CN110283905A - 基于abca2荧光定量pcr诊断活动性结核病的试剂盒 - Google Patents

基于abca2荧光定量pcr诊断活动性结核病的试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明公开了基于ABCA2荧光定量PCR诊断活动性结核病的试剂盒。本发明采用荧光定量PCR检测活动性结核病患者PBMCs中的ABCA2基因的表达量。结果显示ABCA2在菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者PBMCs中的相对表达量均显著低于结核潜伏感染者和健康对照者。受试者工作特征曲线分析结果表明,ABCA2可区分活动性结核病和结核潜伏感染,成为诊断活动性结核病的诊断靶点。

Description

基于ABCA2荧光定量PCR诊断活动性结核病的试剂盒
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及基于ABCA2荧光定量PCR诊断活动性结核病的试剂盒。
背景技术
结核病(Tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,M.tb)感染引发的慢性传染性疾病,严重威胁人类健康。全国第五次结核病流行病学调查显示我国现有超过500万名成人活动性结核病患者。
常用的结核分枝杆菌感染诊断方法包括传统的结核菌素实验(TST)以及γ-干扰素释放试验(IGRAs)。TST方法容易受到卡介苗接种和非结核分枝杆菌的干扰,结核分枝杆菌感染诊断不够明确,更无法区分结核潜伏感染和活动性结核病。新近推行的IGRAs方法,虽然能够检测结核杆菌感染,但也无法区分结核潜伏感染和活动性结核病。因此区分活动性结核病和结核潜伏感染对于结核病的临床诊断具有重要的意义。
ABCA2是ABCA2蛋白(ATP-binding cassette transporterA2)的编码基因,ABCA2是ABC转运子家族的一员,表达于神经细胞、巨噬细胞、单核细胞和造血干细胞等多种组织,主要作用是保持细胞内脂类成分的内平衡和代谢。ABCA2也可表达于肿瘤细胞中,并且在肿瘤生长过程中ABCA2表达的增加会有助于肿瘤细胞的增殖。研究发现,ABCA2与早期动脉粥样硬化、丹吉尔病、小细胞肺癌、急性白血病和阿尔茨海默病等的发病相关,此外,ABCA2还与癌症化疗的耐药相关。但目前尚未发现ABCA2与结核病关系的研究报道。
发明内容
本发明的目的是诊断活动性结核病及区分活动性结核病和结核潜伏感染。
本发明首先保护检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质的新用途。
本发明提供了检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质在如下(a1)-(a16)中任一种中的应用:
(a1)诊断活动性结核病;
(a2)制备诊断活动性结核病的产品;
(a3)诊断待测者是否为活动性结核病患者;
(a4)制备诊断待测者是否为活动性结核病患者的产品;
(a5)诊断菌阳肺结核病;
(a6)制备诊断菌阳肺结核病的产品;
(a7)诊断待测者是否为菌阳肺结核病患者;
(a8)制备诊断待测者是否为菌阳肺结核病患者的产品;
(a9)诊断菌阴肺结核病;
(a10)制备诊断菌阴肺结核病的产品;
(a11)诊断待测者是否为菌阴肺结核病患者;
(a12)制备诊断待测者是否为菌阴肺结核病患者的产品;
(a13)诊断肺外结核病;
(a14)制备诊断肺外结核病的产品;
(a15)诊断待测者是否为肺外结核病患者;
(a16)制备诊断待测者是否为肺外结核病患者的产品。
本发明还提供了检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质在如下(b1)-(b16)中任一种中的应用:
(b1)区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染;
(b2)制备区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的产品;
(b3)诊断待测者为活动性结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b4)制备诊断待测者为活动性结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b5)区分或鉴别菌阳肺结核病和结核潜伏感染;
(b6)制备区分或鉴别菌阳肺结核病和结核潜伏感染的产品;
(b7)诊断待测者为菌阳肺结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b8)制备诊断待测者为菌阳肺结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b9)区分或鉴别菌阴肺结核病和结核潜伏感染;
(b10)制备区分或鉴别菌阴肺结核病和结核潜伏感染的产品;
(b11)诊断待测者为菌阴肺结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b12)制备诊断待测者为菌阴肺结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b13)区分或鉴别肺外结核病和结核潜伏感染;
(b14)制备区分或鉴别肺外结核病和结核潜伏感染的产品;
(b15)诊断待测者为肺外结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b16)制备诊断待测者为肺外结核病患者还是结核潜伏感染者的产品。
本发明还保护用于诊断活动性结核病的试剂盒或用于区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的试剂盒。
本发明提供的用于诊断活动性结核病的试剂盒或用于区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的试剂盒包括检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质。
上述用于诊断活动性结核病的试剂盒还包含数据处理装置甲;所述数据处理装置甲由数据输入模块甲、数据记录模块甲、数据比较模块甲和结论输出模块甲组成;
所述数据输入模块甲用于输入ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据记录模块甲用于存储ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据比较模块甲用于将待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量数值和阈值进行比较;所述阈值为0.01701;
所述结论输出模块甲用于显示结论,即如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.01701,则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.01701,则待测者不为或疑似不为活动性结核病患者。
上述用于区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的试剂盒还包含数据处理装置乙;所述数据处理装置乙由数据输入模块乙、数据记录模块乙、数据比较模块乙和结论输出模块乙组成;
所述数据输入模块乙用于输入ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据记录模块乙用于存储ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据比较模块乙用于将待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量数值和阈值进行比较;所述阈值为0.02124;
所述结论输出模块乙用于显示结论,即如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.02124,则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.02124,则待测者为或疑似为结核潜伏感染者。
上述任一所述的应用或试剂盒中,所述活动性结核病包括菌阳肺结核病、菌阴肺结核病和肺外结核病。
上述任一所述的应用或试剂盒中,所述检测ABCA2基因或检测ABCA2基因编码的mRNA或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质可为检测ABCA2基因或检测ABCA2基因编码的mRNA或检测ABCA2基因编码的蛋白所需的试剂和/或仪器。
所述检测ABCA2基因或检测ABCA2基因编码的mRNA或检测ABCA2基因编码的蛋白所需的试剂和/或仪器可为检测ABCA2基因相对表达量的试剂和/或仪器。
所述相对表达量为ABCA2基因参比内参基因的相对表达量。
进一步的,所述试剂包括由序列1所示的单链DNA分子和序列2所示的单链DNA分子组成的引物对。
所述仪器包括荧光定量PCR仪,具体可为Ⅱ荧光定量PCR仪。
更进一步的,所述内参基因具体可为GAPDH基因。所述试剂还包括用于扩增GAPDH基因的由序列4所示的单链DNA分子和序列5所示的单链DNA分子组成的引物对。
所述相对表达量的计算方法具体如下:以待测者cDNA为模板,采用上述引物对进行实时荧光定量PCR,然后使用2-ΔCt法计算获得。所述待测者cDNA可为待测者外周血中分离的PBMCs的cDNA。
所述实时荧光定量PCR的体系可采用KAPATM 快速定量PCR试剂盒进行配制,具体如下:2×Green Master Mix 10μL,正向引物(浓度为10μM)0.4μL,反向引物(浓度为10μM)0.4μL,cDNA(5-20ng)2μL,用无核酶水补足总体系20μL。正向引物和反向引物分别为用于扩增ABCA2基因的序列1所示的单链DNA分子和序列2所示的单链DNA分子或用于扩增GAPDH基因的序列4所示的单链DNA分子和序列5所示的单链DNA分子。
所述实时荧光定量PCR的反应条件具体如下:预变性:95℃3min;扩增反应:95℃5s,60℃30s,在延伸阶段检测荧光信号,40个循环。
ABCA2基因或ABCA2蛋白作为标志物在开发活动性结核病和/或菌阳肺结核病和/或菌阴肺结核病和/或肺外结核病的诊断试剂中的应用也属于本发明的保护范围。
上述引物对也属于本发明的保护范围。
上述任一所述的应用或试剂盒中,所述ABCA2基因序列如序列表中的序列6所示,所述ABCA2蛋白的氨基酸序列如序列表中的序列7所示。
本发明采用荧光定量PCR检测活动性结核病患者PBMCs中的ABCA2基因的表达量。结果显示ABCA2在菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者PBMCs中的相对表达量均显著低于结核潜伏感染者和健康对照者。受试者工作特征曲线分析结果表明,ABCA2可区分活动性结核病和结核潜伏感染,成为诊断活动性结核病的诊断靶点。
附图说明
图1为实时荧光定量PCR检测菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者、肺外结核病患者和潜伏感染者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图2为实时荧光定量PCR检测菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者、肺外结核病患者和健康对照者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图3为ROC曲线分析菌阳肺结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图4为ROC曲线分析菌阴肺结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图5为ROC曲线分析肺外结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图6为ROC曲线分析菌阳肺结核病患者和健康对照者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图7为ROC曲线分析菌阴肺结核病患者和健康对照者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图8为ROC曲线分析肺外结核病患者和健康对照者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图9为ROC曲线分析活动性结核病患者(包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者、肺外结核病患者)和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的表达水平。
图10为ROC曲线分析活动性结核病患者(包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者、肺外结核病患者)和健康对照者PBMCs中ABCA2的表达水平。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
下述实施例中的ABCA2基因序列如序列表中的序列6所示,ABCA2蛋白的氨基酸序列如序列表中的序列7所示。
下述实施例中的活动性结核病包括菌阳肺结核病、菌阴肺结核病和肺外结核病。
活动性结核病是指由结核分枝杆菌感染引起的慢性传染病。发生于肺组织、气管、支气管和胸膜的结核病变称之为肺结核,发生于其它部位的结核病变称之为肺外结核。
菌阳肺结核病是指痰涂片阳性或痰培养阳性的肺结核,菌阴肺结核病是指临床诊断的痰涂片阴性和/或痰培养阴性的肺结核。
实施例1、活动性结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中的ABCA2表达水平检测及其关联性分析
一、实验材料和方法
1、外周血样本的获得
受试者外周血样本:来源于151例患者和31例健康者的外周血样本。151例患者由120例活动性结核病患者和31例结核潜伏感染者组成,其中,120例活动性结核病患者的具体组成如下:经临床确诊的43例菌阳肺结核病患者、经临床确诊的59例菌阴肺结核病患者、经临床确诊的18例肺外结核病患者。
外周血样本的获得方法具体如下:分别抽取151例患者和31例健康者(均知情同意)的外周血2-3mL,置于含EDTA抗凝采血管,上下颠倒5-6次(目的为抗凝液和外周血混匀),得到外周血标本。
2、外周血单个核细胞(PBMCs)的分离
分离受试者外周血单个核细胞(PBMCs)。具体步骤如下(6h内完成下述步骤):采集受试者抗凝外周血2mL,先用基础培养基RPMI-1640进行1:1稀释,然后用淋巴细胞分离液进行密度梯度离心(Ficoll,GE Biosciences,USA),收集中间单个核细胞层的细胞,再用RPMI-1640培养基洗两遍,得到PBMCs。
3、RNA的提取
使用TRIzolTM Reagent(Invitrogen,USA)分别提取每个样本的PBMCs的RNA。具体步骤如下:向每个样本的PBMCs中加入0.5mL TRIzol和0.1mL氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟;12000g、4℃离心15分钟,分离上层无色水相,然后加入0.25mL异丙醇,颠倒数次混匀,室温沉淀10min;12000g、4℃离心10分钟,弃上清,用1mL含75%乙醇的无核酶水清洗RNA沉淀;7500g、4℃离心10分钟,弃上清,RNA沉淀置于冰上晾干(5-10min),用30μL无核酶水溶解RNA沉淀,-80℃度保存备用。
4、cDNA的合成
使用PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser(TaKaRaBiotechnology,Japan)将步骤3提取的RNA进行反转录,得到cDNA。具体步骤如下:先去除基因组DNA,反应体系为:5×gDNA Eraser Buffer 2μL,gDNA Eraser 1μL,RNA 0.5μg,用无核酶水补至10μL。反应条件为:42℃反应2min。然后进行反转录,反应体系为:去除基因组DNA的反应液10μL,RT Enzyme Mix I 1μL,RT Primer Mix 1μL,5×PrimerScript Buffer 4μL,用无核酶水补至20μL。反转录条件为:37℃15min,85℃5s。
5、引物序列和合成
委托上海生工生物科技有限公司合成引物,并使用HPLC纯化,引物序列如表1所示。
表1、引物序列
6、实时荧光定量PCR(RT-PCR)
采用KAPATM 快速定量PCR试剂盒(Kapa Biosystems,USA)配制定量PCR体系:2×Green Master Mix 10μL,正向引物(浓度为10μM)0.4μL,反向引物(浓度为10μM)0.4μL,cDNA(5-20ng)2μL,用无核酶水补足总体系20μL。以GAPDH基因作为内参基因。正向引物和反向引物分别为ABCA2-F和ABCA2-R或GAPDH-F和GAPDH-R。使用罗氏公司的Ⅱ荧光定量PCR仪进行荧光定量PCR检测。反应条件:预变性:95℃3min;扩增反应:95℃5s,60℃30s,在延伸阶段检测荧光信号,40个循环。使用2-ΔCt计算相对表达量。
7、统计分析
使用GraphPad Prism 5进行统计分析。
二、实验结果
1、活动性结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中的ABCA2相对表达量
采用RT-PCR检测43例菌阳肺结核病患者、59例菌阴肺结核病患者、18例肺外结核病患者、31例结核潜伏感染者PBMCs中的ABCA2相对表达量。结果如图1所示,结果显示ABCA2在活动性结核病患者,包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者PBMCs中的相对表达量均显著低于结核潜伏感染者(p<0.0001)。说明ABCA2的表达量在区分活动性结核病患者和结核潜伏感染者方面具有重要价值。
2、活动性结核病患者和健康者PBMCs中的ABCA2相对表达量
采用RT-PCR检测43例菌阳肺结核病患者、59例菌阴肺结核病患者、18例肺外结核病患者和31例健康者PBMCs中的ABCA2相对表达量。结果如图2所示,结果显示ABCA2在活动性结核病患者,包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者PBMCs中的相对表达量均显著低于健康者(p<0.0001)。说明ABCA2的表达量在诊断活动性结核病方面具有重要价值。
3、菌阳肺结核病患者和结核潜伏感染者的工作特征曲线分析
根据菌阳肺结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图3所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9306,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在区分菌阳肺结核病患者和结核潜伏感染者方面具有重要价值。
4、菌阴肺结核病患者和结核潜伏感染者的工作特征曲线分析
根据菌阴肺结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图4所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9183,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在区分菌阴肺结核病患者和结核潜伏感染者方面具有重要价值。
5、肺外结核病患者和结核潜伏感染者的工作特征曲线分析
根据肺外结核病患者和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图5所示,结果显示ROC曲线下面积为0.8853,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在区分肺外结核病患者和结核潜伏感染者方面具有重要价值。
6、菌阳肺结核病患者和健康者的工作特征曲线分析
根据菌阳肺结核病患者和健康者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPadPrism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图6所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9377,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在诊断菌阳肺结核病方面具有重要价值。
7、菌阴肺结核病患者和健康者的工作特征曲线分析
根据菌阴肺结核病患者和健康者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPadPrism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图7所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9196,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在诊断菌阴肺结核病方面具有重要价值。
8、肺外结核病患者和健康者的工作特征曲线分析
根据肺外结核病患者和健康者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图8所示,结果显示ROC曲线下面积为0.8889,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在诊断肺外结核病方面具有重要价值。
9、活动性结核病患者和结核潜伏感染者的工作特征曲线分析
根据活动性结核病患者(包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者)和结核潜伏感染者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图9所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9177,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在区分活动性结核病患者与结核潜伏感染者方面具有重要价值。
10、活动性结核病患者和健康对照者的工作特征曲线分析
根据活动性结核病患者(包括菌阳肺结核病患者、菌阴肺结核病患者和肺外结核病患者)和健康对照者PBMCs中ABCA2的相对表达量,使用GraphPad Prism 5进行受试者工作特征曲线分析。结果如图10所示,结果显示ROC曲线下面积为0.9215,p<0.0001。说明ABCA2的表达量在诊断活动性结核病方面具有重要价值。
在实际应用中,可根据如下判断标准区分活动性结核病患者与结核潜伏感染者:如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.02124(灵敏度为92.5%,置信区间为86.24%~96.51%;特异性为80.65%,置信区间为62.53%~92.55%),则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.02124,则待测者为或疑似为结核潜伏感染者。
还可根据如下判断标准诊断活动性结核病:如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.01701(灵敏度为82.5%,置信区间为74.5%~88.83%;特异性为87.1%,置信区间为70.17%~96.37%),则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.01701,则待测者不为或疑似不为活动性结核病患者。
以上对本发明进行了详述。对于本领域技术人员来说,在不脱离本发明的宗旨和范围,以及无需进行不必要的实验情况下,可在等同参数、浓度和条件下,在较宽范围内实施本发明。虽然本发明给出了特殊的实施例,应该理解为,可以对本发明作进一步的改进。总之,按本发明的原理,本申请欲包括任何变更、用途或对本发明的改进,包括脱离了本申请中已公开范围,而用本领域已知的常规技术进行的改变。按以下附带的权利要求的范围,可以进行一些基本特征的应用。
序列表
<110>中国人民解放军总医院第八医学中心
<120>基于ABCA2荧光定量PCR诊断活动性结核病的试剂盒
<160>7
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>1
ctcgtgcacc tcatgaccag 20
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>2
gagtcacgtt gcccacaaaa 20
<210>3
<211>115
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>3
ctcgtgcacc tcatgaccag caaccccaaa atcctgtacg cgcctgcggg ctctgaggtc 60
gaccgcgtca tcctcaaggc caacgagact tttgcttttg tgggcaacgt gactc 115
<210>4
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>4
tgttgccatc aatgacccct 20
<210>5
<211>20
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>5
tcgccccact tgattttgga 20
<210>6
<211>8103
<212>DNA
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>6
gcgcgggcga tgcccagcgg cgcggcgggc tgcggggccc ggcggggcgc gcagaggagc 60
gggccgcggc gctgaggcgg cggagcgtgg ccccgccatg ggcttcctgc accagctgca 120
gctgctgctc tggaagaacg tgacgctcaa acgccggagc ccgtgggtcc tggccttcga 180
gatcttcatc cccctggtgc tgttctttat cctgctgggg ctgcgacaga agaagcccac 240
catctccgtg aaggaagtct ccttctacac agcggcgccc ctgacgtctg ccggcatcct 300
gcctgtcatg caatcgctgt gcccggacgg ccagcgagac gagttcggct tcctgcagta 360
cgccaactcc acggtcacgc agctgcttga gcgcctggac cgcgtggtgg aggaaggcaa 420
cctgtttgac ccagcgcggc ccagcctggg ctcagagctc gaggccctac gccagcatct 480
ggaggccctc agtgcgggcc cgggcacctc ggggagccac ctggacagat ccacagtgtc 540
ttccttctct ctggactcgg tggccagaaa cccgcaggag ctctggcgtt tcctgacgca 600
aaacttgtcg ctgcccaata gcacggccca agcactcttg gccgcccgtg tggacccgcc 660
cgaggtctac cacctgctct ttggtccctc atctgccctg gattcacagt ctggcctcca 720
caagggtcag gagccctgga gccgcctagg gggcaatccc ctgttccgga tggaggagct 780
gctgctggct cctgccctcc tggagcagct cacctgcacg ccgggctcgg gggagctggg 840
ccggatcctc actgtgcctg agagtcagaa gggagccctg cagggctacc gggatgctgt 900
ctgcagtggg caggctgctg cgcgtgccag gcgcttctct gggctgtctg ctgagctccg 960
gaaccagctg gacgtggcca aggtctccca gcagctgggc ctggatgccc ccaacggctc 1020
ggactcctcg ccacaggcgc cacccccacg gaggctgcag gcgcttctgg gggacctgct 1080
ggatgcccag aaggttctgc aggatgtgga tgtcctgtcg gccctggccc tgctactgcc 1140
ccagggtgcc tgcactggcc ggacccccgg acccccagcc agtggtgcgg gtggggcggc 1200
caatggcact ggggcagggg cagtcatggg ccccaacgcc accgctgagg agggcgcacc 1260
ctctgctgca gcactggcca ccccggacac gctgcagggc cagtgctcag ccttcgtaca 1320
gctctgggcc ggcctgcagc ccatcttgtg tggcaacaac cgcaccattg aacccgaggc 1380
gctgcggcgg ggcaacatga gctccctggg cttcacgagc aaggagcagc ggaacctggg 1440
cctcctcgtg cacctcatga ccagcaaccc caaaatcctg tacgcgcctg cgggctctga 1500
ggtcgaccgc gtcatcctca aggccaacga gacttttgct tttgtgggca acgtgactca 1560
ctatgcccag gtctggctca acatctcggc ggagatccgc agcttcctgg agcagggcag 1620
gctgcagcaa cacctgcgct ggctgcagca gtatgtagca gagctgcggc tgcaccccga 1680
ggcactgaac ctgtcactgg atgagctgcc gccggccctg agacaggaca acttctcgct 1740
gcccagtggc atggccctcc tgcagcagct ggataccatt gacaacgcgg cctgcggctg 1800
gatccagttc atgtccaagg tgagcgtgga catcttcaag ggcttccccg acgaggagag 1860
cattgtcaac tacaccctca accaggccta ccaggacaac gtcactgttt ttgccagtgt 1920
gatcttccag acccggaagg acggctcgct cccgcctcac gtgcactaca agatccgcca 1980
gaactccagc ttcaccgaga aaaccaacga gatccgccgc gcctactggc ggcctgggcc 2040
caatactggc ggccgcttct acttcctcta cggcttcgtc tggatccagg acatgatgga 2100
gcgcgccatc atcgacactt ttgtggggca cgatgtggtg gagccaggca gctacgtgca 2160
gatgttcccc tacccctgct acacacgcga tgacttcctg tttgtcattg agcacatgat 2220
gccgctgtgc atggtgatct cctgggtcta ctccgtggcc atgaccatcc agcacatcgt 2280
ggcggagaag gagcaccggc tcaaggaggt gatgaagacc atgggcctga acaacgcggt 2340
gcactgggtg gcctggttca tcaccggctt tgtgcagctg tccatctccg tgacagcact 2400
caccgccatc ctgaagtacg gccaggtgct tatgcacagc cacgtggtca tcatctggct 2460
cttcctggca gtctacgcgg tggccaccat catgttctgc ttcctggtgt ctgtgctgta 2520
ctccaaggcc aagctggcct cggcctgcgg tggcatcatc tacttcctga gctacgtgcc 2580
ctacatgtac gtggcgatcc gagaggaggt ggcgcatgat aagatcacgg ccttcgagaa 2640
gtgcatcgcg tccctcatgt ccacgacggc ctttggtctg ggctctaagt acttcgcgct 2700
gtatgaggtg gccggcgtgg gcatccagtg gcacaccttc agccagtccc cggtggaggg 2760
ggacgacttc aacttgctcc tggctgtcac catgctgatg gtggacgccg tggtctatgg 2820
catcctcacg tggtacattg aggctgtgca cccaggcatg tacgggctgc cccggccctg 2880
gtacttccca ctgcagaagt cctactggct gggcagtggg cggacagaag cctgggagtg 2940
gagctggccg tgggcacgca ccccccgcct cagtgtcatg gaggaggacc aggcctgtgc 3000
catggagagc cggcgctttg aggagacccg tggcatggag gaggagccca cccacctgcc 3060
tctggttgtc tgcgtggaca aactcaccaa ggtctacaag gacgacaaga agctggccct 3120
gaacaagctg agcctgaacc tctacgagaa ccaggtggtc tccttcttgg gccacaacgg 3180
ggcgggcaag accaccacca tgtccatcct gaccggcctg ttccctccaa cgtcgggttc 3240
cgccaccatc tacgggcacg acatccgcac ggagatggat gagatccgca agaacctggg 3300
catgtgcccg cagcacaatg tgctctttga ccggctcacg gtggaggaac acctctggtt 3360
ctactcacgg ctcaagagca tggctcagga ggagatccgc agagagatgg acaagatgat 3420
cgaggacctg gagctctcca acaaacggca ctcactggtg cagacattgt cgggtggcat 3480
gaagcgcaag ctgtccgtgg ccatcgcctt cgtgggcggc tctcgcgcca tcatcctgga 3540
cgagcccacg gcgggcgtgg acccctacgc gcgccgcgcc atctgggacc tcatcctgaa 3600
gtacaagcca ggccgcacca tccttctgtc cacccaccac atggatgagg ctgacctgct 3660
tggggaccgc attgccatca tctcccatgg gaagctcaag tgctgcggct ccccgctctt 3720
cctcaagggc acctatggcg acgggtaccg cctcacgctg gtcaagcggc ccgccgagcc 3780
ggggggcccc caagagccag ggctggcatc cagcccccca ggtcgggccc cgctgagcag 3840
ctgctccgag ctccaggtgt cccagttcat ccgcaagcat gtggcctcct gcctgctggt 3900
ctcagacaca agcacggagc tctcctacat cctgcccagc gaggccgcca agaagggggc 3960
tttcgagcgc ctcttccagc acctggagcg cagcctggat gcactgcacc tcagcagctt 4020
cgggctgatg gacacgaccc tggaggaagt gttcctcaag gtgtcggagg aggatcagtc 4080
gctggagaac agtgaggccg atgtgaagga gtccaggaag gatgtgctcc ctggggcgga 4140
gggcccggcg tctggggagg gtcacgctgg caatctggcc cggtgctcgg agctgaccca 4200
gtcgcaggca tcgctgcagt cggcgtcatc tgtgggctct gcccgtggcg acgagggagc 4260
tggctacacc gacgtctatg gcgactaccg ccccctcttt gataacccac aggacccaga 4320
caatgtcagc ctgcaagagg tggaggcaga ggccctgtcg agggtcggcc agggcagccg 4380
caagctggac ggcgggtggc tgaaggtgcg ccagttccac gggctgctgg tcaaacgctt 4440
ccactgcgcc cgccgcaact ccaaggcact cttctcccag atcttgctgc cagccttctt 4500
cgtctgcgtg gccatgaccg tggccctgtc cgtcccggag attggtgatc tgcccccgct 4560
ggtcctgtca ccttcccagt accacaacta cacccagccc cgtggcaatt tcatccccta 4620
cgccaacgag gagcgccgcg agtaccggct gcggctatcg cccgacgcca gcccccagca 4680
gctcgtgagc acgttccggc tgccgtcggg ggtgggtgcc acctgcgtgc tcaagtctcc 4740
cgccaacggc tcgctggggc ccacgttgaa cctgagcagc ggggagtcgc gcctgctggc 4800
ggctcggttc ttcgacagca tgtgtctgga gtccttcaca caggggctgc cactgtccaa 4860
tttcgtgcca cccccaccct cgcccgcccc atctgactcg ccagcgtccc cggatgagga 4920
cctgcaggcc tggaacgtct ccctgccgcc caccgctggg ccagaaatgt ggacgtcggc 4980
accctccctg ccgcgcctgg tacgggagcc cgtccgctgc acctgctctg cgcagggcac 5040
cggcttctcc tgccccagca gtgtgggcgg gcacccgccc cagatgcggg tggtcacagg 5100
cgacatcctg accgacatca ccggccacaa tgtctctgag tacctgctct tcacctccga 5160
ccgcttccga ctgcaccggt atggggccat cacctttgga aacgtcctga agtccatccc 5220
agcctcattt ggcaccaggg ccccacccat ggtgcggaag atcgcggtgc gcagggctgc 5280
ccaggttttc tacaacaaca agggctatca cagcatgccc acctacctca acagcctcaa 5340
caacgccatc ctgcgtgcca acctgcccaa gagcaagggc aacccggcgg cttacggcat 5400
caccgtcacc aaccacccca tgaataagac cagcgccagc ctctccctgg attacctgct 5460
gcagggcacg gatgtcgtca tcgccatctt catcatcgtg gccatgtcct tcgtgccggc 5520
cagcttcgtt gtcttcctcg tggccgagaa gtccaccaag gccaagcacc tgcagtttgt 5580
cagcggctgc aaccccatca tctactggct ggcgaactac gtgtgggaca tgctcaacta 5640
cctggtcccc gctacctgct gtgtcatcat cctgtttgtg ttcgacctgc cggcctacac 5700
gtcgcccacc aacttccctg ccgtcctctc cctcttcctg ctctatgggt ggtccatcac 5760
gcccatcatg tacccggcct ccttctggtt cgaggtcccc agctccgcct acgtgttcct 5820
cattgtcatc aatctcttca tcggcatcac cgccaccgtg gccaccttcc tgctacagct 5880
cttcgagcac gacaaggacc tgaaggttgt caacagttac ctgaaaagct gcttcctcat 5940
tttccccaac tacaacctgg gccacgggct catggagatg gcctacaacg agtacatcaa 6000
cgagtactac gccaagattg gccagtttga caagatgaag tccccgttcg agtgggacat 6060
tgtcacccgc ggactggtgg ccatggcggt tgagggcgtc gtgggcttcc tcctgaccat 6120
catgtgccag tacaacttcc tgcggcggcc acagcgcatg cctgtgtcta ccaagcctgt 6180
ggaggatgat gtggacgtgg ccagtgagcg gcagcgagtg ctccggggag acgccgacaa 6240
tgacatggtc aagattgaga acctgaccaa ggtctacaag tcccggaaga ttggccgtat 6300
cctggccgtt gaccgcctgt gcctgggtgt gcgtcctggc gagtgcttcg ggctcctggg 6360
cgtcaacggt gcgggcaaga ccagcacctt caagatgctg accggcgacg agagcacgac 6420
ggggggcgag gccttcgtca atggacacag cgtgctgaag gagctgctcc aggtgcagca 6480
gagcctcggc tactgcccgc agtgtgacgc gctgttcgac gagctcacgg cccgggagca 6540
cctgcagctg tacacgcggc tgcgtgggat ctcctggaag gacgaggccc gggtggtgaa 6600
gtgggctctg gagaagctgg agctgaccaa gtacgcagac aagccggctg gcacctacag 6660
cggcggcaac aagcggaagc tctccacggc catcgccctc attgggtacc cagccttcat 6720
cttcctggac gagcccacca caggcatgga ccccaaggcc cggcgcttcc tctggaacct 6780
catccttgac ctcatcaaga cagggcgttc agtggtgctg acatcacaca gcatggagga 6840
gtgcgaggcg ctgtgcacgc ggctggccat catggtgaac ggtcgcctgc ggtgcctggg 6900
cagcatccag cacctgaaga accggtttgg agatggctac atgatcacgg tgcggaccaa 6960
gagcagccag agtgtgaagg acgtggtgcg gttcttcaac cgcaacttcc cggaagccat 7020
gctcaaggag cggcaccaca caaaggtgca gtaccagctc aagtcggagc acatctcgct 7080
ggcccaggtg ttcagcaaga tggagcaggt gtctggcgtg ctgggcatcg aggactactc 7140
ggtcagccag accacactgg acaatgtgtt cgtgaacttt gccaagaagc agagtgacaa 7200
cctggagcag caggagacgg agccgccatc cgcactgcag tcccctctcg gctgcttgct 7260
cagcctgctc cggccccggt ctgcccccac ggagctccgg gcacttgtgg cagacgagcc 7320
cgaggacctg gacacggagg acgagggcct catcagcttc gaggaggagc gggcccagct 7380
gtccttcaac acggacacgc tctgctgacc acccagagct gggccaggga ggacacgctc 7440
cactgaccac ccagagctgg gccagggact caacaatggg gacagaagtc ccccagtgcc 7500
tgccagggcc tggagtggag gttcaggacc aaggggcttc tggtcctcca gcccctgtac 7560
tcggccatgc cctgtggtca ctgcggttgc cgcccctaat tgtgccaaag gctgacccgg 7620
cccgggctgc gtacaccctt gccctgcttt gccttaaagc ctcggggtct gcccggcccc 7680
tcgcccctgc ctggcactgc tcaccgccca aggcgacgcc ggctggacca ggcactgctg 7740
gcctttctcc tgcccggcct cggaaccagc ttttctctct tacgatgaag gctgatgccg 7800
agagcgggct gtgggcggag ctgggtcagt cccgtattta ttttgctttg agaagaggct 7860
cctctggccc tgctctcctg cagggaggtg gctgtcctgc gggaagccat cagcttgggc 7920
cagctggcag gtggcaggaa tggagaagct gaccctgctg gccaggcaag gggccagacc 7980
ccccccaacc cccagctgcc atcgctctcc cacccagctt ggccccctgc ccgcccacct 8040
ccctgggagc cgggcctgta catagcgcac agatgtttgt tttaaataaa taaacaaaat 8100
gtc 8103
<210>7
<211>2436
<212>PRT
<213>人工序列(Artificial Sequence)
<400>7
Met Gly Phe Leu His Gln Leu Gln Leu Leu Leu Trp Lys Asn Val Thr
1 5 10 15
Leu Lys Arg Arg Ser Pro Trp Val Leu Ala Phe Glu Ile Phe Ile Pro
20 25 30
Leu Val Leu Phe Phe Ile Leu Leu Gly Leu Arg Gln Lys Lys Pro Thr
35 40 45
Ile Ser Val Lys Glu Val Ser Phe Tyr Thr Ala Ala Pro Leu Thr Ser
50 55 60
Ala Gly Ile Leu Pro Val Met Gln Ser Leu Cys Pro Asp Gly Gln Arg
65 70 75 80
Asp Glu Phe Gly Phe Leu Gln Tyr Ala Asn Ser Thr Val Thr Gln Leu
85 90 95
Leu Glu Arg Leu Asp Arg Val Val Glu Glu Gly Asn Leu Phe Asp Pro
100 105 110
Ala Arg Pro Ser Leu Gly Ser Glu Leu Glu Ala Leu Arg Gln His Leu
115 120 125
Glu Ala Leu Ser Ala Gly Pro Gly Thr Ser Gly Ser His Leu Asp Arg
130 135 140
Ser Thr Val Ser Ser Phe Ser Leu Asp Ser Val Ala Arg Asn Pro Gln
145 150 155 160
Glu Leu Trp Arg Phe Leu Thr Gln Asn Leu Ser Leu Pro Asn Ser Thr
165 170 175
Ala Gln Ala Leu Leu Ala Ala Arg Val Asp Pro Pro Glu Val Tyr His
180 185 190
Leu Leu Phe Gly Pro Ser Ser Ala Leu Asp Ser Gln Ser Gly Leu His
195 200 205
Lys Gly Gln Glu Pro Trp Ser Arg Leu Gly Gly Asn Pro Leu Phe Arg
210 215 220
Met Glu Glu Leu Leu Leu Ala Pro Ala Leu Leu Glu Gln Leu Thr Cys
225 230 235 240
Thr Pro Gly Ser Gly Glu Leu Gly Arg Ile Leu Thr Val Pro Glu Ser
245 250 255
Gln Lys Gly Ala Leu Gln Gly Tyr Arg Asp Ala Val Cys Ser Gly Gln
260 265 270
Ala Ala Ala Arg Ala Arg Arg Phe Ser Gly Leu Ser Ala Glu Leu Arg
275 280 285
Asn Gln Leu Asp Val Ala Lys Val Ser Gln Gln Leu Gly Leu Asp Ala
290 295 300
Pro Asn Gly Ser Asp Ser Ser Pro Gln Ala Pro Pro Pro Arg Arg Leu
305 310 315 320
Gln Ala Leu Leu Gly Asp Leu Leu Asp Ala Gln Lys Val Leu Gln Asp
325 330 335
Val Asp Val Leu Ser Ala Leu Ala Leu Leu Leu Pro Gln Gly Ala Cys
340 345 350
Thr Gly Arg Thr Pro Gly Pro Pro Ala Ser Gly Ala Gly Gly Ala Ala
355 360 365
Asn Gly Thr Gly Ala Gly Ala Val Met Gly Pro Asn Ala Thr Ala Glu
370 375 380
Glu Gly Ala Pro Ser Ala Ala Ala Leu Ala Thr Pro Asp Thr Leu Gln
385 390 395 400
Gly Gln Cys Ser Ala Phe Val Gln Leu Trp Ala Gly Leu Gln Pro Ile
405 410 415
Leu Cys Gly Asn Asn Arg Thr Ile Glu Pro Glu Ala Leu Arg Arg Gly
420 425 430
Asn Met Ser Ser Leu Gly Phe Thr Ser Lys Glu Gln Arg Asn Leu Gly
435 440 445
Leu Leu Val His Leu Met Thr Ser Asn Pro Lys Ile Leu Tyr Ala Pro
450 455 460
Ala Gly Ser Glu Val Asp Arg Val Ile Leu Lys Ala Asn Glu Thr Phe
465 470 475 480
Ala Phe Val Gly Asn Val Thr His Tyr Ala Gln Val Trp Leu Asn Ile
485 490 495
Ser Ala Glu Ile Arg Ser Phe Leu Glu Gln Gly Arg Leu Gln Gln His
500 505 510
Leu Arg Trp Leu Gln Gln Tyr Val Ala Glu Leu Arg Leu His Pro Glu
515 520 525
Ala Leu Asn Leu Ser Leu Asp Glu Leu Pro Pro Ala Leu Arg Gln Asp
530 535 540
Asn Phe Ser Leu Pro Ser Gly Met Ala Leu Leu Gln Gln Leu Asp Thr
545 550 555 560
Ile Asp Asn Ala Ala Cys Gly Trp Ile Gln Phe Met Ser Lys Val Ser
565 570 575
Val Asp Ile Phe Lys Gly Phe Pro Asp Glu Glu Ser Ile Val Asn Tyr
580 585 590
Thr Leu Asn Gln Ala Tyr Gln Asp Asn Val Thr Val Phe Ala Ser Val
595 600 605
Ile Phe Gln Thr Arg Lys Asp Gly Ser Leu Pro Pro His Val His Tyr
610 615 620
Lys Ile Arg Gln Asn Ser Ser Phe Thr Glu Lys Thr Asn Glu Ile Arg
625 630 635 640
Arg Ala Tyr Trp Arg Pro Gly Pro Asn Thr Gly Gly Arg Phe Tyr Phe
645 650 655
Leu Tyr Gly Phe Val Trp Ile Gln Asp Met Met Glu Arg Ala Ile Ile
660 665 670
Asp Thr Phe Val Gly His Asp Val Val Glu Pro Gly Ser Tyr Val Gln
675 680 685
Met Phe Pro Tyr Pro Cys Tyr Thr Arg Asp Asp Phe Leu Phe Val Ile
690 695 700
Glu His Met Met Pro Leu Cys Met Val Ile Ser Trp Val Tyr Ser Val
705 710 715 720
Ala Met Thr Ile Gln His Ile Val Ala Glu Lys Glu His Arg Leu Lys
725 730 735
Glu Val Met Lys Thr Met Gly Leu Asn Asn Ala Val His Trp Val Ala
740 745 750
Trp Phe Ile Thr Gly Phe Val Gln Leu Ser Ile Ser Val Thr Ala Leu
755 760 765
Thr Ala Ile Leu Lys Tyr Gly Gln Val Leu Met His Ser His Val Val
770 775 780
Ile Ile Trp Leu Phe Leu Ala Val Tyr Ala Val Ala Thr Ile Met Phe
785 790 795 800
Cys Phe Leu Val Ser Val Leu Tyr Ser Lys Ala Lys Leu Ala Ser Ala
805 810 815
Cys Gly Gly Ile Ile Tyr Phe Leu Ser Tyr Val Pro Tyr Met Tyr Val
820 825 830
Ala Ile Arg Glu Glu Val Ala His Asp Lys Ile Thr Ala Phe Glu Lys
835 840 845
Cys Ile Ala Ser Leu Met Ser Thr Thr Ala Phe Gly Leu Gly Ser Lys
850 855 860
Tyr Phe Ala Leu Tyr Glu Val Ala Gly Val Gly Ile Gln Trp His Thr
865 870 875 880
Phe Ser Gln Ser Pro Val Glu Gly Asp Asp Phe Asn Leu Leu Leu Ala
885 890 895
Val Thr Met Leu Met Val Asp Ala Val Val Tyr Gly Ile Leu Thr Trp
900 905 910
Tyr Ile Glu Ala Val His Pro Gly Met Tyr Gly Leu Pro Arg Pro Trp
915 920 925
Tyr Phe Pro Leu Gln Lys Ser Tyr Trp Leu Gly Ser Gly Arg Thr Glu
930 935 940
Ala Trp Glu Trp Ser Trp Pro Trp Ala Arg Thr Pro Arg Leu Ser Val
945 950 955 960
Met Glu Glu Asp Gln Ala Cys Ala Met Glu Ser Arg Arg Phe Glu Glu
965 970 975
Thr Arg Gly Met Glu Glu Glu Pro Thr His Leu Pro Leu Val Val Cys
980 985 990
Val Asp Lys Leu Thr Lys Val Tyr Lys Asp Asp Lys Lys Leu Ala Leu
995 1000 1005
Asn Lys Leu Ser Leu Asn Leu Tyr Glu Asn Gln Val Val Ser Phe
1010 1015 1020
Leu Gly His Asn Gly Ala Gly Lys Thr Thr Thr Met Ser Ile Leu
1025 1030 1035
Thr Gly Leu Phe Pro Pro Thr Ser Gly Ser Ala Thr Ile Tyr Gly
1040 1045 1050
His Asp Ile Arg Thr Glu Met Asp Glu Ile Arg Lys Asn Leu Gly
1055 1060 1065
Met Cys Pro Gln His Asn Val Leu Phe Asp Arg Leu Thr Val Glu
1070 1075 1080
Glu His Leu Trp Phe Tyr Ser Arg Leu Lys Ser Met Ala Gln Glu
1085 1090 1095
Glu Ile Arg Arg Glu Met Asp Lys Met Ile Glu Asp Leu Glu Leu
1100 1105 1110
Ser Asn Lys Arg His Ser Leu Val Gln Thr Leu Ser Gly Gly Met
1115 1120 1125
Lys Arg Lys Leu Ser Val Ala Ile Ala Phe Val Gly Gly Ser Arg
1130 1135 1140
Ala Ile Ile Leu Asp Glu Pro Thr Ala Gly Val Asp Pro Tyr Ala
1145 1150 1155
Arg Arg Ala Ile Trp Asp Leu Ile Leu Lys Tyr Lys Pro Gly Arg
1160 1165 1170
Thr Ile Leu Leu Ser Thr His His Met Asp Glu Ala Asp Leu Leu
1175 1180 1185
Gly Asp Arg Ile Ala Ile Ile Ser His Gly Lys Leu Lys Cys Cys
1190 1195 1200
Gly Ser Pro Leu Phe Leu Lys Gly Thr Tyr Gly Asp Gly Tyr Arg
1205 1210 1215
Leu Thr Leu Val Lys Arg Pro Ala Glu Pro Gly Gly Pro Gln Glu
1220 1225 1230
Pro Gly Leu Ala Ser Ser Pro Pro Gly Arg Ala Pro Leu Ser Ser
1235 1240 1245
Cys Ser Glu Leu Gln Val Ser Gln Phe Ile Arg Lys His Val Ala
1250 1255 1260
Ser Cys Leu Leu Val Ser Asp Thr Ser Thr Glu Leu Ser Tyr Ile
1265 1270 1275
Leu Pro Ser Glu Ala Ala Lys Lys Gly Ala Phe Glu Arg Leu Phe
1280 1285 1290
Gln His Leu Glu Arg Ser Leu Asp Ala Leu His Leu Ser Ser Phe
1295 1300 1305
Gly Leu Met Asp Thr Thr Leu Glu Glu Val Phe Leu Lys Val Ser
1310 1315 1320
Glu Glu Asp Gln Ser Leu Glu Asn Ser Glu Ala Asp Val Lys Glu
1325 1330 1335
Ser Arg Lys Asp Val Leu Pro Gly Ala Glu Gly Pro Ala Ser Gly
1340 1345 1350
Glu Gly His Ala Gly Asn Leu Ala Arg Cys Ser Glu Leu Thr Gln
1355 1360 1365
Ser Gln Ala Ser Leu Gln Ser Ala Ser Ser Val Gly Ser Ala Arg
1370 1375 1380
Gly Asp Glu Gly Ala Gly Tyr Thr Asp Val Tyr Gly Asp Tyr Arg
1385 1390 1395
Pro Leu Phe Asp Asn Pro Gln Asp Pro Asp Asn Val Ser Leu Gln
1400 1405 1410
Glu Val Glu Ala Glu Ala Leu Ser Arg Val Gly Gln Gly Ser Arg
1415 1420 1425
Lys Leu Asp Gly Gly Trp Leu Lys Val Arg Gln Phe His Gly Leu
1430 1435 1440
Leu Val Lys Arg Phe His Cys Ala Arg Arg Asn Ser Lys Ala Leu
1445 1450 1455
Phe Ser Gln Ile Leu Leu Pro Ala Phe Phe Val Cys Val Ala Met
1460 1465 1470
Thr Val Ala Leu Ser Val Pro Glu Ile Gly Asp Leu Pro Pro Leu
1475 1480 1485
Val Leu Ser Pro Ser Gln Tyr His Asn Tyr Thr Gln Pro Arg Gly
1490 1495 1500
Asn Phe Ile Pro Tyr Ala Asn Glu Glu Arg Arg Glu Tyr Arg Leu
1505 1510 1515
Arg Leu Ser Pro Asp Ala Ser Pro Gln Gln Leu Val Ser Thr Phe
1520 1525 1530
Arg Leu Pro Ser Gly Val Gly Ala Thr Cys Val Leu Lys Ser Pro
1535 1540 1545
Ala Asn Gly Ser Leu Gly Pro Thr Leu Asn Leu Ser Ser Gly Glu
1550 1555 1560
Ser Arg Leu Leu Ala Ala Arg Phe Phe Asp Ser Met Cys Leu Glu
1565 1570 1575
Ser Phe Thr Gln Gly Leu Pro Leu Ser Asn Phe Val Pro Pro Pro
1580 1585 1590
Pro Ser Pro Ala Pro Ser Asp Ser Pro Ala Ser Pro Asp Glu Asp
1595 1600 1605
Leu Gln Ala Trp Asn Val Ser Leu Pro Pro Thr Ala Gly Pro Glu
1610 1615 1620
Met Trp Thr Ser Ala Pro Ser Leu Pro Arg Leu Val Arg Glu Pro
1625 1630 1635
Val Arg Cys Thr Cys Ser Ala Gln Gly Thr Gly Phe Ser Cys Pro
1640 1645 1650
Ser Ser Val Gly Gly His Pro Pro Gln Met Arg Val Val Thr Gly
1655 1660 1665
Asp Ile Leu Thr Asp Ile Thr Gly His Asn Val Ser Glu Tyr Leu
1670 1675 1680
Leu Phe Thr Ser Asp Arg Phe Arg Leu His Arg Tyr Gly Ala Ile
1685 1690 1695
Thr Phe Gly Asn Val Leu Lys Ser Ile Pro Ala Ser Phe Gly Thr
1700 1705 1710
Arg Ala Pro Pro Met Val Arg Lys Ile Ala Val Arg Arg Ala Ala
1715 1720 1725
Gln Val Phe Tyr Asn Asn Lys Gly Tyr His Ser Met Pro Thr Tyr
1730 1735 1740
Leu Asn Ser Leu Asn Asn Ala Ile Leu Arg Ala Asn Leu Pro Lys
1745 1750 1755
Ser Lys Gly Asn Pro Ala Ala Tyr Gly Ile Thr Val Thr Asn His
1760 1765 1770
Pro Met Asn Lys Thr Ser Ala Ser Leu Ser Leu Asp Tyr Leu Leu
1775 1780 1785
Gln Gly Thr Asp Val Val Ile Ala Ile Phe Ile Ile Val Ala Met
1790 1795 1800
Ser Phe Val Pro Ala Ser Phe Val Val Phe Leu Val Ala Glu Lys
1805 1810 1815
Ser Thr Lys Ala Lys His Leu Gln Phe Val Ser Gly Cys Asn Pro
1820 1825 1830
Ile Ile Tyr Trp Leu Ala Asn Tyr Val Trp Asp Met Leu Asn Tyr
1835 1840 1845
Leu Val Pro Ala Thr Cys Cys Val Ile Ile Leu Phe Val Phe Asp
1850 1855 1860
Leu Pro Ala Tyr Thr Ser Pro Thr Asn Phe Pro Ala Val Leu Ser
1865 1870 1875
Leu Phe Leu Leu Tyr Gly Trp Ser Ile Thr Pro Ile Met Tyr Pro
1880 1885 1890
Ala Ser Phe Trp Phe Glu Val Pro Ser Ser Ala Tyr Val Phe Leu
1895 1900 1905
Ile Val Ile Asn Leu Phe Ile Gly Ile Thr Ala Thr Val Ala Thr
1910 1915 1920
Phe Leu Leu Gln Leu Phe Glu His Asp Lys Asp Leu Lys Val Val
1925 1930 1935
Asn Ser Tyr Leu Lys Ser Cys Phe Leu Ile Phe Pro Asn Tyr Asn
1940 1945 1950
Leu Gly His Gly Leu Met Glu Met Ala Tyr Asn Glu Tyr Ile Asn
1955 1960 1965
Glu Tyr Tyr Ala Lys Ile Gly Gln Phe Asp Lys Met Lys Ser Pro
1970 1975 1980
Phe Glu Trp Asp Ile Val Thr Arg Gly Leu Val Ala Met Ala Val
1985 1990 1995
Glu Gly Val Val Gly Phe Leu Leu Thr Ile Met Cys Gln Tyr Asn
2000 2005 2010
Phe Leu Arg Arg Pro Gln Arg Met Pro Val Ser Thr Lys Pro Val
2015 2020 2025
Glu Asp Asp Val Asp Val Ala Ser Glu Arg Gln Arg Val Leu Arg
2030 2035 2040
Gly Asp Ala Asp Asn Asp Met Val Lys Ile Glu Asn Leu Thr Lys
2045 2050 2055
Val Tyr Lys Ser Arg Lys Ile Gly Arg Ile Leu Ala Val Asp Arg
2060 2065 2070
Leu Cys Leu Gly Val Arg Pro Gly Glu Cys Phe Gly Leu Leu Gly
2075 2080 2085
Val Asn Gly Ala Gly Lys Thr Ser Thr Phe Lys Met Leu Thr Gly
2090 2095 2100
Asp Glu Ser Thr Thr Gly Gly Glu Ala Phe Val Asn Gly His Ser
2105 2110 2115
Val Leu Lys Glu Leu Leu Gln Val Gln Gln Ser Leu Gly Tyr Cys
2120 2125 2130
Pro Gln Cys Asp Ala Leu Phe Asp Glu Leu Thr Ala Arg Glu His
2135 2140 2145
Leu Gln Leu Tyr Thr Arg Leu Arg Gly Ile Ser Trp Lys Asp Glu
2150 2155 2160
Ala Arg Val Val Lys Trp Ala Leu Glu Lys Leu Glu Leu Thr Lys
2165 2170 2175
Tyr Ala Asp Lys Pro Ala Gly Thr Tyr Ser Gly Gly Asn Lys Arg
2180 2185 2190
Lys Leu Ser Thr Ala Ile Ala Leu Ile Gly Tyr Pro Ala Phe Ile
2195 2200 2205
Phe Leu Asp Glu Pro Thr Thr Gly Met Asp Pro Lys Ala Arg Arg
2210 2215 2220
Phe Leu Trp Asn Leu Ile Leu Asp Leu Ile Lys Thr Gly Arg Ser
2225 2230 2235
Val Val Leu Thr Ser His Ser Met Glu Glu Cys Glu Ala Leu Cys
2240 2245 2250
Thr Arg Leu Ala Ile Met Val Asn Gly Arg Leu Arg Cys Leu Gly
2255 2260 2265
Ser Ile Gln His Leu Lys Asn Arg Phe Gly Asp Gly Tyr Met Ile
2270 2275 2280
Thr Val Arg Thr Lys Ser Ser Gln Ser Val Lys Asp Val Val Arg
2285 2290 2295
Phe Phe Asn Arg Asn Phe Pro Glu Ala Met Leu Lys Glu Arg His
2300 2305 2310
His Thr Lys Val Gln Tyr Gln Leu Lys Ser Glu His Ile Ser Leu
2315 2320 2325
Ala Gln Val Phe Ser Lys Met Glu Gln Val Ser Gly Val Leu Gly
2330 2335 2340
Ile Glu Asp Tyr Ser Val Ser Gln Thr Thr Leu Asp Asn Val Phe
2345 2350 2355
Val Asn Phe Ala Lys Lys Gln Ser Asp Asn Leu Glu Gln Gln Glu
2360 2365 2370
Thr Glu Pro Pro Ser Ala Leu Gln Ser Pro Leu Gly Cys Leu Leu
2375 2380 2385
Ser Leu Leu Arg Pro Arg Ser Ala Pro Thr Glu Leu Arg Ala Leu
2390 2395 2400
Val Ala Asp Glu Pro Glu Asp Leu Asp Thr Glu Asp Glu Gly Leu
2405 2410 2415
Ile Ser Phe Glu Glu Glu Arg Ala Gln Leu Ser Phe Asn Thr Asp
2420 2425 2430
Thr Leu Cys
2435

Claims (10)

1.检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质在如下(a1)-(a16)中任一种中的应用:
(a1)诊断活动性结核病;
(a2)制备诊断活动性结核病的产品;
(a3)诊断待测者是否为活动性结核病患者;
(a4)制备诊断待测者是否为活动性结核病患者的产品;
(a5)诊断菌阳肺结核病;
(a6)制备诊断菌阳肺结核病的产品;
(a7)诊断待测者是否为菌阳肺结核病患者;
(a8)制备诊断待测者是否为菌阳肺结核病患者的产品;
(a9)诊断菌阴肺结核病;
(a10)制备诊断菌阴肺结核病的产品;
(a11)诊断待测者是否为菌阴肺结核病患者;
(a12)制备诊断待测者是否为菌阴肺结核病患者的产品;
(a13)诊断肺外结核病;
(a14)制备诊断肺外结核病的产品;
(a15)诊断待测者是否为肺外结核病患者;
(a16)制备诊断待测者是否为肺外结核病患者的产品。
2.检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质在如下(b1)-(b16)中任一种中的应用:
(b1)区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染;
(b2)制备区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的产品;
(b3)诊断待测者为活动性结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b4)制备诊断待测者为活动性结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b5)区分或鉴别菌阳肺结核病和结核潜伏感染;
(b6)制备区分或鉴别菌阳肺结核病和结核潜伏感染的产品;
(b7)诊断待测者为菌阳肺结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b8)制备诊断待测者为菌阳肺结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b9)区分或鉴别菌阴肺结核病和结核潜伏感染;
(b10)制备区分或鉴别菌阴肺结核病和结核潜伏感染的产品;
(b11)诊断待测者为菌阴肺结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b12)制备诊断待测者为菌阴肺结核病患者还是结核潜伏感染者的产品;
(b13)区分或鉴别肺外结核病和结核潜伏感染;
(b14)制备区分或鉴别肺外结核病和结核潜伏感染的产品;
(b15)诊断待测者为肺外结核病患者还是结核潜伏感染者;
(b16)制备诊断待测者为肺外结核病患者还是结核潜伏感染者的产品。
3.用于诊断活动性结核病的试剂盒,其包括检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包含数据处理装置甲;所述数据处理装置甲由数据输入模块甲、数据记录模块甲、数据比较模块甲和结论输出模块甲组成;
所述数据输入模块甲用于输入ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据记录模块甲用于存储ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据比较模块甲用于将待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量数值和阈值进行比较;所述阈值为0.01701;
所述结论输出模块甲用于显示结论,即如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.01701,则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.01701,则待测者不为或疑似不为活动性结核病患者;
或,所述活动性结核病包括菌阳肺结核病、菌阴肺结核病和肺外结核病。
5.用于区分或鉴别活动性结核病和结核潜伏感染的试剂盒,其包括检测ABCA2基因的物质或检测ABCA2基因编码的mRNA的物质或检测ABCA2基因编码的蛋白的物质。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包含数据处理装置乙;所述数据处理装置乙由数据输入模块乙、数据记录模块乙、数据比较模块乙和结论输出模块乙组成;
所述数据输入模块乙用于输入ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据记录模块乙用于存储ABCA2基因的相对表达量数值;
所述数据比较模块乙用于将待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量数值和阈值进行比较;所述阈值为0.02124;
所述结论输出模块乙用于显示结论,即如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量低于0.02124,则待测者为或疑似为活动性结核病患者;如果待测者外周血中ABCA2基因的相对表达量等于或高于0.02124,则待测者为或疑似为结核潜伏感染者;
或,所述活动性结核病包括菌阳肺结核病、菌阴肺结核病和肺外结核病。
7.根据权利要求1或2所述的应用或权利要求3-6任一所述的试剂盒,其特征在于:所述物质为检测ABCA2基因或检测ABCA2基因编码的mRNA或检测ABCA2基因编码的蛋白所需的试剂和/或仪器。
8.根据权利要求7所述的应用或试剂盒,其特征在于:所述试剂包括由序列1所示的单链DNA分子和序列2所示的单链DNA分子组成的引物对。
9.ABCA2基因或ABCA2蛋白作为标志物在开发活动性结核病和/或菌阳肺结核病和/或菌阴肺结核病和/或肺外结核病的诊断试剂中的应用。
10.权利要求8中所述的引物对。
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