CN112292388A - 用于合成elamipretide的结晶二肽 - Google Patents

用于合成elamipretide的结晶二肽 Download PDF

Info

Publication number
CN112292388A
CN112292388A CN201980037029.8A CN201980037029A CN112292388A CN 112292388 A CN112292388 A CN 112292388A CN 201980037029 A CN201980037029 A CN 201980037029A CN 112292388 A CN112292388 A CN 112292388A
Authority
CN
China
Prior art keywords
crystalline form
compound
crystalline
synthesis
values
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
CN201980037029.8A
Other languages
English (en)
Other versions
CN112292388B (zh
Inventor
S·M·邓肯
M·P·雷蒙
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Stealth Biotherapeutics Corp
Original Assignee
Stealth Biotherapeutics Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Stealth Biotherapeutics Corp filed Critical Stealth Biotherapeutics Corp
Publication of CN112292388A publication Critical patent/CN112292388A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN112292388B publication Critical patent/CN112292388B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/06Dipeptides
    • C07K5/06086Dipeptides with the first amino acid being basic
    • C07K5/06095Arg-amino acid
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/06Dipeptides
    • C07K5/06086Dipeptides with the first amino acid being basic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07CACYCLIC OR CARBOCYCLIC COMPOUNDS
    • C07C237/00Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups
    • C07C237/02Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton
    • C07C237/20Carboxylic acid amides, the carbon skeleton of the acid part being further substituted by amino groups having the carbon atoms of the carboxamide groups bound to acyclic carbon atoms of the carbon skeleton the carbon skeleton containing six-membered aromatic rings
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/04Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing only normal peptide links
    • C07K5/10Tetrapeptides
    • C07K5/1019Tetrapeptides with the first amino acid being basic
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07BGENERAL METHODS OF ORGANIC CHEMISTRY; APPARATUS THEREFOR
    • C07B2200/00Indexing scheme relating to specific properties of organic compounds
    • C07B2200/13Crystalline forms, e.g. polymorphs

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

公开了L‑Lys(Boc)‑Phe‑NH2和Boc‑D‑Arg‑DMT的晶形。

Description

用于合成elamipretide的结晶二肽
相关申请
本申请要求于2018年4月2日提交的美国临时专利申请号62/651,430的优先权权益。
发明背景
elamipretide (MTP-131)是一种线粒体靶向肽化合物,具有用于治疗与线粒体功能障碍相关的疾病的治疗潜力。elamipretide含有四个氨基酸残基,并已经根据典型的线性和会聚溶液相肽合成方法合成。迄今为止已经使用的生成elamipretide的合成路线需要制备各种受不同保护的肽,使得选择性地去除某些保护基团,以使脱保护的化合物经受肽偶联,而其它保护基团保留下来以防止不需要的副反应。即使使用保护基团,这样的偶联反应和相关步骤也会产生杂质。因此,需要开发新的方法来纯化elamipretide,所述方法允许在偶联反应后纯化。所需反应产物的结晶是实现必要纯化的一种方法。
发明概述
公开了作为elamipretide的合成中的中间体的L-Lys(Boc)-Phe-NH2和Boc-D-Arg-DMT的晶形,其中DMT是二甲基酪氨酸的缩写。
附图简述
图1是结晶L-Lys(Boc)-Phe-NH2的XRPD图。
图2是结晶Boc-D-Arg-DMT的XRPD图。
发明详述
elamipretide已经显示出在与线粒体功能障碍相关的疾病中具有各种治疗效果。由于依赖色谱分离来富集所需中间体的水平,先前的elamipretide合成路线在放大方面面临挑战。本文公开了可以在elamipretide的合成中用作纯化的中间体的L-Lys(Boc)-Phe-NH2和Boc-D-Arg-DMT的晶形。
本发明的一个方面涉及化合物(I)的晶形:
Figure 100002_DEST_PATH_IMAGE002
该化合物也称为L-Lys(Boc)-Phe-NH2
化合物(I)的晶形可以用于合成elamipretide。
在某些实施方案中,所述晶形的多晶型物由粉末X射线衍射(XRD)表征。θ表示以度为单位测量的衍射角。在某些实施方案中,XRD中使用的衍射仪测量作为衍射角θ的两倍的衍射角。因此,在某些实施方案中,本文所述的衍射图是指针对角度2θ测量的X射线强度。
在某些实施方案中,化合物(I)的晶形不是溶剂化的(例如,晶格不包含溶剂的分子)。在某些替代实施方案中,化合物(I)的晶形是溶剂化的。在一些情况下,溶剂是水。
在一方面,本发明的特征在于化合物(I)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中具有如图1中所示的特征峰。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(I)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如表1中所示的2θ值(°2θ)处具有特征峰。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(I)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:4.7、6.2、12.4、15.8、16.5、18.0、18.2、18.8和19.8。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(I)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:4.7、6.2、11.3、12.4、13.3、15.0、15.8、16.5、17.0、17.7、18.0、18.2、18.8、19.8、22.0和22.8。
表1以及图1中的每个峰的相对强度以及2θ值在某些条件下可以改变或移动,尽管晶形是相同的。本领域普通技术人员通过比较其XRPD数据,应当能够容易地确定给定的晶形是否与表1以及图1中所述的晶形相同。
本发明的一个方面涉及化合物(II)的晶形,
Figure 100002_DEST_PATH_IMAGE004
该化合物也称为Boc-D-Arg-DMT,并且也可以画成两性离子形式。
化合物(II)的晶形可以用于合成elamipretide。
在某些实施方案中,所述晶形的多晶型物由粉末X射线衍射(XRD)表征。θ表示以度为单位测量的衍射角。在某些实施方案中,XRD中使用的衍射仪测量作为衍射角θ的两倍的衍射角。因此,在某些实施方案中,本文所述的衍射图是指针对角度2θ测量的X射线强度。
在某些实施方案中,化合物(II)的晶形不是溶剂化的(例如,晶格不包含溶剂的分子)。在某些替代实施方案中,化合物(II)的晶形是溶剂化的。在一些情况下,溶剂是水。
在一方面,本发明的特征在于化合物(II)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中具有如图2中所示的特征峰。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(II)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如表2中所示的2θ值(°2θ)处具有特征峰。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(II)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:9.3、12.1、16.6、17.6、18.0、18.8和19.4。
在另一方面,本发明的特征在于化合物(II)的晶形,其在粉末X射线衍射(XRPD)图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:9.3、12.1、13.7、16.3、16.6、17.6、18.0、18.8、19.4、21.3、23.0、24.2和25.1。
表2以及图2中的每个峰的相对强度以及2θ值在某些条件下可以改变或移动,尽管晶形是相同的。本领域普通技术人员通过比较其XRPD数据,应当能够容易地确定给定的晶形是否与表1以及图1中所述的晶形相同。
实施例
材料和方法
Figure 100002_DEST_PATH_IMAGE006
实施例1. L-Lys(Boc)-Phe-NH2 (化合物I)
●示例性合成路线
Figure DEST_PATH_IMAGE008
化合物3的合成
Figure DEST_PATH_IMAGE010
Figure DEST_PATH_IMAGE012
化合物I的合成
Figure DEST_PATH_IMAGE014
Figure DEST_PATH_IMAGE016
●化合物I产物浆料的显微镜检查:
Figure DEST_PATH_IMAGE018
●化合物I的初步单溶剂溶解度:
Figure DEST_PATH_IMAGE020
●化合物I的初步沉淀研究(MeOH/水):
Figure DEST_PATH_IMAGE022
●化合物I的过程中沉淀结果(MeOH/水):
Figure DEST_PATH_IMAGE024
实施例2. Boc-D-Arg-DMT-OH
Figure DEST_PATH_IMAGE026
●生产化合物8的制造方法
Figure DEST_PATH_IMAGE028
●生产化合物II的HCl盐的制备方法
Figure DEST_PATH_IMAGE030
●化合物II的两性离子形式的制备
Figure DEST_PATH_IMAGE032
1. 将粗HCl盐悬浮于CH3OH/H2O (1/1,v/v)中。
2. 将悬浮液加热至45-50℃。
3. 在形成澄清溶液后,加入Na2CO3水溶液(1.2当量)。在加入期间,固体开始沉淀。
4. 将悬浮液在45℃下搅拌1小时,然后冷却至15℃并再搅拌一小时。
5. 通过过滤分离固体并干燥,以提供化合物II,通过HPLC测得具有高纯度(99.4面积%)。对于该示范运行,校正残余溶剂、水含量和点燃时的残余物,计算的w/w测定为98.7%。
两性离子化合物的形成导致稳定、易于处理和高度结晶的高纯度材料。
实施例3. 结晶L-Lys(Boc)-Phe-NH2——XRPD峰列表
Figure DEST_PATH_IMAGE034
Figure DEST_PATH_IMAGE036
实施例4. 结晶Boc-D-Arg-DMT——XRPD峰列表
Figure DEST_PATH_IMAGE038
Figure DEST_PATH_IMAGE040
参考引用
在以上描述中提及的所有美国专利和美国公开专利申请及PCT公开专利申请通过引用以其整体并入本文。
等同物
为了理解清楚的目的,目前已通过说明和实例已经详细地充分描述了本发明,对于本领域普通技术人员来说显而易见的是,在不影响本发明或其任何具体实施方案的范围的情况下,通过在条件、制剂和其它参数的范围内修改或改变本发明,可以完成同样的发明,并且这样的修改或改变旨在包括在所附权利要求的范围内。

Claims (8)

1.化合物(I)的晶形,
Figure DEST_PATH_IMAGE002
其中所述晶形在其XRPD图中在如表1中所述的2θ值处具有特征峰。
2.化合物(I)的晶形,
Figure DEST_PATH_IMAGE003
其中所述晶形在其XRPD图中在如图1中所述的2θ值处具有特征峰。
3.化合物(I)的晶形,
Figure DEST_PATH_IMAGE004
其中所述晶形在其XRPD图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:4.7、6.2、12.4、15.8、16.5、18.0、18.2、18.8和19.8。
4.权利要求3所述的晶形,其中所述晶形在其XRPD图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:4.7、6.2、11.3、12.4、13.3、15.0、15.8、16.5、17.0、17.7、18.0、18.2、18.8、19.8、22.0和22.8。
5.化合物(II)的晶形,
Figure DEST_PATH_IMAGE006
其中所述晶形在其XRPD图中在如表2中所述的2θ值处具有特征峰。
6.化合物(II)的晶形,
Figure DEST_PATH_IMAGE007
其中所述晶形在其XRPD图中在如图2中所述的2θ值处具有特征峰。
7.化合物(II)的晶形,
Figure 438091DEST_PATH_IMAGE006
其中所述晶形在其XRPD图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:9.3、12.1、16.6、17.6、18.0、18.8和19.4。
8.权利要求7所述的晶形,其中所述晶形在其XRPD图中在如下2θ值(°2θ)处具有特征峰:9.3、12.1、13.7、16.3、16.6、17.6、18.0、18.8、19.4、21.3、23.0、24.2和25.1。
CN201980037029.8A 2018-04-02 2019-03-28 用于合成elamipretide的结晶二肽 Active CN112292388B (zh)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201862651430P 2018-04-02 2018-04-02
US62/651430 2018-04-02
PCT/US2019/024617 WO2019195080A1 (en) 2018-04-02 2019-03-28 Crystalline dipeptides useful in the synthesis of elamipretide

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN112292388A true CN112292388A (zh) 2021-01-29
CN112292388B CN112292388B (zh) 2024-04-19

Family

ID=68101313

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201980037029.8A Active CN112292388B (zh) 2018-04-02 2019-03-28 用于合成elamipretide的结晶二肽

Country Status (13)

Country Link
US (3) US10975118B2 (zh)
EP (2) EP3774844B1 (zh)
JP (2) JP7350007B2 (zh)
KR (1) KR20210005042A (zh)
CN (1) CN112292388B (zh)
AU (1) AU2019249121B2 (zh)
CA (1) CA3095869A1 (zh)
DK (1) DK3774844T3 (zh)
ES (1) ES2941266T3 (zh)
FI (1) FI3774844T3 (zh)
IL (1) IL277718A (zh)
PT (1) PT3774844T (zh)
WO (1) WO2019195080A1 (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2017156403A1 (en) * 2016-03-11 2017-09-14 Stealth Biotherapeutics Crystalline salt forms
WO2019195080A1 (en) 2018-04-02 2019-10-10 Stealth Biotherapeutics Corp. Crystalline dipeptides useful in the synthesis of elamipretide

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006049480A (ja) * 2004-08-03 2006-02-16 Advanced Lcd Technologies Development Center Co Ltd 結晶化装置、結晶化方法、および位相変調素子
CN104945453A (zh) * 2014-03-28 2015-09-30 苏州汉德景曦新药研发有限公司 吡唑衍生物的多晶型物
CN105188701A (zh) * 2012-12-12 2015-12-23 阿里亚德医药股份有限公司 3-(咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基乙炔基)-4-甲基-n{4-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-3-(三氟甲基)苯基}苯甲酰胺和它的单盐酸盐的晶形
WO2016192680A1 (en) * 2015-06-03 2016-12-08 Triastek, Inc. Dosage forms and use thereof
WO2018034901A1 (en) * 2016-08-16 2018-02-22 Stealth Biotherapeutics N-carboxyanhydride-based-scale synthesis of elamipretide

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL3160985T3 (pl) 2014-06-30 2021-12-27 Flamma S.P.A. Sposób wytwarzania d-arginylo-2,6-dimetylo-l-tyrozylo-l-lizylo-l-fenyloalaninoamidu
US10633415B2 (en) * 2015-03-06 2020-04-28 Stealth Biotherapeutics Corp Processes for preparing pharmaceutically relevant peptides
WO2017156403A1 (en) 2016-03-11 2017-09-14 Stealth Biotherapeutics Crystalline salt forms
WO2018187400A1 (en) * 2017-04-05 2018-10-11 Stealth Biotherapeutics Corp. Crystalline salt forms of boc-d-arg-dmt-lys-(boc)-phe-nh2
WO2019195080A1 (en) 2018-04-02 2019-10-10 Stealth Biotherapeutics Corp. Crystalline dipeptides useful in the synthesis of elamipretide

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006049480A (ja) * 2004-08-03 2006-02-16 Advanced Lcd Technologies Development Center Co Ltd 結晶化装置、結晶化方法、および位相変調素子
CN105188701A (zh) * 2012-12-12 2015-12-23 阿里亚德医药股份有限公司 3-(咪唑并[1,2-b]哒嗪-3-基乙炔基)-4-甲基-n{4-[(4-甲基哌嗪-1-基)甲基]-3-(三氟甲基)苯基}苯甲酰胺和它的单盐酸盐的晶形
CN104945453A (zh) * 2014-03-28 2015-09-30 苏州汉德景曦新药研发有限公司 吡唑衍生物的多晶型物
WO2016192680A1 (en) * 2015-06-03 2016-12-08 Triastek, Inc. Dosage forms and use thereof
WO2018034901A1 (en) * 2016-08-16 2018-02-22 Stealth Biotherapeutics N-carboxyanhydride-based-scale synthesis of elamipretide

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
H GREGORY ET AL: "Org. 715 Polypeptides. Part VII1.1 Variations of the Aspartyl Position in the C-Terminal Tetrapeptide Amide Sequence of the Gastrins", INFORM. BUI 1. CHEM. SOC *
陈珍;陆丹丹;秦亚娟;厉廷有;: "线粒体靶向抗氧化剂SS-31(H-D-Arg-Dmt-Lys-Phe-NH_2)的发现及其研究进展", 中国新药杂志, no. 12 *

Also Published As

Publication number Publication date
EP4219523A3 (en) 2023-08-09
US20230203093A1 (en) 2023-06-29
EP3774844A4 (en) 2021-12-15
PT3774844T (pt) 2023-03-28
WO2019195080A1 (en) 2019-10-10
KR20210005042A (ko) 2021-01-13
EP3774844A1 (en) 2021-02-17
ES2941266T3 (es) 2023-05-19
JP2023165756A (ja) 2023-11-17
US20210292274A1 (en) 2021-09-23
EP3774844B1 (en) 2023-02-22
DK3774844T3 (da) 2023-04-03
EP4219523A2 (en) 2023-08-02
JP2021520357A (ja) 2021-08-19
CN112292388B (zh) 2024-04-19
CA3095869A1 (en) 2019-10-10
US11560404B2 (en) 2023-01-24
JP7350007B2 (ja) 2023-09-25
IL277718A (en) 2020-11-30
AU2019249121B2 (en) 2024-05-02
FI3774844T3 (fi) 2023-04-04
US20200283476A1 (en) 2020-09-10
AU2019249121A1 (en) 2020-11-26
US10975118B2 (en) 2021-04-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2023165756A (ja) エラミプレチドの合成に有用な結晶性ジペプチド
ES2578905T5 (es) Inhibidores de proteasa epoxi cetona peptídicos cristalinos y la síntesis de ceto-epóxidos de aminoácidos
AU2013380573B2 (en) A process for sodium salt of (2S, 5R)-2-carboxamido-7-oxo-6-sulfooxy -1,6-diaza-bicyclo[3.2.1]octane
CA2804262C (en) Process for preparation of optically active diamine derivative salt
AU2017340915B2 (en) Solid state forms of valbenazine
CA2700173A1 (en) Methods of synthesis of certain hydroxamic acid compounds
CN107922435B (zh) 由7-氨基头孢烷酸(7-aca)制备头孢洛扎的方法
CA2615032C (en) Amide forming chemical ligation
DK154653B (da) Fremgangsmaade til fremstilling af pentapeptidet h-arg-x-z-y-tyr-r ved oploesningssyntese
JP2022537732A (ja) オラパリブの新規結晶形及び調製方法
WO2015198505A1 (ja) 合成ペンタペプチドの製造法
Obrecht et al. Novel open‐chain and cyclic conformationally constrained (R)‐and (S)‐α, α‐disubstituted tyrosine analogues
JP7392031B2 (ja) ペプチドエポキシケトン免疫プロテアソーム阻害剤、およびその前駆体の調製プロセス
IT201800003284A1 (it) Forme cristalline di venetoclax
JP2004203822A (ja) テアニンを製造するための新規な中間体
JP2006083155A (ja) テアニンの製造方法
JPWO2012108408A1 (ja) ジペプチド及びトリペプチドの製造方法
JP5346026B2 (ja) 抗ガン剤として治療への応用に有効な、エピポドフィロトキシンの(ポリ)アミノアルキルアミノアセトアミド誘導体の調製方法
WO2006104190A1 (ja) Par-2アゴニスト
JP2008184466A (ja) アセチルチオピロリジン誘導体の製法
JP2002284796A (ja) リジノプリル2水和物の製造方法
WO2009082344A1 (en) Novel process for making (2r)-(3-amino-2-fluoropropyl)phosphinic acid form a
JP2013189381A (ja) ブリンゾラミドの製造方法
JP2008120830A (ja) アセチルチオピロリジン誘導体の製法

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
REG Reference to a national code

Ref country code: HK

Ref legal event code: DE

Ref document number: 40046563

Country of ref document: HK

TA01 Transfer of patent application right
TA01 Transfer of patent application right

Effective date of registration: 20220126

Address after: Massachusetts

Applicant after: STEALTH BIOTHERAPEUTICS

Address before: Monaco city of Monaco

Applicant before: STEALTH BIOTHERAPEUTICS

GR01 Patent grant
GR01 Patent grant