CN111712302A - 精氨酸酶抑制剂及其使用方法 - Google Patents

精氨酸酶抑制剂及其使用方法 Download PDF

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CN111712302A CN201980013045.3A CN201980013045A CN111712302A CN 111712302 A CN111712302 A CN 111712302A CN 201980013045 A CN201980013045 A CN 201980013045A CN 111712302 A CN111712302 A CN 111712302A
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Abstract

披露了具有式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐、包含具有式(Ia)的化合物的药物组合物以及使用它们治疗癌症或呼吸道炎性疾病和抑制精氨酸酶的方法:其中R1为‑NHR1a;R1a为‑H或‑C(O)CH(R1b)NHR1c;并且R1b选自‑H、‑(C1‑C4)烷基和CH2OR1d且R1c为‑H;或者R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且R1d为H或‑CH3

Description

精氨酸酶抑制剂及其使用方法
背景技术
精氨酸酶是催化L-精氨酸转化为尿素和L-鸟氨酸的锰金属酶。存在两种同种型:精氨酸酶1是一种主要存在于肝细胞中的胞浆酶,在肝细胞中它在通过尿素合成而去除氨方面发挥关键作用,而精氨酸酶2是一种在肾脏中高度表达的线粒体酶,它参与鸟氨酸的产生,鸟氨酸是分别对细胞增殖和胶原蛋白产生很重要的聚胺和脯氨酸的前体。
尽管L-精氨酸不是必需氨基酸,因为在健康成人中它可以通过蛋白质转换来提供,但在各种生理和病理条件下(例如,妊娠、自身免疫疾病、癌症),精氨酸酶的表达和分泌增加导致L-精氨酸水平降低。尤其是免疫细胞对L-精氨酸水平降低敏感。当面对低L-精氨酸微环境时,T细胞降低其增殖速率并降低CD3ζ链、IFNγ和裂解酶的表达,导致T细胞反应性受损。树突细胞通过降低其呈递抗原的能力来响应低L-精氨酸条件,并且自然杀伤细胞减少裂解酶的增殖和表达。
肿瘤使用多种免疫抑制机制来逃避免疫系统。其中之一是通过增加循环精氨酸酶的水平,增加肿瘤细胞的精氨酸酶表达和分泌,以及募集表达和分泌精氨酸酶的髓源性抑制细胞来降低L-精氨酸。这些机制一起导致肿瘤微环境中的L-精氨酸减少并产生免疫抑制表型。
已证实精氨酸酶活性的药理学抑制可逆转动物模型中低L-精氨酸诱导的免疫抑制。因此,需要强效的和选择性的精氨酸酶抑制剂,作为单一药剂或与逆转其他免疫抑制机制的疗法组合来逆转免疫抑制并重新激活患者的抗癌免疫。
发明内容
在一个实施例中,披露了具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000021
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NH2;并且
R1b为-CH3或-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000022
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d,并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R1d为H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(Ib)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000031
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d,并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R1d为H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(II)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000032
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NH2;并且
R2b为-CH3或-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(IIa)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000033
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000041
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为-H或-CH3
在一些实施例中,披露了具有式(III)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000042
其中R3为-CH3或-CH(CH3)2
在一些实施例中,披露了具有式(IIIa)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000051
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和-CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000052
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和-CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
在一些实施例中,披露了具有式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000053
其中R4为-OH或-NH2
在一个实施例中,披露了具有式(IVb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000061
其中R4为-OH或-NH2
在一些实施例中,披露了具有式(V)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000062
在一个实施例中,披露了具有式(Vb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000063
在一个实施例中,披露了具有式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000064
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(VIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000071
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
在一些实施例中,披露了表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐和药学上可接受的载体的药物组合物。
在一些实施例中,披露了治疗癌症的方法,这些方法包括具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗癌症。
在一些实施例中,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐在制造用于治疗癌症的药剂中的用途。
在一些实施例中,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物用于治疗癌症。
在一些实施例中,披露了治疗呼吸道炎性疾病的方法,这些方法包括具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些实施例中,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗呼吸道炎性疾病。
在一些实施例中,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐在制造用于治疗呼吸道炎性疾病的药剂中的用途。
在一些实施例中,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物用于治疗呼吸道炎性疾病。
在一些实施例中,前述呼吸道炎性疾病是慢性阻塞性肺病(COPD)或哮喘。
附图说明
图1显示了描绘化合物B向化合物A的转化的NMR光谱,其中化合物B在100%d6-DMSO(标记为A)、于d6-DMSO中的75%D2O(标记为B)、于d6-DMSO中的50%D2O(标记为C)、于d6-DMSO中的25%D2O(标记为E)和100%D2O(标记为F)中制备。
图2显示了化合物B的NMR光谱(在于D2O中的0.1M DCl中),描绘了酸化如何引起几乎完全转化为化合物A。
图3比较了d6-DMSO中的无定形物质(标记为B)与d6-DMSO中的结晶化合物B(标记为A)的NMR光谱,显示了两种物质具有与结晶化合物B相同的环状结构。
具体实施方式
化合物
在一个实施例中,披露了具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000091
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NH2;并且
R1b为-CH3或-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(I)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(I)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(I)的一些实施例中,R1为-NHR1a并且R1a为-H。
在式(I)的一些实施例中,R1为-NHR1a,R1a为-C(O)CH(R1b)NH2并且R1b为-CH3
在式(I)的一些实施例中,R1为-NHR1a,R1a为-C(O)CH(R1b)NH2并且R1b为-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(Ia)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000101
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d;并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元环;并且
R1d为H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(Ia)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(Ia)的化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施例中,具有式(Ia)的化合物由式(Ia1)或(Ia2)表示:
Figure BDA0002629295820000102
其中R1与上述定义相同。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为-H并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为CH2OR1d;R1c为-H并且R1d为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为CH2OR1d;R1c为-H并且R1d为-CH3
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为-(C1-C4)烷基并且R1c为-H。在一些实施例中,C1-C4烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基、叔丁基和异丁基。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为甲基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为乙基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为异丙基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为仲丁基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为异丁基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为叔丁基;并且R1c为-H。
在式(Ia)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c并且R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元环。
在一个实施例中,披露了具有式(Ib)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000111
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d;并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R1d为H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(Ib)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(Ib)的化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施例中,具有式(Ib)的化合物由式(Ib1)或(Ib2)表示:
Figure BDA0002629295820000121
其中R1与上述定义相同。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为-H并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为CH2OR1d;R1c为-H并且R1d为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为CH2OR1d;R1c为-H并且R1d为-CH3
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为-(C1-C4)烷基并且R1c为-H。在一些实施例中,C1-C4烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基、叔丁基和异丁基。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为甲基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为乙基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为异丙基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为仲丁基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为异丁基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c;R1b为叔丁基;并且R1c为-H。
在式(Ib)的一些实施例中,R1a为-C(O)CH(R1b)NHR1c并且R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元环。
在一个实施例中,披露了具有式(II)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000131
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NH2;并且
R2b为-CH3或-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(II)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(II)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(II)的一些实施例中,R2为-OH。
在式(II)的一些实施例中,R2为-NHR2a并且R2a为-H。
在式(II)的一些实施例中,R2为-NHR2a,R2a为-C(O)CH(R2b)NH2并且R2b为-CH3
在式(II)的一些实施例中,R2为-NHR2a,R2a为-C(O)CH(R2b)NH2并且R2b为-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(IIa)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000141
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d;并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIa)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IIa)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IIa)的一个实施例中,R2为-OH。
在式(IIa)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-H。
在式(IIa)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为H并且R2c为H。
在式(IIa)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-CH2OR2d;R2c为H并且R2d为H。
在式(IIa)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-CH2OR2d;R2c为H并且R2d为-CH3
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-(C1-C4)烷基并且R2c为-H。在一些实施例中,C1-C4烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基、叔丁基和异丁基。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为甲基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为乙基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为异丙基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为仲丁基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为异丁基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为叔丁基;并且R2c为-H。
在式(IIa)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c并且R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元环。
在一个实施例中,披露了具有式(IIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000151
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d;并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIb)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IIb)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IIb)的一个实施例中,R2为-OH。
在式(IIb)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-H。
在式(IIb)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为H并且R2c为H。
在式(IIb)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-CH2OR2d;R2c为H并且R2d为H。
在式(IIb)的一个实施例中,R2为-NHR2a;并且R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-CH2OR2d;R2c为H并且R2d为-CH3
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为-(C1-C4)烷基并且R2c为-H。在一些实施例中,C1-C4烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基、叔丁基和异丁基。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为甲基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为乙基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为异丙基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为仲丁基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为异丁基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c;R2b为叔丁基;并且R2c为-H。
在式(IIb)的一些实施例中,R2为-NHR2a;R2a为-C(O)CH(R2b)NHR2c并且R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元环。
在一些实施例中,披露了具有式(III)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000171
其中R3为-CH3或-CH(CH3)2
在一个实施例中,披露了具有式(III)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(III)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(III)的一些实施例中,R3为-CH3
在式(III)的一些实施例中,R3为-CH(CH3)2
在一些实施例中,披露了具有式(IIIa)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000172
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIIa)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IIIa)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为-H。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为-CH2OR3a并且R3a为-H。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为-CH2OR3a并且R3a为-CH3
在式(IIIa)的一个实施例中,R3是为-(C1-C4)烷基。在一些实施例中,-(C1-C4)烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基和异丁基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为甲基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为乙基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为异丙基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为仲丁基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为异丁基。
在式(IIIa)的一个实施例中,R3为叔丁基。
在一些实施例中,披露了具有式(IIIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000181
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和-CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(IIIb)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IIIb)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为-H。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为-CH2OR3a并且R3a为-H。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为-CH2OR3a并且R3a为-CH3
在式(IIIb)的一个实施例中,R3是为-(C1-C4)烷基。在一些实施例中,-(C1-C4)烷基选自甲基、乙基、异丙基、仲丁基和异丁基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为甲基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为乙基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为异丙基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为仲丁基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为异丁基。
在式(IIIb)的一个实施例中,R3为叔丁基。
在一些实施例中,披露了具有式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000191
其中R4为-OH或-NH2
在一个实施例中,披露了具有式(IV)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IV)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IV)的一些实施例中,R4为-OH。
在式(IV)的一些实施例中,R4为-NH2
在一些实施例中,披露了具有式(IVb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000192
其中R4为-OH或-NH2
在一个实施例中,披露了具有式(IVb)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(IVb)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(IVb)的一些实施例中,R4为-OH。
在式(IVb)的一些实施例中,R4为-NH2
在一些实施例中,披露了具有式(V)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000193
在一个实施例中,披露了具有式(V)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(V)的化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施例中,披露了具有式(Vb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000201
在一个实施例中,披露了具有式(Vb)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(Vb)的化合物的药学上可接受的盐。
在一些实施例中,披露了具有式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000202
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(VI)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(VI)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(VI)的一些实施例中,R6a为-H或-CH3;并且R6b是被0个或1个氨基取代的-(C1-C3)烷基。
在式(VI)的一些实施例中,R6a为-H或-CH3;R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;R6c是被0个或1个氨基或-OH取代的-(C1-C3)烷基;并且R6d为H或-CH3
在一些实施例中,具有式(VI)的化合物由式(VIa1)或(VIa2)表示:
Figure BDA0002629295820000211
其中R6a和R6b与上面定义的相同。
在一个实施例中,披露了具有式(VIa1)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(VIa1)的化合物的药学上可接受的盐。
在一个实施例中,披露了具有式(VIa2)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(VIa2)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(VI)的一个实施例中,R6b为-CH3或-CH2CH2NH2
在一些实施例中,披露了具有式(VIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure BDA0002629295820000212
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
在一个实施例中,披露了具有式(VIb)的化合物。在另一个实施例中,披露了具有式(VIb)的化合物的药学上可接受的盐。
在式(VIb)的一个实施例中,R6b为-CH3或-CH2CH2NH2
在式(VIb)的一些实施例中,R6a为-H或-CH3;并且R6b是被0个或1个氨基取代的-(C1-C3)烷基。
在式(VIb)的一些实施例中,R6a为-H或-CH3;R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;R6c是被0个或1个氨基或-OH取代的-(C1-C3)烷基;并且R6d为H或-CH3
在一些实施例中,具有式(VIb)的化合物由式(VIb1)或(VIb2)表示:
Figure BDA0002629295820000221
其中R6a和R6b与上面定义的相同。
在一些实施例中,具有式(I)、(Ia)、(II)、(IIa)、(III)、(IIIa)、(IV)、(V)和(VI)的化合物(包括其种)通过分子内环化转化为具有式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(IVb)、(Vb)和(VIb)的化合物(包括其种),反之亦然。也就是说,它是一个互换过程。具有式(I)、(Ia)、(II)、(IIa)、(III)、(IIIa)、(IV)、(V)和(VI)的化合物(包括其种)和具有式(Ib)、(IIb)、(IIIb)、(IVb)、(Vb)和(VIb)的化合物(包括其种)各自根据诸如温度、压力、湿度、pH和/或介质组成(例如,溶剂)等条件部分或完全转化为另一者。在以下方案中进行了说明:
Figure BDA0002629295820000222
其中R1与上述式(Ia)和(Ib)中的定义相同。
在一些实施例中,披露了表1的化合物或其药学上的盐:
表1
Figure BDA0002629295820000231
Figure BDA0002629295820000241
Figure BDA0002629295820000251
Figure BDA0002629295820000261
Figure BDA0002629295820000271
用语“C1-C4烷基”包括具有1-4个碳原子的无环烷基部分。C1-C4烷基部分的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、仲丁基、异丁基和叔丁基。
用语“药学上可接受的盐”包括保留了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物的生物有效性和特性,并且通常不是生物学上或其他方面不希望的酸加成盐或碱加成盐。在许多情况下,具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物由于存在碱性基团和/或羧基或与之类似的基团而能够形成酸式盐和/或碱式盐。
药学上可接受的酸加成盐可以使用无机酸和有机酸来形成,例如,乙酸盐、天冬氨酸盐、苯甲酸盐、苯磺酸盐、溴化物/氢溴酸盐、碳酸氢盐/碳酸盐、硫酸氢盐/硫酸盐、樟脑磺酸盐、氯化物/盐酸盐、氯茶碱盐(chlortheophyllonate)、柠檬酸盐、乙二磺酸盐(ethanedisulfonate)、富马酸盐、葡庚糖酸盐、葡糖酸盐、葡糖醛酸盐、马尿酸盐、氢碘酸盐/碘化物、羟乙基磺酸盐、乳酸盐、乳糖酸盐、月桂基硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、扁桃酸盐、甲磺酸盐、甲基硫酸盐、萘甲酸盐、萘磺酸盐、烟酸盐、硝酸盐、十八酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、扑酸盐(palmoate)、磷酸盐/磷酸氢盐/磷酸二氢盐、聚半乳糖醛酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、碱式水杨酸盐、硫酸盐/硫酸氢盐、酒石酸盐、甲苯磺酸盐和三氟乙酸盐。可以从中得到盐的无机酸包括例如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等。可以从中得到盐的有机酸包括例如乙酸、丙酸、乙醇酸、草酸、马来酸、丙二酸、琥珀酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸、扁桃酸、甲磺酸、乙磺酸、甲苯磺酸、三氟乙酸、磺基水杨酸等。
药学上可接受的碱加成盐可以用无机碱和有机碱来形成。可以从中得到盐的无机碱包括例如氨以及铵和来自周期表第I至XII列的金属的盐。在某些实施例中,盐衍生自钠、钾、铵、钙、镁、铁、银、锌和铜;特别合适的盐包括铵盐、钾盐、钠盐、钙盐和镁盐。可以从中得到盐的有机碱包括例如伯胺、仲胺和叔胺、经取代的胺(包括天然存在的经取代胺)、环胺、碱性离子交换树脂等。某些有机胺包括异丙基胺、苄星青霉素、胆碱盐(cholinate)、二乙醇胺、二乙胺、赖氨酸、葡甲胺、哌嗪和氨丁三醇。
具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物的药学上可接受的盐可以通过常规化学方法由碱性或酸性部分合成。通常,此类盐可以通过将这些化合物的游离酸形式与化学计算量的适当的碱(如Na+、Ca2+、Mg2+或K+的氢氧化物、碳酸盐、碳酸氢盐等)反应,或通过将这些化合物的游离碱形式与化学计算量的适当的酸反应来制备。典型地,此类反应在水中或在有机溶剂中或在这两者的混合物中进行。通常,在可行的情况下,使用非水介质如醚、乙酸乙酯、乙醇、异丙醇、或乙腈是可取的。另外的合适盐的列表可以例如见于以下中:“Remington′s Pharmaceutical Sciences[雷明顿药物科学],”第20版,Mack Publishing Company[马克出版公司],Easton[伊斯顿],Pa.[宾夕法尼亚州],(1985);Berge等人,″J.Pharm.Sci.[药物科学杂志],1977,66,1-19以及Stahl和Wermuth的“Handbook of Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use[药用盐手册:特性、选择和使用]”(Wiley-VCH[威利-VCH出版社],Weinheim[魏因海姆],德国,2002)。
本文给出的任何式也旨在表示具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物的未标记形式以及同位素标记形式。除了一个或多个原子由相同元素但具有不同质量数的原子替换之外,同位素标记的化合物具有由本文给出的式所描绘的结构。可掺入到具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物及其药学上可接受的盐中的同位素的实例包括氢、碳、氮、氧、磷、硫、氟、氯和碘的同位素,如2H、3H、11C、13C、14C、15N、35S、36Cl和125I。同位素标记的具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物通常可通过本领域技术人员已知的常规技术或通过与附随实例中所描述的那些过程类似的过程使用适当的同位素标记的试剂替代先前采用的非标记试剂来制备。
具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物可具有不同的异构形式。用语“光学异构体”、“立体异构体”或“非对映异构体”是指对于给定的具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物而言,可能存在的各种立体异构构型中的任一种。应当理解的是,取代基可以附连在碳原子的手性中心,因此,所披露的化合物包括对映体、非对映体和外消旋体。术语“对映体”包括彼此为不可重叠的镜像的成对立体异构体。一对对映体的1∶1混合物是外消旋混合物。在适当的情况下,该术语用于指外消旋混合物。术语“非对映体”或“非对映异构体”包括具有至少两个不对称原子,但彼此不互为镜像的立体异构体。根据卡恩-英戈尔德-普雷洛格(Cahn-Ingold-Prelog)R-S系统指定绝对立体化学。当化合物是纯对映体时,每个手性中心的立体化学可以用R或S指定。绝对构型未知的拆分化合物可以根据其在钠D线的波长下旋转平面偏振光的方向(右旋或左旋)而标为(+)或(-)。某些式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)和表1的化合物含有一个或多个不对称中心或轴,并因此可产生对映体、非对映体或其他立体异构形式,就绝对立体化学而言,定义为(R)-或(S)-。本披露意在包括所有此类可能的异构体,包括外消旋混合物、光学纯形式和中间体混合物。光学活性(R)-和(S)-异构体可以使用手性合成子或手性试剂来制备,或使用本领域中熟知的常规技术如手性HPLC来拆分。
本文还披露了实例中的中间体1-48及其盐。
药物组合物
在一些实施例中,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物和药学上可接受的载体的药物组合物。
用语“药学上可接受的载体”包括如本领域技术人员所确定的那样,在合理的医学判断范围内,适合接触人类和动物的组织使用而无过度毒性、刺激、过敏反应或其他问题或并发症的化合物、材料、组合物和/或剂型。
所披露的组合物可以呈适于口服使用的形式(例如,作为片剂、锭剂、硬胶囊或软胶囊、水性或油性悬浮液、乳液、可分散粉剂或颗粒剂、糖浆或酏剂),适于局部使用的形式(例如,作为乳膏、软膏、凝胶或水性或油性溶液或悬浮液),适于通过吸入施用的形式(例如,作为细碎粉末或液体气溶胶),适于通过吹入施用的形式(例如,作为细碎粉末)或适于肠胃外施用的形式(例如,作为用于静脉内、皮下、肌肉内或肌肉内给药的无菌水溶液或油溶液或作为直肠给药的栓剂)。
与一种或多种药学上可接受的载体组合以生产单一剂型的活性成分的量将必然根据所治疗的宿主和特定的施用途径而变化。有关施用途径和剂量方案的更多信息,读者可参阅Comprehensive Medicinal Chemistry[综合药物化学]第5卷第25.3章(编委会主席Corwin Hansch),培格曼出版社(Pergamon Press)1990。
治疗实用性
本发明的化合物可在治疗中用作精氨酸酶抑制剂。
在一个方面,披露了用于在有此需要的受试者中治疗癌症的方法,这些方法包括向受试者施用有效量的具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一个方面,披露了用于在有此需要的受试者中治疗呼吸道炎性疾病的方法,这些方法包括向受试者施用有效量的具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗癌症。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐用于治疗呼吸道炎性疾病。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或药学上可接受的盐在制造用于治疗癌症的药剂中的用途。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或药学上可接受的盐在制造用于治疗呼吸道炎性疾病的药剂中的用途。
在一个方面,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物用于治疗癌症。
在一个方面,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物用于治疗呼吸道炎性疾病。
术语“癌症”包括例如肾细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、肺癌(例如,小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、间皮瘤)、胰腺癌、结直肠癌、乳腺癌、急性髓性白血病(AML)、前列腺癌、胃癌、膀胱癌、黑素瘤、肾癌和卵巢癌。在一些实施例中,癌症已经转移。在一些实施例中,癌症与精氨酸酶1和/或精氨酸酶2调节相关。
在一些实施例中,癌症与血浆精氨酸酶1水平增加相关。在一些实施例中,癌症与血浆精氨酸水平降低相关。在一些实施例中,癌症与血浆精氨酸酶1水平增加和血浆精氨酸水平降低相关。在一些实施例中,与血浆精氨酸酶1水平增加和/或血浆精氨酸水平降低相关的癌症包括肾细胞癌、头颈部鳞状细胞癌、肺癌(例如,小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞癌细胞肺癌(NSCLC)、间皮瘤)、胰腺癌、结直肠癌和乳腺癌。
在一些实施例中,癌症分泌精氨酸酶2,例如急性髓性白血病和前列腺癌。
在一些实施例中,癌症与精氨酸酶1阳性肿瘤浸润性免疫细胞相关,例如肺癌(小细胞肺癌(SCLC)、非小细胞肺癌(NSCLC)、胃癌、膀胱癌、结直肠癌、黑素瘤、头颈部鳞状细胞癌、乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌、胰腺癌和肾癌。
术语“呼吸道炎性疾病”是指影响气腔、肺血管系统、肺间质或其组合的炎性病状或病症。它们可以分离到肺部或涉及多个器官。在一个实施例中,呼吸道炎性疾病是炎性肺病。在另一个实施例中,炎性肺病是非感染性的。
在一些实施例中,呼吸道炎性疾病是哮喘、慢性阻塞性肺病(COPD)、化学诱导的肺纤维化、特发性肺纤维化、囊性纤维化或其组合。在一些实施例中,呼吸道炎性疾病是慢性阻塞性肺病(COPD)或哮喘。
在一个方面,披露了用于在有此需要的受试者中抑制精氨酸酶的方法,这些方法包括向受试者施用有效量的具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐用于抑制精氨酸酶。
在一个方面,披露了具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐在制造用于抑制精氨酸酶的药剂中的用途。
在一个方面,披露了包含具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物或其药学上可接受的盐的药物组合物用于抑制精氨酸酶。
术语“精氨酸酶”包括属于尿酸水解酶(uerohydrolase)家族的含锰酶,这些含锰酶催化尿素循环中的第五步和最后一步,将L-精氨酸转化为L-鸟氨酸和尿素。术语“精氨酸酶”包括该酶的两种同工酶,例如精氨酸酶1,其在尿素循环中起作用并且主要位于肝脏的细胞质中,以及精氨酸酶2,其位于身体几种组织的线粒体中并参与细胞中精氨酸/鸟氨酸浓度的调节。在一些实施例中,具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物或其药学上可接受的盐对精氨酸酶1有选择性。在一些实施例中,具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物或其药学上可接受的盐对精氨酸酶2有选择性。在一些实施例中,具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物或其药学上可接受的盐抑制精氨酸酶1和精氨酸酶2两者。
用语“有效量”包括具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物将在受试者中引发生物学或医学反应(例如降低或抑制与精氨酸酶或癌症相关的酶或蛋白质活性、改善癌症症状或者减缓或延迟癌症进展)的量。在一些实施例中,用语“有效量”包括具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物或表1的化合物在施用给受试者时,对于至少部分减轻、抑制和/或改善癌症或抑制精氨酸酶,和/或减少或抑制受试者中的肿瘤生长或癌细胞增殖有效的量。
术语“受试者”包括暖血哺乳类动物,例如灵长类、狗、猫、兔、大鼠和小鼠。在一些实施例中,受试者为灵长类,例如,人。在一些实施例中,受试者患有癌症。在一些实施例中,受试者需要治疗(例如,该受试者将在生物学或医学上受益于治疗)。在一些实施例中,患者患有癌症。在一些实施例中,受试者血浆精氨酸酶1水平增加。在一些实施例中,受试者的精氨酸水平降低。在一些实施例中,患者的血浆精氨酸酶1水平增加且精氨酸水平降低。在一些实施例中,受试者患有分泌精氨酸酶2的癌症(例如,急性髓性白血病或前列腺癌)。在一些实施例中,受试者具有精氨酸酶1阳性肿瘤浸润性免疫细胞。
用语“抑制”包括降低生物活性或过程的基线活性的降低。在一些实施例中,具有式(I)、(Ia)、(Ib)、(II)、(IIa)、(IIb)、(III)、(IIIa)、(IIIb)、(IV)、(IVb)、(V)、(Vb)、(VI)、(VIb)(包括其任何亚类或种)的化合物和表1的化合物抑制精氨酸酶。
用语“治疗”包括减少或抑制与精氨酸酶相关或受试者体内的酶或蛋白质活性,改善癌症的一种或多种症状,或者减缓或延迟受试者癌症的进展。用语“治疗”还包括减少或抑制受试者中的肿瘤生长或癌细胞增殖。
实例
本披露的多个方面可以通过参考以下非限制性实例进一步定义,这些实例详细描述了本披露的某些化合物和中间体的制备以及使用本披露的化合物的方法。本领域普通技术人员应当清楚的是可以在不偏离本披露的范围的情况下对材料和方法进行许多修改。
除非另行说明:
(i)除非另外说明,否则在环境温度(即在17℃至25℃范围内)和在如氮气等的惰性气体的气氛下进行所有合成;
(ii)通过旋转蒸发或利用Genevac设施或Biotage v10蒸发器在真空中进行蒸发,并且在通过过滤去除残余固体之后进行处理程序;
(iii)在自动化Teledyne Isco
Figure BDA0002629295820000361
Rf或Teledyne Isco
Figure BDA0002629295820000362
上使用预装填的RediSep Rf GoldTM二氧化硅柱(20-40μm,球形颗粒)、GraceResolvTM柱(
Figure BDA0002629295820000363
二氧化硅)或Silicycle柱(40-63μm)进行快速色谱纯化。
(iv)在具有UV采集的Gilson制备型HPLC仪器上进行制备型色谱法;可替代地,在具有MS和UV触发采集的Waters自动纯化HPLC-MS仪上进行制备型色谱法;
(v)在具有UV采集的Gilson仪器(233个进样器/级分收集器,333和334泵,155UV检测器)上或在Varian Prep Star仪器(2台SD1泵、325UV检测器、701级分收集器)上进行手性制备型色谱法,泵随Gilson 305进样而运行;可替代地,在具有MS和UV触发采集的WatersPrep 100SFC-MS仪器或具有UV采集的Thar MultiGram III SFC仪器上进行手性制备型色谱法。
(vi)产率(存在时)不一定是可达到的最大值;
(vii)通常,具有式I的终产物的结构通过核磁共振(NMR)光谱法确认;NMR化学位移值是以δ级测量的[质子磁共振光谱使用Bruker Avance III 600(600MHz)、BrukerAvance 400(400MHz)、Bruker Avance 300(300MHz)或Bruker DRX 500(500MHz)仪器测定];除非另有说明,否则在环境温度下进行测量;使用了以下缩写:s,单峰;d,二重峰;t,三重峰;q,四重峰;m,多重峰;dd,双二重峰;ddd,双双二重峰;dt,双三重峰;bs,宽信号。
(viii)一般而言,具有式I的终产物在液相色谱法之后还通过质谱法(LCMS或UPLC)来表征;如下进行UPLC:使用配备有Waters SQ质谱仪的Waters UPLC(柱温40℃,UV=220-300nm或190-400nm,质谱=具有正/负转换的ESI)以1mL/min的流量,使用经1.50min(连同平衡回到起始条件的总运行时间为1.70min)97%A+3%B至3%A+97%B的溶剂体系,其中A=在水中的0.1%甲酸或0.05%三氟乙酸(用于酸处理)或在水中的0.1%氢氧化铵(用于碱处理),并且B=乙腈。对于酸分析,使用的柱是Waters Acquity HSS T3(1.8μm,2.1×50mm);对于碱分析,使用的柱是Waters Acquity BEH C18(1.7μm,2.1×50mm)。可替代地,如下进行UPLC:使用配备有Waters SQ质谱仪的Waters UPLC(柱温度30℃,UV=210-400nm,质谱=具有正/负切换的ESI)以1mL/min的流速使用经1.5min(连同平衡回到起始条件的总运行时间为2min)2%至98%B的溶剂梯度,其中A=在水中的0.1%甲酸并且B=在乙腈中的0.1%甲酸(用于酸处理),或A=在水中的0.1%氢氧化铵并且B=乙腈(用于碱处理)。对于酸分析使用的柱是Waters Acquity HSS T3(1.8μm,2.1x 30mm),对于碱分析使用的柱是Waters Acquity BEH C18(1.7μm,2.1x 30mm);使用Waters Alliance HT(2795)进行LCMS,该Waters Alliance HT(2795)配备有Waters ZQ ESCi质谱仪和PhenomenexGemini-NX C18(5μm,110A,2.1x 50mm柱),以1.1mL/min流速,经4min 95%A至95%B,保持时间为0.5min,其中A=0.1%甲酸并且B=在水乙腈中的0.1%甲酸(用于酸处理)或A=在水中的0.1%氢氧化铵并且B=乙腈(用于碱处理)。此外,使用Shimadzu UFLC进行LCMS:该Shimadzu UFLC配备有Shimadzu LCMS-2020质谱仪和Waters HSS C18(1.8μm,2.1x 50mm)或Shim-pack XR-ODS(2.2μm,3.0x 50mm)或Phenomenex Gemini-NX C18(3μm,3.0x 50mm)柱,以0.7mL/min(对于Waters HSS C18柱)、1.0mL/min(对于Shim-pack XR-ODS柱)或1.2mL/min(对于Phenomenex Gemini-NX C18)的流速,经2.2min 95%A至95%B,保持时间为0.6min,其中A=在水中的0.1%甲酸或0.05%三氟乙酸(用于酸处理)或在水中的0.1%氢氧化铵或6.5mM碳酸铵(用于碱处理)并且B=乙腈。除非另有说明,否则报告的分子离子对应于[M+H]+;对于具有多个同位素模式的分子(Br、Cl等),除非另有说明,否则报告的值是对于最低同位素质量获得的值。
(ix)离子交换纯化通常使用SCX-2(拜泰齐公司(Biotage))柱进行。
(x)中间体纯度通过薄层色谱、质谱、LCMS、UPLC/MS、HPLC(高效液相色谱法)和/或NMR分析来评估;
(xi)使用了以下缩写:-
EtOH: 乙醇
EtOAc: 乙酸乙酯
LDA: 二异丙基氨基锂
MeOH: 甲醇
TFA: 三氟乙酸
MeCN: 乙腈
LCMS: 液相色谱法-质谱法
rt或RT: 室温
aq: 水性
THF: 四氢呋喃
KHMDS: 双(三甲基甲硅烷基)氨基钾
DCM: 二氯甲烷
DMF: 二甲基甲酰胺
HATU: (1-[双(二甲基氨基)亚甲基]-1H-1,2,3-三唑并[4,5-b]吡啶鎓3-氧化物六氟磷酸盐)
BOC: 叔丁氧羰基
DTNB: 5,5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)
TNB: 2-硝基-5-硫代苯甲酸
HEPES: (4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸)
实例1:(R)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000391
中间体1:(3S,7aR)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-C]噁唑-1(3H)-酮
在氮气下,将2,2,2-三氯乙烷-1,1-二醇(2.155g,13.03mmol)添加到D-脯氨酸(1.00g,8.69mmol)的CHCl3(100mL)溶液中。为反应烧瓶装配反向Dean-Stark分水器并且在搅拌下将反应混合物加热至回流48h。将反应混合物冷却至室温,用DCM(100mL)稀释,并依次用水(2x 200mL)和饱和盐水(2x 200mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并蒸发,获得粗产物。通过从EtOH中结晶纯化粗物质,得到呈白色固体的产物(中间体1,1.13g,53.2%产率)。
1H NMR(300MHz,CDCl3)δ1.66-2.41(4H,m),3.05-3.20(1H,m),3.40-3.50(1H,m),4.10-4.20(1H,m),5.18(1H,s)。
中间体2:(3S,7aS)-7a-((E)-4-溴丁-2-烯基)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-C] 噁唑-1(3H)-酮
在-78℃,在氮气气氛下,将LDA溶液(2.0M于THF/庚烷/乙苯中,2.05mL,4.09mmol)滴加到(3S,7aR)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-c]噁唑-1(3H)-酮(中间体1,1.00g,4.09mmol)的THF(500mL)溶液中。将所得溶液在-78℃下搅拌20min。将(E)-1,4-二溴丁-2-烯(875mg,4.09mmol)作为THF(2mL)溶液滴加到反应混合物中。将反应混合物在-78℃下搅拌30min,然后升温至室温,再搅拌2h。将反应混合物蒸发至干并将所得残余物在EtOAc(20mL)中稀释且依次用水(2x 20mL)和饱和盐水(2x 20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得产物(中间体2,760mg,49%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ1.55-1.75(1H,m),1.85-2.25(3H,m),2.52-2.73(2H,m),3.14-3.32(2H,m),3.89-4.10(2H,m),5.01(1H,s),5.79-5.99(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=378。
中间体3:(3S,7aS)-7a-((E)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基) 丁-2-烯基)-3-(三氧甲基)四氢吡咯并[1,2-c]噁唑-1(3H)-酮
在氮气气氛下将Pd2(dba)3(85.0mg,0.0928mmol)添加到(3S,7aS)-7a-((E)-4-溴丁-2-烯基)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-c]噁唑-1(3H)-酮(中间体2,700mg,1.85mmol)和双(频哪醇合)二硼(942mg,3.71mmol)的THF(30mL)溶液中。将所得混合物加热至60℃并搅拌5h。将反应混合物冷却至室温并浓缩至干。将所得残余物用EtOAc(50mL)稀释并依次用水和饱和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法纯化所得粗物质,获得产物(中间体3,510mg,65%产率)。1H NMR(300MHz,CDCl3)δ1.28(12H,s),1.58-1.80(2H,m),1.83-2.12(3H,m)2.42-2.65(1H,m),3.20(1H,dd),3.47(1H,q),3.71(1H,t),3.90(1H,t),4.98(1H,s),5.38-5.53(1H,m),5.64-5.83(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=424。
中间体4:(3S,7aR)-7a-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁 基)-3-(三氧甲基)四氢吡咯并[1,2-C]噁唑-1(3H)-酮
将Pd/C(10%wt,125mg,0.12mmol)添加到(3S,7aS)-7a-((E)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁-2-烯基)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-c]噁唑-1(3H)-酮(中间体3,500mg,1.18mmol)的MeOH(5mL)溶液中。为反应烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌30min。将反应混合物通过硅藻土过滤并用MeOH洗涤。将滤液浓缩至干,获得粗产物(中间体4,390mg,78%产率),该粗产物无需进一步纯化即使用。m/z(ES+)[M+H]+=426。
实例1:(R)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将浓HCl水溶液(1.00mL,12.0mmol)添加到(3S,7aR)-7a-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)-3-(三氯甲基)四氢吡咯并[1,2-c]噁唑-1(3H)-酮(中间体4,300mg,0.703mmol)和苯基硼酸(172mg,1.41mmol)的1,4-二噁烷(20mL)溶液中。将所得溶液加热至80℃保持15h。将反应混合物冷却至室温并浓缩至干。通过制备型LCMS(XBridgePrep C18 OBD柱,5μ二氧化硅,19×150mm,H2O(含0.05%TFA/MeCN))纯化粗物质。收集纯级分并浓缩至干,获得呈白色固体的(R)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例1,85mg,37%产率)。1H NMR(400MHz,D2O)δ0.63-0.74(2H,m),1.09-1.27(2H,m),1.27-1.37(2H,m),1.65-1.75(1H,m),1.77-2.08(4H,m),2.25-2.37(1H,m),3.21-3.37(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=216。
实例2:(2R,4S)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000421
中间体5:(2S,4S)-4-(苄氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4S)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸(5.00g,21.6mmol)溶于DMF(73mL)中并将溶液冷却至0℃。分批添加氢化钠(60%于矿物油中的分散体)(1.81g,45.3mmol),并将悬浮液在0℃下搅拌1h。添加苄基溴(12.9mL,108mmol)并将反应混合物搅拌过夜,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用乙酸乙酯(250mL)稀释并依次用柠檬酸(10%水溶液)和水洗涤。将有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗产物,获得呈旋转异构体混合物的产物(中间体5,5.5g,62%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.28-1.40(9H,s x2)旋转异构体,2.20(1H,dd),2.36-2.45(1H,m),3.37(1H,dd),3.51-3.58(1H,m),4.14(1H,br s),4.33-4.50(3H,m),4.94-5.17(2H,m),7.25-7.32(10H,m);m/z(ES+)[M+H]+=412。
中间体6:(4S)-4-(苄氧基)-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基
将(2S,4S)-4-(苄氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体5,2.75g,6.68mmol)和巴豆基溴(1.03mL,10.0mmol)溶于THF(45mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。通过滴加KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,20.1mL,10.0mmol)处理该溶液。将反应混合物缓慢升温至室温并搅拌3h。将粗反应混合物用水淬灭并在真空下去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体和E/Z烯烃混合物的产物(中间体6,2.54g,82%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.20-1.41(9H,s x2)旋转异构体,1.54-1.62(3H,m),2.10-2.59(3H,m),2.67-2.97(1H,m),3.10-3.43(1H,m),3.50-3.78(1H,m),3.98-4.15(1H,m),4.34-4.49(2H,m),4.94-5.13(2H,m),5.18-5.30(1H,m),5.38-5.63(1H,m),7.25-7.36(10H,m);m/z(ES+)[M+H]+=466。
中间体8:(2R,4S)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧 杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(0.366g,0.550mmol)和双(二苯基膦)甲烷(0.419g,1.09mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(31mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.74mL,12.0mmol)缓慢添加到溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4S)-4-(苄氧基)-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体6,2.54g,5.46mmol)作为在DCM(21mL)中的溶液添加到反应中,并将反应混合物搅拌过夜。将反应混合物用DCM稀释并用水淬灭。分层,并且将该水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体混合物的(4S)-4-(苄氧基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体7,2.0g,61%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,21.2x 250mm,5μm,温度=23℃,流动相=0-15%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=33mg/进样,浓度=于MeOH中的220ng/mL,流速=75mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。主要异构体的立体化学指定为反式加成产物,次要异构体指定为顺式加成产物。将次要异构体(368mg,0.620mmol)溶于乙酸乙酯(6.2mL)中并用Pd/C(10%wt,132mg,0.124mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,获得呈旋转异构体混合物的(2R,4S)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体8,228mg,98%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.57-0.74(2H,m),1.17(12H,s),1.24-1.47(13H,m),1.59-1.78(1H,m),1.78-1.96(1H,m),2.01-2.20(2H,m),2.84-3.09(1H,m),3.58-3.73(1H,m),4.14-4.31(1H,m),4.98-5.09(1H,m),12.20-12.60(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=414。
实例2:(2R,4S)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.65mL,8.4mmol)添加到(2R,4S)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体8,175mg,0.423mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(3mL)和1M HCl水溶液(3mL)中。添加苯基硼酸(103mg,0.847mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000441
C18Aq,在水中的0至10%至100%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4S)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸(实例2,33mg,33%产率)。1H NMR(400MHz,D2O)δ0.67-0.78(2H,m),1.08-1.41(4H,m),1.81-2.12(3H,m),2.51(1H,dd),3.22-3.37(2H,m),4.46-4.56(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=232。
实例3:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000451
中间体9:(2S,4R)-4-(苄氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸(5.00g,21.6mmol)溶于DMF(73mL)中并将溶液冷却至0℃。分批添加氢化钠(60%wt于矿物油中,1.81g,45.4mmol),并将悬浮液在0℃下搅拌1h。添加苄基溴(12.86mL,108.1mmol)并将反应混合物搅拌过夜,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用乙酸乙酯(250mL)稀释并依次用柠檬酸(10%水溶液)和水洗涤。将有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体混合物的产物(中间体9,5.9g,66%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.27-1.39(9H,s x2)旋转异构体,1.95-2.08(1H,m),2.34-2.47(1H,m),3.41-3.53(2H,m),4.17(1H,br s),4.28(1H,q),4.43-4.55(2H,m),5.06-5.22(2H,m),7.25-7.41(10H,m);m/z(ES+)[M+H]+=412。
中间体10:(4R)-4-(苄氧基)-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基
将(2S,4R)-4-(苄氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体9,2.75g,6.68mmol)和巴豆基溴(1.03mL,10.0mmol)溶于THF(45mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。通过滴加KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,20.1mL,10.0mmol)处理该溶液。将反应混合物缓慢升温至室温并搅拌3h。将粗反应混合物用水淬灭并在真空下去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体和E/Z烯烃混合物的产物(中间体10,1.23g,40%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.25-1.34(9H,s x2)旋转异构体,1.45-1.63(3H,m),2.12-2.64(2H,m),2.64-3.04(1H,m),3.06-3.19(1H,m),3.31-3.45(1H,m),3.46-3.81(1H,m),4.03-4.21(1H,m),4.30-4.55(2H,m),4.90-5.16(2H,m),5.16-5.34(1H,m),5.38-5.68(1H,m),7.25-7.41(10H,m)。m/z(ES+)[M+H]+=466。
中间体12:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(177mg,0.264mmol)和双(二苯基膦)甲烷(203mg,0.527mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(15mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.84mL,5.8mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-4-(苄氧基)-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体10,1.23g,2.64mmol)作为DCM(10mL)溶液添加到反应中,并将反应混合物搅拌过夜。将反应混合物用DCM稀释并用水淬灭。分层,并且将该水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得(4R)-4-(苄氧基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体11,950mg,60%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,21.2x 250mm,5μm,温度=23℃,流动相=0-15%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=33mg/进样,浓度=于MeOH中的220ng/mL,流速=75mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。主要异构体的立体化学指定为反式加成产物,次要异构体指定为顺式加成产物。将主要异构体(385mg,0.649mmol)溶于乙酸乙酯(6.4mL)中并用Pd/C(10%wt,138mg,0.130mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,得到呈旋转异构体混合物的产物(中间体12,249mg,93%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.61-0.73(2H,m),0.97-1.11(1H,m),1.12-1.23(12H,m),1.25-1.44(12H,m),1.51-1.71(1H,m),1.84-2.04(2H,m),2.05-2.19(2H,m),3.12-3.29(1H,m),3.37-3.59(1H,m),4.09-4.23(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=414。
实例3:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.65mL,8.5mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-羟基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体12,197mg,0.179mmol)的DCM(3mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(3mL)和1M HCl水溶液(3mL)中。添加苯基硼酸(102mg,0.837mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000471
C18Aq,在水中的0至10%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酸(实例3,25mg,25%产率)。1H NMR(300MHz,D2O)δ0.68-0.78(2H,m),1.13-1.43(4H,m),1.64-1.79(1H,m),1.94-2.14(2H,m),2.47(1H,d),3.39(2H,m),4.46-4.53(1H,m)。m/z(ES+)[M+H]+=232。
实例4:(2S,4S)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000481
中间体13:(2S,4S)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在0℃下将甲磺酰氯(0.71mL,9.2mmol)滴加到(2S,4R)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(2.45g,7.26mmol)和三乙胺(1.27mL,9.15mmol)的DCM(9.6mL)溶液中。将反应混合物在0℃下搅拌1h,然后在搅拌下升温至室温再持续1h。将反应混合物用二氯甲烷稀释并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干,得到(2S,4R)-4-((甲基磺酰基)氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(2.9g,95%产率),其不经进一步纯化即使用。m/z(ES+)[M+H]+=400。将叠氮化钠(1.65g,25.4mmol)添加到(2S,4R)-4-((甲基磺酰基)氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(2.90g,7.26mmol)的DMF(7.2mL)溶液中。将反应混合物加热至50℃并搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温并浓缩。将所得残余物用EtOAc稀释并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体混合物的产物(中间体13,2.00g,80%产率)。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.27和1.40(9H,s x2)旋转异构体,1.96-2.02(1H,m),2.53-2.63(1H,m),3.24-3.29(1H,m),3.58-3.66(1H,m),4.32-4.41(2H,m),5.06-5.22(2H,m),7.33-7.39(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=347。
中间体14:(4S)-4-叠氮基-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4S)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体13,1.00g,2.89mmol)和巴豆基溴(0.44mL,4.3mmol)溶于THF(20mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。通过滴加KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,8.66mL,4.33mmol)处理该溶液。将反应混合物缓慢升温至室温并搅拌3h。将粗反应混合物用水淬灭并在真空下去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体和E/Z烯烃混合物的产物(中间体14,750mg,65%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.25-1.34(9H,s x2)旋转异构体,1.55-1.64(3H,m),1.99-2.15(1H,m),2.33-2.62(2H,m),2.73-3.10(1H,m),3.26-3.39(1H,m),3.52-3.84(1H,m),4.24-4.33(1H,m),5.03-5.21(2H,m),5.28-5.35(1H,m),5.49-5.65(1H,m),7.31-7.36(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=401。
中间体16:(2S,4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷- 2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯和中间体17:(2R,4S)-4-叠氮基-2-(4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁 基酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(126mg,0.188mmol)和双(二苯基膦)甲烷(144mg,0.375mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(10mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(0.60mL,4.1mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4S)-4-叠氮基-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体14,750mg,1.87mmol)作为DCM(8mL)溶液添加到反应中,并在室温下将反应混合物搅拌过夜。将反应混合物用DCM稀释并用水淬灭。分层,并且将该水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得(4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体15,678mg,68%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,21.2x 250mm,5μm,温度=23℃,流动相=0-15%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=33mg/进样,浓度=于MeOH中的220ng/mL,流速=75mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。主要异构体的立体化学指定为反式加成产物中间体16,次要异构体指定为顺式加成产物中间体17。
中间体16(异构体1,608mg):(2S,4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.64-0.72(2H,m),1.04-1.12(1H,m),1.13-1.20(12H,m),1.22-1.39(12H,m),1.69-1.80(1H,m),2.01-2.23(2H,m),2.36-2.48(1H,m),3.35-3.42(1H,m),3.58-3.69(1H,m),4.33(1H,quin),5.05-5.17(2H,m),7.31-7.40(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=529。
中间体17(异构体2,220mg):(2R,4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。
中间体18:(2S,4S)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2S,4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体16,255mg,0.483mmol)溶于乙酸乙酯(5mL)和甲醇(5mL)中,并用Pd/C(10%wt,128mg,0.120mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,得到呈旋转异构体混合物的产物(中间体18,190mg,95%产率),其不经进一步纯化即使用。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.66(2H,t),0.88-1.03(1H,m),1.16(12H,s),1.24-1.38(13H,m),1.40-1.56(1H,m),1.80-1.91(1H,m),2.00-2.15(2H,m),3.17-3.28(1H,m),3.58-3.61(1H,m),3.80(1H,dd),9.01(2H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=413。
实例4:(2S,4S)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.71mL,9.2mmol)添加到(2S,4S)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体18,190mg,0.461mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(3mL)和1M HCl水溶液(3mL)中。添加苯基硼酸(112mg,0.919mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000511
C18Aq,在水中的0至10%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2S,4S)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例4,40mg,37%产率)。1H NMR(300MHz,D2O)δ0.73(2H,t),1.10-1.42(4H,m),1.69(1H,ddd),1.86-1.99(1H,m),2.10-2.30(2H,m),3.05(1H,dd),3.44(1H,dd),3.69(1H,quin);m/z(ES+)[M+H]+=231。
实例5:(2R,4S)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000521
中间体19:(2R,4S)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4S)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体17,220mg,0.416mmol)溶于乙酸乙酯(5mL)和甲醇(5mL)中,并用Pd/C(10%wt,111mg,0.104mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,得到呈旋转异构体混合物的产物(中间体19,150mg,87%产率),其不经进一步纯化即使用。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.64-0.71(2H,m),1.17(12H,s),1.31-1.40(15H,m),1.49-1.93(3H,m),2.02-2.26(3H,m),3.38-3.47(1H,m),3.72-3.81(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=413。
实例5:(2R,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.56mL,7.3mmol)添加到(2R,4S)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体19,150mg,0.364mmol)的DCM(3mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(99mg,0.81mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000522
C18Aq,在水中的0至10%0至100%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4S)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例5,33mg,39%产率)。1H NMR(400MHz,D2O)δ0.72(1H,m),1.11-1.39(3H,m),1.46-1.55(1H,m),1.63-1.79(2H,m),1.95-2.05(1H,m),2.58-2.65(1H,m),2.87-2.95(1H,m),3.48-3.58(3H,m);m/z(ES+)[M+H]+=231。
实例6:(2S,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000531
中间体20:(2S,4R)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯
在0℃下将甲磺酰氯(2.86mL,36.7mmol)滴加到(2S,4S)-4-羟基吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(7.50g,30.6mmol)和三乙胺(5.11mL,36.7mmol)的DCM(38mL)溶液中。将反应混合物在0℃下搅拌1h,然后在搅拌下升温至室温再持续1h。将反应混合物用二氯甲烷稀释并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干,得到(2S,4S)-4-((甲基磺酰基)氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-(叔丁基)2-甲基酯(9.9g,100%产率),其不经进一步纯化即使用。m/z(ES+)[M+NH4]+=341。
将叠氮化钠(5.96g,91.7mmol)添加到(2S,4S)-4-((甲基磺酰基)氧基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-(叔丁基)2-甲基酯(9.89g,30.6mmol)的DMF(30mL)溶液中。将反应混合物加热至50℃并搅拌过夜。将反应混合物冷却至室温并浓缩。将所得残余物用EtOAc稀释并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体混合物的产物(中间体20,5.95g,72%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.33和1.40(9H,s x2)旋转异构体,2.08-2.22(1H,m),2.26-2.41(1H,m),3.41(1H,dt),3.48-3.61(1H,m),3.65和3.68(3H,s x2)旋转异构体,4.22(1H,dd),4.30-4.43(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=271。
中间体21:(2S,4R)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在0℃下,将氢氧化钠(5.28g,132mmol)的水(22mL)溶液滴加到(2S,4R)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体20,5.95g,22.0mmol)的THF(44mL)和MeOH(22mL)溶液中。将反应混合物搅拌过夜,同时缓慢升温至室温。真空去除挥发物,并用5MHCl将水层酸化至pH~3且用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干,得到呈旋转异构体混合物的(2S,4R)-4-叠氮基-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酸(5.64g,100%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.35和1.40(9H,s x2)旋转异构体,2.07-2.18(1H,m),2.26-2.38(1H,m),3.34-3.44(1H,m),3.48-3.63(1H,m),4.09-4.17(1H,m),4.30-4.37(1H,m);m/z(ES-)[M+HCOO]-=301。
将苄基溴(2.83mL,23.8mmol)滴加到(2S,4R)-4-叠氮基-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酸(5.19g,19.9mmol)和三乙胺(3.46mL,24.8mmol)的DMF(60mL)溶液中,并将反应混合物在室温下搅拌过夜。真空去除挥发物,将所得残余物溶于EtOAc并用水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得产物(中间体21,5.09g,74%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.26和1.39(9H,s x2)旋转异构体,2.11-2.23(1H,m),2.31-2.43(1H,m),3.43(1H,ddd),3.50-3.59(1H,m),4.25-4.40(2H,m),5.07-5.22(2H,m),7.31-7.40(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=347。
中间体22:(4R)-4-叠氮基-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4R)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体21,5.09g,14.7mmol)和巴豆基溴(2.27mL,22.0mmol)溶于THF(100mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。通过滴加KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,44.1mL,22.0mmol)处理该溶液。将反应混合物缓慢升温至室温并搅拌3h。将粗反应混合物用水淬灭并在真空下去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得呈旋转异构体和E/Z烯烃混合物的产物(中间体22,4.6g,78%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ1.26-1.43(9H,m),1.59-1.66(3H,m),2.07-2.17(1H,m),2.32-2.48(2H,m),2.57-3.12(2H,m),3.35-3.82(1H,m),4.20-4.38(1H,m),5.02-5.22(2H,m),5.24-5.41(1H,m),5.46-5.68(1H,m),7.28-7.42(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=401。
中间体24:(2S,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷- 2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯和中间体25:(2R,4R)-4-叠氮基-2-(4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁 基酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(772mg,1.15mmol)和双(二苯基膦)甲烷(883mg,2.30mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(66mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(3.67mL,25.3mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-4-叠氮基-2-(丁-2-烯基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体22,4.60g,11.5mmol)作为DCM(44mL)溶液添加到反应中,并将反应混合物搅拌过夜。将反应混合物用DCM稀释并用水淬灭。分层,并且将该水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,获得(4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体23,2.7g,44%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[Chiralpak IG柱,21.2x 250mm,5μm,温度=23℃,流动相=0-7%MeOH(含0.2%NH4OH):CO2,220nm下UV检测,上样量=16.8mg/进样,浓度=于MeOH中的112.5ng/mL,流速=70mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。主要非对映体中间体25的立体化学指定为反式加成产物,次要非对映体中间体24指定为顺式加成产物。
中间体24(436mg):(2S,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ0.58-0.70(2H,m),1.17(12H,s),1.25-1.40(13H,m),1.74-1.83(1H,s),2.00-2.11(2H,m),2.38-2.47(1H,m),3.07-3.16(1H,m),3.81(1H,m),4.29-4.34(1H,m),5.04-5.17(2H,m),7.34-7.39(m,5H);m/z(ES+)[M+H]+=529。
中间体25(1.60g):(2R,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ0.56-0.73(2H,m),0.98-1.13(1H,m),1.17(12H,s),1.26-1.37(13H,m),1.66-1.79(1H,m),2.01-2.22(2H,m),2.34-2.47(1H,m),3.60(1H,br dd),4.29-4.35(1H,m),5.04-5.18(2H,m),7.31-7.40(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=529。
中间体26:(2S,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2S,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体24,236mg,0.447mmol)溶于乙酸乙酯(4.5mL)中,并用Pd/C(10%wt,119mg,0.112mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,得到产物(中间体26,275mg,100%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.64-0.71(2H,M),1.17(12H,s),1.27-1.40(15H,m),1.57-1.82(4H,m),1.98-2.08(3H,m),3.70-3.78(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=413。
实例6:(2S,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.69mL,8.9mmol)添加到(2S,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体26,184mg,0.446mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(109mg,0.894mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000572
C18Aq,在水中的0至100%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例6,38mg,37%产率)。1H NMR(400MHz,D2O)δ0.72(2H,td),1.09-1.19(1H,m),1.22-1.39(3H,m),1.65-1.76(2H,m),1.95-2.04(1H,m),2.58-2.64(1H,m),2.87-2.94(1H,m),3.48-3.57(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=231。
实例7:(2R,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000571
中间体27:(2R,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体25,688mg,1.30mmol)溶于乙酸乙酯(13mL)和甲醇(4mL)中,并用Pd/C(10%wt,346mg,0.325mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用甲醇冲洗。减压浓缩滤液,得到产物(中间体27,500mg,93%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.67(2H,t),0.94-1.00(1H,m),1.17(12H,s),1.22-1.38(11H,m),1.43-1.53(1H,m),1.85(1H,d),2.00-2.15(2H,m),3.23(2H,dd),3.58-3.61(1H,m),3.80-3.88(1H,m),8.96(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=413。
实例7:(2R,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(1.02mL,13.3mmol)添加到(2R,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体27,275mg,0.667mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(163mg,1.34mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000581
C18Aq,在水中的0至10%至100%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-氨基-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例7,53mg,34%产率)。1H NMR(400MHz,D2O)δ0.76(2H,dt),1.10-1.46(4H,m),1.62-1.71(1H,m),1.84-1.96(1H,m),2.10-2.21(1H,m),2.22-2.32(1H,m),3.07(1H,dd),3.46(1H,dd),3.71(1H,quin);m/z(ES+)[M+H]+=231。
实例8:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000591
中间体28:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丙酰胺基)-2- (4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三乙胺(0.18mL,1.3mmol)和HATU(213mg,0.560mmol)依次添加到Boc-Ala-OH(106mg,0.560mmol)的DMF(2.4mL)溶液中,并在室温下将反应搅拌30min。将(2R,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体27,210mg,0.509mmol)作为DMF(2.4mL)溶液添加到反应混合物中。将反应在室温下搅拌过夜。浓缩粗反应混合物并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)直接纯化,得到呈旋转异构体混合物的产物(中间体28,236mg,79%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.65-0.72(2H,m),1.11-1.18(18H,m),1.26-1.37(20H,m),1.63-1.73(1H,m),2.02-2.25(2H,m),3.09-3.20(1H,m),3.59-3.72(1H,m),3.83-3.94(1H,m),4.18-4.29(1H,m),6.80(1H,brs),7.96(1H,s),13.78(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=584。
实例8:(2R,4R)-4((S)-2-氨基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.62mL,8.1mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体28,236mg,0.404mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(99mg,0.81mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000602
C18Aq,在水中的0至10%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体和旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例8,18mg,15%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.69(2H,dt),1.05-1.14(1H,m),1.21(3H,d),1.23-1.35(3H,m),1.65(1H,dt),1.91-1.96(1H,m),2.17(1H,dd),2.35(1H,dd),3.26(1H,dd),3.46-3.57(2H,m),4.29-4.34(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=302。
实例9:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷- 2-甲酸
Figure BDA0002629295820000601
中间体29:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰 胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三乙胺(0.21mL,1.5mmol)和HATU(254mg,0.668mmol)依次添加到Boc-Val-OH(145mg,0.668mmol)的DMF(2.9mL)溶液中,并在室温下将反应搅拌30min。将(2R,4R)-4-氨基-1-(叔丁氧羰基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体27,250mg,0.606mmol)作为DMF(2.9mL)溶液添加到反应混合物中。将反应在室温下搅拌过夜。浓缩粗反应混合物并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)直接纯化,得到呈旋转异构体混合物的产物(中间体29,250mg,67%产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ0.64-0.73(2H,m),0.73-0.85(6H,m),1.13-1.14(1H,m),1.17(12H,s),1.22-1.42(22H,m),1.56-1.75(1H,m),1.79-1.97(1H,m),2.00-2.26(2H,m),3.08-3.24(1H,m),3.54-3.77(2H,m),4.12-4.36(1H,m),6.58(1H,t),7.96-8.03(2H,m);m/z(ES+)[M+H]+=584。
实例9:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷- 2-甲酸
将三氟乙酸(0.63mL,8.2mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体29,250mg,0.409mmol)的DCM(4mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(99mg,0.81mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用2M氨/甲醇从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000611
C18Aq,在水中的0至10%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体和旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例9,28mg,20%产率)。1HNMR(300MHz,D2O)δ0.66-0.76(2H,m),0.85(6H,dd),1.07-1.43(4H,m),1.55-1.68(1H,m),1.77-1.97(2H,m),2.13-2.33(2H,m),3.07(1H,d),3.08-3.16(1H,m),3.37-3.48(1H,m),4.27-4.40(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=330。
实例10:(2R,4R)-4-((R)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000621
中间体30:(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2- 基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将林德拉催化剂(Lindlar catalyst)(5%wt,0.275g,2.58mmol)添加到(2R,4R)-4-叠氮基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体25,1.56g,2.95mmol)的THF(25mL)溶液中。在室温下将该悬浮液在氢气气氛下(气球,烧瓶抽空并用氢气x3回充)搅拌8.5h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并将滤液浓缩至干。通过硅胶色谱法(于DCM中的1%至15%MeOH)纯化粗物质,得到呈胶质并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,1.01g,68%产率)。1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.74(2H,q),1.20-1.22(14H,m),1.23-1.29(2H,m),1.32(6H,s),1.37-1.42(5H,m),1.74-1.83(1H,m),1.83-1.93(1H,m),2.11-2.19(0.6H,m),2.21-2.32(1.4H,m),3.19(0.4H,dd),3.28(0.6H,dd),3.44-3.51(1H,m),3.63(1H,dd),5.07-5.20(2H,m),7.28-7.34(1H,m),7.34-7.41(4H,m);m/z(ES+)[M+H]+=503。
中间体31:(2R,4R)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4, 5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.235mL,1.34mmol)缓慢添加到经搅拌的HATU(245mg,0.64mmol)和Boc-D-Val-OH(117mg,0.54mmol)的DMF(2mL)溶液中。将溶液搅拌20min,然后添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,270mg,0.54mmol)的DMF(2mL)溶液。将反应搅拌2.5h,用DCM(30mL)稀释,并依次用水(3×25mL)和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的5%至65%EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色泡沫并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基-1-叔丁基酯(中间体31,239mg,63%产率)。1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.74-0.81(2H,m),0.84(3H,d),0.87-0.94(3H,m),1.24(12H,s),1.26-1.34(2H,m),1.37(5H,s),1.40-1.43(2H,m),1.45(4H,s),1.46(9H,s),1.78-1.89(1H,m),1.95-2.07(2H,m),2.21-2.29(0.6H,m),2.31-2.46(1.4H,m),3.51-3.60(1.5H,m),3.65(0.5H,br d),3.72(1H,br dd),4.49-4.58(1H,m),5.01(1H,br d),5.19-5.29(2H,m),6.93-7.09(1H,m),7.36-7.40(1H,m),7.43(4H,app d);m/z(ES+)[M+H]+=702。
中间体32:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰 胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,25mg,0.23mmol)添加到(2R,4R)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体31,239mg,0.34mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。在室温下将该悬浮液在氢气气氛下(气球,烧瓶抽空并用氢气x3回充)搅拌2h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并将滤液浓缩至干。通过硅胶色谱法(于DCM中的2%至15%MeOH)纯化粗物质,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体32,196mg,94%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.63-0.71(2H,m),0.75-0.82(6H,m),1.15(12H,s),1.21-1.30(2H,m),1.32(6H,s),1.36(13H,brs),1.61-1.72(1H,m),1.81-1.90(1H,m),1.92-2.05(2H,m),2.05-2.13(0.6H,m),2.13-2.28(1.4H,m),3.03-3.14(1H,m),3.62(0.6H,t),3.66(1.4H,t),4.18-4.29(1H,m),6.59(1H,d),7.99(1H,br s),12.48(0.4H,br s),12.65(0.6H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=612。
实例10:(2R,4R)-4-((R)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.37mL,4.8mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((R)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体32,195mg,0.32mmol)的DCM(2mL)溶液中。将反应溶液在室温下搅拌22h,然后减压浓缩。将粗氨基酸溶于1M HCl水溶液(2mL)和Et2O(2mL)中。添加苯基硼酸(117mg,0.96mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌5h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000641
C18,在水中的0至80%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((R)-2-氨基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例10,46mg,44%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.73-0.80(2H,m),0.90(6H,app t),1.13-1.25(1H,m),1.26-1.35(1H,m),1.40(2H,quin),1.68-1.80(1H,m),1.85-1.96(1H,m),2.00(1H,td),2.29(1H,dd),2.37-2.45(1H,m),3.18(1H,d),3.28(1H,dd),3.59(1H,dd),4.36-4.49(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=330。
实例11:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡 咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000651
中间体33:(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁 基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.165mL,0.95mmol)缓慢添加到经搅拌的HATU(158mg,0.42mmol)和Boc-Tle-OH(92mg,0.40mmol)的DMF(1.5mL)溶液中。将溶液搅拌15min,然后添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,190mg,0.38mmol)的DMF(1.5mL)溶液。将反应搅拌3h,用EtOAc(30mL)稀释,并依次用水(3×25mL)、饱和NaHCO3水溶液(30mL)和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的5%至65%EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基-1-叔丁基酯(中间体33,261mg,96%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.69(2H,q),0.87(9H,s),1.17(12H,s),1.26(5H,s),1.29-1.32(1H,m),1.34(5H,s),1.38(9H,s),1.72-1.85(1H,m),1.90-2.08(2H,m),2.06-2.18(1H,m),2.22-2.35(2H,m),3.11-3.22(1H,m),3.68-3.81(2H,m),4.23-4.37(1H,m),5.06-5.19(2H,m),6.40(1H,t),7.31-7.40(5H,m),8.11(1H,d);m/z(ES+)[M+Na]+=738。
中间体34:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基 丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,25mg,0.23mmol)添加到(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体33,260mg,0.36mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。在室温下将该悬浮液在氢气气氛下(气球,烧瓶抽空并用氢气x3回充)搅拌15h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并将滤液浓缩至干。通过硅胶色谱法(于DCM中的2至10%MeOH)纯化粗物质,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体34,207mg,91%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.63-0.72(2H,m),0.86(9H,s),1.09-1.20(14H,m),1.21-1.30(2H,m),1.33(5H,s),1.35-1.38(13H,m),1.61-1.73(1H,m),1.89-2.11(2H,m),2.14-2.27(1H,m),3.06-3.14(1H,m),3.59-3.72(1H,m),3.72-3.80(1H,m),4.20-4.30(1H,m),6.35(1H,d),8.08(1H,brs),12.47(0.4H,br s),12.63(0.6H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=626。
实例11:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡 咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.38mL,4.9mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体34,206mg,0.33mmol)的DCM(2mL)溶液中。将反应在室温下搅拌15h,然后减压浓缩。将粗氨基酸溶于1M HCl水溶液(4mL)和Et2O(4mL)中。添加苯基硼酸(120mg,0.99mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌3h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000671
C18,在水中的2至50%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例11,40mg,35%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.72(2H,td),0.89(9H,s),1.10-1.21(1H,m),1.22-1.30(1H,m),1.35(2H,quin),1.64-1.75(1H,m),1.90-2.02(1H,m),2.22-2.34(2H,m),3.04(1H,s),3.22(1H,dd),3.56(1H,dd),4.41(1H,quin);m/z(ES+)[M+H]+=344。
实例12:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-((S)-吡咯烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-2- 甲酸
Figure BDA0002629295820000681
中间体35:(2R,4R)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-2-(4-(4,4,5, 5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.182mL,1.04mmol)缓慢添加到经搅拌的HATU(175mg,0.46mmol)和Boc-Pro-OH(94mg,0.44mmol)的DMF(1.5mL)溶液中。将溶液搅拌20min,然后添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸1.5-苄基1-叔丁基酯(中间体30,210mg,0.42mmol)的DMF(2mL)溶液。将反应搅拌2h,用EtOAc(30mL)稀释,并依次用水(3×25mL)、饱和NaHCO3水溶液和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的5%至100%EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体35,249mg,85%产率)。1HNMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.68-0.79(2H,m),1.20(12H,s),1.31(5H,s),1.36-1.48(16H,m),1.74-1.87(3H,m),1.89-2.10(3H,m),2.13-2.46(2H,m),3.27-3.40(1H,m),3.44(2H,brs),3.50-3.64(2H,m),3.78-4.05(1H,m),4.49(1H,br s),5.10-5.27(2H,m),7.10(1H,brs),7.30-7.42(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=700。
中间体36:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基氨基)吡咯烷-2-甲 酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,25mg,0.23mmol)添加到(2R,4R)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体35,249mg,0.36mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。在室温下将该悬浮液在氢气气氛下(气球,烧瓶抽空并用氢气x3回充)搅拌5h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并将滤液减压浓缩,得到呈无色膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体36,207mg,87%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.66-0.83(2H,m),1.21(12H,s),1.34-1.51(21H,m),1.63-1.97(4H,m),2.06(1H,m),2.11-2.29(2H,m),2.33-2.67(1H,m),3.24-3.52(3H,m),3.53-3.67(1H,m),4.15-4.34(1H,m),4.47-4.74(1H,m),6.76-7.23(1H,m),7.17-7.69(1H,m),9.74(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=610。
实例12:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-((S)-吡咯烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-2- 甲酸
将三氟乙酸(0.518mL,6.73mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-1-(叔丁氧羰基)吡咯烷-2-甲酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体36,205mg,0.34mmol)的DCM(2mL)溶液中。将反应在室温下搅拌2h,然后减压浓缩。将粗氨基酸溶于1M HCl水溶液(4mL)和Et2O(4mL)中。添加苯基硼酸(123mg,1.01mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌2h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000701
C18,在水中的0至50%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-((S)-吡咯烷-2-甲酰胺基)吡咯烷-2-甲酸(实例12,89mg,81%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.70-0.79(2H,m),1.11-1.23(1H,m),1.24-1.33(1H,m),1.34-1.42(2H,m),1.60-1.71(1H,m),1.81-1.91(3H,m),1.91-1.99(1H,m),2.18(1H,dd),2.22-2.29(1H,m),2.40(1H,dd),3.08-3.16(1H,m),3.16-3.22(1H,m),3.25(1H,dd),3.48(1H,dd),3.99(1H,dd),4.29-4.38(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=328。
实例13:(2R,4R)-4-(2-氨基乙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000702
中间体37:(2R,4R)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基- 1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.182mL,1.04mmol)缓慢添加到经搅拌的HATU(175mg,0.46mmol)和Boc-Gly-OH(77mg,0.44mmol)的DMF(1.5mL)溶液中。将溶液搅拌20min,然后添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸1.5-苄基1-叔丁基酯(中间体30,210mg,0.42mmol)的DMF(2mL)溶液。将反应溶液搅拌2h,用EtOAc(30mL)稀释,并依次用水(3×25mL)、饱和NaHCO3水溶液和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的10%至100%EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体37,235mg,85%产率)。
1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.70-0.78(2H,m),1.12-1.18(1H,m),1.20(12H,s),1.25-1.30(1H,m),1.33(5H,s),1.43(15H,s),1.74-1.86(1H,m),1.95(0.5H,br d),2.03(0.5H,br d),2.15-2.26(1H,m),2.26-2.37(1H,m),2.40(1H,dd),3.43-3.57(3H,m),3.57-3.64(1H,m),4.50(1H,br s),5.03(0.5H,br s),5.10(0.5H,br s),5.13-5.25(1H,m),7.01(1H,dd),7.32-7.37(1H,m),7.36-7.41(4H,m);m/z(ES+)[M+H]+=660。
中间体38:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,25mg,0.23mmol)添加到(2R,4R)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体37,233mg,0.35mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。在室温下将该悬浮液在氢气气氛下(气球,烧瓶抽空并用氢气x3回充)搅拌6h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并将滤液浓缩至干,得到呈无色膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体38,176mg,87%产率),其不经进一步纯化即使用。1HNMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.65-0.80(2H,m),1.11-1.18(1H,m),1.18-1.23(12H,m),1.25-1.32(1H,m),1.36-1.45(13H,m),1.47(7H,s),1.70-1.83(0.4H,m),1.84-1.95(0.6H,m),2.06-2.27(2H,m),2.33-2.47(0.4H,m),2.63(0.6H,br d),3.44-3.62(2H,m),3.63-3.82(2H,m),4.28(0.6H,br s),4.36-4.60(0.4H,m),5.26(0.6H,br s),5.58-5.90(0.3H,m),6.83(0.6H,br s),6.97-7.44(0.4H,m);m/z(ES+)[M+H]+=570。
实例13:(2R,4R)-4-(2-氨基乙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(0.476mL,6.18mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-(2-(叔丁氧羰基氨基)乙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体38,176mg,0.31mmol)的DCM(2mL)溶液中。将反应溶液在室温下搅拌2h,然后减压浓缩。将粗氨基酸溶于1M HCl水溶液(4mL)和Et2O(4mL)中。添加苯基硼酸(113mg,0.93mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌2h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000721
C18,在水中的0至40%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-(2-氨基乙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例13,62mg,70%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.76(2H,td),1.15-1.25(1H,m),1.26-1.34(1H,m),1.36-1.46(2H,m),1.69-1.79(1H,m),2.00(1H,ddd),2.27(1H,dd),2.44(1H,dd),3.33(1H,dd),3.42(2H,s),3.59(1H,dd),4.36-4.45(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=288。
实例14:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000731
中间体39:(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧碳基氨基)丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四 甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2,-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将HATU(804mg,2.11mmol)添加到Boc-Abu-OH(430mg,2.11mmol)的DMF(4mL)溶液中,并将反应在室温下搅拌10min。将(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,885mg,1.76mmol)作为DMF(3mL)溶液添加到反应混合物中。添加N,N-二异丙基乙胺(0.75mL,4.3mmol)并将反应在室温下搅拌过夜。然后将反应用水(15mL)和Et2O(10mL)稀释。分层,并用Et2O(2x 10mL)萃取水层。将合并的有机物用5%氯化锂水溶液(10mL)洗涤,经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体39,766mg,63%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.70-0.84(5H,m),1.09-1.19(1H,m),1.21(12H,s),1.36-1.46(18H,m),1.46-1.97(7H,m),2.12-2.45(2H,m),3.45-3.60(1H,m),3.68(1H,br d),3.78-3.94(1H,m),4.42-4.64(1H,m),4.73-5.03(1H,m),5.07-5.33(2H,m),7.09(1H,br d),7.28-7.40(5H,m).m/z(ES+)[M+H]+=688。
中间体40:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧碳基氨基)丁酰胺基)-2- (4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体39,766mg,1.11mmol)溶于EtOAc(11mL)中,并用Pd/C(10重量%,119mg,0.11mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用EtOAc和甲醇冲洗。将滤液浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色泡沫的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体40,470mg,70%产率)。1HNMR(500MHz,CDCl3)δ0.67-0.82(2H,m),0.89(3H,br t),1.11-1.28(14H,m),1.37-1.51(20H,m),1.53-1.65(1H,m),1.65-1.94(2H,m),2.02-2.12(1H,m),2.13-2.31(1H,m),2.70(1H,br d),3.40-3.62(2H,m),3.88-4.04(1H,m),4.26(1H,br s),5.01(1H,br s),6.73(1H,br d);m/z(ES+)[M+H]+=598。
实例14:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将苯基硼酸(192mg,1.57mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体40,470mg,0.79mmol)在2M HCl水溶液(5mL)中的溶液中并将反应在室温下搅拌16h。将反应用水(10mL)和Et2O(10mL)稀释,分层。用Et2O(3x 5mL)洗涤水层,然后冻干成泡沫。真空浓缩有机层。将所得残余物在4M HCl的二噁烷溶液(4mL,16mmol)中稀释,并将所得溶液在室温下搅拌20h。将反应用水(10mL)和Et2O(10mL)稀释,分层。用Et2O(3x 5mL)洗涤水层,然后冻干成泡沫。将来自这两个操作的泡沫合并,并通过离子交换色谱法(Silicycle SiliaSep SPE-R51230B-20X 5g柱)纯化所得粗氨基酸。使用5%的氨的MeOH溶液从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000752
C18Aq,在水中的0至25%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基丁酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例14,96mg,39%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.55-0.82(2H,m),0.88(3H,t),1.12-1.48(4H,m),1.56-1.81(3H,m),1.86-2.10(1H,m),2.12-2.53(2H,m),3.15-3.37(1H,m),3.41-3.53(1H,m),3.62(1H,dd),4.35-4.52(1H,m);m/z(ES+)[M-H2O+H]+=298。
实例15:(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-氨基-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡 咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000751
中间体41:(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基戊酰胺基)-2-(4- (4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁 基酯
将HATU(804mg,2.11mmol)添加到Boc-Ile-OH(489mg,2.11mmol)的DMF(4mL)溶液中,并将反应在室温下搅拌10min。将(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,885mg,1.76mmol)作为DMF(3mL)溶液添加到反应混合物中。添加N,N-二异丙基乙胺(0.75mL,4.3mmol)并将反应在室温下搅拌过夜。然后将反应用水(15mL)和Et2O(10mL)稀释。分层,并用Et2O(2x 10mL)萃取水层。将合并的有机层用5%氯化锂水溶液(10mL)洗涤,经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体41,707mg,56%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.79(2H,br t),0.83-1.05(8H,m),1.12-1.21(1H,m),1.24(12H,s),1.32-1.61(20H,m),1.62-2.02(4H,m),2.18-2.55(2H,m),3.49-3.65(1H,m),3.65-3.78(1H,m),3.90(1H,br s),4.53-4.72(1H,m),4.95(1H,br s),5.07-5.43(2H,m),7.16(1H,br d),7.30-7.44(5H,m).m/z(ES+)[M+H]+=716。
中间体42:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基 戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体41,707mg,0.99mmol)溶于EtOAc(10mL)中,并用Pd/C(10重量%,105mg,0.10mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物通过硅藻土过滤并用EtOAc和甲醇冲洗。将滤液浓缩至干,获得(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体42,603mg,98%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.68-0.80(2H,m),0.83-0.93(6H,m),1.05-1.14(1H,m),1.21(12H,s),1.28-1.36(1H,m),1.37-1.55(22H,m),1.71-1.96(2H,m),2.18-2.31(1H,m),2.72(1H,brd),3.42-3.51(2H,m),3.52-3.63(1H,m),3.86-4.04(1H,m),4.16-4.34(1H,m),4.98(1H,brd),6.69(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=626。
实例15:(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-氨基-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡 咯烷-2-甲酸
将三氟乙酸(1.10mL,14.3mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((2S,3S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体42,603mg,0.96mmol)的DCM(6mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌16h,然后在真空下浓缩。将粗氨基酸溶于Et2O(10mL)中并在真空下再浓缩。这种再溶解和再浓缩过程再重复两次。然后将粗氨基酸溶于Et2O(6mL)和1M HCl水溶液(6mL)中。添加苯基硼酸(235mg,1.93mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌3h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(Silicycle SiliaSep SPE-R51230B-20X 5g柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000771
C18Aq,在水中的0至25%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((2S,3S)-2-氨基-3-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例15,136mg,41%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.55-0.81(2H,m),0.89(6H,dd),1.07-1.52(6H,m),1.63-1.83(2H,m),1.86-2.09(1H,m),2.13-2.51(2H,m),3.11-3.40(2H,m),3.45-3.67(1H,m),4.39-4.54(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=344。
实例16:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000781
中间体43:(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4, 5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将HATU(247mg,0.65mmol)添加到Boc-Leu-OH(125mg,0.54mmol)的DCM(2mL)溶液中,并将反应在室温下搅拌10min。将(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,272mg,0.54mmol)作为DCM(2mL)溶液添加到反应混合物中。添加N,N-二异丙基乙胺(0.19mL,1.1mmol)并将反应在室温下搅拌1h。然后将反应用DCM(20mL)稀释并依次用水(25mL)和饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤。将有机层经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色泡沫并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基-1-叔丁基酯(中间体43,210mg,54%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.77(2H,t),0.91(6H,d),1.06-1.19(1H,m),1.19-1.24(12H,m),1.31-1.51(20H,m),1.50-1.63(2H,m),1.73-2.02(2H,m),2.17-2.55(2H,m),3.35-3.75(2H,m),3.84-4.06(1H,m),4.35-4.75(2H,m),5.00-5.46(2H,m),7.08-7.22(1H,m),7.28-7.42(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=716。
中间体44:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-甲基戊酰 胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)4-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体43,201mg,0.28mmol)溶于EtOAc(4mL)中,并用Pd/C(10重量%,100mg,0.094mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌2h。将反应混合物通过硅藻土过滤并用EtOAc和甲醇冲洗。将滤液浓缩至干,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体44,170mg,97%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.78(2H,t),0.93(6H,d),1.15-1.25(12H,m),1.25-1.31(2H,m),1.39-1.51(19H,m),1.55-1.72(2H,m),1.73-1.89(1H,m),2.01-2.11(1H,m),2.18-2.36(1H,m),2.47-2.83(1H,m),3.37-3.74(2H,m),3.96-4.10(1H,m),4.17-4.32(1H,m),4.82-5.31(1H,m),6.62-7.12(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=626。
实例16:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
将三氟乙酸(1.00mL,13.0mmol)添加到(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体44,170mg,0.27mmol)的DCM(2mL)溶液中。将所得溶液在室温下搅拌2h,然后在真空下浓缩。然后将粗氨基酸溶于Et2O(5mL)和水(4mL)中。添加苯基硼酸(66mg,0.54mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌2h。将混合物用水(5mL)和Et2O(20mL)稀释,分层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 2g柱)纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-4-甲基戊酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例16,88mg,94%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.46-0.68(2H,m),0.73-0.82(6H,m),1.03-1.13(1H,m),1.13-1.23(1H,m),1.23-1.42(4H,m),1.42-1.52(1H,m),1.54-1.66(1H,m),1.76-1.93(1H,m),2.07-2.19(1H,m),2.29(1H,dd),3.13(1H,q),3.34(1H,t),3.48(1H,q),4.23-4.40(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=344。
实例17:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000801
中间体45:(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-(4,4, 5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.108mL,0.62mmol)添加到经搅拌的COMU(292mg,0.68mmol)、(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,311mg,0.62mmol)和Boc-Ser-OH(133mg,0.65mmol)的DMF(5mL)溶液中。将反应搅拌3h,用水(80mL)和EtOAc(15mL)稀释。分离各相,将水相进一步用饱和NaHCO3水溶液稀释,然后用EtOAc(2x 20mL)萃取。将合并的有机物用饱和NaCl水溶液(2x 10mL)洗涤,经MgSO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色干燥膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体45,358mg,84%产率)。1H NMR(500MHz,CDCl3)δ0.76(2H,t),1.16(1H,m),1.21(12H,s),1.31(6H,s),1.35-1.42(5H,m),1.43(11H,s),1.73-1.87(1H,m),1.87-2.02(2H,m),2.14-2.24(1H,m),2.29-2.41(1H,m),3.43-3.52(0.4H,m),3.52-3.61(2H,m),3.66(0.6H,d),3.79-3.92(1H,m),3.92-4.04(1H,m),4.51(1H,br s),5.06-5.26(2H,m),5.36(1H,br s),7.30-7.40(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=690。
中间体46:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰 胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体45,358mg,0.52mmol)溶于EtOAc(4mL)中,并用Pd/C(10重量%,50mg,0.047mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌3.5h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤,浓缩至干,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体46,303mg,97%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.67-0.91(2H,m),1.25(14H,s),1.41-1.47(3H,m),1.48(9H,s),1.53(10H,s),1.82-1.90(2H,m),2.06-2.14(1H,m),2.24-2.33(1H,m),2.76-2.91(1H,m),3.48-3.54(1H,m),3.59(1H,dd),3.70(1H,dd),3.93(1H,d),4.03-4.17(1H,m),4.29(1H,d),6.79-6.98(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=600。
实例17:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(0.771mL,10.01mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体46,300mg,0.50mmol)的DCM(4mL)溶液中。1.5h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(4mL,4.00mmol)和Et2O(4mL)中。添加苯基硼酸(183mg,1.50mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌3h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,分层并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并进行离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000821
C18,在水中的0至30%乙腈)进一步纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-羟基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例17,94mg,59%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.77(2H,td),1.16-1.26(1H,m),1.26-1.35(1H,m),1.35-1.45(2H,m),1.76(1H,ddd),2.02(1H,ddd),2.29(1H,dd),2.46(1H,dd),3.35(1H,dd),3.48(1H,t),3.62(1H,dd),3.66-3.77(2H,m),4.40-4.50(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=318。
实例18:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯 烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000831
中间体47:(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-(4, 4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将N,N-二异丙基乙胺(0.082mL,0.47mmol)添加到经搅拌的COMU(220mg,0.51mmol)、(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,235mg,0.47mmol)和N-Boc-O-甲基-L-丝氨酸(108mg,0.49mmol)的DMF(3mL)溶液中。将反应搅拌2h,然后用水(60mL)和DCM(15mL)稀释。分离各相,将水相用DCM(2x 20mL)萃取。将合并的有机物用饱和NaHCO3水溶液(30mL)、饱和NaCl水溶液(2x 10mL)洗涤,经MgSO4干燥,过滤并减压浓缩。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化所得残余物,得到呈无色干燥膜并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体47,145mg,44%产率)。1HNMR(500MHz,CDCl3)δ0.78(2H,t),1.18(1H,br dd),1.22-1.26(13H,m),1.33(6H,s),1.44(5H,br s),1.46(9H,s),1.57-1.74(1H,m),1.74-1.85(1H,m),1.94(0.4H,d),2.01(0.6H,d),2.18-2.27(0.6H,m),2.32-2.47(1.4H,m),3.32(3H,s),3.39-3.46(1H,m),3.49-3.55(0.4H,m),3.60(1H,dd),3.65-3.76(1.6H,m),4.15(1H,br d),4.51-4.64(1H,m),5.06-5.22(2H,m),5.23-5.34(1H,m),7.32-7.39(5H,m);m/z(ES+)[M+H]+=704。
中间体48:(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙 酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸
将(2R,4R)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体47,145mg,0.21mmol)溶于EtOAc(2mL)中,并用Pd/C(10重量%,22mg,0.021mmol)处理。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌4h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤,浓缩至干,得到呈白色固体并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体48,126mg,100%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,CD2Cl2)δ0.65-0.80(2H,m),1.14-1.29(14H,m),1.35-1.43(5H,m),1.44(7H,s),1.46-1.60(8H,m),1.77-1.95(1H,m),2.03-2.14(1H,m),2.14-2.26(1H,m),2.68(1H,br d),3.33(3H,s),3.38-3.47(1H,m),3.47-3.60(2H,m),3.65-3.76(1H,m),4.02-4.15(1H,m),4.24(1H,br s),5.38(1H,br s),7.06(1H,br s);m/z(ES+)[M+H]+=614。
施例18:(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲氧基丙酰烷胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡 咯烷-2-甲酸
在环境温度下将三氟乙酸(0.25mL,3.26mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-(叔丁氧羰基)-4-((S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-2-甲酸(中间体48,100mg,0.16mmol)的DCM(2mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(2mL,2.00mmol)和Et2O(2mL)中。添加苯基硼酸(60mg,0.49mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌3h。将混合物用Et2O(20mL)和水(5mL)稀释,分层。用Et2O洗涤水层,分层并将水层冻干。将所得固体溶于MeOH(3mL)中并进行离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物。获得的物质通过反相色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000852
C18,在水中的0至20%乙腈)进一步纯化。将产物级分冻干,并将所得物质再次进行反相快速色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000853
C18,在水中的0至2%乙腈)。将产物级分冻干,并将所得物质再次通过反相快速色谱法(RediSep Rf
Figure BDA0002629295820000854
C18,在水中的0至5%乙腈)纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-((S)-2-氨基-3-甲氧基丙酰胺基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例18,18mg,35%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.77(2H,td),1.14-1.27(1H,m),1.27-1.35(1H,m),1.35-1.45(2H,m),1.72-1.81(1H,m),2.02(1H,ddd),2.30(1H,dd),2.41(1H,dd),3.31-3.38(4H,m),3.55-3.60(3H,m),3.63(1H,dd),4.42-4.51(1H,m);m/z(ES+)[M+H]+=332。
实例19:(S)-2-氨基-N-((3R,5R)-8-羟基-6-氧代-7-氧杂-1-氮杂-8-硼杂螺 [4.7]十二烷-3-基)-3-甲基丁酰胺-化合物B
Figure BDA0002629295820000851
经由相互转化过程,通过实例9(化合物A)的分子内环化获得化合物B(实例19)。此外,在各种条件下观察化合物A(实例9)与化合物B之间的相互转化。例如,化合物B在水存在下转化为化合物A,并且这种转化与溶剂中水的浓度成正比。这在图1中得以证明,其中显示了在100%d6-DMSO(标记为A)、75%D2O的d6-DMSO溶液(标记为B)、50%D2O的d6-DMSO溶液(标记为C)、25%D2O的d6-DMSO溶液(标记为E)和100%D2O(标记为F)中制备的化合物B的NMR光谱。在d6-DMSO中,化合物B占优势,而化合物A随D2O浓度的增加成比例增加。在100%D2O中化合物A相对于化合物B的比例达到约90%。此外,化合物B在酸性条件下转化为化合物A。在图2中,化合物B在0.1M DCl(在D2O中)中的NMR光谱证明酸化引起几乎完全转化为化合物A。另外,确定了结晶化合物B和无定形化合物B具有相同的结构形式。在图3中,NMR光谱(在d6-DMSO中获得)表明结晶化合物B和无定形化合物B都具有相同的环状结构。
实例20:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-羟基-3-甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼 基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000861
中间体52:(2R,4R)-4-((S)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-羟基-3-甲基丁酰胺基)- 2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-三氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-三甲酸2-苄基1- (叔丁基)酯
在0℃下将N,N-二异丙基乙胺(0.13mL,0.76mmol)添加到(S)-N-α-叔丁氧羰基-3,3-二甲基-丝氨酸(106mg,0.454mmol)和HATU(0.173g,0.454mmol)的DMF(2.6mL)溶液中,并将反应搅拌15min。添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体30,190mg,0.38mmol)的DMF(1mL)溶液,并将反应搅拌2h,同时缓慢升温至室温。将反应混合物用EtOAc(40mL)稀释,并用饱和NH4Cl水溶液(2x 20mL)、饱和NaHCO3水溶液(2x 20mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的0-50%EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色泡沫并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-((S)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-羟基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(中间体52,223mg,82%产率)。
1H NMR(500MHz,MeOH-d4)δ0.70-0.83(m,2H)1.14-1.27(m,19H)1.31(s,6H)1.36-1.42(m,5H)1.44(s,10H)1.81-1.93(m,1H)2.02-2.14(m,1H)2.14-2.30(m,1H)2.36-2.49(m,1H)3.39-3.48(m,1H)3.73-3.83(m,1H)3.87-3.97(m,1H)4.43-4.53(m,1H)5.09-5.25(m,2H)7.28-7.45(m,5H);m/z(ES+)[M+H]+=718。
实例20:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-羟基-3-甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼 基丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,100mg,0.09mmol)添加到(2R,4R)-4-((S)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-3-羟基-3-甲基丁酰胺基)-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(中间体52,220mg,0.31mmol)的EtOAc(3mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌3h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并浓缩至干。将白色固体溶于DCM(1mL)和三氟乙酸(0.50mL,6.5mmol)中,并将反应在室温下搅拌2h。浓缩溶液,并将所得残余物溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(100mg,0.82mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌2h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-羟基-3-甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例20,92mg,87%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.70(2H,t),1.20(4H,s),1.28(4H,s),1.31-1.40(2H,m),1.77-1.88(1H,m),2.04-2.14(1H,m),2.40-2.47(1H,m),2.48-2.54(1H,m),3.40(1H,dd),3.74(1H,s),3.75-3.80(1H,m),4.47-4.55(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=346。
实例21:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼基 丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000881
中间体53:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]- 2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1- 叔丁基酯
在0℃下将N,N-二异丙基乙胺(0.14mL,0.82mmol)添加到(S)-2-((叔丁氧羰基)氨基)-2,3-二甲基丁酸(0.113g,0.489mmol)和HATU(0.186g,0.489mmol)的DMF(3mL)溶液中,并将反应搅拌15min。添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸3-苄基1-叔丁基酯(中间体30,205mg,0.408mmol)的DMF(1mL)溶液,并将反应搅拌2h,同时缓慢升温至室温。将反应混合物用EtOAc(50mL)稀释,并用饱和NH4Cl水溶液(2x 25mL)、饱和NaHCO3水溶液(2x 25mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的0-50%EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色泡沫并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体53,211mg,72%产率)。
1H NMR(500MHz,MeOH-d4)δ0.72-0.79(2H,m),0.80-0.93(6H,m),1.17-1.25(13H,m),1.31(9H,d),1.36-1.47(16H,m),1.82-1.92(2H,m),1.97-2.09(1H,m),2.15-2.30(1H,m),2.34-2.51(1H,m),3.61-3.75(1H,m),4.42-4.56(1H,m),5.08-5.31(2H,m),7.29-7.46(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=716。
实例21:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼基 丁基)吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,90mg,0.08mmol)添加到(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体53,210mg,0.29mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌3h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并浓缩至干。将白色固体溶于DCM(1mL)和三氟乙酸(0.50mL,6.5mmol)中,并将反应在室温下搅拌2h。浓缩溶液,并将所得残余物溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(100mg,0.82mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌2h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-2,3-二甲基-丁酰基]氨基]-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例21,90mg,89%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.74-0.78(2H,m),0.79(3H,d),0.89(3H,d),1.17-1.27(4H,m),1.28-1.35(1H,m),1.36-1.47(2H,m),1.70-1.81(1H,m),1.93-2.07(2H,m),2.27(1H,dd),2.43(1H,dd),3.27-3.39(1H,m),3.60(1H,dd),4.39-4.48(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=344。
实例22:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-[[(2S)-2,3-二氨基丙酰基]氨基]吡咯 烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000901
中间体54:(2R,4R)-4-[[(2S)-2,3-双(叔丁氧羰基氨基)丙酰基]氨基]-2-[4-(4, 4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在0℃下将N,N-二异丙基乙胺(0.14mL,0.82mmol)添加到Boc-Dap(Boc)-OH·DCHA(0.238g,0.489mmol)和HATU(0.186g,0.489mmol)的DMF(3mL)溶液中,并将反应搅拌15min。添加(2R,4R)-4-氨基-2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基)吡咯烷-1,2-二甲酸16-苄基1-叔丁基酯(中间体30,205mg,0.408mmol)的DMF(1mL)溶液,并将反应搅拌2h,同时缓慢升温至室温。将反应混合物用EtOAc(50mL)稀释,并用饱和NH4Cl水溶液(2x 25mL)、饱和NaHCO3水溶液(2x 25mL)和盐水(20mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(在己烷中的0-50%EtOAc)纯化粗物质,得到呈白色泡沫并且呈旋转异构体混合物的(2R,4R)-4-[[(2S)-2,3-双(叔丁氧羰基氨基)丙酰基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体54,214mg,66%产率)。1H NMR(500MHz,MeOH-d4)δ0.76(2H,q),1.19-1.26(14H,m),1.27-1.34(6H,m),1.37-1.52(24H,m),1.76-1.93(1H,m),2.06-2.31(2H,m),2.50(1H,s),3.19-3.27(2H,m),3.66-3.84(1H,m),4.00-4.13(1H,m),4.35-4.50(1H,m),5.04-5.25(2H,m),7.26-7.50(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=789。
实例22:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-[[(2S)-2,3-二氨基丙酰基]氨基]吡咯 烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,57mg,0.053mmol)添加到(2R,4R)-4-[[(2S)-2,3-双(叔丁氧羰基氨基)丙酰基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体54,210mg,0.27mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌3h。将反应混合物用MeOH稀释,通过硅藻土过滤并浓缩至干。将白色固体溶于DCM(1mL)和三氟乙酸(0.50mL,6.5mmol)中,并将反应在室温下搅拌2h。浓缩溶液,并将所得残余物溶于Et2O(2mL)和1M HCl水溶液(2mL)中。添加苯基硼酸(100mg,0.82mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌3h。将反应混合物用水稀释并用Et2O洗涤。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-[[(2S)-2,3-二氨基丙酰基]氨基]吡咯烷-2-甲酸(实例22,74mg,88%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.71(2H,t),1.11-1.24(1H,m),1.26-1.41(3H,m),1.75-1.89(1H,m),2.00-2.13(1H,m),2.31-2.48(1H,m),2.51-2.67(1H,m),3.39-3.53(3H,m),3.68-3.80(1H,m),4.27(1H,t),4.41-4.52(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=317。
实例23:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000921
中间体55:(2S,4R)-4-(叔丁氧羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯
将二碳酸二叔丁酯(4.41g,20.2mmol)添加到(2S,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸1-(叔丁基)-2-甲基酯草酸盐(4.50g,13.5mmol)和三乙胺(5.63mL,40.4mmol)的DCM(57mL)溶液中并在室温和N2气氛下将反应搅拌过夜。将粗反应混合物用DCM(200mL)稀释,并依次用0.5M HCl(水溶液)、饱和碳酸氢钠和盐水洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(DCM/MeOH)纯化粗物质,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-(叔丁氧羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体55,3.66g,79%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.29-1.42(18H,m),1.96-2.17(2H,m),3.12-3.17(1H,m),3.45-3.56(1H,m),3.62-3.69(3H,m),3.96-4.06(1H,m),4.24-4.34(1H,m),7.17-7.26(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=345。
中间体56:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2- 甲基酯
将氢化钠(60%于矿物油中的分散体)(0.491g,12.3mmol)分批添加到(2S,4R)-4-(叔丁氧基羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体55,3.66g,10.7mmol)的DMF(35mL)溶液中。添加后,将反应搅拌10min,然后添加甲基碘(0.715ml,11.4mmol)并将反应再搅拌3h。将反应混合物冷却至0℃并用水淬灭。将混合物用EtOAc(200mL)稀释,分层。将有机层依次用水和盐水洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈无色油状物的(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体56,3.13g,82%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.28-1.41(18H,m),1.87-2.02(1H,m),2.29-2.44(1H,m),2.69(3H,s),3.13-3.25(1H,m),3.44-3.57(1H,m),3.60-3.68(3H,m),4.23-4.32(1H,m),4.62(1H,br s);m/z:(ES+)[M+H]+=359。
中间体57:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔 丁基酯
在0℃下,将氢氧化钠(2.10g,52.4mmol)的水(11mL)溶液添加到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体56,3.13g,8.73mmol)的THF(22mL)和MeOH(11mL)溶液中。将反应混合物搅拌3h,同时缓慢升温至室温。减压去除挥发物,并且用5M HCl(水溶液)将水层酸化至pH~3并用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩成干燥状态,得到呈白色固体的粗羧酸,其不经进一步纯化即使用。
将苄基溴(1.24mL,10.5mmol)添加到粗羧酸、碘化钠(1.737g,11.59mmol)和K2CO3(3.01g,21.8mmol)的DMF(28mL)溶液中,并在室温下将反应搅拌17h。过滤反应混合物,并用EtOAc冲洗固体。浓缩滤液,并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈无色油状物的(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体57,3.05g,81%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.20-1.42(18H,m),1.91-2.07(1H,m),2.33-2.46(1H,m),2.69(3H,s),3.12-3.26(1H,m),3.44-3.57(1H,m),4.20-4.38(1H,m),4.66(1H,br s),5.07-5.20(2H,m),7.25-7.41(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=435。
中间体58:(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸 2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体57,3.05g,7.02mmol)和巴豆基溴(1.08mL,10.5mmol)溶于THF(25mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。将KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,21.0mL,10.5mmol)滴加到反应混合物中,并将反应搅拌17h,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用水淬灭,并减压去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶纯化法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈黄色油状物并且呈非对映体、E/Z烯烃异构体和旋转异构体混合物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体58,1.26g,37%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.23-1.44(18H,m),1.51-1.70(3H,m),2.00-2.26(2H,m),2.38-2.47(1H,m),2.57-2.68(3H,m),2.71-3.00(1H,m),3.00-3.25(1H,m),3.40-3.74(1H,m),4.54-4.80(1H,m),5.01-5.27(2H,m),5.28-5.47(1H,m),5.49-5.72(1H,m),7.25-7.42(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=489。
中间体59:(4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二 氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(269mg,0.400mmol)和双(二苯基膦)甲烷(308mg,0.801mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(11mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.28mL,8.82mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体58,1.96g,4.01mmol)作为DCM(7.5mL)溶液添加到反应中,并在室温下将反应混合物搅拌16h。将反应混合物冷却至0℃并小心地用MeOH和水淬灭。分层,并且将水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过快速硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化所得残余物,得到呈黄色油状物并且呈非对映体和旋转异构体混合物的(4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体59,2.5g,100%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,30mm×250mm,5μm,温度=20℃,流动相=0-30%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=31mg/进样,浓度=于MeOH中的125mg/mL,流速=75mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。基于实例23和实例24的酶效力回顾性地指定每种非对映体的立体化学与其他示例化合物一致。
中间体60(异构体2,637mg):(2R,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基-1-叔丁基酯。1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.58-0.76(2H,m),1.15(12H,d),1.21-1.47(22H,m),1.69-1.82(1H,m),1.94-2.23(3H,m),2.56-2.62(3H,m),3.19-3.28(1H,m),3.45-3.57(1H,m),4.58-4.79(1H,m),5.01-5.26(2H,m),7.26-7.41(5H,m)。
中间体61(异构体1,860mg):(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1HNMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.62-0.71(2H,m),1.15(12H,s),1.20-1.42(22H,m),1.67-1.84(1H,m),1.92-2.32(3H,m),2.69(3H,s),3.04-3.15(1H,m),3.57-3.71(1H,m),4.52-4.73(1H,m),4.98-5.25(2H,m),7.24-7.40(5H,m)。
中间体62:(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5- 四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,165mg,0.155mmol)添加到(2R,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体60,637mg,1.03mmol)的EtOAc(7mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈白色固体的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体62,350mg,64%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.63-0.73(2H,m),1.14-1.19(12H,m),1.22-1.42(21H,m),1.63-1.77(1H,m),1.99-2.18(3H,m),2.63-2.67(3H,m),3.21-3.27(2H,m),3.41-3.55(1H,m),4.57-4.80(1H,m),12.32-12.75(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=527。
实例23:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(0.51mL,6.7mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体62,350mg,0.66mmol)的DCM(4mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(162mg,1.33mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(60mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸(实例23,140mg,86%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.72-0.82(2H,m),1.09-1.43(4H,m),1.62-1.77(1H,m),1.83-1.95(1H,m),2.23(2H,d),2.46(3H,s),3.02-3.11(1H,m),3.37-3.49(1H,m),3.49-3.61(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=245。
实例24:(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000971
中间体63:(2S,4R)-1-叔丁氧碳基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5- 四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,223mg,0.209mmol)添加到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体61,860mg,1.39mmol)的EtOAc(9.3mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈白色固体的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体63,520mg,71%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.60-0.75(2H,m),1.16(12H,s),1.28-1.45(22H,m),1.56-1.74(1H,m),1.84-1.95(1H,m),2.01-2.22(2H,m),2.69(3H,s),3.01-3.17(1H,m),3.56-3.70(1H,m),4.52-4.73(1H,m),12.35-12.77(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=527。
实例24:(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(1.23mL,16.0mmol)滴加到经搅拌的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体63,520mg,0.80mmol)的DCM(8.5mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(196mg,1.60mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(60mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸(实例24,163mg,83%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.70-0.90(2H,m),1.10-1.46(4H,m),1.65-1.77(2H,m),1.96-2.07(1H,m),2.43(3H,s),2.68-2.77(1H,m),2.96-3.10(1H,m),3.37-3.50(1H,m),3.50-3.60(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=245。
实例25:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820000991
中间体64:(2R,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在室温下将三苯基膦(7.87g,30.0mmol)和水(0.54mL,30.0mmol)添加到(2R,4R)-4-叠氮基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-(叔丁基)酯(5.20g,15.0mmol)的THF(68mL)溶液中。将反应加热至60℃并搅拌6h。将反应混合物冷却至室温,用EtOAc稀释,并依次用水(2x100mL)和饱和氯化钠水溶液(100mL)洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(DCM/MeOH)纯化粗物质,得到呈无色油状物的(2R,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体64,3.2g,67%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.20-1.49(9H,m),1.53-1.64(1H,m),1.65-1.79(2H,m),2.26-2.40(1H,m),2.85-3.01(1H,m),3.31-3.42(1H,m),3.45-3.56(1H,m),4.13-4.24(1H,m),4.99-5.25(2H,m),7.36(5H,s);m/z:(ES+)[M+H]+=321。
中间体65:(2R,4R)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将三乙酰氧基硼氢化钠(6.35g,29.9mmol)分批添加到(2R,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体64,3.20g,9.99mmol)和甲醛(37重量%的H2O溶液,4.46mL,59.9mmol)的MeOH(79mL)溶液中。添加后,将反应在室温下搅拌17h。减压去除挥发物,将所得残余物用DCM稀释。过滤去除固体并将滤液浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc与NH4OH)纯化粗物质,得到(2R,4R)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体65,3.00g,86%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.24(9H,s),1.53-1.67(1H,m),2.10(6H,s),2.40-2.48(1H,m),2.53-2.73(1H,m),2.83-3.06(1H,m),3.59-3.69(1H,m),4.15-4.29(1H,m),5.02-5.21(2H,m),7.26-7.42(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=350。
中间体66:(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔 丁基酯
将(2R,4R)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体65,3.00g,8.61mmol)和巴豆基溴(1.33mL,12.9mmol)溶于THF(18mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。将KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,25.8mL,12.9mmol)滴加到反应混合物中,并将反应搅拌17h,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用水淬灭,并减压去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶纯化法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈黄色油状物并且呈非对映体、E/Z烯烃异构体和旋转异构体混合物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体66,1.55g,45%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.21-1.44(9H,m),1.51-1.70(3H,m),1.79-1.96(1H,m),2.05(6H,s),2.08-2.24(1H,m),2.31-2.43(1H,m),2.54-2.74(1H,m),2.75-3.08(2H,m),3.56-3.86(1H,m),5.00-5.23(2H,m),5.23-5.42(1H,m),5.43-5.73(1H,m),7.23-7.41(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=403。
中间体67:(4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼 烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(240mg,0.36mmol)和双(二苯基膦)甲烷(275mg,0.715mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(10mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.14mL,7.87mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体66,1.44g,3.58mmol)作为DCM(6.7mL)溶液添加到反应中,并在室温下将反应混合物搅拌16h。将反应混合物冷却至0℃并小心地用MeOH和水淬灭。分层,并且将水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过快速硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化所得残余物,得到呈黄色油状物并且呈非对映体和旋转异构体混合物的(4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体67,1.5g,79%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,30mm×250mm,5μm,温度=20℃,流动相=0-15%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=32mg/进样,浓度=于MeOH中的80mg/mL,流速=120mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。基于实例25和实例26的酶效力回顾性地指定每种非对映体的立体化学与其他示例化合物一致。
中间体68(异构体2,190mg):(2R,4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.64-0.71(2H,m),0.97-1.12(1H,m),1.13-1.17(12H,m),1.24(13H,s),1.57-1.81(1H,m),1.81-1.99(1H,m),2.06(6H,s),2.09-2.21(1H,m),2.55-2.74(1H,m),3.02-3.12(1H,m),3.59-3.70(1H,m),5.00-5.20(2H,m),7.27-7.41(5H,m)。
中间体69(异构体1,491mg):(2S,4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.52-0.72(2H,m),0.93-1.12(1H,m),1.12-1.20(12H,m),1.20-1.39(13H,m),1.59-1.74(1H,m),1.77-1.93(1H,m),2.06(6H,s),2.08-2.15(1H,m),2.53-2.65(1H,m),2.78-2.96(1H,m),3.67-3.82(1H,m),5.00-5.21(2H,m),7.27-7.42(5H,m)。
中间体70:(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1, 3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷2-甲酸
将Pd/C(10%wt,57mg,0.054mmol)添加到(2R,4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体68,189mg,0.356mmol)的EtOAc(2.4mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干,获得呈白色固体的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体70,150mg,96%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.53-0.70(2H,m),1.11-1.20(12H,m),1.21-1.41(14H,m),1.56-1.71(1H,m),1.92-2.06(2H,m),2.20(7H,s),2.69-2.78(1H,m),3.37-3.51(1H,m),3.67-4.21(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=441。
实例25:(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(0.26mL,3.4mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体70,150mg,0.34mmol)的DCM(2mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(83mg,0.68mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸(实例25,73mg,83%产率)。
1H NMR(500MHz,D2O)δ0.62-0.73(2H,m),1.14-1.36(4H,m),1.79-1.90(1H,m),1.99-2.10(1H,m),2.57-2.73(2H,m),2.82-2.90(6H,m),3.48-3.56(1H,m),3.89-3.98(1H,m),4.12-4.20(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=259。
实例26:(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820001031
中间体71:(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1, 3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷2-甲酸
将Pd/C(10%wt,148mg,0.139mmol)添加到(2S,4R)-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体69,490mg,0.93mmol)的EtOAc(6.7mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干,获得呈白色固体的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体71,405mg,99%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.52-0.71(2H,m),0.83-1.06(1H,m),1.16(12H,s),1.32(12H,s),1.53-1.67(1H,m),1.75-1.88(1H,m),2.01-2.13(7H,m),2.54-2.69(1H,m),2.79-2.95(1H,m),3.66-3.83(1H,m),7.24-7.46(1H,m),11.86-12.88(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=441。
实例26:(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(1.0mL,13mmol)滴加到经搅拌的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-(二甲基氨基)-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体71,405mg,0.919mmol)的DCM(5.1mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(224mg,1.84mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(60mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2S,4R)-2-(4-二羟硼基丁基)-4-(二甲基氨基)吡咯烷-2-甲酸(实例26,206mg,87%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.71-0.89(2H,m),1.12-1.44(4H,m),1.70-1.82(2H,m),1.97-2.11(1H,m),2.29(6H,s),2.62-2.71(1H,m),2.95-3.10(2H,m),3.61-3.68(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=259。
实例27:(2R,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820001051
中间体72:(2S,4R)-4-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔 丁基2-甲基酯
将乙酸(42μL,0.73mmol)添加到(2S,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸1-(叔丁基)2-甲基酯(7.48g,30.6mmol)和(2-氧代乙基)氨基甲酸叔丁酯(4.64g,29.2mmol)的MeOH(194mL)溶液中,将反应在室温下搅拌3h。将溶液冷却至0℃并分批添加三乙酰氧基硼氢化钠(9.27g,43.7mmol)。将反应搅拌过夜,同时缓慢升温至室温。减压浓缩反应混合物并用DCM稀释所得残余物,依次用饱和碳酸氢钠、水和饱和氯化钠洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(DCM/EtOAc/MeOH)纯化粗物质,得到呈无色油状物的(2S,4R)-4-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体72,4.77g,42%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.25-1.48(20H,m),1.84-2.07(3H,m),2.88-2.98(2H,m),3.02-3.17(1H,m),3.17-3.27(1H,m),3.40-3.51(1H,m),3.64(3H,s),4.14-4.24(1H,m),6.63-6.74(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=388。
中间体73:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1, 2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯
在室温下将二碳酸二叔丁酯(4.29mL,18.5mmol)添加到(2S,4R)-4-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体72,4.77g,12.3mmol)和N,N-二异丙基乙胺(4.30mL,24.6mmol)的DCM(53mL)溶液中并将反应搅拌17h。将反应混合物用DCM稀释,依次用水和饱和氯化钠水溶液洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体73,4.25mg,71%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.21-1.27(1H,m),1.27-1.42(27H,m),1.99-2.07(1H,m),2.33-2.46(1H,m),2.93-3.14(3H,m),3.17-3.24(1H,m),3.48-3.61(1H,m),3.61-3.69(3H,m),4.20-4.44(2H,m),6.79-6.94(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=488。
中间体74:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1, 2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
在0℃下将氢氧化钠(2.09g,52.3mmol)的水(11mL)溶液添加到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-叔丁基2-甲基酯(中间体73,4.25g,8.72mmol)的THF(22mL)和MeOH(11mL)溶液中。将反应混合物搅拌6h,同时缓慢升温至室温。减压去除挥发物,并且用5M HCl(水溶液)将水层酸化至pH~3并用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩成干燥状态,得到呈白色固体的粗羧酸,其不经进一步纯化即使用。
将苄基溴(1.24mL,10.5mmol)添加到粗羧酸、碘化钠(1.96g,13.1mmol)和K2CO3(3.62g,26.2mmol)的DMF(28mL)溶液中,并在室温下将反应搅拌17h。过滤反应混合物,并用EtOAc冲洗固体。浓缩滤液,并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体74,3.91g,80%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.20-1.47(27H,m),2.00-2.13(1H,m),2.36-2.45(1H,m),2.93-3.01(2H,m),3.02-3.26(3H,m),3.48-3.64(1H,m),4.26-4.43(2H,m),5.05-5.22(2H,m),6.78-6.93(1H,m),7.25-7.41(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=564。
中间体75:(4R)-2-[丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨 基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体74,3.91g,6.94mmol)和巴豆基溴(0.93mL,9.0mmol)溶于THF(10.6mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。将KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,34.7mL,17.3mmol)滴加到反应混合物中,并将反应搅拌17h,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用水淬灭,并减压去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶纯化法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈黄色油状物并且呈非对映体、E/Z烯烃异构体和旋转异构体混合物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体75,1.34g,31%产率)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.21-1.45(27H,m),1.53-1.71(3H,m),1.91-2.32(2H,m),2.37-2.47(1H,m),2.69-2.86(1H,m),2.86-3.11(4H,m),3.46-3.58(1H,m),3.58-3.77(1H,m),4.29-4.57(1H,m),5.00-5.20(2H,m),5.28-5.46(1H,m),5.46-5.71(1H,m),6.83-7.00(1H,m),7.19-7.43(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=618。
中间体76:(4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4, 5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(222mg,0.331mmol)和双(二苯基膦)甲烷(254mg,0.661mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(9mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.05mL,7.26mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体75,2.04g,3.30mmol)作为DCM(6.1mL)溶液添加到反应中,并在室温下将反应混合物搅拌16h。将反应混合物冷却至0℃并小心地用MeOH和水淬灭。分层,并且将水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过快速硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化所得残余物,得到呈黄色油状物并且呈非对映体和旋转异构体混合物的(4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体76,1.14g,46%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,30×250mm,5μm,温度=20℃,流动相=0-20%IPA(含0.2%NH4OH):CO2,220nm下UV检测,上样量=18mg/进样,浓度=于MeOH中的46mg/mL,流速=120mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。基于实例27和实例28的酶效力回顾性地指定每种非对映体的立体化学与其他示例化合物一致。
中间体77(异构体2,347mg):(2R,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.60-0.76(2H,m),1.15(12H,s),1.21-1.52(31H,m),1.66-1.82(1H,m),1.96-2.19(2H,m),2.19-2.33(1H,m),2.83-3.10(4H,m),3.48-3.66(1H,m),4.34-4.53(1H,m),5.00-5.23(2H,m),6.83-6.93(1H,m),7.25-7.43(5H,m)。
中间体78(异构体1,540mg):(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.61-0.76(2H,m),1.15(12H,s),1.21-1.47(31H,m),1.61-1.80(1H,m),1.93-2.24(2H,m),2.26-2.43(1H,m),2.89-3.13(5H,m),3.60-3.81(1H,m),4.33-4.49(1H,m),5.00-5.20(2H,m),6.86-6.94(1H,m),7.27-7.39(5H,m)。
中间体79:(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2叔丁氧羰基氨基)乙基]氨 基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,99mg,0.093mmol)添加到(2R,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体77,347mg,0.465mmol)的EtOAc(2.3mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干,获得呈白色固体的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体79,287mg,94%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.65-0.74(2H,m),1.14-1.21(12H,m),1.31-1.43(31H,m),1.66-1.76(1H,m),2.00-2.27(3H,m),2.96-3.12(5H,m),3.37-3.42(1H,m),3.49-3.61(1H,m),4.34-4.49(1H,m),6.84-6.93(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=656。
实例27:(2R,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(0.67mL,8.8mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体79,287mg,0.438mmol)的DCM(3.7mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(107mg,0.878mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例27,106mg,89%产率)。1HNMR(500MHz,D2O)δ0.63-0.77(2H,m),1.13-1.23(1H,m),1.37(3H,br d),1.63-1.76(1H,m),1.92-2.02(1H,m),2.06-2.14(1H,m),2.24-2.33(1H,m),2.78(2H,s),2.96(2H,s),3.08-3.19(1H,m),3.28-3.43(1H,m),3.43-3.51(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=274。
实例28:(2S,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820001101
中间体80:(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基] 氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,137mg,0.129mmol)添加到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸2-苄基1-叔丁基酯(中间体78,480mg,0.64mmol)的EtOAc(7.2mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈白色固体的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体80,170mg,40%产率)。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.58-0.73(2H,m),1.15(12H,s),1.37(31H,br d),1.58-1.74(2H,m),2.18-2.33(2H,m),2.92-3.16(6H,m),3.59-3.73(1H,m),4.31-4.50(1H,m),6.84-6.95(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=656。
实例28:(2S,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(1.00mL,13.0mmol)滴加到经搅拌的(2S,4R)-1-叔丁氧羰基-4-[叔丁氧羰基-[2-(叔丁氧羰基氨基)乙基]氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体80,170mg,0.26mmol)的DCM(5mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(63mg,0.52mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 20cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(20mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-(2-氨基乙基氨基)-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例28,67mg,95%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.65-0.77(2H,m),1.11-1.24(1H,m),1.25-1.34(1H,m),1.34-1.42(2H,m),1.62-1.79(2H,m),1.97-2.06(1H,m),2.61-2.70(1H,m),2.72-2.84(2H,m),2.93(3H,s),3.30-3.41(1H,m),3.47-3.55(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=274。
实例29:(2R,4R)-4-[[2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼基 丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820001121
中间体81:(2S,4R)-4-(叔丁氧羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲基酯
将二碳酸二叔丁酯(6.27g,28.8mmol)添加到(2S,4R)-4-氨基吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基-2-甲基酯(5.00g,18.0mmol)和三乙胺(5.00mL,35.9mmol)的DCM(78ml)溶液中,并将反应在室温下搅拌16h。将反应混合物用DCM稀释,并依次用0.5M HCl(水溶液)、饱和碳酸氢钠和饱和氯化钠洗涤。将有机层经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶色谱法(DCM/MeOH)纯化粗物质,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-(叔丁氧羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲基酯(中间体81,5.4g,79%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.31-1.42(9H,m),1.99-2.23(2H,m),3.22-3.28(1H,m),3.52-3.65(4H,m),3.96-4.10(1H,m),4.30-4.48(1H,m),4.92-5.13(2H,m),7.18-7.41(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=379。
中间体82:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲 基酯
在0℃下将氢化钠(60%于矿物油中的分散体)(0.423g,12.3mmol)分批添加到(2S,4R)-4-(叔丁氧基羰基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲基酯(中间体81,3.20g,8.46mmol)的DMF(33mL)溶液中。在0℃下搅拌反应混合物1h,之后在搅拌下升温至室温再保持1h。添加甲基碘(0.63ml,10.2mmol)并将反应在室温下搅拌16h。将反应混合物冷却至0℃并用水淬灭。减压去除挥发物并用DCM(200mL)稀释悬浮液。分层,依次用水(4x 50mL)和饱和氯化钠水溶液(2x 50mL)洗涤有机层。经Na2SO4干燥有机层,过滤并浓缩至干,得到呈无色油状物的(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲基酯(中间体82,2.33g,70%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.25-1.47(9H,m),1.89-2.08(1H,m),2.31-2.46(1H,m),2.69(3H,d),3.22-3.39(2H,m),3.65(4H,s),4.22-4.49(1H,m),4.87-5.17(2H,m),7.18-7.46(5H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=393。
中间体83:(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯
在0℃下将氢氧化钠(1.425g,35.62mmol)的水(7.5mL)溶液添加到(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸1-苄基2-甲基酯(中间体82,2.33g,5.94mmol)的THF(15mL)和MeOH(7.5mL)溶液中。将反应混合物搅拌6h,同时缓慢升温至室温。减压去除挥发物,并且用5M HCl(水溶液)将水层酸化至pH~3并用DCM(4×50mL)萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩成干燥状态,得到呈白色固体的粗羧酸,其不经进一步纯化即使用。
将苄基溴(0.66mL,5.6mmol)添加到粗羧酸、碘化钠(1.11g,7.38mmol)和K2CO3(1.92g,13.9mmol)的DMF(28mL)溶液中,并在室温下将反应搅拌17h。过滤反应混合物,并用EtOAc冲洗固体。浓缩滤液,并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化,得到呈浅黄色油状物的(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体83,2.45g,94%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.28-1.45(9H,m),1.98(1H,s),2.30-2.46(1H,m),2.64-2.71(3H,m),3.30(1H,s),3.51-3.76(1H,m),4.48(1H,d),4.53-4.75(1H,m),4.88-5.21(4H,m),7.18-7.42(10H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=469。
中间体84:(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二 苄酯
将(2S,4R)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体83,2.45g,5.23mmol)和巴豆基溴(0.81mL,7.8mmol)溶于THF(18mL)中,并在N2气氛下将溶液冷却至-78℃。将KHMDS溶液(0.5M于甲苯中,15.7mL,7.85mmol)滴加到反应混合物中,并将反应搅拌17h,同时缓慢升温至室温。将粗反应混合物用水淬灭,并减压去除挥发物。将粗混合物在DCM中稀释,分层。用水洗涤有机层,经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过硅胶纯化法(己烷/EtOAc)纯化粗物质,得到呈黄色油状物并且呈非对映体、E/Z烯烃异构体和旋转异构体混合物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体84,2.10g,86%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.31-1.40(9H,m),1.46-1.68(3H,m),1.99-2.31(2H,m),2.40-2.47(1H,m),2.55-2.68(3H,m),2.69-3.00(1H,m),3.30(1H,s),3.51-3.77(1H,m),4.55-4.74(1H,m),4.79-5.21(4H,m),5.26-5.41(1H,m),5.42-5.71(1H,m),7.16-7.42(10H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=523。
中间体85:(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯
将三氟乙酸(3.84mL,50.2mmol)滴加到二苄基(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[叔丁氧羰基(甲基)氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体84,2.10g,4.02mmol)的DCM(32mL)溶液中,并将反应在室温下搅拌2h。将反应混合物浓缩至干,得到呈无色油状物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯的TFA盐(中间体85,2.55g,100%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ1.45-1.74(3H,m),2.14-2.33(1H,m),2.34-2.46(1H,m),2.57-2.65(3H,m),2.66-3.07(1H,m),3.15-3.56(1H,m),3.66-3.77(1H,m),3.81-4.13(1H,m),4.79-5.22(4H,m),5.26-5.73(2H,m),7.20-7.41(10H,m),8.62-8.87(2H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=423。
中间体86:(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰 基]-甲基-氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯
将N,N-二异丙基乙胺(0.70mL,4.0mmol)添加到HATU(1.52,4.02mmol)和Boc-Val-OH(873mg,4.02mmol)的DMF(15mL)溶液中并在室温下将反应搅拌30min。添加(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-(甲基氨基)吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯TFA盐(中间体85,2.16g,4.02mmol)的DMF(15mL)溶液和N,N-二异丙基乙胺(0.70mL,4.0mmol)并将反应在室温下再搅拌17h。浓缩反应混合物,并通过硅胶色谱法(己烷/EtOAc)直接纯化,得到呈旋转异构体混合物的(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体86,1.97g,79%产率)。1H NMR(500MHz,DMSO-d61H NMR(500MHz,DMSO-d6)0.61-0.92(6H,m),1.35(9H,br s),1.62(3H,br d),1.79-1.92(1H,m),2.03-2.33(2H,m),2.57-2.76(2H,m),2.76-3.00(3H,m),3.30(1H,s),3.49-3.77(1H,m),4.04-4.16(1H,m),4.78-5.20(5H,m),5.26-5.72(2H,m),6.72-7.03(1H,m),7.17-7.38(10H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=622。
中间体87:(4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]- 2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯
将双(1,5-环辛二烯)二铱(I)二氯化物(213mg,0.317mmol)和双(二苯基膦)甲烷(244mg,0.635mmol)添加到经烘箱干燥的圆底烧瓶中。密封烧瓶并用N2吹扫。将固体溶于DCM(8.9mL)中,并将4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷(1.01mL,6.97mmol)缓慢添加到该溶液中。将反应在室温下搅拌10min。将(4R)-2-(丁-2-烯基)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体86,1.97g,3.17mmol)作为DCM(5.9mL)溶液添加到反应中,并在室温下将反应混合物搅拌16h。将反应混合物冷却至0℃并小心地用MeOH和水淬灭。分层,并且将水层用DCM萃取。将合并的有机物经Na2SO4干燥,过滤并浓缩至干。通过快速硅胶色谱法(己烷/EtOAc)纯化所得残余物,得到呈黄色油状物并且呈非对映体和旋转异构体混合物的(4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体87,1.5g,63%产率)。使经纯化的物质经受手性SFC[(S,S)Whelk-O1柱,30x 250mm,5μm,温度=20℃,流动相=0-30%MeOH:CO2,220nm下UV检测,上样量=31mg/进样,浓度=于MeOH中的125mg/mL,流速=75mL/min,出口压力=100巴],得到两种非对映体。基于实例29和实例30的酶效力回顾性地指定每种非对映体的立体化学与其他示例化合物一致。
中间体88(异构体2,280mg):(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.51-0.70(2H,m),0.72-0.93(6H,m),1.14(12H,s),1.20-1.52(13H,m),1.67-2.31(5H,m),2.54-2.90(3H,m),3.33-3.48(1H,m),3.49-3.85(1H,m),4.01-4.18(1H,m),4.71-5.23(5H,m),6.71-7.07(1H,m),7.19-7.33(10H,m)。
中间体89(异构体1,590mg):(2S,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.49-0.72(2H,m),0.73-0.90(6H,m),1.15(12H,s),1.34(13H,br s),1.59-2.34(5H,m),2.94(3H,br s),3.30(1H,s),3.63-3.76(1H,m),3.96-4.17(1H,m),4.75-5.18(5H,m),6.71-7.05(1H,m),7.17-7.41(10H,m)。
中间体90:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨 基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,99mg,0.093mmol)添加到(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体88,280mg,0.37mmol)的EtOAc(1.8mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌4h。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干,获得呈白色固体的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体90,180mg,92%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.59-0.69(2H,m),0.74-0.87(6H,m),1.16(12H,s),1.22-1.30(3H,m),1.35(9H,s),1.49-1.65(1H,m),1.65-1.82(1H,m),1.82-1.95(2H,m),2.15-2.26(1H,m),2.63-2.91(3H,m),2.92-3.21(3H,m),4.05-4.22(1H,m),4.80-5.16(1H,m),6.76(1H,s),7.56-8.05(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=526。
实例29:(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼 基丁基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(0.53mL,6.9mmol)滴加到经搅拌的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体90,180mg,0.34mmol)的DCM(10mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(84mg,0.69mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(60mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2R,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例29,98mg,86%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.72-0.83(2H,m),0.85-1.01(6H,m),1.10-1.45(4H,m),1.61-1.84(1H,m),1.85-2.03(2H,m),2.19-2.34(1H,m),2.34-2.49(1H,m),3.00(3H,s),3.16-3.51(2H,m),3.76-3.96(1H,m),4.95-5.10(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=344。
实例30:(2S,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼 基丁基)吡咯烷-2-甲酸
Figure BDA0002629295820001191
中间体91:(2S,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]- 2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸
将Pd/C(10%wt,209mg,0.196mmol)添加到(2S,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-1,2-二甲酸二苄酯(中间体89,590mg,0.79mmol)的EtOAc(4mL)溶液中。为烧瓶装配H2气球,并将悬浮液在室温下搅拌过夜。将反应混合物用MeOH稀释并通过硅藻土过滤。将滤液浓缩至干,获得呈白色固体的(2S,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体91,397mg,96%产率),其不经进一步纯化即使用。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ0.58-0.67(2H,m),0.73-0.87(6H,m),1.16(12H,s),1.22-1.31(3H,m),1.35(9H,s),1.51-1.67(1H,m),1.68-1.95(3H,m),2.28-2.37(2H,m),2.95(4H,s),4.05-4.20(1H,m),4.66-4.79(1H,m),6.65-6.90(1H,m),7.85-8.15(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=526。
实例30:(2S,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼 基丁基)吡咯烷-2-甲酸
在室温下将三氟乙酸(1.17mL,15.2mmol)滴加到经搅拌的(2S,4R)-4-[[(2S)-2-(叔丁氧羰基氨基)-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂环戊硼烷-2-基)丁基]吡咯烷-2-甲酸(中间体91,397mg,0.755mmol)的DCM(10mL)溶液中。1h后,将溶液减压浓缩并将所得残余物溶于1M HCl水溶液(5mL)和Et2O(5mL)中。添加苯基硼酸(186mg,1.52mmol)并将澄清的两相溶液在室温下搅拌1h。将混合物用Et2O和水稀释,分层。用Et2O洗涤水层。将水层冻干并通过离子交换色谱法(PoraPak Rxn CX 60cc柱)纯化。使用5%的氨的MeOH溶液(60mL)从柱上洗脱所需产物,得到呈白色固体的(2S,4R)-4-[[(2S)-2-氨基-3-甲基-丁酰基]-甲基-氨基]-2-(4-二羟硼基丁基)吡咯烷-2-甲酸(实例30,163mg,92%产率)。1H NMR(500MHz,D2O)δ0.68-0.78(2H,m),0.83-0.94(6H,m),1.10-1.41(4H,m),1.66-2.13(4H,m),2.49-2.68(1H,m),3.02(3H,s),3.22-3.30(1H,m),3.43-3.60(1H,m),3.70-3.88(1H,m),4.53-4.66(1H,m);m/z:(ES+)[M+H]+=344。
实例31:实例1至30的生物活性
通过使用由大肠杆菌(E.coli.)产生的重组精氨酸酶1或精氨酸酶2测量硫代精氨酸形成硫醇基团来量化实例1至30对人精氨酸酶1和精氨酸酶2活性的抑制作用。用Ellman试剂5,5′-二硫代双(2-硝基苯甲酸)(DTNB)检测硫醇基团。DTNB与硫醇反应产生混合的二硫化物和2-硝基-5-硫代苯甲酸(TNB),后者通过在412nm下阴离子(TNB2-)的吸光度量化。
测定在透明的384孔板(Greiner目录号:781101)中进行。使用Echo声学分配器将300nL DMSO中不同浓度的实例1至30分配至测定板,然后立即进行板密封和离心。
由紧临添加到测定板之前解冻的试剂制备两种预混合物。预混合物1在由以下成分组成的测定缓冲液中包含终浓度为5nM的人精氨酸酶1或人精氨酸酶2和0.5mM的DTNB:45mM HEPES pH7.5、brij 35(0.045%(w/v))和100μM MnCl2。预混合物2在测定缓冲液中包含新鲜解冻的0.5mM硫代精氨酸。将15微升预混合物1分配到含有实例1至30的测定板中,离心并在室温下温育30min,然后添加15微升预混物2。
将测定板离心,然后在Pherastar多模式酶标仪中读取412nm下的吸光度,以收集时间点0(T0)的数据。将板在室温下温育60min,然后再次读数以收集时间点1(T1)的数据。通过从T1(时间点1)测得的值中减去T0(时间点0)测得的A412信号来得到数据。使用以下等式将数据转换为效应%:
化合物效应%=100*[(X-最小值)/(最大值-最小值)],其中X表示基于最小值(媒介物)和最大值(参比化合物)抑制对照的化合物归一化值。
通过相对于试验化合物浓度绘制效应%并使用Genedata Screener Smart拟合算法拟合数据来计算将活性抑制50%的实例1至30的浓度(即,IC50)。这些测定的结果见表2:
表2
Figure BDA0002629295820001211
Figure BDA0002629295820001221
实例32:生物利用度研究
实例8、9和13至20是实例7的前药形式。进行以下药代动力学研究以证明来自实例8的实例7的生物利用度。将实例8在0.9%w/v盐水pH4(用1M HCl调节)中配制以供静脉给药。将配制品以2mg/kg通过股骨导管向两只雄性大鼠给药(各170-250g)。在给药后0.033h、0.083h、0.167h、0.5h、1h、2h、4h、8h和24h采集颈静脉导管连续血样。对于口服给药,将实例8在去离子水pH 4(用1M HCl调节)中配制,并以5mg/kg通过口服灌胃向两只雄性大鼠给药(各170g-250g)。在给药后0.25h、0.5h、1h、1.5h、2h、3h、4h、8h和24h通过颈静脉导管采集连续血样。使用低速离心由血液产生血浆样品。通过掺入空白血浆来制备一组含实例7和实例8的校准用标准品。通过用两倍体积的乙腈沉淀,然后离心来萃取样品和标准品。获得的结果用于确定实例7和实例8的Cl(mL/min/kg)、Vdss(L/kg)、Cmax(μM)、AUC(μM h)、tmax(h)和%F。通过比较实例7作为实例8给药时的口服剂量归一化AUC与实例7作为实例7给药时的剂量归一化IV AUC来测定绝对生物利用度。适当时,使用测得的剂量而非标称剂量来计算生物利用度。以类似的方式,对实例9和13至20重复相同的程序。结果如表3至表12所示。这些结果表明,通过掺入某些氨基酸部分作为前药可以提高生物利用度。
表3
实例8 实例7
Cl(mL/min/kg) NV<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) NV<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) NV<sup>#</sup> 3.60<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) NV<sup>#</sup> 10.40<sup>#</sup>
Tmax(h) NV<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F NV<sup>#</sup> 33.00<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表4
实例9 实例7
Cl(mL/min/kg) 33.30<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.20<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) 0.60<sup>#</sup> 5.70<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) 0.24<sup>#</sup> 16.80<sup>#</sup>
Tmax(h) 0.25<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F 3.20<sup>#</sup> 59.00<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表5
实例13 实例7
Cl(mL/min/kg) 17.90<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.20<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) 0.46<sup>#</sup> 3.30<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) 0.62<sup>#</sup> 13.30<sup>#</sup>
Tmax(h) 0.50<sup>#</sup> 1.25<sup>#</sup>
%F 3.80<sup>#</sup> 40.70<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表6
实例14 实例7
Cl(mL/min/kg) NV<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) NV<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) NV<sup>#</sup> 3.80<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) NV<sup>#</sup> 8.90<sup>#</sup>
Tmax(h) NV<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F NV<sup>#</sup> 29.90<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表7
实例15 实例7
Cl(mL/min/kg) 104.00<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.46<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) NV<sup>#</sup> 5.70<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) NV<sup>#</sup> 15.60<sup>#</sup>
Tmax(h) NV<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F NV<sup>#</sup> 57.10<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表8
实例16 实例7
Cl(mL/min/kg) 585.00<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 7.41<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) NV<sup>#</sup> 1.60<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) NV<sup>#</sup> 5.80<sup>#</sup>
Tmax(h) NV<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F NV<sup>#</sup> 17.00<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表9
实例17 实例7
Cl(mL/min/kg) 40.50<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.36<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) 0.43<sup>#</sup> 4.90<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) 0.38<sup>#</sup> 18.30<sup>#</sup>
Tmax(h) 0.38<sup>#</sup> 1.50<sup>#</sup>
%F 5.80<sup>#</sup> 61.90<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表10
实例18 实例7
Cl(mL/min/kg) 317.00<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.64<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) NV<sup>#</sup> 4.10<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) NV<sup>#</sup> 13.10<sup>#</sup>
Tmax(h) NV<sup>#</sup> 1.50<sup>#</sup>
%F NV<sup>#</sup> 45.70<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表11
实例19 实例7
Cl(mL/min/kg) 36.80<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.20<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) 0.33<sup>#</sup> 5.70<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) 0.21<sup>#</sup> 16.80<sup>#</sup>
Tmax(h) 0.25<sup>#</sup> 1.00<sup>#</sup>
%F 2.50<sup>#</sup> 59.00<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值
表12
实例20 实例7
Cl(mL/min/kg) 8.90<sup>#</sup> 8.90*
Vdss(L/kg) 0.29<sup>#</sup> 0.26*
PO Cmax(μM) 1.80<sup>#</sup> 2.20<sup>#</sup>
PO AUC(μM.h) 6.90<sup>#</sup> 12.20<sup>#</sup>
Tmax(h) 1.00<sup>#</sup> 3.50<sup>#</sup>
%F 25.50<sup>#</sup> 59.00<sup>#</sup>
#前药给药时的观测值*作为有效载荷给药时的观测值。NV没有可报告的值

Claims (24)

1.一种具有式(I)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000011
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d,并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R1d为H或-CH3
2.一种具有式(II)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000012
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为-H或-CH3
3.一种具有式(III)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000021
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和-CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
4.一种具有式(IV)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000022
其中R4为-OH或-NH2
5.一种具有式(V)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000023
6.一种具有式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000024
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
7.一种具有式(VI)的化合物或其药学上可接受的盐;其中
R6a为-H或-CH3;并且R6b是被0个或1个氨基取代的-(C1-C3)烷基;或可替代地,
R6a为-H或-CH3;R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;R6c是被0个或1个氨基或-OH取代的-(C1-C3)烷基;并且R6d为H或-CH3
8.一种具有式(Ib)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000031
其中
R1为-NHR1a
R1a为-H或-C(O)CH(R1b)NHR1c;并且
R1b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR1d,并且R1c为-H;或
R1b和R1c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R1d为H或-CH3
9.一种具有式(IIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000032
其中
R2为-OH或-NHR2a
R2a为-H或-C(O)CH(R2b)NHR2c
R2b选自-H、-(C1-C4)烷基和CH2OR2d并且R2c为-H;或
R2b和R2c与它们附连到的原子一起形成5元杂环;并且
R2d为-H或-CH3
10.一种具有式(IIIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000041
其中
R3选自-H、-(C1-C4)烷基和-CH2OR3a;并且
R3a为-H或-CH3
11.一种具有式(IVb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000042
其中R4为-OH或-NH2
12.一种具有式(Vb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000043
13.一种具有式(VIb)的化合物或其药学上可接受的盐:
Figure FDA0002629295810000044
其中
R6a为-H或-CH3
R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;或被0个或1个氨基或-OR6e取代的-(C1-C3)烷基;并且
R6c是被0个或1个氨基或-OR6f取代的-(C1-C3)烷基;
R6d为H或-CH3;并且
R6e和R6f独立地为-H或-CH3
14.一种具有式(VIb)的化合物或其药学上可接受的盐;其中
R6a为-H或-CH3;并且R6b是被0个或1个氨基取代的-(C1-C3)烷基;或可替代地,
R6a为-H或-CH3;R6b为-C(O)C(R6cR6d)NH2;R6c是被0个或1个氨基或-OH取代的-(C1-C3)烷基;并且R6d为H或-CH3
15.一种表1的化合物或其药学上可接受的盐。
16.一种药物组合物,该药物组合物包含如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐、以及药学上可接受的载体。
17.一种治疗癌症的方法,该方法包括如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
18.如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗癌症。
19.如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于制造用于治疗癌症的药剂。
20.一种药物组合物,该药物组合物包含如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗癌症。
21.一种治疗呼吸道炎性疾病的方法,该方法包括如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐。
22.如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗呼吸道炎性疾病。
23.如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于制造用于治疗呼吸道炎性疾病的药剂。
24.一种药物组合物,该药物组合物包含如权利要求1至15中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐,用于治疗呼吸道炎性疾病。
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