CN109182598A - 一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法 - Google Patents
一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,带有部分CGMMV序列的T1和带有Mg2+‑依赖的DNAzyme的部分酶序列的P1杂交,AcⅡ识别其底物序列5′‑AACGTT‑3′,后者被剪切成两部分,随后解链为4个ssDNA片段,加入脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)及dCTP,进行加尾反应,生成Mg2+‑依赖的DNAzyme的完整酶序列。然后再加入HP,HP的环部位与Mg2+‑依赖的DNAzyme的酶序列进行杂交,在Mg2+存在下,Mg2+‑依赖的DNAzyme酶序列剪切其识别位点,将HP的茎环结构剪切为两部分,位于茎部位的G‑四连体结构被释放,在K+存在下,结合Hemin形成Hemin/G‑四连体结构,在H2O2存在下,催化ABTS2‑氧化,使溶液变绿。溶液吸光度与CGMMV浓度呈正相关。
Description
技术领域
本发明属于光学生物传感技术领域,具体涉及一种基于TdT和DNAzyme 扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法。
背景技术
黄瓜绿斑驳病毒(CGMMV)是一种侵染葫芦科作物的烟草花叶病毒属病毒, 受侵染的瓜类作物在生长点周围表现出绿色斑驳等症状,CGMMV可以通过机 械或通过种子传播,导致黄瓜,甜瓜和西瓜等经济作物的严重减产。由于葫芦科 种子在国际贸易流通较大,因此CGMMV的传播风险很高。此外,西瓜碎片中 的CGMMV在土壤中能存活10个月,表明被该病毒污染的土壤很难补救。严格 的入境检测是防止这种检疫病原体进口的有效手段。因此,迫切需要快速、廉价、 灵敏、特异的检测方法来检测CGMMV。
传统的病毒检测方法有血清学检测、电镜、聚合酶链反应(PCR)和电化学 检测等。然而,这些方法有一些固有的缺点,血清学检测由于其操作简单且能同 时处理大量样品而被广泛采用,但需要购买价格昂贵的血清学检测试剂盒,并且 检测结果的准确性取决于抗体的质量。电镜检测则需的大型和笨重的仪器,费力, 不敏感,而且耗时。
可视化检测因其简单、灵敏度高、直观等优点而受到人们的广泛关注。与病 毒相关的比色检测已被报道,包括禽流感、H5N1流感病毒、乙型肝炎病毒、寨 卡病毒和裂谷热病毒,但是对于植物病毒的可视化检测报道较少。
发明内容
针对以上存在的技术问题,本发明提供一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄 瓜绿斑驳病毒可视化检测方法。
本发明的技术方案为:一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可 视化检测方法,包括以下步骤:
(1)将T1和P1混合在NEB CutSmart缓冲溶液中,在37℃下杂交;
(1)(2)加入内切酶AcⅡ,利用AcⅡ识别5′-AACGTT-3′位点,在37℃ 下持续反应一定时间,获得酶切产物,37℃下解链为4个ssDNA片段;
(3)取一定量的所述酶切产物,加入TdT、dCTP于磷酸盐缓冲溶液中混合, 在37℃反应温度条件下进行加尾反应,升温至85℃灭活3min,获得Mg2+-依赖 的DNAzyme的完整酶序列;
(4)加入HP和含Mg2+缓冲液,在37℃下孵育100min,Mg2+-依赖的 DNAzyme的完整酶序列与HP进行杂交,在Mg2+存在下,Mg2+-依赖的DNAzyme 剪切HP的识别位点,将HP剪切为两部分;
(5)加入一定浓度的Hemin和含K+缓冲液,在37℃下孵育30min,形成 Hemin/G-四连体结构溶液;
(6)最后依次在Hemin/G-四连体结构溶液中加入一定浓度的ABTS2-和 H2O2溶液,室温下反应一段时间,得到绿色溶液。
最后依次在Hemin/G-四连体结构溶液中加入一定浓度的ABTS2-和H2O2溶 液,室温下反应一段时间,得到绿色溶液。进一步地,所述T1的基因序列如SEQ ID No.1所示,P1的基因序列如SEQ ID No.2所示,HP的基因序列如SEQ ID No. 3所示,SEQ ID No.1:AACCCGAACGTTTG,SEQ ID No.2:
ACACACAGCGATCACCCATGTTAAACGTTCGGGTT,SEQ ID No.3:
TTTTGGGTTGGGCGGGATGGGTTTATrAGGTGTGTATCCCGCCC。
更进一步地,P1包括三个区域,具体为:
1)第1-25位,部分Mg2+-依赖DNAzyme部分酶序列;
2)第24-29位,AcⅡ酶识别序列;
3)第23-35位,与CGMMV cDNA的互补序列。
更进一步地,HP包括三个区域,具体为:
1)第1-26位,G-四连体结构序列;
2)第19-34位,环序列,Mg2+-依赖DNAzyme底物序列;
3)第10-18位和第35-43位,茎序列。
进一步地,步骤(1)中所述P1浓度为1.0μM。
进一步地,步骤(4)中所述HP浓度为1.0μM。
进一步地,步骤(2)中所述AcⅡ的酶切反应时间为50min。
进一步地,步骤(3)中所述加尾反应时间为30min。
进一步地,步骤(4)中所述Mg2+-依赖的DNAzyme和HP的杂交时间为100 min。
本发明的工作原理为:T1和P1杂交后形成一条dsDNA,通过内切酶AcⅡ 识别dsDNA上的5′-AACGTT-3′位点,在37℃下将dsDNA剪切为两部分,并解 链为4个ssDNA片段。在TdT和dCTP存在下,进行加尾反应,构建成Mg2+- 依赖的DNAzyme。然后再加入HP和Mg2+,HP第10-18位和第35-43位的茎环 段与Mg2+-依赖的DNAzyme进行杂交,得到环杂交产物,在Mg2+存在下,Mg2+- 依赖的DNAzyme剪切HP的识别位点,将HP的茎环结构剪切为两部分,形成 G-四连体结构,在K+结合Hemin形成Hemin/G-四连体结构,在H2O2存在的情 况下,催化ABTS2-氧化,使溶液变绿。当不存在T1时,AcⅡ不能对单链P1进 行酶切,也就不能够合成Mg2+-依赖的DNAzyme,因此不能对HP进行剪切,也 就不能够形成G-四连体结构,因此溶液中的颜色变化不明显,由此实现特异性 检测。
与现有技术相比,本发明的有益效果为:本发明利用脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)催化dCTP加尾到ssDNA片段的3′端,不需要DNA作为模板,即可获 得合成DNA,因此得到的产物也不会与模板进行杂交结合,影响进一步反应。 经试验证明,本发明的检测体系线性范围为0.1pM-2nM,最低检测限为0.1pM。 总之,本发明具有简单、直接、成本低、特异性好、灵敏度高、反应速度快、干 扰性小等优点。
附图说明
图1是本发明的反应原理流程图;
图2是本发明实施例3的可行性分析PAGE电泳图,其中,泳道1是T1, 泳道2是P1,泳道3是T1和P1混合物,泳道4是P1中加入5U AcⅡ,泳道5 是在T1和P1混合物中加入5U AcⅡ,泳道6是在T1和P1混合物中加入5U AcⅡ, 10U TdT和10mM dCTP;
图3是本发明实施例3的在Hemin(0.6μM,10%DMSO),H2O2(2mM), ABTS2-(2mM),和KCl(10mM)条件下检测溶液吸光度的光谱图,其中,a是 空白,b是不存在T1,c是在T1(0.2nM);
图4是本发明实施例2的吸光度与T1浓度关系图,其中,T1浓度从a到h 的箭头表示0、0.1pM、0.25pM、1pM、2.5pM、25pM、0.2nM、2nM;
图5是本发明实施例2的吸光度与T1浓度对数之间的线性相关图,误差线 表示3次试验标准差;
图6是本发明实施例4的选择性结果图,其中(1)T1,(2)单碱基错配组, (3)二碱基错配组,(4)健康西瓜苗基因组和(5)空白对照组;
图7是本发明实施例5对不同病毒的选择性结果图,其中,(1)T1、(2) CGMMV,(3)6种病毒混合物,包括CGMMV,WMV,CMV,SMV,ZYMV 和SqMV,(4)WMV,(5)CMV,(6)SMV,(7)ZYMV,(8)SqMV,(9) 健康西瓜幼苗;
图8是本发明实施例6中不同P1浓度与吸光度关系图;
图9是本发明实施例7中不同HP浓度与吸光度关系图;
图10是本发明实施例8中AcⅡ的酶切反应时间与吸光度关系图;
图11是本发明实施例9中加尾反应时间与吸光度关系图;
图12是本发明实施例10中Mg2+-依赖的DNAzyme和HP的杂交时间与吸 光度关系图。
具体实施方式
下面结合实施例与附图对本发明做进一步说明,本发明不受下述实施例的限 制。
实施例1
一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其原理 步骤如图1所示,包括以下步骤:
(1)将2μL T1(0、0.1pM、0.25pM、1pM、2.5pM、25pM、0.2nM、2 nM)和2μLP1(1.0μM)混合在1×NEB内切酶缓冲溶液中,在37℃下杂交120 min;所述T1的基因序列如SEQ ID No.1所示,SEQ ID No.1: AACCCGAACGTTTG,P1的基因序列如SEQ ID No.2所示,SEQ ID No.2:ACACACAGCGATCACCCATGTTAAACGTTCGGGTT,P1包括三个区域,具体 为:1)第1-25位,Mg2+-依赖DNAzyme部分酶序列;2)第24-29位,AcⅡ酶 识别序列;3)第23-35位,与CGMMV cDNA的互补序列。
(2)加入5.0U的内切酶AcⅡ,利用AcⅡ识别5′-AAGCTT-3′位点,在37℃ 下持续反应50min,获得酶切产物,37℃下解链为4个ssDNA;
(3)取20μL的所述酶切产物,加入10U TdT、10mMdCTP、0.25mM CoCl2于1×缓冲溶液(50μL)中混合,在37℃反应温度条件下加尾反应30min,然后 升温至85℃灭活3min,获得Mg2+-依赖的DNAzyme完整酶序列的混合液;
(4)在所述Mg2+-依赖的DNAzyme的反应混合液中加入HP和含Mg2+缓 冲液,在37℃下孵育40min,Mg2+-依赖的DNAzyme与HP进行杂交100min, 得到杂交产物,在Mg2+存在下,Mg2 +-依赖的DNAzyme剪切HP的识别位点, 将HP剪切为两部分;HP的基因序列如SEQ ID No.3所示,SEQ ID No.3: TTTTGGGTTGGGCGGGATGGGTTTATrAGGTGTGTATCCCGCCC。HP包括三个区域,具体为:1)第1-26位,G-四连体结构序列;2)第19-34位,Mg2+-依赖DNAzyme 底物序列;3)第10-18位和第35-43位,茎环结构中茎序列。
(5)加入Hemin(0.6μM,10%DMSO)和KCl(10mM),在37℃下孵育30 min,形成Hemin/G-四连体结构溶液;
(6)最后依次在Hemin/G-四连体结构溶液中加入一定浓度的ABTS2-(2mM) 和H2O2(2mM)溶液,室温下反应一段时间,得到不同程度的绿色溶液。
实施例2
不同T1浓度(0、0.1pM、0.25pM、1pM、2.5pM、25pM、0.2nM、2nM) 条件下的溶液吸光度检测:
利用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器对实施例1中步骤(6)最后得到的 溶液进行吸光度测量,测定该溶液在390~490nM波长范围内的吸收光谱。由图 4可知,荧光强度随T1浓度的增加而增大,并且由图5可看出荧光强度和T1浓 度在0.1pM-2nM范围内呈良好的线性关系,线性方程为:A=1.013+0.07356lg C,最低检测限为0.1pM。
实施例3
在Mini-Sub Cell GT电泳槽的1-6号泳道中依次加入T1、P1、T1和P1混合 物、P1中加入5U Ac II、T1和P1混合物中加入5U Ac II、T1和P1混合物中 加入5U Ac II,10U TdT和10mM dCTP,进行PAGE电泳分析。结果如图2所 示,1号泳道和2号泳道的两条不同的带分别对应于T1和P1,当T1和P1都存 在的时候,在3号泳道观察到一条新的带,为T1/P1的杂交条带。在T1不存在 的情况下,4号泳道只有一条带,显示P1不能被AcⅡ剪切。然而,在第5号泳道观察到了一条新的带,表明AcⅡ能够剪切T1/P1杂交后的dsDNA,当TdT和 dCTP加入AcⅡ的酶切产物时,在第6号泳道观测到瀑布状带,表明加尾反应成 功。
以实施例1为参照,其中,T1的浓度为0.2nM,设置两个对照组,编号为 a是空白,b是不存在T1,c是在T1(0.2nM),其余条件均相同,分别在Hemin (0.6μM,10%DMSO),H2O2(2mM),ABTS2-(2mM),和KCl(10mM)条件 下检测溶液吸光度,结果如图3所示,在样品a和b中没有观察到明显的比色信 号,表明在不存在T1的情况下,不能够获得阳性信号。然而在T1存在下,色 度信号急剧增加,表明只有在T1存在下,才能观察到浅绿色。
实施例4
为了评估本发明所提供的检测方法对CGMMV cDNA检测的特异性,开展 了对照实验:采用完全互补的T1、单碱基错配的T1、双碱基错配的T1,完全不 互补的西瓜幼苗DNA以及空白对照组,单碱基错配的T1、双碱基错配的T1基 因序列如SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示,SEQ ID No.4: AACCCGAACGTTAG,SEQ ID No.5:AACCCGAACGTAAG,下划线表示错配 碱基。结果如图4所示,双碱基错配的T1、完全不互补的西瓜幼苗DNA的荧光 强度与空白对照组的相近,单碱基错配的T1存在时,检测溶液的荧光强度比空 白对照组有增强,但是当完全互补的T1存在时,检测溶液的荧光强度与空白对 照组的荧光强度相比有显著的增强。由此可见,本发明可区别完全互补和非互补 的目标DNA,即使只有一个碱基的差异也能够识别,具有良好的特异性。
实施例5
为了评估本发明所提供的检测方法对CGMMV cDNA的选择性,利用不同 病毒cDNA进行检测。反转录反应:取10μl 2×SuperMix,2μL OligodT,8μL病 毒RNA,病毒RNA包括黄瓜绿斑驳病毒(CGMMV)、西瓜花叶病毒(WMV)、黄 瓜花叶病毒(CMV)、大豆花叶病毒(SMV)、西葫芦黄花叶病毒(ZYMV)、南瓜花 叶病毒(SqMV),在42℃下反应1h,然后在85℃下加热3min,使逆转录酶失活。 用西瓜幼苗基因组DNA提取试剂盒提取健康西瓜基因组,6个病毒基因组和西 瓜基因组浓度均稀释至20ng/μL,并在-80℃下保存。
开展实验:以(1)T1、(2)CGMMV、(3)6种病毒cDNA混合液 (CGMMV+WMV+CMV+SMV+SMV+ZYMV+SqMV)、(4)WMV、(5)CMV、 (6)SMV、有7)ZYMV、(8)SqMV、(9)健康西瓜幼苗的顺序制作成9组待 测样本,分别进行分光光度法检测,结果如图5所示,含有CGMMV基因组的 (1)-(3)组的吸光度相差不大,均有明显地增强,而不含CGMMV基因组的 (4)-(9)组的吸光度微弱。由此可知,本发明的检测方法对CGMMV cDNA 有良好的选择性。
实施例6
研究不同P1浓度对吸光度的影响,其中,T1的浓度为0.2nM:
以实施例1为参照,设置6个对照组,每组设置三个平行,其余条件均相同, 采用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器测量光谱的变化,实施例1与6个对照 组的P1浓度与吸光度如表1所示:
表1:各组的P1浓度值与吸光度
组别 | P1浓度 | 吸光度 |
实施例1 | 1.0μM | 0.275Abs |
对比例1 | 0.2μM | 0.03Abs |
对比例2 | 0.4μM | 0.095Abs |
对比例3 | 0.6μM | 0.18Abs |
对比例4 | 0.8μM | 0.225Abs |
对比例5 | 1.2μM | 0.285Abs |
对比例6 | 1.4μM | 0.29Abs |
以P1浓度值为横坐标,以吸光度为纵坐标,做折线图,如图8所示。从图 8中可以看出,检测到的吸光度随着P1浓度值在0.2-1.0μM区间内增大而增大, 当浓度超过1.0μM后,吸光度趋于稳定。由此可知,P1浓度值最佳为1.0μM。
实施例7
研究不同HP浓度对吸光度的影响,其中,T1的浓度为0.2nM:
以实施例1为参照,设置6个对照组,每组设置三个平行,其余条件均相同, 采用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器测量光谱的变化,实施例1与6个对照 组的HP浓度与吸光度如表2所示:
表2:各组的HP浓度值与吸光度
以P1浓度值为横坐标,以吸光度为纵坐标,做折线图,如图9所示。从图 9中可以看出,检测到的吸光度随着HP浓度值在0.2-1.0μM区间内增大而增大, 当浓度超过1.0μM后,吸光度趋于稳定。由此可知,HP浓度值最佳为1.0μM。
实施例8
研究AcⅡ的酶切反应时间对吸光度的影响,其中,T1的浓度为0.2nM:
以实施例1为参照,设置6个对照组,每组设置三个平行,其余条件均相同, 采用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器测量光谱的变化,实施例1与6个对照 组的AcⅡ的酶切反应时间与吸光度如表3所示:
表3:各组的AcⅡ的酶切反应时间与吸光度
组别 | AcⅡ的酶切反应时间 | 吸光度 |
实施例1 | 50min | 0.28Abs |
对比例1 | 10min | 0.025Abs |
对比例2 | 20min | 0.095Abs |
对比例3 | 30min | 0.18Abs |
对比例4 | 40min | 0.25Abs |
对比例5 | 60min | 0.285Abs |
对比例6 | 70min | 0.29Abs |
以AcⅡ的酶切反应时间为横坐标,以吸光度为纵坐标,做折线图,如图10 所示。从图10中可以看出,检测到的吸光度随着AcⅡ的酶切反应时间在10-50 min区间内增大而增大,当AcⅡ的酶切反应时间超过50min后,吸光度趋于稳 定。由此可知,AcⅡ的酶切反应时间最佳为50min。
实施例9
研究加尾反应时间对吸光度的影响,其中,T1的浓度为0.2nM:
以实施例1为参照,设置6个对照组,每组设置三个平行,其余条件均相同, 采用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器测量光谱的变化,实施例1与6个对照 组的加尾反应时间与吸光度如表4所示:
表4:各组的加尾反应时间与吸光度
组别 | 加尾反应时间 | 吸光度 |
实施例1 | 30min | 0.27Abs |
对比例1 | 10min | 0.03Abs |
对比例2 | 15min | 0.095Abs |
对比例3 | 20min | 0.18Abs |
对比例4 | 25min | 0.235Abs |
对比例5 | 35min | 0.275Abs |
对比例6 | 40min | 0.28Abs |
以加尾反应时间为横坐标,以吸光度为纵坐标,做折线图,如图10所示。 从图10中可以看出,检测到的吸光度随着加尾反应时间在10-30min区间内增 大而增大,当加尾反应时间超过30min后,吸光度趋于稳定。由此可知,加尾 反应时间最佳为30min。
实施例10
研究Mg2+-依赖的DNAzyme完整酶序列和HP的杂交时间对吸光度的影响, 其中,T1的浓度为0.2nM:
以实施例1为参照,设置6个对照组,每组设置三个平行,其余条件均相同, 采用NanoDrop 2000(美国,Thermo)仪器测量光谱的变化,实施例1与6个对照 组的Mg2+-依赖的DNAzyme完整酶序列和HP的杂交时间与吸光度如表5所示:
表5:各组的加尾反应时间与吸光度
以Mg2+-依赖的DNAzyme和HP的杂交时间为横坐标,以吸光度为纵坐标, 做折线图,如图11所示。从图11中可以看出,检测到的吸光度随着Mg2+-依赖 的DNAzyme完整酶序列和HP的杂交时间在20-100min区间内增大而增大,当 Mg2+-依赖的DNAzyme完整酶序列和HP的杂交时间超过100min后,吸光度趋 于稳定。由此可知,Mg2+-依赖的DNAzyme完整酶序列和HP的杂交时间最佳为 100min。
上述实施例的说明只是用于理解本发明的方法及其核心思想。应当指出,对 于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明 进行若干改进和修饰,这些改进和修饰也将落入本发明权利要求的保护范围内。
序列表
<110> 临沂大学
<120> 一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法
<130> 无
<141> 2018-09-05
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 14
<212> DNA
<213> A
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(14)
<223> T1的基因序列
<400> 1
aacccgaacg tttg 14
<210> 2
<211> 35
<212> DNA
<213> A
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(35)
<223> P1的基因序列
<400> 2
acacacagcg atcacccatg ttaaacgttc gggtt 35
<210> 3
<211> 44
<212> DNA
<213> A
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(44)
<223> HP的基因序列
<400> 3
ttttgggttg ggcgggatgg gtttatragg tgtgtatccc gccc 44
<210> 4
<211> 14
<212> DNA
<213> A
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(14)
<223> 单碱基错配T1的基因序列
<400> 4
aacccgaacg ttag 14
<210> 5
<211> 14
<212> DNA
<213> A
<220>
<221> misc_feature
<222> (1)..(14)
<223> 双碱基错配T1的基因序列
<400> 5
aacccgaacg taag 14
Claims (10)
1.一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将T1和P1混合在NEB CutSmart缓冲溶液中,在37℃下杂交;
(2)加入内切酶AcⅡ,利用AcⅡ识别5′-AACGTT-3′位点,在37℃下持续反应一定时间,获得酶切产物,37℃下解链为4个ssDNA片段;
(3)取一定量的所述酶切产物,加入TdT和dCTP于磷酸盐缓冲溶液中混合,在37℃下进行加尾反应,升温至85℃灭活3min,获得Mg2+-依赖的DNAzyme的完整酶序列;
(4)加入HP和含Mg2+缓冲液,在37℃下孵育100min,Mg2+-依赖的DNAzyme的完整酶序列与HP进行杂交,在Mg2+存在下,Mg2+-依赖的DNAzyme剪切HP的识别位点,将HP剪切为两部分;
(5)加入一定浓度的Hemin和含K+缓冲液,在37℃下孵育30min,形成Hemin/G-四连体结构溶液;
(6)最后依次在Hemin/G-四连体结构溶液中加入一定浓度的ABTS2-和H2O2溶液,室温下反应一段时间,得到绿色溶液。
2.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,所述T1的基因序列如SEQ ID No.1所示,P1的基因序列如SEQ ID No.2所示,HP的基因序列如SEQ ID No.3所示,SEQ ID No.1:AACCCGAACGTTTG,SEQ ID No.2:ACACACAGCGATCACCCATGTTAAACGTTCGGGTT,SEQ ID No.3:TTTTGGGTTGGGCGGGATGGGTTTATrAGGTGTGTATCCCGCCC。
3.根据权利要求2所述的一种基于TdT和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,HP包括三个区域,具体为:
1)第1-25位,Mg2+-依赖DNAzyme部分酶序列;
2)第24-29位,AcⅡ酶识别序列;
3)第23-35位,与CGMMV cDNA的互补序列。
4.根据权利要求2所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,P1包括三个区域,具体为:
1)第1-26位,G-四连体结构序列;
2)第19-34位,环序列,Mg2+-依赖DNAzyme底物序列;
3)第10-18位和第35-43位,茎序列。
5.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(1)中所述P1浓度为1.0μM。
6.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(4)中所述HP浓度为1.0μM。
7.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述AcⅡ的酶切反应时间为50min。
8.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述AcⅡ酶切的时间为50分钟。
9.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(3)中所述加尾反应时间为30min。
10.根据权利要求1所述的一种基于脱氧核苷酸末端转移酶(TdT)和DNAzyme扩增的黄瓜绿斑驳病毒可视化检测方法,其特征在于,步骤(4)中所述Mg2+-依赖的DNAzyme和HP的杂交时间为100min。
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