CN114774552A - 一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物、诊断试剂及应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物、诊断试剂及应用；本发明通过临床检测，存在PTCH1基因第2630位点核苷酸C突变为G的患者，均患有痣样基底细胞癌症综合征；因此，其能够实现痣样基底细胞癌症综合征的早期诊断和筛查，进而通过检测PTCH1基因第2630位点核苷酸C是否突变为G，能够准确、快捷、简单的实现痣样基底细胞癌症综合征早期辅助诊断和筛查。

Description

一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物、诊断试剂及应用

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物、诊断试剂及应用。

背景技术

基底细胞痣综合征(basal cell nevus syndrome)又称下颌囊肿-基底细胞瘤-骨畸形综合征、多发性囊性肿瘤病、Ward综合征、Gorlin-Goltz综合征、Hermans-Horzberg综合征、遗传性皮肤下颌多肿瘤病、基底细胞母斑综合征、多发性基底细胞痣综合征(Multiple basal cell nevus syndrome)、痣样基底细胞癌综合征(Nevoid basal cellcarcinoma syndrome)、痣样基底细胞瘤综合征(Nevoid basalioma syndrome)等，本综合征为常染色体显性遗传性疾病，累及多种器官。

该综合征已知有皮肤、骨骼、眼、神经、生殖等6个主要器官系统，大概有38种异常，其中以基底细胞癌、颌骨囊肿、手掌或足底角化不良和骨骼异常最多见，其中，皮肤改变：为在儿童期或青春期在暴露或非暴露区皮肤出现多发性痣样基底细胞癌或皮肤多发性良性囊肿和肿瘤，如上皮囊肿、脂肪瘤、纤维瘤等；足跖和手掌皮肤角化不良：足跖和手掌皮肤角化不良性小窝，常见于儿童和青春期，数目多，直径0.1～0.3cm。因皮肤角质缺损。毛细血管扩张，故呈红色，加压变白。其原因是表皮基底细胞分化为棘细胞，角质形成过程中的酶功能缺陷所致。

该综合征的特点为儿童期至成人期均可发生的多发基底细胞癌，见于包括不暴露于阳光的皮肤，家中数代人均有相似皮肤肿瘤患者。本病发生率虽未确定，但在基底细胞癌病人中约占0.5％。在一般群体的家庭中，当只有一人患病或仅患有皮肤囊肿或颌骨囊肿时，往往对本病的诊断有所忽视。再则大多数病例在幼年或青少年期已发病，一般在8～9岁出现某些临床表现，而至几十年后才诊为本病，这不仅导致基底细胞瘤已恶变，而且留下了带有遗传病的后代。因此，如何在儿童期予以早期诊断尤为关键。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的目的在于提供一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物、诊断试剂及应用，该诊断标志物能够实现痣样基底细胞癌症综合征的诊断，能够实现在对儿童进行早期筛查。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

本发明第一方面提供一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物，所述诊断标志物为突变型PTCH1基因，所述突变型PTCH1基因为携带基因突变位点c.2630C>G的PTCH1基因。

本发明第二方面提供一种上述诊断标志物在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒中的应用。

本发明第三方面提供一种上述检测PTCH1基因突变体的试剂在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的产品中的应用，所述PTCH1基因突变体的突变位点为PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C到G的突变。

优选地，所述试剂包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。

优选地，所述试剂还包括PCR扩增反应中的常规试剂，和/或DNA提取过程中使用的试剂，和/或DNA测序过程中使用的试剂。

本发明第四方面提供一种用于诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒，所述试剂盒包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。

优选地，所述试剂盒还包括模板DNA、缓冲液、dNTP和Taq聚合酶。

与现有技术相比，本发明的有益效果至少包括：

本发明通过临床检测，存在PTCH1基因第2630位点核苷酸C突变为G的患者，均患有痣样基底细胞癌症综合征；因此，其能够实现痣样基底细胞癌症综合征的早期诊断和筛查，进而通过检测PTCH1基因第2630位点核苷酸C是否突变为G，能够准确、快捷、简单的实现痣样基底细胞癌症综合征早期辅助诊断和筛查。

附图说明

为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。在所有附图中，类似的元件或部分一般由类似的附图标记标识。附图中，各元件或部分并不一定按照实际的比例绘制。

图1为本发明实施例中段某PTCH1；NM_000264.3:c.2630的核苷酸序列测序结果。

图2为本发明实施例中段某妹妹PTCH1；NM_000264.3:c.2630的核苷酸序列测序结果。

图3为本发明实施例中段某父亲PTCH1；NM_000264.3:c.2630的核苷酸序列测序结果。

具体实施方式

下面将结合实施例对本发明技术方案的实施例进行详细的描述。以下实施例仅用于更加清楚地说明本发明的技术方案，因此只作为示例，而不能以此来限制本发明的保护范围。

除非本文另有定义，连同本发明使用的科学和技术术语应具有本领域普通技术人员通常理解的含义。术语的含义和范围应当清晰，然而，在任何潜在不明确性的情况下，本文提供的定义优先于任何字典或外来定义。在本申请中，除非另有说明，术语“包括”及其他形式的使用是非限制性的。

一般地，连同本文描述的细胞和组织培养、分子生物学、免疫学、微生物学、遗传学以及蛋白和核酸化学和杂交使用的命名法和其技术是本领域众所周知和通常使用的那些。除非另有说明，本发明的方法和技术一般根据本领域众所周知，且如各种一般和更具体的参考文献中所述的常规方法来进行，所述参考文献在本说明书自始至终引用和讨论。酶促反应和纯化技术根据制造商的说明书、如本领域通常实现的或如本文所述来进行。连同本文描述的分析化学、合成有机化学以及医学和药物化学使用的命名法、及其实验室程序和技术是本领域众所周知和通常使用的那些。

本发明实施例提供一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物，该诊断标志物为突变型PTCH1基因，该突变型PTCH1基因为携带基因突变位点c.2630C>G的PTCH1基因。

研究表明，存在PTCH1基因第2630位点核苷酸C突变为G的患者，均患有痣样基底细胞癌症综合征；因此，该诊断标志物能够实现痣样基底细胞癌症综合征的早期诊断和筛查，进而通过检测PTCH1基因第2630位点核苷酸C是否突变为G，能够准确、快捷、简单的实现痣样基底细胞癌症综合征早期辅助诊断和筛查。

本发明实施例还提供一种上述诊断标志物在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒中的应用。

本发明又一实施例提供一种上述检测PTCH1基因突变体的试剂在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的产品中的应用，PTCH1基因突变体的突变位点为PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C到G的突变。

进一步地，所述试剂包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。在本发明中对引物序列不做严格限定，可以根据突变后的序列进行常规设计。

进一步地，所述试剂还包括PCR扩增反应中的常规试剂，和/或DNA提取过程中使用的试剂，和/或DNA测序过程中使用的试剂。

本发明再一实施例提供一种用于诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒，该试剂盒包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。

进一步地，所述试剂盒还包括模板DNA、缓冲液、dNTP和Taq聚合酶。

以下通过具体的实施例对本发明技术方案作进一步详细说明，但是，应当理解为，这些实施例仅是用于更详细地说明之用，而不应理解为用于以任何形式限制本发明。

实施例

痣样基底细胞癌综合征患者致病基因筛查：

选择痣样基底细胞癌综合征家系3名，其中，患者临床表现为痣样基地细胞瘤、鱼鳞病相关表现，掌趾角化，有家族遗传病史；

采集患者样本：全血；

在深圳华大医学检验实验室对其中1名患者(段某)样本进行全外显子组测序，检测区域：人类基因组中约2万个基因的外显子区+线粒体基因组；

检测方法：芯片捕获高通量测序；

检测结果：

在痣样基底细胞癌综合征/前脑无裂畸形7型相关的PTCH1基因上检出与受检者表型相关的1个致病变异；初步判断该变异致病痣样基底细胞癌综合征；

然后，对选择痣样基底细胞癌综合征家系3名患者(段某、段某妹妹、段某父亲)进行PTCH1；NM_000264.3:c.2630的核苷酸序列进行检测，检测结果如图1～3所示；

由图1～3可知，三者均检出PTCH1；NM_000264.3:c.2630C>G(p.Ser877*)变异；

综上，PTCH1；NM_000264.3:c.2630C>G(p.Ser877*)致病痣样基底细胞癌综合征。

最后应说明的是：以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围，其均应涵盖在本发明的权利要求和说明书的范围当中。

Claims (7)

1.一种痣样基底细胞癌综合征的诊断标志物，其特征在于，所述诊断标志物为突变型PTCH1基因，所述突变型PTCH1基因为携带基因突变位点c.2630C>G的PTCH1基因。

2.权利要求1所述的诊断标志物在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒中的应用。

3.检测PTCH1基因突变体的试剂在制备诊断痣样基底细胞癌综合征的产品中的应用，其特征在于，所述PTCH1基因突变体的突变位点为PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C到G的突变。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述试剂包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于，所述试剂还包括PCR扩增反应中的常规试剂，和/或DNA提取过程中使用的试剂，和/或DNA测序过程中使用的试剂。

6.一种用于诊断痣样基底细胞癌综合征的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括检测PTCH1基因的第2630位的核苷酸由C突变为G的引物。

7.根据权利要求6所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括模板DNA、缓冲液、dNTP和Taq聚合酶。

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