CN112375828A - 用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法及其应用,该方法包括以下步骤:1)利用核酸提取试剂盒提取食蟹猴全血DNA;2)靶向文库的构建:针对食蟹猴中至少400个STR位点及SNP位点,根据每个位点设计特异性扩增引物,将合成的全部特异性扩增引物混成引物池,进行靶向文库的构建;3)利用二代测序仪以及测序试剂进行基因测序获得食蟹猴基因型信息。本发明的方法适合对大批量的食蟹猴进行基因分型检测,具有快速且高通量的优点,可应用于食蟹猴的起源鉴定及家族亲缘鉴定。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别是涉及一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法和应用。
背景技术
目前随着生物医药行业的不断快速发展,动物模型也随之开始被大量使用,而食蟹猴作为灵长类动物,其体内的生物代谢以及药理反应也最接近人类,因此食蟹猴也就成为了动物模型的不二选择。随之而来的就是食蟹猴的需求量不断的增长,这也就催生了很多的食蟹猴养殖基地。
为了清晰的掌握饲养食蟹猴种群的遗传结构、遗传谱系,就需要一种方案来区分不同食蟹猴之间的遗传关系,而目前还并没有一种非常准确的检测方法来确定遗传关系。
但随着分子检测技术的不断普及与应用,也催生出了利用STR以及SNP位点来确定遗传关系的方法。而检测STR/SNP位点检测目前主流的方法是Sanger测序法,也就是所谓的一代测序。这个方法的优点是检测速度快,成本低,但这都是建立在检测的STR/SNP位点较少的情况下(50个位点以下)。Sanger测序法如图1所示,1-20个不同STR/SNP位点需要设计20对特异引物,分别对20个STR/SNP位点进行PCR。之后利用Applied Biosystems 3500系列基因分析仪(或是Applied Biosystems公司的其它基因分析仪)对每个样本20个STR/SNP位点分别进行测序得到序列信息,再通过分析序列信息对样本进行基因分型。这种方法在STR/SNP位点较少时较为适用,但如果需要检测上百个STR/SNP位点,例如500个位点,那就需要设计500对特异引物,分别进行500个PCR反应,并分别进行Sanger测序,这不单单只是工作量的事情,成本也会非常的高。
而对于食蟹猴来说,只检测50个位点是远远不够的,食蟹猴需要检测400-600个位点才能完成最准确的检测,因此Sanger测序法无法解决问题。
本领域需要开发一种适合对大批量的食蟹猴进行遗传关系鉴定的高通量的检测方法,以用于食蟹猴的起源鉴定、家族亲缘鉴定和遗传关系鉴定等。
发明内容
本发明所要解决的技术问题在于,提供一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法,能够快速且高通量的对大批量食蟹猴进行遗传关系鉴定,以区分不同食蟹猴之间的起源、家族亲缘及遗传关系。
为解决上述技术问题,本发明提供以下技术方案为:
一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法,包括以下步骤:
1)利用核酸提取试剂盒提取食蟹猴全血DNA;
2)靶向文库的构建:针对食蟹猴中至少400个STR位点及SNP位点,根据每个位点设计特异性扩增引物,将合成的全部特异性扩增引物混成引物池,进行靶向文库的构建;所述STR位点及SNP位点至少包括:
位于染色体号chrX的起始位置76330603至终止位置76330762的位点;
位于染色体号chr3的起始位置128822374至终止位置128822548的位点;
位于染色体号chr2的起始位置139498001至终止位置139498054的位点;
位于染色体号chr5的起始位置35379040至终止位置35379159的位点;
位于染色体号chr3的起始位置129266965至终止位置129267192的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153102294至终止位置153102340的位点;
位于染色体号chr13的起始位置100082209至终止位置100082434的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141344459至终止位置141344686的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153555159至终止位置153555210的位点;
位于染色体号chr7的起始位置21976606至终止位置21976746的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141362575至终止位置141362779的位点;
位于染色体号chr8的起始位置8009408至终止位置8009642的位点;
位于染色体号chr22的起始位置22769190至终止位置22769391的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145612066至终止位置145612116的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9081112至终止位置9081164的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23490674至终止位置23490830的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145765022至终止位置145765077的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9103739至终止位置9103836的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23952065至终止位置23952253的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145787615至终止位置145787716的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11835154至终止位置11835359的位点;
位于染色体号chr12的起始位置85404193至终止位置85404398的位点;
位于染色体号chr3的起始位置148653859至终止位置148654062的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11878062至终止位置11878274的位点;
位于染色体号chr12的起始位置116113459至终止位置116113639的位点;
位于染色体号chr3的起始位置151446980至终止位置151447040的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11884224至终止位置11884417的位点;
位于染色体号chr20的起始位置1925332至终止位置1925473的位点;
位于染色体号chr3的起始位置165184060至终止位置165184237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11886017至终止位置11886136的位点;
位于染色体号chr15的起始位置48019410至终止位置48019654的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187908188至终止位置187908237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置14219293至终止位置14219341的位点;
位于染色体号chr6的起始位置67479741至终止位置67479921的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187910660至终止位置187910711的位点;
位于染色体号chr8的起始位置18249440至终止位置18249655的位点;
位于染色体号chr3的起始位置179118370至终止位置179118523的位点;
位于染色体号chr6的起始位置2641287至终止位置2641333的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69788943至终止位置69788992的位点;
位于染色体号chr17的起始位置13812478至终止位置13812602的位点;
位于染色体号chr6的起始位置9285373至终止位置9285574的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69799745至终止位置69799793的位点;
3)利用二代测序仪以及测序试剂进行基因测序获得食蟹猴基因型信息。
优选的,所述步骤(1)中,所述核酸提取试剂盒为QIAamp DNA Blood Mini Kit。
具体的,所述步骤(2)中,利用检测试剂盒构建靶向文库。
优选的,所述检测试剂盒包括以下试剂:
建库试剂:CleanPlex Targeted Library Kit;
纯化磁珠:Agencourt AMPure XP Kit。
优选的,所述步骤(2)中,针对食蟹猴中至少500个STR位点及SNP位点进行设计。更优选的,针对食蟹猴中至少600个STR位点及SNP位点进行设计。在一种优选的实施方式中,针对食蟹猴中564个STR位点及83个SNP位点进行设计。
具体的,所述步骤(3)中,所述二代测序仪型号为Illumina-MiSeq。
具体的,所述步骤(3)中,所述测序试剂为MiSeq Reagent Kit v3(600-cycle)。
本发明还提供一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的STR标记及SNP标记,所述STR标记及SNP标记包括至少包括以下STR位点及SNP位点:
位于染色体号chrX的起始位置76330603至终止位置76330762的位点;
位于染色体号chr3的起始位置128822374至终止位置128822548的位点;
位于染色体号chr2的起始位置139498001至终止位置139498054的位点;
位于染色体号chr5的起始位置35379040至终止位置35379159的位点;
位于染色体号chr3的起始位置129266965至终止位置129267192的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153102294至终止位置153102340的位点;
位于染色体号chr13的起始位置100082209至终止位置100082434的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141344459至终止位置141344686的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153555159至终止位置153555210的位点;
位于染色体号chr7的起始位置21976606至终止位置21976746的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141362575至终止位置141362779的位点;
位于染色体号chr8的起始位置8009408至终止位置8009642的位点;
位于染色体号chr22的起始位置22769190至终止位置22769391的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145612066至终止位置145612116的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9081112至终止位置9081164的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23490674至终止位置23490830的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145765022至终止位置145765077的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9103739至终止位置9103836的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23952065至终止位置23952253的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145787615至终止位置145787716的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11835154至终止位置11835359的位点;
位于染色体号chr12的起始位置85404193至终止位置85404398的位点;
位于染色体号chr3的起始位置148653859至终止位置148654062的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11878062至终止位置11878274的位点;
位于染色体号chr12的起始位置116113459至终止位置116113639的位点;
位于染色体号chr3的起始位置151446980至终止位置151447040的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11884224至终止位置11884417的位点;
位于染色体号chr20的起始位置1925332至终止位置1925473的位点;
位于染色体号chr3的起始位置165184060至终止位置165184237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11886017至终止位置11886136的位点;
位于染色体号chr15的起始位置48019410至终止位置48019654的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187908188至终止位置187908237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置14219293至终止位置14219341的位点;
位于染色体号chr6的起始位置67479741至终止位置67479921的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187910660至终止位置187910711的位点;
位于染色体号chr8的起始位置18249440至终止位置18249655的位点;
位于染色体号chr3的起始位置179118370至终止位置179118523的位点;
位于染色体号chr6的起始位置2641287至终止位置2641333的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69788943至终止位置69788992的位点;
位于染色体号chr17的起始位置13812478至终止位置13812602的位点;
位于染色体号chr6的起始位置9285373至终止位置9285574的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69799745至终止位置69799793的位点。
具体的,所述STR标记及SNP标记包括至少400个STR位点及SNP位点。优选的,所述STR标记及SNP标记包括至少500个STR位点及SNP位点。更优选的,所述STR标记及SNP标记包括至少600个STR位点及SNP位点。在一种优选的实施方式中,所述STR标记及SNP标记包括564个STR位点及83个SNP位点。
本发明还提供所述STR标记及SNP标记在用于食蟹猴的起源鉴定中的应用。
本发明还提供所述STR标记及SNP标记在用于食蟹猴的家族亲缘鉴定中的应用。
本发明还提供所述STR标记及SNP标记在用于食蟹猴的遗传关系鉴定中的应用。
而对于食蟹猴来说,只检测50个位点是远远不够的,食蟹猴需要检测400-600个位点才能完成最准确的检测。本发明利用多重PCR对食蟹猴至少400个STR位点及SNP位点进行分型检测,并结合二代测序技术,适合对大批量的食蟹猴进行基因分型检测,可应用于食蟹猴的起源鉴定机家族亲缘鉴定。
本发明利用多重PCR技术是将所有需要扩增的目标区域统一设计扩增引物,再将引物混合成引物池,利用1个PCR反应对成百上千个位点进行同时扩增,大大提升了效率。再结合二代测序技术,就能同时检测一个PCR反应中所有的位点,真正实现了高通检测。
本方案使用的多重PCR结合二代测序技术就能很好的解决Sanger测序的弊端。具体原理见图2。通过设计带有通用接头序列的STR/SNP位点特异引物,如果有500个位点,就设计500对,将这些引物混合成一个引物池,每个样本只需要进行1个PCR反应就能得到500个STR/SNP位点的PCR产物集。之后通过带有index的引物扩增第一轮PCR产物得到最终带有index的扩增文库产物。一个样本,一个产物,包含500个STR/SNP位点。之后利用Illumina-MiSeq测序平台完成测序,理论能同时完成500个不同样本的STR/SNP位点的测序。
附图说明
图1是Sanger法检测食蟹猴中STR/SNP原理示意图。
图2是本发明检测食蟹猴中STR/SNP原理示意图。
图3是一代测序法与二代测序法在cutoff值的设定中比对分辨率的示意图。
具体实施方式
下面将对本发明的技术方案进行清楚、完整的描述,显然,所描述的实施例是本发明的一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
实施例1
具体而言,通过设计得到STR位点及SNP位点的扩增引物池,配合检测试剂盒,通过一轮PCR得到带有通用接头的靶向产物,再通过酶切消化,降解非特异性产物,之后通过第二轮PCR获得带有index序列的靶向文库。最后可以将不同的靶向文库进行等量混合进行基因测序。该技术方案包括从样本的核酸抽提到测序结果输出的全部实验流程,主要包括全血DNA抽提、文库构建、测序三方面内容。
1.全血DNA抽提
全血样本基因组DNA的提取方法参照Qiagen公司的QIAamp DNA Blood Mini Kit试剂盒,分别提取了编号为S1-S56共56例食蟹猴全血基因组样本,将得到的DNA样本利用Thermo Fisher Scientific的Qubit 3.0测定DNA浓度,并将DNA用无核酸酶的水稀释至13.3ng/μL。
2.文库制备
文库制备的方法参照Paragon Genomics公司的CleanPlex Targeted LibraryKit。最终得到靶向文库。利用Thermo Fisher Scientific的Qubit 3.0测定文库的浓度,并将文库进行等ng混合。
本发明的方法的一种具体实施方案是,针对食蟹猴中564个STR位点及83个SNP位点进行设计的,各个位点的染色体坐标信息见表1(部分)。
表1. 564个STR位点及83个SNP位点的染色体坐标信息(部分)
染色体号 | 起始位置 | 终止位置 | 染色体号 | 起始位置 | 终止位置 | 染色体号 | 起始位置 | 终止位置 |
chrX | 76330603 | 76330762 | chr3 | 128822374 | 128822548 | chr2 | 139498001 | 139498054 |
chr5 | 35379040 | 35379159 | chr3 | 129266965 | 129267192 | chr2 | 153102294 | 153102340 |
chr13 | 100082209 | 100082434 | chr3 | 141344459 | 141344686 | chr2 | 153555159 | 153555210 |
chr7 | 21976606 | 21976746 | chr3 | 141362575 | 141362779 | chr8 | 8009408 | 8009642 |
chr22 | 22769190 | 22769391 | chr3 | 145612066 | 145612116 | chr8 | 9081112 | 9081164 |
chr22 | 23490674 | 23490830 | chr3 | 145765022 | 145765077 | chr8 | 9103739 | 9103836 |
chr22 | 23952065 | 23952253 | chr3 | 145787615 | 145787716 | chr8 | 11835154 | 11835359 |
chr12 | 85404193 | 85404398 | chr3 | 148653859 | 148654062 | chr8 | 11878062 | 11878274 |
chr12 | 116113459 | 116113639 | chr3 | 151446980 | 151447040 | chr8 | 11884224 | 11884417 |
chr20 | 1925332 | 1925473 | chr3 | 165184060 | 165184237 | chr8 | 11886017 | 11886136 |
chr15 | 48019410 | 48019654 | chr3 | 187908188 | 187908237 | chr8 | 14219293 | 14219341 |
chr6 | 67479741 | 67479921 | chr3 | 187910660 | 187910711 | chr8 | 18249440 | 18249655 |
chr3 | 179118370 | 179118523 | chr6 | 2641287 | 2641333 | chr8 | 69788943 | 69788992 |
chr17 | 13812478 | 13812602 | chr6 | 9285373 | 9285574 | chr8 | 69799745 | 69799793 |
再根据表1所述的每个区域设计特异扩增引物,引物序列见表2。将设计合成的引物混成引物池,进行靶向文库的构建。
表2多重PCR引物序列(部分)
3.测序
本发明采用了Illumina公司的小通量测序平台-MiSeq,选取的测序试剂也为Illumina公司MiSeq Reagent Kit v3(600-cycle),该测序试剂的特点为长读长,理论最长能的600bp长得序列,长读长有利于STR位点的测序,保证了STR位点测序信息的准确性。对于该测序平台,理论上能同时检测200个不同样本的STR/SNP位点。对于得到的测序结果,可以通过读取Index序列信息,得知每条测序信息的样本来源。
4.结果
下表是根据测序结果得到的数据进行亲缘关系的分析:
从以上结果可以看出,56例食蟹猴样本中我们将它们进行亲缘关系的配对,其中17组的配对是和正确答案一致的。剩余5组争议结果中,其中S04,S05,S11,S12未能在本次检测中发现其父亲,发现是这四个样本的DNA发生了降解,而S10的父亲我们能检出的和答案不一致,我们推测其真实的父亲其实是S19。同时,我们将这些样本也同样做了一代测序法的亲缘鉴定,选取了33,47,57个STR位点,结果显示在检测57个STR位点时其亲缘关系配对结果与二代测序法647个STR/SNP位点的结果一致。
虽说利用一代测序法57个STR位点检测的结果与二代测序法647个STR/SNP位点的结果拥有较好的一致性,但是在cutoff值的设定中,二代测序法则拥有更好的分辨率,如图3所示。可以看出利用一代测序法(图3左)检测的亲缘关系结果其分辨率是不及二代测序法(图3右)的,而这还只是分析56例样本的结果,如果样本量再继续增加,随着样本的增多,这样的分辨率势必会出现难以区分的情况。而二代测序法能够同时检测更多的位点,增强鉴定的分辨率,使非亲缘关系的样本之间有较大的差异,即使样本数量增加,也不会对鉴定产生影响。
综上所述,上述各实施例仅为本发明的较佳实施例而已,并不用以限定本发明的保护范围,凡在本发明的精神和原则之内,所做的任何修改、等同替换、改进等,皆应包含在本发明的保护范围内。
Claims (10)
1.一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法,其特征在于,包括:
1)利用核酸提取试剂盒提取食蟹猴全血DNA;
2)靶向文库的构建:针对食蟹猴中至少400个STR位点及SNP位点,根据每个位点设计特异性扩增引物,将合成的全部特异性扩增引物混成引物池,进行靶向文库的构建;所述STR位点及SNP位点至少包括:
位于染色体号chrX的起始位置76330603至终止位置76330762的位点;
位于染色体号chr3的起始位置128822374至终止位置128822548的位点;
位于染色体号chr2的起始位置139498001至终止位置139498054的位点;
位于染色体号chr5的起始位置35379040至终止位置35379159的位点;
位于染色体号chr3的起始位置129266965至终止位置129267192的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153102294至终止位置153102340的位点;
位于染色体号chr13的起始位置100082209至终止位置100082434的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141344459至终止位置141344686的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153555159至终止位置153555210的位点;
位于染色体号chr7的起始位置21976606至终止位置21976746的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141362575至终止位置141362779的位点;
位于染色体号chr8的起始位置8009408至终止位置8009642的位点;
位于染色体号chr22的起始位置22769190至终止位置22769391的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145612066至终止位置145612116的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9081112至终止位置9081164的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23490674至终止位置23490830的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145765022至终止位置145765077的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9103739至终止位置9103836的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23952065至终止位置23952253的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145787615至终止位置145787716的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11835154至终止位置11835359的位点;
位于染色体号chr12的起始位置85404193至终止位置85404398的位点;
位于染色体号chr3的起始位置148653859至终止位置148654062的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11878062至终止位置11878274的位点;
位于染色体号chr12的起始位置116113459至终止位置116113639的位点;
位于染色体号chr3的起始位置151446980至终止位置151447040的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11884224至终止位置11884417的位点;
位于染色体号chr20的起始位置1925332至终止位置1925473的位点;
位于染色体号chr3的起始位置165184060至终止位置165184237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11886017至终止位置11886136的位点;
位于染色体号chr15的起始位置48019410至终止位置48019654的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187908188至终止位置187908237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置14219293至终止位置14219341的位点;
位于染色体号chr6的起始位置67479741至终止位置67479921的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187910660至终止位置187910711的位点;
位于染色体号chr8的起始位置18249440至终止位置18249655的位点;
位于染色体号chr3的起始位置179118370至终止位置179118523的位点;
位于染色体号chr6的起始位置2641287至终止位置2641333的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69788943至终止位置69788992的位点;
位于染色体号chr17的起始位置13812478至终止位置13812602的位点;
位于染色体号chr6的起始位置9285373至终止位置9285574的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69799745至终止位置69799793的位点;
3)利用二代测序仪以及测序试剂进行基因测序获得食蟹猴基因型信息。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(1)中,所述核酸提取试剂盒为QIAamp DNA Blood Mini Kit。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,利用检测试剂盒构建靶向文库。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述检测试剂盒包括以下试剂:
建库试剂:CleanPlex Targeted Library Kit;
纯化磁珠:Agencourt AMPure XP Kit。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(2)中,针对食蟹猴中至少500个STR位点及SNP位点进行设计;更优选的,针对食蟹猴中至少600个STR位点及SNP位点进行设计。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述二代测序仪型号为Illumina-MiSeq。
7.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(3)中,所述测序试剂为MiSeqReagent Kit v3。
8.一种用于食蟹猴遗传关系鉴定的STR标记及SNP标记,其特征在于,所述STR标记及SNP标记包括至少包括以下STR位点及SNP位点:
位于染色体号chrX的起始位置76330603至终止位置76330762的位点;
位于染色体号chr3的起始位置128822374至终止位置128822548的位点;
位于染色体号chr2的起始位置139498001至终止位置139498054的位点;
位于染色体号chr5的起始位置35379040至终止位置35379159的位点;
位于染色体号chr3的起始位置129266965至终止位置129267192的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153102294至终止位置153102340的位点;
位于染色体号chr13的起始位置100082209至终止位置100082434的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141344459至终止位置141344686的位点;
位于染色体号chr2的起始位置153555159至终止位置153555210的位点;
位于染色体号chr7的起始位置21976606至终止位置21976746的位点;
位于染色体号chr3的起始位置141362575至终止位置141362779的位点;
位于染色体号chr8的起始位置8009408至终止位置8009642的位点;
位于染色体号chr22的起始位置22769190至终止位置22769391的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145612066至终止位置145612116的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9081112至终止位置9081164的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23490674至终止位置23490830的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145765022至终止位置145765077的位点;
位于染色体号chr8的起始位置9103739至终止位置9103836的位点;
位于染色体号chr22的起始位置23952065至终止位置23952253的位点;
位于染色体号chr3的起始位置145787615至终止位置145787716的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11835154至终止位置11835359的位点;
位于染色体号chr12的起始位置85404193至终止位置85404398的位点;
位于染色体号chr3的起始位置148653859至终止位置148654062的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11878062至终止位置11878274的位点;
位于染色体号chr12的起始位置116113459至终止位置116113639的位点;
位于染色体号chr3的起始位置151446980至终止位置151447040的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11884224至终止位置11884417的位点;
位于染色体号chr20的起始位置1925332至终止位置1925473的位点;
位于染色体号chr3的起始位置165184060至终止位置165184237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置11886017至终止位置11886136的位点;
位于染色体号chr15的起始位置48019410至终止位置48019654的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187908188至终止位置187908237的位点;
位于染色体号chr8的起始位置14219293至终止位置14219341的位点;
位于染色体号chr6的起始位置67479741至终止位置67479921的位点;
位于染色体号chr3的起始位置187910660至终止位置187910711的位点;
位于染色体号chr8的起始位置18249440至终止位置18249655的位点;
位于染色体号chr3的起始位置179118370至终止位置179118523的位点;
位于染色体号chr6的起始位置2641287至终止位置2641333的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69788943至终止位置69788992的位点;
位于染色体号chr17的起始位置13812478至终止位置13812602的位点;
位于染色体号chr6的起始位置9285373至终止位置9285574的位点;
位于染色体号chr8的起始位置69799745至终止位置69799793的位点。
9.如权利要求8所述的STR标记及SNP标记在用于食蟹猴的起源鉴定中的应用。
10.如权利要求8所述的STR标记及SNP标记在用于食蟹猴的家族亲缘鉴定中的应用。
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CN202011135426.XA CN112375828A (zh) | 2020-10-22 | 2020-10-22 | 用于食蟹猴遗传关系鉴定的方法和应用 |
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CN106947825A (zh) * | 2017-04-25 | 2017-07-14 | 华南理工大学 | 用于食蟹猴起源(亚群)鉴定的snp标记及其应用 |
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刘欢: "我国笼养食蟹猴种群遗传多样性与亲子鉴定研究", 农业科技辑, no. 4, pages 051 - 5 * |
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