CN115812078A

CN115812078A - 抗人类免疫缺陷病毒-1抗体及其使用方法

Info

Publication number: CN115812078A
Application number: CN202180049156.7A
Authority: CN
Inventors: 伊丽莎白·纳西门托; 乔迪·梅尔顿威特
Original assignee: Grifols Diagnostic Solutions Inc
Current assignee: Grifols Diagnostic Solutions Inc
Priority date: 2020-07-13
Filing date: 2021-07-13
Publication date: 2023-03-17
Also published as: WO2022013730A8; TW202216758A; EP4178979A1; JP2023533565A; AU2021308568A1; WO2022013730A1; CA3185333A1

Abstract

一种抗HIV‑1抗体，所述抗HIV‑1抗体包含L‑CDR1、L‑CDR2及L‑CDR3，其中L‑CDR1选自由SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21以及与SEQ ID NO:15、18或21中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，L‑CDR2的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:22以及与SEQ ID NO:16、19或22中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，且L‑CDR3的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:23以及与SEQ ID NO:17、20或23中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组。

Description

抗人类免疫缺陷病毒-1抗体及其使用方法

技术领域

本申请涉及与HIV-1p24蛋白特异性结合的针对人类免疫缺陷病毒-1的抗体(抗HIV-1)。本发明还涉及使用所述抗体检测样品中的HIV-1的方法及测定。

背景

人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)为逆转录病毒，可感染全球3790万人，每年导致约100万个体死亡，尤其是在无法获得诊断及治疗的脆弱人群中(Soliman,M.等人Mechanisms ofHIV Control.Current HIV/AIDS Reports 2017,vol.14(3)；101-9)。HIV-1为获得性免疫缺陷综合征(AIDS)的主要原因，这是一种无法治愈的疾病，经由与HIV-1感染个体的性接触或通过暴露于血液或血源性(blood-derived)污染产品而传播。该病毒通过破坏及削弱免疫细胞的功能来靶向免疫系统。受感染的个体变得免疫缺陷，且对其他机会性感染以及某些类型的癌症易感(WHO网站来源-https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hiv-aids)。目前，仅46％的HIV-1感染个体知晓他们的感染状况。因此，在急性感染中检测HIV-1是重要的公共卫生问题(Stone,M.等人Comparison of detection limits offourth-and fifth-generation combination HIV antigen-antibody,p24 antigen,andviral load assays on diverse HIV isolates.Journal of Clinical Microbiology2018,vol.56(8)；1-12)。

在此特殊背景下，目标是在个体受感染(急性期)后的数周内立即诊断出HIV-1，由此可能会防止二次传播并允许及早获得治疗及照护(Lewis J.等人Field accuracy offourth-generation rapid diagnostic tests for acute HIV-1:a systematicreview.AIDS 2015,vol.29(18)；2465-71)。为了及时达成此目标，使用早期生物标志物进行HIV-1检测是关键的。最常用于诊断HIV-1感染的生物标志物是针对病毒结构蛋白的抗体。在此，p24被视为早期HIV-1检测的重要生物标志物，因为它是HIV-1病毒包膜中最丰富的结构蛋白，并且在感染的初始阶段在血清中以高水平分泌。p24为聚合的衣壳蛋白(capsid protein)，其充当病毒RNA分子周围HIV-1包膜的主要结构组分。p24为源自Gag多聚蛋白前体的24-25kDa的蛋白，与HIV-1RNA一样，其可在血清转化之前检测到(Gray,E.R.等人p24 revisited:a landscape review of antigen detection for early HIVdiagnosis.AIDS.2018,vol.32(15)；2089-102)。

美国疾病控制与预防中心(CDC)及世界卫生组织(WHO)的当前指南推荐使用第四代抗体-抗原测定作为HIV-1筛检的优选方法。这些测试检测p24抗原及抗HIV-1抗体，并将诊断窗口期自暴露后4周缩短至2周(Gray,E.R.等人p24 revisited:a landscape reviewof antigen detection for early HIV diagnosis.AIDS.2018,vol.32(15)；2089-102；Codoner,F.等人Gag protease coevolution analyses define novel structuralsurfaces in the HIV-1matrix and capsid involved in resistance to ProteaseInhibitors.Scientific Reports 2017,vol.7(3717)；1-10；Alexander TS.HumanImmunodeficiency Virus Diagnostic Testing:30Years of Evolution.Clinical andVaccine Immunology 2016,vol.23(4)；249-53；WHO.World Health Organization ModelList of Essential In Vitro Diagnostics.第1版Geneva.2018；Centers for DiseaseControl and Prevention.2017.National HIV testing day and new testingrecommendations.Morbidity and Mortality Weekly Report vol.63(25)；537-37)。

然而，仍需要具有高结合能力及良好制造特征的与p24抗原特异性结合的抗HIV-1抗体，因为目前商业上可得的一些抗体对早期p24检测的灵敏度较低。

因此，本发明提供当与类似的商用试剂相比时具有经改良的针对HIV-1p24蛋白的结合能力的抗HIV-1抗体。这些抗体识别新颖、非交叉反应性表位，并且可在多种HIV-1免疫测定(诸如免疫诊断或血液筛检平台)中用作单独的实体或捕获/检测配偶体(partners)。

概述

当本说明书涉及CDR X的序列或与CDR X相差一个或两个取代、缺失或添加的序列时，应理解这样的取代、缺失或添加可出现在由CDR X定义的氨基酸范围的任何氨基酸处。本说明书将由CDR X定义的氨基酸范围内的每个特定氨基酸个体化为适合于这样的取代、缺失或添加。

作为非限制性说明，抗体#A的L-CDR1可定义为包含氨基酸(1)-(11)的序列，RASQDISNYLH[如SEQ ID NO:15所示]。除非另有规定或后来通过修改而完善，否则位置1、2、3、4、5、6、7、8、9、10及11中的每个都被视为适合于取代、缺失或添加。

在第一方面中，本发明公开了一种抗HIV-1抗体，所述抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列选自由SEQ IDNO:15、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:21以及与SEQ ID NO:15、18或21中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，L-CDR2的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:16、SEQ IDNO:19、SEQ ID NO:22以及与SEQ ID NO:16、19或22中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，且L-CDR3的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQID NO:23以及与SEQ ID NO:17、20或23中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组。

在其他实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27、SEQID NO:30以及与SEQ ID NO:24、27或30中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，H-CDR2的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:31以及与SEQ ID NO:25、28或31中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，H-CDR3的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:32以及与SEQ ID NO:26、29或32中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链包含与以下氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9。在其他实施方案中，轻链包含以下氨基酸序列：SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的重链包含与以下氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。在其他实施方案中，重链包含以下氨基酸序列：SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。

在一些实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:15或与SEQ ID NO:15相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:16或与SEQID NO:16相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ IDNO:17或与SEQ ID NO:17相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。在其他实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:18或与SEQ ID NO:18相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:19或与SEQ ID NO:19相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:20或与SEQ ID NO:20相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。在其他实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:22或与SEQ ID NO:22相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:23或与SEQ ID NO:23相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:24或与SEQ ID NO:24相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:25或与SEQID NO:25相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ IDNO:26或与SEQ ID NO:26相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。在其他实施方案中，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:27或与SEQ ID NO:27相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:28或与SEQ ID NO:28相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:29或与SEQ ID NO:29相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。在其他实施方案中，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:31或与SEQ ID NO:31相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:32或与SEQ ID NO:32相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:15或与SEQ ID NO:15相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:16或与SEQID NO:16相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:17或与SEQ ID NO:17相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:24或与SEQ ID NO:24相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:25或与SEQ ID NO:25相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:26或与SEQ ID NO:26相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:18或与SEQ ID NO:18相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:19或与SEQID NO:19相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:20或与SEQ ID NO:20相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:27或与SEQ ID NO:27相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:28或与SEQ ID NO:28相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:29或与SEQ ID NO:29相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:22或与SEQID NO:22相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:23或与SEQ ID NO:23相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:31或与SEQ ID NO:31相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:32或与SEQ ID NO:32相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列的HIV-1p24蛋白的表位特异性结合。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ IDNO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:22或与SEQ ID NO:22相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:23或与SEQ ID NO:23相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ IDNO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:31或与SEQ ID NO:31相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:32或与SEQ ID NO:32相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

在一些优选实施方案中，所述抗体的轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3，且所述抗体的重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体为单克隆抗体或重组抗体。在其他实施方案中，所述抗体为抗体片段。当抗HIV-1抗体为抗体片段时，其选自可变片段(Fv)、单链Fv(scFv)、双特异性抗体(sc(Fv)2)、单链抗体、单域抗体、Fab片段、F(ab')2片段、Fab'片段、二硫键连接的Fv(dsFv)、化学缀合的Fv(ccFv)、双抗体(diabodies)、抗独特型(anti-idiotypic)(抗Id)抗体、亲和体(affibodies)、纳米抗体(nanobodies)及单抗体(unibodies)。

在一些实施方案中，抗HIV-1抗体包含鼠IgG1类或鼠IgG2a类的恒定区。

在一些实施方案中，抗HIV-1抗体结合至固体支持物。

在一些方面中，本发明公开了一种细胞，其包含本发明的抗HIV-1抗体。

在其他方面中，本发明公开了一种核酸，其包含编码抗HIV-1抗体的核苷酸序列、可操作地连接至所述核苷酸序列的启动子、及选择标志物(selectable marker)。本发明还公开了一种包含所述核酸的细胞。

本发明还公开了包含如本文描述的抗HIV-1抗体及固体支持物的组合物，其中所述抗HIV-1抗体共价地或非共价地结合至固体支持物。在一些实施方案中，固体支持物包含颗粒、珠、膜、表面、多肽芯片、微量滴定板或色谱柱的固相。

本发明还公开用于检测样品中HIV-1的存在的试剂盒，所述试剂盒包含至少一种根据本发明的抗HIV-1抗体及固体支持物，其中所述至少一种抗体共价地或非共价地结合至固体支持物。

附图简述

图1为SE-UPLC分析，显示抗体#A的单体百分比％；及SDS-PAGE，显示抗体#A单克隆(泳道1、2及3分别表示在还原及非还原条件下运行的亚克隆)。

图2为SE-UPLC分析，显示抗体#B的单体百分比％；及SDS-PAGE，显示抗体#B单克隆(泳道1、2及3分别表示在还原及非还原条件下运行的亚克隆)。

图3为SE-UPLC分析，显示抗体#D的单体百分比％；及SDS-PAGE，显示抗体#D单克隆(泳道1、2及3分别表示在还原及非还原条件下运行的亚克隆)。

图4为PDB，显示抗体#A、#B及#D的预测结构(分别为图4A、图4B及图4D)。对于抗体#A，PDB结构代码2XKN用于同源性查询中，而代码5OPY及1F3D分别用于抗体B#及#D。

图5为饱和抗体#A与竞争性#B及#D的传感图。抗体#B及#D向#A中添加信号，表明这些抗体不会在相同表位区内竞争结合。

图6为饱和抗体#B与竞争性#A及#D的传感图。抗体#A及#D向#B中添加信号，表明这些抗体不会在相同表位区内竞争结合。

图7为饱和抗体#D与竞争性#A及#B的传感图。抗体#A及#B向#D中添加信号，表明这些抗体不会在相同表位区内竞争结合。

图8为在不存在竞争性抗体的情况下，抗体#A、#B及#D与HIV-1p24缔合的传感图。每种抗体都获得其完整的结合信号(实验对照)。

图9为抗体#A、#B及#D以及商用mAb#1与抗原HIV-1p24的结合动力学，通过生物层干涉法(BLI)计算。对0.1-33nM的梯度浓度绘制传感图并拟合1:1结合模型以计算ka(缔合速率常数)、kd(解离速率常数)及KD(平衡解离常数)。

图10为通过间接ELISA，抗体#A、#B及#D以及商用mAb#2与HIV-1p24衣壳蛋白的结合。每种抗体的滴定曲线自2μg/mL的浓度开始，随后按1:10稀释(左)。200ng/mL抗体浓度的信噪比数据显示在右侧，表明与抗体#A、#B及#D相比，商用mAb#2的性能较差。

详述

以下描述仅旨在说明本公开内容的各种实施方案。因此，所讨论的具体修改不旨在限制。对本领域技术人员明显的是，可进行各种等同、改变及修改而不脱离本文提出的主题的精神或范围，并且应理解，这样的等同实施方案包括在本文中。

除非上下文另有明确规定，否则如在本说明书及随附的权利要求书中使用的单数形式“一(a)”、“一(an)”及“所述(the)”包括复数指示物。

本说明书通篇，除非上下文另有要求，否则词语“包含(comprise)”或诸如“包含(comprises)”或“包含(comprising)”的变型将应理解为暗示包括所陈述的要素或整数或要素或整数的组，但不排除任何其他要素或整数或要素或整数的组。

除非另有定义，否则本文使用的所有技术及科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同的含义。示范性方法及材料在下面描述，尽管也可使用与本文描述的相似或等效的方法及材料并且这对于本领域技术人员将是明显的。本文提及的所有出版物及其他参考文献均以引用方式以其整体并入。如有冲突，则以本说明书，包括定义为准。材料、方法及实例仅为说明性且不旨在限制。

除非另有明确说明，否则本说明书中的每个实施方案将在加以必要修正的情况下应用于每个其他实施方案。

除非另有说明，否则以下术语应理解为具有以下含义：

如本文所用，术语“核酸”是指包含DNA或RNA的任何材料。核酸可以合成制成或由活细胞制成。

如本文所用，“核苷酸”为由磷酸基团、5-碳糖及含氮碱基组成的核酸亚单元。见于RNA中的5-碳糖为核糖。在DNA中，5-碳糖为2'-脱氧核糖。该术语还包括这样的亚单元的类似物。

如本文所用，术语“多核苷酸”是指核苷酸的聚合链。该术语包括DNA分子(例如，cDNA或基因组DNA或合成DNA)及RNA分子(例如，mRNA或合成RNA)，以及包含非天然核苷酸类似物、非天然核苷间键、或这两者的DNA或RNA的类似物。核酸可呈任何拓扑构象。例如，核酸可以是单链的、双链的、三链的、四联体的、部分双链的、分支的、发夹的、环状的或呈挂锁(padlock)构象。

如本文所用，术语“蛋白”或指由一条或更多条氨基酸残基链组成的大生物分子或大分子。许多蛋白为催化生化反应的酶，且对新陈代谢至关重要。蛋白还具有结构或机械功能，诸如肌肉中的肌动蛋白及肌球蛋白以及细胞骨架中的蛋白，它们形成维持细胞形状的支架系统。其他蛋白在细胞信号传导、免疫应答、细胞黏附及细胞周期中是重要的。然而，蛋白可为完全人工的或重组的，即，并非天然存在于生物系统中。

如本文所用，术语“多肽”是指天然存在及非天然存在两者的蛋白以及其片段、突变体、衍生物及类似物。多肽可以是单体的或聚合的。多肽可包含许多不同的结构域(肽)，每个结构域具有一种或更多种不同活性。

如本文所用，术语“重组”是指生物分子，例如基因或蛋白，其(1)已自其天然存在的环境中移出，(2)不与其中基因见于自然界中的多核苷酸的全部或一部分缔合，(3)与其在自然界中不连接的多核苷酸可操作地连接，或(4)在自然界中不存在。术语“重组”可用于指代克隆的DNA分离物、化学合成的多核苷酸类似物或由异源系统生物合成的多核苷酸类似物，以及由这样的核酸编码的蛋白和/或mRNA。

如本文所用，术语“融合蛋白”是指包含两个或更多个在天然存在的蛋白中不共存的氨基酸序列的蛋白。融合蛋白可包含来自相同或不同生物体的两个或更多个氨基酸序列。融合蛋白的两个或更多个氨基酸序列通常在框内(in frame)，它们之间没有终止密码子，并且通常作为融合蛋白的一部分自mRNA翻译。

当提及根据(3)的蛋白时，术语“融合蛋白”及术语“重组”在本文中可互换使用。

如本文所用，术语“抗体”或“免疫球蛋白”具有相同含义，并且在本发明中等同使用。如本文所用，术语“抗体”是指免疫球蛋白分子及免疫球蛋白分子的免疫活性部分，即含有特异性结合抗原的抗原结合位点的分子。因此，术语抗体不仅涵盖完整抗体分子，而且还涵盖抗体片段或衍生物。

在天然抗体中，两条重链经由二硫键相互连接，且每条重链经由二硫键连接至轻链。有两种类型的轻链，λ(lambda)及κ(kappa)。有五种主要的重链类别(或同种型)，它们决定抗体分子的功能活性：IgM、IgD、IgG、IgA及IgE。每条链包含不同的序列结构域。轻链包括两个结构域，即可变结构域(VL)及恒定结构域(CL)。重链包括四个结构域，即一个可变结构域(VH)及三个恒定结构域(CH1、CH2及CH3，统称为CH)。轻链可变区(VL)及重链可变区(VH)两者决定对抗原的结合识别及特异性。轻链恒定区结构域(CL)及重链恒定区结构域(CH)赋予重要的生物学特性，诸如抗体链缔合、分泌、跨胎盘移动、补体结合(complementbinding)以及与Fc受体(FcR)的结合。Fv片段为免疫球蛋白Fab片段的N末端部分，且由一条轻链及一条重链的可变部分组成。抗体的特异性在于抗体组合位点与抗原决定簇之间的结构互补性。抗体组合位点由主要来自高变区或互补决定区(CDR)的残基构成。有时，来自非高变区或框架区(FR)的残基会影响整体结构域结构，并从而影响组合位点。互补决定区或CDR是指共同定义天然免疫球蛋白结合位点的天然Fv区的结合亲和力及特异性的氨基酸序列。免疫球蛋白的轻链及重链各有三个CDR，分别命名为L-CDR1、L-CDR2、L-CDR3及H-CDR1、H-CDR2、H-CDR3。因此，抗原结合位点通常包括六个CDR，包含来自重链V区及轻链V区各自的CDR组。框架区(FR)是指CDR之间间插的氨基酸序列。

CDR可根据Kabat、Chothia的定义、Kabat及Chothia两者的累加、AbM、接触、IMGT独特编号和/或构象定义或本领域中熟知的任何CDR确定方法来鉴定。抗体CDR可经鉴定为最初由Kabat等人定义的高变区。参见，例如Kabat等人,1992,Sequences of Proteins ofImmunological Interest,第5版,Public Health Service,NIH,Washington D.C.。CDR的位置也可鉴定为最初由Chothia及其他人描述的结构环结构(参见，例如Chothia等人,Nature 342:877-883,1989)。CDR鉴定的其他方法包括“AbM定义”，其是Kabat与Chothia之间的折衷并且是使用Oxford Molecular的AbM抗体建模软件(现为Accelrys0)导出的；CDR的“接触定义”，该定义基于观察到的抗原接触，阐述于MacCallum等人，J.Mol.Biol.,262:732-745,1996中；或“IMGT独特编号”，其依赖于可变区结构的高度保守性(参见Lefranc,M.-P.Nucl.Acids Res.,33,D593-D597,2005)。在本文中称为CDR的“构象定义”的另一种方法中，CDR的位置可鉴定为对抗原结合做出焓贡献的残基。参见，例如Makabe等人,Journalof Biological Chemistry,283:1156-1166,2008。其他CDR边界定义可不严格遵循以上方法中的一种，但将仍然与Kabat CDR的至少一部分重叠，尽管鉴于特定残基或残基组或甚至整个CDR不显著影响抗原结合的预测或实验研究结果，其可能缩短或延长。如本文所用，CDR可指代由本领域中已知的任何方法，包括方法的组合定义的CDR。本文所用的方法可利用根据这些方法中的任一种定义的CDR。对于含有多于一个CDR的任何给定实施方案，除非另有规定，否则CDR可根据Kabat、Chothia、扩展的、AbM、接触、IMGT独特编号和/或构象定义中的任一种来定义。

抗体序列的示范性数据库描述于“Abysis”网站www.bioinf.org.uk/abs(由A.C.Martin in the Department of Biochemistry&Molecular Biology UniversityCollege London,London,England维护)及VBASE2网站www.vbase2.org并可经由其访问，如Retter等人,Nucl.Acids Res.,33(Database issue):D671-D674(2005)中描述的。优选地使用Abysis数据库分析序列，该数据库将来自Kabat、IMGT及Protein Data Bank(PDB)的序列数据与来自PDB的结构数据整合在一起。除非另有说明，否则本文中列出的所有CDR均根据Abysis数据库网站，按照所示方案得出。

如本文所用，术语“抗体”包括分离的抗体、多克隆抗体、单克隆抗体、多特异性抗体、人类抗体、人源化抗体(完全或部分人源化)、动物抗体、重组抗体、嵌合抗体及抗体片段。

如本文所用，术语“单克隆抗体”或“mAb”是指具有结合相同表位的同质抗体群体的抗体组合物。该术语不限于抗体的种类或来源，也不旨在受其制备方式的限制。因此，该术语涵盖由鼠杂交瘤获得的抗体，以及使用人类而非鼠杂交瘤获得的人类单克隆抗体。该术语还涵盖通过本领域已知的用于产生单克隆抗体的其他方法(诸如通过瞬时或稳定转染建立真核细胞系)获得的抗体。

如本文所用，术语“重组抗体”是指自用一种或更多种包含抗体编码序列的表达载体转染的细胞或细胞系表达的抗体，其中所述编码序列不与细胞天然相关。重组抗体或其片段通过技术人员熟知的任何重组方式来制备、表达、产生或分离。

在一些实施方案中，当“重组抗体”源自结合相同表位的同质抗体群体时，它也可也可以是“单克隆抗体”。

因此，本文所用的术语“抗体片段”包括但不限于可变片段(Fv)、单链Fv(scFv)、双特异性抗体(sc(Fv)₂)、单链抗体、单域抗体、Fab片段、F(ab')₂片段、Fab'片段、二硫键连接的Fv(dsFv)、化学缀合的Fv(ccFv)、双抗体及抗独特型(抗Id)抗体以及以上的任一种的具有功能活性的表位结合片段。在某些实施方案中，抗体还包括亲和体、纳米抗体及单抗体。在某些实施方案中，特定抗体包括免疫球蛋白分子及免疫球蛋白分子的免疫活性片段，即含有抗原结合位点的分子。免疫球蛋白分子可为任何类型(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及IgY)、类别(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgAi及IgA2)或子类的。

如本文所用，术语“抗原结合片段(Fab)”是指包含重链及轻链各自的一个恒定结构域及一个可变结构域的抗体片段。可变结构域含有抗原结合位点。通常，抗体包含一个可结晶区片段(Fc)及两个抗原结合片段(Fab)。Fab片段可与Fc区分开，产生两个Fab片段，也称为F(ab')₂片段或二聚抗原结合片段。

术语“分离的”是指实质上不含其他细胞材料和/或化学品的蛋白(例如，抗体)或核酸。例如，当分离的抗体由来自不同物种的细胞表达时(例如在鼠细胞中表达的人类抗体)，并且实质上不含来自不同物种的其他蛋白。可使用本领域中熟知的蛋白纯化技术，通过分离使蛋白实质上不含天然相关组分(或与用于产生抗体的细胞表达系统相关的组分)。

如本文所用，术语“抗原”是指与相应抗体特异性结合的生物分子。来自不同组库(repertoire)的抗体藉助于其可变区相互作用结合特定的抗原结构。

如本文所用，术语“表位”是指抗体特异性结合至的抗原部分。因此，术语“表位”包括能够与免疫球蛋白或T细胞受体特异性结合的任何蛋白决定簇。

当多肽由于抗体识别多肽中包含的特定表位而与抗体结合时，多肽与抗体具有“免疫反应性”。免疫反应性可通过抗体结合，更具体地通过抗体结合动力学，和/或通过使用包含抗体所针对的表位的已知多肽作为竞争剂的结合竞争来确定。确定多肽是否与抗体具有免疫反应性的技术是本领域中已知的。

如本文所用，术语“样品”是指自受试者或患者获得的任何生物材料。在一个方面，样品可包含血液、腹膜液(peritoneal fluid)、CSF、唾液或尿液。在其他方面，样品可包含全血、血浆、血清、自血液样品富集的B细胞、及经培养的细胞(例如，来自受试者的B细胞)。样品还可包括活检或组织样品，包括神经组织。在仍其它方面，样品可包含全细胞和/或细胞裂解物。

可对样品进行处理以便以物理或机械方式破坏组织或细胞结构，从而将细胞内组分释放至还可含有酶、缓冲液、盐、去污剂等的溶液中，该溶液用于使用标准方法制备生物样品以供分析。样品还可包括经处理的样品，诸如通过使样品穿过或通过过滤装置，或在离心之后，或通过黏附于介质、基质或支持物而获得的经处理的样品。

术语“患者”或“个体”在本文中可互换地使用，且是指待诊断或治疗的哺乳动物受试者，优选地为人类患者。在一些情况下，本发明的方法可用于实验动物、兽医应用及疾病动物模型的开发，包括但不限于啮齿动物，包括小鼠、大鼠及仓鼠；以及灵长类动物。

术语“载体”是指可用于将与其连接的另一核酸引入细胞中的核酸。一种类型的载体为“质粒”，其是指线性或环状双链DNA分子，其中可连接另外的核酸区段。另一种类型的载体为病毒载体(例如，复制缺陷型逆转录病毒、腺病毒及腺相关病毒)，其中可将另外的DNA区段引入病毒基因组中。某些载体能够在它们被引入的宿主细胞中自主复制(例如，包含细菌复制起点的细菌载体及附加型哺乳动物载体)。其他载体(例如非附加型哺乳动物载体)在引入至宿主细胞中后整合至宿主细胞的基因组中，并藉此连同宿主基因组一起复制。

“表达载体”为一种可指导所选多核苷酸的表达的载体类型。“表达细胞”为包含表达载体的细胞。

若调控序列影响核苷酸序列的表达(例如，表达的水平、时机或位置)，则核苷酸序列与调控序列“可操作地连接”。“调控序列”为影响与其可操作连接的核酸的表达(例如，表达的水平、时机或位置)的核酸。例如，调控序列可直接或经由一个或更多个其他分子(例如，与调控序列和/或核酸结合的多肽)的作用对受调控的核酸发挥其作用。调控序列的实例包括启动子、增强子及其他表达控制元件。

如本文所用，术语“诊断(diagnostic)”或“经诊断(diagnosed)”意指鉴定病理状况或对疾病易感的患者的存在或性质。诊断方法的灵敏度及特异性不同。诊断测定的“灵敏度”为测试呈阳性的患病个体的百分比(“真阳性”的百分比)。测定未检测到的患病个体为“假阴性”。未患病且在测定中测试呈阴性的受试者称为“真阴性”。诊断测定的“特异性”为1减去假阳性率，其中“假阳性”率定义为测试呈阳性而没有疾病的患者的比例。尽管特定诊断方法可能不提供对状况的确定性诊断，但若该方法提供有助于诊断的阳性指示就足够了。

如本文所用，术语“结合亲和力”是指抗原表位与抗体抗原结合位点之间相互作用的强度。

本发明涉及专用于检测人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)p24蛋白的新颖抗体。这些抗体识别HIV-1p24蛋白的新颖及非交叉反应性表位，并且与其他商业上可得的产品相比，呈现出更高程度的亲和力及灵敏度。因此，本文描述的抗体可用作早期HIV-1检测的免疫测定中的诊断试剂、标准品或阳性对照。它们可用于检测三个主要HIV-1组(M组(主要)、N组(新)及O组(离群(outlier)))中的任一个。

本发明还涉及用于检测样品中HIV-1的存在的组合物及试剂盒，所述组合物及试剂盒包含所述抗HIV-1抗体。

I.抗HIV-1抗体

如本文所用，在两个或更多个核酸或多肽序列的上下文中，术语“同源性”、“相似性”或“同一性”是指当进行比较及比对以获得最大对应时，相同或具有特定百分比的相同核苷酸或氨基酸残基的两个或更多个序列或子序列。为了确定同源性/同一性百分比，出于最佳比较目的比对序列(例如，可在第一氨基酸或核酸序列的序列中引入空位以与第二氨基酸或核酸序列进行最佳比对)。随后比较对应氨基酸位置或核苷酸位置处的氨基酸残基或核苷酸。当第一序列中的位置由与第二序列中对应位置相同的氨基酸残基或核苷酸占据时，则分子在该位置处为相同的。两个序列之间的同一性百分比为序列共有的相同位置的数量的函数(即，同一性％＝相同位置的数量#/位置总数#(例如重叠位置)x 100)。在一些实施方案中，所比较的两个序列在适当(例如，排除延伸超出所比较序列的另外序列)时在序列内引入空位之后具有相同长度。对于两个序列之间的序列比较，“对应”CDR是指两个序列中相同位置的CDR(例如各序列的CDR-H1)。

可使用数学算法来确定两个序列之间的同一性百分比、相似性百分比或相似性百分比。用于比较两个序列的数学算法的优选非限制性实例为按Karlin及Altschul,1993,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:5873-5877中修改的Karlin及Altschul,1990,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 87:2264-2268的算法。这样的算法并入Altschul等人,1990,J.Mol.Biol.215:403-410的NBLAST及XBLAST程序中。BLAST核苷酸检索可利用NBLAST程序、评分＝100、字长＝12来执行，以获得与编码感兴趣的蛋白的核酸同源的核苷酸序列。BLAST蛋白检索可利用XBLAST程序、评分＝50、字长＝3来执行，以获得与感兴趣的蛋白同源的氨基酸序列。为了获得用于比较目的的空位比对，可使用空位BLAST(如Altschul等人,1997,Nucleic Acids Res.25:3389-3402中所述)。当利用BLAST及空位BLAST程序时，可使用各个程序(例如，XBLAST及NBLAST)的默认参数。用于序列比较的数学算法的另一优选非限制性实例为Myers及Miller,CABIOS(1989)的算法。这样的算法并入ALIGN程序(2.0版)中，该程序为GCG序列比对软件包的一部分。当利用ALIGN程序来比较氨基酸序列时，可使用PAM120权重残基表、12的空位长度罚分及4的空位罚分。

在本文描述的一种实施方案中，重组抗体包含轻链及重链。在本文描述的其他实施方案中，重组抗体包含两条轻链及两条重链。本发明的重组抗体的轻链可包含两个结构域，即一个可变结构域(VL)及一个恒定结构域(CL)。本发明的重组抗体的重链可包含四个结构域，即一个可变结构域(VH)及三个恒定结构域(CH1、CH2及CH3，统称为CH)。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体为单克隆抗体。在其他实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体为重组抗体。在其他实施方案中，抗HIV-1抗体为根据本发明的定义的重组单克隆抗体。在其他实施方案中，抗HIV-1抗体为分离的抗体。

在一些实施方案中，抗HIV-1抗体为抗体片段。在优选实施方案中，所述抗体片段选自可变片段(Fv)、单链Fv(scFv)、双特异性抗体(sc(Fv)₂)、单链抗体、单域抗体、Fab片段、F(ab')₂片段、Fab'片段、二硫键连接的Fv(dsFv)、化学缀合的Fv(ccFv)、双抗体、抗独特型(抗Id)抗体、亲和体、纳米抗体及单抗体。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体包含Fc区及两个Fab片段。在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体为抗原结合片段并且不含Fc区。在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体由一个Fab片段组成。在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体由两个Fab片段(F(ab)₂)组成。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体可为技术人员已知的任何类型(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA及IgY)、或技术人员已知的任何类别(例如IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgAi及IgA2)或任何已知子类。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体为IgG类型的。在优选实施方案中，抗HIV-1抗体为IgG1、IgG2、IgG3或IgG4类别的。在另一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体为IgG1或IgG2类别的。在另一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体为IgG2a类别的。

尽管本发明的抗体的物种不受特别限制，本发明的抗体恒定区的物种可为人类、小鼠、兔、大鼠、仓鼠、豚鼠、山羊、绵羊、马、鸡或任何所述物种的嵌合体。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体包含鼠IgG1类别或鼠IgG2a类别的恒定区。

A.轻链

在本文描述的一些实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有互补决定区(CDR)的轻链。所述CDR对应于技术人员已知的任何CDR定义方法鉴定的序列。在一些优选实施方案中，CDR区对应于根据Kabat编号方案所鉴定的序列。在其他优选实施方案中，CDR区可对应于根据其他编号方法或Kabat与其他编号方法的组合所鉴定的序列。例如，CDR区可对应于根据Chothia编号方案所鉴定的序列。

在本文描述的一些实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，它们各自包含选自由以下的氨基酸序列的至少五个连续氨基酸的序列：SEQ ID NO:7、或SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9。在一些优选实施方案中，L-CDR1的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18及SEQ ID NO:21。在一些优选实施方案中，L-CDR2的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19及SEQ ID NO:22。在一些优选实施方案中，L-CDR3的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20及SEQ ID NO:23。在其他优选实施方案中，L-CDR1的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18及SEQ ID NO:21，L-CDR2的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:16、SEQID NO:19及SEQ ID NO:22，且L-CDR3的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:17、SEQ IDNO:20及SEQ ID NO:23。

在本文描述的另一实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链的可变区包含以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9。在又另一实施方案中，重组抗体的轻链的可变区可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:7或SEQ IDNO:8或SEQ ID NO:9。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链包含与以下的氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9。

在本文描述的另一实施方案中，重组抗体包含含有以下的氨基酸序列的轻链：SEQID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3。在其他实施方案中，重组抗体的轻链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链包含与以下的氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3。

B.重链

在本文描述的一些实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有互补决定区(CDR)的重链。所述CDR对应于技术人员已知的任何CDR定义方法鉴定的序列。在一些优选实施方案中，CDR区对应于根据Kabat编号方案所鉴定的序列。在其他优选实施方案中，CDR区可对应于根据其他编号方法或Kabat与其他编号方法的组合所鉴定的序列。例如，CDR区可对应于根据Chothia编号方案所鉴定的序列。

在本文描述的一些实施方案中，抗HIV-1抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，它们各自包含选自由以下的氨基酸序列的至少五个连续氨基酸的序列：SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。在一些优选实施方案中，H-CDR1的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27及SEQ ID NO:30。在一些优选实施方案中，H-CDR2的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:28及SEQ ID NO:31。在一些优选实施方案中，H-CDR3的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:29及SEQ ID NO:32。在一些优选实施方案中，H-CDR1的序列选自由以下组成的组：SEQID NO:24、SEQ ID NO:27及SEQ ID NO:30，H-CDR2的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:28及SEQ ID NO:31，H-CDR3的序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:26、SEQID NO:29及SEQ ID NO:32。

在本文描述的另一实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的重链的可变区包含以下的氨基酸序列：SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。在又另一实施方案中，重组抗体的重链的可变区可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:10或SEQ IDNO:11或SEQ ID NO:12。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的重链包含与以下氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:10或SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。

在本文描述的另一实施方案中，重组抗体包含含有以下的氨基酸序列的重链：SEQID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。在其他实施方案中，重组抗体的轻链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的重链包含与以下氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。

C.示例性抗HIV-1抗体

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:15，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:16，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:17。

在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:18，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:19，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:20。

在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:21，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:22，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:23。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:24，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:25，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:26。

在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:27，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:28，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:29。

在本文描述的其他实施方案中，抗HIV-1抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:30，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:31，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:32。

本发明的抗HIV-1抗体可包含如本文描述的轻链及重链两者的CDR区的任何组合。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:15，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:16，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:17；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:24，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:25，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:26。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:15，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:16，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:17；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:27，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:28，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:29。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:15，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:16，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:17；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:30，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:31，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:32。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:18，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:19，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:20；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:24，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:25，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:26。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:18，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:19，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:20；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:27，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:28，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:29。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:18，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:19，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:20；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:30，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:31，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:32。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:21，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:22，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:23；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:24，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:25，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:26。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:21，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:22，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:23；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:27，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:28，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:29。

在本文描述的一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:21，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:22，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:23；及重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:30，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:31，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:32。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9；及重链，所述重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:7的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:7的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:11的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:7的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:11的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:8的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:10的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:11的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:9的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:12的氨基酸序列的重链。

在其他优选实施方案中，抗HIV-1抗体的轻链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:9且抗HIV-1抗体的重链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12。

在本文描述的一种实施方案中，抗HIV-1抗体包含轻链，所述轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3；及重链，所述重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:4的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:5的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:1的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:6的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:4的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:5的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:2的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:6的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:3的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:4的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:3的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:5的氨基酸序列的重链。

在一种优选实施方案中，抗HIV-1抗体包含含有SEQ ID NO:3的氨基酸序列的轻链及含有SEQ ID NO:6的氨基酸序列的重链。

在其他优选实施方案中，抗HIV-1抗体的轻链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:3，且抗HIV-1抗体的重链可与由以下组成的氨基酸序列具有约70％、75％、80％、85％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、99％或更大同源性：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5或SEQ ID NO:6。

在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白特异性结合。在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的表位结合。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的线性表位结合。在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与包含至少五个连续氨基酸的线性表位结合，所述连续氨基酸选自HIV-1p24蛋白的氨基酸序列(SEQ ID NO:35)或与所述序列具有至少90％同源性的序列。在其他实施方案中，HIV-1p24蛋白的氨基酸序列列于SEQ ID NO:36。

在其他优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的表位结合，特征在于所述表位包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列。

在更优选的实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的表位结合，特征在于所述表位包含选自由SEQ ID NO:33组成的组的氨基酸序列且其中所述抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18及SEQ ID NO:21，L-CDR2的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19及SEQ ID NO:22，且L-CDR3的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20及SEQ ID NO:23；且还包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQID NO:24、SEQ ID NO:27及SEQ ID NO:30，H-CDR2的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQID NO:25、SEQ ID NO:28及SEQ ID NO:31，且H-CDR3的氨基酸序列选自由以下组成的组：SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29及SEQ ID NO:32。

在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的表位结合，特征在于所述表位包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列且其中所述抗体包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、L-CDR2及L-CDR3，其中L-CDR1的氨基酸序列为SEQ ID NO:18，L-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:19，且L-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:20；且所述抗体还包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、H-CDR2及H-CDR3，其中H-CDR1的氨基酸序列为SEQ IDNO:27，H-CDR2的氨基酸序列为SEQ ID NO:28，且H-CDR3的氨基酸序列为SEQ ID NO:29。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体结合至固体支持物。

D.亲和标签

根据本发明的抗HIV-1抗体可任选地包括亲和标签。亲和标签可用于纯化。尽管亲和标签的选择不受特别限制，示例性亲和标签包括聚组氨酸、谷胱甘肽S-转移酶(GST)、几丁质结合蛋白、麦芽糖结合蛋白(MBP)、链霉亲和素结合肽(Strep标签)、异肽键形成、FLAG标签、V5标签、Myc标签、HA标签、NE标签、AviTag、调钙蛋白标签、聚谷氨酸、S标签、SBP标签、Softag 1、Softag 3、TC标签、VSV标签、Xpress标签、Isopeptag、SpyTag、SnoopTag、生物素羧基载体蛋白、绿色荧光蛋白标签、HaloTag、Nus标签及硫氧还蛋白标签。然而，抗HIV-1抗体可以缺乏亲和标签，例如，若在使用后移除亲和标签，或者若使用不需要亲和标签的策略来纯化抗体。示例性亲和标签为聚组氨酸，其通常包含含有4个和10个之间的连续组氨酸的氨基酸序列。

本发明的抗HIV-1抗体可任选地包括亲和标签并且可任选地使用所述亲和标签进行纯化。纯化抗HIV-1抗体的若干种方法是先前技术(the state of the art)中可得的并且技术人员充分了解它们。包含或不包含亲和标签的抗HIV-1抗体的示例性纯化方法为固定化金属亲和色谱(IMAC)、蛋白A/G亲和色谱、交换色谱(IEX或IEC)、疏水相互作用色谱(HIC)和/或除了IMAC或蛋白A/G之外的另外的使用标签及亲和色谱的技术。所使用的纯化方法及标签不应视为限制性的。

II.核酸、克隆细胞及表达细胞

本发明还涉及包含编码本文描述的抗HIV-1抗体的核苷酸序列的核酸。核酸可为分离的核酸。核酸可为DNA或RNA。包含编码本文描述的抗HIV-1抗体的核苷酸序列的DNA通常包含与该核苷酸序列可操作连接的启动子。启动子优选地能够在感兴趣的表达细胞中驱动该核苷酸序列的组成型或诱导型表达。所述核酸也可包含可用于选择包含感兴趣的所述核酸的细胞的选择标志物。可用的选择标志物是技术人员熟知的。核酸的精确核苷酸序列不受特别限制，只要核苷酸序列编码本文描述的抗HIV-1抗体即可。例如，可选择密码子以匹配感兴趣的表达细胞(例如哺乳动物细胞，诸如人类细胞)的密码子偏倚和/或为了在克隆过程中的便利。DNA可为质粒，例如其可包含复制起点(例如，用于质粒在原核细胞中的复制)。

在本文描述的一种实施方案中，核酸包含编码本发明的抗HIV-1抗体的核苷酸序列、可操作地连接至该核苷酸序列的启动子、及选择标志物。

在一些优选实施方案中，核酸包含选自由以下组成的组的核苷酸序列：SEQ IDNO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41及SEQ ID NO:42。在更优选的实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链的核酸包含选自由以下组成的组的核苷酸序列：SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39及SEQ ID NO:41，且本发明的抗HIV-1抗体的重链的核酸包含选自由以下组成的组的核苷酸序列：SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:40及SEQ ID NO:42。

在一些实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链及重链的核酸分别包含SEQ IDNO:37的核苷酸序列及SEQ ID NO:38的核苷酸序列。在其他实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链及重链的核酸分别包含SEQ ID NO:39的核苷酸序列及SEQ ID NO:40的核苷酸序列。在其他实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体的轻链及重链的核酸分别包含SEQ ID NO:41的核苷酸序列及SEQ ID NO:42的核苷酸序列。

本发明的各个方面还涉及一种包含核酸的细胞，所述核酸包含编码如本文描述的抗HIV-1抗体的核苷酸序列。细胞可以是表达细胞或克隆细胞。核酸通常在大肠杆菌中克隆，但也可使用其他克隆细胞。

若细胞为表达细胞，则核酸任选地为染色体的核酸，即其中核苷酸序列整合至染色体中，尽管核酸可存在于表达细胞中，例如，作为染色体外DNA或载体，诸如质粒、黏粒、噬菌体等。载体的形式不应视为限制性的。

在本文描述的一种实施方案中，细胞通常为表达细胞。表达细胞的性质不受特别限制。哺乳动物表达细胞可允许重组抗体或寡聚重组抗体的有利折叠、翻译后修饰和/或分泌，尽管其他真核细胞或原核细胞可用作表达细胞。示例性表达细胞包括CHO细胞系，诸如TunaCHO或ExpiCHO、Expi293、BHK、NS0、Sp2/0、COS、C127、HEK、HT-1080、PER.C6、HeLa及Jurkat细胞。也可选择细胞用于载体的整合，更优选地用于质粒DNA的整合。

本发明的抗HIV-1抗体可通过将包含编码抗HIV-1抗体的核苷酸序列的核酸适当转染至哺乳动物细胞中的策略来产生。技术人员知晓可用于将核酸转染至所选细胞系中的不同技术(脂质转染、电穿孔等)。因此，哺乳动物细胞系及转染策略的选择不应视为限制性的。可进一步选择细胞系以整合质粒DNA。

在本文描述的一种优选实施方案中，细胞包含本发明的抗HIV-1抗体。

III.组合物及试剂盒

本发明的各个方面涉及包含如本文描述的抗HIV-1抗体的组合物。

在本文描述的一种实施方案中，组合物包含本发明的抗HIV-1抗体及固体支持物。

在其他实施方案中，组合物包含本发明的抗HIV-1抗体及固体支持物，其中抗HIV-1抗体共价地或非共价地结合至固体支持物。如本文所用，术语“非共价结合”是指诸如抗体与其抗原、配体与其受体、或酶与其底物之间的特异性结合，例如通过链霉亲和素结合蛋白与链霉亲和素或抗体与其抗原之间的相互作用所例示。

在其他实施方案中，组合物包含本发明的抗HIV-1抗体及固体支持物，其中抗HIV-1抗体直接或间接结合至固体支持物。如本文所用，术语“直接”结合是指分子与固体支持物的直接缀合，例如将抗HIV-1抗体的半胱氨酸硫醇结合至金表面的金-硫醇相互作用。如本文所用，术语“间接”结合包括抗HIV-1抗体与直接结合至固体支持物的另一分子的特异性结合，例如，抗HIV-1抗体可结合直接结合至固体支持物的抗体，从而使抗HIV-1抗体间接结合至固体支持物。术语“间接”结合跟抗HIV-1抗体与固体支持物之间的分子数目无关，只要(a)分子菊链(daisy chain)之间的每个相互作用都为特异性或共价相互作用，及(b)菊链的末端分子直接与固体支持物结合。

固体支持物可以包括颗粒、珠、膜、表面、多肽芯片、微量滴定板或色谱柱的固相。优选地，固体支持物可为乳胶珠。

组合物可包含复数个珠或颗粒，其中复数个珠或颗粒中的每个珠或颗粒直接或间接地结合至至少一种如本文描述的抗HIV-1抗体。组合物可包含复数个珠或颗粒，其中复数个珠或颗粒中的每个珠或颗粒共价地或非共价地结合至至少一种如本文描述的抗HIV-1抗体。

实施方案的各个方面涉及一种用于检测样品中HIV-1的存在的试剂盒，所述试剂盒包含至少一种如本文描述的抗HIV-1抗体及固体支持物或组合物。在一些实施方案中，所述至少一种抗体共价地或非共价地结合至固体支持物。

在此描述的抗HIV-1抗体、组合物及试剂盒可用于例如检测样品中HIV-1的存在或测量样品中HIV-1的浓度的测定中，但它们不限于所述测定。本发明的抗HIV-1抗体、组合物及试剂盒也可用于仅检测HIV-1或与用于检测其他病原体的其他抗体组合(诸如多重测定及方法)来检测HIV-1。

在一些优选实施方案中，本发明的抗HIV-1抗体用于其中也检测其他RNA病毒的方法及测定中。在其他实施方案中，所述抗HIV-1抗体及其他抗HIV-2抗体用于同时检测样品中的HIV-1及HIV-2的方法及测定中。在更优选的实施方案中，所述抗HIV-1抗体及其他抗HIV-2抗体用于特异性检测样品中的HIV-1p24蛋白及HIV-2p26蛋白的方法及测定中。

在本发明的范围内还涵盖在用于检测样品中的HIV-1的方法及测定中使用多于一种如本文描述的抗HIV-1抗体。

在下文中，通过说明性实施例更详细地描述本发明，但并不构成对本发明的限制。

例证

实施例1：优选的抗HIV抗体及稳定的细胞系产生

本发明的轻链与重链的特定组合产生优选抗体，如本文所公开：

抗体	轻链	重链
			#A	SEQ ID NO:1	SEQ ID NO:4
#B	SEQ ID NO:2	SEQ ID NO:5
			#D	SEQ ID NO:3	SEQ ID NO:6

表1.抗HIV-1抗体的轻链与重链的优选组合

将各抗体的可变区及恒定区克隆至双顺反子载体中，并在中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中表达。基于为各抗体生成稳定的细胞系克隆的能力以及功能性抗体的可再现表达及纯化来评估各抗体的制造特征。

池开发

转染：在包含每种抗体的重链及轻链的双顺反子表达载体中生成包含抗体#A、#B及#D的核苷酸序列(SEQ ID NO:37至42)的三种构建体的表达。为了表达抗体，用200μg DNA对CHO细胞进行电穿孔以创建稳定的细胞系。二十四小时后，对经转染的细胞进行计数并置于选择培养基下以稳定整合蛋白质基因。

池生成：将经转染的细胞以0.5x10⁶个细胞/mL的细胞密度接种至具有50mL工作体积的250mL摇瓶中的选择培养基中，并在37℃及5％CO₂孵育。在选择过程期间，每2-3天将细胞离心(spin down)并重悬于新鲜的选择培养基中，直到池恢复其生长速率及生存力。通过活细胞密度(VCD)及生存力百分比以及效价(titer)监测细胞培养物的生长。

生产池(Production Pool)：自稳定池进行一升生产运行以评估VCD、效价及生存力。将细胞在3L摇瓶(1L工作体积)中的生产培养基中放大。自每个稳定池生产运行中收获的条件培养基上清液通过离心旋转澄清，并使用蛋白A柱，通过亲和纯化来纯化蛋白质(表2-表4)。

细胞系建库(banking)：使细胞生长至2.5x10⁶个细胞/ml。在收获用于细胞建库时，生存力高于95％。然后将细胞离心，并将细胞沉淀重悬在含有7.5％二甲基亚砜(DMSO)(Sigma-Aldrich,D1435)的CHO完全培养基中，直至细胞计数为每mL每瓶15x10⁶个细胞。每个池共产生五个小瓶并将其冷冻以保存在液氮中。

表2.抗体#A池1及2的生产及纯化。

表3.抗体#B池1及2的生产及纯化过程。

表4.抗体#D池1及2的生产及纯化过程。

稳定抗体生成

自抗体#A、#B及#D的最佳已建库池细胞系开始，经由单细胞克隆获得稳定克隆。每种抗体的最佳克隆是基于生产运行中抗体#A、#B及#D的纯化材料的表达水平及生物分析表征来选择的。生物分析表征包括SE-UPLC及SDS-PAGE(图1-图3)。

实施例2：抗体建模及评估

使用计算及建模软件Bioiluminate(Schrodinger),3.5版，通过抗体同源性建立抗体#A、#B及#D的三维结构模型。简而言之，将抗体#A、#B及#D的VH区及VL区的氨基酸序列加载至Bioiluminate。通过在蛋白质数据库(PDB)中检索抗体结构并基于高序列相似性及结构适合度选择PDB模板来鉴定框架区及CDR(表5)。本发明的每种抗体的预测CDR序列示于表5中且抗体#A、#B及#D的PDB预测结构分别示于图4A、图4B及图4D中。对于抗体#A，PDB结构代码2XKN用于同源性查询，而代码5OPY及1F3D分别用于抗体B#及#D。

抗体#A及#B由IgG1k同种型产生，而抗体#D由IgG2ak同种型产生。

表5.根据Abysis数据库网站得出的抗体#A、#B及#D的轻链及重链的Chothia CDR

序列。

对三种抗体的核苷酸序列的分析显示，当针对IgBLAST查询时，所有生成的重链(VH)及轻链(VL)都具有独特的互补决定区(CDR)，IgBLAST是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发的一种算法，以促进针对ImMunoGeneTics Database(IMGT)数据库(Lefranc M-P.Lefranc G.

and 30years of Immunoinformatics Insight in Antibody Vand C Domain Structure and Function.于Jefferis R；Strohl W.R.,KatoK.Antibodies 2019,vol.8(29)；1-21)对免疫球蛋白可变结构域序列的分析。

实施例3：表位作图mAb D

HIV-p24的序列经由C末端及N末端处的中性GSGSGSG接头延长以避免经截短的肽。将经延长的抗原序列翻译成15个氨基酸的线性肽，其中肽-肽重叠14个氨基酸。生成的HIV-p24肽微阵列包含232种不同的线性肽，一式两份打印(464个点)，并通过另外的HA(YPYDVPDYAG，38个点)及c-Myc(EQKLISEEDL，38个点)对照肽镶边(framed)。

洗涤缓冲液：PBS,pH 7.4含0.05％Tween 20；在每个孵育步骤之后洗涤3x10秒

封闭缓冲液：Rockland封闭缓冲液MB-070(第一测定之前30min)

孵育缓冲液：含10％封闭缓冲液的洗涤缓冲液

测定条件：孵育缓冲液中的抗体浓度为1μg/ml、10μg/ml及100μg/ml；在4℃孵育16h；在140rpm摇动

二级抗体：山羊抗小鼠IgG(H+L)DyLight680(0.2μg/ml)；在RT在孵育缓冲液中染色45min。对照抗体：小鼠单克隆抗HA(12CA5)DyLight800(0.5μg/ml)；在RT在孵育缓冲液中染色45min

扫描仪：LI-COR Odyssey成像系统；扫描偏移(offset)0.65mm，分辨率21μm，扫描强度7/7(红色＝680nm/绿色＝800nm)

HIV-p24肽微阵列的预染色是用二级山羊抗小鼠IgG(H+L)DyLight680抗体在孵育缓冲液中进行，以研究与可能干扰主要测定的抗原衍生肽的背景相互作用。随后将其他HIV-p24肽微阵列拷贝与单克隆抗体D以1μg/ml、10μg/ml及100μg/ml的浓度在孵育缓冲液中孵育，接着用二级抗体及对照抗体染色并在7/7(红/绿)的扫描强度读出。构成肽微阵列的另外的HA肽随后经染色作为内部质量对照，以确认测定质量及肽微阵列的完整性。

对mAb D进行的针对HIV-p24的表位作图，以及随后的表位置换扫描突出了保守的7个氨基酸的核心基序PIAPGQM(SEQ ID NO:33)。

实施例4：表位分箱研究

抗体#A、#B及#D的分子对接(docking)及蛋白印迹评估表明，这些抗体分别识别HIV-1p24蛋白的1、4及7区的线性表位。为了进一步证实这些观察，使用生物层干涉仪(BLI)进行串联表位分箱测定。将酵母衍生版本的HIV-1p24抗原生物素化(bt-p24)并加载至链霉亲和素(SA)生物传感器上持续300秒。将经加载的传感器浸入饱和抗体(100μg/mL)中600秒，随后浸入竞争性抗体(25μg/mL)中300秒。结果显示，当抗体#A与HIV-1p24结合时，抗体#B及#D增加BLI信号响应，表明与抗体A相比，抗体#B及#D与不同的表位结合。类似地，若抗体#A或#D用作饱和抗体，则其余抗体不会显示对相同表位的竞争(图9-图10)。

表6总结抗体#A、#B及#D的表位分箱数据。简言之，竞争性及饱和抗体的BLI信号针对缓冲液进行归一化。将确定抗体封闭或结合的阈值设置为0.02，以便可在矩阵的对角在线识别自封闭对(灰色表示结合，粗体表示自封闭)。使用Microsoft Excel中的PEARSON函数针对第一抗体#A计算PEARSON相关系数(Liao-Chan S.等人,Monoclonal AntibodyBinding-site Diversity Assessment with a Cell-based Clustering Assay.Journalof Immunological Methods 2014,vol.405；1-14)。针对抗体#A、#B及#D鉴定三个不同的箱。未观察到抗体封闭。

表6.抗HIV-1抗体#A、#B及#D的表位分箱矩阵。

实施例5：抗HIV-1抗体#A、#B及#D的亲和力评估

为了更详细地研究抗体#A、#B及#D与HIV-1p24抗原之间的相互作用，通过BLI进行亲和力分析。将抗体#A、#B及#D与商用单克隆抗体(商用mAb#1)进行比较。使用抗小鼠Fc特异性包被的生物传感器尖端(ForteBio)来捕获抗体#A、#B及#D以及商用mAb#1。用于每种抗体的浓度梯度范围为0.1nM至33nM，且每种稀释液均在含有0.01％(w/v)牛血清白蛋白(BSA)及0.02％(v/v)去污剂Tween-20的磷酸盐缓冲液(PBS)中制备。记录的传感图使用1:1结合模型拟合，并且平衡常数KD由解离速率与缔合速率的比(kd/ka)计算。测试的抗体基于计算的亲和力常数如下排序：抗体#B～抗体#D>抗体#A>商用mAb#1。尽管由于观察到长的解离曲线，无法计算抗体#B及#D的准确KD值，但提供的数据显示抗体#A、#B及#D的计算KD值低于针对商用mAb#1所观察到的值(表7)。该数据支持如下观察：抗体#A、#B及#D呈现比商用mAb#1高的对HIV-1p24的亲和力。

抗体ID	K<sub>D</sub>(nM)	Ka(1/Ms)	Kd(1/s)	排序	全R<sup>2</sup>
						A	0.2	2.41x10<sup>5</sup>	5.90x10<sup>-5</sup>	2	0.9982
B	<2.4x10<sup>-4</sup>	4.08x10<sup>5</sup>	<1.0x10<sup>-7</sup>	1	0.9993
						D	<5.2x10<sup>-4</sup>	1.94x10<sup>5</sup>	<1.0x10<sup>-7</sup>	1	0.9986
(商用mAb#1)	1.3	1.28x10<sup>5</sup>	1.62x10<sup>-4</sup>	3	0.9974

表7.通过BLI，抗体#A、#B、#D及商用mAb#1与HIV-1p24蛋白的结合。KD，平衡解离常数；Ka，缔合速率常数及Kd，解离速率常数。

实施例6：抗HIV-1抗体#A、#B及#D的结合能力

为了进一步评估抗体#A、#B及#D对HIV-1p24抗原的结合，完成间接ELISA测定。使用2μg/mL的起始浓度并进行连续1:10稀释直至达到2x10^-2 ng/mL的较低抗体浓度，为每种抗体生成滴定曲线。将每种抗体的性能与商用克隆(商用mAb#2)进行比较(图10，左)。数据显示当与商用mAb#2相比时，抗体#A、#B及#D比商用抗体具有更高的信噪比(S/N)，主要针对介于20ng/mL和2000ng/mL之间的浓度而言，并且这些抗体也呈现较低的EC50值(图10，右)。

结论

已进行功能测定，其中将抗HIV-1抗体#A、#B及#D与来自商用mAb#1及#2的商用抗HIV-1p24抗体进行比较。通过BLI及间接ELISA评估每种抗体的结合亲和力及效力。在这两个实验中，当与测试的商用抗体相比时，HIV-1抗体#A、#B及#D显示出更好的亲和力及更好的EC50值(关于动力学分析，参见图9及表7，并且关于ELISA数据，参见图10)。

在此提供的实验数据证明本发明的抗HIV-1抗体可用于检测HIV-1结构p24蛋白。当与市面上的类似产品相比时，所述抗体在亲和力、灵敏度、效力、表达、溶解性及可制造性方面显示出改良的特性，并且它们在血清学中的用途可以有助于缩短HIV-1感染与诊断事件之间的时程；因此，防止继发性(secondary)病毒传播。

索引表(Concordance Table)

*除非另有说明，否则所有CDR序列都是利用Abysis数据库根据Chothia得出的。

Claims

1.一种抗HIV-1抗体，包含轻链，所述轻链包含互补决定区L-CDR1、互补决定区L-CDR2及互补决定区L-CDR3，其中

L-CDR1的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:18、SEQ IDNO:21及与SEQ IDNO:15、18及21中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，

L-CDR2的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:22及与SEQ IDNO:16、19及22中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，

L-CDR3的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:20、SEQ IDNO:23及与SEQ IDNO:17、20及23中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组。

2.根据权利要求1所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体包含重链，所述重链包含互补决定区H-CDR1、互补决定区H-CDR2及互补决定区H-CDR3，其中

H-CDR1的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:30及与SEQ IDNO:24、27及30中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，

H-CDR2的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:28、SEQ IDNO:31及与SEQ IDNO:25、28及31中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组，且

H-CDR3的氨基酸序列选自由SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:29、SEQ IDNO:32及与SEQ IDNO:26、29及32中的任一种相差一个或两个取代、缺失或添加的序列组成的组。

3.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述轻链包含与以下的氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:7、SEQ IDNO:8及SEQ ID NO:9。

4.根据权利要求3所述的抗HIV-1抗体，其中所述轻链包含以下的氨基酸序列：SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8及SEQ ID NO:9。

5.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述重链包含与以下的氨基酸序列具有约90％同源性的序列：SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:11及SEQ ID NO:12。

6.根据权利要求5所述的抗HIV-1抗体，其中所述重链包含以下的氨基酸序列：SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:11及SEQ ID NO:12。

7.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQID NO:15或与SEQ ID NO:15相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:16或与SEQ ID NO:16相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:17或与SEQ ID NO:17相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

8.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQID NO:18或与SEQ ID NO:18相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:19或与SEQ ID NO:19相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:20或与SEQ ID NO:20相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

9.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQID NO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:22或与SEQ ID NO:22相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:23或与SEQ ID NO:23相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

10.根据权利要求1至7中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:24或与SEQ ID NO:24相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:25或与SEQ ID NO:25相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:26或与SEQ ID NO:26相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

11.根据权利要求1至6或8中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:27或与SEQ ID NO:27相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:28或与SEQ ID NO:28相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:29或与SEQ ID NO:29相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

12.根据权利要求1至6或9中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:31或与SEQ ID NO:31相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，且

H-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:32或与SEQ ID NO:32相差一个或两个取代、缺失或添加的序列。

13.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:15或与SEQ ID NO:15相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:16或与SEQ ID NO:16相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:17或与SEQ ID NO:17相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:24或与SEQ ID NO:24相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

14.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:18或与SEQ ID NO:18相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:19或与SEQ ID NO:19相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:20或与SEQ ID NO:20相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:27或与SEQ ID NO:27相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

15.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR2的氨基酸序列包含SEQ ID NO:22或与SEQ ID NO:22相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

L-CDR3的氨基酸序列包含SEQ ID NO:23或与SEQ ID NO:23相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

16.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体的所述轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2及SEQ ID NO:3。

17.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体的所述重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5及SEQ ID NO:6。

18.根据权利要求1至6中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体的所述轻链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2及SEQ ID NO:3，且所述抗体的所述重链包含选自由以下组成的组的氨基酸序列：SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5及SEQ IDNO:6。

19.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体为单克隆抗体或重组抗体。

20.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体为抗体片段。

21.根据权利要求20所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体片段选自可变片段(Fv)、单链Fv(scFv)、双特异性抗体(sc(Fv)2)、单链抗体、单域抗体、Fab片段、F(ab')2片段、Fab'片段、二硫键连接的Fv(dsFv)、化学缀合的Fv(ccFv)、双抗体、抗独特型(抗Id)抗体、亲和体、纳米抗体及单抗体。

22.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体包含鼠IgG1类或鼠IgG2a类的恒定区。

23.根据前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中所述抗体结合至固体支持物。

24.一种细胞，所述细胞包含前述权利要求中任一项所述的抗HIV-1抗体。

25.一种核酸，所述核酸包含编码根据权利要求1至20中任一项所述的抗HIV-1抗体的核苷酸序列；可操作地连接至所述核苷酸序列的启动子；及选择标志物。

26.一种细胞，所述细胞包含根据权利要求25所述的核酸。

27.一种组合物，所述组合物包含根据权利要求1至20中任一项所述的抗HIV-1抗体；及固体支持物，其中所述抗HIV-1抗体共价地或非共价地结合至所述固体支持物。

28.根据权利要求27所述的组合物，其中所述固体支持物包含颗粒、珠、膜、表面、多肽芯片、微量滴定板及色谱柱的固相。

29.一种试剂盒，用于检测样品中HIV-1的存在，所述试剂盒包含至少一种根据权利要求1至23中任一项所述的抗HIV-1抗体及固体支持物，其中所述至少一种抗HIV-1抗体共价地或非共价地结合至所述固体支持物。

30.一种抗HIV-1抗体，其特征在于所述抗HIV-1抗体与HIV-1p24蛋白的表位特异性结合，所述HIV-1p24蛋白的表位包含SEQ ID NO:33的氨基酸序列。

31.根据权利要求30所述的抗HIV-1抗体，其中L-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:21或与SEQ ID NO:21相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，

32.根据权利要求30至31中任一项所述的抗HIV-1抗体，其中H-CDR1的氨基酸序列包含SEQ ID NO:30或与SEQ ID NO:30相差一个或两个取代、缺失或添加的序列，