CN113861267A - 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用 - Google Patents

一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN113861267A
CN113861267A CN202111242559.1A CN202111242559A CN113861267A CN 113861267 A CN113861267 A CN 113861267A CN 202111242559 A CN202111242559 A CN 202111242559A CN 113861267 A CN113861267 A CN 113861267A
Authority
CN
China
Prior art keywords
compound
pku
lzg
organic solvent
room temperature
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN202111242559.1A
Other languages
English (en)
Other versions
CN113861267B (zh
Inventor
李子刚
尹丰
詹美苗
孔凌微
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shenzhen Bay Laboratory Pingshan Biomedical R & D And Transformation Center
Peking University Shenzhen Graduate School
Original Assignee
Shenzhen Bay Laboratory Pingshan Biomedical R & D And Transformation Center
Peking University Shenzhen Graduate School
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shenzhen Bay Laboratory Pingshan Biomedical R & D And Transformation Center, Peking University Shenzhen Graduate School filed Critical Shenzhen Bay Laboratory Pingshan Biomedical R & D And Transformation Center
Priority to CN202111242559.1A priority Critical patent/CN113861267B/zh
Publication of CN113861267A publication Critical patent/CN113861267A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN113861267B publication Critical patent/CN113861267B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/10Tetrapeptides
    • C07K5/1002Tetrapeptides with the first amino acid being neutral
    • C07K5/1005Tetrapeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic
    • C07K5/101Tetrapeptides with the first amino acid being neutral and aliphatic the side chain containing 2 to 4 carbon atoms, e.g. Val, Ile, Leu
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02PCLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本发明提出一种缩酯环肽类化合物LZG‑PKU‑H,结构式如下:
Figure DDA0003319738870000011
本发明还提出该化合物的制备方法,以苏氨酸为起始原料,通过一系列反应得到化合物LZG‑PKU‑H。本发明还提出化合物LZG‑PKU‑H在制备抑制HDAC活性药物中的应用。本发明提出的化合物LZG‑PKU‑H结构新颖,具有较强的HDAC抑制性,且结构稳定,其二硫键不易被还原,合成方法具有简便、路线短、中间体稳定、环保经济等优势,同时为后续更多的药用机制等生物学、药学研究提供了参照。

Description

一种缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H及其合成方法和应用
技术领域
本发明属于稳定多肽方法学、有机化学以及化学生物学领域,具体涉及一种新型的用于抑制HDAC活性的缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H及其合成方法和应用。
背景技术
肿瘤的恶性发展与表观遗传的修饰有关,包括基因组DNA的甲基化,以及组蛋白乙酰化等翻译后修饰,而组蛋白去乙酰化酶(HDAC)是一类对组蛋白以及其他细胞蛋白进行去乙酰化修饰的蛋白酶,其通过移除赖氨酸的乙酰基团,使组蛋白所结合的染色体的结构发生改变,进而调节该区域的基因的转录和复制,影响生命体各机能。
根据细胞定位和同源性差异,人体HDAC家族的18个成员被分为Zn2+依赖型的ClassI(HDAC1,2,3,8)、Class IIa(HDAC4,5,7,9)、Class IIb(HDAC6,10)、Class IV(HDAC11)和NAD+依赖型的Class III(SIRT1-7)。
2006年,Vorinostat(SAHA,伏立诺他)被美国FDA批准上市用于治疗皮肤T细胞淋巴瘤,在肿瘤的治疗中取得了较大突破。随后,Romidepsin(FK-228,罗米地辛)、Belinostat(PXD-101)、Panobinostat(LBH-589)和Chidamide(CS055)也相继被批准上市用于治疗皮T-细胞淋巴瘤和外T-细胞淋巴瘤,并取得了良好的效果。
虽然SAHA等HDAC抑制剂在癌症治疗方面取得了一定的成果,但是目前已上市的HDAC抑制剂均为泛抑制剂,对HDAC不同亚型均有较强的抑制作用,其对HDAC不同亚型的非选择性抑制导致了一系列的毒副作用,如SAHA在临床中往往伴随着腹泻、疲劳、白细胞减少症等一系列副作用。此外FK-228进入细胞经谷胱甘肽还原后,所产生的red FK-228具有高亲和性地与肿瘤细胞中HDAC活性位点结合能力,导致其难以泵出,进而出现了逆转耐药的现象等。这些都极大地限制了HDAC抑制剂的临床应用。
因此,开发和设计新型HDAC抑制剂意义重大,其临床的应用前景广阔。
发明内容
本发明的目的在于提供一种缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H。
本发明提供的化合物LZG-PKU-H,具有如下结构式:
Figure BDA0003319738850000021
本发明提出的缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H,其所形成的新型二硫键的稳定性明显优于罗米地辛所包含的二硫键,即该二硫键难以被一般还原性物质还原,诸如恶性肿瘤细胞环境中的高浓度GSH(谷胱甘肽)。此外,化合物LZG-PKU-H保持了对于HDAC尤其HDACClassⅠ型活性的有效抑制
本发明的第二目的在于提供一种缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H的合成方法,由化合物1经包含如下步骤的合成方法制备得到:
(1)化合物1经酯化得到化合物1i,再经酰胺缩合得到化合物2:
Figure BDA0003319738850000022
(2)化合物2经酰胺缩合得到化合物3:
Figure BDA0003319738850000023
(3)化合物3将苏氨酸残基的羟基添加上保护基甲磺酰基,形成化合物3i后,脱去氨基端Fmoc保护基后进行酰胺缩合得到化合物4:
Figure BDA0003319738850000031
(4)化合物4和L-Val通过酯化反应得到化合物5:
Figure BDA0003319738850000032
(5)化合物5脱去羧基端保护基后得到化合物6:
Figure BDA0003319738850000033
(6)化合物6通过分子内酰胺缩合关环得到化合物7:
Figure BDA0003319738850000034
(7)化合物7氧化关环形成分子内二硫键得到化合物LZG-PKU-H:
Figure BDA0003319738850000041
本发明中,步骤(1)中,0℃~室温下,化合物1、Me3SiEtOH、DIPEA和DMAP在有机溶剂中与TCBC进行反应制得化合物1i,其中化合物1、Me3SiEtOH、TCBC、DIPEA和DMAP摩尔比范围为:1:2~3:1~1.3:1~1.3:0.1~0.3;在有机溶剂中,化合物1i、D-Pen、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为:1:1:1~1.3:1~1.3;其中,有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
本发明中所涉及的“室温”具体的温度范围是25-30℃。
化合物2的制备通过常规的酰胺缩合方法所得,以L-苏氨酸为起始原料,室温下,通过酯化等方式让苏氨酸的羧基端添加上保护基,酯化试剂优选为TCBC,有机碱为DMAP和DIPEA,反应12小时,得到中间体,继而利用二乙胺等试剂在室温下反应1.5~2小时脱去氨基端Fmoc保护基得到产物与D-Pen进行下一步酰胺缩合,反应12小时,缩合试剂优选为HOAt和HATU的混合试剂,有机碱优选DIPEA。。
本发明中,步骤(2)中,在有机溶剂中,室温下,化合物2、D-Val、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为1:1:1~1.3:1~1.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
化合物3的制备依旧利用酰胺缩合方法,室温下,利用二乙胺等试剂将化合物2的氨基端Fmoc保护基脱去,反应时间为1.5~2小时,随后与D-Val在室温下进行酰胺缩合,反应12小时。缩合试剂优选为HOAt和HATU的混合试剂,有机碱优选为DIPEA。其中二乙胺的浓度为3%~5%的体积分数,有机溶剂优选为二氯甲烷与乙腈。
本发明中,步骤(3)中,在吡啶中,0℃~室温下,化合物3、MsCl和DMAP的摩尔比范围为1:2~3:0.1~0.3,制得化合物3i;在有机溶剂中,室温下,化合物3i、DABCO、Hm7、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为1:5~10:1:1~1.3:1~1.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
化合物4的制备涉及非天然氨基酸L-2-amino-2-butylenoic的形成,主要方法是将化合物3在有机碱吡啶作为溶剂的情况下,将苏氨酸残基的羟基添加上保护基甲磺酰基,反应温度为0℃~室温,反应时间为12小时,继而在有机碱DABCO的催化下,反应2~3小时,形成中间体,进一步利用二乙胺在室温下脱去中间体氨基端Fmoc保护基,反应时间为1.5~2小时,与巯基由三苯甲基保护的Hm7在室温下进行酰胺缩合。缩合试剂优选为HOAt和HATU的混合试剂,有机碱优选为DIPEA。二乙胺的浓度为3%~5%的体积分数,有机溶剂优选为二氯甲烷与乙腈。
本发明中,步骤(4)中,在有机溶剂中,室温下,化合物4、L-Val、TCBC、DIPEA和DMAP的摩尔比范围为:1:1:1.5~2:1~1.3:0.1~0.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
化合物5的制备是由L-Val和化合物4通过酯化反应所得。缩合试剂为TCBC,有机碱包括DIPEA、DMAP,室温下反应48小时,继而利用二乙胺在室温下反应1.5~2小时脱去中间体氨基酸Fmoc保护基得到化合物5。其中二乙胺的浓度为3%~5%的体积分数,有机溶剂优选为二氯甲烷与乙腈。
本发明中,步骤(5)中,在乙腈中,化合物5、氟化铯的摩尔比范围为:1:5~10。
化合物6的制备为化合物5脱去羧基端保护基TMSE,试剂优选为氟化铯,在60℃的情况下反应24~48小时。
本发明中,步骤(6)中,在有机溶剂中,室温下,化合物6的摩尔浓度大于等于零且小于等于千分之五,有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
化合物7的制备为化合物6通过分子内的酰胺缩合关环所得,缩合试剂优选为HOAt和HATU的混合试剂,室温下反应12小时,有机溶剂优选乙腈。
本发明中,步骤(7)中,在甲醇中,室温下,化合物7和碘的摩尔比范围为:1:1~3。
化合物LZG-PKU-H的制备为化合物7氧化关环形成分子内二硫键所得。室温下,化合物7与碘反应0.5~1小时,随后利用抗坏血酸和柠檬酸处理。有机试剂优选为甲醇。
本发明的第三目的在于缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H在制备抑制HDAC活性的药物中的应用。
本发明的有益效果在于:
本发明提出的缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H,显示出了较FK-228的稳定性,即比FK-228结构能够更长时间保留其二硫键,该特性可以更好地利用在制备治疗各种疾病中的药物中,进而改善逆转耐药现象。
本发明提出的合成LZG-PKU-H的方法路线简短,方法简便,中间体稳定,反应具有一定经济性。
本发明的缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H即使在高浓度GSH存在的情况下,亦具有较强的抑制HDAC活性,且较阳性SAHA的抑制活性强,与未被还原的FK-228抑制活性相当。同时,LZG-PKU-H在是否存在还原性物质如GSH的情况下都具有稳定的抑制HDAC能力,其较FK-228有着较广的适用环境范围,可改善其逆转耐药的缺陷。
附图说明
图1.实施例10中LZG-PKU-H在GSH存在下的LC-MS图。
图2.实施例10中FK228在GSH存在下不同孵育时间情况下的LC-MS图。
图3.实施例11中不同条件下LAG-PKU-H对Hela细胞核提取物的酶活对照图(阳性对照为罗米地辛(FK-228)和伏立诺他(SAHA))。
具体实施方式
下面的实施例将对本发明予以进一步的说明,但并不因此而限制本发明。
申请文件中所用英文缩写对应的中文含义见表1。
表1、英文缩写释义
Figure BDA0003319738850000061
Figure BDA0003319738850000071
实施例1.化合物1i的合成:
Figure BDA0003319738850000072
在0℃条件下,于化合物1(10g,29mmol)和三甲基硅基乙醇(12.9ml,90mmol)、DIPEA(6.5ml,37.7mmol)以及DMAP(1.0g,8.7mmol)的二氯甲烷溶液中缓慢滴入TCBC(6.1ml,37.7mmol),升至室温,搅拌反应过夜。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=2:1~1:1),得白色固体10g,产率80%。
1H NMR(400MHz,CDCl3):δ7.80(d,J=7.5Hz,2H),7.69–7.64(m,2H),7.43(t,J=7.5Hz,3H),7.35–7.30(m,2H),5.88(d,J=8.9Hz,1H),4.46(d,J=7.1Hz,2H),4.43–4.35(m,2H),4.33–4.25(m,3H),1.31(d,J=6.1Hz,3H),1.11–1.04(m,2H),0.08(s,9H)ppm;MSm/z464.18(M+Na+)。
实施例2化合物2的合成:
Figure BDA0003319738850000073
室温下,于体积分数为5%二乙胺乙腈溶液中,加入化合物1i(5g,11.3mmol)搅拌反应两小时,减压旋干溶剂,用二氯甲烷溶解,依次加入HATU(5.6g,14.7mmol),HOAt(2.0g,14.7mmol),DIPEA(2.3ml,14.7mmol)和D-Pen(6.9g,11.3mmol),继续室温搅拌反应过夜。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=1:1~1:2),得白色固体7.8g,产率86%。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ8.64(dd,J=8.4,1.4Hz,1H),7.66–7.58(m,15H),7.31(dt,J=13.7,6.9Hz,9H),5.05(d,J=5.6Hz,1H),4.41(t,J=6.3Hz,3H),4.29(d,J=3.5Hz,2H),4.20–4.14(m,3H),1.15(d,J=6.4Hz,3H),1.07(d,J=5.0Hz,3H),1.01–0.97(m,5H),0.07–0.05(m,9H)ppm;MS m/z 837.33(M+Na+).
实施例3化合物3的合成:
Figure BDA0003319738850000081
室温下,于体积分数为5%二乙胺乙腈溶液中,加入化合物2(5g,6.1mmol)搅拌反应两小时,减压旋干溶剂,用二氯甲烷溶解,依次加入HATU(3.0g,7.9mmol),HOAt(1.1g,7.9mmol),DIPEA(1.2ml,7.9mmol)和D-Val(2.1g,6.1mmol),继续室温搅拌反应过夜。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=1:1~1:3),得白色固体4.6g,产率83%。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ7.51–7.24(m,26H),5.24–5.17(m,1H),4.75–4.69(m,1H),4.36–4.03(m,8H),2.12–1.99(m,1H),1.46–1.42(m,6H),1.37(s,3H),1.02–0.96(m,2H),0.92(t,J=5.5Hz,6H),0.06(s,9H)ppm;MS m/z 936.40(M+Na+).
实施例4化合物3i的合成:
Figure BDA0003319738850000082
在0℃条件下,将化合物3(4g,4.4mmol)溶于吡啶中,加入少量DMAP(161mg,1.32mmol),随后缓慢滴入MsCl(1ml,13.2mmol),继续反应24小时。反应结束后,缓慢加入适量的水,过滤出析出的固体,柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=1:1~1:3),得白色固体2.3g,产率53%。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ7.50–7.43(m,4H),7.43–7.24(m,22H),5.21(dd,J=6.4,2.9Hz,1H),4.92(s,1H),4.74–4.70(m,1H),4.31–4.26(m,2H),4.21–4.02(m,4H),3.19(s,3H),2.11–1.99(m,1H),1.47–1.42(m,6H),1.37(s,3H),0.92(t,J=6.3Hz,8H),0.06(s,9H)ppm;MS m/z 1014.38(M+Na+).
实施例5化合物4的合成:
Figure BDA0003319738850000091
室温下,将化合物3i(2g,2.0mmol)溶于乙腈,随后加入DABCO(2.2g,20mmol),反应过液。继续加入二乙胺(体积分数为5%)反应两小时,减压旋干,用二氯甲烷溶解,依次加入HATU(988mg,2.6mmol),HOAt(354mg,2.6mmol),DIPEA(420μl,2.6mmol)和Hm7(836mg,2mmol),继续室温搅拌反应过夜。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=1:2~1:5),得白色固体1.4g,产率65%。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ9.50(d,J=7.8Hz,1H),7.42–7.30(m,30H),7.25(t,J=7.2Hz,3H),6.57–6.48(m,1H),5.44(dd,J=7.9,3.5Hz,2H),4.67(s,1H),4.44(t,J=6.8Hz,1H),4.27(dd,J=11.7,5.5Hz,1H),4.12(ddd,J=12.8,6.0,3.0Hz,2H),2.40–2.29(m,2H),2.22–2.13(m,3H),2.04(ddd,J=16.8,10.0,5.6Hz,4H),1.15–1.08(m,1H),1.03(t,J=7.1Hz,1H),0.95(t,J=8.6Hz,6H),0.88(dd,J=13.5,6.8Hz,7H),0.06(s,9H)ppm;MS m/z 1074.49(M+H+).
实施例6化合物5的合成:
Figure BDA0003319738850000092
在0℃条件下,于溶有化合物4(1g,0.93mmol),L-Val(308mg,0.93mmol),DIPEA(124μl,1.2mmol)和DMAP(34mg,0.28mmol)的二氯甲烷溶液中,缓慢滴入TCBC(308μl,1.9mmol),升至室温搅拌反应过夜,旋干溶剂,加入体积分数为5%的二乙胺乙腈溶液继续搅拌反应两小时,旋干溶剂。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(乙酸乙酯:甲醇=20:1~10:1),得白色固体524mg,产率48%。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ7.97(d,J=7.5Hz,3H),7.79(dd,J=16.7,8.3Hz,3H),7.49(dd,J=11.2,7.3Hz,3H),7.38–7.28(m,21H),7.24(t,J=7.4Hz,5H),6.57–6.49(m,1H),5.66–5.51(m,2H),5.48–5.38(m,1H),4.65(s,1H),4.50(d,J=7.1Hz,1H),4.19–4.09(m,2H),3.98(t,J=5.6Hz,1H),2.10(dt,J=13.2,6.9Hz,4H),2.00–1.89(m,3H),1.75(t,J=6.3Hz,4H),0.98–0.94(m,6H),0.88(dd,J=6.5,4.4Hz,10H),0.82(d,J=6.6Hz,4H),0.06(s,9H)ppm;MS m/z 1173.56(M+H+).
实施例7化合物6的合成:
Figure BDA0003319738850000101
室温下,于溶有化合物5(500mg,0.42mmol)的乙腈溶液中,加入氟化铯(317mg,2.1mmol),逐步升至60℃,搅拌反应过夜,旋干溶剂,依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(二氯甲烷:甲醇=20:1~10:1,滴加少量醋酸于流动相中),得白色固体274mg,产率60%。
1H NMR(400MHz,MeOD):δ7.61(t,J=8.4Hz,6H),7.37(dt,J=7.1,2.4Hz,8H),7.28(dd,J=7.3,5.1Hz,12H),7.25–7.17(m,9H),6.82(p,J=7.1Hz,1H),5.77–5.64(m,2H),5.44(dd,J=15.4,7.9Hz,1H),4.45–4.40(m,1H),4.22(dd,J=12.9,7.7Hz,1H),3.84(t,J=4.1Hz,1H),2.68(dd,J=14.7,8.1Hz,1H),2.58(dd,J=14.6,5.3Hz,1H),2.20(dt,J=9.8,5.1Hz,3H),2.13(dd,J=12.7,5.9Hz,2H),1.78–1.71(m,4H),1.05–0.99(m,3H),0.98–0.93(m,7H),0.89(dd,J=10.2,6.7Hz,8H)ppm;MS m/z 1073.80(M+H+).
实施例8化合物7的合成:
Figure BDA0003319738850000111
室温下,将化合物6(200mg,0.18mmol)溶于100ml二氯甲烷溶液中,随后依次加入HATU(205mg,0.54mmol),HOAt(73mg,0.54mmol)和DIPEA(87μl,0.54mmol),搅拌反应过夜。依次用饱和NaHCO3溶液,饱和NaCl溶液洗涤,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(二氯甲烷:甲醇=20:1~10:1),得白色固体141mg,产率72%。
1H NMR(400MHz,MeOD):δ7.61(d,J=7.4Hz,6H),7.38(d,J=7.5Hz,8H),7.30(d,J=4.1Hz,4H),7.28–7.25(m,8H),7.20(t,J=7.2Hz,8H),6.83(q,J=7.2Hz,1H),5.60(dt,J=23.2,11.3Hz,2H),5.42–5.33(m,1H),4.58(dd,J=10.1,5.4Hz,2H),4.02–3.95(m,1H),2.62–2.57(m,2H),2.34(dd,J=13.6,6.1Hz,1H),2.18(dd,J=14.6,7.1Hz,3H),2.08–1.97(m,5H),1.04(dd,J=10.3,6.7Hz,8H),0.93–0.88(m,10H)ppm;MS m/z 1077.46(M+Na+).
实施例9化合物LZG-PKU-H的合成:
Figure BDA0003319738850000112
室温下,将化合物7(100mg,0.09mmol)溶于甲醇,随后加入适量碘(68mg,0.27mmol),搅拌反应30分钟,旋干溶剂,加入1M抗环血酸和1M柠檬酸水溶液,二氯甲烷萃取,无水Na2SO3干燥,过滤,减压浓缩,残留物经柱层析纯化(石油醚:乙酸乙酯=3:1~1:1),得白色固体17.8mg,产率33%。
制得的化合物LZG-PKU-H,分子量:568。
1H NMR(400MHz,DMSO):δ7.40–7.35(m,1H),7.35–7.31(m,1H),7.31–7.25(m,1H),7.24–7.20(m,1H),6.81–6.71(m,1H),6.49(dd,J=16.9,5.5Hz,1H),5.95(s,1H),5.52(d,J=10.3Hz,1H),4.85(t,J=8.8Hz,1H),4.63(t,J=5.5Hz,1H),3.91(d,J=4.5Hz,1H),3.00–2.86(m,1H),2.69(d,J=1.8Hz,1H),2.63–2.55(m,2H),2.35(s,1H),2.27(dt,J=13.5,7.8Hz,2H),1.70(d,J=7.2Hz,2H),1.58(d,J=7.3Hz,2H),1.33(d,J=15.9Hz,6H),1.06–1.00(m,5H),0.99–0.87(m,7H)ppm;MS m/z 569.13(M+Na+),681.22(M+CF3COO-).
实施例10LZG-PKU-H在GSH存在下与FK-228稳定性的对比
将实施例9中得到的化合物LZG-PKU-H和FK-228(1mM)分别溶于30%乙腈和100mM的PBS缓冲液中,随后加入10mM的GSH(还原型谷胱甘肽),37℃水浴条件下共孵育,分别取共孵育3-24小时之后的反应液,通过液相色谱-质谱联用仪进行分析,观察二硫键被还原情况。
LZG-PKU-H(1mM,分子量:568)在GSH(10mM)存在下的LC-MS图,如图1所示,该图表明在24小时内化合物的二硫键基本保持稳定,没有出现开环现象。
FK-228(1mM,分子量:540)在GSH(10mM)存在下不同孵育时间情况下的LC-MS图,如图2所示,该图表明FK-228在三小时内就开始出现开环现象。
结合图1和图2可知,化合物LZG-PKU-H较FK-228,其二硫键能够保持很强的稳定性。实施例11化合物LZG-PKU-H对Hela细胞核提取物(高表达HDAC1,2,6,8和4)的抑制实验
1)稀释50-200μg细胞核提取物至85μL的ddH2O(去离子水),用于酶活检测
2)空白孔:85μL的ddH2O
3)100%酶活孔:10μLHeLa细胞核提取物,75μL的ddH2O
4)正对照孔:10μLHeLa细胞核提取物,70μL ddH2O,5μL梯度稀释SAHA(伏立诺他)(购自上海阿拉丁生化科技股份有限公司)
5)实验孔:10μLHeLa细胞核提取物,70μL ddH2O,5μL梯度稀释的抑制剂(此处分别为LZG-PKU-H和FK-228)
6)每孔加10μL的10X HDAC实验缓冲液(HDAC实验缓冲液的配置:25mM Hepes(pH7.5),300mM NaCl,10%甘油,0.04%Triton X-100)
7)每孔加入5μLHDAC荧光底物(荧光底物的配置:浓度为200μM的Boc-Lys(Ac)-AMC),充分混匀,在37℃孵育1小时
8)终止反应:每孔加入10μL显影剂(developer)(10X 0.5%Trypsin-EDTA),充分混匀,37℃孵育30分钟
9)酶标仪检测:用酶标仪检测酶的抑制活性,激发光340-360nm,发射光440-465nm,该体系在30分钟内保持稳定,尽量在30分钟内完成检测。%抑制率=(100%酶活-实验孔酶活)/(100%酶活)×100。
具体结果如图3所示。图3是不同条件下FK-228和LAG-PKU-H对Hela细胞核提取物的酶活对照图(阳性对照:SAHA;图例所述的无还原剂是指在上述步骤中HDAC实验缓冲液未添加有任何能够还原二硫键的还原剂,诸如常用的谷胱甘肽,二硫苏糖醇,三(2-羧乙基)膦等;而加有还原剂即10mM GSH则是指在实验缓冲液中加入了10mM GSH),由图3可知,化合物LZG-PKU-H即使在高浓度GSH存在的情况下,对Hela细胞核提取物亦具有较强的抑制HDAC活性,且较阳性SAHA的抑制活性强,与未被还原的FK-228抑制活性相当(图3所示)。同时图3酶活曲线提示,LZG-PKU-H在是否存在还原性物质如GSH的情况下都具有稳定的抑制HDAC能力,意味着其较FK-228有着较广的适用环境范围,或可改善其逆转耐药的缺陷。

Claims (10)

1.一种缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H,其特征在于:该化合物简称LZG-PKU-H,具有如下结构式:
Figure FDA0003319738840000011
2.一种缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H的合成方法,其特征在于:由化合物1经包含如下步骤的合成方法制备得到:
(1)化合物1经酯化得到化合物1i,再经酰胺缩合得到化合物2:
Figure FDA0003319738840000012
(2)化合物2经酰胺缩合得到化合物3:
Figure FDA0003319738840000013
(3)化合物3将苏氨酸残基的羟基添加上保护基甲磺酰基,形成化合物3i后,脱去氨基端Fmoc保护基后进行酰胺缩合得到化合物4:
Figure FDA0003319738840000014
Figure FDA0003319738840000021
(4)化合物4和L-Val通过酯化反应得到化合物5:
Figure FDA0003319738840000022
(5)化合物5脱去羧基端保护基后得到化合物6:
Figure FDA0003319738840000023
(6)化合物6通过分子内酰胺缩合关环得到化合物7:
Figure FDA0003319738840000024
(7)化合物7氧化关环形成分子内二硫键得到化合物LZG-PKU-H:
Figure FDA0003319738840000025
3.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(1)中,0℃-室温下,化合物1、Me3SiEtOH、DIPEA和DMAP在有机溶剂中与TCBC进行反应制得化合物1i,其中化合物1、Me3SiEtOH、TCBC、DIPEA和DMAP摩尔比范围为:1:2~3:1~1.3:1~1.3:0.1~0.3;在有机溶剂中,化合物1i、D-Pen、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为:1:1:1~1.3:1~1.3;其中,有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
4.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(2)中,在有机溶剂中,室温下,化合物2、D-Val、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为1:1:1~1.3:1~1.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
5.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(3)中,在吡啶中,0℃~室温下,化合物3、MsCl和DMAP的摩尔比范围为1:2~3:0.1~0.3,制得化合物3i;在有机溶剂中,室温下,化合物3i、DABCO、Hm7、HATU和HOAt混合试剂、DIPEA的摩尔比范围为1:5~10:1:1~1.3:1~1.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
6.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(4)中,在有机溶剂中,室温下,化合物4、L-Val、TCBC、DIPEA和DMAP的摩尔比范围为:1:1:1.5~2:1~1.3:0.1~0.3,其中有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
7.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(5)中,在乙腈中,化合物5、氟化铯的摩尔比范围为:1:5~10。
8.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(6)中,在有机溶剂中,室温下,化合物6的摩尔浓度大于零且小于等于千分之五,有机溶剂为二氯甲烷或乙腈中的一种。
9.根据权利要求2所述的合成方法,其特征在于步骤(7)中,在甲醇中,室温下,化合物7和碘的摩尔比范围为:1:1~3。
10.根据权利要求1所述的缩酯环肽类化合物LZG-PKU-H在制备抑制HDAC活性的药物中的应用。
CN202111242559.1A 2021-10-25 2021-10-25 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用 Active CN113861267B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111242559.1A CN113861267B (zh) 2021-10-25 2021-10-25 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202111242559.1A CN113861267B (zh) 2021-10-25 2021-10-25 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN113861267A true CN113861267A (zh) 2021-12-31
CN113861267B CN113861267B (zh) 2023-06-27

Family

ID=78997392

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202111242559.1A Active CN113861267B (zh) 2021-10-25 2021-10-25 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN113861267B (zh)

Citations (14)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001348340A (ja) * 2000-06-07 2001-12-18 Yamanouchi Pharmaceut Co Ltd ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤
WO2005058298A2 (en) * 2003-12-10 2005-06-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Fk228 analogs and their use as hdac-inhibitors
WO2006129105A1 (en) * 2005-06-02 2006-12-07 University Of Southampton Fk 228 derivates as hdac inhibitors
US20080318844A1 (en) * 2007-06-22 2008-12-25 Board Of Regents, The University Of Texas System Composition and method for the treatment of diseases affected by histone deacetylase inhibitors
WO2009022182A1 (en) * 2007-08-13 2009-02-19 Karus Therapeutics Limited Depsipeptide derivatives and their therapeutic use
WO2009141659A1 (en) * 2008-05-22 2009-11-26 Karus Therapeutics Limited Depsipeptides and their therapeutic use
WO2009141657A1 (en) * 2008-05-22 2009-11-26 Karus Therapeutics Limited Depsipeptides and their therapeutic use
US20100056435A1 (en) * 2006-11-22 2010-03-04 Arasu Ganesan Depsipeptides and Their Therapeutic Use
CN101935337A (zh) * 2010-03-29 2011-01-05 无锡好芳德药业有限公司 一种组蛋白去乙酰酶抑制剂fk228的制备方法
CN102276689A (zh) * 2011-05-09 2011-12-14 中国药科大学 组蛋白去乙酰化酶抑制剂fk228的化学合成方法及其应用
US20140235821A1 (en) * 2011-09-30 2014-08-21 Tohoku University Novel phosphatidylinositol-3-kinase inhibitor and pharmaceutical composition
CN104529842A (zh) * 2014-12-22 2015-04-22 泰州施美康多肽药物技术有限公司 一种缩酯环肽类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的中间体及其制备方法
WO2017122822A1 (ja) * 2016-01-13 2017-07-20 国立大学法人東北大学 デプシペプチド類化合物の製造中間体及びその製造方法
CN108530518A (zh) * 2017-03-03 2018-09-14 华东师范大学 海兔毒素10类似物及其制备方法和应用

Patent Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2001348340A (ja) * 2000-06-07 2001-12-18 Yamanouchi Pharmaceut Co Ltd ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤
WO2005058298A2 (en) * 2003-12-10 2005-06-30 Wisconsin Alumni Research Foundation Fk228 analogs and their use as hdac-inhibitors
WO2006129105A1 (en) * 2005-06-02 2006-12-07 University Of Southampton Fk 228 derivates as hdac inhibitors
CN101212982A (zh) * 2005-06-02 2008-07-02 南安普敦大学 作为hdac抑制剂的fk228衍生物
US20100056435A1 (en) * 2006-11-22 2010-03-04 Arasu Ganesan Depsipeptides and Their Therapeutic Use
US20080318844A1 (en) * 2007-06-22 2008-12-25 Board Of Regents, The University Of Texas System Composition and method for the treatment of diseases affected by histone deacetylase inhibitors
WO2009022182A1 (en) * 2007-08-13 2009-02-19 Karus Therapeutics Limited Depsipeptide derivatives and their therapeutic use
WO2009141659A1 (en) * 2008-05-22 2009-11-26 Karus Therapeutics Limited Depsipeptides and their therapeutic use
WO2009141657A1 (en) * 2008-05-22 2009-11-26 Karus Therapeutics Limited Depsipeptides and their therapeutic use
CN101935337A (zh) * 2010-03-29 2011-01-05 无锡好芳德药业有限公司 一种组蛋白去乙酰酶抑制剂fk228的制备方法
CN102276689A (zh) * 2011-05-09 2011-12-14 中国药科大学 组蛋白去乙酰化酶抑制剂fk228的化学合成方法及其应用
US20140235821A1 (en) * 2011-09-30 2014-08-21 Tohoku University Novel phosphatidylinositol-3-kinase inhibitor and pharmaceutical composition
CN104529842A (zh) * 2014-12-22 2015-04-22 泰州施美康多肽药物技术有限公司 一种缩酯环肽类组蛋白去乙酰化酶抑制剂的中间体及其制备方法
WO2017122822A1 (ja) * 2016-01-13 2017-07-20 国立大学法人東北大学 デプシペプチド類化合物の製造中間体及びその製造方法
CN108530518A (zh) * 2017-03-03 2018-09-14 华东师范大学 海兔毒素10类似物及其制备方法和应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN113861267B (zh) 2023-06-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN114716506A (zh) 用于偶联和治疗的哈米特林(hemiasterlin)衍生物
Fukuzumi et al. Chemoselective cyclization of unprotected linear peptides by α-ketoacid–hydroxylamine amide-ligation
CN112592331B (zh) 一种奥司他韦protac化合物及其制备方法与在抗流感病毒药物中的应用
JP7296396B2 (ja) アマニチン類抗体複合物
JPH03220199A (ja) 新規r106類化合物
Miura et al. A Novel Catalytic System for the Mannich‐Type Reaction of Silyl Enolates: Stereoselective Synthesis of β‐Aminoketones
CN110256398B (zh) 一种具有hdac抑制活性的亚甲基醚漆酚异羟肟酸衍生物的合成方法
CN109928908B (zh) 一种用于抗体药物偶联物的药物-连接子mc-mmaf的制备方法及其中间体
CN104725484B (zh) 一种糖基化多肽及其制备方法和其应用
JP2021178855A (ja) ヒストンデアセチラーゼの阻害剤としての大環状分子のチオエステルプロドラッグ
CN113861267A (zh) 一种缩酯环肽类化合物lzg-pku-h及其合成方法和应用
EP3738608A1 (en) Non-natural amatoxin-type antibody conjugate
CN105273064B (zh) 双靶点抗hiv糖肽化合物及其应用
CN115838393A (zh) 用于fapi合成的中间体及其制备方法和应用
CN113975404B (zh) 一种氟苯尼考多肽衍生物及其应用
CN113773283B (zh) 一种含疏水标签的氧桥双环庚烯磺酰胺类化合物及其应用
JP2545750B2 (ja) 直鎖状サーファクチン
CN115385859A (zh) 一种可细胞内自组装的蛋白降解剂及其制备方法和应用
JP4734656B2 (ja) Pf1022類の製造法
CN107365352A (zh) 一种新型含9‑腺嘌呤丙氨酸的三肽化合物及其制备方法和应用
CN111333697B (zh) 一种罗米地辛的合成方法
RU2798981C2 (ru) Конъюгат антитела с аматоксином неприродного типа
CN111378006A (zh) 一种用于抗体偶联药物的新型双臂中间体lnd1026-035及其合成方法
CN107686505A (zh) 一种新型含1‑尿嘧啶丙氨酸的三肽化合物及其制备方法和应用
CN117343125B (zh) 一种抗体偶联药物连接子的合成方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant