CN109536495B - 抑制RTL1基因表达的siRNA及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了抑制RTL1基因表达的siRNA及其应用,所述siRNA为以下三条siRNA中的至少一种:RTL1‑siRNA1,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;RTL1‑siRNA2,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;RTL1‑siRNA3,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;所述siRNA干扰小鼠RTL1基因,转录水平上的干扰效率达到87%;该siRNA可应用于制备预防和/或治疗肌肉肥大症产品。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及抑制RTL1基因表达的siRNA及其应用。
背景技术
RTL1基因(反转录转座子1基因,retrotransposon-like-1),又名父本表达基因11(paternally expressed gene 11,Peg11),在人和小鼠中为父本表达的印记基因,没有内含子序列。RTL1基因在胚胎和胎盘组织中表达量很高,对母体胎盘与胎儿的营养传递起着重要作用,敲除该基因的小鼠表现为胎儿死亡率升高、新生儿生长停滞、胎盘尺寸偏小;与人的胎儿发育和新生儿的生长也有密切关系。该基因位于DLK1-DIO3印记区域,此区域基因对肌肉发育有一定的影响,在转基因小鼠中异位表达RTL1基因,会导致肌肉肥大;此外,该基因与callipyge绵羊的肌肉肥大相关,双肌臀的绵羊中RTL1基因的表达量是正常绵羊中的12倍。
C2C12细胞是由小鼠骨骼肌卫星细胞永生化而来的细胞株,保持着一定的增殖和分化能力,且细胞形态和特性均一,可无限代培养,体外培养的C2C12成肌细胞能在低血清诱导条件下分化为多核的肌管,并表达Myogenin和Myosin等成熟骨骼肌的各种标志蛋白,因此C2C12细胞通常成为体外研究成肌细胞增殖和分化能力的首选模型。
RNA干扰是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象。该技术主要是采用与靶基因同源的20-15nt的siRNA(Small interfering RNA,siRNA),诱导靶基因mRNA特异性的降解,从而抑制基因的表达。由于其干扰效率高、操作简便,常被用于基因功能的研究。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术之缺陷,提供了抑制RTL1基因表达的siRNA及其应用,该siRNA干扰小鼠RTL1基因,转录水平上的干扰效率能达到87%,干扰效率高、特异性好、操作简便、成本低廉,为研究RTL1基因的功能奠定了基础;本发明人发现RTL1基因能够显著抑制成肌细胞的增殖和分化,因而一方面,抑制RTL1基因表达的siRNA能为研究肌肉发育的表达调控机制提供新思路,另一方面,抑制RTL1基因表达的siRNA可以应用于制备预防和/或治疗肌肉肥大症产品。
为实现上述目的,本发明是这样实现的:
本发明的目的之一在于提供了一种抑制RTL1基因表达的siRNA,其为以下三条siRNA中的至少一种:
RTL1-siRNA1,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
RTL1-siRNA2,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
RTL1-siRNA3,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
优选地,所述siRNA为RTL1-siRNA2。
具体地,所述RTL1-siRNA1、RTL1-siRNA2、RTL1-siRNA3序列的3’端均垂悬有dTdT。
本发明的目的之二在于提供了所述的siRNA在制备预防和/或治疗肌肉肥大症产品中的应用。
进一步地,所述预防和/或治疗肌肉肥大症通过抑制RTL1基因表达实现。
具体地,所述siRNA通过抑制RTL1基因的表达来实现抑制小鼠成肌细胞C2C12的增殖。
具体地,所述siRNA通过抑制RTL1基因的表达来实现抑制小鼠成肌细胞C2C12的分化。
本发明具有的有益效果是:
1、本发明提供的抑制RTL1基因表达的siRNA,干扰小鼠RTL1基因,转录水平上的干扰效率能达到87%,干扰效率高、特异性好、操作简便、成本低廉,为研究RTL1基因的功能奠定了基础。
2、本发明人在试验中发现RTL1基因能够显著抑制成肌细胞的增殖和分化,因而,一方面,抑制RTL1基因表达的siRNA能为研究肌肉发育的表达调控机制提供新思路,在家畜肉质性状方面发挥的调控作用打下了基础;
另一方面,RTL1基因是促进肌肉分化的,那么我们抑制它,就可以抑制肌肉过度肥大,因而对肉质性状的改良及肌肉发育相关疾病的治疗具有一定的意义,在猪的肉质改良上,不能过度追求瘦肉率,还要考虑到肉的风味,肥瘦相间的肉比较好吃,所以现在有的时候要控制瘦肉,增加一定量的脂肪;在疾病上来说,可以治愈一些肌肉肥大症,抑制RTL1基因表达的siRNA可以应用于制备预防和/或治疗肌肉肥大症产品,该产品的有效成分为本发明提供的抑制RTL1基因表达的siRNA。
附图说明
图1为转染siRNA后,荧光定量PCR检测对RTL1基因mRNA水平干扰效果图;
图2为转染siRNA后,western-blot检测对RTL1基因蛋白水平干扰效果图;
图3为siRNA干扰RTL1基因后抑制成肌细胞增殖的效果图;
图4为siRNA干扰RTL1基因后抑制成肌细胞分化的效果图;其中图(A)为荧光定量PCR检测成肌细胞分化标志性基因MyoG mRNA表达水平的变化图;(B)为为荧光定量PCR检测成肌细胞分化标志性基因MyHC mRNA表达水平的变化图;
图5为siRNA干扰RTL1基因后采用Western Blot从蛋白水平检测成肌细胞分化标志性基因MyoG和MyHC表达量变化图。
具体实施方式
实施例1抑制RTL1基因表达的siRNA的获得
1、siRNA的设计、合成
根据Genbank中小鼠RTL1基因序列(Gene ID:353326),利用BLOCK-iT RNAiDesigner软件(http://rnaidesigner.thermofisher.com/rnaiexpress/sort.do),针对RTL1基因不同靶位点设计3条siRNA(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3),并设计siRNA阴性对照(NC),序列由广州锐博生物科技有限公司合成。
2、RTL1-siRNA1,正义链:5′-GGAGGAAUCAAGUGAUGAU-3′(SEQ ID NO.1),反义链:5′-AUCAUCACUUGAUUCCUCC-3′(SEQ ID NO.2);
RTL1-siRNA2,正义链:5′-GCAUCGCACUAGAGACAUA-3′(SEQ ID NO.3),反义链:5′-UAUGUCUCUAGUGCGAUGC-3′(SEQ ID NO.4);
RTL1-siRNA3,正义链:5′-GCCCAAGAACUCUCCAGAA-3′(SEQ ID NO.5),反义链:5′-UUCUGGAGAGUUCUUGGGC-3′(SEQ ID NO.6)。
实施例2抑制RTL1基因表达的siRNA的干扰效果检测
1、抑制RTL1基因表达的siRNA的转染
分别转染小鼠成肌细胞C2C12,转染试剂为锐博公司的riboFECTTM CP,转染步骤如下:
(1)转染前一天,将细胞按照1×105个细胞/孔的密度接种于6孔细胞培养板中;
(2)用120μl 1×riboFECTTM CP Buffer稀释5μl 20μM siRNA,轻轻混匀;
(3)向上述(2)中加入12μl riboFECTTM CP Reagent,轻轻吹打混匀,室温放置15min;
(4)用PBS将6孔板中的细胞清洗3次,去掉PBS,将(3)的混合液接种至细胞板,再加入完全培养基,补充至每个孔终体积为2ml。
2、荧光定量PCR检测siRNA对RTL1mRNA水平干扰效率
将干扰组(siRNA-1、siRNA-2、siRNA-3)与阴性对照组(NC)分别转染C2C12细胞,转染24h后收集细胞,Trizo1提取总RNA,TaKaRa Primer Script RT反转录试剂盒进行反转录,采用Bio-Rad公司的SYBR Green荧光染料,Roche公司LightCycler480荧光定量PCR仪,以β-actin作为内参,进行荧光定量PCR实验,用2-ΔΔCt法计算每个基因的相对mRNA表达量,每组实验做3个平行,每个实验重复三次:反应体系为20μ1;反应条件:95℃预变性5min,95℃变性15sec,60℃退火15sec,72℃,15s循环40次。
其中用于荧光定量PCR检测RTL1基因的引物序列如下:
上游引物序列为:CTTTCCTGACCCTTACCA(SEQ ID NO.7)
下游引物序列为:GGTCCAAAAGATTTCGTG(SEQ ID NO.8)
结果表明:如图1所示,相比于阴性对照组(NC)siRNA-1~siRNA-3均有一定的干扰效果,其中siRNA-2的干扰效果最好,使RTL1基因mRNA水平的表达量下降了87%,达到了极显著水平(P<0.01),因此本发明实施例选用siRNA-2进行后续试验。
3、WesternBlot检测siRNA对RTL1蛋白表达的抑制情况
将干扰组(siRNA-2)与阴性对照组(NC)分别转染C2C12细胞,转染48h后收集细胞,采用碧云天生物技术公司的RIPA裂解液(P0013B)提取蛋白,用BCA蛋白浓度测定试剂盒测蛋白浓度,具体方法参照试剂盒的说明书。将蛋白溶液按照4:1的比例加入5*蛋白上样缓冲液,沸水浴变性15min,再调平上样量用SDS-聚丙稀铣胺凝胶电泳跑胶。电泳至溴酚蓝刚跑出即可终止电泳,200mA转膜1小时,之后抗体孵育,一抗孵育3小时,二抗孵育30分钟,显色曝光。
结果如图2所示,表明RTL1-siRNA-2能够限制抑制RTL1蛋白表达。
实施例3 RTL1-siRNA2对小鼠成肌细胞C2C12细胞增殖的影响
1、采用MTT法检测细胞增殖:将处于对数生长期的细胞用培养基制成单细胞悬液,按每孔2000个细胞,将细胞均匀的接种到96孔板中,每孔100μL,37℃、5%CO2饱和湿度条件过夜培养。转染前2个小时,换成无血清DMEM培养基饥饿处理。分别将siRNA-RTL1干扰组和阴性对照组NC转入细胞,细胞于37℃CO2培养箱中培养,4h后吸出混合液换入正常培养基,分别在培养24h、48h、72h,每孔加入10μLMTT,37℃培养4h,吸出培养基,加入150μL DMSO震荡10min,在酶标仪(美国Thermo公司生产,MULTISKAN MK3型)的490nm波长下测定吸光值。
2、结果如图3所示,干扰RTL1基因明显抑制小鼠成肌细胞C2C12的增殖。
实施例4 RTL1-siRNA2对小鼠成肌细胞C2C12细胞分化的影响
1、未分化的C2C12细胞以含有10%FBS的高糖DMEM培养基(生长培养基,growthmedium,GM)进行培养,将细胞按照1×105接种至6孔培养板,待细胞贴壁,密度达到70%,分别转染siRNA干扰组与阴性对照组,6个小时后换成分化培养基(含2%马血清的DMEM培养基,differentiation medium,DM),对C2C12细胞进行诱导分化,分别在诱导分化的0d、2d和6d收集细胞,提取RNA和蛋白,利用荧光定量PCR和WesternBlot检测成肌分化标志基因MyoG和MyHC表达量的变化。
2、图4所示为采用荧光定量PCR检测成肌细胞分化标志性基因MyoG和MyHC mRNA表达水平的变化,发现干扰组基因表达量显著低于阴性对照组,说明siRNA通过干扰RTL1基因而抑制成肌细胞的分化。
3、图5所示为收集诱导分化第6d的细胞,提取蛋白,采用Western Blot从蛋白水平检测成肌细胞分化标志性基因MyoG和MyHC表达量变化,结果发现干扰组基因表达量显著降低,进一步说明转染siRNA抑制成肌细胞的分化。
由实施例3和实施例4可知,本发明人在试验中发现RTL1基因能够显著抑制成肌细胞的增殖和分化,因而,一方面,抑制RTL1基因表达的siRNA能为研究肌肉发育的表达调控机制提供新思路,在家畜肉质性状方面发挥的调控作用打下了基础;
另一方面,RTL1基因是促进肌肉分化的,那么我们抑制它,就可以抑制肌肉过度肥大,因而对肉质性状的改良及肌肉发育相关疾病的治疗具有一定的意义,在猪的肉质改良上,不能过度追求瘦肉率,还要考虑到肉的风味,肥瘦相间的肉比较好吃,所以现在有的时候要控制瘦肉,增加一定量的脂肪;在疾病上来说,可以治愈一些肌肉肥大症,抑制RTL1基因表达的siRNA可以应用于制备预防和/或治疗肌肉肥大症产品,该产品的有效成分为本发明提供的抑制RTL1基因表达的siRNA。
以上所述仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
<120> 抑制RTL1基因表达的siRNA及其应用
<160> 8
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ggaggaauca agugaugau 19
<210> 2
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
aucaucacuu gauuccucc 19
<210> 3
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
gcaucgcacu agagacaua 19
<210> 4
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
uaugucucua gugcgaugc 19
<210> 5
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
gcccaagaac ucuccagaa 19
<210> 6
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
uucuggagag uucuugggc 19
<210> 7
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
ctttcctgac ccttacca 18
<210> 8
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
ggtccaaaag atttcgtg 18
Claims (3)
1.一种抑制RTL1基因表达的siRNA在调控小鼠成肌细胞增殖和分化中的应用,其特征在于,所述siRNA为:
RTL1-siRNA2,其正义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,其反义链的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述RTL1-siRNA2序列的3’端垂悬有dTdT。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述小鼠成肌细胞为小鼠成肌细胞C2C12。
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