CN111100942B - 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用 - Google Patents

与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用 Download PDF

Info

Publication number
CN111100942B
CN111100942B CN201911414923.0A CN201911414923A CN111100942B CN 111100942 B CN111100942 B CN 111100942B CN 201911414923 A CN201911414923 A CN 201911414923A CN 111100942 B CN111100942 B CN 111100942B
Authority
CN
China
Prior art keywords
thermo
photo
tms3193
sensitive
male sterile
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201911414923.0A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111100942A (zh
Inventor
龙湍
唐杰
李佳林
刘昊
韩晓斌
曾翔
吴永忠
黄培劲
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hainan Bolian Rice Gene Technology Co ltd
Original Assignee
Hainan Bolian Rice Gene Technology Co ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Hainan Bolian Rice Gene Technology Co ltd filed Critical Hainan Bolian Rice Gene Technology Co ltd
Priority to CN201911414923.0A priority Critical patent/CN111100942B/zh
Publication of CN111100942A publication Critical patent/CN111100942A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111100942B publication Critical patent/CN111100942B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13Plant traits
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明提供了与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用,属于基因工程技术领域。通过图位克隆的方法,TMS3193被精细定位在1号染色体上,位于分子标记M3193‑2和Indel14430之间28.76Kb的区段内,该区段的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。该基因与标记Indel14420共分离,与标记M3193‑2和Indel14430紧密连锁。TMS3193的突变使水稻表现出长日高温不育,短日低温可育的光温敏感表型。tms3193的精细定位及共分离或紧密连锁标记的开发为水稻光温敏两系不育系的选育提供了新的不育基因源和分子辅助选择手段,在两系不育系选育中应用潜力巨大。

Description

与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用
技术领域
本发明属于植物分子生物学领域,具体涉及与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用。
背景技术
水稻是全球一半以上人口的主粮,提高水稻产量有助于帮助人类彻底摆脱饥饿问题。杂交水稻利用了水稻的杂种优势现象,使水稻的产量、抗性和适应性都有了较大提高。从上世纪60年代袁隆平先生提出利用水稻的雄性不育性生产杂交水稻开始,中国的杂交水稻经历了从三系到两系杂交稻的发展。三系杂交稻利用核质互作不育系进行杂交稻育制种,而两系杂交稻利用光温敏不育系进行杂交稻育制种。相对于三系不育系,两系不育系恢复系广、配组更为自由,大大简化了生产和繁殖过程,应用潜力巨大。
光温敏雄性不育系,其育性受到温度和光照长度的影响。按照对光温条件反应的不同,光温敏不育系可以分为四类:1)光敏不育系,在长日照下不育,短日照下可育;2)反光敏不育系,在短日照下不育,长日照下可育;3)温敏不育系,在高温下不育,低温下可育;4)反温敏不育系,在低温下不育,高温下可育。一般而言,光敏不育系的育性也受到温度的影响,而温敏不育系的育性并不受光照的影响。粳稻品种农垦58S和籼稻品种安农S-1是研究和应用最广泛的光温敏雄性不育系,目前生产上应用的光温敏不育系大部分都是这两个品种的衍生系。
为了更好地利用两系不育系,有必要分离控制光温敏雄性不育性的基因并阐明其分子作用机理。据不完全统计,目前己鉴定了20多个光温敏感型不育基因,其中,有pms3、tms5、CSA、tms9-1、Ugp1和Ugp2等6个基因已被克隆,tms-1、rpms-1和rtms-1等15个基因已完成了定位。虽然众多的水稻光温敏核不育基因被定位或克隆,但对于调控水稻光温敏核不育性状的分子基础依然知之甚少。目前生产上使用的光温敏不育系多带有tms5和pms3基因。
发明内容
本发明的目的是丰富现有技术中的光温敏核不育基因数量,提供一种含有水稻光温敏核雄性不育基因的分离的核苷酸片段,以及提供与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记。
本发明提供的分离的核苷酸片段中含有的水稻光温敏核雄性不育基因命名为tms3193。本发明在前期研究工作中,用钴60辐射10公斤93-11种子得到M0代。辐射后的种子种植于海南省临高县试验田,成熟后分单株收种,共获得M1代材料约6500份。选种子量较多的3617个M1代材料种植成株系,每个株系种50个单株。分别在分蘖期、孕穗期、抽穗期、开花期、灌浆期筛选株型、穗型、育性、产量等各种类型突变体,并收种保存。在其中3193号家系中发现一种突变体表现为雄性不育,被命名为tms3193。该突变体呈现长日高温不育,短日低温可育的光温敏雄性不育表型,该表型由突变后的TMS3193单基因控制。
本发明通过图位克隆的方法,将基因TMS3193精细定位在第1染色体短臂上的两个标记M3193-2和Indel14430之间28.76Kb的染色体片段内,并且本发明还发现该片段与标记Indel14420共分离,与标记M3193-2和Indel14430紧密连锁。
因此本发明首先提供了一种分离的核苷酸片段,其定位在水稻1号染色体上,对应于分子标记M3193-2和Indel14430之间28.76Kb的区段,所述片段的核苷酸序列如SEQ IDNO.8所示。所述的分离的核苷酸片段含有水稻光温敏核雄性育性调控基因TMS3193,该基因突变后导致水稻出现光温敏雄性不育表型。
本发明述及的水稻光温敏核雄性不育基因tms3193对应的野生型基因TMS3193定位在水稻1号染色体上,位于分子标记M3193-2和Indel14430之间28.76Kb的区段内,该区段的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。
本发明提供了含有所述分离的核苷酸片段的生物材料,所示生物材料为表达盒、表达载体、宿主细胞。
本发明提供了与SEQ ID NO.8所示区段共分离的分子标记,其为Indel14420,本领域技术人员能够理解分子标记Indel14420与所述水稻光温敏核雄性不育基因tms3193共分离,以及基于本发明的贡献,了解分子标记Indel14420、M3193-2、Indel14430与水稻光温敏核雄性不育表型共分离或紧密连锁。
在Indel14420序列覆盖的范围内,93-11和明恢63基因组序列存在一个CT的插入缺失。
所述共分离标记Indel14420的序列由如SEQ ID No.1所示正向引物和如SEQ IDNo.2所示反向引物扩增得到。共分离标记Indel14420的引物在以93-11基因组DNA为模板时能扩增出一条61bp的条带,在以明恢63基因组DNA为模板时能扩增出一条63bp的条带。
本发明提供了与SEQ ID NO.8所示区段紧密连锁的分子标记,其为M3193-2或Indel14430,本领域技术人员能够理解分子标记M3193-2或Indel14430与所述水稻光温敏核雄性不育基因tms3193紧密连锁。
本发明发现在M3193-2序列覆盖的范围内,93-11和明恢63基因组序列存在一个G/C的SNP差异。所述紧密连锁标记M3193-2可由如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示两条正向引物与如SEQ ID No.5所示反向引物共同扩增得到。扩增M3193-2的引物在以93-11基因组DNA为模板时能扩增出一条105bp的条带,在以明恢63基因组DNA为模板时能扩增出一条111bp的条带。
本发明发现在Indel14430序列覆盖的范围内,93-11和明恢63基因组序列存在一个GGGTGAATCA的插入缺失。该紧密连锁标记Indel14430由如SEQ ID No.6所示正向引物和如SEQ ID No.7所示反向引物扩增得到。Indel14430的引物在以93-11基因组DNA为模板时能扩增出一条231bp的条带,在以明恢63基因组DNA为模板时能扩增出一条241bp的条带。
基于本发明的发现,本发明提供了用于检测所述水稻光温敏核雄性不育基因tms3193的分子标记,其为以下任一分子标记:Indel14420、M3193-2和/或Indel14430。
进一步地,本发明提供了与水稻光温敏核不育性状相关的分子标记组合,该组合含有分子标记:Indel14420、M3193-2、Indel14430。
所述Indel14420由SEQ ID NO.1-2所示引物扩增得到;所述M3193-2由SEQ IDNO.3-5所示引物扩增得到;所述Indel14430由SEQ ID NO.6-7所示引物扩增得到。
本发明还提供了一种试剂盒,该试剂盒含有以下任一或多个引物组:
引物组1:SEQ ID NO.1-2所示引物、引物组2:SEQ ID NO.3-5所示引物、引物组3:SEQ ID NO.6-7所示引物。
本发明提供了上述分子标记、分子标记组合或试剂盒在检测水稻光温敏核雄性不育基因tms3193、或该基因的基因型中的应用。
当使用Indel14420标记引物进行扩增时,如果只出现61bp的条带,说明被检测材料含有tms3193纯合基因型;如果只出现63bp的条带,说明被检测材料是TMS3193纯合基因型;如果同时出现61bp和63bp条带,说明被检测材料是tms3193杂合基因型;
当使用M3193-2标记引物进行扩增时,如果只出现105bp的条带,说明被检测材料带是tms3193纯合基因型;如果只出现111bp的条带,说明被检测材料是TMS3193纯合基因型;如果同时出现105bp和111bp条带,说明被检测材料是tms3193杂合基因型;
当使用Indel14430标记引物进行扩增时,如果只出现231bp的条带,说明被检测材料带是tms3193纯合基因型;如果只出现241bp的条带,说明被检测材料是TMS3193纯合基因型;如果同时出现231bp和241bp的条带,说明被检测材料是tms3193杂合基因型。
本发明进一步提供了上述分离的核苷酸片段、生物材料、或上述分子标记Indel14420、M3193-2和/或Indel14430、或上述试剂盒在筛选或检测具有光温敏核不育表型的水稻中的应用。
本发明进一步提供了上述分离的核苷酸片段、生物材料、或上述分子标记Indel14420、M3193-2和/或Indel14430、或上述试剂盒在制备转基因植物、或作物改良育种、制种中的应用。
本发明提供的上述应用中,具体操作时,当使用Indel14420标记引物进行扩增时,如果只出现61bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现63bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现61bp和63bp条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;
当使用M3193-2标记引物进行扩增时,如果只出现105bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现111bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现105bp和111bp条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;
当使用Indel14430标记引物进行扩增时,如果只出现231bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现241bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现231bp和241bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型。
本发明还提供了所述tms3193基因及与tms3193紧密连锁的分子标记在筛选水稻光温敏不育系中的应用。在tms3193突变体与其它水稻品种或材料的杂交、回交或自交后代中,当使用Indel14420、M3193-2或Indel14430标记引物进行扩增时,如果只出现61bp、105bp或231bp的条带,说明被检测材料带是tms3193纯合基因型,具有光温敏雄性不育表型;如果只出现63bp、111bp或241bp的条带,说明被检测材料是TMS3193纯合基因型,不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现61bp和63bp,或105bp和111bp,或231bp和241bp的条带,说明被检测材料是tms3193杂合基因型,不具有光温敏雄性不育表型。
本发明将一个新的水稻光温敏核雄性不育基因tms3193定位在一个28.76Kb的染色体片段内,并与分子标记Indel14420共分离,与分子标记M3193-2、Indel14430紧密连锁。tms3193的鉴定为两系不育系的选育提供了新的基因资源,M3193-2、Indel14420和Indel14430等标记的开发可以高效准确的对光温敏核雄性不育表型的水稻进行筛选和检测,从而提高以tms3193为不育基因的两系不育系的选育效率。
附图说明
图1的A显示3193家系中可育植株的花粉碘-碘化钾溶液染色结果;图1的B显示海南临高早造长日高温条件下tms3193突变体的花粉碘-碘化钾溶液染色结果;图1的C显示海南陵水冬季短日低温条件下tms3193突变体的花粉碘-碘化钾溶液染色结果。
图2的A显示TMS3193基因在染色体上的位置;图2的B显示TMS3193基因的粗定位结果;图2的C显示TMS3193基因精细定位的结果及紧密连锁标记的位置。
图3是用紧密连锁标记M3193-2检测tms3193和明恢63的F3群体中不育株的基因型。泳道1、2分别为亲本tms3193和明恢63;29个样本为tms3193和明恢63的F3群体分离出来的不育单株。
图4是用紧密连锁标记Indel14430检测tms3193和明恢63的F3群体中不育株的基因型。泳道1、2分别为亲本tms3193和明恢63;11个样本为tms3193和明恢63的F3群体分离出来的不育单株。
图5是用共分离标记Indel14420检测tms3193和明恢63的F3群体中不育株的基因型。泳道1、2分别为亲本tms3193和明恢63;37个样本为tms3193和明恢63的F3群体分离出来的不育单株。
图6是用标记Indel14420检测不同品种和这些品种与tms3193的F1杂交种的基因型。图6的A中,泳道1-12分别为亲本tms3193、野香B、9311、明恢63、中花11、GD-7S、隆科638S、宜香B、特B、博II B、H28B、R51084;图6的B中泳道1-3为F1杂交种tms3193/野香B的3个不同单株、泳道4-6为F1杂交种tms3193/明恢63的3个不同单株、泳道7-11为F1杂交种tms3193/中花11的5个不同单株、泳道12为亲本tms3193、泳道13野香B、泳道14为9311。
图7是用标记Indel14430检测不同品种和这些品种与tms3193的F1杂交种的基因型。图7的A中,泳道1-12分别为亲本tms3193、野香B、9311、明恢63、中花11、GD-7S、隆科638S、宜香B、特B、博II B、H28B、R51084;图7的B中泳道1-3为F1杂交种tms3193/野香B的3个不同单株、泳道4-6为F1杂交种tms3193/明恢63的3个不同单株、泳道7-8为F1杂交种tms3193/中花11的2个不同单株。
图8是用标记M3193-2检测不同品种和这些品种与tms3193的F1杂交种的基因型。图8的A中,泳道1-9分别为亲本tms3193、野香B、9311、明恢63、GD-7S、隆科638S、博II B、H28B、R51084;图8的B中,泳道1-3为F1杂交种tms3193/野香B的3个不同单株、泳道4-6为F1杂交种tms3193/明恢63的3个不同单株、泳道7-8为F1杂交种tms3193/中花11的2个不同单株。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明,但不用来限制本发明的范围。在不背离本发明精神和实质的情况下,对本发明方法、步骤或条件所作的修改或替换,均属于本发明的范围。
若未特别指明,实施例中所用的技术手段为本领域技术人员所熟知的常规手段。
实施例1水稻光温敏核雄性不育突变体tms3193的表型和遗传分析
1)tms3193突变体的筛选
2013年6月用钴60辐射10公斤93-11种子得到M0代。辐射后的种子种植于海南省临高县试验田,成熟后分单株收种,共获得M1代材料约6500份。2014年春,选种子量较多的3617个M1代材料种植成株系,每个株系种50个单株。分别在分蘖期、孕穗期、抽穗期、开花期、灌浆期筛选株型、穗型、育性、产量等各种类型突变体,并收种保存。在其中3193号家系中发现一种突变体表现为雄性不育,被命名为tms3193。
2)tms3193突变体的表型分析
在临高正季栽培条件下,用碘-碘化钾溶液(0.6%KI,0.3%I2,w/w)对3193家系不同植株的花粉进行染色分析。如图1的A所示,可育植株的花粉粒绝大部分大而圆,并且被染成蓝黑色。而tms3193突变体的花粉粒小而皱缩,并且不能被染色(如图1的B)。此外,可育植株套袋自交后正常结实,而tms3193突变体套袋自交后不结实。而以水稻品种93-11为父本给tms3193突变体授粉则可以结实。这些结果表明该tms3193突变体在长日高温条件下表现出雄性不育表型。将tms3193突变体的稻兜在2015年冬季种植于海南省陵水县提蒙镇,安排稻蔸在1-2月抽穗(经查询当时平均温度为17-24℃)。对抽穗后的花粉粒进行碘-碘化钾溶液(0.6%KI,0.3%I2,w/w)染色,结果表明花粉粒大而饱满,并被染成蓝黑色(图1的C),说明tms3193突变体的雄性育性在短日低温条件下发生了转育,是一个光温敏雄性不育突变体。
3)tms3193突变体的遗传分析
在长日高温条件下种植tms3193的M6代分离群体67株,其中48株育性正常,19株表现雄性不育,可育与不育株分离比符合3:1(χ2=0.19,P>0.05)。用tms3193突变体与93-11回交,在回交后代一个90株的F3分离群体中,68株育性正常,22株不育,可育与不育株分离比也符合3:1(χ2=0.01,P>0.05)。上述结果表明tms3193的雄性不育性状受由一对隐性单基因控制。
实施例2光温敏雄性不育基因TMS3193的初步定位
使用极端性状混合池分析法(bulked segregant analysis)和隐性群体分析法(recessive-class analysis)对TMS3193基因进行定位。以明恢63为父本与tms3193突变体杂交构建了一个F2群体,分离出了205个不育株。利用301对均匀分布于12条染色体上的SSR标记筛选93-11与明恢63之间具有多态性的标记,筛选得到64对具有多态性的SSR标记,多态性较低,表明明恢63与93-11在基因组序列上差异较小。分别构建所述F2群体的可育株和不育株的混合基因池,利用所述64对多态性标记对所述可育基因池与不育基因池进行分析。结果表明1号染色体上的SSR标记RM243和RM023与tms3193的突变表型存在连锁关系。进一步利用上述连锁标记逐个分析明恢63和tms3193的F2群体中的不育株的基因型,最终确定目标基因初步定位于SSR标记RM243和RM023之间,由此将TMS3193粗定位于1号染色体上(图2的A),通过在SSR标记RM243和RM023之间继续筛选多态性标记,得到RM10526、RM10544。TMS3193基因与RM243、RM10526和RM10544标记之间的交换单株分别为1个,4个,5个(图2的B)。
实施例3水稻光温敏雄性不育基因TMS3193的精细定位
在上述粗定位结果的基础上,使用隐性群体分析法(recessive-class analysis)进行精细定位。利用连锁标记挑选F2群体中的tms3193杂合单株发展了一个F3群体,包含3322个单株,其中分离出不育株904株。同时,在标记RM243和RM10526之间进一步开发了5个多态性标记。其中,用于检测分子标记Indel14420的引物如SEQ ID NO.1-2所示;用于检测分子标记M3193-2的引物如SEQ ID NO.3-5所示;用于检测Indel14430的引物如SEQ IDNO.6-7所示。利用这些标记逐个检测F3群体中分离出不育株的基因型,发现在M3193-2标记处只有1个不育株扩出了105bp和111bp的条带,而其它不育株都只扩出了105bp的条带(图3)。这说明在904个不育单株中,有903个单株只扩增出了105bp条带,即具有105bp纯合带型时,有99.9%(903/904)的植株都表现出光温敏雄性不育表型。而在Indel14430标记处也只有1个不育株扩出了231bp和241bp的条带,而其它不育株都只扩出了231bp的条带(图4)。这也说明在具有231bp纯合带型时,有99.9%(903/904)的植株都表现出光温敏雄性不育表型。
标记Indel14420在标记M3193-2和Indel14430之间(图2的C),在标记Indel14420处所有不育株都只扩增出了一条61bp的带型(图5)。这些结果说明TMS3193基因定位在标记M3193-2和Indel14430之间28.76Kb的染色体片段内,该28.76Kb片段的核苷酸序列如SEQID NO.8所示,并且与标记Indel14420共分离(图2的C)。
实施例4M3193-2、Indel14430和Indel14420在不同品种中的多态性
为了验证M3193-2、Indel14430和Indel14420三个标记在指示tms3193突变体光温敏雄性不育表型上的特异性,本发明分析了在多个品种中三个标记的多态性。这些品种包括两系不育系GD-7S、隆科638S,三系保持系野香B、宜香B、特B、博II B、H28B,恢复系9311、明恢63、R51084,常规品种中花11。tms3193与这些品种的杂种F1均没有光温敏不育表型。图6的A显示,Indel14420除了在tms3193和9311中扩增出61bp条带外,在其它亲本中只扩增出了63bp条带,图6的B显示在tms3193与其它亲本的F1杂种中同时扩增出了61bp和63bp条带,说明Indel14420可以在不同品种中特异性标记tms3193的光温敏雄性不育表型。图7的A显示,Indel14430除了在tms3193和9311中扩增出231bp条带外,在其它亲本中只扩增出了241bp条带,图7的B显示在tms3193与其它亲本的F1杂种中同时扩增出了231bp和241bp条带,说明Indel14430可以在不同品种中特异性标记tms3193的光温敏雄性不育表型。图8的A显示,M3193-2除了在tms3193和9311中扩增出105bp条带外,在其它亲本中只扩增出了111bp条带,图8的B显示在tms3193与其它亲本的F1杂种中同时扩增出了105bp和111bp条带,说明M3193-2可以在不同品种中特异性标记tms3193的光温敏雄性不育表型。
实施例5利用tms3193基因转育新的光温敏不育系
用tms3193突变体与育性正常的受体,如博IIB和野香B,进行杂交、回交和自交,并在此过程中用分子标记进行tms3193基因和遗传背景选择,最终获得博IIB和野香B背景下带有纯合tms3193突变基因的隐性核不育系。具体实施步骤如下:
1、以受体亲本,如博IIB和野香B,为父本与母本tms3193杂交获得F1。
2、以F1为母本与受体亲本,如博IIB和野香B,回交获得BC1F1。
3、种植BC1F1,分别使用引物序列如SEQ ID No.1-2、或SEQ ID No.3-5、或SEQ IDNo.6-7的引物对检测tms3193基因型,选择tms3193杂合基因型,即PCR扩增产物的条带同时出现61bp和63bp条带,或同时出现111bp和105bp条带,或同时出现231bp和241bp条带。
4、使用一组基因型(例如200个)在tms3193突变体和轮回亲本之间存在多态性,且分布均匀的分子标记(包括但不限于SSR、SNP、INDEL、EST、RFLP、AFLP、RAPD、SCAR类型标记),对步骤3中选出的单株进行遗传背景鉴定,选取与轮回亲本基因型相似度高(如大于88%相似度,或2%中选率等)的植株。
5、用步骤4中选出的植株与受体亲本,如博IIB和野香B,回交获得BC2F1。
6、种植BC2F1,重复步骤3和步骤4,选出tms3193基因型杂合,遗传背景回复率高(如大于98%,或2%中选率等)的植株,收自交种BC2F2。
7、种植BC2F2,重复步骤3和步骤4,选出tms3193基因型杂合,遗传背景纯合率最高的植株,收自交种BC2F3。BC2F3后代中分离的tms3193纯合株即tms3193基因的光温敏不育系。
以上所述仅是本发明的优选实施方式,应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明技术原理的前提下,还可以做出若干改进和润饰,这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 海南波莲水稻基因科技有限公司
<120> 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用
<130> KHP191116325.9
<160> 8
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
taccaaccca atgtccc 17
<210> 2
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
ctactgacca tccgctgt 18
<210> 3
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
aaaaaattcc caggccgccg cacg 24
<210> 4
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
attcccaggc cgccgctcc 19
<210> 5
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
cgacggcatg caactgcg 18
<210> 6
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
taagcatttg gcatgaacc 19
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
ttttcctgaa gaagggatat 20
<210> 8
<211> 28768
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
ttgttcaatt atacaagtgg aatttcaatt taatgtttac tccctccgtt tcaggttata 60
agatgttttg actttacttc gagtttgacc aagttataga aaaaaaatag taatattttt 120
tacccaagat aaatttatta taaaaatata ttgaattatt aatttaatta aactaatttg 180
ataatgtaaa tattactata tttgtttata aacttagtca aacttaaagc attttaactt 240
tgaccaaagt caaaatatct tataatctga aatggagggg tacaagtatt catgataaaa 300
tcaaaactct attgctagta cgtatatttc taatcctaat cctagtagaa tgcgattaga 360
gtcaacacac ggtatctcgg atgggagagt cgcttatttg gttcatcgat ctttccgtgt 420
gttctcgacg tgttccccgg acaggacgta ccgtattctc atcaatatac tatacaggcg 480
aaaatctgca ggtgagagag gttgtcaaat ttcttttctg cttttctttt actattctct 540
ctctctcttt cgcttgatat tcccaaacta tatatataca caacataatg acatgcatct 600
aggaccaaat taaactcatc gcatggaggg gcaacatgaa aacgagttac aggaaagaca 660
agcaaatcgc cccaagcgga ggagacggcg gctgccgtgg tggtactcgg ttcagatcga 720
cacgaaacgg cgaataggca gaagaaccag gctactcctg agagaaaact gcggcctcta 780
ctcgatatgc cagggtaggt acttaaaatt cacacgcctg ggctcccatc gctctctcgt 840
cattcgagcg aaggaactgc aatcctccta ctaccaccgc gtcctcgagg ctgggatgga 900
gagctgggag gagtacaccg tgcaggacag ggaggaggtc cgggcgctga tagacgagat 960
cgtcgagctc taccggagat cgattcccag gccgccgcac gacgtggttc gcgaacgtcg 1020
acgacgtggg catcgtcgga tcgtcgttgt cgacgacgac gttcgccgcc gcagttgcat 1080
gccgtcgtcg tcgtcctgcg tgtttgtggg gggcgctgtg tttctcattg ttcttatggg 1140
gtggatcttt gggcatgtgt ttcttcttgt ttttttctcg tggatcttaa gctttgtttg 1200
tttcaactca aggtttcact aggttattgt aatctaatat aaaccagatt actataagct 1260
ggattataat aagttatgag ttttttctct agattattgg gtttgaaaag ctaatgtcta 1320
taatacccta agctattgcg gagtgggagg aggatgagag acggcggcgg catggcttgg 1380
gaaggagccg gagtgtaggg tgggagctta gggaaggatt tgcacgcgac tagggagaga 1440
gaaagcagat gcacgtgcgg ccgagggaga ttcgcgcgcg actggagaga gaggaagcgg 1500
atgcgctcaa cctgataggt tcgatggtag tggtggataa tttgcataaa atttttaagg 1560
gtagtgggtc tttagccgga caataatatg aaaaaaaaac gtttagatga gactaccaga 1620
ttatactaat ctggtttata aattataata atctatcata ataatccact tatttgcttc 1680
atattattac taataatcca aatcctatct tattatatag ttgatgtcca ctaactacta 1740
aagcttaaca tgtaactgtt ccacgtcatc atccactagc aattattatc tagagtattt 1800
taaatcacat gcaagtgtac catatcatca cccattagca attattattt agagtatttt 1860
aaatatcatg caaacatgac atatcaatta taattttgtt gtatttttag aactcaatat 1920
gcaagcaata ttaaatcgtt atatatctct acaccatttt tacattattg aaacatatac 1980
atctaccatt tcactccata aatcatggga ttagctaaaa agctgtcgag tattttttag 2040
gaaaaacttt cgaatctaac tacattatat aatttcatta gaactatact ataataataa 2100
taacttgtat atatgtatta aaacaatata tgcaacttta tatcttatat agagataaca 2160
atttagttat agtgtagtta cactatactt acaatataag tatataacaa tagtataact 2220
acaatgtagt tagcatgtaa ctagaatgta acttagatgt aacttgaaca aatctgccat 2280
aaacatgtga tgatgagact agcttgtgaa aaagagggtt tagatctgat agcaaaatat 2340
ctcagcacaa atcttagcgc ggaatcaacg accaaaaaat tgacagtttt caggattgaa 2400
aactatcgac agttagctag caaaaccgta aatcatatat acatgcatta atccacatat 2460
cccgcaacaa aacgcggggt atcaactaat aattataata attctaagct gaaacaaata 2520
gagcatcagt ctttgtcaac tattgtttcg gtgatcctaa aacaaaagtt gtatgtgttc 2580
cttaaacgac ggtgttcagg gttttttttt ggcttgatgc gacctatcat ggcacaaatt 2640
aaaatatgag gtggtttatt ttatatccgg agatcataaa atgtttgtca cgctaggtca 2700
tttaaggggt gtttgggaga gaggggctaa atttgagatc agggactttt ggttttgagc 2760
aagtttaata gtatagccaa ctactagctt taattcattt atagtcaatc taatagcttt 2820
tttttcgggg aatctaatag cttattcata caatagttac atactacact aataatacct 2880
ggccccacct gtcatacaca cactgcgtct tggagtccgt gctatagctg gctataaatc 2940
tgtagcccgc tgctcttctc tctgctcatt tatctgttta aaatatattt gcagctggct 3000
tatagcatgc tattgtacct gctcttacgg tcgcttggct ggcatgtttt gagggggaaa 3060
accgttacga ggttgggccg cgcgcggccg gcgtaccggc gtctggaagc cgctgtgtgc 3120
ttttaccgta caacaatcgc cgcgcagcca cacaagcacg ctttttagct agtacaccgg 3180
cccgtgcgaa cgaatcgctc tgtaaactcg catacacgaa aacatggaca cattttccag 3240
gtgcagacaa gttaggctga gccttttggg ctagaaaaaa aaaaaaggac atcccggcac 3300
aaaccgtgcc ttctcagccg ctcacgacgc ggccacgccc aagcgttttc acccgagccg 3360
gaccaacctg gctctggctg gtataatacg cggtttcaga tcctgatgag gcagcgacga 3420
cggcgacgca ggaggtgcac acaggctcct cgactcgtga ggcgaactct ccctcggcat 3480
cgctacgtga aggtaattaa cacgcgcgct ggggctccct cccacgcgca tcgccctcac 3540
cgtgcgcgcc gatgagctat ggctaccgcg acgtacgtcc cgtcctcgtg gacaaaggcc 3600
gggatcgagg agtacacacc gagcgggaca ggggagtaca caccgagcgg gacaggggag 3660
gaggtgcagc atcgtacgtg gagatcatcg tctgtggtcc gactcggaga tcgtccatgg 3720
ccaaagccac cgccggacgc cgtcgttcgc gaacgtacgt cgtcgacgtg agcagcgtcg 3780
ggttgccgac gttcgaggga gctcctccgt gtggtctcgc gtgtttgggg ggggtgggtg 3840
ctcttaattc gacttcaata taatcgtaga cggtggtgtt gcgagtgaaa ttcgaattta 3900
aggattgcac gtttgcaccc ttcgattagc ttgcctccat ttttacagat ttacagggtc 3960
atttttatca ggaaaatatc cggttctata aaggtcagtg tatagataca gtcagagatt 4020
ggtctcataa actaagacat gtcgatcgac aagggagtaa atatacacat tcattgaatt 4080
tggacttttg ccacggcaca gaaacactga acaaaatgtg cctttgttca atacaatcaa 4140
gaaaaggaat aataaaaagg aatgaaaatc ctctatccta ttaatctagc tataataagg 4200
aactatacag gtatttacgg gaacatgtca gattgcctac gtaaggtttt tgctatgcct 4260
ccatcgaaag tcgaaatagg cgattcaaga aaatacgagg ataaagttga tccccaaacc 4320
accaccatct gcatgccttc atgcaaatac tggggaaacc agcgaaacta tgctgctatt 4380
gccactactg tgccacttac tatggtcaac accagcttat tgcatctcta gcaacaaatt 4440
gtattgtcta acaaaacttc tacaagttca catgaagctc atccagatat actaaggtct 4500
gtcatgcttc tgtcagcaat atatgccttt atatccctga aaagatttaa aagggaaaaa 4560
gataattaac aagccaattg gaaaaaataa aattgtgaaa attatttcac aactccggaa 4620
ggcagatcaa tattgcgggt gatgcacact ttacctgcat ctgggagctg aacagtctgc 4680
attgtcacaa agcagtgagt gcgtgaacag cagtttccac atgaatacac acatatggca 4740
acctcctcca ccacgggcac gggtatgaca tcgtacacca tggaagaaca gtttctttaa 4800
cgtcaaacaa agtttggaag tgcaacttcg atcaaaacat cttgatgcat gcaccaagcc 4860
ttcaaggtag tcctgctttg aaagcatcca attcattagc aagaggcacc gtaaatatca 4920
ctagcagaaa ataatatttg ggatgaaacc acataattac cacattagaa tctaaaagct 4980
catagaatat ttttcatcct gattgaaaat ttggatatgc agtcacaaaa tactgggaca 5040
aaacataaca tgaagcaaca cataagaata gtgaagcata cacttcacac atatgctcaa 5100
gattaaacca aaaggataaa attatggaac aaataataat agtgcaactc acttatattc 5160
tacagtttat gccaaatata atcatgcgaa gagcaaacaa ccaaaaaaaa atcagatccc 5220
cagagttgtt cccaaaaaat cagaagatgt taatttcgag tgcataataa acattcatga 5280
aaaacacaaa taggagatga aaaagattca gctaccaatt taaggatacc tgtagagtgt 5340
acttctgcaa tacgtgatgg tcttttttct gcctcaactt atgaatatgc aaactttcac 5400
cgtcttgttt atagcatgaa tcacaaaagt tgcagcctag gcaaaccaag caccgccatg 5460
ccaagcattg atccatggca cggtgacaag aagaacaagt tgaatcatgt agatgataaa 5520
gaatcatcat tgtggaatgt tttgccctcc ggagagtatc aaactggtat tgattgtctt 5580
gacaatgctt caggaaatct attctgctgt caaagtactt gctttccatt gttggatcta 5640
catcatccgt ttctggaaga ggttcttcct ctatctgtca gaggagatta gtaatctggt 5700
tagtatttcc atgcaggcag attgtagcta ccttaaatag atgaattcat atacgtactc 5760
tttcaaatgc atgcttttgt tttgttgtag ctgggtgcct gtccttcaga ggggtattca 5820
gctcctcagc ataacaacta cgaggacaaa taagaatggc atcataaata atgggtgcct 5880
taacgacaaa gagtaattga ataacaacaa aagagtagga atgtagattc attttgcaat 5940
ttgacaggca aacggtcact gtataagcta gaatggttga actatgcaag tgccatgtgc 6000
aattatatat ttttaccaac agcagacatt tcccctagtg ctgttccaga aagttcttca 6060
gtatgggaaa tgcattctat atggtcacaa aagtttacat gactgaatgc ttaccgttca 6120
caaagaaaga agtttttgca gctggtgcaa acccaactac taccagatac aataggatgg 6180
tggcaatgct tgcaaaattg ctgcagacaa agcattaaaa aatcttcttt catggttcgc 6240
aacctttctc caagctgcca acaatgaaaa ttaaggggtc aagtgcctaa aatactgaag 6300
aaggcccggc gaaaaaaaat tctgaagaaa gggagcacca tgatttaaac aaccaacctt 6360
atgcacaagt aaaatatcct cgaggtttcc tttccggtca tcacgtttgg caacccgtag 6420
aagccttcct agttgagttt ctttcttctg tgaggtgtca tcatctttct tttcaaggag 6480
cctctctgct tccccaggcc agaaatcatt atcacagtat ggcaaccatg cagctgagat 6540
attggtcttg cattcattgg tgggctgaag gaagaagtca tagagtgtat tccgttccac 6600
aactaccccc tccttaacag ccttctttac caaattctgg tacctaaata tattgaaaag 6660
attatcaaat gaaggcccat aaataatttt aggattgact gtaaaagatg atgaagacca 6720
accagctccg aagcttgtca gactttggca tcttctgtat tgtaggatga caatataaaa 6780
cataatcgtc acgctttgta gatgggcaag tccatatgga acagcttaca aaccctcgtt 6840
tcttgcagaa atccaagtag ccaatctggg ggaaaacaga ttggaagata atcagaccaa 6900
catgagatcc ataaactgaa atcaagatca agaacactaa gtgtttaatg attatgcatt 6960
ctcataccaa aatttcatga tacacaaagg tacggagagc ttctccactg gccgacttga 7020
tttccggtct gaagtacttg acagaatcaa tatatgcaag ataaacgtgc ctttgatttg 7080
gtgatgggca ggctgaacca tactcttgca catacatggc gaacaggcat acatctacac 7140
cttcattctt ttgaaacaag agaatggcct gcacaagcac aaaacacgga aatggtaacc 7200
cacattatcc actaaataat gaaagcataa tttaaatgga tgttataata atagcattag 7260
taaagtataa gtatcacata atcacctttg atttgtacgg aaattcccca ggatattgtt 7320
cttttttaaa aaaatccttg aaacgtggtt ggacttgcag tgttctatca gctgaagata 7380
ccactctaac agtaagacct tcaactcctg gtacctaata attggaccat aaaagttcgc 7440
ccaataagtt tctccagtat attacagtgt aataaaaatc ctagaggcag aaaaataaca 7500
ttaagatcag catagatgat cagataagac taagcaaagc atccacaagt ttatgttcca 7560
agtttgacca tgaattgtaa tatgacatct tggtcagcta aatcagatga atatgcagaa 7620
ccaactttta tcggaatcca ataaaatgca aggaaaaaga agaaaaaagt agtttcacta 7680
aaaaggatac tgaaacgcaa caaatatatg gtcatcaaca tgtgttccaa agatgaattc 7740
atgtgtaatc agctgcaatc ctgaagccat aaatacacat tgctagatgc accaagagaa 7800
gtattaagaa catgattaag tgaaatgcca tcagtacatt gtaaaaaata aaaagaaacg 7860
tatgacagta aagatgcatt catgtaatga attatctaag tcaacttaga agactataat 7920
ataaggacta acatgttact tgtaaccttc aatccagcac atagagcaag aagcacaaaa 7980
atgcaattgg aaagacgtat gtaacttttg gctgtggttc aataggttaa cagtgaggta 8040
gcctgttcaa cggtagcaga atgcaacacc agcatattct gtacacggga caaggtataa 8100
aagaaaagca taacacaact acctcatcaa cactttttcc agaagcaatt gccctctgtt 8160
gccgctcctg cacaagccgc tcagaaagcc tttgctcaat atgatcactt agtctagttc 8220
ttggtaactc gcgtgctccc agaatagtag atggctcaag tgaatcaaca tcttcattat 8280
ccttttcctt caagaaacat tttgcacaag tatattcagc ctctggatcc acgattttgg 8340
ggttaaaaag tgcgcagatt tgatgctgcc aagctttgca cttatcgcac tggacccact 8400
gaaaaggcat aattaaacaa aaaatgagta attcgtatat gattccaaat gactagagag 8460
aaataagaga agcatatgtt acccattctg cctcagcatc tgtctctgca tagctgaatc 8520
tcttctgata tttggctttg gcactactaa gatggtggca tctgccacat attgaagatt 8580
tgtcatttcc attttccact tcaacataat aggatcctgt agaattaatt attttaaaac 8640
agagcgcgca aaatcgtgga gggggctcaa agaggagtct ttccatccca cataaattgc 8700
atgtgttctg atcaggcaag ccttcaactg atagcagctc ttcagtcggc actttgctct 8760
acaaaaaata agttaatcat gttaagagat ataaactttg cttaaaacaa gcacacactc 8820
tgtacaatat aatcaagaaa gcttgagtga caacaaaacc caaaatctta gtaccaaatg 8880
aaaatcaatt gaaagtacat aatatttagt taattttgca gctgctcagt ttgaaaattt 8940
ctctagacta catcaaccaa taataatcaa gtgctttaca atactagata aatcatacaa 9000
gatccaacag gttattcact cacctgagaa gtatcatggt tcagagtaca caagtgatct 9060
ttaagctcct cagaagttaa tgcataaagt actgaggccc ctcttctctt ccttgccctc 9120
aggctgtccc ctgacaatgt ttggtccaat aaatcaacct ttgcatcctt catctcaatg 9180
tcactatttt cacgacgaaa ttcttcttca gtttgtacag cactccccga caatctgacc 9240
atatccattc catgtacatt atcggtgcaa gcaatgttgt cccccaagga agtacaacat 9300
ggtgattttg ttggtgaatt agtgacttca gattgtactg tttcagcaga tgcataagtc 9360
tcattggcag caggttgttg ttcctttgaa gcctccattt cattgacatg gacaagatgg 9420
ggaacatcaa ctttcaagcg ttttgctgga taatgcttgc cagaagatcc atctgaagca 9480
ggtgaagtcg gctttgatac agtactattt gatgtctgtt cagctctatc cactgtcttg 9540
cttacagggc tacaagcacc ataattagtc atgaagccct gctgatgatg cataaagtgg 9600
ttgcttaaat ttgagctttt ctccctggag aaaccttcat gatcagaagt atgcccaagt 9660
ttttctttca tttgaatgca tcgatcccgt ttgtgctctc cattgatgta cggatgaatt 9720
tgagcatgat acaagtcacg gtttccagtg gtaatgtttg actgatctga ttgctctagt 9780
gaccgactcc acgtctcttg cttcatctca cattctatgt attgttgcaa caaaggtccc 9840
tgaccggttg tgggatacaa acttttattg tttgtggaaa ggttttgtcc gttcactgtt 9900
gagaaagaat ccatcggaag tgttctcatt gcactagaac atgttgtttg atcccacact 9960
gctgacaaag aactagaact cccagaggtt gatggttgtg aactatcatt ttgatacgca 10020
tcacctggca aaatttgacc atagtgttta tgatgccaaa taacttcagc tcaactctgt 10080
ttcagacata agaaagggga tgtaaactca cctgagaaat gttcttttat atggccaata 10140
tgcagtacat caatactagg gctacatttc ggtagagttg atgcacatga ggtaaaaatg 10200
gtgtttgcta atctttcagg catctgcttg ggtttatcag ccaacgaatg agcaaagtta 10260
gcagcaccca tacagttttc atattggtta tatcctgcca aaatcaagcc aataaagaat 10320
taaaaaaatt aaggtgtatt gtgaggttaa aataggtaac tcatcatctc aactcaccct 10380
gagtggagga tacattatat gcacaggagg gcagattatt aggtccagga gtaactctat 10440
catggtagat gggcacctcc atcacaggca gctgttgtga gtttagtttg gatgaagctg 10500
ctgaagcact ccaatgaaac atactacccc gaaatgatgc agaattgacg atagcattca 10560
acctggttct taaagtttca agatccatat acttaatctg agagagaatc agatgttagc 10620
aagtgactga gaactattta gataaatgaa tccaaataat caacttctaa gtacaccaaa 10680
ctgttcagca gtaacaattc tgtttaagga ttacaagaat atgctgaatt ttgtatttat 10740
tcaataaagc atgtagataa gttcaatatt gtccaatatt agagtagaaa ccacaccaaa 10800
ttaaagcacc ataggtgatc atatatccta taatagttct aatgcagcaa gagacaacac 10860
aaacctttga atcagctttc tcaaaaagat gtcggtcaat acattttcca atttccataa 10920
gaaaggatag gtcaaagttg cagaattcct tccgctcatt taggtactct acactggata 10980
agaaaaaaga atcaggatat agttgaacaa gagataataa ctgcaataag ttatcggttt 11040
gctacaactt aagttgcaac aagccaccaa aagcacgtga tgttatcaga cagactggtc 11100
actagcagtc acagatttta gataaaatcg tgccagtagc attgcagttt ttgaaatgtt 11160
caactaaagt tgcagaaaac atatgtacag tgtatacttt gttggtacgg catgctagta 11220
taaagcaact agtaatctgc gagtcaaagc taatcccaat attggtggtt taagaactta 11280
cattttacgg tgaataatat tgcgaactac ggatgtatct tgatccatat tatccaactg 11340
aagaatttca gctgcagatt gtgtccagcc acttgtgggg tattgctggg taggaaatcc 11400
acttgctgca tattgctgtt gagtcccttg cagggtcttt gccatcatgc ttctatctcg 11460
cctggaattc gcagaataaa cccattacga gcttgatcag tagcttacat gcagccaaca 11520
cataaccagc aggtagatgg caacagagca gaaataggat agtagcaagt ataatacgat 11580
tctactgtga ctcatacaaa caatgtcagt tctggaagag aaacacatcg catctcctaa 11640
actacagtca atatcactac caatgcgcct accaagaagc aatatactag gtaaaatggt 11700
gataacgagt agatggcgca tattgctact acacaatagc gcgtgaaaac cactatcccg 11760
agcacaggat cacccttcga attctctaca cattgcaata ctcaatcagc gtccaatgct 11820
acacaggggt ggacctcatg ttggacatgg gtgttcaagt gaatccccaa tttactatta 11880
ttatatatat ttattggaaa caaaccaggg gcggatccaa cttgggacat gggggttcag 11940
ttgaaccctc acaaacttct tttggggaac aaacaaactg ttattttaaa gtttaggccc 12000
tgaaattaat agaggagctt cttccagatc tagaattgaa gctagggtta actcccccac 12060
aaaaaaaaaa aaagctaggg ttagcgcaag caaattcgag acaaaattag gtcggggagg 12120
atgtggatgc tcaccaggat gcagcaggac gacggcgccc ctccctcccc ggcctctgct 12180
cgccagatgg agatgggcgc cccaacccta acccttgctg tgctcgcgag atgggggatc 12240
ggcgaggacg aaaggggcgg aggccgagac gagacgagac ggggggattt tctttgacgc 12300
ggaaaggacg gcggagatac tcgagtgctc gaggcacaat gatttttgga cgctaaggtt 12360
tttttctttt ctttcctata tgtaaattga tccggttacg tcctggccca gccacgtttg 12420
ggctcggaac aactaacggg ccgtgccgtg ccggcccact tgtcgagggg ttggccctgc 12480
tggtcagtgg atgggccaga atttggcgcc gaatacggct cggccggcct gtctgcctat 12540
gatgaatctc acattgggcc aatacggccc aatttctaaa tttatttcac tcgcggagcc 12600
cattcacccg aaagcgattt tgctaacgat cactcgcgtg atttttttct gacatttcac 12660
gtttttttca ggctcgtcag ccggcgcgtc ggacaccagc acatcggcca ccgtgtcgga 12720
gaagcacgat gacacagtgg cctctgaccg gcgagccagc cgccggtagc acggccaata 12780
ctgatcgacg agagacaccg tctctcttgt cgttgtcgtg aaatataaaa ttacaatcct 12840
atataactaa atttacattt gtaaattcag ttgatttgac atgtaagtgc actgtaattt 12900
tgataaaaaa taatgtttaa gtaaatatgt acatattatt ttctttaaaa tataaaatta 12960
cagtcatata taactaaaat tacatttgta aatttagttg atttgatatg taagtgcact 13020
gtaattttga taaaaataat gtgtaagtaa atatgtactt attattttct ttaaaatata 13080
aaattacagt cttatataac taaaattaca tatgtaaatt tagttgatat aacatgtaag 13140
tgcactataa ttttgataaa aatattgtgt aagtaaattt gcattagtta ttttatttca 13200
aatataaaat tacagtctta tataactaaa attacatatg taaatttagt tgatatgaca 13260
tgtaagtgca ctgtaatttt gataaaaata ttgtgtaagt aaatttgcat tagttatttt 13320
atttcaaata taaaattaca gtcctatata actaaaatta catatgtaaa tttagttgat 13380
ataacatgta agtgcactgt aattttgata aaaatgttgt gtaagtaaat ttgtattaat 13440
tattttattt tgtagtccgt tggatgcaaa tccaaggaaa gaaaaaatct caaaaatcac 13500
ccgagtgatg cataggcggc cccctcgaaa gaggggaaaa gaaaaacatc gaaccgacaa 13560
ggaataagtc cattttgcct ccctcaattc ttcccctttg tcgaattata tccctcaacc 13620
acaaaaccgg gtatattacc tcctccaagt gttaaaacca gtacaaaaca actcccttgg 13680
tggtttttga cagtggtttt gctggcgtgg catcctagtc atcgaaaaaa acttaaaaat 13740
atgtgagggc ccacatgtaa gtggcatttc tattcttcct ctcctccacc actctcctct 13800
ctcctccccc ttctctctcc ccaaacagag cacggccagg agaggggccg gaggcgcggg 13860
aggtgtgggg accgccggag gatgcgggcg cacgccgcaa gggagaggat caccggccgc 13920
ggcgcccacg cggggagggt tcacctgcca cggcgtcgat ctgctcggcc ggcaacacat 13980
cctcctgctg tctatccgcg ccgccaacct ccagcaaaat acataagctc atcaggctac 14040
ctttcgaaga gcatgtcatg tgctgactgt ggagtgcaaa agattaagct ttcacctaaa 14100
cacttggagg gggataaact ggcgaccatc catggagcag caggagtaac aactgaagat 14160
gatcatgatc catcccaaca agtcgccgga gcaagtggta gcctctttcg agcttcgaca 14220
cctcacgagg aacaaatcag acataaaaaa cctcatgaag aacaacccaa cagtaacaaa 14280
agcatccccc ctccattagc tgcatgtcct tcctggaatt ctatttttct tctccaaaga 14340
gacaacgtga gatgcatgga tgaacaattg gctatgcgcc tactactgcc cggactcctc 14400
atcggactcg ccgtcgtagc gctcatcctc cccgtcctcc tgctgctgct gatggtgttg 14460
gtgatggtgg tgcgggtgcg gcagttgacc ggcggcatcg gcgctgccga cctggtggta 14520
gaactggctg agcgactgtg cggcgagcac gctgatgtgg ccgtcctgtg agagtcctag 14580
ctctagcccc ggcatggtgc gacggatgtc agcgccgaca ccggtatggt ccccgtcccc 14640
gtggcggcga cgattgccgg ctccgcctgc tggagcagcc actggacggt ctcaccgtcg 14700
gacttgtggc cgagctccca cgtcagctgg aagatccagg cgacgcacag caccggcatc 14760
cggatccgcc gtccccgggc gtccaccttg gtgtgccggg tccttgttcg agctccgctt 14820
cggtcctagc tcctgcatcc tcctctcccc cgctgcaacc gctaccacct gcatctactg 14880
ctgctgacag cggatcctct ccctcgcggc gtgcgcccgc cgcatcctcc ggcagtcccc 14940
acacctcacg cgcctccggc gcctcccctg gccgtgctct gttcggggag agagaagggg 15000
gaggagagag gagagtggtg gaggagagga agaatagaaa tgccacttac atgtgggtcc 15060
tcaagtattt tttaattttt ttatgactag gaagccacgt cagtaaaacc actgtcaaaa 15120
accaccaagg gagttgtttt tgtactggtt ttaacacttg ggggaggtaa tatacccggt 15180
tttgcggttg agggatgtaa ttcgataaag ggcaagaatt gagggaggca aatggactta 15240
ttccaaccga caacgaaacg aaacggtcct taattactcc tatatatata aggcaaccta 15300
ttattgcctc ttcttttgat cttttcacgt agacgtagta acgatttgat cgaggaggag 15360
ccataatgga tacgaaacag ccgagaatcg acgcaatagg gctgcggttc aagaccgtgg 15420
ttcacatcac gctggtggcg tcgatggcgt acgcggcctt cggcgccgcg gtcgcctacc 15480
cggcctccgg cgctccggcg gctctggcgc tcgcgttcgt cctcggctac ggcgcgctcc 15540
tcttccgtct cccgttctcc gtctacgcgc tcgagttcct gcggcaggag ttcccgatcg 15600
cgcggacgcc gctgtccgtc caggcgtgcg tcgcggtcac ccccgtcgcg ctctccgtcg 15660
ccgtcctggc ggtgctcaac caagcgaggg ccggcggcgg cggcgacgtc gccctcgcca 15720
cctgcgtcgt ctgggccgcc gacgtagccg ccgtcctgtc cctcgcgtgg tgcctcacgc 15780
acggcggcgc cctcgccatg gctctcacca ggaggaaaca gtacgaggag agcgggaagg 15840
cactggagcg gatgatgaaa gggtacaatc ccaaagaccc cgccgcggtc ctcttcgccc 15900
tcgacctggg cgagatccgc gatgcgtccg tccgcctcgc ggcggctgtg tcggccgcgt 15960
gcgcggtcgc tggcggcgtg gcggtcggcg gcggcggcgg cggcatgtca tacacaggtc 16020
tctcctatgc cgccgcattc ttcgcgctcc caatgctgtg cctctcgtac ttccagaaga 16080
cgtgcgccta cccggtggac atgcccaagc acctcgccgc ctacgaccgg ccccacctga 16140
aggtgatccg ctatgcctgc gttcgcttcg tggccgccgt gtcagccgca agcgcgatag 16200
ccggcggctt ggtcgtcggc ggcgtgtctt ggataggcct ctcctacgcc gccgtcttct 16260
tcgcgctccc catgtgcctc ctctacttca gggagaagta cggtttctcc atgtccgata 16320
tgcccagcct gctcaagtgg tgcaacgtgt cggtgcctat ggcggcgcta gcgctgctgt 16380
tccgcctcgt gacggcggcg cggcaggcag ccgcaccgga cgttaggctc gtcgccattg 16440
ccggcaccgt gtgggccgta gacgccgctg cgattgggtt tctcggctgg cgcagcacga 16500
gggagatggc caagcccata ctacgggcga acgcgtcgga gattttcacg tcgttcgtga 16560
tggtttgcct acgatactgg ctgtatctgc acgttttcta tatccttggc aacggttcac 16620
agagatggtt caattcatta tagccgttct agttgagaat tatcaatgtt atgctcaaaa 16680
gtacacttta acattaatat aatataatgt atttgtcttt ttttctaagt atgcaacatt 16740
gttttgtttt agtcactata aaaatgattt ttgcggacgc acaccctatt ttgttacatg 16800
cgggctaaaa gaacatctac atgtaaaaat attttggatg ttgtttggtt cagacacgta 16860
tagaaaaatc gtttttcgta aacaggcctc tcaaagcaat gcaaaaatat tgacgaaccc 16920
ggcataaaaa tttatctata gtggactatg attcttaatg tgttagattg cccctatgtc 16980
aatggatatc taaccctact taaaaaattg taattttcta ttcgtcatac tccgtttcat 17040
ccatcatcca agtccgactg cctttggcct catgatcatg atttctccct atgcctctat 17100
cgctcctcct caccttccct aaccttcgcc gccgcaacgc catggcctgg cgacctccac 17160
ttcgcaccac ttctcctctc ccaatcctaa cccatatgtc ttctttgtct ctagcctcac 17220
cttctcgcgc gcacggcacc gataagcagg cacgggtgtg tggacagccc cctcttcctc 17280
ccaagtcaca acccagccct agccttctcc cttgtgtgcc atgtgccttc tcatgtgcat 17340
gcccgacgac ctggtttgga gctaggggca acgcagccag catctggcct cctccaattg 17400
accatatgaa atcgaattca aggtgagcat gaagctccaa ctgctgtatg cgcgggagga 17460
ggtgaagaga ccgtcgatgc ccaccacgct cctttgtttt cttgcgtgcc atttgtgata 17520
agtaacagta acctagggtc ctggagtctc ccttcgacaa catattcaat tctacggaga 17580
atctttctgc tttaaattta tattccagat catgaaatga aataaataag ttccggaaca 17640
ttgatccaac aataaactta gctatacaaa gaaaataatt tgtaacccac caagtgaaca 17700
attatgaagc tcttggatta aaacaaaaca atgttgcata ctataaaaaa atagatatta 17760
atgtacattt tgagcaaagt taccatttac agaagttgat gtgaatatta ctcaactaaa 17820
atggctatag tgacggcgca tggagcggcc gctgggcgat gccacgtcgg ataggaacag 17880
tgcgcggagt gaaaattttt cgaaaaaacc ctctgattta tgcgtaatta gatctaggtt 17940
ccccacaaac agttctcctg aaatgttatt ttacataggg gtccttctaa aaaccagata 18000
tgctgtgcga aggacttaaa aaatcgtgaa gccggatata tataaggaag aagattatta 18060
aaattaagca ataaataata aaaaatcatt ataaaaatga ccatcgtctt caaaattttc 18120
acaaccacat gtaacgaaga gtttgatcac gcgtctctcg tcatgttgtc cacctaaaaa 18180
ccatacacag ccacttgtgc tactagcctt gtataaggct ataagcatat caccggtcac 18240
tgacacgtgg ccccataaac cgccaccctg cccccgcgac tactggcgcg cgccttctgg 18300
actcttcctg accctttttt ggcgggcgac gcacggtgcc cttgacgtcc acgtcgaccg 18360
cgaccaccaa cctctgaccc cgtcgccctc cacgtcgccg cctccttctc ccccgccgac 18420
gtggccgccg cctccgccac caccaccgct ccccacctcc ccgtgacctt ctcgatctcc 18480
ccgcctattt atgctcgtct cgtcacccgc agcagcagta gcagcagaag aactgaagaa 18540
gagtgatcta gctagctcgc tcgcctgagt tctttgcttc aattcgatcc tcgctaagct 18600
tcctccagct cgatcgatct ctctctgcgt tttagttggt taatttttgt gtttgagtta 18660
tttgcaatgg cggccgctac catggcgctg agcagctcct tcgccgtcgc cgccgctgct 18720
gctggtggcg cgccatggcg tggtgtcgtc tccgctggcc gcgccgcgcc tcgccggcgt 18780
gtcgcgctcg tcgtcagggc ccagtccgag gtgagctgag catgccacgc ttgattgact 18840
tgatcactgt gtgttctggt gattgcttct taatttgcta acttgggatt gatcgttctg 18900
cagccggagg tggagccgac gaaggaggag acggccacgt cgtcgtcgtc cccgtctccg 18960
gcgacgaccc cgactccgag ccccgcggcg gcggcgccca aggcgaagcc ggcggcgagc 19020
acgaagctgt gggacgtgct ggcgttcagc gggccggcgc cggagcggat caacgggcgg 19080
ctggcgatgg tggggttcgt gtcggcgctg gccgtggagg cgtcgcgcgg cggcgggctc 19140
ctggaccagg ccggcagctg gagcgggctg gcgtggttcg ccgccaccgc cgccgtgctc 19200
tccgcggcgt cgctggtgcc gctgctccgc ggcgagaccg cggaggcgag gagcggcggc 19260
gtgatgagcg ccgacgccga gctctggaac gggcggttcg ccatgctcgg cctcgtcgcg 19320
ctcgccttca ccgagttcct caccggctcg ccgctcgtca acgtctaatt taattaatta 19380
attaattaag ctgtacgtac aatacgtgca tgtacgtatg cgtgtactgg gtagatagct 19440
agggatgtgt atgtatgcac tgtagccaat agcaagcttg atagtgcttg gtgtactacc 19500
ttggaatttg aaaaaggaat tcaaattttg aaactcgcaa aatattcgtg ggaaatttgg 19560
atgtttgata cagatccatc tcgcataggg gaaccaaatg tagtggcaac catatttttg 19620
gacactacga tttgaactct gatgtgaaca gtactggtgg atagagtaac gtagtacaaa 19680
ctaacagcta cgataaacaa atttcaattg acactgtttt aggcatcgtt gtcttcgctc 19740
tcttctagag cacaattcgt tcctagagca accaaaatat ttccatggca ttttttaaaa 19800
gaatattcaa accttcaatg gctctatgaa attaatttat atctaaatgc tatacatttc 19860
atgaaaaaaa atggaaataa agaaggtaga ttgtaattag tcagttataa gatgttacgc 19920
tgagatggat gccatataat tctacacatg tttaaatgct gattgaagtt atccataact 19980
aagtgtaatg cagcaaaagc cctctgatta attagtcgaa ttataagagg gcttattcat 20040
actcccccca accaaaagtt tatagcatat ttcttttatc acaaagacca agtagaaact 20100
aacttatttc acatataaca aagaaaaaat aatatgcatt catgattcat gcaactagta 20160
ttacaatgtt tgcttgaatt ttagttaaca atttaattta gcattgtaaa aagtacaagt 20220
ccttcattta agtctttgat gcatatggag acgcatatct catttggaga aaaaaaacag 20280
aaaataaata agctttaaaa cttttggacg aatggagtaa tgaaaaaact tttacaggat 20340
ttttatggac acttaattga aaaacattaa aatatcccat aacattcctt cgttaatcgt 20400
tataaagaga tcccagtttt acacccgtag ctaggttatc ataatcaatt aagctagcat 20460
gcacggcaca aattaagctc tagaacagcg ctaaagaaaa tgatggaaca aaacgccaat 20520
aaaacggtca ctaacattgt tttgccgtct cctctcgagt tgtcgttctt gcatgcggaa 20580
attgctgcca ctttgttggc caaatggaga tggaggctgc taactagcca cgccgggtgg 20640
tgcatgatca gtgatatgac ctcttcgcgg tggcctcgat gtccacgttg agcaaccaat 20700
gaacatggac cccaatcacc ccagctaggc tccatgggca attttggttt gaagcttgtc 20760
ataattttgt ctttttttta aagacaatgg atatatagaa atgcgatctt gaaactcatt 20820
ttggtttaaa gcatgccata attttggttg tttcacgaag cgggtgcagc ttaatgggtt 20880
agttcttttt tttaaaaaaa aaaaagaagt ctatccactc gagtttaatt taattttcta 20940
aacttagcac atgtacttgt aatttagtga tagacgctaa ctatggtgta tgtgtttata 21000
tggtcacgtg tgtttgtaca atatttttta aaagaaaaaa tagttgtgtc aaatcttaag 21060
ccaactttag atagatttgc cccagctaat attgattcca atcgaaatga ctacagtcta 21120
taaagggtaa gaattggcaa caaaccaaaa tagcccgatg cggcgtgact gacgacccag 21180
cctcactcca cgtaggtaga cgtacaacac gtacgattgt tgattgttca tttgctgtat 21240
caacgatagc tcagtaaaat cgtattacct gtaaggtaca aagaaataaa aatgactaaa 21300
atgtccatca ctttaacaaa tcctaatgca attgtctctc attttaacaa accctaatac 21360
aaatctcaat gcaatcgtct attattttaa cataccccaa tatatgtcct ctacttttat 21420
aaacttttaa tgcaattatg gcttaaaaga taaaattatt tagagacaaa taaaattatg 21480
aataaataaa gttattttga gacgaaagga attatgcgtg aaatgggaaa gcaggcaggc 21540
aaaactccta ccatcctctt cacaacgaat ttatctagtt ctcacaacac aaatggatca 21600
ggacaagtta catcaggaac cagcttaacc atgccggtcg ctactactag taactagtgt 21660
tacacagagg tacaaatggc aggcaaaatc atcacccgag cttgctcctc aactgctccg 21720
gcagtgaggc tccgaacacc tgggcgaggg ccatcttctg cctcttattc agcctgcaca 21780
gctccagtcc cccgcaggac ttgccagtca gcagcttgcg cccatcgtct acagctttcc 21840
ttctcaggga gcacagctgt gcagatggtt cggttgtgat cgcactatcg gcatcggctt 21900
cggcttcagc ttcatctgct ccccagtcca actcatcgtc ggtcataccc ttcgaagcct 21960
catttgctga ttcaggggct tcaccgttat cgtctttcgc aggtgtggtc tccgtgtggc 22020
tgtcagtccc ccaccatttc atagtttgca aagacaagcc agatgatgga aatccgtact 22080
tgaagtcgtc catgtaggtt gggatgcctt tggtttgggt accataggac aagattgctg 22140
atccacccaa cacattttgt tttcctgggg gtgagacttg tcctgccttc gaacttccct 22200
gttgagattt tgccactcct tggaaagcgc ctggtgatct atcaatatgt ccagatttaa 22260
gtgtcagaac aaatgctgca aaccgcttca atagtgacaa tagatcatca tatggtgctt 22320
gatgcagaga actgagaaac caaattagac tacaatagtg gtaactggta acaacagagg 22380
gaaagttgat agcatccaag tgtgaaaaca tagaaacacg cagcctcggg tcagagagtc 22440
ccacagaggg atggtctaaa ctgttgttgt ggtcaggttt acctggtacc aacccaatgt 22500
cccactctac tgccccagca tccatactca gacagcggat ggtcagtaga atcctgagca 22560
atgaaccact acaaaaacac actgtatgca agtattgcgc aaatattttt tttccagctg 22620
aaattcataa gcacaattat ccatgtccac agctcaaagt agccataaaa ggaataatag 22680
aacacctaag ggtcatgaga ccaacaaccg agtttgagca gttaaatcag acaagccaaa 22740
agctagtagc agtaaaagtt tactaagcag aagctacaag tacaattaaa attgtcatgt 22800
gcttttagat ttataataca gattagcgac aagaaggcaa gaatgagcat atcattaact 22860
tcttctattg cactacatag cttaagttaa tggtgatatt gtctgcagta aaacgtgcat 22920
agactctcaa gttatacagg atccagagca gaaatcttag tagcagataa aaaaaactgg 22980
gacaaattct tcttaaaatt aataagtaaa tttatgaaaa aacagattgt cctgtaaatt 23040
agttccatcc cttatgatat atgtattact tggccacata tatgttcatc actgttgttt 23100
acaacatagt gcattcagca taacttgaat ctgctggcag tacaagctac aatcagtcgc 23160
aataggaatt accataggac actgccataa aacagccaat attacaactg ggatggagtt 23220
ggactgtaac agaatatcca gatctaccat agatgataat tatcagtcca gatagataag 23280
agaacaagga aatgctggaa tttcaagtac tactttcttc acatcttgta ctagttaagc 23340
gtgatattac actgaaatat tcatgcgagt agaaaaagct ttgaattatt ccatcaacta 23400
cctcagtata ctctgttgat tatcaagaaa atagcactag caagcagttg tcgtggctaa 23460
cattcagtga gaaccaagca tgtccagtta acatttgcag aagagagaag acatatttat 23520
tattgcacag gaaacaggaa taaaatatgg gcatcaacac aatcaagtta aaacgcacta 23580
ctcacactgt tgatagacca gatgcgctta gagccttctg ttttgcaact ttagatatct 23640
caagaagtcc cttggctttc tctctttcag cgttttttgt gtcatcacca gacttcccag 23700
atacaagctg caagcatgaa tatttaagaa aaataatata aataattgga ttgcaaagaa 23760
gaaactaaga acaaagctgg gaaaacataa tcaatatgcg gaagagaaga caacatgggg 23820
tagaaatagc tttcagactg tagttgttct atgtttgcat gcagaataga gtaaatacca 23880
tcttcaataa cagtttgaac caactcacta tgggcattcg aatagccatt gaacaagctt 23940
taaccaatta tgcagctaga cagcatattt cagttatcga atatttaccg gaaggagtat 24000
tttattaggg aaatttaact attcgccact caacagtgat ggcttcaacg atttgccatt 24060
ttacagatgc caattaatta tttgccacta aacagacgtg cactcttaat aaaatgccat 24120
gttacctatt ttgtttacta tttcccacct aaacacaagg attcgcctat tctccttcct 24180
gttttaccct tcatcctacc atgtcctcag tctgttttct ccatggcaaa ggctgccacc 24240
tccagttctc aatcaaggca cgcaccaagt gcatcccaaa agccacaggt gctgtgattg 24300
aagcttctga tgatggcctt ttgtttctta gcagcagttc tgttagcagc tgattgtgga 24360
ataaaataat tcatccatct tagtaactag tcaataccaa ggaattagac ttatatttct 24420
tcgatgtaga ttatacttga tatattcggc ctgtgtcagg aagagctctg aattaatgga 24480
tgattgccat ggcggagcaa ggggtggtcg ctatctgttc tggttagagg cagccagcat 24540
gggaggacaa gggaggtgga gttttactga gagcgcacat caaatttagt ggaaagcaat 24600
gaattaccac ctacataata gggcttctag ggcatagaat ctagcgcctc ttttcttcct 24660
tcgaagcaaa cttcaatctt tcatgaacat cttcaagtag ccaacatctg acataattca 24720
ttcgtctcct tgcttacttt ttgggatacg cttaattcaa ctattaagat aagcctctga 24780
tgagtacgat atcagttcct aaagcagtct accttgtaaa ttgttaaagc caccaactgc 24840
tgcaaaatat ataagcaaag agagcaccat gtttacatat aggatacaac cactgcatac 24900
ttctctttgc tcaaatagcc ctaaattaga acaagcatgc aagttctcat cggcaaatag 24960
ctttctttct tccttctcgc accagtgatt tcctcgtcag ttagacattc aacacaatca 25020
ctcaaaaaca caggaatcag ctcatgaaac taatctgctg aattcctcgt cagttctgac 25080
attcaagttc aacacaatca ctcgagaaca caggaatcgg ctcatgaaac agggcaaaac 25140
atacctttcg atacggccac ctgacgatgc cgtggctgcg gcaaatcctc ttcaaaacgc 25200
tggtgcaaac acctgcaaat ccccccccca cccaaaagtt cgttcagctg ctgcgcggcc 25260
ctcaaatcga gccaggcgac ggatctcgcc cacatctgga gaaggacaga gagagagagc 25320
gagggcgggc gggattaccg aggatggagg ctgcctctgc gattggtagc gagaagagct 25380
tggagatctc ctcgtacgac aacgataccc tcgtcggctt ctgcggctgc gcctcggaag 25440
ccggaggagc cggagtcggc accgccgccg ccgccaccgg ctgctgctcc tgctgctgct 25500
gcggctgctg ctgcggctgg gcagtggaag ccatgggagc cgcgcacata acagcgcggg 25560
tggcgtggga atcgacttcg cgcgggatag atcggggcgc gcgcgaaccg aaccgaatca 25620
aatcgaagct gacgcgaagc ggtaagaggc ggcgcggggt ttgggatggg gatggagtgg 25680
gagagtggaa gagggcgggg cgcagcgcag cggtggcggc cggatgcgtg ggtgggtggg 25740
acggatcgga tcggcgtgcc ggctggctgg ctgggtcgat ttcgatttgg ggatttcgcc 25800
ttcggttggt gcgcgtgtgt ggtggattgg attggattct tcttttttct tgggttggat 25860
tggattctct gctgcactgg agggtttggt tacacagaca ggtgggcccc ctttaatctg 25920
ggaataattt acagcatttt gggcccggcc cggattggta gaagtcctct gcaaaatttg 25980
ataagcgagt acttcagttt cggtcaccta tatatttgtc gaaaaaaaat ttcctaaaat 26040
tttaatagac ataattttaa attttcaaaa atctctccgt aacatgctat tttcgtgaaa 26100
cggaggtcgt gggaacgaat cctctcacat atgtgcacgc agtgactttt ttcttcttca 26160
cttgcataaa ttttgaaaca aatctaacgg tttaaaatta tataaaagtt atatgcacgt 26220
tacgacgtaa ttacattata attatactgt aattatatat gttaactttt taggaaaaaa 26280
attgtcgaca aatatatagc aaaattgctt caattttagg acataattct aggttatttt 26340
tgtgcatatg aaaagagtgt ggcaataatg tttaaaagac cgcgagtggt aacaggtgtg 26400
atcccctact ccctagccct cgtcagttca tcaatgggtt ccgcttaggg gtggggattc 26460
ggtctaacca aaaaatttcg gtgtcggtct tcggtctttc ggtctttgaa aagtgaagac 26520
cgaatttcag cgcaaaaaat gtcaggactg acaaattcgg tctcggtctc agtcttgacc 26580
gaaattcaac aacattttca tatatgcaaa gatataatgg aaatttcaac acaaaaatca 26640
caaaaaaaat cataagcact tataagtaaa gacttttatt aggttgcatg ccttgaagaa 26700
gtagggatgt gaaaattaga atttaatcct attaaacata gtggattgta ggttgcattt 26760
agactttttt tttataattt gatcttttcg gtctattcgg ttttccgagg agactaaccg 26820
aattgaccga acaaaattcg gtttttcact acctagaacc aaatttctcg gtctcggtct 26880
ttttggttcg gtctttttct gcccacccct agttccgctg tcaacggaca cggttggcat 26940
agatgttgat tctgtatttt tttagcagac tcatcatcgg atgtgagtga atacagtgat 27000
caggaggtca acgaggttac catgtcgaag ctcgttgaag cgttggctct accctgcttt 27060
gttgctcgca ctcaagatga aggttttcat aaggttatct tcaatactgg ttgtatgtca 27120
gttatttaaa gagttaaatc gtcattgatg ggctgatctc cacttctcca gttggtataa 27180
tggttgtaga tatccaagga gacggatttc ttcaccgtta gttttttctc atgtttatca 27240
tgtgtcgaat gtgatggctc atttgctaga atactcttgt gaacacctac agggaaaatg 27300
aataggtttc ctcgtgtgtt ctcattaccc cagctgggaa tggaggattg caccacatga 27360
aaagtgcaca gaattttcat ttaccatttg gaacatataa gttcaaatat cagctaacgc 27420
ataacgtttt tcccctatgc caggtcccaa ggcaaatcaa tctatgcaac tccaagtaac 27480
cgtaatttta tcacaagttt aagtgagagc atcaagttta cttatttacc agcttttacg 27540
gattccgcct acgatttcaa acaccccatc tcactgttat catatgtttc gccaatcctt 27600
tgttgagttt gtatcacatt cttgtggttt tctcccctat ttggctattt cctcttctga 27660
tttcaaatgg ccaaccgagg taatgtaagc gacattaggc ccaaactaga aaactaaaca 27720
ggcccagttt tcctgggcca catagcccgc atctcactcg gcccattgcg ttagacaccg 27780
gttagctctt cgcgcccagc ttccggcaca gcgcccaccc gcaccgctgc tgctgctgct 27840
gcggcggctg agcaccgcac cgccggcgtc tggtgacgcc atgcacgtcg cacccttccg 27900
aattcgcggt ctcttccccc ttcaggagcg gcagccggtc gaacgccgcc gcgacgaacg 27960
tggccagcac caccaccacc ggcccggcgg cgacgagccc tcccggcgcg acgccgccgc 28020
cgagcacgcc gccgcgcggc ccggccagga acaccgccgc ggaagcgcct ccgcctccgg 28080
gggcgccctc tgccgccgca tgcggcggtg gggacgggaa gaagcacccc gccaggccca 28140
gtatctccat ggtgccgcgg agcaccaccg ccgcgggctc ccggagcacc acgtccgcga 28200
cgcgcccgga cgcgcccagc accagcgcgc cgcgccgcgc gcggcgcgcc actgcggcga 28260
cgcacgacac cacgtctcgc cccgcgggga cctccacgac gagggcgcgc atcgcgctgg 28320
ggcactcgtg cgcgatcacg gccaccggcg gcggcttcgg cgccccgcgg cccttgcagg 28380
ggcacagcgc cgccgccgcc gccctgctcg gccgccggag cttgcccggc gcggccgccg 28440
ccgcgtcgtt cgcggtgacc acgcccatgt tcgcgtcaaa gattttgccc gcgtcgtcac 28500
gtacttgtgg atgcttaatt actgtgattt ttagagcgtt ttaaagggca gatgcccgtg 28560
ttcttcgaag tagctcagct gttaagaggg aaaataagcg tgatgcgttt ttaattgtta 28620
agtactcgaa catcctaaca agcacccaac tgtcacggtg ctcatgtcct gcaaaaacat 28680
taaaaaacaa ggacccaact gtcacggtgc tcatgtcctg caaaaacatt ttctgcaaca 28740
tgcaagtagg taaagtacat gttgaact 28768

Claims (7)

1.与核苷酸片段共分离或紧密连锁的分子标记,其特征在于,所述核苷酸片段定位在水稻1号染色体上,对应于分子标记M3193-2和Indel14430之间28.76Kb的区段内;所述核苷酸片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;所述分子标记为Indel14420、M3193-2或Indel14430;
所述Indel14420由SEQ ID NO.1-2所示引物扩增得到;
所述M3193-2由SEQ ID NO.3-5所示引物扩增得到;
所述Indel14430由SEQ ID NO.6-7所示引物扩增得到。
2.与水稻光温敏核不育表型相关的分子标记组合,其特征在于,含有以下分子标记:Indel14420、M3193-2、Indel14430。
3.一种试剂盒,其特征在于,含有以下任一或多个引物组:
引物组1:SEQ ID NO.1-2所示引物、引物组2:SEQ ID NO.3-5所示引物、引物组3:SEQID NO.6-7所示引物。
4.权利要求1所述的分子标记、或权利要求2所述的分子标记组合或权利要求3所述的试剂盒在检测水稻光温敏核雄性不育基因、或该基因的基因型中的应用。
5.权利要求1所述的分子标记、或权利要求2所述的分子标记组合或权利要求3所述的试剂盒在筛选或检测具有光温敏核不育表型的水稻中的应用。
6.权利要求1所述的分子标记、或权利要求2所述的分子标记组合或权利要求3所述的试剂盒在制备转基因植物、或作物改良育种、制种中的应用。
7.如权利要求5-6任一所述的应用,其特征在于,
当使用Indel14420标记引物进行扩增时,如果只出现61bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现63bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现61bp和63bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;
当使用M3193-2标记引物进行扩增时,如果只出现105bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现111bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现105bp和111bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;
当使用Indel14430标记引物进行扩增时,如果只出现231bp的条带,说明被检测材料具有光温敏雄性不育表型;如果只出现241bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型;如果同时出现231bp和241bp的条带,说明被检测材料不具有光温敏雄性不育表型。
CN201911414923.0A 2019-12-31 2019-12-31 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用 Active CN111100942B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911414923.0A CN111100942B (zh) 2019-12-31 2019-12-31 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201911414923.0A CN111100942B (zh) 2019-12-31 2019-12-31 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111100942A CN111100942A (zh) 2020-05-05
CN111100942B true CN111100942B (zh) 2023-03-28

Family

ID=70425922

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201911414923.0A Active CN111100942B (zh) 2019-12-31 2019-12-31 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN111100942B (zh)

Families Citing this family (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN116622874B (zh) * 2022-10-21 2024-04-12 南京农业大学 一种甘蓝型油菜低温雄性不育位点的分子标记及其引物对和应用

Citations (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0870852A (ja) * 1994-09-06 1996-03-19 Teijin Ltd セルロースアセテートの脱アセチル化能を有する微生物および該微生物を担持したセルロースアセテート成形体
WO2003095618A2 (en) * 2002-05-09 2003-11-20 Brigham And Women's Hospital, Inc. Identification of dysregulated genes in patients with multiple sclerosis
CN101023185A (zh) * 2004-05-27 2007-08-22 威特克斯医药股份有限公司 用于监测impdh通路抑制作用的生物学标记
EP2272533A1 (en) * 2003-01-13 2011-01-12 MacroGenics, Inc. Soluble FcyR fusion proteins and methods of use thereof
CN102952795A (zh) * 2011-08-18 2013-03-06 华中农业大学 水稻光敏感核不育基因pms3的分离克隆及应用
CN106086028A (zh) * 2016-08-23 2016-11-09 中国农业科学院作物科学研究所 一种通过基因组编辑提高水稻抗性淀粉含量的方法及其专用sgRNA
CN106676179A (zh) * 2017-01-19 2017-05-17 海南波莲水稻基因科技有限公司 一种水稻隐性核雄性不育基因cyp704b2的分子标记及其应用
CN107074969A (zh) * 2014-09-09 2017-08-18 优努姆治疗公司 嵌合受体及其在免疫治疗中的应用
CN108243963A (zh) * 2017-12-18 2018-07-06 海南波莲水稻基因科技有限公司 一种水稻ptc1基因缺失突变体及其分子鉴定方法和应用
CN108588268A (zh) * 2018-07-05 2018-09-28 青岛袁策集团有限公司 一种水稻光敏雄性不育相关基因分子标记
CN108929899A (zh) * 2018-07-05 2018-12-04 青岛袁策集团有限公司 水稻不育基因筛选方法
CN110205327A (zh) * 2019-06-11 2019-09-06 华中农业大学 一种水稻温敏核不育基因tms3突变体及其分子标记与应用

Patent Citations (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0870852A (ja) * 1994-09-06 1996-03-19 Teijin Ltd セルロースアセテートの脱アセチル化能を有する微生物および該微生物を担持したセルロースアセテート成形体
WO2003095618A2 (en) * 2002-05-09 2003-11-20 Brigham And Women's Hospital, Inc. Identification of dysregulated genes in patients with multiple sclerosis
EP2272533A1 (en) * 2003-01-13 2011-01-12 MacroGenics, Inc. Soluble FcyR fusion proteins and methods of use thereof
CN101023185A (zh) * 2004-05-27 2007-08-22 威特克斯医药股份有限公司 用于监测impdh通路抑制作用的生物学标记
CN102952795A (zh) * 2011-08-18 2013-03-06 华中农业大学 水稻光敏感核不育基因pms3的分离克隆及应用
CN107074969A (zh) * 2014-09-09 2017-08-18 优努姆治疗公司 嵌合受体及其在免疫治疗中的应用
CN106086028A (zh) * 2016-08-23 2016-11-09 中国农业科学院作物科学研究所 一种通过基因组编辑提高水稻抗性淀粉含量的方法及其专用sgRNA
CN106676179A (zh) * 2017-01-19 2017-05-17 海南波莲水稻基因科技有限公司 一种水稻隐性核雄性不育基因cyp704b2的分子标记及其应用
CN108243963A (zh) * 2017-12-18 2018-07-06 海南波莲水稻基因科技有限公司 一种水稻ptc1基因缺失突变体及其分子鉴定方法和应用
CN108588268A (zh) * 2018-07-05 2018-09-28 青岛袁策集团有限公司 一种水稻光敏雄性不育相关基因分子标记
CN108929899A (zh) * 2018-07-05 2018-12-04 青岛袁策集团有限公司 水稻不育基因筛选方法
CN110205327A (zh) * 2019-06-11 2019-09-06 华中农业大学 一种水稻温敏核不育基因tms3突变体及其分子标记与应用

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Molecular characetrization and application of a novel cytoplasmic male sterility-associated mitochondrial sequence in rice;Yanping Tan等;《BMC Genet》;20150430(第16期);全文 *
Oryza sativa indica group cultivar shuhui498 chromosome 1,partial sequence;Du H等;《Genbank Database》;20170504;全文 *
分子标记辅助选择育种研究进展;瞿华香等;《作物研究》;20081215;全文 *
水稻光温敏不育基因研究概况;蔡春苗等;《生物技术通报》;20080426(第02期);全文 *
水稻温敏雄性不育突变体mh86s的鉴定及基因克隆;杨绍华等;《福建农业科技》;20200128(第01期);全文 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN111100942A (zh) 2020-05-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5762400B2 (ja) イネ遺伝子組換え事象17053およびその使用方法
JP5769698B2 (ja) 遺伝子組換えイネ事象17314およびその使用方法
CN106998665A (zh) 单倍体植物的产生
CN101253268A (zh) 提高植物育种的方法和组合物
CN108291234A (zh) 倍数孢子体形成基因
JP2022538516A (ja) 単為生殖一倍体誘導遺伝子dmpとその使用
CN112725374A (zh) 创制植物单倍体诱导系的方法及其应用
WO2019203942A1 (en) Methods of identifying, selecting, and producing bacterial leaf blight resistant rice
CN113874388A (zh) 孤雌生殖基因
US8779233B1 (en) QTL regulating ear productivity traits in maize
CN101189341B (zh) 用于制备抗真菌病原体的植物的多核苷酸和方法
CN107418956B (zh) 水稻光敏感核不育基因pms1的分离克隆及应用
CN104561062A (zh) 一种栽培稻种间杂种不育基因s1及其应用
CN111100942B (zh) 与水稻光温敏核雄性不育表型相关的分子标记和应用
CN114350832B (zh) 一种外源萝卜片段特异标记及其制备方法和应用
CN110951753B (zh) 一种水稻光温敏核雄性不育基因tms2759及其分子标记和应用
CN109837295A (zh) 一种用基因编辑创制的水稻单倍体诱导系及其创制方法和应用
US20180265887A1 (en) Basil Plants With High Tolerance to Downy Mildew
CN112195269B (zh) 与水稻核雄性不育表型相关的分子标记和应用
CN100457905C (zh) 一种水稻杂种育性基因及其应用
CN111100869B (zh) 一种与水稻光温敏核雄性不育性状共分离的分子标记和应用
CN111088258B (zh) 一种水稻光温敏核雄性不育基因tms3650及其分子标记和应用
CN108707690B (zh) 与白肋烟控制基因共分离的分子标记及其应用
CN114752601A (zh) 调控水稻柱头外露的基因及其应用
CN112625099A (zh) 油菜矮杆基因bnd2及其在油菜杂交育种中的应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant