CN107805673A

CN107805673A - 一种与小麦苗期根系性状相关的snp标记及应用

Info

Publication number: CN107805673A
Application number: CN201711156638.4A
Authority: CN
Inventors: 何中虎; 杨梦娇; 王彩荣; 肖永贵; 夏先春
Original assignee: Institute of Crop Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Current assignee: Institute of Crop Sciences of Chinese Academy of Agricultural Sciences
Priority date: 2017-11-20
Filing date: 2017-11-20
Publication date: 2018-03-16
Anticipated expiration: 2037-11-20
Also published as: CN107805673B

Abstract

本发明公开了一种与小麦苗期根系性状相关的SNP标记及应用。本发明提供了本发明提供的检测小麦基因组中AX‑110602569‑7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦根系性状中的应用；所述AX‑110602569‑7A基因在小麦染色体7AS上的39cM位置。本发明提供了一个小麦苗期根系性状相关位点QRL.caas‑7A及该位点的辅助筛选小麦苗期根系相关基因的SNP位点。利用该SNP位点可以筛选相关根系性状优良的小麦，在培育水肥高效型小麦品种中发挥重要作用。

Description

一种与小麦苗期根系性状相关的SNP标记及应用

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其涉及一种与小麦苗期根系性状相关的SNP标记及应用。

背景技术

培育高产稳产品质优良的小麦新品种，需要稳固发达的根系系统及高效的肥料利用率。植物根系具有支撑和固定植物,以及从土壤中吸收水分和养分的双重功能,同时又是多种离子、有机酸、激素和氨基酸合成的重要场所,是产量形成的重要贡献者和土壤养分的充分利用者(Xu等，2015)。小麦根系及苗期的生长及生理特性会随着灌溉模式及环境等作用发生一系列变化。苗期以营养生长为主,产生分蘖与次生根,初生根和叶片仍在生长,对营养、水分等条件极为敏感(Xing等，2015)。预期未来世界范围内资源稀缺性，研究不同基因型小麦的根系特性差异,发掘小麦苗期根系生长发育的调控机制,可为抗旱节水小麦品种选育过程中正确选择根系指标提供科学依据，对旱地小麦高产、高效栽培及充分利用土壤资源具有重要意义(Baker等，2015)。

利用遗传育种方法塑造与地上部生长发育相适应的、具有持久稳定活力的根系是小麦根系育种的重要目标。随着研究者对根系重要性的认识程度加深，一些根系研究方法相继发展，其中营养液培养法可简便且有效地测定小麦根系性状(An等，2006)。因磷的活化和转运因子等研究较复杂，植物肥料利用效率相关基因的定位研究起步较晚。目前，已报道的小麦磷利用效率相关QTL位点主要分布于1A、2B、2D、3A、3B、4B、5A、5B、5D、6A、6B和7A等染色体上，部分QTL位点与其它农艺性状相关基因连锁形成密集区，如位于5A和5D染色体上的位点与春化基因Vrn-A1和Vrn-D1连锁(Su等，2006；2009)。在水稻中，虽然已发现的与磷利用相关的QTL位点较多，但只有Pup1位点在不同遗传背景下表现稳定(Chin等2011；Vinod等，2012)。水稻第9染色体上携带的控制根系深度相关的QTL不仅利于提高植物抗旱性，而且可增强植物对根系营养元素的吸收，该基因的遗传区段RM242-RM201对应的标记已应用于分子辅助育种中，并获得了携带该基因且根系性状优良的株系(Steele等，2006)。此外，一个与玉米产量和根系相关的主效QTL已被发掘，并得到应用(Landi等，2010)。小麦基因组结构较水稻和玉米复杂，根系性状如根长度、表面积、体积和干物质重等受多基因控制，通常呈簇存在，主要分布于1D、2A、2D、3A、5A、6A和7D染色体上，单个QTL位点可解释表型变异的3.2％-19.6％，部分QTL存在上位效应。多数根部性状基因与肥水利用、农艺性状及产量性状相关基因相关联(Bai等，2013)，但鲜有紧密连锁标记的报道。

中麦895是中国农业科学院作物科学研究所、中国农业科学院棉花研究所以周麦16为母本、荔垦4号为父本杂交选育而成的半冬性多穗型中晚熟品种，具有叶片功能期长、分蘖能力强、耐后期高温、灌浆速度快等优点。2009年9月通过国家黄淮麦区南片审定。在2013-2015年三年品种比较试验和大田示范中,中麦895表现出高产广适、抗病抗倒、后期耐高温等特点。

营养液培养法已被广泛应用于作物苗期培育以及根系特征、肥料敏感性等性状的研究(肖永贵等，2014)。在可控营养条件下，分析扬麦16/中麦895DH群体不同基因型苗期相关性状，并利用660k SNP芯片对苗期不同根系性状进行QTL定位，得到一个控制根长的主效QTL位点，利用紧密连锁的SNP标记转化为KASP标记，为选育高产稳产品质优良的品种奠定理论基础且提供分子辅助选择手段。

发明内容

本发明的一个目的是提供检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质的应用。

本发明提供的检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦根系性状中的应用；

所述AX-110602569-7A基因在小麦染色体7AS上的39cM位置。

上述应用中，所述AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC或TT或CT；

或所述小麦根系性状为总根长；

或所述AX-110602569-7A基因的核苷酸序列为序列4。

本发明的第2个目的是提供检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质的应用。

本发明提供检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在培育总根长延长的小麦中的应用。

上述应用中，

所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质如下1)或2)：

1)为成套引物，所述成套引物由序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列3所示的单链DNA分子组成；

2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。

含有所述成套引物的PCR试剂中序列表中序列1所示的单链DNA分子或其衍生物、序列表中序列2所示的单链DNA分子或其衍生物和序列表中序列3所示的单链DNA分子的浓度均为0.25uM。

上述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列(实施例为FAM荧光序列F5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’)；

上述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子的5'端连接另一种荧光序列(实施例为HEX荧光序列F5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’)；

或，所述荧光基团序列为荧光序列FAM或荧光序列HEX。

本发明第3个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法。

本发明提供的方法，包括如下步骤：检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第36位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT，基因型为CC的待测小麦总根长大于基因型为TT或CT的待测小麦总根长。

本发明第4个目的是提供一种一种选育根系性状好的小麦的方法。

本发明提供一种选育根系性状好的小麦的方法，为检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT，选择基因型为CC的小麦进行选育，得到目的小麦。

总根长为小麦三叶期幼苗所有根的长度之和，即根系总长。

上述方法中，所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT的方法为如下A)或B)：

A)直接测序；

B)用权利要求5中的所述成套引物对待测小麦基因组DNA进行PCR扩增产物，对所述PCR扩增产物进行基因分型。

上述方法中，

所述基因分型的方法为采用荧光酶标仪(具体采用PHERAstar^plus荧光酶标仪)照射后，若所述PCR产物仅显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色(FAM荧光，红色)，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC；若所述PCR产物仅显示序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色(HEX荧光，蓝色)，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第36位脱氧核糖核苷酸的基因型为TT；

若所述PCR产物显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色和序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色(绿色)，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CT。

本发明第4个目的是提供一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的物质。

本发明提供的物质，为上述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质。

上述中，所述小麦根系性状为小麦苗期根系性状，小麦苗期根系性状具体体现在总根长。

上述中，所述待测小麦具体为如下品种中的任一种或任几种：周麦30、淮麦18、淮麦20、济麦19、济麦21、京双16、济麦22、晋麦45、良星66、周麦20、郑农21、洛麦26、中金13、烟农19、皖麦38、汶农14、小偃54、光泰68、先麦12、豫麦63、周麦16、周麦18、周麦22、周麦31、周麦32。

本发明的实验证明，本发明提供了一个小麦苗期根系性状相关位点QRL.caas-7A及该位点的辅助筛选小麦苗期根系相关基因的SNP位点。利用该SNP位点可以筛选相关根系性状优良的小麦，在培育水肥高效型小麦品种中发挥重要作用。

附图说明

图1为中麦895(右)和扬麦16(左)的苗期根系图。

图2为一个SNP标记与QRL.caas-7AS基因的连锁图。

图3为供试小麦品种根长基因的KASP标记检测结果。

具体实施方式

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。

下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

所有引物合成均由北京奥科生物技术有限责任公司完成。以下实施例中所有用到的小麦材料均来自中国农业科学院国家农作物种质保存中心。

实施例1、与苗期根系相关基因的SNP标记AX110602569的获得

选用扬麦16(中国农业发展集团有限公司，品种权号：CNA20030436.4)/中麦895(河南新大农业发展有限公司，国审麦2012010)DH群体，包括亲本共200个家系。

图1为中麦895(右)和扬麦16(左)的苗期根系图。

1、根系性状调查

根部试验采用水培法，即每个品种选取的种子30粒，用10％的处理20-30分钟，无菌水冲洗5-6次。选取H₂O₂处理过的种子饱满且大小一致置于铺有滤纸的培养皿中，在培养箱暗室催芽。每个材料挑选发芽一致的种子发苗培养，培养盘置于营养液中在可控温室培养，营养液配置参照文献(Ren等，2012)。连续培养10天后对苗期根部性状进行调查。调查性状包括最长根长、侧根长、主根长、总根长、侧根表面积、主根表面积、总根表面积、总根尖数和根系干重。

2、引物获得和标记分析

SNP(单核苷酸多态性)标记在博奥生物有限公司(CapitalBio Corporation,Beijing,China；http://bioservices.capitalbio.com)利用Illumina SNP基因分型检测，主要分为以下步骤：1)将待测小麦品种基因组DNA进行全基因组扩增；2)扩增产物用随机内切酶酶切断化；3)将DNA片段与将DNA片段与芯片进行杂交，芯片的微珠上连接有50-mers长度特异性捕获探针，gDNA酶切后产物与探针互补序列结合；4)清洗去除未杂交上的或错配杂交上的DNA片段；5)二硝基酚(dinitrophenol)和生物素(biotin)标记的核苷酸底物(A/T和C/G)在捕获探针上进行单碱基延伸，只有与gDNA发生互补结合的探针才能得到延伸；通过染色，A/T和C/G将分别标记不同的荧光染料；6)芯片扫描，并利用软件根据两种荧光判读并输出分型结果。

利用Illumina SNP基因分型研究平台对扬麦16/中麦895DH群体进行660k SNP芯片分型，包括BS、BobWhite、CAP、D_contig等系列标记，共计630518个，其中626276个SNP标记在扬麦16/中麦895DH群体内存在差异。

二、关联基因定位和连锁标记AX110602569的发现

利用SAS9.2软件(SAS Institute.2000)进行基本统计量、多重比较分析，并结合SAS的Glmselect程序对SNP数据和根系性状进行逐步回归，根据P值(P<0.01)判断关联位点。定位出AX110602569与位点QRl.caas-7AS关联(P<0.001)。

三、AX110602569位点的等位基因特异标记鉴定

分别提取15个扬麦16/中麦895DH群体的全基因组DNA，以各个基因组DNA为模板，用SNP标记AX110602569位点的等位基因特异标记KASPTM基因分型检测(所用引物为序列1、序列2和序列3)，得到序列4所示的扩增产物，检测该扩增产物，出现C:C分型的片段表明SNP标记AX110602569能够有效鉴定小麦品种根长基因。

表1为AX110602569标记等位变异在扬麦16/中麦895DH群体中的分离

结果表明，AX110602569位点的基因型仅为C：C时，与小麦品种具有较长总根长的表型相符，说明AX110602569位点能够有效鉴定小麦品种总根长基因及其基因型。AX110602569位点的基因型为C：C的小麦品种总根长大于AX110602569位点的基因型为C：T或TT的小麦品种总根长。

根据Wheat DArT maps Version 1.2(http://www.triticarte.com.au)和Allen等(2011)公布的小麦分子标记图谱，将标记AX110602569整合到小麦遗传图谱上，结果如图2所示，确定QRl.caas-7AS在染色体7AS上的39cM位置。

AX110602569SNP位点为AX-110602569-7A基因(序列4)核苷酸序列自5’末端起第19位核苷酸，该第19bp位核苷酸为C或T；AX-110602569-7A基因位于小麦染色体7AS上的39cM位置。

四、检测AX110602569SNP位点的引物组设计

根据AX110602569SNP位点在染色体7A上的39cM位置的基因的核苷酸序列(序列4)，设计测AX110602569位点的引物组如下：

上游引物：F5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTTTATTTTTGGGCACTGCC-3’(序列1)，

上游引物：F5’–AAGGTCGGAGTCAACGGATTTTTATTTTTGGGCACTGCT-3’(序列2)，

下游引物：R5’-TGGGTCACAGGACACGTGT-3’(序列3)。

在序列1所示的上游引物的5’端添加特异荧光序列FAM：5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’(序列5)；

在序列2所示的上游引物的5’端添加特异荧光序列HEX：F5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’(序列6)。

上述5’端添加特异荧光序列FAM序列1所示的单链DNA分子与序列3所示的单链DNA分子扩增AX110602569SNP位点基因型为C:C的片段，携带FAM的序列PCR扩增后的产物经荧光照射显示红色；

上述5’端添加特异荧光序列HEX序列2所示的单链DNA分子与序列3所示的单链DNA分子扩增AX110602569SNP位点基因型为T:T的片段，携带HEX的序列PCR扩增后的产物经荧光照射显示蓝色。

上述5’端添加特异荧光序列FAM序列1所示的单链DNA分子、5’端添加特异荧光序列HEX序列2所示的单链DNA分子和序列3所示的单链DNA分子扩增AX110602569SNP位点基因型为C:T的片段，PCR扩增后的产物经荧光照射照射显示绿色。

五、AX110602569SNP位点检测小麦根系性状方法的建立

提取待测小麦基因组DNA作为模板，用5’端添加特异荧光序列FAM的序列1所示引物、5’端添加特异荧光序列HEX的序列2所示引物和序列3所示引物进行PCR扩增。

PCR扩增的12μL PCR反应体系包括：5’端添加特异荧光序列FAM的序列1所示引物、5’端添加特异荧光序列HEX的序列2所示引物和序列3所示引物，且每条引物终浓度为0.25uM，终浓度为1mmol·L^-1的Tris-HCl(pH 9.0)，终浓度为5mmol·L^-1的KCl，终浓度为2.5mmol·L^-1的MgCl₂(Promega公司)，终浓度为200μmol·L^-1的dNTPs(TaKaRa公司)，TaqDNA聚合酶1.5U(Tiangen公司)，模板DNA 15ng，其余为水。

PCR扩增反应在PTC-200PCR扩增仪上进行，采用Touch down PCR扩增程序为：

94℃预变性15min；(Touch down程序)94℃变性30s，61℃退火60s，72℃延伸30s，11个循环，每个循环退火温度下降0.6℃；(扩增程序)94℃变性30s，55℃退火60s，72℃延伸30s，26个循环；72℃延伸5min；10℃保存。

将得到的PCR扩增产物在PHERAstar^plus荧光酶标仪上用荧光照射进行基因分型，然后在KlusterCaller^TM软件读取分型后的数据。

若PCR扩增产物仅显示红色图像(序列1所示DNA分子5'端连接的荧光颜色)，则待测小麦AX110602569SNP位点为C，基因型为C:C；若PCR扩增产物仅显示蓝色图像(序列2所示DNA分子5'端连接的荧光颜色)，则说明AX110602569SNP位点碱基为T，基因型为T:T；若PCR扩增产物显示绿色图像，则说明AX110602569SNP位点碱基为C/T，基因型为C:T。

PCR扩增产物仅为显示红色(AX110602569SNP位点为C的纯合体，基因型为C：C)的小麦的总根长大于PCR扩增产物仅显示蓝色(AX110602569SNP位点为T的纯合体，基因型为T：T)或绿色(AX110602569SNP位点为C/T杂合体，基因型为C：T)的小麦。

实施例2、AX110602569SNP位点在检测小麦根系性状中的应用

本实施例中的待测小麦为27个非扬麦16/中麦895DH群体的后代品种和中麦895。

其中26个非扬麦16/中麦895DH群体后代品种为测试组，中麦895为对照组；包括周麦30、淮麦18、淮麦20、济麦19、济麦21、京双16、济麦22、晋麦45、良星66、周麦20、郑农21、洛麦26、中金13、烟农19、皖麦38、汶农14、小偃54、光泰68、先麦12、豫麦63、周麦16、周麦18、周麦22、周麦31、周麦32。

一、常规检测不同待测小麦品种的苗期根系性状

小麦品种苗期根系性状鉴定于2015年冬在中国农业科学院作物科学研究所温室中进行。每个待测小麦品种选取饱满且大小一致的种子30粒，用10％的H₂O₂处理20-30分钟，无菌水冲洗5-6次；再将种子置于铺有滤纸的培养皿中，在培养箱中暗室催芽18-24h；然后挑选发芽一致的种子25粒置于发苗网上，生长6天后选取大小一致的麦苗10株转移至培养盘中，每个培养盘进行3次重复；再将培养盘置于营养液中在可控温室中进行培养。营养液配置参照文献(Ren Y,He X,Liu D,Li J,Zhao X,Li B,Tong Y,Zhang A,Li Z.Majorquantitative trait loci for seminal root morphology of wheatseedlings.Molecular Breeding,2012,30:139-148，公众可从中国农业科学院作物科学研究所获得。)。幼苗培养条件为温度22±1℃，相对湿度在50％-60％。每3天更换一次营养液，连续培养10天后对苗期根部进行收获。用扫描仪对各品种收获后的根系进行扫描，再用图像分析软件Win RHIZO(加拿大Regent Instruments公司)分析根部性状包括最长根长、侧根长、主根长、总根长、侧根表面积、主根表面积、总根表面积、总根尖数和根系干重。

总根长的定义：小麦三叶期幼苗所有根的长度之和，即根系总长。

二、AX110602569SNP位点在检测小麦根系性状中的应用

1、提取待测小麦的基因组DNA

分别提取各个待测小麦的基因组DNA。

2、PCR扩增

以上述基因组DNA为模板，用实施例1得到5’端添加特异荧光序列FAM的序列1所示引物、5’端添加特异荧光序列HEX的序列2所示引物和序列3所示引物进行PCR扩增。

将得到的PCR扩增产物(序列4)在PHERAstar^plus荧光酶标仪上用荧光照射进行基因分型，然后在KlusterCaller^TM软件读取分型后的数据。

对各小麦品种PCR扩增产物进行两两比较，若A小麦PCR扩增产物仅为显示红色(AX110602569SNP位点为C的纯合体，基因型为C：C)，B小麦的PCR扩增产物为仅显示蓝色或绿色(AX110602569SNP位点为T的纯合体，基因型为T：T或AX110602569SNP位点为C/T杂合体，基因型为C：T)，则A小麦的根系性状(总根长)优于B小麦。

上述各个小麦的基因型(图3)及其小麦根系性状(根长)见表2所示。

表2 26个小麦品种的SNP位点的基因型和总根长结果

注：中麦895为CC；扬麦16为TT。

以上结果表明：济麦22、晋麦45、皖麦38、汶农14、小偃54、周麦16、周麦18、周麦22、周麦31、周麦32在SNP位点基因型为C:C，并且这些小麦均具有较长的根系总长。从上述结果中还可看出，SNP位点的基因型为CC的小麦的总根长要大于基因型为CT或TT的小麦。

上述结果表明，上述SNP位点可以快速、准确地鉴定小麦品种是否具有较长的总根长。

序列表

<110> 中国农业科学院作物科学研究所

<120>一种与小麦苗期根系性状相关的SNP标记及应用

<160> 4

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 1

gaaggtgacc aagttcatgc ttttattttt gggcactgcc 40

<210> 2

<211> 40

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 2

gaaggtcgga gtcaacggat ttttattttt gggcactgct 40

<210> 3

<211> 19

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<223>

<400> 3

tgggtcacag gacacgtgt 19

<210> 4

<211> 126

<212> DNA

<213> 人工序列

<220>

<221>misc_feature

<220>(19)

<223> y=c或t

<400> 4

tttatttttg ggcactgcya cgcgtccttc ggtcgatgtt tagattttgg aaaattttat 60

tctaggccgg atgaaaactc ccgaacgcaa gccgcttcct gcgatggaca cgtgtcctgt 120

gaccca 126

Claims

1.检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦根系性状中的应用；

所述AX-110602569-7A基因在小麦染色体7AS上的39cM位置。

2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：

所述AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC或TT或CT；

或所述小麦根系性状为总根长；

或所述AX-110602569-7A基因的核苷酸序列为序列4。

3.检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质在选育总根长延长的小麦中的应用。

4.根据权利要求1-3中任一所述的应用，其特征在于：

2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。

5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述序列表中序列1所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子的5'端连接一种荧光序列；

所述序列表中序列2所示的单链DNA分子的衍生物为序列1所示的单链DNA分子的5'端连接另一种荧光序列；

或，所述荧光基团序列为荧光序列FAM或荧光序列HEX。

6.一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的方法，为检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT，基因型为CC的待测小麦总根长大于基因型为TT或CT的待测小麦总根长；

或一种选育根系性状好的小麦的方法，为检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT，选择基因型为CC的小麦进行选育，得到目的小麦。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于：

所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC还是TT还是CT的方法为如下A)或B)：

A)直接测序；

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于：

所述基因分型的方法为采用荧光酶标仪照射后，若所述PCR产物仅显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为CC；若所述PCR产物仅显示序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型为TT；

若所述PCR产物显示序列1所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色和序列2所示DNA分子5'端连接荧光序列的颜色，则待测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第36位脱氧核糖核苷酸的基因型为CT。

9.一种鉴定或辅助鉴定小麦根系性状的物质，为权利要求1-5所述应用中的所述检测小麦基因组中AX-110602569-7A基因第19位脱氧核糖核苷酸的基因型的物质。

10.根据权利要求1-5任一所述的应用或权利要求6-8任一所述的方法或权利要求9所述的物质，其特征在于：所述小麦根系性状为小麦苗期根系性状。