Pro Arg Gln Pro Val Gln Arg Arg
275 280 285
Gly Asp Asp Phe Ile Thr Leu Asn Ala Glu Gln Ala Met Gln Gly Ala
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305 310 315 320
Arg Ala Ser Val Glu Ser Asn Phe Ala Leu Arg Glu Leu Val Gly Glu
325 330 335
Glu Asn Phe Tyr Thr Gly Ile Ala His Gly Glu Gln Glu Arg Leu Gln
340 345 350
Leu Ala Leu Lys Val Leu Arg Glu Gly Gly Ile Tyr Thr Pro Ala Leu
355 360 365
Arg Glu Ile Glu Ser Tyr Asp Ala Val Leu Val Leu Gly Glu Asp Val
370 375 380
Thr Gln Thr Gly Ala Arg Val Ala Leu Ala Val Arg Gln Ala Val Lys
385 390 395 400
Gly Lys Ala Arg Glu Met Ala Ala Ala Gln Lys Val Ala Asp Trp Gln
405 410 415
Ile Ala Ala Ile Leu Asn Ile Gly Gln Arg Ala Lys His Pro Leu Phe
420 425 430
Val Thr Asn Val Asp Asp Thr Arg Leu Asp Asp Ile Ala Ala Trp Thr
435 440 445
Tyr Arg Ala Pro Val Glu Asp Gln Ala Arg Leu Gly Phe Ala Ile Ala
450 455 460
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Leu Gln Ser Lys Ile Asp Val Ile Val Gln Ala Leu Ala Gly Ala Lys
485 490 495
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500 505 510
Gln Ala Ala Ala Asn Val Ala Lys Ala Leu Lys Gly Arg Gly Ala Asp
515 520 525
Val Gly Ile Thr Met Ile Ala Arg Ser Val Asn Ser Met Gly Leu Gly
530 535 540
Ile Met Gly Gly Gly Ser Leu Glu Glu Ala Leu Thr Glu Leu Glu Thr
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Gly Arg Ala Asp Ala Val Val Val Leu Glu Asn Asp Leu His Arg His
565 570 575
Ala Ser Ala Ile Arg Val Asn Ala Ala Leu Ala Lys Ala Pro Leu Val
580 585 590
Met Val Val Asp His Gln Arg Thr Ala Ile Met Glu Asn Ala His Leu
595 600 605
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610 615 620
Asn Glu Gly Arg Ala Gln Arg Phe Phe Gln Val Tyr Asp Pro Ala Tyr
625 630 635 640
Tyr Asp Ser Lys Thr Val Met Leu Glu Ser Trp Arg Trp Leu His Ser
645 650 655
Leu His Ser Thr Leu Leu Ser Arg Glu Val Asp Trp Thr Gln Leu Asp
660 665 670
His Val Ile Asp Ala Val Val Ala Lys Ile Pro Glu Leu Ala Gly Ile
675 680 685
Lys Asp Ala Ala Pro Asp Ala Thr Phe Arg Ile Arg Gly Gln Lys Leu
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Ala Arg Glu Pro His Arg Tyr Ser Gly Arg Thr Ala Met Arg Ala Asn
705 710 715 720
Ile Ser Val His Glu Pro Arg Gln Pro Gln Asp Ile Asp Thr Met Phe
725 730 735
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740 745 750
Val Pro Phe Ala Trp Ala Pro Gly Trp Asn Ser Pro Gln Ala Trp Asn
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770 775 780
Val Arg Leu Phe Glu Thr Ser Glu Asn Gly Leu Asp Tyr Phe Thr Ser
785 790 795 800
Val Pro Ala Arg Phe Gln Pro Gln Asp Gly Lys Trp Arg Ile Ala Pro
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Tyr Tyr His Leu Phe Gly Ser Asp Glu Leu Ser Gln Arg Ala Pro Val
820 825 830
Phe Gln Ser Arg Met Pro Gln Pro Tyr Ile Lys Leu Asn Pro Ala Asp
835 840 845
Ala Ala Lys Leu Gly Val Asn Ala Gly Thr Arg Val Ser Phe Ser Tyr
850 855 860
Asp Gly Asn Thr Val Thr Leu Pro Val Glu Ile Ala Glu Gly Leu Thr
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Ala Gly Gln Val Gly Leu Pro Met Gly Met Ser Gly Ile Ala Pro Val
885 890 895
Leu Ala Gly Ala His Leu Glu Asp Leu Lys Glu Ala Gln Gln
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<210> 32
<211> 325
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoH
<400> 32
Met Ser Trp Ile Ser Pro Glu Leu Ile Glu Ile Leu Leu Thr Ile Leu
1 5 10 15
Lys Ala Val Val Ile Leu Leu Val Val Val Thr Cys Gly Ala Phe Met
20 25 30
Ser Phe Gly Glu Arg Arg Leu Leu Gly Leu Phe Gln Asn Arg Tyr Gly
35 40 45
Pro Asn Arg Val Gly Trp Gly Gly Ser Leu Gln Leu Val Ala Asp Met
50 55 60
Ile Lys Met Phe Phe Lys Glu Asp Trp Ile Pro Lys Phe Ser Asp Arg
65 70 75 80
Val Ile Phe Thr Leu Ala Pro Met Ile Ala Phe Thr Ser Leu Leu Leu
85 90 95
Ala Phe Ala Ile Val Pro Val Ser Pro Gly Trp Val Val Ala Asp Leu
100 105 110
Asn Ile Gly Ile Leu Phe Phe Leu Met Met Ala Gly Leu Ala Val Tyr
115 120 125
Ala Val Leu Phe Ala Gly Trp Ser Ser Asn Asn Lys Tyr Ser Leu Leu
130 135 140
Gly Ala Met Arg Ala Ser Ala Gln Thr Leu Ser Tyr Glu Val Phe Leu
145 150 155 160
Gly Leu Ser Leu Met Gly Val Val Ala Gln Ala Gly Ser Phe Asn Met
165 170 175
Thr Asp Ile Val Asn Ser Gln Ala His Val Trp Asn Val Ile Pro Gln
180 185 190
Phe Phe Gly Phe Ile Thr Phe Ala Ile Ala Gly Val Ala Val Cys His
195 200 205
Arg His Pro Phe Asp Gln Pro Glu Ala Glu Gln Glu Leu Ala Asp Gly
210 215 220
Tyr His Ile Glu Tyr Ser Gly Met Lys Phe Gly Leu Phe Phe Val Gly
225 230 235 240
Glu Tyr Ile Gly Ile Val Thr Ile Ser Ala Leu Met Val Thr Leu Phe
245 250 255
Phe Gly Gly Trp Gln Gly Pro Leu Leu Pro Pro Phe Ile Trp Phe Ala
260 265 270
Leu Lys Thr Ala Phe Phe Met Met Met Phe Ile Leu Ile Arg Ala Ser
275 280 285
Leu Pro Arg Pro Arg Tyr Asp Gln Val Met Ser Phe Gly Trp Lys Ile
290 295 300
Cys Leu Pro Leu Thr Leu Ile Asn Leu Leu Val Thr Ala Ala Val Ile
305 310 315 320
Leu Trp Gln Ala Gln
325
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<211> 180
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoI
<400> 33
Met Thr Leu Lys Glu Leu Leu Val Gly Phe Gly Thr Gln Val Arg Ser
1 5 10 15
Ile Trp Met Ile Gly Leu His Ala Phe Ala Lys Arg Glu Thr Arg Met
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
Leu Cys Ala Val Ala Cys Pro Val Gly Cys Ile Ser Leu Gln Lys Ala
65 70 75 80
Glu Thr Lys Asp Gly Arg Trp Tyr Pro Glu Phe Phe Arg Ile Asn Phe
85 90 95
Ser Arg Cys Ile Phe Cys Gly Leu Cys Glu Glu Ala Cys Pro Thr Thr
100 105 110
Ala Ile Gln Leu Thr Pro Asp Phe Glu Met Gly Glu Tyr Lys Arg Gln
115 120 125
Asp Leu Val Tyr Glu Lys Glu Asp Leu Leu Ile Ser Gly Pro Gly Lys
130 135 140
Tyr Pro Glu Tyr Asn Phe Tyr Arg Met Ala Gly Met Ala Ile Asp Gly
145 150 155 160
Lys Asp Lys Gly Glu Ala Glu Asn Glu Ala Lys Pro Ile Asp Val Lys
165 170 175
Ser Leu Leu Pro
180
<210> 34
<211> 184
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoJ
<400> 34
Met Glu Phe Ala Phe Tyr Ile Cys Gly Leu Ile Ala Ile Leu Ala Thr
1 5 10 15
Leu Arg Val Ile Thr His Thr Asn Pro Val His Ala Leu Leu Tyr Leu
20 25 30
Ile Ile Ser Leu Leu Ala Ile Ser Gly Val Phe Phe Ser Leu Gly Ala
35 40 45
Tyr Phe Ala Gly Ala Leu Glu Ile Ile Val Tyr Ala Gly Ala Ile Met
50 55 60
Val Leu Phe Val Phe Val Val Met Met Leu Asn Leu Gly Gly Ser Glu
65 70 75 80
Ile Glu Gln Glu Arg Gln Trp Leu Lys Pro Gln Val Trp Ile Gly Pro
85 90 95
Ala Ile Leu Ser Ala Ile Met Leu Val Val Ile Val Tyr Ala Ile Leu
100 105 110
Gly Val Asn Asp Gln Gly Ile Asp Gly Thr Pro Ile Ser Ala Lys Ala
115 120 125
Val Gly Ile Thr Leu Phe Gly Pro Tyr Val Leu Ala Val Glu Leu Ala
130 135 140
Ser Met Leu Leu Leu Ala Gly Leu Val Val Ala Phe His Val Gly Arg
145 150 155 160
Glu Glu Arg Ala Gly Glu Val Leu Ser Asn Arg Lys Asp Asp Ser Ala
165 170 175
Lys Arg Lys Thr Glu Glu His Ala
180
<210> 35
<211> 100
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoK
<400> 35
Met Ile Pro Leu Gln His Gly Leu Ile Leu Ala Ala Ile Leu Phe Val
1 5 10 15
Leu Gly Leu Thr Gly Leu Val Ile Arg Arg Asn Leu Leu Phe Met Leu
20 25 30
Ile Gly Leu Glu Ile Met Ile Asn Ala Ser Ala Leu Ala Phe Val Val
35 40 45
Ala Gly Ser Tyr Trp Gly Gln Thr Asp Gly Gln Val Met Tyr Ile Leu
50 55 60
Ala Ile Ser Leu Ala Ala Ala Glu Ala Ser Ile Gly Leu Ala Leu Leu
65 70 75 80
Leu Gln Leu His Arg Arg Arg Gln Asn Leu Asn Ile Asp Ser Val Ser
85 90 95
Glu Met Arg Gly
100
<210> 36
<211> 613
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoL
<400> 36
Met Asn Met Leu Ala Leu Thr Ile Ile Leu Pro Leu Ile Gly Phe Val
1 5 10 15
Leu Leu Ala Phe Ser Arg Gly Arg Trp Ser Glu Asn Val Ser Ala Ile
20 25 30
Val Gly Val Gly Ser Val Gly Leu Ala Ala Leu Val Thr Ala Phe Ile
35 40 45
Gly Val Asp Phe Phe Ala Asn Gly Glu Gln Thr Tyr Ser Gln Pro Leu
50 55 60
Trp Thr Trp Met Ser Val Gly Asp Phe Asn Ile Gly Phe Asn Leu Val
65 70 75 80
Leu Asp Gly Leu Ser Leu Thr Met Leu Ser Val Val Thr Gly Val Gly
85 90 95
Phe Leu Ile His Met Tyr Ala Ser Trp Tyr Met Arg Gly Glu Glu Gly
100 105 110
Tyr Ser Arg Phe Phe Ala Tyr Thr Asn Leu Phe Ile Ala Ser Met Val
115 120 125
Val Leu Val Leu Ala Asp Asn Leu Leu Leu Met Tyr Leu Gly Trp Glu
130 135 140
Gly Val Gly Leu Cys Ser Tyr Leu Leu Ile Gly Phe Tyr Tyr Thr Asp
145 150 155 160
Pro Lys Asn Gly Ala Ala Ala Met Lys Ala Phe Val Val Thr Arg Val
165 170 175
Gly Asp Val Phe Leu Ala Phe Ala Leu Phe Ile Leu Tyr Asn Glu Leu
180 185 190
Gly Thr Leu Asn Phe Arg Glu Met Val Glu Leu Ala Pro Ala His Phe
195 200 205
Ala Asp Gly Asn Asn Met Leu Met Trp Ala Thr Leu Met Leu Leu Gly
210 215 220
Gly Ala Val Gly Lys Ser Ala Gln Leu Pro Leu Gln Thr Trp Leu Ala
225 230 235 240
Asp Ala Met Ala Gly Pro Thr Pro Val Ser Ala Leu Ile His Ala Ala
245 250 255
Thr Met Val Thr Ala Gly Val Tyr Leu Ile Ala Arg Thr His Gly Leu
260 265 270
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275 280 285
Val Thr Leu Leu Leu Ala Gly Phe Ala Ala Leu Val Gln Thr Asp Ile
290 295 300
Lys Arg Val Leu Ala Tyr Ser Thr Met Ser Gln Ile Gly Tyr Met Phe
305 310 315 320
Leu Ala Leu Gly Val Gln Ala Trp Asp Ala Ala Ile Phe His Leu Met
325 330 335
Thr His Ala Phe Phe Lys Ala Leu Leu Phe Leu Ala Ser Gly Ser Val
340 345 350
Ile Leu Ala Cys His His Glu Gln Asn Ile Phe Lys Met Gly Gly Leu
355 360 365
Arg Lys Ser Ile Pro Leu Val Tyr Leu Cys Phe Leu Val Gly Gly Ala
370 375 380
Ala Leu Ser Ala Leu Pro Leu Val Thr Ala Gly Phe Phe Ser Lys Asp
385 390 395 400
Glu Ile Leu Ala Gly Ala Met Ala Asn Gly His Ile Asn Leu Met Val
405 410 415
Ala Gly Leu Val Gly Ala Phe Met Thr Ser Leu Tyr Thr Phe Arg Met
420 425 430
Ile Phe Ile Val Phe His Gly Lys Glu Gln Ile His Ala His Ala Val
435 440 445
Lys Gly Val Thr His Ser Leu Pro Leu Ile Val Leu Leu Ile Leu Ser
450 455 460
Thr Phe Val Gly Ala Leu Ile Val Pro Pro Leu Gln Gly Val Leu Pro
465 470 475 480
Gln Thr Thr Glu Leu Ala His Gly Ser Met Leu Thr Leu Glu Ile Thr
485 490 495
Ser Gly Val Val Ala Val Val Gly Ile Leu Leu Ala Ala Trp Leu Trp
500 505 510
Leu Gly Lys Arg Thr Leu Val Thr Ser Ile Ala Asn Ser Ala Pro Gly
515 520 525
Arg Leu Leu Gly Thr Trp Trp Tyr Asn Ala Trp Gly Phe Asp Trp Leu
530 535 540
Tyr Asp Lys Val Phe Val Lys Pro Phe Leu Gly Ile Ala Trp Leu Leu
545 550 555 560
Lys Arg Asp Pro Leu Asn Ser Met Met Asn Ile Pro Ala Val Leu Ser
565 570 575
Arg Phe Ala Gly Lys Gly Leu Leu Leu Ser Glu Asn Gly Tyr Leu Arg
580 585 590
Trp Tyr Val Ala Ser Met Ser Ile Gly Ala Val Val Val Leu Ala Leu
595 600 605
Leu Met Val Leu Arg
610
<210> 37
<211> 509
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoM
<400> 37
Met Leu Leu Pro Trp Leu Ile Leu Ile Pro Phe Ile Gly Gly Phe Leu
1 5 10 15
Cys Trp Gln Thr Glu Arg Phe Gly Val Lys Val Pro Arg Trp Ile Ala
20 25 30
Leu Ile Thr Met Gly Leu Thr Leu Ala Leu Ser Leu Gln Leu Trp Leu
35 40 45
Gln Gly Gly Tyr Ser Leu Thr Gln Ser Ala Gly Ile Pro Gln Trp Gln
50 55 60
Ser Glu Phe Asp Met Pro Trp Ile Pro Arg Phe Gly Ile Ser Ile His
65 70 75 80
Leu Ala Ile Asp Gly Leu Ser Leu Leu Met Val Val Leu Thr Gly Leu
85 90 95
Leu Gly Val Leu Ala Val Leu Cys Ser Trp Lys Glu Ile Glu Lys Tyr
100 105 110
Gln Gly Phe Phe His Leu Asn Leu Met Trp Ile Leu Gly Gly Val Ile
115 120 125
Gly Val Phe Leu Ala Ile Asp Met Phe Leu Phe Phe Phe Phe Trp Glu
130 135 140
Met Met Leu Val Pro Met Tyr Phe Leu Ile Ala Leu Trp Gly His Lys
145 150 155 160
Ala Ser Asp Gly Lys Thr Arg Ile Thr Ala Ala Thr Lys Phe Phe Ile
165 170 175
Tyr Thr Gln Ala Ser Gly Leu Val Met Leu Ile Ala Ile Leu Ala Leu
180 185 190
Val Phe Val His Tyr Asn Ala Thr Gly Val Trp Thr Phe Asn Tyr Glu
195 200 205
Glu Leu Leu Asn Thr Pro Met Ser Ser Gly Val Glu Tyr Leu Leu Met
210 215 220
Leu Gly Phe Phe Ile Ala Phe Ala Val Lys Met Pro Val Val Pro Leu
225 230 235 240
His Gly Trp Leu Pro Asp Ala His Ser Gln Ala Pro Thr Ala Gly Ser
245 250 255
Val Asp Leu Ala Gly Ile Leu Leu Lys Thr Ala Ala Tyr Gly Leu Leu
260 265 270
Arg Phe Ser Leu Pro Leu Phe Pro Asn Ala Ser Ala Glu Phe Ala Pro
275 280 285
Ile Ala Met Trp Leu Gly Val Ile Gly Ile Phe Tyr Gly Ala Trp Met
290 295 300
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305 310 315 320
Ser His Met Gly Phe Val Leu Ile Ala Ile Tyr Thr Gly Ser Gln Leu
325 330 335
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340 345 350
Ala Gly Leu Phe Ile Leu Cys Gly Gln Leu Tyr Glu Arg Ile His Thr
355 360 365
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405 410 415
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435 440 445
Lys Ser Gln Ile Ala Ser Gln Glu Leu Pro Gly Met Ser Leu Arg Glu
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Leu Phe Met Ile Leu Leu Leu Val Val Leu Leu Val Leu Leu Gly Phe
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485 490 495
Gln Gln Trp Phe Val Asn Ser Val Thr Thr Thr Arg Pro
500 505
<210> 38
<211> 425
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> NuoN
<400> 38
Met Asp Val Thr Pro Leu Met Arg Val Asp Gly Phe Ala Met Leu Tyr
1 5 10 15
Thr Gly Leu Val Leu Leu Ala Ser Leu Ala Thr Cys Thr Phe Ala Tyr
20 25 30
Pro Trp Leu Glu Gly Tyr Asn Asp Asn Lys Asp Glu Phe Tyr Leu Leu
35 40 45
Val Leu Ile Ala Ala Leu Gly Gly Ile Leu Leu Ala Asn Ala Asn His
50 55 60
Leu Ala Ser Leu Phe Leu Gly Ile Glu Leu Ile Ser Leu Pro Leu Phe
65 70 75 80
Gly Leu Val Gly Tyr Ala Phe Arg Gln Lys Arg Ser Leu Glu Ala Ser
85 90 95
Ile Lys Tyr Thr Ile Leu Ser Ala Ala Ala Ser Ser Phe Leu Leu Phe
100 105 110
Gly Met Ala Leu Val Tyr Ala Gln Ser Gly Asp Leu Ser Phe Val Ala
115 120 125
Leu Gly Lys Asn Leu Gly Asp Gly Met Leu Asn Glu Pro Leu Leu Leu
130 135 140
Ala Gly Phe Gly Leu Met Ile Val Gly Leu Gly Phe Lys Leu Ser Leu
145 150 155 160
Val Pro Phe His Leu Trp Thr Pro Asp Val Tyr Gln Gly Ala Pro Ala
165 170 175
Pro Val Ser Thr Phe Leu Ala Thr Ala Ser Lys Ile Ala Ile Phe Gly
180 185 190
Val Val Met Arg Leu Phe Leu Tyr Ala Pro Val Gly Asp Ser Glu Ala
195 200 205
Ile Arg Val Val Leu Ala Ile Ile Ala Phe Ala Ser Ile Ile Phe Gly
210 215 220
Asn Leu Met Ala Leu Ser Gln Thr Asn Ile Lys Arg Leu Leu Gly Tyr
225 230 235 240
Ser Ser Ile Ser His Leu Gly Tyr Leu Leu Val Ala Leu Ile Ala Leu
245 250 255
Gln Thr Gly Glu Met Ser Met Glu Ala Val Gly Val Tyr Leu Ala Gly
260 265 270
Tyr Leu Phe Ser Ser Leu Gly Ala Phe Gly Val Val Ser Leu Met Ser
275 280 285
Ser Pro Tyr Arg Gly Pro Asp Ala Asp Ser Leu Phe Ser Tyr Arg Gly
290 295 300
Leu Phe Trp His Arg Pro Ile Leu Ala Ala Val Met Thr Val Met Met
305 310 315 320
Leu Ser Leu Ala Gly Ile Pro Met Thr Leu Gly Phe Ile Gly Lys Phe
325 330 335
Tyr Val Leu Ala Val Gly Val Gln Ala His Leu Trp Trp Leu Val Gly
340 345 350
Ala Val Val Val Gly Ser Ala Ile Gly Leu Tyr Tyr Tyr Leu Arg Val
355 360 365
Ala Val Ser Leu Tyr Leu His Ala Pro Glu Gln Pro Gly Arg Asp Ala
370 375 380
Pro Ser Asn Trp Gln Tyr Ser Ala Gly Gly Ile Val Val Leu Ile Ser
385 390 395 400
Ala Leu Leu Val Leu Val Leu Gly Val Trp Pro Gln Pro Leu Ile Ser
405 410 415
Ile Val Arg Leu Ala Met Pro Leu Met
420 425
<210> 39
<211> 4695
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pSKH130
<400> 39
tcgaggccgc gattaaattc caacatggat gctgatttat atgggtataa atgggctcgc 60
gataatgtcg ggcaatcagg tgcgacaatc tatcgattgt atgggaagcc cgatgcgcca 120
gagttgtttc tgaaacatgg caaaggtagc gttgccaatg atgttacaga tgagatggtc 180
agactaaact ggctgacgga atttatgcct cttccgacca tcaagcattt tatccgtact 240
cctgatgatg catggttact caccactgcg atccccggga aaacagcatt ccaggtatta 300
gaagaatatc ctgattcagg tgaaaatatt gttgatgcgc tggcagtgtt cctgcgccgg 360
ttgcattcga ttcctgtttg taattgtcct tttaacagcg atcgcgtatt tcgtctcgct 420
caggcgcaat cacgaatgaa taacggtttg gttgatgcga gtgattttga tgacgagcgt 480
aatggctggc ctgttgaaca agtctggaaa gaaatgcata agcttttgcc attctcaccg 540
gattcagtcg tcactcatgg tgatttctca cttgataacc ttatttttga cgaggggaaa 600
ttaataggtt gtattgatgt tggacgagtc ggaatcgcag accgatacca ggatcttgcc 660
atcctatgga actgcctcgg tgagttttct ccttcattac agaaacggct ttttcaaaaa 720
tatggtattg ataatcctga tatgaataaa ttgcagtttc atttgatgct cgatgagttt 780
ttctaatcag aattggttaa ttggttgtaa cactggcaga gcattacgct gacttgacgg 840
gacggcggct ttgttgaata aatcgaactt ttgctgagtt gaaggatcag atcacgcatc 900
ttcccgacaa cgcagaccgt tccgtggcaa agcaaaagtt caaaatcacc aactggtcca 960
cctacaacaa agctctcatc aaccgtggct ccctcacttt ctggctggat gatggggcga 1020
ttcaggcctg gtatgagtca gcaacacctt cttcacgagg cagacctcag cgctcaaaga 1080
tgcaggggta aaagctaacc gcatctttac cgacaaggca tccggcagtt caacagatcg 1140
ggaagggctg gatttgctga ggatgaaggt ggaggaaggt gatgtcattc tggtgaagaa 1200
gctcgaccgt cttggccgcg acaccgccga catgatccaa ctgataaaag agtttgatgc 1260
tcagggtgta gcggttcggt ttattgacga cgggatcagt accgacggtg atatggggca 1320
aatggtggtc accgcgcgta atacgactca ctatagggcg aattggagct ccaccgcggt 1380
ggcggccgct ctagacttta cggtatcgcc gctcccgatt cgcagcgcat cgccttctat 1440
cgccttcttg acgagttctt ctgagcggga ctctggggtt cgctagagga tcgatccttt 1500
ttaacccatc acatatacct gccgttcact attatttagt gaaatgagat attatgatat 1560
tttctgaatt gtgattaaaa aggcaacttt atgcccatgc aacagaaact ataaaaaata 1620
cagagaatga aaagaaacag atagattttt tagttcttta ggcccgtagt ctgcaaatcc 1680
ttttatgatt ttctatcaaa caaaagagga aaatagacca gttgcaatcc aaacgagagt 1740
ctaatagaat gaggtcgaaa agtaaatcgc gcgggtttgt tactgataaa gcaggcaaga 1800
cctaaaatgt gtaaagggca aagtgtatac tttggcgtca ccccttacat attttaggtc 1860
tttttttatt gtgcgtaact aacttgccat cttcaaacag gagggctgga agaagcagac 1920
cgctaacaca gtacataaaa aaggagacat gaacgatgaa catcaaaaag tttgcaaaac 1980
aagcaacagt attaaccttt actaccgcac tgctggcagg aggcgcaact caagcgtttg 2040
cgaaagaaac gaaccaaaag ccatataagg aaacatacgg catttcccat attacacgcc 2100
atgatatgct gcaaatccct gaacagcaaa aaaatgaaaa atatcaagtt cctgaattcg 2160
attcgtccac aattaaaaat atctcttctg caaaaggcct ggacgtttgg gacagctggc 2220
cattacaaaa cgctgacggc actgtcgcaa actatcacgg ctaccacatc gtctttgcat 2280
tagccggaga tcctaaaaat gcggatgaca catcgattta catgttctat caaaaagtcg 2340
gcgaaacttc tattgacagc tggaaaaacg ctggccgcgt ctttaaagac agcgacaaat 2400
tcgatgcaaa tgattctatc ctaaaagacc aaacacaaga atggtcaggt tcagccacat 2460
ttacatctga cggaaaaatc cgtttattct acactgattt ctccggtaaa cattacggca 2520
aacaaacact gacaactgca caagttaacg tatcagcatc agacagctct ttgaacatca 2580
acggtgtaga ggattataaa tcaatctttg acggtgacgg aaaaacgtat caaaatgtac 2640
agcagttcat cgatgaaggc aactacagct caggcgacaa ccatacgctg agagatcctc 2700
actacgtaga agataaaggc cacaaatact tagtatttga agcaaacact ggaactgaag 2760
atggctacca aggcgaagaa tctttattta acaaagcata ctatggcaaa agcacatcat 2820
tcttccgtca agaaagtcaa aaacttctgc aaagcgataa aaaacgcacg gctgagttag 2880
caaacggcgc tctcggtatg attgagctaa acgatgatta cacactgaaa aaagtgatga 2940
aaccgctgat tgcatctaac acagtaacag atgaaattga acgcgcgaac gtctttaaaa 3000
tgaacggcaa atggtacctg ttcactgact cccgcggatc aaaaatgacg attgacggca 3060
ttacgtctaa cgatatttac atgcttggtt atgtttctaa ttctttaact ggcccataca 3120
agccgctgaa caaaactggc cttgtgttaa aaatggatct tgatcctaac gatgtaacct 3180
ttacttactc acacttcgct gtacctcaag cgaaaggaaa caatgtcgtg attacaagct 3240
atatgacaaa cagaggattc tacgcagaca aacaatcaac gtttgcgcca agcttcctgc 3300
tgaacatcaa aggcaagaaa acatctgttg tcaaagacag catccttgaa caaggacaat 3360
taacagttaa caaataaaaa cgcaaaagaa aatgccgatg ggtaccgagc gaaatgaccg 3420
accaagcgac gcccaacctg ccatcggatc ccccgggctg caggaattcg atatcacgct 3480
agtcgaccta gctagcatat ggggagatct actagtaaag catgccaatt ggtattctat 3540
agtgtcacct aaatcgtatg tgtatgatac ataaggttat gtattaattg tagccgcgtt 3600
ctaacgacaa tatgtacaag cctaattgtg tagcatctgg cttactgaag cagaccctat 3660
catctctctc gtaaactgcc gtcagagtcg gtttggttgg acgaaccttc tgagtttctg 3720
gtaacgccgt cccgcacccg gaaatggtca gcgaaccaat cagcagggtc atcgctagcc 3780
catggctaat tcccatgtca gccgttaagt gttcctgtgt cactcaaaat tgctttgaga 3840
ggctctaagg gcttctcagt gcgttacatc cctggcttgt tgtccacaac cgttaaacct 3900
taaaagcttt aaaagcctta tatattcttt tttttcttat aaaacttaaa accttagagg 3960
ctatttaagt tgctgattta tattaatttt attgttcaaa catgagagct tagtacgtga 4020
aacatgagag cttagtacgt tagccatgag agcttagtac gttagccatg agggtttagt 4080
tcgttaaaca tgagagctta gtacgttaaa catgagagct tagtacgtga aacatgagag 4140
cttagtacgt actatcaaca ggttgaactg ctgatcttca gatcctctac gccggacgca 4200
tcgtggccgg atcttgcggc cgcaaaaatt aaaaatgaag ttttaaatca atctaaagta 4260
tatatgagta aacttggtct gacagttacc aatgcttaat cagtgaggca ccaataactg 4320
ccttaaaaaa actagcgctg aggtctgcct cgtgaagaag gtgttgctga ctcataccag 4380
gcctgaatcg ccccatcatc cagccagaaa gtgagggagc cacggttgat gagagctttg 4440
ttgtaggtgg accagttggt gattttgaac ttttgctttg ccacggaacg gtctgcgttg 4500
tcgggaagat gcgtgatctg atccttcaac tcagcaaaag ttcgatttat tcaacaaagc 4560
cacgttgtgt ctcaaaatct ctgatgttac attgcacaag ataaaaatat atcatcatga 4620
acaataaaac tgtctgctta cataaacagt aatacaaggg gtgttatgag ccatattcaa 4680
cgggaaacgt cttgc 4695

Claims (11)

1.埃希氏菌属的重组微生物,所述重组微生物具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性和O-磷酸丝氨酸生产能力。
2.根据权利要求1所述的微生物,其中所述NADH:醌氧化还原酶活性的增强是通过增加nuo操纵子的表达而实现的。
3.根据权利要求1所述的微生物,其中所述NADH:醌氧化还原酶活性的增强包含在编码所述NADH:醌氧化还原酶的基因上游的具有增强活性的基因表达调控序列。
4.根据权利要求3所述的微生物,其中所述编码所述NADH:醌氧化还原酶的基因上游是nuoA基因的上游。
5.根据权利要求1所述的微生物,其中磷酸丝氨酸磷酸酶(SerB)的活性进一步减弱。
6.根据权利要求1所述的微生物,其中O-磷酸丝氨酸输出蛋白(YhhS)的活性进一步增强。
7.根据权利要求1所述的微生物,其中所述微生物是大肠杆菌。
8.生产O-磷酸丝氨酸的方法,其包括:在培养基中培养根据权利要求1至7中任一项所述的微生物。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述方法进一步包括从培养的培养基或微生物回收O-磷酸丝氨酸。
10.生产半胱氨酸或其衍生物的方法,其包括:
a)在培养基中培养具有增强的NADH:醌氧化还原酶活性的生产O-磷酸丝氨酸的微生物以生产O-磷酸丝氨酸或含有O-磷酸丝氨酸的培养基;以及
b)在O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶(OPSS)或表达所述O-磷酸丝氨酸硫化氢解酶的微生物存在下,使步骤a)中生产的O-磷酸丝氨酸或含有所述O-磷酸丝氨酸的培养基与硫化物反应。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述硫化物是选自Na2S、NaSH、(NH4)2S、H2S和Na2S2O3中的至少一种。
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