CN111183155B - 抗cd47抗体及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明描述了抗CD47抗体及其抗原结合片段。本发明还描述了编码所述抗体的核酸、包含所述抗体的组合物、产生所述抗体的方法以及使用所述抗体治疗或预防疾病的方法，所述疾病例如癌症、炎性疾病、感染性疾病、动脉粥样硬化、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤和/或自身免疫性疾病。

Description

抗CD47抗体及其用途
相关申请的交叉引用
本申请要求2017年8月2日提交的美国临时申请62/540,118和2018年4月13日提交的美国临时申请62/657,094的优先权。每个公开通过引用整体并入本文。
发明领域
本发明涉及单克隆抗CD47抗体、编码该抗体的核酸和表达载体、包含该载体的重组细胞，以及包含该抗体的组合物。本发明还提供了制备所述抗体的方法，以及使用所述抗体来治疗疾病的方法，所述疾病包括癌症、炎性疾病、感染性疾病、动脉粥样硬化、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤，和/或自身免疫性疾病。
电子提交的序列表的引用
本申请包含序列表，该序列表通过EFS-Web以ASCII格式的序列表电子提交，文件名为“689204.2WO序列表”，创建日期为2018年7月5日，大小为95kb。通过EFS-Web提交的序列表是本说明书的一部分，其全文通过引用并入本文。
发明背景
癌细胞可以进化出各种武装功能，从而避免宿主的攻击，包括来自免疫系统的攻击。它们要么在细胞表面上呈现像正常人细胞那样的天然外观，要么在被免疫细胞捕获后中断免疫攻击。靶向免疫抑制物CTLA-4、PD-1和PD-L1的治疗性单克隆抗体的惊人成功已确切地证明了后者的机制。这些抗体可以使免疫检查点失活，并使T细胞组织产生对癌细胞的有效攻击，从而在一些患者中产生持久的疗效。这些抗体的早期成功更新了免疫肿瘤学领域，并激发了更多疗法的研究与开发，以利用人类免疫系统对抗癌症。
人类的免疫系统包括适应性免疫和先天免疫。在当前的临床实践或药物开发中，检查点阻断剂和肿瘤微环境调节剂以适应性免疫为靶标。检查点阻断剂和肿瘤微环境调节剂通过从耗尽、枯竭的免疫抑制性调节性T细胞中解救出辅助性T细胞和杀伤性T细胞，或阻断免疫抑制性肿瘤微环境的形成来激活T细胞。最近，越来越多的证据表明，肿瘤细胞还抑制先天免疫，并且缓解这种抑制作用已经在体外和体内治疗癌症中显示出巨大治疗潜力。
先天免疫是抵御病原体的第一道防御。它包括防御机制和吞噬抗原的白细胞。其中，巨噬细胞通过吞噬作用去除功能障碍的衰老细胞和被感染的宿主细胞。肿瘤细胞还通过过度表达分化簇47(CD47)(也称为整联素相关蛋白)来逃避巨噬细胞的攻击，CD47是一种在正常细胞表面也普遍表达的标志物。值得注意的是，在特异性阻断CD47的抗体存在下，巨噬细胞在吞噬作用分析中，在体外攻击肿瘤细胞，并且在异种移植模型中，在体内消灭肿瘤。当前，靶向CD47的几种治疗剂已经进入了药物开发的临床阶段。
起初被鉴定为整合素相关蛋白的CD47，是一种受体配体，可与许多蛋白相互作用。CD47是血小板反应蛋白1(TSP1)的受体，血小板反应蛋白是特征最清楚的分泌性配体之一。另一方面，CD47是信号调节蛋白α(SIRPα)的配体，后者是在巨噬细胞表面表达的抑制性受体。后者的结合阻止了巨噬细胞吞噬癌细胞。
与所有癌症免疫疗法一样，阻断CD47可能会诱导正常细胞发生非计划的免疫攻击，从而导致剂量限制性毒性。实际上，一种CD47阻断抗体B6H12可引起血凝反应，可能是通过与红细胞上的CD47结合引起的。该抗体显著阻断TSP1和SIRPα两者与CD47的结合。然而，尚不清楚B6H12阻断TSP1相互作用是否导致血凝反应。此外，有人提出当巨噬细胞的表面CD47分子被全身性施用的抗CD47抗体覆盖时，巨噬细胞可能攻击正常细胞。因此，开发对肿瘤细胞具有增强的特异性并且对正常细胞具有降低的毒性的抗CD47抗体非常重要。
发明概述
在一个一般方面，本发明涉及结合CD47的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段。
本发明提供了分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含重链互补决定区1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、轻链互补决定区1(LCDR1)、LCDR2和LCDR3，其具有以下多肽序列：
(1)分别为SEQ ID NO：177、46、47、178、112和179；
(2)分别为SEQ ID NO：51、52、53、117、118和119；
(3)分别为SEQ ID NO：54、55、56、120、121和122；
(4)分别为SEQ ID NO：57、58、59、123、124和125；
(5)分别为SEQ ID NO：60、61、62、126、127和128；
(6)分别为SEQ ID NO：180、181、182、129、130和131；
(7)分别为SEQ ID NO：72、73、74、138、139和140；
(8)分别为SEQ ID NO：78、79、80、144、145和146；
(9)分别为SEQ ID NO：81、82、83、147、148和149；
(10)分别为SEQ ID NO：84、85、86、150、151和152；
(11)分别为SEQ ID NO：87、88、89、153、154和155；
(12)分别为SEQ ID NO：90、91、92、156、157和158；
(13)分别为SEQ ID NO：93、94、95、159、160和161；
(14)分别为SEQ ID NO：96、97、98、162、163和164；
(15)分别为SEQ ID NO：99、100、101、165、166和167；
(16)分别为SEQ ID NO：102、103、104、168、169和170；
(17)分别为SEQ ID NO：105、106、107、171、172和173；
(18)分别为SEQ ID NO：108、109、110、174、175和176；或
(19)分别为SEQ ID NO：201、202、203、204、205和206；
其中，所述抗体或其抗原结合片段特异性结合CD47，优选人CD47。SEQ ID NO：177由氨基酸序列GYTFTX1YY表示，其中X1是选自D或A的氨基酸。SEQ ID NO：178由氨基酸序列X1NVGTY表示，其中X1是选自D或E的氨基酸。SEQ ID NO：179由氨基酸序列GQX1YSYPLT表示，其中X1是选自S或T的氨基酸。SEQ ID NO：180由氨基酸序列GYTFTSX1W表示，其中X1是选自S或Y的氨基酸。SEQ ID NO：181由氨基酸序列IDPSDSEX1表示，其中X1是选自T或A的氨基酸。SEQ ID NO：182由氨基酸序列X1RWGYYGKSAX2DY表示，其中X1是选自A或S的氨基酸，并且X2是选自I或M的氨基酸。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或抗原结合片段包含含有与SEQ IDNO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41或43具有至少95％的同一性的多肽序列的重链可变区，或含有与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42或44具有至少95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或抗原结合片段包括：
(a)具有SEQ ID NO：1的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：2的多肽序列的轻链可变区；
(b)具有SEQ ID NO：3的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：4的多肽序列的轻链可变区；
(c)具有SEQ ID NO：5的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：6的多肽序列的轻链可变区；
(d)具有SEQ ID NO：7的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：8的多肽序列的轻链可变区；
(e)具有SEQ ID NO：9的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：10的多肽序列的轻链可变区；
(f)具有SEQ ID NO：11的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：12的多肽序列的轻链可变区；
(g)具有SEQ ID NO：13的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：14的多肽序列的轻链可变区；
(h)具有SEQ ID NO：15的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：16的多肽序列的轻链可变区；
(i)具有SEQ ID NO：17的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：18的多肽序列的轻链可变区；
(j)具有SEQ ID NO：19的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：20的多肽序列的轻链可变区；
(k)具有SEQ ID NO：21的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：22的多肽序列的轻链可变区；
(l)具有SEQ ID NO：23的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：24的多肽序列的轻链可变区；
(m)具有SEQ ID NO：25的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：26的多肽序列的轻链可变区；
(n)具有SEQ ID NO：27的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：28的多肽序列的轻链可变区；
(o)具有SEQ ID NO：29的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：30的多肽序列的轻链可变区；
(p)具有SEQ ID NO：31的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：32的多肽序列的轻链可变区；
(q)具有SEQ ID NO：33的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：34的多肽序列的轻链可变区；
(r)具有SEQ ID NO：35的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：36的多肽序列的轻链可变区；
(s)具有SEQ ID NO：37的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：38的多肽序列的轻链可变区；
(t)具有SEQ ID NO：39的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：40的多肽序列的轻链可变区；
(u)具有SEQ ID NO：41的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：42的多肽序列的轻链可变区；或
(v)具有SEQ ID NO：43的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：44的多肽序列的轻链可变区。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段是嵌合的。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段是人的或人源化的。在某些实施方式中，所述人源化的单克隆抗体或其抗原结合片段包括：
a.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
b.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
c.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
d.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
e.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
f.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
g.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
h.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
i.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
j.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：198的多肽序列的轻链可变区；
k.具有SEQ ID NO：187的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
l.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
m.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：196的多肽序列的轻链可变区；
n.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：197的多肽序列的轻链可变区；或
o.具有SEQ ID NO：199的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：200的多肽序列的轻链可变区。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段能够阻断CD47与血小板反应蛋白1(TSP1)和/或信号调节蛋白α(SIRPα)的结合。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段能够诱导巨噬细胞介导的癌细胞吞噬。
在某些实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段能够结合癌细胞，并且以最小至不可检测的方式结合红细胞。
本发明还提供了分离的核酸，其编码本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段。
本发明还提供了载体，其包含编码本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的分离的核酸。
本发明还提供了宿主细胞，其含有包含编码本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的分离的核酸的载体。
在某些实施方式中，提供了一种药物组合物，其包含本发明的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段和药学上可接受的载体。
本发明还提供了在有所需要的受试者中阻断CD47与血小板反应蛋白-1(TSP1)的结合和/或CD47与信号调节蛋白α(SIRPα)的结合的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗癌症的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。所述癌症可以是任何液体或实体癌，例如，其可以选自但不限于肺癌、胃癌、结肠癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱尿路上皮癌、转移性黑素瘤、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、头颈癌、胰腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤和其他实体瘤，以及非霍奇金淋巴瘤(NHL)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤(MM)、急性髓性白血病(AML)和其他液体肿瘤。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗炎性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗感染性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗动脉粥样硬化的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗心血管疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗代谢性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗辐射诱发的损伤的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了在有所需要的受试者中治疗自身免疫性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
本发明还提供了确定受试者中CD47水平的方法。所述方法包括(a)从受试者获得样品；(b)使样品与本发明的抗体或其抗原结合片段接触；(c)确定受试者中CD47的水平。在某些实施方式中，所述样品是组织或血液样品。所述组织样品可以例如是癌组织样品。所述血液样品可以例如包括癌细胞。
本发明还提供了产生本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的方法，包括在产生所述单克隆抗体或其抗原结合片段的条件下培养包含编码所述单克隆抗体或抗原结合片段的核酸的细胞，以及从所述细胞或培养物中回收所述抗体或抗原结合片段。
本发明还提供了制备包含本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的药物组合物的方法，所述方法包括将所述单克隆抗体或其抗原结合片段与药学上可接受的载体组合以获得药物组合物。
附图的简要说明
结合附图阅读时，将能更好地理解本发明的前述概述以及以下对本申请的优选实施例的详细描述。然而，应理解，本申请不限于附图中所示的明确实施例。
图1显示了通过FACS分析的抗CD47 mAb与RAJI细胞的结合。对照组“CTL Mu 2°Ab”和“CTL Hu 2° Ab”未用一抗处理，但分别用AlexaFluor488偶联的抗小鼠和抗人IgG二抗处理。
图2A-2P显示了通过ELISA分析的阻断CD47(ECD)-HIS和SIRPα-huFc之间相互作用的抗CD47 mAb的活性。使用Prism GraphPad，v7绘制曲线并计算IC50值。图2A显示了抗CD47mAb 15G23A的活性。图2B显示了抗CD47 mAb 17C6A的活性。图2C显示了抗CD47 mAb 13B18A的活性。图2D显示了抗CD47 mAb 4M8A的活性。图2E显示了抗CD47 mAb 14D18A的活性。图2F显示了抗CD47 mAb 11G2A的活性。图2G显示了抗CD47 mAb 13C4A的活性。图2H显示了抗CD47 mAb 5D24A的活性。图2I显示了抗CD47 mAb 9O23A的活性。图2J显示了抗CD47 mAb17N8A的活性。图2K显示了抗CD47 mAb 14P6A的活性。图2L显示了抗CD47 mAb 19L14A的活性。图2M显示了抗CD47 mAb 14O18A的活性。图2N显示了抗CD47 mAb 1J7A的活性。图2O显示了抗CD47 mAb 16M17A的活性。图2P显示了抗CD47 mAb 18M19A(与人IgG4重链和κ轻链嵌合)的活性。
图3A-3B显示了使用来自供体的新鲜血液进行的血凝试验中的抗CD47 mAb的评估。纯化缓冲液、B6H12和PBS被用作对照。抗体浓度显示在面板上方。图3A显示了抗CD47mAb 14P6A、11F6A、18M19A、19L14A、3O5A、10I23A、14N13A、14O18A、13C4A、16M17A和17O12A的血凝试验结果。图3B显示了抗CD47 mAb 12B18A、4M8A、13B18A、11G2A、5D24A、14D18A、17C6A、17N8A、9O23A、15G23A和1J7A以及对照PBS和B6H12的血凝试验结果。
图4A-4C显示了在用抗CD47 mAb 13B18A-huIgG1治疗的小鼠中的体内抗肿瘤活性、体重和血清暴露的图。图4A显示了在RAJI异种移植小鼠模型中13B18A-huIgG1的体内抗肿瘤活性；利妥昔单抗被用作阳性对照。图4B显示了研究期间不同组中动物的体重数据。图4C显示了在施用最终剂量后2天，在mAb处理组中13B18A-huIgG1的血清暴露。
图5A和5B显示了通过ELISA分析的人源化抗CD47 mAb H3L9(图5A)和H5L5(图5B)在阻断人CD47(ECD)-HIS和huSIRPα-muFc之间的相互作用中的活性。
图6显示了用人源化mAb H3L9、H5L5和H8L10进行血凝试验的结果。小鼠mAb15G23A被用作阳性对照。
图7A-7B显示了人源化mAb H3L9、H5L5和H8L10与红细胞(RBC)(图7A)和RAJI细胞(图7B)的结合试验的结果。
图8显示了人源化抗CD47 mAb H3L9、H5L5和H8L10在阻断huSIRPα-muFc与RAJI细胞结合中的活性。“仅第二抗体”和“无单克隆抗体/无第二抗体对照”是阴性对照。
图9显示了人源化抗CD47 mAb H3L9、H5L5和H8L10在诱导巨噬细胞介导的RAJI细胞吞噬中的活性。
发明详述
背景技术和整个说明书中引用或描述了各种出版物、文章和专利；这些参考文献中的每一个均通过引用整体并入本文。本说明书中包括的对文件、行为、材料、装置、物品等的讨论是为了提供本发明的背景。对于所公开或要求保护的任何发明内容，这种讨论并非承认所有这些或任何这些事项构成现有技术的一部分。
除非另有定义，否则本文所用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解的相同含义。否则，本文中使用的某些术语具有说明书中阐述的含义。
必须注意的是，如本文和所附权利要求书中所使用的，单数形式的“一个”、“一种”和“该”包括复数形式，除非上下文另外明确指出。
除非另有说明，否则任何数值，例如本文所述的浓度或浓度范围，在任何情况下均应理解为由术语“约”修饰。因此，数值通常包括所述值的±10％。例如，1mg/mL的浓度包括0.9mg/mL至1.1mg/mL。同样的，1％至10％(w/v)的浓度范围包括0.9％(w/v)至11％(w/v)。如本文所使用的，数值范围的使用明确地包括所有可能的子范围，该范围内的所有单个数值，包括该范围内的整数和分数，除非上下文另外明确指出。
除非另有说明，否则一系列元素之前的术语“至少”应理解为是指该系列中的每个元素。仅使用常规实验，本领域技术人员将认识到或能够确定本文所述的本发明的特定实施方式的多种等同方案。本发明旨在涵盖这样的等同方案。
如本文所用，术语“包含”、“包含有”、“包括”、“包括有”、“具有”、“有”、“含有”或“含”或其任何其他变型将被理解为隐含地包括陈述的整数或整数组，但不排除任何其他整数或整数组，并且是非排他性的或开放式的。例如，包含一系列元素的组合物、混合物、步骤、方法、物品或设备不一定仅限于那些元素，而是可以包括此组合物、混合物、步骤、方法、物品或设备中未明确列出或固有的其他元素。此外，除非明确指出相反的意思，否则“或”是指包含性的“或”而不是排他性的“或”。例如，以下任一条件都满足条件A或B：A为真(或存在)且B为假(或不存在)、A为假(或不存在)且B为真(或存在)，以及A和B均为真(或存在)。
如本文所用，多个叙述的元素之间的连接术语“和/或”应理解为包括单独的和组合的选择。例如，在两个元素由“和/或”连接的情况下，第一个选项是指适用第一个元素而没有第二个元素。第二个选项是指适用第二个元素而没有第一个元素。第三个选项是指第一和第二元素一起适用。这些选项中的任何一个都应理解为落入该含义内，并因此满足本文所用术语“和/或”的要求。一个以上选项的并行适用也应理解为在其含义之内，因此满足术语“和/或”的要求。
如本文所用，在整个说明书和权利要求书中使用的术语“由……组成”或诸如“由……构成”或“由……所组成”的变体表示包括任何所述整数或整数组，但是指定的方法、结构或组合物中没有增加其他的整数或整数组。
如本文所用，在整个说明书和权利要求书中使用的术语“基本上由...组成”或诸如“基本上由...构成”或“基本上由...所组成”的变体表示包括任何所述的整数或整数组，并且可选地包含不会实质上改变指定的方法、结构或组合物的基本或新颖性质的任何所述整数或整数组。参见M.P.E.P.§2111.03。
如本文所用，“受试者”是指任何动物，优选为哺乳动物，最优选为人。如本文所用，术语“哺乳动物”涵盖任何哺乳动物。哺乳动物的例子包括但不限于牛、马、绵羊、猪、猫、狗、小鼠、大鼠、兔、豚鼠、猴、人等，但更优选人。
词语“右”、“左”、“下”和“上”表示附图中的参考方向。
还应当理解，当提及优选发明的部件的尺寸或特性时，如本文所用的术语“大约”、“约”、“通常”、“基本上”以及类似术语表示所描述的尺寸/特性不是严格的边界或参数，并且不排除其在功能上相同或相似的微小变化，如本领域普通技术人员所理解的那样。至少，包括数字参数的此类引用将包括使用本领域公认的数学和工业原理(例如，四舍五入、测量或其他系统误差、制造公差等)不会改变最小有效位数的变化。
在两个或多个核酸或多肽序列(例如抗CD47抗体、CD47多肽和编码它们的多核苷酸)的上下文中，术语“同一的”或“同一性”百分比是指，当使用以下序列比较算法之一或通过目视检查进行比较和比对以获得最大对应性时，两个或多个序列或子序列是相同的或具有特定百分比的氨基酸残基或核苷酸相同。
为了进行序列比较，通常将一个序列用作参考序列，将测试序列与其进行比较。当使用序列比较算法时，将测试序列和参考序列输入计算机，必要时指定子序列坐标，并指定序列算法程序参数。然后，序列比较算法根据指定的程序参数，计算测试序列相对于参考序列的序列同一性百分比。
用于比较的序列的最佳比对可以例如通过如下算法进行，例如通过Smith和Waterman，高等应用数学，2：482(1981)的局部同源算法进行，通过Needleman和Wunsch，分子生物学杂志，48：443(1970)的同源性比对算法进行，通过Pearson和Lipman，美国国家科学院学报，85：2444(1988)的相似性方法研究进行，通过这些算法的计算机化实现(GAP、BESTFIT、FASTA和TFASTA，位于威斯康星州的575科学Madison博士的遗传学计算机组的遗传学软件包中)，或通过目视检查实现(通常参见，分子生物学实验室指南，F.M.Ausubel等编辑，实验室指南，格林出版联合公司(Greene Publishing Associates,Inc.)和约翰威利父子公司(John Wiley&Sons,Inc.)的合资企业(1995年副刊)(Ausubel))。
适于确定序列同一性和序列相似性百分比的算法的实例是BLAST和BLAST2.0算法，这些算法在Altschul等(1990)，分子生物学杂志，215：403-410和Altschul等(1997)，核酸研究，25：3389-3402中分别进行了描述。可通过国家生物技术信息中心的公开途径获得进行BLAST分析的软件。该算法涉及首先通过识别查询序列中长度为W的短序列来识别高分序列对(HSP)，这些短序列在与数据库序列中相同长度的序列对齐时匹配或满足某个正值阈值T。T被称为邻近序列分数阈值(Altschul等，同上)。这些最初的邻近序列的命中充当启动搜索以查找包含它们的较长HSP的种子。然后沿着两个方向将序列的命中在每个序列延伸至累积比对得分不再增加。
对于核苷酸序列，使用参数M(一对匹配残基的加分；始终>0)和N(错配残基的罚分；始终<0)来计算累积得分。对于氨基酸序列，使用得分矩阵来计算累积得分。在以下情况下，将停止序列的命中在每个方向上的延伸：累积比对得分比其最大获得值降低数值X；由于一个或多个负得分残基比对的累积，累积得分变为零或更低；或到达任一序列的末尾。BLAST算法参数W、T和X决定了比对的灵敏度和速度。BLASTN程序(用于核苷酸序列)使用字长(W)为11、期望值(E)为10、M＝5、N＝-4，以及两条链的比较作为默认值。对于氨基酸序列，BLASTP程序默认使用字长(W)为3、期望值(E)为10和BLOSUM62评分矩阵作为默认值(参见Henikoff和Henikoff，美国国家科学院学报，89：10915(1989))。
除了计算序列同一性百分比外，BLAST算法还对两个序列之间的相似性进行统计分析(参见，例如，Karlin和Altschul，美国国家科学院学报，90：5873-5787(1993))。BLAST算法提供的一种相似性测量是最小总和概率(P(N))，它提供了偶然发生两个核苷酸或氨基酸序列匹配的概率的指示。例如，如果在测试核酸与参考核酸的比较中，最小总和概率小于约0.1，更优选地小于约0.01，最优选地小于约0.001，则认为该核酸与参考序列相似。
如下所述，若由第一核酸编码的多肽与由第二核酸编码的多肽在免疫学上交叉反应，则进一步指示两个核酸序列或多肽基本上相同。因此，例如，当两条多肽中仅通过保守取代而不同，则通常认为其中一条多肽与第二多肽基本相同。两个核酸序列基本相同的另一个指示是两个分子在严格条件下彼此杂交。
如本文所用，术语“抑制”、“抑制的”和“抑制性”是指降低活性、应答、症状、病症或其他生物学参数。这可以包括但不限于完全清除活性、应答、症状或病症。这还可包括例如与天然或对照水平相比，活性、应答、症状或病症降低10％。因此，与天然或对照水平相比，降低量可以是10、20、30、40、50、60、70、80、90、100％，或其之间的任何减少量。作为非限制性实例，本发明的抗体可以抑制CD47蛋白的活性。相对于天然CD47蛋白活性，该CD47蛋白的活性可以被降低或消除。
抗体
本发明主要涉及分离的抗CD47抗体、编码该抗体的核酸和表达载体、包含该载体的重组细胞，以及包含该抗体的组合物。本发明还提供了制备所述抗体的方法，以及使用所述抗体来治疗疾病的方法，所述疾病包括癌症、炎性疾病、自身免疫性疾病、动脉粥样硬化、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤，和/或感染性疾病。本发明的抗体具有一种或多种理想的功能特性，包括但不限于与CD47结合的高亲和力、对CD47的高特异性、阻断CD47与血小板反应蛋白1(TSP1)结合的能力和/或无能力、阻断CD47与信号调节蛋白α(SIRPα)结合的能力、诱导与疾病或病症(包括但不限于癌症和动脉粥样硬化)相关的表达CD47的细胞的吞噬的能力，以及单独施用或与其他抗癌疗法联合施用时，抑制动物模型和受试者的肿瘤生长的能力，以及诱导血凝反应的无能性。
在一个一般方面，本发明涉及结合CD47的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段。
如本文所用，术语“抗体”以广义使用，并且包括免疫球蛋白或抗体分子，所述抗体分子包括单克隆或多克隆的人、人源化、复合和嵌合抗体以及抗体片段。通常，抗体是对特定抗原表现出结合特异性的蛋白质或肽链。抗体结构是众所周知的。根据重链恒定结构域的氨基酸序列，免疫球蛋白可分为五个主要类别(即，IgA、IgD、IgE、IgG和IgM)。IgA和IgG进一步亚分类为同种型IgA1、IgA2、IgG1、IgG2、IgG3和IgG4。因此，本发明的抗体可以是五个主要类别或相应的亚类别中的任何一个。优选地，本发明的抗体是IgG1、IgG2、IgG3或IgG4。脊椎动物物种的抗体轻链可以基于其恒定结构域的氨基酸序列被指定为两种明显不同的类型之一，即κ和λ。因此，本发明的抗体可以包含κ或λ轻链恒定结构域。根据特定的实施方式，本发明的抗体包括来自大鼠或人抗体的重链和/或轻链恒定区。除重链和轻链恒定结构域外，抗体还包含由轻链可变区和重链可变区组成的抗原结合区，两者均包含三个结构域(即互补决定区1-3；(CDR1、CDR2和CDR3))。所述轻链可变区结构域可替代地称为LCDR1、LCDR2和LCRD3，所述重链可变区结构域可替代地称为HCDR1、HCRD2和HCDR3。
如本文所用，术语“分离的抗体”是指基本上不含具有不同抗原特异性的其他抗体的抗体(例如，特异性结合CD47的分离的抗体基本上不含不结合CD47的抗体)。另外，分离的抗体基本上不含其他细胞物质和/或化学物质。
如本文所用，术语“单克隆抗体”是指从基本上均质的抗体群体(即，除了可能以少量存在的可能天然存在的突变以外，构成该群体的各个抗体是相同的)中获得的抗体。本发明的单克隆抗体可以通过杂交瘤方法、噬菌体展示技术、单淋巴细胞基因克隆技术或重组DNA方法来制备。例如，所述单克隆抗体可以由杂交瘤产生，所述杂交瘤包括获自具有人源重链转基因和轻链转基因的基因组的转基因非人动物(如转基因小鼠或大鼠)的B细胞。
如本文所用，术语“抗原结合片段”是指抗体片段，例如双抗体、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv片段、二硫键稳定的Fv片段(dsFv)、(dsFv)2、双特异性dsFv(dsFv-dsFv')、二硫键稳定的双抗体(ds双抗体)、单链抗体分子(scFv)、单域抗体(sdab)、scFv二聚体(双价双抗体)、由包含一个或多个CDR的抗体的一部分形成的多特异性抗体、骆驼源单域抗体、纳米抗体、结构域抗体、二价结构域抗体，或任何其他与抗原结合但不包含完整的抗体结构的抗体片段。抗原结合片段能够与亲本抗体或亲本抗体片段结合的相同抗原结合。根据特定的实施方式，所述抗原结合片段包含轻链可变区、轻链恒定区和重链的Fd区段。根据其他特定的实施方式，所述抗原结合片段包含Fab和F(ab')。
如本文所用，术语“单链抗体”是指本领域中常规的单链抗体，其包含通过约15至约20个氨基酸的短肽连接的重链可变区和轻链可变区。如本文所用，术语“单域抗体”是指本领域中常规的单域抗体，其包含重链可变区和重链恒定区，或仅包含重链可变区。
如本文所用，术语“人抗体”是指由人产生的抗体或使用本领域已知的任何技术制备的具有与由人产生的抗体相对应的氨基酸序列的抗体。人抗体的该定义包括完整或全长抗体、其片段，和/或包含至少一种人重链和/或轻链多肽的抗体。
如本文所用，术语“人源化抗体”是指进行修饰以增加与人抗体的序列同源性，从而保留了抗体的抗原结合特性，但降低了其对人体的抗原性的非人抗体。
如本文所用，术语“嵌合抗体”是指其中免疫球蛋白分子的氨基酸序列源自两个或更多个物种的抗体。轻链和重链的可变区通常对应于衍生自一种哺乳动物物种(例如，小鼠、大鼠、兔等)的具有期望的特异性、亲和力和能力的抗体的可变区，而恒定区对应于衍生自另一种哺乳动物(例如人)的抗体的序列，以避免引起该物种的免疫应答。
如本文所用，术语“多特异性抗体”是指包含多个免疫球蛋白可变结构域序列的抗体，其中第一免疫球蛋白可变结构域序列对第一表位具有结合特异性，并且第二免疫球蛋白可变结构域序列对第二表位具有结合特异性。在一个实施方式中，所述第一和第二表位在相同抗原上，例如，在相同的蛋白(或多聚蛋白的亚基)上。在一个实施方式中，所述第一和第二表位重叠或基本上重叠。在一个实施方式中，所述第一和第二表位不重叠或基本不重叠。在一个实施方式中，所述第一和第二表位在不同抗原上，例如，在不同的蛋白(或多聚体蛋白的不同亚基)上。在一个实施方式中，多特异性抗体包含第三、第四或第五免疫球蛋白可变结构域。在一个实施方式中，多特异性抗体是双特异性抗体分子、三特异性抗体，或四特异性抗体分子。
如本文所用，术语“双特异性抗体”是指结合不超过两个表位或两个抗原的多特异性抗体。双特异性抗体的特征在于对第一表位具有结合特异性的第一免疫球蛋白可变结构域序列和对第二表位具有结合特异性的第二免疫球蛋白可变结构域序列。在一个实施方式中，所述第一和第二表位在相同抗原上，例如，在相同的蛋白(或多聚蛋白的亚基)上。在一个实施方式中，所述第一和第二表位重叠或基本上重叠。在一个实施方式中，所述第一和第二表位在不同抗原上，例如，在不同的蛋白(或多聚体蛋白的不同亚基)上。在一个实施方式中，双特异性抗体包含对第一表位具有结合特异性的重链可变结合域序列和轻链可变结构域序列，和对第二表位具有结合特异性的重链可变结构域序列和轻链可变结构域序列。在一个实施方式中，双特异性抗体包含对第一表位具有结合特异性的半抗体或其片段，和对第二表位具有结合特异性的半抗体或其片段。在一个实施方式中，双特异性抗体包含对第一表位具有结合特异性的scFv或其片段，和对第二表位具有结合特异性的scFv或其片段。在一个实施方式中，所述第一表位位于CD47上，并且所述第二表位位于PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、EGFR、HER-2、CD19、CD20、CD33、CD73、爱帕琳肽(apelin)、DLL3、连接蛋白(claudin)18.2、TIP-1、叶酸受体α、CD3和/或其他与肿瘤相关的免疫抑制剂或表面抗原上。
如本文所用，术语“CD47”是指属于免疫球蛋白超家族的多重跨膜受体，已经表明其参与多种细胞过程，包括细胞迁移、粘附和T细胞功能。CD47，也称为整联蛋白相关蛋白(IAP)、卵巢癌抗原(OA3)、Rh相关抗原和MER6，最初被鉴定为人卵巢癌的肿瘤抗原，随后被证明在多种人类肿瘤类型中表达，包括血液肿瘤和实体瘤。CD47和信号调节蛋白α(SIRPα)(一种在巨噬细胞上表达的抑制蛋白)之间的相互作用，可防止对表达CD47的细胞的吞噬。另外，CD47在几乎所有非恶性细胞上均以低水平表达。术语“人CD47”是指源自人的CD47。人CD47的示例性氨基酸序列在GenBank登录号NP_001768.1(SEQ ID NO：207)中显示。
如本文所用，“特异性结合CD47”的抗体是指以1×10-7M以下，优选地为1×10-8M以下，更优选地为5×10-9M以下、1×10-9M以下、5×10-10M以下或1×10-10M以下的KD结合CD47，优选地结合人CD47的抗体。术语“KD”是指解离常数，其是从Kd与Ka之比(即，Kd/Ka)获得的，并被表示为摩尔浓度(M)。鉴于本公开，可以使用本领域的方法确定抗体的KD值。例如，抗体的KD可以通过使用表面等离子体共振来确定，例如通过使用生物传感器系统，例如系统，或者通过使用生物层干涉技术，例如Octet RED96系统。
抗体的KD值越小，所述抗体与靶抗原结合的亲和力越高。
根据一个特定的方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含重链互补决定区1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、轻链互补决定区1(LCDR1)、LCDR2和LCDR3，其具有以下多肽序列：
(1)分别为SEQ ID NO：177、46、47、178、112和179；
(2)分别为SEQ ID NO：51、52、53、117、118和119；
(3)分别为SEQ ID NO：54、55、56、120、121和122；
(4)分别为SEQ ID NO：57、58、59、123、124和125；
(5)分别为SEQ ID NO：60、61、62、126、127和128；
(6)分别为SEQ ID NO：180、181、182、129、130和131；
(7)分别为SEQ ID NO：72、73、74、138、139和140；
(8)分别为SEQ ID NO：78、79、80、144、145和146；
(9)分别为SEQ ID NO：81、82、83、147、148和149；
(10)分别为SEQ ID NO：84、85、86、150、151和152；
(11)分别为SEQ ID NO：87、88、89、153、154和155；
(12)分别为SEQ ID NO：90、91、92、156、157和158；
(13)分别为SEQ ID NO：93、94、95、159、160和161；
(14)分别为SEQ ID NO：96、97、98、162、163和164；
(15)分别为SEQ ID NO：99、100、101、165、166和167；
(16)分别为SEQ ID NO：102、103、104、168、169和170；
(17)分别为SEQ ID NO：105、106、107、171、172和173；
(18)分别为SEQ ID NO：108、109、110、174、175和176；或
(19)分别为SEQ ID NO：201、202、203、204、205和206；
其中，所述抗体或其抗原结合片段特异性结合CD47，优选人CD47。
SEQ ID NO：177显示为氨基酸序列GYTFTX1YY，其中X1是选自D或A的氨基酸。
SEQ ID NO：178显示为氨基酸序列X1NVGTY，其中X1是选自D或E的氨基酸。
SEQ ID NO：179显示氨基酸序列GQX1YSYPLT，其中X1是选自S或T的氨基酸。
SEQ ID NO：180显示氨基酸序列GYTFTSX1W，其中X1是选自S或Y的氨基酸。
SEQ ID NO：181显示氨基酸序列IDPSDSEX1，其中X1是选自T或A的氨基酸。
SEQ ID NO：182显示氨基酸序列X1RWGYYGKSAX2DY，其中X1是选自A或S的氨基酸，并且X2是选自I或M的氨基酸。
根据另一个特定方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含含有与SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41或43之一具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，或含有与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42或44之一具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。根据一个优选的实施方式，本发明所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41或43具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42或44具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区，分别地。
根据另一个特定方面，本发明涉及本发明的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，包括：
a.具有SEQ ID NO：1的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：2的多肽序列的轻链可变区；
b.具有SEQ ID NO：3的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：4的多肽序列的轻链可变区；
c.具有SEQ ID NO：5的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：6的多肽序列的轻链可变区；
d.具有SEQ ID NO：7的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：8的多肽序列的轻链可变区；
e.具有SEQ ID NO：9的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：10的多肽序列的轻链可变区；
f.具有SEQ ID NO：11的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：12的多肽序列的轻链可变区；
g.具有SEQ ID NO：13的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：14的多肽序列的轻链可变区；
h.具有SEQ ID NO：15的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：16的多肽序列的轻链可变区；
i.具有SEQ ID NO：17的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：18的多肽序列的轻链可变区；
j.具有SEQ ID NO：19的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：20的多肽序列的轻链可变区；
k.具有SEQ ID NO：21的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：22的多肽序列的轻链可变区；
l.具有SEQ ID NO：23的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：24的多肽序列的轻链可变区；
m.具有SEQ ID NO：25的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：26的多肽序列的轻链可变区；
n.具有SEQ ID NO：27的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：28的多肽序列的轻链可变区；
o.具有SEQ ID NO：29的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：30的多肽序列的轻链可变区；
p.具有SEQ ID NO：31的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：32的多肽序列的轻链可变区；
q.具有SEQ ID NO：33的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：34的多肽序列的轻链可变区；
r.具有SEQ ID NO：35的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：36的多肽序列的轻链可变区；
s.具有SEQ ID NO：37的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：38的多肽序列的轻链可变区；
t.具有SEQ ID NO：39的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：40的多肽序列的轻链可变区；
u.具有SEQ ID NO：41的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：42的多肽序列的轻链可变区；或
v.具有SEQ ID NO：43的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：44的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：45、46、47、111、112和113所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：1具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：2具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：1的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：2的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：48、49、50、114、115和116所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：3具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：4具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：3的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：4的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：51、52、53、117、118和119所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：5具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：6具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：5的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：6的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：54、55、56、120、121和122所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：7具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：8具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：7的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：8的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：57、58、59、123、124和125所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：9具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：10具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：9的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：10的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：60、61、62、126、127和128所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：11具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：12具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：11的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：12的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：63、64、65、129、130和131所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：13具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：14具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：13的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：14的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：66、67、68、132、133和134所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：15具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：16具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：15的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：16的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：69、70、71、135、136和137所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：17具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：18具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：17的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：18的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：72、73、74、138、139和140所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：19具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：20具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：19的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：20的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：75、76、77、141、142和143所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：21具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：22具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：21的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：22的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：78、79、80、144、145和146所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：23具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：24具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：23的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：24的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：81、82、83、147、148和149所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：25具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：26具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：25的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：26的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：84、85、86、150、151和152所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：27具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：28具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：27的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：28的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：87、88、89、153、154和155所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：29具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：30具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：29的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：30的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：90、91、92、156、157和158所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：31具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：32具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：31的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：32的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：93、94、95、159、160和161所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：33具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：34具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：33的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：34的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：96、97、98、162、163和164所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：35具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：36具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：35的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：36的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：99、100、101、165、166和167所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：37具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：38具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ IDNO：37的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：38的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：102、103、104、168、169和170所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：39具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：40具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQID NO：39的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：40的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：105、106、107、171、172和173所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：41具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：42具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQID NO：41的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：42的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：108、109、110、174、175和176所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：43具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：44具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQID NO：43的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：44的多肽序列的轻链可变区。
在一个实施方式中，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2和LCDR3，其分别具有SEQ ID NO：201、202、203、204、205和206所示的多肽序列。在另一实施方式中，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含含有与SEQ ID NO：199具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的重链可变区，和含有与SEQ ID NO：200具有至少85％，优选地90％，更优选地95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。优选地，所述分离的单克隆抗体或其抗原结合片段包含具有SEQ ID NO：199的多肽序列的重链可变区；和具有SEQ ID NO：200的多肽序列的轻链可变区。
根据另一具体方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段是嵌合的。
根据另一具体方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段是人的或人源化的。
根据另一个特定方面，本发明涉及分离的人源化单克隆抗体或其抗原结合片段，其中所述分离的人源化抗体或其抗原结合片段包括：
a.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
b.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
c.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
d.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
e.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
f.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
g.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
h.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
i.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
j.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：198的多肽序列的轻链可变区；
k.具有SEQ ID NO：187的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
l.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
m.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：196的多肽序列的轻链可变区；
n.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：197的多肽序列的轻链可变区；或
o.具有SEQ ID NO：199的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：200的多肽序列的轻链可变区。
根据另一具体方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段能够阻断CD47与血小板反应蛋白1(TSP1)和/或信号调节蛋白α(SIRPα)的结合。
根据另一具体方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段能够诱导巨噬细胞介导的癌细胞吞噬。
根据另一具体方面，本发明涉及一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段能够结合癌细胞，并且以最小至不可检测的方式结合红细胞。可以使用本领域已知的方法来确定癌细胞与本发明的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段的结合。
在另一个一般方面，本发明涉及一种编码本发明单克隆抗体或其抗原结合片段的分离的核酸。本领域技术人员可以理解，蛋白质的编码序列可以在不改变蛋白质的氨基酸序列的情况下被改变(例如替换、删除、插入等)。因此，本领域技术人员能够理解，可以在不改变蛋白质的氨基酸序列的情况下，改变编码本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的核酸序列。
在另一个一般方面，本发明涉及一种载体，其包含编码本发明单克隆抗体或其抗原结合片段的分离的核酸。鉴于本公开，可以使用本领域技术人员已知的任何载体，例如质粒、粘粒、噬菌体载体或病毒载体。在一些实施方式中，所述载体是重组表达载体，如质粒。所述载体可以包括用于构建表达载体的常规功能的任何元件，例如启动子、核糖体结合元件、终止子、增强子、选择标记和复制起点。启动子可以是组成型、诱导型或抑制型启动子。本领域已知，许多表达载体能够将核酸递送至细胞，其可以在本发明中使用，用于在细胞中产生抗体或其抗原结合片段。根据本发明的实施方式，可以利用常规克隆技术或人工基因合成生产重组表达载体。
在另一个一般方面，本发明涉及一种宿主细胞，其包含编码本发明单克隆抗体或其抗原结合片段的分离的核酸。鉴于本公开内容，本领域技术人员已知的任何宿主细胞可用于重组表达本发明的抗体或其抗原结合片段。在一些实施方式中，宿主细胞是大肠杆菌TG1或BL21细胞(用于表达例如scFv或Fab抗体)、CHO-DG44或CHO-K1细胞或HEK293细胞(用于表达例如全长IgG抗体)。根据具体的实施方式，通过常规方法例如化学转染、热休克或电穿孔将重组表达载体转化到宿主细胞中，其被稳定整合到宿主细胞基因组中，使得重组核酸得到有效表达。
在另一个一般方面，本发明涉及制备本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的方法，包括在一定条件下培养包含编码单克隆抗体或抗原结合片段的核酸的细胞，以产生本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段，并从细胞或细胞培养物(如从上清液中)中回收抗体或其抗原结合片段。可以从细胞中收获表达的抗体或其抗原结合片段，并根据本领域已知的和本文所述的常规技术进行纯化。
药物组合物
在另一个一般方面，本发明涉及一种药物组合物，其包含分离的本发明单克隆抗体或其抗原结合片段和药学上可接受的载体。如本文所用，术语“药物组合物”是指包含本发明的抗体和药学上可接受的载体的产品。本发明的抗体和包含它们的组合物也可用于制备药物，所述药物用于本发明提及的治疗性应用。
如本文所用，术语“载体”是指任何赋形剂、稀释剂、填充剂、盐、缓冲剂、稳定剂、增溶剂、油、脂质、含脂质的囊泡、微球体、脂质包封体、或本领域已知的用于药物制剂的其他物质。应当理解，载体、赋形剂或稀释剂的特性取决于具体应用的给药途径。如本文所用，术语“药学上可接受的载体”是指不干扰本发明所述组合物的有效性或本发明所述组合物的生物活性的无毒物质。根据具体实施方式，鉴于本公开内容，适用于抗体药物组合物的任何药学上可接受的载体均可用于本发明。
用药学上可接受的载体进行药学活性成分的配制是本领域已知的，例如雷明顿：制药科学与实践(例如，第21版(2005年)以及任何更高版本)。其他成分的非限制性实例包括：缓冲剂、稀释剂、溶剂、张度调节剂、防腐剂、稳定剂和螯合剂。一种或多种药学上可接受的载体可以用于配制本发明的药物组合物。
在本发明的一种实施方式中，所述药物组合物是液体制剂。液体制剂的优选实例是水性制剂，即包含水的制剂。液体制剂可以包含溶液、悬浮液、乳液、微乳液、凝胶等。水性制剂通常包含至少50％w/w的水，或至少60％、70％、75％、80％、85％、90％或至少95％w/w的水。
在一种实施方式中，所述药物组合物可以配制成可以，例如通过注射装置(例如，注射器或输液泵)注射的注射剂。例如，可以皮下、肌肉内、腹膜内、玻璃体内或静脉内递送注射剂。
在另一种实施方式中，所述药物组合物是固体制剂，例如冷冻干燥或喷雾干燥的组合物，其可以原样使用，或在使用前由医师或患者向其添加溶剂和/或稀释剂。固体剂型可包括片剂，例如压制片剂和/或包衣片剂，以及胶囊剂(例如，硬或软明胶胶囊)。所述药物组合物也可以是例如小包装、糖衣丸、粉末、颗粒、锭剂或用于重构的粉末的形式。
所述剂型可以是立即释放的，在这种情况下，其可以包含水溶性或分散性载体，或者其可以是延缓释放、持续释放或调节释放的，在这种情况下，其可以包含调节该剂型在胃肠道或皮下溶解速率的水不溶性聚合物。
在其他实施方式中，所述药物组合物可以通过鼻内、颊内或舌下递送。
水性制剂中的pH可以在pH 3至pH 10之间。在本发明的一种实施方式中，制剂的pH为约7.0至约9.5。在本发明的另一种实施方式中，制剂的pH为约3.0至约7.0。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含缓冲剂。缓冲剂的非限制性实例包括：精氨酸、天冬氨酸、二甘氨酸、柠檬酸盐、磷酸氢二钠、富马酸、甘氨酸、双甘氨肽、组氨酸、赖氨酸、马来酸、苹果酸、乙酸钠、碳酸钠、磷酸二氢钠、磷酸钠、琥珀酸、酒石酸、三甲基甘氨酸和三(羟甲基)-氨基甲烷及其混合物。缓冲剂可以单独存在，或以总计约0.01mg/ml至约50mg/ml，例如约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定缓冲剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含防腐剂。防腐剂的非限制性实例包括：苄索氯铵、苯甲酸、苯甲醇、溴硝醇、4-羟基苯甲酸丁酯、氯丁醇、氯甲酚、氯己定、氯苯甘醚、邻甲酚、间甲酚、对甲酚、4-羟基苯甲酸乙酯、咪唑烷脲、4-羟基苯甲酸甲酯、苯酚、2-苯氧基乙醇、2-苯基乙醇、4-羟基苯甲酸丙酯、脱氢乙酸钠、硫柳汞及其混合物。防腐剂可以单独存在，或以总计约0.01mg/ml至约50mg/ml，例如约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定防腐剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含等渗剂。该实施方式的非限制性实例包括盐(例如氯化钠)、氨基酸(例如甘氨酸、组氨酸、精氨酸、赖氨酸、异亮氨酸、天冬氨酸、色氨酸和苏氨酸)、醛醇(alditol)(例如丙三醇、1,2-丙二醇(丙二醇)、1,3-丙二醇和1,3-丁二醇)、聚乙二醇(例如PEG400)及其混合物。等渗剂的另一个实例包括糖。糖的非限制性实例可以是单糖、二糖或多糖，或水溶性葡聚糖，包括例如果糖、葡萄糖、甘露糖、山梨糖、木糖、麦芽糖、乳糖、蔗糖、海藻糖、右旋糖酐、支链淀粉、糊精、环糊精、α和β-HPCD、可溶性淀粉、羟乙基淀粉和羧甲基纤维素钠。等渗剂的另一个实例是糖醇，其中术语“糖醇”定义为具有至少一个-OH基团的C(4-8)烃。糖醇的非限制性实例包括甘露醇、山梨醇、肌醇、半乳糖醇、卫矛醇、木糖醇和阿拉伯糖醇。包含该段中列出的等渗剂的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。等渗剂可以单独存在，或以总计约0.01mg/ml至约50mg/ml，例如约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定等渗剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含螯合剂。螯合剂的非限制性实例包括柠檬酸、天冬氨酸、乙二胺四乙酸(EDTA)盐及其混合物。螯合剂可以单独存在，或以总计约0.01mg/ml至约50mg/ml，例如约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定螯合剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含稳定剂。稳定剂的非限制性实例包括一种或多种聚集抑制剂、一种或多种氧化抑制剂、一种或多种表面活性剂和/或一种或多种蛋白酶抑制剂。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含稳定剂，其中所述稳定剂是羧基-/羟基纤维素及其衍生物(例如HPC、HPC-SL、HPC-L和HPMC)、环糊精、2-甲硫基乙醇、聚乙二醇(例如PEG 3350)、聚乙烯醇(PVA)、聚乙烯吡咯烷酮、盐(例如氯化钠)、含硫物质(例如硫代甘油)或巯基乙酸。稳定剂可以单独存在，或以总计约0.01mg/ml至约50mg/ml，例如约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定稳定剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的其他实施方式中，所述药物组合物包含一种或多种表面活性剂，优选一种表面活性剂、至少一种表面活性剂、或两种不同的表面活性剂。术语“表面活性剂”是指由水溶性(亲水)部分和脂溶性(亲脂)部分组成的任何分子或离子。表面活性剂可以例如选自下组：阴离子表面活性剂、阳离子表面活性剂、非离子表面活性剂和/或两性离子表面活性剂。表面活性剂可以单独存在，或以总计约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定表面活性剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在本发明的另一种实施方式中，所述药物组合物包含一种或多种蛋白酶抑制剂，例如EDTA和/或盐酸(HCl)苯甲脒。蛋白酶抑制剂可以单独存在，或以总计约0.1mg/ml至约20mg/ml的浓度存在。包含这些特定蛋白酶抑制剂中的每一种的药物组合物构成本发明的替代实施方式。
在另一个一般方面，本发明涉及制备包含本发明的单克隆抗体或其抗原结合片段的药物组合物的方法，包括将所述单克隆抗体或其抗原结合片段与药学上可接受的载体组合以获得所述药物组合物。
使用方法
在另一个一般方面，本发明涉及一种阻断CD47与血小板反应蛋白-1(TSP1)结合的方法，或一种阻断CD47与信号调节蛋白α(SIRPα)结合的方法，所述方法包括向受试者施用本发明的药物组合物。
与CD47结合的抗体及其抗原结合片段的功能活性可以通过本领域已知的和本文所述的方法进行表征。表征结合CD47的抗体及其抗原结合片段的方法包括但不限于：亲和力和特异性测定，包括Biacore、ELISA和OctetRed分析；受体配体结合试验，以检测CD47与TSP1和/或SIRPα结合的阻断作用；吞噬作用试验，其中，对表达CD47的细胞进行荧光标记，并与巨噬细胞一起孵育，以检测阻断CD47与SIRPα的结合对巨噬细胞对表达CD47的细胞的吞噬作用的影响；血凝测定法，以检测抗CD47对红细胞的影响；以及基于细胞的测定法，以检测阻断TSP1-CD47相互作用对内皮细胞下游eNOS/NO/cGMP信号传导的影响。根据特定的实施方式，与CD47结合的抗体及其抗原结合片段的表征方法包括以下描述的那些。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的癌症的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。所述癌症可以是任何液体或实体癌，例如，其可以选自但不限于肺癌、胃癌、结肠癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱尿路上皮癌、转移性黑素瘤、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、头颈癌、胰腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤和其他实体瘤，以及非霍奇金淋巴瘤(NHL)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤(MM)、急性髓性白血病(AML)和其他液体肿瘤。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的炎性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的感染性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的动脉粥样硬化的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的心血管疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的代谢性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的辐射诱发的损伤的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
在另一个一般方面，本发明涉及治疗有需要的受试者的自身免疫性疾病的方法，包括向受试者施用本发明的药物组合物。
根据本发明的实施方式，所述药物组合物包含治疗有效量的抗CD47抗体或其抗原结合片段。如本文所用，术语“治疗有效量”是指在受试者中引起期望的生物或药物反应的活性成分或组分的量。根据所述目的，可以以经验和常规方式确定治疗有效量。
如本文所用，对于抗CD47抗体或其抗原结合片段，治疗有效量是指在有需要的受试者中调控免疫应答的抗CD47抗体或其抗原结合片段的量。同样地，如本文所用，对于抗CD47抗体或其抗原结合片段，治疗有效量是指治疗疾病、病症或症状；预防或减缓疾病、病症或症状发展；或减轻或完全减轻与疾病、病症或症状有关的症状的抗CD47抗体或其抗原结合片段的量。
根据特定的实施方式，待治疗的疾病、病症或症状是癌症，优选选自下组的癌症：肺癌、胃癌、结肠癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱尿路上皮癌、转移性黑素瘤、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、头颈癌、胰腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤和其他实体瘤，以及非霍奇金淋巴瘤(NHL)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤(MM)、急性髓性白血病(AML)和其他液体肿瘤。根据其他特定的实施方式，待治疗的疾病、病症或症状是炎性疾病、感染性疾病、动脉粥样硬化、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤、免疫性疾病和/或自身免疫性疾病。
根据具体的实施方式，治疗有效量是指足以实现1、2、3、4或更多种以下效果的治疗量：(i)减轻或改善待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的严重程度；(ii)减少待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的持续时间；(iii)预防待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状发展；(iv)使待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状退化；(v)预防待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的发展或发作；(vi)预防待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的复发；(vii)减少患有待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的受试者的住院治疗；(viii)减少患有待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的受试者的住院时间；(ix)增加患有待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状的受试者的存活率；(xi)抑制或减轻受试者中待治疗的疾病、病症或症状或与之相关的症状、和/或(xii)增强或改善另一种疗法的预防或治疗效果。
治疗有效量或剂量可根据各种因素而变化，例如待治疗的疾病、病症或症状、给药方式、靶位点、受试者的生理状态(包括，例如年龄、体重、健康状况)、受试者是人还是动物、施用的其他药物、以及该处理是预防还是治疗。优化滴定的治疗剂量，以优化安全性和有效性。
根据具体的实施方式，配制本文所述的组合物，以使其适合向受试者施用的预期途径。例如，本文所述的组合物可以配制成适合于静脉内、皮下或肌肉内施用的形式。
如本文所用，术语“治疗”、“治疗的”和“疗法”均指改善或逆转至少一种与下述疾病相关的可测的生理参数，所述疾病包括：癌症、免疫性疾病、病症或症状、自身免疫性疾病、病症或症状，或炎性疾病、病症或症状，感染性疾病、病症或症状、动脉粥样硬化的病症或症状、心血管疾病的病症或症状、代谢性疾病的病症或症状、辐射诱发的损伤的病症或症状，其在受试者中未必必须被辨别，但在受试者中可以被辨别。术语“治疗”、“治疗的”和“疗法”还可指使得疾病、病症或症状消退、阻碍其进展、或至少减缓其进展。在具体的实施方式中，“治疗”、“治疗的”和“疗法”是指减轻、预防与疾病、病症或症状(例如肿瘤，更优选地为癌症)相关的一种或多种症状的发展或发作，或减少其持续时间。在具体的实施方式中，“治疗”、“治疗的”和“疗法”是指预防疾病、病症或症状的复发。在具体的实施方式中，“治疗”、“治疗的”和“疗法”是指增加患有疾病、病症或症状的受试者的存活率。在具体的实施方式中，“治疗”、“治疗的”和“疗法”是指治愈受试者的疾病、病症或症状。
根据特定实施方式，可以将组合物与另一种治疗联合施用，用于治疗癌症，免疫性疾病、病症或症状，自身免疫性疾病、病症或症状，或炎性疾病、病症或症状，感染性疾病、病症或症状，动脉粥样硬化、病症或症状，心血管疾病、病症或症状，代谢性疾病、病症或症状、辐射诱发的损伤、病症或症状。对于癌症治疗，所述组合物可以联合使用的另一种治疗包括但不限于：化学疗法、抗CD20 mAb、抗CTLA-4抗体、抗LAG-3mAb、抗EGFR mAb、抗HER-2mAb、抗CD19 mAb、抗CD33 mAb、抗CD73 mAb、抗CD47 mAb、抗DLL-3mAb、抗爱帕琳肽(apelin)mAb、抗TIP-1mAb、抗CLDN18.2 mAb、抗FOLR1 mAb、抗PD-L1抗体、抗PD-1抗体、PD-1/PD-L1疗法、其他免疫肿瘤学药物、靶向疗法、抗血管生成剂、放射疗法，或其他抗癌药物。抗CD47抗体可用于构建具有伴侣mAb的双特异性抗体，所述伴侣mAb针对PD-1、PD-L1、LAG3、TIM-3、CTLA-4、EGFR、HER-2、CD19、CD20、CD33、CD73、爱帕琳肽(apelin)、DLL3、连接蛋白(claudin)18.2、TIP-1、CD3、叶酸受体α和/或其他肿瘤表面抗原，以治疗同时表达CD47和特定肿瘤相关抗原的癌症/肿瘤。
如本文所用，上下文中向受试者施用两种或更多种疗法的术语“联合”是指使用多于一种的疗法。使用的术语“联合”不限制向受试者施用的治疗的顺序。例如，向受试者施用第一种疗法(例如，本文所述的组合物)可以在施用第二种疗法之前(例如，提前5分钟、15分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、16小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周)，同时，或之后(例如，延后5分钟、15分钟、30分钟、45分钟、1小时、2小时、4小时、6小时、12小时、16小时、24小时、48小时、72小时、96小时、1周、2周、3周、4周、5周、6周、8周或12周)施用。
在另一个一般方面，本发明涉及一种确定受试者中CD47水平的方法。所述方法包括(a)从受试者获得样品；(b)使所述样品与本发明的抗体或其抗原结合片段接触；(c)确定受试者中CD47的水平。
如本文所用，“样品”是指从受试者分离的生物样品，可以包括但不限于全血、血清、血浆、血细胞、内皮细胞、活检组织(例如，癌组织、肝组织等)、淋巴液、腹水、组织液、骨髓、脑脊液、唾液、粘液、痰、汗液、尿液或任何其他分泌物、排泄物或其他体液。“血液样品”是指全血或其任何部分，包括血细胞、血清和血浆。“血液样品”可以例如包括癌细胞。
在某些实施方式中，可以利用选自但不限于下组的方法测定受试者中CD47的水平：蛋白质印迹分析、ELISA分析、FACS分析，和/或免疫组织化学(IHC)。相对蛋白水平可以通过蛋白质印迹分析、FACS分析和免疫组织化学(IHC)来确定，绝对蛋白水平可以通过ELISA分析来确定。当测定CD47的相对水平时，可以在至少两个样品之间测定的CD47水平，例如，在不同时间点来自同一受试者的样品之间、来自同一受试者的不同组织的样品之间，和/或来自两个受试者的样品之间的CD47的水平。可选地，当测定CD47的绝对水平时(例如通过ELISA分析)，可以通过在测试样品之前为ELISA分析建立标准来确定样品中CD47的绝对水平。本领域技术人员将理解，利用本发明的抗体或其抗原结合片段，可使用哪种分析技术确定来自受试者的样品中的CD47水平。
利用确定受试者样品中CD47水平的方法，可诊断疾病中CD47水平的异常(升高、降低或不足)并做出适当的治疗决策。这样的疾病可以选自但不限于癌症，优选的癌症选自下组：肺癌、胃癌、结肠癌、肝细胞癌、肾细胞癌、膀胱尿路上皮癌、转移性黑素瘤、乳腺癌、卵巢癌、宫颈癌、头颈癌、胰腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤和其他实体瘤，以及非霍奇金淋巴瘤(NHL)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、慢性骨髓性白血病(CML)、多发性骨髓瘤(MM)、急性髓性白血病(AML)和其他液体肿瘤、炎性疾病、感染性疾病、动脉粥样硬化、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤、免疫性疾病，和/或自身免疫性疾病。
实施方式
本发明还提供以下非限制性实施方式。
实施方式1是一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其包含重链互补决定区1(HCDR1)、HCDR2、HCDR3、轻链互补决定区1(LCDR1)、LCDR2和LCDR3，其具有以下多肽序列：
(1)分别为SEQ ID NO：177、46、47、178、112和179；
(2)分别为SEQ ID NO：51、52、53、117、118和119；
(3)分别为SEQ ID NO：54、55、56、120、121和122；
(4)分别为SEQ ID NO：57、58、59、123、124和125；
(5)分别为SEQ ID NO：60、61、62、126、127和128；
(6)分别为SEQ ID NO：180、181、182、129、130和131；
(7)分别为SEQ ID NO：72、73、74、138、139和140；
(8)分别为SEQ ID NO：78、79、80、144、145和146；
(9)分别为SEQ ID NO：81、82、83、147、148和149；
(10)分别为SEQ ID NO：84、85、86、150、151和152；
(11)分别为SEQ ID NO：87、88、89、153、154和155；
(12)分别为SEQ ID NO：90、91、92、156、157和158；
(13)分别为SEQ ID NO：93、94、95、159、160和161；
(14)分别为SEQ ID NO：96、97、98、162、163和164；
(15)分别为SEQ ID NO：99、100、101、165、166和167；
(16)分别为SEQ ID NO：102、103、104、168、169和170；
(17)分别为SEQ ID NO：105、106、107、171、172和173；
(18)分别为SEQ ID NO：108、109、110、174、175和176；或
(19)分别为SEQ ID NO：201、202、203、204、205和206；
其中，所述抗体或其抗原结合片段特异性结合CD47，优选人CD47。
实施方式2是如实施方式1所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其包含含有与SEQ ID NO：1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41或43具有至少95％的同一性的多肽序列的重链可变区，或含有与SEQ ID NO：2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、40、42或44具有至少95％的同一性的多肽序列的轻链可变区。
实施方式3是如实施方式1或2所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其包含：
(a)具有SEQ ID NO：1的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：2的多肽序列的轻链可变区；
(b)具有SEQ ID NO：3的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：4的多肽序列的轻链可变区；
(c)具有SEQ ID NO：5的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：6的多肽序列的轻链可变区；
(d)具有SEQ ID NO：7的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：8的多肽序列的轻链可变区；
(e)具有SEQ ID NO：9的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：10的多肽序列的轻链可变区；
(f)具有SEQ ID NO：11的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：12的多肽序列的轻链可变区；
(g)具有SEQ ID NO：13的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：14的多肽序列的轻链可变区；
(h)具有SEQ ID NO：15的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：16的多肽序列的轻链可变区；
(i)具有SEQ ID NO：17的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：18的多肽序列的轻链可变区；
(j)具有SEQ ID NO：19的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：20的多肽序列的轻链可变区；
(k)具有SEQ ID NO：21的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：22的多肽序列的轻链可变区；
(l)具有SEQ ID NO：23的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：24的多肽序列的轻链可变区；
(m)具有SEQ ID NO：25的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：26的多肽序列的轻链可变区；
(n)具有SEQ ID NO：27的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：28的多肽序列的轻链可变区；
(o)具有SEQ ID NO：29的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：30的多肽序列的轻链可变区；
(p)具有SEQ ID NO：31的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：32的多肽序列的轻链可变区；
(q)具有SEQ ID NO：33的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：34的多肽序列的轻链可变区；
(r)具有SEQ ID NO：35的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：36的多肽序列的轻链可变区；
(s)具有SEQ ID NO：37的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：38的多肽序列的轻链可变区；
(t)具有SEQ ID NO：39的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：40的多肽序列的轻链可变区；
(u)具有SEQ ID NO：41的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：42的多肽序列的轻链可变区；或
(v)具有SEQ ID NO：43的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：44的多肽序列的轻链可变区。
实施方式4是如实施方式1至3中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段抑制CD47和血小板反应蛋白-1(TSP-1)和/或CD47和SIRPα的相互作用。
实施方式5是如实施方式1至4中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段是嵌合的。
实施方式6是如实施方式1至5中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段是人的或人源化的。
实施方式7是如实施方式6所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述的抗体或其抗原结合片段包括：
a.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
b.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
c.具有SEQ ID NO：183的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
d.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
e.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：192的多肽序列的轻链可变区；
f.具有SEQ ID NO：184的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
g.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：190的多肽序列的轻链可变区；
h.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：191的多肽序列的轻链可变区；
i.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：193的多肽序列的轻链可变区；
j.具有SEQ ID NO：185的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：198的多肽序列的轻链可变区；
k.具有SEQ ID NO：187的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
l.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：194的多肽序列的轻链可变区；
m.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：196的多肽序列的轻链可变区；
n.具有SEQ ID NO：188的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：197的多肽序列的轻链可变区；或
o.具有SEQ ID NO：199的多肽序列的重链可变区和具有SEQ ID NO：200的多肽序列的轻链可变区。
实施方式8是如实施方式1至7中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段能够阻断CD47与血小板反应蛋白-1(TSP1)的结合和/或与信号调节蛋白α(SIRPα)的结合。
实施方式9是如实施方式1至7中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段能够诱导巨噬细胞介导的癌细胞吞噬。
实施方式10是如实施方式1至7中任一项所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其中，所述抗体或其抗原结合片段能够结合癌细胞，并且以最小至不可检测的方式结合红细胞。
实施方式11是一种分离的核酸，其编码如实施方式1至10中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段。
实施方式12是一种载体，其包含如实施方式11所述的分离的核酸。
实施方式13是一种宿主细胞，其包含如实施方式12所述的载体。
实施方式14是一种药物组合物，其包含如实施方式1至10中任一项所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，和药学上可接受的载体。
实施方式15是一种在有需要的受试者中阻断CD47与血小板反应蛋白-1(TSP1)结合的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式16是一种在有需要的受试者中阻断CD47与信号调节蛋白α(SIRPα)结合的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式17是一种在有需要的受试者中治疗癌症的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式18是一种在有需要的受试者中治疗炎性疾病的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式19是一种在有需要的受试者中治疗感染性疾病的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式20是一种在有需要的受试者中治疗动脉粥样硬化的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式21是一种在有需要的受试者中治疗心血管疾病的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式22是一种在有需要的受试者中治疗代谢性疾病的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式23是一种在有需要的受试者中治疗辐射诱发的损伤的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式24是一种在有需要的受试者中治疗自身免疫性疾病的方法，其包括向受试者施用如实施方式14所述的药物组合物。
实施方式25是一种确定受试者中CD47水平的方法，所述方法包括(a)获得一来自受试者的样品；(b)使所述样品与如实施方式1至10中任一项所述的抗体或抗原结合片段接触；(c)测定受试者中CD47的水平。
实施方式26是如实施方式25所述的方法，其中，所述样品是组织样品。
实施方式27是如实施方式26所述的方法，其中，所述组织样品是癌组织样品。
实施方式28是如实施方式25所述的方法，其中，所述样品是血液样品。
实施方式29是一种产生如实施方式1至10中任一项所述的单克隆抗体或抗原结合片段的方法，其包括在一定条件下培养包含编码单克隆抗体或抗原结合片段的核酸的细胞，以产生所述单克隆抗体或抗原结合片段，并从细胞或培养物中回收所述抗体或抗原结合片段。
实施方式30是一种制备包含实施方式1至10中任一项的单克隆抗体或抗原结合片段的药物组合物的方法，包括将所述单克隆抗体或抗原结合片段与药学上可接受的载体结合，以获得所述药物组合物。
实施例
实施例1：抗CD47单克隆抗体的鉴定
抗CD47单克隆抗体(mAb)从用重组人和食蟹猴CD47-HIS免疫的小鼠中产生。简而言之，在免疫后，使用huCD47-HIS和cyCD47-HIS包被的板通过ELISA估测血清中抗体的效价。收获B细胞并与骨髓瘤细胞系融合以产生杂交瘤。将杂交瘤接种到20×384孔板中，并通过ELISA筛选每个孔的上清液与人和食蟹猴CD47的结合。扩增400个杂交瘤，并通过FACS进一步分析其与RAJI细胞的结合、对CD47/SIRPα相互作用的阻断、在Octet上与重组huCD47的结合动力学，并测试了其与人血的血凝活性。然后通过将亲本杂交瘤以每孔1个细胞铺板在384孔板中，并通过ELISA筛选克隆上清液与huCD47的结合，克隆高度阳性杂交瘤。来自克隆杂交瘤的重链和轻链可变区通过5'RACE扩增并测序。这些来自放大培养的克隆的上清液用于利用蛋白A进行抗体纯化，以进行进一步的鉴定。
表1和表2分别提供了抗CD47单克隆抗体的重链和轻链可变区的序列，表3和表4中提供了抗CD47单克隆抗体的CDR区。使用IMGT方法确定抗CD47单克隆抗体的CDR区。
表1：抗CD47单克隆抗体(mAb)的重链可变区序列
/>
/>
VH：重链可变区
表2：抗CD47 mAb的轻链可变区序列
/>
VL：轻链可变区
表3：抗CD47 mAb的重链CDR区1-3
HC：重链；CDR：互补决定区
使用IMGT方法确定了抗CD47 mAb的HC CDR(Lefranc，M.-P.等，核酸研究，1999；27:209-212)。
表4：抗CD47 mAb的轻链CDR区1-3
/>
LC：轻链；CDR：互补决定区
使用IMGT方法确定了抗CD47 mAb的LC CDR(Lefranc，M.-P.等，核酸研究，1999；27:209-212)。
实施例2：使用FACS检测CD47 mAb与RAJI细胞的结合
通过流式细胞术分析抗CD47单克隆抗体结合细胞表面CD47的能力。将在汉克斯(Hank’s)平衡盐溶液(HBSS)中培养的RAJI(ATCC#CCL-86)细胞(20,000个细胞)与含有纯化的mAb(1μg/ml)的HBSS溶液或单独的HBSS溶液孵育。使用AlexaFluor488偶联的抗小鼠IgG二级抗体，通过FACS(Screener；阿尔伯克基，新墨西哥州)测量RAJI细胞上小鼠抗CD47 mAb的存在。图1中提供了抗CD47 mAb的FACS结合的分析结果。
实施例3：CD47 mAb阻断CD47/SIRPα相互作用的能力评估
通过ELISA分析法测量杂交瘤上清液或纯化的抗CD47mAb在阻断SIRPα/CD47相互作用中的活性。将重组人CD47(ECD)-HIS(1μg/ml)固定在384孔ELISA板上。在增加量的小鼠抗CD47 mAb的存在下，评估重组huSIRPα-huFc-生物素(终浓度0.5μg/ml)的结合，一式三份。使用偶联了HRP的链霉亲和素二抗(赛默飞世尔科技；沃尔瑟姆，马萨诸塞州)测定被结合的SIRPα。加入CD47、封闭溶液、SIRPα蛋白、二级抗体和检测试剂后，使用添加了0.1％吐温20的PBS进行洗涤步骤。图2A至2O提供了ELISA测定的结果。对于18M19A嵌合(在IgG4和κ骨架上)抗体(图2P)，在96孔ELISA板上测定了封闭活性。将重组人CD47(ECD)-HIS(1μg/mL)固定在板上。在增加量的人抗CD47 mAb的存在下测量重组huSIRPα-muFc(终浓度为0.5μg/mL)的结合，一式两份。使用偶联了HRP的抗muFc二抗(杰克逊免疫研究；西格罗夫，宾夕法尼亚州)测定结合的SIRPα。如上所述对板进行洗涤。用TMB检测底物(赛默飞世尔科技；沃尔瑟姆，马萨诸塞州)进行检测。图2P提供了ELISA测定的结果。
实施例4：抗CD47 mAb诱导血凝的潜力评估
为了评估抗CD47 mAb的血凝能力，将两倍连续稀释的纯化的mAb添加到96孔透明圆底培养皿中，并与含有2.5％人红细胞(huRBC)的PBS悬浮液(0.25％RBC最终浓度)一起孵育，在室温下放置1小时。圆底平板中央存在点状斑点，证明血凝缺乏。孔中均匀的颜色证明了发生血凝。图3A至3B提供了血凝试验的结果。
实施例5：嵌合13B18A在RAJI细胞异种移植模型中的体内功效的评估
通过将13B18A的可变区(VH和VL)分别融合到人IgG1重链和κ轻链的恒定区，来构建13B18A抗体的嵌合版本(13B18A-huIgG1)。所得抗体在CHO稳定库中稳定表达，并通过蛋白A亲和柱纯化。为了测试13B18A-huIgG1的功效，将RAJI细胞皮下接种在每只NOD/SCID小鼠的右侧(雌性，n＝10/组)。当平均肿瘤大小达到100mm3时，用指定剂量的测试物治疗小鼠。从第6天到第27天，每周静脉内给药3次，并在同一天使用卡尺以二维方式测量肿瘤体积。为了进行药代动力学(PK)分析，在最终剂量后48小时收集血清，并通过检测结合在重组人CD47(ECD)-HIS包被的ELISA板上的人Fc来测量血清中13B18A-huIgG1的水平。使用加入已知浓度的标准13B18A-huIgG1的血清来绘制标准曲线。用补充有0.1％吐温20的PBS洗涤后，先用HRP偶联的抗huFc二抗(杰克逊免疫研究；西格罗夫，宾夕法尼亚州)检测结合的抗体，然后用TMB检测底物(赛默飞世尔科技；沃尔瑟姆，马萨诸塞州)检测。图4A显示了肿瘤生长曲线。图4B显示了体重数据。图4C显示了药代动力学(PK)数据。
实施例6：抗CD47 mAb的人源化
小鼠抗CD47单克隆抗体13B18A、14P6A和17C6A被人源化，以降低用于人类患者时的免疫原性。将重链和轻链可变区(VH和VL)的序列与蛋白质数据库(PDB)中的人抗体序列进行比较，并建立同源性模型。将小鼠mAb的重链和轻链中的CDR移植到人框架区中，该框架区最有可能维持抗原结合所需的适当结构。在必要时，设计了从人残基到小鼠残基的反向突变或其他突变。表5和表6分别显示了人源化的VH和VL区的序列。人源化的VH和VL区分别与人IgG4重链和κ轻链的恒定区融合。使用对应于mAb序列的构建体在293E细胞中进行瞬时转染，并使用ELISA分析纯化的mAb阻断SIRPα/CD47相互作用的能力。结果以吸光度显示，其中较高的吸光度表示较高的SIRPα/CD47相互作用水平。表7提供了人源化单克隆抗体的IC50值。图5A至5B显示了人源化单克隆抗体H3L9和H5L5的IC50曲线。图6提供了血凝试验测定的结果。表8提供了人源化单克隆抗体H8L10的CDR区。
表5：人源化抗CD47 mAb重链可变区的序列
表6：人源化抗CD47 mAb轻链可变区的序列
表7：SIRPα/CD47相互作用测定中抗CD47 mAb的IC50值
/>
H1L2是指具有H1重链可变区和L2轻链可变区的mAb；表中所有其他人源化mAb均采用相同的命名规则。
表8：人源化单克隆抗体H8L10的重链和轻链CDR区1-3
CDR1(SEQ ID NO：) CDR2(SEQ ID NO：) CDR3(SEQ ID NO：)
HC GYTFTSYW(201) IDPSDSET(202) AGTDLAY(203)
LC QNINVW(204) KAS(205) QQGQSYPFT(206)
实施例7：红细胞(RBC)和RAJI细胞结合测定
通过流式细胞术分析抗CD47单克隆抗体H3L9、H5L5和H8L10结合细胞表面CD47的能力。将纯化的mAb连续稀释(1：3)到FACS缓冲液(含0.1％BSA和0.05％叠氮化钠的汉克斯平衡盐溶液(HBSS))中。纯化的mAb的最高浓度为190μg/ml。通过以600RPM(62×g)离心5分钟，在U型平板中沉淀红细胞或RAJI细胞(ATCC#CCL-86)(14,000个细胞)。将细胞重悬于FACS缓冲液中的20μL纯化抗体中，并在室温下孵育30分钟。温育后，用FACS缓冲液洗涤细胞3次。使用PE/Cy7偶联的抗人IgG(百进生计，货号#409316)二级抗体，通过FACS(Attune NxT流式细胞仪；卡尔斯巴德，加利福尼亚州)测量红细胞和RAJI细胞上抗CD47 mAb的存在。图7A至7B中提供了抗CD47 mAb的FACS结合的分析结果。
实施例8：基于细胞的SIRPα结合测定
RAJI细胞在RPMI+10％FBS中培养。将最终浓度为30nM的人SIRPα(ECD)-mFc(huSIRPα-muFc)蛋白(与小鼠Fc融合的人SIRPαECD)与30、90和300nM的纯化人源化抗CD47mAb一起孵育。然后将混合物添加到96孔圆形底板中的14,000个RAJI细胞中，混合并在室温下在章动器上孵育30分钟。然后将细胞以600rpm离心5分钟，并用FACS缓冲液(补充有0.1％BSA和0.05％叠氮化钠的HBSS)洗涤3次。然后将细胞与偶联FITC的驴抗小鼠Fc多克隆抗体(杰克逊免疫研究，货号：715-095-150)在室温下于章动器上一起孵育15分钟，然后用FACS缓冲液洗涤3次，然后重新悬浮在FACS缓冲液中。然后通过Attune NxT仪器检测细胞，并通过Attune NxT软件分析数据。图8显示了人源化抗CD47单克隆抗体H3L9、H5L5和H8L10在阻断huSIRPα-muFc与RAJI细胞结合中的活性的结果。
实施例9：巨噬细胞介导的吞噬作用测定
在含有50ng/ml GM-CSF(谢南多厄(Shenandoah)，货号：100-08-20ug)AIM-V培养基(赛默飞世尔，货号：12055091)中诱导人单核细胞6天。然后将巨噬细胞用100ng/ml INF-γ极化(谢南多厄，货号：100-77-100ug)2天。将M1巨噬细胞定义为CD14+、CD80+、CD163-和CD206+细胞群。从组织培养板上分离后，巨噬细胞用含有10％FBS的RPMI-1640洗涤一次，然后用冰冷的HBSS洗涤两次。在AIM-V培养基中将细胞数调整为2×106细胞/mL。在96孔板的每个孔中，将25μL测试单克隆抗体和25μL巨噬细胞悬浮液(50,000个细胞)添加到50μLCFSE标记的RAJI细胞(100,000个细胞)(赛默飞世尔，货号：34570)中，并在37℃下孵育2小时。mAb的终浓度为10ug/ml。共培养后，将细胞混合物用偶联了PE-Cy7的抗人CD14 mAb(Biolegend，货号：367111)染色。染色后，通过流式细胞仪分析细胞。PE-Cy7阳性巨噬细胞群中CFSE和PE-Cy7均为阳性的巨噬细胞的百分比呈现吞噬作用。图9显示了人源化抗CD47单克隆抗体H3L9、H5L5和H8L10在诱导巨噬细胞介导的RAJI细胞吞噬中的活性结果。
本领域技术人员将意识到，可以在不脱离本发明的广泛发明构思的情况下对上述实施例进行改变。因此，应当理解，本发明不限于所公开的特定实施例，而是旨在涵盖在本说明书所限定的本发明的精神和范围内的修改。
序列表
<110> 凡恩世制药公司
<120> 抗CD47抗体及其用途
<130> 689204.2WO
<150> US62/540,118
<151> 2017-08-02
<150> US62/657,094
<151> 2018-04-13
<160> 207
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
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100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 2
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
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1 5 10 15
Glu Arg Val Thr Leu Ser Cys Lys Ala Ser Asp Asn Val Gly Thr Tyr
20 25 30
Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Glu Gln Ser Pro Lys Leu Leu Ile
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Ser Gly Ser Ala Arg Asp Phe Thr Leu Thr Ile Thr Ser Val Gln Ala
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
Asp Val Gln Ile Thr Gln Ser Pro Ser Tyr Leu Ala Ala Ser Pro Gly
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Glu Thr Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
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Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
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Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Ser
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100 105 110
Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 14
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
Asp Val Gln Ile Thr Gln Ser Pro Ser Tyr Leu Ala Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Thr Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 15
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Ala His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Arg Asp Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 16
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
Asp Val Gln Ile Thr Gln Ser Pro Ser Tyr Leu Ala Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Thr Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<211> 120
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Ser Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
Ala Val Gln Ile Thr Gln Phe Pro Ser Tyr Leu Ala Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
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20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Arg Asp Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Gly Leu Arg Gly Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Ser Val Thr Val Ser
115
<210> 20
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
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1 5 10 15
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20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
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Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
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Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
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Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 21
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
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35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
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65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Arg Ser Pro Leu Asp His Trp Gly Gln
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Gly Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser
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<210> 22
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 22
Asp Val Gln Ile Thr Gln Ser Pro Ser Tyr Leu Ala Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Thr Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Thr Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
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Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
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Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
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Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 23
Glu Val Lys Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ser Gly Arg
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Thr Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asp Phe
20 25 30
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50 55 60
Ser Val Lys Gly Arg Phe Ile Val Ser Arg Asp Thr Ser Gln Ser Ile
65 70 75 80
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100 105 110
Val Ser Ala
115
<210> 24
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 24
Asp Ile Val Met Thr Gln Ala Ala Pro Ser Val Pro Val Thr Pro Gly
1 5 10 15
Glu Ser Val Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Lys Ser Leu Leu His Ser
20 25 30
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35 40 45
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Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Met Gln His
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Leu Glu Tyr Pro Phe Thr Phe Gly Ser Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 25
<211> 114
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 25
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
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Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
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100 105 110
Ser Ala
<210> 26
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 26
Asp Ile Gln Met Asn Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Thr Ile Thr Ile Thr Cys His Ala Ser Gln Asn Ile Asn Val Trp
20 25 30
Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Asn Ile Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ser Asn Leu His Thr Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Gly Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Ile Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Gly Gln Ser Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
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<211> 114
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 27
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ile Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Phe Ser Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr Leu Thr Val
100 105 110
Ser Ser
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<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 28
Asp Ile Val Met Ser Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ala Val Ser Val Gly
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Met Ser Cys Lys Ser Ser Gln Ser Leu Leu Tyr Ser
20 25 30
Ser Asn Gln Lys Asn Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln
35 40 45
Ser Pro Lys Val Leu Ile Tyr Trp Ala Ser Thr Arg Glu Ser Gly Val
50 55 60
Pro Asp Arg Phe Thr Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Val Lys Ala Glu Asp Leu Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln
85 90 95
Tyr Tyr Ser Tyr Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu
100 105 110
Lys
<210> 29
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 29
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Ser
20 25 30
Leu Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Glu Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Trp Ile Asp Pro Glu Asp Gly Glu Thr Lys Cys Ala Pro Lys Phe
50 55 60
Gln Asp Lys Ala Thr Ile Thr Ala Asp Thr Ser Ser Asn Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Thr Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Val Ile Ser Thr Val Val Ala Pro Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr
100 105 110
Thr Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 30
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 30
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Val Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 31
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 31
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Phe Met Asn Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Arg Ile Asn Pro Tyr Asn Gly Asp Thr Phe Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala His
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Ile Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Val Val Ala Thr Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 32
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 32
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Val Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Arg Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Phe Thr Phe Gly Ser Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 33
<211> 116
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 33
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Ser Phe Thr Gly Tyr
20 25 30
Phe Met His Trp Val Lys Gln Ser His Gly Lys Ser Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Arg Ile Asn Pro Tyr Asn Gly Asp Thr Phe Asn Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Ala Val Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala His
65 70 75 80
Met Glu Leu Arg Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Thr Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Gly Tyr Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Ser Val
100 105 110
Thr Val Ser Ser
115
<210> 34
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 34
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu Tyr Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Arg Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
50 55 60
Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile
65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Phe Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro His Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 35
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 35
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Asn Tyr
20 25 30
Val Ile His Trp Val Lys Gln Lys Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Tyr Asn Asp Gly Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ser Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Lys Gly Gly Thr Gly Thr Gly Asp Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 36
<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 36
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
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35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
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Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
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100 105 110
Lys
<210> 37
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 37
Glu Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Met Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Met Lys Val Ser Cys Val Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ser Pro Glu Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
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100 105 110
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115
<210> 38
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 38
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Thr Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
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100 105 110
<210> 39
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 39
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Pro Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Val Met His Trp Val Lys Gln Lys Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
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100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 40
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 40
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
Asn Gly Asn Thr Tyr Leu His Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser
35 40 45
Pro Lys Leu Leu Ile Tyr Lys Val Ser Asn Arg Phe Ser Gly Val Pro
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65 70 75 80
Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Leu Gly Val Tyr Phe Cys Ser Gln Ser
85 90 95
Thr His Val Pro Trp Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105 110
<210> 41
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 41
Glu Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Val Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Thr Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Asp Ser
20 25 30
Leu Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Glu Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Trp Ile Asp Pro Glu Asp Gly Glu Thr Lys Cys Ala Pro Lys Phe
50 55 60
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65 70 75 80
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100 105 110
Thr Leu Thr Val Ser Ser
115
<210> 42
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 42
Asp Val Val Met Thr Gln Thr Pro Leu Ser Leu Pro Val Ser Leu Gly
1 5 10 15
Asp Gln Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ser Ser Gln Ser Leu Val His Ser
20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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65 70 75 80
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85 90 95
Thr His Val Pro Leu Thr Phe Gly Ala Gly Thr Lys Leu Glu Leu Lys
100 105 110
<210> 43
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 43
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Ile Asn Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
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Val Thr Val Ser Ala
115
<210> 44
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 44
Glu Asn Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Ile Met Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Ser Ser
20 25 30
Tyr Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Ser Gly Ala Ser Pro Lys Leu Trp
35 40 45
Ile Tyr Ser Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser
50 55 60
Gly Ser Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Val Glu
65 70 75 80
Ala Glu Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Ser Gly Tyr Pro
85 90 95
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Gly Ala Ser
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Ser Gly Ser
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Ser Gly Ser
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Ser Gly Ser
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Ser Gly Ser
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Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
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Ser Gly Ser
1
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Arg Met Ser
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Gln Asn Ile Asn Val Trp
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Lys Ala Ser
1
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Gln Gln Gly Gln Ser Tyr Pro Trp Thr
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<211> 3
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Trp Ala Ser
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<211> 9
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Lys Val Ser
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Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
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Lys Val Ser
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Ser Gln Ser Thr His Val Pro Phe Thr
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Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
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Arg Val Ser
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Phe Gln Ser Thr His Val Pro His Thr
1 5
<210> 162
<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 162
Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
<210> 163
<211> 3
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 163
Lys Val Ser
1
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<211> 10
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Ser Gln Ser Thr His Val Pro Pro Leu Thr
1 5 10
<210> 165
<211> 11
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
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<211> 3
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Lys Val Ser
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Ser Gln Ser Thr His Val Pro Leu Thr
1 5
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<211> 11
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Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
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<211> 3
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<400> 169
Lys Val Ser
1
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<211> 9
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Ser Gln Ser Thr His Val Pro Trp Thr
1 5
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<211> 11
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 171
Gln Ser Leu Val His Ser Asn Gly Asn Thr Tyr
1 5 10
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<211> 3
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Lys Val Ser
1
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<211> 9
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 173
Ser Gln Ser Thr His Val Pro Leu Thr
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Ser Ser Val Ser Ser Ser Tyr
1 5
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<211> 3
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Ser Thr Ser
1
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<211> 9
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Gln Gln Tyr Ser Gly Tyr Pro Phe Thr
1 5
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<211> 8
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 177
Gly Tyr Thr Phe Thr Xaa Tyr Tyr
1 5
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<211> 6
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 178
Xaa Asn Val Gly Thr Tyr
1 5
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<211> 9
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 179
Gly Gln Xaa Tyr Ser Tyr Pro Leu Thr
1 5
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<211> 8
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<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Xaa Trp
1 5
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<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
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Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Xaa
1 5
<210> 182
<211> 13
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 182
Xaa Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Xaa Asp Tyr
1 5 10
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<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 183
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Arg Val Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 184
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 184
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Arg Val Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 185
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 185
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 186
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 186
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Leu Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ser Arg Trp Gly Tyr Tyr Gly Lys Ser Ala Met Asp Tyr Trp Gly Gln
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
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<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 187
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Trp Ile Tyr Pro Gly Ser Gly Asn Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Ile Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Gly Pro Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 188
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 188
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Arg Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Trp Ile Tyr Pro Gly Ser Gly Asn Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Ile Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Gly Pro Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 189
<211> 117
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 189
Gln Ile Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Ile Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ala Tyr
20 25 30
Tyr Ile Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Trp Ile Tyr Pro Gly Ser Gly Asn Thr Lys Tyr Asn Glu Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Ala Thr Leu Thr Val Asp Thr Ser Ala Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Ile Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Phe Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Gly Pro Trp Tyr Phe Asp Val Trp Gly Gln Gly Thr Thr
100 105 110
Val Thr Val Ser Ser
115
<210> 190
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 190
Ala Val Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 191
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 191
Ala Val Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 192
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 192
Ala Val Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Gln Arg Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Ala Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 193
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 193
Ala Val Gln Ile Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Gln Thr Ile Thr Ile Asn Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Glu Lys Pro Gly Lys Ala Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Ile Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 194
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 194
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Glu Asn Val Gly Thr Tyr
20 25 30
Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Asn Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr His Cys Gly Gln Thr Tyr Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 195
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 195
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Glu Asn Val Gly Thr Tyr
20 25 30
Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Asn Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr His Cys Gly Gln Thr Tyr Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 196
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 196
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Lys Ala Ser Glu Asn Val Gly Thr Tyr
20 25 30
Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Asn Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr His Cys Gly Gln Thr Tyr Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 197
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 197
Asn Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Lys Ala Ser Glu Asn Val Gly Thr Tyr
20 25 30
Val Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Asn Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Gly Ala Ser Asn Arg Tyr Thr Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Ala Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Asp Tyr His Cys Gly Gln Thr Tyr Ser Tyr Pro Leu
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys
100 105
<210> 198
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 198
Asp Val Gln Leu Thr Gln Ser Pro Ser Phe Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ala Ser Lys Ser Ile Ser Lys Tyr
20 25 30
Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Asn Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Ser Gly Ser Thr Leu Gln Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Glu Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Met Tyr Tyr Cys Gln Gln His Asn Glu Tyr Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 199
<211> 114
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 199
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Asn Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr His Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Leu Thr Val Asp Lys Ser Thr Ser Thr Val Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Gly Thr Asp Leu Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val
100 105 110
Ser Ser
<210> 200
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 200
Glu Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys His Ala Ser Gln Asn Ile Asn Val Trp
20 25 30
Leu Ser Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Lys Ala Ser Asn Leu His Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Gly Gln Ser Tyr Pro Phe
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105
<210> 201
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 201
Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr Trp
1 5
<210> 202
<211> 8
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 202
Ile Asp Pro Ser Asp Ser Glu Thr
1 5
<210> 203
<211> 7
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 203
Ala Gly Thr Asp Leu Ala Tyr
1 5
<210> 204
<211> 6
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 204
Gln Asn Ile Asn Val Trp
1 5
<210> 205
<211> 3
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 205
Lys Ala Ser
1
<210> 206
<211> 9
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 206
Gln Gln Gly Gln Ser Tyr Pro Phe Thr
1 5
<210> 207
<211> 323
<212> PRT
<213> 智人(Homo sapiens)
<400> 207
Met Trp Pro Leu Val Ala Ala Leu Leu Leu Gly Ser Ala Cys Cys Gly
1 5 10 15
Ser Ala Gln Leu Leu Phe Asn Lys Thr Lys Ser Val Glu Phe Thr Phe
20 25 30
Cys Asn Asp Thr Val Val Ile Pro Cys Phe Val Thr Asn Met Glu Ala
35 40 45
Gln Asn Thr Thr Glu Val Tyr Val Lys Trp Lys Phe Lys Gly Arg Asp
50 55 60
Ile Tyr Thr Phe Asp Gly Ala Leu Asn Lys Ser Thr Val Pro Thr Asp
65 70 75 80
Phe Ser Ser Ala Lys Ile Glu Val Ser Gln Leu Leu Lys Gly Asp Ala
85 90 95
Ser Leu Lys Met Asp Lys Ser Asp Ala Val Ser His Thr Gly Asn Tyr
100 105 110
Thr Cys Glu Val Thr Glu Leu Thr Arg Glu Gly Glu Thr Ile Ile Glu
115 120 125
Leu Lys Tyr Arg Val Val Ser Trp Phe Ser Pro Asn Glu Asn Ile Leu
130 135 140
Ile Val Ile Phe Pro Ile Phe Ala Ile Leu Leu Phe Trp Gly Gln Phe
145 150 155 160
Gly Ile Lys Thr Leu Lys Tyr Arg Ser Gly Gly Met Asp Glu Lys Thr
165 170 175
Ile Ala Leu Leu Val Ala Gly Leu Val Ile Thr Val Ile Val Ile Val
180 185 190
Gly Ala Ile Leu Phe Val Pro Gly Glu Tyr Ser Leu Lys Asn Ala Thr
195 200 205
Gly Leu Gly Leu Ile Val Thr Ser Thr Gly Ile Leu Ile Leu Leu His
210 215 220
Tyr Tyr Val Phe Ser Thr Ala Ile Gly Leu Thr Ser Phe Val Ile Ala
225 230 235 240
Ile Leu Val Ile Gln Val Ile Ala Tyr Ile Leu Ala Val Val Gly Leu
245 250 255
Ser Leu Cys Ile Ala Ala Cys Ile Pro Met His Gly Pro Leu Leu Ile
260 265 270
Ser Gly Leu Ser Ile Leu Ala Leu Ala Gln Leu Leu Gly Leu Val Tyr
275 280 285
Met Lys Phe Val Ala Ser Asn Gln Lys Thr Ile Gln Pro Pro Arg Lys
290 295 300
Ala Val Glu Glu Pro Leu Asn Ala Phe Lys Glu Ser Lys Gly Met Met
305 310 315 320
Asn Asp Glu

Claims (18)

1.一种分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其特征在于，包含重链互补决定区1（HCDR1）、HCDR2、HCDR3、轻链互补决定区1（LCDR1）、LCDR2和LCDR3，其具有以下多肽序列：
(1) 分别为SEQ ID NO：201、202、203、204、205和206；或
(2) 分别为SEQ ID NO：81、82、83、147、148和149；
其中，所述抗体或其抗原结合片段特异性结合CD47。
2.如权利要求1所述的分离的单克隆抗体或抗原结合片段，其特征在于，所述CD47为人CD47。
3. 如权利要求1所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其特征在于，包含：
a. 由SEQ ID NO：199的多肽序列组成的重链可变区和由SEQ ID NO：200的多肽序列组成的轻链可变区；或
b. 由SEQ ID NO：25的多肽序列组成的重链可变区和由SEQ ID NO：26的多肽序列组成的轻链可变区。
4.如权利要求1所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其特征在于，所述的抗体或其抗原结合片段是嵌合的，和/或人的或人源化的。
5.如权利要求1至4中任一项所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，其特征在于，所述抗体或其抗原结合片段能够阻断CD47与信号调节蛋白α（SIRPα）的结合，以诱导巨噬细胞介导的癌细胞吞噬，和/或结合癌细胞，并且以最小至不可检测的方式结合红细胞。
6.一种双特异性抗体，其特征在于，包括如权利要求1-5中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段。
7.一种分离的核酸，其特征在于，所述核酸编码权利要求1-5中任一项所述的单克隆抗体或抗原结合片段。
8.一种载体，其特征在于，所述载体包含如权利要求7所述的分离的核酸。
9.一种宿主细胞，其特征在于，包含如权利要求8所述的载体。
10.一种药物组合物，其特征在于，包含如权利要求1-5中任一项所述的分离的单克隆抗体或其抗原结合片段，和药学上可接受的载体。
11.一种权利要求10所述的药物组合物在制备在有需要的受试者中治疗一种疾病和/或病症的药物中的用途，其特征在于，所述疾病和/或病症选自下组：癌症、炎性疾病、感染性疾病、心血管疾病、代谢性疾病、辐射诱发的损伤和自身免疫性疾病。
12.如权利要求11所述的用途，其特征在于，所述心血管疾病为动脉粥样硬化。
13.一种阻断CD47与信号调节蛋白α（SIRPα）结合的方法，其特征在于，包括施用如权利要求10所述的药物组合物；
并且，所述方法为非疾病治疗方法和非疾病诊断方法。
14.一种确定样品中CD47水平的方法，其特征在于，所述方法包括：
a. 获得一样品；
b. 使所述样品与如权利要求1-5中任一项所述的抗体或其抗原结合片段接触；
c. 确定所述样品中CD47的水平；
并且，所述方法为非疾病治疗方法和非疾病诊断方法。
15.如权利要求14所述的方法，其特征在于，所述样品是组织样品或血液样品。
16.如权利要求15所述的方法，其特征在于，所述组织样品是癌组织样品。
17.一种制备如权利要求1-5中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段的方法，其特征在于，包括在一定条件下培养包含编码单克隆抗体或其抗原结合片段的核酸的细胞，以产生所述单克隆抗体或其抗原结合片段，并从细胞或培养物中回收所述抗体或其抗原结合片段。
18.一种制备包含如权利要求1-5中任一项所述的单克隆抗体或其抗原结合片段的药物组合物的方法，其特征在于，包括将所述单克隆抗体或其抗原结合片段与药学上可接受的载体结合，以获得所述药物组合物。
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