CN111826378A

CN111826378A - 一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用

Info

Publication number: CN111826378A
Application number: CN202010781480.5A
Authority: CN
Inventors: 李斌; 任盛
Original assignee: Wuhan Niufusi Biological Technology Co ltd
Current assignee: Wuhan Niufusi Biological Technology Co ltd
Priority date: 2020-08-05
Filing date: 2020-08-05
Publication date: 2020-10-27
Anticipated expiration: 2040-08-05
Also published as: CN111826378B

Abstract

本发明涉及生物医药基因治疗技术领域，公开了一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用。本发明所述核苷酸序列与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥95％相同性。本发明证实使用AAV‑MERTK药物处理可以显著改善MERTK突变导致视网膜色素变性的大鼠的视网膜病理症状，以及视网膜功能的恢复。玻璃体腔注射AAV‑MERTK药物，MERTK可以在视网膜色素上皮层高效表达，并且增加视网膜外核层厚度。同时，视网膜电位图显示，和对照组相比，AAV‑MERTK药物处理组大鼠对刺激反应强烈。因此此AAV‑MERTK药物具有预防或治疗视网膜色素变性的作用。

Description

一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用

技术领域

本发明涉及生物医药基因治疗技术领域，更具体的说是涉及一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用。

背景技术

MERTK编码受体酪氨酸激酶Mer，受体酪氨酸激酶通常情况下通过与几种配体(包括LGALS3、TUB、TULP1或GAS6)结合，将细胞外基质的信号转导到细胞质中。通过以上方式，受体酪氨酸激酶能够调节许多生理过程，包括细胞存活、迁移、分化和凋亡细胞的吞噬(效应细胞)。而在视网膜色素上皮细胞中，MERTK的功能是介导其吞噬视细胞外节段脱落碎片，维持视锥视杆细胞正常代谢更新。

MERTK突变会引起视网膜色素变性38(RP38)，由于MERTK突变导致蛋白失去功能，RPE细胞无法正常吞噬视细胞外节段碎片，内区段与外区段之间存在大量碎片堆积；同时视网膜血管会出现密度与结构异常，具体表现为脱细胞毛细血管的数量增多，Müller细胞纤维通过视网膜延伸到视网膜下间隙。患者在眼底检查时可见视网膜色素沉积，初期表现为视杆细胞丢失，随后是视锥细胞丢失。患者通常有夜视盲和中周边视野丧失。随着病情的发展，远周边视野丧失，最终中央视力丢失。

天然存在的AAV血清型通常无法在玻璃体腔一侧转导视网膜组织细胞，因为存在内限膜、神经胶质细胞等阻止AAV病毒粒子扩散的屏障。通过构建AAV2衣壳蛋白编码序列文库，在loop4的位置插入随机7氨基酸序列，将突变的血清型注入小鼠玻璃体腔进行筛选，富集到一种主要的突变亚型，称为AAV2/2-7M8，即AAV2～588LALGETTRP。AAV2/2-7M8血清型具有很强的视网膜组织趋性，该血清型包装的荧光报告蛋白通过玻璃体腔注射小鼠眼部，能够在整个视网膜中检测到荧光。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列，使得所述核苷酸序列经过密码子使用偏好、DNA重复序列、mRNA二级结构、GC含量等多个参数的优化，可以使MERTK表达效率更高；

本发明的另外一个目的在于提供承载上述核苷酸序列的病毒载体，并具备预防或治疗MERTK突变导致视网膜色素变性的作用；

本发明的另外一个目的在于提供包含上述病毒载体或核苷酸序列的药物制剂，并具备预防或治疗MERTK突变导致视网膜色素变性的作用；；

本发明的另外一个目的在于提供上述核苷酸序列、病毒载体以及药物制剂在预防或治疗MERTK突变导致视网膜色素变性领域的中相关应用，包括但不限于相关药品、试剂的制备以及预防或治疗方法中的应用；

本发明的另外一个目的在于提供上述药物制剂的递送方法，将所述药物制剂注射至眼部如视网膜下或玻璃体腔注射。

为实现上述发明目的，本发明提供如下技术方案：

一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列，其与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥95％相同性。

作为优选，其与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥98％相同性；进一步优选地，其与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥99％相同性；在本发明具体实施方式中，其序列如SEQID NO:3所示。

作为优选，所述核苷酸序列为cDNA序列。

同时，本发明还提供了一种病毒载体，其包含有本发明所述核苷酸序列。

作为优选，所述病毒载体为腺相关病毒载体；在本发明具体实施方式中，所述腺相关病毒载体的血清型为AAV2野生型或AAV2-7M8。

更具体地，所述病毒载体由启动子hRPE 65(序列如SEQ ID NO:4所示)调控MERTK蛋白的表达。

此外，本发明还提供一种药物制剂，包含本发明所述的核苷酸序列或本发明所述的病毒载体。

作为优选，所述药物制剂为液体制剂；所述药物制剂还可以包括药学上可接受的载体或赋形剂。

本发明对MERTK cDNA序列进行密码子优化(codon optimization)得到coMERTK，对优化前后的序列wtMERTK/coMERTK进行细胞水平表达效率检测，发现优化后的序列表达效率显著提高。然后使用AAV2/2-7M8-coMERTK药物感染视网膜色素上皮细胞系APRE-19，MERTK蛋白可有效表达。对MERTK突变的大鼠进行玻璃体腔注射AAV2/2-7M8-MERTK，可在大鼠的视网膜色素上皮细胞检测到MERTK表达。6个月后检测大鼠视网膜外核层(ONL)厚度，发现和对照AAV处理相比，AAV2/2-7M8-MERTK处理的大鼠视网膜外核层厚度显著增加，同时视网膜电位图结果显示大鼠对刺激反应强烈。AAV2/2-7M8-MERTK处理的大鼠视网膜结构和功能均有显著的恢复，证明AAV2/2-7M8-MERTK药物具有预防或治疗视网膜色素变性的作用。

基于上述各项优异的技术效果，本发明提出了如下相关应用：

本发明所述核苷酸序列在制备预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病的病毒载体或药物制剂中的应用，或在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用；

本发明所述病毒载体在制备预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病的药物制剂中的应用，或在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用；

本发明所述的药物制剂在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用。

其中，所述MERTK突变导致的眼部疾病为MERTK突变导致视网膜色素变性。

本发明还对应提供了一种本发明所述药物制剂的递送方法，将所述药物制剂注射至眼部，比如视网膜下或玻璃体腔注射。

由以上技术方案可知，本发明证实使用AAV-MERTK药物处理可以显著改善MERTK突变导致视网膜色素变性的大鼠的视网膜病理症状的改善，以及视网膜功能的恢复。玻璃体腔注射AAV-MERTK药物，MERTK可以在视网膜色素上皮层高效表达，并且增加视网膜外核层厚度。同时，视网膜电位图显示，和对照组相比，AAV-MERTK药物处理组大鼠对刺激反应强烈。因此此AAV-MERTK药物具有预防或治疗视网膜色素变性的作用。

附图说明

图1-图3所示为wtMERTK和coMERTK序列比对；优化后差异性的密码子序列加粗并用下划线标注；

图4所示为AAV-coMERTK载体图谱(A)和AAV-wtMERTK载体图谱(B)；载体包含AAV25’ITR，hRPE65启动子，密码子优化后的MERTK cDNA或野生型MERTK cDNA，bGH polyA序列和AAV2 3’ITR；

图5所示为AAV-coMERTK和AAV-wtMERTK质粒在ARPE-19细胞中的表达效率；

A：在ARPE-19细胞中分别转染AAV-coMERTK和AAV-wtMERTK质粒，48小时后裂解细胞，Western blot检测MERTK蛋白表达水平；

B：AAV-coMERTK和AAV-wtMERTK质粒转染ARPE-19细胞表达MERTK蛋白相对丰度；

图6所示为AAV2/2-7M8-coMERTK病毒可高效感染APRE-19细胞；

将不同血清型的蛋白外壳包装的AAV-coMERTK病毒分别感染ARPE-19细胞(MOI＝10⁴)，48小时后裂解细胞，利用qPCR测定不同血清型感染的细胞和未感染的细胞中MERTKmRNA的含量；

图7所示为AAV2/2-7M8-coMERTK病毒玻璃体腔注射后，视网膜MERTK基因表达检测；

将AAV2/2-7M8-coMERTK病毒对RCS大鼠(MERTK缺陷型大鼠)进行玻璃体腔注射，注射6个月后取大鼠视网膜利用Western Blot对治疗眼(AAV-coMERTK)和未治疗眼(AAV-GFP)进行MERTK蛋白表达检测；

图8所示为AAV2/2-7M8-coMERTK病毒处理后，RCS大鼠及野生型大鼠视网膜外核层厚度检测；

注射后6个月取RCS大鼠以及野生型大鼠的药物注射眼和对照眼视网膜，进行免疫荧光染色，对距离视神经头不同距离的上段与下段外核层厚度进行定量分析；

图9所示为AAV2/2-7M8-coMERTK病毒处理后，大鼠视网膜电位图检测；

注射后6个月RCS大鼠的药物注射眼和对照眼以及野生型大鼠视网膜电图分析，在光照条件下和黑暗条件下给予特定强度的光刺激，记录光刺激下各大鼠(n＝10)药物注射眼和对照眼的b波振幅。

具体实施方式

本发明公开了一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用，本领域技术人员可以借鉴本文内容，适当改进工艺参数实现。特别需要指出的是，所有类似的替换和改动对本领域技术人员来说是显而易见的，它们都被视为包括在本发明。本发明所述核苷酸序列及其应用已经通过较佳实施例进行了描述，相关人员明显能在不脱离本发明内容、精神和范围内对本文所述的核苷酸序列及其应用进行改动或适当变更与组合，来实现和应用本发明技术。

AAV-MERTK药物可以有效的在视网膜细胞表达MERTK，修复患者因为MERTK突变造成的视网膜疾病，MERTK的cDNA编码的蛋白序列参见SEQ ID NO:1所示。

本发明通过优化密码子使用偏好，DNA重复序列，mRNA二级结构，GC含量等多个参数，得到了和wtMERTK(序列如SEQ ID NO:2所示)序列显著不同的优化序列coMERTK(codonoptimized human MERTK cDNA，序列如SEQ ID NO:3所示)，优化序列和野生型序列对比如图1-图3所示。把wt/co MERTK序列构建到AAV载体，质粒图谱如图4所示，然后在ARPE-19细胞中转染相同量的质粒，并检测MERTK基因的表达，序列优化后的MERTK表达效率更高，证明密码子优化能够在不改变蛋白序列的情况下提高蛋白的表达水平，为细胞提供更多的正常功能的蛋白，从而更好地弥补基因突变造成的缺陷。

通过体外实验检验了密码子优化与AAV2/2-7M8血清型两种手段结合提高MERTK表达效率的作用，利用RCS大鼠模型(MERTK缺陷型)进行了体内实验，进一步证明AAV-MERTK基因治疗药物对MERTK突变引起的视网膜色素变性的治疗作用。通过玻璃体腔注射药物，6个月后观察药物治疗对大鼠眼部病变的改善情况。

下面结合实施例，进一步阐述本发明。

实施例1：密码子优化的MERTK载体构建和表达验证

(1)质粒载体构建

1.将AAV-hRPE65质粒骨架，coMERTK片段和wtMERTK片段分别同时用HindIII与XhoI双酶切，然后将酶切后的片段分别于骨架进行连接。

2.连接产物转化大肠杆菌，挑取单菌落进行酶切验证与测序验证。

(2)细胞转染

1.转染前一天，胰酶消化细胞并计数，细胞铺板，使其在转染日密度为90％。

2.对于每孔细胞，使用50μl无血清DMEM培养基稀释0.8μg-1.0μg DNA。

3.对于每孔细胞，使用50μl DMEM培养基稀释1μl-3μl LIPOFECTAMINE 2000试剂。LIPOFECTAMINE 2000稀释后，在5分钟内同稀释的DNA混合。

4.混合稀释的DNA和稀释的LIPOFECTAMINE 2000在室温保温20分钟。

5.直接将复合物加入到每孔中，摇动培养板，轻轻混匀。

6.在37℃，5％的CO ₂中保温24-48小时。

7.在细胞中加入复合物48小时后，裂解细胞。

(3)Western Blot

1.蛋白样品制备，按1:100的比例在裂解液中加入PMSF(按用量现配现用)。

2.使用强裂解液裂解细胞。

3.使用BCA法测定蛋白浓度。

4.电泳

a、根据所检测蛋白大小配制相应的分离胶(5ml/块)，待分离胶凝固。

b、配制5％的浓缩胶(2ml/块)，加满玻璃板，插入梳子。

c、将5μl预染蛋白质分子marker SDS-PAGE加入加样孔内，使用1x的SDS-PAGE蛋白上样缓冲液10μl上样到样品孔边上的空白加样孔内。

5.转膜

将转膜白夹子上面放上湿的垫层，垫层上面铺三张叠在一起的湿滤纸，滤纸上面依次放置湿pvdf膜、胶、滤纸、垫层、黑夹板，将装好的夹板放入装有转膜缓冲液的电泳槽，把转膜槽放置在冰浴中进行转膜。

6.封闭

转膜完毕后，漂洗1-2分钟，用滴管吸尽缓冲液，加入5％的脱脂奶粉，在侧摆摇床上缓慢摇动，室温封闭15-60min。加入TBS洗涤液洗涤5分钟。共洗涤3次。

7.一抗孵育

按照比例使用5％的脱脂奶粉/PBS+2％BSA稀释适量的一抗，4℃缓慢摇动孵育过夜或室温在侧摆摇床上缓慢摇动孵育2h。孵育后洗涤。

8.二抗孵育

加入稀释好的二抗，室温侧摆摇床上缓慢摇动孵育40min-1h。孵育后洗涤。

9.蛋白检测

使用ECL类试剂来检测蛋白，各取1ml混匀后，滴加在蛋白膜表面，避光孵育1-2min。用镊子将蛋白膜整齐的摆放在塑料纸上，放入凝胶成像仪上曝光。结果如图5A、图5B所示，序列优化后的MERTK表达效率更高。

实施例2：AAV2/2-7M8-MERTK高效感染ARPE-19细胞

将不同的蛋白外壳包装构成不同血清型的AAV-coMERTK病毒，其中包括AAV2/2-7M8，AAV2/5，AAV2/8和AAV2/9，将四种血清型病毒分别感染ARPE-19细胞(MOI＝10⁴)，未感染病毒的ARPE-19细胞作为对照。感染后48小时裂解细胞，利用qPCR方法测定不同血清型感染的细胞和未感染的细胞中MERTK mRNA的含量，具体实施方法如下：

(1)病毒包装、病毒感染ARPE-19细胞

1.聚合度90％以上的ARPE-19细胞按1：3比例传盘。

2.转质粒前1-2h左右，换成无血清培养基，用转染试剂将目的基因质粒和辅助质粒转入ARPE-19中。

3.质粒转染24h后，换新的无血清培养基

4.转染72h收毒。带着培养基，吹下细胞，离心；然后分别收获培养基上清与细胞沉淀。用PEG8000沉淀培养基上清中的病毒，沉淀过夜后收集病毒沉淀。

5.将病毒的混合液用碘克沙醇密度梯度离心进行纯化，然后用超滤管进行浓缩。

6.铺板：将对数生长期的ARPE-19细胞消化重悬后，按1*10⁵/mL密度接种于12孔板，生长过夜

7.感染：将70-80％铺满12孔板中的培养液吸除，换新鲜的培养液，同时加入PBS浓度梯度稀释的病毒液，混合均匀后即可放入孵箱培养。

(2)qPCR测定mRNA含量

1、总RNA抽提

1)取匀浆器，加入1ml的Trizol Reagent，置冰上预冷。

2)取100mg组织或细胞，加入到匀浆器中，充分研磨直至无可见组织块，13000g离心10min取上清。

3)加入250μl三氯甲烷，颠倒离心管15s，充分混匀，静置3min；4℃下13000g离心8min。

4)将上清转移到一新的离心管中，加入0.8倍体积的异丙醇，颠倒混匀；-20℃放置15min；4℃下13000g离心10min，管底的白色沉淀即为RNA。

5)吸除液体，加入75％乙醇1.5ml洗涤沉淀；4℃下13000g离心5min；将液体吸除干净，将离心管置于超净台上吹3min；加入20μl无RNA酶的水溶解RNA；55℃孵育5min。

2、反转录

1)取一PCR管，加入含2μg RNA的溶液；加入1μl oligo(dT)；用无核糖核酸酶的去离子水补足至12μl。

2)于PCR仪上70℃保温5min，迅速置冰上冷却；依次加入4μl5×buffer，2μl 10mMdNTPs，1μl RNA inhibitor和1μl反转录酶，用枪抽吸混匀；于PCR仪上42℃保温60min，结束后80℃保温5min灭活反转录酶。

3、定量PCR

1)取0.2ml PCR管，配制如下反应体系，每个反转录产物配制3管。2×qPCR Mix12.5μl；7.5μM基因引物2.0μl；反转录产物2.5μl；ddH₂O 8.0μl。

2)PCR扩增预变性95℃，10min循环(40次)95℃，15s→60℃，60s溶解曲线75℃→95℃，每20s升温1℃；

3)结果处理ΔΔCT法：A＝CT(目的基因，待测样本)-CT(内标基因，待测样本)；B＝CT(目的基因，对照样本)-CT(内标基因，对照样本)；K＝A-B；表达倍数＝2^-K。

结果如图6所示，AAV2/2-7M8血清型病毒感染细胞后MERTK的mRNA含量要显著高于其他血清型，说明AAV2/2-7M8血清型对ARPE-19细胞具有较强的趋性，能够促使携带的MERTK cDNA在ARPE-19细胞中高效表达。MERTK在视网膜中的表达主要位于视网膜色素表皮细胞(RPE)，利用ARPE-19这一细胞系的验证表明，AAV2/2-7M8血清型相对于其他血清型更适合用于治疗MERTK突变引起的视网膜色素变性。

实施例3：AAV-coMERTK基因治疗药物改善RCS大鼠眼部功能，修复视网膜结构

(1)病毒药物注射大鼠

1.准备好5*10¹²vg/ml的AAV-coMERTK药物和AAV-GFP。

2.将1ul/眼的AAV-coMERTK药物和AAV-GFP病毒通过玻璃体腔注射进入适龄大鼠眼内。

3.在大鼠6月龄时，处死大鼠，将大鼠视网膜组织分离出，染色检测视网膜视细胞数量以及目的蛋白含量。

(2)Western Blot

方法同前所述。注射6个月后取大鼠视网膜利用Western Blot对治疗眼(AAV-coMERTK)和未治疗眼(AAV-GFP)进行MERTK蛋白表达检测，结果如图7所示，药物注射眼中(AAV-coMERTK)能够检测到MERTK蛋白而对照眼中(AAV-GFP)检测不到MERTK的表达，说明药物注射能够正确传递药物到大鼠眼部组织。

(3)视网膜组织免疫荧光染色

1.取视网膜组织制片，用0.01M PBS冲洗5min×3次。

2.滴加10％正常山羊血清37℃封闭45min。

3.吸去多余液体，加入一抗(1：100)，放入湿盒中，37℃1h后置于4℃冰箱中过夜(保持在湿盒中)。

4.0.01M PBS冲洗5min×3次。

5.在黑暗条件下加入二抗(1：200)，37℃温育45min。

6.在黑暗条件下吸弃二抗(注：不再冲洗)，加入DAPI染液，室温作用20min。

7.在黑暗条件下0.01M PBS冲洗5min×6次。

8.在黑暗条件下用防荧光淬灭剂封片，荧光显微镜下观察。

接受药物注射的RCS大鼠的眼部组织被用来进行视网膜免疫染色分析，对外核层厚度的定量分析表明，治疗眼的外核层厚度明显大于对照眼(图8)，说明药物注射后治疗眼中表达的MERTK一定程度上恢复了视网膜色素上皮细胞的功能，使其能够正常吞噬视细胞脱落的外节段，从而阻止了视细胞的过度退化，相对于对照眼保留了更多的视细胞。

(4)视网膜电图分析

1.对大鼠进行麻醉和瞳孔扩张处理，同时向眼部滴入包含电极的2.5％羟丙甲纤维素液体，记录角膜电位反应。

2.暗适应条件下让大鼠适应黑暗过夜，用LED灯给予3log sc cd.s/m²强度的短暂闪光刺激，记录暗适应ERG。

3.光适应条件下，LED灯给予2log sc cd.s/m²强度的短暂闪光刺激，记录光适应ERG。

光照条件下和黑暗条件下，治疗眼的b波振幅在给予外界光刺激下均显著高于对照眼(图9)，这说明药物治疗对眼部功能起到了明显的改善作用。

综合以上各实施例结果，本发明证明了AAV-MERTK基因治疗药物对MERTK突变引起的视网膜色素变性的治疗作用，为进一步的临床应用开发奠定了基础。

以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。

序列表

<110> 武汉纽福斯生物科技有限公司

<120> 一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列及其应用

<130> MP2016754

<160> 4

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 999

<212> PRT

<213> 人的MERTK蛋白序列(human MERTK protein)

<400> 1

Met Gly Pro Ala Pro Leu Pro Leu Leu Leu Gly Leu Phe Leu Pro Ala

1 5 10 15

Leu Trp Arg Arg Ala Ile Thr Glu Ala Arg Glu Glu Ala Lys Pro Tyr

20 25 30

Pro Leu Phe Pro Gly Pro Phe Pro Gly Ser Leu Gln Thr Asp His Thr

35 40 45

Pro Leu Leu Ser Leu Pro His Ala Ser Gly Tyr Gln Pro Ala Leu Met

50 55 60

Phe Ser Pro Thr Gln Pro Gly Arg Pro His Thr Gly Asn Val Ala Ile

65 70 75 80

Pro Gln Val Thr Ser Val Glu Ser Lys Pro Leu Pro Pro Leu Ala Phe

85 90 95

Lys His Thr Val Gly His Ile Ile Leu Ser Glu His Lys Gly Val Lys

100 105 110

Phe Asn Cys Ser Ile Ser Val Pro Asn Ile Tyr Gln Asp Thr Thr Ile

115 120 125

Ser Trp Trp Lys Asp Gly Lys Glu Leu Leu Gly Ala His His Ala Ile

130 135 140

Thr Gln Phe Tyr Pro Asp Asp Glu Val Thr Ala Ile Ile Ala Ser Phe

145 150 155 160

Ser Ile Thr Ser Val Gln Arg Ser Asp Asn Gly Ser Tyr Ile Cys Lys

165 170 175

Met Lys Ile Asn Asn Glu Glu Ile Val Ser Asp Pro Ile Tyr Ile Glu

180 185 190

Val Gln Gly Leu Pro His Phe Thr Lys Gln Pro Glu Ser Met Asn Val

195 200 205

Thr Arg Asn Thr Ala Phe Asn Leu Thr Cys Gln Ala Val Gly Pro Pro

210 215 220

Glu Pro Val Asn Ile Phe Trp Val Gln Asn Ser Ser Arg Val Asn Glu

225 230 235 240

Gln Pro Glu Lys Ser Pro Ser Val Leu Thr Val Pro Gly Leu Thr Glu

245 250 255

Met Ala Val Phe Ser Cys Glu Ala His Asn Asp Lys Gly Leu Thr Val

260 265 270

Ser Lys Gly Val Gln Ile Asn Ile Lys Ala Ile Pro Ser Pro Pro Thr

275 280 285

Glu Val Ser Ile Arg Asn Ser Thr Ala His Ser Ile Leu Ile Ser Trp

290 295 300

Val Pro Gly Phe Asp Gly Tyr Ser Pro Phe Arg Asn Cys Ser Ile Gln

305 310 315 320

Val Lys Glu Ala Asp Pro Leu Ser Asn Gly Ser Val Met Ile Phe Asn

325 330 335

Thr Ser Ala Leu Pro His Leu Tyr Gln Ile Lys Gln Leu Gln Ala Leu

340 345 350

Ala Asn Tyr Ser Ile Gly Val Ser Cys Met Asn Glu Ile Gly Trp Ser

355 360 365

Ala Val Ser Pro Trp Ile Leu Ala Ser Thr Thr Glu Gly Ala Pro Ser

370 375 380

Val Ala Pro Leu Asn Val Thr Val Phe Leu Asn Glu Ser Ser Asp Asn

385 390 395 400

Val Asp Ile Arg Trp Met Lys Pro Pro Thr Lys Gln Gln Asp Gly Glu

405 410 415

Leu Val Gly Tyr Arg Ile Ser His Val Trp Gln Ser Ala Gly Ile Ser

420 425 430

Lys Glu Leu Leu Glu Glu Val Gly Gln Asn Gly Ser Arg Ala Arg Ile

435 440 445

Ser Val Gln Val His Asn Ala Thr Cys Thr Val Arg Ile Ala Ala Val

450 455 460

Thr Arg Gly Gly Val Gly Pro Phe Ser Asp Pro Val Lys Ile Phe Ile

465 470 475 480

Pro Ala His Gly Trp Val Asp Tyr Ala Pro Ser Ser Thr Pro Ala Pro

485 490 495

Gly Asn Ala Asp Pro Val Leu Ile Ile Phe Gly Cys Phe Cys Gly Phe

500 505 510

Ile Leu Ile Gly Leu Ile Leu Tyr Ile Ser Leu Ala Ile Arg Lys Arg

515 520 525

Val Gln Glu Thr Lys Phe Gly Asn Ala Phe Thr Glu Glu Asp Ser Glu

530 535 540

Leu Val Val Asn Tyr Ile Ala Lys Lys Ser Phe Cys Arg Arg Ala Ile

545 550 555 560

Glu Leu Thr Leu His Ser Leu Gly Val Ser Glu Glu Leu Gln Asn Lys

565 570 575

Leu Glu Asp Val Val Ile Asp Arg Asn Leu Leu Ile Leu Gly Lys Ile

580 585 590

Leu Gly Glu Gly Glu Phe Gly Ser Val Met Glu Gly Asn Leu Lys Gln

595 600 605

Glu Asp Gly Thr Ser Leu Lys Val Ala Val Lys Thr Met Lys Leu Asp

610 615 620

Asn Ser Ser Gln Arg Glu Ile Glu Glu Phe Leu Ser Glu Ala Ala Cys

625 630 635 640

Met Lys Asp Phe Ser His Pro Asn Val Ile Arg Leu Leu Gly Val Cys

645 650 655

Ile Glu Met Ser Ser Gln Gly Ile Pro Lys Pro Met Val Ile Leu Pro

660 665 670

Phe Met Lys Tyr Gly Asp Leu His Thr Tyr Leu Leu Tyr Ser Arg Leu

675 680 685

Glu Thr Gly Pro Lys His Ile Pro Leu Gln Thr Leu Leu Lys Phe Met

690 695 700

Val Asp Ile Ala Leu Gly Met Glu Tyr Leu Ser Asn Arg Asn Phe Leu

705 710 715 720

His Arg Asp Leu Ala Ala Arg Asn Cys Met Leu Arg Asp Asp Met Thr

725 730 735

Val Cys Val Ala Asp Phe Gly Leu Ser Lys Lys Ile Tyr Ser Gly Asp

740 745 750

Tyr Tyr Arg Gln Gly Arg Ile Ala Lys Met Pro Val Lys Trp Ile Ala

755 760 765

Ile Glu Ser Leu Ala Asp Arg Val Tyr Thr Ser Lys Ser Asp Val Trp

770 775 780

Ala Phe Gly Val Thr Met Trp Glu Ile Ala Thr Arg Gly Met Thr Pro

785 790 795 800

Tyr Pro Gly Val Gln Asn His Glu Met Tyr Asp Tyr Leu Leu His Gly

805 810 815

His Arg Leu Lys Gln Pro Glu Asp Cys Leu Asp Glu Leu Tyr Glu Ile

820 825 830

Met Tyr Ser Cys Trp Arg Thr Asp Pro Leu Asp Arg Pro Thr Phe Ser

835 840 845

Val Leu Arg Leu Gln Leu Glu Lys Leu Leu Glu Ser Leu Pro Asp Val

850 855 860

Arg Asn Gln Ala Asp Val Ile Tyr Val Asn Thr Gln Leu Leu Glu Ser

865 870 875 880

Ser Glu Gly Leu Ala Gln Gly Ser Thr Leu Ala Pro Leu Asp Leu Asn

885 890 895

Ile Asp Pro Asp Ser Ile Ile Ala Ser Cys Thr Pro Arg Ala Ala Ile

900 905 910

Ser Val Val Thr Ala Glu Val His Asp Ser Lys Pro His Glu Gly Arg

915 920 925

Tyr Ile Leu Asn Gly Gly Ser Glu Glu Trp Glu Asp Leu Thr Ser Ala

930 935 940

Pro Ser Ala Ala Val Thr Ala Glu Lys Asn Ser Val Leu Pro Gly Glu

945 950 955 960

Arg Leu Val Arg Asn Gly Val Ser Trp Ser His Ser Ser Met Leu Pro

965 970 975

Leu Gly Ser Ser Leu Pro Asp Glu Leu Leu Phe Ala Asp Asp Ser Ser

980 985 990

Glu Gly Ser Glu Val Leu Met

995

<210> 2

<211> 3000

<212> DNA

<213> 野生型人的MERTK cDNA序列(wild type human MERTK cDNA)

<400> 2

atggggccgg ccccgctgcc gctgctgctg ggcctcttcc tccccgcgct ctggcgtaga 60

gctatcactg aggcaaggga agaagccaag ccttacccgc tattcccggg accttttcca 120

gggagcctgc aaactgacca cacaccgctg ttatcccttc ctcacgccag tgggtaccag 180

cctgccttga tgttttcacc aacccagcct ggaagaccac atacaggaaa cgtagccatt 240

ccccaggtga cctctgtcga atcaaagccc ctaccgcctc ttgccttcaa acacacagtt 300

ggacacataa tactttctga acataaaggt gtcaaattta attgctcaat cagtgtacct 360

aatatatacc aggacaccac aatttcttgg tggaaagatg ggaaggaatt gcttggggca 420

catcatgcaa ttacacagtt ttatccagat gatgaagtta cagcaataat cgcttccttc 480

agcataacca gtgtgcagcg ttcagacaat gggtcgtata tctgtaagat gaaaataaac 540

aatgaagaga tcgtgtctga tcccatctac atcgaagtac aaggacttcc tcactttact 600

aagcagcctg agagcatgaa tgtcaccaga aacacagcct tcaacctcac ctgtcaggct 660

gtgggcccgc ctgagcccgt caacattttc tgggttcaaa acagtagccg tgttaacgaa 720

cagcctgaaa aatccccctc cgtgctaact gttccaggcc tgacggagat ggcggtcttc 780

agttgtgagg cccacaatga caaagggctg accgtgtcca agggagtgca gatcaacatc 840

aaagcaattc cctccccacc aactgaagtc agcatccgta acagcactgc acacagcatt 900

ctgatctcct gggttcctgg ttttgatgga tactccccgt tcaggaattg cagcattcag 960

gtcaaggaag ctgatccgct gagtaatggc tcagtcatga tttttaacac ctctgcctta 1020

ccacatctgt accaaatcaa gcagctgcaa gccctggcta attacagcat tggtgtttcc 1080

tgcatgaatg aaataggctg gtctgcagtg agcccttgga ttctagccag cacgactgaa 1140

ggagccccat cagtagcacc tttaaatgtc actgtgtttc tgaatgaatc tagtgataat 1200

gtggacatca gatggatgaa gcctccgact aagcagcagg atggagaact ggtgggctac 1260

cggatatccc acgtgtggca gagtgcaggg atttccaaag agctcttgga ggaagttggc 1320

cagaatggca gccgagctcg gatctctgtt caagtccaca atgctacgtg cacagtgagg 1380

attgcagccg tcaccagagg gggagttggg cccttcagtg atccagtgaa aatatttatc 1440

cctgcacacg gttgggtaga ttatgccccc tcttcaactc cggcgcctgg caacgcagat 1500

cctgtgctca tcatctttgg ctgcttttgt ggatttattt tgattgggtt gattttatac 1560

atctccttgg ccatcagaaa aagagtccag gagacaaagt ttgggaatgc attcacagag 1620

gaggattctg aattagtggt gaattatata gcaaagaaat ccttctgtcg gcgagccatt 1680

gaacttacct tacatagctt gggagtcagt gaggaactac aaaataaact agaagatgtt 1740

gtgattgaca ggaatcttct aattcttgga aaaattctgg gtgaaggaga gtttgggtct 1800

gtaatggaag gaaatcttaa gcaggaagat gggacctctc tgaaagtggc agtgaagacc 1860

atgaagttgg acaactcttc acagcgggag atcgaggagt ttctcagtga ggcagcgtgc 1920

atgaaagact tcagccaccc aaatgtcatt cgacttctag gtgtgtgtat agaaatgagc 1980

tctcaaggca tcccaaagcc catggtaatt ttacccttca tgaaatacgg ggacctgcat 2040

acttacttac tttattcccg attggagaca ggaccaaagc atattcctct gcagacacta 2100

ttgaagttca tggtggatat tgccctggga atggagtatc tgagcaacag gaattttctt 2160

catcgagatt tagctgctcg aaactgcatg ttgcgagatg acatgactgt ctgtgttgcg 2220

gacttcggcc tctctaagaa gatttacagt ggcgattatt accgccaagg ccgcattgct 2280

aagatgcctg ttaaatggat cgccatagaa agtcttgcag accgagtcta cacaagtaaa 2340

agtgatgtgt gggcatttgg cgtgaccatg tgggaaatag ctacgcgggg aatgactccc 2400

tatcctgggg tccagaacca tgagatgtat gactatcttc tccatggcca caggttgaag 2460

cagcccgaag actgcctgga tgaactgtat gaaataatgt actcttgctg gagaaccgat 2520

cccttagacc gccccacctt ttcagtattg aggctgcagc tagaaaaact cttagaaagt 2580

ttgcctgacg ttcggaacca agcagacgtt atttacgtca atacacagtt gctggagagc 2640

tctgagggcc tggcccaggg ctccaccctt gctccactgg acttgaacat cgaccctgac 2700

tctataattg cctcctgcac tccccgcgct gccatcagtg tggtcacagc agaagttcat 2760

gacagcaaac ctcatgaagg acggtacatc ctgaatgggg gcagtgagga atgggaagat 2820

ctgacttctg ccccctctgc tgcagtcaca gctgaaaaga acagtgtttt accgggggag 2880

agacttgtta ggaatggggt ctcctggtcc cattcgagca tgctgccctt gggaagctca 2940

ttgcccgatg aacttttgtt tgctgacgac tcctcagaag gctcagaagt cctgatgtga 3000

<210> 3

<211> 3000

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 3

atgggaccag caccattgcc acttcttttg ggtctctttc ttcccgctct gtggagaaga 60

gctattacgg aagcaagaga agaggctaaa ccttatcctc tgttcccagg cccctttcca 120

gggtccctgc agactgatca tacccctctc ctgtccctgc cacatgcatc tggctatcag 180

cccgctttga tgttttctcc cactcagcct ggtagacccc ataccggaaa tgtcgcaatt 240

ccacaggtca cctcagttga gtctaaacct ctgcccccac tggcttttaa gcacaccgtt 300

ggacatatta ttctgtcaga gcataaagga gtgaagttta actgtagcat ctccgtacca 360

aatatttacc aggataccac tatttcttgg tggaaggacg gaaaggagtt gttgggcgcc 420

catcacgcaa tcacacagtt ttacccagat gatgaggtga ccgccattat tgcttctttc 480

tctatcacat ccgtacagag atccgataac ggctcataca tctgcaaaat gaagattaac 540

aatgaggaga tcgtctccga tcctatatat attgaggttc agggactccc ccatttcacg 600

aaacagccgg agtctatgaa tgtgacacgc aatactgcat tcaatcttac ttgtcaagca 660

gttggcccac ccgaacccgt gaacattttc tgggtgcaga acagctctcg cgtgaacgaa 720

caaccagaga aatccccctc tgttctgacc gtgccgggtc tcacggaaat ggccgttttc 780

tcctgtgagg cacacaacga caagggcctt accgtcagca agggtgtgca gatcaatatt 840

aaagcaattc cctctcctcc cacggaggtg tctattagga actctaccgc ccatagtatc 900

ttgatttcat gggttcccgg gtttgacggc tattcccctt tccgcaactg ttctattcag 960

gtaaaagaag cggatcccct ctcaaatggc tctgtgatga tctttaatac atccgcgctt 1020

ccacacctgt atcagatcaa acagctgcaa gcactggcaa actacagcat cggggtgtct 1080

tgcatgaatg agatcgggtg gtccgcagtg agtccttgga ttctcgcgtc aaccactgag 1140

ggcgcaccaa gcgtggctcc tcttaatgta actgtgttcc tgaacgaatc tagtgacaac 1200

gtcgacatcc gctggatgaa gccccctacg aagcagcagg acggcgaact cgtgggttac 1260

cggatcagcc atgtgtggca gtccgcaggt atatccaagg agctgctcga agaggtggga 1320

caaaatggct ctcgggccag aatatctgtc caggtgcaca atgccacatg cacagtgaga 1380

atcgctgctg ttactagggg aggagtagga ccatttagtg accctgtcaa aatatttatc 1440

ccagcgcacg gctgggttga ttacgctccc agttctacgc ccgctcctgg caatgctgat 1500

ccggttctca ttatattcgg gtgcttctgt ggattcattc ttatagggct catcctgtac 1560

atttctctcg caataaggaa gcgcgtgcag gagaccaagt tcggaaacgc ttttactgaa 1620

gaagattccg agctggtggt aaactatata gctaagaagt cattctgtcg ccgggcgata 1680

gaactcacac tccacagcct cggggtgtca gaggagttgc agaataagtt ggaggatgtc 1740

gtgatcgacc gcaacctgct catcttggga aagatcctgg gggaaggaga atttggttcc 1800

gtgatggagg gcaatcttaa gcaggaggac ggaacctccc tgaaagtggc tgtgaagacg 1860

atgaaactgg acaactcatc ccagagagag atagaagagt ttctctctga ggctgcctgc 1920

atgaaggatt tctcccaccc aaatgtgatt aggctgctgg gggtgtgcat tgagatgtct 1980

tctcagggta tacctaagcc tatggtaata ttgccattca tgaagtacgg tgatttgcac 2040

acatacctgc tttactctcg cctcgagact gggccaaagc acatccccct tcagacactg 2100

cttaaattca tggtggatat cgcactcggc atggagtacc tttccaacag aaacttcctc 2160

catcgggatc tggcagcgcg caattgtatg cttcgggacg acatgactgt gtgtgtggcc 2220

gattttgggc tgagcaaaaa gatctacagt ggggactatt acaggcaggg tcgcatagca 2280

aagatgccgg tgaaatggat cgcaattgaa tcactcgctg atcgggttta tacctcaaag 2340

tcagacgtgt gggcgttcgg cgtgacgatg tgggaaattg ccacacgcgg catgactccc 2400

tatcctggcg tccagaacca tgagatgtac gattacttgc tccatgggca cagactgaag 2460

cagcccgagg attgcctgga tgagctctat gagatcatgt acagttgctg gcggacagac 2520

ccactcgaca gaccaacatt tagcgtcctg aggctgcagc tggaaaagct gctggaaagt 2580

ttgccagacg tccgaaatca ggctgatgtg atttacgtga acacccagtt gctggagtct 2640

agtgagggac tggcccaagg ttcaaccttg gcccctctcg atctgaatat cgaccccgat 2700

tccattattg cgagctgcac accgagagct gcaattagcg tggtgaccgc cgaagtccac 2760

gacagtaagc cgcatgaagg aagatatatc cttaatgggg gatccgagga atgggaggat 2820

ctgacatccg ctccctctgc agccgtaacc gctgagaaga attctgtgct cccaggcgaa 2880

aggcttgtca gaaacggcgt ctcctggtcc catagctcta tgctgcctct tgggtcctca 2940

ctcccggacg agctgctgtt tgctgacgat agtagcgaag gcagtgaggt gctcatgtga 3000

<210> 4

<211> 722

<212> DNA

<213> 人的RPE65启动子序列(human PRE65 promoter)

<400> 4

agcagacagg cattagtgac aagcaaagat atgcagaatt tcattctcag caaatcaaaa 60

gtcctcaacc tggttggaag aatattggca ctgaatggta tcaataaggt tgctagagag 120

ggttagaggt gcacaatgtg cttccataac attttatact tctccaatct tagcactaat 180

caaacatggt tgaatacttt gtttactata actcttacag agttataaga tctgtgaaga 240

cagggacagg gacaataccc atctctgtct ggttcatagg tggtatgtaa tagatatttt 300

taaaaataag tgagttaatg aatgagggtg agaatgaagg cacagaggta ttagggggag 360

gtgggcccca gagaatggtg ccaaggtcca gtggggtgac tgggatcagc tcaggcctga 420

cgctggccac tcccacctag ctcctttctt tctaatctgt tctcattctc cttgggaagg 480

attgaggtct ctggaaaaca gccaaacaac tgttatggga acagcaagcc caaataaagc 540

caagcatcag ggggatctga gagctgaaag caacttctgt tccccctccc tcagctgaag 600

gggtggggaa gggctcccaa agccataact ccttttaagg gatttagaag gcataaaaag 660

gcccctggct gagaacttcc ttcttcattc tgcagttggt gccagaactc tggatcctga 720

ac 722

Claims

1.一种编码人受体酪氨酸激酶Mer的核苷酸序列，其特征在于，其与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥95％相同性，优选地与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥98％相同性，更优选地与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列有≥99％相同性。

2.根据权利要求1所述核苷酸序列，其特征在于，其序列如SEQ ID NO:3所示。

3.根据权利要求1或2所述核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列为cDNA序列。

4.权利要求1-3任意一项所述核苷酸序列在制备预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病的病毒载体或药物制剂中的应用，或在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用。

5.根据权利要求4所述应用，其特征在于，所述MERTK突变导致的眼部疾病为MERTK突变导致视网膜色素变性。

6.一种病毒载体，其特征在于，其包含有权利要求1-3任意一项所述核苷酸序列。

7.根据权利要求6所述病毒载体，其特征在于，所述病毒载体为腺相关病毒载体。

8.根据权利要求7所述病毒载体，其特征在于，所述腺相关病毒载体的血清型为AAV2野生型或AAV2-7M8。

9.根据权利要求6-8任意一项所述病毒载体，其特征在于，所述病毒载体由启动子hRPE65调控MERTK蛋白的表达。

10.权利要求6-9任意一项所述病毒载体在制备预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病的药物制剂中的应用，或在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用。

11.根据权利要求10所述应用，其特征在于，所述MERTK突变导致的眼部疾病为MERTK突变导致视网膜色素变性。

12.一种药物制剂，其特征在于，包含如权利要求1-3任一项所述的核苷酸序列或权利要求6-9任一项所述的病毒载体。

13.根据权利要求12所述的药物制剂，其特征在于，所述药物制剂为液体制剂。

14.根据权利要求12或13所述药物制剂，其特征在于，还包括药学上可接受的载体或赋形剂。

15.权利要求12-14任意一项所述的药物制剂在预防或治疗MERTK突变导致的眼部疾病中的应用。

16.根据权利要求15所述的应用，其特征在于，所述MERTK突变导致的眼部疾病为MERTK突变导致视网膜色素变性。

17.一种药物制剂的递送方法，其特征在于，将权利要求12-14任意一项所述药物制剂注射至眼部。