CN110283936A - 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒 - Google Patents

一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒 Download PDF

Info

Publication number
CN110283936A
CN110283936A CN201910453760.0A CN201910453760A CN110283936A CN 110283936 A CN110283936 A CN 110283936A CN 201910453760 A CN201910453760 A CN 201910453760A CN 110283936 A CN110283936 A CN 110283936A
Authority
CN
China
Prior art keywords
swine fever
african swine
lamp
hnb
fever virus
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201910453760.0A
Other languages
English (en)
Inventor
陈瑞
张磊
张志刚
董剑辉
张满义
洪金
郭晶莹
潘玉
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shaanxi Lihua Norwich Biotechnology Co Ltd
Original Assignee
Shaanxi Lihua Norwich Biotechnology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shaanxi Lihua Norwich Biotechnology Co Ltd filed Critical Shaanxi Lihua Norwich Biotechnology Co Ltd
Priority to CN201910453760.0A priority Critical patent/CN110283936A/zh
Publication of CN110283936A publication Critical patent/CN110283936A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844Nucleic acid amplification reactions
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/70Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
    • C12Q1/701Specific hybridization probes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/166Oligonucleotides used as internal standards, controls or normalisation probes

Abstract

本发明涉及一种非洲猪瘟病毒LAMP‑HNB可视化检测试剂盒,使用非洲猪瘟病毒P72基因作为LAMP检测的引物组,该引物组特异性检测非洲猪瘟病毒基因P72,可以有效检出ASFV。所述LAMP检测方法可以实现非洲猪瘟病毒的快速检测,检测结果可以直接目测,仅需加热即可实现整个反应,摆脱了传统核酸检测技术对于PCR仪器的依赖,且所述方法检测灵敏度高、特异性强、重复性好、检测速度快。另外本发明采用了可视化检测手段,当样品颜色由紫罗兰色变为天蓝色则说明其为阳性,只需要观察反应产物的颜色即可实现样品检测结果的判断,简单易学,适合临床和基层检测。

Description

一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测试剂盒
技术领域:
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测试剂盒。
背景技术:
非洲猪瘟(African swine fever,ASF)是由非洲猪瘟病毒(African swine fevervirus,ASFV) 引起的一种急性、热性、高度接触性传染病,发病时间短,病死率高。ASF是对养猪业危害 最为严重的疫病,被世界动物卫生组织(OIE)列为法定报告疫病,被我国列为一类传染病。 ASFV属于双链DNA病毒目非洲猪瘟病毒科非洲猪瘟病毒属,该属目前仅有一个ASFV病 毒种。ASFV的基因组为单分子线状DNA,长度约170~190kb。ASFV个体较大,直径可达 200nm,表面为二十面体结构和一层含类脂的囊膜,因此高温和一些破坏囊膜的消毒剂均可 有效杀灭ASFV。但是由于其复杂的分子结构,ASFV对消毒剂的抵抗力较其他的囊膜病毒 稍强,特别是在一些猪肉制品或血液中存活时间更长。据报道,ASFV在在血液、粪便和组 织中存活时间长达半年,在生肉或者未完全煮熟的猪肉制品中存活时间长达3个月,这就导 致ASFV一旦传入,往往在疫源地长期存在,造成二次或次级感染。非洲猪瘟的发病率和病 死率均可达到100%,且目前世界范围内尚无有效疫苗问世,其扩散和流行对养猪产业可能造 成毁灭性打击,由此产生的间接损失则无法估量。
现有的实验室检测方法主要有血清学方法和病原学方法。血清学方法主要有间接酶联免 疫吸附试验、阻断酶联免疫吸附试验和间接荧光抗体试验等,其中酶联免疫吸附试验已经有 商品化的试剂盒出售。ASFV的病原学方法也有很多,如病毒的细胞培养和分离、直接免疫 荧光法、双抗体夹心ELISA法、普通PCR和荧光PCR方法等,其中OIE推荐的普通PCR和荧光PCR方法最为常用。我国《非洲猪瘟防治技术规范(试行)》中提到了3种ASFV病 原学检测方法:双抗体夹心酶联免疫吸附试验、聚合酶链式反应和实时荧光聚合酶链式反应(OIE官方网站)。除此以外,还要加大ASF防控技术研制工作力度,尽快开发简易、高效、 特异的诊断试剂和诊断方法,并能够与古典猪瘟、高致病性猪蓝耳病等其他猪群疫病相鉴别。
环介导等温扩增法(Loop mediated isothermal amplification method,LAMP)是一种新兴的 核酸扩增技术,它采用独特的引物设计实现等温条件下的核酸快速扩增。在现有期刊文献中 也出现了多篇LAMP检测非洲猪瘟的文章,例如江彦增等①、杨吉飞等②、王彩霞等③、王 华等④均建立了非洲猪瘟病毒环介导等温扩增快速检测方法,然而,市场上并未出现相关的 产品。为了将LAMP技术运用到ASFV的检测和产品中,应对2018年在我国发现的非洲猪 瘟疫情,本研究使用非洲猪瘟病毒P72基因作为LAMP检测的引物组,该引物组特异性检测 非洲猪瘟病毒基因P72,可以有效检出ASFV,为非洲猪瘟防控提供新的技术手段,有利于毒 株检测和出入境快速筛查,且检测结果准确性高,重复性好。
发明内容:
为了解决非洲猪瘟检测常规检测方法效率低、对于仪器的依赖性比较强,不能实现现场 检测的技术问题,本发明旨在提供一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测试剂盒,所述 LAMP检测试剂盒可以实现非洲猪瘟病毒的快速检测,检测结果可以直接目测,仅需加热即 可实现整个反应,摆脱了传统核酸检测技术对于PCR仪器的依赖,且所述方法检测灵敏度高、 特异性强、重复性好、检测速度快,可以作为有效的非洲猪瘟现场检测手段。另外本发明采 用了可视化检测手段,当样品颜色由紫罗兰色变为天蓝色则说明其为阳性,只需要观察反应 产物的颜色即可实现样品检测结果的判断,简单易学,适合临床和基层检测。
本发明的目的在于提供一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测试剂盒,该试剂盒采 用环介导等温扩增技术通过对非洲猪瘟病毒衣壳蛋白p72的编码基因B646L基因的检测,可 以有效检出ASFV,为非洲猪瘟防控提供新的技术手段,有利于不同基因型毒株检测和出入 境快速筛查,且该试剂盒通过显色反应,更加有助于判断检测结果。
本发明的第二个目的在于提供非洲猪瘟病毒LAMP检测方法,该检测方法可快速检出 ASF,检测结果准确性高,重复性好。所述方法可以用于疾病的诊断,如非洲猪瘟的诊断;也可以用于非疾病的诊断目的,例如,科研当中病毒的确认、病毒的分型鉴定等。
为了实现上述目的,
本发明提供非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,所述试剂盒由LAMP Mix、Primer Mix、5M Betain、Bst DNA Polymerase、去离子水、阴性对照和阳性对照组成,所述Primer Mix包含SEQ ID No.1-SEQ ID No.6的引物组。
所述LAMP Mix、5M Betain、Bst DNA Polymerase均为购自海基生物科技有限公司的LAMP-HNB变色扩增试剂盒中的2×HNB LAMP Mix、5M Betain、Bst2.0DNAPolymerase, 货号:A3802。
所述引物组包括:一对外引物、一对内引物、一对环引物。其核苷酸序列分别如下所示:
外引物:
4F3 ACGCAGAGATAAGCTT(SEQ ID No.1)
4B3 AAGGTAATCATCATCGC(SEQ ID No.2)
内引物:
4FIP TGATCGGATACGTAACGGGATAGAGATACAGCTCTTC(SEQ ID No.3)
4BIP CCGTAACTGCTCATGGTACGTAGTGGAAGGGTAT(SEQ ID No.4)
环引物
4LoopF ATAGATGAACATGCGTC(SEQ ID No.5)
4LoopB AGTTCTGCAGCTCTTA(SEQ ID No.6)
优选的,所述Primer Mix中4FIP、4BIP、4LoopF、4LoopB、4F3、4B3与去离子水的最佳配比为10∶10∶4∶4∶1∶1∶250。
优选的,所述阳性对照为含有目的基因片段的质粒DNA,阴性对照为无菌水,优选采用 双蒸水、三蒸水或者DEPC水。
优选的,所述阳性对照为含有p72基因的质粒DNA。
优选的,所述p72基因的序列如SEQ ID No.7所示。
本发明另提供一种非洲猪瘟病毒LAMP检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待测样品DNA;
(2)环介导等温扩增反应:配置25μL反应体系,所述反应体系含有HNB LAMP Mix12.5 μl,Primer mix 7.5μl,5M Betain 2μl,模板DNA 2μl,Bst DNA Polymerase 1μl,总量25 μl,然后于63-68℃下反应30-60min;
(3)结果分析:通过肉眼观察反应管中溶液是否变色,若呈现天蓝色判定为阳性,呈现 紫罗兰色则判定为阴性。
所述的非洲猪瘟病毒LAMP检测方法可以用于疾病的诊断,如非洲猪瘟的诊断;也可以 用于非疾病的诊断目的。
优选的,反应的温度为65℃,时间为40min。
基于以上技术方案,本发明具有如下优点和有益效果:
第一,本发明选取非洲猪瘟病毒的保守基因序列p72作为检测的目标基因,能够检测多 种基因型和不同的毒株可以保证检测结果的准确性,避免漏检的出现,对于猪场或者养殖区 域进行净化工作具有重要的意义。
第二,本发明采用LAMP技术,其特异性高,仅能特异性扩增非洲猪瘟病毒的基因组序 列,且引物设计科学,避免了引物二聚体的形成,保证了反应的顺利进行。
第三,本发明的非洲猪瘟病毒LAMP检测方法灵敏度高,最低检测极限是10拷贝阳性 质粒DNA,高于现有技术报道的LAMP检测方法,相比OIE推荐的PCR检测方法,其灵敏 度提高了近50倍。
第四,操作简单,不需要复杂的仪器,不需要特殊试剂,只需要恒温水浴即可反应,反 应条件温和;而且可以通过肉眼颜色反应判定检测结果,不仅适合猪场现场检测,也适合科 研单位进行运用和推广。
附图说明:
图1:酶切验证图:1,pUC57-P72质粒;2,通过SalI-XbaI酶切后的质粒pUC57-P72;M, Marker。
图2:ASFV LAMP产物的可视化鉴定结果:1.阳性对照;2.阴性对照结果表明,阳性对照 的反应管颜色为天蓝色,阴性对照管的颜色为紫罗兰色。
图3:非洲猪瘟阳性质粒LAMP检测灵敏度:1.质粒1×107拷贝/μl;2.质粒1×106拷贝/μl;3. 质粒1×105拷贝/μl;4.质粒1×104拷贝/μl;5.质粒1×103拷贝/μl;6.质粒1×102拷贝/μl;7.质粒 1×101拷贝/μl;8.质粒1×100拷贝/μl;9.阳性对照;10.阴性对照。注:图中有下划线标注的为 阳性检测结果,呈天蓝色,未标注下划线的为阴性检测结果,呈紫罗兰色。
图4:非洲猪瘟阳性质粒LAMP检测敏感性:1.阳性质粒pUC57-P72-1;2.阳性质粒pUC57-P72-2;3.阳性质粒pUC57-P72-3;4.阳性质粒pUC57-P72-4;5.阳性质粒pUC57-P72-5; 6.阳性对照;7.阴性对照。注:图中有下划线标注的为阳性检测结果,呈天蓝色,未标注下划 线的为阴性检测结果,呈紫罗兰色。
图5:非洲猪瘟LAMP特异性检测:1.猪日本乙型脑炎病毒;2.猪瘟病毒;3.猪细小病毒; 4.猪伪狂犬病毒;5.猪圆环病毒;6.猪传染性胃肠炎病毒7.SPF猪淋巴结8.SPF猪血清9.非 洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72;10.阳性对照;11.阴性对照。注:图中有下划线标注的为阳性检 测结果,呈天蓝色,未标注下划线的为阴性检测结果,呈紫罗兰色。
具体实施方式:
以下结合具体实施例对本发明作进一步的说明,但不局限于此。
实施例1:样品、引物设计和制备
1.1质粒、样品来源及实验地点
根据Genebank上提供的非洲猪瘟病毒P72蛋白基因(SEQ ID No.7所示),由生工生物 工程(上海)股份有限公司合成质粒pUC57-P72,溶解稀释至1.0×107拷贝/μL。
猪日本乙型脑炎病毒、猪瘟病毒、猪细小病毒、猪伪狂犬病毒、猪圆环病毒、猪传染性 胃肠炎病毒由陕西诺威利华生物科技有限公司提供。
SPF猪淋巴结、SPF猪血清采集自陕西诺威利华生物科技有限公司。
1.2阳性质粒的鉴定
对阳性质粒pUC57-P72的SalI-XbaI位点进行酶切,验证质粒的正确性。对阳性质粒 pUC57-P72的SalI-XbaI位点进行酶切鉴定,结果表明,质粒形态正常、目的基因大小正确、 载体大小正确、电泳条带清晰、无基因组、无杂带。结果如图1所示。
1.3 ASFV LAMP引物设计和筛选
根据Genebank公布的ASFV毒株P72基因序列,通过http://PrimerExplorer.jp设计和 筛选引物,通过多次筛选和试验后得到最佳的引物组,引物序列如表1所示。由生工生物工 程(上海)股份有限公司合成。具体引物序列如下表1所示:
表1非洲猪瘟病毒LAMP检测引物组
实施例2:非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的建立
本发明提供非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒,所述试剂盒由LAMP Mix、Primer Mix、5M Betain、Bst DNAPolymerase、去离子水、阴性对照和阳性对照组成,所述Primer Mix包含SEQ ID No.1-SEQ ID No.6的引物组。
所述LAMP Mix、5M Betain、Bst DNA Polymerase均为购自海基生物科技有限公司的 LAMP-HNB变色扩增试剂盒中的2×HNB LAMP Mix、5M Betain、Bst2.0 DNA Polymerase,货号:A3802。
所述引物组包括:一对外引物、一对内引物、一对环引物。其核苷酸序列分别如下所示:
外引物:
4F3 ACGCAGAGATAAGCTT(SEQ ID No.1)
4B3 AAGGTAATCATCATCGC(SEQ ID No.2)
内引物:
4FIP TGATCGGATACGTAACGGGATAGAGATACAGCTCTTC(SEQ ID No.3)
4BIP CCGTAACTGCTCATGGTACGTAGTGGAAGGGTAT(SEQ ID No.4)
环引物
4LoopF ATAGATGAACATGCGTC(SEQ ID No.5)
4LoopB AGTTCTGCAGCTCTTA(SEQ ID No.6)
优选的,所述Primer Mix中4FIP、4BIP、4LoopF、4LoopB、4F3、4B3与去离子水的最佳配比为10∶10∶4∶4∶1∶1∶250。
优选的,所述阳性对照为含有目的基因片段的质粒DNA,阴性对照为无菌水,优选采用 双蒸水、三蒸水或者DEPC水。
优选的,所述阳性对照为含有p72基因的质粒DNA。
优选的,所述p72基因的序列如SEQ ID No.7所示。
【注意事项】
1.为了减少交叉污染,请分区操作(试剂和模板的配置操作最好在不同区域中进行)。
2.各区物品均为专用,不可交叉使用,防止污染。
3.实验过程中应穿工作服,带手套,口罩。
实施例3:非洲猪瘟LAMP检测方法的建立
3.1 LAMP反应体系的建立
根据实施例2的试剂盒,利用以上引物确定非洲猪瘟病毒LAMP检测的25μl反应体系 中各组分的含量及比例,将其置于恒温容器中进行扩增。通过肉眼观察颜色变化判断检测结 果。其中25μL反应体系如表2所示。
表2 25μl反应体系
3.2 LAMP反应
3.2.1 LAMP反应时间的确定
按照上述已确定的LAMP反应体系,假定在65℃的条件下,将阳性质粒pUC57-P72分别进行20min、30min、40min、50min、60min的特异性扩增,记录结果,确定最佳反应时间。
分别将浓度为104拷贝的阳性质粒pUC57-P72在65℃下,分别在20min、30min、40min、 50min、60min的时间下进行特异性扩增,结果表明,在40min及以后,阳性质粒pUC57-P72 LAMP反应管均呈现天蓝色(见图2),经凝胶电泳,可见梯状条带,即检测结果为阳性。因 此,其最佳反应时间为40min。
3.2.2 LAMP反应温度的确定
根据上述已确定的反应体系及反应时间。分别将浓度为104和102拷贝阳性质粒pUC57-P72在60-70℃下,设置61℃、63℃、65℃、67℃、69℃五个温度进行反应,观察试 验结果,确定最佳反应温度。
结果表明在65℃的条件下,阳性质粒pUC57-P72LAMP反应管均呈现天蓝色。因此,其 最佳反应温度为65℃。
3.2.3非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的灵敏度检测
非洲猪瘟阳性冻干质粒pUC57-P72用ddH2O将质粒充分溶解稀释到1×107个拷贝数,溶 解后的质粒在-20℃中保存,备用。将稀释到1×107拷贝/μl的质粒做10-1~10-7梯度稀释,分 别对不同拷贝数的阳性质粒样本进行LAMP扩增。
非洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72从10-1~10-6倍稀释的质粒中均可扩增到预期的阳性,可测 到的质粒数为10拷贝/μl(见图3)。对上述样品检测的灵敏度结果见表3。
表3LAMP检测实验样品的敏感性和重复性检测结果
可见,本发明所构建的非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的灵敏度为10拷贝/μl,其可测 到的最小质粒数为10拷贝/μL。相比OIE推荐的PCR检测方法约500拷贝的灵敏度(参见参考文献①),本发明的灵敏度提高了约50倍。
3.3非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的敏感性试验
用试剂盒检测5份敏感性质控样品:非洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72-1、非洲猪瘟阳性质 粒pUC57-P72-2、非洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72-3、非洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72-4、非洲猪 瘟阳性质粒pUC57-P72-5,分别将5种4μg非洲猪瘟阳性冻干质粒用ddH2O将质粒充分溶解 稀释到1×105个拷贝数,重复检测3次。
用本研究研制的非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒检测5份敏感性质控样品,重复检测3 次,5份3次检测的敏感性质控样品均为阳性。对上述样品检测的灵敏度和重复性结果见表4 和图4。
表4 LAMP检测实验样品的重复性检测结果
3.4非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的特异性试验
使用常规方法提取猪日本乙型脑炎病毒、猪瘟病毒、猪细小病毒、猪伪狂犬病毒、猪圆 环病毒、猪传染性胃肠炎病毒、SPF猪淋巴结、SPF猪血清的核酸作为模板,与阳性质粒pUC57-P72一起应用本研究研制的非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒分别进行检测,观察其特异性。
实验结果表明,用该试剂盒检测猪日本乙型脑炎病毒、猪瘟病毒、猪细小病毒、猪伪狂 犬病毒、猪圆环病毒、猪传染性胃肠炎病毒、SPF猪淋巴结、SPF猪血清,结果全为阴性。检测已知非洲猪瘟阳性质粒pUC57-P72-2,结果为阳性。结果见表5、图5。
表5 ASFV LAMP的特异性测定
实施例4:非洲猪瘟LAMP检测方法的灵敏度比较
在本发明研究过程中,对于引物进行了大量的优化工作,得到多组引物,并且比较了现 有技术的多组引物,具体比较的引物组序列如下表6:
表6现有技术的引物组序列(对照组1--6)
注:以上对照组1-4的序列为现有技术中的引物序列,具体见背景技术部分的相关文献,对照组5(SEQ ID No:8-13)为本公司研发过程中筛选较好的一组引物,对照组6为不含环引物的引物组。
采用以上实施例3中“3.2.3非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的灵敏度检测”的方法测定 了本发明实施例1的引物以及以上对照组1-6的敏感性,具体检测结果如下表7。
表7 LAMP检测实验样品的敏感性检测结果
拷贝数 10<sup>8</sup> 10<sup>7</sup> 10<sup>6</sup> 10<sup>5</sup> 10<sup>4</sup> 10<sup>3</sup> 10<sup>2</sup> 10<sup>1</sup> 100
实施例1 + + + + + + + + -
对照1 + + + + + + + - -
对照2 + + + + + + + - -
对照3 + + + + + + - - -
对照4 + + + + + + - - -
对照5 + + + + + + - - -
对照6 + + + + + + + - -
可见,本发明所构建的非洲猪瘟病毒LAMP检测试剂盒的灵敏度为10拷贝/μl,其可测 到的最小质粒数为10拷贝/μL。相比现有技术的引物组1-4以及本公司产品开发过程中筛选 的其他引物、以及不添加环引物的引物组,本发明实施例1的引物组具有更高的灵敏度,对 于非洲猪瘟疫情早期或者潜伏期的检测具有更加重要的意义。
以上实施例是对本发明的进一步详细描述,给出实施例仅为了阐明本发明,而不是为了 限制本发明的范围。
参考文献:
①江彦增,非洲猪瘟病毒环介导等温扩增快速检测方法的建立,《中国农业科学院学位论文》, 第31页。
②杨吉飞等,非洲猪瘟病毒环介导恒温扩增快速检测技术的建立及应用,《中国动物传染病学 报》,2011,19(4):7-12。
③王彩霞等,环介导恒温扩增技术快速检测非洲猪瘟病毒,《动物医学进展》,2010年第31卷 第2期:15-19。
④王华等,非洲猪瘟病毒环介导等温扩增诊断方法的建立,《中国兽医科学》,2010,40(09): 940-944。
序列表
<110> 陕西诺威利华生物科技有限公司
<120> 一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测试剂盒
<160> 13
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 16
<212> DNA
<213> 4F3(ASFV)
<400> 1
acgcagagat aagctt 16
<210> 2
<211> 17
<212> DNA
<213> 4B3(ASFV)
<400> 2
aaggtaatca tcatcgc 17
<210> 3
<211> 37
<212> DNA
<213> 4FIP(ASFV)
<400> 3
tgatcggata cgtaacggga tagagataca gctcttc 37
<210> 4
<211> 34
<212> DNA
<213> 4BIP(ASFV)
<400> 4
ccgtaactgc tcatggtacg tagtggaagg gtat 34
<210> 5
<211> 17
<212> DNA
<213> 4LoopF(ASFV)
<400> 5
atagatgaac atgcgtc 17
<210> 6
<211> 16
<212> DNA
<213> 4LoopB(ASFV)
<400> 6
agttctgcag ctctta 16
<210> 7
<211> 2366
<212> DNA
<213> P72(ASFV)
<400> 7
gtcacggacg ttgtaaaacg acggccagtg aattcgagct cggtacctcg cgaatgcatc 60
tagaatggca tcaggaggag ctttttgtct tattgctaac gatgggaagg ccgacaagat 120
tatattggcc caagacttgc tgaatagcag gatctctaac attaaaaatg tgaacaaaag 180
ttatgggaaa cccgatcccg aacccacttt gagtcaaatc gaagaaacac atttggtgca 240
ttttaatgcg cattttaagc cttatgttcc agtagggttt gaatacaata aagtacgccc 300
gcatacgggt acccccacct tgggaaacaa gcttaccttt ggtattcccc agtacggaga 360
ctttttccat gatatggtgg gccatcatat attgggtgca tgtcattcat cctggcagga 420
tgctccgatt cagggcacgt cccagatggg ggcccatggg cagcttcaaa cgtttcctcg 480
caacggatat gactgggaca accaaacacc cttagagggc gccgtttaca cgcttgtaga 540
tccttttgga agacccattg tacccggcac aaagaatgcg taccgaaact tggtttacta 600
ctgcgaatac cccggagaac gactttatga aaacgtaaga ttcgatgtaa atggaaattc 660
cctagacgaa tatagttcgg atgtcacaac gcttgtgcgc aaattttgca tcccagggga 720
taaaatgact ggatataagc acttggttgg ccaggaggta tcggtggagg gaaccagtgg 780
ccctctccta tgcaacattc atgatttgca caagccgcac caaagcaaac ctattcttac 840
cgatgaaaat gatacgcagc gaacgtgtag ccataccaac ccgaaatttc tttcacagca 900
ttttcccgag aactctcaca atatccaaac agcaggtaaa caagatatta ctcctatcac 960
ggacgcaacg tatctggaca taagacgtaa tgttcattac agctgtaatg gacctcaaac 1020
ccctaaatac tatcagcccc ctcttgcgct ctggattaag ttgcgctttt ggtttaatga 1080
gaacgtgaac cttgctattc cctcagtatc cattcccttc ggcgagcgct ttatcaccat 1140
aaagcttgca tcgcaaaagg atttggtgaa tgaatttcct ggactttttg tacgccagtc 1200
acgttttata gctggacgcc ccagtagacg caatatacgc tttaaaccat ggtttatccc 1260
aggagtcatt aatgaaatct cgctcacgaa taatgaactt tacatcaata acctgtttgt 1320
aacccctgaa atacacaacc tttttgtaaa acgcgttcgc ttttcgctga tacgtgtcca 1380
taaaacgcag gtgacccaca ccaacaataa ccaccacgat gaaaaactaa tgtctgctct 1440
taaatggccc attgaatata tgtttatagg attaaaacct acctggaaca tctccgatca 1500
aaatcctcat caacaccgag attggcacaa gttcggacat gttgttaacg ccattatgca 1560
gcccactcac cacgcagaga taagctttca ggatagagat acagctcttc cagacgcatg 1620
ttcatctata tctgatatta gccccgttac gtatccgatc acattaccta ttattaaaaa 1680
catttccgta actgctcatg gtatcaatct tatcgataaa tttccatcaa agttctgcag 1740
ctcttacata cccttccact acggaggcaa tgcgattaaa acccccgatg atccgggtgc 1800
gatgatgatt acctttgctt tgaagccacg ggaggaatac caacccagtg gtcatattaa 1860
cgtatccaga gcaagagaat tttatattag ttgggacacg gattacgtgg ggtctatcac 1920
tacggctgat cttgtggtat cggcatctgc tattaacttt cttcttcttc agaacggttc 1980
agctgtgctg cgttacagta cctaagtcga ctgcagaggc ctgcatgcaa gcttggcgta 2040
atcatggtca tagctgtttc ctgtgtgaaa ttgttatccg ctcacaattc cacacaacat 2100
acgagccgga agcataaagt gtaaagcctg ggggtgccta atgagtgagc taactcacat 2160
taattgcgtt gcgctcactg cccgctttcc agtcgggaaa cctgtcgtgc cagctgcatt 2220
aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg gtttgcgtat tggggcgctc ttccgcttcc 2280
tcgctcactg actcgctgcg ctcggtcgtt cggctgcggc gagcggtatc agctcactca 2340
aaggcggtaa tacggtatcc acagaa 2366
<210> 8
<211> 16
<212> DNA
<213> 1F3(ASFV)
<400> 8
actgctcatg gtatca 16
<210> 9
<211> 16
<212> DNA
<213> 1B3(ASFV)
<400> 9
atagcagatg ccgata 16
<210> 10
<211> 34
<212> DNA
<213> 1FIP(ASFV)
<400> 10
ggtaatcatc atcgcaccat acccttccac tacg 34
<210> 11
<211> 36
<212> DNA
<213> 1BIP(ASFV)
<400> 11
ttaacgtatc cagagcaaga agccgtagtg atagac 36
<210> 12
<211> 16
<212> DNA
<213> 1LoopF(ASFV)
<400> 12
ttaatcgcat tgcctc 16
<210> 13
<211> 19
<212> DNA
<213> 1LoopB(ASFV)
<400> 13
ttatattagt tgggacacg 19

Claims (9)

1.一种非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,所述试剂盒由HNB-LAMP Mix、Primer Mix、5M Betain、Bst DNA Polymerase、去离子水、阴性对照和阳性对照组成,所述Primer Mix包含SEQ ID No.1- SEQ ID No.6的引物组。
2.根据权利要求1所述的非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,所述HNB-LAMPMix、5M Betain、Bst DNA Polymerase均为购自海基生物科技有限公司的LAMP-HNB变色扩增试剂盒中的2×HNB LAMP Mix、5M Betain、Bst2.0 DNA Polymerase,货号:A3802。
3.根据权利要求所述的非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,所述引物组包括:一对外引物、一对内引物、一对环引物,其核苷酸序列分别如下所示:
外引物:
4F3 ACGCAGAGATAAGCTT(SEQ ID No.1)
4B3 AAGGTAATCATCATCGC(SEQ ID No.2)
内引物:
4FIP TGATCGGATACGTAACGGGATAGAGATACAGCTCTTC(SEQ ID No.3)
4BIP CCGTAACTGCTCATGGTACGTAGTGGAAGGGTAT(SEQ ID No.4)
环引物
4LoopF ATAGATGAACATGCGTC(SEQ ID No.5)
4LoopB AGTTCTGCAGCTCTTA(SEQ ID No.6)
所述Primer Mix中4FIP、4BIP、4LoopF、4LoopB、4F3、4B3与去离子水的最佳配比为10∶10∶4∶4∶1∶1∶250。
4.根据权利要求1所述的非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,优选的,所述阳性对照为含有目的基因片段的质粒DNA,阴性对照为无菌水,优选采用双蒸水、三蒸水或者DEPC水。
5.根据权利要求1所述的非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,优选的,所述阳性对照为含有p72基因的质粒DNA。
6.根据权利要求1所述的非洲猪瘟病毒LAMP–HNB可视化检测试剂盒,优选的,所述p72基因的序列如SEQ ID No.7所示。
7.一种非洲猪瘟病毒LAMP-HNB可视化检测方法,包括如下步骤:
(1)提取待测样品DNA;
(2)环介导等温扩增反应:配置25μL反应体系,所述反应体系含有HNB LAMP Mix 12.5μl,Primer mix 7.5μl,5M Betain 2 μl,模板DNA 2μl,Bst DNA Polymerase 1μl,总量25μl,然后于63-68℃下反应30-60min;
(3)结果分析:通过肉眼观察反应管中溶液是否变色,若呈现天蓝色判定为阳性,呈现紫罗兰色则判定为阴性。
8.根据权利要求7所述检测方法,可以用于疾病的诊断,如非洲猪瘟的诊断;也可以用于非疾病的诊断目的。
9.根据权利要求1-6任一项所述的试剂盒在食品检测中的应用,其特征在于,将所述试剂盒用于生鲜猪肉、冷冻猪肉或者猪肉制品的检测,判断生鲜猪肉、冷冻猪肉或肉制品的原料肉是否存在非洲猪瘟病毒污染。
CN201910453760.0A 2019-05-28 2019-05-28 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒 Pending CN110283936A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910453760.0A CN110283936A (zh) 2019-05-28 2019-05-28 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910453760.0A CN110283936A (zh) 2019-05-28 2019-05-28 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN110283936A true CN110283936A (zh) 2019-09-27

Family

ID=68002788

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910453760.0A Pending CN110283936A (zh) 2019-05-28 2019-05-28 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN110283936A (zh)

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110791591A (zh) * 2019-11-18 2020-02-14 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与双基因缺失疫苗株的lamp检测引物及试剂盒
CN110885905A (zh) * 2019-11-12 2020-03-17 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的lamp检测引物及试剂盒
CN113234862A (zh) * 2021-06-16 2021-08-10 龙岩学院 非洲猪瘟病毒lamp检测引物组及试剂盒
CN113416799A (zh) * 2021-08-04 2021-09-21 国科宁波生命与健康产业研究院 一种检测非洲猪瘟病毒的cda引物组、试剂盒及其应用

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106521027A (zh) * 2016-11-03 2017-03-22 河北出入境检验检疫局检验检疫技术中心 非洲猪瘟病毒的实时等温重组酶聚合酶扩增检测试剂盒
CN109628644A (zh) * 2019-01-15 2019-04-16 许昌佰柯蛋白与基因工程研究院有限公司 一种用于非洲猪瘟病毒lamp检测的引物组、试剂盒及应用

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN106521027A (zh) * 2016-11-03 2017-03-22 河北出入境检验检疫局检验检疫技术中心 非洲猪瘟病毒的实时等温重组酶聚合酶扩增检测试剂盒
CN109628644A (zh) * 2019-01-15 2019-04-16 许昌佰柯蛋白与基因工程研究院有限公司 一种用于非洲猪瘟病毒lamp检测的引物组、试剂盒及应用

Non-Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
(美)詹姆斯H.约根森等: "《临床微生物学手册:第11版》", 31 August 2017, 中华医学电子音像出版社 *
VLASOVA,N.N. ET AL.: "African swine fever virus p72 (B646L) gene, complete cds, KJ195685.1", 《GENBANK》 *
曾军辉: "可视化环介导等温扩增技术研究进展", 《广东畜牧兽医科技》 *
杨吉飞等: "非洲猪瘟病毒环介导恒温扩增快速检测技术的建立及应用", 《中国动物传染病学报》 *
江彦增等: "非洲猪瘟病毒环介导等温扩增快速检测方法的建立", 《中国畜牧兽医》 *
王华等: "非洲猪瘟病毒环介导等温扩增诊断方法的建立", 《中国兽医科学》 *
王彩霞等: "环介导恒温扩增技术快速检测非洲猪瘟病毒", 《动物医学进展》 *
谭贵良等: "《现代分子生物学及组学技术在食品安全检测中的应用》", 30 June 2014, 中山大学出版社 *

Cited By (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110885905A (zh) * 2019-11-12 2020-03-17 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的lamp检测引物及试剂盒
CN110885905B (zh) * 2019-11-12 2023-09-12 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与基因缺失株的lamp检测引物及试剂盒
CN110791591A (zh) * 2019-11-18 2020-02-14 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与双基因缺失疫苗株的lamp检测引物及试剂盒
CN110791591B (zh) * 2019-11-18 2023-06-23 华南农业大学 一种区分非洲猪瘟病毒野毒株与双基因缺失疫苗株的lamp检测引物及试剂盒
CN113234862A (zh) * 2021-06-16 2021-08-10 龙岩学院 非洲猪瘟病毒lamp检测引物组及试剂盒
CN113416799A (zh) * 2021-08-04 2021-09-21 国科宁波生命与健康产业研究院 一种检测非洲猪瘟病毒的cda引物组、试剂盒及其应用
CN113416799B (zh) * 2021-08-04 2022-04-26 国科宁波生命与健康产业研究院 一种检测非洲猪瘟病毒的cda引物组、试剂盒及其应用

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN110093457A (zh) 一种非洲猪瘟病毒asfv-lamp检测引物组及试剂盒
CN110551846B (zh) 一种用于非洲猪瘟病毒核酸快速检测的Cpf1试剂盒及其检测方法
CN110004250A (zh) 一种非洲猪瘟病毒lamp可视化检测试剂盒
CN110283936A (zh) 一种非洲猪瘟病毒lamp-hnb可视化检测试剂盒
de Boer et al. Methodology for detection and typing of foodborne microorganisms
CN103757134B (zh) 非洲猪瘟病毒的荧光定量pcr检测试剂、试剂盒及其检测方法
CN104342503B (zh) 一种同时检测12种常见呼吸道病毒的方法
CN110283935A (zh) 一种非洲猪瘟病毒lamp检测试剂盒及其应用
CN110453011A (zh) 一种基于CRISPR/Cas12a快速精准检测非洲猪瘟病毒的方法及应用
CN104862420B (zh) Rpa‑侧流层析检测口蹄疫病毒气溶胶的引物、探针及试剂盒
CN106868166A (zh) 用于现场快速检测副结核分支杆菌的引物、探针及试剂盒
CN108048584A (zh) Raa荧光法检测布鲁氏杆菌的探针及试剂盒
CN107385019A (zh) 基于生物传感技术检测单核细胞增生李斯特氏菌的方法
CN108841996A (zh) 新城疫新型可视化重组酶聚合酶常温扩增核酸试纸条检测试剂盒及应用
CN110804670A (zh) 一种基于rpa-lfs快速检测副溶血弧菌的特异性引物对、试剂盒及应用
CN109609695A (zh) 检测猪流行性腹泻病毒的rpa-led可视化试剂盒
CN110358866A (zh) 新型鹅星状病毒SYBR Green染料法荧光定量PCR检测试剂盒
CN108060209A (zh) 一种重组酶恒温扩增结合免疫胶体金试纸条检测沙门氏菌的试剂盒及检测方法
CN109913565A (zh) 一种用于检测副溶血弧菌的试剂盒、引物对、探针及方法
CN108588277A (zh) 一种犬瘟热病毒可视化核酸检测方法
CN108504778A (zh) 一种同时检测猪圆环病毒2型和猪伪狂犬病毒的试剂盒及应用
CN105603123A (zh) 快速检测猪细小病毒的实时荧光rpa试剂盒、试纸条rpa试剂盒及其用途
CN104388594B (zh) 一种用于检测猪伪狂犬病毒的Taqman Real-time PCR试剂盒
Zeng et al. A polymerase chain reaction based lateral flow test strip with propidium monoazide for detection of viable Vibrio parahaemolyticus in codfish
CN111876502A (zh) 双重实时荧光定量pcr鉴定布鲁氏菌s2疫苗株的方法及其使用的成套试剂

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination