CN108137593A - 新型蛋白激酶抑制剂的制备和用途 - Google Patents
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Abstract
本发明提供新型化合物以及使用这类化合物治疗或预防癌症的方法。
Description
背景技术
蛋白激酶代表一大类蛋白,这些蛋白在调控多种细胞过程和保持控制细胞功能中起着核心作用。激酶与多种癌症相关,因此是一类引人注目的治疗靶点。但是,可形成对于激酶导向的治疗的抗性。
发明内容
此外,本发明提供特定的化合物(及其组合物)并且证明了它们的有效性,如作为一种或多种蛋白激酶的抑制剂。在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物可以应用在药物中。在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物用于治疗(例如治疗性的和/或预防性的治疗)一种或多种激酶相关的疾病、紊乱或病况(如与一种或多种激酶的水平和/或活性相关的疾病、紊乱或病况,特别地包括与一种或多种失调的蛋白激酶通路相关的疾病、紊乱或病况,或者与不存在疾病、紊乱或者病况所观察到的结果相比与一种或多种激酶升高的水平和/或活性相关的疾病、紊乱或病况)。
在一些特定的实施方式中,所提供的化合物和/或组合物可以应用于治疗癌症。在一些实施方式中,所述癌症可以是或者包括慢性髓细胞性白血病(CML)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、肺癌、黑色素瘤、结直肠癌等。
在一些实施方式中,根据本发明的目标激酶包括一种或多种酪氨酸激酶,如受体酪氨酸激酶。在一些实施方式中,目标激酶包括ABL(例如BCR/ABL)、EGFR、EPHA、EPHB、FLT3、KIT、RET、TXK、BRAF和RAS中的一者或多者。在一些特定的实施方式中,激酶为RAS或者包括RAS。
在一些实施方式中,对于特定的激酶,与所提供的化合物或组合物不存在时相比,当所提供的化合物或组合物存在时,如果激酶活性改变(例如减少)至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍或更多时,则所提供的化合物和/或组合物被认为具有活性。可替选地或额外地,在一些实施方式中,对于特定的激酶,与所提供的化合物或组合物不存在时相比,当所提供的化合物或组合物存在时,如果激酶活性减少至少50%、60%、70%、80%、90%、95%或99%,则所提供的化合物和/或组合物被认为具有活性。在一些实施方式中,对于特定的激酶,当所提供的化合物或组合物存在时而不是所提供的化合物或组合物不存在时,如果激酶活性减少低于已知的阈值水平和/或减少至当合适的阳性对照化合物或组合物存在时观察到的水平相当的程度,则所提供的化合物和/或组合物被认为具有活性。
在一些实施方式中,如果所提供的化合物和/或组合物对于特定的激酶显示出低于约2μM、1μM、0.1μM、0.01μM、0.001μM或更低的IC50(μM),则所提供的化合物和/或组合物被认为是该激酶的抑制剂。在一些特定的实施方式中,如果所提供的化合物和/或组合物对于特定的激酶显示出低于约2μM、0.2μM、0.02μM或更低的IC50(μM),则所提供的化合物和/或组合物被认为是该激酶的抑制剂。
在一些实施方式中,当与特定的激酶的参照抑制剂的IC50(μM)相比,如果所提供的化合物和/或组合物对于该激酶显示出至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍或更多减少的IC50(μM),则所提供的化合物和/或组合物被认为是该激酶的抑制剂。
在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物显示出对于一种特定的激酶或者激酶组特异的活性,这是因为所述化合物和/或组合物对于该相关的激酶或激酶组的水平和/或活性比对于至少一种不同的激酶或激酶组的水平和/或活性产生更为显著的影响。在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物显示出对于单个激酶特异的活性。在一些实施方式中,相对于在可比较条件下的一种或多种合适的参照激酶,如果所提供的化合物对于特定的目标激酶呈现出至少2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍、50倍大的效应时,则所提供的化合物被认为对于该特定的激酶或激酶组有特异性。例如,在一些特定的实施方式中,根据多种不同的激酶的活性来评价所提供的化合物和/或组合物的作用,各个激酶单独地(或者组合地)在合适的寄主细胞中表达,并且评价了所述化合物和/或组合物相对于一种或多种激酶的有差别的活性。
在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物特别地用于治疗已经对于一种或多种替选药剂形成抗性或处于对于一种或多种替选药剂形成抗性的风险中的一个对象或多个对象中的一种或多种疾病、紊乱或病况,所述药剂(例如一种或多种其他的激酶抑制剂)可被用于治疗所述一个或多个对象中的疾病、紊乱或病况或者已经用于治疗所述一个或多个对象中的疾病、紊乱或病况。
在一些实施方式中,所提供的化合物和/或组合物特别地用于与用于治疗相关的疾病、紊乱或病况的一种或多种其他疗法一起的组合疗法方案。
在一些实施方式中,本公开提供和/或利用其结构由以下通式I给出的一种或多种化合物:
其中,各个变量如下文限定和描述。
阅读本公开的本领域技术人员将理解到,式I的各种实施方式、化合物可以以特定的形式被利用,例如特定的盐的形式(例如药学上可接受的盐形式)、特定的前药的形式(例如其中一个或多个部分是离去基团或者一个或多个部分被离去基团修饰,该离去基团在生理条件下和/或尤其当化合物存在于特定的生理位置或位点时被去除或者预计被去除)、特定的酯的形式、特定的被保护的形式(例如其中一个或多个指定的部分包含保护基团或被保护基团修饰,该保护基团如现有技术中已知的保护基团)等。在一些实施方式中,式I的化合物中的一个或多个原子可以被不同的同分异构体或同位素(例如氘或氚取代氢等)取代。
在一些实施方式中,所提供的化合物可以以特定的晶型或以无定形的形式被提供和/或利用。在某些实施方式中,一种晶型可以是特定的多形体、水合物、溶剂合物等或其组合或包含特定的多形体、水合物、溶剂合物等或其组合。
在一些实施方式中,所提供的化合物可以以特定的同分异构体的形式、或同分异构体形式的特定组合被提供和/或利用。在一些实施方式中,所提供的化合物可以包括一个或多个立体中心,并且可以以特定的立体异构体的形式或其组合被提供和/或利用。在一些实施方式中,化合物可以以包括近似等量的两种或更多种不同的同分异构体或立体异构体的形式的形式被提供和/或利用。在一些实施方式中,化合物可以以富集一种或多种同分异构体或立体异构体的形式的形式被提供和/或利用。在一些实施方式中,化合物可以以外消旋(raceminc)的形式被利用。在一些实施方式中,在化合物可以包含多于一个的同分异构位点(例如多于一个立体中心)时,化合物可以以相对于一个同分异构位点的一种形式是富集的形式但是相对于另一同分异构位点处的任何特定形式可以是如此富集的或者可以不是如此富集的形式被利用。
在一些实施方式中,所提供的化合物可以以特定的互变异构体的形式被利用。
在一些实施方式中,所提供的化合物可以以与可检测的部分(例如荧光团、放射性同位素、酶、金属、和/或另一种直接标记或间接标记)相关联的形式被利用。在一些实施方式中,所提供的化合物可以以与一种载体部分相关联的形式被利用。在一些实施方式中,载体部分可以是或可以包含靶向部分(例如,该靶向部分与特定的目标靶标、例如在细胞、组织或器官中或者在细胞、组织或器官上的特定的目标靶标相互作用)。
在一些实施方式中,化合物可以相对于其他相关的形式(例如,相对于其他的盐形式、固体形式、同分异构体或立体异构体形式、互变异构体形式、可检测形式、载体相关的形式等)以大约55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的纯度被提供和/或利用。
附图说明
表1示出式I的代表性化合物。
表2示出化合物IA-9的KINOMEscan数据。
表3示出本发明的化合物对BaF3-BCR/ABL、BaF3-BCR/ABL-T315I、
BaF3-TEL-TIE1和BaF3-TEL-LYN的抗增殖活性。
表4示出本发明的化合物对BaF3-EML4-ALK、BaF3-TEL-INSR和BaF3-TEL-HCK的抗增殖活性。
表5示出本发明的化合物对BaF3-NRASD12、BaF3-KRASD12和Wt-BaF3的抗增殖活性。
图1示出化合物IA-9对人白血病细胞增殖的抑制。在KU812白血病细胞中化合物IA-9、伊马替尼和帕纳替尼的50%抑制浓度(IC50)的比较。
图2示出使用利用媒介物、伊马替尼和化合物IA-9处理的CML小鼠的Kaplan-Meier生存曲线的化合物IA-9的抗白血病活性。
图3示出化合物IA-9对带有NRAS和B-RAF突变的黑色素瘤细胞系的抑制效应。
图4示出化合物IA-9对带有EGFR和RAS突变的肺腺癌细胞系的抑制效应。
图5示出化合物IA-9对表达FLT3-ITD的Ba/F3细胞(ITD)和AML细胞(MV-4-11)的抑制效应。A图呈现出化合物IA-9在处理ITD细胞中的剂量响应曲线。存在IL-3的ITD细胞(ITD+)或者不存在IL-3的ITD细胞(ITD-)用10μM的化合物IA-9以及3倍稀释系列进行处理。B图示出化合物IA-9在处理MV-4-11细胞中的剂量响应曲线。
具体实施方式
定义
给药:本文使用的术语“给药”是指将组合物给药至对象或系统(例如细胞、器官、组织、有机体、或者其相关的部件或者其部件的集合)。本领域普通技术人员将理解到给药的途径可以根据例如组合物被施用的对象或系统、组合物的性质、给药的目的等而不同。例如,在某些实施方式中,给药至动物对象(例如人)可以为经支气管给药(包括支气管滴注)、经口腔给药、经肠道给药、经皮肤给药、动脉注射给药、皮内注射给药、胃内给药、髓内给药、肌肉注射给药、鼻内给药、腹腔内给药、鞘内给药、静脉给药、心室内给药、经粘膜给药、经鼻腔给药、口服给药、经直肠给药、皮下注射给药、经舌下给药、外用给药、经气管给药(包括气管滴注)、经皮给药、经阴道给药和/或经玻璃体给药。在一些实施方式中,给药可包含间歇给药。在一些实施方式中,给药可包含连续给药(例如灌注)持续至少选定的时段。
亲和力:如现有技术中已知的,“亲和力”是特定配体与其伴侣之间结合的紧密性的量度。亲和力可以通过不同方式测定。在一些实施方式中,亲和力可以通过定量分析测量。在一些这样的实施方式中,结合伴侣浓度可被固定为超过配体浓度以模拟生理条件。可替选地或额外地,在一些实施方式中,结合伴侣浓度和/或配体浓度可变化。在一些这样的实施方式中,亲和力可被比作在可比的条件(例如浓度)下的参照。
药剂:本文使用的术语“药剂”可以指化合物或者任何化学类别的实体(包括例如多肽、核酸、碳水化合物、脂类、小分子、金属和/或其组合)。在一些实施方式中,药剂是天然产物或包含天然产物,因为它在自然界中发现和/或从自然界中获得。在一些实施方式中,药剂是一种或多种人造实体或包含一种或多种人造实体,因为它经人的手的作用而被设计、创制和/或制造和/或不是在自然界中发现。在一些实施方式中,药剂可以以分离的形式或者纯化的形式被利用;在一些实施方式中,药剂可以以未加工的形式被利用。在一些实施方式中,潜在的药剂被提供为收集或库,例如收集或库可被筛选以识别或表征它们当中的活性药剂。在一些特定的实施方式中,药剂是或包含小分子、抗体、抗体片段、适体、siRNA、shRNA、DNA/RNA杂合体、反义寡聚核苷酸、核糖酶、肽、模拟肽、肽核酸(“PNA”)等。在一些实施方式中,药剂是激活剂或抑制剂。在一些实施方式中,药剂的IC50和/或结合常数低于约50μM、低于约1μM、低于约500nM、低于约100nM、低于约20nM、低于约10nM、低于约9nM、低于约9nM、低于约7nM、低于约6nM、低于约5nM、低于约4nM、低于约3nM、低于约2nM或低于约1nM。
在一些实施方式中,药剂是聚合物或包含聚合物。在一些实施方式中,药剂不是聚合物,和/或基本上不具有任何聚合物。在一些实施方式中,药剂包含至少一种聚合的部分。在一些实施方式中,药剂缺少任何聚合的部分或基本上不具有任何聚合的部分。在一些实施方式中,药剂以盐的形式被提供和/或利用。
抗增殖药剂:本文使用的术语“抗增殖药剂”指当给药至或施加至分裂细胞源(例如细胞培养物、组织样品、有机体等)时,与在缺乏抗增殖药剂的其他可比较的条件下观察到的结果相比减少细胞增殖的程度(细胞加倍的数量)和/或频率(细胞分裂事件的速率)的物质。
近似:本文使用的应用于一个或多个目标值的术语“近似”或“大约”是指与表述的参考值相似的值。在某些实施方式中,术语“近似”或“大约”指在所表述的参考值的任何方向(大于或小于)上落在25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%或更小范围内的一系列值,除非另有说明或者从上下文是明显的(其中这种数会超过可能值的100%的除外)。
生物活性的:本文使用的术语“生物活性的”指通过目标药剂或实体实现的可观察到的生物效应或结果。例如,在一些实施方式中,特定的结合作用为生物活性。在一些实施方式中,调节(例如诱导、增强或抑制)生物学途径或生物学事件为生物活性。在一些实施方式中,生物活性的出现或者程度是通过检测目标生物学途径或目标生物学事件生成的直接或间接产物来评价。
结合:应理解本文使用的术语“结合”通常指两个或更多个的实体之间的非共价结合。“直接”结合包括实体或者部分之间的物理接触,“非直接”结合包括通过与一个或者多个中间实体的物理接触的物理作用。两个或更多个实体之间的结合可以通常在多种背景的任一背景下进行评估-包括相互作用的实体或部分被单独地研究或者在更为复杂的系统的背景下(例如,在共价地或者以其他方式结合载体实体和/或在生物学系统或细胞中)被研究。
联合治疗:本文使用的术语“联合治疗”指对象同时暴露于两种或更多种的治疗方案或用药程式(例如两种或更多种的治疗药剂)的那些情况。在一些实施方式中,两种或更多种的治疗方案或用药程式被同时给药或施用(例如,一种或多种单个剂量的两种或更多种药剂中的每一者,可基本上同时进行给药);在一些实施方式中,这类治疗方案或用药程式可被相继给药(例如,至少第一剂量的第一药剂先于至少第一剂量的第二药剂进行给药);在一些实施方式中,这类治疗方案或用药程式被给药使得单独的剂量或给药重叠。
可比较的:本文使用的术语“可比较的”用于描述彼此充分类似以允许所获得的结果或所观察到的现象进行比较的两组或更多组的条件、情况、个体或者群体。在一些实施方式中,可比较的多组的条件、情况、个体或者群体的特征在于多个基本上一致的特征和一个或者少量不同的特征。本领域普通技术人员将理解到当多个组的情况、个体或群体的特征在于足够数量和类型的基本上一致的特征以保证如下合理的结论时,则该多个组的情况、个体或群体是彼此可比较的:在不同组的情况、个体或群体下或者利用不同组的情况、个体或群体所获得的结果或所观察到的现象是由那些变化的特征中的改变所引起或者由那些变化的特征中的改变来指示。本领域技术人员将理解到本文使用的相对性的语言(例如增强的、激活的、减少的、抑制的等)通常指在可比较的条件下进行的比较。
确定:本文描述的某些方法学包括“确定”的步骤。本领域普通技术人员在阅读本说明书时将理解到此类“确定”可利用本领域技术人员能够获得的任何类型的技术或者通过使用本领域技术人员能够获得的任何类型的技术来完成,例如包括本文明确地提及的特定技术。在一些实施方式中,确定涉及操控物理样品。在一些实施方式中,确定涉及考虑和/或操控数据或信息,例如利用计算机或者其他适于执行相关分析的处理单元。在一些实施方式中,确定涉及从一来源接收相关信息和/或材料。在一些实施方式中,确定涉及将一个样品或者实体的一个或多个特征与可比较的参照物进行比较。
剂量形式和“单位剂量形式”:如本文使用的术语“剂量形式”指用于待治疗的对象(例如,人类患者)的治疗药剂的物理上离散的单位。在一些实施方式中,每一个单位包含经计算或者证明以当根据合适的给药方案给药至相关群体时产生期望的治疗效果的预定量的活性物质。例如,在一些实施方式中,这种数量是根据已经被确定当给药至相关群体时与期望的或有益的效果有关的给药方案(即,根据治疗性的给药方案)而适合于给药的单位剂量(或者其整个部分)。然而,应理解到给药至任何特定患者的全部剂量(例如,每日总剂量)将通常根据药学专业人士(例如医师)在合理的医学判断的范围内进行选择,并且可包括多于一个这种离散的单位,和/或可利用离散单位的一部分。
给药方案(或者“治疗方案”):如本文使用的给药方案是通常以时间段隔开的、单独地给药至对象的一组单位剂量(通常大于1)。在一些实施方式中,给定的治疗药剂具有推荐的给药方案,其可包括一个或多个剂量。在一些实施方式中,给药方案包含多个剂量,其中每个剂量彼此隔开相同长度的时间段;在一些实施方式中,给药方案包括多个剂量以及隔开单个剂量的至少两个不同的时间段。在一些实施方式中,治疗药剂在预定的时期内被连续给药(例如,通过输液)。在一些实施方式中,治疗药剂一天给药一次(QD)或一天给药两次(BID)。在一些实施方式中,给药方案包含多个剂量,其中每个剂量彼此隔开相同长度的时间段;在一些实施方式中,给药方案包括多个剂量以及隔开单个剂量的至少两个不同的时间段。在一些实施方式中,在一个给药方案中的全部剂量具有相同的单位剂量用量。在一些实施方式中,在一个给药方案中的的不同剂量具有不同的用量。在一些实施方式中,给药方案包含以第一剂量用量的第一剂量,随后是以与第一剂量用量不同的第二剂量用量的一个或多个另外的剂量。在一些实施方式中,给药方案包含以第一剂量用量的第一剂量,随后是以与第一剂量用量相同的第二剂量用量的一个或多个另外的剂量。在一些实施方式中,给药方案与当在相关群体给药时期望的或有益的效果有关(即,是治疗性的给药方案)。
改善、增加、减少等:本文使用的术语如“改善”、“增加”、“减少”等(其一定暗示比较)指与适当的可比较的参照或标准相比较。例如,在一些实施方式中,在目标条件组或目标环境组下(例如在实施治疗之后)的目标药剂或标志物的水平和/或活性与其在可比较的条件组下(例如在对合适的参照对象实施治疗之前或在实施治疗之后)的水平和/或活性剂相比可减少。在一些实施方式中,适当的参照可为历史参照。在一些实施方式中,适当的参照为平均值,例如可以是在相关群体内或者整个相关群体观察到的平均值。
可测量的:本文使用的术语“可测量的”在相关分析的条件下(例如体外和/或体内)都可检测到的特征。在一些实施方式中,对于被认为“可测量的”,目标参数也是可区别的,例如与相关参照参数相区别。本领域普通技术人员将意识到实际上在特定的样品、分析等内并非每一个理论上目标参数都是“可测量的”。
受体酪氨酸激酶:本文使用的术语“受体酪氨酸激酶”指受体酪氨酸激酶(RTK)的蛋白质家族的成员,包括但不限于亚家族,如表皮生长因子受体(EGFR)(包括ErbB1/EGFR、ErbB2/HER2、ErbB3/HER3和ErbB4/HER4)、纤维母细胞生长因子受体(FGFR)(包括FGF1、FGF2、FGF3、FGF4、FGF5、FGF6、FGF7、FGF18和FGF21)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)(包括VEGF-A、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D和PIGF)、FMS-相关酪氨酸激酶(例如FLT3)、RET受体和Eph受体家族(包括EphA1、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphA9、EphA10、EphB1、EphB2、EphB3、EphB4和EphB6)。
参照:本文使用的术语“参照”描述一种标准、对照、或者其他适当的如本文描述进行比较的参照。例如,在一些实施方式中,参考可以是标准的或对照的药剂、动物、个体、群体、样本、序列、一系列步骤、条件集合,或者值,目标的药剂、动物、个体、群体、样本、序列、一系列步骤、条件集合或者值与其进行比较。在一些实施方式中,参照与目标的测试或者测定基本上同时进行测试和/或测定。在一些实施方式中,参照是历史参照,任选地体现在有形介质中。典型地,本领域技术人员将理解,参照在与目标评估中利用的条件可比较的条件进行确定或者表征。
不应的:本文使用的术语“不应的”指如执业医疗人员通常观察到的在给药所提供的组合物之后并没有回应预料的临床效果的任何对象或者病况。
响应:如本文使用的对治疗的响应可以指作为治疗结果发生的或者与治疗相关的对象的病况的任何有益的转变。这种转变可包括病况的稳定(例如阻止在缺少治疗的情况下会发生的恶化),病况的症状的减轻、和/或病况治疗前景的改善等。它可以指对象的响应或者肿瘤的响应。肿瘤或对象的响应可以通过各种各样的标准进行测量,包括临床标准和客观标准。用于评估响应的技术包括但不限于临床检查、正电子放射断层造影术、胸部X-射线CT扫描、MRI、超声波、内窥镜检查、腹腔镜检查、从对象获取的样品中的肿瘤标志物的出现或水平、细胞学检查和/或组织学检查。许多这些技术尝试测量肿瘤大小或测定肿瘤的总负担。评估治疗响应的方法和指导规则在Therasse等人的“New guidelines to evaluatethe response to treatment in solid tumors”,欧洲癌症研究和治疗组织(EuropeanOrganization for Research and Treatment of Cancer)、美国国家癌症研究所(National Cancer Institute of the United States)、加拿大国家癌症研究所(National Cancer Institute of Canada)、J.Natl.Cancer Inst.,2000,92(3):205-216等处详细描述。只要当比较肿瘤组和/或患者组时,基于用于测定响应速率的相同的或者可比较的标准来评估待比较的组,则精确的响应标准可以根据任何适当的方式选取。本领域技术人员将能够选取适当的标准。
样品:如本文使用的术语“样品”通常指从如本文描述的目标源上获得或源自目标源的生物样品。在一些实施方式中,生物样品是细胞培养物或其提取物。在一些实施方式中,目标源包含有机体,例如动物或人类。在一些实施方式中,生物样品是或包含生物组织或生物流体。在一些实施方式中,生物样品可以是或包含骨髓;血液;血细胞;腹水;组织或细针穿刺活检样品;包含细胞的体液;自由漂浮的核酸;痰;唾液;尿液;脑脊液;腹膜液;胸膜液;粪便;淋巴液;妇科相关的体液;皮肤拭样;阴道拭样;口腔拭样;鼻腔拭样;洗液或灌洗液,诸如乳管灌洗液或支气管肺泡灌洗液;抽出物;刮片;骨髓标本;组织活检样本;外科手术样本;粪便、其他体液、分泌物和/或排泄物;和/或来自它们的细胞等。在一些实施方式中,生物样品是或包含从个体获取的细胞。在一些实施方式中,所获取的细胞是或包括来自获取样品的个体的细胞。在一些实施方式中,样品是以任何合适的方式直接从目标源获取的“初级样品”。例如,在一些实施方式中,初级生物样品通过选自由活体取样(细针穿刺或组织活检)、手术、收集体液(例如血液、淋巴液、粪便等)等构成的群组的方法获取。在一些实施方式中,如根据上下文明显地,术语“样品”指通过处理(例如通过去除一种或多种成分和/或通过添加一种或多种试剂等)初级样品获取的制品。例如,利用半透过膜进行过滤。这种“处理过的样品”可包含例如从样品中提取的核酸或蛋白质或者通过将初级样品进行诸如mRNA扩增或逆转录、某些成分的分离和/或纯化等技术获得的核酸或蛋白质。
特异的:当在本文结合具有活性的药剂使用时,术语“特异的”被本领域技术人员理解为意指在潜在的靶标实体或状态之间区别的药剂。例如,在一些实施方式中,如果存在一个或多个竞争性替选靶标的情况下,药剂优选地与该靶标结合,则该药剂被称为“特异地”结合至其靶标。在许多实施方式中,特异性相互作用取决于靶标实体的特定结构特征(例如抗原表位、裂缝、结合位点)的存在。应理解的是特异性并不绝对。在一些实施方式中,特异性可以是对于一个或多个其他的潜在的靶标实体(例如竞争者)相对于结合试剂的特异性而评价。在一些实施方式中,特异性是相对于参照物特异的结合药剂的特异性进行评价。在一些实施方式中,特异性是相对于参照物非特异的结合药剂的特异性进行评价。在一些实施方式中,在与其靶标实体结合的条件下,药剂或实体并未可检测地结合至竞争性替选靶标。在一些实施方式中,相较于一个或多个竞争性替选靶标,结合药剂以更高的结合速率、更低的解脱速率、增加的亲和力、降低的解离和/或增加的稳定性结合至其靶标实体。
对象:如本文使用的对象是指任何哺乳动物,包括人类。在本发明的某些实施方式中,对象是成年人、青少年或婴幼儿。在一些实施方式中,术语“个体”或“患者”被使用且旨在可与“对象”互换。本发明还设想的是药用组合物的给药和/或子宫内治疗的方法的性能。
基本上:如本文使用的术语“基本上”指目标特征或目标性能的显示出完全或接近完全的范围或程度的质量状况。本领域普通技术人员将理解到生物现象和化学现象(如果有的话)很少进行完整和/或继续直到完整或者实现或者避免绝对的结果。因此,在本文使用的术语“基本上”用以体现潜在的很多生物现象和化学现象中固有的完整性的缺乏。
治疗方案:如本文使用的术语“治疗方案”指向相关群体的给药与期望的或有益的治疗结果相关或者预计与期望的或有益的治疗结果相关的给药方案。
治疗有效量:如本文使用的“治疗有效量”指对于施用量产生期望的效果的量。在一些实施方式中,该术语指当根据治疗的给药方案给药至患有或者易受疾病、紊乱和/或病况的群体时,足以治疗所述疾病、紊乱和/或病况的量。在一些实施方式中,“治疗有效量”是减少疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状的发病率和/或严重性、和/或延缓疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状的发作的量。本领域普通技术人员将理解到术语“治疗有效量”实际上并不要求在特定的个体上实现成功的治疗。相反,治疗有效量可以是当给药至需要这种治疗的患者时在大量的患者中提供特定的期望的药理学响应的量。在一些实施方式中,治疗有效量的参照可以是指在一个或多个特定的组织(例如,受疾病、紊乱或病况影响的组织)或体液(例如,血液、唾液、血清、汗液、泪液、尿液等)中测量的量的参照。本领域普通技术人员将意识到,在一些实施方式中,治疗有效量的特定药剂或疗法可以以单次剂量进行配制和/或给药。在一些实施方式中,治疗有效量的药剂可以以多次剂量进行配制和/或给药,例如作为给药方案的一部分。
治疗:如本文使用的术语“治疗”(“也为“treat”或“treating”)在广义上指部分地或者完全地减轻、改善、缓解、抑制特定的疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状、特征和/或病因;延迟特定的疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状、特征和/或病因的发作;减少特定的疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状、特征和/或病因的严重性、和/或降低特定的疾病、紊乱和/或病况的一种或多种症状、特征和/或病因的发病率的物质(例如,所提供的组合物)的任何施用。在一些实施方式中,此类治疗可以实施给并未显示出相关的疾病、紊乱和/或病况的迹象的对象和/或仅仅显示出疾病、紊乱和/或病况的早期迹象的对象。可替选地或附加地,在一些实施方式中,治疗可以被实施给显示出相关疾病、紊乱和/或病况的的一种或多种已确立的迹象的对象。在一些实施方式中,治疗可以被实施给已经被诊断为患有相关疾病、紊乱和/或病况的对象。在一些实施方式中,治疗可被实施给已知具有一种或多种敏感性因子的对象,该一种或多种敏感性因子在统计上与增加的产生相关疾病、紊乱和/或病况的风险相关。
本发明所设想的取代基和变量的组合仅指那些导致形成稳定化合物的组合。如本文使用的术语“稳定的”指具有足以允许制造的稳定性并且使化合物的完整性维持足够的时段以用于本文详述的目的(例如,治疗性或者预防性的给药至对象)的化合物。
在本文变量的任何定义中一列化学基团的详述包括作为任何单个基团或者所列举的基团的变量的定义。对于本文变量的的实施方式的详述包括作为任何单个实施方式或者与任何其他实施方式或其部分组合的实施方式。
某些实施方式的详细描述
1.式I化合物的某些实施方式的一般描述
在某些实施方式中,如本文描述的和/或利用的式I的化合物具有以下结构:
其中:
R’为H或C1-6脂族基;
L为共价键、-S-、-S(O)-、-S(O)2-或–C(O)-;
R1选自:氢、-OR、-SR、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
各个R为独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;
R2和R3各自独立地选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
R4和R5各自独立地任选自H或C1-3脂族基,或者R4和R5通过它们的中间原子结合在一起形成3-6元饱和碳环;和
R6和R7各自独立地为氢或任选取代的C1-6脂族基。
2.化学术语的定义
本发明的化合物包括上述普遍提到的化合物,还包括本文按类、亚类和种类所示出的化合物。如本文所使用的,除非另有说明,否则下列定义应适于化学术语(如:如在描述式I化合物中所利用的)。出于本公开的目的,化学元素被认为与元素周期表(CAS版本,Handbook of Chemistry and Physics,第75版)一致。另外,有机化学的一般原理在在“Organic Chemistry”(Thomas Sorrell,University Science Books,Sausalito:1999)和“March’s Advanced Organic Chemistry”(第5版,Ed.:Smith,M.B.and March,J.,JohnWiley&Sons,New York:2001)中进行描述,其全部内容通过引用并入本文。
如本文使用的术语“脂族的”或“脂族基”指直链的(即,未分枝的)或者支链的、取代的或未取代的烃链,其是完全饱和的或包含一个或多个不饱和单元;或者单环烃或双环烃,其是完全饱和的或者包含一个或多个不饱和单元,但不是芳香族的(本文也称作“碳环”、“碳环的”、“脂环族的”或“环烷基”),其具有附接至分子的剩余部分的单个点。除非另有说明,否则脂族基包含1-6个脂肪族碳原子。在一些实施方式中,脂族基包含1-5个脂肪族碳原子。在其他实施方式中,脂族基包含1-4个脂肪族碳原子。在另一些实施方式中,脂族基包含1-3个脂肪族碳原子,且在又一些实施方式中,脂族基包含1-2个脂肪族碳原子。在一些实施方式中,“碳环的”(或者“脂环族的”或者“碳环”或“环烷基”)是指完全饱和的或者包含一个或多个不饱和单元的单环C3-C8烃,但其不是芳香族的,且具有附接至分子的剩余部分的单个点。合适的脂族基包括但不限于直链的或有支链的、取代的或未取代的烷基、烯基、炔基及其杂合物,例如(环烷基)烷基、(环烯基)烷基或(环烷基)烯基。
术语“杂原子”指氧、硫、氮、磷或硅中的一者或多者(包括氮、硫、磷或硅的任何氧化形式;任何碱性氮的的季氨化形式;或杂环的可取代的氮,例如N(如在3,4-二氢-2H-吡咯基中的N)、NH(如在吡咯烷基中的NH)或NR+(如在N-取代的吡咯烷基中的NR+))。
如本文使用的术语“不饱和的”指具有包含一个或多个不饱和单元的部分。
术语“卤素”是指F、Cl、Br或I。
单独地使用或者作为较大基团如“芳烷基”、“芳氧基”或“芳氧基烷基”中的一部分的术语“芳基”是指具有总计5至14个环成员的单环或双环体系,其中,在该体系种的至少一个环是芳香族的并且其中该体系的各个环包含3至7个环成员。术语“芳基”可以与“芳环”互换使用。在本发明的某些实施方式中,“芳基”指芳族环体系且示例性的基团包括苯基、联苯基、萘基、蒽基等,其可携带一个或多个取代基。如本文所使用的,在术语“芳基”的范围内还包括这样的基团:其中芳族环被稠合到一个或多个非芳族的环,如二氢茚基、邻苯二甲酰亚胺基、萘二甲酰亚胺基(naphthimidyl)、菲啶基、或者四氢萘基等。
单独使用地或者作为较大基团如“杂芳烷基”或“杂芳氧基”的一部分使用的术语“杂芳基”和“杂芳-(heteroar-)”指这样的基团:具有5-10个环原子,优选地具有5、6或9个环原子的基团;具有环阵列中共享的6、10或14个π电子的基团;和除去碳原子外具有1至5个杂原子的基团。术语“杂原子”指氮、氧或硫,并且包括氮或硫的任何氧化形式以及碱性氮的任何季氨化形式。示例性的杂芳基包括噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、三唑基、四唑基、恶唑基、异恶唑基、恶二唑基、噻唑基、异噻唑基、噻二唑基、吡啶基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基、吲哚嗪基(indolizinyl)、嘌呤基、萘啶基和蝶啶基。如本文使用的术语“杂芳基”和“杂芳-”也包括这样的基团:在该基团中芳杂环稠合到一个或多个芳环、脂环族环或者杂环上,其中附接基团或者附接点位于芳杂环上。示例性基团包括吲哚基、异吲哚基、苯并噻吩基、苯并呋喃基、二苯并呋喃基、吲唑基、苯并咪唑基、苯并噻唑基、喹啉基、异喹啉基、噌啉基、酞嗪基、喹唑啉基、喹喔啉基、4H–喹唑啉基、咔唑基、吖啶基、吩嗪基、吩噻嗪基、吩恶唑基、四氢喹啉基、四氢异喹啉基和吡啶并[2,3–b]–1,4–恶嗪–3(4H)–酮。杂芳基可以是单环或双环的。术语“杂芳基”可以与术语“杂芳环”、“杂芳基基团”或“芳杂环”互换使用,任意以上术语包括任选被取代的环。术语“杂芳烷基”指被杂芳基取代的烷基,其中烷基部分和杂芳基部分独立地被任选地取代。
如本文使用的术语“杂环(heterocycle)”、“杂环基(heterocyclyl)”、“杂环基(heterocyclic radical)”以及“杂环(heterocyclic ring)”可以互换使用并且指稳定的5-7元单环或7-10元双环杂环部分,其是饱和的或部分不饱和的,并且除了碳原子外还具有一个或多个、优选地1至4个如上限定的杂原子。当结合杂环的环原子使用时,术语“氮”包括取代的氮。例如,在具有选自氧、硫或氮的0-3个杂原子的饱和或部分不饱和环中,氮可以是N(如在3,4-二氢-2H-吡咯基中的N)、NH(如在吡咯烷基中的NH)或NR+(如在N-取代的吡咯烷基中的NR+)。
杂环可以在任意杂原子或碳原子处附接至其侧基,这导致稳定的结构,并且任意环原子可任选地被取代。这种饱和或部分不饱和的杂环基的示例包括四氢呋喃基、四氢噻吩基、吡咯烷基、哌啶基、吡咯啉基、四氢喹啉基、四氢异喹啉基、十氢喹啉基、恶唑烷基、哌嗪基、二恶烷基、二恶茂烷基、二氮卓基、氧氮卓基、硫氮卓基、吗啉基和奎宁环基。术语“杂环(heterocycle)”、“杂环基(heterocyclyl)”、“杂环(heterocyclyl ring)”、“杂环基团(heterocyclic group)”、“杂环部分(heterocyclic moiety)”以及“杂环基(heterocyclicradical)”可以互换使用,并且也包括这样的基团:在该基团中杂环稠合到一个或多个芳环、杂芳环或者脂环族环上,例如二氢吲哚基、3H-吲哚基、苯并二氢吡喃基、菲啶基或者四氢喹啉基,其中附接基团或者附接点位于杂环上。杂环基团可以是单环或双环的。术语“杂环烷基”指的是被杂环基取代的烷基,其中烷基部分和杂环基部分独立地被任选地取代。
如本文使用的术语“部分不饱和的”指包括至少一个双键或三键的环部分。术语“部分不饱和的”旨在涵盖具有多个不饱和位点的环,但不旨在包括如本文定义的芳基部分或杂芳基部分。
如本文描述的,本发明的化合物可以包含“任选被取代的”的部分。通常,术语“被取代的”,不论其前是否有术语“任选”,指指定的部分中的一个或多个氢被合适的取代基所取代。除非另有说明,否则“任选被取代的”的基团可在该基团的各个可取代的位置处具有合适的取代基,并且当在任何给定结构中多于一个的位置可被选自特定基团的多于一个的取代基取代时,该取代基在每一个位置处可以是相同或不同的。本发明所设想的取代基的组合优选地是那些导致形成稳定的或者化学上可行的化合物的组合。如本文使用的术语“稳定的”指当经受允许其产生、检测以及在某些实施方式中其回收、纯化、以及用于本文所公开的一个或多个目的的条件时基本上不改变的化合物。
在“任选被取代的”基团的可取代碳原子上的合适的一价取代基独立地为卤素;–(CH2)0–4R○;–(CH2)0–4OR○;-O(CH2)0-4R○,–O–(CH2)0–4C(O)OR○;–(CH2)0–4CH(OR○)2;–(CH2)0–4SR○;–(CH2)0–4Ph,其可以被R○取代;–(CH2)0–4O(CH2)0–1Ph,其可以被R○取代;–CH=CHPh,其可以被R○取代;–(CH2)0–4O(CH2)0–1-吡啶基,其可以被R○取代;–NO2;–CN;–N3;-(CH2)0–4N(R○)2;–(CH2)0–4N(R○)C(O)R○;–N(R○)C(S)R○;–(CH2)0–4N(R○)C(O)NR○ 2;-N(R○)C(S)NR○ 2;–(CH2)0–4N(R○)C(O)OR○;–N(R○)N(R○)C(O)R○;-N(R○)N(R○)C(O)NR○ 2;-N(R○)N(R○)C(O)OR○;–(CH2)0–4C(O)R○;–C(S)R○;–(CH2)0–4C(O)OR○;–(CH2)0–4C(O)SR○;-(CH2)0–4C(O)OSiR○ 3;–(CH2)0–4OC(O)R○;–OC(O)(CH2)0–4SR–,SC(S)SR○;–(CH2)0–4SC(O)R○;–(CH2)0–4C(O)NR○ 2;–C(S)NR○ 2;–C(S)SR○;–SC(S)SR○,-(CH2)0–4OC(O)NR○ 2;-C(O)N(OR○)R○;–C(O)C(O)R○;–C(O)CH2C(O)R○;–C(NOR○)R○;-(CH2)0–4SSR○;–(CH2)0–4S(O)2R○;–(CH2)0–4S(O)2OR○;–(CH2)0–4OS(O)2R○;–S(O)2NR○ 2;-(CH2)0–4S(O)R○;-N(R○)S(O)2NR○ 2;–N(R○)S(O)2R○;–N(OR○)R○;–C(NH)NR○ 2;–P(O)2R○;-P(O)R○ 2;-OP(O)R○ 2;–OP(O)(OR○)2;–SiR○ 3;–(C1–4直链或支链烯烃基)O–N(R○)2;或–(C1–4直链或支链烯烃基)C(O)O–N(R○)2,其中各个R○可以如下定义被取代且独立地是氢、C1-6脂族基、–CH2Ph、–O(CH2)0–1Ph、-CH2-(5-6元杂芳环)或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环;或者,尽管如上定义,但是通过它们的中间原子结合在一起的两个独立存在的R○形成具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的3-12元饱和、部分不饱和或芳基的单环或双环,其可以如下文定义被取代。
在R○(或者通过利用其中间原子将两个独立存在的R○结合在一起而形成的环)上的合适的一价取代基独立地为卤素、–(CH2)0–2R●、–(卤素R●)、–(CH2)0–2OH、–(CH2)0–2OR●、–(CH2)0–2CH(OR●)2;-O(卤素R●)、–CN、–N3、–(CH2)0–2C(O)R●、–(CH2)0–2C(O)OH、–(CH2)0–2C(O)OR●、–(CH2)0–2SR●、–(CH2)0–2SH、–(CH2)0–2NH2、–(CH2)0–2NHR●、–(CH2)0–2NR● 2、–NO2、–SiR● 3、–OSiR● 3、-C(O)SR●、–(C1–4直链或支链烯烃基)C(O)OR●或–SSR●,其中各个R●是未被取代的或者在前面具有“卤素”的情况下仅仅被一个或多个卤素取代,并且独立地选自C1-4脂族基、–CH2Ph、–O(CH2)0–1Ph、或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环。在R○的饱和碳原子上的合适的二价取代基包括=O和=S。
“任选被取代”的基团的饱和碳原子上的合适的二价取代基包括以下:=O(“氧代”)、=S、=NNR* 2、=NNHC(O)R*、=NNHC(O)OR*、=NNHS(O)2R*、=NR*、=NOR*、–O(C(R* 2))2– 3O–或–S(C(R* 2))2–3S–,其中各个独立存在的R*选自氢、如下文定义可被取代的C1-6脂族基、或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的未被取代的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环。结合至“任选被取代”的基团的邻近的可取代的碳的合适的二价取代基包括:–O(CR* 2)2–3O–,其中各个独立存在的R*选自氢、如下文定义可被取代的C1-6脂族基或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的未被取代的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环。
在R*的脂族基团上的合适取代基包括卤素、–R●、-(卤素R●)、-OH、–OR●、–O(卤素R●)、–CN、–C(O)OH、–C(O)OR●、–NH2、–NHR●、–NR● 2或–NO2,其中各个R●是未被取代的或者在前面具有“卤素”的情况下仅仅被一个或多个卤素取代,并且独立地为C1-4脂族基、–CH2Ph、–O(CH2)0–1Ph、或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环。
在“任选被取代”的基团的可取代氮上的合适取代基包括 或其中各个独立地为氢、如下文定义可被取代的C1-6脂族基、未被取代的–OPh、或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的未被取代的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环,或者,尽管如上定义,但是通过它们的中间原子结合在一起的两个独立存在的形成具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的为取代的3-12元饱和、部分不饱和或芳基的单环或双环。
在的脂族基团上的合适取代基独立地为卤素、–R●、-(卤素R●)、-OH、–OR●、–O(卤素R●)、–CN、–C(O)OH、–C(O)OR●、–NH2、–NHR●、–NR● 2或–NO2,其中各个R●是未被取代的或者在前面具有“卤素”的情况下仅仅被一个或多个卤素取代,并且独立地为C1-4脂族基、–CH2Ph、–O(CH2)0–1Ph、或者具有独立地选自氮、氧或硫的0-4个杂原子的5-6元饱和、部分不饱和或芳基的环。
如本文使用的术语“药学上可接受的盐”指在合理的医学判断的范围内适合用于与人组织以及较低等动物组织接触而没有过度的毒性、刺激、过敏反应等,并且与合理的收益/风险比例相称的盐。药学上可接受的盐在本领域中是熟知的。例如,S.M.Berge等人在J.Pharmaceutical Sciences(1977,66,1–19)中详细描述了药学上可接受的盐,其通过引用并入本文。本发明的化合物的药学上可接受的盐包括来源于合适的无机的和有机的酸和碱的盐。药学上可接受的、无毒性的酸加成盐为氨基基团与无机酸(例如盐酸、氢溴酸、磷酸、硫酸和高氯酸)或者与有机酸(例如乙酸、草酸、马来酸、酒石酸、柠檬酸、琥珀酸或丙二酸)形成的盐或者通过使用本领域中使用的其他方法(诸如离子交换)所形成的盐。其他药学上可接受的盐包括己二酸盐、褐藻酸盐、抗坏血酸盐、天冬氨酸盐、苯磺酸盐、苯甲酸盐、硫酸氢盐、硼酸盐、丁酸盐、樟脑酸盐、樟脑磺酸盐、柠檬酸盐、环戊烷丙酸盐、二葡糖酸盐、十二烷基硫酸盐、乙磺酸盐、甲酸盐、延胡索酸盐、葡庚酸盐、甘油磷酸盐、葡糖酸盐、半硫酸盐、庚酸盐、己酸盐、氢碘酸盐、2-羟基乙磺酸盐、乳糖醛酸盐、乳酸盐、月桂酸盐、月桂烷硫酸盐、苹果酸盐、马来酸盐、丙二酸盐、甲磺酸盐、2-萘磺酸盐、盐酸盐、硝酸盐、油酸盐、草酸盐、棕榈酸盐、双羟萘酸盐、果胶酸盐、过硫酸盐、3-苯丙酸盐、磷酸盐、特戊酸盐、丙酸盐、硬脂酸盐、琥珀酸盐、硫酸盐、酒石酸盐、硫氰酸盐、对甲苯磺酸盐、十一烷酸盐、戊酸盐等。
源自合适的碱的盐包括碱金属盐、碱土金属盐、铵盐和N+(C1–4烷基)4盐。代表性的碱金属盐或碱土金属盐包括钠盐、锂盐、钾盐、钙盐、镁盐等。其他的药学上可接受的盐包括(视情况)无毒的铵盐、季铵盐和使用抗衡离子(诸如卤化物、氢氧化物、羧酸盐、硫酸盐、磷酸盐、硝酸盐、低级烷基磺酸盐和芳基磺酸盐)形成的胺阳离子盐。
如本领域技术人员将理解到,本文描述的结构可以代表以一种或多种不同的同分异构的(如:对映异构的、非对映异构的、和/或几何学的(或构象的))形式存在的化合物。例如:在一些实施方式中,所描述的结构可以包括一个或多个非对称中心,其可以以R构型和S构型存在,和/或可以报考一个或多个双键,其可以以Z构象异构体或E构象异构体存在。可替选地或者附加地,本文描述的结构可以代表以一种或多种互变异构形式存在的化合物。
在一些实施方式中,如本文使用的化合物可以根据本发明以任意特定的形式(或其组合)被提供或利用,包括任何特定的同分异构形式或其组合、任何特定的互变异构形式或其组合等。
可替选地或附加地,在一些实施方式中,还如本文使用的,本公开提供和/或利用式I的化合物,其中,一个或多个原子可以以一种或多种可替选的同位素形式存在。例如,在一些实施方式中,如式I中描述的一个或多个氢原子可以表示氘或氚;如式I中描述的一个或多个碳原子可以表示13C-或14C-富集的碳。
在一些实施方式中,化合物或组合物、或其特定的形式根据本发明可以用作例如分析工具、生物分析中的探针、合成或其他制备的中间体、和/或根据本发明的治疗药剂。
3.某些示例性实施方式的描述
如本文所述,在一些实施方式中,本发明提供和/或利用式I的化合物或其药学上可接受的盐:
其中:
R’为H或C1-6脂族基;
L为共价键、-S-、-S(O)-、-S(O)2-或–C(O)-;
R1选自:氢、-OR、-SR、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;
R2和R3各自独立地选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
R4和R5各自独立地选自氢或C1-3脂族基,或者R4和R5通过它们的中间原子结合在一起形成3-6元饱和碳环;和
R6和R7各自独立地为氢或任选被取代的C1-6脂族基。
如上文定义,R’为氢或C1-6脂族基。在一些实施方式中,R’为氢。在其他实施方式中,R’为C1-6脂族基。
如上文定义,L为共价键、-S-、-S(O)-、-S(O)2-或–C(O)-。在某些实施方式中,L为共价键。在其他实施方式中,L为-S-、-S(O)-、-S(O)2-或–C(O)-。
如上文定义,R1选自:氢、-OR、-SR、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R1为氢。在其他实施方式中,R1选自:-OR、-SR、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在某些实施方式中,R1选自-OR、-SR、或-N(R)2。在一些实施方式中,R1为-OR。在一些实施方式中,R1为-SR。在一些实施方式中,R1为-N(R)2。
在一些实施方式中,R1为任选地被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R1为任选地被取代的脂族基。在一些实施方式中,R1为甲基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的甲基。在一些实施方式中,R1为乙基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的乙基。在一些实施方式中,R1为2-(二甲氨基)乙基。在一些实施方式中,R1为2-吗啉基乙基。在一些实施方式中,R1为2-(1H-咪唑-4-基)乙基。在一些实施方式中,R1为丙基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的丙基。在一些实施方式中,R1为1-羟基丙烷-2-基。
在一些实施方式中,R1为苯基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的苯基。在一些实施方式中,R1为2-甲氧基-4-(4-甲基哌嗪-1-羰基)苯基。
在一些实施方式中,R1为任选地被取代的3-8元饱和或部分不饱和的碳环。在一些实施方式中,R1为环丙基。
在一些实施方式中,R1为任选地被取代的具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环。在一些实施方式中,R1为哌啶基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的哌啶基。在一些实施方式中,R1为1-甲基哌啶-4-基。在一些实施方式中,R1为4-羟基哌啶-1-基。
在一些实施方式中,R1为任选地被取代的具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。在一些实施方式中,R1为吡唑基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的吡唑基。在一些实施方式中,R1为1-甲基-1H-吡唑-4-基。在一些实施方式中,R1为1,3-二甲基-1H-吡唑-5-基。在一些实施方式中,R1为吡啶基。在一些实施方式中,R1为任选地被取代的吡啶基。在一些实施方式中,R1为6-甲基吡啶-3-基。在一些实施方式中,R1为6-(二乙氨基)-吡啶-3-基。在一些实施方式中,R1为6-(4-甲基哌嗪-1-基)-吡啶-3-基。在一些实施方式中,R1为6-吗啉基吡啶-3-基。
如上定义,各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。
在一些实施方式中,R为氢。在一些实施方式中,R为任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。
在一些实施方式中,R为任选被取代的C1-6脂族基。在一些实施方式中,R为苯基。在一些实施方式中,R为3-8元饱和或部分不饱和的碳环。在一些实施方式中,R为具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环。在一些实施方式中,R为具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。
如上定义,各个R2选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和的或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R2为氢。在其他实施方式中,R2为任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和的或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R2为任选被取代的C1-6脂族基。在一些实施方式中,R2为甲基。在一些实施方式中,R2为任选被取代的甲基。在一些实施方式中,R2为乙基。在一些实施方式中,R2为任选被取代的乙基。
在一些实施方式中,R2为苯基。在一些实施方式中,R2为任选被取代的苯基。
在一些实施方式中,R2为任选被取代的3-8元饱和或部分不饱和的碳环。在一些实施方式中,R2为环丙基。在一些实施方式中,R2为任选被取代的环丙基。在一些实施方式中,R2为环戊基。在一些实施方式中,R2为任选被取代的环戊基。
如上定义,各个R3选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R3为氢。在其他实施方式中,R3为任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,R3为任选被取代的C1-6脂族基。
在一些实施方式中,R3为苯基。在一些实施方式中,R3为任选被取代的苯基。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。在一些实施方式中,R3为其中,表示附接点。
如上定义,R4和R5各自独立地选自氢或C1-3脂族基,或者R4和R5通过它们的中间原子结合在一起形成3-6元饱和碳环。
在一些实施方式中,R4为氢。在一些实施方式中,R4为C1-3脂族基。
在一些实施方式中,R5为氢。在一些实施方式中,R5为C1-3脂族基。
在一些实施方式中,R4和R5通过它们的中间原子结合在一起形成3-6元饱和碳环。
如上定义,R6和R7各自独立地为氢或任选被取代的C1-6脂族基。
在一些实施方式中,R6为氢。在其他实施方式中,R6为任选被取代的C1-6脂族基。
在一些实施方式中,R7为氢。在其他实施方式中,R7为任选被取代的C1-6脂族基。
在一些实施方式中,本发明提供了具有式IA、式IB、式IC或式ID中的任一者的化合物。
在一些实施方式中,本发明提供了式IA的化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
R1选自:氢、-OR、-SR、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;和
各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。
在一些实施方式中,本发明提供了式IB的化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
R2选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环。
在一些实施方式中,本发明提供了式IC的化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
n为0-4;
各个R8独立地选自:氢、-C(O)NR2、-N(R)C(O)R、或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;和
各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。
在一些实施方式中,本发明提供了式ID的化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
n为0-4;
R9选自:氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环(任选桥接的);具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;和
各个R10独立地选自氢、卤素、-N(R)2或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;和
各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环。在一些实施方式中,本发明提供了选自下表1中描述的化合物的式I化合物。
表1代表性的式I化合物
4.化合物和/或其组合物的用途
如本文所述,在一些实施方式中,式I化合物可以例如用在(例如,激酶相关的疾病、紊乱或病况的)各种分析、合成和/或治疗中的任一者中。
激酶相关的疾病、紊乱和病况
蛋白激酶是由多于500种的蛋白质构成的大的多基因家族。不希望束缚于任何特殊的理论,在肿瘤学、神经学和免疫学中激酶可以在许多人类疾病的形成从而治疗中发挥着显著的作用。激酶功能被严格地调节。在一些实施方式中,激酶可导致特别是由于突变、过表达、激活(如过度激活)、或活性抑制引起的增殖性紊乱和/或恶性肿瘤。
在一些实施方式中,癌症治疗干预的目的在于特别是抑制蛋白激酶表达或蛋白激酶活性。在一些实施方式中,癌症治疗干预特别地靶向能够调控激酶的表达或活性的蛋白质。在一些实施方式中,能够调控激酶的表达或活性的蛋白质可以特别是受体或者酶。
在一些实施方式中,利用蛋白激酶抑制剂治疗恶性肿瘤会引起突变。在一些实施方式中,突变会导致对于治疗的抗性。在一些实施方式中,突变可以出现于治疗剂所靶向的蛋白激酶中。在一些实施方式中,突变可以出现于所靶向的激酶的信号传导路径中的蛋白激酶中。尤其,本发明认识到对于额外的治疗方式的需要,该额外的治疗方式包括治疗那些已经对于治疗剂形成抗性的癌症的治疗剂。
受体酪氨酸激酶
受体酪氨酸激酶(RTK)是一类蛋白激酶。RTK是特别用于生长因子、细胞因子和激素的细胞表面受体。在一些实施方式中,RTK可以调控正常的细胞过程。在一些实施方式中,RTK可以在许多类型肿瘤的形成及进展中发挥作用。其中,RTK家族可以包括但不限于表皮生长因子受体(EGFR)、纤维母细胞生长因子受体(FGFR)、血管内皮生长因子受体(VEGFR)、干细胞生长因子受体(SCFR)、转染重排(RET)受体、FMS-相关酪氨酸激酶(例如FLT3)、肝配蛋白受体(Eph)和盘状结构域受体(DDR)。在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向RTK。
EGFR
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向表皮生长因子受体
(EGFR)。EGFR可以形成同源二聚体。在一些实施方式中,EGFR二聚化刺激其内在的蛋白质-酪氨酸激酶的活性。不希望束缚于任何特殊的理论,提出了在一些实施方式中,一种或多种式I化合物可以抑制EGFR二聚化。引起EGFR过表达或过度激活的突变与许多癌症相关。在一些实施方式中,一种或多种式I化合物可以抑制与这类突变相关的EGFR。在一些实施方式中,一种或多种式I化合物可以特异性抑制与这类突变相关的EGFR(例如,相对于在不存在这类突变的情况下所述一种或多种式I化合物对EGFR的作用)。
Eph
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向RTK的肝配蛋白(Eph)亚族的成员。在一些实施方式中,靶向EphA类激酶(例如EphA1、EphA2、EphA3、EphA4、EphA5、EphA6、EphA7、EphA8、EphA9、EphA10)和/或EphB类激酶(例如EphB1、EphB2、EphB3、EphB4、EphB5、EphB6)。当肝配蛋白配体结合至Eph家族受体的胞外球状结构域时,在Eph近膜区中的酪氨酸和丝氨酸残基被磷酸化,允许胞内的酪氨酸激酶转变成其激活形式且随后激活或抑制下游信号转导通路。在一些实施方式中,Eph家族激酶涉及细胞分裂、轴突导向、细胞迁移、血管生成和肢体发展。导致Eph过表达或过度激活的突变与多种癌症相关。
FLT3
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向FLT3激酶。FLT3是一种受体酪氨酸激酶;某些FLT3激活突变已经显示出与一种或多种激酶相关疾病、紊乱或病况(如,白血病)相关。例如,在30%的人急性髓性白血病(AML)中发现FLT3激活突变。本公开确立了某些式I化合物(如IA-9)有效抑制FLT3转化以及抑制带有FLT3突变的人AML细胞的生长。
c-Kit
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向Kit。在一些实施方式中,Kit也被称为c-Kit、肥大细胞/干细胞生长因子受体(SCFR或CD117)。在一些实施方式中,Kit与干细胞因子(SCF)、也称作“青灰因子”或“c-kit配体”结合。在一些实施方式中,当Kit与SCF结合时,它形成二聚体,该二聚体激发其内在的酪氨酸激酶活性、继而磷酸化和激活细胞中传播信号的信号转导分子。在一些实施方式中,通过Kit的信号传导在细胞生存、增殖和分化中起着作用。导致Kit过表达或过度激活的突变与多种癌症相关。
RET
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向RET。RET基因编码用于细胞外信号传导分子的胶质细胞源性神经营养因子(GDNF)家族成员的RTK。当GDNF配体结合至共受体时,两个分子或RET联合在一起激发在各个RET分子的酪氨酸激酶结构域内的酪氨酸残基的转移自磷酸化(trans-autophosphorylation)。导致RET过表达或过度激活的突变与多种癌症相关。
TXK
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向TXK。TXK是非受体酪氨酸激酶的TEC家族中的成员。在一些实施方式中,TXK在T细胞中表达,并且是淋巴细胞抗原受体下游信号传导路径的重要组成部分。尤其,TXK响应于T-细胞受体刺激而被磷酸化且可以通过Src家族激酶通过磷酸化被激活。导致TXK过表达或过度激活的突变与多种癌症相关。
BCR-ABL
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向BCR-ABL激酶。BCR-ABL是通过ABL1激酶基因的部分与断裂点簇区域(BCR)基因的部分融合生成的蛋白质。在一些实施方式中,这种融合产生了组成性激活ABL蛋白激酶。在一些实施方式中,利用旨在抑制BCR-ABL蛋白激酶活性的药剂治疗癌症可导致对于强调需要本公开所提供的化合物、组合物和/或方法的那些药剂产生抗性。
B-RAF
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向B-RAF蛋白激酶。B-RAF是生长信号转导蛋白激酶的RAF激酶家族中的成员。该蛋白质对调控MAP激酶/ERK信号传导路径起作用,这影响细胞分裂、分化和分泌。在一些实施方式中,B-RAF可以通过组成性激活的突变引起癌症。在一些实施方式中,利用旨在抑制B-RAF蛋白激酶活性的药剂治疗癌症可导致对于强调需要本公开所提供的化合物、组合物和/或方法的那些药剂产生抗性。
RAS
在一些实施方式中,本公开的化合物、组合物和/或方法靶向RAS。在一些实施方式中,可以调控激酶的活性的蛋白质包括Ras超家族的成员。Ras超家族可以包括但不限于RAS、Rho、Ran、Rab和Arf。这些家族成员具有共同的提供GTP酶和核苷酸交换活性的结构域。在一些实施方式中,Ras蛋白亚家族包括KRAS、NRAS和HRAS。在一些实施方式中,Ras亚家族对调控细胞增殖起作用。在一些实施方式中,Ras亚家族蛋白的突变可以导致组成性激活的蛋白质。在一些实施方式中,这种组成性激活可以导致癌症。RAS致癌突变,通常是KRAS和NRAS,在人类癌症中十分普遍。在一些实施方式中,由于RAS的酶激活用于关闭本身并且其GTP结合亲和力非常高,因此RAS蛋白难以靶向。鉴定用于阻断RAS致癌信号传导的可替选方式可用于建立对抗RAS驱动的癌症的疗法。
抗性的发展
已发现,利用蛋白激酶抑制剂疗法治疗激酶相关的疾病、紊乱或病况(例如,通过施用蛋白激酶抑制剂)可导致抗性。在一些实施方式中,该抗性源于激酶突变。尤其,本发明认识到对于额外的治疗方式的需要,该额外的治疗方式包括治疗那些已经对一种或多种治疗剂或者用药程式(modality)形成抗性的癌症的治疗剂。在一些实施方式中,本公开提供了通过将式I化合物或其组合物给药至对于一种或多种用于治疗疾病、紊乱或者病况的其他药剂或者用药程式已经形成抗性或者处于形成抗性的风险中的一个或多个对象来治疗一种或多种激酶相关的疾病、紊乱或病况(例如,癌症)的方法;在一些这样的实施方式中,这种抗性归因于改变激酶水平和/或活性的一种或多种突变和/或与改变激酶水平和/或活性的一种或多种突变相关(例如,被式I化合物抑制的激酶)。
5.组合物和给药
在一些实施方式中,根据本发明,一种或多种式I化合物可被提供和/或利用作为组合物、例如药学上可接受的组合物的一部分。在一些特定的实施方式中,包含式I化合物的组合物被配制成给药至有机体(例如,动物、哺乳动物,更具体地人)。在一些实施方式中,有机体患有或者疑似患有激酶相关的疾病、紊乱或病况,例如如本文所述的激酶相关的疾病、紊乱或病况。
在一些实施方式中,化合物和/或组合物可以根据本发明使用对于治疗例如如本文所述的激酶相关的疾病、紊乱或病况或者减轻例如如本文所述的激酶相关的疾病、紊乱或病况的严重性有效的任意量以及任意给药路径进行给药。本领域普通技术人员将意识到,根据合理的医学操作,所需的和/或所给药的确切量(例如,以任何特定的剂量)对于不同的对象和/或不同的疾病、紊乱或病况可以变化,例如考虑以下特征:诸如对象的种类、年龄、总体状况、先前病史(包括先前接收的疗法)等;正在给药的特定药剂的特性、正在利用的特定的给药模式、与药剂组合给药的任何治疗等。
在一些实施方式中,式I化合物可以被配制成单位剂型,例如以便于给药和/或统一剂量。如本文使用的表述“单位剂型”通常指用于给药至对象的物理上离散的单位。应理解到,每日总剂量可通过医师来设定,并且可包括大于1个这种离散的单位,和/或可利用离散的单位的一部分。在一些实施方式中,用于给药的组合物可以制成液体制剂(如:用于口服给药、肠胃外给药、雾化给药等)。液体剂型(如:用于口服给药)包括但不限于药学上可接受的乳液、微乳液、溶液、混悬液、糖浆和酏剂。除活性化合物外,液体剂型还可以包含本领域中常用的惰性稀释剂,例如水或其它溶剂,溶解剂和乳化剂、如乙醇、异丙醇、碳酸乙酯、乙酸乙酯、苄醇、苯甲酸苄酯、丙二醇、1,3-丁二醇、二甲基甲酰胺、油(特别是棉籽油、花生油、玉米油、胚芽油、橄榄油、蓖麻油和芝麻油)、甘油、四氢糠醇、聚乙二醇、失水山梨醇的脂肪酸酯及其混合物。除了惰性稀释剂,口服组合物还可以包括佐剂,如润湿剂、乳化剂和悬浮剂、甜味剂、调味剂和芳香剂等。
可注射制剂,例如无菌可注射的含水混悬剂或者含油混悬剂,可以根据现有技术使用合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂进行配制。无菌可注射的制剂可以是或者可以包含无菌可注射的溶液、混悬剂或乳剂,例如在无毒的、肠胃外可接受的稀释剂或溶剂,例如作为在1,3-丁二醇中的溶液。在可被采用的可接受的媒介和溶剂中,这种制剂包括但不限于水、格林式溶液、U.S.P.和等渗氯化钠溶液。另外,无菌固定油通常被用作溶剂或者助悬介质。出于该目的,任何无刺激性的固定油可被采用,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。此外,诸如油酸的脂肪酸被用于制备注射剂。
可注射配方可以是灭菌的,例如通过截留细菌的过滤器的过滤作用,或者通过包含无菌固体组合物形式的灭菌剂,其可以在使用之前溶解或分散在无菌水中或其他无菌可注射介质中。
在一些实施方式中,可以期望的是延长本发明的化合物的一个或多个效果。在一些实施方式中,可以期望的是例如减缓来自皮下或肌内注射的化合物的吸收。在一些实施方式中,这种减缓可以通过使用具有差的水溶性的晶体材料或者无定形材料的液态混悬剂来实现。因此化合物的吸收速率取决于其溶解速率,而溶解速率则由晶粒大小和晶形决定。可替选地,肠胃外给药的化合物形式的延迟吸收可以通过将化合物溶解或悬浮在油媒介中来实现。贮存型可注射形式通过在诸如聚乳酸-聚乙醇酸的可生物降解聚合物中形成化合物的微囊基质来制备。根据化合物与聚合物的比例以及所采用的特定聚合物的性质,化合物释放的速率可被控制。其它可生物降解的聚合物的示例包括聚(原酸酯)和聚(酸酐)。贮存型可注射制剂也通过将化合物束缚在与身体组织相容的脂质体或微乳液中来制备。
用于直肠或阴道给药的示例性组合物可以例如配制成栓剂。在一些实施方式中,通过将本发明的化合物与一种或多种合适的非刺激性赋形剂或载体(如可可油、聚乙二醇或栓剂蜡)混合来制备,该赋形剂或载体在环境温度下为固体而在身体温度下为液体,因此在直肠或阴道内融化且释放活性化合物。
用于口服给药的示例性固体剂型可以包括例如胶囊、片剂、丸剂、粉剂和颗粒剂。在这种固体剂型中,活性化合物可以与至少一种惰性的、药学上可接受的赋形剂或载体(如柠檬酸钠、磷酸氢钙)和/或a)填充剂或填料,如淀粉、乳糖、蔗糖、葡萄糖、甘露醇和硅酸;b)粘接剂,如羧甲基纤维素、海藻酸盐、明胶、聚乙烯吡咯烷酮、蔗糖和阿拉伯胶;c)保湿剂,如甘油;d)崩解剂,如琼脂、碳酸钙、土豆淀粉或木薯淀粉、海藻酸、某些硅酸盐和碳酸钠;e)溶液阻滞剂,如石蜡;f)加速吸收剂,如季铵盐化合物;g)润湿剂,如鲸蜡醇和单硬脂酸甘油酯;h)吸收剂,如高岭土和皂土;和i)润滑剂,如滑石、硬脂酸钙、硬脂酸镁、固体聚乙二醇、月桂基硫酸钠及其混合物组合。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,该剂型也可能以包含缓冲剂。
使用如乳糖(lactose)或乳糖(milk sugar)以及高分子量的聚乙二醇等的赋形剂,类似类型的固体组合物也可以作为填料用在软填充明胶胶囊以及硬填充明胶胶囊中。片剂、糖衣丸、胶囊、丸剂和颗粒剂的固体剂型可被制备有包衣和壳,诸如肠溶衣以及在药物配制领域中熟知的其他包衣。它们可以任选地包含乳浊剂;并且也可以具有这样的组成:它们仅仅在肠道的某一部分释放活性成分、或者在肠道的某一部分优先释放活性成分,任选地以延迟的方式释放活性成分。可被使用的包埋组合物的示例包括聚合物质和蜡。使用如乳糖(lactose)或乳糖(milk sugar)以及高分子量的聚乙二醇等的这类赋形剂,类似类型的固体组合物也可以作为填料用在软填充明胶胶囊以及硬填充明胶胶囊中。
在一些实施方式中,活性化合物可与上述一种或多种赋形剂一起被制成微囊化的形式。诸如片剂、糖衣丸、胶囊、丸剂和颗粒剂的固体剂型可以被制备有包衣和壳,诸如肠溶衣、释放控制包衣以及在药物配制领域中熟知的其他包衣。在这些固体剂型中,活性化合物可以与至少一种惰性稀释剂,如蔗糖、乳糖或淀粉混合。此类剂型还可以按照惯例包含除惰性稀释剂外的其他物质,例如压片润滑剂和其他压片辅助物,如硬脂酸镁和微晶纤维素。在胶囊、片剂和丸剂的情况下,该剂型还可以包含缓冲剂。它们可以任选地包含乳浊剂;并且也可以具有这样的组成:它们仅仅在肠道的某一部分释放活性成分、或者在肠道的某一部分优先释放活性成分,任选地以延迟的方式释放活性成分。可被使用的包埋组合物的示例包括聚合物质和蜡。
用于局部给药或者经皮给药的示例性剂型可以包括例如膏剂、糊剂、霜剂、洗液、凝胶、粉剂、溶液、喷雾剂、吸入剂或贴剂。在一些实施方式中,活性组分例如在无菌条件下与药学上可接受的载体以及任何需要的防腐剂或可需要的缓冲剂混合。
眼用制剂、滴耳剂和滴眼剂也被构思为在本发明的范围内。
可替选地或附加地,本发明构思经皮贴剂的用途,该经皮贴剂具有增添的向身体提供化合物的受控递送的优点。
经皮递送的制剂可例如通过将化合物溶解或分散在合适的介质中来制备。在一些实施方式中,一种或多种吸收增强剂可被用于增加化合物在皮肤上的通量。在一些实施方式中,经皮进展的速率可例如通过提供速率控制膜或者通过将化合物分散在合适的聚合物基质或凝胶中来控制。
阅读本公开的本领域普通技术人员将理解到根据本发明的一个实施方式所描述的方面和特征如做适当修改可以被应用于其他实施方式,除非有明确地说明说着根据上下文明显不适用的。
为了更充分地理解本文描述的本发明,提供了下面的实施例。应理解,这些实施例仅仅出于说明的目的且不被认为以任何方式限制本发明。
实施例
如在下面的实施例中所述,在某些示例性实施方式中,根据下面的一般程序制备化合物。将理解到,尽管一般方法描述了本发明的某些化合物的合成,但是下面的一般方法以及本领域普通技术人员已知的其他方法也可以适用于如本文描述的全部化合物以及这些化合物中的每一者的亚类和物种。
本发明的各个方面的全部特征如适当修改适用于所有其他的方面。
实施例1:式IA化合物的一般反应顺序
根据方案1合成式IA化合物。下文还描述了示例性方法。
方案1:式IA化合物的一般反应顺序
实施例2:化合物2的合成
乙基-4-(甲氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-羧酸酯。0℃下向500mL化合物1(40g,172mmol)的DCM搅拌溶液中缓慢加入70mL 23%甲胺的乙醇溶液。所得到的混合物在0℃搅拌45分钟。根据TLC监控在化合物1被完全消耗后,向混合物中加入300mL水。有机层被分离且用盐水洗涤(2×200mL)、无水硫酸镁干燥,过滤且蒸发得到36.86g的白色固体形式的所需产物。产率:94%。
实施例3:化合物3的合成
(4-(甲氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲醇。在0℃下,在N2下通过滴液漏斗将化合物2(36.86g,162.2mmol)的THF溶液(200mL)加入到LAH(7.38g,194.6mmol)的THF(干燥,800mL)悬浮液中。在室温下搅拌混合物2小时。TLC表明化合物2被完全消耗。向反应混合物中加入水(8mL)、15%NaOH溶液(24mL)和水(24mL)。轻轻倒出有机层且用EA洗涤固体(2×50mL)。所有有机层被合并且用盐水洗涤(100mL)、MgSO4干燥、过滤且在低压下蒸发。所得到的黄色固体(27g)经过EA/PE(1/1)重结晶得到18.5g的白色固体形式的所需产物。产率:62%。1H NMR,500MHz(CDCl3),7.68(s,1H),5.87(bs,1H),4.50(s,1H),3.04(d,3H,J=5.0Hz),2.52(s,3H),1.67(b,3H)。
实施例4:化合物4的合成
4-(甲氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-甲醛。在室温下搅拌化合物3(18.3g,0.1mol)和MnO2(86.9g,1mol)的DCM(1L)悬浮液16小时。TLC表明化合物3被完全消耗。通过硅藻土垫层过滤反应混合物。滤饼用EA(50mL)洗涤。合并滤液和洗液,减压浓缩得到18.3g的白色固体形式的所需产物。产率:89%。
实施例5:化合物6的合成
N-(4-甲基-3-(((4-(甲氨基)-2-(甲硫基)嘧啶-5-基)甲基)氨基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。向化合物4(1.83g,10mmol)和化合物5(2.94g,10mmol)的甲苯(20mL)溶液中加入p-TsOH·H2O(20mg)。将混合物加热回流且所形成的水经分水器(Dean-Stark trap)去除。在回流3h后,蒸发掉甲苯,然后向其中加入DCM(10mL)和EtOH(10mL)。一次性加入NaBH4(450mg,1.2eq.)并在室温下搅拌混合物过夜。反应混合物利用NH4C1进行急冷,搅拌0.5小时,DCM(3×50mL)萃取。提取物被合并、干燥和蒸发。所得到的残余物经硅胶柱层析纯化(PE/EA=1/1),得到2.2g黄色固体形式的纯化产物。产率:48%。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),10.18(s,1H),8.20(d,2H,J=8.0Hz),7.93(d,J=8.0Hz,1H),7.83(s,1H),4.50(s,1H),7.75(t,J=7.5Hz,1H),7.11(d,J=4.5Hz,1H),7.03(d,J=7.5Hz,1H),6.85(d,J=7.5Hz,2H),5.44(t,J=5.52Hz,1H),4.09(d,J=5.5Hz,2H),2.90(d,J=5.0Hz,3H),2.40(s,3H),2.10(s,3H)。
实施例6:化合物7的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-(甲硫基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。将化合物6(231mg,1mmol)、多聚甲醛(45mg,1.5mmol,3eq.)和p-TsOH·H2O(10mg)在甲苯(10mL)中的混合物在110℃加热2小时。LCMS指示化合物6被完全消耗。将反应混合物浓缩并且经硅胶柱层析纯化(PE/EA=2/1),得到160mg白色固体形式的所需产物。产率:68%。1H NMR,500MHz(CDCl3),8.12(s,1H),8.05(s,1H),7.99(d,1H,J=8.0Hz),7.76(t,1H,J=7.5Hz),7.59(s,1H),7.57(d,1H,J=8.0Hz),7.32(d,1H,J=8.0Hz),7.27(s,1H),7.19(d,1H,J=8.0Hz),4.57(s,2H),4.19(s,2H),3.13(s,3H),2.48(s,3H),2.34(s,3H)。
实施例7:化合物8的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-(甲磺酰基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。将化合物7(473mg,1mmol)和m-CPBA(500mg,2.2mmol)在DCM(25mL)中的混合物在室温下搅拌过夜。混合物中用25mL的DCM稀释、NaHCO3水溶液(3×50mL)洗涤、干燥和浓缩。所得到的残余物经硅胶柱层析纯化,得到225mg淡黄色固体形式的所需产物。产量:45%。1H NMR,500MHz(CDCl3),8.17(s,1H),8.06(s,1H),8.01(d,1H,J=8.0Hz),7.82(s,1H),7.76(d,1H,J=7.5Hz),7.58(t,1H,J=8.0Hz),7.30(s,1H),7.28(s,1H),7.20(d,1H,J=8.0Hz),4.68(s,2H),4.28(s,2H),3.23(s,3H),3.20(s,3H),2.35(s,3H)。
实施例8:用于式IA脂肪胺的一般程序
在室温下将脂肪胺(10eq.)加入到化合物8(101mg,0.2mmol)的二氧六环(10mL)溶液中,密封混合物且在120℃下搅拌过夜。通过旋转蒸发仪蒸发溶剂,且所得到的残余物进行制备型HPLC(碱性条件)以得到所需目标。
实施例9:IA-1的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((1-甲基哌啶-4-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-1(26mg,24%)。MS(ESI)m/z:540.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6)δ10.36(s,1H),8.20(m,2H),7.95(d,1H,J=7.6Hz),7.76(m,1H),7.51(s,1H),7.47(s,1H),7.34(d,1H,J=8.2Hz),7.15(d,1H,J=8.2Hz),6.14(s,1H),4.53(s,2H),4.11(s,2H),3.57(s,1H),3.05(s,3H),2.68(d,2H,),2.28(s,3H),2.12(s,3H),1.89(m,2H),1.77(d,2H,J=13.4Hz),1.42(m,2H)。
实施例10:IA-2的合成
N-(3-(7-((2-(二甲氨基)乙基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-2(40mg,39%)。MS(ESI)m/z:514.2[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),10.36(s,1H),8.21(m,2H),7.94(d,1H,J=7.9Hz),7.76(m,1H),7.51(s,1H),7.48(s,1H),7.35(d,1H,J=8.2Hz),7.15(d,1H,J=8.3Hz),6.06(s,1H),4.54(s,2H),4.11(s,2H),3.27(m,2H),3.06(s,3H),2.34(m,2H),2.28(s,3H),2.13(s,6H)。
实施例11:IA-3的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-(甲氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-3(30mg,33%)。MS(ESI)m/z:457.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),8.10(s,1H),8.02(d,1H,J=7.0Hz),7.80(d,1H,J=7.0Hz),7.72(s,1H),7.62(t,1H,J=8.5Hz),7.53(s,1H),7.25-7.28(m,2H),7.19(d,1H,J=8.0Hz),4.71(bs,1H),4.54(s,2H),4.16(s,2H),3.13(s,3H),2.93(d,3H),2.34(s,3H)。
实施例12:IA-4的合成
N-(3-(7-(环丙氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-4(54mg,56%)。MS(ESI)m/z:483.3[M+H]+。1HNMR,500MHz(DMSO-d6),10.37(s,1H),8.21(m,2H),7.79(d,1H,J=7.9Hz),7.76(m,1H),7.51(s,2H),7.36(d,1H,J=8.1Hz),7.16(d,1H,J=8.2Hz),6.53(d,1H,J=3.5Hz),4.54(s,2H),4.13(s,2H),3.07(m,3H),2.64(t,1H),2.29(m,3H),0.56(m,2H),0.38(m,2H)。
实施例13:IA-5的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((2-吗啉基乙基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-5(65mg,58%)。MS(ESI)m/z:556.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),10.36(s,1H),8.21(m,2H),7.74(d,1H,J=7.8Hz),7.76(m,1H),7.52(s,1H),7.47(s,1H),7.34(d,1H,J=9.8Hz),7.16(d,1H,J=8.2Hz),6.12(s,1H),4.54(s,2H),4.11(s,2H),3.54(m,4H),3.29(m,2H),3.06(m,3H),2.41(m,2H),2.36(s,4H),2.28(s,3H)。
实施例14:IA-6的合成
N-(3-(7-((2-(1H-咪唑基-4-基)乙基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-6(40mg,37%)。MS(ESI)m/z:537.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),11.78(s,1H),10.39(s,1H),8.21(m,2H),7.94(d,1H,J=7.9Hz),7.76(m,1H),7.49(s,3H),7.37(d,1H,J=7.8Hz),7.15(d,1H,J=8.3Hz),6.83(s,1H),6.34(s,1H),4.54(s,2H),4.12(s,2H),3.41(m,2H),3.06(s,3H),2.68(s,2H),2.268(s,3H)。
实施例15:IA-7的合成
(R)-N-(3-(7-((1-羟丙烷-2-基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-7(22mg,22%)。MS(ESI)m/z:501.2[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),10.37(s,1H),8.22(m,2H),7.94(d,1H,J=7.8Hz),7.76(m,1H),7.51(s,1H),7.48(s,1H),7.35(d,1H,J=8.1Hz),7.15(d,1H,J=8.2Hz),5.91(d,1H,J=7.9Hz),4.63(m,1H),4.54(s,2H),4.11(s,2H),3.88(t,1H),3.42(t,1H),3.25(t,1H),3.06(s,3H),2.28(s,3H),1.06(d,3H,J=6.6Hz)。
实施例16:IA-8的合成
(S)-N-(3-(7-((1-羟丙烷-2-基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例8中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-8(41mg,41%)。MS(ESI)m/z:501.2[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),10.37(s,1H),8.21(m,2H),7.94(d,1H,J=7.7Hz),7.76(m,1H),7.51(s,1H),7.48(s,1H),7.35(d,1H,J=8.2Hz),7.15(d,1H,J=8.2Hz),5.92(d,1H,J=8.0Hz),4.63(m,1H),4.54(s,2H),4.11(s,2H),3.88(t,1H),3.42(t,1H),3.24(t,1H),3.06(s,3H),2.28(s,3H),1.06(d,3H,J=6.6Hz)。
实施例17:式IA苯胺化合物的一般反应顺序
根据以下制备甲酰化胺中间体:
在其通过旋转蒸发仪蒸发之前,将胺在HCOOH中回流8-12小时。所得到的残余物通过反相HPLC纯化(0.1%NH3溶液为A,MeCN为B)且冷冻干燥以得到甲酰化胺。
如下描述了替选的制备方法:
在室温下向装有甲酸(2mL)的圆底烧瓶中逐滴加入乙酸酐(1mL)。搅拌反应45分钟后,再逐滴加入苯胺(0.3g)的THF溶液(1mL)。减压蒸发反应混合物且通过反相HPLC(0.1%NH3溶液为A,MeCN为B)进一步纯化,冷冻干燥以得到甲酰化胺。
在N2气氛下,在75℃将在DMF(干燥,3mL)中的化合物8(110mg,0.2mmol)、甲酰化胺(1eq.)和Cs2CO3(80mg)加热持续18小时。过滤掉固体,且滤液通过制备型HPLC纯化得到最终产物。
实施例18:化合物IA-9的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,获得化合物IA-9(47mg,产率38%)。对于C28H26F3N7O(M+1)+的ESI:534.2。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ10.41(s,1H),10.33(brs,1H),8.96(s,1H),8.20(m,3H),7.96(dd,J=6.8,1.6Hz,1H),7.76(m,2H),7.62(s,1H),7.56(m,1H),7.31(d,J=8.0Hz,1H),7.20(d,J=8.0Hz,1H),4.80(s,2H),4.28(s,2H),3.24(s,3H),2.55(s,3H),2.31(s,3H)。
实施例19:化合物IA-10的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((1-甲基-1H-吡唑-4-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得灰白色固体形式的化合物IA-10(20mg,19%)。MS(ESI)m/z:523[M+H]+。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ10.36(s,1H),8.73(s,1H),8.20-8.18(m,2H),7.93(d,J=8.0Hz,1H),7.73-7.65(m,2H),7.60(s,1H),7.53(s,1H),7.42(s,1H),7.35(dd,J=8.0Hz,J=2.0Hz,1H),7.16(d,J=8Hz,1H),4.60(s,2H),4.17(s,2H),3.76(s,3H),2.30(s,3H),3.14(s,3H)。
实施例20:IA-11的合成
N-3-(7-((l,3-二甲基-1H-吡唑-5-基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得灰白色固体形式的化合物IA-11(15mg,12%)。MS(ESI)m/z:536.55[M+H]+。1H NMR,500MHz(MeOD),8.21(s,1H),8.16(d,1H,J=7.5Hz),7.88(d,1H,J=8.0Hz),7.72(d,1H,J=7.5Hz),7.54(s,1H),7.52(s,1H),7.28(dd,1H,J=8.0Hz,J=2.0Hz),7.21(d,1H,J=7.5Hz),6.03(s,1H),4.68(s,2H),4.23(s,2H),3.63(s,3H),3.15(s,3H),2.38(s,3H),2.19(s,3H)。
实施例21:IA-12的合成
N-(3-(7-((6-二乙氨基)吡啶-3-基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得灰白色固体形式的化合物IA-12(20mg,17%)。MS(ESI)m/z:591[M+H]+。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ10.36(s,1H),8.51(s,1H),8.29(s,1H),8.19-8.21(m,2H),7.93(d,J=8Hz,1H),7.75-7.79(m,2H),7.57(s,1H),7.54(s,1H),7.36(dd,J=8.0Hz,J=2.0Hz,1H),7.16(d,J=8Hz,1H),6.50(d,J=9Hz,1H),4.59(s,2H),4.17(s,2H),3.42(q,J=6Hz,4H),3.12(s,3H),2.30(s,3H),1.07(t,J=7.5Hz,6H)。
实施例22:IA-13的合成
N-(3-(7-((6-(4-羟基哌啶-1-基)吡啶-3-基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得灰白色固体形式的化合物IA-13(17mg,14%)。MS(ESI)m/z:619[M+H]+。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ10.36(s,1H),8.65(s,1H),8.40(s,1H),8.18-8.20(m,2H),7.93(d,J=8Hz,1H),7.84-7.86(m,1H),7.75(t,J=7.5Hz,1H),7.60(s,1H),7.54(s,1H),7.35(d,J=8Hz,1H),7.16(d,J=8Hz,1H),6.75(d,J=8Hz,1H),4.64-4.60(m,3H),4.17(s,2H),3.90-3.87(m,2H),3.65-3.62(m,1H),3.12(s,3H),2.93(t,J=10Hz,2H),2.30(s,3H),1.76-1.74(m,2H),1.38-1.31(m,2H)。
实施例23:IA-14的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-(4-甲基哌嗪-1-基)吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得黄色固体形式的化合物IA-14(5mg,4%)。MS(ESI)m/z:618.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(CDCl3),8.31(s,1H),8.09(s,1H),8.00(d,1H,J=7.6Hz),7.83(d,1H,J=9.0Hz),7.78(m,2H),7.59(m,2H),7.34(s,1H),7.27(m,2H),6.65(d,1H,J=9.1Hz),4.58(s,2H),4.19(s,2H),3.48(m,4H),3.14(s,3H),2.53(m,4H),2.35(s,6H)。
实施例24:IA-15的合成
N-(4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-吗啉基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(202mg,0.4mmol)开始,获得白色固体形式的化合物IA-15(12mg,5%)。MS(ESI)m/z:605.3[M+H]+。1H NMR,500MHz(DMSO-d6),8.33(s,1H),8.09(s,1H),8.00(d,1H,J=7.5Hz),7.86(dd,1H,J=9.0Hz,3.0Hz),7.76-7.79(m,3H),7.47(s,1H),7.61(t,1H,J=7.5Hz),7.56(s,1H),7.36(s,1H),7.18-7.23(m,2H),6.70(bs,1H),6.64(d,1H,J=9.0Hz),4.59(s,2H),4.19(s,2H),3.83(t,4H,J=4.5Hz),3.42(t,4H,J=4.5Hz),3.16(s,3H),2.35(s,3H)。
实施例25:IA-16的合成
N-(3-(7-((2-甲氧基-4-(4-甲基哌嗪-1-羰基)苯基)氨基)-1-甲基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例17中描述的程序,以化合物8(101mg,0.2mmol)开始,获得灰白色固体形式的化合物IA-16(4mg,3%)。MS(ESI)m/z:675[M+H]+。1H NMR(500MHz,CDCl3):δ9.94(s,1H),8.11(s,1H),8.03(d,J=8Hz,1H),7.96(s,1H),7.79(d,J=8Hz,1H),7.64-7.60(m,2H),7.33(s,1H),7.25(s,1H),7.18(d,J=8Hz,1H),6.92(d,J=8Hz,1H),6.49-6.46(m,2H),4.58(s,2H),4.20(s,2H),3.65(s,3H),3.24(t,J=5Hz,4H),3.11(s,3H),2.59(t,J=5Hz,4H),2.37(s,3H),2.33(s,3H)。
实施例26:式IB化合物的一般反应顺序
根据方案2合成式IB化合物。在下文进一步描述了示例性方法。
方案2:式IB化合物的一般反应顺序
实施例27:化合物11的合成
乙基2-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-6-氧代-l,6-二氢嘧啶-5-羧酸酯。根据由Choi,等J.Med.Chem.,2010,55(15),5439-5448描述的方法来合成化合物11。将化合物10(25g,117mmol)与6-甲基吡啶-3-胺(13g,120mmol)的混合物加热至130℃持续3小时。通过TLC监控化合物10完全消耗后,将混合物冷却至室温。粉碎滤饼并用EtOAc(50mL)洗涤得到灰色固体形式的所需产物11(28g,产率87%)。ESI MS m/z:275[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ11.51(br,1H),9.50(br,1H),8.58(s,1H),8.47(s,1H),7.93(m,1H),7.25(d,J=8.4Hz,1H),4.18(q,J=7.2Hz,2H),2.44(s,3H),1.25(t,J=7.2Hz,3H)。
实施例28:化合物12的合成
乙基4-氯-2-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)嘧啶-5-羧酸酯。向化合物11(28g,102mmol)与POCl3(31.3g,204mmol)的混合物中加入二乙基苯胺(18.3g,122mmol),将混合物加热至90℃过夜。将混合物冷却至室温且真空浓缩。将残余物分批倒入碎冰(200g)中,所得到的固体通过抽吸收集、用石油醚和EtOAc(1:1,100mL)的混合物洗涤、真空干燥4小时以得到灰色固体形式的所需产物12(14.5g,产率48%)。ESI MS m/z:293[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ11.32(s,1H),9.09(s,1H),9.04(s,1H),8.50(d,J=8.0Hz,1H),7.86(d,J=8.0Hz,1H),4.33(q,J=7.2Hz,2H),2.69(s,3H),1.33(t,J=7.2Hz,3H)。
实施例29:化合物14的合成
将在干燥THF(40mL)中的化合物12(900mg,3.08mmol)、三乙胺(0.632g,6.16mmol)和相对应的胺(6.16mmol,2eq)的混合物在氮气下在室温搅拌过夜。通过蒸发去除有机溶剂以得到化合物13粗品,其直接用于下一步骤。
在0℃下,向化合物13(在上一步骤获得的,3.08mmol)在干燥THF(5mL)中的溶液逐滴加入LiAlH4溶液(THF中1.0M,6.2mL,6.16mmol)。将混合物缓慢地升温至室温,搅拌另一个3小时.。反应混合物用水(30mL)急冷、EA(3×100mL)萃取。合并有机相、干燥和浓缩。粗产物经硅胶柱层析纯化得到化合物14(70%~80%,以两步计的产率)。
实施例30:化合物16的合成
根据Cieplik等Acta Poloniae Pharmaceutica,2003,487-492描述的方法合成化合物16。将化合物14(1.85mmol)在SOCl2(5mL)中的混合物在70℃加热1小时,浓缩。残余物直接地用于下一步骤。向粗产物15(1.84mmol)的THF(15mL)和DMF(5mL)溶液中加入Et3N(559mg,5.52mmol)和化合物5(543mg,1.84mmol)。混合物加热回流1小时,浓缩。残余物经硅胶柱层析纯化得到化合物16(20%~30%,以两步计的产率)。
实施例31:式IB化合物的一般反应顺序
向化合物16(0.172mL)在干燥THF(8mL)中的混合物加入2mL HCHO溶液(40%)和一滴浓盐酸。混合物加热回流1小时,浓缩。残余物经硅胶柱层析纯化得到所需产物IB。
实施例32:IB-1的合成
N-3-(l–乙基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。
按照如在实施例31中描述的合成程序,获得化合物IB-1(43mg,产率46%)。ESIMSm/z:548[M+H]+。1H NMR(MeOD,500MHz):8.76(d,1H,J=2.5Hz),8.19(s,1H),8.13(d,1H,J=8.0Hz),8.00(dd,J=2.5Hz,8.5Hz),7.86(d,1H,J=7.5H),7.68(s,1H),7.64(s,1H),7.51(s,1H),7.30(dd,1H,J=2.0Hz,8.5Hz),7.23-7.18(m,2H),4.68(s,2H),4.24(s,2H),3.72-3.70(m,2H),2.47(s,3H),2.39(s,3H),1.21(t,3H)。
实施例33:IB-2的合成
N-(3-(1–环丙基-7-((甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。
按照如在实施例31中描述的合成程序,获得化合物IB-2(51mg,产率50%)。ESI MSm/z:560[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ0.66-1.87(4H,m),2.29(3H,s),2.36(3H,s),2.81(1H,m),4.17(2H,s),4.59(2H,s),7.09(1H,d,J=8.8Hz),7.16(1H,d,J=8.0Hz),7.31(1H,d,J=8.0Hz),7.51(1H,s),7.74-7.76(2H,m),7.91(1H,d,J=8.0Hz),8.16-8.26(3H,m),8.85(1H,s),9.10(1H,s),10.34(1H,s)。
实施例34:IB-3的合成
N-(3-(1–环戊基-7-((甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-4-甲基苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例32中描述的合成程序,获得化合物IB-3(46mg,产率46%)。ESI MS m/z:588[M+H]+。1H NMR(MeOD,500MHz):8.75(d,1H,J=2.5Hz),8.19(s,1H),8.13(d,1H,J=8.0Hz),7.98(dd,J=2.5Hz,8.5Hz),7.86(d,1H,J=7.5H),7.70-7.67(m,2H),7.46(s,1H),7.33(dd,1H,J=2.0Hz,8.5Hz),7.23(d,1H,J=8.5Hz),7.19(d,1H,J=8.0Hz),5.16-5.12(m,1H),4.60(s,2H),4.24(s,2H),2.47(s,3H),2.38(s,3H),1.88-1.85(m,2H),1.74-1.64(m,4H),1.52-1.42(m,2H)。
实施例35:IB-4的合成
N-(4-甲基-3-(7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1-苯基-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例32中描述的合成程序,获得化合物IB-4(40mg,产率39%)。ESI MS m/z:596[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ2.29(3H,s),2.30(3H,s),4.36(2H,s),4.96(2H,s),6.82(1H,d,J=8.0Hz),7.18(1H,d,J=7.6Hz),7.20-8.21(13H,m),8.46(1H,s),9.06(1H,s),10.38(1H,s)。
实施例36:式IC化合物的一般反应顺序
根据方案3合成IC化合物。在下文进一步描述了示例性方法。
方案3:式IC化合物的一般反应顺序:
实施例37:化合物18的合成
4-(甲氨基)-2-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)嘧啶-5-甲醛。将活性MnO2(8g,92mmol)加入到化合物17(4.5g,18.3mol)在CHCl3(100ml)中的混合物中。混合物在室温下搅拌过夜。根据TLC监控在化合物17被完全消耗后,通过硅藻土过滤混合物,滤饼用CHCl3-MeOH(4:1,2×50mL)洗涤,将合并的滤液浓缩,得到白色固体形式的化合物18粗品(3.5g,产率78%)。ESI MS m/z:244[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ10.04(br,1H),9.56(s,1H),8.84(br,1H),8.61(br,1H),8.47(s,1H),8.08(d,J=7.2Hz,1H),7.20(d,J=7.2Hz,1H),3.00(d,J=4.4Hz,3H),2.41(s,3H)。
实施例38:化合物19的合成
4-甲基-3-(((4-(甲氨基)-2-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)嘧啶-5-基)甲基)氨基)苯甲酸甲酯。化合物18和甲基3-氨基-4-甲基苯甲酸酯(2.7g,16.2mmol)在DCE(100ml)中的混合物在室温下搅拌4小时,随后一次加入NaBH3CN。混合物在室温下搅拌2天,直到根据LCMS监控大多数的起始原料被消耗。混合物真空浓缩,且残余物经硅胶柱层析(THF-石油醚=1:1至1:0)纯化以得到白色固体形式的纯的化合物19(1.8g,产率31%)。ESI MS m/z:393[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ9.05(s,1H),8.80(s,1H),8.08(dd,J=8.4Hz,2.0Hz,1H),7.76(s,1H),7.07-7.15(m,4H),6.95(d,J=4.0Hz,1H),5.54(m,1H),4.12(d,J=4.4Hz,2H),3.78(s,3H),2.93(d,J=4.0Hz,3H),2.36(s,3H),2.17(s,3H)。
实施例39:化合物20的合成
4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯甲酸甲酯。向化合物19(1.4g,3.56mmol)的THF(50mL)溶液中加入HCHO溶液(10mL,40%)和一滴浓盐酸。混合物加热回流1小时且浓缩得到白色固体形式的化合物20(1.5g,产率100%)。化合物20不经进一步纯化而用于下一步骤。ESI MS m/z:405[M+H]+。
实施例40:化合物21的合成
4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯甲酸。向粗化合物20(1.5g,3.56mmol)的MeOH溶液(50mL)中加入NaOH(0.57g,14.24mmol)的水溶液(10mL)。混合物在50℃搅拌过夜。浓缩混合物且将残余物溶解在200mL的水中,冷冻干燥得到黄色粉末形式的粗化合物21(2.0g,粗品),其不经进一步纯化而直接用于下一步骤。ESI MS m/z:391[M+H]+。
实施例41:IC-1的合成
4-甲基-3-(l-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-l,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-N-(3-(三氟甲基)苯基)苯甲酰胺。将化合物21(100mg,粗品,0.25mmol)与3-(三氟甲基)苯胺(50mg,0.3mmol)在干燥吡啶(5mL)中的混合物处于-15℃。POCl3(1mL)与干燥吡啶(5mL)混合,然后加入到上述混合物中。反应混合物在-15℃下搅拌两小时、倒入碎冰中并且用DCM萃取。合并的提取物相继用2M HCl、NaHCO3水溶液和盐水洗涤,Na2SO4干燥,浓缩。残余物经制备型HPLC纯化,得到白色固体形式的化合物IC-1(10mg)。ESI MS m/z:534[M+H]+。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):δ2.37(3H,s),2.42(s,3H),3.14(s,3H),4.25(s,2H),4.68(s,2H),7.10(d,J=8Hz,1H),7.38(d,J=8Hz,1H),7.44(d,J=8Hz,1H),7.54-7.58(m,2H),7.66-7.70(m,2H),8.00-8.06(m,2H),8.20(m,1H),8.75(s,1H),9.07(s,1H),10.44(s,1H)。
实施例42:IC-2的合成
N-(2-羟乙基)-4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯甲酰胺。将化合物21(200mg,粗品,0.5mmol)、2-氨基乙醇(34mg,0.55mmol)、HATU(210mg,0.55mmol)与TEA(101mg,1mmol)在DMF(5mL)中的混合物在室温下搅拌过夜。混合物经制备型HPLC处理,得到白色固体形式的纯的化合物IC-2(19mg)。ESI MS m/z:434[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ9.07(s,1H),8.76(d,J=2.0Hz,1H),8.33(t,J=5.6Hz,1H),8.05(dd,J=8.0Hz,2.4Hz,1H),7.67(s,1H),7.45-7.48(m,2H),7.26(d,J=8.4Hz,1H),7.10(d,J=8.4Hz,1H),4.71(t,J=4.2Hz,1H),4.61(s,2H),3.44-3.50(m,2H),3.25-3.30(m,2H),3.11(s,3H),2.37(s,3H),2.36(s,3H)。
实施例43:IC-3的合成
4-甲基-3-(l-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-l,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)-N-(2-吗啉基乙基)苯甲酰胺。按照如在实施例42中描述的相同的合成程序,获得化合物IC-3(32mg)。ESI MS m/z:503[M+H]+。1H NMR(400Mz,DMSO-d6):δ9.05(s,1H),8.75(d,J=2.0Hz,1H),8.26(m,1H),8.05(dd,J=8.0Hz,2.0Hz,1H),7.66(s,1H),7.40-7.44(m,2H),7.26(d,J=8.0Hz,1H),7.09(d,J=8.0Hz,1H),4.61(s,2H),4.19(s,2H),3.50-3.54(m,4H),3.33(s,3H),3.10(s,3H),2.36-2.42(m,10H)。
实施例44:IC-4的合成
N-甲氧基-4-甲基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯甲酰胺。按照如在实施例43中描述的相同的合成程序,获得化合物IC-4(19mg)。ESI MS m/z:420[M+H]+。1H NMR(400Mz,MeOD-d4):δ8.74(d,J=1.6Hz,1H),8.03(dd,J=8.0Hz,2.0Hz,1H),7.41(s,1H),7.34(d,J=8.0Hz,1H),7.28(d,J=8.0Hz,1H),7.18(d,J=8.4Hz,1H),4.62(s,2H),4.21(s,2H),3.75(s,3H),3.17(s,3H),2.46(s,3H),2.41(s,3H)。
实施例45:IC-5的合成
N-(3-(l-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照实施例39的相同的合成程序,获得化合物IC-5(60mg)。ESI MS m/z:508[M+H]+。1H NMR(500Mz,MeOD-d4):δ8.75(s,1H),8.26(s,1H),8.20(d,J=8.0Hz,1H),8.01(dd,J=8.4Hz,3.0Hz,1H),7.90(d,J=8.0Hz,1H),7.74(t,J=8.0Hz,1H),7.68(s,1H),7.60(s,1H),7.28(t,J=8.0Hz,1H),7.20(t,J=7.5Hz,1H),6.92(dd,J=2.0Hz,8.0Hz,1H),4.95(s,2H),4.52(s,2H),3.21(s,3H),2.47(s,3H)。
实施例46:IC-6的合成
N-(4-甲氧基-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照实施例39的相同的合成程序,获得化合物IC-6(11mg)。ESI MS m/z:550[M+H]+。1H NMR(500Mz,MeOD-d4):δ8.62(s,1H),8.08(s,1H),8.02(d,J=8.0Hz,1H),7.90(dd,J=8.5Hz,2.0Hz,1H),7.74(d,J=8.0Hz,1H),7.58(t,J=8.0Hz,1H),7.50(s,1H),7.33(d,J=2.0Hz,1H),7.21(dd,J=2.0Hz,8.5Hz,1H),7.06(d,J=8.5H,1H),6.89(d,J=8.5H,1H),4.70(s,2H),4.28(s,2H),3.82(s,3H),3.07(s,3H),2.34(s,3H)。
实施例47:IC-7的合成
N-(4-氯-3-(1-甲基-7-((6-甲基吡啶-3-基)氨基)-1,4-二氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-3(2H)-基)苯基)-3-(三氟甲基)苯甲酰胺。按照如在实施例39中描述的合成程序,获得化合物IC-7(25mg)。ESI MS m/z:554[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ10.6(s,1H),9.10(s,1H),8.74(d,1H),8.21(m,2H),8.05(m,1H),8.01(m,1H),7.92,2H),7.45(m,2H),7.08(m,1H),7.03(d,1H),4.75(m,2H),4.36(m,2H),3.16(s,3H),2.56(s,3H)。
实施例48:式ID化合物的一般反应顺序
根据方案4合成式ID化合物。在下文进一步描述了示例性方法。
方案4:式ID1-ID5化合物的一般反应顺序:
实施例49:化合物24的合成
4-(甲氨基)-2-((6-吗啉基吡啶-3-基)氨基)嘧啶-5-羧酸乙酯。按照化合物13的相同的合成程序(参见实施例30),获得化合物24(12.7g)。ESI MS m/z:359[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ9.68(br,1H),8.56(s,1H),8.16(s,1H),7.97(s,1H),6.83(d,J=9.5Hz,1H),4.23(q,J=7.2Hz,2H),3.69(s,3H),3.36(s,4H),2.96(s,3H),1.28(t,J=7.2Hz,3H)。
实施例50:化合物25的合成
(4-(甲氨基)-2-((6-吗啉基吡啶-3-基)氨基)嘧啶-5-基)甲醇。按照化合物14的相同的合成程序(参见实施例30),获得化合物25(6.8g)。ESI MS m/z 317[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.51(s,1H),8.01(s,1H),7.51(s,1H),6.74(s,1H),4.23(s,2H),3.69(s,4H),3.29(s,4H),3.15(s,1H),2.84(s,3H)。
实施例51:ID-1的合成
6-(4-氯-3-(三氟甲基)苯基)-8-甲基-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照化合物20的相同的的合成程序(参见实施例40),获得化合物ID-1(167mg)。ESI MS m/z:506[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.78(s,1H),8.43(d,J=2.5Hz,1H),7.88(dd,J1=9.0Hz,J2=3.0Hz,1H),7.72(s,1H),7.53(d,J=9.0Hz,,1H),7.43(d,J=9.0Hz,,1H),.7.37(dd,J=9.0Hz,3.0Hz,1H),6.76(d,J=9.0Hz,,1H),4.97(s,2H),4.53(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,,4H),3.32(t,J=4.5Hz,4H),3.07(s,3H)。
实施例52:ID-2的合成
6-(3-氯-4-氟苯基)-8-甲基-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照化合物20的相同的的合成程序(参见实施例40),获得化合物ID-2(80mg)。ESI MS m/z:456[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.76(s,1H),8.43(d,J=2.5Hz,1H),7.90(dd,J=9.0Hz,3.0Hz,1H),7.69(s,1H),7.24–7.28(m,2H),7.05–7.07(m,1H),6.76(d,J=9.0Hz,1H),4.89(s,2H),4.44(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,4H),3.30(t,J=4.5Hz,4H),3.05(s,3H)。
实施例53:ID-3的合成
6-(4-溴-2-氟苯基)-8-甲基-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照化合物20的相同的的合成程序(参见实施例40),获得化合物ID-3(27mg)。ESI MS m/z:501[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.78(s,1H),8.45(d,J=2.5Hz,1H),7.90(dd,J=9.0Hz,3.0Hz,1H),7.66(s,1H),7.51(dd,J=12.0Hz,2.5Hz,1H),7.25(dd,J=9.0Hz,3.0Hz,1H),6.93(t,J=9.0Hz,1H),6.77(d,J=9.5Hz,1H),4.74(s,2H),4.33(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,4H),3.32(t,J=4.5Hz,4H),3.05(s,3H)。
实施例54:ID-4的合成
8-甲基-6-(2-甲基-5-(三氟甲基)苯基)-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照化合物20的相同的的合成程序(参见实施例40),获得化合物ID-4(40mg)。ESI MS m/z:486[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.81(s,1H),8.47(s,1H),7.92(dd,J=9.0Hz,3.0Hz,1H),7.64(s,1H),7.43(d,J=7.5Hz,1H),7.32(d,J=8.0Hz,1H),7.17(s,1H),6.79(d,J=9.5Hz,1H),4.64(s,2H),4.22(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,4H),3.32(t,J=4.5Hz,4H),3.07(s,3H),2.40(s,3H)。
实施例55:ID-5的合成
8-甲基-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-6-(3-(三氟甲基)苯基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照化合物20的相同的的合成程序(参见实施例40),获得化合物ID-5(140mg)。ESI MS m/z:472[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.76(s,1H),8.43(s,1H),7.88(dd,J=9.0Hz,2.5Hz,1H),7.72(s,1H),7.43–7.45(m,1H),7.35–7.38(m,2H),7.14(d,J=7.5Hz,1H),6.76(d,J=9.0Hz,1H),4.98(s,2H),4.53(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,4H),3.32(t,J=4.5Hz,4H),3.08(s,3H)。
实施例56:化合物ID-6的一般反应顺序
根据方案5合成化合物ID-6。在下文进一步描述了示例性方法。
方案5:式ID-6化合物的一般反应顺序:
实施例57:ID-6的合成
6-(5-氨基-2-甲基苯基)-8-甲基-N-(6-吗啉基吡啶-3-基)-5,6,7,8-四氢嘧啶并[4,5-d]嘧啶-2-胺。按照式IB化合物的相同的的合成程序(参见实施例27、31和32),获得化合物30。还原化合物30得到所需产物ID-6(40mg)。ESI MS m/z:463[M+H]+。1H NMR(500Mz,DMSO-d6):δ8.74(s,1H),8.49(s,1H),7.93(dd,J=8.5Hz,2.5Hz,1H),7.58(s,1H),6.77–6.80(m,2H),6.18–6.19(m,2H),4.80(s,2H),4.51(s,2H),4.08(s,2H),3.69(t,J=4.5Hz,4H),3.32(t,J=4.5Hz,4H),3.07(s,3H),2.13(s,3H)。
实施例58:化合物IA-9的KINOMEscan数据
KINOMEscanTM基于竞争结合试验,其定量地测定了化合物与固定化的、活性位点针对的配体竞争的能力(Fabian等(2005)Nat.Biotechnol.23,329;Karaman等(2008)Nat.Biotechnol.26,127)。化合物以10μM进行筛选且对于初级筛选结合作用的结果被记录为“%Ctrl”,其中数值越低,表明结合能力越强。可在表2中看到“%Ctrl”低于30的激酶靶标的结果。
%Ctrl的计算方法
测试化合物=待测化合物
阴性对照=DMSO(100%Ctrl)
阳性对照=对照化合物(0%Ctrl)
实施例59:致癌蛋白激酶依赖型细胞增殖的抑制
在掌握kinome数据后,测试了本发明中公开的化合物对于抑制依赖所选择的蛋白激酶的细胞的增殖的能力。测试本发明的化合物以测量与亲本Ba/F3细胞相比,其选择性抑制表达BCR/ABL的Ba/F3细胞1(Ba/F3-p210)或者表达耐伊马替尼的BCR/ABL-T315I突变体的Ba/F3细胞1(Ba/F3-p210-T315I)的细胞增殖的能力。另外,测试化合物以测量其对于抑制TIE1、LYN、EML4-ALK、INSR和HCK激酶的能力。
所使用的鼠科细胞系是用BCR/ABL cDNA(BaF/3-p210)或者BCR/ABL-T315I突变体(Ba/F3-p210-T315I)转化的BaF/3细胞系。这些细胞保持在补充有50μg/mL青霉素、50μg/mL链霉素和200mM L-谷氨酰胺的RPMI/10%的胎牛血清(RPMI/FCS)中。未转化的BaF/3细胞(Wt-BaF/3)类似地通过添加作为IL3源的15%的WEHI条件培养基而保持。
细胞以每孔20000个细胞的密度接种在96孔板中。化合物用生长培养基逐级稀释三倍(Cmax=10μM),然后一式三份加入到96孔板中,在37℃和5%CO2下孵育48小时。在各个板上一式三份包括添加不含细胞的培养基的背景对照孔以及媒介物对照孔。细胞活力使用MTT(Sigma,St.Louis,MO,USA)和MTS(Promega,Madison,WI,USA)根据制造商的说明进行测定。使用GraphPad Prism 5.0(GraphPad Software,San Diego,CA)分析结果并且IC50值根据细胞活力剂量响应曲线进行计算且被定义为对于将细胞活力降低至媒介物对照(DMSO)的50%所需的化合物浓度(表3)。
本发明的化合物对TIE1、LYN、EML4-ALK、INSR和Hck的细胞增殖测试使用如上描述的相同的用于BCR/ABL的方法进行,除了使用BaF3-TEL-TIEl、BaF3-TEL-LYN、BaF3-EML4-ALK、BaF3-TEL-INSR和BaF3-TEL-HCK代替BaF3-BCR/ABL外(表3和表4)。
实施例60:致癌RAS依赖型细胞增殖的抑制
用致癌NRAS或KRAS转化的BaF/3细胞系(BaF/3-NRASD12或BaF/3-KRASD12)以及亲本的BaF/3细胞被用于测量本发明的化合物抑制RAS转化的能力(表5)。细胞以每孔5000个细胞的密度接种在96孔板中。化合物用生长培养基逐级稀释三倍(Cmax=10μM),然后一式三份加入到96孔板中,在37℃和5%CO2下孵育48小时。在各个板上一式三份包括添加不含细胞的培养基的背景对照孔以及媒介物对照孔。细胞活力使用CellTiter Glo Assay(Promega)根据制造商的说明进行测定,其中具有较小的改动,即在使用前将1份的CellTiterGlo试剂稀释到4份的磷酸盐缓冲液(PBS)中。通过Envision(PerkinElmer)读取发光值。
实施例61:人白血病细胞增殖的抑制
在本发明中的化合物中,IA-9是一个强效的激酶抑制剂。IA-9抑制人白血病细胞增殖的活性使用CellTiter Glo Assay(Promega)进行测试。图1显示与FDA批准的药物伊马替尼和帕纳替尼相比,IA-9对KU812细胞、带有BCR/ABL融合致癌基因(美国标准菌库,American Type Culture Collection)的人慢性髓细胞性白血病(CML)急变期细胞系具有更强的抑制增殖能力。
实施例62:化合物IA-9的抗白血病活性
IA-9治疗白血病的活性在所描述的小鼠CML模型中进行测试4。5天前,来自5-氟尿嘧啶(5-FU)-处理的雄性BALB/c供体小鼠的骨髓细胞以1X106细胞/毫升的浓度在由DMEM、15%FCS、5%WEHI条件培养基、50%病毒悬浮液、3μg/mL聚凝胺、2mmol/L L-谷氨酰胺、PSA、7ng/mL IL-3、12ng/mL IL-6和56ng/mL干细胞因子构成的混合物(SCF;R&D系统)中感染24小时。用现配的如上所述的包含逆转录病毒的混合物重复传染一次。感染后的骨髓细胞然后用磷酸盐缓冲液冲洗一次,尾静脉注射给经致死剂量辐射(辐射分两次,每次剂量450rads,间隔4小时)的同系小鼠(雌性BALB/c;6~8周龄),每只小鼠注射4×105细胞。从骨髓移植后的那天开始,受体小鼠通过口喂一天两次用媒介物(10%l-甲基-2-吡咯烷酮:90%PEG-300)、50mg/kg伊马替尼或l0mg/kg IA-9进行处理。图2示出IA-9具有明显更强的抗白血病活性。
实施例63:化合物IA-9的抗黑色素瘤活性
IA-9治疗黑色素瘤的能力利用SK-MEL-5、SK-MEL-28和SK-MEL-30细胞系测定。SK-MEL-5和SK-MEL-28细胞系表达突变体B-Raf(V600E)和野生型N-Ras。SK-MEL-30细胞系表达野生型B-Raf和突变体N-Ras(Q61K)。细胞增殖使用本文描述的方法进行测定。图3示出IA-9用以降低黑色素瘤细胞增殖的能力。
实施例64:化合物IA-9的抗肺癌活性
IA-9治疗肺腺癌的能力利用NCI-H1975和HCC827细胞系测定。这两种细胞系均至少具有EGFR和Ras突变,并且对多种药物具有抗性。细胞增殖使用本文描述的方法进行测定。图4示出IA-9用以降低肺腺癌细胞增殖的能力。
实施例65:致癌FLT3-驱动的白血病的抑制
FLT3是一种受体酪氨酸激酶;在30%的人急性髓细胞性白血病(AML)中发现其激活突变5。例如如本文描述的KINOMEscan数据显示,某些式I化合物(例如IA-9)紧密结合FLT3激酶。
测定了IA-9选择性抑制表达FLT3-ITD致癌蛋白(ITD)(一种在AML中的FLT3的主要的致癌突变)的Ba/F3细胞的细胞增殖的能力。图5A示出在IL-3缺乏的条件下IA-9有效抑制ITD细胞的增殖/活力。加入IL-3在很大程度上恢复了ITD细胞的增殖/存活,这暗示IA-9特异性地抑制FLT3-ITD转化的细胞,其中具有80倍剂量的潜在治疗窗口。
此外,IA-9对FLT3-ITD驱动的人AML增殖的抑制效应说明IA-9能够比达沙替尼更有效地抑制MV-4-11、具有FLT-ITD突变的人AML细胞系的生长,达沙替尼是FDA批准治疗BCR/ABL阳性白血病的激酶抑制剂(图5B)。
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表2化合物IA-9D的KINOMEscan数据
表3本发明的化合物对BaF3-BCR/ABL、BaF3-BCR/ABL-T315I、BaF3-TEL-TIEl和BaF3-TEL-LYN的抗增殖活性
表4本发明的化合物对BaF3-EML4-ALK、BaF3-TEL-INSR和BaF3-TEL-HCK的抗增殖活性
表5本发明的化合物对BaF3-NRASD12、BaF3-KRASD12和Wt-BaF3的抗增殖活性
Cmpd ID | NRas-BaF3 | KRas-BaF3 | Wt-BaF3 |
IC50(μM) | IC50(μM) | IC50(μM) | |
IA-1 | 5.224 | 10.13 | 8.834 |
IA-2 | 3.384 | 3.978 | 4.544 |
IA-3 | 11.51 | 6.468 | 12.45 |
IA-4 | 9.558 | 8.326 | 11.29 |
IA-5 | 3.292 | 3.439 | 6.297 |
IA-6 | 5.502 | 5.533 | 5.137 |
IA-7 | 8.275 | 8.101 | 24.35 |
IA-8 | 5.213 | 7.566 | 17.94 |
IA-9 | 0.38 | 5.38 | |
IA-10 | 2.902 | 4.599 | 11.76 |
IA-11 | 1.022 | 1.493 | 13.52 |
IA-12 | 2.304 | 1.823 | 4.113 |
IA-13 | 0.501 | 0.402 | 2.341 |
IA-14 | 1.531 | 1.463 | 3.665 |
IA-15 | 0.404 | 0.388 | 1.766 |
IA-16 | 4.411 | 4.308 | 4.418 |
IB-1 | 1.503 | 2.113 | 4.84 |
IB-2 | 1.405 | 1.777 | 6.029 |
IB-3 | 5.968 | 5.835 | 9.706 |
IB-4 | 4.927 | 5.36 | 17.13 |
IC-1 | 1.57 | 1.689 | 5.36 |
IC-2 | >10 | >10 | >10 |
IC-3 | >10 | >10 | >10 |
IC-4 | >10 | >10 | >10 |
IC-5 | >10 | >10 | 29.32 |
IC-6 | 8.154 | 10.35 | 22.84 |
Claims (11)
1.一种式I化合物或其药学上可接受的盐,
其中:
R’为氢或C1-6脂族基;
L为共价键、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、或-C(O)-;
R1选自:氢、-OR、-SR、-N(R)2、或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;任选桥接的7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
各个R独立地选自氢或者任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;
R2和R3各自独立地选自氢、任选被取代的基团,该任选被取代的基团选自C1-6脂族基;苯基;3-8元饱和或部分不饱和的碳环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-2个杂原子的4-7元杂环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-4个杂原子的5-6元单环杂芳基环;任选桥接的7-10元双环饱和、部分不饱和或者芳基的环;具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的8-10元双环杂芳基环;或者具有独立地选自氮、氧或硫的1-5个杂原子的7-10元双环饱和或部分不饱和的杂环;
R4和R5各自独立地选自氢或C1-3脂族基,或者R4和R5通过它们的中间原子结合在一起形成3-6元饱和碳环;和
R6和R7各自独立地为氢或任选被取代的C1-6脂族基。
2.一种药物组合物,其包含治疗有效量的权利要求1所述的化合物以及药学上可接受的赋形剂。
3.一种治疗对象的癌症的方法,包括给药治疗有效量的权利要求1所述的化合物。
4.根据权利要求3的方法,其中,所述对象已经接受在先的治疗。
5.根据权利要求3的方法,其中,所述对象已经对在先的治疗方案形成抗性。
6.根据权利要求3的方法,其中,所述癌症具有激酶突变。
7.根据权利要求3的方法,其中,所述癌症具有选自ABL、EGFR、EPHA、EPHB、FLT3、Kit、RET、TXK、BRAF和RAS中的一种或多种激酶的突变。
8.根据权利要求3的方法,其中,其中,所述癌症包括肺癌、乳腺癌、黑色素瘤、慢性髓细胞性白血病(CML)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、或结直肠癌。
9.一种治疗患有疾病或病况的对象的方法,在所述疾病或病况中抑制激酶活性能够预防、抑制、或减轻所述疾病的病状、进展和/或症状,其中所述方法包括将治疗有效量的权利要求1所述的化合物给药至所述对象。
10.根据权利要求9所述的方法,其中,所述疾病或病况包括:肺癌、乳腺癌、黑色素瘤、慢性髓细胞性白血病(CML)、急性淋巴细胞性白血病(ALL)、急性髓细胞性白血病(AML)、或结直肠癌。
11.根据权利要求9所述的方法,其中,所述激酶选自ABL、EGFR、EPHA、EPHB、FLT3、Kit、RET、TXK、BRAF和RAS。
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