CN115885050A - 用于非小细胞肺癌免疫疗法的方法和组合物 - Google Patents

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Abstract

本公开提供用于例如通过向受试者施用包括与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD‑1轴结合拮抗剂(例如,阿特珠单抗)的治疗方案来治疗所述受试者的非小细胞肺癌(NSCLC;例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法和组合物。可使用本公开的组合物和方法治疗的示例性受试者包括那些表现出血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分相对于参考bTMB评分升高的受试者。还提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的组合物(例如,PD‑1轴结合拮抗剂(例如,阿特珠单抗)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)、其药物组合物、其试剂盒以及其制品),所述受试者诸如在开始治疗之前具有提升的bTMB评分的受试者。

Description

用于非小细胞肺癌免疫疗法的方法和组合物
序列表
本申请含有序列表,该序列表已经以ASCII格式以电子方式提交并且以全文引用的方式并入本文中。所述ASCII副本创建于2021年4月22日,命名为50474-211WO2_Sequence_Listing_4_22_21_ST25并且大小为22,260个字节。
技术领域
本公开涉及用于治疗受试者的非小细胞肺癌(NSCLC,例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法和组合物。PD-1轴结合拮抗剂可以是例如PD-L1结合拮抗剂,诸如抗PD-L1抗体,诸如阿特珠单抗(atezolizumab)。
背景技术
癌症仍然是对人类健康最致命的威胁之一。癌症或恶性肿瘤以不受控的方式转移或快速生长,使得极难进行及时检测和治疗。程序性死亡配体1(PD-L1)是一种蛋白质,它牵涉到在癌症、慢性感染、妊娠、组织同种异体移植和自身免疫性疾病期间对免疫系统应答的抑制中。PD-L1通过与抑制性受体(称为程序性死亡1(PD-1))结合来调节免疫应答,该受体在T细胞、B细胞和单核细胞的表面表达。PD-L1还通过与另一种受体B7-1相互作用,对T细胞功能产生负调节。PD-L1/PD-1与PD-L1/B7-1复合物的形成对T细胞受体信号传导产生负调节,从而导致T细胞活化的下调以及抗肿瘤免疫活性的抑制。
尽管在癌症(例如,非小细胞肺癌(NSCLC;例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC))的治疗中取得显著进展,但仍在寻求改善的疗法。
发明内容
本公开尤其涉及治疗受试者的非小细胞肺癌(NSCLC;例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法,以及用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的组合物(例如,PD-1轴结合拮抗剂,或其药物组合物)。还提供相关试剂盒和制品。
在第一方面,本公开提出一种鉴别可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的患有鳞状NSCLC的受试者的方法。该方法可包括,例如,从来自该受试者的样品确定血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分,其中来自该样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将该受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
在另一方面,本公开提出一种为患有鳞状NSCLC的受试者选择疗法的方法。该方法可包括,例如,从来自该受试者的样品确定bTMB评分,其中来自该样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将该受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分。在此类情况下,该方法可以进一步包括向受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分低于参考bTMB评分。在此类情况下,该方法可包括向受试者施用有效量的不含有PD-1轴结合拮抗剂的疗法。
在另一方面,本公开提出一种治疗有此需要的受试者的鳞状NSCLC的方法。该方法可包括:
(a)从来自该受试者的样品确定bTMB评分,其中从该样品确定的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分;以及
(b)向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
在另一方面,本公开提出一种通过向有此需要的受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂来治疗该受试者的鳞状NSCLC的方法,其中,在向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂之前,来自受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分。
在本公开的前述任何方面的一些实施例中,参考bTMB评分为参考群体中的bTMB评分。参考群体可以是,例如,患有鳞状NSCLC的受试者的群体。患有鳞状NSCLC的受试者的群体可包括已经用PD-1轴结合拮抗剂来治疗的受试者的第一子集和已经用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法来治疗的受试者的第二子集。在此类情况下,参考bTMB评分可以基于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的处于或高于参考bTMB评分的显著差异,明显区分受试者的第一子集与受试者的第二子集中的每一个,其中受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性相对于受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性得到显著改善。在一些实施例中,参考bTMB评分基于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的低于bTMB评分的显著差异,明显区分受试者的第一子集与受试者的第二子集中的每一个,其中受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性相对于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性得到显著改善。在一些实施例中,不含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含抗肿瘤剂、化疗剂、生长抑制剂、抗血管生成剂、放疗、细胞毒性剂或它们的组合。例如,在一些实施例中,该不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含化疗剂。在前述任何实施例的上下文中,对治疗的应答性可包括无进展存活(PFS)的增加和/或总存活(OS)的增加。
在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有大于或等于约5%的流行率。在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有约5%至约75%的流行率。在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有约20%至约30%的流行率。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB为预先指定的bTMB评分。例如,参考bTMB评分可以是4至30(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为5至58(例如,5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为6至26(例如,6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为7至24(例如,7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为8至22(例如,8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21或22的参考bTMB评分)。
例如,在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为7至13(例如,7、8、9、10、11、12或13的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为8至12(例如,8、9、10、11或12的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为9至11(例如,9、10或11的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为10。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为13至19(例如,13、14、15、16、17、18或19的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为14至18(例如,14、15、16、17或18的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为5至17(例如,15、16或17的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为16。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为16至24(例如,16、17、18、19、20、21、22、23或24的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为17至23(例如,17、18、19、20、21、22或23的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为18至22(例如,18、19、20、21或22的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为19至21(例如,19、20或21的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为20。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,从样品确定的bTMB评分大于或等于4。例如,参考bTMB评分可以是4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
例如,在一些实施例中,参考bTMB评分为4至100(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于6。例如,参考bTMB评分可以是6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为6至100(例如,6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于8。例如,参考bTMB评分可以是8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为8至100(例如,8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于10。例如,参考bTMB评分可以是10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为10至100(例如,10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于12。例如,参考bTMB评分可以是12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为12至100(例如,12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于14。例如,参考bTMB评分可以是14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为14至100(例如,14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于16。例如,参考bTMB评分可以是16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为16至100(例如,16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于18。例如,参考bTMB评分可以是18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为18至100(例如,18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于20。例如,参考bTMB评分可以是20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为20至100(例如,20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在本公开的前述任何方面或实施例的一些实施例中,从样品确定的bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上技术的体细胞突变的数量表示,如例如使用FOUNDATIONONE CDXTM基因包(panel)或
Figure BDA0004012333940000131
基因包所评定。例如,在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为100kb至约10Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是100kb、150kb、200kb、250kb、300kb、350kb、400kb、450kb、500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb、1.5Mb、1.6Mb、1.7Mb、1.8Mb、1.9Mb、2.0Mb、2.1Mb、2.2Mb、2.3Mb、2.4Mb、2.5Mb、2.6Mb、2.7Mb、2.8Mb、2.9Mb、3.0Mb、3.1Mb、3.2Mb、3.3Mb、3.4Mb、3.5Mb、3.6Mb、3.7Mb、3.8Mb、3.9Mb、4.0Mb、4.1Mb、4.2Mb、4.3Mb、4.4Mb、4.5Mb、4.6Mb、4.7Mb、4.8Mb、4.9Mb、5.0Mb、5.1Mb、5.2Mb、5.3Mb、5.4Mb、5.5Mb、5.6Mb、5.7Mb、5.8Mb、5.9Mb、6.0Mb、6.1Mb、6.2Mb、6.3Mb、6.4Mb、6.5Mb、6.6Mb、6.7Mb、6.8Mb、6.9Mb、7.0Mb、7.1Mb、7.2Mb、7.3Mb、7.4Mb、7.5Mb、7.6Mb、7.7Mb、7.8Mb、7.9Mb、8.0Mb、8.1Mb、8.2Mb、8.3Mb、8.4Mb、8.5Mb、8.6Mb、8.7Mb、8.8Mb、8.9Mb、9.0Mb、9.1Mb、9.2Mb、9.3Mb、9.4Mb、9.5Mb、9.6Mb、9.7Mb、9.8Mb、9.9Mb或10.0Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb或1.5Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb或1.3Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb或1.2Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量可以是,例如,(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为所计数的SNV的数量。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为同义SNV和非同义SNV和/或插入缺失的数量。在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分为等效bTMB值,例如,如通过全外显子组测序所确定。一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量在表1中列示的一种或多种基因中计数。
在本公开的前述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上技术的体细胞突变的数量表示,如例如使用FOUNDATIONONE CDXTM基因包或
Figure BDA0004012333940000151
基因包所评定。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为100kb至约10Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是100kb、150kb、200kb、250kb、300kb、350kb、400kb、450kb、500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb、1.5Mb、1.6Mb、1.7Mb、1.8Mb、1.9Mb、2.0Mb、2.1Mb、2.2Mb、2.3Mb、2.4Mb、2.5Mb、2.6Mb、2.7Mb、2.8Mb、2.9Mb、3.0Mb、3.1Mb、3.2Mb、3.3Mb、3.4Mb、3.5Mb、3.6Mb、3.7Mb、3.8Mb、3.9Mb、4.0Mb、4.1Mb、4.2Mb、4.3Mb、4.4Mb、4.5Mb、4.6Mb、4.7Mb、4.8Mb、4.9Mb、5.0Mb、5.1Mb、5.2Mb、5.3Mb、5.4Mb、5.5Mb、5.6Mb、5.7Mb、5.8Mb、5.9Mb、6.0Mb、6.1Mb、6.2Mb、6.3Mb、6.4Mb、6.5Mb、6.6Mb、6.7Mb、6.8Mb、6.9Mb、7.0Mb、7.1Mb、7.2Mb、7.3Mb、7.4Mb、7.5Mb、7.6Mb、7.7Mb、7.8Mb、7.9Mb、8.0Mb、8.1Mb、8.2Mb、8.3Mb、8.4Mb、8.5Mb、8.6Mb、8.7Mb、8.8Mb、8.9Mb、9.0Mb、9.1Mb、9.2Mb、9.3Mb、9.4Mb、9.5Mb、9.6Mb、9.7Mb、9.8Mb、9.9Mb或10.0Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb或1.5Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb或1.3Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb或1.2Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量可以是,例如,(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为所计数的SNV的数量。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为同义SNV和非同义SNV和/或插入缺失的数量。在一些实施例中,参考bTMB评分为等效bTMB值,例如,如通过全外显子组测序所确定。一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量在表1中列示的一种或多种基因中计数。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定最大体细胞等位基因频率(MSAF)。MSAF可以是例如大于或等于1%。在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,在施用PD-1轴结合拮抗剂前,获自受试者的样品已经被确定为具有大于或等于1%的MSAF。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF小于1%。在一些实施例中,在施用PD-1轴结合拮抗剂前,获自受试者的样品已经被确定为具有小于1%的MSAF。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF已经被确定为大于或等于1%,并且该方法进一步包括向个体施用有效量的并非PD-1轴结合拮抗剂或除了PD-1轴结合拮抗剂之外的抗癌疗法。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF已经被确定为小于1%,并且该方法进一步包括向个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
在一些实施例中,受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括OS的增加。在一些实施例中,受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括PFS的增加。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的OS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约4个月至约10个月、延长约5个月至约9个月、延长约6个月至约8个月、延长约6.5个月至约7.5个月或延长约6.8个月至约7.4个月(例如,延长约4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月、5个月、5.1个月、5.2个月、5.3个月、5.4个月、5.5个月、5.6个月、5.7个月、5.8个月、5.9个月、6个月、6.1个月、6.2个月、6.3个月、6.4个月、6.5个月、6.6个月、6.7个月、6.8个月、6.9个月、7个月、7.1个月、7.2个月、7.3个月、7.4个月、7.5个月、7.6个月、7.7个月、7.8个月、7.9个月、8个月、8.1个月、8.2个月、8.3个月、8.4个月、8.5个月、8.6个月、8.7个月、8.8个月、8.9个月、9个月、9.1个月、9.2个月、9.3个月、9.4个月、9.5个月、9.6个月、9.7个月、9.8个月、9.9个月或10个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约7.1个月。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的PFS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的PFS延长约1个月至约5个月、延长约2个月至约4个月、延长约2.1个月至约3.9个月、延长约2.5个月至约3.5个月或延长约2.8个月至约3.4个月(例如,延长约1个月、1.1个月、1.2个月、1.3个月、1.4个月、1.5个月、1.6个月、1.7个月、1.8个月、1.9个月、2个月、2.1个月、2.2个月、2.3个月、2.4个月、2.5个月、2.6个月、2.7个月、2.8个月、2.9个月、3个月、3.1个月、3.2个月、3.3个月、3.4个月、3.5个月、3.6个月、3.7个月、3.8个月、3.9个月、4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月或5个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约3.1个月。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加将该受试者具有客观缓解的可能性且/或延长该受试者的应答持续时间(DOR)。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加将该受试者具有客观缓解的可能性且/或增加该受试者的客观缓解率(ORR)。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加该受试者具有完全缓解(CR)的可能性。
在一些实施例中,铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。
在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。
在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂。
在其他实施例中,铂类化疗剂为卡铂。
在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含卡铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和培美曲塞(premetrexed)或者卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和培美曲塞。
在一些实施例中,铂类化疗包含卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,在一个或多个给药周期诸如1至10个给药周期(例如,2至8个给药周期、3至7个给药周期或4至6个给药周期)期间向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施例中,在4至6个给药周期期间向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂。PD-1轴结合拮抗剂可以在每一个给药周期期间向受试者施用一次或多次,诸如每个给药周期一次。
在一些实施例中,给药周期持续长达58个月。例如,给药贮器可持续1个月至100个月,诸如2个月至99个月、3个月至98个月、4个月至97个月、5个月至96个月、6个月至95个月、7个月至94个月、8个月至93个月、9个月至92个月、10个月至91个月、11个月至90个月、12个月至89个月、13个月至88个月、14个月至87个月、15个月至86个月、16个月至85个月、17个月至84个月、18个月至83个月、19个月至82个月、20个月至81个月、21个月至80个月、22个月至79个月、23个月至78个月、24个月至77个月、25个月至76个月、26个月至75个月、27个月至74个月、28个月至73个月、29个月至72个月、30个月至71个月、31个月至70个月、32个月至69个月、33个月至68个月、34个月至67个月、35个月至66个月、36个月至65个月、37个月至64个月、36个月至63个月、37个月至62个月、38个月至61个月、39个月至60个月、50个月至70个月、51个月至69个月、52个月至68个月、53个月至67个月、54个月至66个月、55个月至61个月、56个月至60个月或57个月至59个月。
在一些实施例中,每一个给药周期为约21天。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂作为单一疗法向受试者施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂与铂类化疗组合向受试者施用,该铂类化疗诸如包括铂类化疗剂和核苷类似物的铂类化疗。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为顺铂。在其他实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为卡铂。在一些实施例中,向受试者施用的核苷类似物为吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含卡铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和培美曲塞或者卡铂和培美曲塞。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和培美曲塞。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约5的曲线下面积(AUC)向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约6的AUC向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约6的AUC向受试者静脉内施用卡铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以及第7天至第11天(例如,在第7天、第8天、第9天、第10天或第11天)以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以及第7天至第11天(例如,在第7天、第8天、第9天、第10天或第11天)以约1250mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1250mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约500mg/m2的剂量向受试者静脉内施用培美曲塞。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约500mg/m2的剂量向受试者静脉内施用培美曲塞。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂组成的组。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-L1结合拮抗剂。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1、B7-1或者PD-1和B7-1两者的结合。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体为阿特珠单抗
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MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体包含以下高变区(HVR):(a)GFTFSDSWIH(SEQ IDNO:19)的HVR-H1序列;(b)AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)的HVR-H2序列;(c)RHWPGGFDY(SEQ ID NO:21)的HVR-H3序列;(d)RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)的HVR-L1序列;(e)SASFLYS(SEQ ID NO:23)的HVR-L2序列;和(f)QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)的HVR-L3序列。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)重链可变(VH)结构域,其包含与SEQ IDNO:3的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;(b)轻链可变(VL)结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列,和(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体是阿特珠单抗。
在一些实施例中,以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1、PD-L2或者PD-L1和PD-L2两者的结合。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。
在一些实施例中,抗PD-1抗体为MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810或BGB-108。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白。
在一些实施例中,Fc融合蛋白为AMP-224。
在一些实施例中,受试者为化疗初治的。例如,受试者可以是先前未施用用于治疗NSCLC的化疗的受试者。在一些实施例中,受试者先前不曾施用全身疗法来治疗NSCLC。在一些实施例中,先前未向受试者施用用于治疗NSCLC的任何疗法。
在一些实施例中,NSCLC为IV期NSCLC。
在一些实施例中,NSCLC为转移性NSCLC。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中1%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约4%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约5%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%至约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约99%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约1%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约4%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约1%至约100%、肿瘤样品的约5%至约100%、肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约15%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至约100%或肿瘤样品的约90%至约100%(例如,肿瘤样品的约1%、肿瘤样品的约2%、肿瘤样品的约3%、肿瘤样品的约4%、肿瘤样品的约5%、肿瘤样品的约6%、肿瘤样品的约7%、肿瘤样品的约8%、肿瘤样品的约9%、肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%至少于5%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约4%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约1%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约2%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约3%或肿瘤样品中肿瘤细胞的约4%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中5%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约5%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%至约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约99%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约5%至约100%、肿瘤样品的约6%至约100%、肿瘤样品的约7%至约100%、肿瘤样品的约8%至约100%、肿瘤样品的约9%至约100%、肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至100%或肿瘤样品的约90%至100%(例如,肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约5%至少于50%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品被确定为,在肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约5%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约6%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约7%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约8%或肿瘤样品中肿瘤细胞的约9%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中50%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%之约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至100%或肿瘤样品的约90%至100%(例如,肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,可使用免疫组织化学(IHC)及本文所述的其他技术确定PD-L1表达。在一些实施例中,使用抗PD-L1抗体确定PD-L1表达。可使用任何合适的抗PD-L1抗体,包括例如SP142、SP263、22C3、28-8、E1L3N、4059、h5H1和9A11。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP142。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP263。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为22C3。
在一些实施例中,受试者为人,诸如(i)不具有在编码表皮生长因子受体(EGFR)的基因中的敏化突变的人和/或(ii)不具有间变性淋巴瘤受体酪氨酸激酶(ALK)融合致癌基因的人。例如,受试者可以是不具有EGFR或ALK肿瘤基因组畸变的人。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种PD-1轴结合拮抗剂,其用于按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法使用。
在另一方面,本公开提出一种PD-1轴结合拮抗剂用于制造药物的用途,该药物用于按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法来治疗鳞状NSCLC。
在另一方面,本公开提出一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和指示该试剂盒的使用者按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法向受试者施用该PD-1轴结合拮抗剂的包装插页。
在又一方面,本公开提出一种鉴别可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的患有非鳞状NSCLC的受试者的方法。该方法可包括,例如,从来自该受试者的样品确定血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分,其中来自该样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将该受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
在另一方面,本公开提出一种为患有非鳞状NSCLC的受试者选择疗法的方法。该方法可包括,例如,从来自该受试者的样品确定bTMB评分,其中来自该样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将该受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分。在此类情况下,该方法可以进一步包括向受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分低于参考bTMB评分。在此类情况下,该方法可包括向受试者施用有效量的不含有PD-1轴结合拮抗剂的疗法。
在另一方面,本公开提出一种治疗有此需要的受试者的非鳞状NSCLC的方法。该方法可包括:
(a)从来自该受试者的样品确定bTMB评分,其中从该样品确定的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分;以及
(b)向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
在另一方面,本公开提出一种治疗通过向有此需要的受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂来治疗该受试者的非鳞状NSCLC的方法,其中,在向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂之前,来自受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分。
在本公开的前述任何方面的一些实施例中,参考bTMB评分为参考群体中的bTMB评分。参考群体可以是,例如,患有非鳞状NSCLC的受试者的群体。患有非鳞状NSCLC的受试者的群体可包括已经用PD-1轴结合拮抗剂来治疗的受试者的第一子集和已经用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法来治疗的受试者的第二子集。在此类情况下,参考bTMB评分可以基于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的处于或高于参考bTMB评分的显著差异,明显区分受试者的第一子集与受试者的第二子集中的每一个,其中受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性相对于受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性得到显著改善。在一些实施例中,参考bTMB评分基于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的低于bTMB评分的显著差异,明显区分受试者的第一子集与受试者的第二子集中的每一个,其中受试者对用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性相对于受试者对用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性得到显著改善。在一些实施例中,不含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含抗肿瘤剂、化疗剂、生长抑制剂、抗血管生成剂、放疗、细胞毒性剂或它们的组合。例如,在一些实施例中,该不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含化疗剂。在前述任何实施例的上下文中,对治疗的应答性可包括无进展存活(PFS)的增加和/或总存活(OS)的增加。
在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有大于或等于约5%的流行率。在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有约5%至约75%的流行率。在一些实施例中,在参考群体中,来自样品的bTMB评分具有约20%至约30%的流行率。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB为预先指定的bTMB评分。例如,参考bTMB评分可以是4至30(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为5至58(例如,5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为6至26(例如,6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为7至24(例如,7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为8至22(例如,8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21或22的参考bTMB评分)。
例如,在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为7至13(例如,7、8、9、10、11、12或13的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为8至12(例如,8、9、10、11或12的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为9至11(例如,9、10或11的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为10。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为13至19(例如,13、14、15、16、17、18或19的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为14至18(例如,14、15、16、17或18的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为5至17(例如,15、16或17的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为16。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分为16至24(例如,16、17、18、19、20、21、22、23或24的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为17至23(例如,17、18、19、20、21、22或23的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为18至22(例如,18、19、20、21或22的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为19至21(例如,19、20或21的参考bTMB评分)。在一些实施例中,参考bTMB评分为20。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,从样品确定的bTMB评分大于或等于4。例如,参考bTMB评分可以是4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
例如,在一些实施例中,参考bTMB评分为4至100(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于6。例如,参考bTMB评分可以是6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为6至100(例如,6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于8。例如,参考bTMB评分可以是8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为8至100(例如,8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于10。例如,参考bTMB评分可以是10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为10至100(例如,10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于12。例如,参考bTMB评分可以是12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为12至100(例如,12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于14。例如,参考bTMB评分可以是14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为14至100(例如,14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于16。例如,参考bTMB评分可以是16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为16至100(例如,16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于18。例如,参考bTMB评分可以是18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为18至100(例如,18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在一些实施例中,参考bTMB评分大于或等于20。例如,参考bTMB评分可以是20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、101、102、103、104、105、107、108、109、110、111、112、113、114、115、116、117、118、119、120、121、122、123、124、125、126、127、128、129、130、131、132、133、134、135、136、137、138、139、140、141、142、143、144、145、146、147、148、149、150、151、152、153、154、155、156、157、158、159、160、161、162、163、164、165、166、167、168、169、170、171、172、173、174、175、176、177、178、179、180、181、182、183、184、185、186、187、188、189、190、191、192、193、194、195、196、197、198、199、200、201、202、203、204、205、207、208、209、210、211、212、213、214、215、216、217、218、219、220、221、222、223、224、225、226、227、228、229、230、231、232、233、234、235、236、237、238、239、240、241、242、243、244、245、246、247、248、249、250、251、252、253、254、255、256、257、258、259、260、261、262、263、264、265、266、267、268、269、270、271、272、273、274、275、276、277、278、279、280、281、282、283、284、285、286、287、288、289、290、291、292、293、294、295、296、297、298、299、300或更高。
在一些实施例中,参考bTMB评分为20至100(例如,20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100的参考bTMB评分)。
在本公开的前述任何方面或实施例的一些实施例中,从样品确定的bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上技术的体细胞突变的数量表示,如例如使用FOUNDATIONONE CDXTM基因包(panel)或
Figure BDA0004012333940000571
基因包所评定。例如,在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为100kb至约10Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是100kb、150kb、200kb、250kb、300kb、350kb、400kb、450kb、500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb、1.5Mb、1.6Mb、1.7Mb、1.8Mb、1.9Mb、2.0Mb、2.1Mb、2.2Mb、2.3Mb、2.4Mb、2.5Mb、2.6Mb、2.7Mb、2.8Mb、2.9Mb、3.0Mb、3.1Mb、3.2Mb、3.3Mb、3.4Mb、3.5Mb、3.6Mb、3.7Mb、3.8Mb、3.9Mb、4.0Mb、4.1Mb、4.2Mb、4.3Mb、4.4Mb、4.5Mb、4.6Mb、4.7Mb、4.8Mb、4.9Mb、5.0Mb、5.1Mb、5.2Mb、5.3Mb、5.4Mb、5.5Mb、5.6Mb、5.7Mb、5.8Mb、5.9Mb、6.0Mb、6.1Mb、6.2Mb、6.3Mb、6.4Mb、6.5Mb、6.6Mb、6.7Mb、6.8Mb、6.9Mb、7.0Mb、7.1Mb、7.2Mb、7.3Mb、7.4Mb、7.5Mb、7.6Mb、7.7Mb、7.8Mb、7.9Mb、8.0Mb、8.1Mb、8.2Mb、8.3Mb、8.4Mb、8.5Mb、8.6Mb、8.7Mb、8.8Mb、8.9Mb、9.0Mb、9.1Mb、9.2Mb、9.3Mb、9.4Mb、9.5Mb、9.6Mb、9.7Mb、9.8Mb、9.9Mb或10.0Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb或1.5Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb或1.3Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb或1.2Mb)。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量可以是,例如,(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为所计数的SNV的数量。在一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为同义SNV和非同义SNV和/或插入缺失的数量。在一些实施例中,从样品确定的bTMB评分为等效bTMB值,例如,如通过全外显子组测序所确定。一些实施例中,在计算从样品确定的bTMB评分中使用的体细胞突变的数量在表1中列示的一种或多种基因中计数。
在本公开的前述任何方面或实施例的一些实施例中,参考bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上技术的体细胞突变的数量表示,如例如使用FOUNDATIONONE CDXTM基因包或
Figure BDA0004012333940000581
基因包所评定。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为100kb至约10Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是100kb、150kb、200kb、250kb、300kb、350kb、400kb、450kb、500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb、1.5Mb、1.6Mb、1.7Mb、1.8Mb、1.9Mb、2.0Mb、2.1Mb、2.2Mb、2.3Mb、2.4Mb、2.5Mb、2.6Mb、2.7Mb、2.8Mb、2.9Mb、3.0Mb、3.1Mb、3.2Mb、3.3Mb、3.4Mb、3.5Mb、3.6Mb、3.7Mb、3.8Mb、3.9Mb、4.0Mb、4.1Mb、4.2Mb、4.3Mb、4.4Mb、4.5Mb、4.6Mb、4.7Mb、4.8Mb、4.9Mb、5.0Mb、5.1Mb、5.2Mb、5.3Mb、5.4Mb、5.5Mb、5.6Mb、5.7Mb、5.8Mb、5.9Mb、6.0Mb、6.1Mb、6.2Mb、6.3Mb、6.4Mb、6.5Mb、6.6Mb、6.7Mb、6.8Mb、6.9Mb、7.0Mb、7.1Mb、7.2Mb、7.3Mb、7.4Mb、7.5Mb、7.6Mb、7.7Mb、7.8Mb、7.9Mb、8.0Mb、8.1Mb、8.2Mb、8.3Mb、8.4Mb、8.5Mb、8.6Mb、8.7Mb、8.8Mb、8.9Mb、9.0Mb、9.1Mb、9.2Mb、9.3Mb、9.4Mb、9.5Mb、9.6Mb、9.7Mb、9.8Mb、9.9Mb或10.0Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是500kb、550kb、600kb、650kb、700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb、1.3Mb、1.4Mb或1.5Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是700kb、750kb、800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb、1.2Mb或1.3Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb(例如,规定数量的已测序碱基可以是800kb、850kb、900kb、950kb、1.0Mb或1.2Mb)。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量可以是,例如,(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为所计数的SNV的数量。在一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量为同义SNV和非同义SNV和/或插入缺失的数量。在一些实施例中,参考bTMB评分为等效bTMB值,例如,如通过全外显子组测序所确定。一些实施例中,在计算参考bTMB评分中使用的体细胞突变的数量在表1中列示的一种或多种基因中计数。
在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定最大体细胞等位基因频率(MSAF)。MSAF可以是例如大于或等于1%。在本公开的上述任何方面或实施例的一些实施例中,在施用PD-1轴结合拮抗剂前,获自受试者的样品已经被确定为具有大于或等于1%的MSAF。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF小于1%。在一些实施例中,在施用PD-1轴结合拮抗剂前,获自受试者的样品已经被确定为具有小于1%的MSAF。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF已经被确定为大于或等于1%,并且该方法进一步包括向个体施用有效量的并非PD-1轴结合拮抗剂或除了PD-1轴结合拮抗剂之外的抗癌疗法。
在一些实施例中,该方法进一步包括从获自受试者的样品确定MSAF,其中来自样品的MSAF已经被确定为小于1%,并且该方法进一步包括向个体施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
在一些实施例中,受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括OS的增加。在一些实施例中,受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括PFS的增加。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的OS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约4个月至约10个月、延长约5个月至约9个月、延长约6个月至约8个月、延长约6.5个月至约7.5个月或延长约6.8个月至约7.4个月(例如,延长约4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月、5个月、5.1个月、5.2个月、5.3个月、5.4个月、5.5个月、5.6个月、5.7个月、5.8个月、5.9个月、6个月、6.1个月、6.2个月、6.3个月、6.4个月、6.5个月、6.6个月、6.7个月、6.8个月、6.9个月、7个月、7.1个月、7.2个月、7.3个月、7.4个月、7.5个月、7.6个月、7.7个月、7.8个月、7.9个月、8个月、8.1个月、8.2个月、8.3个月、8.4个月、8.5个月、8.6个月、8.7个月、8.8个月、8.9个月、9个月、9.1个月、9.2个月、9.3个月、9.4个月、9.5个月、9.6个月、9.7个月、9.8个月、9.9个月或10个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约7.1个月。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的PFS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的PFS延长约1个月至约5个月、延长约2个月至约4个月、延长约2.1个月至约3.9个月、延长约2.5个月至约3.5个月或延长约2.8个月至约3.4个月(例如,延长约1个月、1.1个月、1.2个月、1.3个月、1.4个月、1.5个月、1.6个月、1.7个月、1.8个月、1.9个月、2个月、2.1个月、2.2个月、2.3个月、2.4个月、2.5个月、2.6个月、2.7个月、2.8个月、2.9个月、3个月、3.1个月、3.2个月、3.3个月、3.4个月、3.5个月、3.6个月、3.7个月、3.8个月、3.9个月、4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月或5个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约3.1个月。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加将该受试者具有客观缓解的可能性且/或延长该受试者的应答持续时间(DOR)。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加将该受试者具有客观缓解的可能性且/或增加该受试者的客观缓解率(ORR)。
在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂增加该受试者具有完全缓解(CR)的可能性。
在一些实施例中,铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。
在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。
在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂。
在其他实施例中,铂类化疗剂为卡铂。
在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含卡铂和吉西他滨。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和培美曲塞(premetrexed)或者卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和培美曲塞。
在一些实施例中,铂类化疗包含卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,在一个或多个给药周期诸如1至10个给药周期(例如,2至8个给药周期、3至7个给药周期或4至6个给药周期)期间向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂。在一些实施例中,在4至6个给药周期期间向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂。PD-1轴结合拮抗剂可以在每一个给药周期期间向受试者施用一次或多次,诸如每个给药周期一次。
在一些实施例中,给药周期持续长达58个月。例如,给药贮器可持续1个月至100个月,诸如2个月至99个月、3个月至98个月、4个月至97个月、5个月至96个月、6个月至95个月、7个月至94个月、8个月至93个月、9个月至92个月、10个月至91个月、11个月至90个月、12个月至89个月、13个月至88个月、14个月至87个月、15个月至86个月、16个月至85个月、17个月至84个月、18个月至83个月、19个月至82个月、20个月至81个月、21个月至80个月、22个月至79个月、23个月至78个月、24个月至77个月、25个月至76个月、26个月至75个月、27个月至74个月、28个月至73个月、29个月至72个月、30个月至71个月、31个月至70个月、32个月至69个月、33个月至68个月、34个月至67个月、35个月至66个月、36个月至65个月、37个月至64个月、36个月至63个月、37个月至62个月、38个月至61个月、39个月至60个月、50个月至70个月、51个月至69个月、52个月至68个月、53个月至67个月、54个月至66个月、55个月至61个月、56个月至60个月或57个月至59个月。
在一些实施例中,每一个给药周期为约21天。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂作为单一疗法向受试者施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂与铂类化疗组合向受试者施用,该铂类化疗诸如包括铂类化疗剂和核苷类似物的铂类化疗。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为顺铂。在其他实施例中,向受试者施用的铂类化疗剂为卡铂。在一些实施例中,向受试者施用的核苷类似物为吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含卡铂和吉西他滨。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和培美曲塞或者卡铂和培美曲塞。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含顺铂和培美曲塞。在一些实施例中,向受试者施用的铂类化疗包含卡铂和培美曲塞。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约5的曲线下面积(AUC)向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约6的AUC向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约6的AUC向受试者静脉内施用卡铂。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以及第7天至第11天(例如,在第7天、第8天、第9天、第10天或第11天)以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以及第7天至第11天(例如,在第7天、第8天、第9天、第10天或第11天)以约1250mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1250mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天(例如,在21天给药周期的第-2天、第-1天、第0天、第1天、第2天、第3天或第4天)以约500mg/m2的剂量向受试者静脉内施用培美曲塞。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约500mg/m2的剂量向受试者静脉内施用培美曲塞。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂组成的组。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-L1结合拮抗剂。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1、B7-1或者PD-1和B7-1两者的结合。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体为阿特珠单抗
Figure BDA0004012333940000641
MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体包含以下高变区(HVR):(a)GFTFSDSWIH(SEQ IDNO:19)的HVR-H1序列;(b)AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)的HVR-H2序列;(c)RHWPGGFDY(SEQ ID NO:21)的HVR-H3序列;(d)RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)的HVR-L1序列;(e)SASFLYS(SEQ ID NO:23)的HVR-L2序列;和(f)QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)的HVR-L3序列。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)重链可变(VH)结构域,其包含与SEQ IDNO:3的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;(b)轻链可变(VL)结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列,和(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列。
在一些实施例中,抗PD-L1抗体是阿特珠单抗。
在一些实施例中,以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1、PD-L2或者PD-L1和PD-L2两者的结合。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。
在一些实施例中,抗PD-1抗体为MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810或BGB-108。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白。
在一些实施例中,Fc融合蛋白为AMP-224。
在一些实施例中,受试者为化疗初治的。例如,受试者可以是先前未施用用于治疗NSCLC的化疗的受试者。在一些实施例中,受试者先前不曾施用全身疗法来治疗NSCLC。在一些实施例中,先前未向受试者施用用于治疗NSCLC的任何疗法。
在一些实施例中,NSCLC为IV期NSCLC。
在一些实施例中,NSCLC为转移性NSCLC。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中1%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约4%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约5%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%至约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约99%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约1%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约4%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约1%至约100%、肿瘤样品的约5%至约100%、肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约15%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至约100%或肿瘤样品的约90%至约100%(例如,肿瘤样品的约1%、肿瘤样品的约2%、肿瘤样品的约3%、肿瘤样品的约4%、肿瘤样品的约5%、肿瘤样品的约6%、肿瘤样品的约7%、肿瘤样品的约8%、肿瘤样品的约9%、肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%至少于5%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约1%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约2%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约3%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约4%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约1%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约2%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约3%或肿瘤样品中肿瘤细胞的约4%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中5%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约5%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%至约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约99%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约5%至约100%、肿瘤样品的约6%至约100%、肿瘤样品的约7%至约100%、肿瘤样品的约8%至约100%、肿瘤样品的约9%至约100%、肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至100%或肿瘤样品的约90%至100%(例如,肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约5%至少于50%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品被确定为,在肿瘤样品中约5%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约6%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约7%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约8%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约9%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约10%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约11%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约12%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约13%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约14%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约15%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约16%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约17%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约18%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约19%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约20%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约21%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约22%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约23%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约24%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约25%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约26%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约27%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约28%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约29%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约30%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约31%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约32%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约33%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约34%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约35%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约36%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约37%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约38%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约39%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约40%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约41%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约42%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约43%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约44%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约45%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约46%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约47%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约48%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约49%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品中肿瘤细胞的约5%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约6%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约7%、肿瘤样品中肿瘤细胞的约8%或肿瘤样品中肿瘤细胞的约9%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中50%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中约50%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%至约100%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%之约100%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约90%至约100%的肿瘤细胞(例如,肿瘤样品中约50%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约51%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约52%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约53%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约54%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约55%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约56%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约57%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约58%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约59%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约60%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约61%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约62%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约63%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约64%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约65%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约66%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约67%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约68%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约69%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约70%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约71%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约72%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约73%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约74%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约75%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约76%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约77%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约78%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约79%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约80%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约81%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约82%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约83%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约84%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约85%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约86%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约87%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约88%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约89%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约90%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约91%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约92%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约93%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约94%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约95%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约96%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约97%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约98%的肿瘤细胞、肿瘤样品中约99%的肿瘤细胞或肿瘤样品中约100%的肿瘤细胞)中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的约10%至约100%、肿瘤样品的约20%至约100%、肿瘤样品的约30%至约100%、肿瘤样品的约40%至约100%、肿瘤样品的约50%至约100%、肿瘤样品的约60%至约100%、肿瘤样品的约70%至约100%、肿瘤样品的约80%至100%或肿瘤样品的约90%至100%(例如,肿瘤样品的约10%、肿瘤样品的约11%、肿瘤样品的约12%、肿瘤样品的约13%、肿瘤样品的约14%、肿瘤样品的约15%、肿瘤样品的约16%、肿瘤样品的约17%、肿瘤样品的约18%、肿瘤样品的约19%、肿瘤样品的约20%、肿瘤样品的约21%、肿瘤样品的约22%、肿瘤样品的约23%、肿瘤样品的约24%、肿瘤样品的约25%、肿瘤样品的约26%、肿瘤样品的约27%、肿瘤样品的约28%、肿瘤样品的约29%、肿瘤样品的约30%、肿瘤样品的约31%、肿瘤样品的约32%、肿瘤样品的约33%、肿瘤样品的约34%、肿瘤样品的约35%、肿瘤样品的约36%、肿瘤样品的约37%、肿瘤样品的约38%、肿瘤样品的约39%、肿瘤样品的约40%、肿瘤样品的约41%、肿瘤样品的约42%、肿瘤样品的约43%、肿瘤样品的约44%、肿瘤样品的约45%、肿瘤样品的约46%、肿瘤样品的约47%、肿瘤样品的约48%、肿瘤样品的约49%、肿瘤样品的约50%、肿瘤样品的约51%、肿瘤样品的约52%、肿瘤样品的约53%、肿瘤样品的约54%、肿瘤样品的约55%、肿瘤样品的约56%、肿瘤样品的约57%、肿瘤样品的约58%、肿瘤样品的约59%、肿瘤样品的约60%、肿瘤样品的约61%、肿瘤样品的约62%、肿瘤样品的约63%、肿瘤样品的约64%、肿瘤样品的约65%、肿瘤样品的约66%、肿瘤样品的约67%、肿瘤样品的约68%、肿瘤样品的约69%、肿瘤样品的约70%、肿瘤样品的约71%、肿瘤样品的约72%、肿瘤样品的约73%、肿瘤样品的约74%、肿瘤样品的约75%、肿瘤样品的约76%、肿瘤样品的约77%、肿瘤样品的约78%、肿瘤样品的约79%、肿瘤样品的约80%、肿瘤样品的约81%、肿瘤样品的约82%、肿瘤样品的约83%、肿瘤样品的约84%、肿瘤样品的约85%、肿瘤样品的约86%、肿瘤样品的约87%、肿瘤样品的约88%、肿瘤样品的约89%、肿瘤样品的约90%、肿瘤样品的约91%、肿瘤样品的约92%、肿瘤样品的约93%、肿瘤样品的约94%、肿瘤样品的约95%、肿瘤样品的约96%、肿瘤样品的约97%、肿瘤样品的约98%、肿瘤样品的约99%或肿瘤样品的约100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
例如,可使用免疫组织化学(IHC)及本文所述的其他技术确定PD-L1表达。在一些实施例中,使用抗PD-L1抗体确定PD-L1表达。可使用任何合适的抗PD-L1抗体,包括例如SP142、SP263、22C3、28-8、E1L3N、4059、h5H1和9A11。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP142。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP263。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为22C3。
在一些实施例中,受试者为人,诸如(i)不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变的人和/或(ii)不具有ALK融合致癌基因的人。例如,受试者可以是不具有EGFR或ALK肿瘤基因组畸变的人。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期期间向受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中该受试者是未接受过化疗的,其中该受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自该受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从该受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在该肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)在占该肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
在又一方面,本公开提出一种PD-1轴结合拮抗剂,其用于按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法使用。
在另一方面,本公开提出一种PD-1轴结合拮抗剂用于制造药物的用途,该药物用于按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法来治疗非鳞状NSCLC。
在另一方面,本公开提出一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和指示该试剂盒的使用者按照根据本公开的上述任何方面或实施例的方法向受试者施用该PD-1轴结合拮抗剂的包装插页。
应了解,本文所描述的各种实施例的一种、一些或所有特性可组合形成本公开的其他实施例。本公开的这些和其他方面对于本领域技术人员将变得显而易见。通过下面的详细描述进一步描述本公开的这些和其他实施例。
附图说明
图1为总结下文实例1中描述的临床试验的设计的示意图。简而言之,将患有非小细胞肺癌(NSCLC)的患者随机分配为一个或两个队列:接受阿特珠单抗单一疗法的那些,和接受铂类化疗的那些。监测患者的总存活(OS)、无进展存活(PFS)和其他参数,如实例1中所述。
图2为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者中,施用阿特珠单抗的那些患者表现出相对于施用铂类化疗方案的那些患者的统计学显著且有临床意义的OS改善。关于实验设计的细节提供在实例1中。
图3为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者中,施用阿特珠单抗的那些患者表现出相对于施用铂类化疗方案的那些患者的有临床意义的PFS改善。关于实验设计的细节提供在实例1中。
图4为显示在纳入如实例1中所述的阿特珠单抗单一疗法安全性和疗效临床研究中的患者的PD-L1表达分布的图。
图5为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于总存活的效应,与施用铂类化疗方案的患者相比。
图6A和图6b提供一系列森林图,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者的各种亚组中,阿特珠单抗单一疗法对于总存活的效应。
图7为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC2/3或IC2/3-WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于总存活的效应,与施用铂类化疗方案的患者相比。
图8为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于总存活的效应,与施用铂类化疗方案的患者相比。
图9为Kaplan-Meier曲线,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于无进展存活的效应,与施用铂类化疗方案的患者相比。
图10显示一组Kaplan-Meier曲线,其表明在如下文实例1中所述进行治疗的TC2/3或IC2/3群体(左)或TC1/2/3或IC1/2/3WT群体(右)中的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于无进展存活的效应,与施用铂类化疗方案的患者相比。
图11提供图,其显示在如下文实例1所述进行治疗的TC3或IC3-WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于总应答率(ORR)和应答持续时间(DOR)的效应。图11还提供表,其显示在如下文实例1中所述进行治疗的TC2/3、IC2/3、TC1/2/3或IC1/2/3WT群体内的患者中,阿特珠单抗单一疗法对于ORR和DOR的效应。
图12为总结如下文实例1所述用阿特珠单抗单一疗法或化疗来治疗的各个患者组经历的不良事件(AE)的图。
图13A至13D为显示按如下文实例1中所述用阿特珠单抗来治疗的生物标志物可评定患者(BEP)中的PD-L1表达进行的总存活分层。图31A显示22C3≥50% TPS群体、SP263≥50% TC群体和SP142 TC3或IC3群体之间的重叠。图13B显示根据22C3 PD-L1 IHC测定对≥50% TPS WT群体中的OS的Kaplan-Meier估计。图13C显示根据SP263 PD-L1 IHC测定对≥50% TC WT群体中的OS的Kaplan-Meier。图13D显示通过SP142IHC、SP263和22C3测定定义的PD-L1亚组中的OS。使用Kaplan-Meier方法估计中位数。对于SP263和22C3亚组分析,显示了未分层的HR。对于22C3与SP142重叠,ITT-WT群体内的BEP包括534例患者;对于SP263与SP142重叠,包括546例患者;而对于22C3与SP263重叠,包括530例患者。ITT-WT=TC1/2/3或IC1/2/3。
图14A至14C为显示在如下文实例1中所述用阿特珠单抗来治疗的患者中,按血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分的总存活和无进展存活分层的图。图14A显示PD-L1-高群体(通过22C3或SP142 IHC定义)与bTMB-高群体之间的重叠。图14B显示bTMB亚组中的OS。bTMB亚组显示为相对于bTMB-BEP的百分比。图14C显示bTMB亚组中的PFS。bTMB亚组显示为相对于bTMB-BEP的百分比。TC1/2/3或IC1/2/3=PD-L1表达≥1%TC或IC。非BEP组包括具有MSAF<1%的bTMB结果的患者(n=88)、具有未通过测试服务提供者的质量控制的样品或具有中位外显子覆盖度<800的患者(n=39)或未提交基线血浆样品的患者(n=38)。TC3或IC3=PD-L1表达≥50% TC或≥10% IC。
图15为显示如下文实例1所述用阿特珠单抗来治疗的患者中的PD-L1表达的流行率的图,如通过免疫组织化学所评定。“ITT-WT”表示TC1/2/3或IC1/2/3-WT患者。BEP表示生物标志物可评定群体;IC,肿瘤浸润免疫细胞;IHC,免疫组织化学;TC,肿瘤细胞;TPS,肿瘤比例评分。
图16A至16F为显示如下文实例1中所述用阿特珠单抗来治疗的患者中,按通过SP142、SP263和22C3免疫组织化学测定所评定的PD-L1表达的总存活分层的图。图16A显示TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体内的22C3≥1%TPS疫组化群体与SP263≥1%TC免疫组织化学群体之间的重叠。图16B和16C显示通过PD-L1 IHC测定获得的PD-L1阳性亚组中的OS。图16D至16F显示通过PD-L1 IHC测定获得的PD-L1-低亚组中的OS。对于22C3与SP263重叠,ITT-WT群体内的BEP为530例患者。Atezo表示阿特珠单抗;chemo,化疗;OS,总存活;PFS,无进展存活;TC,肿瘤细胞;TPS,肿瘤比例评分;WT,野生型。
图17为显示通过SP142 IHC、SP263和22C3测定来定义的PD-L1亚组中的无进展存活的图。SP142 BEP-WT=TC1/2/3或IC1/2/3-WT。对于SP142 ITT-WT和TC3或IC3-WT,分层的HR;对于所有其他亚组,未分层的HR。Atezo表示阿特珠单抗;BEP,生物标志物可评定群体;chemo,化疗;PFS,无进展存活;TC,肿瘤细胞;WT,野生型。
具体实施方式
I.介绍
本公开提供用于治疗或评定患有癌症例如非小细胞肺癌(NSCLC,例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期鳞状和非鳞状NSCLC)的受试者的治疗性、诊断性和预防性方法和组合物。本公开的组合物和方法可用来鉴别患有癌症(例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期鳞状和非鳞状NSCLC)的受试者,该受试者尤其可能受益于用PD-1轴结合拮抗剂(诸如抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗))的治疗。例如,使用本文所述的组合物和方法,如果患有癌症(例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期鳞状和非鳞状NSCLC)的受试者表现出大于或等于参考血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分的bTMB评分,则可以将该受试者鉴别为可能受益于用PD-1轴结合拮抗剂的治疗。本公开部分地基于以下发现:患有癌症(例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期鳞状和非鳞状NSCLC)且表现出处于或高于阈值水平的bTMB评分的受试者具有对PD-1轴结合拮抗剂治疗有应答的高可能性。这一发现在下文的工作实例中进一步详细描述。
本公开的组合物和方法提供一系列重要的临床益处。使用本文所述的组合物和方法,可在治疗开始前评定患有癌症(例如,鳞状和非鳞状NSCLC,包括IV期鳞状和非鳞状NSCLC)的受试者受益于PD-1轴结合拮抗剂疗法的可能性。因此,本公开的组合物和方法使得可能受益于PD-1轴结合拮抗剂疗法的受试者能够在早期被鉴别并据此进行治疗。类似地,可以向例如基于低于bTMB参考水平的bTMB评分而被鉴别为受益于PD-1轴结合拮抗剂疗法的可能性较低的受试者施用不包括PD-1轴结合拮抗剂的治疗方案。
可以与本公开的组合物和方法联合使用的PD-1轴结合拮抗剂包括PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂。例如,PD-1轴结合拮抗剂可以是PD-L1结合拮抗剂,诸如抗PD-L1抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为阿特珠单抗
Figure BDA0004012333940000931
MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。可以通过本文所述的任何施用途径和给药计划,诸如以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向被鉴别为可能受益于阿特珠单抗治疗的受试者静脉内施用阿特珠单抗。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂,诸如抗PD-1抗体。可与本公开的组合物和方法联合使用的示例性抗PD-1抗体包括MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810和BGB-108。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白,诸如AMP-224。
以下章节进一步详细描述用于确定受试者(例如,患有鳞状或非鳞状NSCLC诸如IV期鳞状或非鳞状NSCLC的受试者)受益于PD-1轴结合拮抗剂疗法的可能性的组合物和方法,以及用于据此治疗受试者的组合物和方法。
II.定义
在详细描述本公开的组合物和方法之前,应当理解,本公开不限于特定的组合物或生物学系统,这些组合物或生物学系统当然可以变化。另外应当了解,本文使用的术语只是为了描述特定实施例的目的,并非旨在进行限制。
如在本说明书和所附权利要求中所用,除非内容另外明确规定,否则单数形式“一个”、“一种”、“该”和“所述”包括复数指代物。因此,例如,对“分子”的提及任选地包括两个或更多此类分子的组合等。
如本文所用的术语“约”是指为此技术领域中的技术人员容易知晓的相应值的常见误差范围。在本文中提及“约”值或参数包括(且描述)涉及该值或参数本身的实施例。
应理解,本文所述的公开的方面和实施例包括“包含”、“由以下组成”及“基本上由以下组成”所指的方面和实施例。
如本文所述,各自可互换使用的术语“血液肿瘤突变的负荷评分”、“血液肿瘤突变负荷评分”和“bTMB评分”是指反映在获自个体(例如,处于癌症风险下或患有癌症的个体)的血液样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)中检测到的体细胞突变数量的数值。例如,可以在全基因组或外显子组(例如,预定的一组基因)的基础上,或在基因组或外显子组的子集的基础上测量bTMB评分。在一些实施例中,可基于基因间序列来测量bTMB评分。在一些实施例中,在基因组或外显子组的子集的基础上测量的bTMB评分可以外推以确定全基因组或外显子组bTMB评分。在一些实施例中,预定的该组基因不包含完整基因组或完整外显子组。在一些实施例中,该组亚基因组间隔不包含完整基因组或完整外显子组。在一些实施例中,预定的改组基因包含多个基因,这些基因以突变体形式与对于细胞分裂、生长或存活的效应相关联,或者与癌症相关联。在一些实施例中,预定的该组基因包含至少约50个或更多个、约100个或更多个、约150个或更多个、约200个或更多个、约250个或更多个、约300个或更多个、约350个或更多个、约400个或更多个、约450个或更多个、或约500个或更多个基因。在一些实施例中,预定的该组基因覆盖约1Mb(例如,约1.1Mb,例如,约1.125Mb)。
在一些实施例中,通过测量样品中的无细胞DNA(cfDNA)中的体细胞突变数量来确定bTMB评分。在一些实施例中,通过测量样品中的循环肿瘤DNA(ctDNA)中的体细胞突变数量来确定bTMB评分。在一些实施例中,体细胞突变的数量为所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。在一些实施例中,bTMB评分指代在肿瘤内蓄积的体细胞突变的数量。因此,bTMB评分可用作致癌(例如,肿瘤)细胞上的新抗原数量的替代物。bTMB评分也可用作肿瘤内突变率的替代物,肿瘤内突变率是致癌(例如,肿瘤)细胞上新抗原数量的指标。在一些实施例中,bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将个体鉴别为可能受益于包含免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,阿特珠单抗))的治疗的个体。在一些实施例中,bTMB评分低于参考bTMB评分将个体鉴别为可能受益于包含并非PD-1轴结合拮抗剂或除了PD-1轴结合拮抗剂之外的抗癌疗法的治疗的个体。在一些实施例中,bTMB评分可用于监测患有癌症的个体对免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,阿特珠单抗))的治疗的应答。
本文所用,术语“参考bTMB评分”是指针对被比较的另一bTMB评分的bTMB评分,例如,以作出诊断性、预测性、预后性和/或治疗性确定。例如,参考bTMB评分可以是参考样品、参考群体中的bTMB评分和/或预定的值。在一些情况下,参考bTMB评分是截断值,其基于个体对用免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂疗法)的治疗的应答性与个体对用非PD-1轴结合拮抗剂疗法的治疗的应答性之间的处于或高于截断值和/或低于截断值的显著差异,显著地将参考群体内已经用免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂疗法)来治疗的个体的第一子集与相同参考群体内已经用不包含免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂)的非PD-1轴结合拮抗剂疗法来治疗的个体的第二子集分开。在一些情况下,相对于个体对用非PD-1轴结合拮抗剂疗法的治疗的应答性处于或高于截断值,个体对使用免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂疗法)的治疗的应答性显著改善。在一些情况下,相对于个体对使用免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂疗法)的治疗的应答性低于截断值,个体对用非PD-1轴结合拮抗剂疗法的治疗的应答性显著改善。
本领域技术人员将会了解,参考bTMB评分的数值可依据癌症的类型(例如,肺癌(例如,非小细胞肺癌(NSCLC))、肾癌(例如,肾尿路上皮癌)、膀胱癌(例如,膀胱尿路上皮(移行细胞)癌)、乳腺癌、结直肠癌(例如,结肠腺癌)、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、食管癌、间皮瘤、黑色素瘤(例如,皮肤黑色素瘤)、头颈癌(例如,头颈鳞状细胞癌(HNSCC))、甲状腺癌、肉瘤(例如,软组织肉瘤、纤维肉瘤、粘液肉瘤、脂肪肉瘤、成骨性肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、血管肉瘤、内皮肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、平滑肌肉瘤或横纹肌肉瘤)、前列腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、胸腺癌、白血病(例如,急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓细胞白血病(AML)、慢性髓细胞白血病(CML)、慢性嗜酸细胞白血病或慢性淋巴细胞白血病(CLL))、淋巴牛(例如,霍奇金淋巴瘤或非霍奇金淋巴瘤(NHL))、骨髓瘤(例如,多发性骨髓瘤(MM))、蕈样肉芽肿、merkel细胞癌、血液系统恶性肿瘤、血液组织癌症、B细胞癌、支气管癌、胃癌、脑或中枢神经系统癌症、周围神经系统癌症、子宫癌或子宫内膜癌、口腔癌或咽癌、肝癌、睾丸癌、胆管癌、小肠癌或阑尾癌、唾液腺癌、肾上腺癌、腺癌、炎症性肌纤维母细胞瘤、胃肠道间质瘤(GIST)、结肠癌、骨髓增生异常综合征(MDS)、骨髓增生性疾病(MPD)、真性红细胞增多、脊索瘤、滑膜瘤、尤文氏肉瘤、鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳头状癌、乳头状腺癌、髓样癌、肾细胞癌、肝细胞癌、肝癌、胆管癌、绒毛膜癌、精原细胞瘤、胚胎性癌、肾母细胞瘤、膀胱癌、上皮癌、神经胶质瘤、星形细胞瘤、成神经管细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜瘤、松果体瘤、成血管细胞瘤、听神经瘤、少突神经胶质瘤、脑膜瘤、成神经细胞瘤、成视网膜细胞瘤、滤泡性淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、肝细胞癌、甲状腺癌、小细胞癌、原发性血小板增多症、特发性髓样化生、嗜酸性粒细胞增多综合征、系统性肥大细胞增多症、家族性嗜酸性粒细胞增多症、神经内分泌癌或类癌瘤)、用来测量bTMB评分的方法和/或用来生成bTMB评分的统计方法而变。
术语“等效bTMB值”是指对应于以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb)表示,例如,如通过
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基因包所评定)的bTMB评分的数值。应理解,bTMB评分一般与所测序的基因组区的尺寸线性相关。此类等效bTMB值指示当与bTMB评分相比时的肿瘤突变负荷的等效程度并且在本文所述的方法中可互换使用,例如,以预测癌症患者对免疫检查点抑制剂(例如,抗PD-L1抗体,例如,阿特珠单抗)的应答。举例来说,在一些实施例中,等效bTMB值为归一化的bTMB值,其可通过体细胞突变体(例如,体细胞突变)的计数除以所测序的碱基数量来计算。例如,等效bTMB值可以表示为例如每兆碱基的突变数量。例如,约25的bTMB评分(如作为在约1.1Mb上计数的体细胞突变数量所确定)对应于约23个突变/Mb的等效bTMB值。应理解,如本文所述的bTMB评分(例如,表示为在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量的bTMB评分(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb),如通过/>
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基因包所评定))涵盖使用不同方法(例如,全外显子组测序或全基因组测序)获得的等效bTMB值。举例来说,对于全外显子组的基因包,靶区可以是大约50Mb,且检测出约500个体细胞突变的样品具有约10个突变/Mb的等效bTMB值。在一些实施例中,作为在基因组或外显子组(例如,预定的一组基因)的子集中的规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb),例如,如通过/>
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基因包所评定)而确定的bTMB评分与通过全外显子组测序确定的bTMB评分的偏差小于约30%(例如,小于约30%、约25%、约20%、约15%、约10%、约5%、约4%、约3%、约2%、约1%或更少)。参见例如,Chalmers等人GenomeMedicine 9:34,2017。
如本文所用,术语“最大体细胞等位基因频率”和“MSAF”各自可互换使用,是指表示为分数或百分比的小于约40%(例如,小于40%、30%、20%、10%、5%或1%)的等位基因(即,具有体细胞突变(例如,在编码区内的碱基取代和/或在编码区内的插入缺失突变)的基因变体)的最高频率,该频率是从来自个体的样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)检测的。体细胞突变的等位基因频率可以通过指示体细胞突变的序列读段数量除以与人类基因组的特定区比对的总读段来计算。在一些情况下,从样品中小于约20%的最大体细胞等位基因频率导出MSAF。在一些实施例中,该值为来自受试者的样品中所有携带该等位基因的cfDNA的分数。在一些实施例中,该值为来自受试者的样品中携带该等位基因的ctDNA的分数。在一些实施例中,该值用来估计样品中肿瘤内容物的总量。在一些实施例中,该方法包括确定从样品检测出的每一种体细胞改变的等位基因频率。例如,具有多种体细胞改变的样品可以将那些改变体现为体细胞等位基因频率的分布,该分布可能取决于那些改变在癌症(例如,肿瘤)中的原始克隆频率。在一些实施例中,该值表示为该组预定的基因(例如,该组预定的基因的编码区)的函数。在其他实施例中,该值表示为所测序的亚基因组间隔(例如,所测序的编码亚基因组间隔)的函数。在一些实施例中,MSAF可用来提供对患有癌症的个体的预后。
术语“体细胞突变”或“体细胞变异”是指在体细胞组织(例如,种系外的细胞)中发生的遗传变异。遗传变异的实例包括但不限于点突变(例如,单个核苷酸交换成另一个核苷酸(例如,沉默突变、错义突变和无义突变))、插入和缺失(例如,一个或多个核苷酸的添加和/或去除(例如indels))、扩增、基因重复、拷贝数改变(CNA)、重排和剪接变体。在一些实施例中,插入缺失可以是一个或多个核苷酸(例如,约1至40个核苷酸)的移码突变或整码突变。特定突变的存在可能与疾病状态(例如,癌症,例如,肺癌(例如,非小细胞肺癌(NSCLC))、肾癌(例如,肾尿路上皮癌)、膀胱癌(例如,膀胱尿路上皮(移行细胞)癌)、乳腺癌、结直肠癌(例如,结肠腺癌)、卵巢癌、胰腺癌、胃癌、食管癌、间皮瘤、黑色素瘤(例如,皮肤黑色素瘤)、头颈癌(例如,头颈鳞状细胞癌(HNSCC))、甲状腺癌、肉瘤(例如,软组织肉瘤、纤维肉瘤、粘液肉瘤、脂肪肉瘤、成骨性肉瘤、骨肉瘤、软骨肉瘤、血管肉瘤、内皮肉瘤、淋巴管肉瘤、淋巴管内皮肉瘤、平滑肌肉瘤或横纹肌肉瘤)、前列腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、胸腺癌、白血病(例如,急性淋巴细胞白血病(ALL)、急性髓细胞白血病(AML)、慢性髓细胞白血病(CML)、慢性嗜酸细胞白血病或慢性淋巴细胞白血病(CLL))、淋巴牛(例如,霍奇金淋巴瘤或非霍奇金淋巴瘤(NHL))、骨髓瘤(例如,多发性骨髓瘤(MM))、蕈样肉芽肿、merkel细胞癌、血液系统恶性肿瘤、血液组织癌症、B细胞癌、支气管癌、胃癌、脑或中枢神经系统癌症、周围神经系统癌症、子宫癌或子宫内膜癌、口腔癌或咽癌、肝癌、睾丸癌、胆管癌、小肠癌或阑尾癌、唾液腺癌、肾上腺癌、腺癌、炎症性肌纤维母细胞瘤、胃肠道间质瘤(GIST)、结肠癌、骨髓增生异常综合征(MDS)、骨髓增生性疾病(MPD)、真性红细胞增多、脊索瘤、滑膜瘤、尤文氏肉瘤、鳞状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、汗腺癌、皮脂腺癌、乳头状癌、乳头状腺癌、髓样癌、肾细胞癌、肝细胞癌、肝癌、胆管癌、绒毛膜癌、精原细胞瘤、胚胎性癌、肾母细胞瘤、膀胱癌、上皮癌、神经胶质瘤、星形细胞瘤、成神经管细胞瘤、颅咽管瘤、室管膜瘤、松果体瘤、成血管细胞瘤、听神经瘤、少突神经胶质瘤、脑膜瘤、成神经细胞瘤、成视网膜细胞瘤、滤泡性淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤、套细胞淋巴瘤、肝细胞癌、甲状腺癌、小细胞癌、原发性血小板增多症、特发性髓样化生、嗜酸性粒细胞增多综合征、系统性肥大细胞增多症、家族性嗜酸性粒细胞增多症、神经内分泌癌或类癌瘤)相关联。
在某些实施例中,体细胞改变为沉默突变(例如,同义改变)。在其他实施例中,体细胞改变为非同义单核苷酸变体(SNV)。在其他实施例中,体细胞改变为过客突变(例如,对克隆适合性没有可检测的效应的改变)。在某些实施例中,体细胞改变为意义不明的变体(VUS),例如,其致病性既未证实也未排除的改变。在某些实施例中,体细胞改变尚未被鉴别为与癌症表型相关联。
在某些实施例中,体细胞改变与对于细胞分裂、生长或存活的效应无关或尚未已知与其相关联。在其他实施例中,体细胞改变与对于细胞分裂、生长或存活的效应相关联。
在某些实施例中,体细胞改变的数量排除亚基因组间隔中的一个或多个功能性改变。
如本文所用,术语“亚-基因组间隔”和“亚基因组间隔”可互换使用,是指基因组序列的一部分。在一些实施例中,亚基因组间隔可以是单核苷酸位置,例如,其变体与肿瘤表型(正或负)相关联的核苷酸位置。在一些实施例中,亚基因组间隔包含超过一个核苷酸位置。此类实施例包括长度为至少2、5、10、50、100、150或250个核苷酸位置的序列。亚基因组间隔可包含完整基因或其预先选择的部分,例如,编码区(或其部分)、预先选择的内含子(或其部分)或外显子(或其部分)。亚基因组间隔可包含所有或部分的天然存在的核酸(例如,基因组DNA)的片段。例如,亚基因组间隔可以对应于基因组DNA的片段,该片段经历了测序反应。在某些实施例中,亚基因组间隔为来自基因组来源的连续序列。在其他实施例中,亚基因组间隔包括在基因组中不连续的序列,例如,其可包括在cDNA中的外显子-外显子结点处形成的结点。
在一实施例中,亚基因组间隔包含下列或由其组成:单核苷酸位置;基因内区或基因间区;外显子或内含子,或其片段,通常为外显子序列或其片段;编码区或非编码区,例如,启动子、增强子、5'未翻译区(5'UTR)或3'未翻译区(3'UTR)或其片段;cDNA或其片段;SNV;SNP;体细胞突变、种系突变或两者;改变,例如,点突变或单突变;缺失突变(例如,框内缺失、基因内缺失、全基因缺失);插入突变(例如,基因内插入);倒位突变(例如,染色体内倒位);连接突变;连接的插入突变;反向复制突变;串联复制突变(例如,染色体内串联复制);易位(例如,例如,染色体易位、非相互易位);重排(例如,基因组重排(例如,一个或多个内含子或其片段的重排;重排的内含子可包括5'-和/或3'-UTR));基因拷贝数量的变化;基因表达的变化;RNA水平的变化;或它们的组合。
与对个体的临床益处增加相关联的体细胞突变的“量”或“数量”为生物样品中可检测的水平。这些可以通过本领域技术人员已知并且在本文中公开的方法来测量。所评定的体细胞突变的量可用于确定对治疗的应答。
“基因的拷贝数量”是指细胞中编码特定基因产物的DNA序列的数量。一般而言,对于给定的基因,哺乳动物具有每个基因的两个拷贝。拷贝数量可例如通过基因扩增或复制而增加,或通过缺失而减少。
在一些实施例中,功能性改变为一种改变,与参考序列(例如,野生型或未突变的序列)相比,该改变具有对于细胞分裂、生长或存活的效应(例如,促进细胞分裂、生长或存活)。在某些实施例中,通过将功能性改变包含在功能性改变的数据库(例如,COSMIC数据库)中来鉴别功能性改变(参见Forbes等人Nucl.Acids Res.43(D1):D805-D811,2015,其全文以引用方式并入本文)。在其他实施例中,功能性改变是具有已知功能性状态的改变(例如,作为COSMIC数据库中的已知体细胞改变而发生)。在某些实施例中,功能性改变为可能具有功能性状态的改变(例如,肿瘤抑制基因的截短)。在某些实施例中,功能性改变为驱动基因突变(例如,对于在其微环境中的克隆给出选择性优势的改变,例如,通过增加细胞存活或繁殖)。在其他实施例中,功能性改变为能够引起克隆性扩张的改变。在某些实施例中,功能性改变为能够引起以下一项、两项、三项、四项、五项或全部六项的改变:(a)生长信号的自给自足;(b)降低的对抗生长信号的例如不灵敏度;(c)减少的凋亡;(d)增加的复制潜力;(e)持续的血管生成;或(f)组织侵犯或转移。
在某些实施例中,功能性改变不是过客突变(例如,不是对细胞的克隆适合性没有可检测的效应的改变)。在某些实施例中,功能性改变不是意义不明的变体(VUS)(例如,不是其致病性既未证实也未排除的改变)。
在某些实施例中,排除在该组预定的基因中的预先选择的肿瘤基因中的多个(例如,约10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%或更多的)功能性改变。在某些实施例中,排除在该组预定的基因中的预先选择的基因(例如,肿瘤基因)中的所有功能性改变。在某些实施例中,排除在该组预定的基因中的多个预先选择的基因(例如,肿瘤基因)中的多个功能性改变。在某些实施例中,排除在该组预定的基因中所有基因(例如,肿瘤基因)中的所有功能性改变。
在某些实施例中,体细胞改变的数量排除亚基因组间隔中的种系突变。
在某些实施例中,种系改变为SNP、碱基取代、插入、缺失、插入缺失或沉默突变(例如,同义突变)。
在某些实施例中,使用不与匹配的正常序列进行比较的方法来排除种系改变。在其他实施例中,通过包括使用算法(例如,体细胞-种系-接合性(SGZ)算法)的方法来排除种系改变(参见Sun等人Cancer Research 2014;74(19S):1893-1893)。在某些实施例中,通过将种系改变包含在种系改变的数据库(例如,dbSNP数据库)中来鉴别种系改变(参见Sherry等人Nucleic Acids Res.29(1):308-311,2001,其全文以引用方式并入本文)。在其他实施例中,通过将种系改变包含在ExAC数据库的两个或更多个计数中来鉴别种系改变(参见Exome Aggregation Consortium等人bioRxiv预印本,2015年10月30日,其全文以引用方式并入本文)。在一些实施例中,通过将种系改变包含在1000基因组项目数据库中来鉴别种系改变(McVean等人Nature 491,56-65,2012,其全文以引用方式并入本文)。在一些实施例中,通过将种系改变包含在ESP数据库中来鉴别种系改变(外显子变体服务器,NHLBI GO外显子组测序项目(ESP),Seattle,WA)。
术语“程序性死亡配体1”和“PD-L1”在本文中指天然序列PD-L1多肽、多肽变体以及天然序列多肽和多肽变体的片段(如本文所进一步定义)。本文所述的PD-L1多肽可分离自多种来源,诸如分离自人类组织类型或其他来源,或者通过重组或合成方法制得。
“天然序列PD-L1多肽”包含与来源于天然的相应的PD-L1多肽具有相同的氨基酸序列的多肽。
“PD-L1多肽变体”或其变体是指PD-L1多肽,通常是活性PD-L1多肽,如本文所定义,与本文公开的任何天然序列PD-L1多肽序列具有至少约80%氨基酸序列一致性。此类PD-L1多肽变体包括例如PD-L1多肽,其中在天然氨基酸序列的N末端或C末端添加或缺失一个或多个氨基酸残基。通常,PD-L1多肽变体将与本文所公开的天然序列PD-L1多肽序列具有至少约80%的氨基酸序列同一性,或者至少约81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%氨基酸序列同一性。通常,PD-L1变体多肽的长度为至少约10个氨基酸,可选地至少约20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、281、282、283、284、285、286、287、288或289个氨基酸或更多。任选地,与天然PD-L1多肽序列相比,PD-L1变体多肽将具有不超过一个保守氨基酸置换,可选地,与天然PD-L1多肽序列相比,具有不超过2、3、4、5、6、7、8、9或10个保守氨基酸置换。
本文可互换使用的“多核苷酸”或“核酸”是指任何长度的核苷酸的聚合物,并且包括DNA和RNA。核苷酸可以是脱氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、修饰的核苷酸或碱基,和/或其类似物,或可以通过DNA或RNA聚合酶或通过合成反应纳入聚合物中的任何底物。因此,例如,本文所定义的多核苷酸包括但不限于:单链和双链DNA;包含单链和双链区域的DNA;单链和双链RNA;包含单链和双链区域的RNA;以及包含DNA和RNA(其可以是单链的,或更通常为双链的,或包含单链和双链区域)的杂交分子。另外,本文所用的术语“多核苷酸”是指包含RNA或DNA或RNA和DNA两者的三链区域。此类区域中的链可来自相同的分子或来自不同的分子。区域可包含分子中的一个或多个的全部,但通常仅包含分子的一部分的一个区域。具有三螺旋区的分子之一通常为寡核苷酸。术语“多核苷酸”具体地包括cDNA。
如本文所用,“寡核苷酸”通常是指短的单链多核苷酸,其长度为(但不一定)小于约250个核苷酸。寡核苷酸可以是合成的。术语“寡核苷酸”和“多核苷酸”不是互相排斥的。上面对多核苷酸的描述同样且完全适用于寡核苷酸。
术语“引物”是指单链多核苷酸,其通常能够通过提供游离的3'-OH基团与核酸杂交并允许互补核酸的聚合。
术语“检测”包括任何检测手段,包括直接检测和间接检测。
如本文所用的术语“生物标志物”是指一种可在样品中检测到的指示物,例如预测性的、诊断性的和/或预后性的,例如PD-L1。生物标志物可以用作以某些特征、分子特征、病理特征、组织学特征和/或临床特征为特征的疾病或疾患(例如,癌症)的特定亚型的指示剂。在一些实施例中,生物标记物为基因。生物标志物包括但不限于多核苷酸(例如DNA和/或RNA)、多核苷酸拷贝数改变(例如,DNA拷贝数)、多肽、多肽和多核苷酸修饰(例如,翻译后修饰)、碳水化合物和/或基于糖脂的分子标记。
与对个体的临床益处增加相关的生物标志物的“量”或“水平”是生物样品中可检测的水平。这些可以通过本领域技术人员已知并且在本文中公开的方法来测量。所评定的生物标志物的表达水平或数量可用于确定对治疗的响应。
一般而言,术语“表达的水平”或“表达水平”可互换使用,并且通常是指生物样品中生物标记物的量。“表达”通常是指将信息(例如,基因编码和/或表观遗传信息)转化为细胞中存在并运行的结构的过程。因此,如本文所用,“表达”可以指转录成多核苷酸、翻译成多肽,或者甚至是多核苷酸和/或多肽修饰(例如,多肽的翻译后修饰)。转录的多核苷酸、翻译的多肽或多核苷酸和/或多肽修饰(例如,多肽的翻译后修饰)的片段也应视为已表达,无论它们源自通过选择性剪接或降解的转录本生成的转录本,还是源自多肽的翻译后加工(例如,通过蛋白水解)。“表达的基因”包括转录为多核苷酸如mRNA,然后翻译为多肽的那些,以及还有转录为RNA但不翻译成多肽的(例如,转运RNA和核糖体RNA)那些。
“表达增加”、“表达水平增加”、“水平增加”、“表达升高”、“表达水平升高”或“水平升高”是指相对于对照例如未患有疾病或病症(例如,癌症)的一个或多个个体或内部对照(例如,管家生物标志物),个体中生物标志物的表达增加或水平增加。
“表达降低”、“表达水平降低”、“水平降低”、“表达下降”、“表达水平下降”或“水平下降”是指相对于对照未患有疾病或病症(例如,癌症)的一个或多个个体或内部对照(例如,管家生物标志物),个体中生物标志物的表达增加或水平降低。在一些实施例中,降低的表达为表达很少或不表达。
术语“管家生物标志物”是指通常类似地存在于所有细胞类型中的一种生物标志物或生物标志物组(例如,多核苷酸和/或多肽)。在一些实施例中,管家生物标志物是“管家基因”。“管家基因”在本文中是指编码蛋白质的一个基因或一组基因,这些蛋白质的活性对于维持细胞功能是必不可少的,并且管家基因通常在所有细胞类型中相似地存在。
如本文所用的“扩增”通常是指产生所需序列的多个拷贝的过程。“多拷贝”意指至少两个拷贝。“拷贝”不一定意指与模板序列具有完美的序列互补性或同一性。例如,拷贝可包括核苷酸类似物,例如脱氧肌苷、有意的序列改变(例如通过包含与模板可杂交但不互补的序列的引物所引入的序列改变)和/或扩增过程中发生的序列错误。
如本文所用,“聚合酶链反应”或“PCR”技术通常是指这样的程序,其中如例如美国专利号4,683,195中所述扩增微量的特定核酸、RNA和/或DNA片段。通常,需要从目的区域的末端或以外的区域获得序列信息,以便可以设计寡核苷酸引物;这些引物在序列上与待扩增模板的相反链相同或相似。两条引物的5'末端核苷酸可能与扩增材料的末端一致。PCR可用于从总基因组DNA扩增特定的RNA序列和特定的DNA序列,以及从总细胞RNA、噬菌体或质粒序列转录的cDNA,等等。通常参见Mullis等人,Cold Spring HarborSymp.Quant.Biol.51:263(1987)和Erlich,编,PCR Technology,(Stockton Press,NY,1989)。如本文所用,PCR被认为是用于扩增核酸测试样品的核酸聚合酶反应方法的一种,但不是唯一的示例,包括使用已知的核酸(DNA或RNA)作为引物并利用核酸聚合酶扩增或产生特定的核酸片段,或扩增或产生与特定核酸互补的特定核酸片段。
术语“多重PCR”是指使用一种以上引物组对从单一来源(例如,个体)获得的核酸进行的单一PCR反应,目的是在单一反应中扩增两个或更多个DNA序列。
“定量实时聚合酶链反应”或“qRT-PCR”是指PCR的一种形式,其中在PCR反应的每个步骤中测量PCR产物的量。该技术已经在各种出版物中进行了描述,包括例如Cronin等人,Am.J.Pathol.164(1):35-42(2004)和Ma等人,Cancer Cell 5:607-616(2004)。
术语“微阵列”是指可杂交的阵列元件,优选多核苷酸探针,在基板上的有序排列。
术语“诊断”在本文中用来指代对分子或病理状态、疾病或病症(例如,癌症(例如,非小细胞肺癌(NSCLC,例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)))的鉴别或分类。例如,“诊断”可以指特定类型的癌症的鉴别。“诊断”还可以指癌症的特定亚型的分类,例如,通过组织病理学标准或分子特征(例如,以一种生物标志物或生物标志物组合的表达为特征的亚型(例如,特定基因或由所述基因编码的蛋白质))进行。
如本文所用,术语“样品”是指获自或衍生自目标受试者和/或个体的组合物,其含有例如基于物理、生化、化学和/或生理特征待进行表征和/或鉴别的细胞和/或其他分子实体。例如,短语“疾病样品”及其变型是指从目的受试者获得的任何样品,其预期或已知包含待表征的细胞和/或分子实体。样品包括但不限于,组织样品、原代或培养的细胞或细胞系、细胞上清液、细胞裂解液、血小板、血清、血浆、玻璃体液、淋巴液、滑液、卵泡液、精液、羊水、乳汁、全血、血液来源的细胞、尿液、脑脊液、唾液、痰、眼泪、汗液、粘液、肿瘤溶解产物和组织培养基、组织提取物诸如均质化的组织、肿瘤组织、细胞提取物及其组合。
“组织样品”或“细胞样品”是指从受试者或个体的组织获得的相似细胞的集合。组织或细胞样品的来源可以是来自新鲜的、冷冻的和/或保存的器官、组织样品、活组织检查和/或吸出物的实体组织;血液或任何血液成分,例如血浆;体液,例如脑脊髓液、羊水、腹膜液或间质液;受试者妊娠或发育中任何时候的细胞。组织样品也可以是原代或培养的细胞或细胞系。任选地,组织或细胞样品获自疾病组织/器官。例如,“肿瘤样品”是从肿瘤(例如,肝肿瘤)或其他癌性组织获得的组织样品。组织样品可以包含细胞类型的混合群体(例如,肿瘤细胞和非肿瘤细胞,癌细胞和非癌细胞)。组织样品可以包含在自然环境天然不与组织混合的化合物,例如防腐剂、抗凝剂、缓冲剂、固定剂、营养物、抗生素等。
如本文所用,“肿瘤浸润免疫细胞”是指存在于肿瘤或其样品中的任何免疫细胞。肿瘤浸润免疫细胞包括但不限于肿瘤内免疫细胞、肿瘤周围免疫细胞、其他肿瘤基质细胞(例如,成纤维细胞)或其任何组合。此类肿瘤浸润免疫细胞可以是例如T淋巴细胞(诸如CD8+T淋巴细胞和/或CD4+T淋巴细胞)、B淋巴细胞或其他骨髓谱系细胞,包括粒细胞(例如,嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞)、单核细胞、巨噬细胞、树突细胞(例如,指状树突细胞)、组织细胞和自然杀伤细胞。
如本文所用,“肿瘤细胞”是指存在于肿瘤或其样品中的任何肿瘤细胞。使用本领域已知的和/或本文所述的方法,可以将肿瘤细胞与可能存在于肿瘤样品中的其他细胞,例如基质细胞和肿瘤浸润免疫细胞区分开来。
如本文所用,“参考样品”、“参考细胞”、“参考组织”、“对照样品”、“对照细胞”或“对照组织”是指用于比较目的的样品、细胞、组织、标准品或水平。在一个实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织获自同一受试者或个体身体的健康和/或未患病的部位(例如,组织或细胞)。例如,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织可以是与患病细胞或组织相邻的健康和/或未患病的细胞或组织(例如,与肿瘤相邻的细胞或组织)。在另一实施例中,参考样品获自相同受试者或个体的身体的未经处理的组织和/或细胞。在又一个实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织获自不是该受试者或个体的个体身体的健康和/或未患病的部分(例如,组织或细胞)。在再一实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织获自不是所述受试者或个体的个体身体部分的未经处理的组织和/或细胞。
为了本文的目的,组织样品的“切片”是指组织样品的单个部分或片,例如,从组织样品(例如,肿瘤样品)切下的组织或细胞的薄片。应当理解,可以获取组织样品的多个部分并进行分析,前提是可以理解,可以在形态和分子水平上对组织样品的同一部分进行分析,或者可以针对多肽(例如,通过免疫组化)和/或多核苷酸(例如,通过原位杂交)进行分析。
“关联”或“相关”是指以任何方式将第一分析或方案的性能和/或结果与第二分析或方案的性能和/或结果进行比较。例如,可以在执行第二方案时使用第一分析或方案的结果,和/或可以使用第一分析或方案的结果来确定是否应该执行第二分析或方案。关于多肽分析或方案的实施例,可以使用多肽表达分析或方案的结果来确定是否应进行具体的治疗方案。关于多核苷酸分析或方案的实施例,可以使用多核苷酸表达分析或方案的结果来确定是否应进行具体的治疗方案。
本文中使用的短语“基于”意指有关一种或多种生物标志物的信息用于告知治疗决策、包装插页或市场营销/促销指南等上提供的信息。
本文所用的“标记”一词是指直接或间接缀合或融合至试剂(诸如多核苷酸探针或抗体),并有助于对其缀合或融合的试剂进行检测的化合物或组合物。标记本身可以是可检测的(例如,放射性同位素标记或荧光标记),或者在酶标记的情况下,可以催化可检测的底物化合物或组合物的化学变化。该术语旨在涵盖通过将可检测物质偶联(即物理连接)到探针或抗体来直接标记探针或抗体,以及通过与直接标记的另一种试剂反应来间接标记探针或抗体。间接标记的实例包括使用荧光标记的二级抗体来检测一级抗体以及用生物素对DNA探针进行末端标记,使得它可用荧光标记的链霉亲和素进行检测。
在免疫功能障碍的语境中,术语“功能障碍”是指对抗原刺激的免疫应答降低的状态。该术语包括耗竭和/或无能这两个共同要素,其中可能发生抗原识别,但随后的免疫应答对控制感染或肿瘤生长无效。
如本文所用的术语“功能障碍”还包括对抗原识别的不应(refractory)或无应答,具体而言,将抗原识别转化为下游T细胞效应功能(诸如增殖、细胞因子(例如,IL-2)的产生和/或靶标细胞杀伤)的能力受损。
术语“无能”(anergy)是指通过T细胞受体传递的信号不完全或不充分导致的对抗原刺激的无应答状态(例如,在缺少ras活化的情况下细胞内Ca2+增加)。在缺少共同刺激的情况下,抗原的刺激也会导致产生T细胞无能,导致即使在共同刺激的情况下细胞对随后的抗原活化仍然变得不应。白细胞介素-2的存在常常可以克服这种无应答状态。无能T细胞不会发生克隆扩增和/或获得效应功能。
术语“耗竭”是指T细胞耗竭,即在许多慢性感染和癌症过程中,由于持续的TCR信号传导而产生的一种T细胞功能障碍状态。耗竭与无能的区别在于,耗竭不是通过不完全或不充分的信号传导而产生,而是由持续的信号传导而引起的。耗竭的定义是效应功能不佳、抑制性受体持续表达以及转录状态不同于功能性效应子或记忆T细胞的转录状态。细胞耗竭阻碍了对感染和肿瘤的最佳控制。耗竭既可由外在的负调控途径(例如,免疫调节细胞因子),也可由细胞内在的负调控(共刺激)途径(PD-1、B7-H3、B7-H4等)造成。
“肿瘤免疫”是指肿瘤逃避免疫识别和清除的过程。因此,作为治疗概念,当此类逃避行为减弱时,肿瘤免疫得到“治疗”,并且肿瘤被免疫系统识别并且攻击。肿瘤识别的实例包括肿瘤结合、肿瘤缩小和肿瘤清除。
“免疫原性”是指特定物质激起免疫应答的能力。肿瘤具有免疫原性,并且增强免疫原性有助于通过免疫应答清除肿瘤细胞。增强肿瘤免疫原性的示例包括用PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗))的治疗或使用PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗))和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的治疗。
在本公开的语境中,术语“对……应答”或“对……有应答”指示罹患、易患或证实为患有癌症(例如,NSCLC,诸如鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的患者显示对于疗法(例如,包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的抗癌疗法)的应答。根据本公开的方法,技术人员应很容易地确定,用包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的抗癌疗法来治疗的人是否显示应答。例如,应答可以通过来自癌症的痛苦减少(诸如肿瘤生长减弱和/或停滞、肿瘤尺寸减小和/或癌症的一种或多种症状减轻)来反映。优选地,应答可以通过癌症的转移性转换的指标或癌症的指标减少或减弱(例如,阻止转移灶的形成或降低转移灶的数量或尺寸)来反映。应答可以是例如完全缓解、部分缓解、无进展存活的改善、总存活的改善、持续应答和/或应答持续时间(DOR)的改善。
在一些实施例中,使用本文所公开的方法确定为处于或高于参考bTMB评分(例如,在约4与约30之间的参考bTMB评分,例如,约4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30的参考bTMB评分,诸如16的参考bTMB评分)的bTMB评分用来鉴别预计对用药物的治疗(例如,包含PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体)的治疗)有应答的可能性增加的患者。在一些实施例中,使用本文所公开的方法确定为小于参考bTMB评分(例如,在约4与约30之间的参考bTMB评分,例如,约4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30的参考bTMB评分,诸如16的参考bTMB评分)的bTMB评分用来鉴别预计对用并非PD-1轴结合拮抗剂或除了PD-1轴结合拮抗剂之外的抗癌疗法的治疗有应答的可能性增加的患者。在一些情况下,从来自个体的样品确定的bTMB评分在约8与约100之间(例如,8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95或100)。
一般而言,bTMB评分(例如,参考bTMB评分)与所测序的基因组区的尺寸呈线性相关。上述示例数量是指通过例如使用
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基因包对约1.1Mb测序而获得的bTMB评分。当对X倍的更多碱基测序时,样品的bTMB评分预期为高出约X倍。在一些实施例中,归一化的bTMB值可通过所计数的体细胞变异(例如,突变)数量除以所测序的碱基数量来计算,例如,每兆碱基的所计数的体细胞变异(例如,突变)数量。据此,前述bTMB评分或参考bTMB评分中的任一项可以是等效bTMB值,例如,通过全外显子组测序确定的等效bTMB值。在一些情况下,bTMB评分(例如,参考bTMB评分)可以在约400与约1500之间(例如,约400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400或1500的bTMB评分),例如,在基于全外显子组的测定中。
在一些实施例中,使用本文所公开的方法确定的bTMB评分与MSAF的组合用来鉴别预计对用药物的治疗(例如,包含PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体)的治疗)有应答的可能性增加的患者。在一些实施例中,使用本文所公开的方法确定的bTMB评分与MSAF的组合用来鉴别预计对用并非PD-1轴结合拮抗剂或除了PD-1轴结合拮抗剂之外的疗法的治疗有应答的可能性增加的患者。
“持续缓解”是指停止治疗后减少肿瘤生长的持续作用。例如,与施用期开始时的尺寸相比,肿瘤尺寸可以保持相同或更小。在一些实施例中,持续应答的持续时间至少与治疗持续时间相同、至少为治疗持续时间的1.5倍、2.0倍、2.5倍或3.0倍长度。
如本文所用,“减少或抑制癌症复发”是指减少或抑制肿瘤或癌症复发或肿瘤或癌症进展。如本文所公开,癌症复发和/或癌症进展包括但不限于癌症转移。
如本文所用,“完全缓解”或“CR”是指所有靶病灶的消失。
如本文所用,“部分缓解”或“PR”是指以基线靶病灶的最长直径(SLD)为参考,SLD之和减少至少30%。
如本文所用,“稳定性疾病”或“SD”是指以自治疗开始以来的最小SLD作为参考,靶病灶既没有充分缩小以符合PR,也没有充分增加以符合PD。
如本文所用,“进展性疾病”或“PD”是指靶病灶的SLD增加至少20%,以自治疗开始或出现一个或多个新病灶以来记录的最小SLD作为参考。
如本文所用,“无进展存活期(PFS)”是指在治疗期间和治疗后,被治疗的疾病(例如,癌症)不恶化的时间长度。无进展存活可包括患者经历完全应答或部分应答的时间量,以及患者经历稳定疾病的时间量。在一些实施例中,PFS可以定义为从随机分组或治疗开始至首次记录的如通过RECIST v1.1所评定的疾病进展或因任何原因死亡(以先发生者为准)的时间。
如本文所用,“客观缓解率”或“客观缓解率”(ORR)是指完全缓解(CR)率与部分缓解(PR)率之和。例如,在一些实施例中,ORR是指,基于研究人员评定,在相隔大于或等于28天的两次评定中观察到具有证实的根据RECIST v1.1的客观缓解(CR或PR)的患者的比例。
如本文所用,“总存活”或“OS”是指一组个体中在特定时间段后可能活着的个体的百分比。
如本文所用,术语“应答持续时间”(DOR)是指从记录到肿瘤应答直至疾病进展或死亡(以先发生者为准)的时间长度。
如本文所用,术语“不可手术的”与“不可切除的”可互换使用,是指不可能对其进行手术切除或不能安全地进行手术切除的癌症(例如,NSCLC,诸如鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)。
术语“符合用铂类化疗治疗的条件”是指受试者符合用铂类化疗进行治疗的条件,无论是根据主治临床医生的判断,还是根据本领域已知的铂类化疗的制定标准。例如,Galsky等人Lancet Oncol.12(3):211-4,2011中提出的标准,可用于确定受试者是否符合进行基于顺铂的化疗的条件。在一个示例中,如果患者具有以下中一种或多种情况,则认为他们不适合进行基于顺铂的化疗:肾功能受损(例如,肾小球滤过率(GFR)>30但<60mL/min);GFR可以通过直接测量(即,肌酐清除率或乙二胺四乙酸盐)进行评定,或者,如果无法获得,则通过从血清/血浆肌酐(Cockcroft-Gault公式)计算;听力丧失(例如,在两个连续频率下为25分贝的美国国家癌症研究所(NCI)不良事件通用术语标准(CTCAE)v4.0≥2级的听力测定的听力丧失);周围神经病(例如,NCI CTCAE v4.0≥2级的周围神经病(即,感觉改变或感觉异常,包括刺痛));和/或ECOG体能状态评定(参见Oken等人Am.J.Clin.Oncol.5:649-655,1982)(例如,ECOG体能状态为2)。在一些实施例中,具有以下中一种情况的受试者可能符合进行基于卡铂的化疗的条件:肾功能受损(例如,肾小球滤过率(GFR)>30但<60mL/min);GFR可以通过直接测量(即,肌酐清除率或乙二胺四乙酸盐)进行评定,或者,如果无法获得,则通过从血清/血浆肌酐(Cockcroft-Gault公式)计算;听力丧失(例如,在两个连续频率下为25分贝的CTCAE v4.0≥2级的听力测定的听力丧失);周围神经病(例如,NCICTCAE v4.0≥2级的周围神经病(即,感觉改变或感觉异常,包括刺痛));和/或ECOG体能状态评定(例如,ECOG体能状态为2)。
如本文所用,术语“治疗”是指被设计为在临床病理过程中改变被治疗的个体或细胞的自然进程的临床干预。理想的治疗效果包括降低疾病进展速度、减缓或减轻疾病状态以及缓解或改善预后。例如,如果减轻或消除了与癌症(例如,NSCLC,诸如鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)相关联的一种或多种症状,包括但不限于减少癌细胞的增殖(或摧毁癌细胞)、减轻疾病所致的症状、提高患有该疾病的人的生活质量、减少治疗该疾病所需的其他药物的剂量和/或延长个体的存活,则成功地“治疗”了个体。
如本文所用,“延迟疾病的进展”意为推迟、阻碍、减缓、阻滞、稳定和/或延缓疾病(诸如癌症(例如,NSCLC,诸如鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的发展。这种延迟可以具有不同的时间长度,这取决于病史和/或待治疗的个体。对于本领域技术人员显而易见的是,充分或显著延迟实际上可以涵盖预防,因为个体不会患该病。例如,晚期癌症,诸如转移的发展,可能被延迟。
如在本文中可互换地使用,“有效量”或“治疗有效量”至少是实现可测量的改善或预防特定病症所需的最小量。本文的有效量可以根据诸如个体的疾病状态、年龄、性别和体重以及药剂在患者中引起预期应答的能力等因素而变化。有效量也是治疗有益作用超过治疗的任何毒性或有害作用的量。对于预防用途、有益或预期结果包括诸如消除或降低风险、减轻严重程度或延缓疾病发作,包括疾病的生化、组织学和/或行为症状、其并发症以及在疾病发展过程中出现的中间病理表型。对于治疗用途、有益或预期结果包括临床结果,诸如减少由疾病引起的一种或多种症状、提高患病者的生活质量、减少治疗该疾病所需的其他药物的剂量和增强其他药物的效果(诸如通过靶向、延迟疾病进展和/或延长存活)。在癌症或肿瘤的情况下,有效量的药物可能减少癌细胞的数量;减小肿瘤大小;抑制(即在某种程度上减慢或预期停止)癌细胞浸润进入周围器官中;抑制(即在某种程度上减慢并预期停止)肿瘤转移;在某种程度上抑制肿瘤的生长;以及/或在某种程度上减轻与疾患相关联的一种或多种症状。有效量可以一次或多次施用。出于本公开的目的,药物、化合物或药物组合物的有效量为足以直接或间接地进行预防或治疗的量。如在临床背景中所理解的,与另一药物、化合物或药物组合物结合可以达到或不能达到有效量的药物、化合物或药物组合物。因此,可以在施用一种或多种治疗剂的情况下考虑“有效量”,并且如果与一种或多种其他试剂结合可以获得或实现预期结果,则可以考虑给予有效量的单一药剂。
术语“PD-1轴结合拮抗剂”是指一种分子,该分子抑制PD-1轴结合配偶体与其结合配偶体中的一者或多者的相互作用以消除由PD-1信号传导轴上的信号传导引起的T细胞功能障碍,其结果是恢复或增强T细胞功能(例如,增殖、细胞因子产生和/或靶细胞杀伤)。如本文所用,PD-1轴结合拮抗剂包括PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂。
术语“PD-L1结合拮抗剂”是指减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-L1与其一种或多种结合配偶体(诸如PD-1和/或B7-1)相互作用产生的信号传导的分子。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抑制PD-L1与其结合配偶体结合的分子。在具体方面,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1至PD-1和/或B7-1的结合。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂包括抗PD-L1抗体、其抗原结合片段、免疫粘附素、融合蛋白、寡肽和其他减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-L1与其结合配偶体中的一者或多者(诸如PD-1和/或B7-1)相互作用产生的信号转导的分子。在一个实施例中,PD-L1结合拮抗剂可降低由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的通过PD-L1的信号传导所介导的或通过其的负共刺激信号,从而使功能障碍的T细胞功能障碍较少(例如,增强效应子对抗原识别的应答)。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。在一具体方面,抗PD-L1抗体为阿特珠单抗,其以
Figure BDA0004012333940001131
上市(WHO药物信息(国际非专利药名),推荐INN:清单112,第28卷,第4期,发表于2015年1月16日(见第485页))。在另一具体方面,抗PD-L1抗体为本文所述的MDX-1105。在又一具体方面,抗PD-L1抗体为本文所述的YW243.55.S70。在又一具体方面,抗PD-L1抗体为本文所述的MEDI4736(德瓦鲁单抗)。在还又一具体方面,抗PD-L1抗体为本文所述的MSB0010718C(阿维鲁单抗)。
术语“PD-1结合拮抗剂”是指减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-1与其结合配偶体中的一者或多者(诸如PD-L1和/或PD-L2)相互作用产生的信号传导的分子。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为抑制PD-1与其结合配偶体中的一者或多者结合的分子。在具体方面,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1和/或PD-L2的结合。例如,PD-1结合拮抗剂包括抗PD-1抗体及其抗原结合片段、免疫粘附素、融合蛋白、寡肽以及其他减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-1与PD-L1和/或PD-L2相互作用产生的信号传导的分子。在一个实施例中,PD-1结合拮抗剂可降低由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的通过PD-1的信号传导所介导的或通过其的负共刺激信号,从而使功能障碍的T细胞功能障碍较少(例如,增强效应子对抗原识别的应答)。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。在一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的MDX-1106(纳武单抗)。在另一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的MK-3475(帕博利珠单抗)。在另一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的MEDI-0680(AMP-514)。另一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的PDR001。另一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的REGN2810。另一具体方面,PD-1结合拮抗剂为本文所述的BGB-108。
术语“PD-L2结合拮抗剂”是指减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-L2与其一种或多种结合配偶体(诸如PD-1)的相互作用产生的信号传导的分子。在一些实施例中,PD-L2结合拮抗剂为抑制PD-L2与其结合配偶体中的一者或多者结合的分子。在具体方面,PD-L2结合拮抗剂抑制PD-L2与PD-1的结合。在一些实施例中,PD-L2拮抗剂包括抗PD-L2抗体,其抗原结合片段、免疫粘附素、融合蛋白、寡肽和其他减少、阻断、抑制、消除或干扰由PD-L2与其结合配偶体(诸如PD-1)中的一者或多者相互作用产生的信号传导的分子。在一个实施例中,PD-L2结合拮抗剂可减少由T淋巴细胞上表达的细胞表面蛋白介导的或通过其表达的负共刺激信号,该表面蛋白通过PD-L2介导的信号传导使功能障碍的T细胞功能障碍较少(例如,增强效应子对抗原识别的应答)。在一些实施例中,PD-L2结合拮抗剂为免疫粘附素。
“病症”是将从治疗获益的任何病状,包括但不限于慢性和急性病症或疾病,包括那些使哺乳动物易患所述病症的病理性病状。示例性疾患包括癌症(例如,NSCLC,诸如鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)。
术语“细胞增殖性疾病”和“增殖性疾病”是指与某种程度的异常细胞增殖相关的病症。在一个实施例中,所述细胞增殖性病症为癌症。在一个实施例中,细胞增殖性疾患为肿瘤。
如本文所用,术语“肿瘤”是指所有赘生性细胞生长和增殖,无论是恶性还是良性,以及所有前癌性和癌性细胞和组织。术语“癌症”、“癌性”、“细胞增生性病症”、“增生性病症”和“肿瘤”在本文中并不互相排斥。
术语“癌症”和“癌性”是指或描述哺乳动物中通常以细胞生长不受控制为特征的生理状况。该定义包括良性和恶性癌症。术语“非小细胞肺癌”及其缩写“NSCLC”包括但不限于,鳞状和非鳞状NSCLC。本文所述的方法可用于治疗各个阶段的癌症,包括局部晚期和/或转移性癌症。在癌症分期中,局部晚期一般定义为已经从局部区域扩散到附近组织和/或淋巴结的癌症。在罗马数字分期系统中,局部晚期通常归类为II期或III期。转移性癌症为癌症贯穿身体扩散至远端组织和器官的阶段(IV期)。
如本文所用,术语“细胞毒性剂”是指对细胞有害(例如,引起细胞死亡、抑制增殖或以其他方式阻碍细胞功能)的任何药剂。细胞毒性剂包括但不限于放射性同位素(例如,At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212和Lu的放射性同位素);化疗剂;生长抑制剂;酶及其片段,诸如溶核酶;以及毒素,诸如细菌、真菌、植物或动物来源的小分子毒素或酶活性毒素,包括其片段和/或变体。示例性细胞毒性剂可以选自抗微管剂、铂配位络合物、烷化剂、抗生素剂、拓扑异构酶II抑制剂、抗代谢物、拓扑异构酶I抑制剂、激素和激素类似物、信号转导途径抑制剂、非受体酪氨酸激酶血管生成抑制剂、免疫治疗剂、促凋亡剂、LDH-A抑制剂、脂肪酸生物合成抑制剂、细胞周期信号传导抑制剂、HDAC抑制剂、蛋白酶体抑制剂和癌症代谢抑制剂。在一个实施例中,细胞毒性剂为铂类化疗剂。在一个实施例中,细胞毒性剂为EGFR的拮抗剂。在一个实施例中,细胞毒性剂为N-(3-乙炔基苯基)-6,7-双(2-甲氧基乙氧基)喹唑啉-4-胺(例如,厄洛替尼(erlotinib),TARCEVATM)。在一个实施例中,细胞毒性剂为RAF抑制剂。在一个实施例中,RAF抑制剂是BRAF和/或CRAF抑制剂。在一个实施例中,RAF抑制剂是维罗非尼。在一个实施例中,细胞毒性剂为PI3K抑制剂。
如本文所用,术语“化疗剂”包括可用于治疗癌症(诸如NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC))的化合物。化疗剂的示例包括厄洛替尼(
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Genentech/OSI Pharm.)、硼替佐米(/>
Figure BDA0004012333940001162
Millennium Pharm.)、双硫仑、表没食子儿茶素没食子酸酯、盐孢菌酰胺A(salinosporamide A)、卡非佐米、17-AAG(geldanamycin)、根赤壳菌素、乳酸脱氢酶A(LDH-A)、氟维司群(/>
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Wyeth)、拉帕替尼(/>
Figure BDA00040123339400011610
GSK572016,GlaxoSmith Kline)、Lonafamib(SCH 66336)、索拉非尼(/>
Figure BDA00040123339400011611
Bayer Labs)、吉非替尼(/>
Figure BDA00040123339400011612
AstraZeneca)、AG1478、烷化剂如噻替派和/>
Figure BDA00040123339400011613
环磷酰胺;烷基磺酸盐,例如白消安、英丙舒凡和哌泊舒凡;氮丙啶类,例如苯佐替派(benzodopa)、卡巴醌(carboquone)、美妥替哌(meturedopa)和乌瑞替哌(uredopa);乙烯亚胺类和甲基蜜胺类,包括六甲密胺、三亚乙基密胺(triethylenemelamine)、三亚乙基磷酰胺(triethylenephosphoramide)、三亚乙基硫代磷酰胺(triethylenethiophosphoramide)和三甲基密胺(trimethylomelamine);番荔枝内酯类(acetogenins)(特别是布拉它辛(bullatacin)和布拉它辛酮(bullatacinone));喜树碱(包括拓扑替康和伊立替康);苔藓抑素(bryostatin);callystatin;CC-1065(包括其阿多来新(adozelesin)、卡折来新(carzelesin)和比折来新(bizelesin)合成类似物);念珠藻素类(cryptophycin)(尤其是念珠藻素1和念珠藻素8);肾上腺皮质类固醇(包括泼尼松和泼尼松龙);醋酸环丙孕酮;5α-还原酶,包括非那雄胺和度他雄胺);伏立诺他、罗米地辛、泛比司他、丙戊酸、莫西司他多拉司丁(mocetinostat dolastatin);阿地白介素、滑石倍癌霉素(包括合成类似物KW-2189和CB1-TM1);五加素(eleutherobin);水鬼蕉碱(pancratistatin);sarcodictyin;海绵抑制素(spongistatin);氮芥类,如苯丁酸氮芥、萘氮芥(chlomaphazine)、氯磷酰胺、雌莫司汀、异环磷酰胺、甲氮芥、盐酸甲氧氮芥、美法仑、新霉素、苯芥胆甾醇、泼尼莫司汀(prednimustine)、曲洛磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶芥(uracil mustard);亚硝基脲类,例如卡莫司汀、氯唑霉素、铁莫司汀、洛莫斯汀、尼莫斯汀和雷莫司汀(ranimnustine);抗生素类,例如烯二炔抗生素类(诸如卡奇霉素(calicheamicin),特别是卡奇霉素γ1I和卡奇霉素ω1I(Angew Chem.Intl.Ed.Engl.33:183-186(1994));dynemicin,包括dynemicin A;双膦酸盐类,例如氯膦酸盐;esperamicin;以及新制癌菌素发色团和相关的发色团蛋白烯二炔抗生素发色团)、阿克拉霉素(aclacnomysins)、放线菌素、氨茴霉素(Authramycin)、重氮丝氨酸(azaserine)、博来霉素(bleomycins)、cactinomycin、卡拉比星(carabicin)、洋红霉素(caminomycin)、嗜癌素(carzinophilin)、色霉素(chromomycinis)、更生霉素、道诺霉素、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-氧代-L-正亮氨酸、/>
Figure BDA0004012333940001171
(阿霉素)、吗啉代-阿霉素、氰基吗啉代-阿霉素、2-吡咯烷-阿霉素和脱氧阿霉素)、表柔比星(epirubicin)、伊索比星(esorubicin)、伊达比星(idarubicin)、马赛霉素(marcellomycin)、丝裂霉素例如丝裂霉素C、霉酚酸、诺加霉素、橄榄霉素、培洛霉素(peplomycin)、泊非罗霉素(porfiromycin)、嘌呤霉素、三铁阿霉素(quelamycin)、罗多比星(rodorubicin)、链黑菌素(streptonigrin)、链脲霉素、杀结核菌素(tubercidin)、乌苯美司、净司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin);抗代谢物,例如甲氨蝶呤和5-氟尿嘧啶(5-FU);叶酸类似物,例如二甲叶酸(denopterin)、甲氨蝶呤、蝶罗呤(pteropterin)、三甲蝶呤;嘌呤类似物,例如氟达拉滨、6-巯基嘌呤、硫咪嘌呤(thiamiprine)、硫鸟嘌呤;嘧啶类似物,例如安西他滨(ancitabine)、阿扎胞苷、6-氮杂尿苷、卡莫呋(carmofur)、阿糖胞苷、双脱氧尿苷(dideoxyuridine)、多西氟啶(doxifluridine)、恩诺西汀(enocitabine)、氟尿苷(floxuridine);雄激素,例如钙雌酮、屈他雄酮丙酸酯、环硫雄醇、美雄烷、睾内酯;抗肾上腺素,例如氨基谷氨酰胺、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane);叶酸补充剂,例如叶酸;醋葡醛内酯(aceglatone);醛磷酰胺糖苷(aldophosphamide glycoside);氨基乙酰丙酸(aminolevulinic acid);恩尿嘧啶(eniluracil);安吖啶(amsacrine);bestrabucil;比生群(bisantrene);edatraxate;defofamine;地美可辛(demecolcine);地吖醌(diaziquone);elfomithine;依利醋铵(elliptinium acetate);埃博霉素(epothilone);乙环氧啶(etoglucid);硝酸镓;羟基脲;香菇多糖(lentinan);lonidainine;美登素类生物碱(maytansinoids),例如美登素((maytansine)和安丝菌素(ansamitocins);米托胍腙(mitoguazone);米托蒽醌(mitoxantrone);莫匹丹醇(mopidamnol);nitraerine;喷司他丁(pentostatin);phenamet;吡柔比星(pirarubicin);洛索蒽醌(losoxantrone);鬼臼酸(podophyllinic acid);2-乙基肼;甲苄肼;/>
Figure BDA0004012333940001184
多糖复合物(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.);雷佐生(razoxane);根瘤菌素(rhizoxin);sizofuran;锗螺胺(spirogermanium);细交链格孢酮酸(tenuazonic acid);三亚胺醌(triaziquone);2,2',2”-三氯三乙胺;单端孢霉烯族毒素类(特别是T-2毒素,verracurin A,漆斑菌素A(roridin A)和anguidine);乌拉坦(urethan);长春地辛(vindesine);达卡巴嗪(dacarbazine);甘露莫司汀(mannomustine);二溴甘露醇(mitobronitol);二溴卫矛醇(mitolactol);哌泊溴烷(pipobroman);gacytosine;阿糖胞苷(“Ara-C”);环磷酰胺;塞替派(thiotepa);紫杉烷类;苯丁酸氮芥(chloranmbucil);
Figure BDA0004012333940001181
(吉西他滨);6-硫鸟嘌呤;巯嘌呤;甲氨蝶呤;长春碱;依托泊苷(VP-16);异环磷酰胺;米托蒽醌;长春新碱;/>
Figure BDA0004012333940001182
(长春瑞滨);诺消灵(novantrone);替尼泊苷;依达曲塞(edatrexate);道诺霉素(daunomycin);氨喋呤;卡培他滨/>
Figure BDA0004012333940001183
伊班膦酸盐(ibandronate);CPT-11;拓扑异构酶抑制剂RFS 2000;二氟甲基鸟氨酸(DMFO);视黄醇类,例如视黄酸;以及任何上述的药用盐、酸和衍生物。/>
化疗剂还包括“铂类”化疗剂,其包含含有铂作为分子的组成部分的有机化合物。通常,铂类化疗剂为铂的配位络合物。铂类化疗剂在本领域中有时被称为“铂类药”。铂类化疗剂的示例包括但不限于顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂、四硝酸三铂、菲铂(phenanthriplatin)、吡铂(picoplatin,)、脂铂(lipoplatin)和沙铂(satraplatin)。
如本文所用,“铂类化疗”是指包括铂类化疗剂的化疗方案。例如,铂类化疗可以包括铂类化疗剂(例如,顺铂或卡铂)与一种或多种附加化疗剂(例如,核苷类似物(例如,吉西他滨))组合。
如本文所用,“核苷类似物”是指包括核酸类似物和糖的核苷。核苷类似物可以起到抗代谢药的作用。示例性核苷类似物包括但不限于吉西他滨、阿糖胞苷、氟达拉滨(fludarabine)和克拉屈滨(cladribine)。
化疗剂还包括:(i)起到调节或抑制激素对肿瘤的作用的抗激素剂,诸如抗雌激素和选择性雌激素受体调节剂(SERM),包括例如他莫昔芬(包括
Figure BDA0004012333940001191
枸橼酸他莫昔芬)、雷洛昔芬、屈洛昔芬(droloxifene)、iodoxyfene、4-羟基他莫昔芬、曲奥昔芬(trioxifene)、雷洛昔芬盐酸盐(keoxifene)、LY117018、奥那司酮(onapristone)和
Figure BDA0004012333940001192
(枸橼酸托瑞米芬(toremifine citrate));(ii)抑制芳香化酶的芳香化酶抑制剂,该酶可调节肾上腺的雌激素产生,例如,4(5)-咪唑、氨鲁米特(aminoglutethimide)、/>
Figure BDA0004012333940001193
(醋酸甲地孕酮)、/>
Figure BDA0004012333940001194
(依西美坦;Pfizer)、福美司坦(formestanie)、法屈唑(fadrozole)、/>
Figure BDA0004012333940001195
(伏洛唑(vorozole))、/>
Figure BDA0004012333940001196
(来曲唑;Novartis)和/>
Figure BDA0004012333940001197
(阿那曲唑;AstraZeneca);(iii)抗雄激素,诸如氟他胺(flutamide),尼鲁米特(nilutamide)、比卡鲁胺(bicalutamide)、亮丙瑞林(leuprolide)和戈舍瑞林(goserelin);布舍瑞林(buserelin)、曲普瑞林(tripterelin)、醋酸甲羟孕酮、己烯雌酚、倍美力、氟甲睾酮、所有反式视黄酸、维甲酰酚胺(fenretinide)以及曲沙他滨(1,3-二氧戊环核苷胞嘧啶类似物);(iv)蛋白激酶抑制剂;(v)脂质激酶抑制剂;(vi)反义寡核苷酸,特别是那些抑制与异常细胞增殖有关的信号传导途径中的基因表达的寡核苷酸,例如PKC-α、Ralf和H-Ras;(vii)核酶,诸如VEGF表达抑制剂(例如/>
Figure BDA0004012333940001201
)和HER2表达抑制剂;(viii)疫苗,诸如基因治疗疫苗,例如/>
Figure BDA0004012333940001202
Figure BDA0004012333940001203
rIL-2;拓扑异构酶1抑制剂,诸如
Figure BDA0004012333940001204
rmRH;以及(ix)任何上述的药用盐、酸和衍生物。
化疗剂还包括抗体,诸如阿仑单抗(Campath)、贝伐单抗(bevacizumab)(
Figure BDA0004012333940001205
Genentech);西妥昔单抗(/>
Figure BDA0004012333940001206
Imclone);帕尼单抗(
Figure BDA0004012333940001207
Amgen)、利妥昔单抗(rituximab)(/>
Figure BDA0004012333940001208
Genentech/BiogenIdec)、帕妥珠单抗(/>
Figure BDA0004012333940001209
2C4,Genentech)、曲妥珠单抗(trastuzumab)(
Figure BDA00040123339400012010
Genentech)、托西莫单抗(tositumomab)(Bexxar,Corixia)和抗体药缀合物、吉妥珠单抗奥佐米星(/>
Figure BDA00040123339400012011
Wyeth)。与本公开的化合物组合的具有治疗潜力的其他人源化单克隆抗体包括:阿泊珠单抗(apolizumab)、阿塞珠单抗、阿利珠单抗、巴比妥珠单抗、莫比伐珠单抗(bivatuzumab mertansine)、莫坎妥珠单抗(cantuzumabmertansine)、西利珠单抗(cedelizumab)、塞妥珠单抗(certolizumab pegol)、西孚昔珠单抗(cidfusituzumab)、西土珠单抗(cidtuzumab)、达利珠单抗、依库珠单抗(eculizumab)、依法珠单抗(efalizumab)、依帕珠单抗(epratuzumab)、厄利珠单抗(erlizumab)、泛维珠单抗(felvizumab)、芳妥珠单抗(fontolizumab)、吉妥珠单抗奥唑米星、奥英妥珠单抗(inotuzumab ozogamicin)、伊匹单抗、拉贝珠单抗(labetuzumab)、林妥珠单抗、马妥珠单抗、美泊利单抗、莫维珠单抗、莫妥维珠单抗(motovizumab)、那他珠单抗、尼妥珠单抗、诺罗维珠单抗(nolovizumab)、奴马维珠单抗(numavizumab)、奥瑞珠单抗(ocrelizumab)、奥玛珠单抗、帕丽珠单抗、帕考珠单抗(pascolizumab)、培孚昔单抗(pecfusituzumab)、培土珠单抗(pectuzumab)、培克珠单抗(pexelizumab)、拉利维珠单抗(ralivizumab)、兰尼单抗、瑞丽维珠单抗(reslivizumab)、瑞利珠单抗(reslizumab)、瑞希维珠单抗(resyvizumab)、罗维珠单抗(rovelizumab)、卢丽珠单抗(ruplizumab)、西罗珠单抗、西利珠单抗、松妥珠单抗(Sontuzumab)、替珠单抗(tacatuzumab tetraxetan)、他度珠单抗(tadocizumab)、他利珠单抗、替非珠单抗(tefibazumab)、托珠单抗、托利珠单抗(toralizumab)、西莫白介素单抗(tucotuzumab celmoleukin)、土库昔珠单抗(tucusituzumab)、乌马维珠单抗(umavizumab)、乌珠单抗、尤特克单抗(ustekinumab)、维西珠单抗和抗白介素-12(ABT-874/J695,惠氏研究和雅培实验室)(抗白介素-12是一种重组的人特有序列全长IgG1λ抗体,经基因修饰以识别白介素-12p40蛋白)。
化疗剂还包括“EGFR抑制剂”,是指与EGFR结合或直接相互作用并且阻止或降低其信号传导活性的化合物,并且替代性地称为“EGFR拮抗剂”。此类试剂的实例包括与EGFR结合的抗体和小分子。与EGFR结合的抗体的示例包括MAb 579(ATCC CRL HB 8506)、MAb 455(ATCC CRL HB8507)、MAb 225(ATCC CRL 8508)、MAb 528(ATCC CRL 8509)(参见,美国专利号4,943,533)及其变体,诸如嵌合的225(C225或西妥昔单抗;
Figure BDA0004012333940001211
)和重塑的人225(H225)(参见例如,WO 96/40210,Imclone Systems Inc.);IMC-11F8,一种靶向EGFR的完全人抗体(Imclone);结合II型突变EGFR的抗体(美国专利号5,212,290);如美国专利号5,891,996中所述结合EGFR的人源化和嵌合抗体;以及结合EGFR的人抗体,卡诸如ABX-EGF或帕尼单抗(参见WO98/50433,安尼克斯(Abgenix)/Amgen);EMD 55900(Stragliotto等人Eur.J.Cancer32A:636-640(1996));EMD7200(马妥珠单抗),一种针对EGFR的人源化EGFR抗体,与EGF和TGF-α竞争而与EGFR结合(EMD/默克公司(Merck));人EGFR抗体,HuMax-EGFR(GenMab);完全人抗体,称为E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3和E7.6.3,并在US 6,235,883中进行了描述;MDX-447(梅达雷克斯公司(Medarex Inc));以及mAb806或人源化mAb 806(Johns等人,J.Biol.Chem.279(29):30375-30384(2004))。可以将抗EGFR抗体与细胞毒性剂缀合,从而产生免疫缀合物(参见,例如,EP659439A2,默克专利公司(MerckPatent GmbH))。EGFR拮抗剂包括小分子,例如美国专利号5,616,582、5,457,105、5,475,001、5,654,307、5,679,683、6,084,095、6,265,410、6,455,534、6,521,620、6,596,726、6,713,484、5,770,599、6,140,332、5,866,572、6,399,602、6,344,459、6,602,863、6,391,874、6,344,455、5,760,041、6,002,008和5,747,498,以及以下PCT出版物:WO98/14451、WO98/50038、WO99/09016和WO99/24037中所述的化合物。特定的小分子EGFR拮抗剂包括OSI-774(CP-358774,厄洛替尼,/>
Figure BDA0004012333940001221
基因泰克/OSI Pharmaceuticals);PD183805(CI 1033,2-丙烯酰胺,N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-7-[3-(4-吗啉基)丙氧基]-6-喹唑啉基]-,二盐酸盐,辉瑞公司);ZD1839,吉非替尼(/>
Figure BDA0004012333940001222
4-(3'-氯-4'-氟苯胺基)-7-甲氧基-6-(3-吗啉代丙氧基)喹唑啉,阿斯利康);ZM 105180(6-氨基-4-(3-甲基苯基-氨基)-喹唑啉,捷利康公司(Zeneca));BIBX-1382(N8-(3-氯-4-氟-苯基)-N2-(1-甲基-哌啶-4-基)-嘧啶基[5,4-d]嘧啶-2,8-二胺,勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim));PKI-166((R)-4-[4-[(1-苯乙基)氨基]-1H-吡咯烷酮[2,3-d]嘧啶-6-基]-苯酚);(R)-6-(4-羟苯基)-4-[(1-苯乙基)氨基]-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶);CL-387785(N-[4-[(3-溴苯基)氨基]-6-喹唑啉基]-2-丁炔酰胺);EKB-569(N-[4-[(3-氯-4-氟苯基)氨基]-3-氰基-7-乙氧基-6-喹啉基]-4-(二甲基氨基)-2-丁烯酰胺)(惠氏);AG1478(辉瑞);AG1571(SU5271;辉瑞);双重EGFR/HER2酪氨酸激酶抑制剂,诸如拉帕替尼(/>
Figure BDA0004012333940001223
GSK572016或N-[3-氯-4-[(3-氟苯基)甲氧基]苯基]-6[5[[[2(甲基磺酰基)乙基]氨基]甲基]-2-呋喃基]-4-喹唑啉胺)。
化疗剂还包括“酪氨酸激酶抑制剂”,包括上段所述的EGFR靶向药物;小分子HER2酪氨酸激酶抑制剂,诸如可从武田制药公司(Takeda)获得的TAK165;CP-724,714,一种ErbB2受体酪氨酸激酶的口服选择性抑制剂(辉瑞和OSI);双重HER抑制剂,诸如EKB-569(可从惠氏获得),其可优先结合EGFR但同时抑制过表达HER2和EGFR的细胞;拉帕替尼(GSK572016;可从葛兰素史克公司获得),一种口服HER2和EGFR酪氨酸激酶抑制剂;PKI-166(可从诺华公司获得);泛HER抑制剂,诸如卡那替尼(CI-1033;法玛西亚公司(Pharmacia));Raf-1抑制剂,诸如可从ISIS制药公司获得的抑制Raf-1信号传导的反义剂ISIS-5132;非HER靶向的酪氨酸激酶抑制剂,诸如甲磺酸伊马替尼(
Figure BDA0004012333940001224
可从葛兰素史克公司获得);多靶向酪氨酸激酶抑制剂,诸如舒尼替尼(/>
Figure BDA0004012333940001225
可从辉瑞获得);VEGF受体酪氨酸激酶抑制剂,诸如瓦他拉尼(PTK787/ZK222584,可从诺华/先灵公司(Schering AG)获得);MAPK细胞外调节的激酶I抑制剂CI-1040(可从法玛西亚公司获得);喹唑啉类,诸如PD153035,4-(3-氯苯胺基)喹唑啉;吡啶并嘧啶类;嘧啶并嘧啶类;吡咯并嘧啶类,诸如CGP59326、CGP 60261和CGP 62706;吡唑并嘧啶类,4-(苯基氨基)-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶;姜黄素(二氟甲酰甲烷,4,5-双(4-氟苯胺基)邻苯二甲酰亚胺);含有硝基噻吩部分的酪氨酸酪氨酸;PD-0183805(华纳-兰伯特公司(Warner-Lamber));反义分子(例如与HER编码核酸结合的分子);喹噁啉类(美国专利号5,804,396);酪氨酸磷酸化抑制剂(美国专利号5,804,396);ZD6474(阿斯利康);PTK-787(诺华/先灵公司);泛HER抑制剂,诸如CI-1033(辉瑞);Affinitac(ISIS 3521;Isis/礼来制药公司(Lilly));甲磺酸伊马替尼/>
Figure BDA0004012333940001231
PKI 166(诺华公司);GW2016(葛兰素史克公司);CI-1033(辉瑞);EKB-569(惠氏);塞马替尼(辉瑞);ZD6474(阿斯利康);PTK-787(诺华/先灵公司);INC-1C11(Imclone),雷帕霉素(西罗莫司,/>
Figure BDA0004012333940001232
);或以下任何专利出版物中所述:美国专利号5,804,396、WO1999/09016(American Cyanamid)、WO 1998/43960(American Cyanamid)、WO 1997/38983(Warner Lambert)、WO 1999/06378(Warner Lambert)、WO 1999/06396(Warner Lambert)、WO 1996/30347(Pfizer,Inc)、WO 1996/33978(Zeneca)、WO 1996/3397(Zeneca)和WO1996/33980(Zeneca)。
化疗剂还包括地塞米松、干扰素、秋水仙碱、美托品、环孢素、两性霉素、甲硝唑、阿仑单抗、阿利维甲酸、别嘌呤醇、氨磷汀、三氧化二砷、天冬酰胺酶、卡介苗活菌、贝伐单抗、蓓萨罗丁、克拉屈滨、氯法拉滨、阿法达贝泊汀、地尼白介素、右雷佐生、阿法依泊汀、厄洛替尼、非格司亭、醋酸组氨瑞林、替伊莫单抗、干扰素α-2a、干扰素α-2b、来那度胺、左旋咪唑、美司钠、甲氧沙林、诺龙、奈拉滨、诺非妥莫单抗(nofetumomab)、奥普瑞白介素、帕利夫明、帕米磷酸二钠、聚乙二醇化腺苷脱氨酶、培门冬酶、聚乙二醇非格司亭、培美曲塞二钠、普卡霉素、卟吩姆钠、奎纳克林、拉布立酶、沙格司亭、替莫唑胺、VM-26、6-TG、托瑞米芬、维甲酸、ATRA、戊柔比星、唑来膦酸盐和唑来膦酸,及其药学上可接受的盐。
化疗剂还包括氢化可的松、醋酸氢化可的松、醋酸可的松、特戊酸硫氢可的松、曲安奈德、曲安奈德醇、莫米松、安西奈德、布地奈德、地奈德、醋酸氟氢松、肤轻松、倍他米松、磷酸倍他米松钠、地塞米松、磷酸地塞米松钠、氟可龙、氢化可的松-17-丁酸酯、氢化可的松-17-戊酸酯、二丙酸阿氯米松(aclometasone dipropionate)、戊酸倍他米松、二丙酸倍他米松、泼尼卡酯、氯倍他松-17-丁酸酯、氯倍他索-17-丙酸酯、氟可龙己酸酯、氟可龙戊酸酯和醋酸氟泼尼定;免疫选择性抗炎肽(ImSAID),诸如苯丙氨酸-谷氨酰胺-甘氨酸(FEG)及其D-异构体形式(feG)(伊姆兰生物治疗剂有限公司(IMULAN BioTherapeutics,LLC));抗风湿药物,诸如硫唑嘌呤、环孢素(环孢霉素A)、D-青霉胺、金盐、羟氯喹、来氟米特、米诺环素、柳氮磺吡啶;肿瘤坏死因子α(TNFα)阻断剂,诸如依那西普(Enbrel)、英夫利昔单抗(Remicade)、阿达木单抗(Humira)、赛妥珠单抗(Cimzia)、戈利木单抗(Simponi);白介素1(IL-1)阻断剂,诸如阿那白滞素(Kineret);T细胞共刺激阻断剂,诸如阿巴西普(Orencia);白介素6(IL-6)阻断剂,诸如托珠单抗
Figure BDA0004012333940001241
白介素13(IL-13)阻断剂,诸如来瑞珠单抗(lebrikizumab);干扰素α(IFN)阻断剂,诸如罗那珠单抗;β7整联蛋白阻断剂,诸如rhuMAbβ7;IgE通路阻断剂,诸如抗M1引物;分泌的同源三聚体LTa3和膜结合异源三聚体LTa1/β2阻断剂,诸如抗淋巴毒素α(LTa);放射性同位素(例如At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212和Lu的放射性同位素);各种各样的试验药剂,诸如硫铂、PS-341、苯基丁酸酯、ET-18-OCH3或法呢基转移酶抑制剂(L-739749,L-744832);多酚类物质,诸如槲皮素、白藜芦醇、苦味酚、表没食子儿茶素没食子酸酯、茶黄素、黄烷醇、原花青素、桦木酸及其衍生物;自噬抑制剂,诸如氯喹;δ-9-四氢大麻酚(屈大麻酚,/>
Figure BDA0004012333940001242
);β-拉帕酮;拉帕酚;秋水仙碱;桦木酸;乙酰喜树碱、莨菪亭(scopolectin)和9-氨基喜树碱);鬼臼毒素;替加氟/>
Figure BDA0004012333940001243
贝沙罗汀/>
Figure BDA0004012333940001244
双膦酸盐,诸如氯膦酸盐(例如,/>
Figure BDA0004012333940001245
或/>
Figure BDA0004012333940001246
)、依替膦酸盐/>
Figure BDA0004012333940001247
NE-58095、唑来膦酸/唑来膦酸盐/>
Figure BDA0004012333940001248
阿仑膦酸盐/>
Figure BDA0004012333940001249
帕米膦酸盐/>
Figure BDA00040123339400012410
替罗膦酸盐/>
Figure BDA00040123339400012411
或利塞膦酸盐/>
Figure BDA00040123339400012412
和表皮生长因子受体(EGF-R);疫苗,诸如/>
Figure BDA0004012333940001251
疫苗;哌立福辛(perifosine);COX-2抑制剂(例如,塞来昔布或依托昔布);蛋白体抑制剂(例如,PS341);CCI-779;替吡法尼(R11577);奥拉非尼,ABT510;Bcl-2抑制剂,诸如奥利美森钠(oblimersen sodium)/>
Figure BDA0004012333940001252
匹杉琼(pixantrone);法呢基转移酶抑制剂,诸如洛那法尼(lonafarnib)(SCH6636,SARASARTM);以及以上任一项的药用盐、酸或衍生物;以及上述两种或多种的组合,诸如CHOP(环磷酰胺、阿霉素、长春新碱和泼尼松龙的组合疗法的缩写);以及FOLFOX(奥沙利铂(ELOXATINTM)与5-FU和亚叶酸钙组合治疗方案的缩写)。
化疗剂还包括具有镇痛、解热和抗炎作用的非甾体抗炎药。NSAID包括环氧化酶的非选择性抑制剂。NSAID的具体实例包括阿司匹林、丙酸衍生物(例如布洛芬、非诺洛芬、酮洛芬、氟比洛芬、恶丙嗪(oxaprozin)和萘普生)、乙酸衍生物(例如吲哚美辛、舒林酸、依托度酸、双氯芬酸)、烯醇酸衍生物(例如吡罗昔康、美洛昔康、替诺昔康、屈昔康(droxicam)、氯诺昔康和伊索昔康)、芬那酸(fenamic acid)衍生物(例如甲芬那酸、甲氯芬那酸、氟芬那酸、托芬那酸)和COX-2抑制剂(例如塞来昔布、依托考昔(etoricoxib)、鲁美昔布(lumiracoxib)、帕瑞昔布、罗非考昔(rofecoxib)、罗非考昔和戊地昔布(valdecoxib))。NSAID可适用于减轻病症的症状,诸如转移性骨痛、头痛和偏头痛、术后疼痛、由于炎症和组织损伤、发热、肠梗阻和肾绞痛引起的轻度至中度疼痛。
如本文所用,术语“化疗初治者”是指,在相对于向受试者施用特定治疗剂(诸如本文所述的PD-1轴结合拮抗剂)的时间的过去六个月内,患有癌症(例如,本文所述的癌症,诸如NSCLC,包括鳞状NSCLC和非鳞状NSCLC)的患者不曾接受用于治疗该癌症的化疗。在一些实施例中,在相对于向受试者施用特定治疗剂(诸如本文所述的PD-1轴结合拮抗剂)的时间的过去六个月内,也未向化疗初治者施用新辅助疗法、放疗或放化疗。
当在本文中使用时,“生长抑制剂”是指在体外或体内抑制细胞生长的化合物或组合物。在一个实施例中,生长抑制剂为生长抑制抗体,其防止或减少表达该抗体结合的抗原的细胞的增殖。在另一个实施例中,生长抑制剂可以是显著降低S期细胞百分比的抑制剂。生长抑制剂的实例包括阻断细胞周期进程(在S期以外的地方)的试剂,例如诱导G1停滞和M期停滞的试剂。经典的M期阻滞剂包括长春花(长春新碱和长春碱)、紫杉烷类和拓扑异构酶II抑制剂(例如阿霉素、表柔比星、柔红霉素、依托泊苷和博来霉素)。那些阻滞G1的试剂也溢出到S期阻滞中,例如DNA烷化剂,诸如他莫昔芬、泼尼松、达卡巴嗪、氮芥、顺铂、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶和ara-C。进一步的信息可见于Mendelsohn和Israel编辑的《癌症的分子基础》(The Molecular Basis of Cancer)中Murakami等人所著的第1章,标题为“细胞周期调节,癌基因和抗肿瘤药”(W.B.Saunders,Philadelphia,1995),例如,第13页。
如本文所用,术语“前药”是指药物活性物质的前体或衍生物形式,与母体药物相比对肿瘤细胞的细胞毒性较低,并且能够被酶活化或转化为活性更高的母体形式。参见,例如,Wilman,“Prodrugs in Cancer Chemotherapy”Biochemical Society Transactions,14,pp.375-382,615th Meeting Belfast(1986)和Stella等人,“Prodrugs:A ChemicalApproach to Targeted Drug Delivery,”Directed Drug Delivery,Borchardt等人,(编辑),第247-267页,Humana Press(1985)。本公开的前药包括但不限于含磷酸盐的前药、含硫代磷酸盐的前药、含硫酸盐的前药、含肽的前药、D-氨基酸修饰的前药、糖基化的前药、含β-内酰胺的前药、任选取代的含苯氧基乙酰胺的前药或任选取代的含苯乙酰胺的前药,5-氟胞嘧啶和其他5-氟尿苷前药,其可转化为更具活性的无细胞毒性游离药物。可以衍生为本公开的前药形式的细胞毒性药物的示例包括但不限于上述那些化学治疗剂。
“放射疗法”是指使用定向γ射线或β射线以诱导对细胞的足够损害,从而限制细胞正常发挥功能或完全破坏细胞的能力。将理解的是,在本领域中将有许多已知方法可以确定治疗的剂量和持续时间。典型治疗为一次施用,典型剂量范围为每天10到200单位(Gray)。
“抗血管生成剂”或“血管生成抑制剂”是指小分子量物质、多核苷酸、多肽、分离的蛋白质、重组蛋白质、抗体或其缀合物或融合蛋白,其直接或间接地抑制血管生成、脉管生成或不希望的脉管渗透性。应理解,抗血管生成剂包括那些与血管生成因子或其受体结合并阻断血管生成活性。例如,抗血管生成及为针对上文所定义的药剂的抗体或其他拮抗剂,例如,VEGF-A或VEGF-A受体(例如,KDR受体或Flt-1受体)的抗体、抗PDGFR抑制剂诸如GLEEVECTM(甲磺酸伊马替尼)。抗血管生成剂也包括天然血管生成抑制剂,例如,血管抑素、内皮抑素等。参见例如,Klagsbrun和D’Amore,Annu.Rev.Physiol.,53:217-39(1991);Streit和Detmar,Oncogene,22:3172-3179(2003)(例如,表3列出恶性黑色素瘤的抗血管生成疗法);Ferrara&Alitalo,Nature Medicine 5(12):1359-1364(1999);Tonini等人,Oncogene,22:6549-6556(2003)和Sato Int.J.Clin.Oncol.,8:200-206(2003)。
如本文中可互换地使用,术语“受试者”、“个体”或“患者”出于治疗的目的是指任何被归类为哺乳动物的动物,包括人、家畜和农场动物,以及动物园、运动或宠物动物,诸如猫、狗、马、牛等。优选地,该哺乳动物为人。
本文的术语“抗体”以最广泛的含义使用,并且具体地覆盖单克隆抗体(包括全长单克隆抗体)、多克隆抗体、多特异性抗体(例如,双特异性抗体)和抗体片段,只要它们表现出所需的抗原结合活性即可。
“经分离的”抗体是已经鉴别并且自其自然环境的组分中分离和/或回收的抗体。其自然环境的污染物组分是会干扰抗体研究、诊断或治疗用途的材料,并且可以包括酶、激素和其它蛋白质或非蛋白质溶质。在一些实施例中,将抗体纯化至(1)大于抗体重量的95%(例如通过Lowry方法测定),在一些实施例中,大于99%重量;(2)足以获得N末端或内部氨基酸序列的至少15个残基的程度(例如通过使用旋转杯测序仪),或(3)均质(在还原或非还原条件下进行SDS-PAGE,使用例如考马斯蓝或银染)。经分离的抗体包括重组细胞内的原位抗体,因为不会存在抗体天然环境的至少一种成分。然而,通常,经分离的抗体将通过至少一个纯化步骤来制备。
“天然抗体”通常是约150,000道尔顿的异源四聚体糖蛋白,由两条相同的轻(L)链和两条相同的重(H)链组成。每条轻链通过一个共价二硫键与重链相连,而二硫键的数目在不同免疫球蛋白同种型的重链之间变化。每条重链和轻链还具有规则间隔的链内二硫键。每条重链在一端具有可变结构域(VH),其后是多个恒定结构域。每条轻链的一端具有可变结构域(VL),另一端具有恒定结构域;轻链的恒定结构域与重链的第一恒定结构域对齐,并且轻链可变结构域与重链的可变结构域对齐。据信特定的氨基酸残基在轻链和重链可变结构域之间形成界面。
术语“恒定结构域”是指免疫球蛋白分子的一部分,该部分相对于免疫球蛋白的另一部分(即可变结构域,其包含抗原结合位点)具有更保守的氨基酸序列。恒定结构域包含重链的CH1、CH2和CH3结构域(统称为CH)和轻链的CHL(或CL)结构域。
抗体的“可变区”或“可变结构域”是指抗体的重链或轻链的氨基末端结构域。重链的可变结构域可以称为“VH”。轻链的可变结构域可以称为“VL”。这些结构域通常是抗体中变化最大的部分,并且包含抗原结合位点。
术语“可变的”是指以下事实:可变结构域的某些部分在抗体之间的序列差异很大,并用于每种特定抗体对其特定抗原的结合和特异性。然而,可变性并非在抗体的可变结构域中均匀分布。它集中在轻链和重链可变结构域中的三个称为高变区(HVR)的区段中。可变结构域中保守性更高的部分称为框架区(FR)。天然重链和轻链的可变结构域各自包含四个FR区,其主要采用β折叠结构,由三个HVR连接,这三个HVR形成连接β折叠结构的环并且在一些情况下形成β折叠结构的一部分。每条链中的HVR通过FR区紧密保持在一起,并且与另一条链中的HVR一起,有助于抗体的抗原结合位点的形成(参见Kabat等人,《具有免疫学意义的蛋白质序列》(Sequences of Proteins of Immunological Interest),第五版,美国卫生与公众服务部,国立卫生研究院,马里兰州贝塞斯达(1991))。恒定结构域不直接参与抗体与抗原的结合,但具有各自效应子功能,诸如抗体参与抗体依赖性细胞毒性作用。
来自任何哺乳动物物种抗体(免疫球蛋白)的“轻链”基于其恒定结构域的氨基酸序列,可以配属为两种明显不同的类型中的一种,这两种类型分别称为卡帕(“κ”)和兰姆达(“λ”)。
如本文所用,术语IgG“同种型”或“亚类”是指由免疫球蛋白恒定区的化学和抗原特征定义的免疫球蛋白的任何亚类。
根据其重链恒定结构域的氨基酸序列,可以将抗体(免疫球蛋白)分为不同的类别。免疫球蛋白主要分为五类:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,并且这些抗体中的一些可以进一步分为亚类(同种型),例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。对应于不同类别的免疫球蛋白的重链恒定结构域分别称为α、γ、ε、γ和μ。不同种类的免疫球蛋白的亚基结构和三维构型是众所周知的,并在例如以下文献中有一般描述:Abbas等人,《细胞和分子免疫学》(Cellular and Mol.Immunology),第四版(W.B.Saunders,Co.,2000)。抗体可以是较大融合分子的一部分,该融合分子是通过抗体与一个或多个其它蛋白质或肽的共价或非共价结合形成的。
术语“全长抗体”、“完整抗体”和“全抗体”在本文中可互换使用,是指其基本上完整形式的抗体而不是如下文定义的抗体片段。该术语特别是指具有包含Fc区的重链的抗体。
出于本文目的的“裸抗体”是未与药物部分或放射性标记缀合的抗体。
“抗体片段”包含完整抗体的一部分,优选包含其抗原-结合区。在一些实施例中,本文所述的抗体片段是抗原结合片段。抗体片段的示例包括Fab、Fab'、F(ab')2和Fv片段;双体抗体;线性抗体;单链抗体分子;和由抗体片段形成的多特异性抗体。
木瓜蛋白酶消化抗体产生两个相同抗原结合片段,称为“Fab”片段,每个片段都有单个抗原结合位点和残留的“Fc”片段,其名称反映其是否容易结晶的能力。胃蛋白酶处理产生的F(ab')2片段具有两个抗原结合位点并且仍能与抗原交联。
“Fv”是包含完全的抗原结合位点的最小抗体片段。在一个实施例中,双链Fv种类由紧密和非共价结合的一个重链和一个轻链可变结构域的二聚体组成。在单链Fv(scFv)物种中,一个重链可变结构域和一个轻链可变结构域可通过柔性肽接头共价连接,使得轻链和重链可缔合成类似于在双链Fv物种中的“二聚体”结构。以此构型,每个可变结构域的三个HVR相互作用以在VH-VL二聚体的表面上限定抗原结合位点。六个HVR共同对抗体赋予抗原结合特异性。但是,即使单个可变结构域(或仅包含三个对抗原具有特异性的HVR的Fv的一半)也具有识别和结合抗原的能力,尽管其亲和力低于完整结合位点。
“Fab”片段含有重链可变结构域和轻链可变结构域且亦含有轻链的恒定结构域和重链的第一恒定结构域(CH1)。Fab'片段与Fab片段的不同之处在于Fab'片段在重链CH1结构域的羧基末端添加了一些残基,这些残基包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab'-SH是本文中关于其中恒定结构域的半胱氨酸残基带有游离硫醇基的Fab'的命名。F(ab')2抗体片段最初是作为在其间具有铰链半胱氨酸的成对Fab'片段而产生的。抗体片段的其他化学偶合也是已知的。
“单链Fv”或“scFv”抗体片段包含抗体的VH和VL结构域,其中这些结构域存在于单个多肽链中。一般地,scFv多肽在VH和VL结构域之间进一步包含多肽接头,使scFv形成所需的抗原结合结构。有关scFv的综述,参见例如Pluckthun的《单克隆抗体的药理学》(ThePharmacology of Monoclonal Antibodies),第113卷,Rosenburg和Moore主编,(Springer-Verlag,New York,1994),第269-315页。
术语“双体抗体”是指具有两个抗原结合位点的抗体片段,其片段包含连接至与同一多肽链(VH-VL)中的轻链可变结构域(VL)的重链可变结构域(VH)。通过使用太短以至于不允许同一条链上两个结构域之间配对的接头,这些结构域被迫与另一条链的互补结构域配对并产生两个抗原结合位点。双体抗体可为二价抗体或双特异性抗体。双价抗体更全面地描述于例如:EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等人,Nat.Med.9:129-134(2003);以及Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448(1993)。三体抗体和四体抗体也在Hudson等人,Nat.Med.9:129-134(2003)中进行了描述。
本文所使用的术语“单克隆抗体”是指从基本上同质的抗体群中获得的抗体,例如,除了可能存在的少量突变例如天然存在的突变,该抗体群包含的单个抗体是相同的。因此,修饰语“单克隆的”表明抗体的特征不是离散抗体的混合物。在某些实施例中,这样的单克隆抗体通常包括含有结合靶标的多肽序列的抗体,其中靶标结合多肽序列通过包括从多个多肽序列中选择单个靶标结合多肽序列的过程获得。例如,选择过程可以是从多个克隆,例如杂交瘤克隆、噬菌体克隆或重组DNA克隆的集合中选择独特的克隆。应当理解,可以进一步改变选择的靶标结合序列,例如,以提高对靶标的亲和力、使靶标结合序列人源化、提高其在细胞培养物中的产生、降低其在体内的免疫原性、产生多特异性抗体等,并且包含改变的靶标结合序列的抗体也是本公开的单克隆抗体。与通常包括针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂相反,单克隆抗体制剂中的每种单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。除其特异性外,单克隆抗体制剂的优势还在于其通常不受其他免疫球蛋白的污染。
修饰语“单克隆”表示抗体的特征是从基本上同质的抗体群体获得的,并且不应解释为需要通过任何特定方法产生抗体。例如,根据本公开使用的单克隆抗体可以通过多种技术制备,包括例如杂交瘤方法(例如,Kohler和Milstein,Nature,256:495-97(1975);Hongo等人,Hybridoma,14(3):253-260(1995),Harlow等人,Antibodies:A LaboratoryManual,(Cold Spring Harbor Laboratory Press,2nd ed.1988);Hammerling等人.,在:Monoclonal Antibodies and T-Cell Hybridomas 563-681(Elsevier,N.Y.,1981))、重组DNA方法(参见例如美国专利号4,816,567)、噬菌体展示技术(参见例如Clackson等人,Nature,352:624-628(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Sidhu等人,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等人,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34):12467-12472(2004);和Lee等人,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)、以及用于在动物中生产具有部分或全部编码人类免疫球蛋白序列的人类免疫球蛋白基因座或基因的人类或类人抗体的技术(参见例如WO 1998/24893;WO 1996/34096;WO 1996/33735;WO 1991/10741;Jakobovits等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:2551(1993);Jakobovits等人,Nature 362:255-258(1993);Bruggemann等人,Year in Immunol.7:33(1993);美国专利号5,545,807;5,545,806;5,569,825;5,625,126;5,633,425;和5,661,016;Marks等人,Bio/Technology 10:779-783(1992);Lonberg等人,Nature 368:856-859(1994);Morrison,Nature 368:812-813(1994);Fishwild等人,Nature Biotechnol.14:845-851(1996);Neuberger,NatureBiotechnol.14:826(1996);以及Lonberg等人,Intern.Rev.Immunol.13:65-93(1995))。
本文中的单克隆抗体具体地包括“嵌合”抗体,其中重链和/或轻链的一部分与来自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,而一条或多条链的其余部分与来自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中的相应序列以及这些抗体的片段相同或同源,只要它们表现出所需的生物活性即可(参见,例如美国专利号4,816,567;和Morrison等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 81:6851-6855(1984))。嵌合抗体包括
Figure BDA0004012333940001321
抗体,其中抗体的抗原结合区源自通过例如用目标抗原免疫猕猴产生的抗体。
“人源化”形式的非人(例如,鼠)抗体为包含来源于非人免疫球蛋白的最小序列的嵌合抗体。在一个实施例中,人源化抗体是人类免疫球蛋白(受体抗体),其中来自受体HVR的残基被来自非人类物种(供体抗体)诸如小鼠、大鼠、兔或具有所需特异性、亲和力和/或能力的非人类灵长类动物的HVR的残基取代。在一些实施例中,人免疫球蛋白的FR残基被相应的非人类残基取代。此外,人源化抗体可包含受体抗体或供体抗体中不存在的残基。可以进行这些修饰以进一步改善抗体性能。总体上,人源化抗体将基本上包含所有中的至少一个可变结构域,通常是两个可变结构域,其中所有或基本上所有高变环对应于非人免疫球蛋白的高变环,并且所有或基本上所有的FR为人免疫球蛋白序列的FR。人源化抗体还将任选地包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,该免疫球蛋白通常为人类免疫球蛋白。更多详情,参见例如:Jones等人,Nature 321:522-525(1986);Riechmann等人,Nature 332:323-329(1988);以及Presta,Curr.Op.Struct.Biol.2:593-596(1992)。还参见,例如,Vaswani和Hamilton,Ann.Allergy,Asthma&Immunol.1:105--115(1998);Harris,Biochem.Soc.Transactions 23:1035--1038(1995);Hurle和Gross,Curr.Op.Biotech.5:428--433(1994);以及美国专利号6,982,321和7,087,409。
“人抗体”是具有对应于由人产生的抗体的氨基酸序列的抗体和/或使用本文所公开的用于制备人抗体的任何技术制得的抗体。人抗体的该定义特别地排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。可以使用本领域已知的各种技术产生人抗体,包括噬菌体展示文库。Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.,227:381(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.,222:581(1991)。还可用于制备人类单克隆抗体的方法如Cole等人,Monoclonal Antibodies andCancer Therapy,Alan R.Liss,p.77(1985);Boerner等人,J.Immunol.,147(1):86-95(1991)所述。另外参见van Dijk和van de Winkel,Curr.Opin.Pharmacol.,5:368-74(2001)。可以通过向转基因动物施用抗原来制备人抗体,该转基因动物已经修饰以对抗原攻击产生应答而产生此类抗体,但其内源基因座已失效,例如,免疫异种小鼠(参见,例如,美国专利号6,075,181和6,150,584关于XENOMOUSETM技术)。还参见例如,Li等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)关于通过人类B细胞杂交瘤技术产生的人抗体。
“物种依赖性抗体”是对来自第一哺乳动物物种的抗原具有比对来自第二哺乳动物物种的该抗原同系物更强的结合亲和力的抗体。通常,物种依赖性抗体与人抗原“特异性结合”(例如,其结合亲和力(Kd)值不超过约1x10-7 M,优选不超过约1x10-8 M,优选不超过约1x10-9 M),但对来自第二非人哺乳动物物种的该抗原同系物的结合亲和力比其对该人抗原的结合亲和力弱至少约50倍,或至少约500倍,或至少约1000倍。物种依赖性抗体可以是如上定义的各种抗体中的任何一种,但是优选地是人源化或人抗体。
如本文所用的术语“高变区”、“HVR”或“HV”是指在序列上高变和/或形成结构上限定的环的抗体可变结构域的区域。通常,抗体包含六个HVR;三个在VH中(H1、H2、H3),并且三个在VL中(L1、L2、L3)。在天然抗体中,H3和L3在六个HVR中表现出最多的多样性,尤其是H3被认为在赋予抗体精细特异性方面起着独特的作用。参见例如:Xu等人,Immunity 13:37-45(2000);Johnson和Wu,Methods in Molecular Biology 248:1-25(Lo编,Human Press,Totowa,N.J.,2003)。实际上,仅由重链组成的天然存在的骆驼科动物抗体在不存在轻链的情况下是有功能并稳定的。参见例如:Hamers-Casterman等人,Nature 363:446-448(1993);Sheriff等人,Nature Struct.Biol.3:733-736(1996)。
许多HVR描述得到应用,并且包含于本文中。Kabat互补决定区(CDR)基于序列变异性并且是最常用的(Kabat等人,《具有免疫学意义的蛋白质序列》(Sequences of Proteinsof Immunological Interest),第5版,美国卫生与公众服务部,国立卫生研究院,马里兰州贝塞斯达(1991))。相反,Chothia指的是结构环的位置(Chothia和Lesk J.Mol.Biol.196:901-917(1987))。AbM HVR表示Kabat HVR和Chothia结构环之间的折衷,并且被牛津分子公司(Oxford Molecular)的AbM抗体建模软件采用。“接触”HVR基于可用的复杂晶体结构的分析结果。这些HVR中的每个的残基如下文所述。
Figure BDA0004012333940001341
HVR可以包括以下“扩展HVR”:VL中的24-36或24-34(L1)、46-56或50-56(L2)和89-97或89-96(L3),以及VH中的26-35(H1)、50-65或49-65(H2)和93-102、94-102或95-102(H3)。对于这些定义中的每一个,可变结构域残基均根据上述Kabat等人的方法进行编号。
“框架”或“FR”残基是除本文定义的HVR残基以外的那些可变结构域残基。
术语“Kabat所述的可变结构域残基编号”或“Kabat所述的氨基酸位置编号”及其变型是指在上述Kabat等人的文献中提出的用于重链可变结构域或轻链可变结构域的编号系统。使用该编号系统,实际线性氨基酸序列可能包含较少或附加的氨基酸,其对应于可变结构域的FR或HVR的缩短或插入。例如,重链可变结构域可在H2的残基52之后包括单个氨基酸插入片段(根据Kabat编号的残基52a)以及重链FR残基82之后的插入残基(例如,根据Kabat编号的残基82a、82b和82c等)。可通过将抗体序列与“标准”Kabat编号序列的同源性区域进行比对来确定给定抗体的残基的Kabat编号。
当提及可变结构域中的残基(大约是轻链的残基1-107和重链的残基1-113)时,通常使用Kabat编号系统(例如,Kabat等人,《具有免疫学意义的蛋白质序列》(Sequences ofProteins of Immunological Interest.第5版,美国卫生与公众服务部,国立卫生研究院,Bethesda,Md.(1991))。当提及免疫球蛋白重链恒定区中的残基时,通常使用“EU编号系统”或“EU索引”(例如,上述Kabat等人所报道的EU索引)。“Kabat所述的EU索引”是指人类IgG1EU抗体的残基编号。
表述“线性抗体”是指Zapata等人在(1995Protein Eng,8(10):1057-1062)中所述的抗体。简而言之,这些抗体包含一对串联的Fd区段(VH-CH1-VH-CH1),其与互补的轻链多肽一起形成一对抗原结合区。线性抗体可以为双特异性或单特异性的。
如本文所用,术语“结合”、“特异性结合”或“具有特异性”是指可测量和可再现的相互作用,诸如靶与抗体之间的结合,在分子(包括生物分子)的异质群体的存在下,其确定靶的存在。例如,与靶标(其可以是表位)结合或特异性结合的抗体是与其结合其他靶标相比具有更大亲和力、亲合力、更容易和/或持续时间更长的结合该靶标的抗体。在一个实施例中,抗体与无关靶标的结合程度为该抗体与抗原结合的小于约10%,例如,通过放射免疫分析(RIA)所测量。在某些实施例中,与靶标特异性结合的抗体的解离常数(Kd)为≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM或≤0.1nM。在某些实施例中,抗体与蛋白上的表位特异性结合,该表位在不同物种的蛋白之间具有保守性。在另一实施例中,特异性结合可以包括但不要求排他结合。
相对于本文所鉴别多肽序列的“氨基酸序列同一性百分比(%)”被定义为在比对候选序列与被比较多肽序列并引入缺口(如有必要)以实现最大的序列同一性百分比之后,并且在不考虑将任何保守取代作为序列同一性的组成部分的情况下,候选序列中的氨基酸残基与被比较多肽序列中的氨基酸残基相同的百分比。用于确定氨基酸序列同一性百分比的比对可以以本领域技术范围内的各种方式实现,例如使用可公开获得的计算机软件,诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。本领域技术人员可确定用于测量比对的适当参数,包括在所比较的序列的全长上实现最大比对所需的任何算法。然而,为了本文的目的,使用序列比较计算机程序ALIGN-2来生成氨基酸序列同一性%的值。ALIGN-2序列比较计算机程序由基因泰克公司编写,并且源代码已经与用户文档一起提交到U.S.Copyright Office,Washington D.C.,20559,在那里以美国版权登记号TXU510087注册。ALIGN-2程序可通过位于加利福尼亚州南旧金山的基因泰克公司公开获得。ALIGN-2程序应经编译以在UNIX操作系统上使用,所述UNIX操作系统优选数字UNIX V4.0D。所有序列比较参数均由ALIGN-2程序设置并且不变。
在采用ALIGN-2进行氨基酸序列比较的情况下,给定氨基酸序列A与给定氨基酸序列B的氨基酸序列同一性%(其可以替代地表达为给定氨基酸序列A具有或包含与给定氨基酸序列B的某一氨基酸序列同一性%)计算如下:
100乘以分数X/Y
其中X是由序列比对程序ALIGN-2在该程序对A和B的比对中评分为相同匹配的氨基酸残基的数目,而其中Y是B中氨基酸残基的总数。应当理解,在氨基酸序列A的长度不等于氨基酸序列B的长度的情况下,A与B的氨基酸序列同一性%将不等于B与A的氨基酸序列同一性%。除非另外特别指明,否则本文所使用的所有氨基酸序列同一性%的值是如前一段中所述使用ALIGN-2计算机程序获得的。
除非另有说明,否则本文所述的氨基酸序列为连续的氨基酸序列。
术语“包装插页”用于指治疗产品的商业包装中通常包括的说明书,其含有涉及此类治疗产品的使用的有关适应症、用法、剂量、施用、联合疗法、禁忌症和/或警告的信息。
术语“药物制剂”和“药物组合物”在本文中可互换使用并且是指一种制备物,该制备物的形式容许该制备物中所含的活性成分的生物活性有效,并且该制备物不含对制剂将施用至的受试者具有不可接受的毒性的附加组分。此类制剂为无菌制剂。在优选的实施例中,向人类受试者施用该药物组合物或药物制剂。
“无菌”药物制剂是无菌的或者不含或基本上不含所有活微生物及其孢子。
“药用载体”是指药物制剂中除活性成分外的对受试者无毒的成分。药用载体包括但不限于缓冲剂、赋形剂、稳定剂,或防腐剂。
如本文所用,“施用”意为向受试者给予一定剂量的化合物(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨))或组合物(例如,药物组合物,其包括PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗,任选地还包括附加治疗剂)的方法。在本文所述的方法中利用的组合物可经例如腹膜、肌内、静脉内、皮内、透皮、动脉内、病灶内、颅内、关节内、前列腺内、胸膜内、气管内、鞘内、鼻内、阴道内、直肠内、局部、瘤内、腹膜、皮下、结膜下、囊内、粘膜、心包内、脐内、眼内、眶内、经口、局部、透皮、玻璃体内、眼周、结膜、眼球筋膜下、前房内、视网膜下、眼球后、管内、通过吸入、通过注射、通过植入、通过输注、通过连续输注、通过局部灌注直接浸泡靶细胞、通过导管、通过灌洗、以乳剂或脂质组合物形式施用。本文所述方法中使用的组合物也可以全身或局部施用。施用方法可以根据多种因素而变化(例如,待施用的化合物或组合物以及待治疗的病症、疾病或疾病的严重程度)。
如本文所用,“与……组合”或“与……联合使用”是指除了施用一种治疗模式外,还施用另一种治疗模式,例如,包括施用PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体诸如阿特珠单抗)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的治疗方案。这样,“与……结合”是指在向个体施用一种治疗方式之前,之中或之后施用另一种治疗方式。
III.用于评定患有NSCLC的受试者的诊断性方法和组合物
在特定情况下,本文所提供的方法和测定可用来鉴别可能受益于包括PD-1轴结合拮抗剂诸如抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)的治疗及本文所述其他治疗的患有癌症的个体。在特定情况下,本文所提供的方法和测定可用来为患有癌症(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)的个体选择疗法,该方法包括从来自该个体的样品确定bTMB评分,其中来自该样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将该个体鉴别为可能受益于使用包含PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体,诸如阿特珠单抗)的治疗剂本文所述其他治疗的个体。
本文所提供的方法可包括从来自个体的样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)确定bTMB评分。来自个体的样品可以是存档样品、新鲜样品或冷冻样品。该确定步骤可包括确定在预定的一组基因中发生的体细胞突变(例如,在编码区内的碱基取代和/或在编码区内的插入缺失突变)的总数量,以导出来自该个体的样品的bTMB评分。在一些实施例中,体细胞突变的数量为所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。
可以基于本领域中已知的任何合适的判据(包括但不限于DNA、mRNA、cDNA、蛋白质、蛋白质片段和/或基因拷贝数量的测量结果)来定性和/或定量地确定体细胞突变的数量。在一些情况下,确定了个体的综合基因组图谱。在一些情况下,确定了从个体收集的样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)的综合基因组图谱。在一些情况下,基因组图谱的确定包括应用本领域中已知的或本文所述的下一代测序方法以鉴别基因组改变(例如,体细胞突变(例如,在编码区内的碱基取代和/或在编码区内的插入缺失突变))。在一些情况下,该测试同时对约300个基因的编码区(例如,不同组的至少约300至约400个基因,例如,约300、310、320、330、340、350、360、370、380、390或400个基因的)进行测序,该编码区覆盖至少约0.05Mb至约10Mb(例如,0.05、0.06、0.07、0.08、0.09、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、2、3、4、5、6、7、8、9或10Mb),其中外显子覆盖度的典型中位深度为至少约500x(例如,500x、550x、600x、650x、700x、750x、800x、850x、900x、950x或1,000x)。在其他情况下,该测试同时对约400个基因、约425个基因、约450个基因、约475个基因、约500个基因、约525个基因、约550个基因、约575个基因、约600个基因、约625个基因、约650个基因、约675个基因、约700个基因、约725个基因、约750个基因、约775个基因、约800个基因、约825个基因、约850个基因、约875个基因、约900个基因、约925个基因、约950个基因、约975个基因、约1000个基因或大于1000个基因的编码区进行测序。在一些情况下,该组基因包括表1中列示的一个或多个基因(例如,癌症相关基因)。在一些情况下,该组基因为
Figure BDA0004012333940001391
基因包的基因的组(参见例如,Frampton等人Nat.Biotechnol.31:1023-31,2013,其全文以引用方式并入本文)。在一些情况下,该组基因为/>
Figure BDA0004012333940001392
CDx基因包的基因的组。在一些实施例中,该测试对个体的基因组的大于约10Mb,例如,大于约10Mb、大于约15Mb、大于约20Mb、大于约25Mb、大于约30Mb、大于约35Mb、大于约40Mb、大于约45Mb、大于约50Mb、大于约55Mb、大于约60Mb、大于约65Mb、大于约70Mb、大于约75Mb、大于约80Mb、大于约85Mb、大于约90Mb、大于约95Mb、大于约100Mb、大于约200Mb、大于约300Mb、大于约400Mb、大于约500Mb、大于约600Mb、大于约700Mb、大于约800Mb、大于约900Mb、大于约1Gb、大于约2Gb、大于约3Gb或约3.3Gb.进行测序。在一些情况下,通过全外显子组测序确定bTMB评分。在一些情况下,通过全基因组测序确定bTMB评分。目前的理解是,可独立于基因身份来计算bTMB评分。在一些情况下,每个覆盖的测序读段表示独特的DNA片段,以使得能够对由于肿瘤异质性、低肿瘤纯度和小样品体积而以低频率发生的基因组改变进行高灵敏度的和特异性的检测。该确定步骤可包括确定从来自个体的样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)分离的无细胞DNA(cfDNA)和/或循环肿瘤DNA(ctDNA)中体细胞突变的数量,以导出bTMB评分。在一些实施例中,从样品分离的cfDNA的量为至少约5ng(例如,至少约5ng、至少约10ng、至少约15ng、至少约20ng、至少约25ng、至少约30ng、至少约35ng、至少约40ng、至少约45ng、至少约50ng、至少约75ng、至少约100ng、至少约200ng、至少约300ng、至少约400ng或更多)。例如,在一些实施例中,从样品分离的cfDNA的量为至少约20ng的cfDNA。在一些实施例中,从样品分离的cfDNA的量为,例如,约5ng至约100ng(例如,约5ng至约100ng、约5ng至约90ng、约5ng至约80ng、约5ng至约70ng、约5ng至约60ng、约5ng至约50ng、约5ng至约40ng、约5ng至约30ng、约5ng至约20ng、约5ng至约15ng、约5ng至约10ng、约10ng至约100ng、约10ng至约90ng、约10ng至约80ng、约10ng至约70ng、约10ng至约60ng、约10ng至约50ng、约10ng至约40ng、约10ng至约30ng、约10ng至约20ng、约15ng至约100ng、约15ng至约90ng、约15ng至约80ng、约15ng至约70ng、约15ng至约60ng、约15ng至约50ng、约20ng至约100ng、约20ng至约90ng、约20ng至约80ng、约20ng至约70ng、约20ng至约60ng、约20ng至约50ng、约20ng至约40ng、约20ng至约30ng、约25ng至约100ng、约25ng至约90ng、约25ng至约80ng、约25ng至约70ng、约25ng至约60ng、约25ng至约50ng、约25ng至约40ng、约25ng至约30ng、约30ng至约100ng、约30ng至约90ng、约30ng至约80ng、约30ng至约70ng、约30ng至约60ng、约30ng至约50ng、约30ng至约40ng、约30ng至约35ng、约35ng至约100ng、约35ng至约90ng、约35ng至约80ng、约35ng至约70ng、约35ng至约60ng、约35ng至约50ng、约35ng至约40ng、约40ng至约100ng、约40ng至约90ng、约40ng至约80ng、约40ng至约70ng、约40ng至约60ng、约40ng至约50ng、约40ng至约45ng、约50ng至约100ng、约50ng至约90ng、约50ng至约80ng、约50ng至约70ng、约50ng至约60ng、约60ng至约100ng、约60ng至约90ng、约60ng至约80ng、约60ng至约70ng、约70ng至约100ng、约70ng至约90ng、约70ng至约80ng、约80ng至约100ng、约80ng至约90ng或90ng至约100ng)。在一些实施例中,从样品分离的cfDNA的量为约100ng或更多(例如,约100ng或更多、约200ng或更多、约300ng或更多、约400ng或更多、约500ng或更多、约600ng或更多、约700ng或更多、约800ng或更多、约900ng或更多,或更高)。
任何合适的样品体积可用于前述任何方法中。例如,在一些情况下,样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)可具有约1mL至约50mL的体积,例如,约1mL、约2mL、约3mL、约4mL、约5mL、约6mL、约7mL、约8mL、约9mL、约10mL、约11mL、约12mL、约13mL、约14mL、约15mL、约16mL、约17mL、约18mL、约19mL、约20mL、约22mL、约24mL、约26mL、约28mL、约30mL、约32mL、约34mL、约36mL、约38mL、约40mL、约42mL、约44mL、约46mL、约48mL或约50mL。在一些情况下,样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)可具有约1mL至约50mL、约1mL至约40mL、约1mL至约30mL、约1mL至约20mL、约1mL至约10mL、约5mL至约50mL、约5mL至约40mL、约5mL至约30mL、约5mL至约20mL、约5mL至约10mL、约6mL至约50mL、约6mL至约40mL、约6mL至约30mL、约6mL至约20mL、约6mL至约10mL、约7mL至约50mL、约7mL至约40mL、约7mL至约30mL、约7mL至约20mL、约7mL至约10mL、约8mL至约50mL、约8mL至约40mL、约8mL至约30mL、约8mL至约20mL、约8mL至约10mL、约9mL至约50mL、约9mL至约40mL、约9mL至约30mL、约9mL至约20mL、约9mL至约10mL、约5mL至约15mL、约5mL至约14mL、约5mL至约13mL、约5mL至约12mL、约5mL至约11mL、约6mL至约15mL、约6mL至约14mL、约6mL至约13mL、约6mL至约12mL、约6mL至约11mL、约7mL至约15mL、约7mL至约14mL、约7mL至约13mL、约7mL至约12mL、约7mL至约11mL、约8mL至约15mL、约8mL至约14mL、约8mL至约13mL、约8mL至约12mL、约8mL至约11mL、约9mL至约15mL、约9mL至约14mL、约9mL至约13mL、约9mL至约12mL或约9mL至约11mL的体积。在一些情况下,样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)可具有约10mL的体积。例如,在一些情况下,血浆样品具有10mL的体积。
在前述任何方法的一些实施例中,在测定中评定的体细胞突变各自具有约0.1%或更高的等位基因频率,例如,约0.1%或更高、约0.2%或更高、约0.3%或更高、约0.4%或更高、约0.5%或更高、约0.6%或更高、约0.7%或更高、约0.8%或更高、约0.9%或更高、约1.0%或更高、约1.1%或更高、约1.2%或更高、约1.3%或更高、约1.4%或更高、约1.5%或更高、约1.6%或更高、约1.7%或更高、约1.8%或更高、约1.9%或更高、约2.0%或更高、约2.1%或更高、约2.2%或更高、约2.3%或更高、约2.4%或更高、约2.5%或更高、约2.6%或更高、约2.7%或更高、约2.8%或更高、约2.9%或更高、约3.0%或更高、约3.1%或更高、约3.2%或更高、约3.3%或更高、约3.4%或更高、约3.5%或更高、约3.6%或更高、约3.7%或更高、约3.8%或更高、约3.9%或更高、约4.0%或更高、约4.1%或更高、约4.2%或更高、约4.3%或更高、约4.4%或更高、约4.5%或更高、约4.6%或更高、约4.7%或更高、约4.8%或更高、约4.9%或更高、约5.0%或更高、约6.0%或更高、约7.0%或更高、约8.0%或更高、约9.0%或更高、约10.0%或更高、约11.0%或更高、约12.0%或更高、约13.0%或更高、约14.0%或更高、约15.0%或更高、约16.0%或更高、约17.0%或更高、约18.0%或更高、约19.0%或更高、约20.0%或更高,或更高。例如,在一些实施例中,在测定中评定的体细胞突变各自具有0.5%或更高的等位基因频率。
表1.示例性癌症相关基因
Figure BDA0004012333940001421
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Figure BDA0004012333940001431
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Figure BDA0004012333940001441
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Figure BDA0004012333940001451
该确定步骤可包括从来自个体的样品(例如,全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合)确定等位基因(即,具有体细胞突变(例如,在编码区内的碱基取代和/或在编码区内的插入缺失突变)的基因的变体)的最高相对频率,以导出MSAF。也可以从来自该个体的样品确定下一位最常发生的突变的体细胞等位基因频率。在一些情况下,为从来自该个体的样品中检测到的每一个突变确定体细胞等位基因频率。在一些情况下,具有多种体细胞突变的样品将可以将那些突变体现为体细胞等位基因频率的分布,该分布可能取决于那些改变在癌症(例如,肿瘤)中的原始克隆频率。在一些情况下,将大于40%(例如,>40%、≥50%、≥60%、≥70%、≥80%、≥90%或100%)的体细胞等位基因频率丢弃,将具有低于40%(例如,≤40%)的下一位最高体细胞等位基因频率的变体确定为该样品的MSAF。在一些情况下,从样品中小于约20%的最大体细胞等位基因频率计算MSAF。可发现种系突变具有在约50%与约100%之间的体细胞等位基因频率分布。
MSAF的确定可以在从来自个体的样品确定bTMB之前、同时或之后发生。
在任何前述方法中,获自患者的样品(例如,血液样品)选自由全血、血浆、血清或其组合组成的组。在一些情况下,样品为存档血液样品、新鲜血液样品或冷冻血液样品。
在前述任何情况下,参考bTMB评分可以是患有癌症(例如,肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC))的个体的参考群体中的bTMB评分。该个体的群体可包括已经用免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂疗法)来治疗的个体的第一子集和已经用非PD-1轴结合拮抗剂疗法来治疗的个体的第二子集,其中非PD-1轴结合拮抗剂疗法不包含免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂)。在一些情况下,参考bTMB基于对用PD-1轴结合拮抗剂疗法的治疗的应答性相对于对用非PD-1轴结合拮抗剂疗法的治疗的应答性的显著差异,显著地将个体的第一子集和第二子集中的每一个分开。在一些情况下,对治疗的应答性为无进展存活(PFS)的增加和/或总存活(OS)的增加。
在一些情况下,参考bTMB评分可以是预先指定的bTMB评分。参考bTMB评分可以是在4与30之间(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29和30,例如,在8与30之间,例如,在10与16之间,或例如,在10与20之间)。在一些情况下,参考bTMB评分可以是在10与20之间(例如,10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20)。在其他情况下,参考bTMB评分可以是在16与20之间(例如,16、17、18、19或20)。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于9的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于10的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于11的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于12的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于13的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于14的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于15的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于16的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于17的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于18的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于19的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于20的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于21的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于22的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于23的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于24的参考bTMB评分。例如,在一些情况下,个体的参考群体患有肺癌(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)且具有大于或等于25的参考bTMB评分。
在前述任何情况下,来自样品的bTMB评分可以是大于或等于4(例如,4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30或更大)。例如,来自样品的bTMB评分可以是在约8与约100之间(例如,8、9、10、20、30、40、50、60、70、80、90和100)。在一些情况下,来自样品的bTMB评分可以是在约400与约1500之间(例如,约400、500、600、700、800、900、1000、1100、1200、1300、1400或1500的bTMB评分)。在一些情况下,来自样品的bTMB评分可以是小于4(例如,0、1、2或3)或是不可检测的。
在前述任何情况的一些实施例中,bTMB评分(例如,参考bTMB评分)以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变的数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb)表示,例如,如通过
Figure BDA0004012333940001481
基因包所评定)。在一些实施例中,bTMB评分(例如,参考bTMB评分)为等效bTMB值,例如,如通过全外显子组测序所确定。
在一些情况下下,在参考群体中,来自个体的样品的bTMB评分可具有大于或等于约5%的流行率,例如,在约5%与约75%之间的流行率(例如,在约5%与约15、约15%与30%、约30%与约45%、与45%与约60%或约60%与75%之间的流行率;例如,5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%或75%)。
在一些情况下,在参考群体中,大于或等于参考截断bTMB评分的bTMB评分的流行率为约5%,例如,在约5%与约75%之间的流行率(例如,在约5%与约15%、约15%与约30%、约30%与约45%、约45%与约60%或约60%与75%之间的流行率;例如,5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%或75%)。
在一些情况下,作为在基因组或外显子组(例如,预定的一组基因)的子集中的规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb),例如,如通过
Figure BDA0004012333940001482
基因包所评定)而确定的bTMB评分与通过全外显子组测序确定的bTMB评分的偏差小于约30%(例如,小于约30%、约25%、约20%、约15%、约10%、约5%、约4%、约3%、约2%、约1%或更少)。在一些实施例中,作为在基因组或外显子组(例如,预定的一组基因)的子集中的规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb),例如,如通过/>
Figure BDA0004012333940001491
基因包所评定)而确定的bTMB评分与通过全外显子组测序确定的bTMB评分的偏差为约1%至约30%(例如,约1%至约30%、约1%至约25%、约1%至约20%、约1%至约15%、约1%至约10%、约5%至约30%、约5%至约25%、约5%至约20%、约5%至约15%、约5%至约10%、约10%至约30%、约10%至约25%、约10%至约20%、约10%至约15%、约15%至约30%、约15%至约25%、约15%至约20%、约20%至约30%或约20%至约25%)。在一些实施例中,作为在基因组或外显子组(例如,预定的一组基因)的子集中的规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变数量(例如,约1.1Mb(例如,约1.125Mb),例如,如通过/>
Figure BDA0004012333940001492
基因包所评定)而确定的bTMB评分与通过全外显子组测序确定的bTMB评分的偏差为约10%至约20%(例如,约10%、约11%、约12%、约13%、约14%、约15%、约16%、约17%、约18%、约19%或约20%)。在这里提供的任何方法中,受益于包含免疫检查点抑制剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂)的治疗可以是OS的增加、PFS的增加或OS和PFS的增加。
在前述任何方法中,PD-1轴结合拮抗剂可以是本领域已知或本文描述的任何PD-1轴结合拮抗剂。
在一些实施例中,该方法进一步包括生成针对患者或另一人或实体、护理人员、医师、肿瘤学家、医院、诊所、第三方付款人、保险公司、制药或生物技术公司或政府机关的报告,例如,电子报告、基于网络的报告或纸质报告。在一些实施例中,该报告包括来自包含对bTMB评分进行评定的方法的输出。
IV.用于治疗NSCLC的治疗性方法和组合物
本文提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)。本文还提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。受试者可以是例如基于以下发现被鉴别为可能受益于使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者:该受试者表现出大于或等于参考bTMB评分的bTMB评分。例如,受试者可以是被鉴别为具有大于或等于8的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于9的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于10的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于11的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于12的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于13的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于14的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于15的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于16的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于17的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于18的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于19的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于20的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于21的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于22的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于23的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于24的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于25的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于26的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于27的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于28的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于29的bTMB评分的受试者。在一些实施例中,受试者为被鉴别为具有大于或等于30的bTMB评分的受试者。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂在治疗后在受试者中导致应答。例如,在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解(例如,完全缓解(CR))的可能性,延长受试者的无进展存活(PFS),延长受试者的总存活(OS),且/或延长受试者的应答持续时间(DOR),例如,当与参考治疗(例如,不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗或使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗)相比时。本文还提供增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的方法,该方法包括向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)。本文进一步提供增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的方法,该方法包括向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。本领域已知或本文所述的任何PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可用于本公开的方法中。
例如,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法,该方法包括在一个或多个给药周期内向该受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗并且符合使用铂类化疗进行治疗的条件,并且其中与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂导致改善的治疗应答。
在另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法,其中该治疗包括在一个或多个给药周期内施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗并且符合使用铂类化疗进行治疗的条件,并且其中与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂导致改善的治疗应答
例如,在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解(例如,CR)的可能性,延长受试者的无进展存活(PFS),延长受试者的总存活(OS),且/或延长受试者的应答持续时间(DOR)。在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解的可能性。在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有CR的可能性。在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。在一些实施例中,当与不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的DOR。
受试者可能符合进行任何合适的铂类化疗的条件。对于铂类化疗的适格性可以如本文所述或根据本领域中已知的标准。例如,用于定义符合顺铂使用条件或不符合顺铂使用条件的患者的标准是本领域中已知的,例如,如Galsky等人Lancet.Oncol.12:211-4,2011中所述,其全文以引用方式并入本文。在一些实施例中,受试者符合使用包含顺铂的铂类化疗进行治疗的条件。在一些实施例中,受试者符合使用包含卡铂的铂类化疗进行治疗的条件。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂作为单一疗法施用。
在其他实施例中,PD-1轴结合拮抗剂与有效量的一种或多种附加治疗剂组合施用。在一些实施例中,该一种或多种附加治疗剂选自抗肿瘤剂、化疗剂、生长抑制剂、抗血管生成剂、放疗或细胞毒性剂。在一些实施例中,该一种或多种附加治疗剂为铂类化疗。在一些实施例中,不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括使用铂类化疗的治疗。
在任何前述实例中,每个给药周期可以具有任何合适的长度,例如,约7天、约14天、约21天、约28天或更长。在一些实施例中,每一个给药周期为约21天。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法,该方法包括在一个或多个给药周期内向该受试者施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂导致改善的治疗应答。
在又一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC),该治疗包括在一个或多个给药周期内施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD-1轴结合拮抗剂,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂导致改善的治疗应答。
例如,在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解(例如,CR)的可能性,延长受试者的PFS,延长受试者的OS,且/或延长受试者的DOR。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解的可能性。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有CR的可能性。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的DOR。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的方法,该方法包括在一个或多个给药周期内向该受试者施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在又另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC),该治疗包括在一个或多个给药周期内施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在一些实例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。在一些实例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解(例如,CR)的可能性且/或延长受试者的DOR。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有客观缓解的可能性。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂增加受试者具有CR的可能性。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的DOR。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期内向该受试者施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在再另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个给药周期内施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个给药周期内向该受试者施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在再另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个给药周期内施用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在任何前述实例中,每个给药周期可以具有任何合适的长度,例如,约7天、约14天、约21天、约28天或更长。在一些实施例中,每一个给药周期为约21天。
可使用任何合适数量的给药周期,例如,1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、20、25、30、35、40、45、50个或更多的给药周期。在一些实施例中,可使用10个或更少的给药周期。在一些实施例中,使用20个或更少的给药周期。在一些实施例中,使用25个或更少的给药周期。
可使用任何合适的铂类化疗,包括本领域中已知的或本文所述的任何铂类化疗。在一些实施例中,铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。
例如,在一些情况下,铂类化疗剂为顺铂。可使用本领域中已知的任何合适的顺铂给药方案。在一些实施例中,在21天给药周期内向受试者施用顺铂。在一些实施例中,以约35mg/m2至约140mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。
在另一实例中,在其他实施例中,铂类化疗剂为卡铂。可使用本领域中已知的任何合适的卡铂给药方案。在一些实施例中,在21天给药周期内向受试者施用卡铂。在一些实施例中,以约2至约9的曲线下面积(AUC)向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,以约5的曲线下面积(AUC)向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约5的曲线下面积(AUC)向所述受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂。
在前述任何实例中,铂类化疗可包括核苷类似物。可使用任何合适的核苷类似物,包括本领域中已知的或本文所述的任何核苷类似物。可使用本领域中已知的任何合适的吉西他滨给药方案。在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。在一些实施例中,在21天给药周期内向受试者施用吉西他滨。在一些实施例中,以约500mg/m2至约2000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。一些实施例,在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。
在前述任何实例中,铂类化疗可包括顺铂和吉西他滨。在其他实例中,铂类化疗可包括卡铂和吉西他滨。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向该受试者施用与包含顺铂或卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内施用与包含顺铂或卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向该受试者施用与包含顺铂或卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的OS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约4个月至约10个月、延长约5个月至约9个月、延长约6个月至约8个月、延长约6.5个月至约7.5个月或延长约6.8个月至约7.4个月(例如,延长约4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月、5个月、5.1个月、5.2个月、5.3个月、5.4个月、5.5个月、5.6个月、5.7个月、5.8个月、5.9个月、6个月、6.1个月、6.2个月、6.3个月、6.4个月、6.5个月、6.6个月、6.7个月、6.8个月、6.9个月、7个月、7.1个月、7.2个月、7.3个月、7.4个月、7.5个月、7.6个月、7.7个月、7.8个月、7.9个月、8个月、8.1个月、8.2个月、8.3个月、8.4个月、8.5个月、8.6个月、8.7个月、8.8个月、8.9个月、9个月、9.1个月、9.2个月、9.3个月、9.4个月、9.5个月、9.6个月、9.7个月、9.8个月、9.9个月或10个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约7.1个月。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的PFS。例如,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的PFS延长约1个月至约5个月、延长约2个月至约4个月、延长约2.1个月至约3.9个月、延长约2.5个月至约3.5个月或延长约2.8个月至约3.4个月(例如,延长约1个月、1.1个月、1.2个月、1.3个月、1.4个月、1.5个月、1.6个月、1.7个月、1.8个月、1.9个月、2个月、2.1个月、2.2个月、2.3个月、2.4个月、2.5个月、2.6个月、2.7个月、2.8个月、2.9个月、3个月、3.1个月、3.2个月、3.3个月、3.4个月、3.5个月、3.6个月、3.7个月、3.8个月、3.9个月、4个月、4.1个月、4.2个月、4.3个月、4.4个月、4.5个月、4.6个月、4.7个月、4.8个月、4.9个月或5个月)。在一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可以将该受试者的OS延长约3.1个月。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的OS。例如,与施用不使用PD-1轴结合拮抗剂的铂类化疗相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可将该受试者的OS延长约1个月至约5.5个月、延长约2个月至约5个月、延长约2.1个月至约4.5个月、延长约2.5个月至约4个月、延长约3个月至约3.6个月、延长约3.1个月至约3.5个月(例如,延长约3.3个月)。
在本公开的一些实施例中,与施用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂延长该受试者的PFS。例如,与施用不使用PD-1轴结合拮抗剂的铂类化疗相比,向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂可将该受试者的PFS延长约1个月至约4个月或延长约1.5个月至约2个月(例如,延长约1.7个月)。
在另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内施用与包含顺铂或卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,并且其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
可以使用任何合适的PD-1轴结合拮抗剂。示例性PD-1轴结合拮抗剂在本文中描述。其他PD-1轴结合拮抗剂是本领域中已知的。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂组成的组。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-L1结合拮抗剂。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1、B7-1或者PD-1和B7-1两者的结合。
在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。可包括本文所述或本领域已知的任何合适的抗PD-L1抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体选自由以下项组成的组:阿特珠单抗
Figure BDA0004012333940001591
MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)和MSB0010718C(阿维单抗)。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包含以下高变区(HVR):(a)GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:19)的HVR-H1序列;(b)AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)的HVR-H2序列;(c)RHWPGGFDY(SEQID NO:21)的HVR-H3序列;(d)RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)的HVR-L1序列;(e)SASFLYS(SEQID NO:23)的HVR-L2序列;和(f)QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)的HVR-L3序列。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)重链可变(VH)结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少约85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更大的序列同一性的氨基酸序列;(b)轻链可变(VL)结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少约85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或更大的序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列;或(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。在一些实施例中,抗PD-L1抗体包括:(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列,和(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列。在一些实施例中,抗PD-L1抗体是阿特珠单抗。
可以任何合适的剂量向受试者施用阿特珠单抗。在一些实施例中,以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。在一些实施例中,以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。在一些实施例中,在21天给药周期内向受试者施用阿特珠单抗。在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在又另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在再另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS和/或OS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在又另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在再另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的PFS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在又另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含顺铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在另一实例中,本文提供一种治疗有此需要的受试者的NSCLC的方法,该方法包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在再另一实例中,本文提供一种包含PD-1轴结合拮抗剂的药物组合物,其用于治疗有此需要的受试者的NSCLC,该治疗包括在一个或多个21天给药周期内向受试者施用与包含卡铂和吉西他滨的铂类化疗组合的有效量的阿特珠单抗,其中该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中与使用铂类化疗而不使用阿特珠单抗的治疗相比,该PD-1轴结合拮抗剂延长受试者的OS。
在其他实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1、PD-L2或者PD-L1和PD-L2两者的结合。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。在一些实施例中,抗PD-1抗体选自由以下项组成的组:MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810和BGB-108。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白。在一些实施例中,Fc融合蛋白为AMP-224。
在一些实施例中,先前未向受试者施用用于治疗NSCLC的化疗。例如,在一些实施例中,受试者先前不曾施用全身疗法来治疗NSCLC。在一些实施例中,先前未向受试者施用用于治疗NSCLC的任何疗法。
在一些实施例中,NSCLC为鳞状NSCLC。
在一些实施例中,NSCLC为非鳞状NSCLC。
在一些实施例中,NSCLC为IV期NSCLC。
在一些实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,例如,在肿瘤样品中小于1%(例如,0%、0.25%、0.5%、0.75%或0.99%)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在其他实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中1%或更多(例如,1%或更多、5%或更多、10%或更多、20%或更多、30%或更多、40%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多或99%或更多)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中1%至少于5%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在其他实施例中,获自患者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中5%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在一些实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中5%至少于50%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在其他实施例中,获自患者的肿瘤样品已被确定为,在肿瘤样品中50%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些情况下,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品的小于1%(例如,0%、0.25%、0.5%、0.75%或0.99%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些情况下,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品的1%或更多(例如,1%或更多、5%或更多、10%或更多、20%或更多、30%或更多、40%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多或99%或更多)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在一些实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在其他实施例中,获自患者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在其他实施例中,获自患者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在一些实施例中,获自患者的肿瘤样品已被确定为,在占肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,肿瘤样品为福尔马林固定且石蜡包埋的(FFPE)肿瘤样品、存档肿瘤样品、新鲜肿瘤样品或冷冻肿瘤样品。可使用本文所述的任何方法或使用本领域中已知的任何方法确定本文所述任何生物标志物(例如,PD-L1)的存在和/或表达水平。
受试者优选为人。在其他实施例中,受试者为非人哺乳动物。
作为一般性提议,向人施用的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)的治疗有效量将在约0.01至约50mg/kg患者体重的范围内,无论通过一次或多次施用。在一些实施例中,例如,拮抗剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体))以约0.01至约45mg/kg、约0.01至约40mg/kg、约0.01至约35mg/kg、约0.01至约30mg/kg、约0.01至约25mg/kg、约0.01至约20mg/kg、约0.01至约15mg/kg、约0.01至约10mg/kg、约0.01至约5mg/kg或约0.01至约1mg/kg的剂量施用,例如,每天、每周、每两周、每三周或每四周施用。在一些实施例中,拮抗剂(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或VEGF拮抗剂(例如,抗VEGF抗体(例如,贝伐单抗))))以15mg/kg施用。然而,其他剂量方案可能有用。在一个实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)以约100mg、约200mg、约300mg、约400mg、约500mg、约600mg、约700mg、约800mg、约900mg、约1000mg、约1100mg、约1200mg、约1300mg、约1400mg或约1500mg的剂量向人施用。在一些实施例中,该拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)可以以每三周约1000mg至约1400mg(例如,每三周约1100mg至约1300mg,例如,每三周约1150mg至约1250mg)的剂量施用。在一些实施例中,以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用该拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)。在一些实施例中,该拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)以每三周约1200mg阿特珠单抗的剂量施用。该剂量可以以单剂量或多剂量(例如,2或3个剂量)诸如输注的形式施用。与单一治疗相比,在联合治疗中施用的抗体剂量可以减少。在一些实施例中,治疗方案包括向受试者静脉内施用每三周约1200mg的阿特珠单抗。疗法的进展可以通过常规技术容易地监测。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)以单个给药方案施用。在给药方案的语境中,这些药剂的施用可以是同时的或分开的。
PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以以本领域中已知的任何合适的方式施用。例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以依序(在不同时间)或同时(在相同时间)施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂在铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)之前施用。在其他实施例中,PD-1轴结合拮抗剂在铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)之后施用。在又其他实施例中,PD-1轴结合拮抗剂与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)同时施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)在单独的组合物中。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)在同一组合物中。
PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以通过相同的施用途径或通过不同的施用途径施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)通过静脉内、肌肉内、皮下、局部、口服、经皮、腹膜内、眶内、植入、吸入、鞘内、心室内或鼻内施用。在一些实施例中,通过静脉内、肌肉内、皮下、局部、口服、经皮、腹膜内、眶内、植入、吸入、鞘内、心室内或鼻内施用铂类化疗(例如,卡铂或顺铂和吉西他滨)。可以施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)以用于预防或治疗疾病。PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可基于待治疗的疾病的类型、PD-1轴结合拮抗剂和VEGF拮抗剂的类型、疾病的严重程度和原因、个体的临床状况、个体的临床病史和对治疗的应答以及主治医师的酌情决定来确定。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)通过输液而静脉内施用。
在一些实施例中,该治疗可进一步包括附加疗法。可以使用本领域已知的或本文描述的任何合适的额外疗法。附加疗法可以是放射疗法、手术或囊切除术、化疗、基因疗法、DNA疗法、病毒疗法、RNA疗法、免疫疗法、骨髓移植、纳米疗法、单克隆抗体疗法或前述的组合。附加疗法可以是辅助疗法或新辅助疗法的形式。在一些实施例中,附加疗法是施用小分子酶抑制剂或抗转移剂。在一些实施例中,附加疗法是施用副作用限制剂(例如,旨在降低治疗副作用发生率和/或严重性的试剂,例如止吐剂等)。在一些实施例中,附加疗法为放疗。在一些实施例中,附加疗法为手术。在一些实施例中,附加疗法为放疗与手术的组合。在一些实施例中,附加疗法为伽玛辐照。在一些实施例中,附加疗法是靶向PI3K/AKT/mTOR途径的疗法、HSP90抑制剂、微管蛋白抑制剂、凋亡抑制剂和/或化辽剂。所述附加疗法可以是本文描述的一种或多种化疗剂。
V.联合疗法
本文还提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用与另一抗癌剂或癌症疗法联合使用的治疗方案,该治疗方案包括有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。在一些实施例中,该方法包括向个体施用PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)、铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)和附加治疗剂。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与附加化疗或化疗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与放疗或放疗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与靶向疗法或靶向治疗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与免疫疗法或免疫治疗剂(例如,单克隆抗体)联合施用。
不希望受理论的束缚,据认为通过促进活化共刺激分子或抑制负共刺激分子来增强T细胞刺激可促进肿瘤细胞死亡,从而治疗或延迟癌症的发展。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与针对活化共刺激分子的激动剂联合施用。在一些实施例中,活化性共刺激分子可包括CD40、CD226、CD28、OX40、GITR、CD137、CD27、HVEM或CD127。在一些实施例中,针对活化性共刺激分子的激动剂为与CD40、CD226、CD28、OX40、GITR、CD137、CD27、HVEM或CD127结合的激动剂抗体。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与针对抑制性共刺激分子的拮抗剂联合施用。在一些实施例中,抑制性共刺激分子可包括CTLA-4(也称为CD152)PD-1、TIM-3、BTLA、VISTA、LAG-3、B7-H3、B7-H4、IDO、TIGIT、MICA/B或精氨酸酶。在一些实施例中,针对抑制性共刺激分子的拮抗剂为与CTLA-4、PD-1、TIM-3、BTLA、VISTA、LAG-3、B7-H3、B7-H4、IDO、TIGIT、MICA/B或精氨酸酶结合的拮抗剂抗体。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与针对CTLA-4(也称为CD152)的拮抗剂(例如,阻断抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与伊匹单抗(ipilimumab)(也称为MDX-010、MDX-101或
Figure BDA0004012333940001701
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与曲美木单抗(tremelimumab)(也称为替西木单抗(ticilimumab)或CP-675,206)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与针对B7-H3(也称为CD276)的拮抗剂(例如,阻断抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与MGA271联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与针对TGFβ的拮抗剂(例如,美替木单抗(metelimumab)(也称为CAT-192)、非苏木单抗(fresolimumab)(也称为GC1008)或LY2157299)联合施用。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与包含表达嵌合抗原受体(CAR)的T细胞(例如,细胞毒性T细胞或CTL)的过继转移的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与包含T细胞的过继转移的治疗联合施用,该T细胞包含显性负TGFβ受体(例如,显性负TGFβII型受体)。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)可以与包含HERCREEM方案的治疗(参见例如,ClinicalTrials.gov IdentifierNCT00889954)联合施用。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对CD137(也称为TNFRSF9、4-1BB或ILA)的激动剂(例如,活化抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与乌瑞鲁单抗(urelumab)(也称为BMS-663513)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对CD40的激动剂(例如,活化抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与CP-870893联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对OX40(也称为CD134)的激动剂(例如,活化抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与抗OX40抗体(例如,AgonOX)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对CD27的激动剂(例如,活化抗体)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与CDX-1127联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对吲哚胺-2,3-双加氧酶(IDO)的拮抗剂联合施用。在一些实施例中,IDO拮抗剂为1-甲基-D-色氨酸(也称为1-D-MT)。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与抗体-药物缀合物联合施用。在一些实施例中,抗体-药物缀合物包含mertansine或单甲基澳瑞他汀E(MMAE)。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与抗NaPi2b抗体-MMAE缀合物(也称为DNIB0600A或RG7599)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与曲妥珠单抗美坦新偶联物(trastuzumab emtansine)(也称为T-DM1、曲妥珠单抗美坦新偶联物(ado-trastuzumab emtansine)或
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基因泰克)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与DMUC5754A联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向内皮素B受体(EDNBR)的抗体-药物缀合物(例如,针对EDNBR的抗体与MMAE的缀合物)联合施用。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与血管生成抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与针对血管生成素2(也称为Ang2)的抗体联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与MEDI3617联合施用。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与抗肿瘤剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CSF-1R(也称为M-CSFR或CD115)的药剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与抗CSF-1R(也称为IMC-CS4)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与干扰素(例如,干扰素α或干扰素γ)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与Roferon-A(也称为重组干扰素α-2a)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与GM-CSF(也称为重组人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、rhuGM-CSF、沙格司亭或
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)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-2(也称为阿地白介素或/>
Figure BDA0004012333940001722
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-12联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CD20的抗体联合施用。在一些实施例中,靶向CD20的抗体为奥滨尤妥珠单抗(也称为GA101或/>
Figure BDA0004012333940001723
)或利妥昔单抗。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向GITR的抗体联合施用。在一些实施例中,靶向GITR的抗体为TRX518。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与癌症疫苗联合施用。在一些实施例中,癌症疫苗为肽癌症疫苗,在一些实施例中,为个性化肽疫苗。在一些实施例中,肽癌疫苗为多价长肽、多肽、肽混合物、杂合肽或肽脉冲树突细胞疫苗(参见,例如,Yamada等人,Cancer Sci,104:14-21,2013)。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与佐剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与包含TLR激动剂(例如,Poly-ICLC(也称为
Figure BDA0004012333940001724
)、LPS、MPL或CpG ODN)的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与肿瘤坏死因子(TNF)α联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-1联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与HMGB1联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-10拮抗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-4拮抗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与IL-13拮抗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与HVEM拮抗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与ICOS激动剂联合施用,例如,通过施用ICOS-L或针对ICOS的激动性抗体。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CX3CL1的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CXCL9的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CXCL10的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向CCL5的治疗联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与LFA-1或ICAM1激动剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与选择素激动剂联合施用。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与靶向疗法联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与B-Raf的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与维罗非尼(也称为
Figure BDA0004012333940001731
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与达拉非尼(dabrafenib)(也称为/>
Figure BDA0004012333940001732
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与厄洛替尼(也称为/>
Figure BDA0004012333940001733
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与MEK(例如,MEK1(也称为MAP2K1)或MEK2(也称为MAP2K2))的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与考比替尼(cobimetinib)(也称为GDC-0973或XL-518)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与曲美替尼(trametinib)(也称为/>
Figure BDA0004012333940001734
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与K-Ras的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与c-Met的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与奥纳妥珠单抗(onartuzumab)(也称为MetMAb)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与Alk的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与AF802(也称为CH5424802或艾乐替尼(alectinib))联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与BKM120联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与艾代拉里斯(idelalisib)(也称为GS-1101或CAL-101)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与哌立福辛(也称为KRX-0401)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与Akt的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与MK2206联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与GSK690693联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与GDC-0941联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与mTOR的抑制剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与西罗莫司(也称为雷帕霉素)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂可以与替西罗莫司(temsirolimus)(也称为CCI-779或/>
Figure BDA0004012333940001741
)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与依维莫司(everolimus)(也称为RAD001)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与地磷莫司(ridaforolimus)(也称为AP-23573、MK-8669或deforolimus)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与OSI-027联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与AZD8055联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与INK128联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与双重PI3K/mTOR拮抗剂联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与XL765联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与GDC-0980联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与BEZ235(也称为NVP-BEZ235)联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与BGT226联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与GSK2126458联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与PF-04691502联合施用。在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗可以与PF-05212384(也称为PKI-587)联合施用。
在前述任何实施例中,PD-1轴结合拮抗剂可以是人PD-1轴结合拮抗剂。
在前述任何实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体。
在前述任何实施例中,铂类化疗包括铂类化疗剂(例如,顺铂或卡铂)。在一些实施例中,铂类化疗包括顺铂。在一些实施例中,铂类化疗包括卡铂。在一些实施例中,铂类化疗进一步包括一种或多种附加治疗剂,例如,核苷类似物。在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。在一些实施例中,铂类化疗包括顺铂和吉西他滨。在其他实施例中,铂类化疗包括卡铂和吉西他滨。
VI.PD-L1表达的评定
可以评定根据本文所述的供使用的任何方法和组合物治疗的受试者中的PD-L1的表达。在一种实施例中,该方法包括确定从受试者获得的生物样品(例如,肿瘤样品)中PD-L1的表达水平。在其他实施例中,已经在治疗启动之前确定了从受试者获得的生物样品(例如,肿瘤样品)中的PD-L1表达水平。在又其他实施例中,可以在治疗启动之后确定从受试者获得的生物样品(例如,肿瘤样品)中的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品约1%或更多(例如,约1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、约50%或更多、约60%或更多、约70%或更多、约80%或更多、约90%或更多、约95%或更多、约96%或更多、约97%或更多、约98%或更多、约99%或更多或100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品约1%至少于约5%(例如,1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%或1%至2%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约1%或更多(例如,约1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、约50%或更多、约60%或更多、约70%或更多、约80%或更多、约90%或更多、约95%或更多、约96%或更多、约97%或更多、约98%或更多、约99%或更多或100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约1%至少于约5%(例如,1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%或1%至2%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品约5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品约5%至少于约10%(例如,5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%或8%至8.5%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约5%至少于约10%(例如,5%至9.5%、5%至9%、5%至8.5%、5%至8%、5%至7.5%、5%至7%、5%至6.5%、5%至6%、5%至5.5%、6%至9.5%、6%至9%、6%至8.5%、6%至8%、6%至7.5%、6%至7%、6%至6.5%、7%至9.5%、7%至9%、7%至7.5%、8%至9.5%、8%至9%或8%至8.5%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在占肿瘤样品约10%或更多(例如,10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多或100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约10%或更多(例如,10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多或100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约50%或更多(例如,约50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多或99%或更多)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平和/或在占肿瘤样品约10%或更多(例如,10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、60%或更多、70%或更多、80%或更多、90%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多、99%或更多或100%)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约5%或更多(例如,约5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多或50%或更多)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平和/或在占肿瘤样品约5%或更多(例如,约5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多或50%或更多)的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
应当理解,在任何前述实例中,肿瘤浸润性免疫细胞所占据的肿瘤样品的百分比可以是肿瘤浸润性免疫细胞在从受试者获得的肿瘤样品的切片中覆盖的肿瘤面积的百分比,例如,如通过IHC使用抗PD-L1抗体(例如SP142抗体)所评定。可以使用任何合适的抗PD-L1抗体,包括例如SP142(Ventana)、SP263(Ventana)、22C3(Dako)、28-8(Dako)、E1L3N(CellSignaling Technology)、4059(ProSci,Inc.)、h5H1(Advanced Cell Diagnostics)和9A11。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP142。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP263。
在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约1%或更多(例如,约1%或更多、2%或更多、3%或更多、5%或更多、6%或更多、7%或更多、8%或更多、9%或更多、10%或更多、11%或更多、12%或更多、13%或更多、14%或更多、15%或更多、16%或更多、17%或更多、18%或更多、19%或更多、20%或更多、21%或更多、22%或更多、23%或更多、24%或更多、25%或更多、26%或更多、27%或更多、28%或更多、29%或更多、30%或更多、31%或更多、32%或更多、33%或更多、34%或更多、35%或更多、36%或更多、37%或更多、38%或更多、39%或更多、40%或更多、41%或更多、42%或更多、43%或更多、44%或更多、45%或更多、46%或更多、47%或更多、48%或更多、49%或更多、50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多或99%或更多)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约1%至少于约5%(例如,1%至4.9%、1%至4.5%、1%至4%、1%至3.5%、1%至3%、1%至2.5%或1%至2%)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中小于约1%的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约5%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。例如,在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约5%至少于约50%(例如,5%至49.5%、5%至45%、5%至40%、5%至35%、5%至30%、5%至25%、5%至20%、5%至15%、5%至10%、5%至9%、5%至8%、5%至7%、5%至6%、10%至49.5%、10%至40%、10%至35%、10%至30%、10%至25%、10%至20%、10%至15%、15%至49.5%、15%至45%、15%至40%、15%至35%、15%至30%、15%至30%、15%至25%、15%至20%、20%至49.5%、20%至45%、20%至40%、20%至35%、20%至30%、20%至25%、25%至49.5%、25%至45%、25%至40%、25%至35%、25%至30%、30%至49.5%、30%至45%、30%至40%、30%至35%、35%至49.5%、35%至45%、35%至40%、40%至49.5%、40%至45%或45%至49.5%)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在又其他实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约50%或更多(例如,约50%或更多、51%或更多、52%或更多、53%或更多、54%或更多、55%或更多、56%或更多、57%或更多、58%或更多、59%或更多、60%或更多、61%或更多、62%或更多、63%或更多、64%或更多、65%或更多、66%或更多、67%或更多、68%或更多、69%或更多、70%或更多、71%或更多、72%或更多、73%或更多、74%或更多、75%或更多、76%或更多、77%或更多、78%或更多、79%或更多、80%或更多、81%或更多、82%或更多、83%或更多、84%或更多、85%或更多、86%或更多、87%或更多、88%或更多、89%或更多、90%或更多、91%或更多、92%或更多、93%或更多、94%或更多、95%或更多、96%或更多、97%或更多、98%或更多或99%或更多)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。在一些实施例中,获自受试者的肿瘤样品已经被确定为,在肿瘤样品中约50%至约99%(例如,50%至99%、50%至95%、50%至90%、50%至85%、50%至80%、50%至75%、50%至70%、50%至65%、50%至60%、50%至55%、55%至99%、55%至95%、55%至90%、55%至85%、55%至80%、55%至75%、55%至70%、55%至65%、55%至60%、60%至99%、60%至95%、60%至90%、60%至85%、60%至80%、60%至75%、60%至70%、60%至65%、65%至99%、65%至95%、65%至90%、65%至85%、65%至80%、65%至75%、65%至70%、70%至99%、70%至95%、70%至90%、70%至85%、70%至80%、70%至75%、75%至99%、75%至95%、75%至90%、75%至85%、75%至80%、80%至99%、80%至95%、80%至90%、80%至85%、85%至99%、85%至95%、85%至90%、90%至99%或90%至95%)的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平。
在一些实施例中,肿瘤样品为福尔马林固定且石蜡包埋的(FFPE)肿瘤样品、存档肿瘤样品、新鲜肿瘤样品或冷冻肿瘤样品。
可以基于本领域中已知的任何合适的判据(包括但不限于DNA、mRNA、cDNA、蛋白质、蛋白质片段和/或基因拷贝数量)来定性地和/或定量地评定上述任何生物标志物(包括PD-L1(例如,在获自受试者的肿瘤样品中的肿瘤浸润免疫细胞(IC)上的PD-L1表达和/或在获自受试者的肿瘤样品中的肿瘤细胞(TC)上的PD-L1表达))的存在和/或表达水平(例如,在获自受试者的肿瘤样品中)。用于测量此类生物标志物的方法是本领域已知的并且是技术人员所理解的,包括但不限于,IHC、Western印迹分析、免疫沉淀、分子结合测定、ELISA、ELIFA、荧光活化细胞分选(“FACS”)、MassARRAY、蛋白质组学、基于血液的定量测定(例如,血清ELISA)、生化酶活性测定、原位杂交(ISH)、荧光原位杂交(FISH)、Southern分析、Northern分析、全基因组测序、聚合酶链反应(PCR)(包括定量实时PCR(qRT-PCR)和其他扩增类型检测方法,例如分支DNA、SISBA、TMA)、RNASeq、微阵列分析、基因表达谱分析、全基因组测序(WGS)和/或基因表达的系列分析(“SAGE”),以及可以通过蛋白质、基因和/或组织分析执行的多种测定中的任何一种。用于评定基因和基因产物的状态的典型方案可见于例如Ausubel等人编辑的《分子生物学最新方案》(Current Protocols In Molecular Biology,1995),第2单元(Northern印迹法)、第4单元(Southern印迹法)、第15单元(免疫印迹法)和第18单元(PCR分析)。也可以使用多重免疫测定,诸如可从Rules Based Medicine或MesoScale Discovery(“MSD”)获得的那些。
在前述任何方法中的一些实施例中,生物标志物(例如,PD-L1)的表达水平可以是蛋白质表达水平。在某些实施例中,该方法包括在允许与生物标志物结合的条件下使样品与本发明所述的结合至生物标志物的抗体接触,并检测抗体与生物标志物之间是否形成复合物。此类方法可以是体外或体内方法。在一些实施例中,使用抗体来选择符合用包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)的抗癌疗法进行治疗的条件的受试者,该抗体为例如用于进行受试者选择的生物标志物。在一些实施例中,使用抗体来选择符合用包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的抗癌疗法进行治疗的条件的受试者,该抗体为例如用于进行受试者选择的生物标志物。
可以使用本领域已知的或本文提供的任何测量蛋白质表达水平的方法。例如,在一些实施例中,使用选自由免疫组织化学(IHC)、流式细胞术(例如,荧光活化细胞分选(FACSTM))、Western印迹、酶联免疫吸附测定(ELISA)、免疫沉淀、免疫荧光、放射免疫测定、斑点印迹、免疫检测方法、HPLC、表面等离振子共振、光谱、质谱和HPLC的方法确定生物标志物的蛋白质表达水平。
在一些实施例中,确定生物标志物(例如,PD-L1)在肿瘤浸润免疫细胞中的蛋白质表达水平。在一些实施例中,确定生物标志物在肿瘤细胞中的蛋白质表达水平。在一些实施例中,确定生物标志物在肿瘤浸润免疫细胞和/或肿瘤细胞中的蛋白质表达水平。在一些实施例中,确定生物标志物在外周血单核细胞(PBMC)中的蛋白质表达水平。
在某些实施例中,使用IHC和染色方案检查样品中生物标志蛋白(例如,PD-L1)的存在和/或表达水平/量。组织切片的IHC染色已被证明是确定或检测样品中蛋白质存在的可靠方法。在任何方法、测定和/或试剂盒的一些实施例中,生物标志物为PD-L1的蛋白质表达产物中的一种或多种。在一个实施例中,使用以下方法确定生物标志物的表达水平:(a)使用抗体进行样品(诸如获自受试者的肿瘤样品)的IHC分析;和(b)确定样品中生物标志物的表达水平。在一些实施例中,相对于参考确定IHC染色强度。在一些实施例中,参考是参考值。在一些实施例中,参考为参考样品(例如,对照细胞系染色样品、来自非癌受试者的组织样品或被确定为对于目标生物标志物为阴性的肿瘤样品)。
例如,在一些实施例中,使用IHC确定PD-L1的蛋白质表达水平。在一些实施例中,使用抗PD-L1抗体检测PD-L1的蛋白质表达水平。可使用任何合适的抗PD-L1抗体,包括例如SP142、SP263、22C3、28-8、E1L3N、4059、h5H1和9A11。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP142。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为SP263。
IHC可以与其他技术诸如形态学染色和/或原位杂交(例如,ISH)组合进行。有两种通用的IHC方法可用:直接和间接测定。根据第一测定,直接确定抗体与靶标抗原的结合。这种直接测定使用标记的试剂,例如荧光标签或酶标记的第一抗体,无需进一步的抗体相互作用即可可视化。在典型的间接测定中,未缀合的第一抗体与抗原结合,然后标记的第二抗体与第一抗体结合。当第二抗体与酶标记物偶联时,添加生色或发荧光底物以提供抗原的可视化。发生信号放大是因为几种第二抗体可能与第一抗体上的不同表位反应。
用于IHC的第一抗体和/或第二抗体通常会用可检测的部分标记。许多标记是可获得的,其通常划分成以下类别:(a)放射性同位素,例如35S、14C、1251、3H和131I;(b)胶体金颗粒;(c)荧光标记,包括但不限于稀土螯合物(铕螯合物)、德克萨斯红(Texas Red)、罗丹明、荧光素、丹磺酰基、丽丝胺、伞形酮、藻红蛋白、藻蓝蛋白,或市售荧光团(例如SPECTRUMORANGE7和SPECTRUM GREEN7)和/或以上任何一个或多个的衍生物;(d)各种酶-底物标记是可获得的,并且美国专利号4,275,149提供了其中一些的综述。酶标记的示例包括荧光素酶(例如,荧光虫荧光素酶和细菌荧光素酶;参见,例如,美国专利号4,737,456)、荧光素、2,3-二氢双酮酞嗪(2,3-dihydrophthalazinediones)、苹果酸脱氢酶、脲酶、过氧化酶诸如辣根过氧化物酶(HRPO)、碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶、葡糖淀粉酶、溶菌酶、糖氧化酶(例如,葡萄糖氧化酶、半乳糖氧化酶和葡萄糖-6-磷酸脱氢酶)、杂环氧化酶(诸如尿酸酶和黄嘌呤氧化酶)、乳过氧化物酶、微过氧化物酶等。
酶-底物组合的示例包括:例如,辣根过氧化物酶(HRPO)和作为底物的过氧化氢酶;碱性磷酸酶(AP)和作为生色底物的磷酸对硝基苯酯;以及β-D-半乳糖苷酶(β-D-Gal)和生色底物(例如对硝基苯基-β-D-半乳糖苷酶)或荧光底物(例如4-甲基伞形酮基-β-D-半乳糖苷酶)。有关这些内容的一般评论,参见,例如,美国专利号4,275,149和4,318,980。
标本可以例如手动地或使用自动染色仪器(例如,Ventana BenchMark XT或Benchmark ULTRA仪器)来制备。这样制备的标本可以被安装并盖上盖玻片。然后例如使用显微镜确定载玻片估值,并且可以采用本领域常规使用的染色强度标准。在一个实施例中,应理解,当使用IHC检查来自肿瘤的细胞和/或组织时,可在肿瘤细胞和/或组织中确定或评定染色(与样品中可能存在的基质或周围组织相反)。在其他实施例中,可在样品中可能存在的基质或周围组织中确定或评定染色。在一些实施例中,应理解,当使用IHC检查来自肿瘤的细胞和/或组织时,染色包括确定或评定肿瘤浸润免疫细胞,包括肿瘤内或肿瘤周围的免疫细胞。在一些实施例中,通过IHC在>0%的样品中、在至少1%的样品中、在至少5%的样品中、在至少10%的样品中、在至少15%的样品中、在至少15%的样品中、在至少20%的样品中、在至少25%的样品中、在至少30%的样品中、在至少35%的样品中、在至少40%的样品中、在至少45%的样品中、在至少50%的样品中、在至少55%的样品中、在至少60%的样品中、在至少65%的样品中、在至少70%的样品中、在至少75%的样品中、在至少80%的样品中、在至少85%的样品中、在至少90%的样品中、在至少95%或更多的样品中检测到了生物标志物的存在。可使用本领域中已知的任何方法,例如,由病理学家或通过自动图像分析将样品评分。
在任何方法的一些实施例中,使用诊断性抗体(即,一抗)通过免疫组织化学检测生物标志物。在一些实施例中,诊断抗体特异性地结合人抗原。在一些实施例中,诊断抗体为非人抗体。在一些实施例中,诊断抗体为大鼠、小鼠或兔抗体。在一些实施例中,诊断抗体为兔抗体。在一些实施例中,诊断抗体为单克隆抗体。在一些实施例中,诊断抗体被直接标记。在其他实施例中,诊断抗体被间接标记(例如,通过二抗)。
在任何前述方法的其他实施例中,生物标志物的表达水平可以是核酸表达水平(例如,DNA表达水平或RNA表达水平(例如,mRNA表达水平))。可使用任何合适的确定核酸表达水平的方法。在一些实施例中,核酸表达水平使用RNAseq、RT-qPCR、qPCR、多重qPCR或RT-qPCR、微阵列分析、SAGE、MassARRAY技术、ISH或它们的组合进行测定。
用于评定细胞中的mRNA的方法是众所周知的,包括例如基因表达的系列分析(SAGE)、全基因组测序(WGS)、使用互补DNA探针的杂交测定(诸如使用对一个或多个基因具有特异性的标记核糖核蛋白的原位杂交、Northern印迹和相关技术)和各种核酸扩增测定(诸如使用对一个或多个基因具有特异性的互补引物的RT-PCR(例如,qRT-PCR),以及其他扩增类型检测方法,例如,分枝DNA、SISBA、TMA等)。另外,此类方法可以包括一个或多个步骤,该步骤允许一个人确定生物样品中靶mRNA的水平(例如,通过同时检查“管家”基因诸如肌动蛋白家族成员的比较性对照mRNA序列的水平)。任选地,可以确定扩增的靶标cDNA的序列。任选的方法包括通过微阵列技术检查或检测组织或细胞样品中的mRNA(例如靶标mRNA)的方案。使用核酸微阵列,将来自测试和对照组织样品的测试和对照mRNA样品反转录并标记以产生cDNA探针。然后将探针与固定在固体支持物上的核酸阵列杂交。配置该阵列,以便知道该阵列每个部件的顺序和位置。例如,可以选择基因(其表达与包括免疫疗法和抑制性基质拮抗剂的治疗的临床益处的增加或减少相关)排列在固体支持物上。标记的探针与特定阵列部件的杂交表明衍生出该探针的样品表达该基因。
样品可以在任何合适的时间从受试者获得。例如,在一些实施例中,样品可以在施用治疗方案之前(例如,在几分钟、几小时、几天、几周(例如,1、2、3、4、5、6或7周)、几个月或几年之前)从受试者获得。在前述任何方法的一些实施例中,来自受试者的样品在施用治疗方案之后约2至约10周(例如,2、3、4、5、6、7、8、9或10周)获得。在一些实施例中,来自受试者的样品在施用治疗方案之后约4至约6周获得。
在一些实施例中,检测生物标志物(例如,PD-L1)在组织样品、原代或培养的细胞或细胞系、细胞上清液、细胞裂解液、血小板、血清、血浆、玻璃体液、淋巴液、滑液、卵泡液、精液、羊水、乳汁、全血、血液来源的细胞、尿液、脑脊液、唾液、痰、眼泪、汗液、粘液、肿瘤溶解产物和组织培养基、组织提取物诸如均质化的组织、肿瘤组织、细胞提取物或它们的任何组合中的表达水平或数量。在一些实施例中,样品为组织样品(例如,肿瘤组织样品)、细胞样品、全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合。在一些实施例中,肿瘤组织样品,其中该肿瘤组织样品包括肿瘤细胞、肿瘤浸润免疫细胞、基质细胞或它们的组合。在一些实施例中,肿瘤组织样品为福尔马林固定和石蜡包埋的(FFPE)样品、存档的样品、新鲜的样品或冷冻的样品。
例如,在一些实施例中,使用已知技术(例如,HIC、免疫荧光显微镜或流式细胞术)检测生物标志物(例如,PD-L1)在肿瘤浸润免疫细胞、肿瘤细胞、PBMC或它们的组合中的表达水平。肿瘤浸润免疫细胞包括但不限于肿瘤内免疫细胞、肿瘤周围免疫细胞或其任何组合,或其他肿瘤基质细胞(例如,成纤维细胞)。此类肿瘤浸润免疫细胞可以是T淋巴细胞(诸如CD8+T淋巴细胞(例如,CD8+T效应子(Teff)细胞)和/或CD4+T淋巴细胞(例如,CD4+Teff细胞))、B淋巴细胞或其他骨髓谱系细胞,包括粒细胞(嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、嗜碱性粒细胞)、单核细胞、巨噬细胞、树突细胞(例如,指状树突细胞)、组织细胞和自然杀伤(NK)细胞。在一些实施例中,由于膜染色、细胞质染色或它们的组合而检测到针对生物标志物的染色。在其他实施例中,由于样品中不存在或没有染色而检测到不存在生物标志物。
在特定实施例中,评定生物标志物在含有或被怀疑含有癌细胞的样品中的表达水平。样品可以是,例如,从罹患、被怀疑罹患或被诊断为患有癌症(例如,NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC))的受试者获得的组织活检样品或转移病灶。在一些实施例中,样品是组织的样品、肿瘤的活检样品、已知或怀疑的转移性NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC)病灶或切片或血液样品(例如,外周血样品),已知或怀疑包含循环癌细胞(例如,NSCLC细胞(例如,鳞状或非鳞状NSCLC细胞)。样品可包含癌细胞(即肿瘤细胞)和非癌细胞(例如,淋巴细胞,诸如T细胞或NK细胞)两者,并且在某些实施例中,包含癌细胞和非癌细胞两者。获得生物样品(组织切除物、活检样品和体液(例如,包含癌/肿瘤细胞的血液样品))的方法是本领域中周知的。
在某些实施例中,受试者可能患有晚期、难治性、复发性和/或化疗耐药形式的癌症。
在某些实施例中,与第二样品中的存在/不存在和/或表达水平/量相比,第一样品中的生物标志物的存在和/或表达水平/量增加或升高。在某些实施例中,与第二样品中的存在和/或表达水平/量相比,第一样品中的生物标志物的存在/不存在和/或表达水平/量降低或减少。在某些实施例中,第二样品是参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织。
在某些实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织是来自相同受试者的单个样品或组合的多个样品,其是在与获得测试样品不同的一个或多个时间点获得的。例如,在比获得测试样品时更早的时间点从相同受试者获得参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织。如果参考样品是在癌症的初步诊断期间获得的,而后来在癌症转移时获得测试样品,则这种参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织可能是有用的。
在某些实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织是来自不是该受试者的一个或多个健康个体的组合的多个样品。在某些实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织是组合的多个样品,其来自不是所述受试者的一个或多个患有疾病或病症(例如癌症)的个体。在某些实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织是来自不是该受试者的一个或多个个体的正常组织或合并的血浆或血清样品的合并的RNA样品。在某些实施例中,参考样品、参考细胞、参考组织、对照样品、对照细胞或对照组织是来自肿瘤组织的混合RNA样品,或者是来自不是该受试者的一个或多个患有疾病或病症(例如癌症)个体的混合血浆或血清样品。
在一些实施例中,该方法进一步包括,例如,基于一种或多种生物标志物(例如,PD-L1)的表达水平,向受试者施用有效量的本文所述的治疗方案(例如,包含PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的治疗方案)。
VII.PD-1轴结合拮抗剂
本文提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)。本文还提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。本文还提供增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)。本文进一步提供增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。还提供相关的供使用的组合物(例如,药物组合物)、试剂盒和制品。本文所述的任何方法、供使用的组合物、试剂盒或制品可包括或涉及下述任何PD-1轴结合拮抗剂。
例如,PD-1轴结合拮抗剂包括PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂。PD-L1(程序性死亡配体1)在本领域中也称为“程序性细胞死亡1配体1”、“PDCD1LG1”、“CD274”、“B7-H”和“PDL1”。示例性人PD-L1示出在UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NZQ7.1中。PD-1(程序性死亡1)在本领域中也称为“程序性细胞死亡1”、“PDCD1”、“CD279”和“SLEB2”。示例性人PD-1示出在UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q15116中。PD-L2(程序性死亡配体2)在本领域中也称为“程序性细胞死亡1配体2”、“PDCD1LG2”、“CD273”、“B7-DC”、“Btdc”和“PDL2”。示例性人PD-L2示出在UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9BQ51中。在一些实施例中,PD-L1、PD-1和PD-L2是人PD-L1、PD-1和PD-L2。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂是抗PD-L1抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体为阿特珠单抗、YW243.55.S70、MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。抗体YW243.55.S70为WO 2010/077634中所述的抗PD-L1抗体。MDX-1105,也称为BMS-936559,是WO2007/005874中所述的抗PD-L1抗体。MEDI4736是WO2011/066389和US2013/034559中描述的抗PD-L1单克隆抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体能够抑制PD-L1和PD-1之间和/或PD-L1和B7-1之间的结合。在一些实施例中,抗PD-L1抗体是单克隆抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体是选自由Fab、Fab'-SH、Fv、scFv和(Fab')2片段组成的组的抗体片段。在一些实施例中,抗PD-L1抗体是人源化抗体。在一些实施例中,抗PD-L1抗体是人抗体。
可用于本公开的方法中的抗PD-L1抗体的示例及其制备方法描述于PCT专利申请WO 2010/077634、WO 2007/005874、WO 2011/066389和US2013/034559中,这些专利文献以引用方式并入本文。可用于本公开的抗PD-L1抗体,包括含有此类抗体的组合物,可用作单一疗法或与一种或多种附加治疗剂(例如,铂类化疗)组合。
在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂是抑制PD-1与其配体结合配偶体结合的分子。在具体方面,PD-1配体结合配偶体为PD-L1和/或PD-L2。在另一实施方案中,PD-L1结合拮抗剂为抑制PD-L1与其结合配偶体结合的分子。在具体方面,PD-L1结合配偶体是PD-1和/或B7-1。在另一实施方案中,PD-L2结合拮抗剂为抑制PD-L2与其结合配偶体结合的分子。在一个特定方面,PD-L2结合配偶体是PD-1。拮抗剂可以是抗体、其抗原结合片段、免疫粘附素、融合蛋白或寡肽。
任何合适的抗PD-L1抗体均可用于本文所提供的方法和组合物中。WO 2010/077634A1和US 8,217,149中所述的抗PD-L1抗体可以用于本文所述的方法和组合物中。在一些情况下,抗PD-L1抗体包含SEQ ID NO:3的重链可变区序列和/或SEQ ID NO:4的轻链可变区序列。在更进一步的情况下,提供分离的抗PD-L1抗体,其包含重链可变区和/或轻链可变区序列,其中:
(a)重链序列与以下重链序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:3),并且
(b)轻链序列与以下轻链序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:4)。
在一种情况下,抗PD-L1抗体包含重链可变区,该重链可变区包含HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3序列,其中:
(a)HVR-H1序列是GFTFSX1SWIH(SEQ ID NO:5);
(b)HVR-H2序列是AWIX2PYGGSX3YYADSVKG(SEQ ID NO:6);
(c)HVR-H3序列是RHWPGGFDY(SEQ ID NO:7);
进一步其中:X1为D或G;X2为S或L;X3为T或S。在一个具体方面,X1为D;X2为S并且X3为T。在另一方面,该多肽进一步包含根据下式并列在HVR之间的可变区重链框架序列:(FR-H1)-(HVR-H1)-(FR-H2)-(HVR-H2)-(FR-H3)-(HVR-H3)-(FR-H4)。在再另一方面,框架序列源自人共有框架序列。在进一步方面,框架序列是VH亚组III共有框架。在更进一步方面,框架序列中的至少一个如下:
FR-H1是EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:8)
FR-H2是WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:9)
FR-H3是RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:10)
FR-H4是WGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:11)。
在更进一步方面,重链多肽进一步与包含HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3的可变区轻链组合,其中:
(a)HVR-L1序列是RASQX4X5X6TX7X8A(SEQ ID NO:12);
(b)HVR-L2序列是SASX9LX10S,(SEQ ID NO:13);
(c)HVR-L3序列是QQX11X12X13X14PX15T(SEQ ID NO:14);其中:X4是D或V;X5是V或I;X6是S或N;X7是A或F;X8是V或L;X9是F或T;X10是Y或A;X11是Y、G、F或S;X12是L、Y、F或W;X13是Y、N、A、T、G、F或I;X14是H、V、P、T或I;X15是A、W、R、P或T。在更进一步方面,X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H;X15是A。
在更进一步方面,轻链进一步包含根据下式并列在HVR之间的可变区轻链框架序列:(FR-L1)-(HVR-L1)-(FR-L2)-(HVR-L2)-(FR-L3)-(HVR-L3)-(FR-L4)。在更进一步方面,框架序列源自人共有框架序列。在更进一步方面,框架序列是VLκI共有框架。在更进一步方面,框架序列中的至少一个如下:
FR-L1是DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:15)
FR-L2是WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:16)
FR-L3是GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:17)
FR-L4是FGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:18)。
在另一种情况下,提供了分离的抗PD-L1抗体或抗原结合片段,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)重链包含HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3,其中进一步:
(i)HVR-H1序列是GFTFSX1SWIH;(SEQ ID NO:5)
(ii)HVR-H2序列是AWIX2PYGGSX3YYADSVKG(SEQ ID NO:6)
(iii)HVR-H3序列是RHWPGGFDY,以及(SEQ ID NO:7)
(b)轻链包含HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3,其中进一步:
(i)HVR-L1序列是RASQX4X5X6TX7X8A(SEQ ID NO:12)
(ii)HVR-L2序列是SASX9LX10S;以及(SEQ ID NO:13)
(iii)HVR-L3序列是QQX11X12X13X14PX15T;(SEQ ID NO:14)其中:X1是D或G;X2是S或L;X3是T或S;X4是D或V;X5是V或I;X6是S或N;X7是A或F;X8是V或L;X9是F或T;X10是Y或A;X11是Y、G、F、或S;X12是L、Y、F或W;X13是Y、N、A、T、G、F或I;X14是H、V、P、T或I;X15是A、W、R、P或T。在某一具体方面,X1是D;X2是S以及X3是T。在另一方面,X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H;X15是A。在再另一方面,X1是D;X2是S以及X3是T、X4是D;X5是V;X6是S;X7是A;X8是V;X9是F;X10是Y;X11是Y;X12是L;X13是Y;X14是H以及X15是A。
在进一步方面,重链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-H1)-(HVR-H1)-(FR-H2)-(HVR-H2)-(FR-H3)-(HVR-H3)-(FR-H4),以及轻链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-L1)-(HVR-L1)-(FR-L2)-(HVR-L2)-(FR-L3)-(HVR-L3)-(FR-L4)。在更进一步方面,框架序列源自人共有框架序列。在更进一步方面,重链框架序列源自Kabat亚组I、II或III序列。在更进一步方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一方面,重链框架序列中的一个或多个如SEQ ID NO:8、9、10和11所示。在更进一步方面,轻链框架序列源自KabatκI、II、II或IV亚组序列。在更进一步方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一方面,轻链框架序列中的一个或多个如SEQ ID NO:15、16、17和18所示。
在又一特定方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在另一方面,人恒定区选自IgG1、IgG2、IgG2、IgG3和IgG4。在又一特定方面,人恒定区是IgG1。在另一方面,鼠恒定区选自IgG1、IgG2A、IgG2B和IgG3。在更进一步方面,鼠恒定区为IgG2A。在又一特定方面,抗体具有降低的或最小的效应子功能。在更进一步具体方面,最小的效应子功能来自“无效应子的Fc突变”或无糖基化。在更进一步的情况下,无效应子Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A取代。
在又另一种情况下,提供了包含重链和轻链可变区序列的抗PD-L1抗体,其中:
(a)所述重链进一步包含分别与GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:19)、AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)和RHWPGGFDY(SEQ ID NO:21)具有至少85%序列同一性的HVR-H1、HVR-H2和HVR-H3序列,或
(b)所述轻链进一步包含分别与RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)、SASFLYS(SEQ IDNO:23)和QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)具有至少85%序列同一性的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3序列。
在具体方面,序列一致性是86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%。
在另一方面,重链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-H1)-(HVR-H1)-(FR-H2)-(HVR-H2)-(FR-H3)-(HVR-H3)-(FR-H4),以及轻链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-L1)-(HVR-L1)-(FR-L2)-(HVR-L2)-(FR-L3)-(HVR-L3)-(FR-L4)。在再另一方面,框架序列源自人共有框架序列。在更进一步方面,重链框架序列源自Kabat亚组I、II或III序列。在更进一步方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一方面,重链框架序列中的一个或多个如SEQ ID NO:8、9、10和11所示。在更进一步方面,轻链框架序列源自KabatκI、II、II或IV亚组序列。在更进一步方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一方面,轻链框架序列中的一个或多个如SEQ ID NO:15、16、17和18所示。
在进一步方面,重链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-H1)-(HVR-H1)-(FR-H2)-(HVR-H2)-(FR-H3)-(HVR-H3)-(FR-H4),以及轻链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-L1)-(HVR-L1)-(FR-L2)-(HVR-L2)-(FR-L3)-(HVR-L3)-(FR-L4)。在更进一步方面,框架序列源自人共有框架序列。在更进一步方面,重链框架序列源自Kabat亚组I、II或III序列。在更进一步方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在更进一步方面,一个或多个重链框架序列如下:
FR-H1 EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS(SEQ ID NO:27)
FR-H2 WVRQAPGKGLEWVA(SEQ ID NO:28)
FR-H3 RFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCAR(SEQ ID NO:10)
FR-H4 WGQGTLVTVSS(SEQ ID NO:11)。
在更进一步方面,轻链框架序列源自KabatκI、II、II或IV亚组序列。在更进一步方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在更进一步方面,一个或多个轻链框架序列如下:
FR-L1 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:15)
FR-L2 WYQQKPGKAPKLLIY(SEQ ID NO:16)
FR-L3 GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYC(SEQ ID NO:17)
FR-L4 FGQGTKVEIK(SEQ ID NO:26)。
在又一特定方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在另一方面,人恒定区选自IgG1、IgG2、IgG2、IgG3和IgG4。在又一特定方面,人恒定区是IgG1。在另一方面,鼠恒定区选自IgG1、IgG2A、IgG2B和IgG3。在更进一步方面,鼠恒定区为IgG2A。在又一特定方面,抗体具有降低的或最小的效应子功能。在更进一步具体方面,最小的效应子功能来自“较少效应子的Fc突变”或无糖基化。在更进一步的情况下,无效应子Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A取代。
在又另一种情况下,提供了包含重链和轻链可变区序列的抗PD-L1抗体,其中:
(a)所述重链进一步包含分别与GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:19)、AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)和RHWPGGFDY
(SEQ ID NO:21)具有至少85%序列同一性的HVR-H1、HVR-H2
和HVR-H3序列,和/或
(b)所述轻链进一步包含分别与RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)、SASFLYS(SEQ IDNO:23)和QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)具有至少85%序列同一性的HVR-L1、HVR-L2和HVR-L3序列。
在具体方面,序列一致性是86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%。
在另一方面,重链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-H1)-(HVR-H1)-(FR-H2)-(HVR-H2)-(FR-H3)-(HVR-H3)-(FR-H4),以及轻链可变区包含并列在HVR之间的一个或多个框架序列,如下所示:(FR-L1)-(HVR-L1)-(FR-L2)-(HVR-L2)-(FR-L3)-(HVR-L3)-(FR-L4)。在再另一方面,框架序列源自人共有框架序列。在更进一步方面,重链框架序列源自Kabat亚组I、II或III序列。在更进一步方面,重链框架序列是VH亚组III共有框架。在又一方面,重链框架序列中的一个或多个如SEQ ID NO:8、9、10和WGQGTLVTVSSASTK(SEQ ID NO:29)所示。
在更进一步方面,轻链框架序列源自KabatκI、II、II或IV亚组序列。在更进一步方面,轻链框架序列是VLκI共有框架。在又一方面,轻链框架序列中的一个或多个如SEQ IDNO:15、16、17和18所示。在又一特定方面,抗体进一步包含人或鼠恒定区。在另一方面,人恒定区选自IgG1、IgG2、IgG2、IgG3和IgG4。在又一特定方面,人恒定区是IgG1。在另一方面,鼠恒定区选自IgG1、IgG2A、IgG2B和IgG3。在更进一步方面,鼠恒定区为IgG2A。在又一特定方面,抗体具有降低的或最小的效应子功能。在更进一步具体方面,最小的效应子功能来自“无效应子的Fc突变”或无糖基化。在更进一步的情况下,无效应子Fc突变是恒定区中的N297A或D265A/N297A取代。
在更进一步的情况下,提供了一种分离的抗PD-L1抗体,其包含重链和轻链可变区序列,其中:
(a)重链序列与重链序列具有至少85%的序列同一性:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTK(SEQ ID NO:25),或
(b)轻链序列与轻链序列具有至少85%的序列同一性:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKR(SEQ ID NO:4)。
在一些情况下,提供包含重链和轻链可变区序列的分离的抗PD-L1抗体,其中重链可变区序列与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性。在一些情况下,提供包含重链和轻链可变区序列的分离的抗PD-L1抗体,其中重链可变区序列与SEQ ID NO:25的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性。在一些情况下,提供包含重链和轻链可变区序列的分离的抗PD-L1抗体,其中轻链可变区序列与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性,并且重链可变区序列与SEQ ID NO:25的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性。在一些情况下,重链和/或轻链的N末端处的一个、两个、三个、四个或五个氨基酸残基可被缺失、取代或修饰。
在更进一步的情况下,提供分离的抗PD-L1抗体,其包含重链和轻链序列,其中:
(a)重链序列与重链序列具有至少85%的序列同一性:EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSDSWIHWVRQAPGKGLEWVAWISPYGGSTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARRHWPGGFDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG(SEQ ID NO:30),和/或
(b)轻链序列与轻链序列具有至少85%的序列同一性:DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQDVSTAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASFLYSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYLYHPATFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(SEQ ID NO:31)。
在一些情况下,提供包含重链和轻链序列的分离的抗PD-L1抗体,其中轻链序列与SEQ ID NO:31的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的序列同一性。在一些情况下,提供包含重链和轻链序列的分离的抗PD-L1抗体,其中重链序列与SEQ ID NO:30的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的序列同一性。在一些情况下,提供包含重链和轻链序列的分离的抗PD-L1抗体,其中轻链序列与SEQ ID NO:31的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的序列同一性,并且重链序列与SEQID NO:30的氨基酸序列具有至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的序列同一性。在一些情况下,抗PD-L1抗体包含:重链,其包含SEQ ID NO:30的氨基酸序列;和轻链,其包含SEQ ID NO:31的氨基酸序列。
在一些情况下,分离的抗PD-L1抗体是无糖基化的。抗体的糖基化通常是N-连接或O-连接的。N-连接是指碳水化合物部分连接至天冬酰胺残基的侧链。三肽序列天冬酰胺-X-丝氨酸和天冬酰胺-X-苏氨酸,其中X是脯氨酸以外的任何氨基酸,是将碳水化合物部分酶促连接至天冬酰胺侧链的识别序列。因此,多肽中这些三肽序列中任一个的存在产生潜在的糖基化位点。O-连接的糖基化是指糖N-乙酰半乳糖胺、半乳糖或木糖中的一种附接至羟基氨基酸,该羟基氨基酸最通常为丝氨酸或苏氨酸,但也可以使用5-羟脯氨酸或5-羟基赖氨酸。通过改变氨基酸序列以除去上述三肽序列之一(对于N-连接的糖基化位点),可以方便地从抗体上去除糖基化位点。可以通过将糖基化位点内的天冬酰胺、丝氨酸或苏氨酸残基取代为另一个氨基酸残基(例如,甘氨酸、丙氨酸或保守取代)来进行改变。
在本文的任何情况下,分离的抗PD-L1抗体可以结合人PD-L1,例如UniProtKB/Swiss-Prot登录号Q9NZQ7.1中所示的人PD-L1,或其变体。
在更进一步的情况下,本文提供了编码本文所述的任何抗体的分离的核酸。在一些情况下,核酸进一步包含适用于表达编码任何前述抗PD-L1抗体的核酸的载体。在更进一步具体方面,载体在适用于表达核酸的宿主细胞中。在又一个具体方面,宿主细胞是真核细胞或原核细胞。在更进一步具体方面,真核细胞是哺乳动物细胞,例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞。
抗体或其抗原结合片段可以使用本领域已知的方法来制备;例如,通过包括以下步骤的方法制备:在适用于产生此类抗体或片段的条件下,培养适用于表达的形式的含有编码前述抗PD-L1抗体或抗原结合片段中任一种的核酸的宿主细胞,并回收抗体或片段。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂是抗PD-1抗体(例如,人抗体、人源化抗体或嵌合抗体)。任何合适的抗PD-1抗体均可以用于本公开的语境中。在一些实施例中,抗PD-1抗体选自由以下项组成的组:MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810和BGB-108。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂是免疫粘附素(例如,包含与恒定区(例如,免疫球蛋白序列的Fc区)融合的PD-L1或PD-L2的细胞外或PD-1结合部分的免疫粘附素)。在一些实施例中,PD-1结合拮抗剂是AMP-224。在一些实施例中,PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。MDX-1106也称为MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558或纳武单抗,为WO2006/121168中所述的抗PD-1抗体。MK-3475,也称为lambrolizumab,是WO2009/114335中所述的抗PD-1抗体。AMP-224也称为B7-DCIg,为WO2010/027827和WO2011/066342中所述的PD-L2-Fc融合可溶性受体。在一些情况下,抗PD-1抗体是MDX-1106。“MDX-1106”的替代名称包括MDX-1106-04、ONO-4538、BMS-936558和纳武单抗。在一些情况下,抗PD-1抗体是纳武单抗(CAS登记号:946414-94-4)。在更进一步的情况下,提供了一种分离的抗PD-1抗体,该抗体包含:重链可变区,其包含SEQID NO:1的重链可变区氨基酸序列;和/或轻链可变区,其包含SEQ ID NO:2的轻链可变区氨基酸序列。在更进一步的情况下,提供分离的抗PD-1抗体,其包含重链和/或轻链序列,其中:
(a)重链序列与以下重链序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性:
QVQLVESGGGVVQPGRSLRLDCKASGITFSNSGMHWVRQAPGKGLEWVAVIWYDGSKRYYADSVKGRFTISRDNSKNTLFLQMNSLRAEDTAVYYCATNDDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(SEQ IDNO:1),并且
(b)轻链序列与以下轻链序列具有至少85%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%的序列同一性:
EIVLTQSPATLSLSPGERATLSCRASQSVSSYLAWYQQKPGQAPRLLIYDASNRATGIPARFSGSGSGTDFTLTISSLEPEDFAVYYCQQSSNWPRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC(SEQ IDNO:2)。
在又一个实施例中,提供了编码本文所述的抗体中的任一者的分离的核酸。在一些实施例中,核酸进一步包含适用于表达编码前述抗PD-1抗体中的任一者的核酸的载体。在更进一步具体方面,载体在适用于表达核酸的宿主细胞中。在又一个具体方面,宿主细胞是真核细胞或原核细胞。在更进一步具体方面,真核细胞是哺乳动物细胞,例如中国仓鼠卵巢(CHO)细胞。
抗体或其抗原结合片段可以使用本领域已知的方法来制备;例如,通过包括以下步骤的方法制备:在适用于产生此类抗体或片段的条件下,培养适用于表达的形式的含有编码前述抗PD-1抗体中任一种的核酸的宿主细胞,并且回收抗体或片段,或者根据下文所述的任何方法来制备。
明确预期此类PD-1轴结合拮抗剂抗体(例如,抗PD-L1抗体、抗PD-1抗体和抗PD-L2抗体)或本文所述的其他抗体用于任何以上列举的情况可以单独或组合地具有下文章节1至7中描述的任何特征。
1.抗体亲和力
在某些情况下,本文所提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体)的解离常数(Kd)为≤1μM、≤100nM、≤10nM、≤1nM、≤0.1nM、≤0.01nM或≤0.001nM(例如10-8M或更低,例如10-8M至10-13M,例如10-9M至10-13M)。
在一种情况下,通过放射性标记的抗原结合测定(RIA)测量Kd。在一个实例中,采用目的抗体的Fab形式及其抗原进行RIA。例如,通过在一系列未标记的抗原滴定存在下用最小浓度(125I)标记的抗原平衡Fab,然后用抗Fab抗体包被的板捕获结合的抗原,来测量Fab对抗原的溶液结合亲和力(参见,例如,Chen等人,J.Mol.Biol.293:865-881(1999))。为了确定用于测定的条件,用在50mM碳酸钠(pH 9.6)中5μg/ml捕获抗Fab抗体(Cappel Labs)包被
Figure BDA0004012333940002011
微孔板(Thermo Scientific)过夜,随后在室温(大约23℃)下用在PBS中2%(w/v)牛血清白蛋白阻断二至五小时。在非吸附板(Nunc#269620)中,将100pM或26pM[125I]-抗原与目的Fab的连续稀释液(例如,遵循在Presta等人,Cancer Res.57:4593-4599(1997)中抗VEGF抗体(Fab-12)的评定)混合。然后将目的Fab孵育过夜;然而,孵育可以持续更长时间(例如,约65小时)以确保达到平衡。此后,将混合物转移至捕获板以在室温下孵育(例如,一小时)。随后移除溶液并且用在PBS中的0.1%聚山梨酯20(TWEEN-/>
Figure BDA0004012333940002012
)洗涤该板八次。当板已干燥时,添加150μl/孔的闪烁体(MICROSCINT-20TM;Packard),并且在TOPCOUNTTMγ计数器(Packard)上对板计数十分钟。选择给出小于或等于20%最大结合的各Fab的浓度以用于竞争性结合测定中。
根据另一种情况,使用
Figure BDA0004012333940002021
表面等离子体共振测定测量Kd。例如,使用
Figure BDA0004012333940002022
-2000或/>
Figure BDA0004012333940002023
-3000(BIAcore,Inc.,Piscataway,NJ)在25℃下用固定的抗原CM5芯片以约10个响应单位(RU)进行测定。在一种情况下,根据供应商说明书,用N-乙基-N'-(3-二甲基氨基丙基)-碳化二亚胺盐酸盐(EDC)及N--羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化的葡聚糖生物感测器芯片(CM5,BIACORE,Inc.)。将抗原用10mM乙酸钠,pH 4.8稀释至5μg/ml(约0.2μM),之后以5μL/分钟的流速进行注射以获得大约10响应单位(RU)的偶联蛋白质。注射抗原之后,注射1M乙醇胺以阻断未反应的基团。关于动力学测量,在25℃,以大约25μL/min的流量,注射在含有0.05%聚山梨酯20(TWEEN 20TM)表面活性剂(PBST)的PBS中的Fab的两倍连续稀释液(0.78nM至500nM)。使用简单的一对一Langmuir结合模型(/>
Figure BDA0004012333940002024
Evaluation Software 3.2版),通过同时拟合缔合与解离感测器图来计算缔合速率(kon)与解离速率(koff)。平衡解离常数(Kd)被计算为比率koff/kon。参见,例如,Chen等人,J.Mol.Biol.293:865-881(1999)。若通过上述表面等离子体共振测定得出缔合速率超过106M-1s-1,则可通过使用荧光淬灭技术测定缔合速率,即如在分光计诸如配备止流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-AMINCOTM分光光度计(ThermoSpectronic)中用搅拌比色杯所测得的,在浓度渐增的抗原存在下,测量在25℃下PBS pH 7.2中的20nM抗抗原抗体(Fab形式)的荧光发射强度(激发=295nm;发射=340nm,16nm带通)的增加或减少。
2.抗体片段
在某些情况下,本文提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体)为抗体片段。抗体片段包括但不限于Fab、Fab’、Fab’-SH、F(ab’)2、Fv、和scFv片段,以及下文描述的其他片段。关于某些抗体片段的综述,参见Hudson等人,Nat.Med.9:129-134(2003)。关于scFv片段的综述,参见例如,Pluckthün在The harmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Rosenburg and Moore eds.,(Springer-Verlag,New York),pp.269-315(1994)中所述;还可参见WO 93/16185;以及美国专利号5,571,894和5,587,458。关于对包含补救受体结合表位残基并具有增加的体内半衰期的Fab和F(ab')2片段的讨论,请参见美国专利号5,869,046。
双体抗体是具有两个抗原结合位点的抗体片段,其可以是二价或双特异性的。参见例如,EP 404,097;WO 1993/01161;Hudson等人,Nat.Med.9:129-134(2003);和Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448(1993)。三体抗体和四体抗体也在Hudson等人,Nat.Med.9:129-134(2003)中进行了描述。
单结构域抗体为包含抗体的全部或部分重链可变结构域或全部或部分轻链可变结构域的抗体片段。在某些情况下,单结构域抗体为人单结构域抗体(Domantis,Inc.,Waltham,MA;参见,例如,美国专利号6,248,516B1)。
抗体片段可以通过各种技术制备,包括但不限于完整抗体的蛋白水解消化以及由重组宿主细胞(例如大肠杆菌或噬菌体)产生,如本文所述。
3.嵌合抗体和人源化抗体
在某些情况下,本文提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体)为嵌合抗体。某些嵌合抗体描述于,例如,美国专利号4,816,567和Morrison等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855(1984)中。在一个实例中,嵌合抗体包含非人可变区(例如,源自小鼠、大鼠、仓鼠、兔或非人灵长类动物(诸如猴)的可变区)和人恒定区。在另一个实例中,嵌合抗体为其中类别或亚类已经与亲本抗体的类别或亚类改变的“类别转换”抗体。嵌合抗体包括其抗原结合片段。
在某些情况下,嵌合抗体为人源化抗体。通常,将非人抗体人源化以减少对人的免疫原性,同时保留亲本非人抗体的特异性和亲和力。通常,人源化抗体包含一个或多个可变结构域,其中HVR,例如CDR(或其部分)源自非人抗体,而FR(或其部分)源自人抗体序列。人源化抗体任选地还将包含人恒定区的至少一部分。在一些实例中,人源化抗体中的一些FR残基被来自非人抗体(例如,HVR残基所来源于的抗体)的相应残基置换,例如以恢复或改善抗体特异性或亲和力。
人源化抗体及其制备方法在例如Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008)中综述,并且进一步描述于例如Riechmann等人,Nature 332:323-329(1988);Queen等人,Proc.Natl Acad.Sci.USA 86:10029-10033(1989);美国专利号5,821,337、7,527,791、6,982,321和7,087,409;Kashmiri等人,Methods 36:25-34(2005)(描述了特异性决定区(SDR)移植);Padlan,Mol.Immunol.28:489-498(1991)(描述了“表面再塑”);Dall’Acqua等人,Methods 36:43-60(2005)(描述了“FR改组”);以及Osbourn等人,Methods 36:61-68(2005)和Klimka等人,Br.J.Cancer,83:252-260(2000)(描述了用于FR改组的“指导选择”方法)中。
可用于人源化的人框架区包括但不限于:使用“最佳拟合”方法选择的框架区(参见,例如,Sims等人J.Immunol.151:2296(1993));来源于轻链或重链可变区的特定亚组的人抗体的共有序列的框架区(参见,例如,Carter等人Proc.Natl.Acad.Sci.USA,89:4285(1992);以及Presta等人J.Immunol.,151:2623(1993));人成熟(体细胞突变)框架区或人种系框架区(参见,例如,Almagro和Fransson,Front.Biosci.13:1619-1633(2008));以及来源于筛选FR文库的框架区(参见,例如,Baca等人,J.Biol.Chem.272:10678-10684(1997)和Rosok等人,J.Biol.Chem.271:22611-22618(1996))。
4.人抗体
在某些情况下,本文提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体)为人抗体。可以使用本领域已知的各种技术来产生人抗体。人抗体一般描述于van Dijk和van deWinkel,Curr Opin Pharmacol.5:368-74(2001)和Lonberg,Curr Opin Immunol.20:450-459(2008)中。
可以通过以下方式来制备人抗体:将免疫原施用于转基因动物,所述转基因动物已被修饰以响应于抗原激发而产生具有人可变区的完整人抗体或完整抗体。此类动物通常含有全部或部分人免疫球蛋白基因座,所述全部或部分人免疫球蛋白基因座替代内源性免疫球蛋白基因座,或者在动物的染色体外存在或随机整合至动物的染色体中。在此类转基因小鼠中,内源性免疫球蛋白基因座通常已被灭活。关于从转基因动物获得人抗体的方法的综述,参见Lonberg,Nat.Biotech.23:1117-1125(2005)。另参见,例如,描述XENOMOUSETM技术的美国专利号6,075,181和6,150,584;描述
Figure BDA0004012333940002051
技术的美国专利号5,770,429;描述K-M/>
Figure BDA0004012333940002052
技术的美国专利号7,041,870,以及描述/>
Figure BDA0004012333940002053
技术的美国专利申请公开号US 2007/0061900。可以进一步修饰来自由此类动物产生的完整抗体的人可变区,例如通过与不同的人恒定区组合。
人抗体也可以通过基于杂交瘤的方法制备。已经描述了用于产生人单克隆抗体的人骨髓瘤和小鼠-人杂交骨髓瘤细胞系。(参见例如,Kozbor J.Immunol.,133:3001(1984);Brodeur等人,《单克隆抗体生产技术及应用》(Monoclonal Antibody ProductionTechniques and Applications),第51-63页(Marcel Dekker,Inc.,New York,1987);以及Boerner等人,J.Immunol.,147:86(1991)。)经由人B细胞杂交瘤技术产生的人抗体也如Li等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,103:3557-3562(2006)所述。另外的方法包括例如在美国专利号7,189,826(描述了从杂交瘤细胞系产生单克隆人IgM抗体)和Ni,XiandaiMianyixue,26(4):265-268(2006)(描述了人-人杂交瘤)中描述的那些方法。人类杂交瘤技术(Trioma技术)也描述于Vollmers和Brandlein,Histology and Histopathology,20(3):927-937(2005)和Vollmers和Brandlein,Methods and Findings in Experimental andClinical Pharmacology,27(3):185-91(2005)中。
人抗体还可以通过分离选自人源噬菌体展示文库的Fv克隆可变结构域序列产生。然后可以将此类可变结构域序列与预期的人恒定结构域结合。从抗体文库中选择人抗体的技术描述如下。
5.源自文库的抗体
抗体(例如,抗PD-L1抗体和抗PD-1抗体)可以通过筛选组合文库中具有所需活性的抗体来分离。例如,本领域已知多种方法用于产生噬菌体展示文库并筛选此类文库以获得具有所需结合特征的抗体。此类方法在,例如,Hoogenboom等人,Methods in MolecularBiology 178:1-37(O'Brien等人,编,Human Press,Totowa,NJ,2001)中综述并且进一步描述于,例如,在McCafferty等人,Nature 348:552-554;Clackson等人,Nature 352:624-628(1991);Marks等人,J.Mol.Biol.222:581-597(1992);Marks和Bradbury,in Methods inMolecular Biology 248:161-175(Lo,ed.,Human Press,Totowa,NJ,2003);Sidhu等人,J.Mol.Biol.338(2):299-310(2004);Lee等人,J.Mol.Biol.340(5):1073-1093(2004);Fellouse,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 101(34);12467-12472(2004);和Lee等人,J.Immunol.Methods 284(1-2):119-132(2004)中。
在某些噬菌体展示方法中,将VH和VL基因全套库通过聚合酶链式反应(PCR)进行单独克隆,并在噬菌体文库中随机重组,然后可以从该噬菌体文库中筛选抗原结合噬菌体,如在Winter等人,Ann.Rev.Immunol.,12:433-455(1994)中所描述的。噬菌体通常将抗体片段展示为单链Fv(scFv)片段或Fab片段。来自经免疫的来源的文库提供针对免疫原的高亲和力抗体,而无需构建杂交瘤。替代性地,可以克隆所有天然组成成分(例如,来自人的所有天然组成成分)以提供针对广泛的非自身抗原和自身抗原的抗体的单一来源,而无需任何免疫,如Griffiths等人,EMBO J,12:725-734(1993)所述。最后,还可通过以下方式来制得天然文库:克隆来自干细胞的未重排的V基因区段;以及使用含有随机序列的PCR引物来编码高度可变的CDR3区域并完成体外重排,如由Hoogenboom和Winter,J.Mol.Biol.,227:381-388(1992)所述。描述人抗体噬菌体文库的专利出版物包括,例如:美国专利号5,750,373,和美国公开号2005/0079574、2005/0119455、2005/0266000、2007/0117126、2007/0160598、2007/0237764、2007/0292936和2009/0002360。
在本文中从人抗体文库分离出的抗体或抗体片段被认为是人抗体或人抗体片段。
6.多特异性抗体
在以上任一方面,本文提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体)可以是多特异性抗体,例如,双特异性抗体。多特异性抗体是对至少两个不同位点具有结合特异性的单克隆抗体。在某些情况下,本文提供的抗体为多特异性抗体,例如,双特异性抗体。在某些情况下,结合特异性中的一种为针对PD-L1的,并且另一种为针对任何其他抗原的。在某些情况下,双特异性抗体可结合PD-L1的两个不同的表位。双特异性抗体也可用于将细胞毒性剂定位于表达PD-L1的细胞。双特异性抗体可以制备为全长抗体或抗体片段。
制备多特异性抗体的技术包括但不限于,具有不同特异性的两个免疫球蛋白重链-轻链对的重组共表达(参见,Milstein和Cuello,Nature 305:537(1983)、WO 93/08829和Traunecker等人,EMBO J.10:3655(1991))和“杵臼”工程化(参见,例如,美国专利号5,731,168)。多特异性抗体也可以通过以下技术制造:工程化静电操纵效应以制造抗体Fc-异二聚体分子(参见,例如,WO 2009/089004A1);将两种或更多种抗体或片段交联(参见,例如,美国专利号4,676,980和Brennan等人,Science 229:81(1985));使用亮氨酸拉链来产生双特异性抗体(参见,例如,Kostelny等人,J.Immunol.148(5):1547-1553(1992));使用“双抗体”技术制造双特异性抗体片段(参见,例如,Hollinger等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA90:6444-6448(1993));使用单链Fv(sFv)二聚体(参见,例如,Gruber等人,J.Immunol.152:5368(1994));以及按照例如Tutt等人J.Immunol.147:60(1991)的描述制备三特异性抗体。
本文还包括具有三个或更多个功能性抗原结合位点的工程化抗体,包括“章鱼抗体”(参见,例如,US 2006/0025576A1)。
本文的抗体或片段还包括“双重作用FAb”或“DAF”,其包含与PD-L1以及另一种不同抗原结合的抗原结合位点。
7.抗体变体
在某些情况下,考虑了本文所提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体和抗PD-1抗体)的氨基酸序列变体。例如,可能期望改善抗体的结合亲和力和/或其他生物特性。抗体的氨基酸序列变体可以通过向编码抗体的核苷酸序列中引入适当的修饰或通过肽合成来制备。此类修饰包括例如抗体氨基酸序列内残基的缺失、和/或插入和/或取代。可以进行缺失、插入和取代的任何组合以实现最终构建体,前提条件为最终构建体具有所需特征,例如,抗原结合。
I.取代、插入和删除性变体
在某些情况下,提供具有一或多个氨基酸取代的抗体变体。用于取代突变的目的位点包括HVR和FR。保守置换在表2中的“优选置换”标题下示出。更多实质性改变提供于表2的“示例性置换”标题下,并且在下文参考氨基酸侧链类别进行了进一步描述。可以将氨基酸取代引入目标抗体中,并对产物进行预期活性(例如,保留/改善的抗原结合、降低的免疫原性,或改善的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)或补体依赖性细胞毒性(CDC))筛选。
表2.示例性和优选的氨基酸取代
Figure BDA0004012333940002081
可根据共同的侧链特性将氨基酸分组:
(1)疏水性:正亮氨酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile;
(2)中性亲水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;
(3)酸性:Asp、Glu;
(4)碱性:His、Lys、Arg;
(5)影响链取向的残基:Gly,Pro;
(6)芳族:Trp、Tyr、Phe。
非保守性取代将需要用这些类别中的一个的成员交换另一类别。
一种类型的取代变体涉及取代亲本抗体(例如,人源化抗体或人抗体)的一个或多个高可变区残基。通常,为进一步研究而选择的一种或多种所得变体相对于亲本抗体将在某些生物特性(例如,提高的亲和力和/或降低的免疫原性)上具有修饰(例如,改善)和/或将具有亲本抗体的基本上保留的某些生物特性。示例性置换变体为亲和力成熟抗体,例如,其可使用诸如本文所述的那些基于噬菌体展示的亲和力成熟技术方便地生成。简言之,将一个或多个HVR残基突变并且将变体抗体展示在噬菌体上并针对特定生物活性(例如结合亲和力)进行筛选。
例如,可改变(例如,取代)HVR,以改善抗体亲和力。此类改变可发生于HVR“热点”中,即由体细胞成熟过程中发生高频突变的密码子编码的残基(参见例如:Chowdhury,Methods Mol.Biol.207:179-196(2008))和/或与抗原接触的残基(检测所得变体VH或VL的结合亲和力。通过构建并自二级文库重新选择而实现的亲和力成熟已被例如Hoogenboom等人在Methods in Molecular Biology 178:1-37(O'Brien等人编,Human Press,Totowa,NJ,(2001))中进行描述。在亲和力成熟的一些实例中,通过多种方法(例如,易错PCR、链改组或寡核苷酸定向突变)中的任一者将多样性引入出于成熟目的而挑选的可变基因中。然后创建一个二级文库。随后对该文库进行筛选以鉴别具有所需亲和力的任何抗体变体。引入多样性的另一种方法涉及HVR定向方法,其中将若干HVR残基(例如,每次4-6个残基)随机化。参与抗原结合的HVR残基可例如使用丙氨酸扫描突变或建模来特异性地鉴别。具体而言,常常靶向CDR-H3和CDR-L3。
在某些实例中,置换、插入或缺失可出现在一个或多个HVR内,只要此类改变基本上不降低抗体结合抗原的能力。例如,可在HVR中进行基本上不降低结合亲和力的保守性改变(例如,如本文提供的保守性取代)。此类改变可以例如在HVR中的抗原接触残基之外。在以上提供的变体VH及VL序列的某些实例中,各HVR未改变,或含有不超过一个、两个或三个氨基酸置换。
可用于鉴别可被靶向诱变的抗体残基或区域的方法称作“丙氨酸扫描诱变”,如Cunningham和Wells(1989)Science,244:1081-1085所述。在此方法中,鉴别残基或一组靶残基(例如,带电残基,诸如Arg、Asp、His、Lys和Glu)并用中性或带负电的氨基酸(例如,丙氨酸或多丙氨酸)替换以确定抗体与抗原的相互作用是否受到影响。可在对初始取代展示功能敏感性的氨基酸位置引入其他取代。可替代地或另外地,利用抗原-抗体复合物的晶体结构鉴别抗体与抗原之间的接触点。可靶向或消除作为取代的候选的此类接触残基和相邻残基。可筛选变体以确定它们是否具备期望的特性。
氨基酸序列插入包括长度范围为一个残基至含有一百个或更多个残基的多肽的氨基和/或羧基末端融合,以及一个或多个氨基酸残基的序列内插入。末端插入的实例包括具有N末端甲硫氨酰残基的抗体。抗体分子的其他插入变体包括与增加抗体的血清半衰期的酶(例如,对于ADEPT)或多肽的抗体的N末端或C末端的融合。
II.糖基化变体
在某些情况下,可以改变本公开的抗体以增加或减少抗体被糖基化的程度。对本公开的抗体添加或缺失糖基化位点可以通过改变氨基酸序列以产生或去除一个或多个糖基化位点来方便地实现。
当抗体包含Fc区时,附接于其上的碳水化合物可以被改变。由哺乳动物细胞产生的天然抗体通常包含支链的、双触角寡糖,该双触角寡糖通常通过N-键结连接至Fc区的CH2结构域的Asn297。参见,例如,Wright等人TIBTECH 15:26-32(1997)。寡糖可包括各种碳水化合物,例如,甘露糖、N-乙酰基葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖和唾液酸,以及附接于双触角寡糖结构的“主干”中的GlcNAc的岩藻糖。在一些情况下,可对本公开的抗体中的寡糖进行修饰,以产生具有某些改善特性的抗体变体。
在一种情况下,提供抗体变体,其具有缺乏附接(直接或间接)于Fc区的岩藻糖的碳水化合物结构。例如,此类抗体中岩藻糖的含量可以为1%至80%、1%至65%、5%至65%或20%至40%。岩藻糖的量为通过计算糖链中在Asn297处的岩藻糖的平均量确定,相对于通过MALDI-TOF质谱测得的与Asn 297附接的所有糖结构(例如,复合、杂合和高甘露糖结构)的总和,如WO 2008/077546中所述。Asn297是指位于Fc区中约297位的天冬酰胺残基(Fc区残基的EU编号);然而,由于抗体中的微小序列变化,Asn297也可以位于297位上游或下游大约±3个氨基酸,即在294位和300位之间。此类岩藻糖基化变体可以具有改善的ADCC功能。参见,例如,美国专利公开号US 2003/0157108和US 2004/0093621。与“去岩藻糖基化”或“岩藻糖缺陷型”抗体变体有关的出版物的实例包括:US 2003/0157108;WO 2000/61739;WO 2001/29246;US2003/0115614;US 2002/0164328;US 2004/0093621;US 2004/0132140;US 2004/0110704;US 2004/0110282;US 2004/0109865;WO2003/085119;WO 2003/084570;WO 2005/035586;WO 2005/035778;WO2005/053742;WO2002/031140;Okazaki等人,J.Mol.Biol.336:1239-1249(2004);Yamane-Ohnuki等人,Biotech.Bioeng.87:614(2004)。能够产生去岩藻糖基化抗体的细胞系的实例包括蛋白岩藻糖基化缺陷的Lec13CHO细胞(Ripka等人,Arch.Biochem.Biophys.249:533-545(1986);美国专利申请号US 2003/0157108 A1;和WO 2004/056312 A1,Adams等人,特别是实施例11),和敲除细胞系,诸如α-1,6-岩藻糖基转移酶基因,FUT8敲除CHO细胞(参见,例如,Yamane-Ohnuki等人,Biotech.Bioeng.87:614(2004);Kanda,Y.等人,Biotechnol.Bioeng.,94(4):680-688(2006);和WO2003/085107)。
抗体还提供有二等分的寡糖,例如,其中附接于抗体的Fc区的双触角寡糖被GlcNAc二等分。此类抗体变体可以具有减少的岩藻糖基化和/或改善的ADCC功能。此类抗体变体的实例描述于例如WO 2003/011878、美国专利号6,602,684和US 2005/0123546中。还提供了在连接于Fc区的寡糖中具有至少一个半乳糖残基的抗体变体。这样的抗体变体可以具有改善的CDC功能。此类抗体变体描述于例如WO 1997/30087、WO 1998/58964和WO 1999/22764中。
III.Fc区变体
在某些情况下,可将一个或多个氨基酸修饰引入本公开的抗体的Fc区中,从而生成Fc区变体。Fc区变体可包含人Fc区序列(例如人IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc区),其在一个或多个氨基酸位置上包含氨基酸修饰(例如取代)。
在某些情况下,本公开考虑了具有一些但不是全部效应物功能的抗体变体,这使其成为应用的期望候选物,其中体内的抗体的半衰期为重要的而某些效应子功能(诸如补体和ADCC)为不必要的或有害的。可以进行体外和/或体内细胞毒性测定,以确认CDC和/或ADCC活性的降低/耗尽。例如,可以进行Fc受体(FcR)结合测定以确保抗体缺乏FcγR结合(因此可能缺乏ADCC活性),但是保留FcRn结合能力。介导ADCC的主要细胞NK细胞仅表达FcγRIII,而单核细胞表达FcγRI、FcγRII和FcγRIII。造血细胞上的FcR表达总结在Ravetch和Kinet,Annu.Rev.Immunol.9:457-492(1991)的第464页的表3中。用于评定目的分子的ADCC活性的体外测定的非限制性实例描述于美国专利号5,500,362(参见,例如,Hellstrom,I.等人Proc.Natl.Acad.Sci.USA 83:7059-7063(1986))和Hellstrom,I等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82:1499-1502(1985);美国专利号5,821,337(参见Bruggemann,M.等人,J.Exp.Med.166:1351-1361(1987))中。替代性地,可以采用非放射性测定方法(参见,例如,用于流式细胞术的ACTITM非放射性细胞毒性测定(CellTechnology,Inc.MountainView,CA);以及CYTOTOX
Figure BDA0004012333940002121
非放射性细胞毒性测定(Promega,Madison,WI)))。用于此类测定的有用效应子细胞包括外周血单核细胞(PBMC)和自然杀伤(NK)细胞。替代性地或另外地,目标分子的ADCC活性可以在体内评定,例如,在动物模型(诸如在Clynes等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 95:652-656(1998)中所公开的)中评定。也可以进行C1q结合测定以确认抗体不能结合C1q,因此缺乏CDC活性。参见例如WO2006/029879和WO 2005/100402中的C1q和C3c结合ELISA。为了评定补体激活,可以进行CDC测定(参见,例如,Gazzano-Santoro等人,J.Immunol.Methods 202:163(1996);Cragg等人,Blood.101:1045-1052(2003);和Cragg等人,Blood.103:2738-2743(2004))。FcRn结合和体内清除/半衰期测定也可以使用本领域已知的方法执行(参见例如Petkova等人,Int'l.Immunol.18(12):1759-1769(2006))。
具有降低的效应子功能的抗体包括具有一个或多个Fc区残基238、265、269、270、297、327和329的取代的那些(美国专利号6,737,056和8,219,149)。此类Fc突变体包括在氨基酸位置265、269、270、297和327中的两个或更多个氨基酸位置处具有置换的Fc突变体,包括具有对残基265和297的丙氨酸置换的所谓“DANA”Fc突变体(美国专利号7,332,581和8,219,149)。
描述了具有改善的或降低的与FcR的结合的某些抗体变体。(参见例如美国专利号6,737,056;WO 2004/056312;以及Shields等人,J.Biol.Chem.9(2):6591-6604(2001)。)
在某些实例中,抗体变体包含具有一个或多个氨基酸置换的Fc区,其改善ADCC,例如,在Fc区的298、333和/或334位处的置换(残基的EU编号)。
在一些情况下,例如,如美国专利号6,194,551、WO 99/51642和Idusogie等人J.Immunol.164:4178-4184(2000)中所述,在Fc区中进行改变,导致改变(即,改善或减少)的C1q结合和/或补体依赖性细胞毒性(CDC)。
具有延长的半衰期和改善的新生儿Fc受体(FcRn)结合、负责将母体IgG转移至胎儿(Guyer等人,J.Immunol.117:587(1976);以及Kim等人,J.Immunol.24:249(1994))的抗体描述于US2005/0014934A1(Hinton等人)中。那些抗体包含这样的Fc区,所述Fc区中具有改善Fc区与FcRn的结合的一个或多个取代。此类Fc变体包括在以下Fc区残基中的一处或多处具有取代的Fc变体:238、256、265、272、286、303、305、307、311、312、317、340、356、360、362、376、378、380、382、413、424或434,例如对Fc区残基434的取代(美国专利号7,371,826)。
有关Fc区变体的其他实例,另外参见:Duncan和Winter,Nature322:738-40(1988);美国专利号5,648,260;美国专利号5,624,821;以及WO 94/29351。
IV.半胱氨酸工程抗体变体
在某些实例中,可期望产生半胱氨酸工程化的抗体,例如,“thioMAb”,其中抗体的一个或多个残基被半胱氨酸残基置换。在具体实例中,置换的残基存在于抗体的可接近位点处。如本文进一步描述的,通过用半胱氨酸取代那些残基,从而将反应性硫醇基团定位于抗体的可接近位点,并且可用于将抗体与其他部分(诸如药物部分或接头-药物部分)缀合,以产生免疫缀合物。在某些实例中,可用半胱氨酸置换下列残基中的任何一个或多个:轻链的V205(Kabat编号);重链的A118(EU编号);以及重链Fc区的S400(EU编号)。可如例如美国专利号7,521,541中所述生成半胱氨酸工程化的抗体。
V.抗体衍生物
在某些实例中,可进一步修饰本文提供的抗体以使其含有本领域已知且易于获得的附加的非蛋白质性部分。适合于抗体衍生化的部分包括但不限于水溶性聚合物。水溶性聚合物的非限制性示例包括但不限于聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇的共聚物、羧甲基纤维素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯烷酮、聚-1,3-二氧戊环、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/马来酸酐共聚物、聚氨基酸(均聚物或随机共聚物)和葡聚糖或聚(n-乙烯吡咯烷酮)聚乙二醇、丙二醇均聚物、聚环氧丙烷/环氧乙烷共聚物、聚氧乙烯化多元醇(例如甘油)、聚乙烯醇以及它们的混合物。由于其在水中的稳定性,聚乙二醇丙醛在制造中可具有优势。聚合物可具有任何分子量,并且可以具有支链或不具有支链。连接至抗体的聚合物的数目可变化,并且如果连接了多于一个聚合物,那么它们可以为相同或不同的分子。通常,可基于以下考虑因素测定用于衍生化的聚合物的数目和/或类型,包括但不限于抗体待改善的特定特性或功能、抗体衍生物是否将用于限定条件下的疗法等。
在另一个实例中,提供了抗体和可通过暴露于辐射而选择性地加热的非蛋白质性部分的缀合物。在一个实例中,非蛋白质性部分为碳纳米管(Kam等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102:11600-11605(2005))。辐射可具有任何波长,并且包括但不限于对普通细胞没有伤害、但是将非蛋白质性部分加热至抗体-非蛋白质性部分近端的细胞被杀死的温度的波长。
VI.免疫缀合物
本公开还提供免疫缀合物,其包含与一种或多种细胞毒性剂缀合的本文所提供的抗体(例如,抗PD-L1抗体或抗PD-1抗体),所述一种或多种细胞毒性剂为诸如化学治疗剂或药物、生长抑制剂、毒素(例如,细菌、真菌、植物或动物来源的蛋白质毒素、酶活性毒素,或其片段),或放射性同位素。
在一种情况下,免疫缀合物为抗体-药物缀合物(ADC),其中抗体缀合至一种或多种药物,包括但不限于美登素类生物碱(参见美国专利号5,208,020、5,416,064和欧洲专利EP 0 425 235 B1);奥瑞他汀(auristatin),诸如单甲基奥瑞他汀药物部分DE和DF(MMAE和MMAF)(参见美国专利号5,635,483和5,780,588以及7,498,298);多拉司他汀;卡奇霉素或其衍生物(参见美国专利号5,712,374、5,714,586、5,739,116、5,767,285、5,770,701、5,770,710、5,773,001和5,877,296;Hinman等人,Cancer Res.53:3336-3342(1993);和Lode等人,Cancer Res.58:2925-2928(1998));蒽环类药物,诸如柔红霉素或多柔比星(参见Kratz等人,Current Med.Chem.13:477-523(2006);Jeffrey等人,Bioorganic&Med.Chem.Letters 16:358-362(2006);Torgov等人,Bioconj.Chem.16:717-721(2005);Nagy等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 97:829-834(2000);Dubowchik等人,Bioorg.&Med.Chem.Letters 12:1529-1532(2002);King等人,J.Med.Chem.45:4336-4343(2002);以及美国专利号6,630,579);甲氨蝶呤;长春地碱;紫杉烷,诸如多西他赛、紫杉醇、拉罗他赛、替塞他赛和奥他他赛;单端孢菌素和CC1065。
在另一种情况下,免疫缀合物包含与酶活性毒素或其片段缀合的本文所述的抗体,所述酶活性毒素或其片段包括但不限于白喉A链、白喉毒素的非结合活性片段、外毒素A链(来自铜绿假单胞菌)、蓖麻毒蛋白A链、相思豆毒蛋白A链、蒴莲根毒素A链、α-次黄嘌呤、油桐蛋白、石竹蛋白(dianthin protein)、美洲商陆蛋白(Phytolaca americana protein)(PAPI、PAPII和PAP-S)、苦瓜抑制剂、姜黄素、巴豆毒素、肥皂草抑制剂、明胶、丝林霉素(mitogellin)、局限曲霉素、酚霉素、依诺霉素和单端孢菌素。
在另一个实例中,免疫缀合物包括与放射性原子缀合以形成放射性缀合物的本文所述的抗体。多种放射性同位素可用于生产放射性缀合物。实例包括At211、I131、I125、Y90、Re186、Re188、Sm153、Bi212、P32、Pb212和Lu的放射性同位素。当放射性缀合物用于检测时,它可能包含用于闪烁显像研究的放射性原子,例如,tc99m或I123,或用于核磁共振(NMR)成像(也称为磁共振成像,mri)的自旋标记物,诸如碘-123、碘-131、铟-111、氟-19、碳-13、氮-15、氧-17、钆、锰或铁。可以使用多种双功能蛋白偶联剂,诸如N-琥珀酰亚氨基-3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP)、琥珀酰亚氨基-4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-羧酸琥珀酰亚胺酯(SMCC)、亚氨基硫杂环戊烷(IT)、亚氨基酯的双官能衍生物(诸如己二酸二甲酯盐酸盐)、活性酯(诸如辛二酸二琥珀酰亚胺基酯)、醛(诸如戊二醛)、双叠氮基化合物(诸如双(对叠氮基苯甲酰基)己二胺)、双重氮衍生物(诸如双-(对重氮苯甲酰基)-乙二胺)、二异氰酸酯(诸如甲苯2,6-二异氰酸酯)和双活性氟化合物(诸如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)制备抗体和细胞毒剂的缀合物。例如,可以如Vitetta等人,Science 238:1098(1987)中所述制备蓖麻毒蛋白免疫毒素。碳-14标记的1-异硫氰基苄基-3-甲基二亚乙基三胺五乙酸(MX-DTPA)为一种示例性螯合剂,用于将放射性核苷酸缀合至抗体。参见WO94/11026。接头可以为促进细胞中细胞毒性药物释放的“可切割接头”。例如,可以使用对酸不稳定的接头、肽酶敏感的接头、对光不稳定的接头、二甲基接头或含二硫键的接头(Chari等人,Cancer Res.52:127-131(1992);美国专利号5,208,020)。
本文的免疫缀合物或ADC明确考虑但不限于用交联剂制备的此类缀合物,包括但不限于市售的(例如,来自Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL.,U.S.A)BMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、SMPH、磺基-EMCS、磺基-GMBS、磺基-KMUS、磺基-MBS、磺基-SIAB、磺基-SMCC、磺基-SMPB和SVSB(琥珀酰亚胺基-(4-乙烯基砜)苯甲酸酯)。
VIII.铂类化疗
本文提供用于治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。本文进一步提供增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的方法,该方法包括向该受试者施用治疗方案,该治疗方案包含有效量的PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。还提供相关的供使用的组合物(例如,药物组合物)、试剂盒和制品。本文所述的任何方法、供使用的组合物、试剂盒或制品可包括或涉及下述任何铂类化疗。
可使用任何合适的铂类化疗。在一些实施例中,铂类化疗包括铂类化疗剂(例如,顺铂、卡铂、奥沙利铂、奈达铂(nedaplatin)、四硝酸三铂(triplatin tetranitrate)、菲铂(phenanthriplatin)、吡铂(picoplatin)、顺铂脂质体(lipoplatin)或赛特铂(satraplatin))。在一些实施例中,铂类化疗包括顺铂。在一些实施例中,铂类化疗包括卡铂。
在一些实施例中,铂类化疗进一步包括一种或多种附加治疗剂。例如,铂类化疗可进一步包括本文所述的任何化疗剂。在一个实例中,铂类化疗进一步包括核苷类似物。可使用任何合适的核苷类似物,例如,吉西他滨、阿糖胞苷、氟达拉滨或克拉屈滨(cladribine)。在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。例如,在一些实施例中,铂类化疗包括顺铂和吉西他滨。在其他实施例中,铂类化疗包括卡铂和吉西他滨。
在另一实例中,铂类化疗可包括顺铂、甲氨蝶呤、长春花碱和阿霉素,这在本领域中也称为MVAC。
在另一实例中,铂类化疗可包括剂量密集的甲氨蝶呤、长春花碱、阿霉素和顺铂,这在本领域中也称为DDMVAC。
在另一实例中,铂类化疗可包括顺铂和氟尿嘧啶(5-FU)。
在另一实例中,铂类化疗可包括顺铂、甲氨蝶呤和长春花碱,这在本领域中也称为CMV。
在另一实例中,铂类化疗可包括甲氨蝶呤、卡铂和长春花碱,这在本领域中也称为M-CAVI。
在另一实例中,铂类化疗可包括顺铂和紫杉烷(例如,紫杉醇)。
IX.药物组合物和制剂
本文还提供药物组合物和制剂,其包含PD-1轴结合拮抗剂和/或本文所述的抗体(诸如抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体),并且任选地包含药用载体。本公开还提供药物组合物和制剂,其包含铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)的一个或多个成员,并且任选地包含药用载体。
如本文所述的药物组合物和制剂可通过将具有所需纯度的活性成分(例如,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨))与一种或多种任选使用的药用载体混合来制备(参见例如,Remington’s Pharmaceutical Sciences,第16版,Osol,A.编辑(1980)),例如,为冻干制剂或水溶液的形式。药用载体在所采用的剂量和浓度下通常对受体无毒,包括但不限于:缓冲剂,诸如磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸和甲硫氨酸;防腐剂(诸如十八烷基二甲基苄基氯化铵;六甲基氯化铵;苯扎氯铵;苄索氯铵;苯酚,丁醇或苄醇;对羟基苯甲酸烷基酯,诸如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯;邻苯二酚;间苯二酚;环己醇;3-戊醇;和间甲酚);低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,诸如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,诸如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,诸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、组氨酸、精氨酸或赖氨酸;单糖,二糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,诸如EDTA;糖,诸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇;成盐抗衡离子,诸如钠;金属络合物(例如,锌-蛋白质络合物);和/或非离子表面活性剂,诸如聚乙二醇(PEG)。本文的示例性药学上可接受的运载体进一步包括间质药物分散剂,诸如可溶中性活性透明质酸酶糖蛋白(sHASEGP),例如人可溶性PH-20透明质酸酶糖蛋白,诸如rHuPH20(
Figure BDA0004012333940002181
BaxterInternational,Inc.)。某些示例性sHASEGP和使用方法,包括rHuPH20,描述于美国专利公开号2005/0260186和2006/0104968中。在一个方面中,将sHASEGP与一种或多种另外的糖胺聚糖酶(诸如软骨素酶)组合。
示例性的冻干抗体制剂描述于美国专利号6,267,958中。水性抗体制剂包括在美国专利号6,171,586和WO2006/044908中描述的那些,后一者中的制剂包括组氨酸-乙酸盐缓冲液。
本文的组合物和制剂还可含有多于一种对于所治疗的特定适应症为必需的活性成分,优选为具有不会彼此不利地影响的互补活性的活性成分。此类活性成分适当地以对预期目的有效的量组合存在。
活性成分可以包埋在例如通过凝聚技术或通过界面聚合而制备的微胶囊(例如分别为羟甲基纤维素或明胶微胶囊和聚(甲基丙烯酸甲酯)微胶囊)中;包埋在胶体药物递送系统(例如,脂质体、白蛋白微球、微乳液、纳米粒子和纳米胶囊)中;或包埋在粗乳液中。此类技术公开于Remington's Pharmaceutical Sciences第16版,Osol,A.编(1980)。
可以制备缓释制备物。缓释制备物的合适示例包括含有抗体的固态疏水聚合物的半透性基质,所述基质为例如膜或微胶囊等成型制品的形式。用于体内施用的制剂通常是无菌的。例如,无菌可以通过无菌过滤膜过滤而容易地实现。
X.制品或试剂盒
在本公开的另一实施例中,提供制品或试剂盒,其包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)。在一些实施例中,该制品或试剂盒进一步包括包装插页,该包装插页包括用于使用PD-1轴结合拮抗剂来治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展或者来增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的使用说明。在一些实施例中,该制品或试剂盒进一步包括包装插页,该包装插页包括用于使用与铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)组合的PD-1轴结合拮抗剂来治疗受试者的NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)或延迟其进展或者来增强患有NSCLC(例如,鳞状或非鳞状NSCLC,包括IV期NSCLC)的受试者的免疫功能的使用说明。在制品或试剂盒中可以包括本文所述的任何PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类疗法。
在一些实施例中,PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)处于相同容器或分开的容器中。合适的容器包括例如瓶、小瓶、袋子和注射器。容器可以由多种材料形成,例如玻璃、塑料(诸如聚氯乙烯或聚烯烃)或金属合金(诸如不锈钢或哈氏合金)。在一些实施例中,容器容纳制剂,容器上或与容器相关的标签可以指示使用说明。制品或试剂盒还可以包括从商业和用户角度出发期望的其它材料,包括其它缓冲剂、稀释剂、过滤器、针头、注射器和带有使用说明的包装插页。在一些实施例中,制品进一步包括一种或多种其他试剂(例如,附加化疗剂和抗肿瘤剂)。用于一种或多种试剂的合适容器包括例如瓶、小瓶、袋子和注射器。
在另一实例中,本文提供用于治疗有此需要的受试者的NSCLC的试剂盒,该试剂盒包括PD-1轴结合拮抗剂(例如,抗PD-L1抗体(例如,阿特珠单抗)或抗PD-1抗体)和/或铂类化疗(例如,顺铂或卡铂和吉西他滨)以及用于以包含一个或多个给药周期的治疗方案向受试者施用PD-1轴结合拮抗剂和/或铂类化疗的使用说明,该受试者先前未针对NSCLC进行治疗,其中与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比,该治疗方案延长受试者的PFS和/或OS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该治疗方案延长受试者的PFS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该治疗方案延长受试者的OS。在一些实施例中,当与使用铂类化疗而不使用PD-1轴结合拮抗剂的治疗相比时,该治疗方案增加受试者具有客观缓解(例如,CR)的可能性且/或延长受试者的应答持续时间(DOR)。在一些实施例中,每一个给药周期为约21天。在一些实施例中,铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。在一些实施例中,铂类化疗剂为顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向受试者静脉内施用顺铂。在一些实施例中,铂类化疗剂为卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第-2天至第4天以约5的曲线下面积(AUC)向所述受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天以约5的AUC向受试者静脉内施用卡铂。在一些实施例中,核苷类似物为吉西他滨(gemcitabine)。一些实施例,在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向受试者静脉内施用吉西他滨。在一些实施例中,铂类化疗包含顺铂和吉西他滨。在其他实施例中,铂类化疗包含卡铂和吉西他滨。
在前述任何试剂盒中,抗PD-L1抗体可以是阿特珠单抗。该试剂盒可包括以任何合适的剂量向受试者施用阿特珠单抗的使用说明。在一些实施例中,该试剂盒包括以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗的使用说明。在一些实施例中,该试剂盒包括以每3周约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗的使用说明。在一些实施例中,该试剂盒包括在21天给药周期内向受试者施用阿特珠单抗的使用说明。在一些实施例中,该试剂盒包括在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗的使用说明。在一些实施例中,该试剂盒包括在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向受试者静脉内施用阿特珠单抗的使用说明。
本说明书被认为足以使本领域技术人员能够实施本公开。除了本文中示出和描述的之外,本公开的各种修改对于根据说明书前文的本领域技术人员而言将变得显而易见,并且落入所附权利要求的范围内。
实例
参考以下实例将更详细地理解本公开。但是,它们不应被解释为限制本公开的范围。应当理解,本文描述的实例和实施例仅用于说明目的,并且其各种修改或改变将被建议给本领域技术人员,并且将被包括在本申请的精神和界限内以及本发明所附权利要求的范围内。
实例1:阿特珠单抗(抗PD-L1抗体)的III期、开放标签、随机化研究,在患有未经治疗的小细胞肺癌的患者中进行,与铂类化疗进行比较
本实例描述一项以评定阿特珠单抗治疗相对于施用铂类疗法的治疗对于患有IV期鳞状或非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)的患者的差异性效应为目的来执行的III期临床试验的结果。如下所述,本研究的主要重点为总存活(OS)的改善。次要重点包括无进展存活(PFS)、总应答率(ORR)和应答持续时间(DOR)等。
根据下述方案执行该研究:
实验设计
本研究为一项随机、III期、全球性、多中心、开放标签研究,旨在评定阿特珠单抗在患有IV NSCLC的经PD-L1选择的化疗初治患者中的安全性和功效,与由铂剂(顺铂或卡铂,由研究人员酌情决定)与培美曲塞(非鳞状疾病)或吉西他滨(鳞状疾病)的组合组成的化疗进行比较。图1说明了研究设计。
在筛选时,由中心实验室使用IHC测定测试来自每一例可能符合条件的患者的肿瘤标本的PD-L1表达。只有经PD-L1选择(TC1/2/3或IC1/2/3;对应于≥1%的TC表达PD-L1和≥1%的肿瘤区域为表达PD-L1的IC所占据)的患者才能入组。将患有非鳞状疾病的患者1:1随机分组,以接受单独的阿特珠单抗或者接受与顺铂或卡铂组合的培美曲塞。将患有鳞状疾病的患者1:1随机分组,以接受单独的阿特珠单抗或者接受与顺铂或卡铂组合的吉西他滨。按性别(男性与女性)、ECOG体能状态(0与1)、组织学(非鳞状与鳞状)和通过IHC获得的PD-L1肿瘤表达(TC1/2/3和任何IC与TC0和IC1/2/3),对随机分组进行分层。
鉴于与铂类化疗相关联的毒性(例如,中性粒细胞减少、贫血)并且需要进行预用药,这是一项开放标签的研究。不允许从对照臂(铂类化疗)转组至实验臂(阿特珠单抗)。
在每一个21天周期的第1天静脉内施用阿特珠单抗(1200mg的固定剂量)。只要患者经历如由研究人员所评定的临床益处(即,在综合评定影像学数据、活检结果[如果可用]和临床状态后,不存在如由研究人员所确定的归因于疾病进展的不可接受的毒性或症状恶化),就继续阿特珠单抗治疗,或者继续治疗直至不可接受的毒性或死亡。
在治疗期间,如果用阿特珠单抗进行治疗的患者和显示临床益处证据的患者满足以下所有条件,则允许他们在符合关于进展性疾病的RECIST v1.1标准后继续进行阿特珠单抗治疗:
·研究者评定的临床益处证据
·不存在指示疾病进展明确的症状和体征(包括实验室值的恶化[例如,新的或恶化的高钙血症])
·没有可归因于疾病进展的ECOG体能状态下降
·在方案允许的医学干预措施无法管理的关键解剖部位(例如,软脑膜疾病)处不存在肿瘤进展
·患者必须提供书面同意书,以承认推迟其他治疗选项以支持在根据RECISTv1.1的初始影像学进展时继续进行研究治疗。
除非如研究人员所评定和记录的那样在临床上不可行,否则在第一个影像学疾病进展的证据时(在影像学进展的40天内或下一次抗癌治疗开始之前,以较早者为准),所有患者都必须进行强制性肿瘤活检样品采集。这些数据用来探索影像学发现是否与肿瘤的存在相一致或进展的出现是否由假性进展所引起。此外,分析了这些数据以评定肿瘤组织的变化与临床结果之间的关联,并进一步了解与使用化疗进行治疗后的此类机制相比,对阿特珠单抗的耐药性和进展的潜在机制。该探索性生物标志物评定未用于任何治疗相关决定。不能进行活检样品采集但符合上述所列标准的患者可继续接受阿特珠单抗。
经随机分组以接受与顺铂或卡铂组合的培美曲塞(非鳞状疾病)的患者在用培美曲塞进行维持疗法之后,在每一个21天周期的第1天静脉内接受化疗,持续四个或六个周期。经随机分组以接受与顺铂或卡铂组合的吉西他滨(鳞状疾病)的患者在最佳支持治疗之后,在每一个21天周期的第1天静脉内接受顺铂或卡铂并且在第1天和第8天静脉内接受吉西他滨,持续四个或六个周期。计划用于铂类诱导化疗的预期周期数量(即,四个或六个周期)由研究人员在研究随机分组之前指定。治疗将继续进行,直至疾病进展、不可接受的毒性或死亡。
无论治疗是否延迟,所有患者均在基线并且在第1周期第1天后的48周内每6周(±7天)接受肿瘤评定。在第48周肿瘤评定完成后,无论治疗是否延长,都需要每9周(±7天)进行肿瘤评定,直至根据RECIST v1.1的影像学疾病进展(或者对于在根据RECIST v1.1的影像学疾病进展之后继续用阿特珠单抗进行治疗的经阿特珠单抗治疗的患者而言,临床益处丧失)、撤回同意、死亡或由发起人终结研究,以先发生者为准。因除根据RECIST v1.1的影像学疾病进展(例如,毒性、症状恶化)以外的原因终止治疗的患者,继续进行计划的肿瘤评定,直到根据RECIST v1.1的放射学疾病进展(或对于已在根据RECIST v1.1的放射影像学疾病进展之后继续阿特珠单抗治疗的经阿特珠单抗治疗的患者而言,临床益处丧失)、撤回同意、死亡或由发起人终结研究(以先发生者为准)。在不存在根据RECIST v1.1的影像学疾病进展的情形下,无论患者是否开始新的抗癌疗法,都继续进行肿瘤评定。
当符合以下所有标准时,研究结束:
·已经观察到用于OS的最终分析所需的死亡数量
·最后一例患者的最后一次访视已经发生。
此外,主办者可随时决定终止研究。如果发起人决定终结研究,则可以将仍在接受研究治疗或仍在进行存活随访的患者纳入扩展研究或非介入研究中。
结果量度
本研究的主要功效终点为OS,其定义为从随机分组到因任何原因而死亡的时间。
本研究的次要功效结果量度如下:
·PFS,定义为从随机分组到首次发生研究人员使用RECIST v1.1确定的疾病进展或任何原因导致的死亡(以先发生者为准)之间的时间
·客观缓解(PR加CR),由研究人员根据RECIST v1.1确定
·DOR,定义为从首次出现有记载的客观缓解开始到如研究人员使用RECIST v1.1确定的疾病进展或因任何原因死亡时(以先发生者为准)的时间
·在1年或2年里程碑时间点的OS
·使用SILC量表获得的每一种患者报告的肺癌症状(咳嗽、呼吸困难或胸痛)的TTD和相对于基线的变化(即,基于表现症状的改善或恶化)
·患者报告的肺癌症状的TTD,定义为从随机分组到以下症状分量表(咳嗽、呼吸困难[多项量表]和胸痛)中任一项恶化(10分的变化)的时间,以先发生者为准,如通过EORTC QLQ-LC13所测量
·OS和研究人员根据RECIST v1.1在PD-L1(使用SP263 IHC测定来定义)和bTMB亚群体中评定的PFS。bTMB测定(Foundation Medicine,Cambridge,MA)鉴别跨394个基因的≥0.5%的单核苷酸变体并且通过最大体细胞等位基因频率估计肿瘤分数,滤除种系事件并计数非驱动基因体细胞突变以生成bTMB评分。所评定的bTMB评分截断值为≥10、≥
16和≥20。bTMB评分为16(16个突变/1.1Mb)约等于14.5个突变/Mb。
本研究的探索性结果量度如下:
·OS和研究人员根据RECIST v1.1在PD-L1(使用22c3测定来定义)亚群体中评定的PFS
·在6个月或1年里程碑时间点的PFS
·在3年里程碑时间点的OS
·OS和研究人员基于人口统计学和基线特征在亚组中根据RECIST v1.1评定的PFS
·在进展时采集的强制性活检样品标本中免疫细胞浸润和其他探索性生物标志物的状态
·在使用阿特珠单抗治疗之前、期间或之后或在进展时采集的存档和/或新近获得的肿瘤组织和血液(或血液衍生物)中,与PD-L1、免疫和NSCLC相关的以及其他探索性生物标志物的状态,及其与疾病状态和/或对阿特珠单抗的应答的关联
·EQ-5D-3L调查问卷的效用评分
·与健康相关的生活质量、与肺癌相关的症状和功能性的PRO相对于基线的变化,如根据EORTC QLQ-C30和QLQ-LC13所评定。
材料和方法
患者
全球大约有150个站点参与了本研究,并且大约555例患有IV期NSCLC的经PD–L1选择的化疗初治患者入组。
纳入标准
患者必须符合以下所有标准才能进入研究:
·签署知情同意书
·年龄≥18岁
·ECOG体能状态为0或1
·组织学或细胞系证实的IV期非鳞状或鳞状NSCLC(根据国际癌症联合会/美国癌症联合委员会分期系统,第7版;Detterbeck等人2009)
·患有混合组织学肿瘤的患者必须基于主要组织学成分被分类为非鳞状或鳞状。
·未进行针对IV期非鳞状或鳞状NSCLC的既往治疗
·将已知具有在EGFR基因或ALK融合致癌基因中的敏化突变的患者排除在本研究之外。
·具有未知EGFR或ALK状态的患有非鳞状NSCLC的患者在筛选前/筛选时必须进行测试。
·具有未知EGFR或ALK状态的患有鳞状NSCLC的患者无需在筛选前/
筛选时进行测试。EGFR和/或ALK可以在本地或中心实验室评定。需要其他组织来对EGFR和/或ALK进行中心测试。
·已接受针对非转移性疾病的具有治愈意图的既往新辅助、辅助化疗、放疗或放化疗的患者,自最后一个化疗、放疗或放化疗周期以来,必须在随机分组后经历至少6个月的无治疗间隔。
·具有经治疗的无症状CNS转移史的患者符合条件,前提是他们符合以下所有标准:
仅允许幕上和小脑转移(即没有转移到中脑、脑桥、髓质或脊髓)
无需持续使用皮质类固醇治疗CNS疾病
在随机分组前7天内未进行立体定向辐射或14天内未进行全脑辐射在完成CNS定向疗法和筛选影像学研究之间无中期进展的临床证据
在筛查扫描中发现新的无症状CNS转移的患者必须接受放射疗法和/或CNS转移手术。治疗后,如果符合所有其他标准,则这些患者可能符合条件,无需在随机分组之前进行额外的脑部扫描。
·肿瘤PD-L1表达(TC1/2/3或IC1/2/3;对应于≥1%的TC表达PD-L1和≥1%的肿瘤区域为表达PD-L1的IC占据),如通过由中心实验室对先前获得的存档肿瘤组织或在筛选时获自活检样品的肿瘤样品进行的IHC测定所确定。
·参与本研究需要处于石蜡块中的(优选)代表性福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤标本或15张或更多未染色的、从FFPE肿瘤标本新鲜切割的连续切片(在载玻片上)。该标本必须附带相关联的病理报告。如果在基线时少于15张(但不少于10张)载玻片可用,则患者在与医学监察员讨论后仍可能符合条件。
·对于新鲜收集的标本、切片、芯针活检样品、切除、切口、穿刺或钳夹活检样品是可接受的。细针抽吸(定义为不保留组织架构并产生细胞悬液和/或细胞涂片的样品)、刷洗、来自胸腔积液的细胞沉淀和灌洗样品是不可接受的。
·已脱钙的来自骨转移灶的肿瘤组织是不可接受的。
·对于芯针活检标本,优选地,应提交包埋在单个石蜡块中的至少三个芯以用于评定。
·对于其初始存档肿瘤组织样品为PD-L1阴性的患者,出于测试PD-L1状态的目的,可在筛选时进行活检以提交新鲜的组织。阳性结果导致任何肿瘤组织样品将满足这一适格性标准。
·可测量的疾病,如通过RECIST v1.1所定义
·如果在该部位明确记录了疾病进展,则仅先前照射的病灶可视为可测量的疾病,因为辐射和先前照射的病灶不是可测量疾病的唯一位点
·足够的血液和终末器官功能,通过在随机化前14天内获得的以下实验室测试结果定义:
ANC≥1500个细胞/μL,无粒细胞集落刺激因子支持
淋巴细胞计数≥500个细胞/μL
血小板计数≥100,000个细胞/μL,无输血
血红蛋白≥9.0g/dL
可向患者输血以满足该标准。
INR或aPTT≤1.5×正常上限(ULN)
这仅应用于未接受治疗性抗凝的患者;接受治疗性抗凝的患者在随机分组前至少1周内必须具有处于治疗限内的INR或aPTT。
·AST、ALT和碱性磷酸酶≤2.5×ULN,以下情况除外:
记录有肝转移的患者:AST和/或ALT≤5×ULN
患有记录的肝转移或骨转移的患者:碱性磷酸酶≤5×ULN
血清胆红素≤1.5×ULN
患有已知吉尔伯特病且血清胆红素水平≤3×ULN的患者可以入组。
肌酐清除率计算值(CrCl)≥45mL/min,或如果使用顺铂,CrCl计算值≥60mL/min
·对于具有生育潜力的女性患者和有具有生育潜力的伴侣的男性患者,同意在研究治疗期间使用高效的避孕方法,该方法当持续且正确使用时导致每年<1%的低失败率。女性患者应在最后一次给药阿特珠单抗后继续避孕5个月,并且在最后一次给药顺铂后继续避孕6个月。在该同一时期,女性必须避免捐献卵子。用化疗(顺铂或卡铂加培美曲塞或吉西他滨)进行治疗的男性患者应在最后一次给药化疗后继续避孕6个月。在该同一时期,男性必须避免捐献精子。此类方法包括组合(含雌激素和孕激素)激素避孕、与抑制排卵相关联的仅使用孕激素的激素避孕且同时使用始终含有杀精剂的另一种附加屏障方法、宫内节育装置(IUD)、宫内激素释放系统(IUS)、双侧输精管堵塞或施行双侧输精管切除的伴侣(以这是在整个研究持续期间的唯一伴侣为条件)和性禁欲。因为可能与研究药物相互作用,口服避孕药应始终与附加避孕方法组合。同样的规则也适用于参与本研究的男性患者,如果他们有具有生育潜力的伴侣。男性患者必须始终使用避孕套。
·非绝经后(≥12个月的非疗法所致闭经)或经手术绝育的女性必须在研究药物启动前的14天内具有阴性血清妊娠测试结果。
排除标准
符合以下章节中任何标准的患者将被排除在研究之外。
特定于癌症的排除
·在EGFR基因或ALK融合致癌基因中的已知敏化突变
·活动的或未治疗的CNS转移灶,如在筛选期间或在影像学评定前通过CT或磁共振成像(MRI)评定所确定
·未经手术和/或放疗进行明确治疗的脊髓压迫症,或先前经诊断和治疗的脊髓压迫症,但没有证据表明随机分组前疾病在临床上稳定≥2周
·软脑膜疾病
·无法控制的肿瘤相关疼痛
需要止痛药的患者在进入研究时必须采用稳定的治疗方案。适合姑息放疗的症状性病灶(例如,骨转移或引起神经碰触的转移)应在随机分组前进行治疗。患者应当已从放射治疗的影响中恢复。
不要求最短恢复期。无症状转移病灶的进一步的生长可能会导致功能缺陷或顽固性疼痛(例如,目前与脊髓压迫无关的硬膜外转移),则应考虑对患者进行局部区域治疗(若适合,在入组之前)。
·不受控制的胸腔积液、心包积液或腹水,需要反复引流(每月一次或更频繁)。
·具有留置导管(例如,
Figure BDA0004012333940002291
)的患者是允许的。
·不受控制的或有症状的高血钙症(>1.5mmol/L离子化钙或钙>12mg/dL或校正血清钙>ULN)
·在随机分组之前接受地诺单抗(denosumab)的患者必须有意愿并且符合终止其使用的条件,并且在研究期间用双磷酸盐类代替。
·在随机分组前5年内有并非NSCLC的恶性肿瘤,但那些用具有预期根治性结果的方法来治疗的转移或死亡的风险可忽略不计(例如,预期5年OS>90%)的恶性肿瘤(诸如经充分治疗的原位宫颈癌、基底或鳞状细胞皮肤癌、经根治性手术治疗的局限性前列腺癌、经根治性手术治疗的原位胆管癌)除外。
一般医学排除
·妊娠、哺乳或意图在研究期间妊娠的女性
·存在对嵌合或人源化抗体或融合蛋白的重度变应性、过敏或其他超敏反应史
·已知对在中国仓鼠卵巢细胞中产生的生物药物或阿特珠单抗制剂的任何组分的超敏性
·自身免疫性疾病的病史,包括但不限于,重症肌无力、肌炎、自身免疫性肝炎、全身性红斑狼疮、类风湿性关节炎、炎症性肠病、与抗磷脂综合征相关的血管血栓形成、韦格纳肉芽肿、干燥综合征、格林-巴利综合征、多发性硬化、血管炎或肾小球肾炎。
·有自身免疫相关的甲状腺功能减退症病史并且正在接受稳定剂量的甲状腺替代疗法的患者符合该研究的条件。患有胰岛素方案可控的I型糖尿病的患者符合该研究的条件。患有湿疹、银屑病、慢性单纯性苔藓或仅具有皮肤病表现的白癜风(即,患有银屑病关节炎的患者会被排除)的患者是允许的,前提是他们符合以下条件:
皮疹的面积必须小于体表面积的10%
疾病被良好控制在基线并且仅需要使用低效局部皮质类固醇
在过去12个月内,未发生需要用PUVA[补骨脂素加紫外线A辐射]、甲氨蝶呤、类维生素A、生物药剂、口服钙调磷酸酶抑制剂或高效或口服皮质类固醇来治疗的基础疾病的急性恶化情况。
·具有特发性肺纤维化、机化性肺炎(例如,闭塞性细支气管炎)、药源性肺部炎症、特发性肺部炎症的病史,或在胸部CT扫描中发现存在活动性肺部炎症的证据
·允许有辐射场中的放射性肺炎(纤维化)病史。
·阳性HIV测试
所有患者必须进行HIV测试;排除HIV测试呈阳性的患者。
·患有活动性乙型肝炎(慢性或急性;定义为筛选时乙型肝炎表面抗原[HBsAg]测试呈阳性)或丙型肝炎的患者
·具有既往乙型肝炎病毒(HBV)感染或消退的HBV感染(定义为存在乙型肝炎核心抗体[HBc Ab]但不存在HBsAg)的患者符合条件。在随机分组前必须对这些患者进行HBVDNA测试。
·丙型肝炎病毒(HCV)抗体呈阳性的患者仅在HCV RNA的聚合酶链反应结果呈阴性时才符合条件。
·活动性肺结核
·在随机分组前4周内发生过严重感染,包括但不限于,因感染、菌血症或严重肺炎的并发症而住院
·显著的心血管疾病,诸如纽约心脏协会心脏病(II级或更高级别)、在随机分组前3个月内发生过心肌梗塞或脑血管意外、不稳定心律失常或不稳定心绞痛
·患有已知冠状动脉疾病、不符合上述标准的充血性心力衰竭或左心室射血分数<50%的患者必须正在接受治疗医师认为是最优的稳定的医学方案,若适用,咨询心脏病专家。
·在随机分组前28天内进行过除用于诊断外的大手术或预计在研究进程期间需要进行大手术
·既往同种异体骨髓移植或实体器官移植
·任何其他疾病、新陈代谢功能障碍、体格检查发现或临床实验室发现,根据这些发现合理怀疑存在症禁忌使用研究药物或可能影响对结果的解释或可能使患者处于治疗并发症的高风险中的疾病或病症
·患有干扰其理解、遵循和/或依从研究过程的能力的疾病或病症的患者与用药相关的排除标准
·在研究治疗启动前3周内用任何获批的抗癌疗法(包括激素疗法)进行治疗
·在随机分组前28天内用具有治疗意图的任何其他研究药剂进行治疗
·在随机分组前2周内接受治疗性口服或IV抗生素
·接受预防性抗生素(例如,用于预防尿路感染或用于预防慢性阻塞性肺疾病恶化)的患者符合条件。
·在随机分组前4周内接种减毒活疫苗或预期在研究期间需要接种此类减毒活疫苗
·用CD137激动剂或免疫检查点阻断疗法、抗PD–1和抗PD–L1治疗性抗体进行既往治疗
·已经进行既往抗细胞毒性T淋巴细胞–相关抗原4(CTLA–4)治疗的患者可入组,前提是符合以下要求:
在随机分组前至少6周进行抗CTLA–4的最后一次给药
没有来自抗CTLA–4的严重免疫相关不良效应史(3或4级CTCAE)·在随机分组前4周内或五个药物半衰期(以较长者为准)内,用全身性免疫刺激剂(包括但不限于干扰素或白介素-2)进行治疗
·用癌症疫苗进行既往治疗是允许的。
·在随机分组前2周内用全身性皮质类固醇或其他全身性免疫抑制用药(包括但不限于,皮质类固醇、环磷酰胺、硫唑嘌呤、甲氨蝶呤、沙利度胺和抗–肿瘤坏死因子[抗TNF]剂)进行治疗
曾接受急性、低剂量(≤10mg口服泼尼松或等同物)的全身免疫抑制剂的患者可以被纳入到研究中。允许对慢性阻塞性肺疾病使用皮质类固醇(≤10mg口服泼尼松或等同物),对体位性低血压患者使用盐皮质激素(例如氟氢可的松),以及对肾上腺皮质功能不全使用小剂量补充皮质类固醇。
与化疗相关的排除标准
·对顺铂、卡铂或其他含铂化合物的变应反应史
·听力受损的患者(顺铂)
·如根据NCI CTCAE v4.0标准定义的≥2级周围神经病(顺铂)
·CrCl<60mL/min(顺铂)
·已知对吉西他滨的超敏性
·在吉西他滨启动前7天内的放疗史
治疗分配方法和盲法
这是一项开放标签研究。在已经获得书面知情同意书并且已经建立适格性(包括通过中心测试来确定肿瘤PD-L1状态)后,研究站点的人员在基于交互语音或Web的响应系统(IxRS)中输入人口统计学和基线特征。对于符合入组条件的患者,研究站点从IxRS获得患者的随机分组编号和治疗分配。随机分组到两个治疗臂中的一者以1:1的比率发生。应用区组随机分组以确保对每一个治疗臂的平衡分配。随机分组按以下标准分层:
·性别(男性与女性)
·ECOG体能状态为(0与1)
·组织学(非鳞状与鳞状)
·肿瘤组织PD-L1表达,按IHC分层(TC1/2/3和任何IC与TC0和IC1/2/3)
如果可以,患者在随机分组当天接受研究治疗的第一次给药。如果不可以,则在随机分组后的5天内进行第一次给药。
研究治疗
患有非鳞状疾病的患者接受单独的阿特珠单抗或者接受与顺铂或卡铂组合的培美曲塞。患有鳞状疾病的患者接受单独的阿特珠单抗或者接受与顺铂或卡铂组合的吉西他滨。
制剂、包装和处理
阿特珠单抗
阿特珠单抗(MPDL3280A)药物产品以无菌液体形式提供在一次性使用的20-mL玻璃小瓶中。该小瓶设计为可递送20mL(1200mg)的阿特珠单抗溶液,但可能包含的体积超过规定的体积,从而可以递送全部20mL的体积。
顺铂、卡铂、培美曲塞和吉西他滨
顺铂、卡铂、培美曲塞和吉西他滨以商业上可获得的制剂使用。对于关于顺铂、卡铂、培美曲塞和吉西他滨的制剂、包装和处置的信息,参见关于每一种药物的当地处方信息。
阿特珠单抗施用
被随机分组待使用阿特珠单抗治疗的患者在受监测的环境中接受通过IV输液q21d施用的1200mg阿特珠单抗,在该环境中,可立即得到训练有素的人员和充分的设备/以来来管理潜在的危重反应。根据表3中概述的说明施用阿特珠单抗输液。
表3.阿特珠单抗的首次和后续输液的施用
Figure BDA0004012333940002331
培美曲塞与顺铂或卡铂组合(仅对于患有非鳞状NSCLC的患者)
每一个研究站点施用与铂类化疗(顺铂或卡铂)组合的培美曲塞(非鳞状NSCLC),持续四个或六个周期。化疗诱导周期的预期数量(四个或六个周期)由研究人员在随机分组前指定。选定的铂化疗剂在所有周期内保持(例如,以培美曲塞加顺铂方案开始的患者应保持这一组合而不切换至培美曲塞加卡铂,反之亦然)。然而,对于使用该选定的铂化疗而经历不可接受的毒性的患者,可以在与医学监察员讨论并由医学监察员批准后已考虑进行切换。
患者接受针对培美曲塞的类固醇、叶酸和维生素B12预用药。类固醇的选择和预用药的时机可以根据当地护理标准和处方信息来施用(参见表4)。在所有患者中,由研究人员酌情决定,可以在随机分组前开始补充叶酸以符合预期用于基于培美曲塞的治疗的当地标准;而在分配至阿特珠单抗臂的患者中,在随机分组后停止补充叶酸。此外,根据当地的护理标准和处方信息,患者应接受止吐药和IV水化以进行铂类治疗。
表4列出了针对培美曲塞加铂类化疗的建议预用药,且表5列出了针对培美曲塞加玻璃肋化疗的所用剂量和建议输液时间。化疗输液时间可根据当地护理标准进行调整。
表4.针对培美曲塞加铂类化疗的预用药
Figure BDA0004012333940002341
IM=肌肉内;PO=口服;q9w=每9周。
注:根据当地实践施用预防性止吐药。
表5.培美曲塞加铂类化疗的治疗方案
Figure BDA0004012333940002342
Figure BDA0004012333940002351
在每一个21天周期的第1天,通过IV输液以500mg/m2的剂量施用培美曲塞,之后在培美曲塞施用完成后大约30分钟施用卡铂或顺铂。在完成(四个或六个周期)诱导治疗后未经历根据RECIST v1.1的疾病进展的患者,将继续使用在每一个21天周期的第1天给予的培美曲塞进行维持治疗,直至出现根据RECIST v1.1的疾病进展。所有符合培美曲塞疗法条件的患者,应避免在培美曲塞施用前至少2天(如果非甾体抗炎药(NSAID)的消除半衰期较短)、在培美曲塞施用前至少5天(如果NSAID的消除半衰期较长)、在培美曲塞施用当天以及在培美曲塞施用后至少2天服用NSAID。
吉西他滨与顺铂或卡铂组合(仅对于患有鳞状NSCLC的患者)
每一个研究站点施用与铂类化疗(顺铂或卡铂)组合的吉西他滨(鳞状NSCLC),持续四个或六个周期。化疗诱导周期的预期数量(四个或六个周期)由研究人员在随机分组前指定。选定的铂化疗剂在所有周期内保持(例如,以吉西他滨加顺铂方案开始的患者应保持这一组合而不切换至吉西他滨加卡铂,反之亦然)。然而,对于使用该选定的铂化疗而经历不可接受的毒性的患者,可以在与医学监察员讨论并由医学监察员批准后考虑进行切换。
根据当地的护理标准和处方信息,患者接受止吐药疗法和IV水化以进行铂类治疗。表6列出了针对吉西他滨加铂类治疗的所用剂量和建议输液时间。化疗输液时间可根据当地护理标准进行调整。
表6.吉西他滨加铂类化疗的治疗方案
Figure BDA0004012333940002352
在每一个21天周期的第1和8天通过IV输液以1250mg/m2(与顺铂组合)或1000mg/m2(与卡铂组合)的剂量历经30分钟施用吉西他滨,之后仅在第1天在吉西他滨输液完成后大约30分钟施用顺铂或卡铂。吉西他滨注射必须在输液前稀释。用于重构吉西他滨的推荐稀释剂为不含防腐剂的0.9%氯化钠注射液。根据当地实践和处方信息进行吉西他滨施用;站点遵循它们的用于为肥胖患者确定吉西他滨剂量以及用于在患者体重变化时进行剂量调整的机构护理标准。
顺铂施用
按照上述表格,顺铂在完成培美曲塞或吉西他滨输液后大约30分钟历经1–2小时以75mg/m2的剂量通过IV输液施用。患者在接受顺铂之前和/或之后接受充分的止吐治疗和适当的水化。
卡铂施用
在培美曲塞或吉西他滨输液完成后,卡铂通过IV输液以AUC 6的剂量(当与培美曲塞组合给予时)或以AUC 5的剂量(当与吉西他滨组合给予时)与根据当地实践指南的标准止吐药一起施用。
施用Calvert公式计算卡铂剂量(Calvert等人1989):Calvert公式
总剂量(mg)=(目标AUC)×(肾小球滤过率[GFR]+25)
Calvert公式中用于计算基于AUC的给药的GFR应不超过125mL/min。
出于本方案的目的,GFR视为等同于CrCl。
根据机构指南或Cockcroft和Gault(1976)中描述的方法,使用以下公式来计算CrCl:
CrCl=(140–年龄)(wt)]/[72×Scr](x 0.85,如果是女性)
其中:CrCl=以mL/min为单位的肌酐清除率
年龄=以岁为单位的患者年龄
wt=以kg为单位的患者体重
Scr=以mg/dL为单位的血清肌酐
对于血清肌酐水平异常低的患者,使用最小肌酐水平0.8mg/dL来估计GFR或将估计的GFR封顶为125mL/min。
如果通过同位素稀释质谱法基于血清肌酐测量值估计患者的GFR,美国食品药品监督管理局(FDA)建议医生考虑限制卡铂的剂量以达到所期望的暴露(AUC),从而避免由过量服用引起的潜在毒性。根据卡铂标签中描述的Calvert公式,最大剂量可计算如下:
卡铂最大剂量(mg)=目标AUC(mg·min/mL)×(GFR+25mL/min)
对于肾功能正常的患者,最大剂量基于GFR估计值,该估计值封顶为125mL/min。不应使用更高的估计的GFR值。
对于目标AUC=6,最大剂量为6×150=900mg。
对于目标AUC=5,最大剂量为5×150=750mg。
对于目标AUC=4,最大剂量为4×150=600mg。
伴随疗法
伴随疗法包括患者使用除方案–指定的研究治疗外的任何用药(例如,处方药、非处方药、草药或顺势疗法药物、营养补充剂),从筛选前7天直至治疗终止访视。所有此类用药应报告给研究人员。
允许的疗法
允许患者在研究期间应继续以下疗法:
·口服避孕药
·激素替代疗法
·预防性或治疗性抗凝治疗(诸如低–分子量肝素或稳定剂量水平的华法林)
·姑息放疗(例如,对已知骨转移的治疗或疼痛的症状缓解),前提是它不干扰对肿瘤靶病灶的评定(例如,待照射的病灶不是唯一的疾病部位,因为这会使得无法根据RECIST v1.1通过肿瘤评定来评定患者的应答)。姑息放疗过程中不需保留阿特珠单抗。
·灭活流感疫苗接种
·甲地孕酮作为食欲刺激剂
·皮质类固醇(≤10mg口服泼尼松或等效物)用于慢性阻塞性肺病
·盐皮质激素(例如,氟氢可的松)
·低剂量皮质类固醇用于患有体位性低血压或肾上腺皮质功能不全的患者
一般而言,根据当地的标准,研究者根据临床指征使用支持性疗法来管理患者的护理。经历输液相关症状的患者可以根据标准实践(对于美国以外的站点,可按照当地实践来替代等效用药)用对乙酰氨基酚、布洛芬、苯海拉明和/或法莫替丁或另一种H2受体拮抗剂进行对症治疗。表现为呼吸困难、低血压、喘息、支气管痉挛、心动过速、血氧饱和度降低或呼吸窘迫的危重输液相关事件应根据临床指征使用支持性疗法来管理。
对接受阿特珠单抗治疗的患者的预防性治疗
全身性皮质类固醇和TNF-α抑制剂可能会减弱用阿特珠单抗治疗的潜在有益免疫效应。因此,在常规施用全身性皮质类固醇或TNF-α抑制剂的情况下,主治医师首先考虑了包括抗组胺药在内的替代药物。如果替代药物不可行,则应由主治医师酌情给予全身性皮质类固醇和TNF-α抑制剂,对增强CT扫描禁忌的患者(即造影剂过敏或肾清除率受损的患者)除外。
建议使用全身性皮质类固醇激素,并由主治医师慎重考虑,以治疗与阿特珠单抗疗法相关的特定不良事件。
禁止疗法
在开始研究治疗之前的各个时间段(取决于抗癌药),以及在研究治疗期间直至记录到疾病进展且患者已终止研究治疗,禁止任何意图治疗癌症的伴随疗法(无论是经过卫生当局–批准的还是实验性的)。这包括但不限于化疗、激素疗法、免疫疗法、放疗、未批准的实验药物或草药疗法(除非另有说明)。
除非另有说明,否则患者在研究期间禁止使用以下药物:
·地诺单抗;入组前接受地诺单抗的患者在研究中必须有意愿并且符合接受双膦酸盐的条件。
·任何减毒活疫苗(例如,
Figure BDA0004012333940002381
),在随机分组之前4周内、在治疗期间或在最后一次阿特珠单抗剂量后5个月内(对于随机分组到阿特珠单抗的患者)。
·使用类固醇进行对增强CT扫描禁忌的患者(即具有造影剂过敏或肾清除率受损的患者)的预用药;在此类患者中,进行了胸部的非增强CT以及腹部和骨盆的非增强CT扫描或MRI扫描。
不建议同时使用草药疗法,因为它们的药代动力学、安全性和潜在的药-药相互作用通常是未知的。但是,只要没有与任何研究治疗药物发生已知相互作用,研究人员可酌情决定将其用于本研究中的患者。如上所述,禁止意图用于癌症治疗的草药疗法。
肿瘤组织样品
中央实验室协调组织样品的采集,以便在中央实验室或发起人处进行研究相关测试。提供使用说明手册和供给试剂盒以进行所有中心实验室评定。
用于筛查的存档和新鲜采集的肿瘤组织样品
提交处于石蜡块(优选)中的代表性肿瘤标本或15张(或更多)新鲜切割的连续未染色切片(在载玻片上)和相关病理学报告以用于确定PD-L1状态,从而确保患者在随机分组前符合适格性标准。如果在基线时少于15张(但不少于10张)载玻片可用,则患者在与医学监察员讨论后仍有可能符合条件。此外,评定了由SP263 IHC测定来定义的PD-L1表达。也可能已经评定了探索性生物标志物(包括但不限于,PD-L1、PD-1、突变负荷和其他与免疫或NSCLC生物学相关的生物标志物,诸如通过NGS在提取的DNA和/或RNA上鉴别的T细胞标志物或非遗传性生物标志物)。对于患有非鳞状NSCLC的患者,如果EGFR和/或ALK状态已知,则可能已经在当地或在中心实验室评定。需要其他组织来对EGFR和/或ALK进行中心测试。
基于总的和存活的肿瘤含量,肿瘤组织应具有良好质量(如果所提交的标本的质量不足以确定PD-L1状态,应告知站点)。
如果可行,应已经提交了存档的肿瘤标本。如果存档的标本不可行,则患者仍可能符合条件,前提是该患者有意愿同意并且进行肿瘤的治疗前活检或切除。
对于新鲜采集的活检标本,可接受的样品包括下文概述的那些,前提是存在保留细胞背景和组织架构的最少50个活肿瘤细胞,无论针号或提取方法如何:
·对于深肿瘤组织的芯针活检样品采集;应提交包埋在单个石蜡块中的至少三个芯以进行评定
·用于皮肤、皮下或粘膜病灶的切除、切口、穿刺或钳夹活检样品采集
·肿瘤组织切除术
细针抽吸(定义为不保留组织架构并产生细胞悬液和/或细胞涂片的样品)、刷洗、来自胸腔积液的细胞沉淀和灌洗样品是不可接受的。
已脱钙的来自骨转移灶的肿瘤组织是不可接受的。
对于存档样品,按要求或在研究数据库最终关闭后18个月(以先发生者位准),将所有入组患者的剩余肿瘤组织块返回站点。在适格性确定后不晚于6周,将来自被视为不符合入组研究条件的患者的组织样品返回站点。
在出现影像学进展时的肿瘤样品
除非临床上不可行,否则所有治疗臂中的患者均在出现影像学进展时(在影像学进展的40天内或在下一抗癌治疗开始之前,以先发生者位准)进行强制性肿瘤活检以获得肿瘤样品。
可接受的样品包括下文概述的那些:
·对于深肿瘤组织的芯针活检样品采集;应提交包埋在单个石蜡块中的至少三个芯以进行评定
·切除、切口、穿刺或钳夹活检
·肿瘤组织切除术
可能已经评定了肿瘤组织样品中与免疫相关的、与肿瘤类型–相关的和其他探索性生物标志物(包括但不限于,通过NGS在提取的DNA和/或RNA上鉴别的T细胞生物标志物和非遗传性生物标志物)。NGS可能已经由Foundation Medicine进行。如果由FoundationMedicine进行,则研究人员可能已经从在疾病进展时采集的样品中获得了NGS报告形式的结果,该结果可直接从Foundation Medicine索取而得。研究人员可能已经与患者分享并讨论了该结果,除非患者选择不要。Foundation Medicine NGS测定尚未被FDA许可或批准;来自这些研究性测试的结果不用来指导未来的治疗决定。
在其他时间点的肿瘤样品
如果患者在研究进程期间的任何时间进行具有获得肿瘤组织的可能性的医学上指示的手术(例如,支气管镜检查、食管胃十二指肠镜检查、结肠镜检查),则可以获得任何剩余样品或对于医学诊断而言非必需的样品部分(剩下的肿瘤组织)以用于探索性分析。
具有来自在他们参与研究进程期间(治疗期间和存活随访期间)的不同时间进行的手术的额外组织样品的已签署RCR任选同意书的患者被要求也提交这些任选存在的新鲜活检样品进行中心测试。在临床事件(例如,临床应答)时采集的肿瘤组织样品是优选的。在多个时间从个体患者获得的样品有助于改善对PD-L1表达的动力学以及与介入性抗癌疗法的关系的理解。
抗治疗性抗体测试
使用阿特珠单抗的治疗可能引起免疫应答。密切监测具有对阿特珠单抗的任何潜在免疫应答的患者。在用阿特珠单抗进行治疗之前、期间和之后的多个时间点,采用经验证的筛选和证实性测定来检测ATA。在临床开发计划的支持下,免疫原性评定将会利用基于风险的免疫原性策略(Rosenberg and Worobec 2004;Koren等人2008)来表征对阿特珠单抗的ATA应答。该阶梯式策略包括评定所检测的ATA应答是否与相关临床终点关联。ATA表征测定的实施取决于安全性概况和临床免疫原性数据。
评定的时机
在第1周期第1天前28天内进行筛选测试和评定。可能已经使用了在获得知情同意书之前并且在第1周期第1天前28天内进行的标准护理测试或检查的结果;此类测试不需要重复进行以供筛选。
治疗期间的评定
除非另有说明,否则所有治疗访视均在计划内的日期后±3天内进行。除非指定时间窗口,否则所有评定均在指定访视当天进行。除非另有说明,否则计划在每一个周期的研究治疗施用当天(第1天)进行的评定在研究治疗输液之前进行。
如果由于节假日、周末或其他事件而无法进行计划的给药和研究评定,则给药可以延后至最早的下一日期,后续给药和访视继续以21天计划进行。如果治疗延后不到3天,患者可以已经恢复原计划。
在完成四个或六个周期的与铂剂组合的培美曲塞或吉西他滨后(对于对照臂中的患者)或在五个周期后(对于阿特珠单抗臂中的患者),三个周期中的一个可能已经延迟了1周(一个周期为28天而非21天)以允许休假/节假日。在延迟之后,下一周期从前一次剂量施用后21天开始递送。不允许两个连续的28天周期。
在第1周期第1天后的48周的每6周(±7天)进行肿瘤评定,在48周的肿瘤评定完成后,然后每9周(±7天)进行肿瘤评定,无论治疗延迟如何,直至根据RECIST v1.1的放射影像学进展(或对于已在根据RECIST v1.1的放射影像学疾病进展之后继续用阿特珠单抗进行治疗的经阿特珠单抗治疗的患者而言,临床益处丧失)、撤回同意、死亡或由发起人终结研究(以先发生者为准)。因除根据v1.1的放射影像学疾病进展(例如毒性、症状恶化)以外的原因终止治疗的患者,继续进行计划的肿瘤评定,直到根据RECIST v1.1的放射学疾病进展(或对于已在根据RECIST v1.1的放射影像学疾病进展之后继续阿特珠单抗治疗的经阿特珠单抗治疗的患者而言,临床益处丧失)、撤回同意、死亡或由发起人终结研究(以先发生者为准)。在不存在根据RECIST v1.1的影像学疾病进展的情况下,无论患者是否开始新的抗癌疗法,都继续进行肿瘤评定估。
可以在每一个周期的第1天前≤96小时进行以下评定:
·ECOG体能状态
·有限的身体检查
·当地实验室测试
对于第1周期第1天,不需要重复进行在第1周期第1天前≤96小时进行的筛选评定。在第8天进行吉西他滨输液前,必须也进行当地血液学测试。
在治疗终止访视时的评定
终止研究治疗的患者在研究治疗的最后一次给药后30天内返回门诊进行研究治疗终止访视。应答评定显示根据RECIST v1.1的影像学疾病进展(或对于已在根据RECISTv1.1的影像学疾病进展后继续用阿特珠单抗进行治疗的经阿特珠单抗治疗的患者,临床益处丧失)时的访视用作治疗终止访视。
根据随访访视计划来跟踪终止研究治疗的患者的进展和/或存活,直至死亡、随访失联或撤回同意,这些都定义为研究终止。
安全性的评定
安全性计划
采取措施以确保参与该研究的患者的安全性,包括使用严格的纳入和排除标准以及密切监测(如下文所示)。
阿特珠单抗的施用在受监测的环境中进行,在该环境中,可以立即接触到训练有素的人员以及足够的设备/药物来管理潜在的危重反应。在研究期间并且最长持续至在研究治疗的最后一次给药后90天或在研究治疗的最后一次给药后启动新的全身抗癌治疗(以先发生者为准),记录所有危重不良事件和特别关注的不良事件。在研究期间并且最长持续至在研究治疗的最后一次给药后30天或在研究治疗的最后一次给药后启动新的全身抗癌治疗(以先发生者为准),记录所有其他不良事件。
在不良时间报告期后,继续记录所有死亡。此外,如果研究人员意识到据信与之前暴露于研究治疗有关的任何危重不良事件或特别关注的不良事件,则通知发起人。
剂量调整
关于剂量调整的一般注意事项
剂量调整或延迟的原因、所采取的支持性所示和结果记录人在患者图表中并且记录在eCRF上。根据NCI CTCAE v4.0分级系统对不良事件的严重程度进行分级。
·对对于任何在基线时已经明显的任何伴随条件,如果研究人员认为适当,则根据毒性级别的相应偏移来应用剂量调整。例如,如果患者在基线时有1级虚弱并且在研究治疗期间增加至2级,这视为一个级别的偏移并且出于剂量调整目的而作为1级毒性进行治疗。
·当在同一时间发生不同严重程度级别的几种毒性时,根据观察到的最高级别进行剂量调整。
·在研究人员看来,如果毒性被视为仅由化疗的一种组分所致,则其他化疗组分的剂量不需要调整,并且如果没有禁忌症,则施用其他化疗组分。
·允许研究人员依据毒性的严重程度和对患者的风险与效应的评定而使用自由裁量权来修改或加速下述剂量调整指南,目的是使患者依从性最大化并且可进行支持性治疗。
特定不良事件的阿特珠单抗剂量调整、治疗延迟或治疗终止和管理
本研究中没有针对阿特珠单抗的剂量减少。如果患者经历需要待停药的不良事件,则患者可能在最后一次给药后暂时停止使用阿特珠单抗进行治疗长达105天。如果阿特珠单抗因为不良事件而在最后一次给药后停药>105天,则该患者终止阿特珠单抗治疗并跟踪其安全性和功效。例外情况需要医学监察员批准。
如果患者逐渐减少用于治疗不良事件的类固醇,则阿特珠单抗可能已经从最后一次给药开始停用了>105天的额外时间,直至类固醇终止或降低至泼尼松剂量(或等效剂量)≤10mg/天。可接受的中断长度取决于研究人员与医学监察员之间的共识。
在医学观察员批准下,允许因除毒性之外的原因诸如手术程序造成的剂量中断。可接受的中断长度取决于研究人员与医学监察员之间的共识。
特定不良事件的培美曲塞剂量调整、治疗延迟或治疗终止和管理
剂量调整指南可应用于作为单剂或与顺铂或卡铂组合的培美曲塞。如果患者在两次剂量降低后经历任何血液学或非血液学3或4级毒性,或如果治疗由于毒性而被延迟超过63天,则终止使用培美曲塞的治疗。
在每一个周期开始时,ANC必须已经≥1500/μL且血小板计数必须已经≥100,000/μL。治疗最多延迟63天,以便有足够的时间恢复。可能已经根据美国临床肿瘤学会(ASCO)和美国国家综合癌症网络(NCCN)指南使用了生长因子(Smith等人2006)。恢复后,在后续周期开始时根据先前周期的最低(最低点)血小板和中性粒细胞值调整剂量(参见表7)。在需要因ANC和血小板两者而调整剂量的事件中,患者接受较低的剂量。
表7.针对血液学毒性的培美曲塞剂量调整
毒性 培美曲塞剂量
ANC<500/μL且血小板≥50,000/μL 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,无论ANC如何 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,伴有≥2出血,无论ANC如何 前一个剂量的50%
在每一个周期开始时,CrCl必须已经≥45mL/min。对于入组和给药决定,CrCl使用原始的、基于体重的Cockcroft和Gault公式(1976)来评定或使用适当的放射标记方法(51-CrEDTA或Tc99m-DTPA)来测量,以确定GFR。在基线时使用的CrCl评定方法在整个研究中使用。
如果患者发展出非血液学毒性(参见表8),则培美曲塞停药最长63天,直至消退至等于或小于患者基线(或如果患者在基线时没有该毒性,≤1级)。应根据表8中的指南恢复治疗。对于3或4级神经毒性,培美曲塞应在改善时恢复为前一个剂量的50%或立即停药(基于研究人员的临床判断)。
表8.针对非血液学毒性的培美曲塞剂量调整
Figure BDA0004012333940002451
特定不良事件的吉西他滨剂量调整、治疗延迟或治疗终止和管理
吉西他滨的剂量调整指南提供如下。如果患者在两次剂量减少后经历任何血液学或非血液学3或4级毒性或如果治疗由于毒性而被延迟超过63天,则终止使用吉西他滨的治疗。
针对血液学毒性的吉西他滨剂量调整是基于在治疗的第1天和第8天取得的粒细胞和血小板计数(表9和表10)。在每一次给药前监测接受吉西他滨的患者的全血计数,包括分类计数和血小板计数。治疗最多延迟63天,以便有足够的时间恢复。可根据美国临床肿瘤学会(ASCO)和美国国家综合癌症网络(NCCN)指南使用生长因子(Smith等人2006)。恢复后,在后续周期开始时根据先前周期的最低(最低点)血小板和中性粒细胞值调整剂量。
如果需要因ANC和血小板两者而调整剂量,患者将接受较低的剂量。
表9.针对在第1天的血液学毒性的吉西他滨剂量调整或治疗延迟
Figure BDA0004012333940002452
表10.针对在第8天的血液学毒性的吉西他滨剂量调整或治疗延迟
Figure BDA0004012333940002461
研究人员对骨髓抑制、感染或发热性中性粒细胞减少症的早期和明显迹象保持警惕和警觉,以便及时并适当地管理这些并发症。让患者意识到这些体征,并鼓励他们尽早就医。
如果化疗由于血液学毒性而停药,则每周获得全血细胞计数(包括分类WBC),直到计数达到所述治疗的下限。然后恢复治疗。
对于贫血,不推荐剂量降低。按照治疗医师的机构指南来对患者进行支持。
特定不良事件的顺铂剂量调整、治疗延迟或治疗终止和管理
顺铂的剂量调整指南提供如下。
如果患者在两次剂量减少后经历任何血液学或非血液学3或4级毒性或如果治疗由于毒性而被延迟超过63天,则终止使用顺铂的治疗。
在每一个周期开始时,ANC必须已经≥1500/μL且血小板计数必须已经≥100,000/μL。治疗最多延迟63天,以便有足够的时间恢复。可根据美国临床肿瘤学会(ASCO)和美国国家综合癌症网络(NCCN)指南使用生长因子(Smith等人2006;NCCN 2014)。恢复后,在后续周期开始时根据先前周期的最低血小板和中性粒细胞值调整剂量(参见表11)。
如果需要因ANC和血小板两者而调整剂量,患者将接受较低的剂量。
表11.针对血液学毒性的顺铂剂量调整
毒性 顺铂剂量
ANC<500/μL且血小板≥50,000/μL 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,无论ANC如何 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,伴有≥2出血,无论ANC如何 前一个剂量的50%
ANC<1000/μL将≥38.5℃的发烧 前一个剂量的75%
研究人员对骨髓抑制、感染或发热性中性粒细胞减少症的早期和明显迹象保持警惕和警觉,以便及时并适当地管理这些并发症。让患者意识到这些体征,并鼓励他们尽早就医。
如果化疗由于血液学毒性而停药,则每周获得全血细胞计数(包括分类WBC),直到计数达到所述治疗的下限。然后恢复治疗。对于贫血,不推荐剂量降低。按照机构指南对患者进行支持。
如果患者发展出非血液学毒性(参见表12),则顺铂停药最长63天,直至消退至小于或等于患者基线(或如果患者在基线时没有该毒性,≤1级)。根据表12中的指南恢复治疗。用充分的抗腹泻用药来控制腹泻。用充分的止吐药来控制恶心和/或呕吐。
表12.针对非血液学毒性(不包括神经毒性)的顺铂剂量调整
Figure BDA0004012333940002471
在顺铂的任何周期开始前,CrCl必须已经≥60mL/min。如果在周期之间存在CrCl的减少,但在下一周期时CrCl仍为≥60mL/min,则研究人员使用关于继续施用顺铂、剂量降低或延迟该周期的临床判断。如果患者的CrCl值在最后一次施用顺铂后63天内未恢复为≥60mL/min,则患者终止顺铂治疗。
在神经毒性的事件中,针对顺铂的推荐剂量调整记录在表13中。对于3或4级神经毒性,顺铂在改善时恢复为前一个剂量的50%或立即停药(基于研究人员的临床判断)。
表13.针对相关神经毒性的顺铂剂量调整或治疗终止
毒性 顺铂剂量
1级神经毒性 前一个剂量的100%
2级神经毒性 前一个剂量的75%
3级或4级神经毒性 前一个剂量的50%或永久停药
特定不良事件的卡铂剂量调整、治疗延迟或治疗终止和管理
卡铂的剂量调整指南提供如下。
如果患者在两次剂量减少后经历任何血液学或非血液学3级或4级毒性或如果治疗由于毒性而被延迟超过63天,则终止使用卡铂的治疗。
在每一个周期开始时,ANC必须已经≥1500/μL且血小板计数必须已经≥100,000/μL。治疗最多延迟63天,以便有足够的时间恢复。根据美国临床肿瘤学会(ASCO)和NCCN指南(Smith等人2006;NCCN 2012)使用生长因子。恢复后,在后续周期开始时根据先前周期的最低血小板和中性粒细胞值调整剂量(参见表14)。
如果需要因ANC和血小板两者而调整剂量,患者将接受较低的剂量。
表14.针对血液学毒性的卡铂剂量调整
毒性 顺铂剂量
ANC<500/μL且血小板≥50,000/μL 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,无论ANC如何 前一个剂量的75%
血小板<50,000/μL,伴有≥2级出血,无论ANC如何 前一个剂量的50%
ANC<1000/μL加≥38.5℃的发烧 前一个剂量的75%
研究人员对骨髓抑制、感染或发热性中性粒细胞减少症的早期和明显迹象保持警惕和警觉,以便及时并适当地管理这些并发症。让患者意识到这些体征,并鼓励他们尽早就医。
如果化疗由于血液学毒性而停药,则每周获得全血细胞计数(包括分类WBC),直到计数达到所述治疗的下限。然后可恢复治疗。
对于贫血,不推荐剂量降低。根据治疗医师的机构指南为患者提供支持。
对于非血液学毒性(参见表15),治疗最多延迟63天,直到消退至小于或等于患者的基线值(或如果患者在基线时没有该毒性,≤1级)。在下一周期开始时的剂量减少根据前一周期中给药剂量的非血液学毒性进行。表15提供针对非血液学毒性的剂量调整。
表15.针对非血液学毒性的卡铂剂量调整或治疗终止
Figure BDA0004012333940002481
AUC=浓度曲线下面积。
a:如果研究人员认为合适,将卡铂剂量调整至先前AUC的指定百分比。
b:服用足够的抗腹泻药物后发生的3级或4级腹泻或需要住院治疗的任何级别的腹泻。
c:尽管使用了止吐药。
用充分的抗腹泻用药来控制腹泻。应使用充分的止吐药来控制恶心和/或呕吐。对于3或4级神经毒性,卡铂在改善时恢复为前一个剂量的50%或立即停药(基于研究人员的临床判断)。
不良事件
根据ICH的良好临床实践指南,不良事件是指在临床研究受试者中使用药品时发生的任何不良医学事件,无论其因果关系如何。因此,不良事件可以是以下任何一种:
·与使用药品暂时相关的任何不利和非预期的体征(包括异常的实验室检查结果)、症状或疾病,无论是否被认为与该药品有关
·任何新疾病或现有疾病的恶化(已知疾病的特征、频率或严重程度恶化)
·基线时不存在的间歇性医疗状况(例如,头痛)的复发
·与症状相关的实验室值或其他临床测试(例如,ECG、X射线)的任何恶化或导致研究治疗或伴随治疗改变或研究药物终止
·与方案强制性干预有关的不良事件,包括在分配前发生的那些
危重不良事件(立即可报告给发起人)
危重不良事件是满足以下任何标准的任何不良事件:
·是致命的(即,不良事件实际上引起或导致死亡)
·是危及生命的(即,在研究人员看来,不良事件使患者面临直接的死亡风险)。这不包括任何如果以更严重的形式发生或被允许继续就可能会导致死亡的不良事件。
·需要或延长住院时间
·导致持续或显著的残疾/能力丧失(即,不良事件导致患者进行正常生活功能的能力受到实质性破坏)
·是暴露于研究药物的母亲所生的新生儿/婴儿的先天性异常/出生缺陷
·是研究人员判断的显著医疗事件(例如,可能危及患者或可能需要医学/手术干预以防止上述结果之一)
术语“严重”和“危重”不是同义词。严重程度是指不良事件的强度(例如,分级为轻度、中度或重度,或根据NCI CTCAE;事件本身可能具有相对较小的医学意义(诸如没有任何进一步发现的严重头痛))。
对于记录在eCRF上的每一起不良事件,需要独立地评定严重程度和危重性。
危重不良事件需要由研究人员立即(即,在获知该事件后不超过24小时)报告给发起人。
特别关注的不良事件(立即可报告给发起人)
特别关注的不良事件需要由研究人员立即(即,在获知该事件后不超过24小时)报告给发起人。本研究特别关注的不良事件包括以下:
·以下经证实的由治疗导致的自身免疫病症:
肺炎
缺氧或呼吸困难,≥3级
结肠炎
内分泌病:糖尿病、胰腺炎或肾上腺机能不全
血管炎
肝炎
转氨酶升高:级别≥2(AST或ALT>3×ULN且胆红素>2×ULN)或
AST/ALT>10×ULN
全身性红斑狼疮
Guillain-Barré综合征
皮肤反应:白癜风、类天疱疮
·提示超敏性、细胞因子释放、流感样疾病、全身炎症性应答系统或输液反应综合征的事件
·潜在的药物诱导的肝损伤病例,包括ALT或AST升高结合胆红素升高或临床黄疸(如海氏定律(Hy's Law)所定义)
·怀疑通过研究药物进行的传染性病原体传播,如下定义:
任何致病或非致病的生物体、病毒或感染性颗粒(例如,朊蛋白传播可传播的海绵状脑病)都视为感染源。可能根据临床症状或实验室检查结果怀疑传染源的传播,这些症状和检查结果指示暴露于药品的患者发生感染。该术语仅适用于怀疑研究药物受到污染的情况。
结果
人口统计
下表16至20总结在该研究中分析的患者的人口统计学分布。如下表16至20中及整个本实例中所用,术语“TC3”表示在治疗前从受试者分离的肿瘤样品中50%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者;术语“IC3”表示在占肿瘤样品10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者;且术语“WT”表示不具有EGFR或ALK基因组肿瘤畸变的患者。此外,术语“TC2/3”表示在治疗前从受试者分离的肿瘤样品中5%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者;术语“IC2/3”表示在占肿瘤样品5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者。术语“TC1/2/3”表示在治疗前从受试者分离的肿瘤样品中1%或更多的肿瘤细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者;术语“IC1/2/3”表示在占肿瘤样品1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中具有可检测的PD-L1表达水平的患者。PD-L1表达谱在纳入该研究中的患者中的分布显示在图4中。
表16.肿瘤浸润免疫细胞(IC)IHC诊断标准
Figure BDA0004012333940002511
表17.肿瘤细胞(TC)IHC诊断标准
Figure BDA0004012333940002512
Figure BDA0004012333940002521
表18.患者人口统计学
Figure BDA0004012333940002522
Figure BDA0004012333940002531
Atezo表示阿特珠单抗;chemo,化疗;ECOG,东部肿瘤协作组;WT,野生型。
表19.按PD-L1表达分层的扩展患者人口统计学
Figure BDA0004012333940002532
表20.接受后续癌症疗法的患者的比例
Figure BDA0004012333940002533
患者处置
下表21总结在该研究中接受化疗或阿特珠单抗治疗的患者的数目,以及患者在他们参与本研究后的状态。
表21.治疗暴露
Figure BDA0004012333940002541
功效
总TC3和IC3-WT患者群体
该研究的结果表明,相对于用铂类化疗来治疗的TC3或IC3-WT患者,TC3或IC3-WT群体内的患者经历了统计学显著且有临床意义的总存活(OS)的改善作为施用阿特珠单抗的结果。这些结果总结在下表22中,并且以Kaplan-Meier曲线行驶图形化地显示在图2和5中。
表22.由阿特珠单抗治疗实现的OS改善
Figure BDA0004012333940002542
该研究的结果额外地显示,相对于用铂类化疗来治疗的TC3或IC3-WT患者,TC3或IC3-WT群体内的患者经历了有临床意义的无进展存活(PFS)的改善作为施用阿特珠单抗的结果。这些结果总结在下表23中,并且以Kaplan-Meier曲线行驶图形化地显示在图3和9中。
表23.由阿特珠单抗治疗实现的PFS改善
Figure BDA0004012333940002551
该研究的结果进一步显示,相对于用铂类化疗来治疗的TC3或IC3-WT患者,TC3或IC3-WT群体内的患者经历了总应答率和应答持续时间的改善作为施用阿特珠单抗的结果。这些结果总结在图11中和下表24中。
表24.ORR和DOR的改善
Figure BDA0004012333940002552
按PD-L1表达分层的患者中的功效比较
下表25显示,在具有不同PD-L1表达水平的患者中,阿特珠单抗相对于铂类化疗的功效比较。在TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体(n=554)内,534例患者可通过22C3评定且546例可通过SP263评定(生物标志物可评定群体;BEP)。每一个BEP亚组的关键基线特征与TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体的那些关键基线特征一致。通过2种IHC测定确定的PD-L1表达流行率是类似的(图15)。在22C3与SP263≥50%亚组之间观察到高重(图13A)。此外,SP142 TC3或IC3亚组的显著部分涵盖在22C3≥50% TPS或SP263≥50% TC亚组内(图13A和图16)。
阿特珠单抗单一疗法对于TC2/3或IC2/3WT组内患者的总存活率的效应显示在图7中。阿特珠单抗单一疗法对于TC1/2/3或IC1/2/3WT组内患者的总存活率的效应显示在图8中。阿特珠单抗单一疗法对于(i)TC2/3和IC2/3WT组以及(ii)TC1/2/3和IC1/2/3WT组内患者的无进展存活率的效应显示在图10中。总体而言,在具有高PD-L1表达的患者中,无论使用哪种IHC测定,阿特珠单抗显示与化疗类似的OS改善(图13B和图13C)。阿特珠单抗有利与化疗有利的OS改善也见于PD-L1阳性BEP亚组中(图13D和图16)。PD-L1-低BEP亚组内的患者跨治疗臂显示类似的OS结果,无论哪种测定(图13D和图16)。跨PD-L1 BEP亚组观察到了PFS改善(图17)。
该研究在中期分析中达到其主要终点,该中期分析显示,在具有高PD-L1表达的患者中(TC3/IC3-WT;本文中,“WT”表示不具有ALK或EGFR突变的患者),与单独的化疗相比,阿特珠单抗单一疗法将总存活(OS)延长了7.1个月(中位总存活[OS]=20.2与13.1个月;危害比[HR]=0.595,95% CI:0.398–0.890;p=0.0106)。在具有中等PD-L1表达水平的人们中(TC2/3或IC 2/3-WT)也观察到了令人鼓舞的OS(18.2与14.9个月;危害比[HR]=0.717,95% CI:0.520–0.989;p=0.0416)。
表25.跨按PD-L1表达分层的患者组的阿特珠单抗功效比较
Figure BDA0004012333940002561
TC,肿瘤细胞;IC,肿瘤浸润免疫细胞。使用VENTANA SP142 IHC测定对PD-L1表达进行中心评定。TC3或IC3=TC≥50%或IC≥10% PD-L1+;TC1/2/3或IC1/2/3=TC≥1%或IC≥1% PD-L1+;TC2/3或IC2/3=TC≥5%或IC≥5%PD-L1+。a分层。b仅用于描述性目的。
*TC2/3或IC2/3-WT不符合统计学显著性
**TC1/2/3或IC1/2/3-WT未经正式测试且不符合统计学显著性
按bTMB评分进行分层的患者中的功效比较
在TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体(n=554)内,389例患者的bTMB可评定。在TC1/2/3或IC1/2/3-WT群体与bTMB BEP-WT群体之间,基线特征是一致的。与通过SP142 IHC或22C3评定的高PD-L1表达相比,bTMB评分≥16表示bTMB BEP-WT群体内22.4%的患者并且似乎鉴别了一个独特的群体(图14A)。阿特珠单抗表明与化疗相比的OS和PFS改善,在bTMB≥16截断处形成平台(OS未分层的HR,0.75[95% CI:0.41,1.35];PFS HR,0.55[95% CI:0.33,0.92]);图14B和图14C)。
亚组分析
除上述之外,该研究的结果还表明,阿特珠单抗治疗跨TC3或IC3-WT组患者内的亚群体实现了相对于铂类化疗的总存活改善。图6A和图6B总结了这些亚群体并报告由阿特珠单抗产生的相对于铂类化疗的总存活改善。
功效总结
总之,该研究的结果表明,阿特珠单抗在TC3或IC3-WT群体内的患者中实现了相对于铂类化疗的统计学显著且有临床意义的总存活改善。结果额外地显示,阿特珠单抗在TC3或IC3-WT群体内的患者中实现了相对于铂类化疗的有临床意义的无进展存活改善。此外,在TC3和IC3-WT群体内的所有临床亚组中均发现了OS和PFS的改善。
不良事件
如上所述,在整个临床试验持续期间,监测参与该研究的患者的不良事件。这些不良事件总结在以下的表中,并且还在图12中图形化地描绘。
如这些表表明,与铂类化疗相比,阿特珠单抗表现出有利的安全性概况。所研究的安全性群体包括A臂(阿特珠单抗单一疗法)中的286例和B臂(化疗)中的263例患者。治疗相关的AE(TRAE)和3至4TRAE的发生率分别为60.5%(A臂)和85.2%(B臂)以及12.9%(A臂)和44.1%(B臂)。
表26.治疗暴露
Figure BDA0004012333940002581
表27.总安全性概况
Figure BDA0004012333940002582
表28.死亡和死亡原因
Figure BDA0004012333940002591
表29.治疗相关的不良事件
Figure BDA0004012333940002592
/>
Figure BDA0004012333940002601
a在任何臂中发生率≥10%的TRAE或在任何臂中发生率≥1%的3至4级严重程度。
b化疗臂中的一例患者有5级TRAE(全血细胞减少症);未报告其他5级不良事件。
表30.5级不良事件
Figure BDA0004012333940002602
/>
Figure BDA0004012333940002611
表31.特别关注的不良事件
Figure BDA0004012333940002612
/>
Figure BDA0004012333940002621
表32.需要全身性皮质类固醇的免疫介导的不良事件
Figure BDA0004012333940002622
*仅包括3至4级实验室异常。
其他实施例
尽管为了于清楚理解的目的先前已经通过说明和实例相当详细地描述了本公开的前述组合物和方法,但是所述说明和实例不应解释为限制本公开的范围。本文引用的所有专利和科学文献的公开内容均全文以引用方式明确地并入。
序列表
<110> 基因泰克公司
<120> 用于非小细胞肺癌免疫疗法的方法和组合物
<130> 50474-211WO2
<150> US 63/016,529
<151> 2020-04-28
<160> 31
<170> PatentIn 版本 3.5
<210> 1
<211> 440
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 1
Gln Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Val Val Gln Pro Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Asp Cys Lys Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asn Ser
20 25 30
Gly Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Val Ile Trp Tyr Asp Gly Ser Lys Arg Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Phe
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Thr Asn Asp Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser
100 105 110
Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser
115 120 125
Arg Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp
130 135 140
Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr
145 150 155 160
Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys
180 185 190
Thr Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp
195 200 205
Lys Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Pro Cys Pro Ala
210 215 220
Pro Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro
225 230 235 240
Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val
245 250 255
Val Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val
260 265 270
Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln
275 280 285
Phe Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln
290 295 300
Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly
305 310 315 320
Leu Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro
325 330 335
Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr
340 345 350
Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser
355 360 365
Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr
370 375 380
Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr
385 390 395 400
Ser Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe
405 410 415
Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys
420 425 430
Ser Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys
435 440
<210> 2
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 2
Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Asp Ala Ser Asn Arg Ala Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Ser Ser Asn Trp Pro Arg
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 3
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 3
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 4
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 4
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 5
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa 为 Asp 或 Gly
<400> 5
Gly Phe Thr Phe Ser Xaa Ser Trp Ile His
1 5 10
<210> 6
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa 为 Ser 或 Leu
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (10)..(10)
<223> Xaa 为 Thr 或 Ser
<400> 6
Ala Trp Ile Xaa Pro Tyr Gly Gly Ser Xaa Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 7
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 7
Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr
1 5
<210> 8
<211> 25
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 8
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser
20 25
<210> 9
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 9
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
1 5 10
<210> 10
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 10
Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gln
1 5 10 15
Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg
20 25 30
<210> 11
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 11
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
1 5 10
<210> 12
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa 为 Asp 或 Val
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa 为 Val 或 Ile
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (7)..(7)
<223> Xaa 为 Ser 或 Asn
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (9)..(9)
<223> Xaa 为 Ala 或 Phe
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (10)..(10)
<223> Xaa 为 Val 或 Leu
<400> 12
Arg Ala Ser Gln Xaa Xaa Xaa Thr Xaa Xaa Ala
1 5 10
<210> 13
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa 为 Phe 或 Thr
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa 为 Tyr 或 Ala
<400> 13
Ser Ala Ser Xaa Leu Xaa Ser
1 5
<210> 14
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (3)..(3)
<223> Xaa 为 Tyr,Gly,Phe,或 Ser
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (4)..(4)
<223> Xaa 为 Leu,Tyr,Phe,或 Trp
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (5)..(5)
<223> Xaa 为 Tyr,Asn,Ala,Thr,Gly,Phe,或 Ile
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (6)..(6)
<223> Xaa 为 His,Val,Pro,Thr,或 Ile
<220>
<221> MISC_FEATURE
<222> (8)..(8)
<223> Xa 为 Ala,Trp,Arg,Pro,或 Thr
<400> 14
Gln Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Thr
1 5
<210> 15
<211> 23
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 15
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys
20
<210> 16
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 16
Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile Tyr
1 5 10 15
<210> 17
<211> 32
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 17
Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr
1 5 10 15
Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys
20 25 30
<210> 18
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 18
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg
1 5 10
<210> 19
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 19
Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser Trp Ile His
1 5 10
<210> 20
<211> 18
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 20
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
1 5 10 15
Lys Gly
<210> 21
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 21
Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr
1 5
<210> 22
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 22
Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala Val Ala
1 5 10
<210> 23
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 23
Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser
1 5
<210> 24
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 24
Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala Thr
1 5
<210> 25
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 25
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
115 120
<210> 26
<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 26
Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
1 5 10
<210> 27
<211> 30
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 27
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser
20 25 30
<210> 28
<211> 14
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 28
Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala
1 5 10
<210> 29
<211> 15
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 29
Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys
1 5 10 15
<210> 30
<211> 447
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 30
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Ser
20 25 30
Trp Ile His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Trp Ile Ser Pro Tyr Gly Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg His Trp Pro Gly Gly Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro
115 120 125
Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly
130 135 140
Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn
145 150 155 160
Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln
165 170 175
Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser
180 185 190
Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser
195 200 205
Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr
210 215 220
His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser
225 230 235 240
Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg
245 250 255
Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro
260 265 270
Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala
275 280 285
Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Ala Ser Thr Tyr Arg Val Val
290 295 300
Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr
305 310 315 320
Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr
325 330 335
Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu
340 345 350
Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys
355 360 365
Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser
370 375 380
Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp
385 390 395 400
Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser
405 410 415
Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala
420 425 430
Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
<210> 31
<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成构建体
<400> 31
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Val Ser Thr Ala
20 25 30
Val Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Leu Tyr His Pro Ala
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
115 120 125
Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210

Claims (284)

1.一种鉴别可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的患有鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)的受试者的方法,所述方法包括从来自所述受试者的样品确定血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分,其中来自所述样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将所述受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
2.一种为患有鳞状NSCLC的受试者选择疗法的方法,所述方法包括从来自所述受试者的样品确定bTMB评分,其中来自所述样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将所述受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分处于或高于所述参考bTMB评分,并且所述方法进一步包括向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分低于所述参考bTMB评分。
5.一种治疗有此需要的受试者的鳞状NSCLC的方法,所述方法包括:
(a)从来自所述受试者的样品确定bTMB评分,其中从所述样品确定的所述bTMB评分处于或高于参考bTMB评分;以及
(b)向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
6.一种治疗有此需要的受试者的鳞状NSCLC的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂,其中,在向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂之前,来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分为参考群体中的bTMB评分。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述参考群体为患有鳞状NSCLC的受试者的群体。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述患有鳞状NSCLC的受试者的群体包括已经用PD-1轴结合拮抗剂来治疗的受试者的第一子集和已经用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法来治疗的受试者的第二子集。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述参考bTMB评分基于受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的处于或高于所述参考bTMB评分的显著差异,明显区分所述受试者的第一子集与所述受试者的第二子集中的每一个,其中所述受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性相对于所述受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性得到显著改善。
11.根据权利要求9或10所述的方法,其中所述参考bTMB评分基于受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的低于所述bTMB评分的显著差异,明显区分所述受试者的第一子集与所述受试者的第二子集中的每一个,其中所述受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性相对于所述受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性得到显著改善。
12.根据权利要求9至11中任一项所述的方法,其中所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含抗肿瘤剂、化疗剂、生长抑制剂、抗血管生成剂、放疗、细胞毒性剂或它们的组合。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含化疗剂。
14.根据权利要求10至13中任一项所述的方法,其中对治疗的应答性包括无进展存活(PFS)的增加。
15.根据权利要求10至14中任一项所述的方法,其中对治疗的应答性包括总存活(OS)的增加。
16.根据权利要求1至15中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分为预先指定的bTMB评分。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述参考bTMB评分为4至30,任选地其中所述参考bTMB评分为5至28,任选地其中所述参考bTMB评分为6至26,任选地其中所述参考bTMB评分为7至24,任选地其中所述参考bTMB评分为8至22。
18.根据权利要求16所述的方法,其中所述参考bTMB评分为6至14,任选地其中所述参考bTMB评分为7至13,任选地其中所述参考bTMB评分为8至12,任选地其中所述参考bTMB评分为9至11。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述参考bTMB评分为10。
20.根据权利要求16所述的方法,其中所述参考bTMB评分为12至20,任选地其中所述参考bTMB评分为13至19,任选地其中所述参考bTMB评分为14至18,任选地其中所述参考bTMB评分为15至17。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述参考bTMB评分为16。
22.根据权利要求16所述的方法,其中所述参考bTMB评分为16至24,任选地其中所述参考bTMB评分为17至23,任选地其中所述参考bTMB评分为18至22,任选地其中所述参考bTMB评分为19至21。
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述参考bTMB评分为20。
24.根据权利要求1至23中任一项所述的方法,其中所述样品为全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合。
25.根据权利要求24所述的方法,其中所述样品为存档样品、新鲜样品或冷冻样品。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于8,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为8至100。
27.根据权利要求1至26中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于10,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为10至100。
28.根据权利要求1至27中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于12,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为12至100。
29.根据权利要求1至28中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于14,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为14至100。
30.根据权利要求1至29中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于16,任选地其中从所述样品确定的bTMB评分为16至100。
31.根据权利要求1至30中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于18,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为18至100。
32.根据权利要求1至31中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于20,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为20至100。
33.根据权利要求1至32中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变的数量表示。
34.根据权利要求33所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约100kb至约10Mb。
35.根据权利要求34所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb。
36.根据权利要求35所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb。
37.根据权利要求36所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb。
38.根据权利要求37所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。
39.根据权利要求33至38中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所述所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。
40.根据权利要求39所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为所述所计数的SNV的数量。
41.根据权利要求33至40中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变在表1中列示的一种或多种基因中计数。
42.根据权利要求1至41中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变的数量表示。
43.根据权利要求42所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约100kb至约10Mb。
44.根据权利要求43所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb。
45.根据权利要求44所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb。
46.根据权利要求45所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb。
47.根据权利要求46所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。
48.根据权利要求42至47中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为(i)所计数的单核苷酸变体(SNV)的数量或(ii)所述所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。
49.根据权利要求48所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为所述所计数的SNV的数量。
50.根据权利要求42至49中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变在表1中列示的一种或多种基因中计数。
51.根据权利要求1至4和7至50中任一项所述的方法,其中受益于所述包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括OS的增加。
52.根据权利要求1至4和7至51中任一项所述的方法,其中受益于所述包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括PFS的增加。
53.根据权利要求3和5至52中任一项所述的方法,其中与施用铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的OS。
54.根据权利要求53所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约4个月至约10个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约5个月至约9个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6个月至约8个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6.5个月至约7.5个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6.8个月至约7.4个月。
55.根据权利要求54所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约7.1个月。
56.根据权利要求3和5至55中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的PFS。
57.根据权利要求56所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约1个月至约5个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约2个月至约4个月。
58.根据权利要求57所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约3.1个月。
59.根据权利要求3和5至58中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的应答持续时间(DOR)。
60.根据权利要求3和5至59中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂增加所述受试者的客观缓解率(ORR)。
61.根据权利要求53至60中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。
62.根据权利要求61所述的方法,其中所述铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。
63.根据权利要求61或62所述的方法,其中所述核苷类似物为吉西他滨。
64.根据权利要求61至63中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。
65.根据权利要求61至64中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含顺铂和培美曲塞或者卡铂和培美曲塞。
66.根据权利要求3和5至65中任一项所述的方法,其中在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂。
67.根据权利要求66所述的方法,其中在4至6个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂。
68.根据权利要求67所述的方法,其中在每一个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂一次或多次。
69.根据权利要求68所述的方法,其中每个给药周期向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂一次。
70.根据权利要求66至69中任一项所述的方法,其中所述给药周期持续长达58个月。
71.根据权利要求66至70中任一项所述的方法,其中每一个给药周期具有约21天的持续时间。
72.根据权利要求3和5至71中任一项所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂作为单一疗法向所述受试者施用。
73.根据权利要求3和5至71中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用顺铂。
74.根据权利要求73所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约75mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用顺铂。
75.根据权利要求74所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用顺铂。
76.根据权利要求3和5至75中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用卡铂。
77.根据权利要求76所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约5的曲线下面积(AUC)向所述受试者静脉内施用卡铂。
78.根据权利要求77所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
79.根据权利要求76所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约6的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
80.根据权利要求79所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约6的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
81.根据权利要求3和5至80中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用吉西他滨。
82.根据权利要求81所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1000mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
83.根据权利要求82所述的方法,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
84.根据权利要求81所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1250mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
85.根据权利要求84所述的方法,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1250mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
86.根据权利要求3和5至85中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用培美曲塞。
87.根据权利要求86所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约500mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用培美曲塞。
88.根据权利要求87所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约500mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用培美曲塞。
89.根据权利要求1至88中任一项所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂组成的组。
90.根据权利要求89所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂为PD-L1结合拮抗剂。
91.根据权利要求90所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
92.根据权利要求91所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1、B7-1或者PD-1和B7-1两者的结合。
93.根据权利要求89至92中任一项所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。
94.根据权利要求93所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为阿特珠单抗
Figure FDA0004012333930000091
MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。
95.根据权利要求93或94所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含以下高变区(HVR):
(a)GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:19)的HVR-H1序列;
(b)AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)的HVR-H2序列;
(c)RHWPGGFDY(SEQ ID NO:21)的HVR-H3序列;
(d)RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)的HVR-L 1序列;
(e)SASFLYS(SEQ ID NO:23)的HVR-L2序列;和
(f)QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)的HVR-L3序列。
96.根据权利要求94或95所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)重链可变(VH)结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;
(b)轻链可变(VL)结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
97.根据权利要求96所述的方法,其中所述抗PD-L 1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
98.根据权利要求97所述的方法,其中所述抗PD-L 1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
99.根据权利要求98所述的方法,其中所述抗PD-L 1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
100.根据权利要求99所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
101.根据权利要求100所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
102.根据权利要求101所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
103.根据权利要求102所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;和
(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列。
104.根据权利要求103所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为阿特珠单抗。
105.根据权利要求104所述的方法,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
106.根据权利要求105所述的方法,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
107.根据权利要求106所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
108.根据权利要求107所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
109.根据权利要求89所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。
110.根据权利要求109所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
111.根据权利要求110所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1、PD-L2或者PD-L1和PD-L2两者的结合。
112.根据权利要求89和109至111中任一项所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。
113.根据权利要求112所述的方法,其中所述抗PD-1抗体为MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810或BGB-108。
114.根据权利要求89和109至111中任一项所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白。
115.根据权利要求114所述的方法,其中所述Fc融合蛋白为AMP-224。
116.根据权利要求1至115中任一项所述的方法,其中所述受试者是未接受过化疗的。
117.根据权利要求1至116中任一项所述的方法,其中所述受试者先前不曾施用全身疗法来治疗所述NSCLC。
118.根据权利要求1至117中任一项所述的方法,其中所述受试者先前不曾施用任何疗法来治疗所述NSCLC。
119.根据权利要求1至118中任一项所述的方法,其中所述NSCLC为IV期NSCLC。
120.根据权利要求1至119中任一项所述的方法,其中所述NSCLC为转移性NSCLC。
121.根据权利要求1至120中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
122.根据权利要求121所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
123.根据权利要求1至120中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
124.根据权利要求123所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
125.根据权利要求1至120中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
126.根据权利要求121至125中任一项所述的方法,其中所述PD-L1表达水平通过免疫组织化学(IHC)来评定。
127.根据权利要求126所述的方法,其中所述PD-L1表达水平使用抗PD-L1抗体来评定。
128.根据权利要求127所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP142、SP263、22C3、28-8、E1L3N、4059、h5H1或9A11。
129.根据权利要求128所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP142。
130.根据权利要求128所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP263。
131.根据权利要求128所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为22C3。
132.根据权利要求1至131中任一项所述的方法,其中所述受试者为人。
133.根据权利要求132所述的方法,其中所述受试者不具有在编码表皮生长因子受体(EGFR)的基因中的敏化突变。
134.根据权利要求132或133所述的方法,其中所述受试者不具有间变性淋巴瘤受体酪氨酸激酶(ALK)融合致癌基因。
135.一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
136.一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
137.一种治疗有此需要的人类受试者的鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
138.一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
139.一种治疗有此需要的人类受试者的IV期鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中所述受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
140.一种PD-1轴结合拮抗剂,其用于按照根据权利要求1至139中任一项所述的方法使用。
141.PD-1轴结合拮抗剂用于制造药物的用途,所述药物用于按照根据权利要求1至139中任一项所述的方法来治疗鳞状NSCLC。
142.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和指示所述试剂盒的使用者按照根据权利要求1至139中任一项所述的方法向受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂的包装插页。
143.一种鉴别可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的患有非鳞状非小细胞肺癌(NSCLC)的受试者的方法,所述方法包括从来自所述受试者的样品确定血液肿瘤突变负荷(bTMB)评分,其中来自所述样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将所述受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
144.一种为患有非鳞状NSCLC的受试者选择疗法的方法,所述方法包括从来自所述受试者的样品确定bTMB评分,其中来自所述样品的bTMB评分处于或高于参考bTMB评分将所述受试者鉴别为可能受益于包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗的受试者。
145.根据权利要求143或144所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分处于或高于所述参考bTMB评分,并且所述方法进一步包括向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
146.根据权利要求143或144所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分低于所述参考bTMB评分。
147.一种治疗有此需要的受试者的非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括:
(a)从来自所述受试者的样品确定bTMB评分,其中从所述样品确定的所述bTMB评分处于或高于参考bTMB评分;以及
(b)向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂。
148.一种治疗有此需要的受试者的非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括向所述受试者施用有效量的PD-1轴结合拮抗剂,其中,在向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂之前,来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分。
149.根据权利要求143至148中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分为参考群体中的bTMB评分。
150.根据权利要求149所述的方法,其中所述参考群体为患有鳞状NSCLC的受试者的群体。
151.根据权利要求150所述的方法,其中所述患有鳞状NSCLC的受试者的群体包括已经用PD-1轴结合拮抗剂来治疗的受试者的第一子集和已经用不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法来治疗的受试者的第二子集。
152.根据权利要求151所述的方法,其中所述参考bTMB评分基于受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的处于或高于所述参考bTMB评分的显著差异,明显区分所述受试者的第一子集与所述受试者的第二子集中的每一个,其中所述受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性相对于所述受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性得到显著改善。
153.根据权利要求151或152所述的方法,其中所述参考bTMB评分基于受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性与受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性之间的低于所述bTMB评分的显著差异,明显区分所述受试者的第一子集与所述受试者的第二子集中的每一个,其中所述受试者对用所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法的治疗的应答性相对于所述受试者对用所述PD-1轴结合拮抗剂的治疗的应答性得到显著改善。
154.根据权利要求151至153中任一项所述的方法,其中所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含抗肿瘤剂、化疗剂、生长抑制剂、抗血管生成剂、放疗、细胞毒性剂或它们的组合。
155.根据权利要求154所述的方法,其中所述不包含PD-1轴结合拮抗剂的疗法包含化疗剂。
156.根据权利要求152至155中任一项所述的方法,其中对治疗的应答性包括无进展存活(PFS)的增加。
157.根据权利要求152至156中任一项所述的方法,其中对治疗的应答性包括总存活(OS)的增加。
158.根据权利要求143至157中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分为预先指定的bTMB评分。
159.根据权利要求158所述的方法,其中所述参考bTMB评分为4至30,任选地其中所述参考bTMB评分为5至28,任选地其中所述参考bTMB评分为6至26,任选地其中所述参考bTMB评分为7至24,任选地其中所述参考bTMB评分为8至22。
160.根据权利要求158所述的方法,其中所述参考bTMB评分为6至14,任选地其中所述参考bTMB评分为7至13,任选地其中所述参考bTMB评分为8至12,任选地其中所述参考bTMB评分为9至11。
161.根据权利要求160所述的方法,其中所述参考bTMB评分为10。
162.根据权利要求158所述的方法,其中所述参考bTMB评分为12至20,任选地其中所述参考bTMB评分为13至19,任选地其中所述参考bTMB评分为14至18,任选地其中所述参考bTMB评分为15至17。
163.根据权利要求162所述的方法,其中所述参考bTMB评分为16。
164.根据权利要求158所述的方法,其中所述参考bTMB评分为16至24,任选地其中所述参考bTMB评分为17至23,任选地其中所述参考bTMB评分为18至22,任选地其中所述参考bTMB评分为19至21。
165.根据权利要求164所述的方法,其中所述参考bTMB评分为20。
166.根据权利要求143至165中任一项所述的方法,其中所述样品为全血样品、血浆样品、血清样品或它们的组合。
167.根据权利要求166所述的方法,其中所述样品为存档样品、新鲜样品或冷冻样品。
168.根据权利要求143至167中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于8,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为8至100。
169.根据权利要求143至168中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于10,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为10至100。
170.根据权利要求143至169中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于12,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为12至100。
171.根据权利要求143至170中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于14,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为14至100。
172.根据权利要求143至171中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于16,任选地其中从所述样品确定的bTMB评分为16至100。
173.根据权利要求143至172中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于18,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为18至100。
174.根据权利要求143至173中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分大于或等于20,任选地其中从所述样品确定的所述bTMB评分为20至100。
175.根据权利要求143至174中任一项所述的方法,其中从所述样品确定的所述bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变的数量表示。
176.根据权利要求175所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约100kb至约10Mb。
177.根据权利要求176所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb。
178.根据权利要求177所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb。
179.根据权利要求178所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb。
180.根据权利要求179所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。
181.根据权利要求175至180中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为(i)所计数的SNV的数量或(ii)所述所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。
182.根据权利要求181所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为所述所计数的SNV的数量。
183.根据权利要求175至182中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变在表1中列示的一种或多种基因中计数。
184.根据权利要求143至183中任一项所述的方法,其中所述参考bTMB评分以在规定数量的已测序碱基上计数的体细胞突变的数量表示。
185.根据权利要求184所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约100kb至约10Mb。
186.根据权利要求185所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.5Mb至约1.5Mb。
187.根据权利要求186所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.7Mb至约1.3Mb。
188.根据权利要求187所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约0.8Mb至约1.2Mb。
189.根据权利要求188所述的方法,其中所述规定数量的已测序碱基为约1.1Mb。
190.根据权利要求184至189中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为(i)所计数的SNV的数量或(ii)所述所计数的SNV的数量与所计数的插入缺失突变的数量的和。
191.根据权利要求190所述的方法,其中所述体细胞突变的数量为所述所计数的SNV的数量。
192.根据权利要求184至191中任一项所述的方法,其中所述体细胞突变在表1中列示的一种或多种基因中计数。
193.根据权利要求143至146和149至192中任一项所述的方法,其中受益于所述包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括OS的增加。
194.根据权利要求143至146和149至193中任一项所述的方法,其中受益于所述包含PD-1轴结合拮抗剂的治疗包括PFS的增加。
195.根据权利要求145和147至194中任一项所述的方法,其中与施用铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的OS。
196.根据权利要求195所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约4个月至约10个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约5个月至约9个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6个月至约8个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6.5个月至约7.5个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约6.8个月至约7.4个月。
197.根据权利要求196所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的OS延长约7.1个月。
198.根据权利要求145和147至197中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的PFS。
199.根据权利要求198所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约1个月至约5个月,任选地其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约2个月至约4个月。
200.根据权利要求199所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂将所述受试者的PFS延长约3.1个月。
201.根据权利要求145和147至200中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂延长所述受试者的应答持续时间(DOR)。
202.根据权利要求145和147至201中任一项所述的方法,其中与施用所述铂类化疗而不使用所述PD-1轴结合拮抗剂相比,向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂增加所述受试者的客观缓解率(ORR)。
203.根据权利要求195至202中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含铂类化疗剂和核苷类似物。
204.根据权利要求203所述的方法,其中所述铂类化疗剂为顺铂、卡铂或奥沙利铂。
205.根据权利要求203或204所述的方法,其中所述核苷类似物为吉西他滨。
206.根据权利要求203至205中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含顺铂和吉西他滨或者卡铂和吉西他滨。
207.根据权利要求203至205中任一项所述的方法,其中所述铂类化疗包含顺铂和培美曲塞或者卡铂和培美曲塞。
208.根据权利要求145和147至207中任一项所述的方法,其中在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂。
209.根据权利要求208所述的方法,其中在4至6个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂。
210.根据权利要求209所述的方法,其中在每一个给药周期期间向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂一次或多次。
211.根据权利要求210所述的方法,其中每个给药周期向所述受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂一次。
212.根据权利要求208至211中任一项所述的方法,其中所述给药周期持续长达58个月。
213.根据权利要求208至212中任一项所述的方法,其中每一个给药周期具有约21天的持续时间。
214.根据权利要求145和147至213中任一项所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂作为单一疗法向所述受试者施用。
215.根据权利要求145和147至213中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用顺铂。
216.根据权利要求215所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约75mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用顺铂。
217.根据权利要求216所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约75mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用顺铂。
218.根据权利要求145和147至217中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用卡铂。
219.根据权利要求218所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约5的曲线下面积(AUC)向所述受试者静脉内施用卡铂。
220.根据权利要求219所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约5的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
221.根据权利要求220所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约6的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
222.根据权利要求221所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约6的AUC向所述受试者静脉内施用卡铂。
223.根据权利要求145和147至222中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用吉西他滨。
224.根据权利要求223所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1000mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
225.根据权利要求224所述的方法,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1000mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
226.根据权利要求223所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以及在第7天至第11天以约1250mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
227.根据权利要求226所述的方法,其中在21天给药周期的第1天和第8天以约1250mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用吉西他滨。
228.根据权利要求145和147至227中任一项所述的方法,其中向所述受试者施用培美曲塞。
229.根据权利要求228所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约500mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用培美曲塞。
230.根据权利要求229所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约500mg/m2的剂量向所述受试者静脉内施用培美曲塞。
231.根据权利要求143至230中任一项所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂选自由PD-L1结合拮抗剂、PD-1结合拮抗剂和PD-L2结合拮抗剂组成的组。
232.根据权利要求231所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂为PD-L1结合拮抗剂。
233.根据权利要求232所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
234.根据权利要求233所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂抑制PD-L1与PD-1、B7-1或者PD-1和B7-1两者的结合。
235.根据权利要求231至234中任一项所述的方法,其中所述PD-L1结合拮抗剂为抗PD-L1抗体。
236.根据权利要求235所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为阿特珠单抗
Figure FDA0004012333930000241
MDX-1105、MEDI4736(德瓦鲁单抗)或MSB0010718C(阿维单抗)。
237.根据权利要求235或236所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含以下高变区(HVR):
(a)GFTFSDSWIH(SEQ ID NO:19)的HVR-H1序列;
(b)AWISPYGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:20)的HVR-H2序列;
(c)RHWPGGFDY(SEQ ID NO:21)的HVR-H3序列;
(d)RASQDVSTAVA(SEQ ID NO:22)的HVR-L1序列;
(e)SASFLYS(SEQ ID NO:23)的HVR-L2序列;和
(f)QQYLYHPAT(SEQ ID NO:24)的HVR-L3序列。
238.根据权利要求236或237所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)重链可变(VH)结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;
(b)轻链可变(VL)结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少90%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
239.根据权利要求238所述的方法,其中所述抗PD-L 1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少95%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
240.根据权利要求239所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少96%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
241.根据权利要求240所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少97%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
242.根据权利要求241所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少98%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
243.根据权利要求242所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含与SEQ ID NO:3的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含与SEQ ID NO:4的氨基酸序列具有至少99%序列同一性的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
244.根据权利要求243所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;
(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列;或
(c)如(a)中的VH结构域和如(b)中的VL结构域。
245.根据权利要求244所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体包含:
(a)VH结构域,其包含SEQ ID NO:3的氨基酸序列;和
(b)VL结构域,其包含SEQ ID NO:4的氨基酸序列。
246.根据权利要求245所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为阿特珠单抗。
247.根据权利要求246所述的方法,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
248.根据权利要求247所述的方法,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
249.根据权利要求248所述的方法,其中在21天给药周期的第-2天至第4天以约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
250.根据权利要求249所述的方法,其中在21天给药周期的第1天以约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗。
251.根据权利要求231所述的方法,其中所述PD-1轴结合拮抗剂为PD-1结合拮抗剂。
252.根据权利要求251所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与其配体结合配偶体中的一个或多个的结合。
253.根据权利要求252所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂抑制PD-1与PD-L1、PD-L2或者PD-L1和PD-L2两者的结合。
254.根据权利要求231和251至253中任一项所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂为抗PD-1抗体。
255.根据权利要求254所述的方法,其中所述抗PD-1抗体为MDX-1106(纳武单抗)、MK-3475(派姆单抗)、MEDI-0680(AMP-514)、PDR001、REGN2810或BGB-108。
256.根据权利要求231和251至253中任一项所述的方法,其中所述PD-1结合拮抗剂为Fc融合蛋白。
257.根据权利要求256所述的方法,其中所述Fc融合蛋白为AMP-224。
258.根据权利要求143至257中任一项所述的方法,其中所述受试者是未接受过化疗的。
259.根据权利要求143至258中任一项所述的方法,其中所述受试者先前不曾施用全身疗法来治疗所述NSCLC。
260.根据权利要求143至259中任一项所述的方法,其中所述受试者先前不曾施用任何疗法来治疗所述NSCLC。
261.根据权利要求143至260中任一项所述的方法,其中所述NSCLC为IV期NSCLC。
262.根据权利要求143至261中任一项所述的方法,其中所述NSCLC为转移性NSCLC。
263.根据权利要求143至262中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的1%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的1%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
264.根据权利要求263所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的1%至少于5%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的1%至少于5%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
265.根据权利要求143至262中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的5%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的5%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
266.根据权利要求264所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的5%至少于50%的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的5%至少于10%的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
267.根据权利要求143至262中任一项所述的方法,其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为表现出:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
268.根据权利要求263至267中任一项所述的方法,其中所述PD-L1表达水平通过免疫组织化学(IHC)来评定。
269.根据权利要求268所述的方法,其中所述PD-L1表达水平使用抗PD-L1抗体来评定。
270.根据权利要求269所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP142、SP263、22C3、28-8、E1L3N、4059、h5H1或9A11。
271.根据权利要求270所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP142。
272.根据权利要求270所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为SP263。
273.根据权利要求270所述的方法,其中所述抗PD-L1抗体为22C3。
274.根据权利要求143至273中任一项所述的方法,其中所述受试者为人。
275.根据权利要求274所述的方法,其中所述受试者不具有在编码表皮生长因子受体(EGFR)的基因中的敏化突变。
276.根据权利要求274或275所述的方法,其中所述受试者不具有间变性淋巴瘤受体酪氨酸激酶(ALK)融合致癌基因。
277.一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
278.一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每2周约840mg、每3周约1200mg或每4周约1680mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
279.一种治疗有此需要的人类受试者的非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
280.一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
281.一种治疗有此需要的人类受试者的IV期非鳞状NSCLC的方法,所述方法包括在一个或多个给药周期期间向所述受试者施用有效量的阿特珠单抗,其中所述受试者是未接受过化疗的,其中所述受试者不具有在编码EGFR的基因中的敏化突变并且不具有ALK融合致癌基因,其中来自所述受试者的样品的bTMB评分已经被确定为处于或高于参考bTMB评分,任选地其中所述参考bTMB评分为16,其中以每3周约1200mg的剂量向所述受试者静脉内施用阿特珠单抗,并且其中从所述受试者获得的肿瘤样品已经被确定为具有:
(i)在所述肿瘤样品中的50%或更多的肿瘤细胞中的可检测的PD-L1表达水平;和/或
(ii)包含占所述肿瘤样品的10%或更多的肿瘤浸润免疫细胞中的可检测的PD-L1表达水平。
282.一种PD-1轴结合拮抗剂,其用于按照根据权利要求143至281中任一项所述的方法使用。
283.PD-1轴结合拮抗剂用于制造药物的用途,所述药物用于按照根据权利要求143至281中任一项所述的方法来治疗鳞状NSCLC。
284.一种试剂盒,其包含PD-1轴结合拮抗剂和指示所述试剂盒的使用者按照根据权利要求143至281中任一项所述的方法向受试者施用所述PD-1轴结合拮抗剂的包装插页。
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