CN114381514A - 检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 - Google Patents
检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN114381514A CN114381514A CN202210101156.3A CN202210101156A CN114381514A CN 114381514 A CN114381514 A CN 114381514A CN 202210101156 A CN202210101156 A CN 202210101156A CN 114381514 A CN114381514 A CN 114381514A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gene detection
- detection panel
- gene
- hypertension
- kcnj5
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 84
- 238000001514 detection method Methods 0.000 title claims abstract description 62
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 title claims abstract description 51
- 230000001919 adrenal effect Effects 0.000 title claims abstract description 42
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims abstract description 21
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 20
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 claims abstract description 7
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 32
- 102100021237 G protein-activated inward rectifier potassium channel 4 Human genes 0.000 claims description 22
- 101000614712 Homo sapiens G protein-activated inward rectifier potassium channel 4 Proteins 0.000 claims description 22
- 101000994496 Homo sapiens cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha Proteins 0.000 claims description 22
- 102100032791 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha Human genes 0.000 claims description 22
- 102000014816 CACNA1D Human genes 0.000 claims description 20
- 101000874160 Homo sapiens Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 20
- 101000867817 Homo sapiens Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D Proteins 0.000 claims description 20
- 102100035726 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 20
- 102100023509 Chloride channel protein 2 Human genes 0.000 claims description 19
- 102000000577 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p27 Human genes 0.000 claims description 19
- 108010016777 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p27 Proteins 0.000 claims description 19
- 101000906633 Homo sapiens Chloride channel protein 2 Proteins 0.000 claims description 19
- 101000951145 Homo sapiens Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 19
- 102100038014 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 19
- 101001026573 Homo sapiens cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit Proteins 0.000 claims description 18
- 102100037490 cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit Human genes 0.000 claims description 18
- 102100028914 Catenin beta-1 Human genes 0.000 claims description 17
- 101000916173 Homo sapiens Catenin beta-1 Proteins 0.000 claims description 17
- 101000728115 Homo sapiens Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3 Proteins 0.000 claims description 17
- 101000685323 Homo sapiens Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 17
- 102100029744 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3 Human genes 0.000 claims description 17
- 102100023155 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 17
- 102100025064 Cellular tumor antigen p53 Human genes 0.000 claims description 16
- 108010009911 Cytochrome P-450 CYP11B2 Proteins 0.000 claims description 16
- 102100024329 Cytochrome P450 11B2, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 16
- 102100032610 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas Human genes 0.000 claims description 16
- 101001014590 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas Proteins 0.000 claims description 16
- 101001014594 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short Proteins 0.000 claims description 16
- 101001014610 Homo sapiens Neuroendocrine secretory protein 55 Proteins 0.000 claims description 16
- 101000797903 Homo sapiens Protein ALEX Proteins 0.000 claims description 16
- 102100038042 Retinoblastoma-associated protein Human genes 0.000 claims description 16
- 108010078814 Tumor Suppressor Protein p53 Proteins 0.000 claims description 16
- 102100023180 Armadillo repeat-containing protein 5 Human genes 0.000 claims description 15
- 102100031920 Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 15
- 101000684964 Homo sapiens Armadillo repeat-containing protein 5 Proteins 0.000 claims description 15
- 101000992065 Homo sapiens Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 15
- 101000841466 Homo sapiens Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 Proteins 0.000 claims description 15
- 102100029088 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 Human genes 0.000 claims description 15
- 102100024119 CDK5 and ABL1 enzyme substrate 1 Human genes 0.000 claims description 14
- 101150077031 DAXX gene Proteins 0.000 claims description 14
- 102100028559 Death domain-associated protein 6 Human genes 0.000 claims description 14
- 102100022874 Dexamethasone-induced Ras-related protein 1 Human genes 0.000 claims description 14
- 102100036367 Dual 3',5'-cyclic-AMP and -GMP phosphodiesterase 11A Human genes 0.000 claims description 14
- 102100029974 GTPase HRas Human genes 0.000 claims description 14
- 102100039997 Gastric inhibitory polypeptide receptor Human genes 0.000 claims description 14
- 101000910461 Homo sapiens CDK5 and ABL1 enzyme substrate 1 Proteins 0.000 claims description 14
- 101000620808 Homo sapiens Dexamethasone-induced Ras-related protein 1 Proteins 0.000 claims description 14
- 101001072029 Homo sapiens Dual 3',5'-cyclic-AMP and -GMP phosphodiesterase 11A Proteins 0.000 claims description 14
- 101000584633 Homo sapiens GTPase HRas Proteins 0.000 claims description 14
- 101000886866 Homo sapiens Gastric inhibitory polypeptide receptor Proteins 0.000 claims description 14
- 101000971697 Homo sapiens Kinesin-like protein KIF1B Proteins 0.000 claims description 14
- 101000579425 Homo sapiens Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret Proteins 0.000 claims description 14
- 101000934888 Homo sapiens Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 14
- 101000637950 Homo sapiens Transmembrane protein 127 Proteins 0.000 claims description 14
- 102100021524 Kinesin-like protein KIF1B Human genes 0.000 claims description 14
- 102000007530 Neurofibromin 1 Human genes 0.000 claims description 14
- 108010085793 Neurofibromin 1 Proteins 0.000 claims description 14
- 102100028286 Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret Human genes 0.000 claims description 14
- 102100031715 Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 14
- 108050007461 Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 14
- 102100025393 Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 14
- 102100032072 Transmembrane protein 127 Human genes 0.000 claims description 14
- 102100022455 Adrenocorticotropic hormone receptor Human genes 0.000 claims description 13
- 101001042041 Bos taurus Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 13
- 102100021975 CREB-binding protein Human genes 0.000 claims description 13
- ZEOWTGPWHLSLOG-UHFFFAOYSA-N Cc1ccc(cc1-c1ccc2c(n[nH]c2c1)-c1cnn(c1)C1CC1)C(=O)Nc1cccc(c1)C(F)(F)F Chemical compound Cc1ccc(cc1-c1ccc2c(n[nH]c2c1)-c1cnn(c1)C1CC1)C(=O)Nc1cccc(c1)C(F)(F)F ZEOWTGPWHLSLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 102100031634 Cold shock domain-containing protein E1 Human genes 0.000 claims description 13
- 108010025464 Cyclin-Dependent Kinase 4 Proteins 0.000 claims description 13
- 108010009392 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16 Proteins 0.000 claims description 13
- 102000004480 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p57 Human genes 0.000 claims description 13
- 108010017222 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p57 Proteins 0.000 claims description 13
- 102100036252 Cyclin-dependent kinase 4 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100024458 Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A Human genes 0.000 claims description 13
- 108050002772 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Proteins 0.000 claims description 13
- 102000012199 E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100037249 Egl nine homolog 1 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100036448 Endothelial PAS domain-containing protein 1 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100023593 Fibroblast growth factor receptor 1 Human genes 0.000 claims description 13
- 101710182386 Fibroblast growth factor receptor 1 Proteins 0.000 claims description 13
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 claims description 13
- 108091059596 H3F3A Proteins 0.000 claims description 13
- 102100024229 High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B Human genes 0.000 claims description 13
- 101710145025 High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B Proteins 0.000 claims description 13
- 102100039236 Histone H3.3 Human genes 0.000 claims description 13
- 101000678419 Homo sapiens Adrenocorticotropic hormone receptor Proteins 0.000 claims description 13
- 101000896987 Homo sapiens CREB-binding protein Proteins 0.000 claims description 13
- 101000940535 Homo sapiens Cold shock domain-containing protein E1 Proteins 0.000 claims description 13
- 101000802406 Homo sapiens E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3 Proteins 0.000 claims description 13
- 101000881648 Homo sapiens Egl nine homolog 1 Proteins 0.000 claims description 13
- 101000960234 Homo sapiens Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic Proteins 0.000 claims description 13
- 101001033820 Homo sapiens Malate dehydrogenase, mitochondrial Proteins 0.000 claims description 13
- 101001005668 Homo sapiens Mastermind-like protein 3 Proteins 0.000 claims description 13
- 101000881650 Homo sapiens Prolyl hydroxylase EGLN2 Proteins 0.000 claims description 13
- 101000944219 Homo sapiens cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta Proteins 0.000 claims description 13
- 102000004901 Iron regulatory protein 1 Human genes 0.000 claims description 13
- 108090001025 Iron regulatory protein 1 Proteins 0.000 claims description 13
- 102100039905 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic Human genes 0.000 claims description 13
- 102100039742 Malate dehydrogenase, mitochondrial Human genes 0.000 claims description 13
- 102100025134 Mastermind-like protein 3 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100021769 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein Human genes 0.000 claims description 13
- 102100037248 Prolyl hydroxylase EGLN2 Human genes 0.000 claims description 13
- 108091006417 SLC25A11 Proteins 0.000 claims description 13
- 102000006083 ZNRF3 Human genes 0.000 claims description 13
- 102100033065 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta Human genes 0.000 claims description 13
- 108010018033 endothelial PAS domain-containing protein 1 Proteins 0.000 claims description 13
- 101100489867 Mus musculus Got2 gene Proteins 0.000 claims description 12
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 12
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 12
- 101710083984 AH receptor-interacting protein Proteins 0.000 claims description 11
- 102100034540 Adenomatous polyposis coli protein Human genes 0.000 claims description 11
- 102100039723 Aurora kinase A-interacting protein Human genes 0.000 claims description 11
- 102100031561 Hamartin Human genes 0.000 claims description 11
- 101000924577 Homo sapiens Adenomatous polyposis coli protein Proteins 0.000 claims description 11
- 101000795643 Homo sapiens Hamartin Proteins 0.000 claims description 11
- 101000582631 Homo sapiens Menin Proteins 0.000 claims description 11
- 101000742859 Homo sapiens Retinoblastoma-associated protein Proteins 0.000 claims description 11
- 101000795659 Homo sapiens Tuberin Proteins 0.000 claims description 11
- 102100030550 Menin Human genes 0.000 claims description 11
- 102100031638 Tuberin Human genes 0.000 claims description 11
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 11
- 102100025684 APC membrane recruitment protein 1 Human genes 0.000 claims description 10
- -1 ATP1a1 Proteins 0.000 claims description 10
- 101150020330 ATRX gene Proteins 0.000 claims description 10
- 101000719162 Homo sapiens APC membrane recruitment protein 1 Proteins 0.000 claims description 10
- 101000783469 Naja kaouthia Tryptophan-containing weak neurotoxin Proteins 0.000 claims description 10
- 102000056014 X-linked Nuclear Human genes 0.000 claims description 10
- 108700042462 X-linked Nuclear Proteins 0.000 claims description 10
- 101000701334 Homo sapiens Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 Proteins 0.000 claims description 7
- 102100030458 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 Human genes 0.000 claims description 7
- 102000014835 CACNA1H Human genes 0.000 claims description 6
- 101000932804 Homo sapiens Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1H Proteins 0.000 claims description 6
- 238000003766 bioinformatics method Methods 0.000 claims description 6
- 102100038885 Histone acetyltransferase p300 Human genes 0.000 claims description 4
- 101000882390 Homo sapiens Histone acetyltransferase p300 Proteins 0.000 claims description 4
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 claims description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 abstract description 23
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 abstract description 12
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 abstract description 12
- 208000014311 Cushing syndrome Diseases 0.000 abstract description 11
- 208000016998 Conn syndrome Diseases 0.000 abstract description 10
- 208000013846 primary aldosteronism Diseases 0.000 abstract description 10
- 206010061332 Paraganglion neoplasm Diseases 0.000 abstract description 8
- 201000005255 adrenal gland hyperfunction Diseases 0.000 abstract description 8
- 208000007312 paraganglioma Diseases 0.000 abstract description 8
- 208000028591 pheochromocytoma Diseases 0.000 abstract description 8
- 208000037171 Hypercorticoidism Diseases 0.000 abstract description 7
- 201000009395 primary hyperaldosteronism Diseases 0.000 abstract description 5
- 238000003759 clinical diagnosis Methods 0.000 abstract description 4
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 23
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 21
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 21
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 18
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 18
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 16
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 14
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 8
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 8
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 8
- 238000007885 magnetic separation Methods 0.000 description 7
- 208000019025 Hypokalemia Diseases 0.000 description 6
- 208000024896 potassium deficiency disease Diseases 0.000 description 6
- 238000011160 research Methods 0.000 description 6
- 229910001868 water Inorganic materials 0.000 description 6
- 201000004239 Secondary hypertension Diseases 0.000 description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 5
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 5
- 239000000047 product Substances 0.000 description 5
- 238000013515 script Methods 0.000 description 5
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 5
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000007664 blowing Methods 0.000 description 4
- 238000013461 design Methods 0.000 description 4
- 238000001821 nucleic acid purification Methods 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 4
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 3
- PQSUYGKTWSAVDQ-ZVIOFETBSA-N Aldosterone Chemical compound C([C@@]1([C@@H](C(=O)CO)CC[C@H]1[C@@H]1CC2)C=O)[C@H](O)[C@@H]1[C@]1(C)C2=CC(=O)CC1 PQSUYGKTWSAVDQ-ZVIOFETBSA-N 0.000 description 3
- PQSUYGKTWSAVDQ-UHFFFAOYSA-N Aldosterone Natural products C1CC2C3CCC(C(=O)CO)C3(C=O)CC(O)C2C2(C)C1=CC(=O)CC2 PQSUYGKTWSAVDQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000007530 Essential hypertension Diseases 0.000 description 3
- 229960002478 aldosterone Drugs 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 3
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 3
- 230000007918 pathogenicity Effects 0.000 description 3
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 3
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 239000011534 wash buffer Substances 0.000 description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 2
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 2
- 108091008794 FGF receptors Proteins 0.000 description 2
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 102000052178 fibroblast growth factor receptor activity proteins Human genes 0.000 description 2
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 2
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- JYGXADMDTFJGBT-VWUMJDOOSA-N hydrocortisone Chemical compound O=C1CC[C@]2(C)[C@H]3[C@@H](O)C[C@](C)([C@@](CC4)(O)C(=O)CO)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1 JYGXADMDTFJGBT-VWUMJDOOSA-N 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000036438 mutation frequency Effects 0.000 description 2
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 2
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 2
- 230000010355 oscillation Effects 0.000 description 2
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 101150084750 1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150000874 11 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150028074 2 gene Proteins 0.000 description 1
- 208000004611 Abdominal Obesity Diseases 0.000 description 1
- 208000003200 Adenoma Diseases 0.000 description 1
- 206010001233 Adenoma benign Diseases 0.000 description 1
- 102100034193 Aspartate aminotransferase, mitochondrial Human genes 0.000 description 1
- 206010065941 Central obesity Diseases 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 238000013382 DNA quantification Methods 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 108091092584 GDNA Proteins 0.000 description 1
- 241000222336 Ganoderma Species 0.000 description 1
- 101000799549 Homo sapiens Aspartate aminotransferase, mitochondrial Proteins 0.000 description 1
- 206010020571 Hyperaldosteronism Diseases 0.000 description 1
- 101150051253 KCNJ5 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 208000001132 Osteoporosis Diseases 0.000 description 1
- 208000010067 Pituitary ACTH Hypersecretion Diseases 0.000 description 1
- 208000020627 Pituitary-dependent Cushing syndrome Diseases 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 239000012148 binding buffer Substances 0.000 description 1
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 230000023852 carbohydrate metabolic process Effects 0.000 description 1
- 235000021256 carbohydrate metabolism Nutrition 0.000 description 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- ANTSCNMPPGJYLG-UHFFFAOYSA-N chlordiazepoxide Chemical compound O=N=1CC(NC)=NC2=CC=C(Cl)C=C2C=1C1=CC=CC=C1 ANTSCNMPPGJYLG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 239000013024 dilution buffer Substances 0.000 description 1
- 239000011363 dried mixture Substances 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 229960000890 hydrocortisone Drugs 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 208000029390 inherited neuroendocrine tumor Diseases 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000000392 somatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 238000009987 spinning Methods 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000013589 supplement Substances 0.000 description 1
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 1
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 238000003260 vortexing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/20—Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
- G16B20/50—Mutagenesis
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Artificial Intelligence (AREA)
- Computer Vision & Pattern Recognition (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Evolutionary Computation (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Software Systems (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及生物检测领域,具体地,涉及肾上腺高血压的基因检测panel。进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,包括该基因检测panel的试剂和装置,以及该基因检测panel的用途。使用上述本发明的基因检测panel,结合生物学和生物信息学的相关手段,可以对潜在的致病性突变进行筛选,从而可以结合临床筛查手段和临床表型提高对原发性醛固酮增多症、库欣综合征(皮质醇增多症),以及嗜铬细胞瘤和副神经节瘤的诊断的效率,弥补目前临床诊断不足的问题。同时灵敏度高,成本和操作难度低。
Description
技术领域
本发明属于生物检测领域,具体地,涉及肾上腺高血压的基因检测panel。
背景技术
高血压根据发病原因可分为原发性高血压和继发性高血压。原发性高血压 是指病因不明确的高血压;继发性高血压是指病因明确的高血压,即由其他器 官或系统的疾病(原发病)所导致的高血压,又称为症状性高血压。继发性高 血压的发病率大约占高血压的总体发病率的10%~20%,肾上腺性高血压是继 发性高血压中常见的类型,约占继发性高血压的20%以上,肾上腺性高血压是 指由各种原因导致肾上腺相关激素分泌增加从而引起血压升高,包括原发性醛 固酮增多症(原醛症)、库欣综合征和嗜铬细胞瘤和副神经节瘤等。与原发性 高血压相比,肾上腺性高血压具有起病年轻、伴有激素分泌异常,常伴有高血压以外的其他损害、高血压多为顽固性、并发症多,致死率与致残率较高、确 诊后可通过手术或药物得到根治或有效治疗的特点。
目前肾上腺性高血压的诊断仍主要依靠临床表现、生化检查,以及影像学 检查等,缺点是临床表现不典型、生化指标检出率低,且易受外界因素干扰等 而导致误诊或漏诊。例如常见的肾上腺性高血压原醛症,目前不少医生(甚至 专科医生)尚停留在根据“高血压伴低血钾”的线索来筛查原醛症的“初级水平”。 据研究报道,仅少部分原醛症患者存在低钾血症,醛固酮腺瘤患者约50%表现 有低钾血症,而特发性醛固酮增多症的患者中仅17%表现有低钾血症。因此, 低钾血症对于原醛症的诊断价值有限,敏感性非常低。
研究表明,肾上腺性高血压发生与基因突变存在密切的关系,已有不少基 因明确与其发生发展相关。这些与肾上腺性高血压发生发展相关的基因突变多 数分布于整个编码区,没有明显的突变热点,胚系突变和体细胞突变均与疾病 的发生相关,并且体细胞突变的占比不低,如醛固酮瘤的KCNJ5基因体细胞突 变率为50%~60%,亚洲国家醛固酮瘤的KCNJ5突变率高达65%~80%。
因此,本领域需求一种基因检测产品,其联合临床表征与目前的筛查手段 相结合的方式,以提高诊断的效率,让更多的患者更早的接受相应的治疗,提 高患者的生活质量,弥补目前临床诊断不足的问题。
发明内容
有鉴于此,第一方面,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel, 其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H中的至少两个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、 MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、 DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少 两个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、 PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少两个。
研究表明,与原醛症的发生相关的常见基因包括ATP1A、ATP2B3、 CACNA1D、CACNA1H、CTNNB1、PRKACA等数十个。嗜铬细胞瘤和副神 经节瘤(pheochromocytoma andparaganglioma,PPGL)是目前已知的遗传度最 高的神经内分泌肿瘤。目前认为,PPGL的发生与致病基因的突变有关,约70% 的PPGL患者可检测到明确的致病基因,其中40%的患者存在胚系突变。目前 研究发现了至少30个与PPGL发生有关的致病基因。库欣综合征(Cushing’s Disease)是又称皮质醇增多症,是由各种病因导致的高皮质醇血症,作用于靶器 官,引起的以向心性肥胖、高血压、糖代谢异常、低钾血症和骨质疏松为典型 表现的一种综合征。目前研究发现了至少30个与库欣综合征发生有关的致病基 因,包括USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、RET、 CDKN1B、TSC1、TSC2、RB1、TP53、NF1、VHL、PRKACA、APC、ARMC5、 GIPR等,这些基因主要是通过影响皮质醇的的过量分泌从而导致疾病的发生。选取特异有效基因集合对疾病的辅助诊断非常关键,漏选会降低检测敏感度, 多选则会增加成本和操作难度。本专利发明通过查询大量疾病数据库和文献研 究中关于肾上腺高血压相关疾病研究记录,包括OMIM、ClinVar、DISEASE、 GeneReviews,选取有充分证据可以导致肾上腺性高血压的基因/变异,这些证 据包括基因、蛋白功能研究、家系遗传性研究、人群变异分析等。最终选取了 本发明使用的64个肾上腺性高血压的相关基因的各种组合,其对应基因名称列 举如上(所述基因的相关信息可参见在线《人类孟德尔遗传》(OMIM,Online Mendelian Inheritance in Man)数据库https://www.omim.org/)。使用这些基因的组合能够最大限度的增加灵敏度并降低成本和操作难度。
使用上述本发明的基因检测panel,结合生物学和生物信息学的相关手段, 可以对潜在的致病性突变进行筛选,从而可以结合临床筛查手段和临床表型提 高对原发性醛固酮增多症、库欣综合征(皮质醇增多症),以及嗜铬细胞瘤和 副神经节瘤的诊断的效率,弥补目前临床诊断不足的问题。同时灵敏度高,成 本和操作难度低。
其中,KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H为原发性醛固酮增多症相关基因;SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、 SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、 HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2为嗜铬细胞瘤和副神经节瘤相关基因;以及USP8、 GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、TSC1、TSC2、 RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、 PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300为皮质醇增多症相关基因。
更进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H中的至少三个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、 MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、 DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少 三个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、 PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少三个。
更进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H中的至少五个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、 MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、 DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少 五个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、 PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少五个。
使用上述本发明的基因检测panel,其检测的灵敏度更高,漏检率更低。
更进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、 MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、 DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、 PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300。
使用上述本发明的基因检测panel,能够最大程度的提升检测的灵敏度和覆 盖范围,使得漏检率更低。
第二方面,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、SDHB、PRKACA;和
CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H 中的至少两个;和
SDHA、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、 RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、 FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少两个; 以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、 PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少两个。
进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、SDHB、PRKACA;和
CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H 中的至少三个;和
SDHA、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、 RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、 FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少三个; 以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、 PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少三个。
更进一步地,本发明提供了一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、SDHB、PRKACA;和
CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H 中的至少五个;和
SDHA、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、 RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、 FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少五个; 以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、 PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300中的至少五个。
使用上述本发明的基因检测panel,其检测的灵敏度更高,漏检率更低。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第一基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D;
SDHB、SDHD;以及
PRKACA、APC。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第二基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CLCN2;
SDHB、TMEM127;以及
PRKACA、CDKN1B。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第三基因检测 panel,其包括:
CACNA1D、CLCN2;
SDHD、TMEM127;以及
APC、CDKN1B。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第四基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1;
SDHA、SDHB、SDHD;以及
PRKACA、APC、ARMC5。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第五基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CLCN2、CYP11B2;
SDHD、VHL、EPAS1;以及
PRKACA、APC、CDKN1B。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第六基因检测 panel,其包括:
CYP11B2、CLCN2、CYP11B2;
SDHB、DLST、FGFR1;以及
DAXX、APC、CDKN1B。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第七基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、ATP2B3、CTNNB1;
SDHD、SDHAF2、FH;以及
PRKAR1A、RB1、TP53。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第八基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2;以及
PRKAR1A、RB1、TP53、PRKACA、APC。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第九基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、CLCN2、CTNNB1;
SDHA、SDHB、KIF1B、DLST、FGFR1;以及
PRKAR1A、USP8、GNAS、PRKACA、APC。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第十基因检测 panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、CACNA1H、CLCN2、ATP2B3;
SDHA、SDHB、TMEM127、HRAS、EGLN1;以及
PRKAR1A、CDKN1B、GNAS、PRKACA、PDE11A。
在一个具体的实施方案中,本发明提供了肾上腺高血压的第十一基因检测panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、 CACNA1H;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、 MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、 DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、 TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、 PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、 WTX、CREBBP、EP300。
另一方面,本发明还提供上述基因panel在辅助诊断肾上腺高血压患者病 因的装置中的应用。
又一方面,本发明还提供上述基因panel在辅助诊断肾上腺高血压患者病 因的试剂中的应用。
又一方面,本发明提供了如上所述用途所制备的试剂。
进一步地,所述试剂为基因芯片、检测突变的PCR引物和探针、高通量测 序所用试剂。
在一些具体的实施方案中,基因芯片包括针对上述panel的捕获探针。进 一步地,对应设计捕获探针的区域如表1所示。
在一些具体的实施方案中,高通量测序所用试剂包括Nextseq 500 Mid OutputKit v2.5或Nextseq 500 Mid Output Kit v2。
又一方面,本发明提供了一种辅助诊断肾上腺高血压患者病因的装置,其 包括:
检测模块,包括检测如上所述的基因panel的试剂;
数据处理模块,包括处理所述检测模块获得的数据,并与参考序列进行比 对,获得序列比对结果;以及
筛选模块,包括对所述序列比对结果进行注释并筛选潜在突变基因。
所述参考序列为所提及的上述基因在参考基因组(hg19)上的序列。
又一方面,本发明一种基因突变的筛选方法,包括针对测试对象利用上述 的基因panel通过检测并结合生物信息学分析进行数据处理和基因突变筛选。
在一个具体的实施方案中,一种基因突变的筛选方法,包括针对测试对象 利用上述的基因panel通过高通量测序并结合生物信息学分析进行数据处理和 基因突变筛选。
在一个具体的实施方案中,一种基因突变的筛选方法,包括针对测试对象 利用上述的基因panel通过芯片捕获并结合生物信息学分析进行数据处理和基 因突变筛选。
在一个具体的实施方案中,一种基因突变的筛选方法,包括针对测试对象 利用上述的基因panel通过PCR筛选并结合生物信息学分析进行数据处理和基 因突变筛选。
在一些具体的实施方案中,数据处理和基因突变筛选包括测序数据下机后, 将通过对数据进行质控,比对、比对预处理及重比对,单核苷酸突变(SNVs) calling、短插入/缺失(InDels)突变calling、融合、拷贝数变异(CNVs)、结 果过滤及注释得到检测结果。得到的初步突变结果将根据变异(SNV、Indel、 CNV、融合)与疾病之间的关系,结合受检者临床表型、家族史和具体研究文 献,依据ACMG/AMP指南把变异分成5类:致病、疑似致病、意义未明、疑 似良性、良性。通过以上筛选步骤得到受检者基因突变信息。
附图说明
图1为本发明检测方法的流程图。
具体实施方式
本发明的检测方法流程如图1所示,而下文将结合具体实施方案和实施例, 具体阐述本发明,本发明的优点和各种效果将由此更加清楚地呈现。本领域技 术人员应理解,这些具体实施方案和实施例是用于说明本发明,而非限制本发 明。
实施例1、待测样本处理
1.1、样本提取
使用商品化试剂盒QIAamp DNA FFPE Tissue Kit,按照说明书进行提取。
1.2、DNA样本质量要求
注:提取后的样本DNA,如不立即进行后续实验,可在-20℃以下保存12 个月。
2、文库构建
2.1、DNA打断
A、DNA投入量为0.1μg~0.5μg,选择破碎片段大小为150bp~300bp。
B、使用新芝超声破碎仪超声打断。推荐打断条件如下:
超声打断总时间40min,功率40%,打断模式:超声5s,停5s。
2.2、片段化纯化
A、AMPureXP磁珠在使用前充分漩涡震荡混匀。
B、加入样品体积0.6倍的核酸纯化试剂,用移液器上下混匀10次。
C、室温下静置5min后,置于磁力分离架上5min,直至上清澄清。
D、小心吸取上清转移至含有0.9倍的核酸纯化试剂,用移液器上下混匀 10次。
E、室温下静置5min后,置于磁力分离架上5min,直至上清澄清。小心移 去上清。
F、置于磁力分离架上,加入200μL新鲜配制的80%乙醇,室温静置30sec, 吸弃上清。
G、重复步骤D,并尽量去除所有残留乙醇溶液。
H、离心管留于磁力架上室温开盖5min干燥,使乙醇全部挥发。
I、加入43μL无酶水,使用移液器上下混匀10次。室温孵育5min。
J、置于1.5mL磁力架上5min,取41μL DNA溶液进入下一步文库构建实 验。
2.3、末端修复加A
A、在0.2mL PCR管中,如下配制文库混合液1。
组分 | 加样量(μL) |
片段化DNA | 41 |
10×T4 PNK缓冲液 | 5 |
dNTP Mix(25mM) | 0.7 |
T4 DNA聚合酶 | 1.2 |
T4 PNK | 1.2 |
Klenow Fragment | 0.7 |
Taq DNA连接酶 | 0.2 |
总体积 | 50 |
B、使用移液器上下吹吸将液体混匀,快速离心收集液体。
C、将文库混合液1置于PCR热循环仪中按照以下条件进行孵育。
2.4加接头
A、孵育完成后按下表向装有混合液1的反应管中加入试剂盒内相应组分 试剂,完成混合液2配制(配置过程于冰上完成)。
组分 | 加样量(μL) |
2×Rapid连接酶缓冲液 | 40 |
Adapter(10μM) | 6 |
T4 DNA连接酶 | 4 |
总体积 | 50 |
B、使用移液器上下吹吸将液体混匀,快速离心收集液体。将反应管置于 PCR仪上,20℃孵育20min。
2.5、Adaptor连接产物纯化
A、AMPureXP磁珠在使用前充分漩涡震荡混匀。
B、连接反应完成后,立即加入连接反应体积0.8倍的核酸纯化试剂。使用 移液器上下混匀10次。
C、室温下静置5min后,置于磁力分离架上5min,直至上清澄清。小心移 去上清。
D、置于磁力分离架上,加入200μL新鲜配制的80%乙醇,室温静置30sec, 吸弃上清。
E、重复步骤D,并尽量去除所有残留乙醇溶液。
F、离心管留于磁力架上室温开盖5min干燥,保证所有乙醇全部挥发。
G、加入22.5μL无酶水,使用适宜量程的移液器上下混匀10次。室温孵 育5min。
H、置于磁力架上5min,取20μL DNA溶液进入PCR扩增。
2.6、PCR扩增
A、如下加入试剂,配制混合液3(配置过程于冰上完成):
B、使用移液器上下吹吸将液体混匀,短暂离心收集液体。
C、将配制好的混合液3置于PCR仪,按以下反应程序扩增:
2.7、PCR产物纯化
A、AMPureXP磁珠在使用前充分漩涡震荡混匀。
B、连接反应完成后,立即加入连接反应体积0.8倍的核酸纯化试剂。使用 移液器上下混匀10次。
C、室温下静置5min后,置于磁力分离架上5min,直至上清澄清。小心移 去上清。
D、置于磁力分离架上,加入200μL新鲜配制的80%乙醇,室温静置30sec, 吸弃上清。
E、重复步骤D,并尽量去除所有残留乙醇溶液。
F、离心管留于磁力架上室温开盖5min干燥,保证所有乙醇全部挥发。
G、加入32.5μL无酶水,使用适宜量程的移液器上下混匀10次。室温孵 育5min。
实施例2、捕获探针合成
据上述筛选出的目的基因总计64个基因,进行panel设计。设计区域为各 基因外显子区。探针设计使用Twist提供的设计网站,依据上述要求提交设计。 将设计得到的探针进行比对分析,针对覆盖度低的基因增加探针覆盖度,使得 覆盖度达到99.9%以上。最终调整完成的目标区域大小为161kb,目标区域覆 盖度为100%,设计完成的最终探针包交于Twist进行合成,合成的探针待捕获 使用。设计捕获探针的区域如表1所示。
表1基因目标区域
实施例3、杂交捕获
3.1、文库杂交
A、文库池常包含多个不同样本文库,根据文库DNA浓度计算文库池进入 量,混合获得文库池。文库池DNA总量为1.5μg。
B、文库池DNA混合方案,根据下列公式计算每个样本文库加入体积
V=X/C
说明:当n=1~3时,X(ng)=500;当n=4~8时;X(ng)=1500/n。
n为样本数量,C为DNA定量浓度,V为样本杂交体积。
根据上表计算计算每个样本的文库富集进入量,从而混合各样本得到文库 池。
C、文库池按下表加入试剂,于1.5mL离心管中配制混合液4。
组分 | 加样量(μL) |
Twist Probe Panel | 4 |
Μniversal Blockers | 8 |
Blocker Solution | 5 |
D、使用移液器上下吹吸将液体混匀,短暂离心收集液体。
E、使用可控温真空干燥仪,建议设置干燥温度60℃,打开管盖,直至混 合液4干燥完全。
F、另取0.2mL PCR管,按下表加入试剂盒内相应组分,配制混合液5:
G、将50μL混合液5加入到干燥后混合液4的反应管中,室温静置10min。 使用移液器上下吹吸10次,完全溶解DNA后,转移至新的PCR管中。
H、PCR管置于PCR仪并设定程序:95℃加热10分钟,60℃,加热4小 时。
3.2、文库捕获和清洗
A、捕获磁珠和纯化磁珠提前拿出来室温平衡30min;410μL Fast Wash buffer预热66℃,700μL Wash Buffer2预热48℃。
B、100μL捕获磁珠加入0.2mL PCR管,漩涡震荡15s,短暂离心,上磁 力架,澄清后,缓慢吸弃上清,不要有残留,也不要吸到磁珠。
C、加入200μL Fast Binding Bμffer,拿下磁力架,震荡混匀10s,再放到 磁力架上,澄清后,缓慢吸弃上清,不要有残留,也不要吸到磁珠。
D、重复C两遍。
E、将含200μL Binding Buffer的链霉素磁珠快速加入到放置在PCR仪中 的杂交产物(保持温度60℃)中,移液器吹打混匀,不要漩涡。室温孵育15min, 在垂直混匀仪上保持轻微摇动。孵育完后放置在磁力架上1min,澄清后,吸弃 上清。
F、加入200μL的66℃Fast Wash buffer漩涡震荡10s,稍加离心,直接 PCR仪上66℃孵育5min,放到磁力架1min,澄清后,缓慢吸弃上清,不要有 残留,也不要吸到磁珠。
G、加入200μL的66℃Fast Wash buffer漩涡震荡10s,稍加离心,直接 PCR仪上66℃孵育5min后,吹打混匀,转入新的0.2mL PCR管中,放到磁力 架1min,澄清,缓慢吸弃上清,不要有残留,也不要吸到磁珠。
H、加入200μL的48℃Wash Buffer2漩涡震荡10s,稍加离心,直接PCR 仪上66℃孵育5min后,放到磁力架1min,澄清后,缓慢吸弃上清,不要有残 留,也不要吸到磁珠。
I、重复H两遍。
J、加入21μL的超纯水震荡混匀,重悬磁珠备用(注意必须带磁珠进行 PCR)。
K、如下配制反应液至0.2mL PCR管。
将重悬磁珠22.5μL(体积若不够补水至22.5μL)加入有反应液的0.2mL PCR管,震荡混匀,短暂离心,放入PCR仪器中,反应程序如下:98℃45s; 98℃15s,60℃30s,72℃30s,14循环;72℃2min,4℃。
3.3、PCR反应后纯化
A、将上一步产物转入1.5mL离心管中,加入90μL(1.8×)Twist Beads, 吹打混匀,静置5min,上磁力架,澄清后,去掉上清,不可吸到磁珠。
B、加入200μL 80%乙醇漂洗磁珠,在磁力架上旋转0.2mL PCR管两次, 小心移除上清,不可吸到磁珠。
C、加入200μL 80%乙醇漂洗磁珠,在磁力架上吹吸乙醇,使磁珠更聚集, 小心移除上清,不可吸到磁珠。
D、放置于金属浴中37℃烘干至磁珠表面无明显反光,加入34μL H2O洗 脱,吹打混匀,静置3min,上磁力架上;
E、待溶液澄清后转移33μL上清至新的1.5mL的离心管中(核对样本编 号,做好唯一性标记),震荡混匀,取1μL QB定量,记录浓度,样本-20℃保 存。
4、测序
4.1、文库预处理
4.1.1、准备变性试剂:取200μL1N文库变性液浓储,加800μL无酶水配 置成0.2N文库变性液,涡旋混匀,短暂离心,室温放置备用。
4.1.2、文库变性:取5μL文库(4nM)至低吸附管管底,再加入5μL 0.2N 文库变性液,吹打混匀。关闭管盖室温孵育5min,之后立即置于冰上。
4.1.3、文库稀释:变性后的10μL文库中加入990μL冰上预冷的稀释缓冲 液,混匀后快速离心,置于冰上备用。
4.2、上样
4.2.1、使用洁净的1mL枪头刺穿Load Samples(装入样品)孔的封箔,将 1300μL已制备文库注入Load Samples(装入样品)孔中。避免接触封箔。
4.2.2、加载样品后检查孔中是否有气泡,如果有气泡在工作台轻轻敲打试 剂盒以释放气泡。
4.2.3、将加载好样品的测序试剂盒使用Nextseq CN500测序仪进行测序。
5、数据分析
测序数据下机后,对数据进行生物信息学分析,检测基因上的突变。具体 步骤如下:
5.1、数据质控:采用fastq(v2)对每个样本文库每个lane的fastq数据文 件进行去接头、去低质量(如包含过多的‘N’)reads过滤,得到高质量的clean reads,并生成过滤统计(包括接头统计、数据过滤前后Q20、Q30、GC含量、 碱基质量分布等)。
5.2、比对:使用比对软件bwa-mem2(v2.0)将clean reads比对到人类参 考基因组GRCh37上,得到reads在基因组上的比对信息文件BAM。
5.3、比对预处理及重比对:包括使用in-house scripts对BAM结果进行过 滤(去除多比对位置的reads记录)、Picard Tools(v1.92)对BAM进行基因 组位置排序、GATK对BAM进行重比对、samtools(v1.9)对同一个文库样本 不同lane的BAM文件进行合并、PicardTools对合并后的BAM文件做目标区 域捕获芯片的覆盖度、深度、捕获效率、均一性,可比对序列和碱基的数量等 统计。
5.4、单核苷酸突变(SNVs)calling:采用samtools对最终的BAM生成 mpileup文件,并采用in-house scripts对SNVs进行calling。大致原理为:通过 对每一个位点的碱基型进行扫描,得到碱基分布表,再通过过滤条件,找出可 疑的突变;采用ANNOVAR对突变结果注释。
5.5、短插入/缺失(InDels)突变calling:采用in-house scripts对BAM文 件中的每一个记录进行扫描,找到所有可疑的缺失和插入;采用ANNOVAR对 突变结果注释。
5.6、融合:采用in-house scripts对BAM进行过滤(过滤掉完全比对的条 目),再从原始fastq reads文件里提取fusion fq reads,采用fusionScan软件对 以上reads做融合分析。
5.7、拷贝数变异(CNVs):通过in-house scripts对每个位点的深度统计, 并对背景库做矫正后得到每个区段的相对拷贝数。
5.8、结果过滤及注释:通过建立的背景库、突变特征等对以上原始SNVs、 InDels、fusion、CNVs结果做过滤,得到最终突变结果;如果有对照gDNA样 本,会对结果做“体细胞”或“遗传(杂合/纯合)”注释。
6、结果解读
结果解读主要是解释变异(SNV、Indel、CNV、融合)与疾病之间的关系, 依据ACMG/AMP指南把变异分成5类:致病、疑似致病、意义未明、疑似良 性、良性,通过使用内部软件结合人工实现。其中人工处理包括结合受检者临 床表型、家族史和具体研究文献对变异证据进行调整。
具体如下:
6.1、加载数据库:加载疾病数据库和自定义数据库。
6.2、收集变异信息:对输入的变异信息逐个读取基本变异信息、人群变异 频率数据、疾病变异数据、变异功能预测数据以及变异保守性等其他数据信息。
6.3、处理解读证据:
i)使用收集的变异信息,依次判断每个变异是否满足致病性或者良性证据。 其中致病性证据包括:极强致病的(PVS)、强致病的(PS)、中等致病的(PM)、弱 致病的(PP),良性证据包括:独立良性(BA)、强良性的(BS)、弱良性的(BP)。ii) 组合变异证据,根据ACMG/AMP组合规则给每个变异分类:致病、疑似致病、 意义未明、疑似良性、良性。
实施例4、本发明基因panel检测临床样本
本发明所使用的的基因panel,如下表2所示。
表2、本发明所使用的基因panel
使用如上所述的方法,用本发明所提及的11个基因panel对35例临床样 本进行检测之后进行临床诊断。其临床检测结果如表3所示,而基因panel检 测结果如下表4所示。
表3、临床检测结果
样本编号 | 相关疾病 |
3 | 原发性醛固酮增多症 |
4 | 皮质醇增多症 |
6 | 原发性醛固酮增多症 |
9 | 原发性醛固酮增多症 |
14 | 皮质醇增多症 |
12 | 原发性醛固酮增多症 |
15 | 原发性醛固酮增多症 |
18 | 原发性醛固酮增多症 |
22 | 皮质醇增多症 |
24 | 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤 |
28 | 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤 |
33 | 嗜铬细胞瘤和副神经节瘤 |
表4、基因panel检测结果
从上表可以看出,本发明所涉及的基因检测panel均能够在一定程度上辅 助检测相关临床疾病,为医生的及时诊断提供方向,其灵敏度高,漏检率低, 时间短,成本和操作难度低。
实施例5、本发明基因panel灵敏度检测
选取三个不同突变的标准品,以初始DNA投入量为0.1μg进行DNA打断 后平行测试3批次0.5%、1%、2%、3%、4%、5%突变频率的标准品,每批次 每个浓度的标准品测试10次,取10次测试的突变频率的平均值,具体数据如 下表5所示。结果显示:不同检测限待测位点均能稳定检出,待检位点总体与 梯度存在线性关系,在投入量为0.1μg的条件下,突变检测下限(分析灵敏度) 为0.5%,表明该检测方法灵敏度高。
表5、灵敏度检测
Claims (10)
1.一种肾上腺高血压的基因检测panel,其包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H中的至少两个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少两个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、WTX、CREBBP、EP300中的至少两个。
2.根据权利要求1所述的基因检测panel,其中,所述基因检测panel进一步包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H中的至少三个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少三个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、WTX、CREBBP、EP300中的至少三个。
3.根据权利要求1所述的基因检测panel,其中,所述基因检测panel进一步包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H中的至少五个;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2中的至少五个;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、WTX、CREBBP、EP300中的至少五个。
4.根据权利要求1所述的基因检测panel,其中,所述基因检测panel进一步包括:
KCNJ5、CACNA1D、ATP1A1、ATP2B3、CTNNB1、CLCN2、CYP11B2、CACNA1H;
SDHA、SDHB、SDHC、SDHD、SDHAF2、FH、VHL、EPAS1、CSDE1、MAML3、RET、NF1、MAX、TMEM127、HRAS、EGLN1、EGLN2、KIF1B、DLST、FGFR1、IDH1、H3F3A、MDH2、ACO1、SLC25A11、GOT2;以及
USP8、GNAS、RASD1、PRKAR1A、AIP、CABLES1、MEN1、CDKN1B、TSC1、TSC2、RB1、TP53、PRKACA、APC、ARMC5、GIPR、MC2R、PDE11A、PRKACB、PDE8B、ZNRF3、CDKN2A、CDK4、MDM2、DAXX、ATRX、CDKN1C、WTX、CREBBP、EP300。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的基因检测panel在辅助诊断肾上腺高血压患者病因的装置中的应用。
6.根据权利要求1~4中任一项所述的基因检测panel在辅助诊断肾上腺高血压患者病因的试剂中的应用。
7.一种基因检测panel的试剂,其包括针对根据权利要求1~4中任一项所述的基因检测panel的捕获探针。
8.根据权利要求7所述的试剂,其中,设计对应所述捕获探针序列的区域如表1所示。
9.一种辅助诊断肾上腺高血压患者病因的装置,其包括:
检测模块,包括检测根据权利要求1~4中任一项所述的基因检测panel的试剂;
数据处理模块,包括处理所述检测模块获得的数据,并与参考序列进行比对,获得序列比对结果;以及
筛选模块,包括对所述序列比对结果进行注释并筛选潜在突变基因。
10.一种基因突变的筛选方法,包括针对测试对象利用根据权利要求1~4中任一项所述的基因检测panel通过检测并结合生物信息学分析进行数据处理和基因突变筛选。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210101156.3A CN114381514B (zh) | 2022-01-27 | 2022-01-27 | 检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210101156.3A CN114381514B (zh) | 2022-01-27 | 2022-01-27 | 检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN114381514A true CN114381514A (zh) | 2022-04-22 |
CN114381514B CN114381514B (zh) | 2024-05-07 |
Family
ID=81204759
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202210101156.3A Active CN114381514B (zh) | 2022-01-27 | 2022-01-27 | 检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN114381514B (zh) |
Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013172705A (ja) * | 2012-01-25 | 2013-09-05 | Gunma Univ | Kcnj5遺伝子を利用したアルドステロン産生腺腫の検査方法およびアルドステロン産生腺腫治療薬のスクリーニング方法 |
WO2017166030A1 (zh) * | 2016-03-28 | 2017-10-05 | 深圳市众循精准医学研究院 | 分离的核酸及其在筛查肾上腺皮质腺瘤中的应用 |
CN109750101A (zh) * | 2019-02-15 | 2019-05-14 | 中国医学科学院阜外医院 | 检测单基因遗传性高血压的基因panel及其应用 |
EP3502277A1 (en) * | 2017-12-22 | 2019-06-26 | Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf | Diagnosis of primary aldosteronism |
CN110029158A (zh) * | 2019-02-01 | 2019-07-19 | 北京大学第三医院 | 一种马凡综合征检测panel及其应用 |
WO2019237425A1 (zh) * | 2018-06-14 | 2019-12-19 | 大连医科大学附属第一医院 | 一种用于嗜铬细胞瘤/副神经节瘤早期诊断和术前评估的生物标志物及其应用 |
US10998102B1 (en) * | 2020-10-20 | 2021-05-04 | Analytics4Medicine Llc | Systems for managing resistant hypertension |
CN113736878A (zh) * | 2021-08-24 | 2021-12-03 | 复旦大学附属肿瘤医院 | 一种神经系统肿瘤检测的基因panel、试剂盒及其应用 |
CN113832231A (zh) * | 2021-11-04 | 2021-12-24 | 复旦大学附属肿瘤医院 | 一种妇科肿瘤检测的多基因panel、试剂盒及其应用 |
-
2022
- 2022-01-27 CN CN202210101156.3A patent/CN114381514B/zh active Active
Patent Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2013172705A (ja) * | 2012-01-25 | 2013-09-05 | Gunma Univ | Kcnj5遺伝子を利用したアルドステロン産生腺腫の検査方法およびアルドステロン産生腺腫治療薬のスクリーニング方法 |
WO2017166030A1 (zh) * | 2016-03-28 | 2017-10-05 | 深圳市众循精准医学研究院 | 分离的核酸及其在筛查肾上腺皮质腺瘤中的应用 |
EP3502277A1 (en) * | 2017-12-22 | 2019-06-26 | Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf | Diagnosis of primary aldosteronism |
WO2019237425A1 (zh) * | 2018-06-14 | 2019-12-19 | 大连医科大学附属第一医院 | 一种用于嗜铬细胞瘤/副神经节瘤早期诊断和术前评估的生物标志物及其应用 |
CN110029158A (zh) * | 2019-02-01 | 2019-07-19 | 北京大学第三医院 | 一种马凡综合征检测panel及其应用 |
CN109750101A (zh) * | 2019-02-15 | 2019-05-14 | 中国医学科学院阜外医院 | 检测单基因遗传性高血压的基因panel及其应用 |
US10998102B1 (en) * | 2020-10-20 | 2021-05-04 | Analytics4Medicine Llc | Systems for managing resistant hypertension |
CN113736878A (zh) * | 2021-08-24 | 2021-12-03 | 复旦大学附属肿瘤医院 | 一种神经系统肿瘤检测的基因panel、试剂盒及其应用 |
CN113832231A (zh) * | 2021-11-04 | 2021-12-24 | 复旦大学附属肿瘤医院 | 一种妇科肿瘤检测的多基因panel、试剂盒及其应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
国家卫生健康委高血压诊疗研究重点实验室学术委员会: "高血压患者中原发性醛固酮增多症检出、诊断和治疗的指导意见", 中华高血压杂志, vol. 29, no. 6, pages 508 - 518 * |
张屏: "单基因高血压致病基因变异与中青年高血压的相关性研究", 中国优秀硕士学位论文全文数据库 医药卫生科学辑, no. 1, pages 062 - 984 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN114381514B (zh) | 2024-05-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN110468192B (zh) | 一种检测人类脊髓性肌萎缩症基因突变的飞行时间质谱核酸分析方法 | |
CN108220403B (zh) | 特定突变位点的检测方法、检测装置、存储介质及处理器 | |
CN108048541B (zh) | 确定胎儿alpha地中海贫血基因单体型的系统 | |
CN106480170B (zh) | 确定供体和受体差异snp的方法及应用 | |
CN108315404B (zh) | 确定胎儿beta地中海贫血基因单体型的方法及系统 | |
CN112391477A (zh) | 一种检测游离核酸微卫星不稳定性的方法及装置 | |
Lyons-Weiler et al. | Optimization of the Affymetrix GeneChip Mapping 10K 2.0 Assay for routine clinical use on formalin-fixed paraffin-embedded tissues | |
WO2024139147A1 (zh) | 一种遗传性耳聋辅助诊断的低频外显遗传性标志方法 | |
CN111850116A (zh) | 一组nk/t细胞淋巴瘤的基因突变位点群、靶向测序试剂盒及应用 | |
CN114150051A (zh) | 一种一体化全面检测五种复杂遗传病的试剂盒和方法 | |
CN110993025B (zh) | 胎儿浓度定量的方法和装置及胎儿基因分型的方法和装置 | |
CN114381514A (zh) | 检测肾上腺高血压的基因检测panel及其用途 | |
CN115678964B (zh) | 基于胚胎培养液的植入前胚胎的无创筛选方法 | |
CN114457143B (zh) | 一种构建cnv检测文库的方法及cnv检测方法 | |
CN115938481A (zh) | 一种基于靶向捕获和序列随机测序的通用型胚胎遗传变异检测技术方法和系统 | |
CN113416771B (zh) | 一种用于检测谷固醇血症相关基因突变的探针组合物、检测试剂、检测试剂盒 | |
CN116377058A (zh) | 一种圆锥角膜的检测panel及其应用 | |
JP7368642B2 (ja) | 妊婦の子宮頸部剥離細胞から胎盤栄養膜細胞を分離する方法 | |
CN114250269A (zh) | 一种探针组合物、基于该探针组合物的二代测序文库及其应用 | |
CN111172254B (zh) | 一种smn1基因突变的检测方法及试剂盒 | |
CN106755525A (zh) | 一种检测mthfr基因突变的探针及其应用和试剂盒 | |
CN111471753A (zh) | 一种基于风险评估模型的女性生育遗传风险基因检测方法 | |
CN111304317B (zh) | 一种用于人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症的基因突变检测试剂盒 | |
CN108410979A (zh) | 一种同时检测单基因疾病和染色体疾病的芯片及其应用 | |
CN116524999B (zh) | 一种用于检测结直肠癌微小残留病灶的靶标集合的筛选方法及其检测系统 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
TR01 | Transfer of patent right |
Effective date of registration: 20240715 Address after: Building 16, No. 2 Yujing East Road, Tongzhou District, Beijing 100024, 4th Floor 401, 5th Floor 501 Patentee after: Shengxiang (Beijing) Gene Technology Co.,Ltd. Country or region after: China Address before: No. 680, lushong Road, high tech Industrial Development Zone, Changsha City, Hunan Province, 410205 Patentee before: Shengxiang Biotechnology Co.,Ltd. Country or region before: China |