CN115044614A - 一种用于基因靶向与表达的aav-8型血清型的改造型载体及其构建方法及应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种用于基因靶向与表达的腺相关病毒(AAV)8型血清型(AAV‑8)的改造型载体,包括血清型外壳氨基酸序列,插入位点及插入氨基酸序列;在如SEQ ID NO.2所示的AAV‑8型血清型外壳蛋白的第590位氨基酸与第591位氨基酸之间插入如SEQ ID NO.3所示的10个氨基酸序列:LARGDSTKSA,其中第1、第2和第10位的氨基酸为保护氨基酸,第3至第9位氨基酸为筛选获得的氨基酸序列。此外,本发明还公开了该改造型载体的构建方法和应用。本发明改造型载体的荧光效果更强,能够明显且直观的观察,外源基因能够在体内对靶向组织进行高效表达,在使用相同病毒量的情况下,比野生型血清型有更好的表达效果,并且在通过眼球玻璃体注射比野生型血清型有更少的肝脏渗漏表达。

Description

一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体及 其构建方法及应用
技术领域
本发明属于基因工程和生物技术领域,具体涉及一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型的筛选、构建及应用。
背景技术
AAV是一种有DNA缺陷的非致病性细小病毒,重组腺相关病毒载体(rAAV)源于非致病的野生型腺相关病毒,具有免疫原性弱、安全性好、宿主范围广、感染效率高且组织特异性强,是理想的基因表达载体,已经被FDA批准用于临床实验。
目前AAV病毒包装系统中使用AAV病毒外壳蛋白,较多使用的是传统的野生型的AAV1、2、5、8和9型外壳蛋白,并且具有不同的组织或细胞的特异性。这类天然野生型AAV病毒外壳,虽然能够将AAV有效地靶向目的组织进行外源基因的表达,如AAV1可以高效感染骨骼肌细胞,AAV2能够感染视网膜细胞,AAV8型可将外源基因高效传递至肝细胞,AAV9具有跨血脑屏障的能力并将外源基因在中枢神经系统以及脑部表达等等。病毒的天然亲嗜性决定了靶向传递治疗的基础,另一方面也为我们改造这些病毒外壳,使其具有更高的渗透能力,更持久的表达时间以及更低的免疫原性提供了平台。
鉴于AAV已被广泛运用于各类疾病的临床前研究,当务之急是针对天然野生型AAV外壳蛋白的靶向性改造修饰与优化。目前,用于AAV衣壳蛋白进行改造优化的方法有很多,包括DNA shuffling技术、衣壳蛋白氨基酸定点突变和人工插入、删除氨基酸序列改造衣壳蛋白修饰等等。其中,近年来发展而来的基于噬菌体展示系统技术,从随机肽段库中筛选特异靶向的短肽段插入野生型AAV外壳蛋白的特定位点,是一种高效,可行的筛选方法。
AAV介导的眼科疾病的治疗,在临床上具有很广阔的运用前景,其优势在于眼球组织结构清晰、具有透明的屈光间质,易于观察、定位和操作。此外眼球组织还具有免疫赦免性即不易排斥外来物质的特质,例如腺病毒(AdV)、腺相关病毒(AAV)病毒等,使得病毒不论是单一基因还是多基因治疗眼部疾病的可行性都极具潜力。流行病学资料表明,世界各地大多数人感染过野生型AAV,刚出生的婴儿体内就已存在AAV2抗体,因此AAV2较易引起人体自身免疫反应及获得性免疫反应,而AAV8最初是从恒河猴中分离出来的,在血清学上比较独特,与其他血清型的交叉反应最小,免疫原性要比AAV低得多。在许多眼科疾病中,病人的视网膜通常是比较脆弱的,因此临床实践中往往通过玻璃体注射药物的方式而不是视网膜下腔的注射方式进行感染。相关实验表明,野生型AAV8在眼内玻璃体向视网膜等眼后段的传递效率比较弱,并且在实际眼科疾病临床运用中也发现。因此我们拟用定向进化的方法,将7个随机氨基酸片段及3个保护氨基酸,总共10个氨基酸,一同插入AAV-8型野生型外壳的第590-591位氨基酸之间,插入随机短肽展示库,并通过体外表达的方法在目的组织中筛选出随机短肽库中迅速有效筛选出能够通过玻璃体注射感染到视网膜的穿透性好,感染性强,免疫原性低的新型AAV改造型外壳。
发明内容
本发明要解决的技术问题之一是筛选一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体。
本发明要解决的技术问题之二是提供该改造型载体的构建方法。本发明通过眼球玻璃体注射,筛选到一个能感染到视网膜及视网膜色素上皮细胞的新型AAV-8改造型外壳AAV8-590RGD。即通过使用体外进化筛选的方法,在AAV-8野生型外壳的第590位氨基酸和第591外氨基酸之间插入10个氨基酸,其中包括7个随机氨基酸、5’端2个保护氨基酸LA和3’端1个保护氨基酸A。经过两步病毒包装,使得每个AAV病毒外壳只带有独特唯一的10个氨基酸序列插入,并对应其AAV的基因组序列,将这一病毒注射在小鼠的玻璃体中,约1周后取小鼠的视网膜及脉络膜,提取并分析其基因组,观察是否有AAV病毒从玻璃体渗透到视网膜及视网膜色素上皮层。
本发明要解决的技术问题之三是提供该改造型载体AAV8-590RGD的应用。
为解决上述技术问题,本发明采用如下技术方案:
在本发明的第一方面,提供一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体,在如SEQ ID NO.2所示的AAV-8型血清型外壳蛋白的第590位氨基酸与第591位氨基酸之间插入如SEQ ID NO.3所示的10个氨基酸序列:LARGDSTKSA,其中第1、第2和第10位的氨基酸为保护氨基酸,第3至第9位氨基酸为筛选获得的氨基酸序列。
所述如SEQ ID NO.3所示的10个氨基酸序列,其对应的碱基序列如SEQ ID NO.4所示。
所述用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
所述改造型载体插入的氨基酸序列LARGDSTKSA用于AAV病毒包装用的外壳,或者用于生物大分子、抗体药物、肽段和化学小分子的连接及靶向。
本发明构建含有对应如SEQ ID NO.3所示的10个氨基酸序列(7个随机氨基酸序列及3个保护氨基酸)的30个碱基序列的AAV载体,包括CAP基因、REP基因,选择性的标记Ampicillin抗性基因;在所述CAP蛋白的第590位氨基酸与第591位氨基酸对应的碱基之间插入如SEQ ID NO.4所示的相对应的30个碱基。Ampicillin抗性基因即抗生素抗性基因,其目的是使成功导入载体的细菌对抗生素产生抗性,从而能够筛选并扩增AAV载体。
在本发明的第二方面,还提供上述载体的构建方法,该方法包括如下步骤:
第一步,合成随机的21个碱基以及在5’端和3’端添加保护碱基TTGGCT和GCC,插入AAV-8Cap基因的第590位和591位氨基酸对应的碱基序列之中,形成AAV外壳载体;
第二步,将上述AAV外壳载体,电击转化若干个感受态,每个感受态在Luria-Bertani(LB)培养基培养过夜,次日于每个培养基中取菌液混合接种于LB培养基摇菌过夜,剩余菌液甘油保存(随机片段库);质粒抽提,得到混合载体库,命名为pAAV8-590-7aa。
第三步,pAAV8-590-7aa与AAV-8Cap质粒与辅助质粒一起进行AAV病毒包装、纯化,此病毒命名为AAV library transfer shuttles,与腺病毒一起共感染Hek293T细胞,进行第二轮的AAV病毒的包装和纯化;
第四步,将第二轮的AAV病毒进行C57BL/6J品系小鼠的滴眼给药,取视网膜层和脉络膜层,提取视网膜层和脉络膜层的基因组DNA,检测AAV-8Cap基因590位氨基酸对应的碱基序列后的21个氨基酸并测序;
第五步,分析测序结果并PCR扩增随机序列并重复第一步,进行第二轮筛选,分析测序结果,确定10个氨基酸序列,将其插入AAV-8Cap基因的第590位和591位,AAV病毒包装,玻璃体腔注射感染视网膜,脑立体定位注射感染海马,各细胞体外感染实验,比较AAV-8与AAV8-590RGD的感染差异。
作为本发明优选的技术方案,第三步中,所述AAV library transfer shuttles病毒与腺病毒一起共感染Hek293T细胞具体为,所述AAV library transfer shuttles病毒以感染复数值为1的比例,与腺病毒一起共感染Hek293T细胞。
在本发明的第三方面,还提供该改造型载体的应用。所述的改造型载体在制备感染视网膜的产品中的应用,其中感染视网膜可以通过滴眼给药或者玻璃体注射,但不限于这两种给药方式。所述的改造型载体在制备感染小脑、海马、运动皮层、纹状体的产品中的应用,所述感染小脑、海马、运动皮层、纹状体可以通过脑立体定位注射。所述的改造型载体通过体外感染视网膜神经节分离细胞、Neuro2A细胞、U251细胞、ARPE-19细胞、SH-SY-5Y细胞、BV2细胞、HBMEC原代分离细胞、JURKAT细胞、K562细胞和THP1细胞(但不仅限于上述细胞)中的应用。血清型与野生型AAV-8行血清型,在感染不同组织及细胞中的应用与比较。
以上术语说明如下:
AAV外壳载体:能够表达腺相关病毒蛋白质外壳,又称为壳体。衣壳是由病毒衣壳蛋白亚基所形成的寡聚体。衣壳的作用是用于包裹病毒的遗传物质。
AAV-8型:AAV的一种,最初是从恒河猴中分离出来,在血清学上比较独特,与其他血清型的交叉反应最小,免疫原性要比AAV2低。
AAV-8型血清型外壳蛋白:AAV-8病毒的蛋白质外壳,包裹了AAV-8的遗传物质。
野生型AAV-8血清型:未经修饰或改造的天然AAV-8病毒所具有的抗原。基因靶向与表达:将目的基因定向递送至目标细胞或者组织并进行基因表达。
保护氨基酸:连接插入的氨基酸与原外壳氨基酸的连接氨基酸,用于稳定蛋白构象及功能。
随机氨基酸序列:由随机碱基序列合成的随机碱基序列,其对应相应的随机氨基酸序列。
与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:本发明载体包括血清型外壳氨基酸序列,插入位点及插入氨基酸序列,在所述的AAV-8野生型血清型的基础上,将7个随机氨基酸片段及3个保护氨基酸,总共10个氨基酸,一同插入AAV-8型野生型外壳的第590-591位氨基酸之间,插入随机短肽展示库,并通过体外表达的方法在目的组织中筛选出随机短肽库中迅速有效筛选出能够通过玻璃体注射感染到视网膜的穿透性好,感染性强,免疫原性低的新型AAV改造型外壳。本发明改造型载体的荧光效果更强,能够明显且直观的观察,外源基因能够在体内对靶向组织进行高效表达,在使用相同病毒量的情况下,比野生型血清型有更好的表达效果,并且在通过眼球玻璃体注射比野生型血清型有更少的肝脏渗漏表达。
与野生型AAV-8血清型相比,本发明AAV8-590RGD血清型改造型载体在感染不同组织及细胞中的应用与比较实验显示,本发明具有如下有益效果:
AAV-8改造型血清型能够更好地通过玻璃体注射,感染小鼠视网膜(图3)(图4),并且在肝脏中有更少的渗漏表达(图5)。
AAV-8改造型血清型能够更好地通过体外感染包括但不仅限于视网膜神经节分离细胞(图6)、Neuro2A细胞(图7)、U251细胞(图8)、SH-SY-5Y细胞(图10)、HBMEC原代分离细胞(图12)、JURKAT细胞(图13)。
AAV-8改造型血清型能够更好地通过脑立体定位注射,感染包括但不仅限于小鼠小脑(图16)、海马(图17)和纹状体(图19)。
附图说明
图1为本发明实施例1中AAV8-590RGD载体结构示意图。
图2为本发明实施例3中筛选到的AAV8-590RGD血清型碱基测序结果示意图。
图3为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,分别注射玻璃体腔,感染视网膜(平铺)的情况示意图;其中,图3(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图3(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图4为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,分别注射玻璃体腔,感染视网膜(切片)区域的情况示意图;其中,图4(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图4(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图5为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,分别注射玻璃体腔,感染眼球,大脑及各个脏器的活体成像情况示意图;其中,图5(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图5(B)代表代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图6为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染视网膜神经节分离细胞的情况示意图;其中,图6(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图6(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图7为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染Neuro2A细胞的情况示意图;其中,图7(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图7(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图8为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染U251细胞的情况示意图;其中,图8(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图8(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图9为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染ARPE-19细胞的情况示意图;其中,图9(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图9(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图10为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染SH-SY-5Y细胞的情况示意图;其中,图10(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图10(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图11为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染BV2细胞的情况示意图;其中,图11(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图11(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图12为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染HBMEC原代分离细胞的情况示意图;其中,图12(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图12(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图13为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染JURKAT细胞的情况示意图;其中,图13(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图13(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图14为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染K562细胞的情况示意图;其中,图14(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图14(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图15为本发明实施例4中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染THP1细胞的情况示意图;其中,图15(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图15(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图16为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染小鼠小脑的情况示意图;其中,图16(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图16(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图17为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染小鼠海马的情况示意图;其中,图17(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图17(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图18为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染小鼠运动皮层的情况示意图;其中,图18(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图18(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
图19为本发明实施例5中筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒,与野生的AAV8血清型包装的病毒,感染小鼠纹状体的情况示意图;其中,图19(A)代表野生的AAV8血清型包装的病毒;图19(B)代表本发明筛选到的AAV8-590RGD血清型包装的病毒。
具体实施方式
下面结合具体实施例进一步阐述此发明。应理解的是,在此描述的特定实施方式通过举例的方式来表示,并不作为对本发明的限制。在不偏离本发明范围的情况下,本发明的主要特征可以用于各种实施方式。
实施例1载体构建
序列设计和合成的具体方法和步骤如下:
(1)根据GeneBank中AAV8型包装质粒的Cap的基因信息,设计BsmBI-AAV8 Cap(482-655aa)-BsmBI基因DNA片段,合成双链DNA分子;
(2)分别用合成的引物pAAV8-590-7aa-F(如SEQ ID NO.5所示,即正向引物Primer1)和pAAV8-590-7aa-R(如SEQ ID NO.6所示,即反向引物Primer2)来PCR步骤(1)合成的双链DNA分子,得到PCR产物。
步骤(2)中,所述PCR的体系如下:32.5μLH2O,10μL 5×Buffer缓冲液(含有Mg2+),4μL dNTP(各2.5mM),1μL正向引物Primer1(+),1μL反向引物Primer2(-)(10μM),1μL目的基因模板DNA,以及0.5μL的PrimeSTAR酶,组成反应体系;
所述PCR程序如下:98℃,变性3分钟;退火98℃10秒,55℃15秒,72℃1分钟,重复30个循环;延伸72℃10分钟。
将序列插入位点的具体方法和步骤如下:
1)用限制性内切酶BsmBI酶切病毒载体Rep-AAV8-Cap,回收载体骨架;
2)将步骤(2)的PCR产物和步骤1)的载体骨架重组,转化进大肠杆菌,筛选阳性菌并提取其质粒,得到重组载体。
步骤1)中,所述酶切体系为:BsmBI:1μL,缓冲液:3μL,Rep-AAV8-Cap质粒:1μg,补充水至30μL;37℃酶切4小时。
步骤2)中,所述重组体系为:重组酶:15μL,回收的PCR产物DNA:40ng,回收的质粒:20ng;42℃水浴30min后,转化进大肠杆菌。
pAAV8-590-7aa-F:AGGACCCTGTTACCGCCAAC,如SEQ ID NO:5所示
pAAV8-590-7aa-R:GATGTTTCAGGCCAAAGCCG,如SEQ ID NO:6所示
如图1所示,构建完成的pAAV8-590RGD载体结构,其中包含有氨苄的抗性基因、AAV的复制基因、AAV8的外壳蛋白基因,其中包含有随机碱基序列,对应10个氨基酸序列:LARGDSTKSA,,如SEQ ID NO:3所示。
实施例2 AAV病毒包装
(一)AAV-293细胞的冻存
随着传代的次数增加,AAV-293细胞会出现生长状态下降、突变等。为了防止此类现象的出现,我们需要在开始就对细胞进行大量冻存,以保证实验的稳定性和持续性。在细胞对数生长期进行冻存,增加细胞复苏成活率。
1、去掉
细胞培养上清液,加入PBS洗去残留的培养基;
2、加入0.25%的胰酶,消化1-2min后,镜下观察细胞变圆,细胞间间隙加大时,去除胰酶,加入新鲜培养基吹打混匀,移入离心管中。
3、细胞计数,将细胞全部晃下,加入3mL 37℃预热的10%DMEM,用10mL移液管进行吹打,较大力吹打6-8次即可,不留死角,之后,将所有细胞吸出,置于15mL离心管中,取50μL混匀后的细胞于1.5mLeppendorf管中,加入450μL 10%DMEM,即为10倍稀释,混匀,取10μL细胞于计数板中计数。计数板上共4大格,每大格16小格。计数时,4大格均计数,总数除以4(得每大格细胞数),再乘以10(10倍稀释),即为实际n万/mL细胞浓度。
4、细胞离心,1000rpm/min,5min。去掉上清。
5、根据细胞计数,结果加入细胞冻存液(70%完全培养基+20%FBS+10%DMSO)重悬细胞,密度为3x106个/mL。
6、分装进细胞冻存管,放入冻存盒中,放入-80℃超低温冰箱。
7、第二天将细胞放于液氮罐中长久保存,并作记录。保存过程中,要不时复苏细胞检测细胞存活率,观察细胞状态等。
(二)AAV-293细胞的传代
当细胞生长到汇合率达到80%~90%时需要对细胞进行传代操作,以扩大细胞数量,维持细胞良好的生长状态。
1、消化细胞,方法同细胞冻存。
2、细胞离心结束后,加入完全培养基重悬。
3、根据具体情况,将细胞分到10cm培养皿中,每个培养皿补足到10mL培养基。
(三)AAV-293细胞的复苏
当细胞传代次数过多,细胞状态变差时,或者细胞出现污染事故时,需要丢弃并对最初冻存的细胞进行复苏。
1、设置温度为37~42℃的水浴。
2、查看细胞库记录,根据记录从液氮罐中取出冻存的细胞(需戴上棉手套,防止被冻伤),迅速丢入水浴锅中并快速晃动,尽量在1~2min内使细胞溶液完全溶解。
3、将细胞溶液转移到15mL离心管中,并在其中加上1mL新鲜的完全培养基,混匀后离心,1000rpm/min,5min。
4、去掉上清,加入5mL新鲜的完全培养基,混匀沉淀后,转入6cm培养皿。
5、将培养皿平稳放入37℃、5%CO2和95%相对湿度的培养箱中培养。
6、第二天观察细胞存活率。给细胞换一下培养基。以后每天观察细胞生长情况。
(四)AAV包装和浓缩
1.质粒扩增
构建好的AAV载体、包装质粒和辅助质粒需经过大量抽提,浓度大于1μg/μL,A260/280在1.7-1.8间方可用以包毒。推荐使用Qiagen大抽试剂盒进行质粒的大量去内毒素抽提。
2.传AAV-293细胞
将培养AAV-293细胞T75瓶中的培养基吸净,加入2mL 4度冰箱取出的0.25%胰酶,使其均匀覆盖瓶底,置于37度培养箱中3-5min,取出,摇晃可发现细胞于底部脱离,将其全部晃下,加入3mL 37度水浴中预热的10%DMEM,移液枪用10mL移液管进行吹打,较大力吹打6-8次即可,不留死角,瓶口处较难吹打可将移液管对准培口,小力将培养基打出即可覆盖到接近瓶口的细胞。之后,将所有细胞吸出,置于15mL离心管中,取50μL混匀后的细胞于1.5mL eppendorf管中,加入450μL 10%DMEM,即为10倍稀释,混匀,取10μL细胞于计数板中计数。计数板上共4大格,每大格16小格。计数时,4大格均计数,总数除以4(得每大格细胞数),再乘以10(10倍稀释),即为实际n万/mL细胞浓度。传代当天记为第一天,若第二天进行转染,铺900-1000万/T75;若第三天转染,铺350-400万/T75。每瓶T75加10mL 10%DMEM培养基。转染当天观察细胞密度,80-90%满即可进行转染。转染前无需换培养基。
3.做脂转complex
Figure BDA0002966762370000091
注:LipofiterTM转染试剂为汉恒生物产品,使用说明参考LipofiterTM说明书。
4.AAV病毒收毒:
病毒颗粒同时存在于包装细胞和培养上清中。可以将细胞和培养上清都收集下来以获得最好的收率。
1)准备一个干冰乙醇浴(将乙醇倾入装有干冰的泡沫盒即可,也可用液氮替代干冰乙醇浴)和37℃水浴;
2)将产毒的细胞连同培养基一同收集到一个15mL的离心管中。收集细胞时,将培养盘倾斜一定角度将细胞刮到培养基中;
3)1000rpm/min,离心3分钟,分离细胞和上清,将上清另外存放,细胞用1mL PBS重悬;
4)将细胞悬浮液在干冰乙醇浴和37℃水浴中反复转移,冻融四次。每次融解后稍加震荡。注意:每次凝固和解冻大概需要十分钟的时间。
5.AAV病毒浓缩:
1)10,000g离心去除细胞碎片,将离心上清转移到一个新离心管中。
2)将两次收集的上清混合在一起,用0.45μm滤器过滤除杂质
3)加入1/2体积的1M NaCl,10%PEG8000溶液,混合均匀,4度过夜
4)12,000rpm离心2h,弃上清,病毒沉淀用适量的PBS溶液溶解,待完全溶解后用0.22μm滤器过滤除菌。
5)加入Benzonase核酸酶消化去除残留的质粒DNA(终浓度为50U/mL)。合上管盖,颠倒几次以充分混合。在37℃孵育30分钟;
6)用0.45μm过滤头过滤,取滤出液,即为浓缩的AAV病毒。
6.AAV的纯化
1)向病毒浓缩液中添加固体CsCl直到密度为1.41g/mL(折射率为1.372);
2)将样品加入到超速离心管中,用预先配好的1.41g/mL CsCl溶液将离心管剩余空间填满;
3)在175,000g下离心24小时,以形成密度梯度。按顺序分步收集不同密度的样品,取样进行滴度测定。收集富集有AAV颗粒的组分;
4)重复上述过程一次。
5)将病毒装入100kDa的透析袋,4度透析脱盐过夜。此即为纯化的AAV病毒
AAV病毒包装滴度测定(采用Q-PCR法)
1)取20μL浓缩病毒液,加入1μL RNAse-free DNAse,混匀,37℃水浴反应30min。
2)4℃,12 000rpm/min,离心10min,取10μL上清到另一个无菌的1.5mL EP管中。
3)加入90μL Dilution Buffer(1mM Tris-HCl,pH 8.0,0.1mM EDTA,150mMNaCl),混匀,37℃金属浴反应30min。
4)自然冷却至室温,加入1μL蛋白酶K,65℃水浴反应1h。
5)100℃金属浴反应10min,自然冷却至室温。
6)进行Q-PCR检测滴度。
AAV病毒的储存、稀释
1.病毒的储存:
收到病毒液后在很短时间内即使用腺相关病毒进行实验,可以将病毒暂时放置于4℃保存;如需长期保存请放置于-80℃(病毒置于冻存管,并使用封口膜封口)。
1)病毒可以存放于-80℃6个月以上;但如果病毒储存时间超过6个月,建议在使用前需要重新测定病毒滴度。
2)反复冻融会降低病毒滴度:每次冻融会降低病毒滴度10%;因此在病毒使用过程中应尽量避免反复冻融,为避免反复冻融,建议收到病毒后按照每次的使用量进行分装。
2.病毒的稀释:
如果需要稀释病毒,请将病毒取出置于冰浴融解后,使用PBS缓冲液或培养目的细胞无血清培养基(含血清或含双抗不影响病毒感染)。混匀分装后4℃保存(请尽量在三天内用完)分装后使用。
AAV使用安全注意事项
1.病毒操作时最好使用生物安全柜。如果使用普通超净工作台操作病毒,请不要打开排风机。
2.病毒操作时请穿实验服,带口罩和手套。
3.操作病毒时特别小心不要产生气雾或飞溅。如果操作时超净工作台有病毒污染,请立即用70%乙醇加1%SDS溶液擦拭干净。接触过病毒的枪头、离心管、培养板、培养液等请用84消毒液或1%SDS中浸泡过夜后弃去。
4.用显微镜观察细胞感染情况时应遵从以下步骤:拧紧培养瓶或盖紧培养板。用70%乙醇清理培养瓶外壁后到显微镜处观察拍照。离开显微镜实验台之前,用70%乙醇清理显微镜实验台。
5.如需要离心,应使用密封性好的离心管,或者用封口膜封口后离心,而且尽量使用组织培养室内的离心机。
6.脱掉手套后,用肥皂和水清洗双手。
实施例3含有随机序列的AAV外壳包装的病毒,小鼠玻璃体腔注射及视网膜提取
1.麻醉:4.3%水合氯醛0.01mL/g;
2.散瞳液散瞳,甲基纤维素保持眼表湿润;
3.调整小鼠头位,注射之位置:角膜缘后约1mm;
4.用33G注射器做切口,针尖垂直进入,随后倾斜,将每个AAV外壳都含有特定氨基酸序列的AAV外壳蛋白库病毒,缓慢推注入小鼠玻璃体腔,注射后,留针0.5-1min,迅速出针;
5.约一周后麻醉处死小鼠,取目的组织视网膜及视网膜色素上皮,提取其基因组,测序分析目的组织中渗透进入的AAV外壳序列;
由测序结果分析基因组中所含AAV序列(见图2),方框表示测序获得的插入的含有21个随机碱基序列的总共30个碱基,其中21个随机碱基序列测序结果主峰比较明显,阅读分析得到ttggctagaggtgatagcacaaagtctgcc碱基序列。
实施例4 AAV-8及AAV8-590RGD外壳分别包装的病毒,细胞感染及荧光比较
1.在细胞库表格里查询好所需细胞的位置;
2.将细胞从液氮罐中取出,迅速置于37度水浴锅,不停轻轻摇晃;
3.将内部液体完全融化的冻存管,置于离心机中以800RPM离心5min;
4.离心结束后,将离心管中上清倒去;
5.向冻存管中加入1mL相应的培养基,轻轻吹打均匀,使成为单细胞悬液;
6.取合适大小的皿(通常为10cm或6cm皿),加入培养基;
7.将冻存管中已经吹打均匀的细胞悬液加入皿中;
8.以米子形手法摇晃细胞培养皿,使其均匀混合;
9.将摇晃好的细胞培养皿置于37度培养箱;
10.第二天,将皿取出置于显微镜下观察,进行换液等后续操作;
11.将密度为80%的细胞从培养箱取出;
12.吸掉皿中原有培养基;
13.加入3mLPBS缓冲液,均匀摇晃皿,使PBS可清洗到皿每个角落;
14.洗掉清洗用的PBS缓冲液;
15.加入1mL胰酶,均匀摇晃皿,使胰酶可均匀接触到皿每个角落;
16.将加完胰酶已摇晃均匀的皿放回37度培养箱;
17.消化一定时间(一般为1min到2min之间),取出细胞皿;
18.将皿拿于左手,用右手沿着皿壁轻轻拍打,看到细胞有滑落即为消化好;
19.上一步操作也可换为在显微镜下见细胞变圆即可;
20.加入2mL相应培养基与10cm皿中终止消化;
21.均匀摇晃已经加入终止液的细胞皿;
22.使用1mL移液器,对细胞进行吹打,使其成为单细胞悬液;
23.吹打结束后,吸取全部液体到5mL离心管;
24.将离心管标记好之后,置于离心机中以800RPM离心5min;
25.离心结束后,将离心管中上清倒去;
26.加入2mL相应培养基重悬细胞使其成为单细胞悬液;
27.以一定数量将细胞分到孔板中;
28.将孔板中细胞和培养基混匀;
29.将孔板置于37度培养箱培养;
30.侵染前一天,细胞铺孔板(见上述步骤);
31.胞铺板后12小时即可以侵染;
32.细胞铺板12小时后,准备好相应病毒/丁酸钠;
33.按照细胞对应的MOI值,取适量病毒于2%血清的培养基混匀;
34.按照1:1000的比例,加入丁酸钠;;
35.将孔板换液为2%血清培养基
36.将病毒-丁酸钠混合液加入到孔板中,摇晃均匀;
37.将孔板置于37摄氏度培养箱培养;
38.培养6小时后,将孔板取出,吸掉里面的所有液体;
39.加入一定量新鲜的培养基,继续放置于37摄氏度培养箱培养;
40.一定时间后进行(荧光)拍照,送样;
图6-图15代表相同病毒量的AAV-8(A)和AAV8-590RGD(B)外壳分别包装的病毒,感染视网膜神经节分离细胞(图6)、Neuro2A细胞(图7)、U251细胞(图8)、ARPE-19细胞(图9)、SH-SY-5Y细胞(图10)、BV2细胞(图11)、HBMEC原代分离细胞(图12)、JURKAT细胞(图13)、K562细胞(图14)、THP1(图15)细胞的荧光情况。其中AAV8-590RGD外壳包装的病毒感染视网膜神经节分离细胞(图6)、Neuro2A细胞(图7)、U251细胞(图8)、SH-SY-5Y细胞(图10)、HBMEC原代分离细胞(图12)、JURKAT细胞(图13)比AAV-8外壳包装的病毒具有更好的感染效率。
实施例5 AAV-8及AAV8-590RGD外壳包装的病毒,小鼠玻璃体腔注射、脑定位注射,感染区域比较
(一)玻璃体腔注射(见实施例3)
(二)小鼠脑立体定位注射步骤如下:
1.麻醉
1)用麻药如戊巴比妥钠、水合氯醛或异氟烷/氧气混合气体将小鼠麻醉,麻醉程度适中;
2.固定
1)打开冷光源提供照明,将已麻醉的小鼠固定在脑立体定位注射仪上;
2)固定头颅:先将一侧耳棒轻轻插入外耳道,碰到骨性外耳道底后固定耳棒,继之同样插入固定另一耳棒,检查小鼠头部固定是否稳定,松斜,两侧耳棒刻度是否对称,轻移耳棒使两侧刻度一致头位完全居中,再次固定耳棒;
3)固定上颌:将小鼠的上门牙塞进上齿固定板的槽内,旋紧螺丝。从各方向推压动物头部,均不应出现移动。通过定位针的测量调节前后囟在同一矢状线上,并使前囟(Bregma)和后囟(Lambda)尽量处于同一水平面上;
3.钻孔
1)将小鼠头部的毛用宠物剃毛刀剃掉,然后用医用酒精和碘酒对头部消毒,防止感染;
2)将眼药膏抹在动物眼睛上,保持眼睛湿润,防止动物眼睛由于长时间处于干涩状态而失明;
3)用医用剪刀剪开从两眼间到两耳根间的头皮;
4)用止血钳将开口撑大,用蘸有双氧水的棉棒擦拭并去除颅骨表面硬脑膜(Dura);
5)利用定位仪,保证前囟(Bregma,X=0,Y=0,Z=0)和后囟(Lambda)处于同一水平面上(X、Z值相差皆小于0.1);
6)根据脑图谱,确定待注射脑区的位置参数;
7)利用定位仪找到要注射病毒的位置,用记号笔在颅骨上做好标记;
8)用颅骨转在注射位点处轻磨颅骨,将颅骨慢慢打薄,当颅骨出现裂缝的时候,用医用注射器的针头小心挑破,防止损伤;
4.病毒注射
1)用PBS冲洗微量注射器(5μL规格)3-5次;
2)先吸取约1μL空气,再吸取约1μL稀释好的病毒,在空气中测试注射器是否通畅;
3)将微量注射泵,微量注射器组装好,置于钻好的孔上方,针尖与颅骨平行(Z=0),微调注射器位置使之与之前钻孔时位置相同;
4)根据定好的深度将注射针缓慢下降;
5)以0.05μL/min的速度注射病毒,待还剩0.5μL时停止注射;
6)注射完毕后,将注射针停留在注射位置10min待病毒扩散,然后缓慢提针;
7)用PBS清洗微量注射器5次备用;
8)注意注射过程中若有出血立刻用棉签吸走,以免带出病毒;
5.缝合
1)注射针完全拔出来后将头皮缝合;
2)实验结束后,将小鼠放在温度合适(25℃左右)的地方(如恒温加热板)恢复,等小鼠清醒即可放回笼子中饲养;
6.检测
1)注射过病毒的小鼠饲养3-4周后,脱颈处死,取脑,4%多聚甲醛固定约1天,20%和30%蔗糖溶液脱水;
2)冰冻切片,厚度为10μm。荧光显微镜下观察荧光;
图3、图4、图5代表相同病毒量的AAV-8(A)和AAV8-590RGD(B)外壳分别包装的病毒,通过玻璃体注射,取视网膜瓶体(图3)和视网膜冰冻切片(图4)和活体成像(图5)观察表达效果,发现AAV8-590RGD外壳包装的病毒具有更好的感染效率和更低的脏器渗漏。脑立体定位注射,感染小鼠小脑(图16)、小鼠海马(图17)、小鼠脑运动皮层(图18)和小鼠脑纹状体(图19)的荧光情况。其中AAV8-590RGD外壳包装的病毒感染鼠小脑(图16)、小鼠海马(图17)和小鼠脑纹状体(图19)比AAV-8外壳包装的病毒具有更好的感染效率。
序列表
<110>上海生博生物医药科技有限公司
<120>一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型的筛选、构建及应用
<130> WH-NP-20-100700
<160> 6
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 7320
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 1
ccgccatgcc ggggttttac gagattgtga ttaaggtccc cagcgacctt gacgagcatc 60
tgcccggcat ttctgacagc tttgtgaact gggtggccga gaaggaatgg gagttgccgc 120
cagattctga catggatctg aatctgattg agcaggcacc cctgaccgtg gccgagaagc 180
tgcagcgcga ctttctgacg gaatggcgcc gtgtgagtaa ggccccggag gctcttttct 240
ttgtgcaatt tgagaaggga gagagctact tccacatgca cgtgctcgtg gaaaccaccg 300
gggtgaaatc catggttttg ggacgtttcc tgagtcagat tcgcgaaaaa ctgattcaga 360
gaatttaccg cgggatcgag ccgactttgc caaactggtt cgcggtcaca aagaccagaa 420
atggcgccgg aggcgggaac aaggtggtgg atgagtgcta catccccaat tacttgctcc 480
ccaaaaccca gcctgagctc cagtgggcgt ggactaatat ggaacagtat ttaagcgcct 540
gtttgaatct cacggagcgt aaacggttgg tggcgcagca tctgacgcac gtgtcgcaga 600
cgcaggagca gaacaaagag aatcagaatc ccaattctga tgcgccggtg atcagatcaa 660
aaacttcagc caggtacatg gagctggtcg ggtggctcgt ggacaagggg attacctcgg 720
agaagcagtg gatccaggag gaccaggcct catacatctc cttcaatgcg gcctccaact 780
cgcggtccca aatcaaggct gccttggaca atgcgggaaa gattatgagc ctgactaaaa 840
ccgcccccga ctacctggtg ggccagcagc ccgtggagga catttccagc aatcggattt 900
ataaaatttt ggaactaaac gggtacgatc cccaatatgc ggcttccgtc tttctgggat 960
gggccacgaa aaagttcggc aagaggaaca ccatctggct gtttgggcct gcaactaccg 1020
ggaagaccaa catcgcggag gccatagccc acactgtgcc cttctacggg tgcgtaaact 1080
ggaccaatga gaactttccc ttcaacgact gtgtcgacaa gatggtgatc tggtgggagg 1140
aggggaagat gaccgccaag gtcgtggagt cggccaaagc cattctcgga ggaagcaagg 1200
tgcgcgtgga ccagaaatgc aagtcctcgg cccagataga cccgactccc gtgatcgtca 1260
cctccaacac caacatgtgc gccgtgattg acgggaactc aacgaccttc gaacaccagc 1320
agccgttgca agaccggatg ttcaaatttg aactcacccg ccgtctggat catgactttg 1380
ggaaggtcac caagcaggaa gtcaaagact ttttccggtg ggcaaaggat cacgtggttg 1440
aggtggagca tgaattctac gtcaaaaagg gtggagccaa gaaaagaccc gcccccagtg 1500
acgcagatat aagtgagccc aaacgggtgc gcgagtcagt tgcgcagcca tcgacgtcag 1560
acgcggaagc ttcgatcaac tacgcagaca ggtaccaaaa caaatgttct cgtcacgtgg 1620
gcatgaatct gatgctgttt ccctgcagac aatgcgagag aatgaatcag aattcaaata 1680
tctgcttcac tcacggacag aaagactgtt tagagtgctt tcccgtgtca gaatctcaac 1740
ccgtttctgt cgtcaaaaag gcgtatcaga aactgtgcta cattcatcat atcatgggaa 1800
aggtgccaga cgcttgcact gcctgcgatc tggtcaatgt ggatttggat gactgcatct 1860
ttgaacaata aatgatttaa atcaggtatg gctgccgatg gttatcttcc agattggctc 1920
gaggacaacc tctctgaggg cattcgcgag tggtgggcgc tgaaacctgg agccccgaag 1980
cccaaagcca accagcaaaa gcaggacgac ggccggggtc tggtgcttcc tggctacaag 2040
tacctcggac ccttcaacgg actcgacaag ggggagcccg tcaacgcggc ggacgcagcg 2100
gccctcgagc acgacaaggc ctacgaccag cagctgcagg cgggtgacaa tccgtacctg 2160
cggtataacc acgccgacgc cgagtttcag gagcgtctgc aagaagatac gtcttttggg 2220
ggcaacctcg ggcgagcagt cttccaggcc aagaagcggg ttctcgaacc tctcggtctg 2280
gttgaggaag gcgctaagac ggctcctgga aagaagagac cggtagagcc atcaccccag 2340
cgttctccag actcctctac gggcatcggc aagaaaggcc aacagcccgc cagaaaaaga 2400
ctcaattttg gtcagactgg cgactcagag tcagttccag accctcaacc tctcggagaa 2460
cctccagcag cgccctctgg tgtgggacct aatacaatgg ctgcaggcgg tggcgcacca 2520
atggcagaca ataacgaagg cgccgacgga gtgggtagtt cctcgggaaa ttggcattgc 2580
gattccacat ggctgggcga cagagtcatc accaccagca cccgaacctg ggccctgccc 2640
acctacaaca accacctcta caagcaaatc tccaacggga catcgggagg agccaccaac 2700
gacaacacct acttcggcta cagcaccccc tgggggtatt ttgactttaa cagattccac 2760
tgccactttt caccacgtga ctggcagcga ctcatcaaca acaactgggg attccggccc 2820
aagagactca gcttcaagct cttcaacatc caggtcaagg aggtcacgca gaatgaaggc 2880
accaagacca tcgccaataa cctcaccagc accatccagg tgtttacgga ctcggagtac 2940
cagctgccgt acgttctcgg ctctgcccac cagggctgcc tgcctccgtt cccggcggac 3000
gtgttcatga ttccccagta cggctaccta acactcaaca acggtagtca ggccgtggga 3060
cgctcctcct tctactgcct ggaatacttt ccttcgcaga tgctgagaac cggcaacaac 3120
ttccagttta cttacacctt cgaggacgtg cctttccaca gcagctacgc ccacagccag 3180
agcttggacc ggctgatgaa tcctctgatt gaccagtacc tgtactactt gtctcggact 3240
caaacaacag gaggcacggc aaatacgcag actctgggct tcagccaagg tgggcctaat 3300
acaatggcca atcaggcaaa gaactggctg ccaggaccct gttaccgcca acaacgcgtc 3360
tcaacgacaa ccgggcaaaa caacaatagc aactttgcct ggactgctgg gaccaaatac 3420
catctgaatg gaagaaattc attggctaat cctggcatcg ctatggcaac acacaaagac 3480
gacgaggagc gtttttttcc cagtaacggg atcctgattt ttggcaaaca aaatgctgcc 3540
agagacaatg cggattacag cgatgtcatg ctcaccagcg aggaagaaat caaaaccact 3600
aaccctgtgg ctacagagga atacggtatc gtggcagata acttgcagca gcaaaacttg 3660
gctagaggtg atagcacaaa gtctgccacg gctcctcaaa ttggaactgt caacagccag 3720
ggggccttac ccggtatggt ctggcagaac cgggacgtgt acctgcaggg tcccatctgg 3780
gccaagattc ctcacacgga cggcaacttc cacccctctc cgctgatggg cggctttggc 3840
ctgaaacatc ctccgcctca gatcctgatc aagaacacgc ctgtacctgc ggatcctccg 3900
accaccttca accagtcaaa gctgaactct ttcatcacgc aatacagcac cggacaggtc 3960
agcgtggaaa ttgaatggga gctgcagaag gaaaacagca agcgctggaa ccccgagatc 4020
cagtacacct ccaactacta caaatctaca agtgtggact ttgctgttaa tacagaaggc 4080
gtgtactctg aaccccgccc cattggcacc cgttacctca cccgtaatct gtaattgcct 4140
gttaatcaat aaaccggttg attcgtttca gttgaacttt ggtctctgcg aagggcgaat 4200
tcgtttaaac ctgcaggact agaggtcctg tattagaggt cacgtgagtg ttttgcgaca 4260
ttttgcgaca ccatgtggtc acgctgggta tttaagcccg agtgagcacg cagggtctcc 4320
attttgaagc gggaggtttg aacgcgcagc cgccaagccg aattctgcag atatccatca 4380
cactggcggc cgctcgacta gagcggccgc caccgcggtg gagctccagc ttttgttccc 4440
tttagtgagg gttaattgcg cgcttggcgt aatcatggtc atagctgttt cctgtgtgaa 4500
attgttatcc gctcacaatt ccacacaaca tacgagccgg aagcataaag tgtaaagcct 4560
ggggtgccta atgagtgagc taactcacat taattgcgtt gcgctcactg cccgctttcc 4620
agtcgggaaa cctgtcgtgc cagctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg 4680
gtttgcgtat tgggcgctct tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc 4740
ggctgcggcg agcggtatca gctcactcaa aggcggtaat acggttatcc acagaatcag 4800
gggataacgc aggaaagaac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa 4860
aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc 4920
gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc 4980
ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg 5040
cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt 5100
cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc 5160
gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc 5220
cactggcagc agccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag 5280
agttcttgaa gtggtggcct aactacggct acactagaag aacagtattt ggtatctgcg 5340
ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa 5400
ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag 5460
gatctcaaga agatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact 5520
cacgttaagg gattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttaa 5580
attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt 5640
accaatgctt aatcagtgag gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag 5700
ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta cgatacggga gggcttacca tctggcccca 5760
gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct caccggctcc agatttatca gcaataaacc 5820
agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt 5880
ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg 5940
ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca 6000
gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg 6060
ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca 6120
tggttatggc agcactgcat aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg 6180
tgactggtga gtactcaacc aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct 6240
cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg cgccacatag cagaacttta aaagtgctca 6300
tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca 6360
gttcgatgta acccactcgt gcacccaact gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg 6420
tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac 6480
ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt 6540
attgtctcat gagcggatac atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc 6600
cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccaccta aattgtaagc gttaatattt tgttaaaatt 6660
cgcgttaaat ttttgttaaa tcagctcatt ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat 6720
cccttataaa tcaaaagaat agaccgagat agggttgagt gttgttccag tttggaacaa 6780
gagtccacta ttaaagaacg tggactccaa cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg 6840
cgatggccca ctacgtgaac catcacccta atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa 6900
agcactaaat cggaacccta aagggagccc ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc 6960
gaacgtggcg agaaaggaag ggaagaaagc gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag 7020
tgtagcggtc acgctgcgcg taaccaccac acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg 7080
cgcgtcccat tcgccattca ggctgcgcaa ctgttgggaa gggcgatcgg tgcgggcctc 7140
ttcgctatta cgccagctgg cgaaaggggg atgtgctgca aggcgattaa gttgggtaac 7200
gccagggttt tcccagtcac gacgttgtaa aacgacggcc agtgagcgcg cgtaatacga 7260
ctcactatag ggcgaattgg gtaccgggcc ccccctcgat cgaggtcgac ggtatcgggg 7320
<210> 2
<211> 7336
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 2
ccgccatgcc ggggttttac gagattgtga ttaaggtccc cagcgacctt gacgagcatc 60
tgcccggcat ttctgacagc tttgtgaact gggtggccga gaaggaatgg gagttgccgc 120
cagattctga catggatctg aatctgattg agcaggcacc cctgaccgtg gccgagaagc 180
tgcagcgcga ctttctgacg gaatggcgcc gtgtgagtaa ggccccggag gctcttttct 240
ttgtgcaatt tgagaaggga gagagctact tccacatgca cgtgctcgtg gaaaccaccg 300
gggtgaaatc catggttttg ggacgtttcc tgagtcagat tcgcgaaaaa ctgattcaga 360
gaatttaccg cgggatcgag ccgactttgc caaactggtt cgcggtcaca aagaccagaa 420
atggcgccgg aggcgggaac aaggtggtgg atgagtgcta catccccaat tacttgctcc 480
ccaaaaccca gcctgagctc cagtgggcgt ggactaatat ggaacagtat ttaagcgcct 540
gtttgaatct cacggagcgt aaacggttgg tggcgcagca tctgacgcac gtgtcgcaga 600
cgcaggagca gaacaaagag aatcagaatc ccaattctga tgcgccggtg atcagatcaa 660
aaacttcagc caggtacatg gagctggtcg ggtggctcgt ggacaagggg attacctcgg 720
agaagcagtg gatccaggag gaccaggcct catacatctc cttcaatgcg gcctccaact 780
cgcggtccca aatcaaggct gccttggaca atgcgggaaa gattatgagc ctgactaaaa 840
ccgcccccga ctacctggtg ggccagcagc ccgtggagga catttccagc aatcggattt 900
ataaaatttt ggaactaaac gggtacgatc cccaatatgc ggcttccgtc tttctgggat 960
gggccacgaa aaagttcggc aagaggaaca ccatctggct gtttgggcct gcaactaccg 1020
ggaagaccaa catcgcggag gccatagccc acactgtgcc cttctacggg tgcgtaaact 1080
ggaccaatga gaactttccc ttcaacgact gtgtcgacaa gatggtgatc tggtgggagg 1140
aggggaagat gaccgccaag gtcgtggagt cggccaaagc cattctcgga ggaagcaagg 1200
tgcgcgtgga ccagaaatgc aagtcctcgg cccagataga cccgactccc gtgatcgtca 1260
cctccaacac caacatgtgc gccgtgattg acgggaactc aacgaccttc gaacaccagc 1320
agccgttgca agaccggatg ttcaaatttg aactcacccg ccgtctggat catgactttg 1380
ggaaggtcac caagcaggaa gtcaaagact ttttccggtg ggcaaaggat cacgtggttg 1440
aggtggagca tgaattctac gtcaaaaagg gtggagccaa gaaaagaccc gcccccagtg 1500
acgcagatat aagtgagccc aaacgggtgc gcgagtcagt tgcgcagcca tcgacgtcag 1560
acgcggaagc ttcgatcaac tacgcagaca ggtaccaaaa caaatgttct cgtcacgtgg 1620
gcatgaatct gatgctgttt ccctgcagac aatgcgagag aatgaatcag aattcaaata 1680
tctgcttcac tcacggacag aaagactgtt tagagtgctt tcccgtgtca gaatctcaac 1740
ccgtttctgt cgtcaaaaag gcgtatcaga aactgtgcta cattcatcat atcatgggaa 1800
aggtgccaga cgcttgcact gcctgcgatc tggtcaatgt ggatttggat gactgcatct 1860
ttgaacaata aatgatttaa atcaggtatg gctgccgatg gttatcttcc agattggctc 1920
gaggacaacc tctctgaggg cattcgcgag tggtgggcgc tgaaacctgg agccccgaag 1980
cccaaagcca accagcaaaa gcaggacgac ggccggggtc tggtgcttcc tggctacaag 2040
tacctcggac ccttcaacgg actcgacaag ggggagcccg tcaacgcggc ggacgcagcg 2100
gccctcgagc acgacaaggc ctacgaccag cagctgcagg cgggtgacaa tccgtacctg 2160
cggtataacc acgccgacgc cgagtttcag gagcgtctgc aagaagatac gtcttttggg 2220
ggcaacctcg ggcgagcagt cttccaggcc aagaagcggg ttctcgaacc tctcggtctg 2280
gttgaggaag gcgctaagac ggctcctgga aagaagagac cggtagagcc atcaccccag 2340
cgttctccag actcctctac gggcatcggc aagaaaggcc aacagcccgc cagaaaaaga 2400
ctcaattttg gtcagactgg cgactcagag tcagttccag accctcaacc tctcggagaa 2460
cctccagcag cgccctctgg tgtgggacct aatacaatgg ctgcaggcgg tggcgcacca 2520
atggcagaca ataacgaagg cgccgacgga gtgggtagtt cctcgggaaa ttggcattgc 2580
gattccacat ggctgggcga cagagtcatc accaccagca cccgaacctg ggccctgccc 2640
acctacaaca accacctcta caagcaaatc tccaacggga catcgggagg agccaccaac 2700
gacaacacct acttcggcta cagcaccccc tgggggtatt ttgactttaa cagattccac 2760
tgccactttt caccacgtga ctggcagcga ctcatcaaca acaactgggg attccggccc 2820
aagagactca gcttcaagct cttcaacatc caggtcaagg aggtcacgca gaatgaaggc 2880
accaagacca tcgccaataa cctcaccagc accatccagg tgtttacgga ctcggagtac 2940
cagctgccgt acgttctcgg ctctgcccac cagggctgcc tgcctccgtt cccggcggac 3000
gtgttcatga ttccccagta cggctaccta acactcaaca acggtagtca ggccgtggga 3060
cgctcctcct tctactgcct ggaatacttt ccttcgcaga tgctgagaac cggcaacaac 3120
ttccagttta cttacacctt cgaggacgtg cctttccaca gcagctacgc ccacagccag 3180
agcttggacc ggctgatgaa tcctctgatt gaccagtacc tgtactactt gtctcggact 3240
caaacaacag gaggcacggc aaatacgcag actctgggct tcagccaagg tgggcctaat 3300
acaatggcca atcaggcaaa gaactggctg ccaggaccct gttaccgcca acaacgcgtc 3360
tcaacgacaa ccgggcaaaa caacaatagc aactttgcct ggactgctgg gaccaaatac 3420
catctgaatg gaagaaattc attggctaat cctggcatcg ctatggcaac acacaaagac 3480
gacgaggagc gtttttttcc cagtaacggg atcctgattt ttggcaaaca aaatgctgcc 3540
agagacaatg cggattacag cgatgtcatg ctcaccagcg aggaagaaat caaaaccact 3600
aaccctgtgg ctacagagga atacggtatc gtggcagata acttgcagca gcaaaacacg 3660
gctcctcaaa ttggaactgt caacagccag ggggccttac ccggtatggt ctggcagaac 3720
cgggacgtgt acctgcaggg tcccatctgg gccaagattc ctcacacgga cggcaacttc 3780
cacccgtctc cgctgatggg cggctttggc ctgaaacatc ctccgcctca gatcctgatc 3840
aagaacacgc ctgtacctgc ggatcctccg accaccttca accagtcaaa gctgaactct 3900
ttcatcacgc aatacagcac cggacaggtc agcgtggaaa ttgaatggga gctgcagaag 3960
gaaaacagca agcgctggaa ccccgagatc cagtacacct ccaactacta caaatctaca 4020
agtgtggact ttgctgttaa tacagaaggc gtgtactctg aaccccgccc cattggcacc 4080
cgttacctca cccgtaatct gtaattgcct gttaatcaat aaaccggttg attcgtttca 4140
gttgaacttt ggtctctgcg aagggcgaat tcgtttaaac ctgcaggact agaggtcctg 4200
tattagaggt cacgtgagtg ttttgcgaca ttttgcgaca ccatgtggtc acgctgggta 4260
tttaagcccg agtgagcacg cagggtctcc attttgaagc gggaggtttg aacgcgcagc 4320
cgccaagccg aattctgcag atatccatca cactggcggc cgctcgacta gagcggccgc 4380
caccgcggtg gagctccagc ttttgttccc tttagtgagg gttaattgcg cgcttggcgt 4440
aatcatggtc atagctgttt cctgtgtgaa attgttatcc gctcacaatt ccacacaaca 4500
tacgagccgg aagcataaag tgtaaagcct ggggtgccta atgagtgagc taactcacat 4560
taattgcgtt gcgctcactg cccgctttcc agtcgggaaa cctgtcgtgc cagctgcatt 4620
aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg gtttgcgtat tgggcgctct tccgcttcct 4680
cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc ggctgcggcg agcggtatca gctcactcaa 4740
aggcggtaat acggttatcc acagaatcag gggataacgc aggaaagaac atgtgagcaa 4800
aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc 4860
tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga 4920
caggactata aagataccag gcgtttcccc ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc 4980
cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt 5040
ctcatagctc acgctgtagg tatctcagtt cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct 5100
gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg 5160
agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc cactggcagc agccactggt aacaggatta 5220
gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag agttcttgaa gtggtggcct aactacggct 5280
acactagaag aacagtattt ggtatctgcg ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa 5340
gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt 5400
gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag gatctcaaga agatcctttg atcttttcta 5460
cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact cacgttaagg gattttggtc atgagattat 5520
caaaaaggat cttcacctag atccttttaa attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa 5580
gtatatatga gtaaacttgg tctgacagtt accaatgctt aatcagtgag gcacctatct 5640
cagcgatctg tctatttcgt tcatccatag ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta 5700
cgatacggga gggcttacca tctggcccca gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct 5760
caccggctcc agatttatca gcaataaacc agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg 5820
gtcctgcaac tttatccgcc tccatccagt ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa 5880
gtagttcgcc agttaatagt ttgcgcaacg ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt 5940
cacgctcgtc gtttggtatg gcttcattca gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta 6000
catgatcccc catgttgtgc aaaaaagcgg ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca 6060
gaagtaagtt ggccgcagtg ttatcactca tggttatggc agcactgcat aattctctta 6120
ctgtcatgcc atccgtaaga tgcttttctg tgactggtga gtactcaacc aagtcattct 6180
gagaatagtg tatgcggcga ccgagttgct cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg 6240
cgccacatag cagaacttta aaagtgctca tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac 6300
tctcaaggat cttaccgctg ttgagatcca gttcgatgta acccactcgt gcacccaact 6360
gatcttcagc atcttttact ttcaccagcg tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa 6420
atgccgcaaa aaagggaata agggcgacac ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt 6480
ttcaatatta ttgaagcatt tatcagggtt attgtctcat gagcggatac atatttgaat 6540
gtatttagaa aaataaacaa ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccaccta 6600
aattgtaagc gttaatattt tgttaaaatt cgcgttaaat ttttgttaaa tcagctcatt 6660
ttttaaccaa taggccgaaa tcggcaaaat cccttataaa tcaaaagaat agaccgagat 6720
agggttgagt gttgttccag tttggaacaa gagtccacta ttaaagaacg tggactccaa 6780
cgtcaaaggg cgaaaaaccg tctatcaggg cgatggccca ctacgtgaac catcacccta 6840
atcaagtttt ttggggtcga ggtgccgtaa agcactaaat cggaacccta aagggagccc 6900
ccgatttaga gcttgacggg gaaagccggc gaacgtggcg agaaaggaag ggaagaaagc 6960
gaaaggagcg ggcgctaggg cgctggcaag tgtagcggtc acgctgcgcg taaccaccac 7020
acccgccgcg cttaatgcgc cgctacaggg cgcgtcccat tcgccattca ggctgcgcaa 7080
ctgttgggaa gggcgatcgg tgcgggcctc ttcgctatta cgccagctgg cgaaaggggg 7140
atgtgctgca aggcgattaa gttgggtaac gccagggttt tcccagtcac gacgttgtaa 7200
aacgacggcc agtgagcgcg cgtaatacga ctcactatag ggcgaattgg gtaccgggcc 7260
ccccctcgat cgaggtcgac ggtatcgggg gagctcgcag ggtctccatt ttgaagcggg 7320
aggtttgaac gcgcag 7336
<210> 3
<211> 10
<212> PRT
<213>人工序列(未知)
<400> 3
LARGDSTKSA 10
<210> 4
<211> 30
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 4
ttggctagag gtgatagcac aaagtctgcc 30
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 5
aggaccctgt taccgccaac 20
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 6
gatgtttcag gccaaagccg 20

Claims (9)

1.一种用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体,特征在于:在如SEQ IDNO.2所示的AAV-8型血清型外壳蛋白的第590位氨基酸与第591位氨基酸之间插入如SEQ IDNO.3所示的10个氨基酸序列:LARGDSTKSA,其中第1、第2和第10位的氨基酸为保护氨基酸,第3至第9位氨基酸为筛选获得的氨基酸序列。
2.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述如SEQ ID NO.3所示的10个氨基酸序列,其对应的碱基序列如SEQ ID NO.4所示。
3.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述用于基因靶向与表达的AAV-8型血清型的改造型载体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
4.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述改造型载体插入的氨基酸序列LARGDSTKSA用于AAV病毒包装用的外壳,或者用于生物大分子、抗体药物、肽段和化学小分子的连接及靶向。
5.如权利要求1-4任一项所述的改造型载体的构建方法,包括如下步骤:
第一步:合成随机的21个碱基,并在5’端和3’端添加保护碱基TTGGCT和GCC,并插入AAV-8Cap基因的第590位和591位氨基酸对应的碱基序列之中,形成AAV外壳载体;
第二步,将上述AAV外壳载体,电击转化若干个感受态,每个感受态在LB培养基培养过夜,次日于每个培养基中取菌液混合接种于LB培养基摇菌过夜,剩余菌液甘油保存;质粒抽提,得到混合载体库,命名为pAAV8-590-7aa;
第三步,pAAV8-590-7aa与AAV-8Cap质粒与辅助质粒一起进行AAV病毒包装、纯化,此病毒命名为AAV library transfer shuttles,与腺病毒一起共感染Hek293T细胞,进行第二轮的AAV病毒的包装和纯化;
第四步,将第二轮的AAV病毒进行C57BL/6J品系小鼠的滴眼给药,取视网膜层和脉络膜层,提取视网膜层和脉络膜层的基因组DNA,检测AAV-8Cap基因590位氨基酸对应的碱基序列后的21个氨基酸并测序;
第五步,分析测序结果并PCR扩增随机序列并重复第一步,进行第二轮筛选,分析测序结果,确定10个氨基酸序列,将其插入AAV-8Cap基因的第590位和591位,AAV病毒包装,玻璃体腔注射感染视网膜,脑立体定位注射感染海马,各细胞体外感染实验,比较AAV-8与AAV8-590RGD的感染差异。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,第三步中,所述AAV library transfershuttles病毒与腺病毒一起共感染Hek293T细胞具体为,所述AAV library transfershuttles病毒以感染复数值为1的比例,与腺病毒一起共感染Hek293T细胞。
7.一种如权利要求1-4任一项所述的载体在制备感染视网膜的产品中的应用。
8.一种如权利要求1-4任一项所述的载体在制备通过脑立体定位注射,感染小脑、海马、运动皮层、纹状体的产品中的应用。
9.一种如权利要求1-4任一项所述的载体通过体外感染视网膜神经节分离细胞、Neuro2A细胞、U251细胞、ARPE-19细胞、SH-SY-5Y细胞、BV2细胞、HBMEC原代分离细胞、JURKAT细胞、K562细胞和THP1细胞中的应用。
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