CN110072989A - 核酸在纸上的稳定化 - Google Patents
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Abstract
本发明及其实施方案涉及用于在固体基质上储存、稳定和保存生物样本和/或核酸的组合物和方法。还描述了从固体基质中提取、收集和回收生物样本和/或核酸的方法。
Description
相关申请的交叉引用
本申请依据35U.S.C.§119(e)要求2016年10月24日提交的美国临时专利申请No.62/411,996的优先权,所述临时专利申请通过引用整体并入本文。
技术领域
本发明及其实施方案涉及用于在固体基质上储存、稳定和保存生物样本和/或核酸的组合物和方法。还描述了用于从固体基质中提取、收集和回收生物样本和/或核酸的方法。
背景技术
本文中的所有出版物均以引用方式并入,其程度如同每个单独的出版物或专利申请被明确地和单独地指出通过引用并入一般。以下描述包括可用于理解本发明的信息。并非承认本文提供的任何信息是现有技术或与当前要求保护的发明相关,或者明确地或隐含地提及的任何出版物是现有技术。
用于储存、稳定和/或保存核酸的结构和功能完整性的方法对于广泛多种应用是重要的,所述应用包括诊断应用、治疗应用、预后应用、研究应用、法医应用、测序应用、扩增应用、分析物检测、传感应用等。各种条件如pH、温度、湿度、运输等都会导致核酸的降解。因此,一直需要用于储存、稳定和/或保存生物样本和/或核酸的材料、组合物和方法。
例如,由于发展中国家的农村城市难以进入,因此当必须使用复杂的设备进行测试时,如果要分析的分析物不稳定,则对某人的健康状况进行可靠的预后具有挑战性。一种这样的测试是通过定量患者临床样本中的病毒RNA来确定人类免疫缺陷病毒(HIV)的存在。该测试可以用沉积在有纤维质的纸上的一滴血液或血浆进行,所述材料然后可以容易地运送到诊断实验室。然而,临床样本中HIV RNA的定量具有挑战性,因为病毒RNA降解相当快,尤其是在诸如位于非洲大陆的国家中观察到的较高温度和湿度条件下。因此,修改样本收集装置如纸基材料以捕获血斑来提高HIV RNA的稳定性是非常必要的,从而允许准确诊断和评估具有低HIV病毒载量的患者中的治疗功效。
发明内容
结合系统、组合物、方法和制品来描述和说明以下实施方案及其方面,所述实施方案及其方面是示例性和说明性的,而不是对范围进行限制。
本发明及其实施方案涉及用于在固体基质上储存、稳定和保存生物样本和/或核酸的组合物和方法。还描述了用于从固体基质中提取、收集和回收生物样本和/或核酸的方法。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;所述固体基质不包含变性剂;并且所述生物样本包含一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含至少一种还原剂,其中所述还原剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述还原剂是二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺或半胱氨酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含至少一种抗氧化剂,其中所述抗氧化剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)或甲基氢醌(THQ)。在一些实施方案中,所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。在一些实施方案中,所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。在一些实施方案中,所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。在一些实施方案中,所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。在一些实施方案中,所述缓冲剂是柠檬酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于在固体基质上储存一个或多个生物样本的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及以基本上干燥的状态或干燥状态将所述生物样本储存在所述固体基质上,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述方法还包括从所述固体基质中回收所述生物样本。在一些实施方案中,所述方法还包括从所述生物样本中提取所述核酸。在一些实施方案中,将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存在所述固体基质上。在一些实施方案中,所述方法还包括从所述固体基质中回收所述核酸。在一些实施方案中,所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。在一些实施方案中,所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。在一些实施方案中,所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。在一些实施方案中,所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。在一些实施方案中,所述核酸是RNA。在一些实施方案中,所述核酸是病毒RNA。在一些实施方案中,所述缓冲剂是柠檬酸。
附图说明
示例性实施方案在参考图中示出。本文公开的实施方案和附图旨在被认为是说明性而非限制性的。
图1描绘了根据本发明的各种实施方案,从在25℃和45℃下储存30天的903纸进行HIV RNA回收,其中将在45℃下在制剂1、2、3、4和5(表1)中浸泡的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与在水中浸泡的未受保护的纸(无制剂,NF 45℃)和在水中浸泡的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)进行比较。
图2描绘了根据本发明的各种实施方案,从在25℃和50℃下储存30天的Perkin-ElmerTM226纸或903纸进行HIV RNA回收,其中将在50℃下在制剂1、2和4(表1)中浸泡的受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸的Ct值(循环阈值)与在水中浸泡的未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸(无制剂,NF 50℃)和在水中浸泡的未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较。
图3描绘了根据本发明的各种实施方案,从在25℃和50℃下储存24天的903纸进行HIV RNA回收,其中将在50℃下在制剂2、6、7、8、9、10、11、12、13和14(表1)中浸泡的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较。
图4描绘了根据本发明的各种实施方案,从在25℃和50℃下储存28天的903纸进行HIV RNA回收,其中将在50℃下在制剂2、4、7、10、12、14、15和16(表1)中浸泡的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较。
图5描绘了根据本发明的各种实施方案,从在40%相对湿度下在25℃和50℃下储存6天的903纸进行HIV RNA回收,其中将在50℃下在制剂14、15、17、18、19、20、21、22、23和24(表1)中浸泡的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和在水中浸泡的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较。
具体实施方式
本文引用的所有参考文献都通过引用整体并入,如同完全阐述一样。除非另外定义,否则本文使用的技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。
本领域技术人员将认识到许多与本文所述的那些相似或等同的方法和材料,其可用于本发明的实践中。本发明的其它特征和优点将从结合附图的以下详细描述中变得显而易见,所述附图通过举例说明了本发明的实施方案的各种特征。实际上,本发明绝不限于所描述的方法和材料。为方便起见,在此集中了本文、本说明书、实施例和所附权利要求中使用的某些术语。
除非另有说明,或从上下文暗示,否则以下术语和短语包括下面提供的含义。除非另有明确说明,或从上下文显而易见,否则下面的术语和短语不排除所述术语或短语在其所属领域中获得的含义。提供这些定义是为了帮助描述特定的实施方案,并且不旨在限制要求保护的发明,因为本发明的范围仅由权利要求限制。除非另外定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。
如本文所用,术语“包含”是关于实施方案可用的组合物、方法、系统、制品及其相应组分使用的,但是可以包含未指明的要素,无论其是否有用。本领域技术人员将理解,一般而言,本文使用的术语通常旨在作为“开放”术语(例如,术语“包括”应解释为“包括但不限于”,术语“具有”应解释为“至少具有”等)。尽管开放式术语“包含”,作为术语如包括、含有或具有的同义词,在本文中用于描述和要求保护发明、本发明或其实施方案,但可以替代地使用诸如“由……组成”或“基本上由……组成”的替代术语来描述。
“任选的”或“任选地”是指随后描述的情形可能发生或可能不发生,因此该描述包括情形发生的情况和情形不发生的情况。
除非另有说明,否则在描述本申请的特定实施方案的上下文中(尤其是在权利要求书的上下文中)使用的术语“一个”和“一种”和“所述”以及类似的提及物可以被解释为涵盖单数和复数。本文中对数值范围的叙述仅仅旨在用作单独提及落入该范围内的每个单独值的简写方法。除非本文另有说明,否则每个单独的值被并入本说明书中,就如同其在本文中是单独引用的一样。除非本文另有说明或与上下文明显矛盾,否则本文所述的所有方法可以任何合适的顺序进行。关于本文的某些实施方案提供的任何和所有实施例或示例性语言(例如,“诸如”)的使用仅旨在更好地说明本申请,并且不对另外要求保护的本申请的范围构成限制。缩写“例如”源自拉丁语exempli gratia,并且在本文中用于表示非限制性实例。因此,缩写“e.g.”与术语“例如”同义。本说明书中的语言不应被解释为表示对于本申请的实践必不可少的任何未要求保护的要素。
如本文所用的术语“样本”或“生物样本”表示从生物有机体获取或分离的样本,例如来自受试者的血液样本。示例性生物样本包括但不限于颊拭子;粘液;全血、血液、血清;血浆;尿液;唾液;精液;淋巴液;粪便提取物;痰液;泪液;其它体液或生物流体;细胞样本;组织样本;肿瘤样本;和/或肿瘤活检等。所述术语还包括上述样本的混合物。例如,生物样本可以是血液和唾液;尿液和粪便提取物;粘液和组织样本;血液、唾液和肿瘤样本的混合物等。术语“样本”还包括未经处理或预处理(或预加工)的生物样本。在一些实施方案中,样本可包含来自受试者的一种或多种细胞。另外的生物样本包括但不限于人类和动物的生理/病理体液(例如,分泌物、排泄物、渗出物和渗出液)或细胞悬浮液(例如,血液、淋巴液、滑液、精液、含有颊细胞的唾液、皮肤刮屑、毛根细胞等);人体或动物体组织(例如骨骼、肝脏、肾脏等)的液体提取物或匀浆。
在一些实施方案中,生物样本是颊拭子;粘液;全血;血液;血清;血浆;滑液;脊髓液、脑脊液、尿液;唾液;精液;预射精液;阴道液;母乳;淋巴液;粪便提取物;痰液;泪液;其它体液或生物流体;细胞;细胞样本;组织;组织样本;肿瘤;肿瘤样本;肿瘤活检;人类和动物的生理/病理体液(例如,分泌物、排泄物、渗出物和渗出液)或细胞悬浮液(例如,血液、淋巴液、滑液、精液、含有颊细胞的唾液、皮肤刮屑、毛根细胞等);或人体或动物体组织(例如骨骼、肝脏、肾脏等)的液体提取物或匀浆。
在一些实施方案中,生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。在一些实施方案中,生物样本是血液。在一些实施方案中,生物样本是血清。在一些实施方案中,生物样本是血浆。在一些实施方案中,生物样本是组织。在一些实施方案中,生物样本是唾液。在一些实施方案中,生物样本是细胞。在一些实施方案中,生物样本是滑液。在一些实施方案中,生物样本是尿液。在一些实施方案中,生物样本是精液。
在一些实施方案中,生物样本呈干燥状态或基本上干燥的状态。在一些实施方案中,生物样本呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,生物样本呈干燥状态。
术语“核酸”不加限制地指所有形式的RNA(例如,mRNA、miRNA、rRNA、tRNA、piRNA、ncRNA),DNA(例如,基因组DNA、mtDNA),以及重组RNA和DNA分子或者使用核苷酸类似物产生的DNA或RNA的类似物。核酸分子可以是单链或双链的。链可以包括编码或非编码链。天然存在的RNA或DNA分子的核酸片段由本发明所涵盖并且可以使用所公开的组合物和方法回收。术语“片段”是指核酸(例如,RNA或DNA)的一部分。核酸可以来自任何来源,包括但不限于动物、人类、植物、病毒、细菌、真菌、质粒或寄生虫。在一些实施方案中,核酸是病毒RNA。在一些实施方案中,核酸是人类免疫缺陷病毒(HIV)RNA(即HIV RNA)。在一些实施方案中,核酸是DNA和/或RNA或其组合。在一些实施方案中,核酸是DNA(脱氧核糖核酸)。在一些实施方案中,核酸是RNA(核糖核酸)。
在一些实施方案中,核酸呈干燥状态或基本上干燥的状态。在一些实施方案中,核酸呈干燥状态。在一些实施方案中,核酸呈基本上干燥的状态。
在一些实施方案中,核酸是人类核酸(例如,人类DNA、人类RNA等)。在一些实施方案中,核酸是动物核酸(例如,动物DNA、动物RNA等)。在一些实施方案中,核酸是感染因子核酸(例如,感染因子DNA、感染因子RNA等)。感染因子核酸的非限制性实例包括病毒核酸、细菌核酸、真菌核酸和寄生虫核酸。在一些实施方案中,核酸是病毒核酸(例如,病毒DNA、病毒RNA等)。在一些实施方案中,核酸是细菌核酸(例如,细菌DNA、细菌RNA等)。在一些实施方案中,核酸是真菌核酸(例如,真菌DNA、真菌RNA等)。在一些实施方案中,核酸是寄生虫核酸(例如,寄生虫DNA、寄生虫RNA等)。在一些实施方案中,核酸是植物核酸(例如,植物DNA、植物RNA等)。
术语“感染因子”通常是指渗入另一种活生物体的任何物质。感染因子的非限制性实例包括病毒、细菌、真菌和寄生虫。在一些实施方案中,感染因子是病毒、细菌、真菌和/或寄生虫中的任何一种或多种。在一些实施方案中,感染因子是一种或多种病毒。在一些实施方案中,感染因子是一种或多种细菌。在一些实施方案中,感染因子是一种或多种真菌。在一些实施方案中,感染因子是一种或多种寄生虫。
病毒的非限制性实例包括人类免疫缺陷病毒(HIV)、人类乳头状瘤病毒(HPV)、肝炎病毒、埃博拉病毒、寨卡病毒、西尼罗河病毒、登革热病毒、轮状病毒、流感病毒、麻疹病毒、脊髓灰质炎病毒、黄热病毒、疱疹病毒、水痘带状疱疹病毒和狂犬病毒。
细菌的非限制性实例包括破伤风梭菌(Clostridium tetani)、霍乱弧菌(Vibriocholerae)、结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)、鼠疫耶尔森氏菌(Yersiniapestis)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)、梅毒密螺旋体(Treponemapallidium)、淋病奈瑟氏球菌(Neisseria gonorrhoeae)、伤寒沙门氏菌(Salmonellatyphi)、嗜肺军团菌(Legionella pneumophila)、炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)、艰难梭菌(Clostridium difficile)、麻风分枝杆菌(Mycobacterium leprae)和弥漫型麻风分枝杆菌(Mycobacterium lepromatosis)。
寄生虫的非限制性实例包括疟原虫(Plasmodium)型、溶组织内阿米巴(Entamoebahistolytica)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)、刚地弓形虫(Toxoplasma gondii)、克氏锥虫(Trypanosoma cruzi)、布氏冈比亚锥虫(Trypanosoma brucei gambiense)、布氏罗得西亚锥虫(Trypanosoma brucei rhodesiense)、猪肉绦虫(Taenia solium)、十二指肠钩虫(Ancylostoma duodenale)、美洲钩虫(Necator americanus)、蠕形住肠线虫(Enterobius vermicularis)、类圆线虫(Strongyloides)、旋毛形线虫(Trichinella)、麦地那龙线虫(Dracunculus medinensis)、人头虱(Pediculus humanus capitis)和人体虱(Pediculus humanus corporis)。
真菌的非限制性实例包括以下属酵母:念珠菌属(Candida)、耳念珠菌(Candidaauris)、隐球菌属(Cryptococcus)、组织胞浆菌属(Histoplasma)、芽生菌属(Blastomyces)、球孢子菌属(Coccidioides)、曲霉属(Aspergillus)、毛癣菌属(Trichophyton)、表皮癣菌属(Epidermophyton)、小孢子菌属(Microsporum)、红色毛癣菌(Trichophyton rubrum)、镰刀菌属(Fusarium)、根霉属(Rhizopus)物种、毛霉属(Mucor)物种、灰色小克银汉霉(Cunninghamella bertholletiae)、鳞质霉属(Apophysomyces)物种、横梗霉属(Lichtheimia)物种、芽生菌属(Blastomyces)、球孢子菌属(Coccidioides)、组织胞浆菌属(Histoplasma)和孢子丝菌属(Sporothrix)。
另外,生物样本可包含各种生物材料,包括但不限于核酸、蛋白质、病毒、细菌、寄生虫、感染因子、朊病毒、干细胞等。其它生物材料包括但不限于植物的生理/病理提取物或细胞悬浮液;细菌、真菌、质粒、病毒、寄生虫等的液体产品、提取物或悬浮液;包括蠕虫、原生动物、螺旋体等的寄生虫的液体产品、提取物或悬浮液;感染因子;细菌、病毒、真菌或寄生虫。
另外,生物样本可包含来自各种来源的组合,非限制性实例包括含有人类核酸的人类血液或人血浆;含有感染因子的血液或血浆;含有病毒、细菌、真菌或寄生虫的人类血液或血浆;含有病毒核酸如病毒RNA(例如HIV RNA)的人类血液或血浆;含有细菌核酸如细菌DNA和/或RNA的动物粪便提取物;来自一名受试者的人类血液与来自另一受试者的人类血液的混合物;含有感染因子核酸的精液等。
在各种实施方案中,生物样本包含一种或多种核酸。在一些实施方案中,核酸是人类核酸、动物核酸和/或感染因子核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸和/或感染因子核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸和/或感染因子核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸。在一些实施方案中,核酸是动物核酸。在一些实施方案中,核酸是感染因子核酸。在一些实施方案中,核酸是人类核酸、动物核酸、病毒核酸、细菌核酸、真菌核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸、病毒核酸、细菌核酸、真菌核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸、病毒核酸、细菌核酸、真菌核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸和/或病毒核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸和/或细菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸和/或真菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是人类核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸和/或病毒核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸和/或细菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸和/或真菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,核酸是动物核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。
在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种感染因子,其中所述感染因子包含一种或多种核酸。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种感染因子;和一种或多种核酸,其中所述核酸是动物核酸和/或感染因子核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种感染因子;和一种或多种核酸,其中所述核酸是人类核酸和/或感染因子核酸中的任何一种或多种。
在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种病毒;和一种或多种核酸,其中所述核酸是人类核酸和/或病毒核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种细菌;和一种或多种核酸,其中所述核酸是人类核酸和/或细菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种真菌;和一种或多种核酸,其中所述核酸是人类核酸和/或真菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种寄生虫;和一种或多种核酸,其中所述核酸是人类核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。
在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种病毒;和一种或多种核酸,其中所述核酸是动物核酸和/或病毒核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种细菌;和一种或多种核酸,其中所述核酸是动物核酸和/或细菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种真菌;和一种或多种核酸,其中所述核酸是动物核酸和/或真菌核酸中的任何一种或多种。在一些实施方案中,生物样本包含一种或多种寄生虫;和一种或多种核酸,其中所述核酸是动物核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。
如本文所用,“受试者”是指人类或动物。通常动物是脊椎动物,例如灵长类动物、啮齿动物、家养动物或野生动物。灵长类动物包括黑猩猩、食蟹猴、蜘蛛猴和猕猴,例如恒河猴。啮齿动物包括小鼠、大鼠、土拨鼠、白鼬、兔子和仓鼠。家养和野生动物包括牛、马、猪、鹿、野牛、水牛,猫科动物例如家猫,和犬科动物例如狗、狐狸、狼。术语“患者”、“个体”和“受试者”在本文中可互换使用。在一些实施方案中,受试者是哺乳动物。哺乳动物可以是人类、非人灵长类动物、小鼠、大鼠、狗、猫、马或牛,但不限于这些实例。此外,本文所述的方法可用于治疗驯养动物和/或宠物。在一些实施方案中,受试者是动物。在一些实施方案中,受试者是人类。
如本文所用,“哺乳动物”是指哺乳动物类的任何成员,包括但不限于人类和非人灵长类动物,如黑猩猩和其它猿和猴物种;农场动物,如牛、绵羊、猪、山羊和马;家养哺乳动物,如狗和猫;实验动物,包括啮齿动物如小鼠、大鼠和豚鼠等。所述术语并不表示特定的年龄或性别。因此,成人和新生儿受试者以及胎儿,无论是男性还是女性,都意欲包括在该术语的范围内。在一些实施方案中,哺乳动物是人类。
术语“提取”是指用于从样本(例如,生物样本)中释放、分离和/或隔离出核酸的任何方法。在一个实施方案中,不受理论束缚,例如,在空气中的蒸发样本细胞裂解期间或通过与基质材料接触或在基质材料和/或固体基质(例如,化学改性的固体基质)中存在与样本接触后导致细胞裂解和核酸释放的化合物时,可以提取核酸如RNA和DNA。本领域技术人员将理解,任何导致核酸(例如RNA)从样本(例如,血浆、血液、血清、组织、唾液、细胞、滑液、尿液、精液等)中被提取出来,使得核酸可以被捕获在用于储存、稳定和/或保存核酸的基质材料和/或固体基质上的方法都可用于所公开的组合物和方法中。在另一个实施方案中,不受理论束缚,可以例如使用任何已知的方法或技术在从基质材料和/或固体基质移出样本之后,从样本(例如生物样本)中提取核酸如RNA和DNA。例如,可以使用任何导致核酸(例如RNA)从样本(例如生物样本)中被提取出来的方法。例如,可以使用任何导致核酸(例如RNA)从样本(例如生物样本)中被提取出来的手动方法或自动方法。
在另一个实施方案中,不受理论束缚,例如在空气中裂解期间或通过与基质材料接触或在基质材料和/或固体基质材料(例如化学改性的固体基质)中存在与生物样本和/或其中的感染因子接触后导致核酸从感染因子中释放的化合物,可以从感染因子中提取感染因子核酸,其中感染因子存在于生物样本中。在另一实施方案中,不受理论束缚,可以例如使用任何已知的方法或技术在从基质材料和/或固体基质中移出感染因子和/或生物样本之后,从感染因子和/或生物样本中提取感染因子核酸,其中感染因子存在于生物样本中。在一些实施方案中,感染因子是病毒、细菌、真菌或寄生虫中的任何一种或多种。在一些实施方案中,感染因子核酸是病毒核酸、细菌核酸、真菌核酸和/或寄生虫核酸中的任何一种或多种。
术语“回收”是指从基质材料和/或固体基质中获取核酸。在一些实施方案中,所述方法包括从基质材料和/或固体基质中回收一种或多种核酸。在一些实施方案中,通过固相提取技术从基质材料和/或固体基质中回收核酸。在一些实施方案中,通过使固体基质在溶剂、水溶液、缓冲剂(或缓冲溶液)、有机溶液或其组合中再水合而从基质材料和/或固体基质中回收核酸。在一些实施方案中,对回收的核酸进行进一步分析。
术语“储存”或“保存”在本文中可互换使用,涉及到将生物样本和/或提取的核酸维持为适于进一步分析的形式。如本文所用,术语“进行储存”、“储存的”、“被储存”和“储存”的其它派生词,当提及生物样本以干燥或基本干燥形式夹带于干燥或基本干燥的稳定化固体基质中时,意思是指生物样本和生物样本内含物(例如核酸)以适于后续分析的形式被保存并且没有经历实质性降解。用生物样本处理的干燥稳定化固体基质根据本发明可以储存的时间段可能与生物样本从生物样本采集地点运输到进行后续分析的地方所需的时间一样短。用生物样本处理的干燥稳定化固体基质的储存条件可以改变。通常,样本储存在-200℃至60℃、-150℃至60℃、-100℃至60℃、-50℃至60℃、-25℃至60℃、-10℃至60℃、0℃至60℃、0℃至50℃、0℃至40℃、0℃至30℃、5℃至60℃、5℃至50℃、5℃至40℃、5℃至30℃、10℃至60℃、10℃至50℃、10℃至40℃、10℃至30℃、15℃至60℃、15℃至50℃、15℃至40℃、15℃至30℃、20℃至60℃、20℃至50℃、20℃至40℃、20℃至30℃或20℃至25℃的温度下。在一些实施方案中,样本储存在15℃至30℃下。
另外,用生物样本处理的干燥稳定化固体基质可任选地在干燥或脱水条件下和/或在惰性气氛下储存。
此外,用生物样本处理的干燥稳定化固体基质可任选地在环境条件下储存,其中温度(例如环境温度)和/或湿度(例如相对湿度)可根据环境而变化。此外,用生物样本处理的干燥稳定化固体基质可任选地在环境温度下储存。
术语“环境温度”是指范围为0℃至60℃的温度。在一些实施方案中,环境温度为0℃至60℃、0℃至50℃、0℃至40℃、0℃至30℃、10℃至60℃、10℃至50℃、10℃至40℃、10℃至30℃、15℃至30℃、20℃至60℃、20℃至50℃、20℃至40℃、20℃至30℃、30℃至60℃、30℃至50℃、30℃至40℃、40℃至60℃、40℃至50℃或50℃至60℃。在一些实施方案中,环境温度为室温。在一些实施方案中,环境温度为15℃至30℃。
在各种实施方案中,相对湿度在1%至100%的范围内。在一些实施方案中,相对湿度为1%至10%、1%至20%、1%至30%、1%至40%、1%至50%、1%至60%、1%至70%、1%至80%、1%至90%、1%至100%、10%至20%、10%至30%、10%至40%、10%至50%、10%至60%、10%至70%、10%至80%、10%至90%、10%至100%、20%至30%、20%至40%、20%至50%、20%至60%、20%至70%、20%至80%、20%至90%、20%至100%、30%至40%、30%至50%、30%至60%、30%至30%、30%至80%、30%至90%、30%至100%、40%至50%、40%至60%、40%至70%、40%至80%、40%至90%、40%至100%、50%至60%、50%至70%、50%至80%、50%至90%、50%至100%、60%至70%、60%至80%、60%至90%、60%至100%、70%至80%、70%至90%、70%至100%、80%至90%、80%至100%、90%至100%。
如本文所用的术语“还原剂”是指向另一种化学物质提供电子的化学物质。本领域已知多种还原剂。可用于本发明的组合物和方法的各种实施方案中的还原剂的非限制性实例包括二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺和半胱氨酸。在一些实施方案中,还原剂是二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺和/或半胱氨酸中的一种或多种。在一些实施方案中,还原剂是二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺或半胱氨酸。在一些实施方案中,还原剂是二硫苏糖醇(DTT)。在一些实施方案中,还原剂是2-巯基乙醇(2-ME)。在一些实施方案中,还原剂是2-巯基乙胺。在一些实施方案中,还原剂是半胱氨酸。此外,本领域已知的这些或其它还原剂的任何组合可用于实施本发明。
本发明不限于还原剂的任何特定浓度。在各种实施方案中,适用于本发明(例如,组合物、方法、试剂盒、固体基质、基质材料、制剂等)的还原剂的浓度为1mM–200mM。
在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM–200mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM–200mM、1mM–175mM、1mM–150mM、1mM–125mM、1mM–100mM、1mM–75mM、1mM–50mM、1mM–25mM、1mM–10mM、10mM–200mM、10mM–175mM、10mM–150mM、10mM–125mM、10mM–100mM、10mM–75mM、10mM–50mM、10mM–25mM、20mM–200mM、20mM–175mM、20mM–150mM、20mM–125mM、20mM–100mM、20mM–75mM或20mM–50mM。
在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM至150mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM至100mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM至80mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为1mM至60mM。
在各种实施方案中,还原剂的浓度为10mM至150mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为10mM至100mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为10mM至80mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为10mM至60mM。
在各种实施方案中,还原剂的浓度为20mM至150mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为20mM至100mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为20mM至80mM。在各种实施方案中,还原剂的浓度为20mM至60mM。
缓冲剂的非限制性实例是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、酒石酸、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸,或其任何组合。此外,本领域中已知的这些或其它缓冲剂的任何组合可用于实践本发明。
在本发明的各种实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、酒石酸、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸,或其任何组合。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、酒石酸、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、酒石酸、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸中的任何一种或多种。
在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、酒石酸、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸,或其任何组合。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸中的任何一种或多种。
在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂是三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS);2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)和三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl);或柠檬酸和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。
在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂是三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂是2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)和三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)。在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂是柠檬酸和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。
在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂具有相同浓度(非限制性实例为缓冲剂(A)具有88mM的浓度并且缓冲剂(B)具有88mM的浓度)。在一些实施方案中,两种不同的缓冲剂具有不同浓度(非限制性实例为缓冲剂(A)具有88mM的浓度并且缓冲剂(B)具有35mM的浓度)。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸,或其任何组合。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸,或其任何组合。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)或其组合。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸或琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、苹果酸或琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸或三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)。
在一些实施方案中,缓冲剂是柠檬酸。在一些实施方案中,缓冲剂是三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)。在一些实施方案中,缓冲剂是三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)。在一些实施方案中,缓冲剂是2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)。在一些实施方案中,缓冲剂是3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。在一些实施方案中,缓冲剂是2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)。在一些实施方案中,缓冲剂是4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)。在一些实施方案中,缓冲剂是酒石酸。在一些实施方案中,缓冲剂是磷酸盐缓冲剂。在一些实施方案中,缓冲剂是乙酸。在一些实施方案中,缓冲剂是抗坏血酸。在一些实施方案中,缓冲剂是磺基水杨酸。在一些实施方案中,缓冲剂是甲酸。在一些实施方案中,缓冲剂是甘氨酸。在一些实施方案中,缓冲剂是甘氨酸-甘氨酸(Gly-Gly)。在一些实施方案中,缓冲剂是苹果酸。在一些实施方案中,缓冲剂是琥珀酸。
在一些实施方案中,缓冲剂呈干燥状态或基本上干燥的状态。在一些实施方案中,缓冲剂呈干燥状态。在一些实施方案中,缓冲剂呈基本上干燥的状态。
本发明不限于缓冲剂的任何特定浓度。在各种实施方案中,适用于本发明(例如,组合物、方法、试剂盒、固体基质、基质材料、制剂等)的缓冲剂的浓度为1mM–2M。
在各种实施方案中,缓冲剂具有1mM–2M的浓度。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM–10mM、1mM–20mM、1mM–30mM、1mM–40mM、1mM–50mM、1mM–60mM、1mM–70mM、1mM–80mM、1mM–90mM、1mM–100mM、1mM–110mM、1mM–120mM、1mM–130mM、1mM–140mM、1mM–150mM、1mM–160mM、1mM–170mM、1mM–180mM、1mM–190mM、1mM–200mM、1mM–210mM、1mM–220mM、1mM–230mM、1mM–240mM、1mM–250mM、1mM–260mM、1mM–270mM、1mM–280mM、1mM–290mM、1mM–300mM、1mM–310mM、1mM–320mM、1mM–330mM、1mM–340mM、1mM–350mM、1mM–360mM、1mM–370mM、1mM–380mM、1mM–390mM、1mM–400mM、1mM–410mM、1mM–420mM、1mM–430mM、1mM–440mM、1mM–450mM、1mM–460mM、1mM–470mM、1mM–480mM、1mM–490mM、1mM–500mM、1mM–600mM、1mM–650mM、1mM–700mM、1mM–750mM、1mM–800mM、1mM–850mM、1mM–900mM、1mM–950mM、1mM–1M、1mM–1.1M、1mM–1.2M、1mM–1.3M、1mM–1.4M、1mM–1.5M、1mM–1.6M、1mM–1.7M、1mM–1.8M、1mM–1.9M或1mM–2M。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM–20mM、10mM–30mM、10mM–40mM、10mM–50mM、10mM–60mM、10mM–70mM、10mM–80mM、10mM–90mM、10mM–100mM、10mM–110mM、10mM–120mM、10mM–130mM、10mM–140mM、10mM–150mM、10mM–160mM、10mM–170mM、10mM–180mM、10mM–190mM、10mM–200mM、10mM–210mM、10mM–220mM、10mM–230mM、10mM–240mM、10mM–250mM、10mM–260mM、10mM–270mM、10mM–280mM、10mM–290mM、10mM–300mM、10mM–310mM、10mM–320mM、10mM–330mM、10mM–340mM、10mM–350mM、10mM–360mM、10mM–370mM、10mM–380mM、10mM–390mM、10mM–400mM、10mM–410mM、10mM–420mM、10mM–430mM、10mM–440mM、10mM–450mM、10mM–460mM、10mM–470mM、10mM–480mM、10mM–490mM、10mM–500mM、10mM–600mM、10mM–650mM、10mM–700mM、10mM–750mM、10mM–800mM、10mM–850mM、10mM–900mM、10mM–950mM、10mM–1M、10mM–1.1M、10mM–1.2M、10mM–1.3M、10mM–1.4M、10mM–1.5M、10mM–1.6M、10mM–1.7M、10mM–1.8M、10mM–1.9M或10mM–2M。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM–30mM、20mM–40mM、20mM–50mM、20mM–60mM、20mM–70mM、20mM–80mM、20mM–90mM、20mM–100mM、20mM–110mM、20mM–120mM、20mM–130mM、20mM–140mM、20mM–150mM、20mM–160mM、20mM–170mM、20mM–180mM、20mM–190mM、20mM–200mM、20mM–210mM、20mM–220mM、20mM–230mM、20mM–240mM、20mM–250mM、20mM–260mM、20mM–270mM、20mM–280mM、20mM–290mM、20mM–300mM、20mM–310mM、20mM–320mM、20mM–330mM、20mM–340mM、20mM–350mM、20mM–360mM、20mM–370mM、20mM–380mM、20mM–390mM、20mM–400mM、20mM–410mM、20mM–420mM、20mM–430mM、20mM–440mM、20mM–450mM、20mM–460mM、20mM–470mM、20mM–480mM、20mM–490mM、20mM–500mM、20mM–600mM、20mM–650mM、20mM–700mM、20mM–750mM、20mM–800mM、20mM–850mM、20mM–900mM、20mM–950mM、20mM–1M、20mM–1.1M、20mM–1.2M、20mM–1.3M、20mM–1.4M、20mM–1.5M、20mM–1.6M、20mM–1.7M、20mM–1.8M、20mM–1.9M或20mM–2M。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM–1.5M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM–1M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM-500mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM-300mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM-200mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM-180mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为1mM-150mM。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM–1.5M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM–1M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM-500mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM-300mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM-200mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM-180mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为10mM-150mM。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM–1.5M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM–1M。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM-500mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM-300mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM-200mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM-180mM。在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为20mM-150mM。
在各种实施方案中,缓冲剂的浓度为35mM至150mM。在一些实施方案中,缓冲剂的浓度为35mM。在一些实施方案中,缓冲剂的浓度为40mM。在一些实施方案中,缓冲剂的浓度为88mM。在一些实施方案中,缓冲剂的浓度为100mM。在一些实施方案中,缓冲剂的浓度为150mM。
本领域技术人员将认识到,选择用于本发明的组合物和方法的各种实施方案的缓冲剂的pH是相关的。缓冲剂的pH通常将在以下范围内:2.0至8.0、2.0至7.9、2.0至7.8、2.0至7.7、2.0至7.6、2.0至7.5、2.0至7.4、2.0至7.3、2.0至7.2、2.0至7.1、2.0至7.0、2.0至6.9、2.0至6.8、2.0至6.7、2.0至6.6、2.0至6.5、2.0至6.4、2.0至6.3、2.0至6.2、2.0至6.1、2.0至6.0、2.0至5.9、2.0至5.8、2.0至5.7、2.0至5.6、2.0至5.5、2.0至5.4、2.0至5.3、2.0至5.2、2.0至5.1、2.0至5.0、2.0至4.9、2.0至4.8、2.0至4.7、2.0至4.6、2.0至4.5、2.0至4.4、2.0至4.3、2.0至4.2、2.0至4.1、2.0至4.0、2.0至3.9、2.0至3.8、2.0至3.7、2.0至3.6、2.0至3.5、2.0至3.4、2.0至3.3、2.0至3.2、2.0至3.1、2.0至3.0、3.0至8.0、3.0至7.9、3.0至7.8、3.0至7.7、3.0至7.6、3.0至7.5、3.0至7.4、3.0至7.3、3.0至7.2、3.0至7.1、3.0至7.0、3.0至6.9、3.0至6.8、3.0至6.7、3.0至6.6、3.0至6.5、3.0至6.4、3.0至6.3、3.0至6.2、3.0至6.1、3.0至6.0、3.0至5.9、3.0至5.8、3.0至5.7、3.0至5.6、3.0至5.5、3.0至5.4、3.0至5.3、3.0至5.2、3.0至5.1、3.0至5.0、3.0至4.9、3.0至4.8、3.0至4.7、3.0至4.6、3.0至4.5、3.0至4.4、3.0至4.3、3.0至4.2、3.0至4.1、3.0至4.0、4.0至8.0、4.0至7.9、4.0至7.8、4.0至7.7、4.0至7.6、4.0至7.5、4.0至7.4、4.0至7.3、4.0至7.2、4.0至7.1、4.0至7.0、4.0至6.9、4.0至6.8、4.0至6.7、4.0至6.6、4.0至6.5、4.0至6.4、4.0至6.3、4.0至6.2、4.0至6.1、4.0至6.0、4.0至5.9、4.0至5.8、4.0至5.7、4.0至5.6、4.0至5.5、4.0至5.4、4.0至5.3、4.0至5.2、4.0至5.1、4.0至5.0、5.0至8.0、5.0至7.9、5.0至7.8、5.0至7.7、5.0至7.6、5.0至7.5、5.0至7.4、5.0至7.3、5.0至7.2、5.0至7.1、5.0至7.0、5.0至6.9、5.0至6.8、5.0至6.7、5.0至6.6、5.0至6.5、5.0至6.4、5.0至6.3、5.0至6.2、5.0至6.1、5.0至6.0、6.0至8.0、6.0至7.9、6.0至7.8、6.0至7.7、6.0至7.6、6.0至7.5、6.0至7.4、6.0至7.3、6.0至7.2、6.0至7.1、6.0至7.0、7.0至8.0、3.5至4.5、3.5至7.0或4.5至7.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是3.5。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是4.5。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是7.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是3.0至8.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是2.0至8.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是3.5至4.5。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是3.0至5.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH是3.5至7.0。
在一些实施方案中,缓冲剂不含有或包含或基本上由以下组成或由以下组成:变性剂。在一些实施方案中,缓冲剂不含有或包含或基本上由以下组成或由以下组成:蛋白质变性剂。在一些实施方案中,缓冲剂不含有或包含或基本上由以下组成或由以下组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂、RNA酶抑制剂或其任何组合。在一些实施方案中,缓冲剂不含有或包含或基本上由以下组成或由以下组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂和/或RNA酶抑制剂。在一些实施方案中,缓冲剂不包含变性剂。在一些实施方案中,缓冲剂不包含蛋白质变性剂。
本领域技术人员将认识到,选择用于本发明的组合物和方法的各种实施方案的组合物和/或制剂的pH是相关的。所述组合物和/或制剂的pH通常将在以下范围内:2.0至8.0、2.0至7.9、2.0至7.8、2.0至7.7、2.0至7.6、2.0至7.5、2.0至7.4、2.0至7.3、2.0至7.2、2.0至7.1、2.0至7.0、2.0至6.9、2.0至6.8、2.0至6.7、2.0至6.6、2.0至6.5、2.0至6.4、2.0至6.3、2.0至6.2、2.0至6.1、2.0至6.0、2.0至5.9、2.0至5.8、2.0至5.7、2.0至5.6、2.0至5.5、2.0至5.4、2.0至5.3、2.0至5.2、2.0至5.1、2.0至5.0、2.0至4.9、2.0至4.8、2.0至4.7、2.0至4.6、2.0至4.5、2.0至4.4、2.0至4.3、2.0至4.2、2.0至4.1、2.0至4.0、2.0至3.9、2.0至3.8、2.0至3.7、2.0至3.6、2.0至3.5、2.0至3.4、2.0至3.3、2.0至3.2、2.0至3.1、2.0至3.0、3.0至8.0、3.0至7.9、3.0至7.8、3.0至7.7、3.0至7.6、3.0至7.5、3.0至7.4、3.0至7.3、3.0至7.2、3.0至7.1、3.0至7.0、3.0至6.9、3.0至6.8、3.0至6.7、3.0至6.6、3.0至6.5、3.0至6.4、3.0至6.3、3.0至6.2、3.0至6.1、3.0至6.0、3.0至5.9、3.0至5.8、3.0至5.7、3.0至5.6、3.0至5.5、3.0至5.4、3.0至5.3、3.0至5.2、3.0至5.1、3.0至5.0、3.0至4.9、3.0至4.8、3.0至4.7、3.0至4.6、3.0至4.5、3.0至4.4、3.0至4.3、3.0至4.2、3.0至4.1、3.0至4.0、4.0至8.0、4.0至7.9、4.0至7.8、4.0至7.7、4.0至7.6、4.0至7.5、4.0至7.4、4.0至7.3、4.0至7.2、4.0至7.1、4.0至7.0、4.0至6.9、4.0至6.8、4.0至6.7、4.0至6.6、4.0至6.5、4.0至6.4、4.0至6.3、4.0至6.2、4.0至6.1、4.0至6.0、4.0至5.9、4.0至5.8、4.0至5.7、4.0至5.6、4.0至5.5、4.0至5.4、4.0至5.3、4.0至5.2、4.0至5.1、4.0至5.0、5.0至8.0、5.0至7.9、5.0至7.8、5.0至7.7、5.0至7.6、5.0至7.5、5.0至7.4、5.0至7.3、5.0至7.2、5.0至7.1、5.0至7.0、5.0至6.9、5.0至6.8、5.0至6.7、5.0至6.6、5.0至6.5、5.0至6.4、5.0至6.3、5.0至6.2、5.0至6.1、5.0至6.0、6.0至8.0、6.0至7.9、6.0至7.8、6.0至7.7、6.0至7.6、6.0至7.5、6.0至7.4、6.0至7.3、6.0至7.2、6.0至7.1、6.0至7.0、7.0至8.0、3.5至4.5、3.5至7.0或4.5至7.0。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为3.5。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为4.5。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为7.0。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为3.0至8.0。在一些实施方案中,缓冲剂的pH为2.0至8.0。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为3.5至4.5。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为3.0至5.0。在一些实施方案中,组合物和/或制剂的pH为3.5至7.0。
术语“UV保护剂”或“自由基捕集剂”或“抗氧化剂”可以在本文中互换使用。抗氧化剂的非限制性实例包括氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)和甲基氢醌(THQ)。此外,本领域已知的这些或其它抗氧化剂的任何组合可用于实践本发明。在一些实施方案中,抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)和/或甲基氢醌(THQ)中的一种或多种。在一些实施方案中,抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)或甲基氢醌(THQ)。在一些实施方案中,抗氧化剂是氢醌(HQ)。在一些实施方案中,抗氧化剂是甲基氢醌(THQ)。在一些实施方案中,抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)。
本发明不限于抗氧化剂的任何特定浓度。在各种实施方案中,适用于本发明(例如,组合物、方法、试剂盒、固体基质、基质材料、制剂等)的抗氧化剂的浓度为1mM–200mM。
在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM–200mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM–200mM、1mM–175mM、1mM–150mM、1mM–125mM、1mM–100mM、1mM–75mM、1mM–50mM、1mM–25mM、1mM–10mM、10mM–200mM、10mM–175mM、10mM–150mM、10mM–125mM、10mM–100mM、10mM–75mM、10mM–50mM、10mM–25mM、20mM–200mM、20mM–175mM、20mM–150mM、20mM–125mM、20mM–100mM、20mM–75mM或20mM–50mM。
在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM至150mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM至100mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM至80mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为1mM至60mM。
在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为10mM至150mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为10mM至100mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为10mM至80mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为10mM至60mM。
在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为20mM至150mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为20mM至100mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为20mM至80mM。在各种实施方案中,抗氧化剂的浓度为20mM至60mM。在一些实施方案中,抗氧化剂的浓度为40mM。
如本文所用的术语“变性剂”是引起蛋白质和/或其它生物化合物变性的任何物质。本领域技术人员将理解,众多变性剂是本领域中已知的并且可以根据经验选择用于本文所述的组合物和方法中。变性剂的非限制性实例包括硫氰酸胍、盐酸胍、精氨酸、十二烷基硫酸钠(SDS)、硫氰酸钠、脲和硫脲。此外,本领域已知的这些或其它变性剂的任何组合可用于实践本发明。在一些实施方案中,变性剂是硫氰酸胍、盐酸胍、精氨酸、十二烷基硫酸钠(SDS)、硫氰酸钠、脲和/或硫脲中的一种或多种。在一些实施方案中,变性剂是硫氰酸胍、盐酸胍、精氨酸、十二烷基硫酸钠(SDS)、硫氰酸钠、脲或硫脲。在一些实施方案中,变性剂是硫氰酸胍、盐酸胍、精氨酸、十二烷基硫酸钠(SDS)、硫氰酸钠、脲或硫脲。
在一些实施方案中,变性剂是硫氰酸钠。在一些实施方案中,变性剂是脲。在一些实施方案中,变性剂是硫脲。在一些实施方案中,变性剂是硫氰酸胍。在一些实施方案中,变性剂是盐酸胍。在一些实施方案中,变性剂是精氨酸。在一些实施方案中,变性剂是十二烷基硫酸钠(SDS)。
在一些实施方案中,变性剂是蛋白质变性剂。
在各种实施方案中,变性剂不存在于本发明中,例如,换句话说,变性剂不存在于本发明的组合物、方法、试剂盒、固体基质、基质材料等中。
在各种实施方案中,适用于本发明(例如,组合物、方法、试剂盒、固体基质、基质材料、制剂等)的变性剂的浓度为10mM–12M。
在各种实施方案中,变性剂的浓度为10mM–12M。在各种实施方案中,变性剂的浓度为10mM–12M、10mM–11M、10mM–10M、10mM–9M、10mM–8M、10mM–7M、10mM–6M、10mM–5M、10mM–4M、10mM–3M、10mM–2M、10mM–1M、10mM–900mM、10mM–800mM、10mM–700mM、10mM–600mM、10mM–500mM、10mM–400mM或10mM–300mM。在一些实施方案中,变性剂的浓度为420mM。
术语“固体基质”和“稳定化固体基质”在本文中可互换使用。如本文所用,术语“固体基质”和“稳定化固体基质”包括但不限于已经与本发明组合物和/或其实施方案(即用于使生物样本和/或核酸稳定在基质材料上的组合物)和/或本发明制剂和/或缓冲剂接触,或者用本发明组合物和/或其实施方案(即用于使生物样本和/或核酸稳定在基质材料上的组合物)和/或本发明制剂和/或缓冲剂处理的任何基质材料。这也包括已经施加有本发明组合物和/或其实施方案(即用于使生物样本和/或核酸稳定在基质材料上的组合物)和/或本发明制剂和/或缓冲剂的任何基质材料。
在一些实施方案中,术语“固体基质”或“稳定化固体基质”是指基质材料和本发明组合物或本发明制剂,其中本发明组合物或本发明制剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于基质材料中。
在一些实施方案中,术语“固体基质”或“稳定化固体基质”是指基质材料和缓冲剂,其中所述缓冲剂浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中。在一些实施方案中,缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于基质材料中。在一些实施方案中,所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成。在一些实施方案中,所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中。在一些实施方案中,所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中,并且所述基质材料呈干燥状态或基本上干燥的状态。
在一些实施方案中,所述固体基质由基质材料和缓冲剂组成。在一些实施方案中,所述固体基质由基质材料和缓冲剂组成,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中。在一些实施方案中,所述固体基质由基质材料和缓冲剂组成,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中,并且所述基质材料呈干燥状态或基本上干燥的状态。
在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料和缓冲剂,其中所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料和缓冲剂,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中,其中所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料和缓冲剂,其中所述缓冲剂以干燥状态或基本上干燥的状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中,并且所述基质材料呈干燥状态或基本上干燥的状态,并且其中所述固体基质材料不包含变性剂。
在一些实施方案中,所述固体基质呈球粒或小片形式。在一些实施方案中,所述固体基质具有多孔性质以将生物样本浸渍或掺合或夹带于固体基质之中或之上。如本文所用,术语“夹带”意指在储存期间生物样本和/或核酸在基本上不依赖于离子、共价或范德华相互作用的情况下结合到固体基质上。
在一些实施方案中,使固体基质与生物样本接触(或者使生物样本吸附在固体基质上),以使得固体基质不抑制生物样本或生物样本内含物(例如核酸)的储存、稳定、保存、回收或后续分析。
术语“固体基质”和“稳定化固体基质”在本文中可互换使用。在一些实施方案中,所述固体基质呈干燥状态或基本上干燥的状态。在一些实施方案中,所述固体基质呈干燥状态。在一些实施方案中,所述固体基质呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,所述固体基质、所述基质材料和所述缓冲剂各自独立地呈干燥状态或基本上干燥的状态。
在一些实施方案中,所述固体基质不含有或不包含变性剂或者基本上不由或不由变性剂组成。在一些实施方案中,所述固体基质不含有或不包含蛋白质变性剂或者基本上不由或不由蛋白质变性剂组成。在一些实施方案中,所述固体基质不含有或不包含以下物质或者基本上不由或不由以下物质组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂、RNA酶抑制剂或其任何组合。在一些实施方案中,所述固体基质不含有或不包含以下物质或者基本上不由或不由以下物质组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂和/或RNA酶抑制剂。在一些实施方案中,所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质不包含蛋白质变性剂。
在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料、至少一种缓冲剂、至少一种任选的变性剂、至少一种任选的还原剂;和至少一种任选的抗氧化剂,其中所述缓冲剂、任选的变性剂、任选的还原剂和任选的抗氧化剂各自以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中。
在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料、至少一种缓冲剂、至少一种任选的还原剂;和至少一种任选的抗氧化剂,其中所述缓冲剂、任选的变性剂、任选的还原剂和任选的抗氧化剂各自以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在或掺合到或夹带于所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂。
术语“基质材料”是指但不限于将吸附本发明的组合物和/或制剂和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸并且不会抑制生物样本或生物样本内含物(例如核酸)的储存或后续分析的任何材料。这包括扁平干燥基质或与粘合剂组合以形成吸附本发明的组合物和/或制剂和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸的球粒或小片的基质。在一些实施方案中,所述基质材料具有多孔性质以将本发明的组合物和/或制剂和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸夹带于基质材料之中或之上。如本文所用,术语“夹带”是指在储存期间本发明的组合物和/或制剂和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸在基本上不依赖于离子、共价或范德华相互作用的情况下结合到基质材料上。
在各种实施方案中,基质材料是不可溶解的基本上干燥的固体材料或不可溶解的干燥固体材料。在各种实施方案中,基质材料是不可溶解的干燥固体材料。在各种实施方案中,基质材料是不可溶解的基本上干燥的固体材料。基质材料的非限制性实例包括纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)、包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)在内的亲水性聚合物、聚四氟乙烯(EmporeTM,3M,明尼苏达州圣保罗市(St.Paul,Minn.))、玻璃纤维、碳纤维和多孔陶瓷。基质材料的另外的非限制性实例包括纤维素基产品、有纤维质的纸、纤维素纸、纤维素、醋酸纤维素、玻璃纤维或其任何组合。在一些实施方案中,基质材料可以是多孔的。在一些实施方案中,基质材料是纤维素纸。在一些实施方案中,基质材料是多孔纤维素纸。多孔纤维素纸的非限制性实例包括WhatmanTM903和PerkinElmerTM226。多孔的有纤维质的纸的非限制性实例包括WhatmanTM903和PerkinElmerTM226。多孔纤维素纸的非限制性实例包括WhatmanTM903、PerkinElmerTM226、31-ETF、FTATM或FTATMElute。在一些实施方案中,基质材料是有纤维质的纸。在一些实施方案中,基质材料呈球粒或小片形式。在一些实施方案中,基质材料呈干燥状态或基本上干燥的状态。
在一些实施方案中,所述基质材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)、包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)在内的亲水性聚合物、聚四氟乙烯玻璃纤维、碳纤维、多孔陶瓷纤维素基产品、有纤维质的纸、滤纸、纤维素纸、纤维素、醋酸纤维素或玻璃纤维或其组合。
在一些实施方案中,基质材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)。在一些实施方案中,基质材料是亲水性聚合物,包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)。在一些实施方案中,基质材料是聚四氟乙烯玻璃纤维。在一些实施方案中,基质材料是碳纤维。在一些实施方案中,基质材料是多孔陶瓷纤维素基产品。在一些实施方案中,基质材料是滤纸。在一些实施方案中,基质材料是纤维素纸。在一些实施方案中,基质材料是纤维素。在一些实施方案中,基质材料是醋酸纤维素。在一些实施方案中,基质材料是玻璃纤维。在一些实施方案中,基质材料是有纤维质的纸。
在一些实施方案中,基质材料呈干燥状态或基本上干燥的状态。在一些实施方案中,基质材料呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,基质材料呈干燥状态。
在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)、包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)在内的亲水性聚合物、聚四氟乙烯玻璃纤维、碳纤维、多孔陶瓷、纤维素基产品、有纤维质的纸、纤维素纸、滤纸、纤维素、醋酸纤维素或玻璃纤维或其组合。
在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是亲水性聚合物,包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是聚四氟乙烯玻璃纤维。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是碳纤维。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是多孔陶瓷。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是纤维素基产品。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是纤维素纸。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是滤纸。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是纤维素。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是醋酸纤维素。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是玻璃纤维。在一些实施方案中,不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。
在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)、包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)在内的亲水性聚合物、聚四氟乙烯玻璃纤维、碳纤维、多孔陶瓷、纤维素基产品、有纤维质的纸、滤纸、纤维素纸、纤维素、醋酸纤维素或玻璃纤维或其组合。
在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是纤维素基材料(例如,纤维素、硝化纤维素或羧甲基纤维素纸)。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是亲水性聚合物,包括合成的亲水性聚合物(例如,聚酯、聚酰胺、碳水化合物聚合物)。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是聚四氟乙烯玻璃纤维。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是碳纤维。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是多孔陶瓷。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是纤维素基产品。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是纤维素纸。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是滤纸。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是纤维素。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是醋酸纤维素。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是玻璃纤维。在一些实施方案中,不可溶解的基本上干燥的固体材料是有纤维质的纸。
在一些实施方案中,基质材料不含有或不包含变性剂或基本上不由或不由变性剂组成。在一些实施方案中,基质材料不含有或不包含蛋白质变性剂或基本上不由或不由蛋白质变性剂组成。在一些实施方案中,基质材料不含有或不包含以下物质或基本上不由或不由以下物质组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂、RNA酶抑制剂或其任何组合。在一些实施方案中,基质材料不含有或不包含以下物质或基本上不由或不由以下物质组成:变性剂、蛋白质变性剂、还原剂、抗氧化剂、UV保护剂、自由基清除剂、螯合剂和/或RNA酶抑制剂。在一些实施方案中,基质材料不包含变性剂。在一些实施方案中,基质材料不包含蛋白质变性剂。
如本文所用,术语“吸附”是指使本发明组合物和/或本发明制剂和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸吸收、吸附或以其它方式掺合到基质材料和/或固体基质之中或之上,以使得其不容易从基质材料和/或固体基质中除去,除非经受有意或无意地进行用于从基质材料和/或固体基质中除去所吸附的组合物和/或缓冲剂和/或生物样本和/或核酸的条件。
如本文所用,术语“分析”或“分析的”或“进行分析”或“后续分析”包括但不限于可对储存在固体基质上的生物样本和/或核酸进行的任何分析。储存在固体基质上的生物样本和/或核酸可以在体外分析。生物样本和/或核酸可以在分析之前首先从固体基质中移出。核酸可经受化学、生物化学、生物或分析型分析或其组合。可对储存在和/或提取到固体基质上和/或从固体基质中回收的生物样本和/或核酸进行的分析的非限制性实例包括聚合酶链反应(PCR)、连接酶链反应(LCR)、逆转录酶起始PCR、DNA或RNA杂交技术(包括但不限于限制性片段长度多态性(RFLP))和其它使用基因或DNA或RNA探针的技术,或基因组测序。可对储存在和/或提取到固体基质上和/或从固体基质中回收的生物样本和/或核酸进行的分析的其它非限制性实例包括使用储存和/或提取和/或回收的生物样本和/或核酸作为模板以使用PCR方法进行后续分析。PCR方法的非限制性实例包括使用DNA或RNA作为模板的PCR。当分析RNA时,RNA可用作使用逆转录酶起始PCR的模板。由RNA模板产生的DNA序列然后可以用作模板以用于进一步PCR扩增。在一些实施方案中,分析可包括定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)。
不受理论束缚,在实时PCR测定中,通过荧光信号的积累来检测阳性反应。Ct(循环阈值)被定义为荧光信号超过阈值(即,超过背景水平)所需的循环数。Ct水平与样本中的靶核酸量成反比(即,Ct水平越低,样本中的靶核酸量越大;Ct水平越高,样本中的靶核酸量越小)。
如本文所用,术语“溶剂”是指溶解溶质(例如,化学上不同的液体、固体或气体)从而产生溶液的物质。溶剂的非限制性实例包括本领域通常已知的任何非极性、极性非质子和/或极性质子溶剂或其组合。在一个实施方案中,溶剂是水。
如本文所用,术语“基本干燥”或“基本上干燥的状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有大约小于或等于10%溶剂含量至1%溶剂含量(例如,小于或等于10%水含量至1%水含量)。在一些实施方案中,“基本上干燥的状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有10%至1%溶剂含量、9%至1%溶剂含量、8%至1%溶剂含量、7%至1%溶剂含量、6%至1%溶剂含量、5%至1%溶剂含量、4%至1%溶剂含量、3%至1%溶剂含量或2%至1%溶剂含量。在一些实施方案中,溶剂是水。在一些实施方案中,“基本上干燥的状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有10重量%至1重量%溶剂、9重量%至1重量%溶剂、8重量%至1重量%溶剂、7重量%至1重量%溶剂、6重量%至1重量%溶剂、5重量%至1重量%溶剂、4重量%至1重量%溶剂、3重量%至1重量%溶剂或2重量%至1重量%溶剂。在一些实施方案中,溶剂是水。
如本文所用,术语“干燥”或“干燥状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有大约小于1%溶剂含量至0%溶剂含量(例如,小于1%水含量至0%水含量)。在一些实施方案中,“干燥状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有0.99%至0%溶剂含量、0.9%至0%溶剂含量、0.9%至0.25%溶剂含量、0.9%至0.1%溶剂含量、0.5%至0%溶剂含量、0.5%至0.1%溶剂含量、0.5%至0.25%溶剂含量、0.25%至0%溶剂含量或0.25%至0.1%溶剂含量。在一些实施方案中,溶剂是水。在一些实施方案中,“干燥状态”是指将样本(例如生物样本)和/或基质材料和/或缓冲剂和/或固体基质和/或核酸和/或变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂和/或其任何组合干燥至具有0.99重量%至0重量%溶剂、0.9重量%至0重量%溶剂、0.9重量%至0.25重量%溶剂、0.9重量%至0.1重量%溶剂、0.5重量%至0重量%溶剂、0.5重量%至0.1重量%溶剂、0.5重量%至0.25重量%溶剂、0.25重量%至0重量%溶剂或0.25重量%至0.1重量%溶剂。在一些实施方案中,溶剂是水。
表1.制剂
本发明的各种非限制性实施方案
在各种实施方案中,本发明提供了一种以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,并且其中所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,其中所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述固体基质不包含变性剂;并且所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述固体基质不包含变性剂;并且所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述生物样本在环境温度下或在环境条件下储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述生物样本在环境温度下或在环境条件下储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及将所述生物样本以干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料,并且所述缓冲剂以干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本以干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料,并且所述缓冲剂以干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;从所述固体基质中回收所述生物样本;以及从所述生物样本中提取所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所提取的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;从所述固体基质中回收所述生物样本;以及从所述生物样本中提取所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所提取的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;从所述固体基质中回收所述生物样本;以及从所述生物样本中提取所述核酸,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所提取的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;从所述固体基质中回收所述生物样本;以及从所述生物样本中提取所述核酸,其中所述固体基质包含基质材料和两种不同的缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所提取的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;从所述固体基质中回收所述生物样本;以及从所述生物样本中提取所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;以及从所述固体基质中回收所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所回收的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;以及从所述固体基质中回收所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所回收的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;以及从所述固体基质中回收所述核酸,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所回收的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;以及从所述固体基质中回收所述核酸,其中所述固体基质包含基质材料和两种不同的缓冲剂,其中:所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料;所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;并且所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,在环境温度下或在环境条件下将所述生物样本储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所回收的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本储存和/或稳定和/或保存在固体基质上的方法,其包括:使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存在所述固体基质上;以及从所述固体基质中回收所述核酸,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所述核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析所回收的核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,并且所述两种不同的缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,并且其中所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,并且所述两种不同的缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,并且其中所述生物样本包含一种或多种核酸。
在各种实施方案中,本发明提供了一种以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或稳定和/或保存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和两种不同的缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,并且所述两种不同的缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述固体基质不包含变性剂;并且所述生物样本包含一种或多种核酸。
本发明的各种实施方案涉及一种核酸稳定化基质,其中所述基质被配置成长时间从生物样本中收集、提取和储存一种或多种核酸,接着用于各种应用中。所述基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态储存一种或多种核酸并且基本上保留所述一种或多种核酸的完整性。
本发明的各种实施方案涉及一种生物样本稳定化基质,其中所述基质被配置成长时间从生物样本中收集、提取和储存一种或多种生物材料(例如核酸、蛋白质等),接着用于各种应用中。所述基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态储存一个或多个生物样本并且基本上保留所述一个或多个生物样本的完整性。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一种或多种核酸稳定和/或储存和/或保存在基质材料上的组合物,其包含至少一种缓冲剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种抗氧化剂。在一些实施方案中,所述组合物具有2.0至8.0的pH。在一些实施方案中,所述组合物呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,所述组合物呈干燥状态。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一个或多个生物样本稳定和/或储存和/或保存在基质材料上的组合物,其包含至少一种缓冲剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种抗氧化剂。在一些实施方案中,所述组合物具有2.0至8.0的pH。在一些实施方案中,所述组合物呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,所述组合物呈干燥状态。在一些实施方案中,所述组合物具有2.0至8.0的pH。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于将一个或多个生物样本稳定和/或储存和/或保存在基质材料上的组合物,所述组合物包含至少一种缓冲剂,其条件是所述组合物不包含变性剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述组合物还包含至少一种抗氧化剂。在一些实施方案中,所述组合物具有2.0至8.0的pH。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态稳定来自生物样本的一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种抗氧化剂。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的材料,其中所述固体基质被配置成以基本上干燥的状态或干燥状态稳定生物样本中的一种或多种核酸,其中所述固体基质不包含变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种抗氧化剂。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以干燥状态浸渍在其中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态稳定来自生物样本的一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种抗氧化剂。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以干燥状态浸渍在其中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以干燥状态稳定来自生物样本的一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以干燥状态浸渍在所述基质材料中的至少一种抗氧化剂。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态稳定一个或多个生物样本。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:基质材料;和以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以干燥状态稳定一个或多个生物样本。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一个或多个生物样本稳定在固体基质上的方法,其包括:a)提供基质材料;b)使所述基质材料与稳定化组合物接触;c)将与所述稳定化组合物接触的所述基质材料干燥以形成稳定化固体基质;d)用一个或多个生物样本处理所述稳定化固体基质;e)将用所述一个或多个生物样本处理的所述稳定化固体基质干燥;以及f)将所述干燥的用所述一个或多个生物样本处理的稳定化固体基质储存在环境条件下。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一种或多种核酸稳定和/或储存和/或保存在固体基质上的组合物,其包含:至少一种缓冲剂;至少一种任选的变性剂;至少一种任选的还原剂;和至少一种任选的抗氧化剂,其中所述组合物具有3.0至8.0之间的pH。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂选自三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、柠檬酸、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂是柠檬酸。在一些实施方案中,所述至少一种任选的变性剂选自硫氰酸钠、脲和硫脲。在一些实施方案中,所述至少一种任选的还原剂是三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)。在一些实施方案中,所述至少一种任选的抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)。在一些实施方案中,所述固体基质包含基质材料。在一些实施方案中,所述基质材料是有纤维质的纸。在一些实施方案中,所述一种或多种核酸是病毒RNA。在一些实施方案中,所述病毒RNA是HIVRNA。在一些实施方案中,所述pH介于3.5与7.0之间。在一些实施方案中,所述组合物呈基本上干燥的状态。在一些实施方案中,所述组合物呈干燥状态。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一种或多种核酸稳定在固体基质上的方法,其包括:a)提供基质材料;b)使所述基质材料与稳定化组合物接触;c)将与所述稳定化组合物接触的所述基质材料干燥以形成稳定化固体基质;d)用生物样本处理所述稳定化固体基质,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;e)将用所述生物样本处理的所述稳定化固体基质干燥;以及f)将所述干燥的用所述生物样本处理的稳定化固体基质储存在环境条件下。在一些实施方案中,所述稳定化组合物包含:至少一种缓冲剂;至少一种任选的变性剂;至少一种任选的还原剂;和至少一种任选的抗氧化剂,其中所述稳定化组合物具有介于3.0与8.0之间的pH。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂选自三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、柠檬酸、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂是柠檬酸。在一些实施方案中,所述至少一种任选的变性剂选自硫氰酸钠、脲和硫脲。在一些实施方案中,所述至少一种任选的抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)。在一些实施方案中,所述固体基质是有纤维质的纸。在一些实施方案中,所述生物样本是人血浆。在一些实施方案中,所述一种或多种核酸是病毒RNA。在一些实施方案中,所述病毒RNA是HIV RNA。在一些实施方案中,所述pH介于3.5与7.0之间。在一些实施方案中,所述方法还包括从所述干燥的用所述生物样本处理的稳定化固体基质中提取所述一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述方法还包括分析从所述干燥的稳定化固体基质中提取的所述一种或多种核酸。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一种或多种核酸稳定在固体基质上的方法,其包括:提供基质材料;使所述基质材料与稳定化组合物接触;将与所述稳定化组合物接触的所述基质材料干燥以形成稳定化固体基质;用生物样本处理所述稳定化固体基质,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将用所述生物样本处理的所述稳定化固体基质干燥;以及将所述干燥的用所述生物样本处理的稳定化固体基质储存在环境条件下。在一些实施方案中,所述稳定化组合物包含至少一种缓冲剂,并且不包含变性剂。在一些实施方案中,所述稳定化组合物还包含至少一种抗氧化剂。在一些实施方案中,所述稳定化组合物还包含至少一种还原剂。
本发明的各种实施方案提供了一种用于将一种或多种核酸稳定在固体基质上的方法,其包括:提供基质材料;使所述基质材料与稳定化组合物接触;将与所述稳定化组合物接触的所述基质材料干燥以形成稳定化固体基质;用生物样本处理所述稳定化固体基质,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;将用所述生物样本处理的所述稳定化固体基质干燥;以及将所述干燥的用所述生物样本处理的稳定化固体基质储存在环境条件下。在一些实施方案中,所述稳定化组合物基本上由缓冲剂组成或由缓冲剂组成。在一些实施方案中,所述稳定化组合物基本上由两种不同的缓冲剂组成或由两种不同的缓冲剂组成。
本发明的各种实施方案提供了一种固体基质,其包含:以基本上干燥的状态浸渍在其中的至少一种缓冲剂,其中所述固体基质被配置成在环境温度下以基本上干燥的状态稳定来自生物样本的一种或多种核酸。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在其中的至少一种变性剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在其中的至少一种还原剂。在一些实施方案中,所述固体基质还包含以基本上干燥的状态浸渍在其中的至少一种抗氧化剂。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂选自三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、柠檬酸、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)和3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂是柠檬酸。在一些实施方案中,所述至少一种变性剂选自硫氰酸钠、脲和硫脲。在一些实施方案中,所述至少一种抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)。在一些实施方案中,所述固体基质是有纤维质的纸。在一些实施方案中,所述生物样本是人血浆。在一些实施方案中,所述一种或多种核酸是病毒RNA。在一些实施方案中,所述病毒RNA是HIV RNA。在一些实施方案中,所述至少一种缓冲剂具有介于3.0与8.0之间的pH。在一些实施方案中,所述pH介于3.5与7.0之间。
试剂盒
在本发明试剂盒中配置的组件的确切性质取决于其预期目的。在一个实施方案中,所述试剂盒被配置用于人类受试者。在其它实施方案中,所述试剂盒被配置用于研究和/或兽医学应用,治疗受试者例如但不限于农场动物、家养动物和实验动物(例如,一只或多只小鼠)。
试剂盒中可包括使用说明。“使用说明”通常包括描述在使用试剂盒组件来实现所期望结果(例如,允许准确诊断和评估具有低HIV病毒载量的患者中的治疗功效)时所用的技术的明确表述。任选地,所述试剂盒还含有其它有用的组件,例如测量工具、稀释剂、洗脱缓冲液、注射器或如将由本领域技术人员容易认识到的其它有用的用具。
在试剂盒中组装的材料或组分可以保持其可操作性和实用性的任何方便和适宜的储存方式被提供给专业人员。例如,所述组分可以呈溶解、脱水、干燥、基本上干燥或冻干形式;它们可以在环境、室温、冷藏或冷冻温度下,或在环境条件下提供。所述组分通常包含在合适的包装材料中。如本文所用,短语“包装材料”是指用于容纳试剂盒内含物如本发明组合物等的一种或多种物理结构。所述包装材料通过熟知的方法构造,以提供无菌、无污染的环境。如本文所用,术语“包装”是指能够容纳单个试剂盒组件的合适材料,例如玻璃、塑料、纸、箔等。包装材料通常具有外部标签,其指示试剂盒和/或其组件的内含物和/或目的。
在各种实施方案中,本发明提供了一种试剂盒,其包括:固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种试剂盒,其包括:固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和两种不同的缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和两种不同的缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。在一些实施方案中,所述生物样本在环境温度下或在环境条件下储存和/或保存和/或稳定。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中,其条件是所述固体基质不包含变性剂;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种试剂盒,其包括:固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种试剂盒,其包括:固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和两种不同的缓冲剂组成或由基质材料和两种不同的缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
在各种实施方案中,本发明提供了一种用于在环境温度下或在环境条件下以基本上干燥的状态或干燥状态储存和/或保存和/或稳定生物样本的试剂盒,所述试剂盒包括:固体基质,其中所述固体基质基本上由基质材料和缓冲剂组成或由基质材料和缓冲剂组成,其中所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料或不可溶解的基本上干燥的固体材料,并且所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍和/或掺入和/或夹带在所述基质材料中;所述试剂盒的使用说明;以及用于样本处理和制备的试剂和说明。
本发明的其它特征和实施方案包括以下编号段落中的一个或多个:
1.一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:
所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料;
所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;
所述固体基质不包含变性剂;并且
所述生物样本包含一种或多种核酸。
2.根据段落1所述的固体基质,其中所述固体基质还包含至少一种还原剂,其中所述还原剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。
3.根据段落2所述的固体基质,其中所述还原剂是二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺或半胱氨酸。
4.根据段落1所述的固体基质,其中所述固体基质还包含至少一种抗氧化剂,其中所述抗氧化剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。
5.根据段落4所述的固体基质,其中所述抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)或甲基氢醌(THQ)。
6.根据段落1所述的固体基质,其中所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。
7.根据段落1所述的固体基质,其中所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
8.根据段落1所述的固体基质,其中所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。
9.根据段落1所述的固体基质,其中所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。
10.一种用于将一个或多个生物样本储存在根据权利要求1所述的固体基质上的方法,其包括:
使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;
将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;并且
将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存在所述固体基质上。
11.根据段落10所述的方法,其还包括从所述固体基质中回收所述生物样本。
12.根据段落11所述的方法,其还包括从所述生物样本中提取所述核酸。
13.根据段落10所述的方法,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存在所述固体基质上。
14.根据段落13所述的方法,其还包括从所述固体基质中回收所述核酸。
15.根据段落10所述的方法,其中所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。
16.根据段落10所述的方法,其中所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
17.根据段落10所述的方法,其中所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。
18.根据段落10所述的方法,其中所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。
19.根据段落10所述的方法,其中所述核酸是RNA。
20.根据段落10所述的方法,其中所述核酸是病毒RNA。
本发明的非限制性益处
在各种实施方案中,已发现,当有纤维质的纸首先用包含低pH缓冲剂的制剂涂覆时,从掺入人血浆中的灭活HIV病毒(即手动添加到人血浆中的iHIV病毒)中回收的HIV RNA在有纤维质的纸上干燥后可稳定化。在一些实施方案中,变性剂和其它添加剂如另一种缓冲剂的添加显示出类似的结果。在一些实施方案中,还原剂和UV保护剂/自由基捕集剂/抗氧化剂的进一步添加对于增加HIV RNA的稳定性可能是有益的。在各种实施方案中,已发现,当有纤维质的纸首先用基本上由低pH缓冲剂组成或由低pH缓冲剂组成的制剂涂覆时,从掺入人血浆中的灭活HIV病毒(即手动添加到人血浆中的iHIV病毒)中回收的HIV RNA在有纤维质的纸上干燥后可稳定化。在各种实施方案中,已发现,当有纤维质的纸首先用包含低pH缓冲剂的制剂涂覆时,从掺入人血浆中的灭活HIV病毒(即手动添加到人血浆中的iHIV病毒)中回收的HIV RNA在有纤维质的纸上干燥后可稳定化,其中所述制剂不包含变性剂。
在各种实施方案中,由市售903纸,使用冲压装置制造小圆盘(12mm)并浸泡到制剂中持续1至2分钟。通过将浸泡的圆盘快速地触碰一张纸来除去过量的制剂。然后,将圆盘转移到干净的容器中并在层流罩中干燥过夜。一旦干燥,就将掺有灭活HIV病毒(12,000个病毒颗粒)(即手动添加到人血浆中的iHIV病毒)的人血浆添加到涂覆的圆盘中并在层流罩中干燥过夜。一旦干燥,就将圆盘储存在含有干燥剂的密封袋中以保持低水分,并放置在45℃或50℃下温育箱中持续数周。在所需量的时间之后,移出圆盘并回收来自HIV病毒的RNA并通过定量PCR来进行定量。仅仅几天后,观察到与在时间0时经受处理并储存在25℃下的样本相比,未受保护样本中的HIV RNA水平下降。在一些实施方案中,用本文所述的制剂浸泡的圆盘在45℃(或50℃)下温育后即使在高温下4周后也能够将HIV RNA水平保持在与时间0样本类似的水平。
令人惊讶地,在各种实施方案中,在不存在变性剂的情况下用包含一种或多种缓冲剂的制剂浸泡的有纤维质的纸在50℃下温育后即使在高温下数周后也能够将HIV RNA水平保持在与储存在25℃下的时间0圆盘类似的水平(参见图3和图4和图5)。还令人惊讶地,在各种实施方案中,在不存在变性剂和/或抗氧化剂和/或还原剂的情况下用基本上由一种或两种缓冲剂组成(或由一种或两种缓冲剂组成)的制剂浸泡的有纤维质的纸在50℃下温育后即使在高温下数周后也能够将HIV RNA水平保持在与储存在25℃下的时间0圆盘类似的水平(参见图3和图4和图5)。
实施例
以下实施例不旨在限制本发明的权利要求书的范围,而是旨在示例某些实施方案。本领域技术人员所想到的示例性方法的任何变化都将落入本发明的范围内。
本发明将通过以下实施例进一步解释,所述实施例旨在仅示例本发明,而不应被视为以任何方式限制本发明。提供以下实施例以更好地说明要求保护的发明,而不应当被解释为限制本发明的范围。就提及特定材料而言,它仅仅是为了说明目的而不旨在限制本发明。本领域技术人员可以在不运用创造性才能的情况下并且在不脱离本发明范围的情况下开发出等效的手段或反应物。
实施例1.用于制备含有制剂的903和PerkinElmerTM226 12mm圆盘的一般程序:使用冲压装置制备12mm尺寸的圆盘。将多达15个圆盘放置在10cm培养皿中并添加3ml制剂。将圆盘浸泡1分钟,并通过将各个过滤器快速地触碰一张纸而除去圆盘上的过量制剂。将圆盘面朝上转移至干净的10cm培养皿中以在层流柜中在环境温度下干燥过夜。24小时后,将圆盘转移至24孔板并将稀释于人血浆中的95μl灭活HIV(iHIV)(125,000个病毒颗粒/ml)在每个圆盘上点样。然后将含有iHIV的圆盘在环境温度下在层流柜中干燥24小时。然后将24孔板密封在每袋含有1种干燥剂的箔袋中,并在25℃、45℃或50℃下温育7、14、28、30和/或60天。所有实验均对于每个条件至少2次重复进行。
实施例2.病毒RNA纯化的一般程序:使用500μl洗脱缓冲液(2%DTT、5%聚多卡醇、4M硫氰酸胍、50mM柠檬酸钠,pH 5.8)通过在37℃下在摇动(220rpm)下温育90分钟而从圆盘中回收HIV RNA。在14,000rpm下收获洗脱液5分钟以除去任何纸碎片,并且根据制造商说明书使用QIAamp MinElute病毒旋转试剂盒(Qiagen)将200μl用于HIV RNA纯化。在50μl洗脱缓冲液中洗脱HIV RNA。
实施例3.通过qRT-PCR进行病毒RNA定量的一般程序:在LightCycler 96上使用12.475μl的HIV RNA一式两份地在20μl最终反应体积中进行qRT-PCR,所述最终反应体积含有0.4μM引物(内部)、0.1μM引物探针(内部)、0.125μl HawkZ05酶(Roche)、4μl酶5x缓冲剂(内部)和1.5mM MnOAc。通过将反应物在52℃下温育5分钟,在55℃下温育5分钟,在60℃下温育10分钟,在65℃下温育5分钟,以及94℃下10秒和60℃下1分钟的45次循环来进行扩增。
实施例4.从在45℃下30天的903纸中回收HIV RNA:根据本文实施例1中所描述的方案使制剂1、2、3、4和5(表1)在903纸上吸附并干燥。随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至用制剂1、2、3、4和5处理的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在45℃下储存30天(制剂1、2、3、4和5)。作为对照,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在45℃下储存30天(无制剂,NF 45℃)。作为参考,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在25℃下储存30天(无制剂,NF 25℃)。根据本文实施例2中所述的方案从903纸中回收HIV RNA。回收后,使用本文实施例3中所述的方案通过qRT-PCR进行病毒RNA定量以确定HIV RNA的水平。将浸泡在制剂1、2、3、4和5(表1)中的受保护903纸的Ct值(循环阈值)与浸泡在水中的未受保护的纸(无制剂,NF 45℃)和浸泡在水中的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)进行比较(参见图1)。在25℃下温育的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)用作参考,其Ct值与新鲜样本类似(参见图1)。
实施例5.从在50℃下储存30天的Perkin-ElmerTM226纸或903纸中回收HIV RNA:
根据本文实施例1中所述的方案使制剂1、2和4(表1)在Perkin-ElmerTM226纸或903纸上吸附并干燥。随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至用制剂1、2和4处理的Perkin-ElmerTM226纸或903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存30天(制剂1、2和4)。作为对照,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在Perkin-ElmerTM226纸和903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存30天(无制剂,NF 50℃)。作为参考,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在Perkin-ElmerTM226纸和903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在25℃下储存30天(无制剂,NF 25℃)。根据本文实施例2中所述的方案从Perkin-ElmerTM226纸和903纸中回收HIV RNA。回收后,使用本文实施例3中所述的方案通过qRT-PCR进行病毒RNA定量以确定HIV RNA的水平。将浸泡在制剂1、2和4(表1)中的受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸的Ct值(循环阈值)与浸泡在水中的未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸(无制剂,NF 50℃)和浸泡在水中的未受保护的Perkin-ElmerTM226纸和903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较(参见图2)。在25℃下温育的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)用作参考,其Ct值与新鲜样本类似(参见图2)。
实施例6.从在50℃下储存24天的903纸中回收HIV RNA:
根据本文实施例1中所述的方案使制剂2、6、7、8、9、10、11、12、13和14(表1)在903纸上吸附并干燥。随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至用制剂2、6、7、8、9、10、11、12、13和14处理的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存24天(制剂2、6、7、8、9、10、11、12、13和14)。作为对照,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存24天(无制剂,NF 50℃)。作为参考,根据本文实施例1中所述的方案使水(无制剂)在903纸上吸附并干燥,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在25℃下储存24天(无制剂,NF 25℃)。根据本文实施例2中所述的方案从903纸中回收HIV RNA。回收后,使用本文实施例3中所述的方案通过qRT-PCR进行病毒RNA定量以确定HIV RNA的水平。将浸泡在制剂2、6、7、8、9、10、11、12、13和14(表1)中的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较(参见图3)。在25℃下温育的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)用作参考,其Ct值与新鲜样本类似(参见图3)。
实施例7.从在50℃下储存28天的903纸中回收HIV RNA:根据本文实施例1中所述的方案将制剂2、4、7、10、12、14、15和16(表1)吸附并干燥在903纸上。随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至用制剂2、4、7、10、12、14、15和16处理的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存28天(制剂2、4、7、10、12、14、15和16)。作为对照,根据本文实施例1中所述的方案将水(无制剂)吸附并干燥在903纸上,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在50℃下储存28天(无制剂,NF 50℃)。作为参考,根据本文实施例1中所述的方案将水(无制剂)吸附并干燥在903纸上,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在25℃下储存28天(无制剂,NF 25℃)。根据本文实施例2中所述的方案从903纸中回收HIV RNA。回收后,使用本文实施例3中所述的方案通过qRT-PCR进行病毒RNA定量以确定HIV RNA的水平。将浸泡在制剂2、4、7、10、12、14、15和16(表1)中的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较(参见图4)。在25℃下温育的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)用作参考,其Ct值与新鲜样本类似(参见图4)。
实施例8.从在40%相对湿度下在50℃下储存6天的903纸中回收HIVRNA:根据本文实施例1中所述的方案将制剂14、15、17、18、19、20、21、22、23和24(表1)吸附并干燥在903纸上。随后将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至用制剂14、15、17、18、19、20、21、22、23和24处理的903纸上,干燥,并且将所述纸在未密封箔袋中在40%相对湿度下在50℃下储存6天。作为对照,根据本文实施例1中所述的方案将水(无制剂)吸附并干燥在903纸上,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在未密封箔袋中在40%相对湿度下在50℃下储存6天(无制剂,NF50℃)。作为参考,根据本文实施例1中所述的方案将水(无制剂)吸附并干燥在903纸上,随后根据本文实施例1中所述的方案将稀释于人血浆中的灭活HIV病毒(iHIV病毒)添加至未受保护的903纸上,干燥,并且将所述纸在含有干燥剂的密封箔袋中在25℃下储存6天(无制剂,NF 25℃)。根据本文实施例2中所述的方案从903纸中回收HIV RNA。回收后,使用本文实施例3中所述的方案通过qRT-PCR进行病毒RNA定量以确定HIV RNA的水平。将浸泡在制剂14、15、17、18、19、20、21、22、23和24(表1)中的受保护的903纸的Ct值(循环阈值)与浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 50℃)和浸泡在水中的未受保护的903纸(无制剂,NF 25℃)进行比较(参见图5)。在25℃下温育的未受保护的纸(无制剂,NF 25℃)用作参考,其Ct值与新鲜样本类似(参见图5)。
上述各种方法和技术提供了多种方式来实施本申请。当然,应当理解,未必所有的所述目标或优点都可以根据本文描述的任何特定实施方案来实现。因此,例如,本领域技术人员将认识到,所述方法可以实现或优化如本文所教导的一个优点或一组优点而未必实现如本文所教导或建议的其它目标或优点的方式进行。本文提及多种替代方案。应当理解,一些实施方案明确包括一个、另一个或若干特征,而其它明确排除一个、另一个或若干特征,而还有一些通过包括一个、另一个或若干有利特征而减弱特定特征。
此外,本领域技术人员将认识到来自不同实施方案的各种特征的适用性。类似地,本领域普通技术人员可以各种组合使用上面讨论的各种要素、特征和步骤,以及每个这样的要素、特征或步骤的其它已知等同方案,以根据本文所述的原理来执行方法。在各种实施方案中,将明确包括一些要素、特征和步骤并且明确排除其它要素、特征和步骤。
尽管本申请已在某些实施方案和实施例的情形下公开,但本领域技术人员将理解,本申请的实施方案超出了具体公开的实施方案的范围,延伸到其它替代实施方案和/或用途和修改及其等同方案。
本文描述了本申请的各种实施方案,包括本发明人已知的用于实施本申请的最佳模式。在阅读前面的描述之后,这些实施方案的变化对于本领域普通技术人员将变得显而易见。预期本领域技术人员可以适当地采用这些变化,并且可以不同于本文具体描述的方式来实施本申请。因此,本申请的许多实施方案包括适用法律所允许的所附权利要求中所述主题的所有修改和等同方案。此外,除非本文另有说明或上下文明显矛盾,否则本申请涵盖上述要素的所有可能变型的任何组合。
本文引用的所有专利、专利申请、专利申请公开以及其它材料如文章、书籍、说明书、出版物、文件、物品和/或其类似物出于所有目的特此通过引用整体并入本文,而与其相关的任何起诉文件历史,与本文件不一致或相冲突的其中任一种,或者关于现在或以后与本文件相关的权利要求的最广泛范围可能具有限制性影响的其中任一种除外。举例来说,在与任何所包含的材料相关和与本文件相关的术语的描述、定义和/或使用之间存在任何不一致或冲突时,以本文件中的术语的描述、定义和/或使用为准。
应理解,本文公开的本申请的实施方案说明了本申请的实施方案的原理。可以采用的其它修改可以在本申请的范围内。因此,作为示例而非限制,可以根据本文的教导利用本申请的实施方案的替代配置。因此,本申请的实施方案不限于精确地如所示和所述的那些。
上文在具体实施方式中描述了本发明的各种实施方案。虽然这些描述直接描述了上述实施方案,但应理解,本领域技术人员可以设想对本文所示和所述的具体实施方案的修改和/或变化。落入本说明书范围内的任何此类修改或变化也旨在包括于其中。除非特别指出,否则本发明人的意图是本说明书和权利要求书中的词语和短语向适用领域的普通技术人员给予普通和习惯的含义。
已经呈现了本申请人在提交本申请时已知的本发明的各种实施方案的前述描述,并且旨在用于说明和描述的目的。本说明书不是旨在穷举,也不是将本发明局限于所公开的确切形式,并且根据上述教导可以进行许多修改和变化。所描述的实施方案用于解释本发明的原理及其实际应用,并且使得本领域其他技术人员能够在各种实施方案中利用本发明并且存在适合于预期的特定用途的各种修改。因此,意图是本发明不限于为实施本发明而公开的特定实施方案。
虽然已经示出和描述了本发明的特定实施方案,但是对于本领域技术人员来说显而易见的是,基于本文的教导,可以在不脱离本发明及其更广泛的方面的情况下进行改变和修改,因此所附权利要求在其范围内涵盖在本发明的真实精神和范围内的所有这些变化和修改。
Claims (20)
1.一种用于以基本上干燥的状态或干燥状态储存生物样本的固体基质,其中所述固体基质包含基质材料和至少一种缓冲剂,其中:
所述基质材料是不可溶解的干燥固体材料;
所述缓冲剂以基本上干燥的状态或干燥状态浸渍在所述基质材料中;
所述固体基质不包含变性剂;并且
所述生物样本包含一种或多种核酸。
2.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述固体基质还包含至少一种还原剂,其中所述还原剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。
3.根据权利要求2所述的固体基质,其中所述还原剂是二硫苏糖醇(DTT)、2-巯基乙醇(2-ME)、2-巯基乙胺或半胱氨酸。
4.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述固体基质还包含至少一种抗氧化剂,其中所述抗氧化剂以基本上干燥的状态浸渍在所述基质材料中。
5.根据权利要求4所述的固体基质,其中所述抗氧化剂是氢醌单甲醚(MEHQ)、氢醌(HQ)或甲基氢醌(THQ)。
6.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。
7.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
8.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。
9.根据权利要求1所述的固体基质,其中所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。
10.一种用于将一个或多个生物样本储存在根据权利要求1所述的固体基质上的方法,其包括:
使所述固体基质与生物样本接触,其中所述生物样本包含一种或多种核酸;
将含有所述生物样本的所述固体基质干燥;以及
将所述生物样本以基本上干燥的状态或干燥状态储存在所述固体基质上。
11.根据权利要求10所述的方法,其还包括从所述固体基质中回收所述生物样本。
12.根据权利要求11所述的方法,其还包括从所述生物样本中提取所述核酸。
13.根据权利要求10所述的方法,其中将所述核酸从所述生物样本中提取出来并以基本上干燥的状态或干燥状态储存在所述固体基质上。
14.根据权利要求13所述的方法,其还包括从所述固体基质中回收所述核酸。
15.根据权利要求10所述的方法,其中所述不可溶解的干燥固体材料是有纤维质的纸。
16.根据权利要求10所述的方法,其中所述缓冲剂选自柠檬酸、三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP-HCl)、三(2-羧乙基)膦盐酸盐的氧化形式(TCEPO-HCl)、2-氨基-2-羟甲基-丙烷-1,3-二醇(Tris)、2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、3-(N-吗啉代)丙磺酸(MOPS)、4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸(HEPES)、磷酸盐缓冲剂、乙酸、抗坏血酸、磺基水杨酸、甲酸、甘氨酸、甘氨酸-甘氨酸、苹果酸和琥珀酸。
17.根据权利要求10所述的方法,其中所述缓冲剂具有2.0至8.0的pH。
18.根据权利要求10所述的方法,其中所述生物样本是血液、血清、血浆、组织、唾液、细胞、滑液、尿液或精液。
19.根据权利要求10所述的方法,其中所述核酸是RNA。
20.根据权利要求10所述的方法,其中所述核酸是病毒RNA。
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Families Citing this family (8)
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---|---|---|---|---|
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GB2595193B (en) | 2019-11-06 | 2022-10-12 | Univ Leland Stanford Junior | Methods and systems for analyzing nucleic acid molecules |
KR20220157976A (ko) * | 2020-02-24 | 2022-11-29 | 더 보드 어브 트러스티스 어브 더 리랜드 스탠포드 주니어 유니버시티 | 무세포 핵산의 분석 방법 및 이의 적용 |
WO2021216780A1 (en) * | 2020-04-21 | 2021-10-28 | Biomerica, Inc. | Collection devices for biological samples and methods of use thereof |
US11783912B2 (en) | 2021-05-05 | 2023-10-10 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods and systems for analyzing nucleic acid molecules |
WO2022256606A1 (en) * | 2021-06-03 | 2022-12-08 | Regents Of The University Of Minnesota | Methods, devices and systems for separating biological analytes from samples |
Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1980738A (zh) * | 2004-04-09 | 2007-06-13 | 科研智囊团有限公司 | 用于收集、储存和运输生物样本的设备和方法 |
US20120052572A1 (en) * | 2010-07-26 | 2012-03-01 | Whitney Scott E | Compositions for stabilizing dna, rna and proteins in blood and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures |
WO2014099121A1 (en) * | 2012-12-20 | 2014-06-26 | General Electric Company | Formulations for nucleic acid stabilization on solid substrates |
US20140234942A1 (en) * | 2012-04-30 | 2014-08-21 | General Electric Company | Substrates and methods for collection, stabilization and elution of biomolecules |
CN105431536A (zh) * | 2013-08-16 | 2016-03-23 | 通用电气公司 | 用于提取和储存核酸的方法和组合物 |
Family Cites Families (11)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4970171A (en) | 1987-11-09 | 1990-11-13 | Miles Inc. | Denaturant reagents for convenient determination of hemoglobin derivatives in blood |
US5496562A (en) * | 1988-10-05 | 1996-03-05 | Flinders Technologies Pty Ltd | Solid medium and method for DNA storage |
EP0787298A1 (en) * | 1995-08-22 | 1997-08-06 | Koninklijke Philips Electronics N.V. | Method and device for investigating non-linear optical behavior of a layer formed from first and second reactants e.g. antibody and antigen |
AU2002333673B2 (en) * | 2001-11-06 | 2008-08-14 | Promega Corporation | Isolation and purification of nucleic acids |
US20080176209A1 (en) * | 2004-04-08 | 2008-07-24 | Biomatrica, Inc. | Integration of sample storage and sample management for life science |
WO2010132508A2 (en) * | 2009-05-11 | 2010-11-18 | Biomatrica, Inc. | Compositions and methods for biological sample storage |
US9044738B2 (en) * | 2012-04-30 | 2015-06-02 | General Electric Company | Methods and compositions for extraction and storage of nucleic acids |
US9040675B2 (en) * | 2012-04-30 | 2015-05-26 | General Electric Company | Formulations for nucleic acid stabilization on solid substrates |
CA2948845C (en) | 2014-05-14 | 2022-05-31 | Merial, Inc. | Methods for freeze-drying and rehydrating biologics |
CN115161178A (zh) * | 2015-09-09 | 2022-10-11 | 集联健康有限公司 | 用于样品收集、稳定化和保存的系统、方法和装置 |
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Patent Citations (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1980738A (zh) * | 2004-04-09 | 2007-06-13 | 科研智囊团有限公司 | 用于收集、储存和运输生物样本的设备和方法 |
US20120052572A1 (en) * | 2010-07-26 | 2012-03-01 | Whitney Scott E | Compositions for stabilizing dna, rna and proteins in blood and other biological samples during shipping and storage at ambient temperatures |
US20140234942A1 (en) * | 2012-04-30 | 2014-08-21 | General Electric Company | Substrates and methods for collection, stabilization and elution of biomolecules |
WO2014099121A1 (en) * | 2012-12-20 | 2014-06-26 | General Electric Company | Formulations for nucleic acid stabilization on solid substrates |
CN105431536A (zh) * | 2013-08-16 | 2016-03-23 | 通用电气公司 | 用于提取和储存核酸的方法和组合物 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
张丽等: "核酸提取方法的研究进展", 《中国动物检疫》 * |
Also Published As
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