CN111663004B - 一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用 - Google Patents

一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用。本发明还公开了一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力或抗倒伏性状的引物对,所述引物对为由序列2和序列3所示的两条单链DNA组成的引物对。本发明的引物对具有如下c1)‑c3)中任一种用途:c1)鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状;c2)筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种;c3)小麦育种。本发明的引物对及利用所述引物对鉴定和筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力或抗倒伏小麦品种的方法具有良好的应用前景。

Description

一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用。
背景技术
小麦是世界上种植面积最广,总产量最多的粮食作物,全世界约有40%的人口以小麦为主食。我国目前已是小麦生产第一大国,产量超过一亿吨。随着世界人口的逐步增加,粮食安全问题越来越凸显,稳定提高我国小麦生产能力对于促进国民经济发展、确保粮食安全具有重要意义。
近几十年来,随着小麦生产总量的逐渐提升,稳定的高产与倒伏之间的矛盾越来越明显。倒伏是指植物茎永久性偏垂直位置的一种表型特征,在田间通常由风雨引起并随着病原菌和害虫对茎和根的侵入而加剧,是农业生产中面临的最为严峻的问题之一,同时倒伏也不利于机械化收割,增加了农户的机收成本。小麦倒伏可分为茎倒伏和根倒伏两类,两种类型倒伏的发生取决于植物本身特性和特定的生长环境。无论根倒伏还是茎倒伏,茎秆的机械强度和弹性都是非常重要的抗倒伏育种选择指标。1925年首次在小麦中发现茎秆中木质素缺乏会引起倒伏现象发生。另外小麦中木质素含量的多少与茎秆强度和抗倒性密切相关,特别是茎秆基部第二节间木质素含量与茎秆抗折力呈显著正相关。
肖世和等人使用茎秆强度测量器DIK7400对小麦茎秆强度进行测量,将茎秆推至与地面呈45度夹角时力的大小表示茎秆强度的强弱,并通过证明无论何时测定,强秆品种的茎秆强度值总是比弱秆品种大,此种方法可在田间直接无损伤、可重复、快速地测定大量材料的茎秆强度值,这也是目前比较实用的小麦品种抗倒性评价的方法。
发明内容
本发明的目的是提供一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用。
为实现上述目的,本发明首先提供了DNA片段甲或检测待测小麦是否含有所述DNA片段甲的物质的新用途。
本发明提供了DNA片段甲或检测待测小麦是否含有所述DNA片段甲的物质在如下c1)-c6)中任一种中的应用:
c1)鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状;
c2)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的产品;
c3)筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种;
c4)制备筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种的产品;
c5)小麦育种;
c6)制备小麦育种的产品;
所述DNA片段甲为a1)或a2):
a1)小麦基因组中对应于序列表中SEQ ID No.1所示的DNA分子;
a2)含有a1)所述DNA分子的DNA片段。
上述应用中,所述检测待测小麦是否含有所述DNA片段甲的物质为如下b1)或b2):
b1)由SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的两条单链DNA组成的引物对;
b2)由将SEQ ID No.2和SEQ ID No.3经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA组成,且与b1)中所述引物对功能相同的引物对。
为实现上述目的,本发明又提供了一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的引物对。
本发明提供的鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的引物对为上述b1)或b2)所述的引物对。
所述引物对中的各条引物独立包装。
为实现上述目的,本发明还提供了一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的试剂盒。
本发明提供的鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的试剂盒包括上述引物对。
进一步的,所述试剂盒还可包括其他用于PCR扩增的试剂和/或用于检测扩增产物的试剂。
更进一步的,所述用于PCR扩增的试剂具体可为缓冲液(如10×EasyTaq Buffer)、dNTP Mixture、酶(如Easy Taq酶)、双蒸水等试剂。
所述用于检测扩增产物的试剂具体可为指示剂(如6x Loading Buffer指示剂)、琼脂糖凝胶(如2.0%琼脂糖凝胶)等试剂。
上述引物对或试剂盒在如下c1)-c6)中任一种中的应用也属于本发明的保护范围:
c1)鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状;
c2)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的产品;
c3)筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种;
c4)制备筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种的产品;
c5)小麦育种;
c6)制备小麦育种的产品。
为实现上述目的,本发明还提供了如下d1)-d7)中任一种方法:
d1)鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦茎秆强度大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d2)鉴定或辅助鉴定小麦茎秆抗折力的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦茎秆抗折力大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d3)鉴定或辅助鉴定小麦抗倒伏性状的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦抗倒伏能力大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d4)筛选或辅助筛选高茎秆强度小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为高茎秆强度小麦品种;
d5)筛选或辅助筛选高茎秆抗折力小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为高茎秆抗折力小麦品种;
d6)筛选或辅助筛选抗倒伏小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为抗倒伏小麦品种;
d7)小麦育种方法,所述方法包括如下步骤:选择不含有DNA片段甲的小麦作为亲本进行育种;
所述DNA片段甲为a1)或a2):
a1)小麦基因组中对应于序列表中SEQ ID No.1所示的DNA分子;
a2)含有a1)所述DNA分子的DNA片段。
上述方法中,所述检测待测小麦是否含有DNA片段甲的方法包括如下步骤:以待测小麦的基因组DNA作为模板,以由SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的两条单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;根据所述扩增产物确定所述待测小麦是否含有DNA片段甲:如果所述扩增产物中仅含有大小为94bp的条带,则所述待测小麦不含有或候选不含有DNA片段甲;如果所述扩增产物中含有大小为94bp和220bp的条带,则所述待测小麦含有或候选含有DNA片段甲。
上述方法中,所述PCR扩增体系如下:SEQ ID No.2所示的上游引物(10uM/μl)0.5μl、SEQ ID No.3所示的下游引物(10uM/μl)0.5μl、10×EasyTaq Buffer(250mM Mg2+)2μl、dNTP Mixture(2.5mM each)2μl、Easy Taq酶(5U/μl)0.2μl、小麦模板DNA 2μl和双蒸水12.8μl。所述上游引物和所述下游引物在反应体系中的终浓度均为0.25uM。
所述PCR扩增程序如下:95℃预变性5min,95℃变性40s,59℃退火30s,72℃延伸30s,38个循环,72℃延伸10min。
上述方法中,可通过2%琼脂糖凝胶电泳检测所述扩增产物。
上述任一所述应用或方法中,所述高茎秆强度小麦品种的判定方法如下:1)当待测小麦品种的茎秆强度值大于或等于对照品种时,该待测小麦品种为高茎秆强度小麦品种;2)当待测小麦品种的茎秆强度值小于对照品种时,根据比值确定待测小麦品种是否为高茎秆强度小麦品种:若待测小麦品种的比值大于0且小于16%,则待测小麦品种为高茎秆强度小麦品种;所述比值=【(对照品种茎秆强度值-待测小麦品种茎秆强度值)/对照品种茎秆强度值】*100%;各茎秆强度值均为同一年度下均值。待测小麦品种不满足上述1)或2)的条件时,则待测小麦品种为低茎秆强度小麦品种。
所述高茎秆抗折力小麦品种的判定方法如下:1)当待测小麦品种的茎秆抗折力值大于或等于对照品种时,该待测小麦品种为高茎秆抗折力小麦品种;2)当待测小麦品种的茎秆抗折力值小于对照品种时,根据比值确定待测小麦品种是否为高茎秆抗折力小麦品种:若待测小麦品种的比值大于0且小于16%,则待测小麦品种为高茎秆抗折力小麦品种;所述比值=【(对照品种茎秆抗折力值-待测小麦品种茎秆抗折力值)/对照品种茎秆抗折力值】*100%;各茎秆抗折力值均为同一年度下均值。待测小麦品种不满足上述1)或2)的条件时,则待测小麦品种为低茎秆抗折力小麦品种。
所述对照品种为矮抗58(目前黄淮南部麦区种植面积最大的小麦品种、全国小麦主导品种之一,抗倒能力强)。
上述任一所述应用或方法中,所述小麦育种的目的是培育高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种。
上述DNA片段甲或检测待测小麦是否含有DNA片段甲的物质也属于本发明的保护范围。
本发明通过对高茎秆强度小麦品种和低茎秆强度小麦品种的CCR基因序列进行测序比较发现:与低茎秆强度小麦品种相比,高茎秆强度小麦品种存在一个大小为141bp的片段缺失,并基于该缺失片段设计了BJ2分子标记。通过实验证明:利用BJ2分子标记可有效鉴定和筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种,具有良好的应用前景。
附图说明
图1为BJ2分子标记检测结果。其中,1-4依次为876、兰考298、安农0822、贵农775;6-9依次为Niavt14、晋麦73、临优8159、中洛铁秆。每个样品两次重复,最右侧为Marker。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。
下述实施例中的876在文献“王三锦.小麦降落值分子标记开发[D].安徽农业大学,2018.”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的兰考298在文献“刘理森,张倩,任妍,顾晶晶,詹克慧.241份小麦品种(系)白粉病抗性鉴定与分子标记检测.分子植物育种,2016,14(03)”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的安农0822在文献“刘方方.小麦抗寒相关基因克隆及分子标记开发.安徽农业大学,2016.”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的贵农775在文献“徐如宏,任明见,黄世全,杨英仓,张庆勤.小麦抗病种质贵农775中抗白粉病基因的RAPD标记.作物学报,2005(02)”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的临优8159在文献“马卓,黎丹,陶晡等.小麦品种对麦红吸浆虫抗虫性鉴定[J].河北农业大学学报,2014,37(02):87-92.”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的中洛铁杆在文献“施卫萍.小麦染色体片段代换系的构建以及相关农艺性状的QTL初步鉴定.扬州大学,2015.”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的Niavt14在文献“朱芳芳.Niavt14/徐州25重组自交系群体小麦纹枯病抗性QTL分析.南京农业大学,2011.”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的晋麦73在文献“张明义,曹亚萍,乔合心,辛志勇,陈孝,徐惠君.多抗优质高产小麦新品种晋麦73.中国种业,2002(12)”中公开过,公众可以从安徽农业大学获得。该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的茎秆强度测定步骤参照文献“肖世和,张秀英,闫长生,等.小麦茎秆强度的鉴定方法研究[J].中国农业科学,2002,35(1)”中的方法进行。茎秆抗折力测定步骤参照文献“王勇,李晴祺,李朝恒,李安飞.小麦品种茎秆的质量及解剖学研究.作物学报,1998,24(4)”中的方法进行。
实施例1、BJ2分子标记的获得及验证
一、BJ2分子标记的获得
茎秆强度测定:经2年(2014年和2018年)茎秆强度测定,选取如下茎秆强度较稳定的8个品种:876、兰考298、安农0822、贵农775、临优8159、中洛铁秆、Niavt14、晋麦73作为基因型测定的供试材料。茎秆强度测定结果如表1所示。结果发现:876、兰考298、安农0822和贵农775的茎秆强度明显大于临优8159、中洛铁秆、Niavt14、晋麦73。
表1、8个品种两年茎秆强度
品种 带型 14年茎秆强度 18年茎秆强度 平均值
876 A 2.302 3.710 3.006
兰考298 A 2.415 4.835 3.625
安农0822 A 2.605 4.840 3.7225
贵农775 A 1.894 3.473 2.6835
临优8159 B 1.719 0.71 1.2145
中洛铁秆 B 0.786 0.835 0.8105
Niavt14 B 1.912 2.519 2.2155
晋麦73 B 1.812 2.323 2.0675
基因型测定:分别克隆供试材料的CCR基因,并对获得的CCR基因序列进行测序比较,结果发现:经鉴定茎秆强度较高的小麦品种(876、兰考298、安农0822、贵农775)存在一个大小为141bp的片段缺失,不含有大小为141bp的片段,而经鉴定茎秆强度较低的小麦品种(临优8159、中洛铁秆、Niavt14、晋麦73)含有大小为141bp的片段,该大小为141bp的片段的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。基于该缺失片段,设计BJ2分子标记,引物序列如下:
BJ2-F:CTGCTGGAGCGACCTTGAAT(SEQ ID No.2);
BJ2-R:TTCTGAAGTGGAACAAAAGC(SEQ ID No.3)。
二、BJ2分子标记的验证
1、采用SDS-Tris饱和酚法提取步骤一中的供试材料种子的基因组DNA。
2、以步骤1获得的基因组DNA为模板,采用BJ2-F和BJ2-R进行PCR扩增,获得PCR产物。
PCR扩增程序如下:95℃预变性5min;95℃变性40s,59℃退火30s,72℃延伸30s,38个循环;72℃延伸10min,12℃保存。
PCR反应体系如表2所示。
表2、PCR反应体系
反应成分 反应浓度 体积
10×EasyTaq Buffer(250mM Mg<sup>2+</sup>) 2μl
dNTP Mixture(2.5mM each) 0.25mM 2μl
BJ2-F(10uM/μl) 0.25uM 0.5μl
BJ2-R(10uM/μl) 0.25uM 0.5μl
Easy Taq酶(5U/μl) 0.05U/μl 0.2μl
DNA 2μl
ddH<sub>2</sub>O 12.8μl
3、向PCR扩增完成的体系中加入4μl 6x Loading Buffer指示剂后离心,吸取6μl加入到2.0%琼脂糖凝胶电泳泳道中。电压设置为120V、电流设置为100mA,电泳约20min,结束后将凝胶放在紫外凝胶成像系统中查看拍照保存。
结果如图1所示:BJ2分子标记在经鉴定茎秆强度较高的小麦品种(876、兰考298、安农0822、贵农775)中均仅能扩增出大小为94bp的一条带,并将其记作A带型。BJ2分子标记在经鉴定茎秆强度较低的小麦品种(临优8159、中洛铁秆、Niavt14、晋麦73)中均扩增出大小分别为94bp(SEQ ID No.4)和220bp(SEQ ID No.5)的两条带,并将其记作B带型。因此可通过BJ2分子标记鉴定待测小麦品种的茎秆强度。
实施例2、BJ2分子标记的应用
一、供试材料与实验方法
供试小麦材料:146份自然群体材料,具体材料名称如表3和表4所示。146份自然群体材料覆盖黄淮冬麦区、长江中下游冬麦区、西南冬麦区、北方麦区及外国麦区,材料来源丰富,遗传背景丰富。146份自然群体材料记载于文献“韩新峰.232份小麦品种资源抗倒伏相关因素分析[D].安徽农业大学,2014.”(记作文献1)和“王三锦.小麦降落值分子标记开发[D].安徽农业大学,2018.”(记作文献2)中。表3和表4第1列的来源-序号中标有“Ⅰ”的材料表示记载在文献1的附表中,表3和表4第1列的来源-序号中标有“Ⅱ”的材料表示记载在文献2的附录A中名称为“86份自然群体材料对应的编号及品种名称”的附表中,表3和表4第1列的来源-序号中标有“Ⅲ”的材料表示记载在文献2的附录A中名称为“320普通小麦自然群体材料编号及名称”的附表中。
茎秆强度和茎秆抗折力测定:分别在2014和2018年测定自然群体材料的茎秆强度和茎秆抗折力,2014年测定表3所示的127份自然群体材料的茎秆强度和茎秆抗折力,2018年测定表4所示的51份自然群体材料的茎秆强度和茎秆抗折力。根据如下方法判断每种小麦品种材料为高茎秆强度小麦品种还是低茎秆强度小麦品种、高茎秆抗折力小麦品种还是低茎秆抗折力小麦品种:
高茎秆强度小麦品种的判定方法如下:1)当待测小麦品种的茎秆强度值大于或等于对照品种时,该待测小麦品种为高茎秆强度小麦品种;2)当待测小麦品种的茎秆强度值小于对照品种时,根据比值确定待测小麦品种是否为高茎秆强度小麦品种:若待测小麦品种的比值大于0且小于16%,则待测小麦品种为高茎秆强度小麦品种;所述比值=【(对照品种茎秆强度值-待测小麦品种茎秆强度值)/对照品种茎秆强度值】*100%;各茎秆强度值均为同一年度下均值。待测小麦品种不满足上述1)或2)的条件时,则待测小麦品种为低茎秆强度小麦品种。
高茎秆抗折力小麦品种的判定方法如下:1)当待测小麦品种的茎秆抗折力值大于或等于对照品种时,该待测小麦品种为高茎秆抗折力小麦品种;2)当待测小麦品种的茎秆抗折力值小于对照品种时,根据比值确定待测小麦品种是否为高茎秆抗折力小麦品种:若待测小麦品种的比值大于0且小于16%,则待测小麦品种为高茎秆抗折力小麦品种;所述比值=【(对照品种茎秆抗折力值-待测小麦品种茎秆抗折力值)/对照品种茎秆抗折力值】*100%;各茎秆抗折力值均为同一年度下均值。待测小麦品种不满足上述1)或2)的条件时,则待测小麦品种为低茎秆抗折力小麦品种。
对照小麦品种为矮抗58。
基因型测定:利用BJ2分子标记按照实施例1步骤二中方法测定146份自然群体材料的基因型,若某一材料仅能扩增出大小为94bp的一条带,则该材料的基因型为A带型;若某一材料可扩增出大小分别为94bp和220bp的两条带,则该材料的基因型为B带型。
二、实验结果
2014年测定的127份自然群体材料的茎秆强度和茎秆抗折力、基因型的结果如表3所示。2018年测定的51份自然群体材料的茎秆强度和茎秆抗折力、基因型的结果如表4所示。2014年和2018年的146份自然群体的茎秆强度、茎秆抗折力与基因型的统计分析结果如表5所示。
结果表明:2014年,127份材料中,117份材料基因型为A带型,A带型小麦材料茎秆强度均值为1.605±0.476,茎秆抗折力均值为12.782±2.788;10份材料基因型为B带型,B带型小麦材料茎秆强度均值为0.945±0.138,茎秆抗折力均值为10.450±2.948。2018年,51材料中,46份材料基因型为A带型,A带型小麦材料茎秆强度均值为3.406±0.968,茎秆抗折力均值为10.909±5.205;5份材料基因型为B带型,B带型小麦材料茎秆强度均值为2.559±0.717,茎秆抗折力均值为4.595±0.455。综上所述,不同年度间,A带型小麦品种茎秆强度和/或茎秆抗折力均高于B带型小麦品种,BJ2分子标记可用于鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力。
另外,2014年,A带型的小麦材料中,有105份小麦材料为高茎秆强度小麦品种;有68份小麦材料为高茎秆抗折力小麦品种。2018年,A带型的小麦材料中,有32份小麦材料为高茎秆强度小麦品种;有42份小麦材料为高茎秆抗折力小麦品种。
综上所述,不同年度间,大多数的A带型小麦品种为高茎秆强度小麦品种或高茎秆抗折力小麦品种,BJ2分子标记可用于筛选高茎秆强度小麦品种或高茎秆抗折力小麦品种。
表3、127份自然群体材料品种名称、带型、茎秆强度、抗折力检测结果
Figure BDA0002605245530000091
Figure BDA0002605245530000101
Figure BDA0002605245530000111
Figure BDA0002605245530000121
表4、51份自然群体材料品种名称、带型、茎秆强度、抗折力检测结果
Figure BDA0002605245530000122
Figure BDA0002605245530000131
表5、146份自然群体的茎秆强度、茎秆抗折力与带型检测比较
表型 带型 均值±标准差 差异性
2014年茎秆强度 A 1.605±0.476 0.000
B 0.945±0.138
2014年茎秆抗折力 A 12.782±2.788 0.015
B 10.450±2.948
2018年茎秆强度 A 3.406±0.968 0.064
B 2.559±0.717
2018年茎秆抗折力 A 10.909±5.205 0.010
B 4.595±0.455
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110>安徽农业大学
<120>一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法及其应用
<160>5
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>141
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>1
agactaaggc atagcctagt agtggaaagg ggctgatgcc ttcccaccca cccaggttca 60
aggcatggta cttgcaattt gggtttgttg cacaaactat actgtagggg ttcccttaca 120
gtcttccgat caaaaaaaat c 141
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>2
ctgctggagc gaccttgaat 20
<210>3
<211>20
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>3
ttctgaagtg gaacaaaagc 20
<210>4
<211>94
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>4
ctgctggagc gaccttgaat tctgcaagaa aaccaaggtc agcaacccga ccagactctg 60
ttcaattccc ttcggctttt gttccacttc agaa 94
<210>5
<211>220
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>5
ctgctggagc gaccttgaat tctgcaagaa aaccaaggtc agcagttcaa tcagactaag 60
gcatagccta gtagtggaaa ggggctgatg ccttcccacc cacccaggtt caaggcatgg 120
tacttgcaat ttgggtttgt tgcacaaact atactgtagg ggttccctta cagtcttccg 180
atcaaaaaaa atccccttcg gcttttgttc cacttcagaa 220

Claims (9)

1.DNA片段甲或检测待测小麦是否含有所述DNA片段甲的物质在如下c1)-c6)中任一种中的应用:
c1)鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状;
c2)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的产品;
c3)筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种;
c4)制备筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种的产品;
c5)小麦育种;
c6)制备小麦育种的产品;
所述DNA片段甲为小麦基因组中对应于序列表中SEQ ID No.1所示的DNA分子。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述检测待测小麦是否含有所述DNA片段甲的物质为由SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的两条单链DNA组成的引物对。
3.一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的引物对,为权利要求2中所述的引物对。
4.一种鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的试剂盒,其包括权利要求3所述的引物对。
5.权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒在如下c1)-c6)中任一种中的应用:
c1)鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状;
c2)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦的茎秆强度和/或茎秆抗折力和/或抗倒伏性状的产品;
c3)筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种;
c4)制备筛选或辅助筛选高茎秆强度和/或高茎秆抗折力和/或抗倒伏小麦品种的产品;
c5)小麦育种;
c6)制备小麦育种的产品。
6.如下d1)-d7)中任一种方法:
d1)鉴定或辅助鉴定小麦茎秆强度的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦茎秆强度大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d2)鉴定或辅助鉴定小麦茎秆抗折力的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦茎秆抗折力大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d3)鉴定或辅助鉴定小麦抗倒伏性状的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦抗倒伏能力大于或候选大于含有DNA片段甲的小麦;
d4)筛选或辅助筛选高茎秆强度小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为高茎秆强度小麦品种;
d5)筛选或辅助筛选高茎秆抗折力小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为高茎秆抗折力小麦品种;
d6)筛选或辅助筛选抗倒伏小麦品种的方法,所述方法包括如下步骤:检测待测小麦是否含有DNA片段甲,不含有DNA片段甲的小麦品种为或候选为抗倒伏小麦品种;
d7)小麦育种方法,所述方法包括如下步骤:选择不含有DNA片段甲的小麦作为亲本进行育种;
所述DNA片段甲为小麦基因组中对应于序列表中SEQ ID No.1所示的DNA分子。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述检测待测小麦是否含有DNA片段甲的方法包括如下步骤:以待测小麦的基因组DNA作为模板,以由SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示的两条单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物;根据所述扩增产物确定所述待测小麦是否含有DNA片段甲:如果所述扩增产物中仅含有大小为94bp的条带,则所述待测小麦不含有或候选不含有DNA片段甲;如果所述扩增产物中含有大小为94bp和220bp的条带,则所述待测小麦含有或候选含有DNA片段甲。
8.权利要求1或2中所述的DNA片段甲。
9.权利要求1或2中所述的检测待测小麦是否含有DNA片段甲的物质。
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Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106480180A (zh) * 2016-09-30 2017-03-08 山东农业大学 一种小麦茎秆断裂强度分子标记qwqd4b.4‑13及其应用
CN106755354A (zh) * 2016-12-05 2017-05-31 中国农业科学院作物科学研究所 一种与小麦千粒重和茎秆可溶性糖含量相关的分子标记TaSnRK2.4A及其应用
CN109234435A (zh) * 2018-10-23 2019-01-18 四川省农业科学院作物研究所 一种用于鉴定小麦茎秆壁厚的方法及其引物

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106480180A (zh) * 2016-09-30 2017-03-08 山东农业大学 一种小麦茎秆断裂强度分子标记qwqd4b.4‑13及其应用
CN106755354A (zh) * 2016-12-05 2017-05-31 中国农业科学院作物科学研究所 一种与小麦千粒重和茎秆可溶性糖含量相关的分子标记TaSnRK2.4A及其应用
CN109234435A (zh) * 2018-10-23 2019-01-18 四川省农业科学院作物研究所 一种用于鉴定小麦茎秆壁厚的方法及其引物

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Characterization of a cinnamoyl-CoA reductase that is associated with stem development in wheat;Qing-Hu Ma;《Journal of Experimental Botany》;20070423;第58卷(第8期);第2011-2021页 *
小麦茎秆实心度对茎秆强度的影响及相关性状QTL分析;潘婷 等;《作物学报》;20161009;第43卷(第1期);第9-18页 *
小麦茎秆断裂强度相关性状QTL的连锁和关联分析;刘凯 等;《作物学报》;20161129;第43卷(第4期);第483-495页 *

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