CN107022610A - 肿瘤驱动基因的检测芯片及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了肿瘤驱动基因的检测芯片及其应用，上述肿瘤驱动基因的检测芯片包括ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂。通过特异性的针对ALK、EGFR、RET以及ROS1设计相应的融合探针，临床检测的结果表明，该检测芯片灵敏度高，能够特异性的检测ALK、EGFR、RET以及ROS1在特定的位点区域是否与融合片断发生基因融合。进一步包括用于检测基因突变第二序列组以及用于检测基因扩增的第三序列组的检测芯片，通过一次检测即能够同时检测包括ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1在内的多种肿瘤驱动基因是否发生基因融合、基因突变及基因扩增。

Description

肿瘤驱动基因的检测芯片及其应用
技术领域
本发明涉及生物技术领域，特别是涉及一种肿瘤驱动基因的检测芯片及其应用。
背景技术
肿瘤是一组由驱动基因所致的恶性疾病，具有高发病率、高死亡率的特征。较为常见的肿瘤驱动基因例如有ALK基因、BRAF基因、DDR2基因、EGFR基因、ERBB2基因、FGFR1基因、KRAS基因、MET基因、NRAS基因、PIK3CA基因、RET基因以及ROS1基因等。近10年来，我国肿瘤的发病率快速增长，严重危害公众健康。临床研究发现，约87％的患者已有可知驱动基因，其中约有81％驱动基因已有明确的靶向抑制剂，66％患者可接受已上市药物的个体化靶向治疗。研究结果表明通过检测驱动基因，并且接受靶向治疗，患者生存期至少可延长1年以上。NCCN指南(2017版)明确提出：肿瘤患者分子检测应选择更为广谱的分子分型，因为这是提高患者获益的关键。因此检测肿瘤驱动基因并针对性的指导个体化靶向治疗非常有必要。
然而，由于肿瘤驱动基因变异形式多样，常有突变、扩增或融合等变异形式，特别是肿瘤驱动基因容易与源自CCDC6基因、CD74基因、CLTC基因或ERC1基因等等的融合片断发生基因融合。传统的检测产品灵敏度较低，一般仅针对肿瘤驱动基因的突变或扩增设计，而对于肿瘤驱动基因是否与融合片断发生基因融合则较难检测。
发明内容
基于此，有必要提供一种灵敏度较高，能够特异性的检测肿瘤驱动基因是否与融合片断发生基因融合的检测芯片及其应用。
一种肿瘤驱动基因的检测芯片，所述检测芯片上包括用于检测基因融合的第一序列组，所述第一序列组包括ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂；
所述ALK融合检测剂用于检测ALK基因与融合片断融合后形成的ALK融合基因；
所述EGFR融合检测剂用于检测EGFR基因与所述融合片断融合后形成的EGFR融合基因；
所述RET融合检测剂用于检测RET基因与所述融合片断融合后形成的RET融合基因；
所述ROS1融合检测剂用于检测ROS1基因与所述融合片断融合后形成的ROS1融合基因。
在一个实施方式中，所述ALK融合检测剂针对2号染色体第29446129～29448537位点区域内的ALK基因设计；
所述EGFR融合检测剂针对7号染色体第55267769～55269109位点区域内的EGFR基因设计；
所述RET融合检测剂针对10号染色体第43610118～43612098位点区域内的RET基因设计；
所述ROS1融合检测剂针对6号染色体第117640938～117658598位点区域内的ROS1基因设计。
在一个实施方式中，所述融合片断源自CCDC6基因、CD74基因、CLTC基因、ERC1基因、EZR基因、GOLGA5基因、GOPC基因、KIF5B基因、KLC1基因、KTN1基因、LRIG3基因、NCOA4基因、NPM1基因、PRKAR1A基因、PURB基因、RAD51基因、SDC4基因、SLC34A2基因、STRN基因、TFG基因、TPM3基因、TRIM24基因及TRIM33基因中的至少一种。
在一个实施方式中，，所述ALK融合检测剂包括如SEQ ID No.1～SEQ ID No.27所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述EGFR融合检测剂包括如SEQ ID No.28～SEQ ID No.46所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述RET融合检测剂包括如SEQ ID No.47～SEQ ID No.78所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述ROS1融合检测剂包括如SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示的核苷酸链中的至少一条。
在一个实施方式中，如SEQ ID No.1所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446129～29446249位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.2所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446189～29446309位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.3所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446249～29446369位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.4所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446309～29446429位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.5所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446396～29446489位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.6所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446429～29446549位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.7所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446489～29446609位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.8所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446549～29446669位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.9所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447338～29447457位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.10所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447397～29447517位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.11所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447457～29447577位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.12所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447517～29447637位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.13所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447577～29447697位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.14所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447637～29447757位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.15所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447697～29447817位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.16所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447757～29447877位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.17所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447817～29447937位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.18所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447877～29447997位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.19所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447937～29448057位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.20所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447997～29448117位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.21所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448057～29448177位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.22所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448117～29448237位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.23所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448177～29448297位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.24所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448237～29448357位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.25所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448297～29448417位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.26所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448357～29448477位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.27所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448417～29448537位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合。
在一个实施方式中，，如SEQ ID No.28所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267769～55267889位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.29所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267829～55267949位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.30所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267889～55268009位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.31所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267949～55268069位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.32所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268009～55268129位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.33所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268069～55268189位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.34所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268129～55268249位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.35所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268189～55268309位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.36所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268249～55268369位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.37所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268309～55268428位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.38所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268595～55268715位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.39所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268629～55268749位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.40所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268640～55268760位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.41所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268689～55268809位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.42所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268749～55268869位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.43所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268809～55268929位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.44所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268869～55268989位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.45所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268929～55269049位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.46所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268989～55269109位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合。
在一个实施方式中，如SEQ ID No.47所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610118～43610238位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.48所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610178～43610298位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.49所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610238～43610358位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.50所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610298～43610418位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.51所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610358～43610478位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.52所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610418～43610538位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.53所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610478～43610598位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.54所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610538～43610658位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.55所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610598～43610718位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.56所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610658～43610778位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.57所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610718～43610838位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.58所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610778～43610898位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.59所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610838～43610958位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.60所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610898～43611018位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.61所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610958～43611078位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.62所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611018～43611138位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.63所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611078～43611198位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.64所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611138～43611258位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.65所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611198～43611318位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.66所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611258～43611378位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.67所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611318～43611438位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.68所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611378～43611498位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.69所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611438～43611558位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.70所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611498～43611618位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.71所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611558～43611678位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.72所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611618～43611738位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.73所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611678～43611798位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.74所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611738～43611858位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.75所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611798～43611918位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.76所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611858～43611978位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.77所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611918～43612038位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.78所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611978～43612098位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合。
在一个实施方式中，所述检测芯片上还包括用于检测基因突变第二序列组以及用于检测基因扩增的第三序列组；
所述第二序列组包括ALK突变检测剂、BRAF突变检测剂、DDR2突变检测剂、EGFR突变检测剂、ERBB2突变检测剂、FGFR1突变检测剂、KRAS突变检测剂，MET突变检测剂、NRAS突变检测剂、PIK3CA突变检测剂、RET突变检测剂以及ROS1突变检测剂；
所述第三序列组包括ALK扩增检测剂、MET扩增检测剂、PIK3CA扩增检测剂以及FGFR1扩增检测剂；
所述ALK突变检测剂针对2号染色体上外显子1～外显子27中的ALK突变基因进行设计，所述BRAF突变检测剂针对7号染色体外显子11～外显子15中的BRAF突变基因进行设计，DDR2突变检测剂针对1号染色体外显子1～外显子19中DDR2突变基因进行设计，EGFR突变检测剂针对7号染色体外显子18～外显子21中EGFR突变基因进行设计，ERBB2突变检测剂针对17号染色体外显子8～外显子21中ERBB2突变基因进行设计，FGFR1突变检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1突变基因进行设计，KRAS突变检测剂针对12号染色体外显子1～外显子6中的KRAS突变基因进行设计，MET突变检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET突变基因进行设计，NRAS突变检测剂针对1号染色体上外显子2和外显子3的NRAS突变基因进行设计，PIK3CA突变检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA突变基因进行设计，RET突变检测剂针对10号染色体上外显子1～外显子20中的RET突变基因进行设计，ROS1突变检测剂针对6号染色体上外显子1～外显子44中的ROS1突变基因进行设计；
所述ALK扩增检测剂针对2号染色体外显子1～外显子27中的的ALK扩增基因进行设计，所述MET扩增检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET扩增基因进行设计，所述PIK3CA扩增检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA扩增基因进行设计，所述FGFR1扩增检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1扩增基因进行设计。
在一个实施方式中，所述ALK扩增检测剂包括如SEQ ID No.196～SEQ ID No.197所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述MET扩增检测剂包括如SEQ ID No.198～SEQ ID No.199所示的核苷酸链中的至少一条。
上述的肿瘤驱动基因的检测芯片在肿瘤的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中的应用。
上述肿瘤驱动基因的检测芯片包括用于检测基因融合的第一序列组，第一序列组包括ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂。根据检测方法不同，检测剂例如可以是探针或引物等。其中，ALK融合检测剂用于检测ALK基因与融合片断融合后形成的ALK融合基因。EGFR融合检测剂用于检测EGFR基因与所述融合片断融合后形成的EGFR融合基因。RET融合检测剂用于检测RET基因与所述融合片断融合后形成的RET融合基因。ROS1融合检测剂用于检测ROS1基因与所述融合片断融合后形成的ROS1融合基因。通过特异性的针对ALK、EGFR、RET以及ROS1设计相应的融合检测剂，临床检测的结果表明，该检测芯片灵敏度高，能够特异性的检测ALK、EGFR、RET以及ROS1在特定的位点区域是否与融合片断发生基因融合。
另外，进一步包括用于检测基因突变第二序列组以及用于检测基因扩增的第三序列组的检测芯片，通过一次检测即能够同时检测包括ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1在内的多种肿瘤驱动基因是否发生基因融合、基因突变及基因扩增。
具体实施方式
下面主要结合具体实施例对本发明做进一步的解释说明。
一实施方式的肿瘤驱动基因的检测芯片，该检测芯片上包括用于检测基因融合的第一序列组。第一序列组包括ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂。其中，ALK融合检测剂用于检测ALK基因与融合片断融合后形成的ALK融合基因。EGFR融合检测剂用于检测EGFR基因与所述融合片断融合后形成的EGFR融合基因。RET融合检测剂用于检测RET基因与所述融合片断融合后形成的RET融合基因。ROS1融合检测剂用于检测ROS1基因与所述融合片断融合后形成的ROS1融合基因。
一般地，基因融合是指两个或多个基因编码区相连，在调控序列(包括启动子、增强子、核糖体结合序列、终止子等)的控制之下，部分或全部的序列构成一个新的杂合基因。发生基因融合后，相应的位点区域的基因发生改变。通过特异性的针对ALK、EGFR、RET以及ROS1设计相应的融合检测剂。例如当ALK基因与融合片断发生融合时，ALK基因内部的某些位点区域的序列会发生改变，通过ALK融合检测剂能够针对性的捕获到发生融合后的ALK融合基因，从而检测ALK在特定的位点区域是否与融合片断发生基因融合。其他的EGFR基因、RET基因以及ROS1基因的设计方案类似。
具体地，根据检测方法不同，检测剂例如可以是探针或引物等。本实施方式中，检测剂为探针，探针捕获灵敏度高、特异性好。
在一个实施方式中，ALK融合检测剂针针2号染色体第29446129～29448537位点区域内的ALK基因设计。EGFR融合检测剂针对7号染色体第55267769～55269109位点区域内的EGFR基因设计。RET融合检测剂针对10号染色体第43610118～43612098位点区域内的RET基因设计。ROS1融合检测剂针对6号染色体第117640938～117658598位点区域内的ROS1基因设计。融合的基因为点可能会有很多，针对性的设计能够提高检测的灵敏度。例如，ALK融合检测剂能够针对性的检测2号染色体第29446129～29448537位点区域内融合后的ALK融合基因，从而检测ALK在该特定位点区域内是否与融合片断发生了基因融合。
在一个实施方式中，ALK融合检测剂可以包括如SEQ ID No.1～SEQ ID No.27所示的核苷酸链中的至少一条。
具体地，如SEQ ID No.1所示的核苷酸链针对2号染色体第29446129～29446249位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.2所示的核苷酸链针对2号染色体第29446189～29446309位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.3所示的核苷酸链针对2号染色体第29446249～29446369位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.4所示的核苷酸链针对2号染色体第29446309～29446429位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.5所示的核苷酸链针对2号染色体第29446396～29446489位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.6所示的核苷酸链针对2号染色体第29446429～29446549位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.7所示的核苷酸链针对2号染色体第29446489～29446609位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.8所示的核苷酸链针对2号染色体第29446549～29446669位点区域的ALK基因设计。如SEQ IDNo.9所示的核苷酸链针对2号染色体第29447338～29447457位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.10所示的核苷酸链针对2号染色体第29447397～29447517位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.11所示的核苷酸链针对2号染色体第29447457～29447577位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.12所示的核苷酸链针对2号染色体第29447517～29447637位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.13所示的核苷酸链针对2号染色体第29447577～29447697位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.14所示的核苷酸链针对2号染色体第29447637～29447757位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.15所示的核苷酸链针对2号染色体第29447697～29447817位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.16所示的核苷酸链针对2号染色体第29447757～29447877位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.17所示的核苷酸链针对2号染色体第29447817～29447937位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.18所示的核苷酸链针对2号染色体第29447877～29447997位点区域的ALK基因设计。如SEQ IDNo.19所示的核苷酸链针对2号染色体第29447937～29448057位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.20所示的核苷酸链针对2号染色体第29447997～29448117位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.21所示的核苷酸链针对2号染色体第29448057～29448177位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.22所示的核苷酸链针对2号染色体第29448117～29448237位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.23所示的核苷酸链针对2号染色体第29448177～29448297位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.24所示的核苷酸链针对2号染色体第29448237～29448357位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.25所示的核苷酸链针对2号染色体第29448297～29448417位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.26所示的核苷酸链针对2号染色体第29448357～29448477位点区域的ALK基因设计。如SEQ ID No.27所示的核苷酸链针对2号染色体第29448417～29448537位点区域的ALK基因设计。
具体地，ALK融合检测剂可以包括一条核苷酸链也可以包括多条核苷酸链。例如1条、3条、9条、27条等等。可以根据具体检测的位点区域选用不同的检测剂。在一个实施方式中，ALK融合检测剂包括27条核苷酸链，分别如SEQ ID No.1～SEQ ID No.27所示。多条核苷酸链能够捕获相应的捕获多个特定位点区域内发生融合后ALK基因，从而判定具体在哪一个位点区域ALK基因与融合片断发生了基因融合。
在一个实施方式中，EGFR融合检测剂包括如SEQ ID No.28～SEQ ID No.46所示的核苷酸链中的至少一条。
具体地，如SEQ ID No.28所示的核苷酸链针对7号染色体第55267769～55267889位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.29所示的核苷酸链针对7号染色体第55267829～55267949位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.30所示的核苷酸链针对7号染色体第55267889～55268009位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.31所示的核苷酸链针对7号染色体第55267949～55268069位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.32所示的核苷酸链针对7号染色体第55268009～55268129位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.33所示的核苷酸链针对7号染色体第55268069～55268189位点区域的EGFR基因设计。如SEQ IDNo.34所示的核苷酸链针对7号染色体第55268129～55268249位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.35所示的核苷酸链针对7号染色体第55268189～55268309位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.36所示的核苷酸链针对7号染色体第55268249～55268369位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.37所示的核苷酸链针对7号染色体第55268309～55268428位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.38所示的核苷酸链针对7号染色体第55268595～55268715位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.39所示的核苷酸链针对7号染色体第55268629～55268749位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.40所示的核苷酸链针对7号染色体第55268640～55268760位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.41所示的核苷酸链针对7号染色体第55268689～55268809位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.42所示的核苷酸链针对7号染色体第55268749～55268869位点区域的EGFR基因设计。如SEQ IDNo.43所示的核苷酸链针对7号染色体第55268809～55268929位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.44所示的核苷酸链针对7号染色体第55268869～55268989位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.45所示的核苷酸链针对7号染色体第55268929～55269049位点区域的EGFR基因设计。如SEQ ID No.46所示的核苷酸链针对7号染色体第55268989～55269109位点区域的EGFR基因设计。
具体地，EGFR融合检测剂可以包括一条核苷酸链也可以包括多条核苷酸链。例如1条、3条、9条或19条等等。可以根据具体检测的位点区域选用不同的检测剂。在一个实施方式中，EGFR融合检测剂包括19条核苷酸链，分别如SEQ ID No.28～SEQ ID No.46所示。多条核苷酸链能够捕获相应的捕获多个特定位点区域内发生融合后EGFR基因，从而判定具体在哪一个位点区域EGFR基因与融合片断发生了基因融合。
在一个实施方式中，RET融合检测剂包括如SEQ ID No.47～SEQ ID No.78所示的核苷酸链中的至少一条。
具体地，如SEQ ID No.47所示的核苷酸链针对10号染色体第43610118～43610238位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.48所示的核苷酸链针对10号染色体第43610178～43610298位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.49所示的核苷酸链针对10号染色体第43610238～43610358位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.50所示的核苷酸链针对10号染色体第43610298～43610418位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.51所示的核苷酸链针对10号染色体第43610358～43610478位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.52所示的核苷酸链针对10号染色体第43610418～43610538位点区域的RET基因设计。如SEQ IDNo.53所示的核苷酸链针对10号染色体第43610478～43610598位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.54所示的核苷酸链针对10号染色体第43610538～43610658位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.55所示的核苷酸链针对10号染色体第43610598～43610718位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.56所示的核苷酸链针对10号染色体第43610658～43610778位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.57所示的核苷酸链针对10号染色体第43610718～43610838位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.58所示的核苷酸链针对10号染色体第43610778～43610898位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.59所示的核苷酸链针对10号染色体第43610838～43610958位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.60所示的核苷酸链针对10号染色体第43610898～43611018位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.61所示的核苷酸链针对10号染色体第43610958～43611078位点区域的RET基因设计。如SEQ IDNo.62所示的核苷酸链针对10号染色体第43611018～43611138位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.63所示的核苷酸链针对10号染色体第43611078～43611198位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.64所示的核苷酸链针对10号染色体第43611138～43611258位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.65所示的核苷酸链针对10号染色体第43611198～43611318位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.66所示的核苷酸链针对10号染色体第43611258～43611378位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.67所示的核苷酸链针对10号染色体第43611318～43611438位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.68所示的核苷酸链针对10号染色体第43611378～43611498位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.69所示的核苷酸链针对10号染色体第43611438～43611558位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.70所示的核苷酸链针对10号染色体第43611498～43611618位点区域的RET基因设计。如SEQ IDNo.71所示的核苷酸链针对10号染色体第43611558～43611678位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.72所示的核苷酸链针对10号染色体第43611618～43611738位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.73所示的核苷酸链针对10号染色体第43611678～43611798位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.74所示的核苷酸链针对10号染色体第43611738～43611858位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.75所示的核苷酸链针对10号染色体第43611798～43611918位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.76所示的核苷酸链针对10号染色体第43611858～43611978位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.77所示的核苷酸链针对10号染色体第43611918～43612038位点区域的RET基因设计。如SEQ ID No.78所示的核苷酸链针对10号染色体第43611978～43612098位点区域的RET基因设计。
具体地，RET融合检测剂可以包括一条核苷酸链也可以包括多条核苷酸链。例如1条、3条、20条或32条等等。可以根据具体检测的位点区域选用不同的检测剂。在一个实施方式中，RET融合检测剂包括32条核苷酸链，分别如SEQ ID No.47～SEQ ID No.78所示。多条核苷酸链能够捕获相应的捕获多个特定位点区域内发生融合后RET基因，从而判定具体在哪一个位点区域RET基因与融合片断发生了基因融合。
在一个实施方式中，ROS1融合检测剂包括如SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示的核苷酸链中的至少一条。
具体地，如SEQ ID No.79所示的核苷酸链针对6号染色体第117640938～117641058位点区域的ROS1基因设计。SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示的核苷酸链具体的检测6号染色体上的检测区域如下表1所示。
表1：SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示的核苷酸链具体的检测区域
具体地，ROS1融合检测剂可以包括一条核苷酸链也可以包括多条核苷酸链。例如1条、40条、50条或117条等等。可以根据具体检测的位点区域选用不同的检测剂。在一个实施方式中，ROS1融合检测剂包括117条核苷酸链，分别如SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示。多条核苷酸链能够捕获相应的捕获多个特定位点区域内发生融合后RET基因，从而判定具体在哪一个位点区域RET基因与融合片断发生了基因融合。
进一步地，在一个实施方式中，SEQ ID No.1～SEQ ID No.195所示核苷酸链的检测剂均为探针。检测芯片上包括SEQ ID No.1～SEQ ID No.195所示核苷酸链的所有的探针，从而能够特异性的检测ALK基因、EGFR基因、RET基因以及ROS1基因是否发生基因融合。
在一个实施方式中，能够与ALK基因、EGFR基因、RET基因以及ROS1基因发生基因融合的融合片断源自CCDC6基因、CD74基因、CLTC基因、ERC1基因、EZR基因、GOLGA5基因、GOPC基因、KIF5B基因、KLC1基因、KTN1基因、LRIG3基因、NCOA4基因、NPM1基因、PRKAR1A基因、PURB基因、RAD51基因、SDC4基因、SLC34A2基因、STRN基因、TFG基因、TPM3基因、TRIM24基因及TRIM33基因中的至少一种。研究表明，上述基因中的一些片段容易与ALK基因、EGFR基因、RET基因或者ROS1基因发生基因融合。因此针对性的对上述融合片断设计相应的ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂的序列，提高检测的确确性。
在一个实施方式中，该肿瘤驱动基因的检测芯片还包括针对上述融合片断设计的融合检测剂。例如CCDC6融合检测剂、CD74融合检测剂、CLTC融合检测剂、ERC1融合检测剂、EZR融合检测剂、GOLGA5融合检测剂、GOPC融合检测剂、KIF5B融合检测剂、KLC1融合检测剂、KTN1融合检测剂、LRIG3融合检测剂、NCOA4融合检测剂、NPM1融合检测剂、PRKAR1A融合检测剂、PURB融合检测剂、RAD51融合检测剂、SDC4融合检测剂、SLC34A2融合检测剂、STRN融合检测剂、TFG融合检测剂、TPM3融合检测剂、TRIM24融合检测剂及TRIM33融合检测剂。例如，当CCDC6基因与ALK、EGFR、RET或者ROS1发生融合时，该CCDC6融合检测剂用于检测融合后的CCDC6融合基因。进一步地，当ALK融合检测剂和CCDC6融合检测剂均有显示捕获到相应的基因时，推测ALK与CCDC6在特定的区域发生了基因融合，其他融合检测剂也类似。通过针对融合片断设计的融合检测剂，更加准确的知道ALK、EGFR、RET以及ROS1具体与哪一个基因发生了基因融合。
具体地，CCDC6融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.200所示。CD74融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.201所示。CLTC融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.202所示。ERC1融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.203所示。EZR融合检测剂的核苷酸链如SEQ IDNo.204所示。GOLGA5融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.205所示。GOPC融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.206所示。KIF5B融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.207所示。KLC1融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.208所示。KTN1融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.209所示。LRIG3融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.210所示。NCOA4融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.211所示。NPM1融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.212所示。PRKAR1A融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.213所示。PURB融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.214所示。RAD51融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.215所示。SDC4融合检测剂的核苷酸链如SEQ IDNo.216所示。SLC34A2融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.217所示。STRN融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.218所示。TFG融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.219所示。TPM3融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.220所示。TRIM24融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.221所示。TRIM33融合检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.222所示。
在其他实施方式中，可以理解，针对与融合基因融合而设计的ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂时，可以根据现有的文献或数据库报道，选择相应的两种或两种以上基因的融合位点信息，并针对该融合位点在特定的区域内设计检测剂序列。
在一个实施方式中，检测芯片上还包括用于检测基因突变第二序列组以及用于检测基因扩增的第三序列组。该检测芯片能够用于同时检测多种肿瘤驱动基因，多种肿瘤驱动基因包括ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1。其中，第二序列组包括ALK突变检测剂、BRAF突变检测剂、DDR2突变检测剂、EGFR突变检测剂、ERBB2突变检测剂、FGFR1突变检测剂、KRAS突变检测剂，MET突变检测剂、NRAS突变检测剂、PIK3CA突变检测剂、RET突变检测剂以及ROS1突变检测剂。第三序列组包括ALK扩增检测剂、MET扩增检测剂、PIK3CA扩增检测剂以及FGFR1扩增检测剂。
ALK突变检测剂针对2号染色体上外显子1～外显子27中的ALK基因进行设计。BRAF突变检测剂针对7号染色体外显子11～外显子15中的BRAF基因进行设计。DDR2突变检测剂针对1号染色体外显子1～外显子19中DDR2基因进行设计。EGFR突变检测剂针对7号染色体外显子18～外显子21中EGFR基因进行设计。ERBB2突变检测剂针对17号染色体外显子8～外显子21中ERBB2基因进行设计。FGFR1突变检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1基因进行设计。KRAS突变检测剂针对12号染色体外显子1～外显子6中的KRAS基因进行设计。MET突变检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET基因进行设计。NRAS突变检测剂针对1号染色体上外显子2和外显子3的NRAS基因进行设计。PIK3CA突变检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA基因进行设计。RET突变检测剂针对10号染色体上外显子1～外显子20中的RET基因进行设计。ROS1突变检测剂针对6号染色体上外显子1～外显子44中的ROS1基因进行设计。ALK扩增检测剂针对2号染色体外显子1～外显子27中的的ALK扩增基因进行设计。MET扩增检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET扩增基因进行设计。PIK3CA扩增检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA扩增基因进行设计。FGFR1扩增检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1扩增基因进行设计。
在一个实施方式中，ALK扩增检测剂包括如SEQ ID No.196～SEQ ID No.197所示的核苷酸链中的至少一条。
在一个实施方式中，MET扩增检测剂包括如SEQ ID No.198～SEQ ID No.199所示的核苷酸链中的至少一条。
具体地，ALK突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.223所示。BRAF突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.224所示。DDR2突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.225所示。EGFR突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.226所示。ERBB2突变检测剂的核苷酸链如SEQ IDNo.227所示。FGFR1突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.228所示。KRAS突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.229所示。MET突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.230所示。NRAS突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.231所示。PIK3CA突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.232所示。RET突变检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.233所示。ROS1突变检测剂的核苷酸链如SEQID No.234所示。
具体地，PIK3CA扩增检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.235所示。FGFR1扩增检测剂扩增检测剂的核苷酸链如SEQ ID No.236所示。
更进一步地，在一个实施方式中，检测剂为探针，该检测芯片上包括如SEQ IDNo.1～SEQ ID No.236所示的核苷酸链的所有的探针。从而能够特异性的同时检测ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1多种基因的融合以及突变或扩增，一次检测所有的驱动基因，节约样本。
上述检测芯片上包括用于检测融合基因的第一序列组以及用于检测突变或扩增的第二序列组，特异性的针对融合基因设计相应的融合基因检测剂，并在针对特定的区域设计相应的突变或扩增的检测剂。临床检测的结果表明，该检测芯片灵敏度高、特异性高，能够同时检测包括ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1在内的多种肿瘤驱动基因具体的基因的融合、突变及扩增，能够通过一次检测所有的驱动基因，节约样本。
上述检测芯片可以应用在肿瘤的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中，特别是在肺癌的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中。
进一步地，可以根据上述检测芯片的临床检测数据，判断ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1的发生的融合、突变及扩增的类型，从而指导用药。例如可参考如下表2所示的方案推荐。
表2：驱动基因变异与临床用药的关系
上述检测芯片对于样本的需求量少，通过对特定区域设计检测剂并对外显子与内含子测序，只需一次检测将ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1融合、突变及扩增等类型一一测定，节约组织样本，可以广泛应用在肿瘤特别是在肺癌的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中。
下面为具体实施例部分。
以下实施例中，如无特别说明，未注明具体条件的实验方法，通常按照常规条件。
实施例1
在检测芯片上设有如SEQ ID No.1～SEQ ID No.236所示序列的236个探针，用该检测芯片检测非小细胞肺癌患者的静脉血为样本(由金华中医院提供)中12个肿瘤驱动基因的变异情况，该12个肿瘤驱动基因分别为ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1。测序平台为Illumina，参考基因组为GRCh37/hg19，参考转录组为Ensembl75。参考数据库有COSMIC(版本v74)、dbSNP(版本v142)、iCMDB(版本4.0.0)。过滤条件如下：
1.保留满足以下过滤条件的变异:a.碱基质量>20，b.序列比对质量>50，c.链偏好性<90％，d.P值<0.001支持变异的测序短片段数目vs.期望基准误差，e.变异位点总读数深度>＝30，f.样本中支持SNP变异的测序短片段读数>＝3，g.样本中支持Indel变异的测序短片段数>＝5。
2.其它过滤条件使用软件默认参数
3.只保留非同义突变，或者位于基因编码区/选择性拼接位点的插入/缺失变异。
4.只保留panel目标检测区的变异。
5.与靶向药物/化疗药物/预后相关的突变位点列在了临床相关突变列表中。
6.不满足条件5的变异位点，但位于文献报道的有临床意义的区域(密码子、外显子、基因或染色体)列在了临床相关变异区域列表中。
7.具有临床意义的多态位点列在了临床相关多态位点列表中。
通过检测芯片上的探针检测样本中的序列，并与正常人作对比。SEQ ID No.28和SEQ ID No.229所示的核苷酸链能够捕获相应的基因。分析结果为：该样本的EGFR外显子19缺失，发生基因融合，具体位于7号染色体上第55267769～55267889位点区间，同时该样本还存在KRAS外显子2～3突变，具体位于12号染色体第25380168～25398329区域。
针对该检测结果第一推荐治疗药物:(1)吉非替尼，FDA已批准。(2)埃克替尼，CFDA已批准。(3)厄洛替尼，FDA已批准。(4)Brigatinib(AP26113)处于临床III期试验。(5)索拉非尼联合厄洛替尼或吉非替尼，临床II期试验。(6)索拉非尼，临床II期试验。
第二推荐治疗药物:(1)阿法替尼，FDA已批准。(2)Abemaciclib，临床III期试验。(3)AZD3759，临床I期试验。
第三推荐治疗药物：(1)ASP8273，临床III期试验。(2)安卓健，临床II期试验。
不推荐治疗药物：暂无。
注：第一推荐表示有系统评价/随机对照研究证实相关变异对该药敏感/部分敏感。第二推荐表示有队列研究/病例对照/病例系列/病例报告研究证实相关变异对该药敏感/部分敏感。第三推荐表示有动物试验/细胞系试验证实相关变异对该药敏感/部分敏感；或者有研究证实变异对该药的同类型药(如TKI)敏感/部分敏感，推理对该药也敏感/部分敏感。不推荐表示有研究证实相关变异对该药耐药/部分耐药。
以上结果显示，该检测芯片灵敏度高，一次检测即能够同时检测包括ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1在内的多种肿瘤驱动基因的融合、突变及扩增。对于样本的需求量少，只需一次检测将ALK、BRAF、DDR2、EGFR、ERBB2、FGFR1、KRAS、MET、NRAS、PIK3CA、RET以及ROS1融合、突变及扩增等类型一一测定，节约组织样本，可以广泛应用在肿瘤特别是在肺癌的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中。
以上所述实施例仅表达了本发明的一种或几种实施方式，其描述较为具体和详细，但并不能因此而理解为对本发明专利范围的限制。应当指出的是，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明构思的前提下，还可以做出若干变形和改进，这些都属于本发明的保护范围。因此，本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。
SEQUENCE LISTING
<110> 常州桐树生物科技有限公司
<120> 肿瘤驱动基因的检测芯片及其应用
<160> 236
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
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<212> DNA
<213> ALK融合探针
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tgacctgaag gaggtgccgc ggaaaaacat caccctcatt cggtgagcgc cctgctgccg 60
tcctgggagg agaggggtgc agtgtagggg ctgaatgtta tcacagcacc gcagactcct 120
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<212> DNA
<213> ALK融合探针
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gaccatcatg accgactaca accccaacta ctgctttgct ggcaagacct cctccatcag 60
tgacctgaag gaggtgccgc ggaaaaacat caccctcatt cggtgagcgc cctgctgccg 120
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gcaagccatg cagatggagc tgcagagccc tgagtacaag ctgagcaagc tccgcacctc 60
gaccatcatg accgactaca accccaacta ctgctttgct ggcaagacct cctccatcag 120
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gccaggccat gttgcagctg accacccacc tgcagtgtac cgccggaagc accaggagct 60
gcaagccatg cagatggagc tgcagagccc tgagtacaag ctgagcaagc tccgcacctc 120
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tggagatcca gggaggcttc ctgtaggaag tggcctgtgt agtgcttcaa gggccaggct 60
gccaggccat gttgcagctg accacccacc tgcagtgtac cgccggaagc accaggagct 120
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ttaatcattt tattagtatt tctaagtatg atggaaaggt tcagagctca ggggaggata 60
tggagatcca gggaggcttc ctgtaggaag tggcctgtgt agtgcttcaa gggccaggct 120
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tatctgattt ttagctttgc atttacttta aatcatgctt caattaaaga cacaccttct 60
ttaatcattt tattagtatt tctaagtatg atggaaaggt tcagagctca ggggaggata 120
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cttggaggaa ccagactaac atgactctgc cctatataat acaaataatt attttccata 60
tatctgattt ttagctttgc atttacttta aatcatgctt caattaaaga cacaccttct 120
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ttggggggct gggctttaca cacagaatct acccactgaa tcacaatttt gttctggctt 60
ccatggagtt tgccttccag aacatcctca catgtaggag tgataatggt cactcacat 119
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cattgcatag aggagggaac tgagcacata gcgggtgact catttgccct ggcccatgtg 60
ttggggggct gggctttaca cacagaatct acccactgaa tcacaatttt gttctggctt 120
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caatttacac atttcaattc attcgatcct caggtaaccc taatctgatc acggtcggtc 60
cattgcatag aggagggaac tgagcacata gcgggtgact catttgccct ggcccatgtg 120
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tccctcaaag ggacaggata ataggagcta acacttgttg catggttact acgtgctcgg 60
caatttacac atttcaattc attcgatcct caggtaaccc taatctgatc acggtcggtc 120
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caaagggatc tgccggtaga agggagatgg cagcacacac tgtgtcccca tatggtgcca 60
tccctcaaag ggacaggata ataggagcta acacttgttg catggttact acgtgctcgg 120
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ggcttgaaaa gggcagaggg aaaggctctt gagagccctc gcaggccagg cccctgcagg 60
caaagggatc tgccggtaga agggagatgg cagcacacac tgtgtcccca tatggtgcca 120
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cagtgtggtc ccaaccagct cttactgctg gcagagacat gcccaggaca gatgggcaga 60
ggcttgaaaa gggcagaggg aaaggctctt gagagccctc gcaggccagg cccctgcagg 120
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gagtatattt ctgttcagcc tgtgagccaa ggtgagctga cctgcaggtc acagagaact 60
cagtgtggtc ccaaccagct cttactgctg gcagagacat gcccaggaca gatgggcaga 120
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ctcttcccca aaccagccct ccaccaccct ccaggcagag agataggaaa atcggtttct 60
gagtatattt ctgttcagcc tgtgagccaa ggtgagctga cctgcaggtc acagagaact 120
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<213> ALK融合探针
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cacatgcttc caccggcgca gctcctgttt ggctcccacc ctatgtaatg cactagccca 60
ctcttcccca aaccagccct ccaccaccct ccaggcagag agataggaaa atcggtttct 120
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<213> ALK融合探针
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ttcagtgtcc atcacgatgg tgaaagctcg cccccacccc tagacgtcac ttctagctcc 60
cacatgcttc caccggcgca gctcctgttt ggctcccacc ctatgtaatg cactagccca 120
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ctgattctgc acctcagccc cgtgtgtatc ctcctggctg atcagggggt ggggagctcc 60
ttcagtgtcc atcacgatgg tgaaagctcg cccccacccc tagacgtcac ttctagctcc 120
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ccaaaacgga agctcccaac cttcccccca ccagagcagc tgcagttccc tgaggagccc 60
ctgattctgc acctcagccc cgtgtgtatc ctcctggctg atcagggggt ggggagctcc 120
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acttcgttat gctagtccct ggaattgggt ggggtggtga ttagggcagc ccaggccaag 60
ccaaaacgga agctcccaac cttcccccca ccagagcagc tgcagttccc tgaggagccc 120
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agggggcagg aaggcaggac tgaatagtgt ctcaggctgt gccacaggtg ccaaggtgtc 60
acttcgttat gctagtccct ggaattgggt ggggtggtga ttagggcagc ccaggccaag 120
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ctggtcctgg ctttctccgg catcatgatt ggtgagtgca cagagcccca gggactccca 60
agggggcagg aaggcaggac tgaatagtgt ctcaggctgt gccacaggtg ccaaggtgtc 120
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gagccacacc tgccactctc gctgatcctc tctgtggtga cctctgccct cgtggccgcc 60
ctggtcctgg ctttctccgg catcatgatt ggtgagtgca cagagcccca gggactccca 120
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gagacctggt gtggttgtca ataccccagt gggacctgtc ttccagtgtc acccaccccg 60
gagccacacc tgccactctc gctgatcctc tctgtggtga cctctgccct cgtggccgcc 120
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ggagcaagta gtttttgtct cagtggggga ggttatttct gacttgggac caactcaaag 60
gagacctggt gtggttgtca ataccccagt gggacctgtc ttccagtgtc acccaccccg 120
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<213> EGFR融合探针
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gcgtagaaaa actagagggc attattgtta ttctgattca aatgtacagt gctggcatgg 60
tctttaaaca gtaaccagta ctagctggcc aagacagaaa agtctaccac aaagacttgg 120
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<213> EGFR融合探针
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tctttaaaca gtaaccagta ctagctggcc aagacagaaa agtctaccac aaagacttgg 60
ttctttcatc acttatttga ctggaagtgt cgcatcacca atgccttctt taagcaatgc 120
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ttctttcatc acttatttga ctggaagtgt cgcatcacca atgccttctt taagcaatgc 60
catctttatc atttcttcca gtgttctaat tgcactgttt tttctcattc cttccccagg 120
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<213> EGFR融合探针
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catctttatc atttcttcca gtgttctaat tgcactgttt tttctcattc cttccccagg 60
ctggatgata gacgcagata gtcgcccaaa gttccgtgag ttgatcatcg aattctccaa 120
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<213> EGFR融合探针
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ctggatgata gacgcagata gtcgcccaaa gttccgtgag ttgatcatcg aattctccaa 60
aatggcccga gacccccagc gctaccttgt cattcaggta caaattgcag tctgtgcttc 120
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<213> EGFR融合探针
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aatggcccga gacccccagc gctaccttgt cattcaggta caaattgcag tctgtgcttc 60
cattgggaag agtccctcta atgagcatct catgtcactg tgttctgtca catgccagcc 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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cattgggaag agtccctcta atgagcatct catgtcactg tgttctgtca catgccagcc 60
tggcctccct gtgtcccaga tcgcattatt aaaccctcca gcgcattaga gcaagcctca 120
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<213> EGFR融合探针
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tggcctccct gtgtcccaga tcgcattatt aaaccctcca gcgcattaga gcaagcctca 60
gtaaggcgca ggccacatcg tgaactaagc agcatccgtg agtggggccc acccaactcc 120
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<213> EGFR融合探针
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gtaaggcgca ggccacatcg tgaactaagc agcatccgtg agtggggccc acccaactcc 60
atctccccct ccccgtctga actctcctct ggtgctcgtc ctcactgtcc ggctagccaa 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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atctccccct ccccgtctga actctcctct ggtgctcgtc ctcactgtcc ggctagccaa 60
agcctcagct gggtctaaga gagaagcatg gtctattggg ctttggtgtc aggcagacg 119
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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actcgatgaa tgctgcagct tcttcccttt ctgtttcctc agaagctatt tgaatctcat 60
gtaggggctt tcaagcatca aaggatggtt catgttttat tttaaggcac ccacatcatg 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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ttcctcagaa gctatttgaa tctcatgtag gggctttcaa gcatcaaagg atggttcatg 60
ttttatttta aggcacccac atcatgtcat gaggggaggc agctataatt tagagaacca 120
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<213> EGFR融合探针
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ctatttgaat ctcatgtagg ggctttcaag catcaaagga tggttcatgt tttattttaa 60
ggcacccaca tcatgtcatg aggggaggca gctataattt agagaaccaa gggggatttc 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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ttttatttta aggcacccac atcatgtcat gaggggaggc agctataatt tagagaacca 60
agggggattt cattataaca aaattggcaa acacacaggc acctgctggc aatagacccc 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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agggggattt cattataaca aaattggcaa acacacaggc acctgctggc aatagacccc 60
tgctcctata gccaagaagt ggaatagcat ctctacgggc cattctaata gcctcaaaat 120
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<213> EGFR融合探针
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tgctcctata gccaagaagt ggaatagcat ctctacgggc cattctaata gcctcaaaat 60
ctctgcacca gggggatgaa agaatgcatt tgccaagtcc tacagactcc aacttctacc 120
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ctctgcacca gggggatgaa agaatgcatt tgccaagtcc tacagactcc aacttctacc 60
gtgccctgat ggatgaagaa gacatggacg acgtggtgga tgccgacgag tacctcatcc 120
<210> 45
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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gtgccctgat ggatgaagaa gacatggacg acgtggtgga tgccgacgag tacctcatcc 60
cacagcaggg cttcttcagc agcccctcca cgtcacggac tcccctcctg agctctctgg 120
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<212> DNA
<213> EGFR融合探针
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cacagcaggg cttcttcagc agcccctcca cgtcacggac tcccctcctg agctctctgg 60
tatgaaatct ctgtctctct ctctctctca agctgtgtct actcatttga acaaattgaa 120
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<213> RET融合探针
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ggtgcccgcc ggccctcgct ggactccatg gagaaccagg tctccgtgga tgccttcaag 60
atcctggtga gggtccctgc ggggcaggga agatcccctg ccctccccag ctgccttcca 120
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<212> DNA
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atcctggtga gggtccctgc ggggcaggga agatcccctg ccctccccag ctgccttcca 60
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gggagggagg ccagctgggg agacagaggc catcctgtga ggggctgcca acgctgggca 60
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tggggagcct ggcctgcagg tctgcatgtg ctactcagag cctccaggct gtgccgagta 60
tcctggagcc tccttgtccc ggccaggcag gcctctgccc tctcctggtg gtggcctgcc 120
<210> 54
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 54
tcctggagcc tccttgtccc ggccaggcag gcctctgccc tctcctggtg gtggcctgcc 60
ccttcagtgt tcctactagc actgtccagg gcgctggaag ccaagcccag ttctggaagt 120
<210> 55
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 55
ccttcagtgt tcctactagc actgtccagg gcgctggaag ccaagcccag ttctggaagt 60
aacagaggct cagagccaag ggtgtgagtg aacggtgagc cacgcagctt atggtggcgt 120
<210> 56
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 56
aacagaggct cagagccaag ggtgtgagtg aacggtgagc cacgcagctt atggtggcgt 60
gaatagctcc tcggcaggag cctccaggga ggaagctgag cacccagtgg ccacagggcc 120
<210> 57
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 57
gaatagctcc tcggcaggag cctccaggga ggaagctgag cacccagtgg ccacagggcc 60
ctggcagttc ccatctcagg ctgggaggtg gcctgggatt cctgggaggg gccatatccc 120
<210> 58
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 58
ctggcagttc ccatctcagg ctgggaggtg gcctgggatt cctgggaggg gccatatccc 60
acagtgcagc tcagcctgag gcctcggccc tggagcctcc gttcaggcaa cacccagccc 120
<210> 59
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 59
acagtgcagc tcagcctgag gcctcggccc tggagcctcc gttcaggcaa cacccagccc 60
tcggtaaggg tgtgagccaa ggaggccttc ccagatgtgg ccactgccgc ttccccacca 120
<210> 60
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 60
tcggtaaggg tgtgagccaa ggaggccttc ccagatgtgg ccactgccgc ttccccacca 60
gctttcctaa ttggtggtcc ccatcctggc ctggctgcag cttagcctca tggcagggct 120
<210> 61
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 61
gctttcctaa ttggtggtcc ccatcctggc ctggctgcag cttagcctca tggcagggct 60
ctaggatgag ccaccagagt ccttcataaa cccagtgggt ttgtgtgagg ctgcccagga 120
<210> 62
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 62
ctaggatgag ccaccagagt ccttcataaa cccagtgggt ttgtgtgagg ctgcccagga 60
aggccgcact ggtctgggct gctgctggca gagaccacca ccctaacccc agtcagctcc 120
<210> 63
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 63
aggccgcact ggtctgggct gctgctggca gagaccacca ccctaacccc agtcagctcc 60
agagtcacac tcatcagcac caggtcttgg acccatgact caacctcagt atttgagagg 120
<210> 64
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 64
agagtcacac tcatcagcac caggtcttgg acccatgact caacctcagt atttgagagg 60
atcaggttga tgtcgccctc atgtgcttat tgcagtctct agagtgtggt aaacaggttt 120
<210> 65
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 65
atcaggttga tgtcgccctc atgtgcttat tgcagtctct agagtgtggt aaacaggttt 60
ccagtgccag ctgtggaggt gacagcggca gggaagccat ggcagtgtcg acactgacct 120
<210> 66
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 66
ccagtgccag ctgtggaggt gacagcggca gggaagccat ggcagtgtcg acactgacct 60
tgactgtggg ttcccaggga atgtggggcc agaccaggac agcccaggag caggagacct 120
<210> 67
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 67
tgactgtggg ttcccaggga atgtggggcc agaccaggac agcccaggag caggagacct 60
ggggtgacgg atgcccagag ctggcacatc aagggagggt tcctggatca tggcaggctt 120
<210> 68
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 68
ggggtgacgg atgcccagag ctggcacatc aagggagggt tcctggatca tggcaggctt 60
tggcctccct ggtcagagtt caagtactgg gggccagggt gggggtctgg gaaggcatcc 120
<210> 69
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 69
tggcctccct ggtcagagtt caagtactgg gggccagggt gggggtctgg gaaggcatcc 60
ggagcagtcc caagtgggcc caatgtgtgg atagaacttt ggtgggaggg cagggtggta 120
<210> 70
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 70
ggagcagtcc caagtgggcc caatgtgtgg atagaacttt ggtgggaggg cagggtggta 60
gtgccagcag gcagggtgag cgggtgcgtg agggccagtg gcagcccttg aggagcagtg 120
<210> 71
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 71
gtgccagcag gcagggtgag cgggtgcgtg agggccagtg gcagcccttg aggagcagtg 60
cttccacact ctgaggcgga acatggtggc gcctttcttt gcaggggtgg ctatgtagag 120
<210> 72
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 72
cttccacact ctgaggcgga acatggtggc gcctttcttt gcaggggtgg ctatgtagag 60
aagttgtcct ggacacttcc actgtagtca gaggtcctgg gctgggcctg gtgctcattt 120
<210> 73
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 73
aagttgtcct ggacacttcc actgtagtca gaggtcctgg gctgggcctg gtgctcattt 60
agtcctgggg caggggtcag gggagacagt agaccaggaa ccagagaggg tcgaagtact 120
<210> 74
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 74
agtcctgggg caggggtcag gggagacagt agaccaggaa ccagagaggg tcgaagtact 60
gagtccaagc catgctgtga ccacacctgt catgtagcag ctttcagggg cctggctgtg 120
<210> 75
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 75
gagtccaagc catgctgtga ccacacctgt catgtagcag ctttcagggg cctggctgtg 60
gggtcctgcc cagggcagag acaggcagcg ttgccgctgg ctcagatgac agccggttct 120
<210> 76
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 76
gggtcctgcc cagggcagag acaggcagcg ttgccgctgg ctcagatgac agccggttct 60
ctgcacattg gaacttgtcc atggggcctc ctttaagggt cttgccttct tcctcccctg 120
<210> 77
<211> 120
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 77
ctgcacattg gaacttgtcc atggggcctc ctttaagggt cttgccttct tcctcccctg 60
tcatcctcac acttttcccc cctcttctcc cccttccctc atttccaaca taggaggatc 120
<210> 78
<211> 119
<212> DNA
<213> RET融合探针
<400> 78
tcatcctcac acttttcccc cctcttctcc cccttccctc atttccaaca taggaggatc 60
caaagtggga attccctcgg aagaacttgg ttcttggaaa aactctagga gaaggcgaa 119
<210> 79
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 79
aagtggagaa atcaaagtag cagtgaaggt aatgtgaatc ttcgaactcc ttgacacatt 60
atatcaccat atctacaaag attgacctgg atataattat aataaaagtt gagtgctctt 120
<210> 80
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 80
gggaagtgga gcctttggag aagtgtatga aggaacagca gtggacatct taggagttgg 60
aagtggagaa atcaaagtag cagtgaaggt aatgtgaatc ttcgaactcc ttgacacatt 120
<210> 81
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 81
agaggagatt gaaaatcttc ctgccttccc tcgggaaaaa ctgactctgc gtctcttgct 60
gggaagtgga gcctttggag aagtgtatga aggaacagca gtggacatct taggagttgg 120
<210> 82
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 82
tatatatgtg gagggtgggg agacaaaaat gttgctattt tacagtactc ttccaaccca 60
agaggagatt gaaaatcttc ctgccttccc tcgggaaaaa ctgactctgc gtctcttgct 120
<210> 83
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 83
atgagatatt tctttctctc tcaaacacaa ataccaatac caacacaaac ttgtacaccc 60
tatatatgtg gagggtgggg agacaaaaat gttgctattt tacagtactc ttccaaccca 120
<210> 84
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 84
aattaggaac ccaaagttcc acatcaccgt gtcacataaa acacacaata ctgcaaagcc 60
atgagatatt tctttctctc tcaaacacaa ataccaatac caacacaaac ttgtacaccc 120
<210> 85
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 85
cctagaagtg gaccatcatg ctctgtctgg gtaaaaggtt gtagaatagt aaagtaaagt 60
aattaggaac ccaaagttcc acatcaccgt gtcacataaa acacacaata ctgcaaagcc 120
<210> 86
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 86
gctacaataa aagtgttgag gcaatgcata cacatatata tttttatcaa aattaaggtg 60
cctagaagtg gaccatcatg ctctgtctgg gtaaaaggtt gtagaatagt aaagtaaagt 120
<210> 87
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 87
agctttttat acaaattggc aatctgaaga agttaatacc tactaacttt gactcaacaa 60
gctacaataa aagtgttgag gcaatgcata cacatatata tttttatcaa aattaaggtg 120
<210> 88
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 88
gtgtgaaata gctaagagaa aagcttataa acccagatgc atttattact aatttgcagt 60
agctttttat acaaattggc aatctgaaga agttaatacc tactaacttt gactcaacaa 120
<210> 89
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 89
atggtgatgg ggttgatttt tttggtcata gtaaattttg ttttacgtaa gatgtcacat 60
gtgtgaaata gctaagagaa aagcttataa acccagatgc atttattact aatttgcagt 120
<210> 90
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 90
cagcattttc cccccttgta gtattccaag tgagaaactt ggctttttaa agttaacctt 60
atggtgatgg ggttgatttt tttggtcata gtaaattttg ttttacgtaa gatgtcacat 120
<210> 91
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 91
tactcagcat atctgctact caagattctc tattaaaaat tgaaagcatt tttaacatag 60
cagcattttc cccccttgta gtattccaag tgagaaactt ggctttttaa agttaacctt 120
<210> 92
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 92
tgaagtagac acaaaggtga tctaaatcag ctgtttagag gtgactttcc tttgagcaaa 60
tactcagcat atctgctact caagattctc tattaaaaat tgaaagcatt tttaacatag 120
<210> 93
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 93
taaatgatca taggccttgc tttcagaaat ttataatgca aggtgtaaaa acaaaggatt 60
tgaagtagac acaaaggtga tctaaatcag ctgtttagag gtgactttcc tttgagcaaa 120
<210> 94
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 94
gaaaatattc aagtgtctta tgcaaaggtt cattatatta ggatctatgc aaaaaggaat 60
taaatgatca taggccttgc tttcagaaat ttataatgca aggtgtaaaa acaaaggatt 120
<210> 95
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 95
tgcccacaaa accttcttaa gatagatgag ttttgaactt ttgttgccgt cataattaag 60
gaaaatattc aagtgtctta tgcaaaggtt cattatatta ggatctatgc aaaaaggaat 120
<210> 96
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 96
cttgtgttac gtggtcagcc ttaagtcaat cttactccat ttcagaagtt gtgtgatgat 60
tgcccacaaa accttcttaa gatagatgag ttttgaactt ttgttgccgt cataattaag 120
<210> 97
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 97
gatggtaaca tggttggttg acctggaggc agtgtttgag aggagaggag ttttgagagc 60
cttgtgttac gtggtcagcc ttaagtcaat cttactccat ttcagaagtt gtgtgatgat 120
<210> 98
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 98
tttgtcatgt agctcaaaaa caaatgaaag aaggagaaaa atattacatt gaagagaata 60
gatggtaaca tggttggttg acctggaggc agtgtttgag aggagaggag ttttgagagc 120
<210> 99
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 99
atggatggaa aattatgtgg ttttaagaaa aatacagaaa aatccattag tttccagtat 60
tttgtcatgt agctcaaaaa caaatgaaag aaggagaaaa atattacatt gaagagaata 120
<210> 100
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 100
tggcagccgg agtaggcctg gctaatgcct gctatgcaat acagtatgta gctttggcca 60
tcattatgga gcacctaggc aaagggtggg caacagtaag gagagtgcct atgaattccg 120
<210> 101
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 101
caaggaaggg gtgacagtgc ttataaacga agacaaagag ttggctgagc tgcgaggtct 60
ggcagccgga gtaggcctgg ctaatgcctg ctatgcaata cagtatgtag ctttggccat 120
<210> 102
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 102
aattatgtca ttttttcctt tatagtctgg catagaagat taaagaatca aaaaagtgcc 60
aaggaagggg tgacagtgct tataaacgaa gacaaagagt tggctgagct gcgaggtctg 120
<210> 103
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 103
acttcaaatg cactgttaac atttcctaaa ggaaaaaaga agcaatattt tattttgtaa 60
attatgtcat tttttccttt atagtctggc atagaagatt aaagaatcaa aaaagtgcca 120
<210> 104
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 104
aaaatcaaat tatgaaaact tctataacta ttctactgat agtgttcttg cataaaaaca 60
cttcaaatgc actgttaaca tttcctaaag gaaaaaagaa gcaatatttt attttgtaaa 120
<210> 105
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 105
tttgtgtact tatatatggc tttttacctg gatttaatta gttttttata agatatttta 60
aaatcaaatt atgaaaactt ctataactat tctactgata gtgttcttgc ataaaaacac 120
<210> 106
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 106
aacaacagta agaaatacat taaattttaa gaagtgagat taaaaatggt gtagtatgat 60
ttgtgtactt atatatggct ttttacctgg atttaattag ttttttataa gatattttaa 120
<210> 107
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 107
tcgtttatgg gtgattttga caaataagtt ttaatattaa gatactttaa tttgtttata 60
acaacagtaa gaaatacatt aaattttaag aagtgagatt aaaaatggtg tagtatgatt 120
<210> 108
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 108
ctgaactcaa aaatgaattt gtttcactaa taattatgtt tgttttggtt tattttgact 60
cgtttatggg tgattttgac aaataagttt taatattaag atactttaat ttgtttataa 120
<210> 109
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 109
aaattgccat tatactgaaa gcattttctt ttctactgag gaatataacc tggatgtgac 60
tgaactcaaa aatgaatttg tttcactaat aattatgttt gttttggttt attttgactc 120
<210> 110
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 110
atgtgtatat gaacaacaat gataaacact cttgtactct gcaaaaaaaa aaaaaaaaaa 60
aattgccatt atactgaaag cattttcttt tctactgagg aatataacct ggatgtgact 120
<210> 111
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 111
gcagaccact gctaacattt ggtaagcttc gttccaatac tttttctaca tattcgagta 60
tgtgtatatg aacaacaatg ataaacactc ttgtactctg caaaaaaaaa aaaaaaaaaa 120
<210> 112
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 112
ctaatactgc ttattatata aggaagacag tacaaattac tcatgattct acaactaggg 60
cagaccactg ctaacatttg gtaagcttcg ttccaatact ttttctacat attcgagtat 120
<210> 113
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 113
atgacaatcc tattgacata attgtatttt aatattaaaa aaattttatt attataaaac 60
taatactgct tattatataa ggaagacagt acaaattact catgattcta caactagggc 120
<210> 114
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 114
tgatcatctc tcaaagcatg cttgctgctt tcaacttctg agccaatagt ccagtacaga 60
tgacaatcct attgacataa ttgtatttta atattaaaaa aattttatta ttataaaact 120
<210> 115
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 115
gaataaaact ctaacttctt gaacatagaa gctactgtga aattaagttc aaattttaat 60
gatcatctct caaagcatgc ttgctgcttt caacttctga gccaatagtc cagtacagat 120
<210> 116
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 116
atttagcaaa aggtacttgt gatctttcac tgtgtagccc ttcaaattga atttcatgtg 60
aataaaactc taacttcttg aacatagaag ctactgtgaa attaagttca aattttaatg 120
<210> 117
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 117
tacattgggc ctttaaaagt gaagcgaggt ggtgagaaca tttcaagttg gaaaaattaa 60
tttagcaaaa ggtacttgtg atctttcact gtgtagccct tcaaattgaa tttcatgtga 120
<210> 118
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 118
tgagggcact catcagttat aaacataaaa ttagacaatt tttaaaatga gtgttgacag 60
cctttgcttc tgagcagtca tatctaatgc ataacattag ccttctgctg ggagtagggg 120
<210> 119
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 119
ttgagtaatt aaaataacaa aacagtcaca attattttaa aatttgtatt gtgctgaggg 60
cactcatcag ttataaacat aaaattagac aatttttaaa atgagtgttg acagcctttg 120
<210> 120
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 120
agcagcagtg catgtggttt tactagtaag agcgtgtgtg tgcatgagaa aagattgagt 60
aattaaaata acaaaacagt cacaattatt ttaaaatttg tattgtgctg agggcactca 120
<210> 121
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 121
tttgaaattc acgaattttt gagtctagct aagctaattc ggttctttgc ttttagcagc 60
agtgcatgtg gttttactag taagagcgtg tgtgtgcatg agaaaagatt gagtaattaa 120
<210> 122
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 122
ccaagacatc ctatggatat ctgactttct caggacttaa aggtctttat tctgtttgaa 60
attcacgaat ttttgagtct agctaagcta attcggttct ttgcttttag cagcagtgca 120
<210> 123
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 123
acccataact ctagtggatg aacatgagat aatttcagac aacctattgt gcttccaaga 60
catcctatgg atatctgact ttctcaggac ttaaaggtct ttattctgtt tgaaattcac 120
<210> 124
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 124
gaagaatcct tcagctgacc tttgcttgct ttcttgtaca tcaccattgt ttaaacccat 60
aactctagtg gatgaacatg agataatttc agacaaccta ttgtgcttcc aagacatcct 120
<210> 125
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 125
tggcatatag gcttgactgc ttgtctgctt tcctactggg aaggagaatt acatgaagaa 60
tccttcagct gacctttgct tgctttcttg tacatcacca ttgtttaaac ccataactct 120
<210> 126
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 126
ccactaagcc agcccctcca gacttacgca tatgactgca gtatatttgg cagttggcat 60
ataggcttga ctgcttgtct gctttcctac tgggaaggag aattacatga agaatccttc 120
<210> 127
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 127
tctcaggata aagacagcca acactttact gtgttctaag tctttattct ttctgcaaag 60
tgattggagt cacaatcttt atgagagcac tttgaagctc gatttgagat ttttttcaaa 120
<210> 128
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 128
caagtagggg taagttacaa gggaaagttg atggaaaagt cacaaacata aagttgaact 60
ctcaggataa agacagccaa cactttactg tgttctaagt ctttattctt tctgcaaagt 120
<210> 129
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 129
ttcttaccag aaaagaacac tcaaacacat attaagaaag ttgtggcttg ttttgttcac 60
aagtaggggt aagttacaag ggaaagttga tggaaaagtc acaaacataa agttgaactc 120
<210> 130
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 130
ctatctattg ctaatattga gagtccccaa cacactgaat cattaaaaga agggcatgat 60
tcttaccaga aaagaacact caaacacata ttaagaaagt tgtggcttgt tttgttcaca 120
<210> 131
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 131
aatagcactt tctttcattc cccaaactgt ccgagtttgc ttataagata tatggacccc 60
tatctattgc taatattgag agtccccaac acactgaatc attaaaagaa gggcatgatt 120
<210> 132
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 132
ttttagagtt atcacagtga tcatacattc ttgtttattt ctgtttcagc acaaataata 60
atagcacttt ctttcattcc ccaaactgtc cgagtttgct tataagatat atggacccct 120
<210> 133
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 133
tttaatgata ataaaatgca gtaaaaacct caaagggaat ggtcaagtac tgattggact 60
tttagagtta tcacagtgat catacattct tgtttatttc tgtttcagca caaataataa 120
<210> 134
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 134
gaaggcagaa aaattaggtt aggtagatag aaagctattt tttttctaag aagatttact 60
ttaatgataa taaaatgcag taaaaacctc aaagggaatg gtcaagtact gattggactt 120
<210> 135
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 135
cttgctttca gacatctgat ctgcttattt caaatccctg ctcatttata aatgaccagg 60
aaggcagaaa aattaggtta ggtagataga aagctatttt ttttctaaga agatttactt 120
<210> 136
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 136
gtttggaatg agtagggcct cttttgcaga agatccattt ctggcttgtg ggatcgactc 60
ttgctttcag acatctgatc tgcttatttc aaatccctgc tcatttataa atgaccagga 120
<210> 137
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 137
atgggaggcc agtgacaatc tttgattggg atagttttgg tttctaagca gacaggctgg 60
tttggaatga gtagggcctc ttttgcagaa gatccatttc tggcttgtgg gatcgactct 120
<210> 138
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 138
tatggtttaa aataaataaa agaaaaataa ccctgggtac agaaaaaagt atagaattaa 60
tgggaggcca gtgacaatct ttgattggga tagttttggt ttctaagcag acaggctggt 120
<210> 139
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 139
ttaggtttct ttaaaacagt atttatttct gattggctgc atacaaatgt tttgtggctt 60
atggtttaaa ataaataaaa gaaaaataac cctgggtaca gaaaaaagta tagaattaat 120
<210> 140
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 140
atatacatgt acatttcatg ttatacttta gataaaacta cttgcaaggg caccaacttt 60
taggtttctt taaaacagta tttatttctg attggctgca tacaaatgtt ttgtggctta 120
<210> 141
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 141
ttataaccac taacttctgt gaattgtttt ctgatctagg cataactatt ttatggaaaa 60
tatacatgta catttcatgt tatactttag ataaaactac ttgcaagggc accaactttt 120
<210> 142
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 142
acatgaaata ttgcctgatt aagttaataa aatttacatt gttacctttg gctatacatt 60
tataaccact aacttctgtg aattgttttc tgatctaggc ataactattt tatggaaaat 120
<210> 143
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 143
aacaaactgt ttacttaatc atacctgatt gatttatctc ttagttgatc taatctccca 60
catgaaatat tgcctgatta agttaataaa atttacattg ttacctttgg ctatacattt 120
<210> 144
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 144
ttctggttgt tacaatccca ctgacctttg gtaagtataa tagaattttt aaaataggca 60
acaaactgtt tacttaatca tacctgattg atttatctct tagttgatct aatctcccac 120
<210> 145
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 145
attagatgat ttttggatac cagaaacaag tttcatactt actattatag ttggaatatt 60
tctggttgtt acaatcccac tgacctttgg taagtataat agaattttta aaataggcaa 120
<210> 146
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 146
gtagagctgg ggcaacttag cttttatcta tgaattaatt tctttttctg atttatatta 60
ttagatgatt tttggatacc agaaacaagt ttcatactta ctattatagt tggaatattt 120
<210> 147
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 147
caactggctt gcaaaaatcc agtagtagct agctctgcta tattactctg tgtgcttagg 60
tagagctggg gcaacttagc ttttatctat gaattaattt ctttttctga tttatattat 120
<210> 148
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 148
tgatttcaca tggcataaac actgtctgta tggatgcttt caagctacca acggtctaac 60
aactggcttg caaaaatcca gtagtagcta gctctgctat attactctgt gtgcttaggt 120
<210> 149
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 149
gtggatatat tccagtggtt tgttgctctc tgcaaaaaaa agcaaaaaca ccttgctttt 60
gatttcacat ggcataaaca ctgtctgtat ggatgctttc aagctaccaa cggtctaaca 120
<210> 150
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 150
tcctaaattt attaaaaaga tatatatgtt tcctaagtca ttttaaagta gaagattgag 60
tggatatatt ccagtggttt gttgctctct gcaaaaaaaa gcaaaaacac cttgcttttg 120
<210> 151
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 151
agatattata caaaataata atgccaacta tttagtatcc aaagactgag atttcttggt 60
cctaaattta ttaaaaagat atatatgttt cctaagtcat tttaaagtag aagattgagt 120
<210> 152
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 152
taagagaaat taccatgttt attcctcagt ttaatatcca tgaaattaaa tatgtatgaa 60
gatattatac aaaataataa tgccaactat ttagtatcca aagactgaga tttcttggtc 120
<210> 153
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 153
gccatagttt gccagactct ggcctacgtg tttgtttcct ctacacaact gaaactacct 60
aagagaaatt accatgttta ttcctcagtt taatatccat gaaattaaat atgtatgaag 120
<210> 154
<211> 119
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 154
cattttatac actcacatgc tatataaaac ttacatgatt cttgtttata ttatagttag 60
ttatctagtt agttgtgtac agaagtttgc tacccagctc agcaaacttt ttctgaaaa 119
<210> 155
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 155
aagacttaaa tgaactcatc ataatgctta cctgatgctc cttagtcaaa tgaattattg 60
cattttatac actcacatgc tatataaaac ttacatgatt cttgtttata ttatagttag 120
<210> 156
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 156
ccccttagct gtgatttcct attatttatt ttctgccaat tgaaattctt ctcatccttc 60
aagacttaaa tgaactcatc ataatgctta cctgatgctc cttagtcaaa tgaattattg 120
<210> 157
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 157
tagtctttgg ccctgtgttt gcctcagcct agaatacagg tccccactac ctaccctgtg 60
ccccttagct gtgatttcct attatttatt ttctgccaat tgaaattctt ctcatccttc 120
<210> 158
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 158
ttccaatatt tatgtctgtg ctgtagccat atcagaccag taaaaagttt ttatgtcact 60
tagtctttgg ccctgtgttt gcctcagcct agaatacagg tccccactac ctaccctgtg 120
<210> 159
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 159
caaacttctt tgtggcatgt gaggtcttct gtaatttatc ctccaattgt ggtttatctt 60
ttccaatatt tatgtctgtg ctgtagccat atcagaccag taaaaagttt ttatgtcact 120
<210> 160
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 160
cttaatccct ctctgaaata cccacaatgg ctctccattt actgctttca gaatcagcta 60
caaacttctt tgtggcatgt gaggtcttct gtaatttatc ctccaattgt ggtttatctt 120
<210> 161
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 161
gtgcccttga cttacgcata ctgctgacag ttaaatttag ttgaagcaca ggctggatta 60
cttaatccct ctctgaaata cccacaatgg ctctccattt actgctttca gaatcagcta 120
<210> 162
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 162
gagttctcat cttcctcttt ccaccttggc tttcctaatt taaggtatca tttcttgcct 60
gtgcccttga cttacgcata ctgctgacag ttaaatttag ttgaagcaca ggctggatta 120
<210> 163
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 163
tttttccctc tactcagtaa tcaggtcctg ttgattttac catcttgatt tttctctgat 60
gagttctcat cttcctcttt ccaccttggc tttcctaatt taaggtatca tttcttgcct 120
<210> 164
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 164
tagtttatga tatattgtct ttctaatcac ataggcagga aatctcagtg ccatatgtga 60
tttttccctc tactcagtaa tcaggtcctg ttgattttac catcttgatt tttctctgat 120
<210> 165
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 165
acaggcctaa gacctttgtt tcttccccaa tatctacctc ttccactgtg tattttattt 60
tagtttatga tatattgtct ttctaatcac ataggcagga aatctcagtg ccatatgtga 120
<210> 166
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 166
ccagccatat aattctattc acattatacc agccttatga ccactcctac attatacata 60
acaggcctaa gacctttgtt tcttccccaa tatctacctc ttccactgtg tattttattt 120
<210> 167
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 167
ctaccacatc aattccatgc tcctaattag gcttccaagg ctgttcacaa tctgttctat 60
ccagccatat aattctattc acattatacc agccttatga ccactcctac attatacata 120
<210> 168
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 168
aaacatcatt atcatcatgt catttttctc cccaataata atcagccacc cccttaattc 60
ctaccacatc aattccatgc tcctaattag gcttccaagg ctgttcacaa tctgttctat 120
<210> 169
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 169
atatataatc ttattatcca aactattaaa ctattccatt catgtgatgt gatctttcta 60
aaacatcatt atcatcatgt catttttctc cccaataata atcagccacc cccttaattc 120
<210> 170
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 170
attcttaaca ttagcaatag ataatggtga ctatatatat atatatatat atatatatat 60
atatataatc ttattatcca aactattaaa ctattccatt catgtgatgt gatctttcta 120
<210> 171
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 171
ttaccatgtc tgtctacaca ctagcttatt acctaaaggt tcagtaataa atatcagtac 60
attcttaaca ttagcaatag ataatggtga ctatatatat atatatatat atatatatat 120
<210> 172
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 172
aatctagggt ttggtgaata tagtggaatc agtgagaata ttatattagt tggaggtatg 60
ttaccatgtc tgtctacaca ctagcttatt acctaaaggt tcagtaataa atatcagtac 120
<210> 173
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 173
tgcacatgga agtccaaaaa cctgaaagga atatttcagt tcagagtagt agctgcaaat 60
aatctagggt ttggtgaata tagtggaatc agtgagaata ttatattagt tggaggtatg 120
<210> 174
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 174
aatttacaga accagaattt aaggtggaag atgacattta atggatcctg cagtagtgtt 60
tgcacatgga agtccaaaaa cctgaaagga atatttcagt tcagagtagt agctgcaaat 120
<210> 175
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 175
ggtatattgt catgtatatt ttctgtattt attatttttt gcagaaagag cacttcaaat 60
aatttacaga accagaattt aaggtggaag atgacattta atggatcctg cagtagtgtt 120
<210> 176
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 176
ccaaaggaca ctctctggcg ttcagtcact aagaagatct atgaacaact agaaataaca 60
ggtatattgt catgtatatt ttctgtattt attatttttt gcagaaagag cacttcaaat 120
<210> 177
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 177
cttgagataa ggtatgtgtg tttgcaaagt acttgtaaat gacaaagaac taagaagata 60
attataaagt aatcaaaagt aacactattt atgcaaatgt atttatatac aaacacaaag 120
<210> 178
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 178
aaaaattcaa tacagtggga gaaagctgaa gataatggat gtagaattac atactatatc 60
cttgagataa ggtatgtgtg tttgcaaagt acttgtaaat gacaaagaac taagaagata 120
<210> 179
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 179
tttttcccta aagctggagt cccaaataaa ccaggcattc ccaaattact agaagggagt 60
aaaaattcaa tacagtggga gaaagctgaa gataatggat gtagaattac atactatatc 120
<210> 180
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 180
ctgtagaaag atttcagtgc agaagattaa tacttcaaac atatcaacca atattttctt 60
tttttcccta aagctggagt cccaaataaa ccaggcattc ccaaattact agaagggagt 120
<210> 181
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 181
cggccatctt ggccccgcct ctgaatattt ctttaatgtt gtctttcctc ttaatatatt 60
ctgtagaaag atttcagtgc agaagattaa tacttcaaac atatcaacca atattttctt 120
<210> 182
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 182
atattgttaa tcttatcacc aattcatcaa atccatcact aataaaaact tcaaatgctc 60
atttaaaaat atgtaatcat ataagaatat ttctgaatat ttcttttttt aaaatttctt 120
<210> 183
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 183
gatagttttc tttattttca tttatcactt attttgtttc aagttgagat atattgttaa 60
tcttatcacc aattcatcaa atccatcact aataaaaact tcaaatgctc atttaaaaat 120
<210> 184
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 184
aataaaaaaa tttgaaaaaa agaatggagg gaaaatgctc caaaacttat gatagttttc 60
tttattttca tttatcactt attttgtttc aagttgagat atattgttaa tcttatcacc 120
<210> 185
<211> 119
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 185
atactaggat gaaaaatata agaagttcat taaaaattaa ctagtgttct gaaagatata 60
ccttaactct gagatgagct ctataagaat ggaaggaaca aagatctaga accaaaaat 119
<210> 186
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 186
actatatgaa aatagtgtta ctgaatgttc aaaaaatatt tattggctac tatatttgag 60
atactaggat gaaaaatata agaagttcat taaaaattaa ctagtgttct gaaagatata 120
<210> 187
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 187
aattacttct tctttcagta tccttatttc atgtctagct atgacaattt tatggtgata 60
actatatgaa aatagtgtta ctgaatgttc aaaaaatatt tattggctac tatatttgag 120
<210> 188
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 188
accttgcagg cagtaatgaa ataatactgg ctgggtctgg ctggatcctg aactgggcaa 60
aattacttct tctttcagta tccttatttc atgtctagct atgacaattt tatggtgata 120
<210> 189
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 189
ttaaaagcag tacattatta tttctagaac ttgaatgaag aaattcagaa aatataggag 60
accttgcagg cagtaatgaa ataatactgg ctgggtctgg ctggatcctg aactgggcaa 120
<210> 190
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 190
tgtttcagtt tttttcttat cacttatttc actaatccta gagatatatg aaattgttct 60
ttaaaagcag tacattatta tttctagaac ttgaatgaag aaattcagaa aatataggag 120
<210> 191
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 191
ttccagaaag ctttaagaca aaaggtgagt actaacatac tcaatactca gaaaactctg 60
tgtttcagtt tttttcttat cacttatttc actaatccta gagatatatg aaattgttct 120
<210> 192
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 192
atacttcata taatgtcaga gtagtggtgg tttataagac gggagaaaat agcacctcac 60
ttccagaaag ctttaagaca aaaggtgagt actaacatac tcaatactca gaaaactctg 120
<210> 193
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 193
ttaaaacttc atgcagccaa ggtcctgctt atgtctgtaa tatcacaaat ctacaacctt 60
atacttcata taatgtcaga gtagtggtgg tttataagac gggagaaaat agcacctcac 120
<210> 194
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 194
gaaacaaaaa tattaatcga gacttctttt tctagtggaa atacaatgag ttttaccatg 60
ttaaaacttc atgcagccaa ggtcctgctt atgtctgtaa tatcacaaat ctacaacctt 120
<210> 195
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1融合探针
<400> 195
aaattttaac cacttgctat aagcctatac atttttgtgt tttaagaata ttttcttaga 60
gaaacaaaaa tattaatcga gacttctttt tctagtggaa atacaatgag ttttaccatg 120
<210> 196
<211> 120
<212> DNA
<213> ALK扩增探针
<400> 196
gacatggaga agtacttacc catgcttccc tggagtgggc atcaggagga tctctcttgc 60
agcctcgttg tggggcagca gctgggcaat gtaccttcca gagggctgca ggtgcctgtg 120
<210> 197
<211> 120
<212> DNA
<213> ALK扩增探针
<400> 197
caccgagacg gccagtgtgc agtgctcact gctgctcctc atccacggac tcaggatggt 60
gtgcttggag tcagctgagg tgttgagaag gagaaaggag cctggaaaga gacagggaaa 120
<210> 198
<211> 120
<212> DNA
<213> MET扩增探针
<400> 198
tgtcttatat gtagtccata aaacccatga gttctgggca ctgggtcaaa gtctcctggg 60
gcccatgata gccgtcttta acaagctctt tctttctctc tgttttaaga tctgggcagt 120
<210> 199
<211> 120
<212> DNA
<213> MET扩增探针
<400> 199
gaattagttc gctacgatgc aagagtacac actcctcatt tggataggct tgtaagtgcc 60
cgaagtgtaa gcccaactac agaaatggtt tcaaatgaat ctgtagacta ccgagctact 120
<210> 200
<211> 120
<212> DNA
<213> CCDC6融合探针
<400> 200
gcaacattgt cttaggaact ttcacagaaa ctatcctgtg gtcaaaaaca ttcttctccc 60
tttgctttgc aaaaaggaag ctgacatttc ctgctataaa tcagtacatc acaacttatc 120
<210> 201
<211> 120
<212> DNA
<213> CD74融合探针
<400> 201
agaggagaga tgataaatgg acaaatagga atgcacaggt gggtggatgg ataaagggct 60
ggacgcatga ctacgtcact gcccccagga gctgccatcc tgggtgtcct ggtcccatgt 120
<210> 202
<211> 120
<212> DNA
<213> CLTC融合探针
<400> 202
tttgaggttg agattatgtt gctagagtgg aggagattgg agtgttctaa atgctaacag 60
tttgtcctgc ctccttgccc ctgccccctg ctcctttttg ttttcttcta ctgtaggtca 120
<210> 203
<211> 120
<212> DNA
<213> ERC1融合探针
<400> 203
gtgcttttaa gtaatcaagc ccttgccacc tctgctgtct aacacagttt tgttctctct 60
gttacagaga gcaaatttct cacatttgtc ttgcttaact aacttgagcc tttgctgtta 120
<210> 204
<211> 120
<212> DNA
<213> EZR融合探针
<400> 204
gcactgaaca gttcggggtg gagggagcaa agtgggtgaa agtcaatcag aggtcctccc 60
tctatgaatc cagcagctgc actgactcgt gtacaaagtc aaacccatct ctttggggat 120
<210> 205
<211> 120
<212> DNA
<213> GOLGA5融合探针
<400> 205
ccaaattgat ttcatgaccc cagtttttga aaatcacttt tgtagacatt gagtcagtat 60
agagttttga gaaatcaatg aatgccacaa tttacctatg aaaatgtagt agtgtgattt 120
<210> 206
<211> 120
<212> DNA
<213> GOPC融合探针
<400> 206
gtcctcctac taaagggaaa aggaaccaag taaaacagta gggtttcatt tggtacttaa 60
gagcccagta ataccccttt gggaaacaca tgctttggtg cttacaagtt caagaaaatc 120
<210> 207
<211> 120
<212> DNA
<213> KIF5B融合探针
<400> 207
attcaaaata actcggcaac aggcatttca tgagataaca agtagccttg ctcagtctca 60
aatgcctatt aggcatttgt aacgtttcag tgctcaaaca gtagttttca ggagcaaact 120
<210> 208
<211> 120
<212> DNA
<213> KLC1融合探针
<400> 208
gaatagttga acacgggtac acaccctgtg caatcccagc cccatcactg ttcctctgag 60
gggtcctttg tgtttccagt tccccgcctc caccctcacc ccctccaagg aaccactctt 120
<210> 209
<211> 120
<212> DNA
<213> KTN1融合探针
<400> 209
actgtgtact gacccaggta aaactataaa tagctacaac agttcatatc ttcataatat 60
gtttcttagg ggatgagatt tctctttagc acaagcctga gcataccata ttaggcataa 120
<210> 210
<211> 120
<212> DNA
<213> LRIG3融合探针
<400> 210
tcttggagta gatgccacac acagtgctac ccagaaagct cctgaggctt agttatagat 60
taaacacatc atcaagtaaa atcccacctc tgactttgct tttggaggca tttacactaa 120
<210> 211
<211> 120
<212> DNA
<213> NCOA4融合探针
<400> 211
ctgtctcaaa aaaagaaaaa gtgcagacag aatctccaaa gcagtcataa ttgttctggc 60
aaactaatac tgtgtacttt ttgtgtagac ttcttccaga gcctgcaatt tcttcaataa 120
<210> 212
<211> 120
<212> DNA
<213> NPM1融合探针
<400> 212
agtgaacatt aggcctcaaa atacttttgt taaaaagttc cttttcccat gtgctctttt 60
tttttttttt tttaaataga atagaagtct cagtttttag agtatttact atcagtgttc 120
<210> 213
<211> 120
<212> DNA
<213> PRKAR1A融合探针
<400> 213
ttgagtattg tagttgtagg tttgatttgc attgatggca atcttcagga atacttaagg 60
attacatttt cttattccct tgccatttgg tacagttggt ataaattaac ctagccactg 120
<210> 214
<211> 120
<212> DNA
<213> PURB融合探针
<400> 214
aaactatgat ccacatcaca caaagatttc atgtatttca tgatcaaaaa gtgctttatc 60
tttgagaaat gtcagggtta caatggaaat atacaatgta aagtcacttg atattttttc 120
<210> 215
<211> 120
<212> DNA
<213> RAD51融合探针
<400> 215
atactgtgga ggctgttgcc tatgcgccaa agaaggagct aataaatatt aagggaatta 60
gtgaagccaa agctgataaa attctggtaa gtactgctta cttaacctag ggaggcatta 120
<210> 216
<211> 120
<212> DNA
<213> SDC4融合探针
<400> 216
aggcctgagc caccatgccc accccagggc cagattttta aaaagccttc ccgcatagtg 60
gggtaagacc cctcacttat tctgcctatg ggggctgtat tttctgcctc tcccaatagg 120
<210> 217
<211> 120
<212> DNA
<213> SLC34A2融合探针
<400> 217
gagcacagaa gggcttgctg actgaggagt gtttgaagag tgggaggatg cagggtgaag 60
gaacaaaagt aaccaggggc tcacagtggg tcgggaacca gggcagagag acagagacag 120
<210> 218
<211> 120
<212> DNA
<213> STRN融合探针
<400> 218
gtgagctact gcgcctggcc aattgcacat atattaaaat gttatatatt catacataaa 60
atatgcaatg aaaagaataa ctttaaagtt ataaaattct tttaactacg taagttctac 120
<210> 219
<211> 120
<212> DNA
<213> TFG融合探针
<400> 219
atttttattt actgattttc aactcacttg gcttttaatg aacattagcg ttacttatct 60
gttggcagct gggttggaaa acatttgttt ttctagactt tatgaaatgg tagccactgg 120
<210> 220
<211> 120
<212> DNA
<213> TPM3融合探针
<400> 220
gagagaatgg aaacactgca ggcaggatga tttaagaacc tggaaataag gaatttaatc 60
ttgttcagct tgaggagtat aactaaaatt actatcctga gtaacctgta ctaaatccat 120
<210> 221
<211> 120
<212> DNA
<213> TRIM24融合探针
<400> 221
agaaatgtat gttttcaacc ctccatcttt accttgaagt tgctatgtat atatttacat 60
tttttttcca atatgtataa acctgccaag attgggtact gtgattttct ggtatatact 120
<210> 222
<211> 120
<212> DNA
<213> TRIM33融合探针
<400> 222
tgccaatcct caactcattt agaaaaggat atttgataat attcttaatt tattatattt 60
aagtatatac tccaaattat acacaataaa ttttcttcac tggagctgtt aatacaatca 120
<210> 223
<211> 120
<212> DNA
<213> ALK突变探针
<400> 223
cttaaagaag catatgtggc tctggatatt ttttgaaaag aaaaactgct tagtaactag 60
cagaagtgtt cctaaaagag tcatacacag gcccagggca gttcttgggt gggtccatcc 120
<210> 224
<211> 120
<212> DNA
<213> BRAF突变探针
<400> 224
catccacaaa atggatccag acaactgttc aaactgatgg gacccactcc atcgagattt 60
cactgtagct agaccaaaat cacctatttt tactgtgagg tcttcatgaa gaaatatatc 120
<210> 225
<211> 120
<212> DNA
<213> DDR2突变探针
<400> 225
aagtctataa taaaatattg ctttctcttt ttcccagcct ccatcaaggg agacctgcaa 60
gttgcctggg gttcagtgct ctagaaagtt ccaaggtttg tggcttgaat tattctaaag 120
<210> 226
<211> 120
<212> DNA
<213> EGFR突变探针
<400> 226
tctgtcatag ggactctgga tcccagaagg tgagaaagtt aaaattcccg tcgctatcaa 60
ggaattaaga gaagcaacat ctccgaaagc caacaaggaa atcctcgatg tgagtttctg 120
<210> 227
<211> 120
<212> DNA
<213> ERBB2突变探针
<400> 227
aaggacatct tccacaagaa caaccagctg gctctcacac tgatagacac caaccgctct 60
cgggcctgta agccatgccc ctccctgctg cctcttctct cagacagcct gaccccagcc 120
<210> 228
<211> 120
<212> DNA
<213> FGFR1突变探针
<400> 228
cagacagact cagtgccttc atggcacaac atcttcatta gataaactgg attcctttcc 60
tcaggagacc caatttggtc ctctaagtaa aacggccatt tcattttctc tcaggtcaat 120
<210> 229
<211> 120
<212> DNA
<213> KRAS突变探针
<400> 229
gtcagcttat tatattcaat ttaaacccac ctataatggt gaatatcttc aaatgattta 60
gtattattta tggcaaatac acaaagaaag ccctccccag tcctcatgta ctggtccctc 120
<210> 230
<211> 120
<212> DNA
<213> MET突变探针
<400> 230
tcctaatata attaaggata gcaattatga aatgtgctta gagaatcaca agttatcgtg 60
aaagccaggt tcctgtactc caagaatgtg aatgaggatt tagtcattca ttcaggacaa 120
<210> 231
<211> 120
<212> DNA
<213> NRAS突变探针
<400> 231
atggcactgt actcttcttg tccagctgta tccagtatgt ccaacaaaca ggtttcacca 60
tctataacca cttgttttct gtaagaatcc tgggggtgtg gagggtaagg gggcagggag 120
<210> 232
<211> 120
<212> DNA
<213> PIK3CA突变探针
<400> 232
agaacaatgc ctccacgacc atcatcaggt gaactgtggg gcatccactt gatgccccca 60
agaatcctag tagaatgttt actaccaaat ggaatgatag tgactttaga atgcctccgt 120
<210> 233
<211> 119
<212> DNA
<213> RET突变探针
<400> 233
agactgagcg ccgcacccgc catccagacc cgccggccct agccgcagtc cctccagccg 60
tggccccagc gcgcacgggc gatggcgaag gcgacgtccg gtgccgcggg gctgcgtct 119
<210> 234
<211> 120
<212> DNA
<213> ROS1突变探针
<400> 234
ttaatcagac ccatctccat atccactgtg agtgagacag gcatagttca ggccttcagg 60
cttgccagaa gggcagtaag ccacttgttt ttcttggcag aaatctttgt ctgcatgtgg 120
<210> 235
<211> 120
<212> DNA
<213> PIK3CA扩增探针
<400> 235
ctttattctc aactgccaat ggactgtttt acaatgccat cttattccag acgcatttcc 60
acagctacac catatatgaa tggagaaaca tctacaaaat ccctttgggt tataaatagt 120
<210> 236
<211> 119
<212> DNA
<213> FGFR1扩增探针
<400> 236
agaagcactg gcaaaaccat gcccacatag agggggcaga cacatgtctg ggtttcagtt 60
tctgcagacc ttcatcattt gttttccttt ttgttttctc tgttgcccag gctggagtg 119

Claims (10)

1.一种肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述检测芯片上包括用于检测基因融合的第一序列组，所述第一序列组包括ALK融合检测剂、EGFR融合检测剂、RET融合检测剂以及ROS1融合检测剂；
所述ALK融合检测剂用于检测ALK基因与融合片断融合后形成的ALK融合基因；
所述EGFR融合检测剂用于检测EGFR基因与所述融合片断融合后形成的EGFR融合基因；
所述RET融合检测剂用于检测RET基因与所述融合片断融合后形成的RET融合基因；
所述ROS1融合检测剂用于检测ROS1基因与所述融合片断融合后形成的ROS1融合基因。
2.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述ALK融合检测剂针对2号染色体第29446129～29448537位点区域内的ALK基因设计；
所述EGFR融合检测剂针对7号染色体第55267769～55269109位点区域内的EGFR基因设计；
所述RET融合检测剂针对10号染色体第43610118～43612098位点区域内的RET基因设计；
所述ROS1融合检测剂针对6号染色体第117640938～117658598位点区域内的ROS1基因设计。
3.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述融合片断源自CCDC6基因、CD74基因、CLTC基因、ERC1基因、EZR基因、GOLGA5基因、GOPC基因、KIF5B基因、KLC1基因、KTN1基因、LRIG3基因、NCOA4基因、NPM1基因、PRKAR1A基因、PURB基因、RAD51基因、SDC4基因、SLC34A2基因、STRN基因、TFG基因、TPM3基因、TRIM24基因及TRIM33基因中的至少一种。
4.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述ALK融合检测剂包括如SEQ ID No.1～SEQ ID No.27所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述EGFR融合检测剂包括如SEQ ID No.28～SEQ ID No.46所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述RET融合检测剂包括如SEQ ID No.47～SEQ ID No.78所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述ROS1融合检测剂包括如SEQ ID No.79～SEQ ID No.195所示的核苷酸链中的至少一条。
5.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，如SEQ ID No.1所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446129～29446249位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.2所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446189～29446309位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.3所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446249～29446369位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.4所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446309～29446429位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.5所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446396～29446489位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.6所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446429～29446549位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.7所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446489～29446609位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.8所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29446549～29446669位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.9所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447338～29447457位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.10所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447397～29447517位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.11所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447457～29447577位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.12所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447517～29447637位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.13所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447577～29447697位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.14所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447637～29447757位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.15所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447697～29447817位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.16所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447757～29447877位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.17所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447817～29447937位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.18所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447877～29447997位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.19所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447937～29448057位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.20所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29447997～29448117位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.21所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448057～29448177位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.22所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448117～29448237位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.23所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448177～29448297位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.24所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448237～29448357位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.25所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448297～29448417位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.26所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448357～29448477位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.27所示的核苷酸链用于检测2号染色体第29448417～29448537位点区域的ALK基因是否与所述融合片断发生基因融合。
6.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，如SEQ ID No.28所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267769～55267889位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.29所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267829～55267949位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.30所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267889～55268009位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.31所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55267949～55268069位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.32所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268009～55268129位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.33所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268069～55268189位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.34所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268129～55268249位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.35所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268189～55268309位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.36所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268249～55268369位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.37所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268309～55268428位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.38所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268595～55268715位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.39所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268629～55268749位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.40所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268640～55268760位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.41所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268689～55268809位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.42所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268749～55268869位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.43所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268809～55268929位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.44所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268869～55268989位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.45所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268929～55269049位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.46所示的核苷酸链用于检测7号染色体第55268989～55269109位点区域的EGFR基因是否与所述融合片断发生基因融合。
7.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，如SEQ ID No.47所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610118～43610238位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.48所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610178～43610298位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.49所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610238～43610358位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.50所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610298～43610418位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.51所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610358～43610478位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.52所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610418～43610538位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.53所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610478～43610598位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.54所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610538～43610658位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.55所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610598～43610718位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.56所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610658～43610778位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.57所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610718～43610838位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.58所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610778～43610898位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.59所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610838～43610958位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.60所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610898～43611018位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.61所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43610958～43611078位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.62所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611018～43611138位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.63所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611078～43611198位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.64所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611138～43611258位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.65所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611198～43611318位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.66所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611258～43611378位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.67所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611318～43611438位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.68所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611378～43611498位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.69所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611438～43611558位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.70所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611498～43611618位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.71所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611558～43611678位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.72所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611618～43611738位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.73所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611678～43611798位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.74所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611738～43611858位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.75所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611798～43611918位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.76所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611858～43611978位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.77所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611918～43612038位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合；及/或，
如SEQ ID No.78所示的核苷酸链用于检测10号染色体第43611978～43612098位点区域的RET基因是否与所述融合片断发生基因融合。
8.根据权利要求1所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述检测芯片上还包括用于检测基因突变第二序列组以及用于检测基因扩增的第三序列组；
所述第二序列组包括ALK突变检测剂、BRAF突变检测剂、DDR2突变检测剂、EGFR突变检测剂、ERBB2突变检测剂、FGFR1突变检测剂、KRAS突变检测剂，MET突变检测剂、NRAS突变检测剂、PIK3CA突变检测剂、RET突变检测剂以及ROS1突变检测剂；
所述第三序列组包括ALK扩增检测剂、MET扩增检测剂、PIK3CA扩增检测剂以及FGFR1扩增检测剂；
所述ALK突变检测剂针对2号染色体上外显子1～外显子27中的ALK突变基因进行设计，所述BRAF突变检测剂针对7号染色体外显子11～外显子15中的BRAF突变基因进行设计，DDR2突变检测剂针对1号染色体外显子1～外显子19中DDR2突变基因进行设计，EGFR突变检测剂针对7号染色体外显子18～外显子21中EGFR突变基因进行设计，ERBB2突变检测剂针对17号染色体外显子8～外显子21中ERBB2突变基因进行设计，FGFR1突变检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1突变基因进行设计，KRAS突变检测剂针对12号染色体外显子1～外显子6中的KRAS突变基因进行设计，MET突变检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET突变基因进行设计，NRAS突变检测剂针对1号染色体上外显子2和外显子3的NRAS突变基因进行设计，PIK3CA突变检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA突变基因进行设计，RET突变检测剂针对10号染色体上外显子1～外显子20中的RET突变基因进行设计，ROS1突变检测剂针对6号染色体上外显子1～外显子44中的ROS1突变基因进行设计；
所述ALK扩增检测剂针对2号染色体外显子1～外显子27中的的ALK扩增基因进行设计，所述MET扩增检测剂针对7号染色体外显子1～外显子21中的MET扩增基因进行设计，所述PIK3CA扩增检测剂针对3号染色体上外显子1～外显子21中的PIK3CA扩增基因进行设计，所述FGFR1扩增检测剂针对8号染色体外显子1～外显子19中FGFR1扩增基因进行设计。
9.根据权利要求8所述的肿瘤驱动基因的检测芯片，其特征在于，所述ALK扩增检测剂包括如SEQ ID No.196～SEQ ID No.197所示的核苷酸链中的至少一条；及/或，
所述MET扩增检测剂包括如SEQ ID No.198～SEQ ID No.199所示的核苷酸链中的至少一条。
10.如权利要求1～9任一项所述的肿瘤驱动基因的检测芯片在肿瘤的检测试剂、检测试剂盒或检测设备中的应用。
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