CN105754997B - 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用 - Google Patents

狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用 Download PDF

Info

Publication number
CN105754997B
CN105754997B CN201610191332.1A CN201610191332A CN105754997B CN 105754997 B CN105754997 B CN 105754997B CN 201610191332 A CN201610191332 A CN 201610191332A CN 105754997 B CN105754997 B CN 105754997B
Authority
CN
China
Prior art keywords
bbsi
noti
guide rna
cmv
rabies viruses
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201610191332.1A
Other languages
English (en)
Other versions
CN105754997A (zh
Inventor
曹罡
张冉
刘传刚
傅振芳
戴金霞
曹云兹
曾思华
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Huazhong Agricultural University
Original Assignee
Huazhong Agricultural University
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Huazhong Agricultural University filed Critical Huazhong Agricultural University
Priority to CN201610191332.1A priority Critical patent/CN105754997B/zh
Publication of CN105754997A publication Critical patent/CN105754997A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN105754997B publication Critical patent/CN105754997B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011Details
    • C12N2750/14011Parvoviridae
    • C12N2750/14111Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

本发明公开了一种狂犬病毒DRV‑AH08株的先导RNA及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用。首先我们确定了先导RNA的长度,选用出现频率最高的64nt长度的先导RNA进行后续试验,我们发现在细胞内和鼠脑内过表达先导RNA,均能抑制狂犬病毒的复制。同时,在已经感染了狂犬病毒的细胞内过表达先导RNA,能明显抑制狂犬病毒的复制;而在已经感染了狂犬病毒的小鼠上过表达先导RNA,能明显推迟小鼠发病时间,并明显提高小鼠存活率。综上所述,先导RNA不仅在狂犬病的预防方面有潜在的应用价值,还在狂犬病暴露后治疗中有巨大的药用价值。

Description

狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA及其在制备预防与治疗狂犬 病毒的药品中的应用
技术领域
本发明涉及公共卫生和预防兽医学领域,具体地指一种狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用。
背景技术
狂犬病是一种人兽共患传染病,所有温血动物都能感染,至今仍然在全世界广泛流行。2002~2007年,全国狂犬病死亡11198例,占同期各种传染病病死数的30%,高居所有法定传染病病死数之首。因此狂犬病与艾滋病、病毒性肝炎、结核病一样,已成为危害我国人口健康与公共卫生安全的重大传染病。狂犬病一旦发病,其致死率几乎为100%,因而控制狂犬病的主要手段是预防。免疫预防分为暴露前和暴露后免疫。暴露前免疫是给经常与狂犬病病毒接触的人接种疫苗。暴露后免疫是给被患狂犬病动物或者被疑似狂犬病动物咬伤,舔伤,抓伤的人接种疫苗。对伤势过重者还要用抗狂犬病血清进行治疗。但是暴露后免疫和治疗一定要尽早、及时,一旦出现临床症状,就预示着暴露后免疫和治疗的失败和患者的死亡。
狂犬病毒因其高致死率,对公共卫生安全危害极大。狂犬病毒感染后病毒通过神经进入血脑屏障,神经细胞坏死和凋亡不明显,病理变化不典型,甚至有的病例其脑组织标本无炎症反应,狂犬病的发病机理始终不清楚,为发病后治疗带来极大困难,目前狂犬病暴露后的治疗只有使用含有中和抗体的抗血清这一种方法,而抗血清价格昂贵,而且可能产生过敏性休克和血清病等不良反应,这使得抗血清的使用有一定的局限性。
发明内容
本发明目的是针对现有技术存在的缺陷,提供了一种狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用。
为实现上述目的,本发明提供的一种狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA,所述先导RNA的核苷酸序列
为下述长短不一的RNA核苷酸序列中任意一种,分别为
先导RNA1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,
先导RNA2的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,
先导RNA3的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,
先导RNA4的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示,
先导RNA5的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,
先导RNA6的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示,
先导RNA7的核苷酸序列如SEQ ID No.7所示。
先导RNA(Leader RNA)是狂犬病毒感染宿主后产生的一条单股正链的非编码小RNA,长度约64nt,先导RNA既不加帽也无poly A尾巴,是狂犬病毒感染后最早的转录产物。本发明利用先导RNA这一特性,在狂犬病毒感染后,用先导RNA来进行治疗,发挥类似于RNAi的作用来抑制狂犬病毒的复制,也尚未有相关报道。
本发明还提供了一种重组真核表达载体AAV-U6,所述重组真核表达载体AAV-U6是在真核表达载体AAV的NotI酶切位点之间插入U6-BbsI-CMV-mcherry片段得到的,其中,U6-BbsI-CMV-mcherry片段的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示。
上述重组真核表达载体AAV-U6的构建方法,包括以下步骤:
1)PCR扩增U6启动子:以PX335质粒(购买于Addgene,编号:#61515)为模板设计引物对,同时下游引物的末端带有与CAG Enhancer序列互补的一段同源臂),其中,引物对为:
U6-F-NotI:5’-AAATATGCGGCCGCGAGGGCCTATTTCCCATGATT-3’,
NotI
U6-R-BbsI:
5’-CATTTACCGTAAGTTATGTAAAAAAGGTCTTCTCGAAGACCC-3’;
BbsI 反向BbsI
进行PCR扩增,纯化得到NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段,其核苷酸序列如SEQ IDNo.9所示;
2)PCR扩增mCherry表达盒:以pmCherry(本实验室保存)为模板设计引物对,mCherry核苷酸序列如SEQ ID No.10所示,其中,上游引物带有与NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT序列末端相同的一段同源臂,下游引物带有NotI酶切位点;使用的引物序列如下:
CMV-CAG-F-BbsI:
5’-GGGTCTTCGAGAAGACCTTTTTTACATAACTTACGGTAAATG,
反向BbsI BbsI
CMV-terminator-R-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCTAAGATACATTGATGAGTTTGG-3’;
NotI
PCR扩增纯化得到CAG-CMV-mCherry-Terminator-NotI片段,其核苷酸序列如SEQID No.11所示;
3)融合PCR扩增U6-BbsI-CMV-mCherry;
以NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段和
CAG-CMV-mCherry-Terminator-NotI片段作为模板进行融合PCR;其中,引物对为:
U6-F-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCGAGGGCCTATTTCCCATGATT-3’,
NotI
CMV-terminator-R-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCTAAGATACATTGATGAGTTTGG-3’;
NotI
PCR扩增纯化得到U6-BbsI-CMV-mCherry片段,其核苷酸序列如SEQ ID No.8所示;
4)酶切:NotI酶切载体pAAV和片段U6-BbsI-CMV-mCherry,酶切后纯化线性化的载体和片段;
5)连接:用T4连接酶连接线性化的载体和片段,并转化大肠杆菌感受态Stbl3,挑取克隆并提质粒测序,鉴定正确即得到重组真核表达载体AAV-U6。
在上述技术方案中,所述步骤1)中,PCR反应体系如下:
PCR的条件如下:
所述步骤2)中,PCR反应体系如下:
CMV-CAG-F-BbsI:
5’-GGGTCTTCGAGAAGACCTTTTTTACATAACTTACGGTAAATG-3’,
反向BbsI BbsI
CMV-terminator-R-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCTAAGATACATTGATGAGTTTGG-3’;
NotI
PCR的条件如下:
所述步骤3)中,PCR反应体系如下:
PCR的条件如下:
本发明还提供了一种含有先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6,所述先导RNA对应的双链DNA序列插入到重组真核表达载体AAV-U6的BbsI酶切位点之间。
本发明还提供了一种含有上述重组真核表达载体AAV-U6的大肠杆菌Stbl3表达菌株。
本发明提供了一种上述狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA在制备治疗和预防狂犬病的药品中的应用。
本发明还提供了一种含有先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6在制备治疗和预防狂犬病的药品中的应用。
本发明还提供了一种含有重组真核表达载体AAV-U6的大肠杆菌Stbl3表达菌株在制备治疗和预防狂犬病的药品中的应用。
本发明的有益效果在于:
本发明采用类腺病毒载体在小鼠脑内过表达先导RNA,然后小鼠经脑感染狂犬病毒DRV-AH08株,后经脑切片染色观察发现过表达先导RNA能抑制狂犬病毒复制,并且用体外转录的方式获得纯的先导RNA,在SK-N-SH细胞系上转染先导RNA进入细胞,再感染狂犬病毒,经狂犬病毒染色观察发现病毒的复制被抑制。同时本发明也在SK-N-SH细胞系上感染狂犬病毒后再转染先导RNA,发现先导RNA仍然能抑制狂犬病毒的复制,在活体动物试验中,感染了狂犬病毒的小鼠,经注射能过表达先导RNA的类腺病毒,可以显著的增加小鼠的存活率。利用先导RNA对狂犬病进行暴露后治疗,在狂犬病的预防与治疗方面尚属先例,相对于抗血清,先导RNA价格较低,产生过敏性反应的可能性小,极具推广价值,这对于研究狂犬病暴露后治疗手段具有重要的意义和广阔的应用前景。
附图说明
图1为Leader RNA转录起止位置的确定示意图;
其中,图1A是转录终止位置确定,Leader RNA转录终止的位置并不单一,大部分终止于离基因组3’末端64nt的位置;
图1B是转录起始位置确定,Leader RNA转录起始位置为基因组3’末端第一个碱基;
图2为先导RNA在SK-N-SH细胞内过表达能抑制狂犬病毒DRV-AH08的复制图;
图中,第一排为转染了对照RNA再感染狂犬病毒的细胞,在荧光条件下(左图)和明场条件下(右图)的成像。
第二排为转染了先导RNA再感染狂犬病毒的细胞,在荧光条件下(左图)和明场条件下(右图)的成像。绿色表示狂犬病毒。图片中右下角白色矩形表示200μm比例尺。
图3为先导RNA过表达载体pAAV-U6的结构示意图以及插入片段的位点(Insertionsite)和序列(Insert)示意图;
图4为含有先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6的图谱;
图5为先导RNA在鼠脑内过表达能抑制狂犬病毒DRV-AH08的复制图;
图中,图5A~C为为低倍镜下观察小鼠脑切片,图5A中左脑海马区的红色荧光为先导RNA过表达区域,右脑海马区的红色荧光为对照RNA过表达区域;
图5B中绿色荧光表示狂犬病毒;图5C为A,B图叠加的效果图。
图5D~I为鼠脑局部在高倍镜下观察的图片;
图5D表示高倍镜下观察鼠脑左边海马区,红色为先导RNA过表达的区域;
图5E表示与D图相同区域内狂犬病毒存在情况;
图5F为D图与E图叠加的效果图,在先导RNA存在的区域(红色)狂犬病毒(绿色)的含量下降;
图5G表示高倍镜下观察鼠脑右边海马区,红色为对照RNA过表达的区域;
图5H表示与G图相同区域内狂犬病毒存在情况;
图5I为H图与G图叠加的效果图,在对照RNA存在的区域(红色)狂犬病毒(绿色)的含量并没有减少,图中可见对照RNA存在的区域(红色)狂犬病毒(绿色)共同存在的细胞(黄色)。
图6为SK-N-SH感染狂犬病毒DRV-AH08后过表达先导RNA能够抑制病毒复制;
图6中,第一排为感染狂犬病毒后再转染对照RNA的细胞,在荧光条件下(左图)和明场条件下(右图)的成像;
第二排为感染狂犬病毒后再转染先导RNA的细胞,在荧光条件下(左图)和明场条件下(右图)的成像。绿色表示狂犬病毒,图片右下角白色矩形表示200μm比例尺。
图7为小鼠感染狂犬病毒DRV-AH08后过表达先导RNA能够降低小鼠死亡率的显示图。
具体实施方式
为了更好地解释本发明,以下结合具体实施例进一步阐明本发明的主要内容,但本发明的内容不仅仅局限于以下实施例。
实施例1Leader RNA1(先导RNA1)转录起始和终止位置的确定
1、Leader RNA1转录终止位置的确定
1)用DRV-AH08经脑注射感染成年小鼠,小鼠发病后心脏灌注后取脑,提取脑组织RNA;
2)用E.coli Poly(A)Polymerase(NEB)给RNA3’端加A,反应体系如下:
反应程序:在温度为37℃条件下反应30~60min;
3)用adapter1-d(T)将加A后的RNA反转成cDNA,
adapter1-d(T)序列为:
5’-ACTGTCAACTGGTGTCGTGGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTVN-3’;
反转反应体系如下:
反应程序如下:
室温 10min
42℃ 60min
冰上 2min
4)反转后用一对引物进行扩增,
上游引物来源于Adapter1,序列为:
5’-ACTGTCAACTGGTGTCGTGGAGT-3’,
下游引物来源于DRV-AH08基因组,序列为:
5’-ACGCTTAACAACAAAATCAT-3’;
扩增后的片段与pMD-18T连接,转化DH5α,挑菌30个,送测序,比对测序结果,与d(T)紧挨的序列即为leader RNA转录终止的位置。
2、Leader RNA1转录起始位置的确定
1)用DRV-AH08经脑注射感染成年小鼠,小鼠发病后心脏灌注后取脑,提取脑组织RNA;
2)利用已知的转录终止位置,设计反转录引物,序列为:
5’-GGTGTTACATTTTTGCTTTACAAA-3’,将脑组织RNA反转成cDNA;
反转体系如下:
反应程序:
室温 10min
42℃ 60min
冰上 2min
3)根据设计的adapter2序列合成单链核苷酸,序列分别为
adapter2-1:
5’-GATCCGAAGCAATACGACTAGGCTAGGNNNN-3’,
adapter2-2:5’-CCTAGCCTAGTCGTATTGCTTCGGATC-3’;
将合成的单链寡核苷酸成对变性、退火,退火之后形成具有粘性末端的DNA双链adapter2,粘性末端为NNNN,变性、退火体系如下:
反应程序:
4)反转得到的cDNA与退火成双链的adapter2连接,连接体系如下
Adapter2退火产物 1μl
cDNA 5μl
T4连接酶(Takara) 0.5μl
10*T4连接酶缓冲液 1μl
总计 7.5μl
16℃孵育5-6h。
5)连接后用一对引物进行扩增,
上游引物来源于Adapter2,序列为:
5’-GATCCGAAGCAATACGACTAGGCTA-3’,
下游引物来源于Leader RNA转录终止区域,序列为:
5’-GGTGTTACATTTTTGCTTTAC-3’;
扩增后的片段与pMD-18T连接,转化DH5α,挑菌30个,送测序,比对测序结果,与adapter2紧挨的序列即为leader RNA转录起始的位置,先导RNA1的核苷酸序列如SEQ IDNo.1所示。
同理,通过上述方法得到其他先导RNA2~7核苷酸序列,如SEQ ID No.1~7所示
实施例2先导RNA的过表达在体外和体内均能抑制狂犬病毒的复制
1、先导RNA1的过表达在体外能抑制狂犬病毒的复制
1)根据上述的先导RNA1核苷酸序列,利用体外转录的方法体外合成先导RNA,并纯化,分装后保存于-80℃。对照RNA购买于上海吉玛制药技术有限公司;
2)SK-N-SH细胞用MEM培养基培养(含胎牛血清15%)。细胞长满后,胰酶消化、吹散,接种于24孔板,待细胞汇合度到70-80%后进行转染。
3)按脂质体转染法,将先导RNA(40pmol)和对照RNA(40pmol)分别与脂质体混合,250μl转染液37℃孵育。每种RNA做6个复孔。
4)转染后1h,按每孔0.01MOI感染DRV-AH08。37℃孵育6h后换维持液。
5)转染后24小时,用4%多聚甲醛固定细胞,用FITC标记的狂犬病毒N蛋白单抗染色镜检。
如图2所示:将先导RNA和对照RNA分别转染SK-N-SH细胞后,感染狂犬病毒DRV-AH08,24小时后固定细胞染色镜检。与转染了对照RNA的细胞相比,转染了先导RNA1的细胞狂犬病毒的复制明显减少。
2、先导RNA1的过表达在体内能抑制狂犬病毒的复制
1)根据上述的先导RNA1核苷酸序列,构建真核表达载体AAV-U6,AAV-U6载体示意图如图(3)所示:
2)PCR扩增U6启动子,上游引物带有NotI酶切位点,下游引物带有两个反向的BbsI酶切位点,在BbsI酶切位点之后是连续的TTTTT(引物上为AAAAA),为U6启动子的终止子。同时下游引物的末端带有与CAG Enhancer序列互补的一段同源臂,扩增后得到NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段(其核苷酸序列如SEQ ID No.9所示)并纯化。使用的引物序列如下:
U6-F-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCGAGGGCCTATTTCCCATGATT-3’;
U6-R-BbsI:
5’-CATTTACCGTAAGTTATGTAAAAAAGGTCTTCTCGAAGACCC-3’;
PCR的条件如下:
3)PCR扩增mCherry表达盒。上游引物带有与NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT序列末端相同的一段同源臂,下游引物带有NotI酶切位点。扩增后得到CAG-CMV-mCherry-Terminator-NotI片段其核苷酸序列如SEQ ID No.11所示并纯化。使用的引物序列如下:
CMV-CAG-F-BbsI:
5’-GGGTCTTCGAGAAGACCTTTTTTACATAACTTACGGTAAATG-3’,
CMV-terminator-R-NotI:
5’-AAATATGCGGCCGCTAAGATACATTGATGAGTTTGG-3’;
PCR的条件如下:
4)融合PCR扩增U6-BbsI-CMV-mCherry。使用U6-F-NotI和CMV-terminator-R-NotI分别作为上下游引物,
以NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段和CAG-CMV-mCherry-Terminator-NotI片段作为模板,做融合PCR,获得U6-BbsI-CMV-mCherry片段并纯化。
PCR的条件如下:
5)分别用NotI酶切载体pAAV和片段U6-BbsI-CMV-mcherry,酶切后纯化线性化的载体和片段。
6)用T4连接酶连接线性化的载体和片段,并转化大肠杆菌感受态Stbl3。
7)挑取克隆并提质粒测序,鉴定正确;
8)使用之前构建的真核表达载体AAV-U6,将先导RNA1插入AAV-U6载体中并包装成AAV病毒,在活体内过表达先导RNA1。同时用过表达其他非编码小RNA的AAV病毒作为对照。
9)过表达载体构建方式如下:
根据先导RNA和对照RNA序列在其正向寡核苷酸Forward oligo 5’端加上CACCG,在其逆向寡核苷酸Reverse oligo 5’端加上AAAA,分别合成。如下:
Forward oligo:5’-CACCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-3’,
Reverse oligo:3’-CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAA-5’;
将合成的两条互补的寡核苷酸序列成对变性、退火,退火之后形成具有粘性末端的DNA双链,可连入经Bbs1酶切线性化的AAV-U6真核表达载体中。变性、退火体系如下:
反应程序:
10)Bbs1酶切线性化AAV-U6真核表达载体;酶切体系和反应条件如下:
37℃孵育3-4h,酶切完成后,琼脂糖凝脂电泳后,BioFluxR胶回收试剂盒回收,溶于30-40μl ddH2O中。
11)变性退火得到的先导RNA1、对照RNA双链寡聚核苷酸,分别与经Bbs1酶切线性化的质粒载体连接;反应体系如下:
sgRNA退火产物 1μl
Bbs1线性化载体 50ng
T4连接酶(Takara) 0.5μl
10xT4连接酶缓冲液 1μl
16℃孵育1-3h;
12)将上述连接产物转化大肠杆菌感受态细胞(Stbl3),并涂布氨苄抗性平板(50μg/ml),并挑取单克隆菌落。
13)DNA测序鉴定阳性克隆,得到AAV-U6-先导RNA1和AAV-U6-对照RNA的表达载体。
2、小鼠实验
1)使用三维立体脑定位注射仪将rAAV-U6-先导RNA1注射于小鼠左脑海马区内,再将rAAV-U6-对照RNA注射于同一只小鼠右脑海马区内注射后两周,分别经左右脑注射DRV-AH08病毒。
2)待小鼠发病濒死时,麻醉小鼠,做心脏灌注,取鼠脑,并用4%多聚甲醛固定过夜。
3)固定后的鼠脑用震荡切片机切片,厚度为30μm。分别用本实验室制作的狂犬病毒P蛋白单抗和购买的羊抗鼠二抗(绿色)孵育,孵育后于荧光显微镜下观察拍照如图5所示。在注射了rAAV-U6-先导RNA的鼠脑区域(左边海马区,红色),狂犬病毒的量(绿色)明显少于注射了rAAV-U6-对照RNA的鼠脑区域(右边海马区,红色),说明过表达先导RNA1能在活体水平显著抑制狂犬病毒的复制。
实施例3先导RNA1对狂犬病毒的感染有潜在的治疗作用
1、细胞水平的治疗
1)根据上述的先导RNA1核苷酸序列,利用体外转录的方法体外合成先导RNA1,并纯化,分装后保存于-80℃。对照RNA购买于上海吉玛制药技术有限公司;
2)SK-N-SH细胞用MEM培养基培养(含胎牛血清15%)。细胞长满后,胰酶消化、吹散,接种于24孔板,待细胞汇合度到70-80%后感染狂犬病毒;
3)按每孔0.01MOI感染DRV-AH08,37℃孵育1h后转染RNA;
4)按脂质体转染法,将先导RNA(40pmol)和对照RNA(40pmol)分别与脂质体混合,250μl转染液37℃孵育6h后换维持液,每种RNA做6个复孔;
5)转染后24小时,用4%多聚甲醛固定细胞,用FITC标记的狂犬病毒N蛋白单抗染色镜检,如图6所示。细胞感染狂犬病毒后,转染了先导RNA1的细胞,狂犬病毒荧光斑的数量明显少于转让了对照RNA的细胞,说明狂犬病毒感染后,在细胞水平上,过表达先导RNA1仍然可以抑制狂犬病毒的进一步复制。
2、活体水平的治疗
1)根据上述的先导RNA1核苷酸序列,使用上述真核表达载体AAV-U6,在活体内过表达先导RNA1。同时用过表达其他非编码小RNA的AAV病毒作为对照。AAV-U6能表达红色荧光蛋白作为指示;
2)小鼠经后肢肌肉感染狂犬病毒;1小时后将过表达先导RNA1的病毒AAV-U6-先导RNA1和过表达对照RNA的病毒AAV-U6-对照RNA注射进小鼠后肢肌肉,注射了狂犬病毒的位置附近。
观察实验组和对照组的小鼠存活率,如图7所示:对照组小鼠全部死亡,而实验组有30%的小鼠存活,并且对照组的小鼠平均发病死亡时间比实验组短。说明在活体水平,感染狂犬病毒后,过表达先导RNA1可以一直病毒在活体的复制,推迟发病时间,降低死亡率。
通过上述实施例2~3的方法步骤,也可以验证先导RNA2~7用于制备治疗和预防狂犬病的药品。
其它未详细说明的部分均为现有技术。尽管上述实施例对本发明做出了详尽的描述,但它仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部实施例,人们还可以根据本实施例在不经创造性前提下获得其他实施例,这些实施例都属于本发明保护范围。

Claims (4)

1.含有狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6,其特征在于:所述先导RNA为先导RNA1,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述先导RNA对应的双链DNA序列插入到重组真核表达载体AAV-U6的BbsI酶切位点之间;其中,所述重组真核表达载体AAV-U6是在真核表达载体AAV的NotI酶切位点之间插入U6-BbsI-CMV-mcherry片段得到的,U6-BbsI-CMV-mcherry片段的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示。
2.根据权利要求1所述含有狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6,其特征在于:所述重组真核表达载体AAV-U6的构建方法,包括以下步骤:
1)PCR扩增U6启动子:以PX335质粒为模板设计引物对,同时下游引物的末端带有与CAGEnhancer序列互补的一段同源臂,其中,引物对为:
U6-F-NotI:
U6-R-BbsI:
进行PCR扩增,纯化得到NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段,其核苷酸序列如SEQ ID No.9所示;
2)PCR扩增mcherry表达盒:以pmCherry为模板设计引物对,mCherry核苷酸序列如SEQID No.10所示,其中,上游引物带有与NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT序列末端相同的一段同源臂,下游引物带有NotI酶切位点;使用的引物序列如下:
CMV-CAG-F-BbsI:
CMV-terminator-R-NotI:
PCR扩增纯化得到CAG-CMV-mcherry-Terminator-NotI片段,其核苷酸序列如SEQ IDNo.11所示;
3)融合PCR扩增U6-BbsI-CMV-mcherry;
以NotI-U6-BbsI-BbsI-TTTTT片段和CAG-CMV-mcherry-Terminator-NotI片段作为模板进行融合PCR;其中,引物对为:
U6-F-NotI:
CMV-terminator-R-NotI:
PCR扩增纯化得到U6-BbsI-CMV-mcherry片段,其核苷酸序列如SEQ ID No.8所示;
4)酶切:NotI酶切载体pAAV和片段U6-BbsI-CMV-mcherry,酶切后纯化线性化的载体和片段;
5)连接:用T4连接酶连接线性化的载体和片段,并转化大肠杆菌感受态Stbl3,挑取克隆并提质粒测序,鉴定正确即得到重组真核表达载体AAV-U6。
3.根据权利要求2所述含有狂犬病毒DRV-AH08株的先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6,其特征在于:所述步骤1)中,PCR反应体系如下:
PCR的条件如下:
所述步骤2)中,PCR反应体系如下:
CMV-CAG-F-BbsI:
CMV-terminator-R-NotI:
PCR的条件如下:
所述步骤3)中,PCR反应体系如下:
PCR的条件如下:
4.一种权利要求1所述含有先导RNA对应的双链DNA序列的重组真核表达载体AAV-U6在制备治疗和预防狂犬病的药品中的应用。
CN201610191332.1A 2016-03-30 2016-03-30 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用 Active CN105754997B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610191332.1A CN105754997B (zh) 2016-03-30 2016-03-30 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610191332.1A CN105754997B (zh) 2016-03-30 2016-03-30 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN105754997A CN105754997A (zh) 2016-07-13
CN105754997B true CN105754997B (zh) 2019-02-26

Family

ID=56345450

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610191332.1A Active CN105754997B (zh) 2016-03-30 2016-03-30 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN105754997B (zh)

Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000015821A1 (en) * 1998-09-11 2000-03-23 The Regents Of The University Of California Recombinant adenovirus for tissue specific expression in heart
CN1475573A (zh) * 2002-08-16 2004-02-18 本元正阳基因技术股份有限公司 利用rna干扰现象介导功能基因下调的腺相关病毒载体
CN1626663A (zh) * 2003-12-10 2005-06-15 清华大学 一种哺乳动物细胞siRNA表达载体
CN101643749A (zh) * 2009-06-11 2010-02-10 吴沛宏 腺相关病毒载体及其制备方法和应用
CN102443595A (zh) * 2011-11-11 2012-05-09 中国科学院武汉病毒研究所 一种微rna功能的双荧光报告系统的制备方法及应用
CN103589753A (zh) * 2013-11-08 2014-02-19 中国人民解放军第四军医大学 特异性抑制人SIRT1 基因表达的shRNA慢病毒表达载体及其构建方法与应用
CN104704112A (zh) * 2012-08-03 2015-06-10 赛诺菲巴斯德 传染性流感病毒的生产

Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000015821A1 (en) * 1998-09-11 2000-03-23 The Regents Of The University Of California Recombinant adenovirus for tissue specific expression in heart
CN1475573A (zh) * 2002-08-16 2004-02-18 本元正阳基因技术股份有限公司 利用rna干扰现象介导功能基因下调的腺相关病毒载体
CN1626663A (zh) * 2003-12-10 2005-06-15 清华大学 一种哺乳动物细胞siRNA表达载体
CN101643749A (zh) * 2009-06-11 2010-02-10 吴沛宏 腺相关病毒载体及其制备方法和应用
CN102443595A (zh) * 2011-11-11 2012-05-09 中国科学院武汉病毒研究所 一种微rna功能的双荧光报告系统的制备方法及应用
CN104704112A (zh) * 2012-08-03 2015-06-10 赛诺菲巴斯德 传染性流感病毒的生产
CN103589753A (zh) * 2013-11-08 2014-02-19 中国人民解放军第四军医大学 特异性抑制人SIRT1 基因表达的shRNA慢病毒表达载体及其构建方法与应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Phosphorylation of rabies virus nucleoprotein regulates viral RNA transcription and replication by modulating leader RNA encapsidation;Yang, Y et al.;《JOURNAL OF VIROLOGY》;19990228;第73卷(第2期);第1661–1664页
The Specificity of Rabies Virus RNA Encapsidation by Nucleoprotein;Yang, J et al.;《VIROLOGY》;19980301;第242卷(第1期);第110页左栏第2段、右栏第1段,第112页右栏第1段,图5、图6
狂犬病毒街毒株DRV-AH08基因组序列测定分析及G蛋白免疫原性研究;于福来;《中国博士学位论文全文数据库 农业科技辑》;20141015(第10期);D050-29,4.2.2.DRV-AH08全基因组组成及分析,图4-7,附录一

Also Published As

Publication number Publication date
CN105754997A (zh) 2016-07-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107532173A (zh) 靶向中枢神经系统的aav载体
CN105960413A (zh) 人工dna-结合蛋白及其用途
JPH02502876A (ja) ワクチンと生物学的殺虫剤における組換えバクロウイルス閉塞体
CN104797593A (zh) 靶向少突胶质细胞的aav载体
CN106946995A (zh) Ⅰ群血清4型禽腺病毒基因工程亚单位疫苗、其制备方法及应用
CN110592172B (zh) 利用CRISPR/Cas9敲除文库技术筛选JEV抗性基因的方法与靶点
CN114134211B (zh) Usp30基因作为靶点在抑制塞内卡谷病毒复制中的应用
CN109929014A (zh) 一种抑制鸡先天性免疫反应鸡马立克氏病病毒蛋白及其应用
CN105754997B (zh) 狂犬病毒drv-ah08株的先导rna及其在制备预防与治疗狂犬病毒的药品中的应用
Feng et al. Generation of Anti‐Mastitis Gene‐Edited Dairy Goats with Enhancing Lysozyme Expression by Inflammatory Regulatory Sequence using ISDra2‐TnpB System
CN108704128A (zh) 一种犬瘟热细小病毒二联亚单位疫苗
CN106916832B (zh) O型口蹄疫病毒重组核酸、重组疫苗株及其制备方法和应用
CN105624162B (zh) 针对哺乳动物R-Spondin2基因靶点的小干扰RNA、短发卡RNA及载体和应用
CN109867713B (zh) 一种犬瘟热基因工程亚单位疫苗
CN101768575B (zh) 双表达g基因的重组狂犬病病毒的构建及其生物学特性分析
CN101525388B (zh) 特异性双链rna结合蛋白嵌合体及其在病毒感染性疾病中的应用
CN107129527A (zh) 一种马链球菌兽疫亚种保护性抗原hp0623及其制备方法
US20220009968A1 (en) Crispr-cas-based composition for gene correction
CN101386860A (zh) 一种构建脑心肌炎病毒感染性克隆的方法
Anoyatbekova et al. Identification of the emergent pestivirus infections of small ruminants in Tajikistan
CN110283820A (zh) 抑制细粒棘球蚴原头节dna氧化损伤修复基因表达的干扰rna及其应用
WO2019063789A1 (en) VECTOR OF RECOMBINANT DEFECTIVE WING VIRUS (DWV)
CN104211802B (zh) 人凝血因子轻链蛋白及其应用
WO2022166771A1 (zh) 3'utr的构建方法和应用
CN105968211A (zh) 一种重组抗病毒蛋白及其制备方法和应用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant