CN110760599B - 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 - Google Patents
大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN110760599B CN110760599B CN201911295159.XA CN201911295159A CN110760599B CN 110760599 B CN110760599 B CN 110760599B CN 201911295159 A CN201911295159 A CN 201911295159A CN 110760599 B CN110760599 B CN 110760599B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- salmon
- microsatellite
- primer
- seq
- molecular marker
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了大麻哈鱼的微卫星分子标记位点及多态性引物和应用。本发明从大麻哈鱼基因组DNA中筛选出10个微卫星位点，并根据这些位点在微卫星位点两端的侧翼序列设计特异性引物，使用所获得引物的扩增结果具有多态性和稳定性，可适用于大麻哈鱼亲缘关系鉴定，种群遗传多样性检测，以及分子辅助育种领域。
Description
技术领域
本发明属于分子生物学DNA分子标记技术领域，具体涉及大麻哈鱼微卫星分子标记的开发技术。
背景技术
大麻哈鱼Oncorhynchus keta(Walbaum)隶属鲑科太平洋鲑属，具溯河洄游性，即为江里生、海里长又回原产地河流产卵繁殖。大麻哈鱼系世界名贵经济鱼类，其卵也是著名的水产品，营养价值很高，素以肉质鲜美、营养丰富著称于世，历来被人们视为名贵鱼类。大麻哈鱼也是吉林省长白山地区图们江流域著名的冷水性鱼类。但是，由于近些年其生存环境恶化，致使其资源急剧减少，目前已处于濒危状态，亟需大力开展水产种质资源保护工作。水产资源作为农林水中的重要组成部分，抵御环境胁迫的能力最弱，因农、林、水利的不利影响导致水生生物灭绝的事例越来越多，且一经灭绝无法修复，因此保护大麻哈鱼等鱼类资源势在必行，有条件的国家也都采取人工增殖放流措施，并将此作为分配海洋捕捞份额的依据，而开展大麻哈鱼人工增殖放流属地的追踪调查研究是其中最首要的一环。
即，如何建立微卫星分子标记方法鉴定亲子关系，有效地追踪大麻哈鱼人工增殖放流属地是当前亟需解决的问题。
发明内容
本发明的目的是提供大麻哈鱼微卫星分子标记位点以及其多态性引物，并提供具体的应用方法，以弥补现有技术的不足。
微卫星标记(SSRs：simple sequence repeats)是由2-6bp碱基组成的一个多次串联重复序列，又称为短序列重复(Short tandem repeats，STRS)，是一种广泛应用在遗传学领域的DNA分子标记。STRS普遍存在于真核生物的基因组中，平均每10kb就出现一个STR位点，重复数为10-20次，其中动物体中以双核苷酸(CA/GT)n最为常见。微卫星具有多态性高，提供的遗传信息多，PCR扩增效果重复性好，以及在基因组中分散分布等优点，常用于群体遗传学分析、基因图谱分析及亲缘关系等研究，但是，微卫星标记研究和应用难点在于难以筛选合适的标记位点。
为达到上述目的，本发明采取的具体技术方案为：
大麻哈鱼微卫星分子标记位点的序列为SEQ ID：1-10。
所述微卫星分子标记位点序列SEQ ID：1-10的微卫星两端的侧翼序列上设计的引物序列为SEQ ID：11-30。
所述微卫星分子标记位点序列SEQ ID：1-10及引物序列SEQ ID：11-30的筛选是基于全基因组的简化基因组测序后进行多态性筛选。
进一步的，所述具体的筛选方法为：先用酶切法建库，然后进行测序，对读到的序列进行微卫星分析，先选出微卫星重复单元比较多的序列，再对比基因组文库筛选得到了50个微卫星分子标记位点，并根据相关位点，设计引物并予以合成；再在大麻哈鱼多个个体中进行PCR扩增验证，筛选出扩增产物正确的引物对，再对产物正确的引物对进行筛选，最终从中筛选出10对多态性良好的微卫星引物序列SEQ ID：11-30，再反向得到相对应的微卫星分子标记位点序列SEQ ID：1-10。
所述微卫星分子标记位点，对应的位点序列和对应的引物信息如表1：
表1
| 位点 | 微卫星序列 | 正向引物序列 | 反向引物序列 |
| DMH-1 | SEQ ID No：1 | SEQ ID No：11 | SEQ ID No：12 |
| DMH-2 | SEQ ID No：2 | SEQ ID No：13 | SEQ ID No：14 |
| DMH-3 | SEQ ID No：3 | SEQ ID No：15 | SEQ ID No：16 |
| DMH-4 | SEQ ID No：4 | SEQ ID No：17 | SEQ ID No：18 |
| DMH-5 | SEQ ID No：5 | SEQ ID No：19 | SEQ ID No：20 |
| DMH-6 | SEQ ID No：6 | SEQ ID No：21 | SEQ ID No：22 |
| DMH-7 | SEQ ID No：7 | SEQ ID No：23 | SEQ ID No：24 |
| DMH-8 | SEQ ID No：8 | SEQ ID No：25 | SEQ ID No：26 |
| DMH-9 | SEQ ID No：9 | SEQ ID No：27 | SEQ ID No：28 |
| DMH-10 | SEQ ID No：10 | SEQ ID No：29 | SEQ ID No：30 |
所述的微卫星分子标记位点序列SEQ ID：1-10能够用于大麻哈鱼亲缘鉴定。
所述的引物序列SEQ ID：11-30能够用于大麻哈鱼亲缘鉴定。
进一步的，所述亲缘鉴定方法具体包括以下步骤：
1)样品基因组DNA提取；
2)荧光引物合成：对得到的10对引物进行荧光引物合成；
3)PCR扩增，产物分析检测；
4)对上述检测数据分析，计算等位基因、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量，多态性分析鉴定亲缘关系。
本发明的优点和技术效果：
本发明从大麻哈鱼基因组DNA中筛选出10个微卫星位点，并根据这些位点在微卫星位点两端的侧翼序列设计特异性引物，使用所获得引物的扩增结果具有多态性和稳定性，可适用于大麻哈鱼亲缘关系鉴定，种群遗传多样性检测，以及分子辅助育种领域。
大麻哈鱼微卫星分子标记位点及引物的开发，能够应用于建立大麻哈鱼DNA条形编码，在子二代F2繁殖洄游的年份和季节，对捕获的大麻哈鱼进行遗传多样性分析并逐一的亲缘关系认定。利用本发明能够更加准确掌握我国内陆水域自然江河中放流大麻哈鱼的资料，进一步调整保护措施，同时在河口捕获大麻哈鱼的放流来源的确定将有利地支持我国海洋捕捞权利。本发明为大麻哈鱼的亲缘关系的鉴定以及遗传多样性提供资料，能够更加准确评估大麻哈鱼增殖放流效果。
说明书附图
图1为实施例中部分引物扩增效果图一。
图2为实施例中部分引物扩增效果图二。
具体实施方式
实施例1微卫星分子标记的筛选
本发明根据构建的大麻哈鱼鳍条组织基因组文库中进行的SSR分析，对比基因组文库筛选得到了50个微卫星分子标记位点，并根据相关位点，设计了50对筛选引物序列，在大麻哈鱼16个个体中进行验证。
实施例2微卫星引物的验证
以大麻哈鱼基因组为模板，用50对引物序列进行温度梯度PCR以摸索出最佳退火温度，1％琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增结果。
PCR体系：2×Taq PCR mix 12.5μL；primers(5uM)1μL；DNA模板1μL；ddH2O至25μL。PCR程序：94℃5min，(94℃30s，X℃30s，72℃30s)×35 cycle，72℃5min。筛选出具有正确目的条带的引物对。
实施例3微卫星引物多态性验证
对实施例2得到有条带的引物进行荧光引物合成，在其中1条引物的5’加FAM/HEX/Tamra等标记。PCR扩增检测，引物扩增效果图如图1-2所示，从图中可以看出，使用该PCR体系扩增，能够得到非常好的引物扩增效果。
PCR体系：10×PCR buffer 1μL；primers(10mM)0.4μL；dNTP 0.6μL；DNA模板1μL；Taq酶0.5μL；ddH2O至10μL。PCR程序：94℃2min，(94℃30s，60℃to 50℃Δ1℃30s，72℃30s)×50 cycle，(94℃30s，50℃30s，72℃30s)×30 cycle，72℃5min.产物用ABI3730xl全自动DNA测序仪分析。软件Cervus3.0进行遗传指标(等位基因(na：Observed number ofalleles)、观测杂合度(HO：Observed heterozygosity)、期望杂合度(HE：Expectedheterozygosity)、多态信息含量(PIC：polymorphism information content))计算，最终得到如下表2的。
表2：10个微卫星位点的重复单位、引物的相关信息
其中Tm是微卫星的退火温度，NA为等位基因数，HO观望杂合度，HE为期望杂合度。PIC为多态信息含量。
本发明的10对引物序列对50个大麻哈鱼基因组DNA进行扩增，遗传多样性分析结果表明每个微卫星位点的等位基因数目从5到14不等，平均等位基因数为9.2，平均观望杂合度0.698，平均期望杂合度为0.8046。
实施例4：亲缘鉴定方法
选取327尾大麻哈鱼鳍条样本进行基因组DNA提取，用此10对微卫星引物进行PCR扩增，10μL体系PCR：10×PCR buffer 1μL；primers(10mM)0.4μL；dNTP 0.6μL；DNA模板1μL；Taq酶0.5μL；ddH2O至10μL。PCR程序：94℃2min，(94℃30s，60℃to 50℃Δ1℃30s，72℃30s)×50 cycle，(94℃30s，50℃30s，72℃30s)×30 cycle，72℃5min产物上3730xl基因分析仪检测；
表3 10对微卫星引物对327尾大麻哈鱼遗传多样性分析
本发明的10对引物对327个大麻哈鱼基因组DNA进行扩增，遗传多样性分析结果表明：10个微卫星位点的平均等位基因数为15.3，平均观望杂合度0.769，平均期望杂合度为0.798。PIC平均0.774。
上述实施例说明了本发明的微卫星标记位点和相应的引物序列能够用于大麻哈鱼遗传多样性检测以及家系和个体鉴定。
以上已对本发明创造的较佳实施例进行了具体说明，但本发明创造并不限于所述实施例，熟悉本领域的技术人员在不违背本发明创造精神的前提下还可作出种种的等同的变型或替换，这些等同的变型或替换均包含在本申请权利要求所限定的范围内。
序列表
<110> 吉林省水产科学研究院
<120> 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用
<160> 30
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 220
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 1
acgtcaattc ctccagattg gcacagtgcc aagtctttaa ggagtctcct ggattgtgct 60
cccactgtca gggtggtaac gcatgctccc acgcacacag acacacacac acacacacac 120
aaagacacac acacaaagac ccacacacag acaccacatc taggtttctc actagcaatc 180
aaactctctg tgtttcaaac tagtggctgg ttacacttac 220
<210> 2
<211> 230
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 2
aaccaaaagc ttgcactttg ttttcttgct agttctgaca tgagccccag tctcccaagc 60
ttctagtgtt aaacctgtct aagctgatac agttccctga gctgctgctg ctgctgctgc 120
tgctgctgct acagatttgt gtggcctgtt gctgttcaga gccagcaacc tggttcctga 180
taatagccca tgtgtgtgtt gcgctagcct gctaacctcc tcagcacctt 230
<210> 3
<211> 222
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 3
tcaaacaatg gttttgctaa tagctaggca ataaacaatc tagttcacca gtttgctctc 60
taaaaatagc tgatagaata ttctacacag tgcctttgca tctctctctc tctctctctc 120
tctttctcac tctcgcgctc tctcttctct ccctgcaata actacactta tcagtcttat 180
cttcaacaaa tagacctggg tgaaagtgtc acaaggaagt gt 222
<210> 4
<211> 220
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 4
ttacaaggct tctgcccacc tctgtagacc ttcctgccca ttttccaact ttataccctc 60
agtagagccc tctgcacacc agatttggtt gatttgctaa tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg 120
tcactactgt gtttgtagaa agcggacgag gcagcgttgg cgcagcagca gtcgaagcag 180
caggcgctag aagcagagcg ggagcgtgtg gtggaactgc 220
<210> 5
<211> 222
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 5
agggtgtctg ttgtgccagt gacagacgag aaaccctctc attccatgtc attccttcat 60
cctgtgatca cctgtttccc ccagttcagc cccgtacatc cacacacaca cacacacaca 120
cagctagcat tagcattagc agcagcagtg cagtgggtgg aaaaacaggc tgcggtgctt 180
agattactgc atcactcagc tctctctccc cagggccaat aa 222
<210> 6
<211> 222
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 6
cagaacagcc ctcctcccag agagagaagg gaagggacag gaaaaaaaag acctctctcc 60
tcctctcatc ctactcctct cattcctcct ctttcctccc agagagagag agagagagag 120
agaagccaag aaacagacag tctcctccta atttcttcct cctcatgtct gcacactcaa 180
tctcctctct ttccttctat atcctcccct ctcttccttc tg 222
<210> 7
<211> 230
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 7
atggccatta catgcctctg ccccgcctct gtgtgtcaat gattgggcta aaactgtcat 60
gtccgagtgt cctcaaggga gggcatttca gcactgccaa tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg 120
tgtgtgtgtg ttgcccattt ccctttcaga tgagctgtta tctgtgctca ggaaagccag 180
cagagagaga gagaaggaga ggcatcaccc cctctaacac acacactgtg 230
<210> 8
<211> 224
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 8
aacaagaaac actggttaca gaacatataa agggaagata agtggttcca gctggcgcag 60
acaatcaggc cgagattggg aaccacgccc acacaaacac gagagagaga gagagagaga 120
gagaaagaga gagagatgga ggcagtggat tcatgaaccg tgacagcctc agtatgtatg 180
gtttccagtt tacatagagt ccagtgaagt tctttcaggg ccga 224
<210> 9
<211> 220
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 9
caccagagtg cgcaggaacc aaggaaaccc aagtcccaga agcacatcaa agatattatt 60
accaatggag atagagacag ccatgtcccc catacctaaa acacacacac acacacacac 120
aatagtcata acaaggcata cagttagaga caggcatgtc cttcataccg tacaaaacaa 180
acaaacaaaa aggctaacgt cacaacacac acagaccgtt 220
<210> 10
<211> 222
<212> DNA
<213> 大麻哈鱼(Oncorhynchus keta)
<400> 10
aacctccccc atgtttcttg aatcttgttt tctaaattaa aattgtaaac ttaatttttc 60
tgcaatgttg agaatccaca taactctgtg tgcgtgtgtt tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg 120
tgttatttta aaaatgtgca agggtgccaa tacatttggc cggaaatgta catctttcct 180
cagaactata accaagattt ttcgtcagaa ctgaagccta ca 222
<210> 11
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
ggattgtgct cccactgtca 20
<210> 12
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
ccagccacta gtttgaaaca ca 22
<210> 13
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
tgctagttct gacatgagcc c 21
<210> 14
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
caggttgctg gctctgaaca 20
<210> 15
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
tctagttcac cagtttgctc tct 23
<210> 16
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
tgtgacactt tcacccaggt c 21
<210> 17
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
gcttctgccc acctctgtag 20
<210> 18
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
ctcccgctct gcttctagc 19
<210> 19
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
ttgtgccagt gacagacgag 20
<210> 20
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
ggggagagag agctgagtga 20
<210> 21
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 21
ccagagagag aagggaaggg a 21
<210> 22
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 22
cagaaggaag agaggggagg a 21
<210> 23
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 23
tcaagggagg gcatttcagc 20
<210> 24
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 24
tgtgttagag ggggtgatgc 20
<210> 25
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 25
agggaagata agtggttcca gc 22
<210> 26
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 26
catactgagg ctgtcacggt 20
<210> 27
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 27
cccaagtccc agaagcacat 20
<210> 28
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 28
tgcctgtctc taactgtatg cc 22
<210> 29
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 29
aacctccccc atgtttcttg a 21
<210> 30
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 30
tgtattggca cccttgcaca 20
Claims (6)
1.大麻哈鱼微卫星分子标记位点的组合，其特征在于，大麻哈鱼微卫星分子标记位点的序列为SEQ ID NO：1-10。
2.如权利要求1所述的大麻哈鱼微卫星分子标记位点的组合，其特征在于，该微卫星分子标记位点两端的侧翼序列上设计的引物序列为SEQ ID：11-30；所述引物序列的筛选方法基于全基因组的简化基因组测序后进行多态性筛选。
3.如权利要求2所述的大麻哈鱼微卫星分子标记位点的组合，其特征在于，所述筛选方法具体为：先用酶切法建库，然后进行测序，对读到的序列进行微卫星分析，先选出微卫星重复单元比较多的序列，再对比基因组文库筛选得到了多个微卫星分子标记位点，并根据相关位点，设计引物并予以合成；再在大麻哈鱼多个个体中进行PCR扩增验证，筛选出扩增产物正确的引物对，再对产物正确的引物对进行筛选，最终从中筛选出10对多态性良好的微卫星引物序列SEQ ID：11-30。
4.权利要求1所述的大麻哈鱼微卫星分子标记位点的组合在大麻哈鱼亲缘鉴定中的应用。
5.权利要求2中所述的引物序列SEQ ID NO：11-30在大麻哈鱼亲缘鉴定中的应用。
6.如权利要求5所述的应用，其特征在于，该应用的具体亲缘鉴定方法包括以下步骤：
1)样品基因组DNA提取；
2)荧光引物合成：对得到的10对引物序列SEQ ID NO：11-30进行荧光引物合成；
3）PCR扩增，产物分析检测；
4）对上述检测数据分析，计算等位基因、观测杂合度、期望杂合度、多态信息含量，多态性分析鉴定亲缘关系。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201911295159.XA CN110760599B (zh) | 2019-12-16 | 2019-12-16 | 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201911295159.XA CN110760599B (zh) | 2019-12-16 | 2019-12-16 | 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN110760599A CN110760599A (zh) | 2020-02-07 |
| CN110760599B true CN110760599B (zh) | 2020-10-02 |
Family
ID=69341532
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201911295159.XA Active CN110760599B (zh) | 2019-12-16 | 2019-12-16 | 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN110760599B (zh) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN111471755B (zh) * | 2020-05-18 | 2023-11-24 | 上海思路迪生物医学科技有限公司 | 用于微卫星不稳定性检测的生物标志物组合、试剂盒及其用途 |
| CN112690241B (zh) * | 2021-01-30 | 2021-09-14 | 吉林省水产科学研究院 | 基于摩斯密码规则的大麻哈鱼耳石标记方法 |
| CN115141892B (zh) * | 2022-07-12 | 2023-07-18 | 吉林省水产科学研究院(吉林省渔业生态环境及水产品质量监督检测中心) | 一种大麻哈鱼放流效果的评估方法 |
Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104726555A (zh) * | 2015-02-03 | 2015-06-24 | 浙江省海洋水产研究所 | 日本黄姑鱼微卫星dna标记 |
| CN104975012A (zh) * | 2015-07-01 | 2015-10-14 | 国家海洋局第一海洋研究所 | 星斑川鲽微卫星分子标记位点及引物 |
| CN105063031A (zh) * | 2015-08-05 | 2015-11-18 | 中国长江三峡集团公司 | 一种圆口铜鱼微卫星标记及其应用 |
| CN105331732A (zh) * | 2015-12-04 | 2016-02-17 | 南京师范大学 | 一种鉴别河川沙塘鳢家系的方法 |
| CN108866203A (zh) * | 2018-07-06 | 2018-11-23 | 江汉大学 | 一种杂交鲟亲子鉴定微卫星标记引物及其杂交鲟亲子鉴定方法 |
-
2019
- 2019-12-16 CN CN201911295159.XA patent/CN110760599B/zh active Active
Patent Citations (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104726555A (zh) * | 2015-02-03 | 2015-06-24 | 浙江省海洋水产研究所 | 日本黄姑鱼微卫星dna标记 |
| CN104975012A (zh) * | 2015-07-01 | 2015-10-14 | 国家海洋局第一海洋研究所 | 星斑川鲽微卫星分子标记位点及引物 |
| CN105063031A (zh) * | 2015-08-05 | 2015-11-18 | 中国长江三峡集团公司 | 一种圆口铜鱼微卫星标记及其应用 |
| CN105331732A (zh) * | 2015-12-04 | 2016-02-17 | 南京师范大学 | 一种鉴别河川沙塘鳢家系的方法 |
| CN108866203A (zh) * | 2018-07-06 | 2018-11-23 | 江汉大学 | 一种杂交鲟亲子鉴定微卫星标记引物及其杂交鲟亲子鉴定方法 |
Non-Patent Citations (3)
| Title |
|---|
| Stock origins of chum salmon (Oncorhynchus keta) in the Gulf of Alaska during winter as estimated with microsatellites;Terry D. Beacham et al.,;《North Pacific Anadromous Fish Commission》;20091231;15-23 * |
| 微卫星（Microsatellite）标记技术及其在水产动物遗传研究中的应用;李春艳等;《天津水产》;20101231(第3期);22-26 * |
| 微卫星标记对黑龙江流域大麻哈鱼遗传多样性的研究;陈金平等;《水生生物学报》;20041130;第28卷(第6期);607-612 * |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN110760599A (zh) | 2020-02-07 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN110760599B (zh) | 大麻哈鱼微卫星分子标记位点及多态性引物和应用 | |
| Askari et al. | Application of molecular markers in fisheries and aquaculture. | |
| CN110551828B (zh) | 一种与鸡背部毛孔密度相关的snp分子标记及其应用 | |
| CN106811540B (zh) | 一种鉴定乌苏里拟鲿雌、雄个体的微卫星标记与特异性引物及应用 | |
| Liu et al. | Development of genomic microsatellite multiplex PCR using dye-labeled universal primer and its validation in pedigree analysis of Pacific oyster (Crassostrea gigas) | |
| KR101845027B1 (ko) | 전복류의 종구별, 유전자 다양성 또는 세대 간 연관관계 분석용 마이크로새틀라이트 마커군 및 이를 이용한 분석방법 | |
| CN101818195B (zh) | 猪miR-27a前体侧翼序列SNP作为猪产仔数性状的遗传标记及应用 | |
| Kocher et al. | Genome mapping and genomics in fishes and aquatic animals | |
| Bi et al. | Genetic diversity of wild population of Pyropia haitanensis based on SSR analysis | |
| CN109182546B (zh) | 用于穿山甲亲子鉴定的ssr荧光标记引物及应用 | |
| Kang et al. | Development of microsatellite markers for a hard-shelled mussel, Mytilus coruscus, and cross-species transfer | |
| CN106434644A (zh) | 大泷六线鱼微卫星位点及其应用 | |
| Wirgin et al. | Use of nuclear DNA in stock identification: single-copy and repetitive sequence markers | |
| US6514705B2 (en) | Method for analyzing phyletic lineage of scallop | |
| CN110452992A (zh) | 一种凡纳滨对虾est微卫星位点引物的标记方法 | |
| CN105671170A (zh) | 一种用于鉴别鸡匍匐性状的引物组合及其应用 | |
| CN113373241B (zh) | 一种荷马条鳅属鱼类微卫星标记及其扩增引物和应用 | |
| CN109880916B (zh) | 一种与鸡繁殖性状相关的nr3c2基因的分子标记及其应用 | |
| Håland | Development of multiplex microsatellite panels for population genetic studies of Triturus cristatus | |
| O'Connell et al. | Characterization of microsatellite loci in western redcedar (Thuja plicata). | |
| KR102066113B1 (ko) | 재첩류 원산지 판별 마커 및 그를 이용한 원산지 판별방법 | |
| CN116064507B (zh) | 大刺鳅性别鉴定的特异性dna片段、遗传性别标记引物及应用 | |
| Sun et al. | Fourteen polymorphic microsatellite markers isolated from big-head croaker (Collichthys lucidus) | |
| CN114058715B (zh) | 一种须鳗虾虎鱼多态性微卫星分子标记及其引物对和应用 | |
| Sabry et al. | A Comparable Genetic Diversity between Chicken Ecotypes of Different Zones using DNA Barcoding. |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| GR01 | Patent grant |