CN106520809A - 一种GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的制备方法 - Google Patents
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Abstract
一种GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的制备方法,涉及GyV3新型环形病毒的诊断用融合蛋白的制备技术领域。本发明设计了扩增出pGEX‑6p‑1线性化载体以及GyV3病毒VP3基因片段的两对引物,利用商品化的重组酶ExnaseTM II,不经酶切连接反应,直接在体外快速重组取得阳性克隆体,并转化BL21细菌,经IPTG诱导下即获得GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白。本发明简化了克隆过程,实现VP3基因快速克隆表达。
Description
技术领域
本发明涉及GyV3新型环形病毒的诊断用融合蛋白的制备技术领域。
背景技术
鸡的传染性贫血病毒(CAV)一直被认为是环形病毒属中唯一成员。直到2011年,Rijsewijk等从发病鸡的血清样品中检测到新型环形病毒序列,即环形病毒属中第二个成员,命名为AGV2。同年,Sauvage等在健康人的皮肤棉试样品中检测到首个新型人源环形病毒HGyV序列。序列分析惊人发现,新型人源环形病毒HGyV与AGV2的基因组序列同源性高达96%。自2012年以来,环形病毒属中第三个成员GyV3的DNA序列也在人的粪便、皮肤拭子以及其他动物粪便中相继被发现。
目前尚无检测GyV3抗原及其抗体的血清学方法。因此,对GyV3病毒早期表达蛋白VP3基因在体外进行克隆,构建VP3表达载体,实现其表达,将为深入开展GyV3蛋白抗原及其抗体检测、血清学调查,明确GyV3在鸡群以及人群中的感染复制情况提供有效诊断试剂;并为探究GyV3 VP3生物学功能具有重要意义。
在传统表达载体的构建中,往往需要设计选择限制性内切酶酶切位点,通过酶切、连接的方法构建载体,实现外源基因的表达。但有时由于找不到合适的酶切位点,往往导致克隆过程繁琐,效率低下。
发明内容
本发明的目的是在于提供一种GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的制备方法,并实现VP3蛋白的表达,可以用于对GyV3在鸡群以及人群中的感染提供明确、有效的诊断。
本发明技术方案包括以下步骤:
1)以pGEX-6p-1质粒为模板,采用下述引物PCR扩增出pGEX-6p-1线性化表达载体;
上游引物:5‘TAATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGC3’;
下游引物:5‘CATGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGAT3’;
2)以人工合成的GyV3-VP3 基因为模板,采用下述引物PCR扩增出VP3基因片段;
上游引物:5‘GTTCCAGGGGCCCATGGAACCGGGACTTGG3’;
下游引物:5‘GTTTTCACCGTCATTACAGTCTTAGCCTTT3’;
3)在重组酶ExnaseTM II的作用下,将所述pGEX-6p-1线性化表达载体和VP3基因片段进行重组克隆,取得阳性克隆体,并转化BL21细菌,经IPTG诱导下即获得GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白。
本发明上述扩增pGEX-6p-1线性化载体上游引物位于pGEX-6p-1质粒1022-1047位;且在引物的5‘端带有额外TAA碱基;扩增pGEX-6p-1线性化载体下游引物位于pGEX-6p-1质粒916-941位;且在引物的5‘端带有额外CAT碱基。
本发明上述扩增GyV3病毒VP3基因上游引物包括VP3基因起始密码ATG及其后14个碱基,且在引物的5‘端带有16个与pGEX-6p-1线性化载体下游引物反向互补碱基;扩增GyV3病毒VP3基因下游引物包括VP3基因终止密码TAA及其前14个碱基,且在引物的5‘端带有16个与pGEX-6p-1线性化载体上游引物反向互补碱基。
本发明设计了扩增出pGEX-6p-1线性化载体以及GyV3病毒VP3基因片段的两对引物,利用商品化的重组酶ExnaseTM II,不经酶切连接反应,直接在体外快速重组取得阳性克隆体,并转化BL21细菌,经IPTG诱导下即获得GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白。本发明简化了克隆过程,实现VP3基因快速克隆表达。
本发明设计的引物及基于重组酶ExnaseTM II的克隆策略,可快速构建GyV3病毒VP3基因的原核表达载体。本发明获得的GyV3病毒VP3表达及纯化的蛋白,可直接提供VP3蛋白作为GyV3诊断抗原;作为免疫原获得抗VP3多克隆抗体;为开展GyV3流行病学调查提供有效诊断试剂;并为进一步探究VP3生物学功能具有重要意义。
附图表说明
图1为本发明GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的构建示意图。
图2为扩增出的pGEX-6p-1线性化载体、扩增出的GyV3病毒VP3基因片段和DNAMarker在1%的琼脂糖凝胶中的电泳图。
图3为SDS-PAGE分析GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的表达的电泳图。
图4为Western blot 鉴定抗AGV3 VP3蛋白多克隆抗体的电泳图。
具体实施方式
结合附图以下实施方式给出了GyV3新型环形病毒VP3蛋白制备的示例。
1、设计扩增含pGEX-6p-1线性化载体以及GyV3病毒VP3基因片段引物:
扩增pGEX-6p-1线性化载体上游引物位于pGEX-6p-1质粒1022-1047位;且在5’端带有额外TAA碱基;扩增pGEX-6p-1线性化载体下游引物位于pGEX-6p-1质粒916-941位;且在5’端带有额外CAT碱基。
PCR扩增pGEX-6p-1线性化载体引物:
上游引物:5‘TAATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGC3’;
下游引物:5‘CATGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGAT3’。
扩增GyV3病毒VP3基因上游引物包括VP3基因起始密码ATG及其后14个碱基,且在5’端带有16个与pGEX-6p-1线性化载体下游引物反向互补碱基;扩增GyV3病毒VP3基因下游引物包括VP3基因终止密码TAA及其前14个碱基,且在5’端带有16个与pGEX-6p-1线性化载体上游引物反向互补碱基。
PCR扩增GyV3病毒VP3基因引物:
上游引物:5‘GTTCCAGGGGCCCATGGAACCGGGACTTGG3’;
下游引物:5‘GTTTTCACCGTCATTACAGTCTTAGCCTTT3’。
以上两对引物均由Life Technologies上海赛默飞世尔科技公司合成并鉴定。
2、pGEX-6p-1线性化载体、GyV3病毒VP3基因片段的PCR扩增:
如图1中的步骤1所示分别以pGEX-6p-1质粒以及合成的GyV3 VP3基因为模版,采用上述合成的对应引物进行PCR扩增。
PCR扩增反应体系为:40μl水,5μl 10倍缓冲液,1μl 10 mM dNTP,1μl 10 μmol 上游引物,1μl 10 μmol 下游引物, 1μl 10ng/μl的pGEX-6p-1质粒或pcGyV3-VP3质粒,1μl商品化的Phanta Super-Fidelity DNA 聚合酶。PCR扩增反应循环参数为:94℃变性5分钟,随后进行30个循环(94℃变性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸3分钟),最后72℃延伸10分钟。
PCR结束后,PCR产物在1%的琼脂糖凝胶中进行电泳。如图2所示,其中泳道M表示对照品DNA Marker的电泳分析图,其中泳道1、2分别代表线性化载体pGEX-6p-1以及GyV3病毒VP3片段PCR扩增产物的电泳分析图。
从图2可见,采用以上方法分别PCR扩增出了pGEX-6p-1线性化载体和GyV3病毒VP3基因片段。
3、GyV3病毒VP3片段快速克隆进pGEX-6p-1载体:
如图1中的步骤2所示,将以上纯化的表达线性化载体pGEX-6p-1以及GyV3病毒VP3片段PCR产物在商品化重组酶ExnaseTM II的作用下进行重组克隆。
具体操作如下:将纯化的GyV3病毒VP3片段产物50~100ng、纯化的pGEX-6p-1表达线性化载体50ng、2μL商品化的ExnaseTM II 酶和4μL 5倍的缓冲液水混合,再补加水至20μL。将以上反应物于37℃作用30分钟后,置冰上5分钟。随后将20μL反应物转化到常规感受态细菌,涂LB板。经16小时后挑取细菌克隆进行质粒制备,阳性克隆鉴定即为阳性克隆体,命名为pGEX-VP3。
4、GyV3病毒VP3蛋白诱导表达及其纯化:
将阳性克隆体pGEX-VP3转化BL21细菌,经IPTG诱导(0.1mmol/mL)后收集细菌,进行超声(40赫兹)破碎。
将超声破碎样品离心后分别取得上清和沉淀。分别取30μL裂解上清和沉淀,加入5μL 6×SDS凝胶上样缓冲液混匀,煮沸5min;用于SDS-PAGE(5%的浓缩胶,10%的分离胶)电泳分析重组蛋白的表达及其表达形式。同时设立转化空载体的细菌裂解上清和沉淀对照。图3显示了SDS-PAGE分析VP3蛋白的表达结果,其中:泳道 1为转化有pGEX-VP3重组克隆的细菌裂解沉淀,泳道2为转化有pGEX-VP3重组克隆的细菌裂解上清。与转化有空载体的细菌裂解上清(泳道5)和沉淀(泳道4)比较,泳道2中在40kD处可见一特异性差异表达蛋白条带。这表明,GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白可在超声破碎样品上清中以可溶性形式存在。 在确定VP3的可溶性表达基础上,将超声破碎样品上清通过GST纯化柱进行了GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的纯化。图3 泳道3为纯化后的GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白。
5、GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的免疫反应性:
为进一步测定纯化后蛋白的抗原性,评价其能否作为免疫原及诊断用抗原, 将纯化的GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白腹腔免疫6周龄BALB/C小鼠,免疫三次,每次间隔14天,剂量均为50μg /只/次。首免时与等体积的完全弗氏佐剂混合至油包水状,再次免疫时与等体积的不完全弗氏佐剂混合,之后免疫不加佐剂。三免后采集小鼠血清,用在293T细胞中表达的GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白作为抗原进行Western blot分析血清中抗VP3特异性抗体。如图4所示:其中泳道1为转染EGFP-VP3表达质粒的293T细胞裂解物;泳道2为转染对照EGFP表达质粒的293T细胞裂解物。由图4可见:这一结果表明本发明表达的GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白具有很好的反应性及免疫原性,在GyV3血清学诊断中将具有良好的应用前景。
<110>扬州大学
<120>一种GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的制备方法
<160>4
<210>1
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根据pGEX-6p-1基因序列设计
<400>1
taatgacggt gaaaacctct gacacatgc
<210>2
<211>29
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根据pGEX-6p-1基因序列设计
<400>2
catgggcccc tggaacagaa cttccagat
<210>3
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根据GyV3病毒VP3基因片段设计
<400>3
gttccagggg cccatggaac cgggacttgg
<210>4
<211>30
<212>DNA
<213>人工序列
<220>
<223>根据GyV3病毒VP3基因片段设计
<400>4
gttttcaccg tcattacagt cttagccttt
Claims (1)
1.一种GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白的制备方法,其特征在于包括以下步骤:
1)以pGEX-6p-1质粒为模板,采用下述引物PCR扩增出pGEX-6p-1线性化表达载体;
上游引物:5‘TAATGACGGTGAAAACCTCTGACACATGC3’;
下游引物:5‘CATGGGCCCCTGGAACAGAACTTCCAGAT3’;
2)以人工合成的GyV3-VP3 基因为模板,采用下述引物PCR扩增出VP3基因片段;
上游引物:5‘GTTCCAGGGGCCCATGGAACCGGGACTTGG3’;
下游引物:5‘GTTTTCACCGTCATTACAGTCTTAGCCTTT3’;
3)在重组酶ExnaseTM II的作用下,将所述pGEX-6p-1线性化表达载体和VP3基因片段进行重组克隆,取得阳性克隆体,并转化BL21细菌,经IPTG诱导下即获得GyV3新型环形病毒VP3融合蛋白。
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