CN113286510A - 用于植物病原体抑制的微生物 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及用一种或多种微生物来治疗植物以抑制植物病原体。更具体地，本发明涉及分离的芽孢杆菌属(Bacillus)菌株，以及具有这些菌株的所有鉴定特性的菌株，及其组合，用于包括上述用途的用途。

Description

用于植物病原体抑制的微生物
相关申请的交叉引用
本申请根据35 U.S.C. § 119(e)，要求于2018年9月28日提交的美国临时申请序列号62/738,208的优先权，所述美国临时申请的整体公开内容引入本文作为参考。
技术领域
本发明涉及用一种或多种微生物来治疗植物以抑制植物病原体。更具体地，本发明涉及分离的芽孢杆菌属菌株，以及具有这些菌株的所有鉴定特性的菌株，及其组合，用于包括上述用途的用途。
背景技术和发明内容
本发明涉及用于抑制植物病原体的微生物，例如分离的芽孢杆菌属菌株。真菌病原体在植物中引起各种疾病，包括但不限于由狭长孢灵芝(Ganoderma boninense)引起的茎基腐病、由棕榈疫霉(Phytophthora palmivora)引起的芽腐病和由尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)引起的枯萎病。这些疾病有害地影响油棕种植园中的棕榈植物，并且造成棕榈油行业中的重大经济损失。另外的真菌物种，芽枝状枝孢(Cladosporium cladosporioides)引起许多植物的叶和果实中的枝孢菌腐病(Cladosporium rot)，最值得注意的是红酒葡萄树。芽枝状枝孢在收获时影响多达50%的葡萄簇，极大地降低了产率并有害地影响了酒品质。在果实表面上生长的酵母如盔形毕赤酵母(Pichia manshurica)可以促成异味和酒变质，也导致酒品质损失和经济损失。烟曲霉(Aspergillus fumigatus)是普遍存在的霉菌，其通常在腐烂的植被上发现，并且不仅是作为软腐病的因子的问题，而且已被确定为人中的曲霉菌病的全球首因，且造成真菌感染患者中的最高数目的死亡之一。例如，一般而言，许多其它真菌病对植物具有有害作用，并且造成园艺、农业和林业行业中的重大经济损失。青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)是土壤传播的细菌菌株，其在广泛范围的宿主植物中引起细菌性萎蔫病。
申请人已开发了可用于抑制植物病原体的芽孢杆菌属菌株及其组合。这些菌株包括选自以下的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2(NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在一个实施方案中，提供了治疗植物以抑制真菌病或细菌病的方法。该方法包括使植物与包含有效量的分离的芽孢杆菌属菌株的组合物接触，并且抑制真菌病或细菌病，所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2(NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在另一个实施方案中，提供了商业包装。商业包装包含分离的芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在又一个实施方案中，提供了组合物，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
下述条款及其组合提供了在本文中描述的本发明的各个另外的说明性方面。在本专利申请的任何其它节段，包括标题为“具体实施方式”和实施例的节段中描述的各个实施方案，适用于下文编号条款中描述的本发明的任何下述实施方案。
1. 一种治疗植物以抑制真菌病或细菌病的方法，所述方法包括使植物与包含有效量的分离的芽孢杆菌属菌株的组合物接触，并且抑制所述真菌病或细菌病，所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86(NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101(NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607(NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
2. 条款1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
3. 条款1或2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607(NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
4. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号 B-50943)。
5. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号 B-67219)。
6. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)。
7. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号 B-67218)。
8. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号 B-67274)。
9. 条款1至8中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株具有抗真菌活性。
10. 条款1至9中任一项的方法，其中所述真菌病由选自以下的属的真菌引起：灵芝属、疫霉属、镰刀菌属及其组合。
11. 条款10的方法，其中所述真菌病由选自以下的真菌引起：狭长孢灵芝、奇异灵芝、韦伯灵芝、棕榈疫霉、九州镰孢、尖孢镰刀菌、Fusarium nelsonii、芽枝状枝孢、盔形毕赤酵母、库德毕赤酵母、烟曲霉及其组合。
12. 条款11的方法，其中所述真菌是狭长孢灵芝。
13. 条款11的方法，其中所述真菌是奇异灵芝。
14. 条款11的方法，其中所述真菌是韦伯灵芝。
15. 条款11的方法，其中所述真菌是棕榈疫霉。
16. 条款11的方法，其中所述真菌是九州镰孢。
17. 条款11的方法，其中所述真菌是尖孢镰刀菌。
18. 条款11的方法，其中所述真菌是Fusarium nelsonii。
19. 条款1至18中任一项的方法，其进一步包括用不同的芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合治疗植物。
20. 条款1至19中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 108 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物。
21. 条款1至19中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 104 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物。
22. 条款1至19中任一项的方法，其中所述有效量为大于约1.0 x 102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 103 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物的量。
23. 条款1至22中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含活的芽孢杆菌属细胞或孢子。
24. 条款23的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含活的芽孢杆菌属细胞。
25. 条款23的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含孢子。
26. 条款1至25中任一项的方法，其中所述组合物是液体。
27. 条款1至25中任一项的方法，其中所述组合物是干燥的。
28. 条款27的方法，其中所述组合物是冻干的。
29. 条款1至28中任一项的方法，其中所述接触是通过将所述组合物喷雾到植物上。
30. 条款1至28中任一项的方法，其中所述接触是通过将所述组合物手动施加到植物上。
31. 条款1至30中任一项的方法，其中通过使所述组合物与选自叶、种子、根、花、枝条、芽及其组合的植物部分接触，来接触植物。
32. 条款1至30中任一项的方法，其中通过将所述组合物施加于植物由其获得养分的土壤，来接触植物。
33. 条款1至32中任一项的方法，其中所述植物是棕榈植物。
34. 一种商业包装或组合物，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607(NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
35. 一种用于抑制植物中的真菌病或细菌病的商业包装或组合物，其包含分离的芽孢杆菌属菌株，其中所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18(NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
36. 条款34至35中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为浓缩物形式。
37. 条款34至35中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为超浓缩物形式。
38. 条款34至37中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为干燥形式。
39. 条款34至37中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为选自粉末和液体的形式。
40. 条款34至39中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含所述芽孢杆菌属菌株的载体。
41. 条款40的商业包装或组合物，其中所述载体选自盐、糊精及其组合。
42. 条款34至41中任一项的商业包装或组合物，其在袋中。
43. 条款42的商业包装或组合物，其中所述袋是塑料袋。
44. 条款34至43中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明书。
45. 条款42至43中任一项的商业包装或组合物，其在20磅的袋中。
46. 条款42至43中任一项的商业包装或组合物，其在50磅的袋中。
47. 条款39的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为粉末形式。
48. 条款39的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为液体形式。
49. 条款34至48中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株在用于商业用途的容器中。
50. 条款49的商业包装或组合物，其中所述容器包含塑料。
51. 条款49的商业包装或组合物，其中所述容器包含纸。
52. 条款34至51中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含粘合剂。
53. 条款52的商业包装或组合物，其中所述粘合剂选自粘土、酵母细胞壁组分、硅酸铝和葡聚糖或其组合。
54. 条款34或36至53中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株用于抑制植物中的真菌病。
55. 条款34或36至53中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株用于抑制植物中的细菌病。
56. 条款11的方法，其中所述真菌是芽枝状枝孢。
57. 条款11的方法，其中所述真菌是盔形毕赤酵母。
58. 条款11的方法，其中所述真菌是库德毕赤酵母。
59. 条款11的方法，其中所述真菌是烟曲霉。
60. 条款1至33中任一项的方法，其中所述细菌病由雷尔氏菌属的细菌引起。
61. 条款60的方法，其中所述细菌是青枯雷尔氏菌。
附图说明
图1显示了通过来自各种芽孢杆菌属菌株的上清液，在肉汤培养中的狭长孢灵芝、韦伯灵芝和尖孢镰刀菌的生长抑制百分比。
图2A显示了在液体肉汤测定法中生长24小时之后，芽孢杆菌属菌株300抑制了烟曲霉生物量累积(p=0.02)。图2B是在液体肉汤(左)或具有芽孢杆菌属菌株300上清液的液体肉汤(右)中，烟曲霉生长24小时之后的照片。
具体实施方式
申请人已开发了芽孢杆菌属菌株及其组合，其可以用于治疗植物以抑制真菌病或细菌病。更具体地，本发明涉及分离的芽孢杆菌属菌株，以及具有这些菌株的所有鉴定特性的菌株，及其组合，用于包括上述用途的用途。例如，这些真菌和细菌病有害地影响植物，并且造成园艺、农业和林业行业中的重大经济损失。
在一个实施方案中，提供了治疗植物以抑制真菌病或细菌病的方法。该方法包括使植物与包含有效量的分离的芽孢杆菌属菌株的组合物接触，并且抑制真菌病或细菌病，所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2(NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在另一个实施方案中，提供了商业包装。商业包装包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在又一个实施方案中，提供了组合物，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。在另一个方面，芽孢杆菌属菌株组合物可以用于抑制植物中的真菌病或细菌病。
在另一个实施方案中，提供了用于抑制植物中的真菌病或细菌病的商业包装或组合物，其包含分离的芽孢杆菌属菌株，其中所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607(NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
下述条款及其组合提供了在本文中描述的本发明的各个另外的说明性方面。在标题为“具体实施方式”的这个节段中描述的各个实施方案，适用于下文编号条款中描述的本发明的任何下述实施方案。
1. 一种治疗植物以抑制真菌病或细菌病的方法，所述方法包括使植物与包含有效量的分离的芽孢杆菌属菌株的组合物接触，并且抑制所述真菌病或细菌病，所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86(NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101(NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607(NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
2. 条款1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
3. 条款1或2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607(NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
4. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号 B-50943)。
5. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号 B-67219)。
6. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)。
7. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号 B-67218)。
8. 条款2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号 B-67274)。
9. 条款1至8中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株具有抗真菌活性。
10. 条款1至9中任一项的方法，其中所述真菌病由选自以下的属的真菌引起：灵芝属、疫霉属、镰刀菌属及其组合。
11. 条款10的方法，其中所述真菌病由选自以下的真菌引起：狭长孢灵芝、奇异灵芝、韦伯灵芝、棕榈疫霉、九州镰孢、尖孢镰刀菌、Fusarium nelsonii、芽枝状枝孢、盔形毕赤酵母、库德毕赤酵母、烟曲霉及其组合。
12. 条款11的方法，其中所述真菌是狭长孢灵芝。
13. 条款11的方法，其中所述真菌是奇异灵芝。
14. 条款11的方法，其中所述真菌是韦伯灵芝。
15. 条款11的方法，其中所述真菌是棕榈疫霉。
16. 条款11的方法，其中所述真菌是九州镰孢。
17. 条款11的方法，其中所述真菌是尖孢镰刀菌。
18. 条款11的方法，其中所述真菌是Fusarium nelsonii。
19. 条款1至18中任一项的方法，其进一步包括用不同的芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合治疗植物。
20. 条款1至19中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 108 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物。
21. 条款1至19中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株的有效量为约1.0 x102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 104 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物。
22. 条款1至19中任一项的方法，其中所述有效量为大于约1.0 x 102 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物至约1.0 x 103 CFU/ml或克的用于与植物接触的组合物的量。
23. 条款1至22中任一项的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含活的芽孢杆菌属细胞或孢子。
24. 条款23的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含活的芽孢杆菌属细胞。
25. 条款23的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株包含孢子。
26. 条款1至25中任一项的方法，其中所述组合物是液体。
27. 条款1至25中任一项的方法，其中所述组合物是干燥的。
28. 条款27的方法，其中所述组合物是冻干的。
29. 条款1至28中任一项的方法，其中所述接触是通过将所述组合物喷雾到植物上。
30. 条款1至28中任一项的方法，其中所述接触是通过将所述组合物手动施加到植物上。
31. 条款1至30中任一项的方法，其中通过使所述组合物与选自叶、种子、根、花、枝条、芽及其组合的植物部分接触，来接触植物。
32. 条款1至30中任一项的方法，其中通过将所述组合物施加于植物由其获得养分的土壤，来接触植物。
33. 条款1至32中任一项的方法，其中所述植物是棕榈植物。
34. 一种商业包装或组合物，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607(NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
35. 一种用于抑制植物中的真菌病或细菌病的商业包装或组合物，其包含分离的芽孢杆菌属菌株，其中所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18(NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
36. 条款34至35中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为浓缩物形式。
37. 条款34至35中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为超浓缩物形式。
38. 条款34至37中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为干燥形式。
39. 条款34至37中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为选自粉末和液体的形式。
40. 条款34至39中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含所述芽孢杆菌属菌株的载体。
41. 条款40的商业包装或组合物，其中所述载体选自盐、糊精及其组合。
42. 条款34至41中任一项的商业包装或组合物，其在袋中。
43. 条款42的商业包装或组合物，其中所述袋是塑料袋。
44. 条款34至43中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明书。
45. 条款42至43中任一项的商业包装或组合物，其在20磅的袋中。
46. 条款42至43中任一项的商业包装或组合物，其在50磅的袋中。
47. 条款39的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为粉末形式。
48. 条款39的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株为液体形式。
49. 条款34至48中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株在用于商业用途的容器中。
50. 条款49的商业包装或组合物，其中所述容器包含塑料。
51. 条款49的商业包装或组合物，其中所述容器包含纸。
52. 条款34至51中任一项的商业包装或组合物，其进一步包含粘合剂。
53. 条款52的商业包装或组合物，其中所述粘合剂选自粘土、酵母细胞壁组分、硅酸铝和葡聚糖或其组合。
54. 条款34或36至53中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株用于抑制植物中的真菌病。
55. 条款34或36至53中任一项的商业包装或组合物，其中所述芽孢杆菌属菌株用于抑制植物中的细菌病。
56. 条款11的方法，其中所述真菌是芽枝状枝孢。
57. 条款11的方法，其中所述真菌是盔形毕赤酵母。
58. 条款11的方法，其中所述真菌是库德毕赤酵母。
59. 条款11的方法，其中所述真菌是烟曲霉。
60. 条款1至33中任一项的方法，其中所述细菌病由雷尔氏菌属的细菌引起。
61. 条款60的方法，其中所述细菌是青枯雷尔氏菌。
在各个实施方案中，用于根据本文所述的方法、商业包装和组合物使用的芽孢杆菌属菌株可以选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12(NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18(NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
芽孢杆菌属菌株MDG 101和芽孢杆菌属菌株MDG 235于2016年1月4日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(Agricultural Research Service Culture Collection)(NRRL)，National Center for Agricultural Utilization Research，AgriculturalResearch Service，USDA，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604-3999，并且分别给予保藏号B-67275和B-67276。芽孢杆菌属菌株MGL77、芽孢杆菌属菌株MGL177和芽孢杆菌属菌株MGL102于2016年6月7日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(NRRL)，National Center for Agricultural Utilization Research，AgriculturalResearch Service，USDA，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604-3999，并且分别给予保藏号B-67274、B-67275和B-67276。保藏根据国际承认用于专利程序的微生物保藏的布达佩斯条约进行。NRRL菌株命名为MDG 101、MDG 235、MGL77、MGL177和MGL102，其分别等价于如本申请中提及的芽孢杆菌属菌株101、235、77、177和102。
芽孢杆菌属菌株MDG86和芽孢杆菌属菌株MDG300于2014年3月14日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(NRRL)，National Center for Agricultural UtilizationResearch，Agricultural Research Service，USDA，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604-3999，并且分别给予保藏号B-50944和B-50943。保藏根据国际承认用于专利程序目的的微生物保藏的布达佩斯条约进行。NRRL菌株命名为MDG86和MDG300，其分别等价于如本申请中提及的芽孢杆菌属菌株86和300。
芽孢杆菌属菌株ATC2于2015年9月16日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(NRRL)，National Center for Agricultural Utilization Research，AgriculturalResearch Service，USDA，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604-3999，并且给予保藏号B-67134。保藏根据国际承认用于专利程序目的的微生物保藏的布达佩斯条约进行。NRRL菌株命名为ATC2，其等价于如本申请中提及的芽孢杆菌属菌株ATC2。
芽孢杆菌属菌株MDGA12于2017年9月14日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(NRRL)，International Depository Authority，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604，并且给予保藏号B-67516。保藏根据国际承认用于专利程序目的的微生物保藏的布达佩斯条约进行。NRRL菌株命名为MDGA12，其等价于如本申请中提及的芽孢杆菌属菌株A12。
芽孢杆菌属菌株V17、V18和1607于2018年8月14日保藏于农业研究机构培养物保藏中心(NRRL)，International Depository Authority，1815 North University Street，Peoria，Illinois 61604，并且分别给予保藏号B-67664、B-67665和B-67666。保藏根据国际承认用于专利程序目的的微生物保藏的布达佩斯条约进行。NRRL菌株命名为MDGV17、MDGV18和MDG1607，其分别等价于如本申请中提及的芽孢杆菌属菌株V17、V18和1607。芽孢杆菌属菌株V17是短小芽孢杆菌(Bacilluspumilus)菌株，且芽孢杆菌属菌株1607是解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)菌株，菌株102和177是短小芽孢杆菌菌株，菌株77是地衣芽孢杆菌(Bacilluslicheniformis)菌株，并且在本申请中描述的所有其它菌株是枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilus)菌株。
在一个说明性方面，这些菌株中的任一种可以单独或组合用于治疗植物以抑制真菌或细菌感染或疾病，其形式为待施加于植物或植物由其获得养分的土壤的液体或干燥喷雾、或者其形式为用于手动施加于植物或植物由其获得养分的土壤的液体或干燥组合物。在一个实施方案中，多重菌株用于在单一组合物中组合治疗植物。在另一个实施方案中，多重菌株用于在分开的组合物中组合治疗植物。
如本文使用的，“具有芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的所有鉴定特性的菌株”，可以是具有芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的所有鉴定特性(例如，基于DNA分析的DNA指纹对应于芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的DNA指纹，对应于芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的酶活性，对应于芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的抗微生物活性，对应于芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的抗生素敏感性和耐受谱，或其组合)的突变菌株。在替代实施方案中，突变可以是天然突变或基因工程突变。在另一个实施方案中，“具有芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的所有鉴定特性的菌株”，可以是例如通过以下产生的菌株：从芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607中分离一种或多种质粒，并且将一种或多种质粒引入另一种细菌，如另一种芽孢杆菌属菌株内，只要一种或多种质粒含有提供芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的鉴定特性(例如，基于DNA分析的DNA指纹对应于芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的DNA指纹)的DNA。
在另一个实施方案中，在前面的段落中描述的一种或多种芽孢杆菌属菌株(例如，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607)，可以连同另一种细菌菌株一起用于治疗植物，所述另一种细菌菌株选自不同的芽孢杆菌属菌株、乳酸菌菌株及其组合。在另外一个实施方案中，另外的芽孢杆菌属菌株可以选自解淀粉芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、短小芽孢杆菌、其它芽孢杆菌属菌株及其组合。在又一个实施方案中，在前面的段落中描述的一种或多种芽孢杆菌属菌株(例如，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607)，可以连同任何其它细菌菌株一起用于治疗植物，所述任何其它细菌菌株有效治疗植物，以抑制真菌感染或细菌感染或者真菌病或细菌病。
如本文使用的，术语“抑制(inhibit)”、“抑制(inhibiting)”和“抑制(inhibited)”意指减轻或消除植物或人的真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染的症状，或者减轻或消除一类真菌或细菌的数目或活性，所述真菌或细菌引起真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染，并且发现与植物或人相关。可以使用本文所述的方法、商业包装和组合物抑制的示例性真菌病是茎基腐病、芽腐病、枯萎病、软腐病、枝孢菌腐病和曲霉菌病。示例性的细菌病是由青枯雷尔氏菌引起的细菌性萎蔫病。本文所述的芽孢杆菌属菌株还可以防止果实上的异味和酒变质，其导致酒品质损失和经济损失。
本文所述的组合物可以用于治疗植物持续任何时间段，所述时间段有效抑制真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染、和/或控制真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染的有害效应。例如，在一个实施方案中，植物的治疗可以每天一次、每两周一次、每周三次、每周四次、每周五次、每周一次、每月一次、或任何合适的时间、或使用任何合适的方案而进行，用于抑制真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染。植物治疗的时间段是非限制性的，并且应当了解，可以使用任何时间段或治疗时间表，其确定为有效抑制真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染、和/或控制真菌病或细菌病或者真菌感染或细菌感染的有害效应。
在各个说明性实施方案中，芽孢杆菌属菌株(例如，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607)，或者除芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607之外添加的任何其它细菌菌株，可以用于按以下治疗植物：约1.0 x 102 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 103 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x104 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 105 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 106 CFU、约1.0x 102 CFU至约1.0 x 107 CFU. 约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 108 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 109 CFU、约1.0 x 102 CFU至约1.0 x 1010 CFU、约1.0 x 103 CFU至约5.0 x 1012CFU、或约1.0 x 103 CFU至约1.0 x 1010 CFU。在其它实施方案中，芽孢杆菌属菌株(例如，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607)，可以用于按以下量治疗植物：大于或约1.0 x 102 CFU、大于或约1.0 x 103 CFU、大于或约1.1 x 103CFU、大于或约1.25 x 103 CFU、大于或约1.5 x 103 CFU、大于或约1.75 x 103 CFU、大于或约1.0 x 104 CFU、大于或约2.0 x 104 CFU、大于或约3.0 x 104 CFU、大于或约4.0 x 104CFU、大于或约5.0 x 104 CFU、大于或约6.0 x 104 CFU、大于或约7.0 x 104 CFU、大于或约8.0 x 104 CFU、大于或约1.0 x 105 CFU、大于或约1.0 x 106 CFU、大于或约1.0 x 107CFU、大于或约1.0 x 108 CFU、大于或约1.0 x 109 CFU、大于或约1.0 x 1010 CFU、大于或约1.0 x 1011 CFU、或大于或约1.0 x 1012 CFU。在使用“CFU”的所有实施方案中，CFU可以是施加于植物的液体或粉末制剂的CFU/克或CFU/ml。
在各个说明性方面，可以被抑制的真菌包括选自以下的属的真菌：灵芝属、疫霉属、镰刀菌属、枝孢菌属(Cladosporium)、毕赤酵母属(Pichia)和曲霉属(Aspergillus)及其组合，或选自以下的真菌：狭长孢灵芝、奇异灵芝、韦伯灵芝、棕榈疫霉、九州镰孢、尖孢镰刀菌、Fusarium nelsonii、芽枝状枝孢、盔形毕赤酵母、库德毕赤酵母、烟曲霉及其组合。在本文所述的一些实施方案中，芽孢杆菌属菌株(例如，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607)可以具有抗真菌活性。此类抗真菌活性可以针对例如选自以下的属的真菌：灵芝属、疫霉属、镰刀菌属、枝孢菌属、毕赤酵母属和曲霉属及其组合，或选自以下的真菌：狭长孢灵芝、奇异灵芝、韦伯灵芝、棕榈疫霉、九州镰孢、尖孢镰刀菌、Fusarium nelsonii、芽枝状枝孢、盔形毕赤酵母、库德毕赤酵母、烟曲霉及其组合。如本文使用的，毕赤酵母属是酵母，但可以被视为一类真菌。可以被本文所述的芽孢杆菌属物种抑制的其它类型的酵母(即，被视为真菌)是酵母属(Saccharomyces)物种、克鲁维酵母属(Kluyveromyces)物种、有孢圆酵母属(Torulaspora)物种、裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)物种、汉逊酵母属(Hansenula)物种、球拟酵母属(Torulopsis)物种、假丝酵母属(Candida)物种和Karwinskia物种。在又一个实施方案中，植物的任何真菌病都可以被本文所述的芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607，以及具有芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株或其组合抑制。在另外一个实施方案中，植物的任何细菌病都可以被本文所述的芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607，以及具有芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株或其组合抑制，例如由青枯雷尔氏菌引起的细菌性萎蔫病。
在一个实施方案中，提供了商业包装，其包含选自芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的分离的芽孢杆菌属菌株，具有任何这些芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在另一个实施方案中，提供了组合物，其包含选自芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607的分离的芽孢杆菌属菌株，具有任何这些芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在又一个实施方案中，提供了用于抑制植物中的真菌病或细菌病的商业包装或组合物，其包含分离的芽孢杆菌属菌株，其中所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17(NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607(NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在这些实施方案中，芽孢杆菌属菌株可以是例如液体或干燥组合物的形式，例如悬浮液或冻干组合物或粉末、冷冻干燥的组合物、凝胶或丸粒。在一个示例性的实施方案中，芽孢杆菌属菌株可以是粉末或液体的形式，并且可以配制为待喷雾于或手动施加于植物或植物由其获得养分的土壤。在其它实施方案中，芽孢杆菌属菌株可以与肥料混合，与土壤混合，或者用作种子包衣用于接触植物或植物部分。用于使植物或土壤与芽孢杆菌属菌株接触的本领域已知的任何合适方法，都可以用于获得任何有效量的本文所述的芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607，或者具有任何这些芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株或其组合。在一个方面，芽孢杆菌属菌株可以包含活的芽孢杆菌属细胞或孢子。在另一个示例性的实施方案中，可以通过使芽孢杆菌属菌株与选自叶、种子、根、花、枝条、芽及其组合的植物部分接触，使植物与芽孢杆菌属菌株接触。
在说明性方面，芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607，或者具有任何这些芽孢杆菌属菌株的所有鉴定特性的菌株及其组合，可以是商业包装或任何其它合适的组合物的形式。在另一个说明性实施方案中，商业包装或其它组合物中的芽孢杆菌属菌株，可以是浓缩物(例如，约1 x 108至约5 x 109 CFU/g)或超浓缩物(例如，约1 x 1010至约5 x 1012 CFU/g)的形式。在另一个实施方案中，商业包装或其它组合物中的芽孢杆菌属菌株，可以是干燥形式(例如粉末)、液体形式、冷冻干燥的形式或凝胶形式、或者用于施加于植物或植物由其获得养分的土壤的任何其它合适形式。
在另一个说明性实施方案中，商业包装或组合物中的芽孢杆菌属菌株可以进一步包含芽孢杆菌属菌株的载体。在各个实施方案中，载体可以选自糠、稻壳、盐、矿物油、糊精(例如麦芽糖糊精)、乳清、糖、石灰石、干燥淀粉、铝硅酸钠、植物油及其组合。在另一个实施方案中，载体可以是本领域已知的用于组合物的任何合适的载体，所述组合物用于施加于植物，以治疗具有真菌或细菌病或感染的植物。在另一个实施方案中，商业包装或组合物中的芽孢杆菌属菌株可以进一步包含粘合剂，例如粘土、酵母细胞壁组分、硅酸铝、葡聚糖或其它已知的粘合剂，和/或微量营养素，包括但不限于氮和磷。这些组分中的任一种都可以外源添加(即，并非天然与芽孢杆菌属菌株组合存在)，并且本文所述的任何组合物可以存在于植物的营养组合物中。
在又其它实施方案中，包含分离的芽孢杆菌属菌株的商业包装或组合物可以用于抑制真菌病或细菌病，并且芽孢杆菌属菌株可以选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18(NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
在另一个实施方案中，商业包装或组合物可以在用于商业用途的容器中。在各个实施方案中，容器可以是例如袋(例如，20磅袋、50磅袋、2盎司袋、1磅袋或1千克袋)、小袋、鼓状物(drum)、瓶或盒子。在说明性方面，包含芽孢杆菌属菌株的容器可以包含塑料、金属、箔、纸、纤维或纸板(例如，塑料桶、纸袋、箔袋、纤维鼓状物等)。商业包装可以进一步包括一种或多种芽孢杆菌属菌株的使用说明书。
下述实施例仅用于说明性目的。实施例是非限制性的，并不预期以任何方式限制本发明。
实施例1
培养条件
所有真菌培养物都得自ATCC，并且包括狭长孢灵芝 ATCC 204074，韦伯灵芝ATCC76753，奇异灵芝ATCC 76757、76537，棕榈疫霉ATCC 26008，棕榈疫霉ATCC 52161，尖孢镰刀菌ATCC 36870，九州镰孢ATCC 56750和Fusarium nelsonii 201410。灵芝属物种在酵母霉菌琼脂上进行培养，疫霉属物种在番茄汁琼脂上进行培养，并且镰刀属物种在马铃薯右旋糖琼脂上进行培养。芽孢杆菌属菌株86、300、101、235、77、177、102、A12、ATC2、V17、V18或1607在胰蛋白酶大豆琼脂上进行培养。
实施例2
抗真菌平板测定法
用置于平板中央的真菌生长物的琼脂塞来接种平板。芽孢杆菌属培养物以3 cm的距离在琼脂塞的任一侧上以两条平行线在平板上进行划线培养。使平板在30℃下温育直至真菌培养物的直径超过6 cm。除了在12天时记录的九州镰孢之外的所有菌株都在6天时记录。测量真菌生长，并且对于每种芽孢杆菌属菌株分配抑制得分。-、+、++或+++的得分分别定义为无抑制、1 cm真菌生长的抑制、2 cm的抑制和3 cm的抑制。
几种芽孢杆菌属菌株具有针对所有六种真菌菌株的强抗真菌活性(参见下表1)。前六种菌株具有针对所有真菌菌株的至少中等活性，并且在肉汤测定法中进一步评估其抗真菌活性。
狭长孢灵芝 奇异灵芝 韦伯灵芝 棕榈疫霉1 棕榈疫霉2 九州镰孢 尖孢镰刀菌 <i>Fusarium nelsonii</i>
77 +++ + +++ ++ +++ ++ ++ ++
1607 ++ + +++ +++ +++ ++ ++ ++
ATC2 +++ + +++ ++ +++ ++ ++ ++
300 +++ ++ +++ ++ +++ ++ ++ ++
101 +++ + +++ ++ +++ ++ ++ ++
235 +++ ++ +++ ++ +++ ++ ++ +
86 ++ + + ++ +++ + ++ +
V18 ++ + - ++ +++ + ++ +
A12 ++ + + ++ +++ + + +
V17 ++ + ++ + +++ - + +
102 - + - - +++ - - -
177 - + - - ++ - - -
表1. 在抗真菌平板测定法中，通过芽孢杆菌属菌株的真菌生长抑制。超过3 cm的真菌生长抑制由“+++”指示，2至3 cm 抑制由“++”指示，1至2 cm抑制由“+”指示，且无抑制由“-”指示。
实施例3
抗真菌肉汤测定法
使用肉汤法评估在平板测定法中表现最佳的芽孢杆菌属菌株。真菌生长物的琼脂塞用于接种含10%无细胞芽孢杆菌属上清液的20 ml肉汤培养基。上清液通过以下进行制备：使芽孢杆菌属在胰蛋白酶大豆肉汤中生长24小时，将培养物以4000 rpm离心20分钟，然后用0.22 µm滤器过滤灭菌上清液。使真菌培养物在30°C下生长两周。将真菌生长物过滤并允许完全干燥。记录干真菌总重量，并且将抑制报告为与对照相比的生长重量的降低百分比。奇异灵芝和棕榈疫霉菌株从肉汤测定法中排除，因为它们在肉汤培养基中生长并不良好。
F. nelsonii和九州镰孢完全不受任何芽孢杆菌属物种的抑制(数据未显示)。然而，所有六种芽孢杆菌属菌株都将狭长孢灵芝抑制超过40%，所述狭长孢灵芝是作为引起油棕植物中的茎基腐烂的原因的病原体(参见图1 - 图1中的菌株“AlgT2”与菌株ATC2相同)。芽孢杆菌属菌株235、300和1607也具有针对韦伯灵芝的强活性。芽孢杆菌属菌株101和300具有针对尖孢镰刀菌的最佳活性。
实施例4
另外的致病性或腐败真菌的分离和鉴定
另外的真菌分离株得自霉变或腐烂的植被包括变质的玉米和干草青贮饲料，并且通过在室温(19-21°C)下、避光温育2-5天的酸化马铃薯右旋糖琼脂上的稀释铺平板进行分离，直至观察到明显的分离株生长。使用Nucleospin Microbial DNA提取试剂盒(Machery-Nagel，Düren，德国)，采用珠磨(bead-beating)步骤用于细胞裂解，从真菌分离株中提取DNA。使用引物(TCCGTAGGTGAACCTGCGG)和ITS4 (TCCTCCGCTTATTGATATGC)，来扩增真菌核糖体基因间间隔区(ITS) (White等人，Amplification and direct sequencing of fungalribosomal RNA genes for phylogenetics，第315-322页，在PCR Protocols: A Guide toMethods and Applications中，编辑Innis等人，Academic Press，Inc.，New York (1990)，所述参考文献关于该实施例中描述的扩增方法引入本文作为参考)，遵循推荐的扩增参数。通过凝胶电泳确定产物大小，用Qiagen MinElute PCR纯化试剂盒(Hilden，德国)提纯PCR产物，并且通过Eurofins Genomics (Louisville，KY)，执行每种纯化的PCR产物的DNA测序。在Chromas 2.6 (Technelysium，South Brisbane，澳大利亚)中，就质量对序列进行修整，并且使用核苷酸BLAST搜索(美国国家生物技术信息中心(National Center forBiotechnology Information)，Bethesda，Maryland)，鉴定最接近的物种匹配。
实施例5
使用植物和腐败真菌的抗真菌交叉划线测定法
使用本领域已知且在下文描述的琼脂交叉划线抗微生物敏感性方法，测试了芽孢杆菌属菌株的菌株特异性抗真菌活性。简言之，从冷冻甘油储液中，在沿非酸化马铃薯右旋糖琼脂平板的中心向下的单个1 cm宽的垂直划线中，接种芽孢杆菌属菌株77、86、300、101、235和V18。使平板在37°C下有氧温育24小时，或直至存在芽孢杆菌属生长物的汇合划线。枝孢菌属、毕赤酵母属和烟曲霉的分离株从平板中央水平地划线培养，在芽孢杆菌属生长物的1 mm内开始划线，并且向板周边划线培养。使平板在25°C下在有氧条件下对于毕赤酵母属酵母温育3天，且对于剩余的真菌分离株温育5天。测量了其中真菌分离株生长被芽孢杆菌属菌株抑制的抑制区带。表2显示了利用琼脂交叉划线法，针对芽枝状枝孢、盔形毕赤酵母、库德毕赤酵母和烟曲霉的分离株的抗微生物筛选。-、+、++或+++的得分分别定义为无抑制、2-5 mm真菌生长的抑制、5-10 mm的抑制和>10 mm的抑制。
几种芽孢杆菌属菌株具有针对所有测试的真菌菌株的广泛抗真菌活性(参见下表2)。在肉汤测定法中进一步评估表现最佳的芽孢杆菌属菌株的抗真菌活性。
表2. 在抗真菌交叉划线测定法中，通过芽孢杆菌属菌株的真菌生长抑制。超过10mm的真菌生长抑制由“+++”指示，5至10 mm 抑制由“++”指示，2至5 mm抑制由“+”指示，且小于2 mm抑制由“-”指示。
Figure DEST_PATH_IMAGE002
实施例6
烟曲霉抗真菌肉汤测定法
使用肉汤法评估在平板测定法中表现最佳的芽孢杆菌属菌株(芽孢杆菌属菌株300)，以确定在液体基质中抑制烟曲霉的功效。上清液通过以下进行制备：使芽孢杆菌属菌株300在胰蛋白酶大豆肉汤中在32℃下生长24小时，将培养物以4000 rpm离心20分钟，然后用0.22 µm滤器过滤灭菌上清液。将烟曲霉在马铃薯右旋糖肉汤中繁殖，以产生大约105个孢子/ml的悬浮液。0.1 ml量的该接种物用于接种与1 ml来自芽孢杆菌属菌株300的无菌过滤的上清液、或1 ml无菌培养肉汤(对照)混合的5 ml马铃薯右旋糖肉汤。制备每种治疗的九个重复，并且使所有重复在37℃下温育24小时。将重复合并成一式三份的样品，经由以4000 rpm离心20分钟使真菌生物量沉降，用无菌水洗涤以去除培养基残留物，在无菌过滤器上干燥并称重，以确定真菌生物量。图2B中所示的照片在24小时生长期结束时拍摄，并且管从左到右为对照和芽孢杆菌属菌株300治疗。记录干真菌总重量，并且将抑制报告为与对照相比的生长重量的降低百分比。芽孢杆菌属菌株300显著抑制了烟曲霉生物量(p=0.02)，该物种与许多植物物种中的软腐病加速相关，并且导致人中的机会性感染(参见图2A)。
实施例7
通过芽孢杆菌属菌株的青枯雷尔氏菌抑制
青枯雷尔氏菌是土壤传播的病原体，其在各种作物中引起细菌性萎蔫病。雷尔氏菌属的菌株从土壤中进行分离，并且测试了分离的雷尔氏菌属菌株通过芽孢杆菌属物种的抑制。土壤样品在半选择性培养基上就雷尔氏菌属物种进行铺平板。改良的SMSA培养基含有在pH 7.0下的1g/L酪蛋白、10g/L蛋白胨、5ml/L甘油和17g/L琼脂(Elphinstone等人，1996)。在高压灭菌后，向培养基中补充5mg/L结晶紫、100mg/L硫酸多粘菌素B、25mg/L杆菌肽、5mg/L氯霉素、0.5mg/L青霉素和100mg/L环己酰亚胺。通过16S测序将推定的雷尔氏菌属分离株鉴定为雷尔氏菌属物种。使用交叉划线法，测试芽孢杆菌属物种针对雷尔氏菌属物种的抗微生物活性。芽孢杆菌属和雷尔氏菌属划线之间的抑制区带以mm进行测量。
如下表1中所示，所有测试的芽孢杆菌属物种都显示所有三种雷尔氏菌属分离株的一些抑制。芽孢杆菌属菌种具有用作针对雷尔氏菌属物种的生物防治剂的潜力。
Figure DEST_PATH_IMAGE004
表1. 通过芽孢杆菌属的雷尔氏菌属物种抑制(mm)。芽孢杆菌属和雷尔氏菌属划线之间的抑制区带以mm进行测量。超过10 mm的生长抑制由“+++”指示，6至9 mm抑制由“++”指示，1至5 mm抑制由“+”指示，且无抑制由“-”指示。

Claims (29)

1. 一种治疗植物以抑制真菌病或细菌病的方法，所述方法包括使植物与包含有效量的分离的芽孢杆菌属(Bacillus)菌株的组合物接触，并且抑制所述真菌病或细菌病，所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101(NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607(NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
2. 权利要求1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
3. 权利要求1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
4. 权利要求2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)。
5. 权利要求2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)。
6. 权利要求2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)。
7. 权利要求2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)。
8. 权利要求2的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株是芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号 B-67274)。
9.权利要求1的方法，其中所述芽孢杆菌属菌株具有抗真菌活性。
10.权利要求9的方法，其中所述真菌病由选自以下的属的真菌引起：灵芝属(Ganoderma)、疫霉属(Phytophthora)、镰刀菌属(Fusarium)及其组合。
11. 权利要求9的方法，其中所述真菌病由选自以下的真菌引起：狭长孢灵芝(Ganoderma boninense)、奇异灵芝(Ganoderma mirabile)、韦伯灵芝(Ganoderma weberianum)、棕榈疫霉(Phytophthora palmivora)、九州镰孢(Fusarium kyushuense)、尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)、Fusarium nelsonii、芽枝状枝孢(Cladosporium cladosporioides)、盔形毕赤酵母(Pichia manshurica)、库德毕赤酵母(Pichia kudriavzevii)、烟曲霉(Aspergillus fumigatus)及其组合。
12.权利要求11的方法，其中所述真菌是狭长孢灵芝。
13.权利要求11的方法，其中所述真菌是奇异灵芝。
14.权利要求11的方法，其中所述真菌是韦伯灵芝。
15.权利要求11的方法，其中所述真菌是棕榈疫霉。
16.权利要求11的方法，其中所述真菌是九州镰孢。
17.权利要求11的方法，其中所述真菌是尖孢镰刀菌。
18. 权利要求11的方法，其中所述真菌是Fusarium nelsonii。
19. 一种商业包装或组合物，其包含选自以下的分离的芽孢杆菌属菌株：芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
20. 一种用于抑制植物中的真菌病或细菌病的商业包装或组合物，其包含分离的芽孢杆菌属菌株，其中所述分离的芽孢杆菌属菌株选自芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)、具有芽孢杆菌属菌株86 (NRRL编号B-50944)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)、具有芽孢杆菌属菌株300 (NRRL编号B-50943)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)、具有芽孢杆菌属菌株101 (NRRL编号B-67218)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)、具有芽孢杆菌属菌株235 (NRRL编号B-67219)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 77 (NRRL编号B-67274)、具有芽孢杆菌属菌株77 (NRRL编号B-67274)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 177 (NRRL编号 B-67275)、具有芽孢杆菌属菌株177 (NRRL编号B-67275)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 102 (NRRL编号B-67276)、具有芽孢杆菌属菌株102 (NRRL编号B-67276)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 ATC2 (NRRL编号B-67134)、具有芽孢杆菌属菌株ATC2 (NRRL编号B-67134)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 A12 (NRRL编号B-67516)、具有芽孢杆菌属菌株A12 (NRRL编号B-67516)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号 B-67664)、具有芽孢杆菌属菌株V17 (NRRL编号B-67664)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株V18 (NRRL编号B-67665)、具有芽孢杆菌属菌株V18(NRRL编号B-67665)的所有鉴定特性的菌株、芽孢杆菌属菌株 1607 (NRRL编号B-67666)、具有芽孢杆菌属菌株1607 (NRRL编号B-67666)的所有鉴定特性的菌株及其组合。
21.权利要求20的组合物，其中所述组合物是液体。
22.权利要求20的组合物，其中所述组合物是干燥的。
23.权利要求22的组合物，其中所述组合物是冷冻干燥的、以粉末形式或以丸粒形式。
24.权利要求11的方法，其中所述真菌是芽枝状枝孢。
25.权利要求11的方法，其中所述真菌是盔形毕赤酵母。
26.权利要求11的方法，其中所述真菌是库德毕赤酵母。
27.权利要求11的方法，其中所述真菌是烟曲霉。
28.权利要求1的方法，其中所述细菌病由雷尔氏菌属(Ralstonia)的细菌引起。
29. 权利要求28的方法，其中所述细菌是青枯雷尔氏菌(Ralstonia solanacearum)。
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