CN111892574A - 一类非典型角环素类化合物及其制备方法和应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一类非典型角环素类化合物及其制备方法和应用。本发明从菌株M.echinospora SCSIO 04089中分离出具有抗菌或抗肿瘤活性的非典型角环素类化合物‑化合物1‑7(式1)，因此可以将这些化合物用于制备抗菌药物和抗肿瘤药物。
Figure DDA0002498628200000011

Description

一类非典型角环素类化合物及其制备方法和应用
技术领域：
本发明属于工业微生物领域，具体涉及一类非典型角环素类化合物及其制备方法和应用。
背景技术：
已报道的有kinamycins、jadomycins、fluostatins和lomaiviticin等，具有良好的抗肿瘤和抗细菌活性。
发明内容：
本发明的第一个目的是提供具有抑菌和抗肿瘤活性的非典型角环素类化合物。
本发明的非典型角环素类化合物，其为式(I)中的任一化合物：
Figure BDA0002498628180000011
具体是：Gephysulfuromycin(1)、homo-phenanthroviridin aglycone(2)、homo-benzo[b]phenanthridone(3)、homo-stealthin D(4)、furannenestatin(5)、1-acetyl-2-ethylchrysophanol(6)和WS-5995D(7)。
本发明的第二个目的是提供上述化合物在制备抗菌药物中的应用。
一种抗菌药物，含有上述非典型角环素类化合物作为有效成分。
所述的抗菌药物是抗Staphylococcus aureus、Bacillus thuringiensis、Bacillus subtilis、Micrococcus luteus和/或MRSA的药物。
本发明的第三个目的是提供上述非典型角环素类化合物在制备抗肿瘤药物中的应用。
一种抗肿瘤药物，其含有上述非典型角环素类化合物作为活性成分。
所述的抗肿瘤药物是抗神经癌、肝癌和/或乳腺癌的药物。
本发明的第四个目的是提供一种上述非典型角环素类化合物的制备方法，其是从M.echinospora SCSIO 04089的发酵培养物中分离得到的。
所述的M.echinospora SCSIO 04089的发酵培养物是以N4培养基作为M.echinospora SCSIO 04089的发酵培养基经发酵而获得，所述的N4培养基为每升含有可溶性淀粉15g，鱼蛋白胨8g，细菌学蛋白胨5g，甘油7.5g，CaCO32g，KBr 0.2g，海盐30g，HP20大孔树脂50g，水为溶剂，pH7.0。
优选，具体制备方法为：
将菌株M.echinospora SCSIO 04089用N4培养基进行发酵培养，7d后分别收集大孔树脂和菌丝体，大孔树脂用丙酮洗脱；菌丝体用甲醇浸提并超声破碎，回收有机溶剂后，将两者剩余的水相用乙酸乙酯萃取，回收乙酸乙酯后得到粗提物；
将粗提物经正相硅胶柱层析分离，用氯仿/甲醇作为洗脱剂进行梯度洗脱，从100/0、99/1、49/1、24/1、12/1、6/1、2/1和0/100，v/v，梯度洗脱，将氯仿/甲醇100/0v/v洗脱得到的馏份Fr1用凝胶柱层析进行分离，洗脱馏份经纯化得到化合物1-7。
菌株M.echinospora SCSIO 04089在制备化合物1、2、3、4、5、6或7中的应用。
本发明从菌株M.echinospora SCSIO 04089中分离出具有抗菌或抗肿瘤活性的非典型角环素类化合物-化合物1-7，因此可以将这些化合物用于制备抗菌药物和抗肿瘤药物。
本发明的Micromonospora echinospora SCSIO 04089公开于文献：海洋来源小单孢菌SCSIO 04089聚酮化合物nenestatin A生物合成中调控与后修饰基因功能研究，作者：蒋晓东，硕士论文，中国科学院南海海洋研究所，2017年。该菌株本申请人也持有，并保证自申请日起20年内向公众提供。
附图说明：
图1是化合物1的HRESIMS谱图；图2是化合物1的1H-NMR谱图；图3是化合物1的13C-NMR谱图；图4是化合物1的DEPT135谱图；图5是化合物1的COSY谱图；图6是化合物1的HSQC谱图；图7是化合物1的HMBC谱图；图8是化合物1的NOESY谱图；图9是化合物2的HRESIMS谱图；图10是化合物2的1H-NMR谱图；图11是化合物2的13C-NMR谱图；图12是化合物2的DEPT135谱图；图13是化合物2的COSY谱图；图14是化合物2的HSQC谱图；图15是化合物2的HMBC谱图；
图16是化合物3的HRESIMS谱图；图17是化合物3的1H-NMR谱图；图18是化合物3的13C-NMR谱图；图19是化合物3的DEPT135谱图；图20是化合物3的COSY谱图；图21是化合物3的HSQC谱图；图22是化合物3的HMBC谱图；
图23是化合物4的HRESIMS谱图；图24是化合物4的1H-NMR谱图；图25是化合物4的13C-NMR谱图；图26是化合物4的DEPT135谱图；图27是化合物4的COSY谱图；图28是化合物4的HSQC谱图；图29是化合物4的HMBC谱图；图30是化合物4的手性分析HPLC谱图；
图31是化合物5的HRESIMS谱图；图32是化合物5的1H-NMR谱图；图33是化合物5的13C-NMR谱图；图34是化合物5的DEPT135谱图；图35是化合物5的COSY谱图；图36是化合物5的HSQC谱图；图37是化合物5的HMBC谱图；
图38是化合物6的HRESIMS谱图；图39是化合物6的1H-NMR谱图；图40是化合物6的13C-NMR谱图；图41是化合物6的DEPT135谱图；图42是化合物6的COSY谱图；图43是化合物6的HSQC谱图；图44是化合物6的HMBC谱图；
图45是化合物7的HRESIMS谱图；图46是化合物7的1H-NMR谱图；图47是化合物7的13C-NMR谱图；图48是化合物7的DEPT135谱图；图49是化合物7的COSY谱图；图50是化合物7的HSQC谱图；图51是化合物7的HMBC谱图。
具体实施方式：
以下实施例是对本发明的进一步说明，而不是对本发明的限制。
野生型菌株M.echinospora SCSIO 04089在N4培养基中除产生已知化合物homo-dehydrorabelomycin E、homorabelomycin和homoseongomycin外，还产生了新化合物1-7，经HRESIMS和NMR数据分析，确认了7个新化合物Gephysulfuromycin(1)(图1-8)，homo-phenanthroviridin aglycone(2)(图9-15)，homo-benzo[b]phenanthridone(3)(图16-22)，homo-stealthin D(4)(图23-30)，furannenestatin(5)(图31-37)，1-acetyl-2-ethylchrysophanol(6)(图38-44)和WS-5995D(7)(图45-51)的结构。
以下进一步提供实施实例，这些实施实例有助于理解本发明，仅用作说明而不是对本发明的限制。
实施例1：非典型角环素类化合物的发酵和制备
1.放大发酵培养
将菌株M.echinospora SCSIO 04089在ATCC172培养基固体平板上活化后，刮取适量菌丝体接种到50mLA1培养基中，28℃摇床200rpm培养3d后得到种子液；将种子液以体积分数5％的接种量接入200mLN4发酵培养基(共30L)中，28℃摇床200rpm培养7d后得到发酵培养物。
ATCC172培养基：可溶性淀粉20g，葡萄糖10g，酵母提取粉5g，干酪素5g，碳酸钙19g，海盐10g，加纯净水至1L，pH7.0。灭菌制得。
A1培养基：可溶性淀粉10g，酵母提取粉4g，细菌学蛋白胨2g，海盐10g，加纯净水至1L，pH7.0。灭菌制得。
N4培养基：可溶性淀粉15g，鱼蛋白胨8g，细菌学蛋白胨5g，甘油7.5g，CaCO32g，KBr0.2g，海盐30g，HP20大孔树脂5％(质量分数，即50g)，加纯净水至1L，pH7.0。灭菌制得。
2.发酵液的萃取
经7d发酵培养后的发酵培养物，用分液漏斗分别收集HP20大孔树脂和发酵液。发酵液3900rpm离心20min后，收集菌丝体，然后大孔树脂用15L丙酮洗脱；菌丝体用1L甲醇浸提3次，每次超声破碎细胞0.5h。然后用旋转蒸发仪回收两部分中的有机溶剂，剩余的水相合并后用1L乙酸乙酯萃取10次，旋转蒸发仪回收乙酸乙酯萃取物中的乙酸乙酯后得到粗提物。
3.化合物的分离
将上述野生型菌株M.echinospora SCSIO 04089的N4培养基的粗提物20g用氯仿甲醇(1:1，v/v)溶解，加入40mL 100-200目硅胶拌样，以拌样硅胶(40mL)/分离硅胶(120mL)1:3干法装柱，用氯仿/甲醇作为洗脱剂进行梯度洗脱(100/0、99/1、49/1、24/1、12/1、6/1、2/1和0/100，v/v，每个600mL)，依次得到馏份Fr1-Fr8。将馏份Fr1(氯仿/甲醇100/0v/v洗脱的馏分)用Sephadex LH-20凝胶柱层析(120cm×3cm，氯仿/甲醇1:1)进行分离，每10mL接收一瓶，根据TLC检测结果将馏份合并得到馏份Fr1-1到Fr1-4。将馏份Fr1-3(第13-25瓶，1.0g)再次用2mL 100-200目硅胶拌样，以拌样硅胶(2mL)/分离硅胶(20mL)1:10干法装柱，用石油醚/乙酸乙酯作为洗脱剂进行梯度洗脱(100/0、9/1、4/1、2/1和0/100，v/v，每个100mL)，依次得到馏份Fr1-3-1到Fr1-3-5。将馏份Fr1-3-3(石油醚/乙酸乙酯4/1v/v洗脱的馏分)采用半制备高效液相色谱(Phenomenex Luna C18，250mm×10.0mm，5μm；A相为水，B相为乙腈，体积分数60％的B相等度洗脱；流速为2.5mL/min；检测波长为280nm)纯化得到化合物homo-phenanthroviridin aglycone(2)(Rt＝18.0min)和homo-benzo[b]phenanthridone(3)(Rt＝20.0min)。将馏份Fr1-3-4(石油醚/乙酸乙酯2/1v/v洗脱的馏分)采用半制备高效液相色谱(Phenomenex Luna C18，250mm×10.0mm，5μm；A相为水，B相为乙腈，体积分数55％的B相等度洗脱；流速为2.5mL/min；检测波长为280nm)纯化得到化合物Gephysulfuromycin(1)(Rt＝15.0min)、homo-stealthin D(4)(Rt＝17.0min)和WS-5995D(7)(Rt＝21.0min)。
将馏份Fr1-2(第8-12瓶，200mg)采用半制备高效液相色谱(Phenomenex LunaC18，250mm×10.0mm，5μm；A相为水，B相为乙腈，体积分数60％的B相等度洗脱；流速为2.5mL/min；检测波长为280nm)纯化得到化合物furannenestatin(5)(Rt＝18.0min)和1-acetyl-2-ethylchrysophanol(6)(Rt＝21.0min)。
4.化合物的结构鉴定
化合物1-7的结构根据HRESIMS、1H-NMR、13C-NMR、DEPT135、HSQC、HMBC和COSY谱图进行鉴定，其核磁数据归属见表1和2。化合物Gephysulfuromycin(1)的谱图见图1-8，homo-phenanthroviridin aglycone(2)的谱图见图9-15，homo-benzo[b]phenanthridone(3)的谱图见图16-22，homo-stealthin D(4)的谱图见图23-30，furannenestatin(5)的谱图见图31-37，1-acetyl-2-ethylchrysophanol(6)的谱图见图38-44和WS-5995D(7)的谱图见图45-51。
由此确定化合物1-7的结构式如下所示：
Figure BDA0002498628180000051
表1化合物1-3的1H-NMR(700MHz)和13C-NMR(175MHz)核磁数据
Figure BDA0002498628180000052
Figure BDA0002498628180000061
a700MHz for 1H,175MHz for 13C,(CD3)2CO,tetramethylsilane(TMS)as aninternal standard；
b700MHz for 1H,175MHz for 13C,CDCl3,tetramethylsilane(TMS)as aninternal standard.
表2化合物4-7的1H-NMR(700MHz)和13C-NMR(175MHz)核磁数据
Figure BDA0002498628180000062
Figure BDA0002498628180000071
a700MHz for 1H,175MHz for 13C,(CD3)2CO,tetramethylsilane(TMS)as aninternal standard；
b700MHz for 1H,175MHz for13C,CDCl3,tetramethylsilane(TMS)as an internalstandard；
c700MHz for 1H,175MHz for13C,D2O,tetramethylsilane(TMS)as an internalstandard.
实施例2:化合物1-7的抗菌活性的测定
采用微量肉汤培养基稀释法测定了化合物1-7对5种指示菌StaphylococcusaureusATCC 29213、Bacillus thuringiensis SCSIO BT01、Bacillus subtilis SCSIOBS01、Micrococcus luteus SCSIO ML01和MRSAshhs-A1(临床样品)的抑制活性。将化合物1-7或阳性药物以DMSO为溶剂配成终浓度为1.28mg/mL的母液，-20℃保藏备用。在96孔板上第1列的每孔加入无菌Mueller-Hinton(MH)肉汤液体培养基200μL，第2列的每孔加入MH液体培养基100μL，第3列加入90μLMH液体培养基，第4列加入190μL MH液体培养基，其余每列加入MH液体培养基100μL。然后在第3列和第4列中分别加入化合物1-7或阳性药物10μL，混合均匀(用移液枪吹打充分混匀)，再从第4列吸取100μL液体到第5列，混合混匀，同理依次往下2倍稀释到第12列，最后1列取100μL弃去。5种指示菌经摇床37℃，200rpm培养16h，用无菌MH培养基稀释到OD值(600nm)为0.04-0.06，再稀释10倍加入到96孔板中，除第1列以外每孔加入稀释菌液100μL，使样品终浓度分别为64、32、16、8、4、2、1、0.5、0.25、0.125μg mL-1，每个浓度3个平行；最终第1列为空白培养基对照，第2列为菌液生长对照(即阴性对照)，第3～12列为样品测试列，37℃培养18h，用酶标仪测定各孔的吸收OD值，并计算各化合物的最小抑菌浓度(MIC)，抑制率(％)＝(实验值-空白对照)/阴性对照-空白对照)×100％，抑制率>80％为MIC值。其结果见表3。
表3.化合物1-7的抗菌活性(MIC，μgmL-1)
Figure BDA0002498628180000081
实施例3:化合物1-5的抗肿瘤活性的测定
采用SRB法测定了化合物1-5对3种肿瘤细胞株SF-268，MCF-7和HepG2的抑制活性。3种肿瘤细胞株采用RPMI培养基培养，将180μL培养物(浓度为3×104个细胞每mL)加入到96孔板中，37℃，5％CO2培养18h；将20μL的待测样品(终浓度为1、10和100μM，溶剂为DMSO)加入到96孔板相应的孔中，用DMSO作为阴性对照，每个浓度做3个平行，继续培养72小时；加入50％的三氯乙酸50μL混合，再加入0.4％的SRB(溶解在1％的乙酸中)放置30分钟；去除上清，将与染料结合的蛋白溶解200μL10mM的Tris缓冲液中，用酶标仪测定各孔的OD值(570nm)，并计算相应的抑制率；以顺铂作为阳性对照。采用SigmaPlot 14.0软件中非线性曲线拟合(non-linear curve-fitting)的方法计算相应的IC50，其结果见表4。
表4.化合物1-5的细胞毒活性
Figure BDA0002498628180000082

Claims (10)

1.如式(I)中的任一非典型角环素类化合物：
Figure FDA0002498628170000011
2.权利要求1中的任一非典型角环素类化合物在制备抗菌药物中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述的抗菌药物是抗Staphylococcusaureus、Bacillus thuringiensis、Bacillus subtilis、Micrococcus luteus和/或MRSA的药物。
4.一种抗菌药物，其特征在于，含有权利要求1所述的任一非典型角环素类化合物作为有效成分。
5.权利要求1中的化合物1、2、3、4或5在制备抗肿瘤药物中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述的抗肿瘤药物是抗神经癌、肝癌和/或乳腺癌的药物。
7.一种抗肿瘤药物，其特征在于，其含有权利要求1中的化合物1、2、3、4或5作为活性成分。
8.一种权利要求1所述的非典型角环素类化合物的制备方法，其特征在于，是从M.echinospora SCSIO 04089的发酵培养物中分离得到的。
9.根据权利要求8所述的制备方法，其特征在于，将菌株M.echinospora SCSIO 04089用N4培养基进行发酵培养，7d后分别收集大孔树脂和菌丝体，大孔树脂用丙酮洗脱；菌丝体用甲醇浸提并超声破碎，回收有机溶剂后，将两者剩余的水相用乙酸乙酯萃取，回收乙酸乙酯后得到粗提物；
将粗提物经正相硅胶柱层析分离，用氯仿/甲醇作为洗脱剂进行梯度洗脱，从100/0、99/1、49/1、24/1、12/1、6/1、2/1和0/100，v/v，梯度洗脱，将氯仿/甲醇100/0v/v洗脱得到的馏份Fr1用凝胶柱层析进行分离，洗脱馏份经纯化得到化合物1-7；
所述的N4培养基为每升含有可溶性淀粉15g，鱼蛋白胨8g，细菌学蛋白胨5g，甘油7.5g，CaCO32 g，KBr 0.2g，海盐30g，HP20大孔树脂50g，水为溶剂，pH7.0。
10.菌株M.echinospora SCSIO 04089在制备权利要求1中所述的任一非典型角环素类化合物的应用。
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