CN111778254B - 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用 - Google Patents

抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN111778254B
CN111778254B CN202010746211.5A CN202010746211A CN111778254B CN 111778254 B CN111778254 B CN 111778254B CN 202010746211 A CN202010746211 A CN 202010746211A CN 111778254 B CN111778254 B CN 111778254B
Authority
CN
China
Prior art keywords
seq
sirna
sense strand
antisense strand
nucleotides
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN202010746211.5A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111778254A (zh
Inventor
董长贵
张佩琢
胡荣宽
杜永华
张紫楠
李琴
杜宏
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shanghai Genepharma Co Ltd
Original Assignee
Suzhou Genepharma Co ltd
Shanghai Genepharma Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Suzhou Genepharma Co ltd, Shanghai Genepharma Co Ltd filed Critical Suzhou Genepharma Co ltd
Priority to CN202010746211.5A priority Critical patent/CN111778254B/zh
Publication of CN111778254A publication Critical patent/CN111778254A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111778254B publication Critical patent/CN111778254B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • C12N15/1131Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing against viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • A61K31/713Double-stranded nucleic acids or oligonucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/14Type of nucleic acid interfering N.A.
    • C12N2310/141MicroRNAs, miRNAs

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

本发明公开了抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用。本发明要求保护一种siRNA含有正义链和反义链,所述siRNA为21‑si‑P14‑19,且所述正义链或所述反义链的部分核苷酸为2'‑O‑甲基核糖核苷酸,部分磷酸酯基为硫代磷酸酯基。本发明提供了全新的siRNA及其组合物,能够有效预防和/或治疗新型冠状病毒。

Description

抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
本发明是申请日为2020年4月3日、申请号为202010256865.X、发明名称为抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用的分案申请。
技术领域
本发明涉及生物医药技术领域,具体涉及抑制新型冠状病毒基因表达的小干扰核酸以及该小干扰核酸在制备用于预防和/或治疗新型冠状病毒肺炎的药物组合物中的应用。
背景技术
新型冠状病毒肺炎(CoronaVirusDisease2019,COVID-19)是一种急性感染性肺炎,研究人员发现其病原体是由一种先前未在人类中发现的新型β冠状病毒引起的,该病毒随后被世界卫生组织(WHO)命名为COVID-19。COVID-19患者初始症状多为发热、乏力和干咳,并逐渐出现呼吸困难等严重表现。多数患者预后良好,部分严重病例可出现急性呼吸窘迫综合征和脓毒症休克,甚至死亡。截至2020年3月1日,COVID-19已经感染了88000多人,造成近3000人死亡。全球的科学家和临床医生正在迅速开展工作,以抗击由新型冠状病毒引起的呼吸道疾病COVID-19,但是目前仍然缺乏针对COVID-19病毒的有效抗病毒药物,当前治疗还是隔离治疗、对症支持治疗为主。因此,开发有效预防和/或治疗新型冠状病毒肺炎的siRNA及其药物产品成为迫切需要解决的的问题。
发明内容
本发明的目的是提供一种靶向新型冠状病毒基因的siRNA及其在制备新型冠状病毒肺炎药物中的应用。
新型冠状病毒(COVID-19)与SARS-CoV和MERS-CoV病毒类似,COVID-19(2019-nCoV)的基因组也分为非结构基因和结构基因两个部分。其中约占COVID-19全基因组总长度三分之二的非结构基因含有两段编码蛋白质的序列,称为ORF1a和ORF1b。而紧随其后的结构基因区域则编码S蛋白、orf3a蛋白、E蛋白、M蛋白、orf6蛋白、orf7a蛋白、orf8蛋白、N蛋白等结构蛋白。
本发明提供了一种siRNA分子,该siRNA含有互补的正义链和反义链,所述正义链含有如SEQ ID NO:5所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:6所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ IDNO:10所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:58所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:59所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:60所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:69所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:70所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:123所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ IDNO:124所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:131所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:132所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:145所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:146所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:171所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:172所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:177所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:178所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQ ID NO:185所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:186所示的核苷酸序列;或者,所述正义链含有如SEQID NO:197所示的核苷酸序列,所述反义链含有如SEQ ID NO:198所示的核苷酸序列;
其中,
正义链5’-AGGGAUUGUACAGAAAGUGUG-3’(SEQ ID NO:5),
反义链5’-CACUUUCUGUACAAUCCCUUU-3’(SEQ ID NO:6);
正义链5’-GGUGAUUGUGAAGAAGAAGAG-3’(SEQ ID NO:9),
反义链5’-CUUCUUCUUCACAAUCACCUU-3’(SEQ ID NO:10);
正义链5’-AAUCCAUCAUUGCCUACACUA-3’(SEQ ID NO:57),
反义链5’-CAUAGUGUAGGCAAUGAUGGA-3’(SEQ ID NO:58);
正义链5’-AAACCGUGCUUUAACUGGAAU-3’(SEQ ID NO:59),
反义链5’-CUAUUCCAGUUAAAGCACGGU-3’(SEQ ID NO:60);
正义链5’-AAUGGCACACACUGGUUUGUA-3’(SEQ ID NO:69),
反义链5’-GUUACAAACCAGUGUGUGCCA-3’(SEQ ID NO:70);
正义链5’-CAAGGCCAAACUGUCACUAAG-3’(SEQ ID NO:123),
反义链5’-UAGUGACAGUUUGGCCUUGUU-3’(SEQ ID NO:124);
正义链5’-GGCUGAUGAAACUCAAGCCUU-3’(SEQ ID NO:131),
反义链5’-GGCUUGAGUUUCAUCAGCCUU-3’(SEQIDNO:132);
正义链5’-UCAGCACCUUUAAUUGAAUUG-3’(SEQ ID NO:145),
反义链5’-AUUCAAUUAAAGGUGCUGAUU-3’(SEQ ID NO:146);
正义链5’-CUUCCUCAAGGAACAACAUUG-3’(SEQ ID NO:171),
反义链5’-AUGUUGUUCCUUGAGGAAGUU-3’(SEQ ID NO:172);
正义链5’-GAGUGUGUUAGAGGUACAACA-3’(SEQ ID NO:177),
反义链5’-UUGUACCUCUAACACACUCUU-3’(SEQ ID NO:178);
正义链5’-CUGACUUGCUUUAGCACUCAA-3’(SEQ ID NO:185),
反义链5’-GAGUGCUAAAGCAAGUCAGUU-3’(SEQ ID NO:186);
正义链5’-CUUGCUGUUGUUGUUUGUAAC-3’(SEQ ID NO:197),
反义链5’-UACAAACAACAACAGCAAGUU-3’(SEQ ID NO:198)。
优选地,所述siRNA相互互补的正义链和反义链中至少一条单链删除或增加一个或几个核苷酸,从而得到与所述siRNA具有相同功能的siRNA衍生物。
优选地,所述siRNA相互互补的所述正义链和所述反义链中至少一条单链的磷酸-糖骨架中的至少一部分为硫代磷酸酯骨架;
或者,相互互补的所述正义链和所述反义链中至少一条单链的至少一部分核苷酸进行核苷酸取代或修饰;
或者,相互互补的所述正义链和所述反义链中至少一条单链连接信号分子和/或活性分子和/或功能基团。
优选地,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:5核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:6核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:9核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:10核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:57核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:58核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:59核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:60核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:69核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:70核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:123核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:124核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:131核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:132核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:145核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:146核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:171核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:172核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:177核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:178核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:185核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:186核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
或者,所述siRNA的正义链SEQ ID NO:197核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:198核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸。
优选地,所述siRNA的正义链和/或反义链的核苷酸序列第1、2、3位核苷酸之间磷酸酯基和第19、20、21位核苷酸之间磷酸酯基均为硫代磷酸酯基。
优选地,所述siRNA的正义链的5’末端进行胆固醇修饰。
本发明还提供上述siRNA在制备预防和/或治疗病毒性肺炎的药物中的应用。
优选地,所述病毒性肺炎为新型冠状病毒肺炎COVID-19。
本发明还提供一种试剂盒,所述试剂盒包含上述siRNA,所述试剂盒具有治疗新型冠状病毒COVID-19的功能。
本发明提供了靶向新型冠状病毒基因的非修饰的siRNA序列和修饰的siRNA序列,通过实验证明,本发明修饰的siRNA对新型冠状病毒基因具有明显的抑制效果,为临床上治疗新型冠状病毒肺炎奠定了基础,具有重大的临床意义和推广价值。
附图说明
图1为本发明实施例3中双荧光素酶报告基因质粒GP-miRGLO质粒的图谱;
图2为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NS-964、21si-NS-1989和21si-NS-2139的siRNA与对应的编号为P17的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图3为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NS-2588、21si-NS-2798和21si-NS-2915的siRNA与对应的编号为P18的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图4为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NS-5890、21si-NS-6010、21si-NS-6015和21si-NS-6201的siRNA与对应的编号为P19的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图5为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NS-17211、21si-NS-17400和21si-NS-17447的siRNA与对应的编号为P20的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图6为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NS-19760、21si-NS-19831和21si-NS-19897的siRNA与对应的编号为P21的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图7为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-SP-88、21si-SP-241、21si-SP-337和21si-SP-450的siRNA与对应的编号为P22的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图8为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-SP-1027、21si-SP-1060、21si-SP-1493、21si-SP-1547、21si-SP-1816和21si-SP-1932的siRNA与对应的编号为P23的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图9为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-SP-2128、21si-SP-2069、21si-SP-2289、21si-SP-2301和21si-SP-2643的siRNA与对应的编号为P24的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图10为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-SP-2956、21si-SP-3051、21si-SP-3292、21si-SP-3387和21si-SP-3584的siRNA与对应的编号为P25的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图11为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-P3-50、21si-P3-223、21si-P3-592、21si-P3-735、21si-P3-209、21si-P3-244、21si-P3-528、21si-P3-704、21si-P3-725和21si-P3-744的siRNA与对应的编号为P34的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图12为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-HY8-152、21si-HY8-160、21si-HY8-7、21si-HY8-22和21si-HY8-119的siRNA与对应的编号为P30的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图13为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-P8-30、21si-P8-62、21si-P8-95、21si-P8-98、21si-P8-269和21si-P8-164的siRNA与对应的编号为P33的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图14为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-P10b-203、21si-P10b-256、21si-P10b-275、21si-P10b-80、21si-P10b-103、21si-P10b-158、21si-P10b-27、21si-P10b-38和21si-P10b-95的siRNA与对应的编号为P29的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图15为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-EP-20、21si-EP-83、21si-EP-96和21si-EP-124的siRNA与对应的编号为P26的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图16为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-MP-237、21si-MP-13、21si-MP-42、21si-MP-249、21si-MP-484、21si-MP-501、21si-MP-56、21si-MP-220、21si-MP-410和21si-MP-61的siRNA与对应的编号为P27的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图17为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-P13-163、21si-P13-199和21si-P13-213的siRNA与对应的编号为P31的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图18为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-P14-8、21si-P14-19和21si-P14-82的siRNA与对应的编号为P32的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图;
图19为本发明实施例4中编号为mimicsNC、21si-NP-173、21si-NP-209、21si-NP-223、21si-NP-229、21si-NP-249、21si-NP-448、21si-NP-460、21si-NP-468、21si-NP-479、21si-NP-698、21si-NP-722、21si-NP-745、21si-NP-781、21si-NP-796、21si-NP-1123和21si-NP-1162的siRNA与对应的编号为P28的报告质粒进行双荧光素酶检测实验的结果图。
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
下述非限制性实施例可以使本领域的技术人员更好的理解本发明。
任何熟悉本领域的技术人员在本发明的纰漏范围内,根据本发明的技术方案及构思进行替换或改变均属于本发明的保护范畴。
下述实施例中所使用的293T细胞系购自中科院典藏细胞库。
实施例1
小干扰核酸的合成
选择序列相对保守的新型冠状病毒(COVID-19)基因组(Genebank登记号MN988668.1)(SEQIDNO:227)为模板。分别针对COVID-19基因的保守区,选取21bp的核苷酸序列,设计小干扰核酸(siRNA)。
本实施例中设计的siRNA经上海吉玛制药技术有限公司进行合成,上述合成的siRNA序列如表1所示。
表1
Figure BDA0002608434130000071
Figure BDA0002608434130000081
Figure BDA0002608434130000091
Figure BDA0002608434130000101
Figure BDA0002608434130000111
如表1所示,本实施例还设置了正义链核苷酸序列如SEQIDNO:207所示,反义链核苷酸序列如SEQIDNO:208所示的siRNA,编号为M-mimicsNC为与新型冠状病毒(COVID-19)基因无对应靶位点的无关序列,作为阴性对照。
实施例2
修饰的小干扰核酸的合成
通过对表1中序列正义链和反义链进行化学修饰后得到如表2中所示的经修饰的siRNA,即正义链第1、2、3、19、20、21位碱基的核苷酸残基中戊糖基团的2’羟基均被甲氧基修饰,所述正义链第1、2、3位碱基之间的磷酸酯基为硫代磷酸酯基,所述正义链第19、20、21位碱基之间的磷酸酯基为硫代磷酸酯基;反义链第1、2、3、19、20、21位碱基的核苷酸残基中戊糖基团的2’羟基均被甲氧基修饰,所述反义链第1、2、3位碱基之间的磷酸酯基为硫代磷酸酯基,所述反义链第19、20、21位碱基之间的磷酸酯基为硫代磷酸酯基;本实施例中设计的siRNA经上海吉玛制药技术有限公司进行合成,合成时在siRNA的正义链5’末端链接胆固醇进行修饰。
表2
Figure BDA0002608434130000131
Figure BDA0002608434130000141
Figure BDA0002608434130000151
Figure BDA0002608434130000161
其中m代表左侧的核苷酸残基中戊糖基团为2’-甲氧基核糖基,s代表其左右两侧的脱氧核糖核苷酸残基之间的磷酸酯基为硫代磷酸酯基。
实施例3
双荧光素酶报告基因质粒构建
本实施例使用的双荧光素酶报告基因质粒是GP-miRGLO质粒(该空载体的序列如其说明书所示),购自Promega公司,其图谱信息图1所示。在GP-miRGLO质粒中插入一段新型冠状病毒(COVID-19)基因组序列来制备如表3所示的双荧光素酶报告基因质粒。
表3
Figure BDA0002608434130000171
实施例4
细胞转染
1.293T细胞在10cm培养皿中培养至80-90%融合时,倾去培养液,用2mlPBS洗涤细胞两次。
2.加入2mlTrypsin-EDTAsolution,混匀后,37℃放置1分钟。
3.小心吸去胰酶溶液,加入2ml含10%FBS的DMEM培养液,吹打使细胞形成单细胞悬液。
4.血球计数板计数,将细胞稀释至1×106细胞/ml。按5×105细胞/孔的浓度接种12孔板,混匀后于37℃5%CO2培养24小时。
5.每1OD260 siRNA用120μlDEPC-H2O溶解,终浓度约为20μM。
6.在1.5mlEP管中加入100μl无血清DMEM,加入7ulsiRNA,再加入对应的双荧光报告载体1.2ug,混匀;取另一1.5mlEP管,加入100μl无血清DMEM,加入4μlLipofectamine2000,混匀,室温放置5分钟后将两管混合,室温放置20分钟。
分组按照质粒与siRNA分子的对应关系进行,具体对应情况如表2所示。
每组做3复孔,取均值,检测时间点24/48h,做一次。
吸去12孔板中的培养液,将转染混合物逐滴加入12孔板中,混匀后,在培养箱中温育5小时。
7.吸弃转染液,加入500ul含10%FBS的DMEM培养液。37℃5%CO2继续培养24、48小时,分别收样。
双荧光素酶系统检测
使用Dual-Luciferase报告基因检测系统试剂盒(promega)检测双荧光素酶(具体使用方法见说明书)。
试剂准备:
1、制备被动裂解缓冲液1×PLB:将1倍体积的5XpassiveLysisBuffer(PLB)加到4倍体积的蒸馏水中。混合均匀。4℃储存待用。
2、LARⅡ:用LuciferaseAssayBufferⅡ溶解冻干粉LuciferaseAssaySubstrate。储存于-20℃待用。
3、配制
Figure BDA0002608434130000181
试剂(现用现配):按本次实验所需用量,取一定量的
Figure BDA0002608434130000182
加入到相应量的
Figure BDA0002608434130000183
Buffer中,配种成终浓度为1×浓度,待用。
检测步骤:
1.倾去12孔板中的培养液,用500ulPBS洗涤细胞两次。
2.将1×PLB300ul加入到培养孔中。细胞被动裂解:在室温轻缓晃动培养板15分钟,把裂解液转移到检测试板中。每孔100ul,实验设计3复孔。
3.打开TecanM1000酶标仪,预热,选择双荧光素酶检测系统。
4.每孔加入10ul的LARII试剂,选择1-2秒延迟,5-10读数,酶标仪上检测萤火虫荧光素酶活性。
5.取出测试板,每孔加入
Figure BDA0002608434130000184
试剂,选择1-2秒延迟,5-10读数,酶标仪上检测海肾荧光素酶活性。
6.结果统计与分析。
双荧光素酶检测结果如图2-图19所示,结果表明,编号为21-si-SP-2069、21-si-SP-2289、21-si-SP-3292、21-si-P3-244、21-si-P8-62、21-si-P8-164、21-si-P10B-158、21-si-P14-19、21-si-NP-722、21-si-NP-1123、21-si-NS-2139和21-si-NS-2798的siRNA能够有效的抑制新型冠状病毒基因的表达。
以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说,在不脱离本发明的宗旨和范围,以及无需进行不必要的实验情况下,可在等同参数、浓度和条件下,在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例,应该理解为,可以对本发明作进一步的改进。总之,按本发明的原理,本发明欲包括任何变更、用途或对本发明的改进,包括脱离了本发明中已公开范围,而用本领域已知的常规技术进行的改变。
序列表
<110> 苏州吉玛基因股份有限公司
上海吉玛制药技术有限公司
<120> 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
<160> 435
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 209
<211> 1500
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 209
tggggaatgt ccaaattttg tatttccctt aaattccata atcaagacta ttcaaccaag 60
ggttgaaaag aaaaagcttg atggctttat gggtagaatt cgatctgtct atccagttgc 120
gtcaccaaat gaatgcaacc aaatgtgcct ttcaactctc atgaagtgtg atcattgtgg 180
tgaaacttca tggcagacgg gcgattttgt taaagccact tgcgaatttt gtggcactga 240
gaatttgact aaagaaggtg ccactacttg tggttactta ccccaaaatg ctgttgttaa 300
aatttattgt ccagcatgtc acaattcaga agtaggacct gagcatagtc ttgccgaata 360
ccataatgaa tctggcttga aaaccattct tcgtaagggt ggtcgcacta ttgcctttgg 420
aggctgtgtg ttctcttatg ttggttgcca taacaagtgt gcctattggg ttccacgtgc 480
tagcgctaac ataggttgta accatacagg tgttgttgga gaaggttccg aaggtcttaa 540
tgacaacctt cttgaaatac tccaaaaaga gaaagtcaac atcaatattg ttggtgactt 600
taaacttaat gaagagatcg ccattatttt ggcatctttt tctgcttcca caagtgcttt 660
tgtggaaact gtgaaaggtt tggattataa agcattcaaa caaattgttg aatcctgtgg 720
taattttaaa gttacaaaag gaaaagctaa aaaaggtgcc tggaatattg gtgaacagaa 780
atcaatactg agtcctcttt atgcatttgc atcagaggct gctcgtgttg tacgatcaat 840
tttctcccgc actcttgaaa ctgctcaaaa ttctgtgcgt gttttacaga aggccgctat 900
aacaatacta gatggaattt cacagtattc actgagactc attgatgcta tgatgttcac 960
atctgatttg gctactaaca atctagttgt aatggcctac attacaggtg gtgttgttca 1020
gttgacttcg cagtggctaa ctaacatctt tggcactgtt tatgaaaaac tcaaacccgt 1080
ccttgattgg cttgaagaga agtttaagga aggtgtagag tttcttagag acggttggga 1140
aattgttaaa tttatctcaa cctgtgcttg tgaaattgtc ggtggacaaa ttgtcacctg 1200
tgcaaaggaa attaaggaga gtgttcagac attctttaag cttgtaaata aatttttggc 1260
tttgtgtgct gactctatca ttattggtgg agctaaactt aaagccttga atttaggtga 1320
aacatttgtc acgcactcaa agggattgta cagaaagtgt gttaaatcca gagaagaaac 1380
tggcctactc atgcctctaa aagccccaaa agaaattatc ttcttagagg gagaaacact 1440
tcccacagaa gtgttaacag aggaagttgt cttgaaaact ggtgatttac aaccattaga 1500
<210> 210
<211> 500
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 210
aaggttacaa gagtgtgaat atcacttttg aacttgatga aaggattgat aaagtactta 60
atgagaagtg ctctgcctat acagttgaac tcggtacaga agtaaatgag ttcgcctgtg 120
ttgtggcaga tgctgtcata aaaactttgc aaccagtatc tgaattactt acaccactgg 180
gcattgattt agatgagtgg agtatggcta catactactt atttgatgag tctggtgagt 240
ttaaattggc ttcacatatg tattgttctt tctaccctcc agatgaggat gaagaagaag 300
gtgattgtga agaagaagag tttgagccat caactcaata tgagtatggt actgaagatg 360
attaccaagg taaacctttg gaatttggtg ccacttctgc tgctcttcaa cctgaagaag 420
agcaagaaga agattggtta gatgatgata gtcaacaaac tgttggtcaa caagacggca 480
gtgaggacaa tcagacaact 500
<210> 211
<211> 500
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 211
atatcaaatt tgctgatgat ttaaaccagt taactggtta taagaaacct gcttcaagag 60
agcttaaagt tacatttttc cctgacttaa atggtgatgt ggtggctatt gattataaac 120
actacacacc ctcttttaag aaaggagcta aattgttaca taaacctatt gtttggcatg 180
ttaacaatgc aactaataaa gccacgtata aaccaaatac ctggtgtata cgttgtcttt 240
ggagcacaaa accagttgaa acatcaaatt cgtttgatgt actgaagtca gaggacgcgc 300
agggaatgga taatcttgcc tgcgaagatc taaaaccagt ctctgaagaa gtagtggaaa 360
atcctaccat acagaaagac gttcttgagt gtaatgtgaa aactaccgaa gttgtaggag 420
acattatact taaaccagca aataatagtt taaaaattac agaagaggtt ggccacacag 480
atctaatggc tgcttatgta 500
<210> 212
<211> 500
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 212
caatggccac aaattatgat ttgagtgttg tcaatgccag attacgtgct aagcactatg 60
tgtacattgg cgaccctgct caattacctg caccacgcac attgctaact aagggcacac 120
tagaaccaga atatttcaat tcagtgtgta gacttatgaa aactataggt ccagacatgt 180
tcctcggaac ttgtcggcgt tgtcctgctg aaattgttga cactgtgagt gctttggttt 240
atgataataa gcttaaagca cataaagaca aatcagctca atgctttaaa atgttttata 300
agggtgttat cacgcatgat gtttcatctg caattaacag gccacaaata ggcgtggtaa 360
gagaattcct tacacgtaac cctgcttgga gaaaagctgt ctttatttca ccttataatt 420
cacagaatgc tgtagcctca aagattttgg gactaccaac tcaaactgtt gattcatcac 480
agggctcaga atatgactat 500
<210> 213
<211> 440
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 213
tactgtgatc tgggactaca aaagagatgc tccagcacat atatctacta ttggtgtttg 60
ttctatgact gacatagcca agaaaccaac tgaaacgatt tgtgcaccac tcactgtctt 120
ttttgatggt agagttgatg gtcaagtaga cttatttaga aatgcccgta atggtgttct 180
tattacagaa ggtagtgtta aaggtttaca accatctgta ggtcccaaac aagctagtct 240
taatggagtc acattaattg gagaagccgt aaaaacacag ttcaattatt ataagaaagt 300
tgatggtgtt gtccaacaat tacctgaaac ttactttact cagagtagaa atttacaaga 360
atttaaaccc aggagtcaaa tggaaattga tttcttagaa ttagctatgg atgaattcat 420
tgaacggtat aaattagaag 440
<210> 214
<211> 960
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 214
atgtttgttt ttcttgtttt attgccacta gtctctagtc agtgtgttaa tcttacaacc 60
agaactcaat taccccctgc atacactaat tctttcacac gtggtgttta ttaccctgac 120
aaagttttca gatcctcagt tttacattca actcaggact tgttcttacc tttcttttcc 180
aatgttactt ggttccatgc tatacatgtc tctgggacca atggtactaa gaggtttgat 240
aaccctgtcc taccatttaa tgatggtgtt tattttgctt ccactgagaa gtctaacata 300
ataagaggct ggatttttgg tactacttta gattcgaaga cccagtccct acttattgtt 360
aataacgcta ctaatgttgt tattaaagtc tgtgaatttc aattttgtaa tgatccattt 420
ttgggtgttt attaccacaa aaacaacaaa agttggatgg aaagtgagtt cagagtttat 480
tctagtgcga ataattgcac ttttgaatat gtctctcagc cttttcttat ggaccttgaa 540
ggaaaacagg gtaatttcaa aaatcttagg gaatttgtgt ttaagaatat tgatggttat 600
tttaaaatat attctaagca cacgcctatt aatttagtgc gtgatctccc tcagggtttt 660
tcggctttag aaccattggt agatttgcca ataggtatta acatcactag gtttcaaact 720
ttacttgctt tacatagaag ttatttgact cctggtgatt cttcttcagg ttggacagct 780
ggtgctgcag cttattatgt gggttatctt caacctagga cttttctatt aaaatataat 840
gaaaatggaa ccattacaga tgctgtagac tgtgcacttg accctctctc agaaacaaag 900
tgtacgttga aatccttcac tgtagaaaaa ggaatctatc aaacttctaa ctttagagtc 960
<210> 215
<211> 940
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 215
caaccaacag aatctattgt tagatttcct aatattacaa acttgtgccc ttttggtgaa 60
gtttttaacg ccaccagatt tgcatctgtt tatgcttgga acaggaagag aatcagcaac 120
tgtgttgctg attattctgt cctatataat tccgcatcat tttccacttt taagtgttat 180
ggagtgtctc ctactaaatt aaatgatctc tgctttacta atgtctatgc agattcattt 240
gtaattagag gtgatgaagt cagacaaatc gctccagggc aaactggaaa gattgctgat 300
tataattata aattaccaga tgattttaca ggctgcgtta tagcttggaa ttctaacaat 360
cttgattcta aggttggtgg taattataat tacctgtata gattgtttag gaagtctaat 420
ctcaaacctt ttgagagaga tatttcaact gaaatctatc aggccggtag cacaccttgt 480
aatggtgttg aaggttttaa ttgttacttt cctttacaat catatggttt ccaacccact 540
aatggtgttg gttaccaacc atacagagta gtagtacttt cttttgaact tctacatgca 600
ccagcaactg tttgtggacc taaaaagtct actaatttgg ttaaaaacaa atgtgtcaat 660
ttcaacttca atggtttaac aggcacaggt gttcttactg agtctaacaa aaagtttctg 720
cctttccaac aatttggcag agacattgct gacactactg atgctgtccg tgatccacag 780
acacttgaga ttcttgacat tacaccatgt tcttttggtg gtgtcagtgt tataacacca 840
ggaacaaata cttctaacca ggttgctgtt ctttatcagg atgttaactg cacagaagtc 900
cctgttgcta ttcatgcaga tcaacttact cctacttggc 940
<210> 216
<211> 960
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 216
gtgtttattc tacaggttct aatgtttttc aaacacgtgc aggctgttta ataggggctg 60
aacatgtcaa caactcatat gagtgtgaca tacccattgg tgcaggtata tgcgctagtt 120
atcagactca gactaattct cctcggcggg cacgtagtgt agctagtcaa tccatcattg 180
cctacactat gtcacttggt gcagaaaatt cagttgctta ctctaataac tctattgcca 240
tacccacaaa ttttactatt agtgttacca cagaaattct accagtgtct atgaccaaga 300
catcagtaga ttgtacaatg tacatttgtg gtgattcaac tgaatgcagc aatcttttgt 360
tgcaatatgg cagtttttgt acacaattaa accgtgcttt aactggaata gctgttgaac 420
aagacaaaaa cacccaagaa gtttttgcac aagtcaaaca aatttacaaa acaccaccaa 480
ttaaagattt tggtggtttt aatttttcac aaatattacc agatccatca aaaccaagca 540
agaggtcatt tattgaagat ctacttttca acaaagtgac acttgcagat gctggcttca 600
tcaaacaata tggtgattgc cttggtgata ttgctgctag agacctcatt tgtgcacaaa 660
agtttaacgg ccttactgtt ttgccacctt tgctcacaga tgaaatgatt gctcaataca 720
cttctgcact gttagcgggt acaatcactt ctggttggac ctttggtgca ggtgctgcat 780
tacaaatacc atttgctatg caaatggctt ataggtttaa tggtattgga gttacacaga 840
atgttctcta tgagaaccaa aaattgattg ccaaccaatt taatagtgct attggcaaaa 900
ttcaagactc actttcttcc acagcaagtg cacttggaaa acttcaagat gtggtcaacc 960
<210> 217
<211> 962
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 217
aaaatgcaca agctttaaac acgcttgtta aacaacttag ctccaatttt ggtgcaattt 60
caagtgtttt aaatgatatc ctttcacgtc ttgacaaagt tgaggctgaa gtgcaaattg 120
ataggttgat cacaggcaga cttcaaagtt tgcagacata tgtgactcaa caattaatta 180
gagctgcaga aatcagagct tctgctaatc ttgctgctac taaaatgtca gagtgtgtac 240
ttggacaatc aaaaagagtt gatttttgtg gaaagggcta tcatcttatg tccttccctc 300
agtcagcacc tcatggtgta gtcttcttgc atgtgactta tgtccctgca caagaaaaga 360
acttcacaac tgctcctgcc atttgtcatg atggaaaagc acactttcct cgtgaaggtg 420
tctttgtttc aaatggcaca cactggtttg taacacaaag gaatttttat gaaccacaaa 480
tcattactac agacaacaca tttgtgtctg gtaactgtga tgttgtaata ggaattgtca 540
acaacacagt ttatgatcct ttgcaacctg aattagactc attcaaggag gagttagata 600
aatattttaa gaatcataca tcaccagatg ttgatttagg tgacatctct ggcattaatg 660
cttcagttgt aaacattcaa aaagaaattg accgcctcaa tgaggttgcc aagaatttaa 720
atgaatctct catcgatctc caagaacttg gaaagtatga gcagtatata aaatggccat 780
ggtacatttg gctaggtttt atagctggct tgattgccat agtaatggtg acaattatgc 840
tttgctgtat gaccagttgc tgtagttgtc tcaagggctg ttgttcttgt ggatcctgct 900
gcaaatttga tgaagacgac tctgagccag tgctcaaagg agtcaaatta cattacacat 960
aa 962
<210> 218
<211> 228
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 218
atgtactcat tcgtttcgga agagacaggt acgttaatag ttaatagcgt acttcttttt 60
cttgctttcg tggtattctt gctagttaca ctagccatcc ttactgcgct tcgattgtgt 120
gcgtactgct gcaatattgt taacgtgagt cttgtaaaac cttcttttta cgtttactct 180
cgtgttaaaa atctgaattc ttctagagtt cctgatcttc tggtctaa 228
<210> 219
<211> 669
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 219
atggcagatt ccaacggtac tattaccgtt gaagagctta aaaagctcct tgaacaatgg 60
aacctagtaa taggtttcct attccttaca tggatttgtc ttctacaatt tgcctatgcc 120
aacaggaata ggtttttgta tataattaag ttaattttcc tctggctgtt atggccagta 180
actttagctt gttttgtgct tgctgctgtt tacagaataa attggatcac cggtggaatt 240
gctatcgcaa tggcttgtct tgtaggcttg atgtggctca gctacttcat tgcttctttc 300
agactgtttg cgcgtacgcg ttccatgtgg tcattcaatc cagaaactaa cattcttctc 360
aacgtgccac tccatggcac tattctgacc agaccgcttc tagaaagtga actcgtaatc 420
ggagctgtga tccttcgtgg acatcttcgt attgctggac accatctagg acgctgtgac 480
atcaaggacc tgcctaaaga aatcactgtt gctacatcac gaacgctttc ttattacaaa 540
ttgggagctt cgcagcgtgt agcaggtgac tcaggttttg ctgcatacag tcgctacagg 600
attggcaact ataaattaaa cacagaccat tccagtagca gtgacaatat tgctttgctt 660
gtacagtaa 669
<210> 220
<211> 1069
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 220
taaattccct cgaggacaag gcgttccaat taacaccaat agcagtccag atgaccaaat 60
tggctactac cgaagagcta ccagacgaat tcgtggtggt gacggtaaaa tgaaagatct 120
cagtccaaga tggtatttct actacctagg aactgggcca gaagctggac ttccctatgg 180
tgctaacaaa gacggcatca tatgggttgc aactgaggga gccttgaata caccaaaaga 240
tcacattggc acccgcaatc ctgctaacaa tgctgcaatc gtgctacaac ttcctcaagg 300
aacaacattg ccaaaaggct tctacgcaga agggagcaga ggcggcagtc aagcctcttc 360
tcgttcctca tcacgtagtc gcaacagttc aagaaattca actccaggca gcagtagggg 420
aacttctcct gctagaatgg ctggcaatgg cggtgatgct gctcttgctt tgctgctgct 480
tgacagattg aaccagcttg agagcaaaat gtctggtaaa ggccaacaac aacaaggcca 540
aactgtcact aagaaatctg ctgctgaggc ttctaagaag cctcggcaaa aacgtactgc 600
cactaaagca tacaatgtaa cacaagcttt cggcagacgt ggtccagaac aaacccaagg 660
aaattttggg gaccaggaac taatcagaca aggaactgat tacaaacatt ggccgcaaat 720
tgcacaattt gcccccagcg cttcagcgtt cttcggaatg tcgcgcattg gcatggaagt 780
cacaccttcg ggaacgtggt tgacctacac agctgccatc aaattggatg acaaagatcc 840
aaatttcaaa gatcaagtca ttttgctgaa taagcatatt gacgcataca aaacattccc 900
accaacagag cctaaaaagg acaaaaagaa gaaggctgat gaaactcaag ccttaccgca 960
gagacagaag aaacagcaaa ctgtgactct tcttcctgct gcagatttgg atgatttctc 1020
caaacaattg caacaatcca tgagcagtgc tgactcaact caggcctaa 1069
<210> 221
<211> 366
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 221
atgaaatttc ttgttttctt aggaatcatc acaactgtag ctgcatttca ccaagaatgt 60
agtttacagt catgtactca acatcaacca tatgtagttg atgacccgtg tcctattcac 120
ttctattcta aatggtatat tagagtagga gctagaaaat cagcaccttt aattgaattg 180
tgcgtggatg aggctggttc taaatcaccc attcagtaca tcgatatcgg taattataca 240
gtttcctgtt taccttttac aattaattgc caggaaccta aattgggtag tcttgtagtg 300
cgttgttcgt tctatgaaga ctttttagag tatcatgacg ttcgtgttgt tttagatttc 360
atctaa 366
<210> 222
<211> 186
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 222
atgtttcatc tcgttgactt tcaggttact atagcagaga tattactaat tattatgagg 60
acttttaaag tttccatttg gaatcttgat tacatcataa acctcataat taaaaattta 120
tctaagtcac taactgagaa taaatattct caattagatg aagagcaacc aatggagatt 180
gattaa 186
<210> 223
<211> 294
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 223
atggacccca aaatcagcga aatgcacccc gcattacgtt tggtggaccc tcagattcaa 60
ctggcagtaa ccagaatgga gaacgcagtg gggcgcgatc aaaacaacgt cggccccaag 120
gtttacccaa taatactgcg tcttggttca ccgctctcac tcaacatggc aaggaagacc 180
ttaaattccc tcgaggacaa ggcgttccaa ttaacaccaa tagcagtcca gatgaccaaa 240
ttggctacta ccgaagagct accagacgaa ttcgtggtgg tgacggtaaa atga 294
<210> 224
<211> 222
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 224
atgctgcaat cgtgctacaa cttcctcaag gaacaacatt gccaaaaggc ttctacgcag 60
aagggagcag aggcggcagt caagcctctt ctcgttcctc atcacgtagt cgcaacagtt 120
caagaaattc aactccaggc agcagtaggg gaacttctcc tgctagaatg gctggcaatg 180
gcggtgatgc tgctcttgct ttgctgctgc ttgacagatt ga 222
<210> 225
<211> 368
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 225
atgaaaatta ttcttttctt ggcactgata acactcgcta cttgtgagct ttatcactac 60
caagagtgtg ttagaggtac aacagtactt ttaaaagaac cttgctcttc tggaacatac 120
gagggcaatt caccatttca tcctctagct gataacaaat ttgcactgac ttgctttagc 180
actcaatttg cttttgcttg tcctgacggc gtaaaacacg tctatcagtt acgtgccaga 240
tcagtttcac ctaaactgtt catcagacaa gaggaagttc aagaacttta ctctccaatt 300
tttcttattg ttgcggcaat agtgtttata acactttgct tcacactcaa aagaaagaca 360
gaatgatt 368
<210> 226
<211> 828
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 226
atggatttgt ttatgagaat cttcacaatt ggaactgtaa ctttgaagca aggtgaaatc 60
aaggatgcta ctccttcaga ttttgttcgc gctactgcaa cgataccgat acaagcctca 120
ctccctttcg gatggcttat tgttggcgtt gcacttcttg ctgtttttca gagcgcttcc 180
aaaatcataa ccctcaaaaa gagatggcaa ctagcactct ccaagggtgt tcactttgtt 240
tgcaacttgc tgttgttgtt tgtaacagtt tactcacacc ttttgctcgt tgctgctggc 300
cttgaagccc cttttctcta tctttatgct ttagtctact tcttgcagag tataaacttt 360
gtaagaataa taatgaggct ttggctttgc tggaaatgcc gttccaaaaa cccattactt 420
tatgatgcca actattttct ttgctggcat actaattgtt acgactattg tataccttac 480
aatagtgtaa cttcttcaat tgtcattact tcaggtgatg gcacaacaag tcctatttct 540
gaacatgact accagattgg tggttatact gaaaaatggg aatctggagt aaaagactgt 600
gttgtattac acagttactt cacttcagac tattaccagc tgtactcaac tcaattgagt 660
acagacactg gtgttgaaca tgttaccttc ttcatctaca ataaaattgt tgatgagcct 720
gaagaacatg tccaaattca cacaatcgac ggttcatccg gagttgttaa tccagtaatg 780
gaaccaattt atgatgaacc gacgacgact actagcgtgc ctttgtaa 828

Claims (3)

1.一种siRNA,该siRNA由正义链和反义链组成,其特征在于,所述正义链为如SEQ IDNO:171所示的核苷酸序列,所述反义链为如SEQ ID NO:172所示的核苷酸序列;
其中,
正义链5’-CUUCCUCAAGGAACAACAUUG-3’(SEQ ID NO:171),
反义链5’-AUGUUGUUCCUUGAGGAAGUU-3’(SEQ ID NO:172);
所述siRNA的正义链SEQ ID NO:171核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸,所述siRNA的反义链SEQ ID NO:172核苷酸序列的第1、2、3、19、20、21位核苷酸均为2'-O-甲基核糖核苷酸;
所述siRNA的正义链和/或反义链的核苷酸序列第1、2、3位核苷酸之间磷酸酯基和第19、20、21位核苷酸之间磷酸酯基均为硫代磷酸酯基;
所述siRNA的正义链的5’末端进行胆固醇修饰。
2.权利要求1所述的siRNA在制备预防和/或治疗COVID-19的药物中的应用。
3.一种试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的siRNA,所述试剂盒具有治疗COVID-19的功能。
CN202010746211.5A 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用 Active CN111778254B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202010746211.5A CN111778254B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202010746211.5A CN111778254B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN202010256865.XA CN111139241B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202010256865.XA Division CN111139241B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111778254A CN111778254A (zh) 2020-10-16
CN111778254B true CN111778254B (zh) 2022-02-18

Family

ID=70528745

Family Applications (4)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202010746188.XA Active CN111876419B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN202010746211.5A Active CN111778254B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN202010746189.4A Active CN111748557B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN202010256865.XA Active CN111139241B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202010746188.XA Active CN111876419B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Family Applications After (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202010746189.4A Active CN111748557B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN202010256865.XA Active CN111139241B (zh) 2020-04-03 2020-04-03 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (4) CN111876419B (zh)

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2021196480A1 (zh) * 2020-04-03 2021-10-07 苏州吉玛基因股份有限公司 小干扰核酸及组合物、fish探针组及其制备方法和应用
GB2594365B (en) 2020-04-22 2023-07-05 BioNTech SE Coronavirus vaccine
CN111647685A (zh) * 2020-05-19 2020-09-11 广州中科抗体生物技术有限公司 一种检测covid-19病毒的引物组、探针组和试剂盒及其应用
WO2021241040A1 (ja) * 2020-05-27 2021-12-02 株式会社ボナック SARS-CoV-2遺伝子発現抑制核酸分子及びその用途
CN112111489A (zh) * 2020-06-23 2020-12-22 深圳罗兹曼国际转化医学研究院 抑制SARS-COV-2病毒复制的shRNA及其应用
RU2733361C1 (ru) * 2020-07-14 2020-10-01 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научный центр "Институт иммунологии" Федерального медико-биологического агентства России (ФГБУ "ГНЦ Институт иммунологии" ФМБА России) Средство для ингибирования репликации вируса SARS-CoV-2, опосредованного РНК-интерференцией
CN111729079A (zh) * 2020-07-30 2020-10-02 山东兴瑞生物科技有限公司 一种针对新型冠状病毒的dc疫苗、制备方法及其应用
CN112143731B (zh) * 2020-09-14 2022-03-15 广州瑞风生物科技有限公司 靶向破坏SARS-CoV-2病毒基因组的gRNA及其应用
CN112063764A (zh) * 2020-10-28 2020-12-11 江苏科德生物医药科技有限公司 一种用于新型冠状病毒核酸检测的多重实时荧光rt-pcr引物探针组合物及试剂盒
WO2022103817A2 (en) * 2020-11-11 2022-05-19 Georgetown University Rna molecules for use in inhibiting sars-cov-2 protein production
EP4256055A1 (en) * 2020-12-03 2023-10-11 Microbio (Shanghai) Co., Ltd. Interfering rnas targeting severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus and uses thereof for treating covid-19
CN113817729B (zh) * 2020-12-10 2023-03-24 南京吉迈生物技术有限公司 一种抑制新型冠状病毒(CoV19)的siRNA及其组合物和应用
CN112592923A (zh) * 2020-12-11 2021-04-02 中国科学院深圳先进技术研究院 Ires序列、ires序列的应用和多顺反子表达载体
WO2022120819A1 (zh) * 2020-12-11 2022-06-16 中国科学院深圳先进技术研究院 Ires序列、ires序列的应用和多顺反子表达载体
CN113817730B (zh) * 2021-02-04 2023-02-07 南京吉迈生物技术有限公司 一种抑制新型冠状病毒(CoV19)的siRNA及其组合物和应用
RU2746362C9 (ru) * 2021-03-11 2021-04-26 Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научный центр "Институт иммунологии" Федерального медико-биологического агентства России (ФГБУ "ГНЦ Институт иммунологии" ФМБА России) Комбинированное лекарственное средство, обладающее противовирусным эффектом в отношении нового коронавируса SARS-CoV-2
BR112023018838A2 (pt) * 2021-03-17 2023-12-26 Excepgen Inc Composições de vacina e métodos para uso das mesmas
TW202309282A (zh) 2021-04-28 2023-03-01 日商日本新藥股份有限公司 抗病毒核酸
CN113151608B (zh) * 2021-05-26 2021-11-05 华中农业大学 检测具有感染性SARS-CoV-2的PCR靶序列、引物和探针及应用
EP4359528A1 (en) * 2021-06-25 2024-05-01 Alpine Antiviral GmbH Sirna combinations targeting sars-cov-2 and/or host factor transcripts
WO2023279042A2 (en) * 2021-07-02 2023-01-05 Siemens Healthcare Laboratory, Llc Compositions and methods for detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 variants
CN114250229B (zh) * 2021-07-19 2023-12-26 深圳大学 抑制新冠病毒2019-nCoV的siRNA及其用途
WO2024002985A1 (en) 2022-06-26 2024-01-04 BioNTech SE Coronavirus vaccine
CN116350768A (zh) * 2023-03-13 2023-06-30 深圳湾实验室 一种Caspase-8的多肽类特异性抑制剂及应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1590545A (zh) * 2003-06-04 2005-03-09 杭州新瑞佳生物医药技术开发有限公司 攻击SARS病毒mRNA分子的小干扰核糖核酸分子(SiRNA)及应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1590545A (zh) * 2003-06-04 2005-03-09 杭州新瑞佳生物医药技术开发有限公司 攻击SARS病毒mRNA分子的小干扰核糖核酸分子(SiRNA)及应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Research and Development on Therapeutic Agents and Vaccines for COVID-19 and Related Human Coronavirus Diseases;Cynthia Liu等;《ACS Cent. Sci》;20200312;第315、318、325页 *
siRNA的化学修饰和临床应用;孙莉萍等;《生命的化学》;20051231;摘要,第340-341页 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN111748557B (zh) 2022-03-11
CN111139241A (zh) 2020-05-12
CN111139241B (zh) 2020-09-01
CN111778254A (zh) 2020-10-16
CN111748557A (zh) 2020-10-09
CN111876419B (zh) 2022-03-11
CN111876419A (zh) 2020-11-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111778254B (zh) 抑制新型冠状病毒的小干扰核酸及组合物和应用
CN111849988B (zh) 一种小干扰核酸及组合物和应用
CN112708699B (zh) 一种病毒样本灭活裂解试剂盒及其应用
JP4643906B2 (ja) 遺伝子発現の標的化阻害のための合成二本鎖オリゴヌクレオチド
EP3081646B1 (en) Non-coding rna of salmonella and identification and use thereof
RU2733361C1 (ru) Средство для ингибирования репликации вируса SARS-CoV-2, опосредованного РНК-интерференцией
CN104673798A (zh) UsiRNA复合物
CN113249380B (zh) 靶向covid-19新冠病毒的反义寡核苷酸、natac嵌合分子及其应用
WO2020139764A1 (en) Compositions and methods for inhibiting hmgb1 expression
CN111455060A (zh) 诊断和治疗口腔鳞癌的相关生物标志物及应用
EP3081645B1 (en) Non-coding rna of in-vivo infected microorganisms, parasitic microorganisms, symbiotic microorganisms and identification and application thereof
KR20160093721A (ko) 조류인플루엔자 바이러스 miRNA 및 이의 식별, 검출과 응용
WO2022120936A1 (zh) 一种修饰的核酸及其应用
CN117203339A (zh) 抗病毒核酸
CN113817729B (zh) 一种抑制新型冠状病毒(CoV19)的siRNA及其组合物和应用
WO2022087600A1 (en) Micro rna interactions as therapeutic targets for covid-19 and other viral infections
KR20240033228A (ko) Mst1 관련 질환 및 장애의 치료
KR20230030690A (ko) 코로나바이러스감염증-19의 치료에 사용하기 위한 SARS-CoV-2 번역 조절 저해 활성을 갖는 안티센스 올리고뉴클레오티드
CN116732028A (zh) 基于crispr-cas13系统干预抑制寨卡病毒的方法及应用
CN114921553A (zh) 人脑胶质瘤标志物hsa_circ_0009362及其应用
CN109694867A (zh) 一种DICER1基因及其siRNA的应用
CN118043460A (zh) 产品和组合物

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
TR01 Transfer of patent right

Effective date of registration: 20230817

Address after: Room 602, 1011 Halley Road, Pudong New Area pilot Free Trade Zone, Shanghai, 201203

Patentee after: SHANGHAI GENEPHARMA CO.,LTD.

Address before: 215123 No. 199 Dongping street, Suzhou Industrial Park, Suzhou, Jiangsu.

Patentee before: SUZHOU GENEPHARMA Co.,Ltd.

Patentee before: SHANGHAI GENEPHARMA CO.,LTD.

TR01 Transfer of patent right