CN114410492A - 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用 - Google Patents

一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN114410492A
CN114410492A CN202111597319.3A CN202111597319A CN114410492A CN 114410492 A CN114410492 A CN 114410492A CN 202111597319 A CN202111597319 A CN 202111597319A CN 114410492 A CN114410492 A CN 114410492A
Authority
CN
China
Prior art keywords
cucurbitadienol
squalene
yeast
engineering bacteria
synthase
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202111597319.3A
Other languages
English (en)
Inventor
赵云现
崔金旺
朱志通
胡江林
赵凯
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hebei Weidakang Biotechnology Co ltd
Original Assignee
Hebei Weidakang Biotechnology Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hebei Weidakang Biotechnology Co ltd filed Critical Hebei Weidakang Biotechnology Co ltd
Priority to CN202111597319.3A priority Critical patent/CN114410492A/zh
Publication of CN114410492A publication Critical patent/CN114410492A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0071Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
    • C12N9/0073Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14) with NADH or NADPH as one donor, and incorporation of one atom of oxygen 1.14.13
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • C12N15/81Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi for yeasts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/905Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in yeast
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0071Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
    • C12N9/0083Miscellaneous (1.14.99)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/90Isomerases (5.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P33/00Preparation of steroids
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y114/00Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
    • C12Y114/13Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with NADH or NADPH as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (1.14.13)
    • C12Y114/13132Squalene monooxygenase (1.14.13.132)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y114/00Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
    • C12Y114/99Miscellaneous (1.14.99)
    • C12Y114/99007Squalene monooxygenase (1.14.99.7)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y504/00Intramolecular transferases (5.4)
    • C12Y504/99Intramolecular transferases (5.4) transferring other groups (5.4.99)
    • C12Y504/99033Cucurbitadienol synthase (5.4.99.33)

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇工程菌、构建及其应用,属于生物技术领域。通过表达异源角鲨烯氧化模块、提高MVA途径代谢通路和敲除羊毛甾醇竞争途径构建底盘酵母工程菌,在该底盘菌的基础上表达异源蛋白葫芦二烯醇合酶,构建得到生物合成葫芦二烯醇的酵母工程菌。本发明可以从头合成葫芦二烯醇,该方法不污染环境,且产量高、成本低,且无中间产物角鲨烯的纯在,为工业化生产葫芦二烯醇提供了依据。本发明最终生产葫芦二烯醇得产量可达到1432mg/L。

Description

一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及 其应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,尤其涉及一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用。
背景技术
葫芦二烯醇是从罗汉果、西瓜、冬瓜和苦瓜等多种葫芦科植物中分离得到的葫芦烷型四环三萜类化合物的基本前体,其在生物体内能被进一步被酶修饰形成罗汉果甜苷和葫芦素等化合物。葫芦二烯醇从植物中发现,传统的生产葫芦二烯醇的是通过植物提取,但容易受到植物生长的周期性与不稳定性等因素,并不利于工业化生产,且含量极低,根据现有报道从植物中提取的含量约为万分之一。除此,目前还报道了:葫芦二烯醇的生物合成前体物质在酿酒酵母中的主要合成途径是通过MVA途径合成,2分子的异戊二烯焦磷酸(IPP)分子和1分子的二甲烯丙基焦磷酸(DMAPP)经浓缩形成15个碳分子的法呢基焦磷酸(FPP),2分子的FPP随后头对头耦合形成1分子的角鲨烯(Squalene,SQ),角鲨烯随后被酵母自身的角鲨烯环氧化酶(ERG1)氧化生产2,3-环氧化角鲨烯,随后通过异源的葫芦二烯醇合酶(CBS)合成葫芦二烯醇。目前对于葫芦二烯醇生物合成的方法的优化往往是简单通过筛选不同来源的葫芦二烯醇合酶生产葫芦二烯醇,其虽然得到了相对较高的葫芦二烯醇产量,但是往往存在较多的中间产物角鲨烯,而过多的中间产物并不利于下游产业的分离纯化。
发明内容:
针对现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用,该工程菌株可以将葡萄糖转化为葫芦二烯醇,产量较高,且无中间产物角鲨烯的存在,有利于葫芦二烯醇的大规模生成。
提供一种以葡萄糖为底物微生物合成葫芦二烯醇的工程菌的方法,包括以下步骤:
1)获得西葫芦籽来源的角鲨烯环氧化酶(cpSE2)替代酵母自身来源的ERG1,其催化角鲨烯生成2,3环氧角鲨烯的能力优于酵母自身ERG1;
2)利用酵母的自身同源重组系统在Gal7位点过表达角鲨烯环氧化酶cpSE2和角鲨烯合酶ERG9;
3)敲除羊毛甾醇合ERG7,并在该位点调控HMGS和截短HMGR的表达,获得产2,3-环氧角鲨烯的工程菌;
4)构建葫芦二烯醇合酶CDS表达质粒,将质粒导入步骤3)的工程菌中,得到产葫芦二烯醇的酵母工程菌。
按上述方案,步骤(1)为:采集西葫芦籽的RNA,经过反转录得到西葫芦籽来源的角鲨烯环氧化酶(cpSE2)。
按上述方案,所述角鲨烯环氧化酶基因cpSE2的核苷酸序列如SEQ ID NO.001中所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.002所示。该角鲨烯环氧化酶催化角鲨烯生成2,3环氧角鲨烯得活性比酿酒酵母自身来源的ERG1高50%。按上述方案,步骤(3)中截短HMGR指羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白截短了N端前400-551个氨基酸,优选截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前500-551个氨基酸,更优选的范围为截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前551个氨基酸。
按上述方案,步骤(4)具体为:通过使用高拷贝质粒pRS313过表达葫芦二烯醇合酶CDS生物合成模块,得到产葫芦二烯醇的酵母工程菌。
按上述方案,所述的酵母为酿酒酵母。
提供一种以葡萄糖为底物微生物合成葫芦二烯醇的工程菌株,酵母工程菌中整合了葫芦二烯醇合酶CDS基因和环角鲨烯氧化酶cpSE2基因。
按上述方案,所述的酵母工程菌上过表达角鲨烯环氧化酶cpSE2和角鲨烯合酶ERG9。
按上述方案,所述人工合成葫芦二烯醇合酶CDS基因序列,其核苷酸序列如SEQ IDNO.003所示,其核苷酸序列如SEQ ID NO.004所示。
按上述方案,步骤(1)为:采集西葫芦籽的RNA,经过反转录得到西葫芦籽来源的环角鲨烯氧化酶(cpSE2)。
按上述方案,所述角鲨烯环氧化酶基因cpSE2的核苷酸序列如SEQ ID NO.001中所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.002所示。该角鲨烯环氧化酶催化角鲨烯生成2,3环氧角鲨烯活性比酿酒酵母自身来源的ERG1高50%。
按上述方案,所述酵母工程菌中敲除羊毛甾醇合酶ERG7位点,在该位点调控HMGS和截短HMGR的表达。
按上述方案,所述截短HMGR指羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端截短了前400-551个氨基酸,优选截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前500-551个氨基酸,更优选的范围为截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前551个氨基酸。
本发明还有一个目的在于提供一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌株在生物合成葫芦二烯醇中的应用。
按上述方案,所述的生物合成葫芦二烯醇的方法为:
将以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌株培养,获得种子液;
将种子液接种到含有葡萄糖、氮源、金属元素和维生素的培养基中,分批流加补料发酵合成葫芦二烯醇;发酵过程中:分批补料葡萄糖控制葡萄糖浓度在10-15g/L。
按上述方案,所述的发酵温度为28-32℃;发酵时间优选为120h-144h。
按上述方案,发酵过程中pH控制范围为4.5-5.5;溶氧量不高于40%,优选不高于20%。
本发明优选的一个以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌构建的实施方式为:
1)分别构建酿酒酵母角鲨烯生物合成增强模块PTEF1-ERG9-CYCt和PTDH3-cpSE2-Ttp1模块,利用酵母的自身同源重组特点将这两个模块整合至酿酒酵母的基因组中。
2)在1)构建所得菌株基础上通过在ERG7位点插入MVA增强途径模块的2个表达模块PPGK1-trHMGR-TADH1和PPDC1-HMGS-TADH2模块,从而将酿酒酵母的代谢途径导向了MVA途径;
3)构建高等拷贝质粒表达葫芦二烯醇合酶CDS,构建葫芦二烯醇生物合成模块,将其导入2)中所构建菌株,得到以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的生产菌株。
本发明通过新的角鲨烯环氧化酶的挖掘并替换酵母自身的ERG1,以及过表达角鲨烯环氧化酶cpSE2和角鲨烯合酶ERG9以增强前体物质的合成,以及可进一步地,敲除羊毛甾醇合酶ERG7位点,弱化葫芦二烯醇的竞争途径;且在该位点调控HMGS和截短HMGR的表达,将酵母的代谢流导向MVA途径,获得改造酵母工程菌,然后过表达葫芦二烯醇合酶CDS,由此获得的酵母工程菌通过增强角鲨烯氧化模块表达、提高MVA途径代谢通路和敲除羊毛甾醇竞争途径构建底盘酵母细胞工程菌,在该底盘菌的基础上表达异源蛋白葫芦二烯醇合酶,转化酿酒酵母宿主产生的2,3-单氧化角鲨烯,生成葫芦二烯醇,葫芦二烯醇产量达到1432mg/L,且无中间产物角鲨烯的存在。
与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
本发明通过表达高活性的异源角鲨烯环氧化酶cpSE2,在酿酒酵母中催化角鲨烯生成2,3-氧化角鲨烯,以及进一步地,提高MVA途径代谢通路和敲除羊毛甾醇竞争途径异源表达葫芦二烯醇合酶,最终得到从头产葫芦二烯醇的工程菌。该方法操作简单,不污染环境,产量高,且相较于现有技术,没有中间产物角鲨烯的存在,更有利于最终产物的分离提纯,为绿色生物制造葫芦二烯醇提供了一种新的解决思路方法。
附图说明:
图1为酿酒酵母发酵生产葫芦二烯醇产量图。
具体实施方式
实施例1产葫芦二烯醇底盘菌的构建
(1)一种角鲨烯环氧化酶核苷酸的获得
Trizol法提取西葫芦籽(Cucurbita pepo)的RNA,RNA经过反转录盒转化成cDNA模板,在用TDH3--cpSE2-F/Ttp1-cpSE2-R为引物组合扩增得到cpSE2基因,经测序后,cpSE2核苷酸片段如序列表SEQ ID NO.001中所示,其氨基酸序列见序列表SEQ ID NO.002所示,其与西葫芦籽数据库中的cpSE基因同源性为99%。以酿酒酵母基因组为模板,TDH3-up/down为引物,PCR扩增后得到启动子PTDH3;同样的,以酿酒酵母基因组为模板,Ttp1-up/down为引物,扩增得到Ttp1终止子;将PTDH3启动子、cpSE2基因和Ttp1终止子使用Gibsonassembly的方法进行片段组装,构建得到PTDH3-cpSE2-Ttp1表达基因簇模块片段1,该片段编码西葫芦籽的角鲨烯氧化酶,其催化活性相较于酵母本身ERG1编码的角鲨烯氧化酶的催化活性提高50%。
(2)增强角鲨烯基因表达模块的构建
以酿酒酵母基因组为模板,TEF1-up/down为引物,PCR扩增后得到启动子PTEF;同样的,以酿酒酵母基因组为模板,CYC1t-up/down为引物,PCR扩增后得到终止子CYC1t;以酿酒酵母基因组为模板,ERG9-up/down为引物,扩增得到ERG9基因组;使用Overlap的构建方法,将前边的三片段进行组装,构建得到PTEF1-ERG9-CYCt表达基因簇模块片段2。
以Gal7-1-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增Gal7基因上游500bp的同源片段3;以Gal7-2-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增Gal7基因下游500bp的同源片段4;以Ura3-up/down为引物,pUC19-Ura3基因组为模板,扩增得到Ura3筛选标记标签5。
将上述得到的片段,利用酵母的多片段自组装技术,通过醋酸锂法制备感受态细胞。按照电转法将上述得到的5个片段以摩尔比1:1:1:1:1的方式加入感受态细胞中。转化后在SM-ΔUra固体筛选培养基中30℃恒温培养箱培养48h,提取酵母基因组进行验证,正确的菌株命名为SC-C03。
a)其中醋酸锂制备酵母感受态的方法如下:
I)取1ml的酵母培养物(OD 0.6-0.8),10 000r/min离心1min,除尽上清,
II)无菌水洗涤细胞沉淀,10 000r/min离心1min,除尽上清,两遍;
III)加入1mL酵母处理液(含DTT),25℃金属浴20min;
IV)10 000r/min离心1min,除尽上清;
V)加入1mL1M山梨醇(过滤除菌),充分混匀,两遍
VI)加入60ul 1M山梨醇,并加入2ul的目标质粒或DNA片段,充分混匀后转移到电
转杯,冰置5min;
VII)2.7kv电击,电击时间为5.7ms左右均可;
VIII)加入1ml 1M的山梨醇,转移到1.5mL的EP管中,30℃恒温振荡培养箱250
r/min培养48h,涂布对应筛选标签的平板,筛选阳性单克隆。
(3)羊毛甾醇合酶的敲除与甲羟戊酸途径的调控
3-羟基-3甲基戊二酸辅酶A还原酶HMGR是MVA途径中的限速酶,加强HMGR表达有利于提高MVA途径中甲羟戊二酸供应,HMGR含有N端跨膜区和C端催化活性区,分别发挥相应跨膜定位作用和催化活性作用,细胞中HMGR过表达会导致甲羟戊酸代谢途径反馈抑制,因此截短N端跨膜区可以降低反馈抑制和提高甲羟戊酸代谢流。通过以trHMGR-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到截短了551个氨基酸的trHMGR基因片段;以PGK1-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到Ppgk1启动子;同样的以ADH1-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到ADH1终止子;将模块通过Gibson assembly的方法进行组装构建得到PPGK1-trHMGR-TADH1基因表达片段。以PDC1-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到PPDC1启动子片段;以HMGS-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到HMGS基因片段;以TADH2-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到TADH2终止子片段,通过Gibson assembly的方法进行片段组装,构建得到PPDC1-HMGS-TADH2表达片段。
以ERG7-1-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到ERG7上游500bp同源臂片段;以Trp1-F/R为引物,pUC19-Trp1质粒为模板,扩增得到Trp1筛选抗性片段基因;以ERG7-2-up/down为引物,酿酒酵母基因组为模板,扩增得到ERG7基因下游500bp的同源片段。将PPGK1-trHMGR-TADH1、PPDC1-HMGS-TADH2和ERG7上下游同源片段、Trp1筛选标签用酵母的多片段同源重组策略,整合至SC-C03菌株,孵育后的菌液涂布SM-ΔUra,ΔTrp平板,筛选出的阳性单克隆提基因组验证,得到调控甲羟戊酸途径且弱化羊毛甾醇合酶的SC-C05菌株。
实施例2产葫芦二烯醇酿酒酵母工程菌的构建
1)葫芦二烯醇合酶基因片段获得
人工合成葫芦二烯醇合酶CDS基因序列,其核苷酸序列见SEQ ID NO.003,其核苷酸序列见SEQ ID NO.004,将其构建至pUC19质粒载体骨架,得到pUC19-CDS质粒;以酿酒酵母基因组为模板,TEF-up/down为引物,扩增得到PTEF启动子片段;同时以酿酒酵母基因组为模板,CYC1-up/down为引物,扩增得到TCYC终止子片段;以pUC19-CDS质粒为模板,CDS-1-up/down为引物,扩增得到CDS基因片段,将启动子PTEF、CDS结构基因片段、TCYC1终止子片段通过Overlap的方法将三片段进行组装,得到PTEF-CDS-TCYC1表达模块,使用Gibsonassembly的方法将pTEF-CDS-TCYC1表达模块质粒整合pUC19质粒上,构建得到pUC19-pTEF-CDS-TCYC1表达模块质粒。
2)一种产葫芦二烯醇酿酒酵母工程菌的构建
以sacII-pTEF-F/sacII-TCUC1-R为引物,pUC19-pTEF-CDS-TCYC1表达模块质粒为模板扩增得到两端含sacII酶切位点的pTEF-CDS-TCYC1表达模块;随后对pRS313载体和pTEF-CDS-TCYC1表达模块使用sacII酶进行酶切处理,酶连后的质粒转入DH5α感受态中,筛选测序得到正确的pRS313-pTEF-CDS-TCYC1质粒。
将上述构建得到的pRS313-pTEF-CDS-TCYC1质粒转入SC-C05菌株中,构建得到产葫芦二烯醇酿酒酵母工程菌SC-C10菌株。
实施例3.一株产葫芦二烯醇酿酒酵母工程菌的发酵
摇瓶发酵:挑取固体平板上活化的SC-C10单克隆,于YPD液体培养基中30℃250rpm过夜振荡培养制备种子液;将制备好的种子液接种至ΔLEU高密度发酵培养基振荡培养5d进行发酵液测量。其中发酵培养基配方如下:
发酵培养基:25g/L的葡萄糖,15g/L(NH4)2SO4,8g/L K2HPO4,3g/L MgSO4*7H2O,5g/L赖氨酸,10ml微量元素(含15g/L EDTA,10.2g/L ZnSO4*7H2O,0.5g/L MnCl2*4H2O,0.86g/LCoCl2*6H2O,0.5g/L CuSO4,0.56g/L Na2MoO4*2H2O,3.84g/L CaCl2,5.12g/L FeSO4*7H2O),12ml维生素(含0.05g/L生物素,0.2g/L对氨基苯甲酸,1g/L烟酸,1g/L泛酸钙,1g/L盐酸硫胺,1g/L盐酸吡哆醛1.25g/L肌醇)。1L补料培养基:400g/L葡萄糖,10ml的微量元素。发酵过程控制温度为30℃,溶氧优选控制在不超过20%,pH设置为5.5,溶氧和转速相偶联,当溶氧值高于40%时加入补料培养基至维持葡萄糖在15g/L,发酵5d后取发酵液进行检测,见图1。
葫芦二烯醇的产品检测方法
取发酵液于破碎管中,13000rpm离心2min,弃上清,重复2次;加入与沉淀等体积的玻璃珠(直径0.5mm)后,加入500ul的萃取液(甲醇:丙酮=1:1),振荡破碎5min,超声破碎30min,12000rpm离心5min,取上清液重复1次。上清液过滤至也想小瓶后,使用GC-MS进行样品的定性和定量分析。GC-MS测定条件:进样口温度300℃,进样体积1ul,不分流,溶剂延时12min,色谱柱:HP-5ms(30mm x 0.25mm);色谱条件:80℃,保持1min;20℃/min升温至300℃,保持15min;MS条件:SIM:69、218、363和411.
结果显示SC-C10酿酒酵母工程菌摇瓶发酵产葫芦二烯醇产量达到62.3mg/L,检测发酵液中无角鲨烯的产生;高密度发酵中葫芦二烯醇产量达到1432mg/L,在初始发酵24h检测到30mg/L的角鲨烯的生成,在最终发酵120h时未检测到中间体角鲨烯的生成。
SEQUENCE LISTING
<110> 河北维达康生物科技有限公司
<120> 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用
<130> 1
<160> 4
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1575
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
atggagttcc tatccgcggc tcttctcggc cttctattgg cctccatcct tcctctcttt 60
ttcttcttct ctttcagaga cggaatcaaa cacgacggcg acaacaacac caccgccgta 120
atcgattcaa agattccgtc gggaaatgac gtccgtcgcg ccgaatcctc cgatgatttt 180
gacgttatca tcgtcggcgc tggagttgcc ggcgccgccc ttgcttatac tctcgccaag 240
gatggacgaa aagtgcatgt aattgaaaga gacttgtcgg agccggagag aatcgtcgga 300
gaattgcttc aacccggcgg ctatttgaag ctcatcgagt tagggcttga agacagtctg 360
aaggggatcg atgctcagca ggtgtttggt tatgcgctct tcaaagacgg aaaccacacc 420
agattggctt atcctttgga caaatttgat tccaatattt ctgggagaag cttccacaat 480
ggccgattca ttcagaggtt gaggcaaaag gctgctgctc tttccaatgt aaaactggaa 540
caagggactg taacttccat agttgaagaa gatgggactg taaaaggtgt gcaatataaa 600
accaagaatg gacaagagtt gacatcttat gctcccctca ccattgtttg tgatggcggc 660
ttttcgaatt tgcgtcgcaa cctctgcaaa cctcagattg atattccctc atgctttgtt 720
ggtttggtcc tggagaactg taagctgccc cttgaaaatc atggacatgt tgtgcttgct 780
gacccatcgc ctatcttgtt ataccggatt agcagcacgg agatacgctg cttagtcgat 840
atccccggcc aaaaagtgcc ttctgtggct aacggcgaca tggcacacta cttgaaaacc 900
gctgtggctc ctcagctacc gcccgagttg cagaccgcct tcatagcttc agttgataag 960
gggaacataa aaagcacaac aaacagaagc atgccagcag ccccacatcc cacaccagga 1020
gcacttctct tgggtgatgc attcaacatg cgacatcctt taaccggtgg aggtatgacc 1080
gttgctctcg ccgatatcgt cgtgctacga gaccttcttc gacccctttc aaatttgaac 1140
gatgccgatg ccttgtgcaa ctatctcgaa tccttctaca cattgcgaaa gccagtggca 1200
tctacaataa acacattggc aggtgcctta taccaggtct tttgtgcatc gcccgacccg 1260
gccaggaagg aaatgcgcga agcttgtttc gattatttga gtctaggagg tgtattttcc 1320
tctggaccag tgtctcttct ctctggtctc aacccgcgcc cattaagcct gttctgtcac 1380
ttctttgccg tggccatata cggtgtcact cggttgctaa tcccattccc ttcgcctaag 1440
cgtatatgga tcggagttcg attgattacg ggagcagcag gcataatttt tcccataatc 1500
aaggctgaag gagtgagaca aatgttcttt cctgcaacaa tgcctgcata ctacagagcc 1560
cctcctatgc agtaa 1575
<210> 2
<211> 524
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 2
MEFLSAALLG LLLASILPLF FFFSFRDGIK HDGDNNTTAV IDSKIPSGND VRRAESSDDF 60
DVIIVGAGVA GAALAYTLAK DGRKVHVIER DLSEPERIVG ELLQPGGYLK LIELGLEDSL 120
KGIDAQQVFG YALFKDGNHT RLAYPLDKFD SNISGRSFHN GRFIQRLRQK AAALSNVKLE 180
QGTVTSIVEE DGTVKGVQYK TKNGQELTSY APLTIVCDGG FSNLRRNLCK PQIDIPSCFV 240
GLVLENCKLP LENHGHVVLA DPSPILLYRI SSTEIRCLVD IPGQKVPSVA NGDMAHYLKT 300
AVAPQLPPEL QTAFIASVDK GNIKSTTNRS MPAAPHPTPG ALLLGDAFNM RHPLTGGGMT 360
VALADIVVLR DLLRPLSNLN DADALCNYLE SFYTLRKPVA STINTLAGAL YQVFCASPDP 420
ARKEMREACF DYLSLGGVFS SGPVSLLSGL NPRPLSLFCH FFAVAIYGVT RLLIPFPSPK 480
RIWIGVRLIT GAAGIIFPII KAEGVRQMFF PATMPAYYRA PPMQ 524
<210> 3
<211> 2295
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
atgtggaggt taaaagttgg ggcggagagc gttggggaga aagaagagaa atggttgaag 60
agtataagca atcacttggg acgccaagtg tgggagtttt gtgccgacca acccactgct 120
tctccaaatc acttacaaca aatcgataat gcgcggaagc actttcgtaa taatcgcttc 180
caccggaagc aatcttccga tctctttctt gctattcaga atgaaaagga gatagcaaat 240
ggtacaaaag gtggaggaat caaagtgaaa gaagaggaag atgtaaggaa agagacagtg 300
aagaatacag tagaaagggc attaagtttc tattcagcca ttcagacaaa cgatgggaat 360
tgggcttcgg atcttggagg gcccatgttt ttactcccgg gtcttgtgat tgctctctat 420
gtcactggcg tcttgaattc ggttctatcc aagcaccatc gacaagaaat gtgtagatat 480
ctttataatc accagaatga agatggtgga tggggtctcc acatcgaagg tacgagcacg 540
atgtttggtt cggcactgaa ttatgttgca ctgaggttgc ttggagaaga cgctgatggc 600
ggagagggcg gtgcaatgac aaaagcacgt ggttggatct tggaccgcgg cggtgccacc 660
gcaatcactt cttggggaaa attgtggctc tctgtacttg gagtctatga atggagtggc 720
aataatcctc ttccacctga gttttggtta ctcccttatt gcctaccctt tcatccagga 780
agaatgtggt gccattgtcg aatggtttat ctaccaatgt catacttata tggaaagaga 840
tttgttgggc caatcacacc catagttcta tctctaagaa aagagctcta cacaattcca 900
tatcatgaaa tagattggaa taaatctcgc aatacatgtg caaaggagga tctgtactat 960
ccacatccga agatgcaaga tattctgtgg ggatcaatat accatttgta tgagccttta 1020
tttactcgtt ggcctggaaa acggctgagg gaaaaggctt tgcaaatggc aatgaaacat 1080
attcactatg aagatgaaaa cagtagatat atatgtcttg gacctgtcaa taaagtactt 1140
aatatgcttt gttgttgggt tgaagatcct tattcagatg ccttcaaatt tcatcttcaa 1200
cgagtccccg actatctttg gattgctgaa gatggcatga gaatgcaggg ttacaatggg 1260
agccagttgt gggacactgc tttctctgtt caagcaatca tatccaccaa acttatagac 1320
agctttggca caaccttaaa aaaagcacat gattttgtca aagattctca gatccagcag 1380
gactttcctg gggatcctaa tgtttggttc cgtcacattc ataaaggtgc ttggccattt 1440
tcaactcgtg atcatggatg gctcatctct gactgtacag ctgaggggtt aaaggcttct 1500
ttgatgttat ccaaacttcc atccaaaata gttggggagc cattagaaaa gagtcgcctt 1560
tgcgatgctg taaatgttct cctttcttta caaaatgaaa atggtggatt tgcatcatat 1620
gagttgacaa gatcataccc ttggttggag ttgatcaacc ctgcagaaac attcggagat 1680
atcgttatcg attatcccta tgtggagtgc acctcagcta caatggaagc attgacactg 1740
tttaagaagt tacatccagg ccataggacc aaagagattg atactgcagt tgccaaggca 1800
gctaacttcc tagaaaatat gcaaaggacg gatggctctt ggtacgggtg ttggggggtt 1860
tgcttcacgt atgcagggtg gtttggcata aagggtttgg ttgctgcagg aaggacatat 1920
agtacttgtg ttgccattcg caaggcttgt gattttttgc tatctaaaga attacctggc 1980
ggtggatggg gagagagtta cctttcatgt cagaataagg tctataccaa tcttgaaggc 2040
aacaggccgc atttggttaa cactgcttgg gttttgatgg ctctcattga agctggccag 2100
gctgagagag acccagcacc attgcaccgt gcagcaaggt tgttaatcaa ttcccaattg 2160
gagaatggtg atttccccca agaggaaatc atgggagtgt ttaataaaaa ttgcatgatc 2220
acatatgctg catatcgaaa tatctttccc atttgggctc ttggagagta tttccatcgg 2280
gttcttactg aatga 2295
<210> 4
<211> 764
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 4
MWRLKVGAES VGEKEEKWLK SISNHLGRQV WEFCADQPTA SPNHLQQIDN ARKHFRNNRF 60
HRKQSSDLFL AIQNEKEIAN GTKGGGIKVK EEEDVRKETV KNTVERALSF YSAIQTNDGN 120
WASDLGGPMF LLPGLVIALY VTGVLNSVLS KHHRQEMCRY LYNHQNEDGG WGLHIEGTST 180
MFGSALNYVA LRLLGEDADG GEGGAMTKAR GWILDRGGAT AITSWGKLWL SVLGVYEWSG 240
NNPLPPEFWL LPYCLPFHPG RMWCHCRMVY LPMSYLYGKR FVGPITPIVL SLRKELYTIP 300
YHEIDWNKSR NTCAKEDLYY PHPKMQDILW GSIYHLYEPL FTRWPGKRLR EKALQMAMKH 360
IHYEDENSRY ICLGPVNKVL NMLCCWVEDP YSDAFKFHLQ RVPDYLWIAE DGMRMQGYNG 420
SQLWDTAFSV QAIISTKLID SFGTTLKKAH DFVKDSQIQQ DFPGDPNVWF RHIHKGAWPF 480
STRDHGWLIS DCTAEGLKAS LMLSKLPSKI VGEPLEKSRL CDAVNVLLSL QNENGGFASY 540
ELTRSYPWLE LINPAETFGD IVIDYPYVEC TSATMEALTL FKKLHPGHRT KEIDTAVAKA 600
ANFLENMQRT DGSWYGCWGV CFTYAGWFGI KGLVAAGRTY STCVAIRKAC DFLLSKELPG 660
GGWGESYLSC QNKVYTNLEG NRPHLVNTAW VLMALIEAGQ AERDPAPLHR AARLLINSQL 720
ENGDFPQEEI MGVFNKNCMI TYAAYRNIFP IWALGEYFHR VLTE 764

Claims (10)

1.一种以葡萄糖为底物微生物合成葫芦二烯醇的工程菌,其特征在于:酵母工程菌中整合了葫芦二烯醇合酶CDS基因和角鲨烯环氧化酶cpSE2基因。
2.根据权利要求1所述的工程菌,其特征在于:所述的酵母工程菌上过表达角鲨烯环氧化酶cpSE2和角鲨烯合酶ERG9;
和/或所述酵母工程菌中敲除羊毛甾醇合酶ERG7位点,在该位点调控HMGS和截短HMGR的表达。
3.根据权利要求2所述的工程菌,其特征在于:所述截短HMGR指羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端截短了前400-551个氨基酸,优选截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前500-551个氨基酸,更优选的范围为截短羟甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶蛋白N端前551个氨基酸。
4.根据权利要求1或2所述的工程菌,其特征在于:所述葫芦二烯醇合酶CDS基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.003所示,其氨基酸序列如SEQ ID NO.004所示。
5.根据权利要求1或2所述的工程菌,其特征在于:所述角鲨烯环氧化酶基因cpSE2的核苷酸序列如SEQ ID NO.001中所示,氨基酸序列如SEQ ID NO.002所示。
6.一种权利要求1所述的以葡萄糖为底物微生物合成葫芦二烯醇的工程菌的构建方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)获得西葫芦籽来源的角鲨烯环氧化酶(cpSE2)替代酵母自身来源的ERG1,其催化角鲨烯生成2,3环氧角鲨烯的能力优于酵母自身ERG1;
2)利用酵母的自身同源重组系统在Gal7位点过表达角鲨烯环氧化酶cpSE2和角鲨烯合酶ERG9;
3)敲除羊毛甾醇合ERG7,并在该位点调控HMGS和截短HMGR的表达,获得产2,3-环氧角鲨烯的工程菌;
4)构建葫芦二烯醇合酶CDS表达质粒,将质粒导入步骤3)的工程菌中,得到产葫芦二烯醇的酵母工程菌。
7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:步骤(1)为:采集西葫芦籽的RNA,经过反转录得到西葫芦籽来源的角鲨烯环氧化酶(cpSE2);
所述的酵母为酿酒酵母;
步骤(4)为:通过使用高拷贝质粒pRS313过表达葫芦二烯醇合酶CDS生物合成模块,得到产葫芦二烯醇的酵母工程菌。
8.权利要求1所述的工程菌在生物合成葫芦二烯醇中的应用。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于:所述的应用方法为:
将权利要求1所述的以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌培养,获得种子液;
将种子液接种到含有葡萄糖、氮源、金属元素和维生素的培养基中,分批流加补料发酵合成葫芦二烯醇;发酵过程中:分批补料葡萄糖控制葡萄糖浓度在10-15g/L。
10.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的发酵温度为28-32℃,发酵时间为120h-144h,发酵过程中pH控制范围为4.5-5.5;溶氧量不高于40%,优选不高于20%。
CN202111597319.3A 2021-12-24 2021-12-24 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用 Pending CN114410492A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111597319.3A CN114410492A (zh) 2021-12-24 2021-12-24 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111597319.3A CN114410492A (zh) 2021-12-24 2021-12-24 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN114410492A true CN114410492A (zh) 2022-04-29

Family

ID=81266929

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202111597319.3A Pending CN114410492A (zh) 2021-12-24 2021-12-24 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN114410492A (zh)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112921049A (zh) * 2021-02-06 2021-06-08 石河子大学 一种用于生产香草醛的基因片段、酿酒酵母工程菌及其构建方法

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109385377A (zh) * 2017-08-04 2019-02-26 中国科学院天津工业生物技术研究所 用于生产葫芦二烯醇的工程菌及其制备方法与应用
CN112063647A (zh) * 2020-09-17 2020-12-11 云南农业大学 酿酒酵母重组菌Cuol01的构建方法、酿酒酵母重组菌Cuol02及应用
CN113302298A (zh) * 2018-11-09 2021-08-24 银杏生物制品公司 罗汉果甙的生物合成
CN113755355A (zh) * 2021-09-30 2021-12-07 河北维达康生物科技有限公司 一种以葡萄糖为底物生物合成罗汉果醇的工程菌株、构建及其应用

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN109385377A (zh) * 2017-08-04 2019-02-26 中国科学院天津工业生物技术研究所 用于生产葫芦二烯醇的工程菌及其制备方法与应用
CN113302298A (zh) * 2018-11-09 2021-08-24 银杏生物制品公司 罗汉果甙的生物合成
CN112063647A (zh) * 2020-09-17 2020-12-11 云南农业大学 酿酒酵母重组菌Cuol01的构建方法、酿酒酵母重组菌Cuol02及应用
CN113755355A (zh) * 2021-09-30 2021-12-07 河北维达康生物科技有限公司 一种以葡萄糖为底物生物合成罗汉果醇的工程菌株、构建及其应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
GENBANK: "AJR21209", GENBANK, pages 1 *
GENBANK: "XP_023553953", GENBANK, pages 1 *
LEMENG DONG 等: "Co-expression of squalene epoxidases with triterpene cyclases boosts production of triterpenoids in plants and yeast", METABOLIC ENGINEERING, vol. 49, pages 1 - 12, XP085507108, DOI: 10.1016/j.ymben.2018.07.002 *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112921049A (zh) * 2021-02-06 2021-06-08 石河子大学 一种用于生产香草醛的基因片段、酿酒酵母工程菌及其构建方法
CN112921049B (zh) * 2021-02-06 2024-01-23 石河子大学 一种用于生产香草醛的基因片段、酿酒酵母工程菌及其构建方法

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN101903522B (zh) 在真核生物中生产二羧酸
US8735112B2 (en) Dicarboxylic acid production in a recombinant yeast
CN111434773B (zh) 一种高产檀香油的重组酵母菌及其构建方法与应用
TWI608097B (zh) 用於製造乳酸之微生物及使用該微生物製造乳酸的方法
CN106367361B (zh) 一种酿酒酵母工程菌株及其构建方法、应用
CN101287833A (zh) 酵母和l-乳酸的制造方法
CN112695003B (zh) 一种高产西柏三烯一醇的基因工程菌及其构建方法与应用
CN113832041B (zh) 高产赤霉素ga3的藤仓赤霉基因工程菌、构建方法及应用
CN114058525A (zh) 一种高产角鲨烯基因工程菌及其构建方法与应用
CN113755355A (zh) 一种以葡萄糖为底物生物合成罗汉果醇的工程菌株、构建及其应用
CN111088175A (zh) 一种产红没药烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与用途
CN114410492A (zh) 一种以葡萄糖为底物生物合成葫芦二烯醇的工程菌、构建及其应用
CN114517161B (zh) 高产赤霉素ga3的基因工程菌、构建方法及应用
CN115927436A (zh) 一种合成24-表麦角固醇真菌的构建方法与应用
CN106754448B (zh) 一种重组酵母菌株及其应用
CN111548946B (zh) 一种生产次丹参酮二烯的重组酵母工程菌
CN111378587B (zh) 一种合成β-法尼烯的基因工程菌及其应用
KR20130037608A (ko) 카프로산 생산용 재조합 미생물 및 이를 이용하여 카프로산을 대량 생산하는 방법
BR112021011954A2 (pt) Leveduras que produzem semi-aldeído malônico
CN117844729B (zh) 一种重组菌株及其制备方法与应用、补身醇的制备方法
CN108913732A (zh) 一种莫纳可林j异源生产的方法及应用
WO2023108503A1 (zh) 一种工程菌的构建方法及其应用
CN115305254B (zh) 一种萜类底盘微生物与工程菌及其构建方法和应用
CN116262929A (zh) 一种工程菌的构建方法及其应用
CN116478845A (zh) 一种代谢工程改造热带假丝酵母生产鼠尾草酸的方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination