CN116392500A - microRNA及其在诊断和治疗中的用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及miRNA及其在诊断和治疗中的用途，具体提供miR‑494‑3p或其变体，或它们的类似物等试剂在制备预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的药物组合物中的用途。本发明证明了miRNA直接参与细胞坏死性凋亡诱导的疾病的发生并且可用于该疾病的治疗。

Description

microRNA及其在诊断和治疗中的用途
技术领域
本发明涉及生物医药领域。具体涉及用于诊断和治疗用途的microRNA。
背景技术
急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)是临床常见的急腹症之一，被定义为一种以急性炎症和胰腺实质坏死为特征的炎症性疾病，按照其严重程度分为轻症急性胰腺炎、中度重症急性胰腺炎、重症急性胰腺炎。其病因及发病机制复杂，死亡率居高不下。根据流行病学资料显示，AP患者占同期住院患者的0.27％左右，男女比例为1.29：1，平均发病年龄为53.7±23.3，且成年和儿童均可发病。目前，急性胰腺炎的治疗仍具挑战性，具有高病死率、高致残率、高额费用的特点。
急性胰腺炎的致病因素复杂，例如胆道疾病、长期过量摄取酒精、高血脂症、暴饮暴食、药物、手术和创伤以及寄生虫感染等都可引发急性胰腺炎。其中，酒精和胆源性因素占主要方面，大约80％的急性胰腺炎患者发病与过量饮酒和胆结石有关。在我国主要为胆源性胰腺炎，在欧美国家则主要是酒精性胰腺炎，这可能与不同国家和地区的饮食习惯相关。吸烟是急性胰腺炎发病的常见危险因素，严重吸烟者急性胰腺炎的发病风险升高2倍以上。此外，采用激素取代疗法、患有心脏疾病、高血压者患急性胰腺炎的发病风险亦明显上升。随着肥胖发病率的日益升高，由高血脂所致的急性胰腺炎患者也逐渐增多。
microRNA(miR或miRNA,微小RNA)是一类在较高等的真核生物体内广泛存在的，长度约18-26个碱基的单链RNA分子。它可以通过碱基配对原则特异性地与一些mRNA上的靶位点相结合，引起靶mRNA降解或翻译抑制，进而在转录后水平对靶基因进行调控。
microRNA来源于长度约为1000bp的长链RNA初始转录产物(Pri-miRNA)，Pri-miRNA在细胞核中经Drosha酶剪切形成长度约为60-80nt的具有茎环结构的miRNA前体(Pre-miRNA)。Pre-miRNA转运至胞质后，被Dicer酶进一步剪切成长约22nt的双链miRNA。双链miRNA解开后，成熟的miRNA进入RNA诱导的基因沉默复合物，与互补的mRNA完全或不完全配对，降解靶mRNA或抑制其表达。尽管microRNA在细胞总RNA中所占的比重很少，但由于它可以高效地对所有具有靶位点的mRNA产生调控作用，microRNA在生物体的发育、炎症反应以及炎症相关肿瘤发生发展中所起的作用不可忽视。
目前，急性胰腺炎和急性胰腺炎相关胰腺癌相关的microRNA绝大部分都知之甚少，因此本领域迫切需要探究microRNA在急性胰腺炎和急性胰腺炎相关胰腺癌中的作用，以期开发出有效的治疗药物。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于检测和治疗胰腺炎的microRNA，miR-494-3p。
本发明第一方面提供试剂在制备预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的药物组合物中的用途；其中，所述的试剂选自下组：
(a)miR-494-3p或其变体，或它们的类似物；
(b)miR-494-3p的前体物；
(c)多核苷酸，其能转录为(b)中所述的miR-494-3p的前体物，或能在宿主内加工成(a)中所述的miR-494-3p；
(d)核酸构建物，所述的核酸构建物含有(a)、(b)或(c)；
(e)(a)的激动剂。
在一个或多个实施方案中，所述细胞坏死性凋亡是Tyro3/MLKL信号通路相关的细胞坏死性凋亡。
在一个或多个实施方案中，所述细胞坏死性凋亡是由MLKL寡聚化诱导的细胞坏死性凋亡。
在一个或多个实施方案中，所述疾病是受益于Tyro3蛋白水平下调的疾病。
在一个或多个实施方案中，所述疾病是受益于MLKL的Tyr376的磷酸化水平下调的疾病。
在一个或多个实施方案中，所述疾病是胰腺炎。在一个或多个实施方案中，所述胰腺炎是miR-494-3p表达下调导致的胰腺炎；优选地，所述胰腺炎包括急性胰腺炎。
在一个或多个实施方案中，所述变体是与miR-494-3p具有至少80％，至少90％，至少95％，至少98％，或至少99％序列相同性的变体。
在一个或多个实施方案中，所述类似物是衍生物，优选经修饰的衍生物。
在一个或多个实施方案中，所述衍生物是RNA诱导沉默复合物(RISC)、miR-494-3pagomir或miR-494-3p mimic。
在一个或多个实施方案中，miR-494-3p的前体物是前体miRNA或初级miRNA。
在一个或多个实施方案中，miR-494-3p的核苷酸序列如SEQ ID NO:20所示。
在一个或多个实施方案中，所述miR-494-3p来源于人或非人哺乳动物。
在一个或多个实施方案中，所述的非人哺乳动物为大鼠、小鼠。
在一个或多个实施方案中，所述的宿主为：人或啮齿动物(如：大鼠、小鼠)。
在一个或多个实施方案中，所述核酸构建物为表达载体或整合载体，包括但不限于：质粒、或病毒载体；更佳的，所述病毒载体为腺病毒载体、或腺病毒相关载体。
在一个或多个实施方案中，所述多核苷酸或核酸构建物具有式(I)所示的结构：
Seq正向-X-Seq反向 (I)
式(I)中，Seq正向为能在宿主中被加工成miR-494-3p的核苷酸序列；
Seq反向为与Seq正向基本上互补或完全互补的核苷酸序列；
X为位于Seq正向和Seq反向之间的间隔序列，并且所述间隔序列与Seq正向和Seq反向不互补。
在一个或多个实施方案中，式(I)所示的结构在细胞中形成式(II)所示的二级结构：
Figure BDA0003439934300000031
式(II)中，Seq正向、Seq反向和X的定义如上述，||表示在Seq正向和Seq反向之间的碱基互补配对的关系。
在一个或多个实施方案中，miR-494-3p的激动剂选自下组：促进miR-494-3p表达的物质、提高miR-494-3p活性的物质。
在一个或多个实施方案中，前体miRNA的序列如SEQ ID NO:21所示。
在一个或多个实施方案中，所述的前体miRNA来源于人。
在一个或多个实施方案中，所述试剂通过抑制Tyro3/MLKL信号通路发挥作用，或通过下调Tyro3蛋白水平、抑制MLKL寡聚化、下调MLKL的Tyr376的磷酸化水平发挥作用
本发明另一方面提供一种诊断细胞坏死性凋亡诱导的疾病的方法，所述方法包括：分别检测待测样本和对照样本miR-494-3p的水平，如果与对照样本相比，待测样本的miR-494-3p的水平存在显著性降低，则是潜在的细胞坏死性凋亡诱导的疾病患病样本；其中，所述对照样本呈现正常的miR-494-3p水平或健康者的miR-494-3p水平。
在一个或多个实施方案中，所述的显著性降低是指：与对照样本相比，所述miR-494-3p的表达水平的降低幅度≥10％，较佳地≥20％，较佳地≥50％，更佳地≥80％，最佳地≥100％。
在一个或多个实施方案中，所述的检测是不以获得疾病诊断结果为目的的。
在一个或多个实施方案中，所述的检测方法还包括：比较待测样本和对照样本的选自以下的一项或多项：Tyro3蛋白水平、MLKL寡聚化水平、MLKL的Tyr376的磷酸化水平，其中，若Tyro3蛋白水平升高和/或MLKL寡聚化水平升高和/或MLKL的Tyr376的磷酸化水平提高，则待测样本是潜在的细胞坏死性凋亡诱导的疾病样本。
在本发明的另一方面，提供一种检测miR-494-3p的试剂在制备诊断细胞坏死性凋亡诱导的疾病的试剂盒中的用途。
在一个或多个实施方案中，所述试剂是检测miR-494-3p的特异性抗体、特异性探针、或特异性引物。
在一个或多个实施方案中，所述试剂盒还包括检测选自以下的一项或多项的试剂：Tyro3蛋白水平、MLKL寡聚化水平、MLKL的Tyr376的磷酸化水平。
在一个或多个实施方案中，所述试剂盒还包括免疫学检测、核酸杂交、或核酸扩增所需的其他试剂，例如缓冲液、二价离子、dNTP、或聚合酶等。
在本发明的另一方面，提供一种筛选预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质的方法，所述方法包括：
(1)用候选物质处理表达miR-494-3p的体系；和
(2)检测所述体系中miR-494-3p的表达情况；
其中，若所述候选物质可提高miR-494-3p的表达，则表明该候选物质是预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质。
在另一优选例中，步骤(1)包括：在测试组中，将候选物质加入到表达miR-494-3p的体系中；和/或
步骤(2)包括：检测测试组的体系中miR-494-3p的表达，并与对照组比较，其中所述的对照组是不添加所述候选物质的表达miR-494-3p的体系；
如果测试组中miR-494-3p的表达在统计学上高于(优选显著高于，如高20％以上，较佳的高50％以上；更佳的高80％以上)对照组，就表明该候选物是预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质。
在一个或多个实施方案中，所述方法还包括，检测测试组体系中Tyro3的表达、MLKL寡聚化、或MLKL的Tyr376的磷酸化，并与对照组比较，其中所述的对照组是不添加所述候选物质的测试组相同体系。
在一个或多个实施方案中，所述的体系选自：细胞体系(如表达miR-494-3p的细胞)(或细胞培养物体系)、亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系。
在一个或多个实施方案中，所述的方法还包括：对获得的潜在物质进行进一步的细胞实验和/或动物试验，以从候选物质中进一步选择和确定对于预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病有用的物质。
在本发明的另一方面，提供了一种预防和治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的方法，包括给需要的对象施用含有试剂和药学上可接受的辅料的药物组合物，所述试剂选自以下的一种或多种：
(a)miR-494-3p或其变体，或它们的类似物；
(b)miR-494-3p的前体物；
(c)多核苷酸，其能转录为(b)中所述的miR-494-3p的前体物，或能在宿主内加工成(a)中所述的miR-494-3p；
(d)核酸构建物，所述的核酸构建物含有(a)、(b)或(c)；
(e)(a)的激动剂。
在一个或多个实施方案中，所述的对象包括人。
应理解，在本发明范围内中，本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以相互组合，从而构成新的或优选的技术方案。
附图说明
下面附图用于说明本发明的具体实施方案，而不用于限定由权利要求书所界定的本发明范围。
图1显示miR-494-3p敲除本身不影响小鼠的胰腺组织结构。(a)显示miR-494-3p敲除小鼠(miR-494-3p-/-)的胰腺组织中miR-494-3p相对水平显著低于野生型小鼠(WT)，因此miR-494-3p敲除成功；(b)显示8周龄miR-494-3p敲除小鼠与同龄野生型小鼠的胰腺组织结构类似，比例尺：50um；以上所述的附图中***P<0.001。
图2显示L-Arg/雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p-/-的小鼠比野生型小鼠表现出了更严重的急性胰腺炎现象。(a)和(d)为两种急性胰腺炎模型构建图。(b)显示，L-Arg腹腔注射小鼠48h后，miR-494-3p-/-小鼠较野生型小鼠表达更高的血清淀粉酶活性；(c)显示，miR-494-3p-/-小鼠的胰腺组织结构较野生型小鼠呈现更严重的水肿、坏死和炎症因子浸润，比例尺：50um。(e)显示,雨蛙素腹腔注射小鼠24h后，miR-494-3p-/-小鼠的胰腺组织结构较野生型小鼠呈现更严重的水肿、充血、炎症因子浸润和坏死，比例尺：50um。(f)、(g)、(i)分别显示野生型小鼠/大鼠腹腔注射L-Arg或雨蛙素后，小鼠/大鼠胰腺组织中miR-494-3p水平均显著降低；(h)显示医院提供的临床样本中，相较于健康人群，急性胰腺炎病人的血浆样本中miR-494-3p的水平显著降低；以上所述的附图中*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001。
图3显示在L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，坏死性凋亡参与了急性胰腺炎的发生发展。(a)和(b)显示在两种模型中，p-RIPK3(RIPK3的活化形式)及p-MLKL(MLKL的活性形式)蛋白水平均显著升高；(c)显示在雨蛙素模型中，给予小鼠腹腔注射RIPK1的抑制剂Nec-1处理，(d)显示，小鼠的胰腺组织破坏程度显著降低，比例尺：50um；(e)显示，胰腺组织中p-MLKL(MLKL的活化形式)的蛋白水平显著降低。
图4显示在体外诱导的坏死性凋亡中，miR-494-3p模拟物抑制坏死性凋亡发生，显著促进细胞存活。(a)、(b)、(c)分别显示，在MEF细胞、L929细胞和HT-29细胞中转染miR-494-3p mimic提高miR-494-3p表达后，可以显著抑制mTNFa、z-VAD、Smac(TSZ)联合处理诱导的细胞坏死性凋亡，提高细胞存活率；(d)显示，miR-494-3p mimic也可以显著抑制MEF细胞中mTNFa、CHX、z-VAD(TCZ)联合处理诱导的细胞坏死性凋亡，提高细胞存活率；(e)、(f)显示，在MEF细胞中转染miR-494-3p抑制剂抑制miR-494-3p功能后，可以显著降低TSZ/TCZ联合处理下的细胞存活率；以上所述的附图中*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001。
图5显示miR-494-3p模拟物显著抑制坏死性凋亡发生过程中的MLKL寡聚化。(a)、(b)、(c)分别显示，在MEF细胞、L929细胞、HT-29细胞中，TSZ诱导坏死性凋亡，细胞转染miR-494-3p mimic致miR-494-3p过表达后，非还原性PAGE结果显示MLKL的寡聚化水平被显著抑制；(d)显示，L929细胞中免疫荧光结果也表明miR-494-3p mimic能显著抑制MLKL寡聚化。
图6显示miR-494-3p靶向调节Tyro3。(a)显示miR-494-3p和Tyro3 mRNA 3’UTR序列存在序列互补；(b)显示在双荧光素酶报告基因实验中，miR-494-3p mimic显著抑制了Tyro3 mRNA 3’UTR的荧光信号，而对其突变序列的荧光信号没有影响；(c)显示在MEF细胞和L929细胞中诱导坏死性凋亡，miR-494-3p mimic显著下调了Tyro3在蛋白水平的表达；(d)显示在L929细胞中，miR-494-3p mimic显著下调了MLKL(Tyr376)表达；以上所述的附图中*P<0.05。
图7显示过表达Tyro3可以显著抑制miR-494-3p对细胞存活的作用。(a)显示在L929细胞中诱导坏死性凋亡，过表达Tyro3可以显著抑制miR-494-3p对MLKL寡聚化的下调作用；(b)显示在L929细胞中过表达Tyro3可以显著抑制miR-494-3p对细胞存活的促进作用；以上所述的附图中**P<0.01，***P<0.001。
图8显示在L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p agomir保护了小鼠的胰腺组织。(a)和(e)分别显示L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3pagomir尾静脉注射的实验设计思路图；(b)和(f)分别显示L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p agomir尾静脉注射显著增加了胰腺组织中的miR-494-3p表达；(c)和(g)分别显示miR-494-3p agomir处理后，小鼠血清中淀粉酶活性显著下降；(d)和(h)分别显示miR-494-3p agomir治疗后，小鼠的胰腺组织破坏程度显著降低；(i)显示在雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p agomir治疗后，小鼠胰腺组织中炎症因子水平显著下调；(j)和(k)显示在雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p agomir治疗后，小鼠胰腺组织中Tyro3在蛋白水平和mRNA水平均显著下调；(l)显示在分离的小鼠原代胰腺腺泡细胞中诱导坏死性凋亡，miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠中的MLKL寡聚化水平显著下调；以上所述的附图中*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001。(d)的比例尺：100um。
图9显示小鼠胰腺长期过表达miR-494-3p不会对小鼠造成显著的毒副作用。(a)显示miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠的胰腺组织中miR-494-3p相对水平显著高于miR-494-3p flox/flox小鼠，因此miR-494-3p过表达成功；(b)显示相同饲养条件下，52周龄miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠与同龄miR-494-3p flox/flox小鼠的血清淀粉酶水平没有显著差异；(c)显示相同饲养条件下，miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠与同龄miR-494-3p flox/flox小鼠胰腺组织结构类似；(d)显示相同饲养条件下，miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠与同龄miR-494-3p flox/flox小鼠的体重、肝脏/体重比、脾脏/体重比、结肠长度均没有显著差异；以上所述的附图中*P<0.05。
具体实施方式
本发明人经过广泛而深入的研究，发现miRNA：miR-494-3p或其变体或类似物直接参与细胞坏死性凋亡诱导的疾病(例如胰腺炎)的发生和发展；胰腺炎发生过程中，miR-494-3p被下调；施用miR-494-3p模拟物可以缓解胰腺炎。发明人还发现，miR-494-3p通过抑制Tyro3的表达，能够下调MLKL的Tyr376磷酸化，继而抑制MLKL的寡聚化，阻断Tyro3/MLKL信号通路，从而抑制细胞坏死性凋亡。因此，miR-494-3p可以作为胰腺炎以及细胞坏死性凋亡诱导的疾病的诊断或治疗靶点。
miRNA及其前体
如本文所用，所述的“miRNA”是指一种RNA分子，从可形成miRNA前体的转录物加工而来。成熟的miRNA通常具有18-26个核苷酸(nt)(优选地约19-22nt)，也不排除具有其它数目核苷酸的miRNA分子。miRNA通常可被Northern印迹检测到。miRNA可被从细胞中分离。
miRNA的前体物包括初级miRNA(primary miRNA，Pri-mRNA)和前体miRNA(Precursor miRNA，Pre-miRNA)。miRNA的形成过程包括：首先在细胞核内转录出较长的初级miRNA，然后由Drosha加工成前体miRNA，在转运复合物的帮助下被转运出细胞核，在胞浆中由Dicer剪切成为成熟miRNA，随即被整合进RNA诱导的基因沉默复合物(RNA-inducedsilencing complex，RISC，由miRNA与Argonaute蛋白和Dicer酶形成的复合物)中，基于与mRNA完全或不完全配对来调节基因表达。所述的前体miRNA可折叠成一种稳定的茎环(发夹)结构，所述的茎环结构长度一般在50-100bp之间。所述的前体miRNA可折叠成稳定的茎环结构，茎环结构的茎部两侧包含基本上互补的两条序列。所述的前体miRNA可以是天然的或是人工合成的。
前体miRNA可被剪切生成miRNA，所述的miRNA可与编码基因的mRNA的至少一部分序列基本上互补。如本文中所用的，“基本上互补”是指核酸的序列是足够互补的，可以以一种可预见的方式发生相互作用，如形成二级结构(如茎环结构)。通常，两条“基本上互补”的核苷酸序列互相之间至少70％的核苷酸是互补的；优选的，至少80％的核苷酸是互补的；更优选的，至少有90％的核苷酸是互补的；进一步优选的，至少95％的核苷酸是互补的；如98％、99％或100％。一般地，两条足够互补的分子之间可以具有最多40个不匹配的核苷酸；优选的，具有最多30个不匹配的核苷酸；更优选的，具有最多20个不匹配的核苷酸；进一步优选的，具有最多10个不匹配的核苷酸，如具有1、2、3、4、5、8、11个不匹配的核苷酸。
如本文所用，“茎环”结构也被称为发夹结构，是指一种核苷酸分子，其可形成一种包括双链区域(茎部)的二级结构，所述的双链区域由该核苷酸分子的两个区域(位于同一分子上)形成，两个区域分列双链部分两侧；其还包括至少一个“环”结构，包括非互补的核苷酸分子，即单链区域。即使该核苷酸分子的两个区域不是完全互补的，核苷酸的双链部分也保持双链状态。例如，插入、缺失、取代等可导致一个小区域的不互补或该小区域自身形成茎环结构或其它形式的二级结构，然而，该两个区域仍可基本上互补，并在可预见的方式中发生相互作用，形成茎环结构的双链区域。茎环结构是本领域技术人员所熟知的，通常在获得了一条具有一级结构的核苷酸序列后，本领域技术人员能够确定该核酸是否能形成茎环结构。
本发明所述的miRNA包括：miR-494-3p或其变体，以及它们的类似物(例如衍生物)。其中，miR-494-3p的核苷酸如SEQ ID NO:20所示。所述变体与miR-494-3p序列有一个到多个核苷酸的差异但是保留miR-494-3p的功能，例如与miR-494-3p具有至少80％，至少90％，至少95％，至少98％，或至少99％序列相同性但保留miR-494-3p的功能的变体。所述变体还包含RNA的DNA相应物。
miR-494-3p或其变体的类似物(例如衍生物)可以是增加miR-494-3p或其变体的含量的试剂。通常，它们在体内表达为miR-494-3p或其变体。作为衍生物的一种，本领域的普通技术人员可以使用通用的方法对miR-494-3p或其变体进行修饰，修饰的方式包括(但不限于)：烃基修饰、糖基化修饰、核酸化修饰、肽段修饰、脂类修饰、卤素修饰、甲基化修饰、甲氧基化修饰、硫代修饰、胆固醇修饰、烷基修饰、锁核酸修饰、肽核酸修饰、和/或磷酸骨架由磷脂连接代替的修饰等。其中，糖基化修饰基团包括：2-甲氧基-糖基、烃基-糖基、糖环基等。为了提高miRNA的稳定性或其他性质，还可在所述的miRNA的至少一端加上至少一个保护碱基，如“TT”等。示例性衍生物包括miR-494-3p的模拟物：miR-494-3p agomir和miR-494-3p mimic。
上述经修饰的衍生物(本文还称为修饰变体)还可以是具有式(III)结构的单体或多聚体：
(X)n-(Y)m 式(III)
其中，X为序列如SEQ ID NO:20所示的miR-494-3p或其变体；n为任选自1-50的(较佳地1-20，如5，10，15)正整数；例如，n为1、2、3、或5；Y为促进miRNA施药稳定性的修饰物，其与X共价连接或偶联或附着于X；m为1-1500的正整数，较佳地1-200，如10，20，50，100，150。
在另一优选例中，所述Y包括但不限于：胆固醇、类固醇、甾醇、醇、有机酸、脂肪酸、酯、单糖、多糖、氨基酸、多肽、单核苷酸、多核苷酸。
miR-494-3p的衍生物还可以是含有miR-494-3p的RNA诱导沉默复合物。
多核苷酸以及核酸构建物
根据本发明所提供的miRNA序列，可设计出在被导入后可被加工成可影响相应的miRNA表达的miRNA的多核苷酸，也即所述多核苷酸能够在体内上调相应的miRNA的量。因此，本发明提供了一种分离的多核苷酸，所述的多核苷酸可被细胞(例如动物细胞)转录成前体miRNA，所述的前体miRNA可被宿主(如人细胞)加工成所述的miRNA。本文中，miR-494-3p的前体miRNA的序列如SEQ ID NO:21所示。
作为本发明的一种优选方式，所述的miR-494-3p多核苷酸含有式(I)所示的结构：
Seq正向-X-Seq反向 (I)
式(I)中，Seq正向为能在宿主中被加工成miR-494-3p的核苷酸序列；Seq反向为与Seq正向基本上互补或完全互补的核苷酸序列；X为位于Seq正向和Seq反向之间的间隔序列，并且所述间隔序列与Seq正向和Seq反向不互补。
式(I)所示的结构在转入细胞后，形成式(II)所示的二级结构：
Figure BDA0003439934300000111
式(II)中，Seq正向、Seq反向和X的定义如上述，||表示在Seq正向和Seq反向之间的碱基互补配对的关系。
通常，所述的多核苷酸位于核酸构建物上，例如表达载体或整合载体上。因此，本发明还包括一种载体，它含有所述的miRNA，或所述的多核苷酸。所述的核酸构建物(例如表达载体)通常还含有启动子、复制起始点和/或标记基因等。本领域的技术人员熟知的方法能用于构建本发明所需的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等。所述的表达载体优选地包含一个或多个选择性标记基因，以提供用于选择转化的宿主细胞的表型性状，如卡拉霉素、庆大霉素、潮霉素、氨苄青霉素抗性。
药物组合物和药物制备
本发明提供了一种用于治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的药物组合物，包括药学上可接受的辅料或有效量的选自下组的一种或多种活性成分：(a)miR-494-3p或其变体，或它们的类似物(例如衍生物)；(b)miR-494-3p的前体物；(c)多核苷酸，其能转录为(b)中所述的miR-494-3p的前体物，或能在宿主内加工成(a)中所述的miR-494-3p；(d)核酸构建物，所述的核酸构建物含有(a)、(b)或(c)；(e)(a)的激动剂。核酸构建物核酸构建物在一个或多个实施方案中，活性成分具有如前所述的式(II)或式(III)所示的结构。
发明人发现，miR-494-3p通过抑制Tyro3的表达，能够下调MLKL的Tyr376磷酸化，继而抑制MLKL的寡聚化，阻断Tyro3/MLKL信号通路。因此，本文所述的药物组合物可以治疗由Tyro3/MLKL信号通路引起的细胞坏死性凋亡所诱导的疾病，特别是受益于Tyro3蛋白水平下调或受益于MLKL的Tyr376的磷酸化水平下调的疾病，例如胰腺炎(急性胰腺炎)。所述的急性胰腺炎是miR-494-3p表达下调导致的炎症性疾病。
作为本发明的优选方式，所述的miR-494-3p来源于人或非人哺乳动物(例如大鼠、小鼠)。
本文所述的激动剂可以刺激miR-494-3p或其变体的表达、提高miR-494-3p活性。本发明包括本领域已知的任何miR-494-3p的激动剂。如本发明所用，术语“有效量”或“有效剂量”是指可对人和/或动物产生功能或活性的且被人和/或动物所接受的量。
如本文中所用，“药学上可接受的”的成分是适用于人和/或哺乳动物而无过度不良副反应(如毒性、刺激和反应)的，即具有合理的效益/风险比的物质。
本发明的药物组合物含有安全有效量的本发明的活性成分以及药学上可接受的辅料。术语“药学上可接受的辅料”指用于治疗剂给药的辅料，包括各种赋形剂和稀释剂。这类辅料包括(但不限于)：盐水、缓冲液、葡萄糖、水、甘油、乙醇、及其组合。通常药物制剂与给药方式匹配，本发明的药物组合物的剂型为注射剂、口服制剂(片剂、胶囊、口服液)、透皮剂、缓释剂。例如用生理盐水或含葡萄糖和其他辅剂的水溶液通过常规方法进行制备。本发明的药学上可接受的辅料包括适用于核酸递送，特别是miRNA或其前体物或多核苷酸递送的辅料。所述的药物组合物宜在无菌条件下制造。
本发明所述的活性成分可随给药的模式和待治疗的疾病的严重程度等而变化。优选的有效量的选择可以由本领有普通技术人员根据各因素来确定(例如通过临床试验)。所述的因素包括(但不限于)：所述的活性成分的药代动力学参数例如生物利用率、代谢、半衰期等；患者所要治疗的疾病严重程度、患者体重、患者的免疫状况、给药的途径等。通常，当本发明的活性成分每天以约0.00001mg-50mg/kg动物体重(较佳的0.0001mg-10mg/kg动物体重)的剂量给予，能得到令人满意的效果。例如，由治疗状况的迫切要求，可每天给予若干次分开的剂量，或将剂量按比例地减少。
本发明所述的药学上可接受的辅料包括(但不限于)：脂质体、纤维素、纳米凝胶载体的选择应与给药方式相匹配，这些都是本领域普通技术人员所熟知的。
本发明还提供了上述活性成分在制备药物中的用途，所述药物用于治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病，例如由Tyro3/MLKL信号通路引起的细胞坏死性凋亡所诱导的疾病，特别是受益于Tyro3蛋白水平下调或受益于MLKL的Tyr376的磷酸化水平下调的疾病。
诊断方法及试剂盒
本发明还提供了一种诊断细胞坏死性凋亡诱导的疾病的方法，在一个优选例中，包括步骤：分别检测待测样本和对照样本miR-494-3p的表达水平，如果与对照样本相比，待测样本的miR-494-3p的表达水平存在显著性降低，则是潜在的细胞坏死性凋亡诱导的疾病患病样本；其中，所述的对照样本呈现正常的miR-494-3p表达水平或健康者的miR-494-3p表达水平。较佳地，所述的显著性降低是指：与对照样本相比，所述miR-494-3p的表达水平的降低幅度≥10％，较佳地≥20％，较佳地≥50％，更佳地≥80％，最佳地≥100％。本发明还提供一种诊断细胞坏死性凋亡诱导的疾病的试剂盒，包含检测miR-494-3p的试剂，所述试剂是检测miR-494-3p的特异性抗体、特异性探针、或特异性引物。所述试剂盒还包括免疫学检测、核酸杂交、或核酸扩增所需的其他试剂，例如缓冲液、二价离子、dNTP、或聚合酶等。
所述的检测方法还可包括：比较待测样本和对照样本的选自以下的一项或多项：Tyro3蛋白水平、MLKL寡聚化水平、MLKL的Tyr376的磷酸化水平，其中，若Tyro3蛋白水平升高和/或MLKL寡聚化水平升高和/或MLKL的Tyr376的磷酸化水平提高，则待测样本是潜在的细胞坏死性凋亡诱导的疾病样本。因此，上述检测试剂盒还可包括检测选自以下的一项或多项的试剂：Tyro3蛋白水平、MLKL寡聚化水平、MLKL的Tyr376的磷酸化水平。本领域知晓进行这些检测所需的试剂。例如，检测蛋白水平的试剂例如抗体以及免疫反应检测所需的缓冲液等；寡聚化水平和磷酸化水平的检测试剂例如磷酸化特异性抗体、基于ELISA的检测试剂、流式细胞术检测试剂等。
药物筛选
在得知了miR-494-3p与细胞坏死性凋亡诱导的疾病的密切相关性后，可以基于该特征来筛选上调miR-494-3p的表达的物质。可从所述的物质中找到对于预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病(例如急性胰腺炎)有用的(潜在)物质。
因此，本发明提供一种筛选预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质的方法，所述方法包括：(1)用候选物质处理表达miR-494-3p的体系；和(2)检测所述体系中miR-494-3p的表达情况；其中，若所述候选物质可提高iR-494-3p的表达，则表明该候选物质是预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病(例如急性胰腺炎)的潜在物质。所述方法还可包括，检测测试组体系中Tyro3的表达、MLKL寡聚化、或MLKL的Tyr376的磷酸化，并与对照组比较。
所述的表达miR-494-3p的体系例如可以是细胞(或细胞培养物)体系，所述的细胞可以是内源性表达miR-494-3p的细胞；或可以是重组表达miR-494-3p的细胞。所述的表达miR-494-3p的体系还可以是亚细胞体系、溶液体系、组织体系、器官体系或动物体系(如动物模型，优选非人哺乳动物的动物模型，如鼠、兔、羊、猴等)等。
在本发明的优选方式中，在进行筛选时，为了更易于观察到miR-494-3p的表达的改变，还可设置对照组，所述的对照组可以是不添加所述候选物质的测试组相同体系。
作为本发明的优选方式，所述的方法还包括：对获得的潜在物质进行进一步的细胞实验和/或动物试验，以进一步选择和确定对于预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病真正有用的物质。
本发明对于miR-494-3p的表达、活性、存在量或分泌情况的检测方法没有特别的限制。可以采用常规的定量或半定量检测技术。
另一方面，本发明还提供了采用所述筛选方法获得的预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质。这些初步筛选出的物质可构成一个筛选库，以便于人们最终可以从中筛选出能够对于上调miR-494-3p的表达和活性，进而预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病有用的物质。
本发明的主要优点在于：
(1)本发明揭示了miRNA在L-Arg或雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎中的调控作用，证明了miRNA直接参与急性胰腺炎的发生，将miRNA和急性胰腺炎的发生直接联系在一起；
(2)在L-Arg或雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎模型中，组织中miR-494-3p的表达水平会伴随着急性胰腺炎的发展而降低；
(3)在L-Arg或雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎模型中，miR-494-3p敲除小鼠比野生型小鼠表现出更严重的炎症反应(包括：胰腺组织水肿，充血，炎症因子浸润，坏死更加严重)以及Tyro3/MLKL信号通路的活化。
(4)在L-Arg或雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎模型中，小鼠尾静脉注射miR-494-3p模拟物可以显著抑制急性胰腺炎的发展以及Tyro3/MLKL信号通路的活化。
下面结合具体实施例，进一步阐述本发明。应理解，这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件如J.萨姆布鲁克等编著，分子克隆实验指南，第三版，科学出版社，2002中所述的条件，或按照制造厂商所建议的条件。
实施例
材料与方法
C57BL/6背景的miR-494-3p-/-小鼠胚胎干细胞购自美国MMRRC(Mutant MouseResource&Research Centers)并委托南方模式生物公司进行胚胎解冻和胚胎移植。C57BL/6购买自上海灵畅生物科技有限公司。
miR-494-3p敲除小鼠基因型鉴定引物序列见表1。
表1
SEQ ID NO: 引物方向 引物序列(5’-3’)
1 正向 GGTCGCTTCTCATCACCCAC
2 反向1 AGTAGAAGGTGGCGCGAAGG
3 反向2 GGGAAGCAGCCAATGATTTG
Q-PCR引物见表2。
表2
Figure BDA0003439934300000161
Figure BDA0003439934300000171
miR-494-3p敲除小鼠(miR-494-3p-/-)的建立
C57BL/6背景的miR-494-3p-/-小鼠胚胎干细胞购自美国MMRRC(Mutant MouseResource&Research Centers)：简单来讲，将靶向载体LoxP-F3-PGK-EM7-PuroΔtk-bpA-LoxP-FRT转染到野生型小鼠的胚胎干细胞(ES细胞)中，靶向载体的序列通过同源重组的方法置换野生型小鼠中的胚胎干细胞中的miR-494序列，进而得到中靶的ES细胞。中靶的胚胎干细胞可以在EM7/PGK启动子的作用下表达puromycin/thymidine kinase活性进而成功抵抗puromycin的筛选。购买的胚胎干细胞委托上海南方模式生物公司构建基因敲除小鼠：首先将胚胎干细胞显微注射入小鼠的囊胚腔中，再将注射后的囊胚移植到假孕小鼠的子宫内即可繁殖得到嵌合体小鼠，雄性嵌合体小鼠与野生型雌鼠交配即可繁殖得到基因敲除小鼠。
miR-494-3p模拟物
miR-494-3p模拟物包括miR-494-3p agomir(产品编号miR40003182-4-5)和miR-494-3p mimic(产品编号miR10003182-1-5)，均由锐博生物公司合成和修饰。
miR-494-3p agomir序列为：UGAAACAUACACGGGAAACCUC(SEQ ID NO:18)，该序列经过甲基化和胆固醇修饰。
control agomir序列为：UCACAACCUCCUAGAAAGAGUAGA(SEQ ID NO:19)，该序列经过甲基化和胆固醇修饰。
L-Arg诱导的急性胰腺炎/重症急性胰腺炎模型
急性胰腺炎模型：将6-8周龄雄性小鼠标记并记录体重，每组小鼠8-10只，小鼠禁食，给予0.9％生理盐水喂养。根据小鼠体重，10％L-Arg以4g/kg的剂量腹腔注射给小鼠，时间间隔1h，共注射两次。分别于48h，72h后麻醉小鼠，取血、胰腺组织。
重症急性胰腺炎模型：将相应的约200g SD雄性大鼠标记并记录体重，每组大鼠10-12只，大鼠禁食，给予0.9％生理盐水喂养，根据大鼠体重，10％L-Arg以4g/kg的剂量腹腔注射给大鼠，时间间隔1h，共注射两次。分别于24h，48h，72h等时间点麻醉大鼠，取血、胰腺组织。
雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型
将6-8周龄雄性小鼠标记并记录体重，每组小鼠8-10只，小鼠禁食，给予0.9％生理盐水喂养。根据小鼠体重，雨蛙素以50ug/kg的剂量腹腔注射给小鼠，时间间隔1h，连续注射12h，第一针注射24h后麻醉小鼠，取血、胰腺组织。
小鼠原代胰腺腺泡细胞的分离和培养
在无菌环境下将小鼠胰腺组织取出，置于新的无菌HBSS中，用无菌剪刀将胰腺剪成4到5mm的组织块。继续用上述HBSS溶液洗涤三次后，收集含有胰腺组织的HBSS，4℃，720g离心2min。吸除上清，将组织块置于5ml配制好的含有胶原酶的HBSS中并置于37℃消化1小时。消化完成后，加入5ml含有5％FBS的HBSS终止消化，4℃，720g离心2min，小心吸除上清,用5ml含有5％FBS的HBSS重悬，4℃，800g离心2min，该步骤重复两遍。继续用5ml含有5％FBS的HBSS重悬后可过滤，过滤后的液体小心滴加至20ml含有30％FBS的HBSS中，轻轻颠倒混匀后4℃，400g离心2min。弃去上清，将沉淀用新配置的含有10％FBS、10％大豆胰蛋白酶抑制剂、1％双抗和0.1％地塞米松的Way’s media重悬。细胞计数后可铺至培养皿中，待细胞贴壁24小时后更换新鲜培养基以供后续实验。
免疫组化以及拍照
小鼠胰腺组织免疫组化按照常用的方法操作；为了更好的脱蜡，石蜡切片事先在65℃烘箱中放置30min-1h；为了获得更好的抗原活性，所有实验采用高压锅修复抗原。免疫组化图像使用高通量生物组织处理分析系统vectra2拍摄。
反转录PCR(RT-PCR)和实时定量PCR(Real-time Q-PCR)
小鼠胰腺组织使用TRIzol reagent(TaKaRa)裂解，并按照说明书操作提取总RNA。每个样品取1ug RNA，使用PrimeScriptTMRT reagent Kit(Prefect Real Time)试剂盒(TaKaRa)反转录。实时定量PCR使用HieffTM qPCR SYBR Green Master Mix试剂盒(翊圣生物科技公司)，在Applied Biosystems 7900sequence Detection System上进行。反应体系为10ul，包含2ul RT-PCR产物、0.5uM引物和5ul HieffTM qPCR SYBR Green Master Mix。反应条件为95℃5分钟，(95℃10秒，60℃30秒)×40。所有的反应重复3次，使用GAPDH作为内参。miR-494-3p的定量使用U6作为内参。
免疫印迹分析
小鼠的胰腺组织或转染后细胞，使用RIPA裂解液裂解30min，冷冻离心后取上清为蛋白裂解液。蛋白定量后进行SDS-PAGE电泳。电泳后将蛋白转移到硝酸纤维膜上，用5％脱脂牛奶封闭2小时，随后与相应的一抗(稀释于3％BSA-TBST)在4℃孵育过夜。次日洗去多余的一抗，1小时孵育二抗，TBST洗涤，再使用ECL化学发光液(Sigma)和X胶片(Kodak)检测抗体信号。
数据统计
本文统计数据为3次独立实验结果的平均值±S.D.，使用非配对t检验(unpairedStudent’s T-test)来检验实验差别的显著性，*代表P<0.05，**代表P<0.01，***代表P<0.001。显著性检验和绘图使用Graphpad5.0软件。
实施例1，miR-494-3p敲除不影响小鼠的胰腺组织结构
在本实施例中，利用qPCR分别检测miR-494-3p-/-小鼠和野生型小鼠胰腺组织中miR-494-3p的相对含量以确保miR-494-3p在小鼠体内成功被敲除(图1，a)。接下来，收集8周龄的miR-494-3p敲除小鼠和同龄野生型小鼠的胰腺组织以便确定miR-494-3p敲除是否会导致小鼠自发急性胰腺炎，H&E染色结果显示(图1，b)，miR-494-3p敲除小鼠的胰腺组织与正常小鼠相似，并未有自发胰腺炎出现。图1的结果表明，miR-494-3p敲除不影响小鼠的胰腺组织结构。
实施例2，miR-494-3p敲除促进了L-Arg/雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎的发生发展
本实施例试图检验miR-494-3p是否与L-Arg/雨蛙素诱导的急性胰腺炎有关。发明人在miR-494-3p-/-小鼠和野生型小鼠中建立了L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型(图2，a、d)，收集小鼠的胰腺组织、血清进行后续实验。发明人通过检测并分析小鼠的血清淀粉酶活性和胰腺组织切片H&E染色，发现miR-494-3p-/-小鼠的急性胰腺炎比野生型小鼠更严重，并且具有显著性差异(图2，b、c、e)。另一方面，为了检测L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p自身的表达量是否有变化，发明人利用qPCR分别检测了注射L-Arg或雨蛙素的野生型小鼠和注射0.9％生理盐水或PBS的小鼠的胰腺组织中miR-494-3p的相对水平，发现L-Arg或雨蛙素诱导急性胰腺炎后miR-494-3p表达显著下调(图2，f、g)。同样的，在L-Arg诱导的大鼠重症急性胰腺炎模型中，利用qPCR分别检测了注射L-Arg的野生型SD大鼠和注射0.9％生理盐水的大鼠的胰腺组织中miR-494-3p的相对水平，发现L-Arg诱导重症急性胰腺炎后miR-494-3p表达也显著下调(图2，i)。更为重要的是，发明人对医院提供的健康人群(6组)和急性胰腺炎患者血样(7组)中的miR-494-3p进行检测，发现急性胰腺炎患者血样中的miR-494-3p水平也是显著下调的(图2，h)。
实施例3，坏死性凋亡参与了急性胰腺炎的发生发展
在本实施例中，发明人分别在L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中对胰腺组织提取的蛋白检测了坏死性凋亡信号。从免疫印迹实验结果可以看出p-RIPK3(RIPK3的活化形式)、p-MLKL(MLKL的活化形式)的表达水平均显著上调(图3，a、b)。另外，发明人在雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎模型中，腹腔注射RIPK1的抑制剂Nec-1(图3，c)。通过胰腺组织H&E染色和免疫印迹实验，发现Nec-1能显著减轻胰腺组织的损伤(图3，d)，并显著抑制p-MLKL(MLKL的活化形式)的表达水平(图3，e)，说明在急性胰腺炎中坏死性凋亡信号被显著激活。
实施例4，体外过表达miR-494-3p抑制细胞程序性坏死
本实施例试图在体外实验中探究miR-494-3p和坏死性凋亡之间的关系。发明人分别在MEF细胞、L929和HT-29细胞中转染miR-494-3p mimic提高miR-494-3p的水平，在多个时间点用TNFa、z-VAD、Smac(TSZ)联合处理诱导细胞坏死性凋亡。细胞存活率检测结果显示在多种细胞中过表达miR-494-3p均能显著抑制细胞坏死，促进细胞的存活(图4，a、b、c)。另外，发明人还用TNFa、CHX、z-VAD(TCZ)联合处理MEF细胞诱导坏死性凋亡，发现过表达miR-494-3p也能显著促进细胞的存活(图4，d)。相对应的，发明人还在MEF细胞中通过转染miR-494-3p抑制剂(锐博生物公司，产品编号miR20003182-1-5)抑制miR-494-3p的作用。虽然miR-494-3p抑制剂的作用机制限制了其功效，但发明人仍能观测到，在TSZ或TCZ诱导的坏死性凋亡中，伴着miR-494-3p抑制剂对miR-494-3p功能的抑制，MEF细胞的存活率也随之下降(图4，e、f)。
实施例5，体外过表达miR-494-3p抑制MLKL寡聚化
在本实施例中，为了明确miR-494-3p抑制细胞坏死性凋亡的机制，确定miR-494-3p是在哪一步对坏死性凋亡进行调控，发明人在MEF细胞中检测miR-494-3p过表达对坏死性凋亡信号通路中关键蛋白分子的影响。在MEF细胞中，TSZ诱导坏死性凋亡，细胞转染miR-494-3p mimic致miR-494-3p过表达后，从免疫印迹实验结果可以看出，p-RIPK1(S166)、p-RIPK3(S232)和p-MLKL(S345)的表达都没有显著变化，而非还原性PAGE结果显示MLKL的寡聚化水平被显著抑制(图5，a)。同样的，在L929、HT-29细胞中miR-494-3p mimic也能显著抑制MLKL寡聚化(图5，b、c)。
为了进一步确认这个实验结果，发明人对L929细胞的p-MLKL(S345)进行了免疫荧光染色。既然免疫印迹实验结果可以确定miR-494过表达后p-MLKL(S345)水平没有变化，那么该免疫荧光中p-MLKL(S345)的信号则反映了MLKL寡聚化的水平。L929细胞用mTNFa处理6h诱导坏死性凋亡，从免疫荧光结果可以看出，miR-494-3p过表达后p-MLKL(S345)的荧光信号减弱，说明MLKL寡聚化被显著抑制(图5，d)。由此得出结论，miR-494-3p通过抑制MLKL寡聚体的形成促进细胞存活。
实施例6，miR-494-3p靶向调节Tyro3
在本实施例中，发明人检索并分析了Targetscan数据库，通过比对发现Tyro3mRNA的3’UTR上有潜在的miR-494-3p的作用位点(图6，a)。发明人将该Tyro3 mRNA 3’UTR全长序列和Tyro3 mRNA 3’UTR突变序列分别克隆到双荧光素酶报告基因载体中。利用双荧光素酶报告基因检测系统，发明人发现miR-494-3p mimic显著抑制了Tyro3 mRNA 3’UTR的荧光信号，而对其突变序列的荧光信号没有影响(图6，b)，从而证实miR-494-3p可以直接靶向Tyro3 mRNA 3’UTR序列。
为了进一步验证miR-494-3p对Tyro3的靶向作用，发明人在MEF细胞和L929细胞中诱导坏死性凋亡，从免疫印迹实验结果可以看出miR-494-3p mimic可以显著抑制Tyro3在蛋白水平的表达(图6，c)。
文献报道Tyro3是通过对MLKL的Tyr376磷酸化影响其寡聚化，进而调控坏死性凋亡。发明人随后在L929细胞中用mTNFa处理6h诱导坏死性凋亡，过表达miR-494-3p并转染MLKL-FLAG，通过免疫共沉淀和免疫印迹实验检测MLKL Tyr376的表达。从结果可以看出miR-494-3p过表达确实可以显著抑制MLKL(Tyr376)磷酸化(图6，d)。
实施例7、体外过表达Tyro3抑制miR-494-3p对细胞存活的促进作用
为了验证在细胞中回补Tyro3能否阻断miR-494-3p的作用，发明人在L929细胞中通过mTNFa处理诱导坏死性凋亡，发现过表达Tyro3可以逆转由miR-494-3p mimic引起的MLKL寡聚化水平的下调(图7，a)以及细胞存活率的上升(图7，b)。这更进一步证实了miR-494-3p确实可以直接靶向Tyro3 mRNA3’UTR序列，显著抑制Tyro3的表达。综合以上实验数据，发明人证实Tyro3确为miR-494-3p的靶基因，miR-494-3p抑制Tyro3并进一步通过调控MLKL的Tyr376磷酸化影响MLKL的寡聚化。
实施例8、L-Arg或雨蛙素诱导的急性胰腺炎模型中，miR-494-3p模拟物缓解了急性胰腺炎的发生
为了进一步确认miR-494-3p在急性胰腺炎中的作用，在注射L-Arg之前，发明人通过尾静脉注射miR-494-3p agomir(图8，a)，从而过表达miR-494-3p，以期达到治疗急性胰腺炎的目的。确认miR-494-3p在胰腺组织中过表达(图8，b)后，分别检测并分析了小鼠的血清淀粉酶活性、胰腺组织结构(图8，c、d)，发现经miR-494-3p agomir处理后，血清淀粉酶水平显著下降，组织结构显著恢复，小鼠的急性胰腺炎有明显减轻的趋势。同样地，在注射雨蛙素之前，发明人通过尾静脉注射miR-494-3p agomir(图8，e)使其过表达。确认miR-494-3p在胰腺组织中过表达(图8，f)后，分别检测并分析了小鼠的血清淀粉酶活性、胰腺组织结构(图8，g、h)，发现miR-494-3p agomir也能显著缓解雨蛙素诱导的小鼠急性胰腺炎的发展。并且发现miR-494-3p在胰腺组织中过表达后，组织中炎症因子的水平也显著下调(图8，i)。以上结果表明，miR-494-3p agomir在急性胰腺炎模型中起到显著的治疗作用。
此外，为了确认miR-494-3p在急性胰腺炎中发挥作用的分子机制，发明人检测了雨蛙素诱导模型中miR-494-3p过表达后胰腺组织中Tyro3的水平，发现Tyro3在蛋白水平和mRNA水平均显著下调(图8，j、k)。并且，在分离的小鼠原代胰腺腺泡细胞中诱导坏死性凋亡，相较于flox/flox小鼠，miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠中的MLKL寡聚化水平显著下调(图8，l)。
实施例9、胰腺长期稳定过表达miR-494-3p无显著毒副作用
为了证实miR-494-3p模拟物临床应用的安全性，发明人对长期(约52周龄)胰腺特异性过表达miR-494-3p小鼠(图9，a)和miR-494-3p flox/flox小鼠给予相同的饲养环境，并进行观察和检测，同时收集了小鼠的血清和胰腺组织等。检测结果表明，两组小鼠的血清淀粉酶水平没有显著差异(图9，b)，胰腺组织H&E染色结果显示miR-494-3p胰腺特异性过表达小鼠的胰腺组织结构正常，和miR-494-3p flox/flox小鼠的胰腺组织没有显著差异(图9，c)。且两者的体重、肝重/体重比、脾脏/体重比、结肠长度均没有显著差异(图9，d)，说明胰腺长期特异性过表达miR-494-3p没有显著毒副作用，对小鼠的正常生活没有显著影响，极大地提高了其临床应用的可行性。
在本发明提及的所有文献都在本申请中引用作为参考，就如同每一篇文献被单独引用作为参考那样。此外应理解，在阅读了本发明的上述讲授内容之后，本领域技术人员可以对本发明做各种改动和修改，这些等价形式同样落于本申请所附权利要求书所限定的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 中国科学院上海营养与健康研究所
<120> microRNA及其在诊断和治疗中的用途
<130> 217952
<160> 21
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
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<213> Homo sapiens
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cgggaaaccu cuuuuuuagu aucaa 85

Claims (10)

1.试剂在制备预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的药物组合物中的用途；其中，所述的试剂选自下组：
(a)miR-494-3p或其变体，或它们的类似物；
(b)miR-494-3p的前体物；
(c)多核苷酸，其能转录为(b)中所述的miR-494-3p的前体物，或能在宿主内加工成(a)中所述的miR-494-3p；
(d)核酸构建物，所述的核酸构建物含有(a)、(b)或(c)；
(e)(a)的激动剂。
2.如权利要求1所述的用途，其特征在于，
所述细胞坏死性凋亡是Tyro3/MLKL信号通路相关的细胞坏死性凋亡，和/或
所述细胞坏死性凋亡是由MLKL寡聚化诱导的细胞坏死性凋亡，和/或
所述疾病是受益于Tyro3蛋白水平下调的疾病，和/或
所述疾病是受益于MLKL的Tyr376的磷酸化水平下调的疾病；
优选地，所述疾病是胰腺炎。
3.如权利要求1所述的用途，其特征在于，
所述多核苷酸或核酸构建物具有式(I)所示的结构：
Seq正向-X-Seq反向 (I)
式(I)中，Seq正向为能在宿主中被加工成miR-494-3p的核苷酸序列；
Seq反向为与Seq正向基本上互补或完全互补的核苷酸序列；
X为位于Seq正向和Seq反向之间的间隔序列，并且所述间隔序列与Seq正向和Seq反向不互补。
4.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述核酸构建物为表达载体或整合载体。
5.如权利要求1所述的用途，其特征在于，
所述miR-494-3p的序列如SEQ ID NO:20所示，所述变体是与miR-494-3p具有至少80％，至少90％，至少95％，至少98％，或至少99％序列相同性的变体，和/或
miR-494-3p的前体物是前体miRNA或初级miRNA；优选地，前体miRNA的序列如SEQ IDNO:21所示，和/或
所述类似物是衍生物，优选是经修饰的衍生物或RNA诱导沉默复合物。
6.如权利要求1所述的用途，其特征在于，(e)所述的激动剂选自下组：促进miR-494-3p表达的物质、提高miR-494-3p活性的物质。
7.如权利要求1所述的用途，其特征在于，所述试剂通过抑制Tyro3/MLKL信号通路发挥作用，或通过下调Tyro3蛋白水平、抑制MLKL寡聚化、下调MLKL的Tyr376的磷酸化水平发挥作用。
8.检测miR-494-3p的试剂在制备诊断细胞坏死性凋亡诱导的疾病的试剂盒中的用途，
优选地，所述试剂是检测miR-494-3p的特异性抗体、特异性探针、或特异性引物，
优选地，所述试剂盒还包括免疫学检测、核酸杂交、或核酸扩增所需的其他试剂。
9.一种筛选预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质的方法，所述方法包括：
(1)用候选物质处理表达miR-494-3p的体系；和
(2)检测所述体系中miR-494-3p的表达情况；
其中，若所述候选物质可提高miR-494-3p的表达，则表明该候选物质是预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质，
优选地，所述方法还包括，检测测试组体系中Tyro3的表达、MLKL寡聚化、或MLKL的Tyr376的磷酸化，并与对照组比较，其中所述的对照组是不添加所述候选物质的测试组相同体系。
10.如权利要求9所述的方法，其特征在于，
步骤(1)包括：在测试组中，将候选物质加入到表达miR-494-3p的体系中；和/或
步骤(2)包括：检测测试组的体系中miR-494-3p的表达，并与对照组比较，其中所述的对照组是不添加所述候选物质的表达miR-494-3p的体系；和/或
如果测试组中miR-494-3p的表达在统计学上高于对照组，就表明该候选物是预防或治疗细胞坏死性凋亡诱导的疾病的潜在物质。
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