CN113684163B - 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法 - Google Patents

一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法 Download PDF

Info

Publication number
CN113684163B
CN113684163B CN202110891714.6A CN202110891714A CN113684163B CN 113684163 B CN113684163 B CN 113684163B CN 202110891714 A CN202110891714 A CN 202110891714A CN 113684163 B CN113684163 B CN 113684163B
Authority
CN
China
Prior art keywords
tetraose
gene
lactoyl
genetically engineered
gale
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN202110891714.6A
Other languages
English (en)
Other versions
CN113684163A (zh
Inventor
张涛
胡苗苗
江波
李梦丽
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Jiangnan University
Original Assignee
Jiangnan University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Jiangnan University filed Critical Jiangnan University
Priority to CN202110891714.6A priority Critical patent/CN113684163B/zh
Publication of CN113684163A publication Critical patent/CN113684163A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN113684163B publication Critical patent/CN113684163B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2468Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1) acting on beta-galactose-glycoside bonds, e.g. carrageenases (3.2.1.83; 3.2.1.157); beta-agarase (3.2.1.81)
    • C12N9/2471Beta-galactosidase (3.2.1.23), i.e. exo-(1-->4)-beta-D-galactanase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1096Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1205Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1), e.g. protein kinases
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/12Transferases (2.) transferring phosphorus containing groups, e.g. kinases (2.7)
    • C12N9/1241Nucleotidyltransferases (2.7.7)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/90Isomerases (5.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/04Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y206/00Transferases transferring nitrogenous groups (2.6)
    • C12Y206/01Transaminases (2.6.1)
    • C12Y206/01016Glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing) (2.6.1.16), i.e. glucosamine-6-phosphate-synthase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y207/00Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/01Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1)
    • C12Y207/01006Galactokinase (2.7.1.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y207/00Transferases transferring phosphorus-containing groups (2.7)
    • C12Y207/01Phosphotransferases with an alcohol group as acceptor (2.7.1)
    • C12Y207/0101Phosphoglucokinase (2.7.1.10)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y302/00Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01023Beta-galactosidase (3.2.1.23), i.e. exo-(1-->4)-beta-D-galactanase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y501/00Racemaces and epimerases (5.1)
    • C12Y501/03Racemaces and epimerases (5.1) acting on carbohydrates and derivatives (5.1.3)
    • C12Y501/03002UDP-glucose 4-epimerase (5.1.3.2), i.e. UDP-galactose 4-epimerase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y503/00Intramolecular oxidoreductases (5.3)
    • C12Y503/01Intramolecular oxidoreductases (5.3) interconverting aldoses and ketoses (5.3.1)
    • C12Y503/01009Glucose-6-phosphate isomerase (5.3.1.9)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y504/00Intramolecular transferases (5.4)
    • C12Y504/02Phosphotransferases (phosphomutases) (5.4.2)
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种提高乳酰‑N‑四糖产量的基因工程菌及其生产方法,属于代谢工程和食品发酵技术领域。本发明通过lgtA和wbgO的外源表达,组合调控乳酰‑N‑四糖合成途径中galE,galT和galK的表达并敲除大肠杆菌宿主乳酰‑N‑四糖合成途径中的lacZ表达,以及对发酵培养基的半乳糖和IPTG添加量进行优化,从而达到提高乳酰‑N‑四糖产量的目的,在摇瓶实验中,大肠杆菌生产乳酰‑N‑四糖的能力由0.22g/L提升至4.00g/L,在3L发酵罐中,乳酰‑N‑四糖的产量达到19.80g/L,为乳酰‑N‑四糖的工业化生产奠定了基础。

Description

一种提高乳酰-N-四糖产量的基因工程菌及其生产方法
技术领域
本发明涉及一种提高乳酰-N-四糖产量的基因工程菌及其生产方法,属于代谢工程和食品发酵技术领域。
背景技术
人乳寡糖(human milk oligosaccharides,HMOs)是存在于人乳中的一类天然存在的低聚糖,对婴儿消化系统的早期发育,及出生后免疫系统的完善和体内生态平衡的建立发挥着不可替代的作用。HMOs可耐受婴儿消化道内酶的水解,进而抵御胃肠道病原微生物的感染和维持胃肠道微生态平衡。乳酰-N-四糖(LNT)是人乳寡糖中的一种重要寡糖,能够增强人体免疫力,调节肠道菌群,促进细胞成熟和加速伤口愈合等生物学功能。鉴于乳酰-N-四糖的重要生物功能和生理活性,已经允许添加进商品化婴幼儿配方奶粉中。虽然近年来对人乳寡糖各组分的研究不断深入,但其具体的生物功能还不是很明确,因此获得足够量结构均一的人乳寡糖单体来开展它们的生物学功能研究,以及开发其在医药领域的应用是现阶段研究人员迫切需要解决的问题。
目前报道的乳酰-N-四糖的合成方法主要包括三种,分别是化学合成、酶法合成和发酵法合成。化学合成法存在反应步骤复杂、原材料价格昂贵等问题,造成生产成本较高不利于工业的大规模合成,且化学合成中使用的部分有毒试剂,使产品不宜用于食品添加剂。酶合成法需要昂贵的核苷酸糖作为底物,不利于乳酰-N-四糖的大规模生产。而生物法可以利用廉价碳氮源和底物,实现乳酰N-四糖的合成,且对环境不造成影响。因此,通过生物法制备乳酰-N-四糖受到了越来越多的关注。
最近,Florian等人利用半乳糖作为碳源在大肠杆菌细胞内发酵合成LNT,产量达到12.72 g/L(Florian等人,2015),但是该方法使用的半乳糖作为唯一碳源,导致生产成本升高,且最终产量不高,因此,寻求廉价高产的LNT合成方法来解决目前微生物生产的瓶颈,打造更高效的生产菌株是非常必要的。
发明内容
[技术问题]
现有技术不能提供成本低廉且绿色高效生产乳酰-N-四糖的方法。
[技术方案]
本发明为了解决现有微生物方法合成的乳酰-N-四糖产量较低的问题,提供了一种产乳酰-N-四糖的基因工程菌及其构建方法。
本发明的第一个目的是提供一种基因工程菌,所述基因工程菌敲除了β-半乳糖苷酶基因lacZ,并过表达β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA和β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO
在一种实施方式中,所述基因工程菌还过表达磷酸葡萄糖变位酶基因pgm、葡萄糖-6-磷酸异构酶基因pgi、谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶基因glmS、磷酸葡萄糖胺变位酶基因glmM、N-乙酰氨基葡萄糖-1-磷酸尿苷转移酶glmU、UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因galE、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT和/或半乳糖激酶基因galK
在一种实施方式中,β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA来源于脑膜炎奈瑟球菌(Neisseria meningitidis),β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO来源于大肠杆菌O55:H7。
在一种实施方式中,β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO来源于大肠杆菌O55:H7的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
在一种实施方式中,磷酸葡萄糖变位酶基因pgm、葡萄糖-6-磷酸异构酶基因pgi、谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶基因glmS、磷酸葡萄糖胺变位酶基因glmM、N-乙酰氨基葡萄糖-1-磷酸尿苷转移酶glmU、UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因galE、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT和半乳糖激酶基因galK均来源于大肠杆菌K-12(Escherichia coli)。
在一种实施方式中,磷酸葡萄糖变位酶基因pgm的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,葡萄糖-6-磷酸异构酶基因pgi的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示,谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶基因glmS的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,磷酸葡萄糖胺变位酶基因glmM的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,N-乙酰氨基葡萄糖-1-磷酸尿苷转移酶glmU的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因galE的核苷酸序列如SEQ IDNO.6所示,半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,半乳糖激酶基因galK的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
在一种实施方式中,所述基因工程菌以大肠杆菌为宿主。
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1、pETDuet-1或pRSFDuet-1质粒表达基因pgm、pgiglmMglmUglmSgalEgalTgalKlgtA和/或wbgO
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达pgm、pgiglmMglmUglmSgalEgalT和/或galK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达pgmpgi
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达glmMglmU和/或glmS
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达galEgalTgalK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pRSFDuet-1表达galEgalTgalK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pETDuet-1表达lgtAwbgO,利用pCDFDuet-1表达galEgalTgalK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pETDuet-1表达lgtAwbgO,利用pRSFDuet-1表达galEgalTgalK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pRSFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pCDFDuet-1表达galEgalTgalK
在一种实施方式中,所述基因工程菌利用pRSFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达galEgalTgalK
本发明提供了一种构建所述重组大肠杆菌的方法,先在大肠杆菌基因组中敲除β-半乳糖苷酶基因lacZ,再利用表达载体,过表达β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA、β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO和UDP-葡萄糖4-差向异构酶基因galE、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT和半乳糖激酶基因galK
在本发明的一种实施方式中,利用pTargetF质粒敲除β-半乳糖苷酶基因lacZ
在本发明的一种实施方式中,表达载体为pCDFDuet-1和/或pETDuet-1,所述重组大肠杆菌以pETDuet-1质粒表达基因galEgalTgalK,以pCDFDuet-1质粒表达基因lgtAwbgO
本发明还提供了上述基因工程菌在生产乳酰-N-四糖及含有乳酰-N-四糖的产品中的应用。
本发明还提供了一种生产乳酰-N-四糖的方法,所述方法为,以乳糖和甘油为碳源,利用上述基因工程菌为发酵菌株发酵生产乳酰-N-四糖。
在一种实施方式中,将上述基因工程菌接种于发酵培养基中,培养至OD600为10~13,加入终浓度为15~25 g/L乳糖、0~20 g/L半乳糖和0.2~1.0 mM的IPTG。
在一种实施方式中,待初始碳源消耗完后,流加750~850 g/L甘油和15~25 g/LMgSO4·7H2O,待初始乳糖消耗完后,流加乳糖使其浓度维持在3~10 g/L。
在一种实施方式中,发酵条件为,培养温度为24~38℃,搅拌转速250~850 r/min,通气量0.8~1.2 vvm,pH 6.5~7.0,发酵时间为55~65 h。
在一种实施方式中,所述发酵培养基的组成为:10~20 g/L甘油,10~15 g/L磷酸二氢钾,2~6 g/L磷酸氢二氨,1~2 g/L柠檬酸,1~2 g/L七水硫酸镁和7.5~12.5 mL/L微量金属元素,余量为水。
在一种实施方式中,所述微量金属元素的组成为:8~12 g/L硫酸亚铁,2~2.5 g/L七水硫酸锌,0.5~1.5 g/L无水硫酸铜和1.5~2.5 g/L二水氯化钙。
本发明的有益效果:
本发明通过β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA和β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO的外源表达,组合调控乳酰-N-四糖合成途径中UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因galE、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT和半乳糖激酶基因galK的表达并敲除大肠杆菌宿主乳酰-N-四糖合成途径中的lacZ表达,以及对发酵培养基的半乳糖和IPTG添加量进行优化,从而达到提高乳酰-N-四糖产量的目的,在摇瓶实验中,大肠杆菌生产乳酰-N-四糖的能力由0.22 g/L提升至4.00 g/L,在3 L发酵罐中,乳酰-N-四糖的产量达到19.8 g/L,为乳酰-N-四糖的工业化生产奠定了基础。
附图说明
图1为乳酰-N-四糖代谢通路图;
图2为乳酰-N-四糖标样和乳酰-N-四糖产物样品的二级质谱图。
具体实施方式
以下结合实例与附图对本发明的具体实施作进一步的说明,以下实例中所使用的质粒、PCR试剂、限制性内切酶、质粒抽提试剂盒、DNA胶回收试剂盒等采用商业产品,具体操作按照试剂盒说明书进行。本发明的实施方式不限于此,其他未注明的实验操作和工艺参数按照常规技术进行。
质粒和DNA产物的测序工作交予天霖生物科技(上海)有限公司完成。
大肠杆菌感受态的制备:上海生工生物工程公司试剂盒。
LB液体培养基:10 g/L蛋白胨,5 g/L酵母提取物,10 g/L氯化钠。
LB固体培养基:10 g/L蛋白胨,5 g/L酵母提取物,10 g/L氯化钠,17 g/L琼脂粉。
本发明实施例中所述的乳酰-N-四糖的测定方法使用HPLC,具体为:
1 mL发酵液于100°C煮沸10 min,13400 rpm离心10 min,上清液经0.22 μm膜过滤处理,利用HPLC检测乳酰-N-四糖的生成量。HPLC检测条件:示差折光检测器;色谱柱为Rezex ROA-organic acid(Phenomenex,USA),柱温为50ºC;流动相为5 mM的H2SO4水溶液,流速为0.6 mL/min;进样量为10 μL。
实施例1:大肠杆菌BL21(DE3)染色体组基因lacZ的敲除
利用CRISPR-Cas9基因敲除系统敲除大肠杆菌BL21(DE3)中lacZ,具体步骤如下(所涉及到的引物序列见表1):
(1)以大肠杆菌BL21(DE3)基因组为模板,使用lacZ-up-F/R和lacZ-down-F/R通过PCR分别扩增出lacZ的上下游片段,胶回收。再分别以lacZ上下游片段为模板,采用lacZ-up-F/lacZ-down-R引物通过重叠PCR得到完整的lacZ模板,胶回收DNA片段。
(2)以原始pTargetF质粒为模板,lacZ-sg-F/R为引物,采用PCR扩增将原始质粒上的N20序列分别替换为与lacZ序列互补的N20序列,得到带有靶向lacZ的pTargetF质粒(即带有lacZ特异性N20序列的靶向质粒pTargetF)。转化大肠杆菌DH5α感受态,涂布LB平板(含壮观霉素),37℃扩大培养提取质粒并测序。
(3)取pCas质粒及大肠杆菌BL21(DE3)感受态,冰上放置5 min至感受态融化,取5μL质粒加入100 μL感受态细胞中,轻轻混匀。冰浴30 min,42℃热激90 s,立即置于冰上5min。加入1 mL LB培养基,30℃,180 rpm培养1 h。取200 μL浓缩菌液,均匀涂布于LB平板(含卡那霉素)上,30℃倒置培养过夜至长出大肠杆菌BL21(DE3)/pCas的单菌落。
(4)挑取大肠杆菌BL21(DE3)/pCas单菌落于LB培养基中,30℃培养1.0 h,加入终浓度为30 mM的L-阿拉伯糖以诱导pCas-λ-red系统表达。当OD600达到0.6-0.8时,制备大肠杆菌BL21(DE3)/pCas感受态。
(5)将200 ng步骤(2)构建的带有lacZ特异性N20序列的靶向质粒pTargetF和1000ng的供体DNA片段(即步骤(1)得到的完整的lacZ模板),电转至步骤(4)制备的大肠杆菌BL21(DE3)/pCas感受态,涂布于LB平板(卡那霉素和壮观霉素),30℃培养24 h,挑取平板上的阳性菌落于LB中培养10 h,送天霖生物科技(上海)有限公司测序验证。
(6)将步骤(5)测序验证成功的阳性克隆菌落挑至4 mL LB液体试管,加入终浓度为1 mM的IPTG和30 mg/L卡那霉素,30℃培养8-16 h,以去除pTargetF质粒,再在42℃培养12 h,去除pCas质粒,得到基因组敲除lacZ基因的大肠杆菌BL21(DE3) ΔlacZ
表1.lacZ敲除的引物序列
实施例2:重组质粒的构建及高产乳酰-N-四糖重组菌的筛选
重组菌的构建具体步骤如下(所涉及到的引物序列见表2):
(1)pgmpgiglmMglmUglmSglmU-glmSgalEgalE-galTgalE-galT-galK基因片段的获得:以大肠杆菌K-12(Escherichia coli)的基因组为模板,以pgm-F/pgm-R、pgi-F/pgi-R、glmM-F/glmM-R、glmU-F/glmU-R、glmS-F/glmS-R、glmUS-F/glmUS -R、galE-F/galE-R、galT-F/galT-R、galK-F/galK-R、galET-F/galET-R和galETK-F/galETK-R为引物,分别PCR扩增出pgmpgiglmMglmUglmSglmU-glmSgalEgalT,galK,galE-galTgalE-galT-galK基因片段,胶回收DNA片段,将回收的pgmpgiglmMglmUglmSglmU- glmSgalEgalT,galK,galE-galTgalE-galT-galK基因片段通过无缝克隆试剂盒(南京诺唯赞生命科技有限公司)分别连接到载体pETDuet-1的BamHI和SaiI酶切位点之间,获得质粒pET-pgm、pET-pgi、pET-glmM、pET- glmU、pET-glmS、pET-glmUS、pET-galE、pET-galT、pET-galK、pET-galET和pET-galETK。将glmU-glmS基因片段连接到载体质粒pET-glmM的BgiII和XhoI酶切位点之间,获得的质粒pET-glmM-glmUS;
(2)lgtAwbgO基因片段的获得:委托天霖生物科技(上海)有限公司合成来源于脑膜炎奈瑟球菌的lgtA基因序列和来源于大肠杆菌O55:H7(Escherichia coli O55:H7)的wbgO基因序列,将合成后的lgtA基因片段通过无缝克隆试剂盒(南京诺唯赞生命科技有限公司)连接到载体pCDFDuet-1的BamHI和SaiI酶切位点之间,获得质粒pCDF-lgtA,再将wbgO基因片段连接到载体质粒pCDF-lgtA的BgiII和XhoI酶切位点之间,最终获得的质粒为pCDF-lgtA-wbgO。
表2. 质粒构建引物
(3)根据乳酰-N-四糖合成通路中的关键基因将步骤(1)获得的质粒pET-pgm、pET-pgi、pET-glmM、pET- glmU、pET-glmS、pET-glmUS、pET-glmM-glmUS、pET-galE、pET-galT、pET-galK、pET-galET、pET-galETK和pCDF-lgtA-wbgO进行组合并分别转入实施例1获得大肠杆菌BL21(DE3) ΔlacZ,共得到了13个不同的工程菌,分别表示为B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B10、B11、B12和B13,具体每个菌株携带的乳酰-N-四糖合成通路中的关键基因见表3,13个不同的工程菌株发酵培养后经HPLC鉴定确认产乳酰-N-四糖(图2),其产量分别为0.22 g/L、0.85 g/L、0.62 g/L、1.09 g/L、0.62 g/L、0.80 g/L、0.22 g/L、0.55 g/L、1.00g/L、0.56 g/L、0.67 g/L、2.30 g/L和3.14 g/L(见表3)。菌株B13相对于菌株B1,乳酰-N-四糖的产量增加了13.3倍。因此,过表达与UDP-半乳糖合成相关的大肠杆菌内源性基因galE- galT-galK,能够增加乳酰-N-四糖产量。菌株B13的乳酰-N-四糖代谢通路图如图1所示。
表3. 各工程菌详细信息
发酵培养方法如下:
将构建的工程菌接种于LB液体培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养12 h,得到种子液;再将种子液以2 mL/100 mL的接种量接入50 mL发酵培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养至OD600为0.6;加入终浓度为0.4 mM的IPTG,同时加入乳糖至乳糖浓度为10 g/L,25℃,200rpm的条件下诱导培养48 h。
发酵培养基:20 g/L甘油,13.5 g/L磷酸二氢钾,4.0 g/L磷酸氢二氨,1.7 g/L柠檬酸,1.4 g/L七水硫酸镁和微量金属元素(10 mg/L硫酸亚铁,2.25 mg/L七水硫酸锌,1.0mg/L无水硫酸铜,2.0 mg/L二水氯化钙),pH 6.8。
实施例3:三种不同拷贝数重组质粒的筛选
不同拷贝数重组质粒菌的构建具体步骤如下(所涉及到的引物序列见表4):
(1)galE-galT-galK基因片段的获得:以大肠杆菌K-12(Escherichia coli)的基因组为模板,以galETK-F/galETK-R为引物,用PCR扩增出galE-galT-galK基因片段,胶回收DNA片段,将回收的DNA基因片段通过无缝克隆试剂盒(南京诺唯赞生命科技有限公司)分别连接到载体pCDFDuet-1、pETDuet-1和pRSFDuet-1的BamHI和SaiI酶切位点之间,最终获得质粒pCDF-galETK、pET-galETK和pRSF-galETK;
(2)lgtAwbgO基因片段的获得:委托天霖生物科技(上海)有限公司合成来源于脑膜炎奈瑟球菌的lgtA基因序列和来源于大肠杆菌O55:H7(Escherichia coli O55:H7)的wbgO基因序列,将合成后的lgtA基因片段通过无缝克隆试剂盒(南京诺唯赞生命科技有限公司)连接到载体pETDuet-1/pRSFDuet-1的BamHI和SaiI酶切位点之间,获得质粒pET-lgtA/pRSF-lgtA,再将wbgO基因片段连接到载体质粒pET-lgtA/pRSF-lgtA的BgiII和XhoI酶切位点之间,最终获得质粒pET-lgtA-wbgO/pRSF-lgtA-wbgO。
表4. 质粒构建引物
(3)质粒pRSFDuet-1具有较高的拷贝数,质粒pETDuet-1有中等的拷贝数,而质粒pCDFDuet-1具有较低的拷贝数。其中pRSF,pET和pCDF分别是表达质粒pRSFDuet-1,pETDuet-1和pCDFDuet-1的复制子,代表不同的拷贝数,三者的拷贝数分别为100,40和20。
将表达galE-galT-galK基因片段的质粒pCDF-galETK、pET-galETK和pRSF-galETK,和,表达lgtAwbgO基因片段的质粒pCDF-lgtA-wbgO、pET- lgtA-wbgO和pRSF-lgtA-wbgO进行组合,得到了6个不同的工程菌,分别表示为B13~18(表5)。6个不同的工程菌株发酵后的乳酰-N-四糖的产量分别为3.14 g/L、0.95 g/L、1.71 g/L、0.77 g/L、2.81g/L和2.51 g/L。其中含有重组质粒pCDF-lgtA-wbgO和pET-galE-galT-galK的工程菌(即菌株B13)获得了3.140 g/L的最高产量(见表5)。因此,表达相对较低的基因剂量的大肠杆菌内源性基因galE-galT-galK同时低水平基因剂量的外源基因lgtAwbgO可以有更高的乳酰-N-四糖产量。
表5. 各工程菌详细信息
发酵培养方法如下:
将构建的工程菌接种于LB液体培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养12 h,得到种子液;再将种子液以2 mL/100 mL的接种量接入50 mL发酵培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养至OD600为0.6;加入终浓度为0.4 mM的IPTG,同时加入乳糖至乳糖浓度为10 g/L,25℃,200rpm的条件下诱导培养48 h。
发酵培养基:20 g/L甘油,13.5 g/L磷酸二氢钾,4.0 g/L磷酸氢二氨,1.7 g/L柠檬酸,1.4 g/L七水硫酸镁和微量金属元素(10 mg/L硫酸亚铁,2.25 mg/L七水硫酸锌,1.0mg/L无水硫酸铜,2.0 mg/L二水氯化钙),pH 6.8。
实施例4:不同半乳糖添加量对产乳酰-N-四糖的筛选
采用不同半乳糖添加量的发酵培养基对实施例3获得的高产乳酰-N-四糖的工程菌B13进行发酵,具体发酵方法如下:
将基因工程菌B13接种于LB液体培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养12 h,得到种子液;再将种子液以2 mL/100 mL的接种量接入50 mL发酵培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养至OD600为0.6;加入终浓度为0.4 mM的IPTG,同时加入乳糖至乳糖浓度为10 g/L,且同时加入不同浓度的半乳糖(见表6),25℃,200 rpm的条件下诱导培养48 h。
上述发酵培养基的组成为,20 g/L甘油,13.5 g/L磷酸二氢钾,4.0 g/L磷酸氢二氨,1.7 g/L柠檬酸,1.4 g/L七水硫酸镁和10 mL/L微量金属元素;微量金属元素包括:10g/L硫酸亚铁,2.25 g/L七水硫酸锌,1.0 g/L无水硫酸铜,2.0 g/L二水氯化钙,pH 6.8。
菌株B13在不同半乳糖添加量的发酵培养基中乳酰-N-四糖的产量检测的结果如表6所示,由该表可以看出,当培养基半乳糖添加量为5 g/L时,相对于半乳糖添加量为0 g/L时的发酵生产乳酰-N-四糖产量提高了20.3%。
表6. 各不同半乳糖添加量详细信息
实施例5:不同IPTG添加量对产乳酰-N-四糖的筛选
采用不同IPTG添加量的发酵培养基对实施例3获得的高产乳酰-N-四糖的工程菌B13进行发酵,具体发酵方法如下:
将构建的基因工程菌B13接种于LB液体培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养12 h,得到种子液;再将种子液以2 mL/100 mL的接种量接入50 mL发酵培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养至OD600为0.6;加入不同终浓度的IPTG(见表7),同时加入乳糖至乳糖浓度为10 g/L,且同时加入半乳糖至半乳糖浓度为5 g/L,25℃,200 rpm的条件下诱导培养48 h。
上述发酵培养基的组成为,20 g/L甘油,13.5 g/L磷酸二氢钾,4.0 g/L磷酸氢二氨,1.7 g/L柠檬酸,1.4 g/L七水硫酸镁和微量金属元素(10 mg/L硫酸亚铁,2.25 mg/L七水硫酸锌,1.0 mg/L无水硫酸铜,2.0 mg/L二水氯化钙),pH 6.8。
诱导剂的浓度是影响酶表达的关键因素,在发酵培养基添加5 g/L的半乳糖前提下,对菌株B13进行不同IPTG添加量的发酵培养基中诱导培养,乳酰-N-四糖的产量检测的结果如表7所示,由该表可以看出,随着IPTG的升高乳酰-N-四糖产量保持增长,当达到0.5mM最高,之后随着IPTG的升高乳酰-N-四糖产量降低。因此,相对较高的诱导剂浓度可能对生产乳酰-N-四糖没有帮助。当培养基IPTG添加量为0.5 mM时,相对于实施例4的IPTG添加量0.4 mM时的发酵生产乳酰-N-四糖产量提高了5.9%。
表7. 各不同IPTG添加量详细信息
实施例6:高效生产工程菌发酵罐生产乳酰-N-四糖
为了进一步验证乳酰-N-四糖合成方法的有效性,提高乳酰-N-四糖的产量。
将实施例3获得的基因工程菌B13接种于LB液体培养基,37℃,200 rpm,摇瓶培养12 h,得到种子液;将种子液以体积比10%的接种量接种到工作体积为1 L的发酵培养基中,发酵罐发酵温度37℃,搅拌转速800 r/min,通气量1 vvm,pH 6.8 (补加氨水自动控制)。发酵12 h(OD600约为12),加入终浓度为20 g/L乳糖、5 g/L半乳糖和0.5 mM的IPTG。为了维持菌体的生长以及乳酰-N-四糖的合成,待初始碳源消耗完后流加800 g/L的甘油(含20 g/L的MgSO4·7H2O)以补充碳源,待初始乳糖消耗完后流加200 g/L的乳糖并使其在体系中的浓度维持在5 g/L左右至发酵结束。培养整个过程达到59 h后,菌体OD600达到69.1,乳酰-N-四糖的产量最高达到19.79 g/L。表8为发酵过程中菌的乳酰-N-四糖合成量动态变化表。
表8. 发酵过程中乳酰-N-四糖合成量动态变化表
虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大学
<120> 一种提高乳酰-N-四糖产量的基因工程菌及其生产方法
<130> BAA210937A
<160> 10
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 1005
<212> DNA
<213> 脑膜炎奈瑟球菌
<400> 1
atgggccagc cgctggttag cgttctgatc tgcgcgtaca acgttgaaaa atatttcgcg 60
cagagcctgg cagctgttgt taaccagacc tggcgtaacc tggacattct gatcgttgat 120
gatggctcta ccgatggcac cctggcgatc gcgcagcgtt tccaggaaca ggacggtcgt 180
atccgtattc tggcgcagcc gcgtaactct ggtctgattc caagcctgaa catcggcctg 240
gatgaactgg cgaaaagcgg cggtggtggt gaatacatcg cgcgtaccga tgcggatgat 300
atcgcagctc cggattggat tgaaaaaatc gttggtgaaa tggaaaaaga tcgtagcatc 360
atcgcaatgg gcgcttggct ggaagtgctg tccgaagaaa aagatggcaa ccgtctggca 420
cgtcaccacg aacacggtaa aatctggaaa aaaccgaccc gtcacgaaga catcgcggat 480
ttcttcccat tcggcaaccc gattcacaac aacaccatga tcatgcgtcg ttccgtgatc 540
gatggcggcc tgcgttacaa caccgaacgt gattgggcag aagactatca gttctggtat 600
gatgtttcta aactgggtcg tctggcgtac tacccggaag cgctggttaa ataccgtctg 660
cacgctaacc aggttagctc caaatatagc atccgccagc acgaaatcgc tcagggtatc 720
cagaaaaccg cacgtaacga tttcctgcag tctatgggtt tcaaaacccg tttcgatagc 780
ctggaatacc gtcagattaa agcggttgcg tatgaactgc tggaaaaaca cctgccggaa 840
gaagattttg aactggcgcg tcgtttcctg taccagtgct tcaaacgtac cgataccctg 900
ccggcgggcg cttggctgga tttcgcggcg gatggccgta tgcgtcgtct gttcaccctg 960
cgtcagtact tcggtatcct gcaccgtctg ctgaaaaacc gttaa 1005
<210> 2
<211> 798
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 2
atgataatcg atgaagctga atctgccgaa tcaactcatc ctgttgtttc tgttattctg 60
ccagttaata aaaaaaaccc ttttcttgat gaggcaataa atagtatttt atcgcaaaca 120
ttttcgtcat tcgagataat aatagttgca aattgttgta cggatgattt ttataatgag 180
ttgaaacaca aagttaatga caaaattaag ttgattcgta caaatattgc ttatttaccg 240
tactcattaa ataaagccat cgatttgtcc aatggtgagt ttattgcaag gatggattcc 300
gatgatattt ctcatcctga tagattcacg aaacaagttg attttttaaa aaataatcct 360
tatgtggatg tcgtcggtac taatgcaata tttattgatg ataaaggtcg agaaataaac 420
aaaacaaagc tacctgaaga aaatttggat attgtaaaaa acttaccgta taaatgttgc 480
attgttcatc catctgtaat gtttaggaag aaagtaatcg cttcaattgg cggttatatg 540
ttttcaaact attctgagga ttatgagtta tggaatagat taagtttagc aaaaataaaa 600
tttcaaaatt taccggaata tttattctat tacaggttgc atgaaggtca gtcaactgct 660
aaaaaaaact tgtatatggt tatggtaaat gatttggtaa taaagatgaa atgctttttt 720
ttgacaggta atatcaacta tctcttcgga gggattagaa ctattgcttc ttttatatac 780
tgtaaataca taaagtga 798
<210> 3
<211> 1338
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 3
atgagtaatc gtaaatattt cggtaccgat gggattcgtg gtcgtgtagg ggatgcgccg 60
atcacacctg attttgtgct taagctgggt tgggccgcgg gtaaagtgct ggcgcgccac 120
ggctcccgta agattattat tggtaaagac acgcgtattt ctggctatat gctggagtca 180
gcactggaag cgggtctggc ggcagcgggc ctttccgcac tcttcactgg cccgatgcca 240
acaccggccg tggcttatct gacgcgtacc ttccgcgcag aggccggaat tgtgatatct 300
gcatcgcata acccgttcta cgataatggc attaaattct tctctatcga cggcaccaaa 360
ctgccggatg cggtagaaga ggccatcgaa gcggaaatgg aaaaggagat cagctgcgtt 420
gattcggcag aactgggtaa agccagccgt atcgttgatg ccgcgggtcg ctatatcgag 480
ttttgcaaag ccacgttccc gaacgaactt agcctcagtg aactgaagat tgtggtggat 540
tgtgcaaacg gtgcgactta tcacatcgcg ccgaacgtgc tgcgcgaact gggggcgaac 600
gttatcgcta tcggttgtga gccaaacggt gtaaacatca atgccgaagt gggggctacc 660
gacgttcgcg cgctccaggc tcgtgtgctg gctgaaaaag cggatctcgg tattgccttc 720
gacggcgatg gcgatcgcgt gattatggtt gaccatgaag gcaataaagt cgatggcgat 780
cagatcatgt atatcatcgc gcgtgaaggt cttcgtcagg gccagctgcg tggtggcgct 840
gtgggtacat tgatgagcaa catggggctt gaactggcgc tgaaacagtt aggaattcca 900
tttgcgcgcg cgaaagtggg tgaccgctac gtactggaaa aaatgcagga gaaaggctgg 960
cgtatcggtg cagagaattc cggtcatgtg atcctgctgg ataaaactac taccggtgac 1020
ggcatcgttg ctggcttgca ggtgctggcg gcgatggcac gtaaccatat gagcctgcac 1080
gacctttgca gcggcatgaa aatgttcccg cagattctgg ttaacgtacg ttacaccgca 1140
ggtagcggcg atccacttga gcatgagtca gttaaagccg tgaccgcaga ggttgaagct 1200
gcgctgggca accgtggacg cgtgttgctg cgtaaatccg gcaccgaacc gttaattcgc 1260
gtgatggtgg aaggcgaaga cgaagcgcag gtgactgaat ttgcacaccg catcgccgat 1320
gcagtaaaag ccgtttaa 1338
<210> 4
<211> 1371
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 4
atgttgaata atgctatgag cgtagtgatc cttgccgcag gcaaaggcac gcgcatgtat 60
tccgatcttc cgaaagtgct gcataccctt gccgggaaag cgatggttca gcatgtcatt 120
gatgctgcga atgaattagg cgcagcgcac gttcacctgg tgtacggtca cggcggcgat 180
ctgctaaaac aggcgctgaa agacgacaac cttaactggg tgcttcaggc agagcagctg 240
ggtacgggtc atgcaatgca gcaggccgca cctttctttg ccgatgatga agacatttta 300
atgctctacg gcgacgtgcc gctgatctct gtcgaaacac tccagcgtct gcgtgatgct 360
aaaccgcagg gtggcattgg tctgctgacg gtgaaactgg atgatccgac cggttatgga 420
cgtatcaccc gtgaaaacgg caaagttacc ggcattgttg agcacaaaga tgccaccgac 480
gagcagcgtc agattcagga gatcaacacc ggcattctga ttgccaacgg cgcagatatg 540
aaacgctggc tggcgaagct gaccaacaat aatgctcagg gcgaatacta catcaccgac 600
attattgcgc tggcgtatca ggaagggcgt gaaatcgtcg ccgttcatcc gcaacgttta 660
agcgaagtag aaggcgtgaa taaccgcctg caactctccc gtctggagcg tgtttatcag 720
tccgaacagg ctgaaaaact gctgttagca ggcgttatgc tgcgcgatcc agcgcgtttt 780
gatctgcgtg gtacgctaac tcacgggcgc gatgttgaaa ttgatactaa cgttatcatc 840
gagggcaacg tgactctcgg tcatcgcgtg aaaattggca ccggttgcgt gattaaaaac 900
agcgtgattg gcgatgattg cgaaatcagt ccgtataccg ttgtggaaga tgcgaatctg 960
gcagcggcct gtaccattgg cccgtttgcc cgtttgcgtc ctggtgctga gttgctggaa 1020
ggtgctcacg tcggtaactt cgttgagatg aaaaaagcgc gtctgggtaa aggctcgaaa 1080
gctggtcatc tgacttacct gggcgatgcg gaaattggcg ataacgttaa catcggcgcg 1140
ggaaccatta cctgcaacta cgatggtgcg aataaattta agaccattat cggcgacgat 1200
gtgtttgttg gttccgacac tcagctggtg gccccggtaa cagtaggcaa aggcgcgacc 1260
attgctgcgg gtacaactgt gacgcgtaat gtcggcgaaa atgcattagc tatcagccgt 1320
gtgccgcaga ctcagaaaga aggctggcgt cgtccggtaa agaaaaagtg a 1371
<210> 5
<211> 1830
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 5
atgtgtggaa ttgttggcgc gatcgcgcaa cgtgatgtag cagaaatcct tcttgaaggt 60
ttacgtcgtc tggaataccg cggatatgac tctgccggtc tggccgttgt tgatgcagaa 120
ggtcatatga cccgcctgcg tcgcctcggt aaagtccaga tgctggcaca ggcagcggaa 180
gaacatcctc tgcatggcgg cactggtatt gctcacactc gctgggcgac ccacggtgaa 240
ccttcagaag tgaatgcgca tccgcatgtt tctgaacaca ttgtggtggt gcataacggc 300
atcatcgaaa accatgaacc gctgcgtgaa gagctaaaag cgcgtggcta taccttcgtt 360
tctgaaaccg acaccgaagt gattgcccat ctggtgaact gggagctgaa acaaggcggg 420
actctgcgtg aggccgttct gcgtgctatc ccgcagctgc gtggtgcgta cggtacagtg 480
atcatggact cccgtcaccc ggataccctg ctggcggcac gttctggtag tccgctggtg 540
attggcctgg ggatgggcga aaactttatc gcttctgacc agctggcgct gttgccggtg 600
acccgtcgct ttatcttcct tgaagagggc gatattgcgg aaatcactcg ccgttcggta 660
aacatcttcg ataaaactgg cgcggaagta aaacgtcagg atatcgaatc caatctgcaa 720
tatgacgcgg gcgataaagg catttaccgt cactacatgc agaaagagat ctacgaacag 780
ccgaacgcga tcaaaaacac ccttaccgga cgcatcagcc acggtcaggt tgatttaagc 840
gagctgggac cgaacgccga cgaactgctg tcgaaggttg agcatattca gatcctcgcc 900
tgtggtactt cttataactc cggtatggtt tcccgctact ggtttgaatc gctagcaggt 960
attccgtgcg acgtcgaaat cgcctctgaa ttccgctatc gcaaatctgc cgtgcgtcgt 1020
aacagcctga tgatcacctt gtcacagtct ggcgaaaccg cggataccct ggctggcctg 1080
cgtctgtcga aagagctggg ttaccttggt tcactggcaa tctgtaacgt tccgggttct 1140
tctctggtgc gcgaatccga tctggcgcta atgaccaacg cgggtacaga aatcggcgtg 1200
gcatccacta aagcattcac cactcagtta actgtgctgt tgatgctggt ggcgaagctg 1260
tctcgcctga aaggtctgga tgcctccatt gaacatgaca tcgtgcatgg tctgcaggcg 1320
ctgccgagcc gtattgagca gatgctgtct caggacaaac gcattgaagc gctggcagaa 1380
gatttctctg acaaacatca cgcgctgttc ctgggccgtg gcgatcagta cccaatcgcg 1440
ctggaaggcg cattgaagtt gaaagagatc tcttacattc acgctgaagc ctacgctgct 1500
ggcgaactga aacacggtcc gctggcgcta attgatgccg atatgccggt tattgttgtt 1560
gcaccgaaca acgaattgct ggaaaaactg aaatccaaca ttgaagaagt tcgcgcgcgt 1620
ggcggtcagt tgtatgtctt cgccgatcag gatgcgggtt ttgtaagtag cgataacatg 1680
cacatcatcg agatgccgca tgtggaagag gtgattgcac cgatcttcta caccgttccg 1740
ctgcagctgc tggcttacca tgtcgcgctg atcaaaggca ccgacgttga ccagccgcgt 1800
aacctggcaa aatcggttac ggttgagtaa 1830
<210> 6
<211> 1017
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 6
atgagagttc tggttaccgg tggtagcggt tacattggaa gtcatacctg tgtgcaatta 60
ctgcaaaacg gtcatgatgt catcattctt gataacctct gtaacagtaa gcgcagcgta 120
ctgcctgtta tcgagcgttt aggcggcaaa catccaacgt ttgttgaagg cgatattcgt 180
aacgaagcgt tgatgaccga gatcctgcac gatcacgcta tcgacaccgt gatccacttc 240
gccgggctga aagccgtggg cgaatcggta caaaaaccgc tggaatatta cgacaacaat 300
gtcaacggca ctctgcgcct gattagcgcc atgcgcgccg ctaacgtcaa aaactttatt 360
tttagctcct ccgccaccgt ttatggcgat cagcccaaaa ttccatacgt tgaaagcttc 420
ccgaccggca caccgcaaag cccttacggc aaaagcaagc tgatggtgga acagatcctc 480
accgatctgc aaaaagccca gccggactgg agcattgccc tgctgcgcta cttcaacccg 540
gttggcgcgc atccgtcggg cgatatgggc gaagatccgc aaggcattcc gaataacctg 600
atgccataca tcgcccaggt tgctgtaggc cgtcgcgact cgctggcgat ttttggtaac 660
gattatccga ccgaagatgg tactggcgta cgcgattaca tccacgtaat ggatctggcg 720
gacggtcacg tcgtggcgat ggaaaaactg gcgaacaagc caggcgtaca catctacaac 780
ctcggcgctg gcgtaggcaa cagcgtgctg gacgtggtta atgccttcag caaagcctgc 840
ggcaaaccgg ttaattatca ttttgcaccg cgtcgcgagg gcgaccttcc ggcctactgg 900
gcggacgcca gcaaagccga ccgtgaactg aactggcgcg taacgcgcac actcgatgaa 960
atggcgcagg acacctggca ctggcagtca cgccatccac agggatatcc cgattaa 1017
<210> 7
<211> 1047
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 7
atgacgcaat ttaatcccgt tgatcatcca catcgccgct acaacccgct caccgggcaa 60
tggattctgg tttcaccgca ccgcgctaag cgcccctggc agggggcgca ggaaacgcca 120
gccaaacagg tgttacctgc gcacgatcca gattgcttcc tctgcgcagg taatgtgcgg 180
gtgacaggcg ataaaaaccc cgattacacc gggacttacg ttttcactaa tgactttgcg 240
gctttgatgt ctgacacgcc agatgcgcca gaaagtcacg atccgctgat gcgttgccag 300
agcgcgcgcg gcaccagccg ggtgatctgc ttttcaccgg atcacagtaa aacgctgcca 360
gagctcagcg ttgcagcatt gacggaaatc gtcaaaacct ggcaggagca aaccgcagaa 420
ctggggaaaa cgtacccatg ggtgcaggtt tttgaaaaca aaggcgcggc gatgggctgc 480
tctaacccgc atccgcacgg tcagatttgg gcaaatagct tcctgcctaa cgaagctgag 540
cgcgaagacc gcctgcaaaa agaatatttt gccgaacaga aatcaccaat gctggtggat 600
tatgttcagc gcgagctggc agacggtagc cgtaccgttg tcgaaaccga acactggtta 660
gccgtcgtgc cttactgggc tgcctggccg ttcgaaacgc tactgctgcc caaagcccac 720
gttttacgga tcaccgattt gaccgacgcc cagcgcagcg atctggcgct ggcgttgaaa 780
aagctgacca gtcgttatga caacctcttc cagtgctcct tcccctactc tatgggctgg 840
cacggcgcgc catttaatgg cgaagagaat caacactggc agctgcacgc gcacttttat 900
ccgcctctgc tgcgctccgc caccgtacgt aaatttatgg ttggttatga aatgctggca 960
gagacccagc gagacctgac cgcagaacag gcagcagagc gtttgcgcgc agtcagcgat 1020
atccattttc gcgaatccgg agtgtaa 1047
<210> 8
<211> 1149
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 8
atgagtctga aagaaaaaac acaatctctg tttgccaacg catttggcta ccctgccact 60
cacaccattc aggcgcctgg ccgcgtgaat ttgattggtg aacacaccga ctacaacgac 120
ggtttcgttc tgccctgcgc gattgattat caaaccgtga tcagttgtgc accacgcgat 180
gaccgtaaag ttcgcgtgat ggcagccgat tatgaaaatc agctcgacga gttttccctc 240
gatgcgccca ttgtcgcaca tgaaaactat caatgggcta actacgttcg tggcgtggtg 300
aaacatctgc aactgcgtaa caacagcttc ggcggcgtgg acatggtgat cagcggcaat 360
gtgccgcagg gtgccgggtt aagttcttcc gcttcactgg aagtcgcggt cggaaccgta 420
ttgcagcagc tttatcatct gccgctggac ggcgcacaaa tcgcgcttaa cggtcaggaa 480
gcagaaaacc agtttgtagg ctgtaactgc gggatcatgg atcagctaat ttccgcgctc 540
ggcaagaaag atcatgcctt gctgatcgat tgccgctcac tggggaccaa agcagtttcc 600
atgcccaaag gtgtggctgt cgtcatcatc aacagtaact tcaaacgtac cctggttggc 660
agcgaataca acacccgtcg tgaacagtgc gaaaccggtg cgcgtttctt ccagcagcca 720
gccctgcgtg atgtcaccat tgaagagttc aacgctgttg cgcatgaact ggacccgatc 780
gtggcaaaac gcgtgcgtca tatactgact gaaaacgccc gcaccgttga agctgccagc 840
gcgctggagc aaggcgacct gaaacgtatg ggcgagttga tggcggagtc tcatgcctct 900
atgcgcgatg atttcgaaat caccgtgccg caaattgaca ctctggtaga aatcgtcaaa 960
gctgtgattg gcgacaaagg tggcgtacgc atgaccggcg gcggatttgg cggctgtatc 1020
gtcgcgctga tcccggaaga gctggtgcct gccgtacagc aagctgtcgc tgaacaatat 1080
gaagcaaaaa caggtattaa agagactttt tacgtttgta aaccatcaca aggagcagga 1140
cagtgctga 1149
<210> 9
<211> 1641
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 9
atggcaatcc acaatcgtgc aggccaacct gcacaacaga gtgatttgat taacgtcgcc 60
caactgacgg cgcaatatta tgtactgaaa ccagaagcag ggaatgcgga gcacgcggtg 120
aaattcggta cttccggtca ccgtggcagt gcagcgcgcc acagctttaa cgagccgcac 180
attctggcga tcgctcaggc aattgctgaa gaacgtgcga aaaacggcat cactggccct 240
tgctatgtgg gtaaagatac tcacgccctg tccgaacctg cattcatttc cgttctggaa 300
gtgctggcag cgaacggcgt tgatgtcatt gtgcaggaaa acaatggctt caccccgacg 360
cctgccgttt ccaatgccat cctggttcac aataaaaaag gtggcccgct ggcagacggt 420
atcgtgatta caccgtccca taacccgccg gaagatggtg gaatcaaata caatccgcca 480
aatggtggcc cggctgatac caacgtcact aaagtggtgg aagacagggc caacgcactg 540
ctggccgatg gcctgaaagg cgtgaagcgt atctccctcg acgaagcgat ggcatccggt 600
catgtgaaag agcaggatct ggtgcagccg ttcgtggaag gtctggccga tatcgttgat 660
atggccgcga ttcagaaagc gggcctgacg ctgggcgttg atccgctggg cggttccggt 720
atcgaatact ggaagcgtat tggcgagtat tacaacctca acctgactat cgttaacgat 780
caggtcgatc aaaccttccg ctttatgcac cttgataaag acggcgcgat ccgtatggac 840
tgctcctccg agtgtgcgat ggcgggcctg ctggcactgc gtgataagtt cgatctggcg 900
tttgctaacg acccggatta tgaccgtcac ggtatcgtca ctccggcagg tttgatgaat 960
ccgaaccact acctggcggt ggcaatcaat tacctgttcc agcatcgtcc gcagtggggc 1020
aaagatgttg ccgtcggtaa aacgctggtt tcatctgcga tgatcgaccg tgtggtcaac 1080
gacttgggcc gtaaactggt agaagtcccg gtaggtttca aatggtttgt cgatggtctg 1140
ttcgacggca gcttcggctt tggcggcgaa gagagtgcag gggcttcctt cctgcgtttc 1200
gacggcacgc cgtggtccac cgacaaagac ggcatcatca tgtgtctgct ggcggcggaa 1260
atcaccgctg tcaccggtaa gaacccgcag gaacactaca acgaactggc aaaacgcttt 1320
ggtgcgccga gctacaaccg tttgcaggca gctgcgactt ccgcacaaaa agcggcgctg 1380
tctaagctgt ctccggaaat ggtgagcgcc agcaccctgg caggtgaccc gatcaccgcg 1440
cgcctgactg ctgctccggg caacggtgct tctattggcg gtctgaaagt gatgactgac 1500
aacggctggt tcgccgcgcg tccgtcaggc acggaagacg catataagat ctactgcgaa 1560
agcttcctcg gtgaagaaca tcgcaagcag attgagaaag aagcggttga gattgttagc 1620
gaagttctga aaaacgcgta a 1641
<210> 10
<211> 1650
<212> DNA
<213> 大肠杆菌
<400> 10
atgaaaaaca tcaatccaac gcagaccgct gcctggcagg cactacagaa acacttcgat 60
gaaatgaaag acgttacgat cgccgatctt tttgctaaag acggcgatcg tttttctaag 120
ttctccgcaa ccttcgacga tcagatgctg gtggattact ccaaaaaccg catcactgaa 180
gagacgctgg cgaaattaca ggatctggcg aaagagtgcg atctggcggg cgcgattaag 240
tcgatgttct ctggcgagaa gatcaaccgc actgaaaacc gcgccgtgct gcacgtagcg 300
ctgcgtaacc gtagcaatac cccgattttg gttgatggca aagacgtaat gccggaagtc 360
aacgcggtgc tggagaagat gaaaaccttc tcagaagcga ttatttccgg tgagtggaaa 420
ggttataccg gcaaagcaat cactgacgta gtgaacatcg ggatcggcgg ttctgacctc 480
ggcccataca tggtgaccga agctctgcgt ccgtacaaaa accacctgaa catgcacttt 540
gtttctaacg tcgatgggac tcacatcgcg gaagtgctga aaaaagtaaa cccggaaacc 600
acgctgttct tggtagcatc taaaaccttc accactcagg aaactatgac caacgcccat 660
agcgcgcgtg actggttcct gaaagcggca ggtgatgaaa aacacgttgc aaaacacttt 720
gcggcgcttt ccaccaatgc caaagccgtt ggcgagtttg gtattgatac tgccaacatg 780
ttcgagttct gggactgggt tggcggccgt tactctttgt ggtcagcgat tggcctgtcg 840
attgttctct ccatcggctt tgataacttc gttgaactgc tttccggcgc acacgcgatg 900
gacaagcatt tctccaccac gcctgccgag aaaaacctgc ctgtactgct ggcgctgatt 960
ggcatctggt acaacaattt ctttggtgcg gaaactgaag cgattctgcc gtatgaccag 1020
tatatgcacc gtttcgcggc gtacttccag cagggcaata tggagtccaa cggtaagtat 1080
gttgaccgta acggtaacgt tgtggattac cagactggcc cgattatctg gggtgaacca 1140
ggcactaacg gtcagcacgc gttctaccag ctgatccacc agggaaccaa aatggtaccg 1200
tgcgatttca tcgctccggc tatcacccat aacccgctct ctgatcatca ccagaaactg 1260
ctgtctaact tcttcgccca gaccgaagcg ctggcgtttg gtaaatcccg cgaagtggtt 1320
gagcaggaat atcgtgatca gggtaaagat ccggcaacgc ttgactacgt ggtgccgttc 1380
aaagtattcg aaggtaaccg cccgaccaac tccatcctgc tgcgtgaaat cactccgttc 1440
agcctgggtg cgttgattgc gctgtatgag cacaaaatct ttactcaggg cgtgatcctg 1500
aacatcttca ccttcgacca gtggggcgtg gaactgggta aacagctggc gaaccgtatt 1560
ctgccagagc tgaaagatga taaagaaatc agcagccacg atagctcgac caatggtctg 1620
attaaccgct ataaagcgtg gcgcggttaa 1650

Claims (6)

1.一种产乳酰-N-四糖的基因工程菌,其特征在于,所述基因工程菌敲除了β-半乳糖苷酶基因lacZ,并过表达β-1,3-N-乙酰氨基葡萄糖转移酶基因lgtA、β-1,3-半乳糖基转移酶基因wbgO、UDP-葡萄糖-4-差向异构酶基因galE、半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶基因galT和半乳糖激酶基因galK;所述基因工程菌利用pCDFDuet-1表达lgtAwbgO,利用pETDuet-1表达galEgalTgalK
所述lgtA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述wbgO的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述galE的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示,所述galT的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,所述galK的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
2.根据权利要求1所述的基因工程菌,其特征在于,以大肠杆菌为宿主。
3.权利要求1或2所述的基因工程菌在生产乳酰-N-四糖中的应用。
4.一种生产乳酰-N-四糖的方法,其特征在于,以乳糖和甘油为碳源,利用权利要求1或2所述的基因工程菌发酵生产乳酰-N-四糖。
5. 根据权利要求4所述的方法,其特征在于,培养至OD600为10~13,加入终浓度为15~25g/L乳糖、0~20 g/L半乳糖和0.2~1.0 mM的IPTG。
6. 根据权利要求4所述的方法,其特征在于,发酵条件为,培养温度为24~38℃,搅拌转速250~850 r/min,通气量0.8~1.2 vvm,pH 6.5~7.0。
CN202110891714.6A 2021-08-04 2021-08-04 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法 Active CN113684163B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202110891714.6A CN113684163B (zh) 2021-08-04 2021-08-04 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202110891714.6A CN113684163B (zh) 2021-08-04 2021-08-04 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN113684163A CN113684163A (zh) 2021-11-23
CN113684163B true CN113684163B (zh) 2023-07-25

Family

ID=78578828

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202110891714.6A Active CN113684163B (zh) 2021-08-04 2021-08-04 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN113684163B (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114990037B (zh) * 2022-05-24 2024-03-26 江南大学 一种高产乳酰-n-四糖的重组大肠杆菌的构建方法及应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108026556A (zh) * 2015-09-12 2018-05-11 詹尼温生物技术有限责任公司 在具有经改造的输入/输出的微生物宿主中人乳寡糖的产生
CN111979168A (zh) * 2020-08-17 2020-11-24 江南大学 一种提高乳酰-n-三糖ii产量的基因工程菌及生产方法
CN113136357A (zh) * 2021-04-25 2021-07-20 江南大学 一种产乳酰-n-新四糖的基因工程菌及生产方法

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN108026556A (zh) * 2015-09-12 2018-05-11 詹尼温生物技术有限责任公司 在具有经改造的输入/输出的微生物宿主中人乳寡糖的产生
CN111979168A (zh) * 2020-08-17 2020-11-24 江南大学 一种提高乳酰-n-三糖ii产量的基因工程菌及生产方法
CN113136357A (zh) * 2021-04-25 2021-07-20 江南大学 一种产乳酰-n-新四糖的基因工程菌及生产方法

Also Published As

Publication number Publication date
CN113684163A (zh) 2021-11-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN110804577B (zh) 一种高效生产2’-岩藻糖基乳糖的重组菌的构建方法及其应用
CN113136357B (zh) 一种产乳酰-n-新四糖的基因工程菌及生产方法
CN112342176A (zh) 产2’-岩藻糖基乳糖的基因工程菌及其应用
JP2019531752A (ja) フコシル化オリゴ糖の製造のための改良された方法
CN111979168B (zh) 一种提高乳酰-n-三糖ii产量的基因工程菌及生产方法
CN113684164B (zh) 一种高产乳酰-n-新四糖的微生物的构建方法及应用
CN113652385B (zh) 一种高产乳酰-n-四糖的微生物的构建方法及应用
CN113621631A (zh) 一种甲羟戊酸激酶基因rkmk及其应用
CN114874964B (zh) 一种高产2′-岩藻糖基乳糖的重组大肠杆菌的构建方法及应用
CN114480240A (zh) 一种产岩藻糖基乳糖的基因工程菌及生产方法
CN114381416A (zh) 一种高产5-氨基乙酰丙酸的重组大肠杆菌菌株及其应用
CN113684163B (zh) 一种提高乳酰-n-四糖产量的基因工程菌及其生产方法
CN113151133B (zh) 一种产唾液酸乳糖的重组宿主菌及其构建方法和应用
CN113832092B (zh) 一种提高乳酰-n-岩藻五糖产量的基因工程菌及其生产方法
CN113957027B (zh) 一种提高乳酰-n-岩藻六糖产量的基因工程菌及其生产方法
CN107299074B (zh) 甲酸脱氢酶工程菌株的构建方法及应用
CN114854659B (zh) 一种麦角硫因生产工艺及其应用
CN114277068B (zh) 一种r-3-羟基丁酸乙酯微生物发酵制备方法
CN116333953A (zh) 一种高产胞嘧啶核苷的基因工程菌及其应用
CN114806991A (zh) 一种提高岩藻糖基乳糖产量的工程大肠杆菌及生产方法
CN116676243A (zh) 产2&#39;-岩藻糖基乳糖的重组大肠杆菌的构建方法及其应用
CN114672525A (zh) N-乙酰基-5-甲氧基色胺的生物合成方法及其应用
CN116925993B (zh) 用于酶催化生产胞苷酸的基因工程改造菌株和方法
CN116042682B (zh) 一株产2’-岩藻糖基乳糖的工程菌及其构建方法和应用
CN116478894A (zh) 一种提高唾液酸乳糖产量的基因工程菌及其生产方法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant