CN106947825B - 用于食蟹猴起源（亚群）鉴定的snp标记及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的SNP标记及其应用。该SNP标记包括48个SNP位点，为SNP1～SNP48，并分别表示其位于SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第61位。本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的48个SNP标记，对于进口食蟹猴真实起源(亚群)的鉴定，SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的，从而促进食蟹猴起源(亚群)鉴定标准化进程。
Description
技术领域
本发明涉及利用基因组生物信息分析技术的优势，具体涉及一种用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的SNP标记及其应用；通过高通量测序并筛选出食蟹猴的 48个SNP标记，用以区分不同起源(亚群)的食蟹猴。
背景技术
目前国内生物医药产业迅猛发展，实验动物作为生物医药产业的重要支撑条件及生命科学研究的重要材料，其质量直接关系到实验结果的可靠性和真实性。实验动物的遗传质量是实验动物质量好坏的重要因素之一，只有应用遗传特性稳定的实验动物才能保证生物医学研究结果具有可比性及实验结果的可靠性。因此，实验动物质量标准化，尤其遗传质量的标准化将直接影响生物医药的研发水平。但由于缺乏统一的、标准化的遗传质量控制标准，实验动物的遗传质量监控也渐渐成为其生产应用中较突出的问题。就目前情况而言，筛查到国内外广泛认可的有效遗传标记是实现实验动物遗传质量监测技术突破的有途径之一。
目前，我国实验动物遗传监测主要推行国家标准(GB 14923-2010)，主要采取形态学(毛色基因测试法)、数量遗传学(下颌骨测定法)、免疫标记基因检测法(皮肤移植法)以及生化标记基因检测法等。这些方法各有优势，而且在实验动物的繁殖生产和日常监测管理工作中仍有至关重要的使用价值，但随着实验动物科学和分子生物学的飞速发展，传统的检测方法包括国标力推的生化标记基因检测法、皮肤移植法和免疫学检测法已不能完全适应多种品系实验动物的遗传监测工作。
随着DNA指纹技术、随机扩增多态性(RAPD)、微卫星和单核苷酸多态性 (SNP)等一系列分子遗传标记的发现，微卫星和SNP标记脱颖而出，已经大量应用于实验动物的遗传检测，其中，SNP标记是继生化标记和RAPD遗传标记之后的第三代DNA分子标记，具有位点丰富、遗传稳定、筛选规模化等显著优点。然而，相比于目前先进的分子检测技术及国际同行的领先程度，我国的遗传监测标准还有待改进，且刻不容缓。
发明内容
为了克服现有技术的缺点与不足，本发明的目的在于提供一种用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的SNP标记。
食蟹猴(Macaca fascicularis)是生物医药研究中常用的灵长类动物，其自然分布区域在灵长类中仅次于人类及恒河猴，主要分布于亚洲东南部国家，其不同区域种群间的遗传差异会对相同实验的治疗效果产生一定偏差影响，因此，本发明旨在利用高通量测序筛选出食蟹猴的48个SNP标记，用以区分不同起源 (亚群)的食蟹猴。
本发明的另一目的在于提供所述的用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的SNP标记的应用。
本发明的目的通过下述技术方案实现：
本发明首先对由20只已知起源(亚群)的食蟹猴DNA样本组成的简化代表文库进行简化基因组测序，利用生物信息学方法仔细筛选出48个起源(亚群) 标记(AIMs panel)，尽量最大覆盖整个基因组，用以鉴定未知地理起源(亚群) 食蟹猴的起源(亚群)鉴定。
然后，随机抽取了400只未知起源(亚群)的食蟹猴，应用48个SNP(AIMs panel)对提取的DNA进行基因分型，并用STRUCTURE来鉴定食蟹猴的地理起源(亚群)，并将已知起源(亚群)(分别为印度支那、毛里求斯、马来西亚群岛及菲律宾群岛)的食蟹猴作为参考样本。
所述的48个SNP位点为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、 SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、 SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、 SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、 SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、 SNP45、SNP46、SNP47、SNP48。
所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO：16所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO：17所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO：18所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO：19所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO：20所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO：21所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO：22所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO：23所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；
所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO：24所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO：25所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO：26所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO：27所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO：28所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；
所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO：30所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO：31所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO：32所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO：33所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO：34所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO：35所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO：36所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO：37所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO：38所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO：39所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO：40所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO：41所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO：42所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO：43所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；
所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO：44所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO：45所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO：46所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO：47所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的48个SNP位点所在的DNA片段，其序列分别如SEQ ID NO：1～ SEQ ID NO：48所示。
所述的48个SNP位点可应用于食蟹猴起源(亚群)的鉴定。
所述的48个SNP位点在制备试剂盒或检测方法中的应用；所述的试剂盒或检测方法的用途为食蟹猴起源(亚群)的鉴定。
所述的DNA片段在辅助进行食蟹猴起源(亚群)的鉴定中的应用。
本发明相对于现有技术，具有如下的优点及效果：
本发明采用生物信息技术的优势开发出能用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的 SNP标记，对于进口食蟹猴真实起源(亚群)的鉴定，SNP标记的应用可大大降低成本和简化操作。SNP标记应用可达到快速初筛和降低检测成本的目的，从而促进食蟹猴起源(亚群)鉴定标准化进程。
附图说明
图1是400只未知起源(亚群)的食蟹猴的的结构(K＝4)。
具体实施方式
下面结合实施例及附图对本发明作进一步详细的描述，但本发明的实施方式不限于此。
实施例1
1、实验动物样本
20只已知起源(亚群)的食蟹猴(包括有菲律宾、马来西亚、毛里求斯、印度支那等)；400只未知起源(亚群)的食蟹猴；
2、动物血样来源：蓝岛生物技术有限公司
3、目标SNP的筛选过程
3.1、测序
首先，测序了由20只食蟹猴DNA样本组成的简化基因组文库，这20只食蟹猴的来源包括4个不同地区。
DNA样品浓度设置为90ng/μL，分别用HinfI酶消化，然后对消化产物进行清洗，对清洗后的片段进行电泳，回收200～500bp间的条带，重复以上步骤直至原料回收充足，再次量化调整合成溶液，然后分别从这20个回收处理过的样品中，取等量体积混合，且混合体积为75μL，最后用Illumina Genome Analyzer II进行测序。
3.2、SNP筛选
检测到146,250个SNP，其中约5000个SNP是唯一存在于其中一个种群的，从这些地理上唯一的SNP中，针对每个种群，分别挑选出12个频率最高的位点，组成48个起源(亚群)标记(AIMs panel)，尽量最大覆盖整个基因组。
所述的48个SNP位点为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、 SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、 SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、 SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、 SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、 SNP45、SNP46、SNP47、SNP48。
所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第 61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO：16所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO：17所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO：18所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO：19所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO：20所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO：21所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO：22所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO：23所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；
所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO：24所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO：25所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO：26所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO：27所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO：28所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M(A/C)；
所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO：30所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO：31所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO：32所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO：33所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO：34所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(T/C)；
所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO：35所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO：36所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y(C/T)；
所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO：37所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO：38所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO：39所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(T/G)；
所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO：40所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W(A/T)；
所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO：41所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO：42所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(G/C)；
所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO：43所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S(C/G)；
所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO：44所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO：45所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO：46所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K(G/T)；
所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO：47所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(A/G)；
所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R(G/A)；
所述的48个SNP位点所在的DNA片段，其序列分别如SEQ ID NO：1～ SEQ ID NO：48所示。
4、分型
然后，随机抽取了400只未知起源(亚群)的食蟹猴，应用48个SNP(AIMs panel)对提取的DNA进行分型，并用STRUCTURE来鉴定食蟹猴的地理起源 (亚群)，并将已知起源(亚群)(分别为印度支那、马来西亚群岛、菲律宾群岛及毛里求斯)的食蟹猴作为参考样本。如图1，结果显示这400只食蟹猴起源 (亚群)于印度支那地区。
上述实施例为本发明较佳的实施方式，但本发明的实施方式并不受上述实施例的限制，其他的任何未背离本发明的精神实质与原理下所作的改变、修饰、替代、组合、简化，均应为等效的置换方式，都包含在本发明的保护范围之内。
SEQUENCE LISTING
<110> 华南理工大学
<120> 用于食蟹猴起源（亚群）鉴定的SNP标记及其应用
<130> 1
<160> 48
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP1位点所在的DNA序列
<400> 1
ctccttccca ctccattcta tttcattcca ctgcatagcc tccctcccac ccatctattc 60
gtcccagccc ccaaactgac actgggattg ccatatccag gaagccacgt ggaaggcttt 120
t 121
<210> 2
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP2位点所在的DNA序列
<400> 2
atttttaaac ctgattcatc tctactgcat tgtaaatggc aaactgaatt gacagtaaaa 60
ttacgtgcat gtcaaaaaat aatacacaca cacaacgagg atagagtaag aacgaatgaa 120
g 121
<210> 3
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP3位点所在的DNA序列
<400> 3
ctttgtgtag agtcgattaa aattagaaac cagccaggaa gcgattatag aaatccagga 60
gagcactgtt gggagtatgc actgaagggg tgatggggta ggagaaggag tgccccaggg 120
a 121
<210> 4
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP4位点所在的DNA序列
<400> 4
cccccgcaca gggtgagtgg tgcctttatt ctgagttatt taaggatccc agtcattatg 60
atacaggagc tagaaagaaa tttaggcaga gaaggagggt aagagagtcc tcagcaaagt 120
t 121
<210> 5
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP5位点所在的DNA序列
<400> 5
ggagtccagc actagtgagc agagtgccag aatgacagcc atggacaatg ccagcaagaa 60
tgcttgtaag tacacaataa ggatggtgcc agcaggaatg cttgtgagca cacagtgaat 120
c 121
<210> 6
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP6位点所在的DNA序列
<400> 6
tgtttgtttg ttttgagaca aagtcccact ctgtcaccca ggctggagtg cagtggcaca 60
atctcagctt actgcaacct ctgcctccca ggttcgagtg attctctgcc tcagtctccc 120
a 121
<210> 7
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP7位点所在的DNA序列
<400> 7
gaagcaagct aaagtattcc attaatcttc cccagtgcag aggattaagt gagtggttct 60
taggtttgaa cacatgtcag gagggcttgt atcaatgcag agtgtggacc cacctccaga 120
g 121
<210> 8
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP8位点所在的DNA序列
<400> 8
tttgagcagc ttttgcttca tgccctacaa atatctctga gcatctggac tggacaatgg 60
gatctgattt gagtttgagg agtggtaaga actataactt ggactcagct tactcctgaa 120
g 121
<210> 9
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP9位点所在的DNA序列
<400> 9
ggataaggaa atagaagggg atgaaagaga tggcatgggg tatgctttcc catctggctt 60
agaaaaatag ttttaatatc cagtggaaag agggatagag caaaggataa ataaattcta 120
t 121
<210> 10
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP10位点所在的DNA序列
<400> 10
aggattctag gataggttta ccagaactta aagctgggag gcccctcagg gaaggagagg 60
ggaaattgtt tgttgaaagc aacacagcaa gggcagagca gagccagggc tagggtccgg 120
c 121
<210> 11
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP11位点所在的DNA序列
<400> 11
tccacagcaa aggagagtaa gttcttattg aggtggtcga gatcctacct gagacactgg 60
gaaggtggcg ggagattgga acatgcagta gttgcgttct ggagtttact gaggttttcc 120
c 121
<210> 12
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP12位点所在的DNA序列
<400> 12
ttacaaaatc cataaagtta aaccaggaga aatggacaaa aacacactca ttgtagaggt 60
ctttaatgat cccttggctc atggcagagc agttagacac acacacacac acacacacac 120
a 121
<210> 13
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP13位点所在的DNA序列
<400> 13
agagctgagc tggagttgag taacctaatg tagcttgtcc caaaccatat gccacaaacc 60
gctacatcct caagacattc acaggtgttg tctggaaaaa caacaagagt gagaatccca 120
t 121
<210> 14
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP14位点所在的DNA序列
<400> 14
ttcaggctgg agtgcagtgg ggcaatcata actcactgca gcctcaaact cctgggctca 60
ggtgaccctc ctgcctcagc ctcctgagta gctaggacta taagtccgta tcaccatacc 120
t 121
<210> 15
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP15位点所在的DNA序列
<400> 15
aggcttagga aaagctttgt gtttacagag agggagatgg tgtgccggca tcattcttag 60
ataaggaagc tgaggcttgt gtggatgtgc aactatgcca gggtcagttt tgggtacaat 120
g 121
<210> 16
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP16位点所在的DNA序列
<400> 16
gctggtccaa agagcacact ttaagtagca agggtataaa tggcaatggg ataaggcaaa 60
aatatatata tattttgact aaagtttgag gaaattgcaa tagattattg agtaggattg 120
t 121
<210> 17
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP17位点所在的DNA序列
<400> 17
agtcaatgtg ttactttaac tagagacttg acttatggtt ggtattaaaa tctttgttcc 60
tggatacagg agagccaaga atcattaggt atatgtggat atattttagg agatgagagt 120
g 121
<210> 18
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP18位点所在的DNA序列
<400> 18
atcgcttgac cctgggaggc ggagactgca gtaagccaag atcgtgctgc tgctctccag 60
tctgggtgac agagtgagat ccagtccaaa aaaagaaaga gagggattgt cttttccaca 120
t 121
<210> 19
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP19位点所在的DNA序列
<400> 19
ccacgagagt gaaaggttct gtctcactgt cattctgggt gctactgggg tattaaaaaa 60
aaactgccac tagcttgggt ctgcaaaaac agtgcccaat tttgtggttg aaaccctggg 120
c 121
<210> 20
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP20位点所在的DNA序列
<400> 20
gactcagttc atttggaacg atagtgtcct gacagttgtt tttgtttcct tctttctaac 60
atatcaacct tttgaaatct gaacccaatg gagtatgtca gcacaaccag gcaggtttct 120
g 121
<210> 21
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP21位点所在的DNA序列
<400> 21
atcccataaa gcagagtgaa atcctatacg tgggaaaatg taggggcaat tggctaaggt 60
ggcctcttta ccccacccat ccttcttgcc tacyyctggt ggcttatcct agaatcgagg 120
c 121
<210> 22
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP22位点所在的DNA序列
<400> 22
catgccttca gtcctgctct gctctccctg tctgccactg tccaaaatgg gaagcctgcc 60
tgctctgcaa ggcttgtctc cagtccagcc catttcaccc tctgcacggg gttctgcttt 120
g 121
<210> 23
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP23位点所在的DNA序列
<400> 23
cttttgatta tagccttcct ggtaggtatg aagtagtatc tcactgtggt tttgatttct 60
attttctcaa taactaatga tgttgggaat ctttttatgt gtttattggc tatttgtata 120
t 121
<210> 24
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP24位点所在的DNA序列
<400> 24
cctagaaatt cttgatgttg aaggcacagc agccaactgc caccagctga tgccacacca 60
gagccaggac taggacagat ttatggggcc agaaacgtga ggccaggctg ccggctcccc 120
a 121
<210> 25
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP25位点所在的DNA序列
<400> 25
tgctcctcat ttgtcttcca ccaggattgt aaggcctccc caaccatgtg gaactctgag 60
ccagtaaaac ctctttcctt tataaattac ccagtcttga gtatgtcttt atttagcagc 120
a 121
<210> 26
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP26位点所在的DNA序列
<400> 26
ttagatggct tttacctgct gacagcgcta aagtgttgag gtcttgcaat gagctaaata 60
ggctatgctt gataacaaat tgatgcgagg ttacaccagg gagaggatgg gactgtgaat 120
t 121
<210> 27
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP27位点所在的DNA序列
<400> 27
gtgatggcag ttaggggagt gggtgagttg ggtgcacaca cacctacacc gagtatggat 60
ataggtacac acagcccggg cgcggtggct cctgcctgtg atcccaacac tttgggaggc 120
t 121
<210> 28
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP28位点所在的DNA序列
<400> 28
tcaaggccaa cagattttac aaataaagaa aaggagtgca agaaaggtta agagctccaa 60
gtcacatggc tagtcaagta cagtcttcct catggctcct gtagtgcctg ttaacagaaa 120
t 121
<210> 29
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP29位点所在的DNA序列
<400> 29
actgagcagt ttttttcatt tgtttaagtt cttatagctt taaaactccr tcacgaattt 60
aatgtttttt cttcttttgt ctttagtagc accatattga gagtggtcaa tatcaaaatt 120
g 121
<210> 30
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP30位点所在的DNA序列
<400> 30
ctacaaagag aataaaatac ctaggaatcc aacttacaag ggatgtgaag gacgtcttca 60
aggagaacta caaatcactg cttaatgaaa taaaagagaa cacaaacaaa gagaagaaca 120
t 121
<210> 31
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP31位点所在的DNA序列
<400> 31
agtatacatg tgcagcaacc tctttgggat gtttgaatgt gcaggattat ctgaggaaac 60
gtttgatcca cttgaaagcc catttagtgg taggacatgg tgccgagtgt cagagtccag 120
t 121
<210> 32
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP32位点所在的DNA序列
<400> 32
acccaccaac tgcttgcacc ctcaccgtgg aaaaggtaca ggcactcaac accagcccag 60
gccatgagga cagctgcaaa gccacaggtg cagagctgcc caaggccttg ggagcccagc 120
c 121
<210> 33
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP33位点所在的DNA序列
<400> 33
ctgcctggct ctcattgaac ccacttagtc ttcttcctga tgagttggca caggcaggcc 60
tagctttccc ttcaacattt tgtcatctta cacataacca gattccaaac cctctcaatt 120
c 121
<210> 34
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP34位点所在的DNA序列
<400> 34
gttcatctgt ctcagcttct ctttgcctac agacgtggat gagtgcgagc gagaggataa 60
tgcaggttgt gtgcatgact gtgtcaacat ccctggcaat taccggtgta cctgctatga 120
t 121
<210> 35
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP35位点所在的DNA序列
<400> 35
ttggaggccg agatggaagg atcacttcag gccaggagtt caagactaac ctgttcaaca 60
gaagtagtac tacagaacaa agaaatgact gtctttgtga cactgttagg aacactggat 120
a 121
<210> 36
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP36位点所在的DNA序列
<400> 36
gaatctctct ctctctccaa tttcaccact atcctagcac aagctactat catgtccagc 60
ctccatatca cctgtgctta cctagtactg tactcatgca tgcactggtt ccccctgcca 120
g 121
<210> 37
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP37位点所在的DNA序列
<400> 37
aggctccatg ggaagcgggg ttcagccttc ctctctactc cacctgcctg cccagagtgg 60
acctggcaca aagtgagcag acagtagcca tcggttgaca ggatcactaa atcccaaatc 120
t 121
<210> 38
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP38位点所在的DNA序列
<400> 38
gggtttcact cctgttgccc agattggagt gcagtggcat gatctcaact cactgcaacc 60
tccaccttcc ggttcaagca attctcctgc ttcagcctcc caagcagctg ggactacagg 120
t 121
<210> 39
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP39位点所在的DNA序列
<400> 39
aatctgtccc aggctataga aaatgtcctg agtgtcctgc tcttctaccc ggatgatgag 60
tctgccaaga gggctctgaa ccagtaccag gcccagctgg gagagccgag acctggcctc 120
g 121
<210> 40
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP40位点所在的DNA序列
<400> 40
gcatatgagt cacatcacga ggtaagtcac acaggctagc agaggtgcta gctcagggaa 60
agggaaatca aaaatagata taaagtagga agtcaggagg gcataaggtt tttcagaaaa 120
t 121
<210> 41
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP41位点所在的DNA序列
<400> 41
acagaattcc caaaccctct ggagagagtt ttccctcttg tgggagggat ccagtgggaa 60
ataattgcat cacaggggct ggtctttccc gttctgttct catgatagtg aataagtctc 120
a 121
<210> 42
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP42位点所在的DNA序列
<220>
<221> misc_feature
<222> (6)..(30)
<223> n is a, c, g, or t
<400> 42
caggtnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn actcatttag ttctgaggat tgataccgcc 60
gagcactgga aggtgagtgc tgattggttg gttcaggtga actctgattg gctggttcag 120
g 121
<210> 43
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP43位点所在的DNA序列
<400> 43
ccagcaatgc tgggatctct tacgataaac tttcctgaga gattgacaca ctcagaacaa 60
cgtatgtgct gcttaaaatc ttacatgtct tgtacttcca gccattgtca gactggccac 120
c 121
<210> 44
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP44位点所在的DNA序列
<400> 44
cctaaggctc tgttcttcta catacacata caccaggtgc acacacatac acactcatgt 60
gcacacatac atgcagagac atgtggtata catgacaaca taggaataat ttaattttat 120
a 121
<210> 45
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP45位点所在的DNA序列
<400> 45
aattggatga cactccagga aggagggggg aaatgaaaac agctgttccg agaggacaac 60
acggtgttgt gcagaagatg agcccacagc ccgggaggac tgagcagcct gggaggactg 120
a 121
<210> 46
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP46位点所在的DNA序列
<400> 46
agctgggact acaggtacct gccactatgc ctggctagtt tccgtatttt tagtagaagt 60
ggactttcac catattgacc aggctggtct cgaactcctg accttaaatg atccacccac 120
c 121
<210> 47
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP47位点所在的DNA序列
<400> 47
caatgaagcc agtctgagtc ccaaaacctc aaaagtaagg aagacaacag tgcagccttc 60
agtctgtggc caaaggcccg agagccctta gcaaaccact ggtgtaagtc caagagtcca 120
a 121
<210> 48
<211> 121
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> SNP48位点所在的DNA序列
<400> 48
aagaggtatt tttagatatg agtccaagag ggtttcccag aggaggtgac ctaaatgaag 60
gaagggaaca agccatttga agatccaggg gaagagcgag gggatggatt tggggaagac 120
t 121
Claims (5)
1.一种用于食蟹猴起源鉴定的SNP标记，其特征在于所述的SNP标记包括48个SNP位点，为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4、SNP5、SNP6、SNP7、SNP8、SNP9、SNP10、SNP11、SNP12、SNP13、SNP14、SNP15、SNP16、SNP17、SNP18、SNP19、SNP20、SNP21、SNP22、SNP23、SNP24、SNP25、SNP26、SNP27、SNP28、SNP29、SNP30、SNP31、SNP32、SNP33、SNP34、SNP35、SNP36、SNP37、SNP38、SNP39、SNP40、SNP41、SNP42、SNP43、SNP44、SNP45、SNP46、SNP47、SNP48；
所述的SNP1表示该SNP位点位于SEQ ID NO：1所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP2表示该SNP位点位于SEQ ID NO：2所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP3表示该SNP位点位于SEQ ID NO：3所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP4表示该SNP位点位于SEQ ID NO：4所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP5表示该SNP位点位于SEQ ID NO：5所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP6表示该SNP位点位于SEQ ID NO：6所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP7表示该SNP位点位于SEQ ID NO：7所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP8表示该SNP位点位于SEQ ID NO：8所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP9表示该SNP位点位于SEQ ID NO：9所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP10表示该SNP位点位于SEQ ID NO：10所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP11表示该SNP位点位于SEQ ID NO：11所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP12表示该SNP位点位于SEQ ID NO：12所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP13表示该SNP位点位于SEQ ID NO：13所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP14表示该SNP位点位于SEQ ID NO：14所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP15表示该SNP位点位于SEQ ID NO：15所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP16表示该SNP位点位于SEQ ID NO：16所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W；
所述的SNP17表示该SNP位点位于SEQ ID NO：17所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP18表示该SNP位点位于SEQ ID NO：18所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP19表示该SNP位点位于SEQ ID NO：19所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W；
所述的SNP20表示该SNP位点位于SEQ ID NO：20所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP21表示该SNP位点位于SEQ ID NO：21所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP22表示该SNP位点位于SEQ ID NO：22所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP23表示该SNP位点位于SEQ ID NO：23所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M；
所述的SNP24表示该SNP位点位于SEQ ID NO：24所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S；
所述的SNP25表示该SNP位点位于SEQ ID NO：25所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP26表示该SNP位点位于SEQ ID NO：26所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP27表示该SNP位点位于SEQ ID NO：27所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP28表示该SNP位点位于SEQ ID NO：28所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP29表示该SNP位点位于SEQ ID NO：29所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基M；
所述的SNP30表示该SNP位点位于SEQ ID NO：30所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W；
所述的SNP31表示该SNP位点位于SEQ ID NO：31所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP32表示该SNP位点位于SEQ ID NO：32所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S；
所述的SNP33表示该SNP位点位于SEQ ID NO：33所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP34表示该SNP位点位于SEQ ID NO：34所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP35表示该SNP位点位于SEQ ID NO：35所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP36表示该SNP位点位于SEQ ID NO：36所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基Y；
所述的SNP37表示该SNP位点位于SEQ ID NO：37所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP38表示该SNP位点位于SEQ ID NO：38所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP39表示该SNP位点位于SEQ ID NO：39所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP40表示该SNP位点位于SEQ ID NO：40所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基W；
所述的SNP41表示该SNP位点位于SEQ ID NO：41所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP42表示该SNP位点位于SEQ ID NO：42所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S；
所述的SNP43表示该SNP位点位于SEQ ID NO：43所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基S；
所述的SNP44表示该SNP位点位于SEQ ID NO：44所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP45表示该SNP位点位于SEQ ID NO：45所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP46表示该SNP位点位于SEQ ID NO：46所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基K；
所述的SNP47表示该SNP位点位于SEQ ID NO：47所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R；
所述的SNP48表示该SNP位点位于SEQ ID NO：48所示的核苷酸序列的第61位，并且该位置处核苷酸序列为简并碱基R。
2.权利要求1所述的用于食蟹猴起源鉴定的SNP标记所在的DNA片段，其特征在于：所述的DNA片段的序列分别如SEQ ID NO：1～SEQ ID NO：48所示。
3.权利要求1所述的用于食蟹猴起源鉴定的SNP标记在食蟹猴起源的鉴定中的应用。
4.权利要求1所述的用于食蟹猴起源鉴定的SNP标记在制备试剂盒或检测方法中的应用，其特征在于：所述的试剂盒或检测方法的用途为食蟹猴起源的鉴定。
5.权利要求2所述的DNA片段在辅助进行食蟹猴起源的鉴定中的应用。
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