CN111020041A - 16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及其快速检测方法 - Google Patents

Abstract

本发明公开16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及其快速检测方法，本发明方法提供了用于不同血清型沙门氏菌——肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌的共72个特异性分子检测靶标及对应的PCR引物组和快速检测方法。本发明方法具有检测时间短、成本低、操作简单、特异性强的优点；同时本发明的检测方法可用于检测某些抗原不表达的菌株，弥补免疫检测的缺陷，检测结果更准确，判定更简单，实用性更强。

Description

16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及其快速检测 方法

技术领域

本发明属于微生物检验技术领域，涉及一种鉴别沙门氏菌的方法，具体涉及16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及其快速检测方法。

背景技术

沙门氏菌(Salmonella)是最常见的食源性致病菌之一，也是全球腹泻疾病的四个主要病原菌之一。人类感染沙门氏菌后初期症状为恶心、呕吐、腹泻、发烧等，若不及时治疗死亡率高达10％。通常情况下沙门氏菌食用量超过105CFU即可造成人类感染，而对于高度易感人群15-20CFU即可引起沙门氏菌感染(Kokkinos等，2014)。疾病的严重程度取决于宿主因素与沙门氏菌的血清型(WHO，2018)。

沙门氏菌血清型复杂，分布广泛，几乎大部分的血清型均可污染食品导致食源性疾病，与人类疾病有关的血清型主要集中于A-E群，其中A-D群的致病沙门氏菌占70％。肠炎沙门氏菌与鼠伤寒沙门氏菌是检出率最高的两种血清型(WHO，2018)；在欧盟国家，血清型检出率依次为肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌(EFSA andECDC，2017)。十二五期间本研究团队首次系统完成了我国43个主要城市4300份食品中致病微生物风险调查，已分离保存了46种血清型1500多株沙门氏菌，为目前我国食品源沙门氏菌血清型最多的菌种资源库，其中肠炎沙门氏菌(17％)、德尔卑沙门氏菌(15％)、鼠伤寒沙门氏菌(12％)、印第安纳沙门氏菌(6％)为菌株数最多的血清型。

沙门氏菌的检测主要利用国标规定的传统培养方法(GB 4789.4-2016)，该方法结果较为准确，检测时间较长(5d以上)、操作复杂(预增菌、选择性培养、显色培养、生化鉴定和血清型鉴定)、成本高，且如果血清凝集反应迟缓或特异性差，将造成错误的判断结果。以PCR为主的分子生物学检测方法以其快速、准确、简便的特点，逐渐成为取代传统检测方法最具潜力的检测技术之一。

目前国内外PCR检测方法大部分是对沙门氏菌进行检测，针对血清型的PCR检测靶标及引物的研究报道仅有肠炎沙门氏菌特异性基因Prot6e、Sdf、sdfI、SEN1392、sefA；鼠伤寒沙门氏菌特异性基因MDH、fliC、spy、fliB-IS200、fliA-IS200、pefA、STM4495、STM4497、STM2；德尔卑沙门氏菌特异性基因RU61_00441、RU61_00445、RU61_00447、RU61_00448、RU61_RS23380、RU61_RS09205、RU61_RS06985、RU61_RS06990；婴儿沙门氏菌特异性基因ISR2-ISR3、Infspe、ISR2；印第安纳沙门氏菌特异性基因ISR2-ISR3 MG752992、NZ_CP015724.1；哈达尔沙门氏菌特异性基因HSR3、Heidspe；纽波特沙门氏菌特异性基因Newpspe；维尔肖沙门氏菌特异性基因Hypothetical protein。而针对其他血清型的PCR检测靶标及引物的研究报道几乎没有，因此，也没有有关其他血清型检测的PCR方法建立的报道。

经对现有技术的文献检索，尚未发现与本发明的16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及相应的PCR检测方法报道。

发明内容

针对上述问题，本发明的目的是克服现有技术的不足，提供鉴别16种不同血清型沙门氏菌，即肠炎沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovarEnteritidis)、鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovarTyphimurium)、德尔卑沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovarDerby)、印第安纳沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovar Indiana)、阿贡纳沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovar Agona)、婴儿沙门氏菌(Salmonella enterica subsp.enterica serovar Infantis)、里森沙门氏菌(Salmonellaenterica subsp.enterica serovar Rissen)、布伦登卢普沙门氏菌(Salmonellaenterica subsp.enterica serovar Braenderup)、维尔肖沙门氏菌(Salmonellaenterica subsp.enterica serovar Virchow)、奥尔巴尼沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Albany)、哈达尔沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Hadar)、韦太夫雷登沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Weltevreden)、伦敦沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar London)、火鸡沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Meleagridis)、山夫登堡沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Senftenberg)、波莫纳沙门氏菌(Salmonella entericasubsp.enterica serovar Pomona)的特异性新分子靶标及相应的检测方法。

为实现上述目的，本发明采取的技术方案为：本发明要求保护一组用于鉴别16种不同血清型沙门氏菌的核苷酸序列所述核苷酸序列如SEQ ID NO：1～72所示。

通过生物信息学分析得到16种不同血清型沙门氏菌(肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌)基因组的特异性序列片段；所述片段可作为鉴别所述沙门氏菌的特异性新分子靶标，所述核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.72所示。通过检测待检测物是否含有相应的序列即可得到待检测物是否含有属于所述16种不同血清型沙门氏菌的菌株。

进一步地，所述序列SEQ ID NO.1～4用于鉴别所述肠炎沙门氏菌，所述序列SEQID NO.5用于鉴别所述鼠伤寒沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.6～13用于鉴别所述德尔卑沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.14～18用于鉴别所述印第安纳沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.19～25用于鉴别所述阿贡纳沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.26～28用于鉴别所述婴儿沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.29～30用于鉴别所述里森沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.31～34用于鉴别所述布伦登卢普沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.35用于鉴别所述维尔肖沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.36～38用于鉴别所述奥尔巴尼沙门氏菌，所述序列SEQID NO.39～42用于鉴别所述哈达尔沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.43～53用于鉴别所述韦太夫雷登沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.54～58用于鉴别所述伦敦沙门氏菌，所述序列SEQID NO.59～63用于鉴别所述火鸡沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.64用于鉴别所述山夫登堡沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.65～72用于鉴别所述波莫纳沙门氏菌。

进一步地，本发明还要求保护用于鉴别所述16种不同血清型沙门氏菌的引物组，所述引物组为根据如SEQ ID NO：1～72所示核苷酸序列设计得到。

通过根据相应的核苷酸序列涉及对应的用于PCR的引物组，每一个引物组包括一条正向引物和一条反向引物，对应检测一个核苷酸序列。所述引物组扩增产物对应如SEQID NO：1～72所示核苷酸序列的全部或部分序列。

作为本发明的优选实施方式，所述引物组的核苷酸序列按5′到3′如SEQ ID NO.73～216所示；其中：其中，SEQ ID NO.73、74对应SEQ ID NO.1；SEQ ID NO.75、76对应SEQ IDNO.2；SEQ ID NO.77、78对应SEQ ID NO.3；......；SEQ ID NO.213、214对应SEQ ID NO.71；SEQ ID NO.215、216对应SEQ ID NO.72。

进一步地，本发明还要求保护所述引物组在鉴别所述16种不同血清型沙门氏菌中的用途。

本发明还提供了用于鉴别所述16种不同血清型沙门氏菌的方法，包括如下步骤：

S1：使用所述的引物组中的其中一种对待测样品DNA进行PCR扩增；

S2：进行凝胶电泳检测扩增产物；

S3：观察扩增产物是否符合预期。。

一般地，一个PCR体系中仅含有一组引物；可通过设置多个PCR体系，同时对单个菌的DNA使用不同引物进行扩增，提高检测效率。

作为本发明的优选实施方式，所述S1中的PCR扩增体系包括PCR反应缓冲液、MgCl₂、dNTP、PCR聚合酶、模板DNA、引物组和灭菌双蒸水。

作为本发明的优选实施方式，所述PCR扩增体系为：增体系为：10×PCR反应缓冲液2.5μL，25mM MgCl₂2.0μL，2.5mM dNTP 1.0μL，模板DNA 1～2μL，5μM引物各1μL，Taq酶1U，灭菌双蒸水补足体积至25μL。

作为本发明的优选实施方式，所述S1中的PCR扩增程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s；50～62℃退火30s；72℃延伸30～90s；变性、退火、延伸共进行35个循环；最后72℃延伸10min。

本发明公开了用于鉴别所述16种不同血清型沙门氏菌(肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌)的，共72个特异性分子靶标，并提供了相关的引物组，以及对应的PCR检测方法。与现有技术相比，本发明无需沙门氏菌诊断血清即可检测目标血清型，具有检测时间短、成本低、操作简单、特异性强的优点；同时时本发明的检测方法可用于检测某些抗原不表达的菌株，弥补免疫检测的缺陷，检测结果更准确，结果判定更简单，实用性更强。

附图说明

图1为实施例3中使用引物组1进行PCR检测的电泳结果。

图2为实施例3中使用引物组2进行PCR检测的电泳结果。

图3为实施例3中使用引物组3进行PCR检测的电泳结果

图4为实施例3中使用引物组4进行PCR检测的电泳结果。

图5为实施例4中鼠伤寒沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图6为实施例5中使用引物组6进行PCR检测的电泳结果。

图7为实施例5中使用引物组7进行PCR检测的电泳结果。

图8为实施例5中使用引物组8进行PCR检测的电泳结果。

图9为实施例5中使用引物组9进行PCR检测的电泳结果。

图10为实施例5中使用引物组10进行PCR检测的电泳结果。

图11为实施例5中使用引物组11进行PCR检测的电泳结果。

图12为实施例5中使用引物组12进行PCR检测的电泳结果。

图13为实施例5中使用引物组13进行PCR检测的电泳结果。

图14为实施例6中使用引物组14进行PCR检测的电泳结果。

图15为实施例6中使用引物组15进行PCR检测的电泳结果。

图16为实施例6中使用引物组16进行PCR检测的电泳结果。

图17为实施例6中使用引物组17进行PCR检测的电泳结果。

图18为实施例6中使用引物组18进行PCR检测的电泳结果。

图19为实施例7中阿贡纳沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图20为实施例8中婴儿沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图21为实施例9中里森沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图22为实施例10中布伦登卢普沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图23为实施例11中维尔肖沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图24为实施例12中奥尔巴尼沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图25为实施例13中哈达尔沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图26为实施例14中使用引物组43进行PCR检测的电泳结果。

图27为实施例14中使用引物组44、45进行PCR检测的电泳结果。

图28为实施例14中使用引物组46、47进行PCR检测的电泳结果。

图29为实施例14中使用引物组48进行PCR检测的电泳结果。

图30为实施例14中使用引物组49、50进行PCR检测的电泳结果。

图31为实施例14中使用引物组51、52进行PCR检测的电泳结果。

图32为实施例14中使用引物组53进行PCR检测的电泳结果。

图33为实施例15中伦敦沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图34为实施例16中火鸡沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图35为实施例17中山夫登堡沙门氏菌PCR检测方法特异性评价电泳结果。

图36为实施例18使用引物组65～68进行PCR检测的电泳结果。

图37为实施例18使用引物组69～72进行PCR检测的电泳结果。

具体实施方式

为更好的说明本发明的目的、技术方案和优点，下面将结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明。

实施例1沙门氏菌不同种特异性新分子靶标的挖掘

根据GenBank数据库及本团队自测的不同血清型沙门氏菌全基因组DNA序列，进行生物信息学分析；筛选得到16种不同血清型沙门氏菌(肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌)的特异性基因片段，所述基因片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.72所示。

其中，所述序列SEQ ID NO.1～4用于鉴别所述肠炎沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.5用于鉴别所述鼠伤寒沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.6～13用于鉴别所述德尔卑沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.14～18用于鉴别所述印第安纳沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.19～25用于鉴别所述阿贡纳沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.26～28用于鉴别所述婴儿沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.29～30用于鉴别所述里森沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.31～34用于鉴别所述布伦登卢普沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.35用于鉴别所述维尔肖沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.36～38用于鉴别所述奥尔巴尼沙门氏菌，所述序列SEQID NO.39～42用于鉴别所述哈达尔沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.43～53用于鉴别所述韦太夫雷登沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.54～58用于鉴别所述伦敦沙门氏菌，所述序列SEQID NO.59～63用于鉴别所述火鸡沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.64用于鉴别所述山夫登堡沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.65～72用于鉴别所述波莫纳沙门氏菌。

实施例2引物有效性快速检测

1)引物设计

根据实施例1中的所述序列SEQ ID NO.1～72设计特异性PCR扩增引物组(包括正向引物和反向引物)，引物组序列如下表1。

表1特异性PCR检测引物组

2)鉴别所述16种不同血清型沙门氏菌的方法，步骤如下：

S1 DNA模板制备：使用商品化的细菌基因组DNA抽提试剂盒分别提取待测细菌基因组DNA，作为待检模板DNA；

S2 PCR扩增：使用所述引物组1～72中的其中一种对待测样品DNA进行PCR扩增；

①PCR检测体系：

其中：

所述引物组1～4用于鉴别所述肠炎沙门氏菌，所述引物组5用于鉴别所述鼠伤寒沙门氏菌，所述引物组6～13用于鉴别所述德尔卑沙门氏菌，所述引物组14～18用于鉴别所述印第安纳沙门氏菌，所述引物组19～25用于鉴别所述阿贡纳沙门氏菌，引物组26～28用于鉴别所述婴儿沙门氏菌，引物组29～30用于鉴别所述里森沙门氏菌，所述引物组31～34用于鉴别所述布伦登卢普沙门氏菌，所述引物组35用于鉴别所述维尔肖沙门氏菌，所述引物组36～38用于鉴别所述奥尔巴尼沙门氏菌，所述引物组39～42用于鉴别所述哈达尔沙门氏菌，所述引物组43～53用于鉴别所述韦太夫雷登沙门氏菌，所述引物组54～58用于鉴别所述伦敦沙门氏菌，所述引物组59～63用于鉴别所述火鸡沙门氏菌，所述引物组64用于鉴别所述山夫登堡沙门氏菌，所述引物组65～72用于鉴别所述波莫纳沙门氏菌。

②PCR扩增程序：

其中，

使用引物组67时，退火温度为50℃；

使用引物组9、65、70时，退火温度为54℃；

使用引物组1～7、11、19～28、31～34、43～56、58、63、66、71～72时，退火温度为58℃；

使用引物组14～18、29～30、35～42、57、59～61、68～69时，退火温度为60℃；

使用引物组8、10、12～13、62、64时，退火温度为62℃。

使用引物组1～9、11～23、29、32～33、38、41～45、49、55、62、67～68、71时，延伸时间为30s。

使用引物组10、24～28、34～37、40、46～47、51、53～54、58～61、64～65、69～70、72时，延伸时间为60s。

使用引物组30～31、39、48、50～52、56～57、63、66时，延伸时间为90s。

S3：取PCR扩增产物进行凝胶电泳，观察各引物组对应产物大小的位置是否存在单一扩增条带。如果存在，说明样品中含有对应的沙门氏菌；如果没有出现相应的单一扩增条带，则说明样品中不含有对应的沙门氏菌。

实施例3肠炎沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取91株肠炎沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组1～4中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图1～4(肠炎沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表2所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表2本发明肠炎沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图1～4和表2可得，通过所述引物组的扩增结果中只有肠炎沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例4鼠伤寒沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取91株鼠伤寒沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组5的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图5(鼠伤寒沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表3所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表3本发明鼠伤寒沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图5和表3可得，通过所述引物组的扩增结果中只有鼠伤寒沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例5德尔卑沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取84株德尔卑沙门氏菌、40株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组6～13中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图6～13(德尔卑沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表4所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表4本发明德尔卑沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图6～13和表4可得，通过所述引物组的扩增结果中只有德尔卑沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例6印第安纳沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取67株印第安纳沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2 PCR扩增时，使用的引物为引物组14～18中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图13～18(印第安纳沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表5所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表5本发明印第安纳沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图13～18和表5可得，通过所述引物组的扩增结果中只有印第安纳沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例7阿贡纳沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取67株阿贡纳沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组19～25中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图19(阿贡纳沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表6所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表6本发明阿贡纳沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图19和表6可得，通过所述引物组的扩增结果中只有阿贡纳沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例8婴儿沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取5株婴儿沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组26～28中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图20(婴儿沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表7所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表7本发明婴儿沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图20和表7可得，通过所述引物组的扩增结果中只有婴儿沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例9里森沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取19株里森沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组29～30中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图21(里森沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表8所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表8本发明里森沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图21和表8可得，通过所述引物组的扩增结果中只有里森沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例10布伦登卢普沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取9株布伦登卢普沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2 PCR扩增时，使用的引物为引物组31～34中任一组的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图22(布伦登卢普沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表9所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表9本发明布伦登卢普沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图22和表9可得，通过所述引物组的扩增结果中只有布伦登卢普沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例11维尔肖沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取3株维尔肖沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物组35中的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图23(维尔肖沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表10所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表10本发明维尔肖沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图23和表10可得，通过所述引物组的扩增结果中只有维尔肖沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例12奥尔巴尼沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取84株奥尔巴尼沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2 PCR扩增时，使用的引物为引物组36～38中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图24(奥尔巴尼沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表11所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表11本发明奥尔巴尼沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图24和表11可得，通过所述引物组的扩增结果中只有奥尔巴尼沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例13哈达尔沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取5株哈达尔沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物39～42中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图25(哈达尔沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表12所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表12本发明哈达尔沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图25和表12可得，通过所述引物组的扩增结果中只有哈达尔沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例14韦太夫雷登沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取30株韦太夫雷登沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2 PCR扩增时，使用的引物为引物43～53中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图26～32(韦太夫雷登沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表13所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表13本发明韦太夫雷登沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图26～32和表13可得，通过所述引物组的扩增结果中只有韦太夫雷登沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例15伦敦沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取17株伦敦沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物54～58中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图33(伦敦沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表14所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表14本发明伦敦沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图33和表14可得，通过所述引物组的扩增结果中只有伦敦沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例16火鸡沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取18株火鸡沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物59～63中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图34(火鸡沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNAmarker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表15所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表15本发明火鸡沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图34和表15可得，通过所述引物组的扩增结果中只有火鸡沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例17山夫登堡沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取9株山夫登堡沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2 PCR扩增时，使用的引物为引物64中的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图35(山夫登堡沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表16所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表16本发明山夫登堡沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图35和表16可得，通过所述引物组的扩增结果中只有山夫登堡沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例18波莫纳沙门氏菌PCR检测方法的特异性评价

取12株波莫纳沙门氏菌、41株非目标血清型的沙门氏菌，以及22株非沙门氏菌，按照实施例2的方法进行PCR检测。其中，S1 DNA模板制备为分别提取各细菌的基因组DNA；S2PCR扩增时，使用的引物为引物65～72中任一种的引物。

PCR扩增产物凝胶结果如图36、37(波莫纳沙门氏菌凝胶图中第一个和最后一个为DNA marker，倒数第二个为阴性对照；其他血清型沙门氏菌和非沙门氏菌凝胶图中第一个和第二个分别为DNA marker、阳性对照)。

各菌株及检测结果如下表17所示；表中，检测结果栏目中″+″表示阳性，″-″表示阴性。

表17本发明波莫纳沙门氏菌检测特异性评价试验结果

由图36、37和表17可得，通过所述引物组的扩增结果中只有波莫纳沙门氏菌显示出特异性扩增条带，其他血清型沙门氏菌及非沙门氏菌菌株均无特异性条带。

实施例19沙门氏菌疑似菌株的检测

利用实施例2中的16种不同血清型沙门氏菌PCR检测方法以及血清凝集法分别对391株从食品样品中分离的沙门氏菌疑似菌株进行检测，食品样品采集于广东省的超市及集贸市场，样品处理及疑似菌株的分离参见国标法。检测结果如表18。

表18沙门氏菌疑似菌株检测结果

由表18可得，本发明方法对所述的16种不同血清型沙门氏菌检测结果与血清凝集法一致，说明本发明方法的可靠性高。

最后应当说明的是，以上实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对本发明保护范围的限制，尽管参照较佳实施例对本发明作了详细地说明，本领域的普通技术人员应当理解，可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换，而不脱离本发明技术方案的实质和范围。

SEQUENCE LISTING

<110> 广东省微生物研究所（广东省微生物分析检测中心）、广东环凯生物科技有限公司

<120> 16种不同血清型沙门氏菌特异性新分子靶标及其快速检测方法

<130> 2019

<160> 216

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 618

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis

<400> 1

atgagcgaca ataaaacaga atactcatat tatattaagg ttaaaaatga aagcgcccgg 60

aaacgtctcg gcttcccttt tgctttctgg tggaaaactg aaagcagcga agccgctgcc 120

acagcacgcc ttgccgtatc aatgcttgac gccggattcg aaccgacaga ttttgcaaaa 180

ccggttcgcg ttaattcccc cgctgttaac gaacttccgc cggagggaag ttttgatacc 240

accttctgtc agaaatatga gctgggcggc gaagatggca aaacatttat gctcatcccc 300

ggcacgcccg ctactgacgc ccacgacgaa aaaacggagg aatgcgccga cgacgctggc 360

accgaagaaa gcgggacaga caccagtgac aacgacgaat gtcaggactg cgaagtttcc 420

gtcgccaccc tgccgttccc ccagcgcgtg ttgcacattt ttacttacgc tgccacagac 480

aaaaaatatt tgcatcacgc cacccgcgct caacgcaggc atattaccgt tctcgaaatg 540

gaacaggaaa acagctatat ccagaacctg ttaatggtat tgcggaagtc tgaacaggtt 600

catgcccagg atgagtaa 618

<210> 2

<211> 522

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis

<400> 2

atgtcagaaa ccgctctggt tatcgtaaaa ttcctaattg gtaaatccgt cggacaattt 60

atgctcacag tggctttatt tttcttaatt atcatcttca ttcctagaga tattacggag 120

cttattgagg cgcgtagcga tttaccatat gccgttcaga tttttagttt tgctgtggct 180

taccttatag tgctgatcct caaagtcact ggttattttt tcgtgtcggc gctgccgttg 240

tgccagcgta ggggcagggc aaaacgcatg ttaaaaacgc ttaattcatt gagtactgaa 300

cagctgtttt tacttgaacc ctttcttaaa actcattctc ccactttccg ggcgtcctgg 360

gataaccctg atgcagatgc tctggttaag gcaggtatcg ttcgtccggc tggttcgtgt 420

atcgacggtg tttctgtgat gttcaaaatc gaacccgagt atgagtcgtt aatgctttcc 480

acctggaatc cctgcacaaa acggttcgat attagccgtt ag 522

<210> 3

<211> 600

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis

<400> 3

atggcgcatc tacaacttgt taaacaaacc tcatcagggc ttctgctccc ggcaacgccg 60

gagagtgagg acttcctgcg ctcagtaaaa atcggtgcgt ggatacacgc cgattttaag 120

cgagtacgta actacgcgtt ccacaaacgt tttttcaagc tccttcagct tggtttcgat 180

tactggactc cgatcggcgg ggcgatcctg cctcaggaac aggagctgat taccggcttt 240

gtcgatttcc tgtgtgagtc agcagcgcag ggccacagtc ccgcactcag tgacgcggcg 300

gaacagtacc tgcataaggt tgctgtcaac cgaacgctcg atgttgcgct gctcaagtcc 360

ttcgacgctt tccgcgagtg ggtaaccatt caggccgggt tttatactga gcattattat 420

ccggatggca gccgtgggcg ccgggcgaaa tccatcgctt ttgcgaatat ggacgaaacc 480

gagtttcagc aggtttataa ggccgtactg aacgtcctgt ggaactggat tctgtttcgt 540

aaattctcct ctccggaaga ggtcgaaaat gtcgcagcgc aactgctgga gtttgcgtaa 600

<210> 4

<211> 555

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis

<400> 4

atgaataaaa taaatgtgct gggtgtaata ataaaacact acaaaacaat gtcagatcag 60

cgtggaacaa tgttgatgag cgacattatc gtacatttta ttgttccgtt atctctttct 120

ttcgttctgt gctggacata cggaataatg aaaccggcaa ttgcttccgt ctttgttaac 180

ttcggggcta ttacaacagc actattaatg agtgcagtaa taatgattta tgaacaaaaa 240

caaaaaacca tcactaagat atcagacata attgaaggaa acaaatcccg agacaaattg 300

atatcattaa acactaacaa aaccatatat gagcagttat gccacaacgt cgcttatgca 360

atattaactt caatagtatt ggttatattt tcagtgataa tatatttcct gcctgacaat 420

gcagtggatt taatgaaatg gtattttcgc gcacctgcat atattgttag ctttttagcc 480

tatacatcct tttttatcac tgttataacg ttcttaatgg taataaaaag atttagcaca 540

attttagata attga 555

<210> 5

<211> 609

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium

<400> 5

atgacgatga aaaacgacaa ggcatggatt ggagacctgc taggcgggcc gctgatgagc 60

agggaaagtc gaatcatcgc tgagctcatg cttaccgctc ccaatgaaca aacctggcaa 120

gagcagatcg tgggtcataa cattctccag gcttcctctg ccaatacggc gaagcgctat 180

gctacaacga taaaactacg cctgaatacg cttgataaag tggcgtggtc gcttattgct 240

gaagggagcg agcgcgagcg tcagcaattg ctgttcgtcg ctctgatcct ccattcaccg 300

gttgttaaag acttcctggc tgaagtggtg aacgacctgt gcagacaatt taaagaaaag 360

ctccctatgg atagctggga tgagtttgtg gctaaccatc ttcgtcagca gcccgtactc 420

accagttact cagattcatc catcaaaaaa atgggtaaca acttgatcaa agcactggct 480

gaagctggtt atctggatac acctcgtcgg cgtaatctcc agtcggtctt tcttttacca 540

gaaactcagg cgaccttgca gcgccttgga caacaagaat tagtttctat tctggaggga 600

caacggtga 609

<210> 6

<211> 519

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 6

atgggcgtgc cgcaaacaaa atcagaatta ttaaatgcga tggataagga ttttagtaag 60

ttaatcggtt atctgaatgc tatcccttca gaactactct cagaaaaatc aatggaaggc 120

catgcgaaag atacgatgat gagtgtcaga gatcttatct cgtatctttt gggctggaat 180

atgttagtca taaagtggat aacaaatgat gaaaaagggg aatcagttga ttttcctgaa 240

accggttata aatggaatca gcttggcctt ctggcccaaa aattttacaa agattatgaa 300

ggtgttcaat acataacttt gattcaggat cttaagttag caaaagagaa tgtagttgcg 360

cttattaatg cccgtgatga caatgtactc tacggaaaac cgtggtatgg taaatggaca 420

atgggaagga tgatttcatt caatacatca tctccctatg ctaatgcctg tggacgttta 480

agaaaatggg caaaagagta taatgttaga ttgaaatag 519

<210> 7

<211> 588

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 7

atgagttatg actatgaaaa attagaaaac aaaaaagatg agataattag tattgttcat 60

gaaatattta ctgagaatga taaggcagct atttccctag tagattcatt ctgtagatta 120

acgccgcctg aaaaagaaaa atttgtaatg gaatatatta cagtcaactc atcaggccga 180

cgtggcggaa aatcaagaaa attgggtaat tttgttctta attggagaaa attattcaat 240

gatcttcccg atttagtctt aacagcggca ggtgttgcag ctgaaccaaa attagtattc 300

tttgcagcat taagtatttg gaataagatt tggtgtcatt cttcaataga acttacgcca 360

gaacatgcta ctgttttgta cgccttatgg caaggaagag atgagtataa taaaataaag 420

agagatgatg cgtttgcaaa gagtggcata caattcaatt tttacggaat gcaagagtta 480

gtggatattt cattcgatga tatcattgat gatctaatta aaatgcgatg tatagaagtt 540

aatgataata taatatggct tcgcgagtgg gtcagcggag tatattaa 588

<210> 8

<211> 558

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 8

atgaaaaaca aatctgagaa aaaaacgaag agaagaaaag gatggataaa aaatcttact 60

gaatatgaac aatcaatttt cgttaacatg ctgaatgaag cagcaatggt taaaagaaga 120

tgggtgacta aaaaagaaaa acgtgaagtt atatatagat ttcgtgatgt tgtccttgct 180

ataagagaag caaataaaac taacgaggat aaaggtaatg gtgtatcaga acaagaaata 240

gtcaatgaag ttgatggagc aacatctgat gttgttaaag ttaaaaaaga aagaaaacca 300

cgagtcagaa atatcgatga gtatggtcgt ttgagaagag tatcattatc agaaagaaag 360

ttcataaata atgcagtatc ggaatcaaca aaagcaaaag agtcaaagtt gacagatgaa 420

gaacgaagga aagtgttgtg tgttgcccgc gaacagattc gttctcaacg taaagcgaat 480

cagattaaaa gtgtaagaac taaagcaaga catgctgcag tgtttgaatg gaaacgccct 540

gattctcctc gtcgctaa 558

<210> 9

<211> 282

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 9

atgtctagtt ataatattga agttaaggtt gaaacagatt ctgaaggttc ggaaatatcc 60

aagacgtgga atatttttag tctggatggt tcattagtga aaagtgggat actttctgaa 120

tctgaagcga agaattggat taaagctacc gaagataaag aatttttatt cgatgtatcc 180

aaagatatta aagccgatat atctcatcca aaaaaaataa atgaagcctt aaatcctgtg 240

gtacaaccca cagggtgtat ttattggact ctgaatttat ag 282

<210> 10

<211> 1251

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 10

atgatgaata aacagattaa aataaaggga atgacagcta tatttacttt atgcttttca 60

acgctatatg taggtaatgt tttttctgca tatcctgtca caaactacac tcttgatcct 120

tacctgatgg ggagatcacc actgtcatta ggaaatggtt taatcgaaac attagtctca 180

atgaatgaca agttggctca ggcaaatata actgccaatg agaatcaaaa gaacactgtt 240

atgagtaatg ctaaccaagc tatacaagaa caacgcatga agaatgtctt gaagagaata 300

cctgatgcta acgcttgtgt ggaagcgact gcagcaggag gtcgtggttc tgctggttct 360

aacacaaatg ctgccaaagc tgctttagct gaaaacagcg taaaaatgtt tacaggagca 420

agcaccggca taaatgaggc caaaaataac gtgatggggc gagtctcgat tgatgtctgt 480

tctggcgaag acgtgaagta caacagaggt ggatgtagtg ccataggcca atatcctgac 540

agagataaat cagcttcatc actgacaacc ccgccactat ctgtatctga tgctcagggg 600

aataaagttt caaaccaatc ttatgacgtt aaacagatga aagtggctga cgctgctaag 660

cgaaatctga ttggtaattt accgctacag cagctaaatg acaggaacct tgaggacacg 720

aaagaagggc gcgaatacct gtcagcattc tcaagttttg ttgccagaag caccgcagga 780

accaatgctg ttgattctat tctggcaata aagaaatccg gggatgtatc agtaaactca 840

agaggggtaa atataggctc aggacttggt tctacagcag gagcaagtca ggcgtggacc 900

gatacgtctg tgaaaaccaa gtatgcgaca ttattccccg gagcagagtt cccgcctaag 960

ccatcggaat gggaaatgtt gaggtatgag atttattctc gttatgcgga taccactggc 1020

gctgacgcat ggcaggttaa aatcagtagc tcggatgaaa gagaaacagc tcatgggcag 1080

gcaagaatgc aggccatcga tctaagatta cagatgcttc aaatagaaag aacagaagac 1140

acaaatattt tattagccgc actattagga caacagctac aacctgttga taaagtgatg 1200

ctgaataacc tgaaaatcaa tgccacaaaa tcaacgcagg ccgctaagta a 1251

<210> 11

<211> 240

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 11

atgaataaac tgagagggaa ttttattttt cttatcctga tttttatttt gtttgattca 60

tgtatcagaa acaagcatga gtacttagtt ctcgttcctt tgttttttat tagtgacatt 120

ttttcggtgt ggctctctaa gcattttgag aaaaataagg tcttggtaaa gatagcatca 180

ttcatgattt tctatgggtt aatggcagtg cttgtcatgg gctttataaa atcacgatga 240

<210> 12

<211> 576

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 12

atggccttac cgaaagaatg tagagttgaa agatctaagt atttagaaga acaatataag 60

aagtatcaaa taacagaact tgaaaactta accactgaag attttagagt gttggggatg 120

tatatacaga catattgttt tattgagttg aatatacaga gaatatttca aaaacttaag 180

gaaaatggaa ttataaaaat aaagaaaggc actaaaatca atgttcctta tataatggat 240

atgttgaaaa agtcgattaa tcaggtgatc acagagccat cagagatttc tctttttatt 300

gagaatctag gagagataga gcttcgtaga agttatagaa atatttttgc gcattgggcg 360

gcgaagcgaa tacctaaaga agacgctatg gtttttatta ccagtaatgc gcaggattat 420

aaaaaagtga ttggtaaaga aatgaactca gattacattg cttatgctat tttagacatt 480

gctgatattc gtggtttaat agttcatttg ctcgaatatg ataaatggct agctgaattc 540

accgggcatc tctatagcaa gtttcaggat gaataa 576

<210> 13

<211> 546

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Derby

<400> 13

atgaatttta aaccgatatg ggatatctgg tatccatcgc cagataaact ctcctgccaa 60

acgtcttata cgcttgagga cgctcagcaa aaattggaac atgccctcga aaaaaatgaa 120

cagatgcatg gaacgataaa gccgttgcgc gtgacggtgc ggtatgactt cagacgttgc 180

gatggacgga aactcacagc gtcatttaac gggcgctggc atgaaacgcc agttggcgta 240

acgttggaag gtcaaacatc gccatcaacg tttggtcccc tgattattac catcgcactc 300

cttctggcgc tgggaatgga aatactcact ctcgctaacc ttgtcggacg ctttatcgga 360

gggatatttt tcccgctgga caacattgtt agtggacccg aaataaactg gccgctcatt 420

gttatcctgc tcggtttccc ccccattttt cttgccatcg caacaggtat tctcgcgttg 480

ctgaacgccg ttgaacgtga acaaaaacaa caactgcttc gttttatccg cgatgcgctg 540

aaatag 546

<210> 14

<211> 609

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Indiana

<400> 14

atgaatagga caataaagaa aaatatagaa aatataaaaa taattactga tgaaataaaa 60

cgatgtgcta ttgaggaaga tgaaggtaag atattaaaat tggtttccac ttttgaaaag 120

tttcctcgta aagaagttag ttctttttat aacgtttttt ttagggattt aaatctttgt 180

gaaaaattga ttagcatggc gaagtattat ataaataatg ataaaatact tatagaaata 240

atatcttcgc taggaaatat ggtcgttcga tatggtttac ctccatcaga cgatttgtat 300

gaactttttt ttagtttgag gaatagaaag aaagttaact attatatttc actgtttatt 360

ctccatttcc cacaatcgga gtcatgtgat tttagatggg attatatttt atctatccct 420

gatattgcac caaaagagaa atcaaagaaa aacttttact caatcattaa aaatatcaat 480

gcgtcaggag agaaaatccc ctttgaatat aaagccagaa tagtttatct attgggggtg 540

tttagtgata ataatatgta tggtgaagag ttcatgatgt taagagcgca acttcaatcc 600

gtagattga 609

<210> 15

<211> 681

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Indiana

<400> 15

atgaacgtaa tgcaggataa aattcaccca atgcttttgc cgttctatga agaagtccga 60

atggatgatt ctcttacggt ggttattgtg agctttccac aagggatttc taaaccttat 120

gttgtgcgcc atcaggggag ggaagaaatc ttcattcgtg tggggtcaac gtccagattg 180

gcaactcgcg agcagcaaat gcatttgttt gaaattagca gtatgttaca tactgaggta 240

atgcccgttc cgagaaccga tattacctgt ctggatgaag cccgtttatt gaattatctg 300

cgcaatattt tgcatgatcc cgatattccg gagacaccgg aacaatggca acaacggctg 360

ttgggattga gttttctgac gcaaacgggt gaaaacattt gttgtacgat tgctgggtta 420

gtgctttttg gtaaacatcc acgtcagtat ttacgtcaat cgggtatccg agtctttgcc 480

ttcgccagtg aatacaaaga atatcagccg ttgttggatg atatgctgga tggcccaatg 540

gtgggacgtt ttgatactga agaggctggg agagcgttga tcgatggagg attgattgag 600

cgtttgatgt caaccatcat gccatttatt acttctgagg cctctcaacc cgatatgaac 660

ttgcgtcggg aaaccaccta g 681

<210> 16

<211> 195

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Indiana

<400> 16

atgcttaaaa gcgagttact ggagatcatt gctaacggga aaagctccgg agtggagttc 60

aagcgagatg atgtccgccc ggaacaactg gcgaaagacg ttgttgcgat ggctaacttt 120

tggggaggat gtgttctgct gggtgttgag gatgatggca ccattaccgg aattcagcat 180

cagaacctgg aatag 195

<210> 17

<211> 684

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Indiana

<400> 17

atggttgcca ttttaccggc agggcctctg caaaaatgcc gggccgcaga tactgcggca 60

gaggttgaga gttatacacg ctacatcctt tcactgcgcc agttcgctgg ctatgtttcc 120

atccgcccgg aagtctcacg atttcccggt ttatctgtac ctgctgatta tcagcgcttt 180

ttatctgcgc cagatctctg gtcaatgctg tactgcgccg gaaacgatcc ggtaacccct 240

acacccgctg ccacatcagc tcctttgact ttacgggctg cggcctgcaa agacgttcgg 300

ctttgctgcc gcgtgaccgt aaacctgcac cagaacctgc aatctttcgc gcactgcacc 360

cgaccagtgc gtcactttcg tcgcgcaaag cgacaaagtg acacacaacc accacaccgc 420

gctatgcccc tgttttcggg gttccagcgc tcattcccga atctgacacg cctttttagg 480

gccgctgtca gcaagaaaaa ggagaaaaag atcgataccg aggggggcat gacgccccgg 540

agaattcctg ctcacacagg cagcctgtac cgcgtacagt ctgaaactcc ctatacctca 600

acaagctgcc actccggcgt gaaggtatcg ttctggcgca gcctaaaagc atacgccgga 660

gactgtttgt gttttcaaaa ttaa 684

<210> 18

<211> 162

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Indiana

<400> 18

atgcaaaacc ctcggccctt aagcaatata gaaatcaaaa atgcccgccc ttccgctaaa 60

ccacacgtac tttatgatgg tgatgggctg gaactaaaaa tcactccgca aggctcaaag 120

ttgtggctgt ttcgctacta ccatccccac tcgcacaaat ga 162

<210> 19

<211> 291

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 19

atgtttgatc ccagcgcaac aatagagaat cttcatggca ttgtcagtca tgtggatatc 60

gttgcgaaaa aggttgtgct gcgaatgagt tcagagagga ctgtaacctt cactattgac 120

gaaaacacac tgtatattgg cgaatatggt ggggattttg acatggaaga tttggtttcg 180

ttcaaaggca aagaagcatg ggtttggtat aaaaactgtg atattaaaaa taagaatgaa 240

ccaatagtac tgattaattt tttattaggt ggtggagtac atggggagta a 291

<210> 20

<211> 438

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 20

atgagtaaaa acctagtctc tttatcgaat gaagttgatg aaaaaatatt gaagatgaaa 60

gataaagtca aaaccacaaa gaggaaagca aatcccctta agctgcttgg tttatttttt 120

gcagctctga caactatttt agttggctta agtaatggtc gtgtcaattt atctacctat 180

tcattaataa caagcgcact tttaacctta gttgtcggtc ttgaatccca tttttcatat 240

caagagcaat gggcaagaca aaaatggaca ttattgaaac tttatcaaat acaaaataaa 300

atccggctgc tcaatgaaag tgatagaaca aatcaagata ttataaatat ctatatttca 360

gattacttgt caatatggga tatggatctt tctcggtggg aaaagattaa aacacaagaa 420

aaacacaagg cgtcttaa 438

<210> 21

<211> 375

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 21

atgaaaataa atctattttt agccttttca cttatctctt tagcttcaat cacttgcgcc 60

gagaataaaa taaaggtcac aggaatatac tccgatctca aatttcatga tggcactggc 120

gatgttgtgg gaacggagat tattatcggt tactccagta aaggatattg ggtttccttc 180

cagtacagtg aaggtgagcc cacgttcccg gtaatcgttc tggcgagtat caataaaggt 240

aaaatcacct ttaaagtgcc ttctgagttc aatgaattta atggtgagat ttcatcagac 300

ggttggcttg ttggtgagtt tgatgggaat aagcagaaaa tcattttaca gagagggaaa 360

agctattggc agtaa 375

<210> 22

<211> 348

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 22

atgaaggtag acctgagaaa actatctatt ggctggattg acaccataga aacgcgtaat 60

gatagcttga ttatgagcgt agtttcattt gcagacgagc taaaaataaa atgtgatggt 120

gtgattttct tgtcagtaca ctatcgtggt gatgatgagc ctggtactga atttggtact 180

gtggttgaag ttcggcatga atatcggagc gttagaagtg aagatattcc gttgcataat 240

tactattatc aatcaaatat accattgaat attgtaaggc tggaggggga cttcatagtt 300

aaccttgtct gcaaatccat ctctactata ggtcaggaga atgaataa 348

<210> 23

<211> 405

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 23

atgaatatct actttaaata tattatactt ttttgtttta ttattccagg cacgaatacg 60

tttgccgtgg aagttccgtg gatcacgaaa aaagagagac aggaggtaac gacgtattat 120

ctctacgaga cctgttccgt tattggtgaa actcgaggtg ggatgatccc ctattttgat 180

tgtgagagct acgtatatgg cgtcctggat gcctaccttg ccgttcgtga tacgattccg 240

gtggctcagc gggcttgctt ccccaaaaat ctggcaccgt ggcaggtgct tgaactttcc 300

gcagattatg atgaaaatgt gatgcaacaa acaattattc agggttatcg gcctgcctcg 360

gaggttttaa ttgaacattt aagagagaaa tatccgtgtg agtga 405

<210> 24

<211> 795

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 24

atgtcgagaa atattattac acctaaggaa gcagtaagta tttgcaggaa gataaggaat 60

tcgtgtgacc gggattttat taccaaagga ttccggtttt tgttaagcca actgcccatg 120

ggatttcatg atgttactga ggccactttg tggcgggcaa gaaaaacaga tgaagcccat 180

cctgaaggat ttgattatat caaggatgtt atctgccctc ctgcacaatc agccaaaacc 240

gggcgactca ataatgaagg catgcctgta ttgtacgcat ctatcagcaa tcatggttgt 300

cttgctgaga ttggtgccgt accgggagat aaggttcagg tatctgcatt tgacctaaaa 360

cctgagcaaa aattgcactg tggctttgtc ggtgacattg ttaaagcgca caaatggaat 420

agtgaagatt ttactctcgt ccagaaaaca ctggaaccat ttactgaaga gcaaaaaacc 480

agtattttct tgattgatag ttttatcgca gaaatactcg ccgataatta tgctaacata 540

aatgaatatc tgcacacgac aactcttgca gatgttataa ggaatggtaa gaataaactg 600

gatgcgattg tatatcctgg agttgaatct gtaggggcaa aaaattacgc tatacacgct 660

gattcgttga ttaaatttaa catccccgac atatatcttc ttgaaataaa aaacaagtat 720

ccttatggtt tttatgaatg gaccgtactt cggcaaagag accattatga tggtgacatg 780

attatttgga agtaa 795

<210> 25

<211> 929

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona

<400> 25

agtcatactt tcaaaatata cgaaaaatga aaacacttga ggaagcccat aatacactaa 60

tggggcactc tgttatcagt ccctatatga gagttcttta ccatcttttg aaacacatct 120

ttacgtattc aactaatcct gatatttata aaaaatatac atccccatta cgctcactta 180

ttcgtaatga tgttctttat cttgttgcac taaatacagc aattatctac aaagatggtt 240

cgttagatga taatggctat caagagtttc aggagtatct tcaaaagagt gatttctttg 300

aacatacaat attcactgct gatgagtata aaaattttaa tgctgttaaa agtgaagtag 360

aattcagttt tgatcaaaac tttaatatcc cgattaggaa ttatattttt aattatgtga 420

aaacattgag gttccaaaat gatgtgattg atttgcacaa ggatttaatg ctttgtgtta 480

tttttaaaaa tccgtttact cctcttgtta actcttatat tgacaatgtt tcactggttg 540

tcaaagaatc atataagtat cacttaggtc aggtttgtaa atccgaaaat agatacttgg 600

gtcttctgaa tgatttatgc gcatattatg aaaaggagaa taaagaaaag gaacttacat 660

tgataaataa tttctctact cttcgtgaaa ttgcgagtag taataaagat aagtatacat 720

tattcttcgt aagacgatct gatggattct cagataattg cgccaatgta gcaaactgga 780

ttgttgagtt tgatagatat agagaagtat tgcggcagca tgaaaataat aagttaaaag 840

tagaaaaaga tcttgacaat atatcaaaat tattttcgag tatgtttaat gaaagtatag 900

ctaaatataa attaaatggt ctattttag 929

<210> 26

<211> 1086

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis

<400> 26

atgacaaaag cagatatccc attaaaaact gagcgactac ataccgtagc cccatacatt 60

gggaagatgc gccccgaaat tgcggggtgg gctattgata ctgtatccaa accaggcgaa 120

ttagtatacg acccattttg tggttctggt actgtgctcc tcgaagcttg gctcaaaggt 180

agggatacta ttggtaccga cctcaacccc tatgcctgcc tagtgtcacg cgcaaaacta 240

aatccatatg aacctaataa ttcagaaagg gtccatgtac tattagataa atactcagct 300

ttcgttgaaa agataaagcc gaccatcgat cttgatgaaa ttcctgtttg ggtaaaggac 360

ttctataatc cacaaacttt aatcgagttg ttagcatggg ttgcagtttt aaaaaataat 420

aatgatgagt ttgctctcgc ttgcttgctt tccatcgctc accatcagcg acctggtttt 480

ctttcatatc catcaagtca tacagtgccg tatctcagaa ctaaaaaatt tcctccacat 540

gattttcctg agctctacga atataggcaa gtacgccctc gactagaaaa gaaaattttc 600

cgggtgtata actcattgcc ttcaattgat tactcattaa gtagaactgt ttatcagcaa 660

gatgcttcta ctttagagtt gcctcgtaag gttgatgcaa taattaccag tcccccatac 720

atgggacaac ttgattatgc tcgtgataat agattacgac tttatcttat gggtgttgag 780

gattggtcat cgctcaataa gtccatttcc ccaagcgcaa caagatttgt tgagcaattt 840

agttcatgtc tcaattcatg gcgtaaaaat ttacgtcatg gaggcaaact tgcgattttt 900

gttggtacca caaccaatac tacaaaaaaa aggctagacg atattgtaat tgatttgata 960

aataatgaat ggcctgacta tgaattaacc gacaaaattt cgagtgaaat tcctgaagcc 1020

cgacgagcca ggaaaaattg taagggaagt gttgctgagt ctctattaat atttgaatat 1080

aagtaa 1086

<210> 27

<211> 873

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis

<400> 27

atgattaact ggccggattc tttaattgat gagctagctg ctcgccgatg tgtaatattt 60

atcggctccg gtacatcggc tagtgcgaca aaaaaagggc ctaataatga gacaatcagc 120

cctccaacct gggatagatt acttgaaatc cttctggaaa aatgtcatga agatcaagat 180

ggttctaaag aaaaagcgaa tgagcttctt caaaatcaaa aatatcttga ttgtgctgaa 240

ttaatccgcc acaactgcat gcaaccagct gactataaca gaagcattga atcaattttt 300

tcgggatata acccaactga aatacataag gcagttttaa gtcttgacca gaaaatagtt 360

ttcacaacaa atttcgatag aatttatgag catctttgtt taagagatga aggtcgagat 420

gggtatgtag ctctaaatta ttatgacgat ggtcttattg caagaatgcg ttcacctaag 480

agaattattg taaaagttca tggttgcgca ggaactcctg aacatacaat tctcaccaaa 540

tctgattttt tcaaagccag gtcaaaatat ccaggttttt tcagtgcgtt agaaagtata 600

tttttgactc ataccattct ttttatcgga tacagtgtca atgatccgga aattcagttg 660

atacttgaaa ataatataat tacataccct agtgataatc ctcattatgc aaccatgtca 720

aaaggcatgc ataggacaat gatagcagca ttcaaaaaaa caaataatat atccgtgctg 780

gaatatgatt ctgctgacaa tcatatacag ctggtagaaa gtttgaaaga attatgtgtc 840

caagtcgaag atagaagaca ataccaaggt taa 873

<210> 28

<211> 1050

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis

<400> 28

ttgaaatcag tagcaatgtt caataataaa ggtggtgtag gaaaaacaac cctaacctgc 60

aacctagcat cgtttattgc aacggagttc aataagcgag tgttaattgt tgattgcgat 120

ccgcaatgta attccacaca attaatcatg ggaattgagg agtctgctga gttttatact 180

aggtcaaata acaaaatcag cactataaaa gatgtcttgc aaccaattga agatggtgac 240

tcagatataa acactgatct aacgttccta aaatcttcag aaaatagatt tggtgtagat 300

ttactacctg gccaccctta tttagcaata attgaagata gattaggtgc tgcatggtca 360

caacttcgtg cgggagacag acctggttat aggcaaacaa actggaataa tcacctctgt 420

agattcttag aaaataaata tgatctcgtc atgtatgatc ttggccctag cttgggctca 480

ataaatcgct cggtactaat tggttgccaa cacttcctaa cccctttagg atctgatgtt 540

tttagtatca ttggtgttaa aaatatagcg acctggcttt caaaatggct aaaagactat 600

attaatctat ggaatctatt agaacctgag gagaaaacta tattaagaga ccgatttaat 660

atcattgata ctcctagtgt atataaaggt ttcatcggtt acactgttca actttatatt 720

acaaaatcct acggtaaaga aagacgtgct acaaaggcat acgaatctat tataggtaat 780

gttggtgtcg aaattaatac atatcttcgt aatttctatc ctcagcattt agaggctcat 840

ccagaacatg ccaaacttgg tgatatacaa cacctttata gtcttgtacc tctagctcaa 900

aaaaatgctg ttccaattca cggtttaacc agtactgatg gacttgtcgg atctcaatat 960

tctgcagtca aagaatttta caatacgata catccaattg cagagaacct cttacgtaat 1020

ttaaatatgt tgggggtaga tgctaaatga 1050

<210> 29

<211> 546

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Rissen

<400> 29

atgattaata aggttttatt tcaatcaatg ttaatagtta ttttcactac tatttcttgc 60

tcttcatcag ccaggctttc ccattcagaa aaaatgaatg tttttaatga taaggctctg 120

gtggcagaag ctaaatatag ctttattgat gttcgtgata ataatctatt tgttgatggt 180

aagtacaaca aatcttatgt tgataaaatg tatgatactt actccattgt ttatcaggaa 240

aatagtatta actattactt aatgttaaaa agtggcgggt tattgaaaaa acatatactc 300

aaaacaaaag aatatttaaa tgggaaggat tgtgaaaaag ctaagtatgt taaaaactgt 360

attttcatgg aaaaaaggat tgacgagatg tataaccttt cggtgatgat tgataatggt 420

atggatgcag atttaattag aaaaaattta tacaatgacg tatacaaaga cagttacaaa 480

gttatgctaa tgaataaata cattgaagct cataattttt tagaagaaag tcaataccga 540

gattga 546

<210> 30

<211> 1470

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Rissen

<400> 30

atgagtgtag ctaattgcat aaagatcaaa gggttaggat ctgaatcgac tgggtatctt 60

tttaaggcaa gttcctgcga tgcaagtttt gtgatctcat cgaagcatgg tctttgccat 120

cagaagacaa gttgtgagcc attcaaagca aagacagcag gatgttgtag gcaatgccca 180

gtccaactca gcttagatac tatttcatta gaaaactcta aaatgagcct caatgccata 240

aagatcttta gttttcctga tagagacttg gctataactc ttgtcgaggg atattctagt 300

caccctttac gcatcggtag tgaagctaat attagttcaa cacattatta cctcaatgct 360

tataaacaag atgatacgga accagggcgt attatgctca attttcctga taaatcaact 420

gatgggctta tatattataa tatagaatcg aactcaacac ctgatttggt cgaaaagtct 480

agagggtata aaggtgtttc tggtgcatta gtcttagaat atcctgcttc agatttccca 540

atagcacatg ctgttgttat agaaaatggt aaaaataatg atcttgttgc tgaatctcta 600

actgatattg accatgagca gcttaataat tttttcgact gtatcgtttt tcataaacca 660

gcttggacaa taaaattaga taattcaata ggtgattatg tccaagaaat tttcaggaaa 720

aaagttactg atgaatttga agttgttact tacataccgt cacataaagg atttcctcac 780

tttaacttaa atccaattgc aaaatttttg cttattgaat ttaatcatat gcttactaca 840

aataaacttt ctctttctca aggtatgtat agagccggta atttattagc taatgaggaa 900

aagcatgaac cagccaataa gttgctaaca ggaaggttgg tagaaacata tcttaatgca 960

cctcatcttt actctactgg gctgacggac aaatactatc atcacatgca ttatatgatt 1020

agtcccgatg gcaattatga attagcattt tcaaattatt gtggtcacaa taatataatt 1080

gaaggtttaa atgatgaaat agggaaagta atttctaatt tcaattttta tggttttaat 1140

caggaattat ttttagaacg ttcattttta aatcaaaaac ttcctgcatc agaatgtgaa 1200

actctattta aagttctttt ttctgaagat aaatgtatca gtacattttg tttagttttt 1260

actgtatccc tggaggaata taataaaaat gaattcgctt cggtaaatga ttatattatc 1320

tcgctggtta accaagcatg tgctggtatt gatgaagaaa tcctcaagag tctttccttt 1380

ggcttaaaat taaatttatt gatcatgcca agtaataaaa ttaatgaatt atcgctggca 1440

attgttaagg agttaattgg tgatgattag 1470

<210> 31

<211> 1488

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Braenderup

<400> 31

atgaaagaaa tagtaaaaca agatggcttt aatgaatctg aaaaatattt agcagattta 60

tgcagcaaga ctttcttaag cttatggagt taccctaatg tttatactga cgagggtaaa 120

aaaagtgata atagtgatgg gaaagaatta tgtgatttat tagttgtatt caatcagcat 180

gtcattatat tttctgataa agatattggt tttaaagata ctgggaacat cgaagttgat 240

tgggggagat gggttaaacg ggcagttttg aagtctgcga accaattgta cggagcagaa 300

aactggatca gggaaagatc aaacagaata tatctcgacc ctaaatgcaa gcacaaattc 360

ccactaaact tccctagcac ggaagttatt aaaatacata gaatcgctgt agctaagaat 420

gcaaccaagc gattttcctc gatagttcaa ggttcaggaa gcctgataat aaatccatta 480

ataaccggag atgaacacct aaaaaatcca tttatgattg gtatacctgt accaaacaaa 540

ccatacattc atatttttga tgatgtcgcg ttagatgtta tattaaatga actagataca 600

atatcagact ttattgatta cttagaaaaa aaagaagaat tcataacttc tgggaaatta 660

atctccgctg ctggagaaga agatttactt ggtcattact taatgagtgc aaaaaaagac 720

ctcgcccctg gattttatat tgaacatgat cacaaggcag taattttaga ggggcaatat 780

gagtctttaa taaaactacc gcaatatcac ctaggtaaag catacgatag aatatcttat 840

ttctgggatg acttcattga gcatttttcc agacatgcat taggagggac tttactatat 900

gagaacaaac atccattatc agatgcaact ttaggcctac aagtaatggc atcagagaag 960

agagtagccc gtcgagtttt atcaagctcg attttagaaa aaataacaaa aacgccacct 1020

caaaaaaaag ctgttcgtgt catggtttcg ccaaccaatc ctaatcatgg atacgtttgg 1080

cttatattac ccattccacc tcaagctcaa tcatatgaag attataggca ttacagaaag 1140

aagtatcttt atatttattg cacatccgta aaattattat atccagattt aaatatcatc 1200

attggggtag ccactgaacc gcgtgatggt ggaggtggag aggatatgat ctatcttgat 1260

actaatggtt gggaagcgag tgattttgag caagcggagc aagatcgaaa aacttatggg 1320

gtactactac ctgaaaatgt tcagcaattc tctggtgttg agtatcaata tcccataaat 1380

gatgacaaga aattaaactc agaaaaaaaa tcacgaaccg ctataattgc taagaaaaaa 1440

aagaaaagtc aaaagaaagc tagaaaacta aatcgcaaac ggaaatag 1488

<210> 32

<211> 570

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Braenderup

<400> 32

atggatcaag taagagccta ttacacagaa aattttatca gagtgtatca agcatattca 60

gatgaaattg ccgattccgt cttaaaaaat aaaacttttg tttccccgcc gtttaacatg 120

gcgcgtatga cctggattaa accatcattt ctctggatga tgtatagatc tcactggggt 180

acgaaagatc ctggtcaaaa aagaatccta gctattgaca tagctcgcac tgactttgat 240

actattttcg aaaagtcggt aattaacaac catgacaaaa atcacaattt atcatcaaat 300

agctggaaag aagcagtgaa aaaaagtgat attatcattc aatgggatcc agaacgagat 360

atttatttaa acaaacttaa ttaccggaca attcaaatag gtctacgaaa tgaagccgtc 420

ataaattata ctaataaatg gataaaaaac atccacgatg ttactaaatt agcatcaaaa 480

atacattcac ttgtactatc aggtaattta gaagaagcaa tgttattatt gccaatagaa 540

tctgaatacc ccactaacca tcaaaggtaa 570

<210> 33

<211> 549

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Braenderup

<400> 33

atgatggata gtagacagaa aaaattagtt ctttcggtta ttaataataa accaatccac 60

gagggaaaag tgtctgatga ggattttctt gccgaatttc catccggttg tgacaatgtc 120

agtgagtttg taactaaatt attgattgaa tcctgtgttt ctatggatgc gcaatgtgtt 180

gaattatctc tatatgtagg attccacttt ggtttttcag gtgctgatga gctcatttta 240

gataagcttc tggtatgtga ttttcattac agacatgatg aaattgtacg agctttagtt 300

ctaataggag catccacaga tgagactgtc gatgctcttt ccaaatgcgc tttaactgaa 360

tttgattatc tatcagatga cagagatgac ggcatatata ctttgtcatg gaattgtata 420

tatgcgctgg ctaaaatagc aacaccttat gcgattaata aattgaaatg gttatctgaa 480

tgtgatatcc aggaaattaa agataaagca gttgaagtaa taaaaaaata taaaataaat 540

attatgtga 549

<210> 34

<211> 1098

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Braenderup

<400> 34

atggataaat acttcagaat acgaccacag tggagcttag tagaagcatt tgaagaaaca 60

aataaacact atcaaccagg gagcatggta acaggtgccg cacgtaacgt tcaaatagag 120

aattgggggg tcttaatcgg tagaactaga gcattagctg aaataaaata cgccattaat 180

tcatttggtt caaaaagtaa actatgcaag cacatacaaa tatcaacaaa atactttaat 240

atgcttgagg atttctttca agaattgcca gatgataaaa aacccggaaa aatatatcaa 300

ggaatgacta tatcaggata ttttctttta aagaaaattg gtggcggtgg caatgctgta 360

gtttgggaag caagggatcc aaaaggcaaa gtacgcgctt tgaaaatcct aaaaaaacct 420

aacaccactt cagtacatcg ctttaatgac gaaattttaa cactgaaaaa aattgaaagc 480

ttgaatgata acaaaattaa tgtaatcaat attacagaca attatcaacc agatgaaaag 540

gatgtttttc catggtatgc aatgccaaaa gcagtctcat tagacaaata cattgaaaag 600

cactcaccat ctccattgac tatattaaaa ggaatgctgg aaatatgcat aactattgaa 660

ctacttcaca aacaaaaaat atttcacagg gacatcaaac ctgacaacat tcttatttac 720

aaaaataaat ggcatctatg tgattttggc attgctactt tcccgaacaa acaaagaatt 780

acaaaagaag gtgagaaatt aggctccttg cactttcatg ccccagaaat gctaatgact 840

tcggagcaaa gttcgggaga gagtgcggac atttatagct ttgctaaaac actatgggta 900

cttttgagtg ggcacaaata tccgattgca ggagaattgc gtatggaccg aagtgaggct 960

ttgttatcaa cttattgtca aatgaaaaat attcattatc tagatttagc tatatctgaa 1020

tgcacacgct ttaacccaag tgaaaggcca aaaatgaaat cggtgaggca ccacattgaa 1080

aaggtattag cggagtaa 1098

<210> 35

<211> 792

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Virchow

<400> 35

atgttaaaaa cacacatgaa tgcaaccgag aatcatttgg tttctatctc acagattcct 60

gctaatgctg gacatacatt acatagaggt acaccgagag aagcgtttat taaagagttt 120

ctttccgggc acttaagctc taatgtggca attggttcag gggaaattat agattctaac 180

tctcaaccaa gagtacaaag aaatcagtat gatattgtca tctataaaaa caattatcca 240

aaattagatt ttggcggtgg agttaatggt tttttaattg agtcagtaat tgctacaata 300

gaagtaaaat cattattaga ccaatctgca attgaccagt cggttaaggc agctcacaac 360

gcgaaagttt taaacccaag cataaataaa agtttcagca ctggatgggt gccacctaaa 420

attataaatt atgttgtggc atatgatggg ccagcacaaa tgaatactgt gtataactgg 480

atcttaaata gtcatcaaac gaataggatc ccgttgccat catggaatca gcaaacgaaa 540

tatcaaacac caggtacagc acttgatggt gtggttttat taaataaagg atttataaag 600

cttgataata caccattatc gttaaactct tctcagcaat caggaactca tatagttgtt 660

gacagtaatg atggtaatct attaatgatg tttttggctt tacaggaagc gtgtgacaat 720

atccaaggcg cttggttgaa tgcaggacca tatgtaagaa atgtcggatt taacaatgta 780

agaataatat aa 792

<210> 36

<211> 1032

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Albany

<400> 36

atgcgatatg gagttattat tccggctctg cttttacttg caggtaccag ccaggtttat 60

gcaaacgatg gcgcatgtct cagttaccag aaagaagtca ccctcagcgg ctatgtgcag 120

gtcgtcgtta attttggccc tccaggttac ggtgaaaccc cggaagacca gaaaatagac 180

agacgggacg ttgaggttaa cctcttactg gatcagccag tctgtaccat cggcacggat 240

agcgctgaag cagagaaaga cgatatggaa atcgcactga cgtcgaacga tggaacgaat 300

aacagtctgc gggcatttgc aggtgagcac attaccgtca ccggggggct tcagcactcc 360

gatgttgctg aaggggcaac gctcgttctg acatctacac aggtgctggg gcaaaccact 420

gacagtgata caaaccgaca gactacgctg aacgacggcc aaaagcgtga gatgctgact 480

caatttaagc agtttcagca ggcattaaaa aatcaggaca tttcaacagt agagtcattt 540

ttcactttcc cattatcctg ggagacagag gtcccctggc aaaaaggcga tcttcaggac 600

cttcctgtag ccagccttaa agtagataaa gaaacgtttg aacaacattt ctctgatata 660

gcaaagtttc tcaatccact ggtaaatatc gattctgatt tacaaacact taccacaatg 720

gaatatcggg aaaacagcct tactgctgaa gcacaaaagc gcaagtatta ttcaacggga 780

gatgatgata gtgaccagta tttgtattat taccaggaag gcgatcagaa acattatgtt 840

aaaggcgtat gcgataacgt cgtcagtacc gccgaatttt atgatagcga attatcggta 900

acggtaggat cggctccgaa taaacaaatt ccggggggat ctgaatattg tgaacaccag 960

cgggcaatac ttgattttgt actcatcaat aacaggcttc atctgaaaga cggtatcggg 1020

ggcgctgatt ga 1032

<210> 37

<211> 1257

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Albany

<400> 37

atgagtactc tgagttatct agataagttg ctggatggcg ttgaggttga gtggttgact 60

gcctctgaga ttttcaacat taaaaatggt tacacgccat ctaaagctaa aaaagaattt 120

tgggaagatg gaaatatccc ttggtttagg cttgaggata tacgaactaa tggcagagag 180

cttaatgatt ctattttgta cgtaaatcaa gcgggagtta aaggtaatct ctttcctaaa 240

gattcaatat ttatgtcaac aacggcaaca ataggagagt ttgctttggt caaaatacca 300

cacctgacca atcaacaaat caccaacttt tcattaaaga acgagtttga agaaattgta 360

gatataaagt atttattcta tagattccac cactttgggg agtggtgcaa ggaaaatgct 420

aacaaaagtg gcggcttatc tattatagga attaaaaaat tatcatcgta taaatttcca 480

atcccctgcc cggacaaccc ggaaaaatct ctcgctatcc agtctgaaat cgtgcggatt 540

ctggatacat ttaccgccct aaccgctgag ctaaccgctg agcttagcac acgcaaaaag 600

cagtacaact actatcgcga ccagttgctg agttttgaag acggcgaggt tgaatggagg 660

acgttggggg aacttggggt gcttatcaga ggtaaacgtt ttgtgaaaac cgatataatt 720

cccaaaggcg taccgtgtat tcactacggt gagatgtata cccattacag catctgggcg 780

gataaagcaa aatcgtatat ttctactgaa ttagcttcca agttaagaaa agcaacatac 840

ggagatgttg ttttcgtctc tgcgggcgaa acaattgcgg atattggtcg tggaacagca 900

tggctaggcg atgaagatgt tgttattcac gacgcatgct ttttctataa aagctcatta 960

aatcccaagt atgtggcata cttctcaaga acaaatttct tccacgacca gatcaaaaaa 1020

tcaatctcct cagggaaaat atctgccatc aatgccaaag gcttggaaaa agtgattatt 1080

ccggttccgt caccagaagc acaagcccgc atcgttgcca tcttggacaa attcgacacc 1140

ctgactagct caattaccga aggtctgccc cgcgaaattg cgctgcgcca gaagcagtac 1200

gaacactacc gtgatttgct gttcagcttc ccgaaaccag aagtcgctat agactaa 1257

<210> 38

<211> 324

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Albany

<400> 38

atggaacagc acaaaactat cctacaagct ttggcgaatg gttcatttgg taactttata 60

aatgaatcat cagatatgga tatcaacatc tttgaagagt tactttcttc cgggatggtg 120

acggccattg atgcttgtac ctttgatgga aaagaatatc ttgatcctaa gataactttg 180

agagggcggg agtttctgaa tcaactgaca gctaagccga aagaatcggc atggaaagtc 240

tggttcaaaa cttggtggaa agtaattgtg gctgttactg ctgtcttaag ttccgttgcc 300

acaattgcgg gatatttcaa ataa 324

<210> 39

<211> 1701

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Hadar

<400> 39

atgaaggttt taatctcaca atatattaga acgctgaaag aaagaaatga acttgatctg 60

ctgctgccta atttgttgct atcgatggat attgttcctc tttttactac gcaaacaggc 120

acccggcaat atggagtcga tattgctgca atcggtaaag atcctgaaga tggtgtaaga 180

aagatttttc tctttgtgat caaacagaaa aatctgggca tggccgaatg ggattcagga 240

agaaattcta tcagacaaag tttaaacgaa atttttgatg tttacataaa aaataatatt 300

ttaccaaaac ataaaaaatt accaaagaag ataatactat ctaccagcgg agatatgaaa 360

gaagagctaa gtcaaagctg ggccggttac attgatgagc accagcccca cgagtttgat 420

ttctggggag cagctcaact agcaacacgt atagaaaaat atatgctaaa cgagcatata 480

ttcactgaca gtgaccgaac tgatttgagg aaatcgttat cattaatttg tgaaaatgat 540

tattcaagag aagatttcca ccgcttatta cttcgtacac tacaactcaa taataaagga 600

gaaaaagtaa aacaggtcaa aaaatctgaa cttgagaaat caatccgtac agcctatctt 660

gccacaaata tactagccta ttgggcaata caagatggta atgcaaaaca agccctctat 720

gtatcggagc gttgcctgct atgggtatgg caccgtattc accttgaaaa aagtccacaa 780

caatacttct ctgccattaa tattatatgg caaaactata ttaatatctc cgcagaatac 840

ttttccaaac ttcaacccta ttttcacgaa aaatatcttc tgtcgtcata ctctgccgat 900

agcgcattaa ttaatcttac tatatttgaa caaataggta tactctctac tatcgggcta 960

aataatctcc tcacgggtct acgatgtaat ggtgatgagc agacagccag atttaataat 1020

gcaactatca ttgccgagag tttatgcgca cttatcagca ataacccagc atcaggctca 1080

cctcgttttg atgaaaatgc aatagatatt acactggctt ttatttttct ttctttaaca 1140

ggggaaaagg atcgtgctgg agaatggctc gaaacattga tcgtcaggct ggactttgta 1200

cttaaaattg gacgaaatca ccctatatcg acagattcca ttgatgatct tatctgtctg 1260

gattgcaata atgatgacac gtatctcaga gaaaaaacaa caagtacatc atggataatt 1320

cctactctga tgggatgggc tgtcattctg gagaaagaaa aggaatataa tattttactg 1380

agaggaataa aagaattcta tccaaaaatc tgctcccagc tatggcatcc aacgaacgat 1440

ctttatcatc atctctactt tcatcaggcg caatacgtca caggcgaaac agaagcgcca 1500

ataacatttc cggacaatat gaataattac caggccagga tgaatgagtt gaaagaaaag 1560

gatagatata atattttcac ggaatcaagt gcaagaaagg ccgatttaac cattctggat 1620

tttatagcct gcaggcattt caggacacca gttccacctg ccctttggta taatatgcag 1680

aaaaaacaga atgacagtta a 1701

<210> 40

<211> 1020

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Hadar

<400> 40

atggcttctt atgcattctg gaataacaaa ggtggtactg gaaaaacaag cttagcattt 60

caagtgatta ctcgttttgc tgaacttcat cctgaacaac gaattttagc aattgacctc 120

tgcccacaag ctaatttatc agagttattg ctaggtggga tgaataatag tggtagtgac 180

aaattattaa ttcgccaagg attaactccc cgttgtagta ttggtgggta ttttcaactt 240

cgtttacctg caccatactc ccctccagca tttagctcta cagattatat aactcaccca 300

tccggataca attctgatat ccccaataat attgatttaa tatgtggaga tccattgcta 360

gaattacaag caaatgcagt aaacactctt gctaaccaaa acataccagg aactaacgca 420

tggattgctg ttattgattg gttaaaggat ctgttagatc agttgagaga tacttacgac 480

actatttttt tagactgcaa tcctagtttt tcattttata ctcaaatcgc cttggcaaat 540

gcagaatgta tcgtccttcc tgttatggcg gatgattcat cacgcagagc aatattaaac 600

gcaatctcgt tggtatatgg tttaaagctc ccctcagaga tatatacagc ccatatgttt 660

tctacaaagt taaaggacgc cggacgtaac ttacctcagg tgcaccaaat tgtaaaaaac 720

cgcctcacac aatatatggg ggatgcctca gcttatgctg ctgtactcga tgcaatcaaa 780

tgtgatgtcg aagaactgtt gagaaatcat cctcatttat ttaccttttc aaatgtagat 840

gacggttttt caagcattcg tgacttccaa accacaggag tcatagctca tgctaaaggt 900

cagccattct ctaaggtcag ggctggtaag caaagcatta atggacatcg agttcaagtt 960

aaagctgatt atctcgaaaa ttgtagggat gcaatcaatt ctctagttgc aaaattctga 1020

<210> 41

<211> 156

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Hadar

<400> 41

atgcctgtga gttttaactc tatgctttat accagaaaaa tgagtctggc cagccttatc 60

aaatcaatat ctgtgatttt taccgtaagc atggatatgt tttgcgtact gtggaagagg 120

agtgatacca gttttaatga actggctgag acatag 156

<210> 42

<211> 699

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Hadar

<400> 42

atgttgtatc gagttgatga aatactggga tatttaaatc gttgtgagcg taccacatca 60

aatcagtcag atccgctaga gattctggct aagaggctct ccttacgcgg gctgatcgtg 120

agctttattt tgttgttgtt aatgctactt ccattcggga tttatgccca ttttcctgag 180

ggcgtgctta ttcgggtgag ccaaattttc ttcatattgc tgatgttgag ttgcatattc 240

acgttattgg ttgagccagc attgatgcta ttaggtttat ttaagtggaa aacgatgacg 300

ttaacccgat ttctgaaaga agtccgagag gatgaagggc atgtggcaac attagaacgc 360

tatgcagaaa aagagcttca gtatgcagaa tatcaattag tcaagaaaat cacggcgaat 420

gaaaatagaa tcaaattttt ctttggcgag aaaacagcaa tatttgcatt gctggcgttt 480

tcggttccgt ttatgaagga tctttttgga agggaactta atctgtcagc ttttcgttgg 540

gaggatggtt tttctggctc cgttgacatt ttattaggat ttgtttgggc attgattttt 600

ggcatgtctc tgggggctgt tgcattaaag ttagtgactg aacgatataa atatcagtta 660

tctttactaa aacagacact atggattaaa aaaatttaa 699

<210> 43

<211> 213

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 43

atgaacaaaa acactgctaa tagtttaatg atggcattac ttaaattaaa tgaatcaacc 60

aacgatgttt tttttgaaat agaaaaaata gatgatgata aaattaaacg cttgttcaga 120

cggtcaattg caaatgtcat tgggatgatt tatttagaac tcatgtcacc aataattgaa 180

gaatatccgg acttagatcc ggataaaaaa taa 213

<210> 44

<211> 438

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 44

atgaaaatcg ctatcgtagt tgcttcaaat ggactggttg caaaagagct gctgcatgtt 60

gctgaagata ctgtggggca tgtgggtaac atatctgcaa tagattttca caatggcgaa 120

agcctggatg aacttttagg gcgttataaa gcagctatcc tcagactcaa tgcacaacat 180

ggaattctgt ttctaatcgc aggggaaaat agttgtcatc aatttattgc cagtcagttt 240

cttcgtgaat acaacaacag ccagattatc atcggcgtta atctgactat gttagtttca 300

ttaatgcttt acgaaaataa tgaaactgat attcagcttc tgacactcaa ggctcagcag 360

tacggtaaaa atgcaattca tgctgtgaat gtaaaaacat atgaaggaga taacgaaatt 420

tttgatgata caatatag 438

<210> 45

<211> 648

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 45

atgaagaaaa ttgaatgtaa agcagtttta ttcgatcttg atggtacgct ggttgattca 60

ggctcatgca ttgagcgctt atggacgtac tgggcagaaa aaaatcatat cgatgttaac 120

tatgttcttt cggttattca tggcagaacg gtaagcgaaa cactgaaact tatctcaccg 180

tatttttata atcagaaatg cattgatgaa attgaatttc tggcaatgga ggcgttgagc 240

catgtcagcc ccattcctgg cgttattgat gtactgaaaa aaataccgat gaataaggtt 300

gctattgtga cgtctggtgt aaaaaccgta tccatgcgta gccttatggg ggcaggaata 360

ccagtaccga atataatgat caccgcagag gatgtatccc gtggcaaacc ggatcctgag 420

ccatacctta aggcagccag ccgattaggg gttaatccag ataactgcct tgtttttgag 480

gatgctgact cggggataag atcagctatt gcagcgggaa tgtccgttat ttcgatagga 540

acaacaggtc attcgttttc tgataatatt tcaactcatc ttgatgacta taaaaatatt 600

agcattgcta ttaaagatga tcttatcaca attttcgtcc ctcattaa 648

<210> 46

<211> 759

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 46

atggcaaggc ccgttgatat agaacgtcga aataaaatta ttaatattgt gctcgctaat 60

ggacgggcaa caataagtga acttgcgaaa atgtttaatg tttcaacaga gacgatccgt 120

aaggatgtcg cagatctgag cgagaaaaaa atactccaga agggacatgg aattgttctt 180

cctgccagta gttatactga aaatccactt ccttataaaa tatcgaaaaa tgcggacgcg 240

aaatcaaaga tcgcaaatta cgccgcttcc ctgataacgg gtaaaaagac aatttttatt 300

gatactggaa ctactgtgct tcaattggca aatgttctta atatgtttga ggggctgact 360

atcatcacga attctatgat ggctgctaat gctctgtcag acagtaaaaa tgagcttctg 420

gttacaggcg gagagttacg ccccaggagt tactcctatg ttggtgcatg gacgctgcga 480

gccttacgcc agagtaaaat tgatattgca tttatgggat gtgatggttt tcatcgggac 540

gggccaactg tgggttcgta cagagaactt gaagcgaaag aaatcgttct tgagaatgct 600

gatgaatcta ttttactggc cgatacgtcc aaaatttcta tgcaagggct gtattgctac 660

tgttcgttca gtgatctgga tagagttatt tttgaacgag atttaactgt ttcagaaaga 720

gaatatatat ctgctcccgt taaagcaaac ccatcctga 759

<210> 47

<211> 873

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 47

atgataaaca gtgagccgca atttcagacg caggaagaga accgtaaagc gctgggtgct 60

ttcctgcgta accgccgtga aagtcttgaa ccgcagcatc tggggctgcc tccggccgga 120

cgccgacgca cggccgggtt gcgacgagaa gaagtggcga tgctggcgga cattggtgtc 180

acctggtata catggctgga gcagggcaga gatatcaggc catcagccag aaccatcaat 240

gctattgctg acgtgttgca gtgttcgcct gccgaaaccc gtcatctttt tttattatcc 300

gggctggtgc cggaagagac agcggaggca aaggcctgtg aatcggtcag ccctgaggct 360

cgttgtctgc tggatgcact gatgccgcag ccagcctgtc tgcagatgcc aaattttgac 420

ctggtcggtt ataaccgcag cttttgccat ttagtgggcg tggatctgga tttgcttgcc 480

ccggaggatc gtaactgtat ttatctctgg ctgaccagta cgacatggcg tggtcgccac 540

gtatgcacag aggatattgt attgcagaat tttgtggcgt atttccgggc cgggatggtg 600

gagcatcggg gtgagtcacg ctgggaggct ctgcttaccc gcttttttgc cgcttcgccg 660

gagtttgaga tgctatggca ccagctccac gacgttggca cgattgagaa ccggcggaaa 720

acgtttgtcc atccgcggct ggggcaattt agtctgcaac aaatgtactg gtattccgcg 780

ccacgcaatg gggcccgact gctggtttat ttgccggtag atgaggcagg ggaacgtgcg 840

cttgccagtc tggcccagga aatagtgcta taa 873

<210> 48

<211> 1296

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 48

ctgaacgcca gcgtcacgca acttgaactt attgtggcac tgtacagtgt tgcgctggcc 60

atcttcctgg cacctagcag ccggctgggc gacaacgcag gtcgtcgtcg gttgtttctt 120

atcggggtgg ccatatttgg cggcgcatca ctggcatgcg gactggcaca aaccgttaac 180

cagttgctga ttgcccgggt cgtacaggga gcaggcgcgg cactgattat tccgcaaatc 240

cttgccacag tgcacatcac tctggaaggt gcggcgcatg tgcgcgccat cagcctggtt 300

ggcggcattg gtggcatcgc ttttatcatc gggcagatgg gtggcggctg gctggtgtca 360

gccgatatcg caggccttgg ctggcgcaac gcgtttttta tcaacatccc cgtgtgcctg 420

attgtgctgc tattcggccg ccgctatatc ccggaaacac gcagtgatac accctcacgg 480

attgactggc agggcgctgg attactggct ctggcactgg gttgcctgct gttttccatc 540

tcgctggggc cagagctcca ctggccgtgg gtaatgcaac taatgctgct ggccgtctta 600

ccgctgcttt atggcatgta ccgcaatgcc ctacgccagc agcttcagga aagacaacct 660

ctgctgccac cgcgactgct gcaacttccg ggggtgagtt tcagtattct ggccggactg 720

ttgtttttca gcgcctggtc aggattcctg ttttgcatgg cgctgatgat gcaaagcggc 780

ctcggtatgg tgccacagca ggctggcgac agctttattg cctcaggcgt ggcctatttt 840

atcgccgcgc tgtatgtccc caggctcaca acccgttatc aacaacggac aatcttgctg 900

gcagggttga gtattcaaat cacgggtctg ctcatactta tcattatgtt acatattctg 960

ggcagtcata cgggaatgct ggccctgtcg attgccacat cgactatctg caccggccag 1020

gcgtttatcg taaacagctt ttatcgtatc ggtatacgca acattccggc aggtgacgca 1080

ggcgcaggga gcgccgttct cagcacgata cttcaggcca gtatggggat tgggccggta 1140

ttgcccggcg gcgtattcct gtatttttta gcaggcaacc acggtaacta tccgcaggcc 1200

atgacaggct ttttaacagt ggaaattatc atgatgctga cgcttatggt ggtaacacta 1260

ttttctcgcc gtacagtcgt cgcggttcct ggttaa 1296

<210> 49

<211> 243

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 49

atgatgggat atgctcgcca gcacacgcct cagcgctcag ctccgttgaa cggatggcat 60

atatttgaaa aggtcgttca gaagatcaag atctttttct atatcggaaa gtttgccgat 120

ctgatcatta ttgatcggga accattcgtc acaccagcgg aaaaatttgg ggggattacg 180

gtgctgttga cgattgcggg cggtagtgtc gtctggcagg acgaaaaaca cctgaaacgg 240

taa 243

<210> 50

<211> 2040

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 50

atgttcattg gaaaagtgtt agcgttaacc gcgtccggcg ctttttttgt tacgccggtt 60

agtctgttaa ttgatggcaa cttacgagac ctcccagagg cattgggaaa agatctttac 120

cctcatggcg gtgaagccat tggttttgag aaccatttca gcaaaaaatt tgttcggggt 180

gaaatggcaa tatggaaagc ccgatatcag ccgtctgata aatctgcgca gtatgtcatt 240

actgactacc tgtcgcgcgt ttatcctgta gtcgcgttac cccatgcctc cgatgagcct 300

gatgctgtca gggagtggtt actcaccaac taccagccgc aaaacgatac gccggtcatt 360

tttcagctaa gtgatggcgt atccctgaga ttaccgggtg acttgccgga tcctagaaaa 420

tatgattttg atatgccgct ggagagttat cgtcaggttc ctcagacact acttgactct 480

catgccctca cggtgatcac tgaactccct aaggtaagtg aaaaatatga ttgcgcggaa 540

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caacggataa aaaagacctt cgaagccgca tctcaagcgg gaatggaaac gctggcccag 1020

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aatgctctga ctcgcaagca tcaactgata tcggctatcg aaaaagaggc actggcgacg 1200

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<210> 51

<211> 726

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 51

atgctgacca gtagtgattt tgatatgcat gggcgggccg acctcatata tcaggagcga 60

cctgatcggt taaacgtagt tgatttgaaa accggaaagg taacagacga acaaaaccag 120

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aatacagacc tgattgaacg ggtcactatg attatcaaaa atattaatcg acttttgcca 300

cggaatatcc cacttccagt atatgagctg gcttgtcctg gcacgtactg ctcccattgt 360

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ctttctgatc atcagcatgg cggaatcgat atcagcggga aattacttga agtggaaagt 480

gacgatcatc ttcttacgct gaagatcctg ctacctgata gttcggttgt taaggtcttt 540

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aattaa 726

<210> 52

<211> 1671

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 52

atggacaatg gttacgatga ggattacata tctggtctga ctgatcgtgt tttcttaatc 60

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<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden

<400> 53

atgttaaata tcagaccctt tacgtggttt tctagaacgc agcaacgcta taatgtaaaa 60

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taa 783

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar London

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar London

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar London

<400> 56

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ttaacaccat tgcttcctgg agggaaagag tcttgtatgg aggatttatt tgatagcacg 1560

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar London

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gtgaacattg ttaaagaaaa aattgaagaa ctattggctg gttcatttac tcatgaatta 60

attgaggtga ctctcacaca acaaactaat gaaaatccaa aaatgtttac aggttctgga 120

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar London

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Meleagridis

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Meleagridis

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<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Meleagridis

<400> 61

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<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Meleagridis

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ggcttcggga aaactgtcgt cattgacact gaatattcgg gccgtcaggt gctgcgtacc 240

tctcaggcaa cctgtgatta cgccagcact aagttaggat atgcgacccc taattcacct 300

attggtcggt tatgccgcca ggcccaaatt gggctgaaat ctgaaagcaa tcaatggggg 360

cggtacacta ttgtcgaaat ccgcaatttt gctcgtttta gcggtattga agcggcacag 420

aacatcaaga attttcaggt aatggaatca aattcaattg cgggtaaagg taagcaaggt 480

cttcagactg taattaataa tctgaaactc tctttacagc gatggtatcg acctaaacat 540

cagcaagccg ttgtgacgga tgtggcattg tcaccactct tcgaaaacac tcctgctgac 600

agtatcgagc aggagtcgga aaactggttg gatttggcga ctggacaaga ttatgagttg 660

ttcctggatg atgccgaaga gcaattaaat cactacgata tttatggtcg cagcgatgat 720

gaccgtgaca attatattgg gctgagcaac tatttctttc ttaatccgac agaggaacag 780

ctcagcgtca tgactggtgc gacgaccatg ggacccatgc tagttgaagg ggtggcagga 840

tcaggtaaaa cctgtgtcgc acttgggcgt gcgaaaacgc tatgcgactt agcccgtacc 900

cccgatgaag aacggtttaa tgctgacttt ttagatgaaa gcagtgtggg atttgtacga 960

acgggagagc tggtaaacta tctgaaggct tcctgccagt cgctgagcat cgataaacta 1020

ccaatagaag agtaccgttc attggtttat cggcttaaca atgttcgcca gcttgagcaa 1080

cgccccacgt cgaccagcgc ggaagggcag aaagtgactc gcgctaagtt tacgaatgtc 1140

tcagaaaatc tttcctatga tttctctgct gaaacaacca tgaactggct ttatgcgtca 1200

gcgcaagcga tcggcgctct ccttcagctt gaactgcaaa agcaactggc ctcactaagc 1260

atccccgcgg agctactcaa agcgcaattc ctggcagaaa ctaaagctgg aaatgcctta 1320

ctggagctcg tgaaacggag cctggcgtca gattatgctt ctcttttcaa tcagctctcc 1380

gggcattctg gcgacgcttt tgcactggat aaccttctga gccggttggt caatgcacat 1440

gagcggatcg aacgtgattt gtttgataag aatacgctct gggtgcatcc gtctgaggaa 1500

aaatggctga ttgtaaaaga ggctaaagcg gcagtaacaa ccctgcgtga aatgagcgtg 1560

gtgttcgtcg ttgtcgagcg gatccgtgat gagaacgacc gacctcgccg gaaagcgacg 1620

gagatattga ttgaaacata caccgatttg ctcaacattt ttgcgcaaaa cggcagcgtg 1680

cgaagcgaag atggtctgag cgtttattcc gctgaagatg cagagattat ttgggaatgt 1740

cgcaccgatc ttaaactggt gtgtgatatt ccatcggtgg tgaatagcat caaaattacg 1800

tgggcgaaag attttgacgc ggtcaacatc catcttatca accaaaagct gtttggtatt 1860

aaccagaaac gcattttttc gttgtctgag ccgaacccct ttgtacgcaa aattgaagtg 1920

ggtgaagaga aaacgcaaac ctctctcgca gcacggcttc gctctcagat gcaacggatt 1980

tatagctcgt ggcagtatgc cgatctctat cgggatgcgt tgctctcctt cccgcaatac 2040

tggcaggact acccgcatgt gagtcaggcg tcagaacgtc taaaagcgaa attactggca 2100

gatcatgata aagatattct gttagcgctt gctcaaatca taacacgcgg tgcgcaatcc 2160

agtcggcttg ctccgcgctt gcaggagcag ccttggtatc cttctgtttt tattgatgaa 2220

gttcaggatt ttacagaagt gcaggttttc ctgatggctc aacaggccga tccgaaatat 2280

cacgcagtaa cgctagtggg ggatatgcat cagcagctag gccgtgggaa tgttcacgat 2340

cttgatgcct gtttccctta ccattcattg acaaaattcc tgctaaaaga aaataaaaga 2400

caggaacgag agccacagct ggcggcgacg tcgatgctct ttcgctcgtt agttcagaac 2460

gatagtcgct tgcagcagtc ggcagagcag ctcactctct ggcgagaaca agcgcaaaac 2520

gggactagta aaaggttcat caaccagcct ttcgataaca ttgatgctga attggtcgat 2580

ctcattagtg aacaacctca tgggcggact attgctgtta tctgtccaga cctggctcta 2640

gcccgggaac tggaggtgcg tgtacgcaat gatttgattc agaagtcttc aaggactccg 2700

cgcgttgcag aacatatcga tctcgcccaa aagtatcagg ttcatttctc ctgtgctgag 2760

aatgtcaaag gcctggagtt tgacaccatg atttatgttg ggcttgagaa aatagactgg 2820

gctaatccac aagagctcaa caaagtatat gtaacgatat caaggccaag gaagcggctg 2880

attatgtttg gtaatcaata tgatttaccc gacactgtcg caacatgttt acttacttat 2940

tctgaacgca ggagcgcctg a 2961

<210> 63

<211> 822

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Meleagridis

<400> 63

gtgaagttta ttgagacaga gctatttgga accgtggttg ttccaaatga tatctcacaa 60

attttagaga ttatagatga acagcctgat aattcgattt ctcatggcat tttcatgtgg 120

agaggtcaag gtgatattgg ctgggctatt cacagtgctg cctacagacg tttagcaaat 180

tccattgcgg gtagattacc agatgagcag gatatgcgcg actatgagcg aactcttatt 240

agtgaagcgc ggcatcaggg gtatggtttc ggaggtggtc gcaaactgag cgacttcgag 300

ttgcttgcaa agctccaaca ccatggagca gcaacaagac taattgatgt atccagaaat 360

atgcttgtcg ccttgtggtt tgcatgtaca tctcggccag aaagtacagg gctgttgttt 420

ggtatttccg ctgcggtagt tctcggcctc gaaggtagtt atggctatga caacgggaat 480

tacaatgaaa aatttccgca tagtgaagct gaaggtgaac aacatggtga tttacccatt 540

gtctggcaac ctcccgttgt tactaaaaga atagctgctc aaagtgctca gttcgtttat 600

agcgatgttt cgcatggacg tatggggagt ttggttcttg acagtgcggt ttgccacaat 660

ggggtactgg cactggcgat cacgtcagat atgaagaaaa aatttttgaa agttctggaa 720

cgctcttttg atatacgttc aataactctt tttcctgatt ttgacggatt ttgccgcgct 780

aactctgagg gcttcagtct cttaagtaat aaccgttggt ag 822

<210> 64

<211> 792

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Senftenberg

<400> 64

atgaaagagt ataacatttt ttatattcca ttctggtatt cacaacaaac tagatttagg 60

gcagttacaa gatttttttc atggattata atttatctaa ttcctgttct tctatctttt 120

atgtttctat ctccgatagt taattttatt tatttattga aatcatttct tggtatcctt 180

ttagtgtata atctttatga gattgggtat atatataatg atactgaaac gataaaaaat 240

gaagtatcgc caacattgcg gcttggatat tctcagttac aattttatga aagaaacaag 300

aaaactattt atttttttcg ttttactatc gcaatatctt taacaattat tatttttttt 360

tcatatgaga attctttgac ttttttgtta gcaagttggt tcataatacc tacatatgta 420

gtttataatt cagtcaggaa tagattaaat ataccactac atttcgtatt agtgacattg 480

cgatattgtt caccagtgtt attgttttct ggggttaata atgttagcgt tttttttata 540

atgattttat tatttcctct tatcaatacc tttgaaagat gtgccgagaa tagattcggg 600

ctaagctttt ttaagacatt tttattgact aataaaaaaa acggccgcta tatttattac 660

atgattctct tgattggtgg tattttttgt tattattatt ttaagactta tgtatgcttt 720

gttttttcat gttatgcatt ctactatatg atgtttaggt ttttatatac gcaggtgaat 780

attaatgtgt ga 792

<210> 65

<211> 1662

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 65

gtgaaacatc aaatatcaaa taaatacatt tatttttctg tatgcgtaat atttttctct 60

gtgatttacg tgttgaatta ttacacacca cttcagtcag atgattatgg gtatgcaatt 120

cttggatata atttagaagc gcatttacat cattacctta catggagtgg aagaattgtt 180

gcagatttta taagcccaac attgctactg ataaataaca agttccttat agcagcaatt 240

caaacacttg gtgtattgtt ggttctactt ttaatttcaa aatttgataa taaagcaaaa 300

agattatata tattatcagt aatttcaatt gtgtttttcc tttcacaccc aagctttgga 360

caatcaaact tatggattgt tggtagtgca aactatttat ggacttcagt tttatatgtt 420

tttgtagcta aagaggtaat tggttatgtg caaaataaaa aaattaatcc tattgcctac 480

ccagtatcat tattagcagg atgtacaaat gagaatgcaa gtctaacatt agtaggaatt 540

atcatattaa gtgttttata tttattaata aagacaaaaa aaattgactt taagctttta 600

tcgattttat ttttaacaat aataggcgcg atttttttat tggcaacacc aggcaatgag 660

tcacgaatga tggatccatc atttgcacag tggcgttcac tttctttaat agaaaaaatt 720

gacttgcaca ttttccatag agtgccagat gtctttaaat catctaaact agcttatatt 780

atagctatag cgttaattgt attatgtctg cgtattgaaa aatcaaaacc aatcacaaaa 840

gatggcgggc ctactgactt attaatatcc gcggtgcttt tatttgcctc aataggttgt 900

tctttggtca tggtgttttc tccagcgttt cctgataggg caaagacgcc atcatttata 960

ttctgcatta tgtccattgc atattcatta aacttcttaa ggtatgaaat tttaaataat 1020

tacataatta aaaccttgta ctttataata tctataactt ttatagctga gtcaatttcg 1080

gttatatctt catatcactc aattaattta caaaactcga tgcgtattaa actgatagca 1140

aaaagcaata atgaaaaaga aacattaata cctgagtttt atttcaaacc aatgcccagt 1200

tccacttata aatttgacac ttggacaaat tttgatgcca tgtcaaaata ttacaacaaa 1260

aaaaatattg ttgcatacgg tacaatattt gattattcag tcatagatga taataattat 1320

aaaatccatg atagtagcga catgcaaaca aaaaatggtt tgaagggtat ttatatatat 1380

tcagaaaaat atttattgaa tactgtgttt ttatttgaat taacgcatca agaaaggcta 1440

tccgttcaac ctaatcagcg tttctttttc catgttacag acataactgg taattatcac 1500

aatttcgact ttgacccaaa ctatacttac gtaaatgata gagtattcct ttacgcaaaa 1560

ttagataata taccattatg gtatattaaa agcgtatcat ttgggtcatt tgactcaaca 1620

tcaccagcta aaagatattc tcaattacac tttacacttt aa 1662

<210> 66

<211> 129

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 66

atgtatcacg tcagtagtct tttttattat aaaacctaca actattcgaa acatattatt 60

tataagcgtc ctgcaatcac ctcatacgca tttaatataa cgaaggtgga agttattacc 120

ttaccataa 129

<210> 67

<211> 465

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 67

atgtttatac atagactaag cgatgtccaa tcacaatcta taggtgaagg taccaatgta 60

tggcaatttg ttgttattct taaaaatgcc aaaattggta gaaattgcaa tatatgtacg 120

aactgcttta tagaaaatga tgttatcatt ggagattctg tgactataaa gtctggagtt 180

tatatttggg atggagtaag gatacataat aatgtcttca ttggtccttg tgttgccttt 240

acaaatgata aatatccacg ttccaagaat catgataccc aattttttga aactgtaatt 300

ggggaaaatt cttcgattgg tgctaattcg actattcttc ccggtattaa aattggtcgt 360

aactgtatga ttggggctgg ggctgttgtg acaaaagatg tgcctgataa tgctctggtt 420

gtaggtaatc ccgcaaacat cgtgaagttt ttggaggttc aatga 465

<210> 68

<211> 1104

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 68

atgatccctt ttctagacct acagaagtcc aatgctcgtt ataaggatga attaatcaaa 60

gccgcaacca gagttattga aagtggatgg tacatttcag gttcggaatt gaatgctttt 120

gaggaaaatt ttgcaaaata ctgtaacgtg aaacatgcca taggtgtggc gaatggactt 180

gatgccttaa cgttaactct caaggcatgg caggagctag gtaaaataaa acagaatgat 240

gaagtacttg ttcctgccaa tacatatatt gcttcaattc tcgcaataag tgaggcaggt 300

ttaaggccag tactaattga accaaacgag tttagttata atatatcgat tgacaatatc 360

aaatctaaag ttacagtcaa tacgcgcgtt atacttcccg tgcatctcta tggattaatt 420

tcaccaatgg atgaaattat gcactttgca aaagagcata atcttttagt attggaggat 480

agtgcacaag cacatggtgc ttccattaat ggaaaaaaag cgggaagttg gggggatgcc 540

gctggattta gtttttatcc aggtaaaaac cttggtgcat taggtgacgc cggagcgatc 600

actactaatg atactaaatt agccgacgtt gtaagttact tgagaaatta tggttcaaaa 660

acaaaatata agcatgagta taaaggtgta aatagtagac tagacgaaat tcaggccgca 720

tttttgaatg taaaattaac atatcttgat aacgatattt ttataagacg cagtatagca 780

aatcgatatt taagcgagat aaataatgat tcaataactc ttccagcaat ttcctgcgaa 840

gagaatcatg tgtggcatct ttttgttgtt agagtaaaaa atagagacat atttcaacgc 900

tatctggaag acaatgatat ccaaaccgta attcattatc caacaccacc acatcaacaa 960

caggcttata acgaacttca tgatttaagt ctccctctta gtgaagaact acatcatgag 1020

gtggtttcta taccaatgga tcccactctt acagaagagc aagttagtta tgtaattgat 1080

actttaaata aatttgattg ttaa 1104

<210> 69

<211> 876

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 69

atgtatcaaa gtgataaggt ttctataatt ataatatctt ataatcatgg tcaatttata 60

aaagatgcga ttgaaagtgt attgtgccaa acatataaaa atattgaact tgttattgta 120

gataacaact cttcggataa tacatcagac atacttaaaa actatcaaaa aattgataat 180

gtaaaattaa tttttctgaa aaataacgct ggtattacag gtggaattaa tgaaggacta 240

aaaaatatta gtggggagtt tgtaagtttc tttgctagtg atgacattat gatctcaaat 300

agaattgaac ttcaggttaa tgccttaaaa aatgcccctg aagctgctgc ttgttttggt 360

aatatgatca gaattaacga cgatggctca attaataaag gagggctatt acctaaggta 420

ggctttaaat ggtggactct caatgatcta attacagata gaatttgttt gtactctcca 480

actcaactgt accgagcaag tctttttatt aataacgcag ttatttttcc aaaagaaatt 540

aggattgaag atatttggct ttattttaaa cttctaaatg caggttacaa atttatcaca 600

ataccttacc ttctgacaat gtatcgtatt catagtaata atacccatac gcattataag 660

atgatgatgt tagaaaaaat aaagatctta aacgattata aagataaaga attttatagt 720

agagctcttc gattcatcta tctggaacat ttttcaaatt ttggctcaac ttcgaagaaa 780

gatgctctgg gactccttcc aaaagttatg ctcagcatta aatctaagta tttatatatt 840

ggattagcta gacttttttt tgattggaga cagtaa 876

<210> 70

<211> 684

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 70

atgtttaagc atgtatacgt tgatctatgt gatactctaa ttaaaggtaa cacaacgttc 60

atgttcttgg attctttctt tactcataac tataatcgct attattggtt ttatagaaaa 120

attagctcgt catttatcat gagagccata tttaagttgt tatttacagc taaaatcgat 180

cttaatagaa ggattgcgat tcgcttttta aacggataca gtagaaattc acttaagatt 240

catgtgcaat ggatgcttgc taataatctt tttataaaga ataaagaact cgctgatgtc 300

atccaattgg ctaagaataa gcaaatacct gtgacaatta tttccgcttc tttagatttt 360

attgttgagg taattgcttc acatttatcc cttaattatt tttgtagtca actggtgtat 420

aaaaatgagt tgtgtcaagg ggtgattatt gatgatctcc tttttagtaa aaataaaata 480

ttcgatgaga ttgagaaaga tgcagtttcc tactgtttta ttagtgataa cattcaggat 540

gtcgaaatat taaaattatg tagccatggg tatggtgtcc ctactttgaa aaatgaaaaa 600

gtattcataa aaaatggtat tgaatttatc aattatgata aacttattaa catgataaaa 660

atggatgatt atgaaagagt ataa 684

<210> 71

<211> 825

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 71

atgtgtgata gtgcaaaatc gtttagcgta ttgatgtctt tatactataa agaaagtcca 60

gtttatcttg aagcgtgttt cgcaagtctt gcaaatcaat cgttgttgcc tgccgagatt 120

atatgcgttt ttgatggacc acttagtgct gaactggaag gtgtggtttc aaaatggagt 180

ggcagcctga atattaatat agtaagaatt ccggttaatg ttggtttagg tagcgctctc 240

aacaaaggtc ttgcacagtg ttcatttaat atcgttgcta gaatggatac tgatgatatt 300

tgccataaag accgtttttt aaaacaaata tcttatcttc aacaacatcc agaagttggg 360

ttgttgagtt ctactattgg tgaatttaaa aactcaatta acgacgttta tgcttttcgt 420

aaattaccat taacacatca agaaattttg cgatttgtta aaaaaagaaa tgcgttcaac 480

catatggctg ttgtatttaa aaaagatttg gttatcagtg ctggtggtta ccagcatgag 540

tatttatatg aagactatgc gctttggatg cgcatgatac aaaatggtgt tatcacagct 600

aatttatctg atgtattagt atttgctaga actggaaatg gaatgtctgc cagacgtgca 660

ggtttgaaat atgcaaagtc agaattttca gtacaagttg atttttacaa aaaaggttat 720

ttgactttcc ctgagttaat aaaaaatctt ttaattcgac ttccttttcg acttttacct 780

gtcccattat tgtcaatatt atattctaca atactacgta gatag 825

<210> 72

<211> 867

<212> DNA

<213> Salmonella enterica subsp. enterica serovar Pomona

<400> 72

atgcatttag atatgaattt tattgtaagg aaaaatctgg acggagaata cgtcataatt 60

catgctaatc agcttaaaga gggtgttgag tatgcggtaa aaatgggtgt gactcaagtt 120

cagataagag gcgtgcttgg gagtgatgat ataggtatga caattgattt taggcaattt 180

gagaaactct ctaaaaaatt aaaggtcatt tcttttacag ataaaataga tagtattatt 240

aattttgatt ttatttattc tttgagccga cttgaaaaga ttttttttca aaaaaaacaa 300

tctttcacta tggatgtttc attgtttcct gcgctgaaat atttaggctt cgagtattgg 360

aagggggtga gtaatattaa cttatctcgt agcctagaaa gtttagttgt ttataaattt 420

aacgagccta atcttaaaga ttttttgggc ttgagtaaat taaatgcact tcatatttat 480

gattcgaaaa tatcagattt atctgatatt gaatccctct ctattaaaga attatatttg 540

gttaaaaata attgcctgaa ggaagtgggg gttattagta gaatgaattc actgaggaaa 600

ttatatatag aaaaatgcag gggcgttact gatttttctt ttttaatagg aaacaaaact 660

attgaagatt tgtttttatc tgatgtggat tctttttgtt ttattccaag tatgagaaac 720

ttgaactctc ttagattttg gagtttagag gacggtgatt tgagtttttt attacagtcc 780

cctacattaa agatagttga ctttcatcct caaaggaaaa attacactca taaaaaagaa 840

gaaataaata ttttaattaa tacataa 867

<210> 73

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 73

gtctcggctt cccttttgct 20

<210> 74

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 74

tcagacttcc gcaataccat 20

<210> 75

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 75

ggacaattta tgctcacagt 20

<210> 76

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 76

ctaacggcta atatcgaacc 20

<210> 77

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 77

tccttcagct tggtttcgat 20

<210> 78

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 78

cagtacggcc ttataaacct 20

<210> 79

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 79

tcagatcagc gtggaacaat 20

<210> 80

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 80

caggtgcgcg aaaataccat 20

<210> 81

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 81

aaaaacgaca aggcatggat 20

<210> 82

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 82

caccgttgtc cctccagaat 20

<210> 83

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 83

gcgatggata aggattttag 20

<210> 84

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 84

agcataggga gatgatgtat 20

<210> 85

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 85

gagaatgata aggcagctat 20

<210> 86

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 86

taatatactc cgctgaccca 20

<210> 87

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 87

ctgaatgaag cagcaatggt 20

<210> 88

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 88

gagaatcagg gcgtttccat 20

<210> 89

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 89

agtctggatg gttcattagt 20

<210> 90

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 90

cagagtccaa taaatacacc 20

<210> 91

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 91

cctgtcacaa actacactct 20

<210> 92

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 92

ctgcgttgat tttgtggcat 20

<210> 93

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 93

gtatcagaaa caagcatgag 20

<210> 94

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 94

ataaagccca tgacaagcac 20

<210> 95

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 95

tggccttacc gaaagaatgt 20

<210> 96

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 96

tatagagatg cccggtgaat 20

<210> 97

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 97

aactctcctg ccaaacgtct 20

<210> 98

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 98

cgcggataaa acgaagcagt 20

<210> 99

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 99

tgtgctattg aggaagatga 20

<210> 100

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 100

ggattgaagt tgcgctctta 20

<210> 101

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 101

ccaatgcttt tgccgttcta 20

<210> 102

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 102

tttcccgacg caagttcata 20

<210> 103

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 103

agcgagttac tggagatcat 20

<210> 104

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 104

tgctgaattc cggtaatggt 20

<210> 105

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 105

gcggcagagg ttgagagtta 20

<210> 106

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 106

taggctgcgc cagaacgata 20

<210> 107

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 107

tgcaaaaccc tcggccctta 20

<210> 108

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 108

ttgtgcgagt ggggatggta 20

<210> 109

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 109

atgtttgatc ccagcgcaac 20

<210> 110

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 110

ttactcccca tgtactccac 20

<210> 111

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 111

aaagcaaatc cccttaagct 20

<210> 112

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 112

tcccaccgag aaagatccat 20

<210> 113

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 113

aatcacttgc gccgagaata 20

<210> 114

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 114

ctgcttattc ccatcaaact 20

<210> 115

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 115

tatctattgg ctggattgac 20

<210> 116

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 116

tcattctcct gacctatagt 20

<210> 117

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 117

aggaggtaac gacgtattat 20

<210> 118

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 118

tcactcacac ggatatttct 20

<210> 119

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 119

cacctaagga agcagtaagt 20

<210> 120

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 120

aatggtctct ttgccgaagt 20

<210> 121

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 121

cttgggatag tgccgtaagt 20

<210> 122

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 122

actcaacaat ccagtttgct 20

<210> 123

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 123

gacaaaagca gatatcccat 20

<210> 124

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 124

agcaacactt cccttacaat 20

<210> 125

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 125

tgattaactg gccggattct 20

<210> 126

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 126

tatcttcgac ttggacacat 20

<210> 127

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 127

acggagttca ataagcgagt 20

<210> 128

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 128

ggttctctgc aattggatgt 20

<210> 129

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 129

tcttgctctt catcagccag 20

<210> 130

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 130

ctcggtattg actttcttct 20

<210> 131

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 131

gggttaggat ctgaatcgac 20

<210> 132

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 132

acaattgcca gcgataattc 20

<210> 133

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 133

cagatttatg cagcaagact 20

<210> 134

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 134

ctcgcttccc aaccattagt 20

<210> 135

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 135

tgaaattgcc gattccgtct 20

<210> 136

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 136

ggttagtggg gtattcagat 20

<210> 137

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 137

acgagggaaa agtgtctgat 20

<210> 138

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 138

agccagcgca tatatacaat 20

<210> 139

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 139

cttcagaata cgaccacagt 20

<210> 140

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 140

ttgggttaaa gcgtgtgcat 20

<210> 141

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 141

ctatctcaca gattcctgct 20

<210> 142

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 142

gcattcaacc aagcgccttg 20

<210> 143

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 143

ctcagttacc agaaagaagt 20

<210> 144

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 144

gaagcctgtt attgatgagt 20

<210> 145

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 145

gcgttgaggt tgagtggttg 20

<210> 146

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 146

gaacagcaaa tcacggtagt 20

<210> 147

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 147

tcctacaagc tttggcgaat 20

<210> 148

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 148

gtggcaacgg aacttaagac 20

<210> 149

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 149

ttgatctgct gctgcctaat 20

<210> 150

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 150

tggaactggt gtcctgaaat 20

<210> 151

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 151

ggaataacaa aggtggtact 20

<210> 152

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 152

cctgacctta gagaatggct 20

<210> 153

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 153

tgcctgtgag ttttaactct 20

<210> 154

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 154

ctatgtctca gccagttcat 20

<210> 155

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 155

gcgtaccaca tcaaatcagt 20

<210> 156

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 156

cccagagaca tgccaaaaat 20

<210> 157

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 157

aatgaatcaa ccaacgatgt 20

<210> 158

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 158

gatctaagtc cggatattct 20

<210> 159

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 159

aaatcgctat cgtagttgct 20

<210> 160

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 160

tttaccgtac tgctgagcct 20

<210> 161

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 161

ttcgatcttg atggtacgct 20

<210> 162

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 162

tcagaaaacg aatgacctgt 20

<210> 163

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 163

atggacgggc aacaataagt 20

<210> 164

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 164

ttgctttaac gggagcagat 20

<210> 165

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 165

gataaacagt gagccgcaat 20

<210> 166

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 166

ccggcaaata aaccagcagt 20

<210> 167

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 167

gcaggactca cgcttttact 20

<210> 168

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 168

accaccataa gcgtcagcat 20

<210> 169

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 169

gtcgttcaga agatcaagat 20

<210> 170

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 170

atcgtcaaca gcaccgtaat 20

<210> 171

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 171

cattggaaaa gtgttagcgt 20

<210> 172

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 172

ttcgccgata gtcatttcct 20

<210> 173

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 173

cctgatcggt taaacgtagt 20

<210> 174

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 174

tgaaacgccg atcttcttgt 20

<210> 175

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 175

acaatggtta cgatgaggat 20

<210> 176

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 176

acaatggtta cgatgaggat 20

<210> 177

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 177

ctagaacgca gcaacgctat 20

<210> 178

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 178

gcagcctgac catactcaat 20

<210> 179

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 179

caggagattt tgttatccgt 20

<210> 180

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 180

gtatttccag agaggccagt 20

<210> 181

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 181

ccacatcaac agcgaaacct 20

<210> 182

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 182

atatcccgac cttcattcct 20

<210> 183

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 183

tcatatcagc acctaccact 20

<210> 184

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 184

gtctttccat caagcaccgt 20

<210> 185

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 185

tggctggttc atttactcat 20

<210> 186

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 186

cgcacctgga agatgatgat 20

<210> 187

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 187

ggtgtgactc aagttcagat 20

<210> 188

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 188

aatcaccgtc ctctaaactc 20

<210> 189

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 189

ttgcagagag gcttcgacat 20

<210> 190

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 190

ttaccgcctg ctccacttct 20

<210> 191

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 191

tgatatgacc cattcaccat 20

<210> 192

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 192

gcaaccaaaa gagcgcgtat 20

<210> 193

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 193

tgttggataa gtatgctgct 20

<210> 194

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 194

ctcaggacta ttttcgctct 20

<210> 195

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 195

cggcgatcat tatttttgct 20

<210> 196

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 196

accttccatc atcttcccat 20

<210> 197

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 197

cggaactgga tgcactcaat 20

<210> 198

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 198

cgcttccttg gccttgatat 20

<210> 199

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 199

cagagctatt tggaaccgtg 20

<210> 200

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 200

actgaagccc tcagagttag 20

<210> 201

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 201

caaactagat ttagggcagt 20

<210> 202

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 202

ccaccaatca agagaatcat 20

<210> 203

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 203

tctctgtgat ttacgtgttg 20

<210> 204

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 204

tttagctggt gatgttgagt 20

<210> 205

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 205

atgtatcacg tcagtagtct 20

<210> 206

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 206

gtaataactt ccaccttcgt 20

<210> 207

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 207

gcgatgtcca atcacaatct 20

<210> 208

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 208

acctacaacc agagcattat 20

<210> 209

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 209

acctacagaa gtccaatgct 20

<210> 210

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 210

atgtggtggt gttggataat 20

<210> 211

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 211

agatgcgatt gaaagtgtat 20

<210> 212

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 212

aatgttccag atagatgaat 20

<210> 213

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 213

cgttcatgtt cttggattct 20

<210> 214

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 214

tttcaaagta gggacaccat 20

<210> 215

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 215

cagtttatct tgaagcgtgt 20

<210> 216

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 216

ttgacaataa tgggacaggt 20

Claims (9)

1.核苷酸序列在鉴别16种不同血清型沙门氏菌中的应用，其特征在于，所述核苷酸序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.72所示；所述沙门氏菌为肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌其中的一种。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述序列SEQ ID NO.1～4用于鉴别所述肠炎沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.5用于鉴别所述鼠伤寒沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.6～13用于鉴别所述德尔卑沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.14～18用于鉴别所述印第安纳沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.19～25用于鉴别所述阿贡纳沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.26～28用于鉴别所述婴儿沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.29～30用于鉴别所述里森沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.31～34用于鉴别所述布伦登卢普沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.35用于鉴别所述维尔肖沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.36～38用于鉴别所述奥尔巴尼沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.39～42用于鉴别所述哈达尔沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.43～53用于鉴别所述韦太夫雷登沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.54～58用于鉴别所述伦敦沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.59～63用于鉴别所述火鸡沙门氏菌，所述序列SEQ IDNO.64用于鉴别所述山夫登堡沙门氏菌，所述序列SEQ ID NO.65～72用于鉴别所述波莫纳沙门氏菌。

3.用于鉴别16种不同血清型沙门氏菌的引物组，其特征在于，所述引物组为根据如权利要求1所述序列设计得到。

4.如权利要求3所述引物组，其特征在于，所述引物组的序列按5′到3′如SEQ ID NO.73～216所示；其中，SEQ ID NO.73、74对应SEQ ID NO.1；SEQ ID NO.75、76对应SEQ ID NO.2；SEQ ID NO.77、78对应SEQ ID NO.3；......；SEQ ID NO.213、214对应SEQ ID NO.71；SEQID NO.215、216对应SEQ ID NO.72。

5.如权利要求3或4所述引物组在鉴别16种不同血清型沙门氏菌中的应用；所述沙门氏菌为肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、德尔卑沙门氏菌、印第安纳沙门氏菌、阿贡纳沙门氏菌、婴儿沙门氏菌、里森沙门氏菌、布伦登卢普沙门氏菌、维尔肖沙门氏菌、奥尔巴尼沙门氏菌、哈达尔沙门氏菌、韦太夫雷登沙门氏菌、伦敦沙门氏菌、火鸡沙门氏菌、山夫登堡沙门氏菌和波莫纳沙门氏菌其中的一种。

6.用于所述16种不同血清型沙门氏菌的方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1：使用如权利要求3或4所述引物组中的其中一种对待测样品DNA进行PCR扩增；

S2：进行凝胶电泳检测扩增产物；

S3：观察扩增产物是否符合预期。

7.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述S1中的PCR扩增体系包括PCR反应缓冲液、MgCl₂、dNTP、PCR聚合酶、模板DNA、引物组和灭菌双蒸水。

8.如权利要求7所述的方法，其特征在于，所述PCR扩增体系为：10×PCR反应缓冲液2.5μL，25mM MgCl₂ 2.0μL，2.5mM dNTP 1.0μL膜板DNA 1～2μL，5μM引物各1μL，Taq酶1U，灭菌双蒸水补足体积至25μL。

9.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述S1中的PCR扩增程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s；50～62℃退火30s；72℃延伸30～90s；变性、退火、延伸共进行35个循环；最后72℃延伸10min。

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