CN109706264A - 苎麻叶背毡毛主效qtl及其紧密连锁的分子标记和应用 - Google Patents

Abstract

本发明涉及苎麻叶背毡毛分子生物学领域，具体而言，涉及苎麻叶背毡毛主效QTL及其紧密连锁的分子标记和应用。本发明提供了位于7号和13号染色体上的苎麻叶背毡毛SNP标记及其应用，苎麻叶背毡毛SNP标记为苎麻叶背毡毛性状的检测以及新品种培育、种群的遗传多样性提供理论支持。本发明还提供了苎麻叶背毡毛相关的SSR序列及其应用，该SSR序列为苎麻叶背毡毛的检测提供良好的技术支持。

Description

苎麻叶背毡毛主效QTL及其紧密连锁的分子标记和应用

技术领域

本发明涉及苎麻叶背毡毛分子生物学领域，具体而言，涉及苎麻叶背毡毛主效QTL及其紧密连锁的分子标记和应用。

背景技术

苎麻是重要纤维作物之一，苎麻叶是蛋白质含量较高、营养丰富，是优异的饲草作物。苎麻叶背毡毛主要是表皮毛纤维，其大量存在于栽培种苎麻中，导致苎麻的适口性差，显著降低了其饲用性能。因此，寻找叶背毡毛相关基因将为该品种的改进提供良好的理论基础。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供苎麻叶背毡毛SNP标记及其应用，苎麻叶背毡毛SNP标记为苎麻叶背毡毛性状的检测以及新品种培育、种群的遗传多样性提供理论支持。

本发明的第二目的在于提供苎麻叶背毡毛相关的SSR序列及其应用，该SSR序列为苎麻叶背毡毛的检测提供良好的技术支持。

为了实现本发明的上述目的，特采用以下技术方案：

苎麻叶背毡毛SNP标记，所述SNP标记位于第7号染色体上或第13号染色体上；

位于第7号染色体上，所述SNP标记为以下中的任一种或多种：

SEQ ID NO.1中的第1116位碱基；

SEQ ID NO.2中的第125和142位碱基；

SEQ ID NO.3中的第277、301、338、564和601位碱基；

SEQ ID NO.4中的第568位碱基；

SEQ ID NO.5中的第1120和1813位碱基；

SEQ ID NO.6中的第1120位碱基；

位于第13号染色体上，所述SNP标记为以下中的任一种或多种：

SEQ ID NO.7中的第966位碱基；

SEQ ID NO.8中的第1813、2282、2539和2839位碱基；

SEQ ID NO.9中的第1052位碱基；

SEQ ID NO.10中的第248位碱基；

SEQ ID NO.11中的第580位碱基；

SEQ ID NO.12中的第626位碱基；

SEQ ID NO.13中的第150和154位碱基；

SEQ ID NO.14中的第85位碱基；

SEQ ID NO.15中的第618和852位碱基；

SEQ ID NO.16中的第336位碱基；

SEQ ID NO.17中的第109位碱基；

SEQ ID NO.18中的第553位碱基；

SEQ ID NO.19中的第260位碱基。

叶背毡毛是典型的数量性状，表型连续分布且容易受到环境条件的影响。本发明利用连锁及关联分析的方法，在苎麻定位到2个叶背毡毛主效QTL(qLH7、qLH13)。这两个QTL的识别将为培育无毡毛的优异饲用苎麻品种提供了遗传位点。

基于上述的苎麻叶背毡毛SNP标记，一方面，本发明还提供了用于检测上述的苎麻叶背毡毛SNP标记的引物对，所述SNP标记位于第7号染色体上，引物对包括根据SEQ IDNO.1-SEQ IDNO.6所示的序列设计的引物对中的任一种或多种；

所述SNP标记位于第13号染色体上，包括根据SEQ ID NO.7-SEQ ID NO.19所示的序列设计的引物对中的任一种或多种。

基于上述的苎麻叶背毡毛SNP标记，一方面，本发明还提供了用于检测上述的SNP标记的探针。

基于上述的苎麻叶背毡毛SNP标记，一方面，本发明还提供了用于检测上述的SNP标记的芯片。

基于上述的苎麻叶背毡毛SNP标记，一方面，本发明还提供了上述的SNP标记在研究苎麻种群的遗传多样性以及培育苎麻新品种中的应用。

本发明还提供了苎麻叶背毡毛相关的SSR序列，SNP标记位于第7号染色体上，SSR序列如SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21所示；

SNP标记位于第13号染色体上，SSR序列如SEQ ID NO.22-SEQ ID NO.27所示。

本发明基于SNP标记定位到苎麻第7号染色体上，因此，根据第7号染色体scaffold序列开发SSR、INDEL标记，然后用PRIMER5、DNAMAN设计SSR、INDEL引物，共通过生物公司合成新开发的SSR引物16对、INDEL引物7对，然后通过对不同形状的苎麻叶背毡毛性状进行鉴定，筛选得到上述的两个序列为苎麻叶背毡毛性状相关的SSR标记。

本发明基于SNP标记定位到苎麻第13号染色体上，因此，根据第13号染色体scaffold序列开发SSR、INDEL标记，然后用PRIMER5、DNAMAN设计SSR、INDEL引物，共通过生物公司合成新开发的SSR引物17对，然后通过对不同形状的苎麻叶背毡毛性状进行鉴定，筛选得到上述的六个序列为苎麻叶背毡毛性状相关的SSR标记。

基于上述的SSR标记，本发明提供了检测苎麻叶背毡毛性状的引物对，为以下引物对中的任一种或多种：

第一引物对：如SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29所示；

第二引物对：如SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31所示

第三引物对：如SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33所示；

第四引物对：如SEQ ID NO.34和SEQ ID NO.35所示；

第五引物对：如SEQ ID NO.36和SEQ ID NO.37所示；

第六引物对：如SEQ ID NO.38和SEQ ID NO.39所示；

第七引物对：如SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41所示；

第八引物对：如SEQ ID NO.42和SEQ ID NO.43所示。

其中，第一引物对对应于SEQ ID NO.20所示的SSR标记，第二引物对对应于SEQ IDNO.21所示的SSR标记，第三引物对对应于SEQ ID NO.22所示的SSR标记，第四引物对对应于SEQ IDNO.23所示的SSR标记，第五引物对对应于SEQ ID NO.24所示的SSR标记，第六引物对对应于SEQ ID NO.25所示的SSR标记，第七引物对对应于SEQ ID NO.26所示的SSR标记，第八引物对对应于SEQ ID NO.27所示的SSR标记。

基于上述的检测苎麻叶背毡毛性状的引物对，本发明还提供了检测苎麻叶背毡毛的试剂盒，含有上述的检测苎麻叶背毡毛性状的引物对。

进一步地，所述试剂盒还包括dNTPs、缓冲液、酶、双蒸水中的任一种或多种。

基于上述的检测苎麻叶背毡毛性状的引物对，本发明还提供了检测苎麻叶背毡毛的方法，包括以下步骤：

待检测样本的基因组作为模板，以上述的引物对进行PCR扩增，根据扩增产物的条带判断是否为叶背毡毛性状。

与现有技术相比，本发明的有益效果为：

(1)本发明的提供了位于7号和13染色体上的苎麻叶背毡毛SNP标记及其应用，苎麻叶背毡毛SNP标记为苎麻叶背毡毛性状的检测以及新品种培育、种群的遗传多样性提供理论支持。

(2)本发明还提供了位于7号和13号染色体上的苎麻叶背毡毛相关的SSR序列及其应用，该SSR序列为苎麻叶背毡毛的检测提供良好的技术支持。

附图说明

为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案，以下将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍。

图1为本发明实施例1对整合的遗传图谱上的1085个SNP位点与2个性状进行单个SNP位点的关联分析图；

图2为本发明实施例2中涉及的电泳图；

图3为本发明实施例2中不同引物对在不同植株中的部分扩增结果在物理图谱上的位置示意图；

图4为本发明实施例2中根据重组单株构建了qLH7的物理图谱；

图5为本发明实施例3中涉及的电泳图；

图6为本发明实施例3中涉及的另一个电泳图；

图7为本发明实施例3中涉及的另一个电泳图；

图8为本发明实施例3中不同引物对在不同植株中的部分扩增结果在物理图谱上的位置示意图；

图9为本发明实施例3中根据重组单株构建了qLH13的物理图谱。

具体实施方式

下面将结合实施例对本发明的实施方案进行详细描述，但是本领域技术人员将会理解，下列实施例仅用于说明本发明，而不应视为限制本发明的范围。实施例中未注明具体条件者，按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者，均为可以通过市售购买获得的常规产品。

实施例1

苎麻叶背毡毛SNP标记的获得，步骤如下：

亲本中饲苎1号和青叶苎麻杂交获得110个单株RaF2群体，对这110个RaF2群体和两亲本转录组测序；

通过Jionmap4.0软件构建了一张含1085个分子标记高密度遗传图谱，这1085个标记均匀分布在14个连锁群上，平均标记间距1.95cM；

根据RaF2表型数据，结合高密度连锁图谱，对性状利用MapQTL(version：6.0)软件进行QTL检测，通过GWAS利用plink(version：1.07)软件对整合的遗传图谱上的1085个SNP位点与2个性状进行单个SNP位点的关联分析，结果如图1所示。

图1中，上半图表示QTL分析得到的LOD值，其中黑色细虚线表示单个连锁群范围内α＝0.05水平上的LOD值，黑色粗虚线表示所有连锁群范围内α＝0.05水平上的LOD值；下半图表示GWAS分析得到的-Lg(p)值，蓝色虚线表示经过Bonferroni校正后的阈值(p≤0.05)。横坐标从左到右的数字表示1到14号连锁群。

以单个连锁群范围内α＝0.05水平上的LOD值作为阈值，即出现一个LOD峰值大于或等于阈值时视为该位点存在一个QTL。LOD峰值位置即为相应QTL基因最可能的位置。

获得2个苎麻叶背毡毛性状的主效QTL，分别位于苎麻第7和第13号染色体上。

其中，位于第7号染色体上的苎麻叶背毡毛SNP标记，包括：

SEQ ID NO.1中的第1116位碱基；

SEQ ID NO.2中的第125和142位碱基；

SEQ ID NO.3中的第277、301、338、564和601位碱基；

SEQ ID NO.4中的第568位碱基；

SEQ ID NO.5中的第1120和1813位碱基；

SEQ ID NO.6中的第1120位碱基；

位于第13号染色体上的苎麻叶背毡毛SNP标记，包括：

SEQ ID NO.7中的第966位碱基；

SEQ ID NO.8中的第1813、2282、2539和2839位碱基；

SEQ ID NO.9中的第1052位碱基；

SEQ ID NO.10中的第248位碱基；

SEQ ID NO.11中的第580位碱基；

SEQ ID NO.12中的第626位碱基；

SEQ ID NO.13中的第150和154位碱基；

SEQ ID NO.14中的第85位碱基；

SEQ ID NO.15中的第618和852位碱基；

SEQ ID NO.16中的第336位碱基；

SEQ ID NO.17中的第109位碱基；

SEQ ID NO.18中的第553位碱基；

SEQ ID NO.19中的第260位碱基。

本发明筛选的上述的苎麻叶背毡毛SNP标记可通过设计引物，对其进行检测，还可设计成探针、芯片等对其检测。

另外，SNP标记还可用于研究苎麻种群的遗传多样性以及培育苎麻新品种。

实施例2

基于苎麻第7号染色体上有苎麻叶背毡毛SNP标记，因此，根据7号染色体scaffold序列开发苎麻叶背毡毛SSR、INDEL标记，然后用PRIMER5、DNAMAN设计SSR、INDEL引物。通过生物公司合成SSR引物16对、INDEL引物7对。

对亲本中饲苎1号和青叶苎麻杂交获得的110个单株RaF2群体进行基因型的鉴定，这一过程包括以下步骤：

1)DNA提取工作；

2)利用合成的SSR引物16对、INDEL引物7对分别对各个单株的基因组进行PCR扩增，然后电泳分析其条带，进行基因型分析。与中饲苎1号基因型一致的记作“Z”，与青叶苎麻基因型相同的记作“Q”，如果一个单株同时含有中饲苎1号和青叶苎麻的基因型则为杂合基因型记为“H”。

部分电泳结果如图2所示。其中，图2中的数字编号为RaF2群体不同引物扩增的结果。

筛选得到杂合基因型的SSR引物对，包括：

如SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29所示的引物对(7-2)；

如SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31所示的引物对(7-6)。

对应的SSR序列依次如SEQ ID NO.20、SEQ ID NO.21所示。

不同引物对在不同植株中的扩增结果在物理图谱上的位置如图3所示。图3中，左边数第一个竖直虚线表示如SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29所示的引物对即SSR7-2对不同植株基因组的扩增结果，右边数第一个竖直虚线表示如SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31所示的引物对即SSR7-6对不同植株基因组的扩增结果。

根据重组单株构建了qLH7的物理图谱，具体如图4所示。图4中，各位点对应在染色体上的位置如表1所示。

表1各位点对应在染色体上的位置

Maker_Symbol	基因组位点	Maker_Symbol	基因组位点
				Maker_249	27579	Maker_1348	883287
Maker_250	28439	Maker_1346	883346
				Maker_251	28468	Maker_1345	883821
Maker_252	28727	Maker_4784	906085
				SSR7-2	46747	Maker_1856	1171241
Maker_1478	129219	Maker_1849	1172515
				Maker_1147	327340	Maker_1371	1312333
Maker_1146	327348	LCM7-6	1319792
				SSR7-4	844739	Maker_6116	1503359
Maker_1351	883047	Maker_3669	1757175
				Maker_1350	883085

qHL7置信区间68.4-101cM，位置79.1cM，LOD值18.0。

本发明实施例提供的上述的引物对以及序列可用于苎麻叶背毡毛的检测。

实施例3

基于苎麻第13染色体上有苎麻叶背毡毛SNP标记，因此，根据13号染色体scaffold序列开发SSR、INDEL标记，然后用PRIMER5、DNAMAN设计SSR、INDEL引物。通过生物公司合成SSR引物17对。

对亲本中饲苎1号和青叶苎麻杂交获得的110个单株RaF2群体进行基因型的鉴定，这一过程包括以下步骤：

1)DNA提取工作；

2)利用SSR引物17对分别对各个单株的基因组进行PCR扩增，然后电泳分析其条带，进行基因型分析。与中饲苎1号基因型一致的记作“Z”，与青叶苎麻基因型相同的记作“Q”，如果一个单株同时含有中饲苎1号和青叶苎麻的基因型则为杂合基因型记为“H”。

部分电泳结果如图5-7所示。其中，图5、图6和图7中的数字编号为不同的RaF2群体的标号。

筛选得到杂合基因型的SSR引物对，包括：

如SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33所示的引物对；

如SEQ ID NO.34和SEQ ID NO.35所示的引物对；

如SEQ ID NO.36和SEQ ID NO.37所示的引物对；

如SEQ ID NO.38和SEQ ID NO.39所示的引物对；

如SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41所示的引物对；

如SEQ ID NO.42和SEQ ID NO.43所示的引物对。

对应的SSR序列依次如SEQ ID NO.22-SEQ ID NO.27所示。

不同引物对在不同植株中的部分扩增结果在物理图谱上的位置如图8所示。

根据重组单株构建了qLH13的物理图谱，具体如图9所示。图9中，重组单株中的各位点对应在染色体上的位置如表2所示。

表2各位点对应在染色体上的位置

得到qHL13的置信区间19.4-54.1cM，位置48.1cM，LOD值15.0。

本发明实施例提供的上述的引物对以及序列可用于苎麻叶背毡毛的检测。

尽管已用具体实施例来说明和描述了本发明，然而应意识到，在不背离本发明的精神和范围的情况下可以作出许多其它的更改和修改。因此，这意味着在所附权利要求中包括属于本发明范围内的所有这些变化和修改。

SEQUENCE LISTING

<110> 中国农业科学院麻类研究所

<120> 苎麻叶背毡毛主效QTL及其紧密连锁的分子标记和应用

<130> 2019

<160> 43

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 1687

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich

<400> 1

agagcacatt agtggactca cttgatacat tgtatatcat gggtcttcaa gaacagttcc 60

agaaagcaag agaatgggtt gcgaattctt tggattttaa caagaattac gatgcgagtg 120

tctttgagac aaccataaga gttgttggtg gacttcttag tgcatatgac ctctcaggag 180

ataaagtttt cctcgataag gctaaagaca ttgcagacag attgctgcca gcttgggata 240

cacctagtgg aataccttac aatattatta acttagctca aggaaggcca cacaacccca 300

gctggactgg gggtgagagt atactggcag attcgggcac ggagcagctg gaatttattg 360

ctctttctca aaggactgga gacccgaagt accagcaaaa ggtcgagaat gtcataacac 420

agatcaagaa gatattcccc gatgatggtt tgcttcctat ctatcttgac cctaatagag 480

gctcaacagc gtattcccct ataacatttg gtgccatggg agacagcttt tatgaatact 540

tgctcaaagt ttggatacag gggaataaaa cttcagctgt gaatcgttac agagaaatgt 600

gggaaacatc gatgaaaggt ctgtcgagct tggttcgaag aactacgcca tcatcttttg 660

catatctttg tgagaagaat ggggattctt tatcagacaa gatggacgag ttggcatgct 720

ttgctccagg aatgctggct ttaggatcat ttggttatgg tcccgatgaa gctcaaaagt 780

ttttatcact tgctgaagag cttgcttgga catgctacaa tttctaccag tcgacaccga 840

caaagttagc tggagaaaat tatttcttcc acactgggca ggatatgagt gtgggcacat 900

catggaacat attgcgacca gagactgttg aatcactctt ctacctgtat cgtctaacgg 960

gaaacaagac gtaccaagag tggggttgga acatattcca agcttttgaa aagaactctc 1020

gcattgaaac gggatatgtt ggcctaaaag atgttaacac tggtgtgaaa gacaatatga 1080

tgcagagctt ctttctcgct gagaccctca agtatctcta tcttctcttc tcacccccct 1140

cggttatacc attagacgag tgggttttca acacggaagc ccacccgata agaatcgtca 1200

cccgtcacga tgtaggggat tttaagaaca tggatgagaa acaaaaaccg aagcttaagt 1260

tacgtagccg gaaggaaggt cggtcacgag attagttaga aatcgcttat tgtttgtggt 1320

tgaatcccat caattttcag gcttttaagt agatgatgag gagcgaaaaa tgattcaata 1380

ttgaaatctg atgttgagct cattcttatt aaaaagaaaa ataatgaagc caacaaattt 1440

tactagctgg aaaagttgta tcccacagtt aaaaacatgc cagccttgtt ttttttgttt 1500

tgttttttta ccatggtatg taacataggt aatagggtta tttacttaaa attattattg 1560

cctcttacac acaaattcaa aatttccctt ttttgctgct actctgagat ggatgggcat 1620

ttgtaatttt gtggaaaaag acttgctttt ccttatttag gattgttact gaaaagaaac 1680

acttatt 1687

<210> 2

<211> 335

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 2

tcgatactca taggctggca aagacggcta acaaatctca ccgcgacagg atccaagatt 60

tcaatcagta tcttgccaac atgagtgagc attacgacat tccgaaggtt ggccctggtt 120

gatttggcca aacgtaccca agaccaaagc caaaaagatt aatttgctat gtcaataact 180

atacaatttg gtgggtcgtc tattatgtta catgttttcg gtttttagca atatcgtaat 240

acattgcgga acattgcgta tgatgtattc taaatttttc ttctgggact tcatttcttt 300

ctctctatta tacaatgatt tgtgcaagtg cattt 335

<210> 3

<211> 1537

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 3

tgaatatcct tctgcaccaa agcaaaagaa gtacgttcgt gttagtttct tcagatctgg 60

ttggcgaatc agaaaagttc ctggtagaaa tgcatgtgag atcaaaatgt tccaccaaga 120

agatgccggt ttaaatgtcg agatggcaaa attggctttc tcaaaaggca tatggagtta 180

tatctgtaag atggacaatg ctctacgcaa gtaccctatg atgagacaca ctcaatcttc 240

atctgctaat gcactcactt tgattaaaat ggttcccgcg gaattagata gtacgaatga 300

cgagacttca caattaacct cagcagcgcc aactgccatt cagggttcag ttggtggtca 360

ggagaagaaa ttgtcaagaa ggccgtcgaa gaaaatggta gcaaatggct tgttgcttat 420

cggtggcgta atctgcctca ctcgtggtca ttctagcttg ggcgccaaag ttgccatggc 480

atatattctc aataaactgc gcaagcacgg tgcttcgtcg agtcaaagca atcagactat 540

aggtacatga tctcgctgcc caatagttga tgtcaaacgc catagtcaag tttcctaccc 600

cgtcatacgt cacagtgtac atattcaagc aagtgttgtg attatagatt agagtgtacc 660

cttctttgcc tatgaagaaa agggaagaca gtaatgcatg gaaggtctcg ggtttgaggc 720

agaaaagata tcggtgcaca tttgttaaga accctgtacc cgaagtaata ctcgtctatt 780

acacttctac caccgctgta gatcttaaga gcccggtagt tacgggttca acacaataaa 840

aaaaattctc tcgtcgttgg tttatcaata ggaacttaat agtgttgtcc tatgttttgc 900

tttattttct ggggatagtc agttcgaaca accatcgggg atgtttttag gcactgatga 960

tcaagccaag tcatagccgg gaaggacatt agtgcttcag ttgccatcgg agcttatgaa 1020

atttccttta tgttggttga caaagcgcgt tagatttgcg catggctcgg atatgtttcc 1080

tcggcgaagg ctcttaatca aagtgcattt gcggctcggt cctcaagttc aatatcaatg 1140

accgcccggc aaatagtgta gcttcgtcaa tgccggttag ggcggtactc actaggcctc 1200

tcaaccgtcg gtcgtggtcg atgagagcag gtttagcttt agtaaataca agttggagga 1260

cgagcaaatt gtatgaaata caaacttatt ggctttcttt tttttttttt ttttgaattt 1320

tttttttctg gtttacttgg caattgtttt tttatattta ttttcgtcgg aggccattag 1380

cttgctgata tcgtaaaact tggaaggagc tatgaatgcc aacagcataa gaaatgtcct 1440

ttttctttgt tatatatatt tagtggcaaa aactgtaaag tgtgtacagt atttaaacgg 1500

gtgttttttt tttttttttt ggaaacaata atgaatt 1537

<210> 4

<211> 2583

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 4

atatagcatc atttatgaac aaactaatat tatattcgat tttagttttt cattattatt 60

atatttccag agaaagagag agaaatgaat tggaatagag agagagaagg agatcatgga 120

tagctagaga tactctgtgt cgctctgtgt ctcgttgctt agattctttg tgaatttttt 180

tttttctttt tttccaactt cttcttcttc ttttgatttt catggctgcg acaactcaac 240

cccaacaaca gggaccagat cgtagtacca ctggtgtgca cgtgtggatt tgtgcgcaca 300

cattcattac ttcaagtttt cctgtcccca aattttgctt tggtgttggt caattttttg 360

tactgcctgt gtttctaaga ctcttctaag tcacttaagc ctactgatca tggatgcaga 420

agacaaacct tcggaattag aaaacgtgaa ggatcagcaa ccctcatcaa aaaatggaac 480

atcggtttct ccagatccat ctcaagatgc tgccactgta ggtcatacaa gggatccggc 540

agttcattca ggatccgttg gttctggagg agatcgaaca gtctatccac cgaacatcta 600

tgctccccag gcccagacct tctactacag aggttacgac aatggagctg gtgaatggga 660

tgagtattct cagtatctca atgctgaagg attggaaatt ggatctcctg gcctctacaa 720

tgaaaatcct tctcttgtat tccattctgg atatggttac aatccacaaa tgccgtatgg 780

accttattcg ccggttacaa cgcctttgcc ttctgtaggc ggagatgcac agttgtactc 840

cccccagcaa tttccgtatt ccgggccacc ttattatcag cagttaggtc cacataacat 900

gccatatatt tcttcaccaa ctccagtttc acaaccggag ctcacttcat tacttggtgt 960

agaccaacaa ggtgatagca tggtatttgg accaaggcct ggttatgctg gcgttgggtc 1020

tttcggtaga ggcagttttc ctggaaatcc tggttctctt ggttttcatg atttgcagca 1080

aggttttgat ggattgagat ctggtggaat ttggtctgat tggtcaaaac cctcagacag 1140

gcagaggccc ttgactcctt tttcaccagc agtatctcca cagccgattg gcccagttgg 1200

atcatttgga caaaatgttg gaatggcttc tcaacaccaa agatcactat atgggtttgg 1260

atctggttca aattcgtata gtagaagtta tgttccgagt ggtttcggtc aaggctctaa 1320

tgcatccttt tccaatttgg gaatagatag tcggggctgg ctgcttgaca gcagcaaacg 1380

gcgtgtgaga ggcagtgttt cgttgtgcag ctgtaatggc accatcgata ttcttaatga 1440

gcagaaccga ggaccaaggg cctcaaagcc aaagagtcaa gttatggccg atggcacctc 1500

tgcaatagac aataacaaac cgaacacaac caccactaag gtgcacgatg aatcatacaa 1560

tcggctggac ttcttaacgg agtacaatga agcgaaattc tttatcatca aatcttacag 1620

cgaagataat gttcacaaga gtattaaata tggtgtgtgg gctagcacac caaatgggaa 1680

cagaaagtta gatgctgcat ttcgtgaagc aaaggagaag aaagatgctt gcccggtctt 1740

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<211> 1920

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

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tcttgatgag agggcttcaa tgccaccgaa ttcggcgact actagtgcgg caaacactgt 360

ggttgcttct catcatggga ttgaagtagc agtagagttc aagcccgttg aacacccgaa 420

cgagcctctc gatagcgata gaccaattca gtgcccgttg cctgaaccat caattcttaa 480

cgatggaaga atatggaagg agcgggtatc tgcgacggtc cgcaggagag ccgacctgcc 540

ggtgatgaag gaaggagggt ctctcgaacc cgaaagtgcc gaggggaagc cacccaggcc 600

gatgccacat acacaaccca gccgcggtat tctaccgtct cttagtgccc cggaacataa 660

cattataaac ctgcttgaag aatgtaatgc ttctgggatc tgaacaaaat ctggtacaac 720

attattgttt tctgtactgg gaaaataata ccagtccaaa attttcacat ataatacacg 780

tttcaatgtg ttttacatat cctcttatac aatttttttc cttctaaagt tttaccctct 840

tgtatttgta catgtattat catgaattca cagttaattg tgaatgtata tccaagcaaa 900

agtggcatga attatcagct ctttaaatta atattattct ttttgtttgt 950

<210> 12

<211> 1373

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 12

atatcagtaa aatccaattt gattgcttgt cttctcagtt ctcagccagc cgaccccacc 60

ccaacccagc cccactccga gcgtccctct ctcagcccga ctcctccgcg gcagcaggca 120

gcggttctcg ctacttgacg tgattctcat ctcagtgccc gagaagcaat cctattttct 180

caatgtcatt cacattaaag gtttcaacga gcgcaatcgg atggatgaat attcctaatt 240

ggagtcgatc gtcctcgtcg gctatgatcc cccgttgctc aatgtccacg ccggcgatcc 300

agcctcttgc caaatctgtc tccaacatcc cgataatggt gaatggttgt actggaaata 360

tggggaaggc tgtcattaaa gcagcagatt ctgccgggct taatatcgtg ccttggtcat 420

ttggctctga agaagagtct gggacaaccg tggaagtgtg tggaaaggag atcacagtgc 480

acggcccttc tgaaagagag aacactctct cgtctctttt cgtggagtat ccgaatttga 540

ttgtggtgga ttacacggtg ccttctgcag tcaatgctaa tgcggagcta tattgcaaag 600

ttggagttcc gtttgtgatg ggaacaactg ggggaaacag gggatctatt gtacaagact 660

gttcaagact cgaaggttta tgcagttata tctccacaaa tgggaaaaca ggttgttgca 720

tttctttcag ctatggaaat catggctgag caatgccctg gtgctttctc cggttattcg 780

ctgcaggtga tggagtccca tcaagcgagc aaagtggaca tgtcaggaac tgccaaagct 840

gtcatttctt gcttccagaa attgggagtt tcttttgaca tgaactgaga tacaaatgat 900

ccgagacgca aagcaacaag tcgacatggt gggagttcct gaggagcact tatctggcca 960

tgcattccat ctataccatc taacgtcacc cgatggatca gtttctttcg agtttcagca 1020

taatgtatgt ggtagatcaa tttatgccga ggggactgtc gatgctgtca tttttctcgc 1080

taagaaggtt gagtcgaaag cagagaagcg gttgtacgac atgattgatg ttttgcgaga 1140

gggtaacatg cgatgaaaaa atatccatcg gcttttaaac ctgtattcgt tttaggttgt 1200

tgtttgttct agtatttagg tgtttgggaa actggttcgg aagttttttt tttttcttca 1260

ccgctctcca ctctccagcg agattcttct cttttggctg ctggttgagt ttgacacaga 1320

attttttaga aatgtggttt catggttgaa gtaattgtaa ccataatttt gac 1373

<210> 13

<211> 1360

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 13

aaagcaccac tcagaaaatt cttccccaaa catcctttga agtgtaagat ttattgccag 60

agcccaaaaa gcttcaaact tgcttacaaa tttgccaatg tttcaaaggc aatgatgggt 120

tttttgatga tcagagttca gcaataatga tgtaaatgac agtatgactg ggacatcagt 180

ccttagccaa acccattttt tgttgccagc caaagagcca agccaaaccc cagaatcgag 240

ttcaagcttc aaggaccaag aatgtgtctc actcttgaaa aagtgcaaga gcatgagaga 300

gctcaagcaa attcatggcc aaatcctcaa gctgggcctc ttttgggact ctctctgtgc 360

aggcaatctt gtggccgctt gcgctctctc ggattggggc agcatggact acgcgtgctc 420

ggttttcgag cagctcgaag atcccgggac cttcctgttc aacaccatga tcagagggca 480

tgtcaaggat gggaattggg gtcaggcatt ggttctttac tgtgacatgc ttgagagcgg 540

agctgagccg gacaatttca cttaccccgc gcttttgaag gcgtgcgcca agctttcggc 600

gctcgaggaa ggaaggcggt tgcacgggca cattctcaag ctcgggctca aaggtgatgt 660

gtttgtgcag aatagcttgg tgaacatgta tggaaagtgt gggaatttgg aacttgcttg 720

tggtgttttt aggctaatga gtgaaaagag tgttgcttca tggagtgcta ttattggagc 780

tcatgctagt ttacggaaat ggtgggattg tcttgttctg tttggggata tgaatagaga 840

gggttgttgg agagctgagg aaagtacttt ggttagtgtt atctctgctt gtacccattt 900

gggtgctctt gatttgggga agtgcacaca tgggtcattg ttgaggaata ttagcggtct 960

caatgtgata gtagagactt cgctgataga catgtatgtg aaatgtggtt gcttggagaa 1020

agggttatct ctgttccgca agatggcaaa gaggaaccag ttgtcttatt ctgtgatgat 1080

ctcagggctt gcgatgcacg ggcatggcag gaaggctttg gaggttttct ccgaaatgct 1140

gaaagaggga ttggctccgg atgatgtggt ctacgtgggt gttctgagtg cttgtagcca 1200

tgctggcctg gtcgacgagg gtctacagtg cttcaacagg atgaagcttg aacacgggat 1260

cgaaccgaca gtccagcatt atggttgtac ggtggatctc cttggcagag cagggaagct 1320

caacgaagca ctagagctca ttaagaccat gcccatcaag 1360

<210> 14

<211> 1054

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 14

gagaagagaa agagaacagt cgaagaagaa gaagaactca gccatggcga gatcgacaac 60

caaggacgct caagctctct ttcactctct ccgctctgct tatgccgcca cacctaccaa 120

cctcaagatc atcgatcttt acgtggtctt cgctgtatgc acagcttgta ttcaggtcgt 180

ttatatggct cttgttggat ccttcccatt caactctttt ctctctggtg ttctttcgtg 240

tattgggaca gcggtccttg ctgtttgtct ccgcatccag gtgaacaaag agaacaagga 300

attcaaggat ttgccaccag agagagcttt tgcagatttt gttctctgca acttggtgct 360

ccatttggtt ataatgaatt tcctcggata aaaaagcttc tttagctact ataatatgtt 420

ctaggaccga gagacttaga caaaactaca ttttataggc ctttgataca gcgctcatga 480

tcttgcatct tgcggagctc gttgtgtatt aaattgcacc tcaattttca atcagaattt 540

tgcgttgatg cttttgtcta agaattacaa gtataacagc taaacagact tttccatctt 600

ttacagcgtc tcgagtccgt ttgcctgata aaagatgtct gcaatagtct accgtcgtca 660

aaacattgtt tggaaacata acttgatgtg gccttgtttt gtcaagccta gctgtttatt 720

tgctttaaga ttggagcgac aataaagccc taacgaggtt ttgtaagaag aataagaaat 780

attcttttat ttgtctgtag aatttggtag taactggaca ctagtgtgcc ttgaaaggga 840

aatgcttggt agaataaaca agttcagtga ccaaaacaaa agaaagaaag ttggtgcgac 900

tataagctag gacgttactt agaaaccaac atcctttgag caactattta caagtcatgc 960

tctatgaaca ccactagggc atattgcttg tgttgtcaag ttcatttgtg ttgtttcctt 1020

gcaaaaaaaa aagttcattt gtgttgtgaa gctt 1054

<210> 15

<211> 1300

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 15

acgaacaaca acccaacaat ggctctgcta ttcacaaccc caagctcttc cctcttctct 60

tcttcccaaa accccaccaa caccaagcag accctgagcc tgacccacct ctctccttct 120

tcctcttctc tttccctccc attcctcacc agacccacaa cccctctcgc tctccgcctc 180

cgcctccgcc gcctccgcgc ctctccctcc gactccgact ccgacgaccc ctccgccgcc 240

ggacccgccg acgagtgggg cgagccgccc gtgccggagc ccgcctccgc ctactctaag 300

ctctcggccg ccgacccccc caagaacgac gacgagtggg gcccagacgg ctaccccgcc 360

aaacccgccg ccgcggccga agccgaagcg agctccgatg agtcggagga ggaggagaag 420

aggaagaagg agagggtttt ggagctgaag aggtgtctgg cggacactgt gtacgggacc 480

gagctggggt tccgggcgag gttggaggag agggcggaga ttctggagct tgtcaaccag 540

ctcgaggcgc tgaacccgac gccggcgccg acgcagagcc ccgagcttct cgccggagat 600

tgggtcttgc tgtacacagg gttttccgag ctgttgccaa ttttggctgc gggttcaacc 660

ccgttgttga aagtgaataa gataagccaa tcgatcaaca tcggcagttc gacaattgtg 720

aacgcgacct cgttgtccag ccccttttca acattttctt tcagcgcaac cgctacgttt 780

gaagttcgca gtccctcaag aatacaggtt caattcaagg agggcacatt tcaaccccca 840

gagataaagt cgagtgtcga tctcccggga gaagtggatg tcttcgggca gaaaatcaac 900

ctgtctcctt tgcagcagac tctcaaccct attcaggagg cggtggcaaa catctcacgg 960

gttatttcgg ggcagccacc tcttaggctt ccaattccgg gtgagaggac gagttcttgg 1020

cttctcataa catacctcga cgaggatttc cgaatctcaa ggggcgatgg tggtcttttt 1080

gttcttgcta aggaaggaag tcctcttcta tatcagtagc caggtatatt ctttggttgt 1140

atggtttata gccacaatat cacacattgt ctctccctct ttcttttttt tccttttttt 1200

cctctttaag aactctatct ctgttgtgag aaaaatatgg tactggtttc atcttgtata 1260

tgcaattttt ttttgccaaa aatgaaatgc tattttaagc 1300

<210> 16

<211> 1199

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 16

aaaaacaaaa acaacgaaac aaacaaaaca aagaagacaa caaaacaagg aagaagtgtt 60

tcaaaaggaa aataagaaat agccaaataa aaaaaacaag tggtttccca atttcctcag 120

actctctctc tccctctctc tctctctgtt tctctgtgtt tgattcctga gaaaccgaga 180

gcgaacagaa ggaaaatccc cggagagaga gggacagcag agaaaatggg gacgagagcc 240

gagaacggcg tggccggaga cggcggcgat tcggcgagat ccgaaggcaa gtttcctctg 300

agctcgtggg aggtgactgt ggcttcgacg gtgctcttgg gcttcgtgct cggattcctc 360

ggcgtttacc tcaccatgcc ctcctccgat tacagcttcc tcaagctccc tcgcaccctc 420

gaagatcttc aacttctcag gtcctggtgg ggtattgcat ggtttacatt ttcatgcaga 480

ctttcatgat cccgggaacc gtgttcatgt cgctgctcgc cggttccctt ttcggagtct 540

tcaggggtgt ggcactggtt gtttttgctg caactgcagg ggcttcttct tgctatttct 600

tgtctaagct tattgggcgt cccattgtgt tctcactttg gcctgacaag ttgaggttct 660

ttcaggctca ggtggcgaaa agaagagagc ggctgttgaa ctacatgctc ttcctgaggt 720

tgacaccaac cttgccaaat acgttcatca actttgcttc tccaattgtt gatgttccat 780

atcatatttt ctttttcgga accttgattg gtctcatacc ggcagcttat gttactgtca 840

aggccggact agcactcgga gagctgcagt ccattggcga tctctatgat ttcagctcag 900

tcgctacttt gttcttcata ggacttgtct cggttacccc cacattggtg agcaaaggca 960

agtcgtagag cttcagccca agcgagctgg tgatcacaga cccacgatct cccgatcaca 1020

accttcgtgg tgaatggaag tgagacgccg gacaaacttt ctgcactgtg ttggggctgg 1080

ggaacttgga agagttggtt gggtttgggg atggatgtaa tgtgtttaat gtcattggta 1140

gaaataactc tggttctttt atctgtatat ttaataaaag acttatattt aggtgttat 1199

<210> 17

<211> 1225

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 17

aaacccatta ttcccaaact ctttccctta gaacatacac aacaatatat atataacacc 60

ttttattatt ctctttgtca agtaattctc tcatcacaat ttacaaccca atctttgcaa 120

aacatactga tctctctctc tctctctaaa atggcaccaa cagtctgtgt aatggacgcc 180

tctggtgaac ttggatcaac ccttgttgag cgtctccttc aaaggggtta tacagttcat 240

gccgtggttc aaagccaagg tgatgaagag atgatcaata agagtgataa gctgaagatt 300

ttcaggtctg acccatttga ttatcagagc ataattgatg ctttgagagg ctgttctggc 360

ttgttctact cttttgagcc tcctcaagat caacccactt atgatgaatt tatggcagat 420

gtggaggtaa gagcagcaca taatgtgctt gaagcatgtg cacagacaga tacaatagac 480

agagtagtct tcacttcttc aatcacagcc gttgtttgga ggaacgatcg cacttctgat 540

tcatctgatt tggatgagag acattggagt gatgttaatc tttgtcgtaa atacaagttg 600

tggcatggct tatcaaaaac cctagccgag aagacggctt gggccttggc gatggaccgg 660

ggagtgagca tggtgtccgt caacggcggc ttgttgacgg gcaaccaatt gtcgatcagc 720

aacccctact tgaaaggggc ggctgagatg tatgaggacg gggtgtttgt gaccgtcgat 780

ttggatttct tggcggacgc ccacatttgc gtcttcgagg acgtctcatc ctacggtcga 840

tatttgtgct tcaaccatgt catcaaccgc accgaagacg cccttcggct agctcaaaag 900

ttgacccctt ccgctcccgc tccacctcaa acttacgagg aggataataa aatcatccaa 960

cagaggatca gcaacaagaa attgaacaaa cttatggtga attttgaaag agtggctcac 1020

gtagagtgaa tcatcagaat ttgcactatt tttttttttt tgattgtgac tcaaatagag 1080

acacgtcatc atcacattct ttcttttctg tctagactag atcaactaaa agattagcaa 1140

gtgcaagata ttttgttgta catgatctct tggttgtatt tcatatttta aaatattgga 1200

gaatgaaatt atccttttgt ttcac 1225

<210> 18

<211> 750

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 18

gaggaggagg agggggcggg ggcggggtcg gcggtggcag tggcggtggc ggtggcgttg 60

gaggaggagg ggccgcaagc ggggcgggag cgaatagcaa gccgtcgaac tggaagacaa 120

ggatttgcaa caagtgggag ttgactgggt attgcccatt tggaagcaaa tgccattttg 180

ctcatggcca aacagagtta caccgttatg ggggcgggct ggtggagacg gaagtcagag 240

actcttcttc tgctcctact gaaaataagc agccgggtgg agcacccccc aagacgaccg 300

tagataccgt ggttgcatcg gtcccgtcag ttcctctctc cgacgtctat cacataggag 360

ttccatcgca aaggtcgtcc atcgtgattc agaggcccgg gcagagggct catcagaaat 420

ggaagggtcc cgacaaaatc agtaggatat acggtgactg gattgacgac attgaatagg 480

aaaacttgaa cagctgacct ggaacgacgg caaccccttc gagcgttctc taaatctccg 540

agagacttga tacgcccctc cgtgcgatat gatcggaaca tgtaactgta gctcttaatc 600

tgaggcaaga acttttcgtc ttgcttcaaa tggaacgtgc aaatttgcaa tggatgtcca 660

agttgagtac catatttatg tgcaaatgta tgttatttac ttataattac tgtgacttgt 720

cttgcacaat gcacagctgg ccctttgcct 750

<210> 19

<211> 2377

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 19

acattacaca cgcacgaact cacccaaccc aacccaaacc cccaaatccc aaagtccaat 60

caaacttcct cccaacccaa acaccccttt catttgtctg cgccgccggt tgatgacgga 120

ctaccgtata gcgccggcca tgaatctctg gactgacgac aacgcctcca tgatggaggc 180

cttcatgagc tcctccgacc tctccgcctt ctggcttcct cctcctccgc caacgccacc 240

cccaccctcc ccccgccccc caaccaccac cagccccagt cctccgcctc cggggtcacc 300

gctgcgccga cgccggcccc ggtcctcaac caggagggcc tccagcaccg cctccaggcg 360

atcatcgacg gcgcgcgcga cgcctggacc tacgccatct tctggcagtc ctcctacgac 420

tactccgccg ccgggacggt ggtgctgggc tggggcgacg ggtactacaa gggggacgag 480

gacaagtcca ggggcaagtc caaggccaac gcgacctccg cggtggagca ggagcaccgc 540

aagaaggtgc tccgcgacct caactcgctc atctccggct ccgccgccgc cgccgacgag 600

cccgccgtcg acgaggaggt caccgacacc gagtggttct tcctgatatc gatgacgcag 660

tcgttcgtca acggcagcgg gctgccgggg caggcgttca tgagctcgca gcctgtctgg 720

gtcgccggcg ccgaccgcct cgccgcgtcg ccctgcgagc gggcccggca gggccagatc 780

ttcgggatcc agaccatcgt ctgcatcccc tccgagaacg gcgtcgtcga gctcggctcc 840

accgacctca tcttcaacgg ccctgatctg ctgaacaaag ttagggtttt gttcaatttc 900

agcgccggcc tcgactccgg ctcgtggccg ctcgaccagg gcgagaacga cccttcctcg 960

atatggctca acgaccaccc ctcctcctcc ggcgccgccg cggcccccgc cggggccggg 1020

atcgacctca aggacgcggc cactccgacg gccaacaacc accccagctc gagcagcctg 1080

acggaggctc cgagctcgaa ggctcagcag acgcagagct tcttcaccaa agagttgaat 1140

ttctcggagt acggattcga cggggccacc aacggcaagg ggaacgggaa ttcgcagtcg 1200

ctgaagccgg agtccggcga gattttgaac tttggggaga gcaaggttag aggaggaggc 1260

ggcggggcgg gccctttcgg gcaggcggct ttcgcggtgg aggagacgaa caagaagaag 1320

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gacatcgagg cgtcggtggt gagggaggcg gacagcagca gggtggctgc gggggcgggg 1500

gcggtgaatt cggaggccga gaagcgcccg aggaagcgcg ggaggaagcc cgccaacggc 1560

cgggaggagc cgctgaatca cgtcgaggcg gagcggcagc ggagggagaa gctcaaccag 1620

cggttctacg cgctccgcgc tgtcgtcccc aacgtgtcga agatggacaa ggcctcgctc 1680

ctgggcgacg cgatctccta catcaacgag ctcaaggcca agctccaggc caccgaggcc 1740

gacaaggagg atctccagag gcaggtcgac tctgccaaga aggagctgat gaccagcaag 1800

gactcgcgaa cctcctccgg tgctgctgga ggaggagggg gccatcacga ccactctgtc 1860

tcgagcaagc tcatcgacct cgaaatcgac gtcaagatca tcggctggga cgcgatgatc 1920

cggatccagt gcagcaagaa gaaccacccc gccgcgaggc taatggcggc gctgaaagag 1980

ctcgacttgg atgtcaacca cgccagtgtg tcggtggtca atgatttgat gatccaacaa 2040

gcgaatgtca agatgggaag caggtgctac acccaggaac agctccggtt agccttgtcg 2100

gcgaaagtcg gcgatggccg gtaagctcgg ataacgtaaa ggaataaaat cggcggcttt 2160

cgattgttgt aggagatgat gaggaaccga gtttctggga cattttaagg cttcccggca 2220

aagacgaaaa aaaaaaaaac cttgcagagc tctgtaaaaa gtattagtaa ttgttaaact 2280

tgagtgcttt atggtagttg ttaatcttga attagtctct gtatttagtg gagttttgag 2340

cattcatcaa caattttcat ggttttttcc ctttttg 2377

<210> 20

<211> 220

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 20

agtaatgttt gcatttcggt tctcgtcgcc atgaacgact ctcagagcat ttcctcttcc 60

tccgccgatt ccgggtccat cgccaccgcg gatcaggtac tctctctctc tctctctctg 120

tgatttgtac aggtttgaat taatttcgaa tccaaaagtt tggtttttgg accactttgc 180

atgaatttga tgtttttttt aattaattaa ttactattcg 220

<210> 21

<211> 240

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 21

agctatgggt ataggcggtg atagccaagt tcaagaagag cacttcgacg tcctcactaa 60

aaccggtcaa aggactggtc tttccaagcc caggcaactt ctctctctct ctctctctct 120

ctctctctct ctctctctca acatgttttt ttttttaatt caaaaaagaa aattgatcag 180

ttgtttattt aaggcaatca atttcatgga tgttgaggtt ttgaatgcat agactaacag 240

<210> 22

<211> 222

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 22

agatttgtat acttcgaacc atctaaattt ttcgtgacac tagattctca actctcaacg 60

cgtattgtag ccatctcttg tcacaacccc tctctctgcc tctctctctc tctctctctc 120

tttttttaaa taaatgaaat aactaaaaaa tagatagaaa ttattatttt tttttaaata 180

atgggattgg taagattcca tggctagaac cgtttccact aa 222

<210> 23

<211> 220

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 23

accagcttcg ccagcaatag ccttcaggat gcaaaacaag tcgaaccaat atcaaaatat 60

atatgtgtgt atatatatat acacacacat ttatatattt gtgtgtgtgt gtgtgtgtgt 120

ttgtgtgaga gtgtgattaa aggcactaaa gaacacgaag caaaagagta cttgattcca 180

aatgcagaag ctgcagtaaa aggaaagcct aaaagtatat 220

<210> 24

<211> 220

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 24

ggagattcgc cggtgagaga ggttttccgt cgacggaaag agattttccg gcgaggaaaa 60

acaaaaattg gagggagaga acagtagaag aagaaagagg agagagagag agagagagaa 120

ataaaaggct ttagaaaacc gaaaaagagc aaagaggaga taatttatac ttttatagtt 180

ttaagaaaaa aaaaaaggaa aagaaatatg aacgctttta 220

<210> 25

<211> 218

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 25

gatcgggcgt gtcttgccac tgccaccaca actcacacct cactctctca ttcattcatt 60

cgctcacatc ccaattcggc aattcccact ttcttcccac tctctctctc tctctctatc 120

taacggctct tttttgccac caaacaaagc caatacattt acatcacacc aaactctctg 180

tctctctctc tcaccaaata cctaaaaaaa tacctttc 218

<210> 26

<211> 254

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 26

agctagagag gtgctggttt tatggagatg tactgttagg atgtgtttgc tcatttggat 60

ggaacacata agtagggtgg tttaaggcaa gaatttggat ctctctctct ctctctctct 120

ctctctctct ctctctctct ctctctctct ctcttattca gaaaaaagag ttcactactt 180

ttgaaaatct actagaatgg aggaaaacaa gtagtcctcc aaaataaaga aattaaaact 240

atatagtacg caaa 254

<210> 27

<211> 230

<212> DNA

<213> Boehmeria nivea (L.) Gaudich.

<400> 27

cgagcatgcc tgaattggca acaaccatga accattcatt ttaggaggct agtctttaat 60

acaaatcaag aaaacttctt tcaaattgtc gtttagagaa tatatatata tatatatata 120

tatatatatg cgcgcgcgcg tataagtaca aaaaccgaag caggcggctt gaagaagata 180

aggttggttt cttgttgcaa ctgcataagt ttagatattt agatgaggtg 230

<210> 28

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 28

gtttgcattt cggttctcgt 20

<210> 29

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 29

catcaaattc atgcaaagtg gtc 23

<210> 30

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 30

agcacttcga cgtcctcact 20

<210> 31

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 31

gcattcaaaa cctcaacatc c 21

<210> 32

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 32

cgcgtattgt agccatctct tg 22

<210> 33

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 33

acggttctag ccatggaatc tt 22

<210> 34

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 34

tcaggatgca aaacaagtcg aa 22

<210> 35

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 35

gctttccttt tactgcagct tct 23

<210> 36

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 36

ttcgccggtg agagaggttt 20

<210> 37

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 37

tctcctcttt gctctttttc ggt 23

<210> 38

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 38

tcattcattc attcgctcac at 22

<210> 39

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 39

ggtgtgatgt aaatgtattg gct 23

<210> 40

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 40

aggatgtgtt tgctcatttg g 21

<210> 41

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 41

gaggactact tgttttcctc ca 22

<210> 42

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 42

atgcctgaat tggcaacaac 20

<210> 43

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 43

tgcagttgca acaagaaacc 20

Claims (10)

1.苎麻叶背毡毛SNP标记，其特征在于，所述SNP标记位于第7号染色体上或第13号染色体上；

位于第7号染色体上，所述SNP标记为以下中的任一种或多种：

SEQ ID NO.1中的第1116位碱基；

SEQ ID NO.2中的第125和142位碱基；

SEQ ID NO.3中的第277、301、338、564和601位碱基；

SEQ ID NO.4中的第568位碱基；

SEQ ID NO.5中的第1120和1813位碱基；

SEQ ID NO.6中的第1120位碱基；

位于第13号染色体上，所述SNP标记为以下中的任一种或多种：

SEQ ID NO.7中的第966位碱基；

SEQ ID NO.8中的第1813、2282、2539和2839位碱基；

SEQ ID NO.9中的第1052位碱基；

SEQ ID NO.10中的第248位碱基；

SEQ ID NO.11中的第580位碱基；

SEQ ID NO.12中的第626位碱基；

SEQ ID NO.13中的第150和154位碱基；

SEQ ID NO.14中的第85位碱基；

SEQ ID NO.15中的第618和852位碱基；

SEQ ID NO.16中的第336位碱基；

SEQ ID NO.17中的第109位碱基；

SEQ ID NO.18中的第553位碱基；

SEQ ID NO.19中的第260位碱基。

2.用于检测权利要求1所述的苎麻叶背毡毛SNP标记的引物对，其特征在于，所述SNP标记位于第7号染色体上，引物对包括根据SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.6所示的序列设计的引物对中的任一种或多种；

所述SNP标记位于第13号染色体上，包括根据SEQ ID NO.7-SEQ ID NO.19所示的序列设计的引物对中的任一种或多种。

3.用于检测权利要求1所述的SNP标记的探针。

4.用于检测权利要求1所述的SNP标记的芯片。

5.权利要求1所述的SNP标记在研究苎麻种群的遗传多样性以及培育苎麻新品种中的应用。

6.苎麻叶背毡毛相关的SSR序列，其特征在于，SNP标记位于第7号染色体上，SSR序列如SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.21所示；

SNP标记位于第13号染色体上，SSR序列如SEQ ID NO.22-SEQ ID NO.27所示。

7.检测苎麻叶背毡毛性状的引物对，其特征在于，为以下引物对中的任一种或多种：

第一引物对：如SEQ ID NO.28和SEQ ID NO.29所示；

第二引物对：如SEQ ID NO.30和SEQ ID NO.31所示

第三引物对：如SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33所示；

第四引物对：如SEQ ID NO.34和SEQ ID NO.35所示；

第五引物对：如SEQ ID NO.36和SEQ ID NO.37所示；

第六引物对：如SEQ ID NO.38和SEQ ID NO.39所示；

第七引物对：如SEQ ID NO.40和SEQ ID NO.41所示；

第八引物对：如SEQ ID NO.42和SEQ ID NO.43所示。

8.检测苎麻叶背毡毛的试剂盒，其特征在于，含有权利要求7中的检测苎麻叶背毡毛性状的引物对。

9.根据权利要求8所述的试剂盒，其特征在于，还包括dNTPs、缓冲液、酶、双蒸水中的任一种或多种。

10.检测苎麻叶背毡毛的方法，其特征在于，包括以下步骤：

待检测样本的基因组作为模板，以权利要求7中的引物对进行PCR扩增，根据扩增产物的条带判断是否为叶背毡毛性状。