CN108085262B - 对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细胞、其产生方法及其用途 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及基因工程领域。具体地,本发明涉及对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细胞、其产生方法及其用途。更具体地,所述重组宿主细胞通过增加野生型宿主细胞中PDR5蛋白的表达量或活性而产生,其可用于萜类生产。

Description

对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细 胞、其产生方法及其用途
技术领域
本发明涉及基因工程领域。具体地,本发明涉及对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细胞、其产生方法及其用途。
背景技术
天然活性产物一般为生物体生物合成的微量次生代谢物,在生物体内主要发挥信号传导、化感、阻止病菌和昆虫入侵等作用。同时由于其重要的生物学活性,已被广泛地应用于医疗保健和营养等领域。从原植物中直接提取是目前生产这类天然产物的主要方式,但这种方法有较多的缺点,包括含量低和差异大,产品纯化难,植物生长周期长,对生物资源尤其野生资源造成严重破坏等。
目前利用合成生物学的原理,设计和改造微生物菌株来生产天然产物已被国际认为是一种最有潜力的方法,如在酵母工程菌中生产青蒿素的前体青蒿酸最高达到25g/L(Paddon CJ et al.,2013,Nature,2013,496:528-532)。然而许多天然产物对微生物宿主有毒性,将严重影响其在细胞工厂中的生产效率。因此,挖掘能提高微生物宿主对该天然产物具有耐受性的功能蛋白是高效细胞工厂创建成功的关键。
水解ATP供能的ABC转运蛋白(ATP-binding cassette transporter)和依赖于H+/Na+浓度梯度的逆向转运的MATE解毒蛋白(Multidrug and toxic compound extrusiontransporter)等转运蛋白是执行该功能的主要蛋白。例如,在植物药黄连素的转运研究中,科学家发现了MATE类外排蛋白AtDTX1能向细胞外转运黄连素,并在酿酒酵母中过表达AtDTX1蛋白能显著提高细胞对抗黄连素的毒性(Li L et al.,J Biol Chem 2002,277(7):5360-5368.)。
青蒿素、紫杉醇、β-榄香烯、莪术油、吉马烯A等萜类化合物在肿瘤和感染等方面有广泛临床应用。然而,许多重要的萜类化合物对微生物宿主均有毒性。针对数量众多的萜类化合物,尤其是一些重要的萜类化合物,有必要挖掘能提高宿主细胞对其具有耐受性的特定功能蛋白,从而为这类化合物的高效生物合成奠定基础。
发明概述
本发明提供了对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的宿主细胞及其用途,具体技术方案如下:
第一方面,本发明提供了一种重组宿主细胞,其包含与对应野生型宿主细胞相比表达量或活性增加的PDR5蛋白。
第二方面,本发明提供了一种产生对萜类或含萜精油的耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细胞的方法,其包括增加野生型宿主细胞中PDR5蛋白的表达量或活性的步骤。
在本发明的具体实施方案中,PDR5蛋白的表达量增加通过增加PDR5基因的拷贝数和/或使用强启动子实现。
在与增加PDR5基因的拷贝数有关的一个具体实施方案中,PDR5基因是酿酒酵母PDR5基因。
在与增加PDR5基因的拷贝数有关的进一步的具体实施方案中,酿酒酵母PDR5基因由SEQ ID NO:1的核酸序列组成。
第三方面,本发明提供了分离的编码PDR5蛋白的多核苷酸用于提高宿主细胞对萜类或含萜精油的耐受性或提高宿主细胞萜类产量的用途。
在一个具体实施方案中,编码PDR5蛋白的多核苷酸是酿酒酵母PDR5基因。
在进一步的实施方案中,酿酒酵母PDR5基因由SEQ ID NO:1的核酸序列组成。
第四方面,本发明提供了PDR5蛋白用于提高宿主细胞对萜类或含萜精油的耐受性或提高宿主细胞萜类产量的用途。
在一个具体实施方案中,PDR5蛋白是酿酒酵母PDR5蛋白。
在一个具体实施方案中,酿酒酵母PDR5蛋白由SEQ ID NO:139的氨基酸序列组成。
在本发明的上述各方面中,宿主细胞进一步包含用于萜类生产的外源多核苷酸。
在本发明的上述各方面中,宿主细胞是真核生物,优选酵母纲(Saccharomycetes)。
在本发明的上述各方面中,宿主细胞选自伞菌属(Agaricus)、曲霉属(Aspergillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、念珠菌属(Candida)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、埃希菌属(Escherichia)、镰孢属(Fusarium)、赤霉属(Gibberella)、克鲁维酵母属(Kluyveromyce)、硫磺菌属(Laetiporus)、香菇属(Lentinus)、红发夫酵母属(Phaffia)、平革菌属(Phanerochaete)、毕赤酵母属(Pichia)、藓属(Physcomitrella)、红酵母属(Rhodoturula)、酵母属(Saccharomyces)、裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)、痂圆孢属(Sphaceloma)、红发夫酵母属(Xanthophyllomyces)和耶氏酵母属(Yarrowiagenera)。
在本发明的上述各方面中,宿主细胞选自酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、解脂耶氏酵母(Yarrowialipolytica)、光滑念珠菌(Candida glabrata)、棉阿舒囊霉(Ashbya gossypii)、产朊假丝酵母(Cyberlindnera jadinii)、巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)、乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)、多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)、博伊丁念珠菌(Candida boidinii)、Arxula adeninivorans、红发夫酵母(Xanthophyllomycesdendrorhous)或白色念珠菌(Candida albicans)物种,优选酿酒酵母。
在本发明的上述各方面中,萜类选自半萜、单萜、倍半萜和二萜,优选选自单萜和倍半萜,尤其优选倍半萜。
在本发明的上述各方面中,萜类选自香叶酯、香叶醇、金合欢醇、橙花叔醇、诺卡酮、吉玛烯A、榄香烯、檀香醇、香紫苏醇,优选选自金合欢醇、橙花叔醇、吉玛烯A、榄香烯和檀香醇,含萜精油选自莪术油、姜黄油、甜橙油、薄荷油、紫苏油和檀香油,优选选自莪术油、姜黄油和檀香油。
第五方面,本发明提供了一种生产萜类的方法,包括在培养基中于导致产生萜类的条件下培养本发明的重组宿主细胞或由本发明的方法产生的重组宿主细胞,并从培养基中回收所述萜类。
附图说明
图1.酵母细胞ABC和MATE类转运蛋白突变株系构建流程图
图2.吉马烯A(Gemacrene A,以下简称GMA)对突变菌株生长的影响。当在培养基中添加GMA时,ABC转运蛋白ScPDR5(酿酒酵母PDR5)缺失的菌株NK2-ScPDR5的生长与对照菌株相比,生长明显受到抑制。
图3.调控ScPDR5基因表达对GMA耐受性的变化。在菌株NK2中过表达ScPDR5基因能显著提高菌株对GMA的耐受性,而菌株NK2、NK2-GFP,NK2-ScPDR5的生长明显受抑制,其中ScPDR5功能的缺失导致菌株对萜类的耐受性显著降低。
发明详述
本发明并不限于本文所述的具体方法、方案、试剂等,因为这些可以变化。本文所用的术语仅用于描述具体实施方案的目的而不是为了限制本发明的范围。除非另有定义,本文所用的所有技术和科学术语均具有与本领域技术人员通常理解的相同的含义。
如本文所用,术语“宿主细胞”意指任何细胞类型,所述细胞类型适于进行本发明的重组操作,例如对于用包含本发明的多核苷酸的核酸构建体或表达载体的转化、转染、转导等是易感的。术语宿主细胞涵盖亲本细胞的任何后代,其由于在复制过程中发生的突变而不同于亲本细胞。
适于本发明的宿主细胞包括原核生物和真核生物。示例性的宿主细胞是真核生物,优选酵母纲,例如选自伞菌属、曲霉属、芽孢杆菌属、念珠菌属、棒状杆菌属、埃希菌属、镰孢属、赤霉属、克鲁维酵母属、硫磺菌属、香菇属、红发夫酵母属、平革菌属、毕赤酵母属、藓属、红酵母属、酵母属、裂殖酵母属、痂圆孢属、红发夫酵母属和耶氏酵母属。优选选自酿酒酵母、粟酒裂殖酵母、解脂耶氏酵母、光滑念珠菌、棉阿舒囊霉、产朊假丝酵母、巴斯德毕赤酵母、乳酸克鲁维酵母、多形汉逊酵母、博伊丁念珠菌、Arxula adeninivorans、红发夫酵母或白色念珠菌物种。特别优选酿酒酵母。
在本发明的一个具体实施方案中,所使用的宿主细胞为酿酒酵母CEN.PK2-1D(以下简称NK2,购自欧洲酿酒酵母保藏中心(EUROSCARF))。
如本文所用,术语“重组”是指通过人介入来改变遗传物质。通常,重组是指通过分子生物学方法来操作细胞或病毒或表达载体中的DNA或RNA。
如本文所用,术语“表达”是指内源或外源目标蛋白在细胞中产生的过程,其包括但不限于转录、转录后修饰、翻译、翻译后修饰和分泌。
本发明通过同源重组进行基因表达的方法属于本领域的常规方法(Shao Z etal.,Nucleic Acids Research 2009,37(2):e16;Dai Z et al.,Metabolic Engineering2013,20:146–156)。
如本文所用,术语“表达量增加”是指与野生型相比,目标蛋白在细胞中以较高水平产生,即过表达。
目标蛋白的表达量增加可通过增加编码目标蛋白的多核苷酸的拷贝数的方式实现,例如将一或多个额外拷贝的外源多核苷酸导入宿主细胞。如本文所用,术语“外源多核苷酸”是指对于宿主细胞并非天然的多核苷酸,其包括来自与宿主细胞相同种属的同源多核苷酸和来自与宿主细胞不同种属的异源多核苷酸。
可以通过许多已知的技术将位于表达载体中的外源多核苷酸导入宿主细胞,包括但不限于:热激转化,电穿孔,DEAE-葡聚糖转染,显微注射,脂质体介导的转染,磷酸钙沉淀,原生质融合,微粒轰击,病毒转化及类似技术。
目标蛋白的表达量增加还可以通过使用强启动子的方式实现,例如增加用于驱动编码序列的表达的启动子的强度或改变所述启动子的类型。
在一些实施方案中,可利用同源重组将编码目标蛋白的内源基因的启动子替换成导致目标蛋白表达量增加的启动子,例如强启动子。所述强启动子例如组成型或诱导型启动子。在另一些实施方案中,可利用同源重组将诱导型或组成型启动子和编码目标蛋白的基因或转录因子基因整合到基因组的另一基因座中。
目标蛋白的表达量增加还可以通过本领域已知的其他常规方式实现,例如增加核糖体结合位点或Kozak序列的强度,对编码区进行结构修饰,改变密码子使用,增加mRNA转录物的稳定性,增加蛋白的稳定性,利用宿主细胞的天然机制(例如,热休克、应激、重金属或抗生素暴露)诱导目标蛋白过表达等。例如本发明的萜类经证实能诱导PDR5过表达。
目标蛋白的表达量增加还可通过上述方式的任意组合实现,例如使用含有导致宿主细胞中目标蛋白过表达的启动子的质粒将编码目标蛋白的外源多核苷酸导入该宿主细胞中。
如本文所用,术语“活性增加”是指与在野生型宿主细胞中相比,目标蛋白的特定生物学功能增加。本发明中PDR5蛋白的活性增加是指与在野生型宿主细胞中相比,重组宿主细胞中PDR5蛋白通过生物膜转运分子和离子的功能增加。
如本文所用,术语“载体”是指线性的或环状的DNA分子,其包含编码目标蛋白的多核苷酸,并与供用于其表达的调控序列可操作地连接。用于本发明的载体包括在宿主细胞中自主复制的载体,如质粒载体;还包括能够整合到宿主细胞基因组中并和宿主细胞基因一起复制的载体。可商购获得适于本发明的载体。
如本文所用,术语“分离的”多核苷酸是指从至少一种与其天然结合的成分分离的多核苷酸。
如本文所用,术语“转运蛋白”是指参与将分子和离子移动通过生物膜的一种膜蛋白。目前已知的转运蛋白家族包括SMR家族、RND家族、MATE家族和ABC转运蛋白家族等。
ABC转运蛋白利用腺苷三磷酸(ATP)水解的能量参与多种底物,例如代谢产物、脂质和固醇以及药物的跨膜运输。截至目前,拟南芥和水稻基因组中分别有129种和128种ABC转运蛋白;酿酒酵母和白念珠菌中分别有31种和28种ABC转运蛋白。以酿酒酵母为例,其ABC转运蛋白超家族成员分为6个亚族,非限制性实例包括PDR5、PDR10、PDR15、SNQ2、YOR1、YOL075C和PDR18等。
ABC转运蛋白通常具有不同的底物特异性,本领域技术人员并不完全知晓不同的ABC转运蛋白与其底物的对应关系。以PDR5为例,之前有报道内源PDR5基因的删除导致酵母对丁醇的耐受性增加。本发明发现,PDR5基因的删除导致酵母对萜类耐受性的降低,而其过表达导致酵母对萜类或含萜精油耐受性的增加。
PDR5(pleiotropic drug resistance 5)基因编码一种涉及细胞内外物质交换的细胞质膜ABC转运蛋白PDR5,酿酒酵母PDR5基因的GenBank号为Z75061.1。
作为示例,本发明使用的PDR5基因是酿酒酵母PDR5基因,特别是由SEQ ID NO:1的核酸序列组成的酿酒酵母PDR5基因。
作为示例,本发明使用的PDR5蛋白是酿酒酵母PDR5蛋白,特别是由SEQ ID NO:139的氨基酸序列组成的酿酒酵母PDR5蛋白。
本领域技术人员应当理解,上述基因/蛋白或其序列仅为例证,任何该基因/蛋白的功能类似物或经基因/蛋白序列的任意常规调整获得的同样能提高宿主细胞对萜类或含萜精油的耐受性的基因/蛋白序列的等同技术方案均在本发明的保护范围之内。
用于特定萜类生产的外源多核苷酸,如橙花叔醇合成酶基因,吉玛烯A合成酶基因,香紫苏醇生产的,焦磷酸赖百当烯二醇酯合酶基因和香紫苏醇合酶基因等,可根据实际生产需要用于本发明。
如本文所用,术语“萜类”是指数量大且多样的一类有机分子,该分子衍生自以多种方式组装和修饰并且根据组成员中所用的类异戊二烯单元的数目分组的五碳类异戊二烯单元。例如,半萜具有一个类异戊二烯单元,单萜具有两个类异戊二烯单元,倍半萜具有三个类异戊二烯单元,二萜具有四个异戊二烯单元,三萜具有六个类异戊二烯单元,四萜具有八个类异戊二烯单元。萜类有链形的,环状的,还有饱和程度不同的烯键。萜类经过化学修饰,如氧化、碳链重排,可以形成大量的类萜,其也属于本发明的萜类。
如本文所用,术语“含萜精油”是指从植物的花、叶、茎、根或果实中通过水蒸气蒸馏法、挤压法、冷浸法或溶媒等提取法提炼萃取的含有萜类的挥发性芳香物质。本发明重组宿主细胞对包含萜类的含萜精油的耐受性也提高,所述含萜精油例如选自莪术油、姜黄油、甜橙油、薄荷油、紫苏油和檀香油,优选莪术油、姜黄油和檀香油。
本发明成功筛选和鉴定到能提高宿主细胞例如酿酒酵母对萜类或含萜精油耐受性的ABC转运蛋白PDR5,并构建了对萜类或含萜精油耐受性提高的宿主细胞,为萜类的高效生物合成奠定了基础。
实施例
为使本发明的技术方案和优点更加清楚,下面将通过实施例对本发明实施方式作进一步地详细描述。应当理解实施例不应理解为限制性的,本领域技术人员能够基于本发明的原理对实施方式做进一步的调整。
实施例1:系列萜类对酿酒酵母CEN.PK2-1D生长的影响
取适量DMSO溶剂配制表1所列萜类或含萜精油(均购自上海源叶生物科技有限公司)的储备母液(终浓度均为10g/L)备用。在固体选择培养基1中活化酿酒酵母CEN.PK2-1D(以下简称NK2,购自欧洲酿酒酵母保藏中心(EUROSCARF)),固体选择培养基1组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),2%葡萄糖,0.01%Leu.(亮氨酸),0.005%His.(组氨酸),0.01%Ura.(尿嘧啶),0.01%Trp.(色氨酸)和2%琼脂粉。然后接种于相应液体选择培养基1中,液体选择培养基1组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His,2%葡萄糖,0.01%Leu.,0.005%His.,0.01%Ura.0.01%Trp.。于30℃,250rpm培养16小时制备种子液。将种子液分别接种于含4ml液体选择培养基1的试管中,再分别加入适量的萜类或含萜精油储备母液,使其终浓度分别如表1所示。于30℃,250rpm培养8小时,用酶标分析仪于600nm测样品OD值。以萜类或含萜精油浓度0mg/L为对照参比计算抑制率(抑制率=(1-添加GMA生长OD/对照参比OD)×100%。并以抑制率50%以上的最低浓度孔中的药物浓度计为MIC50,单位mg/L。
表1:系列萜类或含萜精油对酿酒酵母的抑制
Figure BDA0001160100440000061
如表1,不同浓度的萜类或含萜精油对常见的酿酒酵母工程底盘菌株NK2的生长存在明显抑制作用。
实施例2:酵母细胞ABC和MATE类转运蛋白突变株系构建
1.pEASY-Trp-URA质粒的构建
分别以A:pRS313-TRP-PGK1-MAA45-CYC1t(记载在中国专利201610236283.9中,公众可以从中国科学院天津工业生物技术研究所中获得)和B:pHUra-δDNA(Zhubo Dai,YiLiu,Luqi Huang,Xueli Zhang,Biotechnology and Bioengineering,2012,109(11):2845-2853。公众可以从中国科学院天津工业生物技术研究所中获得)为模板,使用表2中引物扩增TRP-URA-BamH1(1253bp)、BamH1-TRP-URA(1184bp),扩增体系为:5×Phusion HFBuffer 10μL、dNTP(10mM每种dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性2分钟(1个循环);98℃变性10秒、退火10秒(退火温度58℃)、72℃延伸1分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环)。
表2:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000071
BamH1分别酶切TRP-URA-BamH1、BamH1-TRP-URA,割胶纯化两个片段,两个基因片段各50ng加入连接体系:2μL 10×T4DNA Ligase Reaction Buffer(NEB公司)、1μLT4ligase(NEB公司,400,000cohesive end units/ml),补充蒸馏水至20μL,室温反应2小时得到连接产物,取1μL连接产物加入扩增体系:5×Phusion HF Buffer(NEB公司)10μL、dNTP(10mM每种dNTP)1μL、DNA模板20ng、加引物TRP-F(10μM)和URA-R(10μM)各1μL、PhusionHigh-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)(NEB公司)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性2分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸均用1.5分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环)。
将目标大小片段扩增产物克隆到pEASY-Blunt克隆载体(购自北京全式金生物技术有限公司)。克隆体系为:1μL PCR扩增产物、1μL pEASY-Blunt克隆载体,轻轻混合、25℃反应10分钟后,加入50μL Trans10感受态细胞中(购自北京全式金生物技术有限公司),冰浴30分钟。42℃热激30秒,立即至于冰上2分钟。加入800μL LB培养基,250rpm,37℃孵育1小时,取200μL菌液涂在含有氨苄青霉素的LB平板上,过夜培养后,PCR筛选5个阳性单菌落,将阳性克隆进行液体培养,提取阳性克隆质粒进行测序验证,测序结果表明在载体pEASY-Blunt上插入目的片段,得到质粒:pEASY-TRP-URA。
2.突变株系的构建
2.1同源重组法基因敲除
同源重组法基因敲除是应用DNA同源重组原理,将含有营养缺陷型筛选标记的同源DNA片段导入受体细胞,使同源片段在原有位置替代了靶基因片段,并通过营养缺陷型培养基筛选出丧失该基因活性的菌株。敲除主要分为两步,第一,同源重组片段的制备,同源重组片段分为两部分,第一部分是带有筛选标记的同源重组片段,通过PCR扩增得到含有50bp同源区域和TRP-URA筛选标记的同源重组片段Gene-TU,第二部分是含有500-600bp同源区域的同源重组片段Gene-Up、Gene-Down;第二,体内同源重组,将扩增到的同源重组片段通过电击法整合到受体细胞中,使其发生同源重组。敲除原理参见图1。
2.2同源重组片段制备
分别以C:pEASY-TRP-URA(可从本实施例:步骤1中获得)和D:CEN.PK2-1D基因组(使用康为世纪酵母基因组提取试剂盒(货号:CW0569),根据厂商说明提取基因组)为模板和表3中的引物,扩增敲除模块:M1(ScPDR5-TU、ScPDR5-UP、ScPDR5-Down),M2(ScPDR10-TU、ScPDR10-UP、ScPDR10-Down),M3(ScPDR11-TU、ScPDR11-UP、ScPDR11-Down),M4(ScPDR12-TU、ScPDR12-UP、ScPDR12-Down),M5(ScPDR15-TU、ScPDR15-UP、ScPDR15-Down),M6(ScAUS1-TU、ScAUS1-UP、ScAUS1-Down),M7(ScYOR1-TU、ScYOR1-UP、ScYOR1-Down),M8(ScSNQ2-TU、ScSNQ2-UP、ScSNQ2-Down),M9(ScSTE6-TU、ScSTE6-UP、ScSTE6-Down),M10(ScSCE1-TU、ScSCE1-UP、ScSCE1-Down),M11(ScSCE2-TU、ScSCE2-UP、ScSCE2-Down),M12(ScSCE3-TU、ScSCE3-UP、ScSCE3-Down),敲除模块均为三个基因片段摩尔比1:1:1混合。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μl、dNTP(10mM每种dNTP)1μl、DNA模板20ng、引物(10μM)各1μl、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μl)0.5μl、补加蒸馏水至总体积50μl。扩增条件为98℃预变性1.5分钟(1个循环);98℃变性10秒、退火10秒(退火温度58℃)、72℃延伸均用2分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环),产物经割胶回收保存。
表3:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000081
Figure BDA0001160100440000091
Figure BDA0001160100440000101
Figure BDA0001160100440000111
2.3菌株的构建
出发菌酿酒酵母NK2于液体培养基1(液体培养基配方参考实施例1)中过夜培养,取1ml(OD约0.6-1.0)分装到1.5ml EP管中,4℃、10000g离心1min,弃上清,沉淀用无菌水(4℃)洗涤,同样条件下离心,弃上清。菌体加入1ml处理液(10mM LiAc;10mM DTT;0.6Msorbitol;10mM Tris-HCl(pH7.5),处理液使用时才加DTT),25℃下放置20min。离心,弃上清,菌体中加入1ml 1M sorbitol(0.22μM水系膜过膜除菌)重悬,离心,弃上清(用1Msorbitol重悬二次),到最终体积约为90μl,同样方法制备12管。分别加入敲除模块M1、M2、M3、M4、M5、M6、M7、M8、M9、M10、M11、M12(敲除模块可从本实施例:步骤2.2中获得)片段4.5μL,混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于筛选固体培养基2中,固体培养基2组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),0.01%Leu.,0.005%His.,2%葡萄糖和2%琼脂粉。筛选培养的条件为:30℃,培养36h以上。PCR验证和测序鉴定出正确的阳性克隆,分别命名为菌株NK2-ScPDR5、NK2-ScPDR10、NK2-ScPDR11、NK2-ScPDR12、NK2-ScPDR15、NK2-ScAUS1、NK2-ScYOR1、NK2-ScSNQ2、NK2-ScSTE6、NK2-ScSCE1、NK2-ScSCE2、NK2-ScSCE3。菌株信息如表4。
表4:工程菌株信息表
Figure BDA0001160100440000112
Figure BDA0001160100440000121
实施例3:筛选和鉴定与萜类耐受性相关的转运蛋白
1.提高GMA耐受性的转运蛋白筛选
分别在固体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)中活化NK2,在固体选择培养基2(培养基配方参考实施例2)中活化NK2-ScPDR5、NK2-ScPDR10、NK2-ScPDR11、NK2-ScPDR12、NK2-ScPDR15、NK2-ScAUS1、NK2-ScYOR1、NK2-ScSNQ2、NK2-ScSTE6、NK2-ScSCE1、NK2-ScSCE2、NK2-ScSCE3,分别接种于相应液体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)和液体选择培养基2中,液体培养2组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),0.01%Leu.,0.005%His.,2%葡萄糖。于30℃,250rpm培养16h制备种子液。将种子液分别接种于含GMA(终浓度为5mg/L)或不含GMA的4ml相应液体选择培养基的试管中于30℃,250rpm培养8小时,用酶标分析仪于600nm测样品OD值。以药物浓度0mg/L为对照参比计算抑制率。(抑制率=(1-添加GMA生长OD/对照参比OD)×100%)。
如图2,当在培养基中添加GMA时,ABC转运蛋白ScPDR5缺失的菌株NK2-ScPDR5的生长与对照菌株相比,生长明显受到抑制。
2.提高GMA耐受性的转运蛋白功能鉴定
2.1过表达ScPDR5及对照菌株的构建
2.1.1pRS313-TRP-TEF1-MAA45-CYC1t质粒的构建
以pM3-ERG9(记载在中国专利申请201210453416.X中,可从中国科学院天津工业生物技术研究所获得)为模板及引物列表5中引物,扩增TEF1(450bp)。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM每种dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为98℃预变性2分钟(1个循环);98℃变性10秒、退火10秒(退火温度58℃)、72℃延伸1分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环)。
表5:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000122
用Pac1和SexA1对扩增片段TEF1和质粒pRS313-TRP-PGK1-MAA45-CYC1t进行双酶切,胶回收片段TEF1和pRS313-TRP-MAA45-CYC1t将所得片段各50ng加入连接体系:2μL 10×T4DNA Ligase Reaction Buffer(NEB公司)、1μL T4ligase(NEB公司,400,000cohesiveend units/ml),补充蒸馏水至20μL,室温反应2小时得到连接产物,转入Trans10感受态细胞中和测序验证(方法同实施例2:步骤1)。得到质粒:pRS313-TRP-TEF1-MAA45-CYC1t。
2.1.2对照pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t质粒的构建
以pYM–N9(Carsten Janke,Maria M.Magiera and Nicole Rathfelder,et al.,Yeast 2004;21:947–962.可从中国科学院天津工业生物技术研究所获得)为模板及引物列表5中引物,扩增GFP(828bp)。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM每种dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为98℃预变性2分钟(1个循环);98℃变性10秒、退火10秒(退火温度58℃)、72℃延伸1分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环)。
用SexA1和Asc1对扩增片段GFP和质粒pRS313-TRP-TEF1-MAA45-CYC1t(可以从本实施例:步骤2.1.1中获得)进行双酶切,胶回收片段GFP和pRS313-TRP-TEF1-…-CYC1t,将所得片段各50ng加入连接体系:2μL 10×T4DNA Ligase Reaction Buffer(NEB公司)、1μLT4ligase(NEB公司,400,000cohesive end units/ml),补充蒸馏水至20μL,室温反应2小时得到连接产物,转入Trans10感受态细胞中和测序验证(方法同实施例2:步骤1)。得到pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t质粒。
2.1.3菌株NK2+ScPDR5和NK2+GFP构建
以E:pRS313-TRP-TEF1-MAA45-CYC1t(可以从本实施例:步骤2.1.1中获得)和D:CEN.PK2-1D基因组(可从实施例2:步骤2.2中获得)为模板及列表6中引物,扩增Asse-313-TRP-TEF1-CYC1t(6680bp)、Asse-ScPDR5(4550bp)、Helper-TEF1(550bp)、Helper-CYC1(550bp),扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM每种dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性2分钟(1个循环);98℃变性10秒、退火10秒(退火温度58℃)、72℃延伸3分钟(32个循环);72℃延伸8分钟(1个循环)。胶回收备用。
表6:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000131
采用和实施例2:步骤2.3中相同的方法进行NK2感受态细胞的制备及转化,分别加入片段Asse-313-TRP-TEF1-CYC1t、Asse-ScPDR5、Helper-TEF1、Helper-CYC1共6μL(摩尔比为1:1:1:1)和质粒pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t(可从本实施例:步骤2.2.2中获得)混匀后分别转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体选择培养基3中,固体选择培养基3组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),0.01%Leu.,0.005%His.0.01%Ura.,2%葡萄糖和2%琼脂粉。筛选培养的条件为:30℃,培养36h以上。PCR鉴定出正确的阳性克隆,命名为菌株NK2+ScPDR5和NK2+GFP。
2.2调控ScPDR5基因表达对GMA耐受性的变化
在固体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)中活化NK2,并将其接种于相应液体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)中于30℃,250rpm培养16h制备种子液,在固体选择培养基3(培养基配方参考本实施例:步骤2.1.3)中活化NK2+GFP、NK2-ScPDR5(可从实施例2中获得)和NK2+ScPDR5,并将其接种于相应液体选择培养基3中,液体选择培养基3组成如下:0.8%酵母选择培养基SD-Trp(购自北京泛基诺科技有限公司),2%葡萄糖。于30℃,250rpm培养16h制备种子液。将种子液NK2、NK2+GFP、NK2+ScPDR5和NK2-ScPDR5接种于含GMA(终浓度为5mg/L)/不含GMA的4ml相应液体选择培养基的试管中,于30℃,250rpm培养8小时,用酶标分析仪于600nm测样品OD值,并以药物浓度0mg/L为对照参比。
如图3,在菌株NK2中过表达ScPDR5基因能显著提高菌株对GMA的耐受性,而菌株NK2、NK2-GFP,NK2-ScPDR5的生长明显受抑制,其中ScPDR5功能的缺失导致菌株对GMA的耐受性显著降低。
实施例4:酿酒酵母中过表达ScPDR5基因能提高菌株对萜类及含萜精油的耐受性
在固体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)中活化NK2,并将其接种于相应液体选择培养基1(培养基配方参考实施例1)中于30℃,250rpm培养16h制备种子液,在固体选择培养基3(培养基配方参考本实施例:步骤2)中活化NK2+GFP、NK2-ScPDR5和NK2+ScPDR5,并将其接种于相应液体选择培养基3(培养基配方参考实施例3)中于30℃,250rpm培养16h制备种子液。将种子液NK2、NK2+GFP、NK2+ScPDR5和NK2-ScPDR5同样分别接种于含各种萜类(终浓度如表7)/不含各种萜类的4ml相应液体选择培养基的试管中,于30℃,250rpm培养8小时,用酶标分析仪于600nm测样品OD值。以药物浓度0mg/L为对照参比计算抑制率。(抑制率=(1-添加GMA生长OD/对照参比OD)×100%)。酿酒酵母中过表达ScPDR5基因能提高菌株对萜类及含萜精油的耐受性,结果如表7。
表7:酿酒酵母中调控ScPDR5基因表达与菌株对萜类及含萜精油的耐受性关系
Figure BDA0001160100440000141
Figure BDA0001160100440000151
表注:“↑”代表耐受性提高
如表7,通过在菌株NK2中敲除和过表达ScPDR5能显著影响菌株对相关萜类或含萜精油的耐受性。在NK2-ScPDR5中,由于ScPDR5功能的缺失导致菌株对相关萜类或含萜精油的耐受性显著降低,抑制率显著提高;相反,在NK2+ScPDR5中,由于ScPDR5的过表达导致菌株对相关萜类或含萜精油的耐受性显著提高,抑制率显著降低。
实施例5:过表达ScPDR5基因对萜类工程菌株的目标产物产量影响
5.1基因元件的获得和所用质粒的构建
5.1.1基因元件的制备
在金斯瑞生物科技有限公司全合成GES基因(SEQ ID NO:2)、SAAT基因(SEQ IDNO:3)、NES基因(SEQ ID NO:4)、LPS基因(SEQ ID NO:5)、TPS基因(SEQ ID NO:6)和SaGGPS基因(SEQ ID NO:7)。
提取酵母菌株NK2-SQ(创建酵母细胞工厂发酵生产羽扇豆醇,中国中药杂志,林庭庭,王冬,戴住波,张学礼,黄璐琦,2016,41(6):1008-1015)的基因组DNA作为模板,用表8中的引物进行扩增,得到ERG20片段(SEQ ID NO:8);以合成的LPS基因和TPS基因为模板,用表8中的引物进行扩增,得到cLPS片段和cTPS片段。
上述扩增体系为:TAKARA
Figure BDA0001160100440000153
HS DNA聚合酶5×PS Buffer 10μL,dNTPMix4μL,引物各1μL,DNA模板1μL,
Figure BDA0001160100440000154
HS聚合酶(2.5U/μL)0.5μL,补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、55℃退火15秒、72℃延伸2.5分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环)。所得PCR产物经纯化后,置于-20℃冰箱,备用。
表8:引物序列
Figure BDA0001160100440000152
Figure BDA0001160100440000161
5.1.2基因元件质粒的构建
5.1.2.1pM2-cLPS和pM2-SAAT质粒的构建
用SexA1和Asc1分别对上述5.1.1中扩增得到的cLPS,全合成的SAAT以及质粒pM2-tHMG1(记载在中国专利ZL201310399947.X中)进行双酶切,得到SAAT酶切产物、cLPS酶切产物和质粒pM2-tHMG1酶切后骨架;再将pM2-tHMG1酶切后骨架分别与酶切产物cLPS和SAAT进行连接,得到重组质粒pM2-cLPS和pM2-SAAT。
5.1.2.2pM4-ERG20和pM4-SaGGPS质粒的构建
用SexA1和Asc1分别对上述5.1.1中得到的ERG20、SaGGPS以及质粒pM11-AtCPR1(pM11-AtCPR1记载在中国专利ZL201310399947.X中,公众可从天津工业生物技术研究所和中国中医科学院中药研究所获得))进行双酶切;得到ERG20和SaGGPS酶切产物和质粒pM11-AtCPR1酶切后骨架;再将ERG20和SaGGPS酶切产物分别与质粒pM11-AtCPR1酶切后骨架连接,得到重组质粒pM4-ERG20和pM4-SaGGPS。
5.1.2.3pM3-cTPS和pM3-GES质粒的构建
用SexA1和Asc1分别对上述5.1.1中扩增得到的cTPS,全合成的GES以及质粒pM3-ERG9(记载在中国专利申请201210453416.X中)进行双酶切;得到GES酶切产物、cLPS酶切产物和质粒pM3-ERG9酶切后骨架;再将pM3-ERG9酶切后骨架分别与酶切产物cTPS和GES进行连接,得到重组质粒pM3-cTPS和pM3-GES。
5.1.2.4pEASY-GAL80-LEU2质粒的构建
分别以NK2-SQ基因组DNA和pRS425(Sikorski,R.S.and Hieter,P.1989,Genetics122(1):19-27,公众可从天津工业生物技术研究所和中国中医科学院中药研究所获得)为模板,用引物表9中引物,扩增GAL80和LEU2。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM each dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-FidelityDNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。
扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸1分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环)。将扩增产物GAL80克隆到pEASY-BluntSimple克隆载体转化,测序验证,得到质粒pEASY-GAL80。
表9:引物序列
Figure BDA0001160100440000162
PmeI酶切pEASY-GAL80,割胶纯化5145bp目的片段(30ng),加入4μL NEB buffer、1μL CIP去磷酸化酶(NEB公司),补充蒸馏水至40μL,37℃处理1h,加入终浓度为10μmol的EDTA,65℃30min终止反应,割胶回收目的片段pEASY-GAL80,备用。
割胶纯化LEU2(30ng),加入4μL10×T4DNA Ligase Reaction Buffer(NEB公司)、1μL T4Polynucleotide kinase(NEB公司),补充蒸馏水至40μL,37℃磷酸化1h;割胶回收后,与pEASY-GAL80用T4DNA连接酶连接(NEB公司),转化,测序验证,得到质粒pEASY-GAL80-LEU2。
5.1.2.5pRS313-LEU2-PTEF1-SynSmFPS-GGGS-NES-TCYC1质粒的构建
以SynSmFPS(记载在中国专利201610961269.5上,公众可以从中国科学院天津工业生物技术研究所中获得)和NES为模板,用表10中引物分别扩增得到SynSmFPS-GGGS和GGGS-SynNES。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM each dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、55℃退火15秒、72℃延伸2分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环)。所得PCR产物经纯化后,置于-20℃冰箱,备用。
表10:引物序列
Figure BDA0001160100440000171
以SynSmFPS-GGGS和GGGS-NES共同作为模板,用表10中引物(SexA1-SynSmFPS和NES-Asc1-R)扩增得到SynSmFPS-GGGS-NES片段。
扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM each dNTP)1μL、DNA模板SynSmFPS-GGGS和GGGS-NES各20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-Fidelity DNAPolymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸2分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环)。
将扩增产物纯化,然后用SexA1和Asc1酶切,割胶回收目的片段SexA1-SynSmFPS-GGGS-NES-Asc1,备用。
将质粒pRS313-LEU2-PTEF1-STpGMAS-TCYC1(记载在中国专利201610961269.5上,公众可以从中国科学院天津工业生物技术研究所中获得)用SexA1和Asc1酶切,割胶回收大片段,得到载体pRS313-LEU2-PTEF1-...-TCYC1;将载体pRS313-LEU2-PTEF1-...-TCYC1与SexA1-SynSmFPS-GGGS-NES-Asc1各50ng加入连接体系:2μL 10×T4DNA Ligase Reaction Buffer(NEB公司)、1μL T4DNA Ligase(NEB公司,400,000cohesive end units/ml),补充蒸馏水至20μL,室温反应2小时得到连接产物,转入Trans10感受态细胞中,提取质粒测序验证,得到pRS313-LEU2-PTEF1-SynSmFPS-GGGS-NES-TCYC1质粒。
表11:质粒信息
Figure BDA0001160100440000181
5.2单萜香叶酯
5.2.1功能模块的制备
分别用表12中描述的PCR模板和引物进行PCR获得功能模块:M21(GAL80-LEU2-up),M22(PPGK1-SAAT-TADH1),M23(PTDH3-ERG20-TTPI1),M24(PTEF1-GES-TCYC1),M25(GAL80-LEU2-down)。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM each dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸均用2分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环),产物经割胶回收保存。
表12:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000182
Figure BDA0001160100440000191
5.2.2香叶酯工程菌的构建
采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行FPP-001(记载在中国专利201610961269.5上,公众可以从中国科学院天津工业生物技术研究所中获得)感受态细胞的制备。然后,在感受态中分别加入片段M21、M22、M23、M24、M25共5μL(摩尔比为1:1:1:1:1)混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基4(固体培养基4配方如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),0.01%Trp.,2%葡萄糖和2%琼脂粉)中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,命名为菌株GE-001;在此基础上,采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行GE-001感受态细胞的制备。然后,将对照质粒pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t和4μL片段混合物(Asse-313-TRP-TEF1-CYC1t、Asse-ScPDR5、Helper-TEF1、Helper-CYC1,摩尔比为1:1:1:1)分别加入到两管GE-001感受态细胞中,混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基5(固体培养基5配方如下:0.8%酵母选择培养基SD-Ura-Trp-Leu-His(购自北京泛基诺科技有限公司),2%葡萄糖和2%琼脂粉)中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,获得对照菌株GE-CK和ScPDR5过表达菌株GE+ScPDR5。
5.2.3工程菌培养及产物提取
在固体培养基5中活化5.1.2.2制备的GE-CK和GE+ScPDR5,于相应液体选择培养基中制备种子液(30℃,250rpm,16h),以1%的接种量接种于含15mL液体选择培养基的100mL三角瓶中,30℃,250rpm振荡培养3天,然后加入2.25mL正己烷,继续震荡培养1h。最后,将三角瓶中液体转移至50mL离心管,5000rpm离心5min,收集有机相过有机尼龙膜(0.22μm),用GC-MS检测。检测仪器:安捷伦气质联用仪Agilent 7890A/5975C。GC-MS测定条件:进样口温度250℃,进样体积1μL,不分流,溶剂延时5min;色谱柱:HP-5ms(30m*0.25mm);色谱条件:45℃,1min,10℃/min到220℃保温5min;MS条件:Full Scan:45-700amu。备用。用香叶酯的标准品进行定性定量,香叶酯标准品在西格玛公司购买(货号:45896)。
结果:工程菌GE-CK和GE+ScPDR5发酵3天时香叶酯产量分别为0.09mg/(L·OD)和0.13mg/(L·OD),后者香叶酯的产量较前者提高了41%。
5.3倍半萜橙花叔醇
5.3.1功能模块的制备
分别用表13中描述的PCR模板和引物进行PCR获得功能模块:M26(GAL80-LEU2-up),M27(PTEF1-SynSmFPS-GGGS-NES-TCYC1),M28(GAL80-LEU2-down)。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mM each dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-Fidelity DNA Polymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸均用2分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环),产物经割胶回收保存。
表13:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000201
5.3.2橙花叔醇工程菌的构建
采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行FPP-001感受态细胞的制备。然后,在感受态中分别加入片段M26、M27、M28共3μL(摩尔比为1:1:1)混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基4中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,命名为菌株NE-001;在此基础上,采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行NE-001感受态细胞的制备。然后,将对照质粒pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t和4μL片段混合物(Asse-313-TRP-TEF1-CYC1t、Asse-ScPDR5、Helper-TEF1、Helper-CYC1,摩尔比为1:1:1:1)分别加入到两管NE-001感受态细胞中,混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基5中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,分别获得对照菌株NE-CK和ScPDR5过表达菌株NE+ScPDR5。
5.3.3工程菌培养及产物提取
在固体选择培养基5中活化5.3.2制备的工程菌株NE-CK和NE+ScPDR5,于相应液体选择培养基中制备种子液(30℃,250rpm,16h),以1%的接种量接种于含15mL相应液体选择培养基的100mL三角瓶中,30℃,250rpm振荡培养1天,然后加入1.5mL正十二烷,继续震荡培养5天。最后,将三角瓶中液体转移至50mL离心管,5000rpm离心5min,收集有机相,用正己烷稀释10倍,过有机尼龙膜(0.22μm),用GC-MS检测。检测仪器:安捷伦气质联用仪Agilent7890A/5975C。GC-MS测定条件:进样口温度250℃,进样体积1μL,不分流,溶剂延时3min;色谱柱:HP-5ms(30m*0.25mm);色谱条件:45℃,1min,10℃/min到300℃保温5min;MS条件:Full Scan:50-750amu。备用。用橙花叔醇的标准品对样品进行定性定量橙花叔醇标准品在西格玛公司购买(货号:81431)。
结果:工程菌NE-CK和NE+ScPDR5发酵6天时橙花叔醇产量分别达到13.9mg/(L·OD)和15.0mg/(L·OD),后者橙花叔醇的产量较前者提高了8%。
5.4二萜香紫苏醇
5.4.1功能模块的制备分别用表14中描述的PCR模板)和引物进行PCR获得功能模块:M29(GAL80-LEU2-up),M30(PPGK1-cLPS-TADH1),M31(PTDH3-SaGGPPS-TTPI1),M32(PTEF1-cTPS-TCYC1),M33(GAL80-LEU2-down)。扩增体系为:5×Phusion HF Buffer 10μL、dNTP(10mMeach dNTP)1μL、DNA模板20ng、引物(10μM)各1.5μL、Phusion High-Fidelity DNAPolymerase(2.5U/μL)0.5μL、补加蒸馏水至总体积50μL。扩增条件为:98℃预变性3分钟(1个循环);98℃变性10秒、58℃退火10秒、72℃延伸均用2分钟(30个循环);72℃延伸10分钟(1个循环),产物经割胶回收保存。
表14:PCR体系信息表
Figure BDA0001160100440000211
Figure BDA0001160100440000221
5.4.2香紫苏醇底盘细胞的构建
采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行FPP-001感受态细胞的制备。然后,在感受态中分别加入片段M29、M30、M31、M32、M33共5μL(摩尔比为1:1:1:1:1)混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基4中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,命名为菌株SC-001;在此基础上,采用和实施例2:步骤3中相同的方法进行SC-001感受态细胞的制备。然后,将pRS313-TRP-TEF1-GFP-CYC1t和4μL片段混合物(Asse-313-TRP-TEF1-CYC1t、Asse-ScPDR5、Helper-TEF1、Helper-CYC1,摩尔比为1:1:1:1)分别加入到两管SC-001感受态细胞中,混匀后转移至电转杯中,2.7kv电击5.7ms,加入1ml 1M sorbitol,30℃复苏1h,涂布于固体培养基5中,30℃,培养36h以上,PCR鉴定出正确的阳性克隆,获得对照菌株SC-CK和ScPDR5过表达菌株SC+ScPDR5。
5.4.3工程菌培养及产物提取
在固体选择培养基5中活化5.4.2制备的工程菌株SC-CK和SC+ScPDR5,于相应液体选择培养基中制备种子液(30℃,250rpm,16h),以1%的接种量接种于含15mL相应液体选择培养基的100mL三角瓶中,30℃,250rpm振荡培养1天,然后加入1.5mL正十二烷,继续震荡培养5天。最后,将三角瓶中液体转移至50mL离心管,5000rpm离心5min,收集有机相,用正己烷稀释10倍,过有机尼龙膜(0.22μm),用GC-MS检测。检测仪器:安捷伦气质联用仪Agilent7890A/5975C。GC-MS测定条件:进样口温度300℃,进样体积1μL,不分流,溶剂延时5min;色谱柱:HP-5ms(30m*0.25mm);色谱条件:50℃,2min,20℃/min到280℃保温4min,20℃/min到300℃保温7.5min;MS条件:Full Scan:20-600amu。备用。用香紫苏醇的标准品进行定性定量,香紫苏醇标准品在西格玛公司购买(货号:49944)。
结果:工程菌株SC-CK和SC+ScPDR5发酵6天时香紫苏醇产量分别达到1.34mg/(L·OD)和1.67mg/(L·OD),后者香紫苏醇的产量较前者提高了25%。
序列表
<110> 中国科学院天津工业生物技术研究所
张学礼
戴住波
张丽丽
王冬
刘芸
马晓琳
<120> 对萜类或含萜精油耐受性提高或萜类产量提高的重组宿主细胞、其产生方法及其用途
<160> 138
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 4536
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<400> 1
atgcccgagg ccaagcttaa caataacgtc aacgacgtta ctagctactc ctccgcgtct 60
tcttctactg aaaacgctgc tgatctacac aattataatg ggttcgatga gcatacagaa 120
gctcgaatcc aaaaactggc aaggactctg accgcacaga gtatgcaaaa ctccactcaa 180
tcggcaccca acaaaagtga tgctcagtct atattttcta gcggtgtgga aggtgtaaac 240
ccgatattct ctgatcctga agctccaggc tatgacccaa aattggaccc caactccgaa 300
aatttttcta gtgccgcctg ggttaagaat atggctcacc taagtgcggc agaccctgac 360
ttttataagc cttattcctt aggttgcgct tggaagaact taagtgcttc tggtgcttcc 420
gcagatgtcg cctatcagtc aactgtggtt aatattccat acaaaatcct aaaaagtggg 480
ctgagaaagt ttcaacgttc taaagaaacc aatactttcc aaatcttgaa accaatggat 540
ggttgcctaa acccaggtga attgctagtc gttttaggta gaccaggctc tggctgtact 600
actttattaa aatccatctc ttcaaatact catggttttg atcttggtgc agatactaaa 660
atttcttaca gcggctactc aggtgatgat attaagaaac attttcgtgg tgaagttgtt 720
tacaacgcag aagctgatgt acatctgcct catttaacag tcttcgaaac tttggttaca 780
gtagcgaggt tgaaaacccc acagaaccgt atcaagggtg tcgataggga aagttatgcg 840
aatcatttgg cggaagtagc aatggcaacg tacggtttat cgcatacaag gaatacaaaa 900
gttggtaacg acatcgtcag aggtgtttcc ggtggtgaaa ggaagcgtgt ctccattgct 960
gaagtctcca tctgtggatc caaatttcaa tgctgggata atgctacaag gggtttggat 1020
tccgctaccg ctttggaatt tattcgtgcc ttaaagactc aagctgatat ttccaataca 1080
tctgccacag tggccatcta tcaatgttct caagatgcgt acgacttgtt caataaagtc 1140
tgtgttttgg atgatggtta tcagatctac tatggccccg ccgataaggc caagaagtac 1200
tttgaagata tggggtatgt ttgtccaagc agacaaacca ccgcagattt tttgacctca 1260
gttacaagtc cctctgagag aaccctgaac aaagatatgc taaaaaaagg tattcatata 1320
ccacagaccc cgaaggaaat gaacgattac tgggtaaaat ctccaaatta caaagagcta 1380
atgaaagaag tcgaccaacg attattgaat gacgatgaag caagccgtga agctattaag 1440
gaagcccaca ttgctaagca gtccaagaga gcaagacctt cctctcctta tactgtcagc 1500
tacatgatgc aagttaaata cctattaatc agaaatatgt ggagactgcg aaataatatc 1560
gggtttacat tatttatgat tttgggtaac tgtagtatgg ctttaatctt gggttcaatg 1620
tttttcaaga tcatgaaaaa gggtgatact tctacattct atttccgtgg ttctgctatg 1680
ttttttgcaa ttctattcaa tgcattttct tctctgttag aaatcttttc gttatatgag 1740
gccagaccaa tcactgaaaa acatagaaca tattcgttat accatccaag tgctgacgct 1800
tttgcatcag ttctatcaga aataccctca aagttaatca tcgctgtttg cttcaatata 1860
atcttctatt tcttagtaga ctttagaaga aatggtggtg tattcttttt ctacttatta 1920
ataaacattg tcgcggtttt ctccatgtct cacttgttta gatgtgttgg ttccttaaca 1980
aagacattgt cagaagctat ggttcccgct tctatgttat tgttggctct atccatgtat 2040
accggttttg ctattcctaa gaagaagatc ctacgttggt ctaaatggat ttggtatatc 2100
aatccgttgg cttacttatt cgaatctttg ttaattaacg agtttcatgg tataaaattc 2160
ccctgcgctg aatatgttcc tcgtggtcct gcgtatgcaa acatttctag tacagaatct 2220
gtttgtaccg tggttggagc tgttccaggc caagactatg ttctgggtga tgatttcatt 2280
agaggaactt atcaatacta ccacaaagac aaatggcgtg gtttcggtat tggtatggct 2340
tatgtcgtct tctttttctt tgtctatcta ttcttatgtg aatacaacga gggtgctaaa 2400
caaaaaggtg aaatattagt tttcccacgc agtatagtta aaagaatgaa gaaaagaggt 2460
gtactaactg aaaagaatgc aaatgacccc gaaaacgttg gggaacgtag tgacttatcc 2520
agcgatagga aaatgctaca agaaagctct gaagaggaat ccgatactta cggagaaatt 2580
ggtttatcca agtcagaggc tatatttcac tggagaaacc tttgttacga agttcagatt 2640
aaggccgaaa caagacgtat tttgaacaat gttgatggtt gggttaaacc aggtacttta 2700
acagctttaa tgggtgcttc aggtgctggt aaaaccacac ttctggattg tttggccgaa 2760
agggttacca tgggtgttat aactggtgat atcttggtca atggtattcc ccgtgataaa 2820
tctttcccaa gatccattgg ttattgtcag caacaagatt tgcatttgaa aactgccact 2880
gtgagggagt cattgagatt ttctgcttac ctacgtcaac cagctgaagt ttccattgaa 2940
gaaaagaaca gatatgttga agaagttatt aaaattcttg aaatggaaaa atatgctgat 3000
gctgttgttg gtgttgctgg tgaaggttta aacgttgaac aaagaaaaag attaaccatt 3060
ggtgttgaat taactgccaa accaaaactg ttggtctttt tagatgaacc tacttctggt 3120
ttggattctc aaactgcttg gtctatttgt cagctaatga aaaagttggc aaatcatggt 3180
caagcaattc tatgtactat tcaccaaccc tctgctattt tgatgcaaga attcgatcgt 3240
ttactattta tgcaacgtgg tggtaagact gtctactttg gcgacttggg cgaaggttgt 3300
aaaactatga tcgattattt tgaaagccat ggtgctcata aatgccctgc tgacgccaac 3360
ccagctgaat ggatgctaga agttgttggt gcagctccag gctctcatgc aaatcaagat 3420
tattacgaag tttggaggaa ttctgaagag tacagggccg ttcaatctga attagattgg 3480
atggaaagag aattaccaaa gaaaggttcg ataactgcag ctgaggacaa acacgaattt 3540
tcacaatcaa ttatttatca aacaaaattg gtcagtattc gtctattcca gcaatattgg 3600
agatctccag attatttatg gtcgaagttt attttaacta ttttcaatca attgttcatc 3660
ggtttcactt tcttcaaagc aggaacctcg ctacagggtt tacaaaatca aatgttggct 3720
gtgttcatgt ttacggttat tttcaatcct attctacaac aatacctacc atcttttgtc 3780
cagcaaagag atttgtatga ggccagggaa cgcccctcaa ggactttttc ttggatttca 3840
tttatcttcg ctcaaatatt cgtggaagtt ccatggaata tattggcagg tactattgct 3900
tattttatct actattatcc aattggattt tactccaacg cgtctgcagc tggccagttg 3960
catgaaaggg gtgctttatt ttggttgttc tcttgtgctt tctacgttta tgttggttct 4020
atgggtctgc ttgtcatttc attcaaccaa gttgcagaaa gtgcagctaa cttagcctct 4080
ttgttgttta caatgtcttt gtctttttgt ggtgttatga ctaccccaag tgccatgcct 4140
agattttgga tattcatgta cagggtttca cctttgactt atttcattca ggctctgttg 4200
gctgttggtg ttgctaacgt agacgtcaaa tgcgctgatt acgaattgct agaattcaca 4260
ccaccatccg gtatgacatg tgggcagtac atggaaccat atttacaact agcaaagact 4320
ggttacttaa ctgatgaaaa tgccactgac acctgtagtt tctgtcaaat atctacaacc 4380
aatgattact tagctaatgt caattctttc tacagtgaga gatggagaaa ttatggtatc 4440
ttcatctgtt atattgcatt caattatatc gctggtgtct ttttctactg gttagcaaga 4500
gtgcctaaaa agaacggtaa actctccaag aaataa 4536
<210> 2
<211> 1617
<212> DNA
<213> 人工
<400> 2
accwggttct gcttgtactc ctttggcatc tgctatgcca ttgtcttcta ctccattgat 60
taacggtgat aattctcaga gaaaaaatac aagacaacat atggaagagt cttcatctaa 120
aagaagagaa tatttgttgg aagaaacaac aagaaaattg caaagaaacg atactgaatc 180
tgttgagaaa ttaaaattga tagataacat tcaacaatta ggtattggat actattttga 240
agatgctata aatgctgttt tacgttctcc tttttctaca ggtgaagaag atttgtttac 300
agctgcattg agatttaggt tgttgaggca taatggtatt gaaatttctc ctgaaatttt 360
cttgaagttc aaagatgaaa ggggaaagtt cgatgaatct gatactttgg gtttattgtc 420
tttatacgag gcttcaaact tgggtgttgc tggtgaagag attttggagg aggctatgga 480
gttcgctgaa gctaggttga ggaggtcttt gtctgagcca gcagctccat tgcacggtga 540
agttgcacag gctttagacg tcccaaggca cttgagaatg gctagattgg aagctagaag 600
atttattgaa caatacggta agcagtctga ccatgacggt gacttgttgg aattggcaat 660
tttagattat aaccaagtcc aggctcagca ccagtctgaa ttgacagaaa ttattaggtg 720
gtggaaagaa ttgggattgg ttgataaatt atcttttggt agagatagac cattggaatg 780
ctttttgtgg actgtcggtt tgttgccaga gccaaagtat tcttctgtta gaattgagtt 840
ggctaaagct atttctattt tgttggttat tgatgatatt ttcgatacat acggtgaaat 900
ggatgattta attttgttca ctgacgctat tagaaggtgg gacttagagg ctatggaagg 960
tttacctgaa tatatgaaga tttgctacat ggctttgtac aatactacaa acgaagtttg 1020
ttataaagtt ttaagagata ctggtagaat tgttttgtta aatttgaaat caacttggat 1080
tgatatgatt gaaggtttta tggaagaggc taaatggttc aacggaggtt ctgctcctaa 1140
gttggaggaa tatattgaaa atggtgtttc aactgctggt gcttacatgg ctttcgctca 1200
tattttcttt ttaattggag aaggtgttac tcatcaaaat tctcaattgt tcactcaaaa 1260
gccatatcca aaagtctttt ctgctgcagg tagaattttg agattgtggg acgacttggg 1320
tacagctaag gaggagcaag agaggggtga tttagcttct tgtgttcaat tatttatgaa 1380
ggaaaaatca ttgactgaag aggaggctag atctagaatt ttggaagaaa ttaagggttt 1440
atggagagat ttgaatggtg agttggtcta taataagaat ttaccattat caattattaa 1500
agtcgctttg aacatggcta gggcttctca ggtcgtctat aaacacgatc aagatactta 1560
cttttcttct gttgacaatt acgttgatgc tttatttttc actcaataag gcgcgcc 1617
<210> 3
<211> 1374
<212> DNA
<213> 人工
<400> 3
accwggtatg gaaaaaattg aagtctctat taattcaaaa catacaatta agccatcaac 60
atcttcaaca ccattgcagc catataaatt gactttattg gatcagttaa ctccaccagc 120
ttatgttcca attgtcttct tttatccaat tacagatcat gatttcaatt tgccacagac 180
tttggctgac ttgagacagg ctttgtcaga aactttaact ttgtactatc cattatcagg 240
tagagttaaa aataatttgt atatagacga tttcgaagag ggtgtcccat acttggaggc 300
tagggtcaac tgcgacatga ctgatttttt gagattaaga aagattgaat gtttaaacga 360
attcgttcca ataaaaccat tttctatgga agctatatct gatgaaaggt atccattatt 420
gggagttcaa gttaatgttt ttgattcagg tatagctatt ggtgtttctg tttctcataa 480
gttgattgat ggtggtacag ctgattgttt tttgaagtct tggggtgctg ttttcagggg 540
ttgtagggaa aatattattc atccatcttt gtctgaagca gcattgttgt tcccacctag 600
ggatgacttg ccagaaaaat atgttgatca aatggaagct ttatggttcg ctggtaagaa 660
ggtcgctact agaaggtttg tcttcggtgt taaagctatt tcttctattc aagacgaggc 720
taagtctgag tctgtcccta agccatctag agtccacgca gttactggtt ttttgtggaa 780
acatttaata gctgcatcta gagctttgac atctggtaca acatctacta gattgtctat 840
tgcagctcag gctgtcaact tgaggactag aatgaacatg gaaacagttt tagacaacgc 900
aactggtaac ttgttttggt gggctcaggc aattttggaa ttgtctcaca caacacctga 960
aatatctgat ttgaaattat gtgatttggt taacttgtta aatggttctg ttaagcaatg 1020
taacggtgat tattttgaaa cttttaaagg taaggaagga tacggtagaa tgtgtgaata 1080
tttagatttc cagagaacta tgtcttctat ggagccagca ccagatattt acttgttttc 1140
ttcatggaca aatttcttta acccattgga tttcggttgg ggtaggacat cttggattgg 1200
tgttgctggt aagattgagt ctgcttcttg caaattcatt atattggtcc caacacagtg 1260
cggttctggt attgaggcat gggtcaattt ggaggaggag aaaatggcta tgttggagca 1320
ggacccacac tttttggctt tggcttcacc aaagacattg atttaaggcg cgcc 1374
<210> 4
<211> 1722
<212> DNA
<213> 人工
<400> 4
atggctactg ctgcaggtcc aattgcaaca aacaactctc cacaaaactc aaacgcttac 60
agaactccaa ttgcaccatc tgttccaatt acacataaat ggtcaatcgc tgaagatttg 120
acttgtatct ctaacccatc aaagcataac aacccacaaa caggttacag atctttttca 180
gatgaattgt acgttaagta cgaagaaaaa ttggaagatg ttagaaaagc attgagagaa 240
gttgaagaaa atccattgga aggtttagtt atgatcgatg ctttgcaaag attgggtatc 300
gattaccatt tcagaggtga aattggtgca tttttgcaaa agcaacaaat catctcttca 360
actccagatg gttacccaga acatggtttg tacgaagttt ctactttgtt tagattttta 420
agacaagaag gtcataacgt tacagctgat gtttttaata acttcaagga taaggaaggt 480
agattcagat ctgaattgtc aacagatatc agaggtttga tgtctttgta cgaagcatca 540
caattgagaa tcgaaggtga agatatcttg gatcaagctg cagatttctc ttcacaattg 600
ttaggtagat ggactaaaga tccaaatcat catgaagcta gattggtttc taacactttg 660
acacatccat accataaatc attggcaact tttatgggtc aaaaattgtc ttacatgaat 720
tgtaaaggtc caaattggga tggtgttgat aatttgcaag aattggctaa gatggatttg 780
actatcgttc aatcaatcca tcaaaaggaa gttttccaag tttctcaatg gtggaaggat 840
acaggtttgg ctaacgaatt gaaattggca agaaatcaac cattgaaatg gtacatgtgg 900
ccaatggctg cattaactga tccaagattt tcagaagaaa gagttgaatt gacaaaacca 960
atttctttta tatatatcat cgatgatatt tttgatgttt acggtactat cgaagaattg 1020
actttgttta ctgatgctgt taacagatgg gaattgtctg cagttgaaca attgccagat 1080
tacatgaagg tttgtttcaa agcattgtat gatgttacta acgaaatcgc atacaagatc 1140
tataagaaac atggtcaaaa cccaatcgat tctttgcaaa agacttgggc ttcattgtgt 1200
aacgcatttt tagttgaggc taagtggttt gcatctggtc atttgccaaa cgctgaagaa 1260
tatttgaaaa atggtatcat ctcttcaggt gttcatgttg ttttggcaca tatgtttttc 1320
ttgttaggtg acggtattac acaagaatca gttgatttgg ttgatgatta tccaggtatc 1380
tctacttcaa tcgctacaat cttgagattg tctgatgatt tgggttcagc aaaagatgaa 1440
gatcaagatg gttatgatgg ttcttacatc gaatgttaca tgaaggaaca taagggttct 1500
tcagttgatt cagctagaga agaagttatt agaatgatct ctgaagcatg gaagtgtttg 1560
aataaggaat gtttgtcacc aaacccattt tctgaatctt ttagaatcgg ttctttgaat 1620
atggctagaa tgatcccaat gatgtactca tacgatgata accataattt gccaatctta 1680
gaagaacata tgaaagcaat gatctataat acttctttat aa 1722
<210> 5
<211> 2379
<212> DNA
<213> 人工
<400> 5
acctggtaaa acaatgactt cagttaattt gtccagagca ccagctgcaa ttacaagaag 60
aagattgcaa ttacaacctg aatttcatgc cgaatgttca tggttaaagt cttcatccaa 120
acacgctcca ttgacattaa gttgccaaat cagacctaag caattgtctc aaattgctga 180
attaagagtc acttcattgg atgccagtca agcatctgaa aaagacattt ctttggtaca 240
aacaccacat aaggtagaag ttaacgaaaa gattgaagaa tctatagaat atgttcaaaa 300
cttgttaatg acctcaggtg acggtagaat tagtgtctct ccttacgaca ctgcagtaat 360
agccttaatc aaagatttga agggtagaga cgctccacaa tttccttctt gtttagaatg 420
gatagctcat caccaattgg cagatggttc atggggtgac gaatttttct gtatctatga 480
tagaatcttg aatactttag cttgcgttgt cgcattaaaa tcctggaact tgcatagtga 540
tataatcgaa aagggtgtta cctacatcaa ggaaaacgtc cataaattga agggtgcaaa 600
cgttgaacac agaactgccg gtttcgaatt ggtagttcca acttttatgc aaatggcaac 660
cgatttgggt atccaagatt tgccatatga ccatcctttg attaaagaaa tcgccgatac 720
aaagcaacaa agattgaagg aaatcccaaa ggacttggtt taccaaatgc ctaccaattt 780
gttgtactct ttggaaggtt tgggtgactt ggaatgggaa agattgttaa agttacaaag 840
tggtaacggt tcatttttga cctcacctag ttctactgcc gctgtcttga tgcatacaaa 900
ggatgaaaag tgtttgaagt acatcgaaaa tgctttgaaa aactgcgacg gtggtgcacc 960
acacacttac cctgttgata tattctctag attatgggct atcgacagat tgcaaagatt 1020
gggtatctct agatttttcc aacatgaaat taaatacttt ttggatcaca tagaatccgt 1080
atgggaagaa acaggtgttt tcagtggtag atacaccaag ttttctgata ttgatgacac 1140
ttcaatgggt gttagattgt tgaagatgca tggttacgat gttgacccaa atgtcttaaa 1200
gcacttcaaa caacaagatg gtaaattttc ctgttacatt ggtcaaagtg tagaatcagc 1260
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tgcttgttcc ttagggatga taccattcca gcatttgagt ggtctctcca ctcttccttt 60
ttcaatgggt aataac 76
<210> 81
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工
<400> 81
aacttaattg agggcgaaga gcaag 25
<210> 82
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工
<400> 82
gatgttagca gtcatagaac cgagt 25
<210> 83
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工
<400> 83
ggagagacca ctcaaatgct ggaat 25
<210> 84
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工
<400> 84
gccgcctaca cccagatgat acagga 26
<210> 85
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工
<400> 85
gtgcgttaat taaagtgatc ccccacacac catag 35
<210> 86
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 86
tggcgaccwg gttttgtaat taaaacttag attaga 36
<210> 87
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工
<400> 87
gtgcgaccwg gtaaaacaat gtctaaaggt gaagaattat tc 42
<210> 88
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 88
tgtcgcggcg cgccctatag ggagaccggc agatcc 36
<210> 89
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工
<400> 89
tttgtaatta aaacttagat tagattgcta tgctt 35
<210> 90
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工
<400> 90
ccgctgatcc tagagggccg catcatgtaa ttagt 35
<210> 91
<211> 77
<212> DNA
<213> 人工
<400> 91
tgctcattag aaagaaagca tagcaatcta atctaagttt taattacaaa atgcccgagg 60
ccaagcttaa caataac 77
<210> 92
<211> 75
<212> DNA
<213> 人工
<400> 92
tgtaagcgtg acataactaa ttacatgatg cggccctcta ggatcagcgg ttatttcttg 60
gagagtttac cgttc 75
<210> 93
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工
<400> 93
agtgatcccc cacacaccat agct 24
<210> 94
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工
<400> 94
tttgtaatta aaacttagat tagattg 27
<210> 95
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工
<400> 95
gcgccgcggg cgcgttggcc gattcattaa tgca 34
<210> 96
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工
<400> 96
ccgctgatcc tagagggccg 20
<210> 97
<211> 42
<212> DNA
<213> 人工
<400> 97
gcgaccwggt aaaacaatgg cttcagaaaa agaaattagg ag 42
<210> 98
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工
<400> 98
tcgcggcgcg ccctatttgc ttctcttgta aactttg 37
<210> 99
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 99
gcgaccwggt atgcaagcat ctgaaaaaga catttc 36
<210> 100
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工
<400> 100
gcggcgcgcc ttagacaact ggtctaaaca aaac 34
<210> 101
<211> 34
<212> DNA
<213> 人工
<400> 101
gcgaccwggt atggcaaaga tgaaggaaaa cttc 34
<210> 102
<211> 37
<212> DNA
<213> 人工
<400> 102
gcggcgcgcc ttagaaaaca aaagacttca tgtcttc 37
<210> 103
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工
<400> 103
gcggtttaaa ccaagacaca ttaccccgcc atactgcaac 40
<210> 104
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工
<400> 104
gattgataca gtcgatgaat attacccac 29
<210> 105
<211> 38
<212> DNA
<213> 人工
<400> 105
tggcgtccgg attaagcaag gattttctta acttcttc 38
<210> 106
<211> 35
<212> DNA
<213> 人工
<400> 106
tggcgtccgg agatgcggta ttttctcctt acgca 35
<210> 107
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 107
acctggtaaa acaatggcta atttgaatgg tgaatc 36
<210> 108
<211> 40
<212> DNA
<213> 人工
<400> 108
gtagccatag aaccaccacc tttttgtctt ttatagattt 40
<210> 109
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工
<400> 109
ggtggtggtt ctatggctac tgctgcaggt cc 32
<210> 110
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 110
gcgggcgcgc cttataaaga agtattatag atcatt 36
<210> 111
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 111
acctggtaaa acaatggcta atttgaatgg tgaatc 36
<210> 112
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工
<400> 112
gcgggcgcgc cttataaaga agtattatag atcatt 36
<210> 113
<211> 74
<212> DNA
<213> 人工
<400> 113
cttgcaaatg cctattgtgc agatgttata atatctgtgc gtttaattaa ggctcgtatg 60
ttgtgtggaa ttgt 74
<210> 114
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 114
acaacatttg gtcactaaat cgatatttta c 31
<210> 115
<211> 80
<212> DNA
<213> 人工
<400> 115
ctgtttcctg tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccttaatt 60
aaacgcacag atattataac 80
<210> 116
<211> 74
<212> DNA
<213> 人工
<400> 116
cctccgcgtc attaaacttc ttgttgttga cgctaacatc aacgctagta ttcggcatgc 60
cggtagaggt gtgg 74
<210> 117
<211> 76
<212> DNA
<213> 人工
<400> 117
caggtatagc atgaggtcgc tcttattgac cacacctcta ccggcatgcc gaatactagc 60
gttgaatgtt agcgtc 76
<210> 118
<211> 75
<212> DNA
<213> 人工
<400> 118
aggagtagaa acattttgaa gctatggtgt gtgggggatc actttaatta atctatataa 60
cagttgaaat ttgga 75
<210> 119
<211> 76
<212> DNA
<213> 人工
<400> 119
gtcattttcg cgttgagaag atgttcttat ccaaatttca actgttatat agattaatta 60
aagtgatccc ccacac 76
<210> 120
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工
<400> 120
cgtattacaa ttcactggcc gtcgttttac aacgtcgtga ctgggaaaac cctggcgcgt 60
tggccgattc attaatgc 78
<210> 121
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 121
ggttaccaga tctacaccgt tcccgatttc a 31
<210> 122
<211> 79
<212> DNA
<213> 人工
<400> 122
cgaaggcttt aatttgcaag ctgcggccct gcattaatga atcggccaac gcgccagggt 60
tttcccagtc acgacgttg 79
<210> 123
<211> 70
<212> DNA
<213> 人工
<400> 123
ggagtagaaa cattttgaag ctatggtgtg tgggggatca ctttaattaa ggctcgtatg 60
ttgtgtggaa 70
<210> 124
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 124
acaacatttg gtcactaaat cgatatttta c 31
<210> 125
<211> 80
<212> DNA
<213> 人工
<400> 125
ctgtttcctg tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccttaatt 60
aaacgcacag atattataac 80
<210> 126
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工
<400> 126
cgtattacaa ttcactggcc gtcgttttac aacgtcgtga ctgggaaaac cctggcgcgt 60
tggccgattc attaatgc 78
<210> 127
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 127
ggttaccaga tctacaccgt tcccgatttc a 31
<210> 128
<211> 79
<212> DNA
<213> 人工
<400> 128
cgaaggcttt aatttgcaag ctgcggccct gcattaatga atcggccaac gcgccagggt 60
tttcccagtc acgacgttg 79
<210> 129
<211> 74
<212> DNA
<213> 人工
<400> 129
cttgcaaatg cctattgtgc agatgttata atatctgtgc gtttaattaa ggctcgtatg 60
ttgtgtggaa ttgt 74
<210> 130
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 130
acaacatttg gtcactaaat cgatatttta c 31
<210> 131
<211> 80
<212> DNA
<213> 人工
<400> 131
ctgtttcctg tgtgaaattg ttatccgctc acaattccac acaacatacg agccttaatt 60
aaacgcacag atattataac 80
<210> 132
<211> 74
<212> DNA
<213> 人工
<400> 132
cctccgcgtc attaaacttc ttgttgttga cgctaacatc aacgctagta ttcggcatgc 60
cggtagaggt gtgg 74
<210> 133
<211> 76
<212> DNA
<213> 人工
<400> 133
caggtatagc atgaggtcgc tcttattgac cacacctcta ccggcatgcc gaatactagc 60
gttgaatgtt agcgtc 76
<210> 134
<211> 75
<212> DNA
<213> 人工
<400> 134
aggagtagaa acattttgaa gctatggtgt gtgggggatc actttaatta atctatataa 60
cagttgaaat ttgga 75
<210> 135
<211> 76
<212> DNA
<213> 人工
<400> 135
gtcattttcg cgttgagaag atgttcttat ccaaatttca actgttatat agattaatta 60
aagtgatccc ccacac 76
<210> 136
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工
<400> 136
cgtattacaa ttcactggcc gtcgttttac aacgtcgtga ctgggaaaac cctggcgcgt 60
tggccgattc attaatgc 78
<210> 137
<211> 31
<212> DNA
<213> 人工
<400> 137
ggttaccaga tctacaccgt tcccgatttc a 31
<210> 138
<211> 79
<212> DNA
<213> 人工
<400> 138
cgaaggcttt aatttgcaag ctgcggccct gcattaatga atcggccaac gcgccagggt 60
tttcccagtc acgacgttg 79
<210> 139
<211> 1511
<212> 蛋白质
<213> 酿酒酵母
<400> 1
Met Pro Glu Ala Lys Leu Asn Asn Asn Val Asn Asp Val Thr Ser Tyr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Ser Ser Ser Thr Glu Asn Ala Ala Asp Leu His Asn Tyr
20 25 30
Asn Gly Phe Asp Glu His Thr Glu Ala Arg Ile Gln Lys Leu Ala Arg
35 40 45
Thr Leu Thr Ala Gln Ser Met Gln Asn Ser Thr Gln Ser Ala Pro Asn
50 55 60
Lys Ser Asp Ala Gln Ser Ile Phe Ser Ser Gly Val Glu Gly Val Asn
65 70 75 80
Pro Ile Phe Ser Asp Pro Glu Ala Pro Gly Tyr Asp Pro Lys Leu Asp
85 90 95
Pro Asn Ser Glu Asn Phe Ser Ser Ala Ala Trp Val Lys Asn Met Ala
100 105 110
His Leu Ser Ala Ala Asp Pro Asp Phe Tyr Lys Pro Tyr Ser Leu Gly
115 120 125
Cys Ala Trp Lys Asn Leu Ser Ala Ser Gly Ala Ser Ala Asp Val Ala
130 135 140
Tyr Gln Ser Thr Val Val Asn Ile Pro Tyr Lys Ile Leu Lys Ser Gly
145 150 155 160
Leu Arg Lys Phe Gln Arg Ser Lys Glu Thr Asn Thr Phe Gln Ile Leu
165 170 175
Lys Pro Met Asp Gly Cys Leu Asn Pro Gly Glu Leu Leu Val Val Leu
180 185 190
Gly Arg Pro Gly Ser Gly Cys Thr Thr Leu Leu Lys Ser Ile Ser Ser
195 200 205
Asn Thr His Gly Phe Asp Leu Gly Ala Asp Thr Lys Ile Ser Tyr Ser
210 215 220
Gly Tyr Ser Gly Asp Asp Ile Lys Lys His Phe Arg Gly Glu Val Val
225 230 235 240
Tyr Asn Ala Glu Ala Asp Val His Leu Pro His Leu Thr Val Phe Glu
245 250 255
Thr Leu Val Thr Val Ala Arg Leu Lys Thr Pro Gln Asn Arg Ile Lys
260 265 270
Gly Val Asp Arg Glu Ser Tyr Ala Asn His Leu Ala Glu Val Ala Met
275 280 285
Ala Thr Tyr Gly Leu Ser His Thr Arg Asn Thr Lys Val Gly Asn Asp
290 295 300
Ile Val Arg Gly Val Ser Gly Gly Glu Arg Lys Arg Val Ser Ile Ala
305 310 315 320
Glu Val Ser Ile Cys Gly Ser Lys Phe Gln Cys Trp Asp Asn Ala Thr
325 330 335
Arg Gly Leu Asp Ser Ala Thr Ala Leu Glu Phe Ile Arg Ala Leu Lys
340 345 350
Thr Gln Ala Asp Ile Ser Asn Thr Ser Ala Thr Val Ala Ile Tyr Gln
355 360 365
Cys Ser Gln Asp Ala Tyr Asp Leu Phe Asn Lys Val Cys Val Leu Asp
370 375 380
Asp Gly Tyr Gln Ile Tyr Tyr Gly Pro Ala Asp Lys Ala Lys Lys Tyr
385 390 395 400
Phe Glu Asp Met Gly Tyr Val Cys Pro Ser Arg Gln Thr Thr Ala Asp
405 410 415
Phe Leu Thr Ser Val Thr Ser Pro Ser Glu Arg Thr Leu Asn Lys Asp
420 425 430
Met Leu Lys Lys Gly Ile His Ile Pro Gln Thr Pro Lys Glu Met Asn
435 440 445
Asp Tyr Trp Val Lys Ser Pro Asn Tyr Lys Glu Leu Met Lys Glu Val
450 455 460
Asp Gln Arg Leu Leu Asn Asp Asp Glu Ala Ser Arg Glu Ala Ile Lys
465 470 475 480
Glu Ala His Ile Ala Lys Gln Ser Lys Arg Ala Arg Pro Ser Ser Pro
485 490 495
Tyr Thr Val Ser Tyr Met Met Gln Val Lys Tyr Leu Leu Ile Arg Asn
500 505 510
Met Trp Arg Leu Arg Asn Asn Ile Gly Phe Thr Leu Phe Met Ile Leu
515 520 525
Gly Asn Cys Ser Met Ala Leu Ile Leu Gly Ser Met Phe Phe Lys Ile
530 535 540
Met Lys Lys Gly Asp Thr Ser Thr Phe Tyr Phe Arg Gly Ser Ala Met
545 550 555 560
Phe Phe Ala Ile Leu Phe Asn Ala Phe Ser Ser Leu Leu Glu Ile Phe
565 570 575
Ser Leu Tyr Glu Ala Arg Pro Ile Thr Glu Lys His Arg Thr Tyr Ser
580 585 590
Leu Tyr His Pro Ser Ala Asp Ala Phe Ala Ser Val Leu Ser Glu Ile
595 600 605
Pro Ser Lys Leu Ile Ile Ala Val Cys Phe Asn Ile Ile Phe Tyr Phe
610 615 620
Leu Val Asp Phe Arg Arg Asn Gly Gly Val Phe Phe Phe Tyr Leu Leu
625 630 635 640
Ile Asn Ile Val Ala Val Phe Ser Met Ser His Leu Phe Arg Cys Val
645 650 655
Gly Ser Leu Thr Lys Thr Leu Ser Glu Ala Met Val Pro Ala Ser Met
660 665 670
Leu Leu Leu Ala Leu Ser Met Tyr Thr Gly Phe Ala Ile Pro Lys Lys
675 680 685
Lys Ile Leu Arg Trp Ser Lys Trp Ile Trp Tyr Ile Asn Pro Leu Ala
690 695 700
Tyr Leu Phe Glu Ser Leu Leu Ile Asn Glu Phe His Gly Ile Lys Phe
705 710 715 720
Pro Cys Ala Glu Tyr Val Pro Arg Gly Pro Ala Tyr Ala Asn Ile Ser
725 730 735
Ser Thr Glu Ser Val Cys Thr Val Val Gly Ala Val Pro Gly Gln Asp
740 745 750
Tyr Val Leu Gly Asp Asp Phe Ile Arg Gly Thr Tyr Gln Tyr Tyr His
755 760 765
Lys Asp Lys Trp Arg Gly Phe Gly Ile Gly Met Ala Tyr Val Val Phe
770 775 780
Phe Phe Phe Val Tyr Leu Phe Leu Cys Glu Tyr Asn Glu Gly Ala Lys
785 790 795 800
Gln Lys Gly Glu Ile Leu Val Phe Pro Arg Ser Ile Val Lys Arg Met
805 810 815
Lys Lys Arg Gly Val Leu Thr Glu Lys Asn Ala Asn Asp Pro Glu Asn
820 825 830
Val Gly Glu Arg Ser Asp Leu Ser Ser Asp Arg Lys Met Leu Gln Glu
835 840 845
Ser Ser Glu Glu Glu Ser Asp Thr Tyr Gly Glu Ile Gly Leu Ser Lys
850 855 860
Ser Glu Ala Ile Phe His Trp Arg Asn Leu Cys Tyr Glu Val Gln Ile
865 870 875 880
Lys Ala Glu Thr Arg Arg Ile Leu Asn Asn Val Asp Gly Trp Val Lys
885 890 895
Pro Gly Thr Leu Thr Ala Leu Met Gly Ala Ser Gly Ala Gly Lys Thr
900 905 910
Thr Leu Leu Asp Cys Leu Ala Glu Arg Val Thr Met Gly Val Ile Thr
915 920 925
Gly Asp Ile Leu Val Asn Gly Ile Pro Arg Asp Lys Ser Phe Pro Arg
930 935 940
Ser Ile Gly Tyr Cys Gln Gln Gln Asp Leu His Leu Lys Thr Ala Thr
945 950 955 960
Val Arg Glu Ser Leu Arg Phe Ser Ala Tyr Leu Arg Gln Pro Ala Glu
965 970 975
Val Ser Ile Glu Glu Lys Asn Arg Tyr Val Glu Glu Val Ile Lys Ile
980 985 990
Leu Glu Met Glu Lys Tyr Ala Asp Ala Val Val Gly Val Ala Gly Glu
995 1000 1005
Gly Leu Asn Val Glu Gln Arg Lys Arg Leu Thr Ile Gly Val Glu
1010 1015 1020
Leu Thr Ala Lys Pro Lys Leu Leu Val Phe Leu Asp Glu Pro Thr
1025 1030 1035
Ser Gly Leu Asp Ser Gln Thr Ala Trp Ser Ile Cys Gln Leu Met
1040 1045 1050
Lys Lys Leu Ala Asn His Gly Gln Ala Ile Leu Cys Thr Ile His
1055 1060 1065
Gln Pro Ser Ala Ile Leu Met Gln Glu Phe Asp Arg Leu Leu Phe
1070 1075 1080
Met Gln Arg Gly Gly Lys Thr Val Tyr Phe Gly Asp Leu Gly Glu
1085 1090 1095
Gly Cys Lys Thr Met Ile Asp Tyr Phe Glu Ser His Gly Ala His
1100 1105 1110
Lys Cys Pro Ala Asp Ala Asn Pro Ala Glu Trp Met Leu Glu Val
1115 1120 1125
Val Gly Ala Ala Pro Gly Ser His Ala Asn Gln Asp Tyr Tyr Glu
1130 1135 1140
Val Trp Arg Asn Ser Glu Glu Tyr Arg Ala Val Gln Ser Glu Leu
1145 1150 1155
Asp Trp Met Glu Arg Glu Leu Pro Lys Lys Gly Ser Ile Thr Ala
1160 1165 1170
Ala Glu Asp Lys His Glu Phe Ser Gln Ser Ile Ile Tyr Gln Thr
1175 1180 1185
Lys Leu Val Ser Ile Arg Leu Phe Gln Gln Tyr Trp Arg Ser Pro
1190 1195 1200
Asp Tyr Leu Trp Ser Lys Phe Ile Leu Thr Ile Phe Asn Gln Leu
1205 1210 1215
Phe Ile Gly Phe Thr Phe Phe Lys Ala Gly Thr Ser Leu Gln Gly
1220 1225 1230
Leu Gln Asn Gln Met Leu Ala Val Phe Met Phe Thr Val Ile Phe
1235 1240 1245
Asn Pro Ile Leu Gln Gln Tyr Leu Pro Ser Phe Val Gln Gln Arg
1250 1255 1260
Asp Leu Tyr Glu Ala Arg Glu Arg Pro Ser Arg Thr Phe Ser Trp
1265 1270 1275
Ile Ser Phe Ile Phe Ala Gln Ile Phe Val Glu Val Pro Trp Asn
1280 1285 1290
Ile Leu Ala Gly Thr Ile Ala Tyr Phe Ile Tyr Tyr Tyr Pro Ile
1295 1300 1305
Gly Phe Tyr Ser Asn Ala Ser Ala Ala Gly Gln Leu His Glu Arg
1310 1315 1320
Gly Ala Leu Phe Trp Leu Phe Ser Cys Ala Phe Tyr Val Tyr Val
1325 1330 1335
Gly Ser Met Gly Leu Leu Val Ile Ser Phe Asn Gln Val Ala Glu
1340 1345 1350
Ser Ala Ala Asn Leu Ala Ser Leu Leu Phe Thr Met Ser Leu Ser
1355 1360 1365
Phe Cys Gly Val Met Thr Thr Pro Ser Ala Met Pro Arg Phe Trp
1370 1375 1380
Ile Phe Met Tyr Arg Val Ser Pro Leu Thr Tyr Phe Ile Gln Ala
1385 1390 1395
Leu Leu Ala Val Gly Val Ala Asn Val Asp Val Lys Cys Ala Asp
1400 1405 1410
Tyr Glu Leu Leu Glu Phe Thr Pro Pro Ser Gly Met Thr Cys Gly
1415 1420 1425
Gln Tyr Met Glu Pro Tyr Leu Gln Leu Ala Lys Thr Gly Tyr Leu
1430 1435 1440
Thr Asp Glu Asn Ala Thr Asp Thr Cys Ser Phe Cys Gln Ile Ser
1445 1450 1455
Thr Thr Asn Asp Tyr Leu Ala Asn Val Asn Ser Phe Tyr Ser Glu
1460 1465 1470
Arg Trp Arg Asn Tyr Gly Ile Phe Ile Cys Tyr Ile Ala Phe Asn
1475 1480 1485
Tyr Ile Ala Gly Val Phe Phe Tyr Trp Leu Ala Arg Val Pro Lys
1490 1495 1500
Lys Asn Gly Lys Leu Ser Lys Lys
1505 1510

Claims (28)

1.一种产生萜类产量提高的重组宿主细胞的方法,其包括增加野生型宿主细胞中酿酒酵母PDR5蛋白的表达量的步骤,其中所述萜类选自香叶酯、橙花叔醇和香紫苏醇。
2.权利要求1的方法,其中酿酒酵母PDR5蛋白的表达量增加通过增加PDR5基因的拷贝数和/或使用强启动子实现。
3.权利要求2的方法,其中所述PDR5基因是酿酒酵母PDR5基因。
4.权利要求3的方法,其中所述酿酒酵母PDR5基因由SEQ ID NO:1的核酸序列组成。
5.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞进一步包含用于萜类生产的外源多核苷酸。
6.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞是真核生物。
7.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞选自酵母纲(Saccharomycetes)。
8.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞选自伞菌属(Agaricus)、曲霉属(Aspergillus)、芽孢杆菌属(Bacillus)、念珠菌属(Candida)、棒状杆菌属(Corynebacterium)、埃希菌属(Escherichia)、镰孢属(Fusarium)、赤霉属(Gibberella)、克鲁维酵母属(Kluyveromyce)、硫磺菌属(Laetiporus)、香菇属(Lentinus)、红发夫酵母属(Phaffia)、平革菌属(Phanerochaete)、毕赤酵母属(Pichia)、藓属(Physcomitrella)、红酵母属(Rhodoturula)、酵母属(Saccharomyces)、裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)、痂圆孢属(Sphaceloma)、红发夫酵母属(Xanthophyllomyces)和耶氏酵母属(Yarrowiagenera)。
9.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞选自酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)、解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)、光滑念珠菌(Candida glabrata)、棉阿舒囊霉(Ashbya gossypii)、产朊假丝酵母(Cyberlindnera jadinii)、巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)、乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)、多形汉逊酵母(Hansenula polymorpha)、博伊丁念珠菌(Candida boidinii)、Arxula adeninivorans、红发夫酵母(Xanthophyllomycesdendrorhous)或白色念珠菌(Candida albicans)物种。
10.权利要求1的方法,其中所述宿主细胞是酿酒酵母。
11.分离的编码酿酒酵母PDR5蛋白的多核苷酸用于提高宿主细胞萜类产量的用途,其中所述萜类选自香叶酯、橙花叔醇和香紫苏醇。
12.权利要求11的用途,其中所述编码酿酒酵母PDR5蛋白的多核苷酸是酿酒酵母PDR5基因。
13.权利要求12的用途,其中所述酿酒酵母PDR5基因由SEQ ID NO:1的核酸序列组成。
14.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞进一步包含用于萜类生产的外源多核苷酸。
15.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞是真核生物。
16.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞选自酵母纲。
17.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞选自伞菌属、曲霉属、芽孢杆菌属、念珠菌属、棒状杆菌属、埃希菌属、镰孢属、赤霉属、克鲁维酵母属、硫磺菌属、香菇属、红发夫酵母属、平革菌属、毕赤酵母属、藓属、红酵母属、酵母属、裂殖酵母属、痂圆孢属、红发夫酵母属和耶氏酵母属。
18.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞选自酿酒酵母、粟酒裂殖酵母、解脂耶氏酵母、光滑念珠菌、棉阿舒囊霉、产朊假丝酵母、巴斯德毕赤酵母、乳酸克鲁维酵母、多形汉逊酵母、博伊丁念珠菌、Arxula adeninivorans、红发夫酵母或白色念珠菌物种。
19.权利要求11的用途,其中所述宿主细胞是酿酒酵母。
20.酿酒酵母PDR5蛋白用于提高宿主细胞萜类产量的用途,其中所述萜类选自香叶酯、橙花叔醇和香紫苏醇。
21.权利要求20的用途,其中所述酿酒酵母PDR5蛋白由SEQ ID NO:139的氨基酸序列组成。
22.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞进一步包含用于萜类生产的外源多核苷酸。
23.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞是真核生物。
24.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞选自酵母纲。
25.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞选自伞菌属、曲霉属、芽孢杆菌属、念珠菌属、棒状杆菌属、埃希菌属、镰孢属、赤霉属、克鲁维酵母属、硫磺菌属、香菇属、红发夫酵母属、平革菌属、毕赤酵母属、藓属、红酵母属、酵母属、裂殖酵母属、痂圆孢属、红发夫酵母属和耶氏酵母属。
26.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞选自酿酒酵母、粟酒裂殖酵母、解脂耶氏酵母、光滑念珠菌、棉阿舒囊霉、产朊假丝酵母、巴斯德毕赤酵母、乳酸克鲁维酵母、多形汉逊酵母、博伊丁念珠菌、Arxula adeninivorans、红发夫酵母或白色念珠菌物种。
27.权利要求20的用途,其中所述宿主细胞是酿酒酵母。
28.一种生产萜类的方法,包括在培养基中于导致产生萜类的条件下培养由权利要求1-10任一项的方法产生的重组宿主细胞,并从培养基中回收所述萜类,其中所述萜类选自香叶酯、橙花叔醇和香紫苏醇。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111434773B (zh) * 2019-01-15 2021-06-18 天津大学 一种高产檀香油的重组酵母菌及其构建方法与应用
CN111518735A (zh) * 2019-02-02 2020-08-11 江南大学 一种谷氨酸棒状杆菌重组菌、制备方法和应用
CN110438145A (zh) * 2019-07-15 2019-11-12 天津大学 合成香叶醇的谷氨酸棒状杆菌及构建方法及应用
CN111073823B (zh) * 2019-12-27 2021-08-03 天津科技大学 一种高产丁酸乙酯酿酒酵母菌株及其构建方法与用途
CN112746062A (zh) * 2020-12-31 2021-05-04 河北省农林科学院经济作物研究所 与紫苏萜类物质生物合成有关的蛋白及其编码基因与应用
WO2023108503A1 (zh) * 2021-12-15 2023-06-22 中国科学院大连化学物理研究所 一种工程菌的构建方法及其应用
CN115976118B (zh) * 2022-06-14 2024-01-23 武汉合生科技有限公司 一种生物合成诺卡酮的方法及载体
CN114989997B (zh) * 2022-06-28 2023-04-28 南京工业大学 一株高产香紫苏醇的重组解脂耶氏酵母菌及其构建方法和应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105189771A (zh) * 2013-02-11 2015-12-23 埃沃尔瓦公司 在重组宿主中有效产生甜菊醇糖苷

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013110191A1 (en) * 2012-01-23 2013-08-01 The University Of British Columbia Abc trepenoid transporters and methods of using the same
WO2014027118A1 (en) * 2012-08-17 2014-02-20 Evolva Sa Increased production of terpenes and terpenoids

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN105189771A (zh) * 2013-02-11 2015-12-23 埃沃尔瓦公司 在重组宿主中有效产生甜菊醇糖苷

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Monoterpenoid biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae;Marilyne Oswald等;《FEMS Yeast Research》;20061109;第7卷(第3期);第413-421页全文,尤其是第418页左栏第2段、表4,第420页左栏第5段 *
代谢工程改造酿酒酵母生产单萜的关键问题解析;刘继栋;《中国博士学位论文全文数据库》;20140115;2014年第01期A006-50正文第10页第1段 *
酿酒酵母耐受D-柠檬烯胁迫的蛋白组学分析;胡菲菲;《中国优秀硕士论文全文数据库》;20130415;2013年第04期B024-339正文15-21页,尤其是第19页第1段,第20页第1、2段和第21页第1段,图3-5、图3-6 *

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