CN105039369A - 穿心莲甲羟戊酸 5-焦磷酸脱羧酶基因 - Google Patents
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Abstract
本发明属于生物技术领域,涉及穿心莲甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶基因,具有SEQ?ID?NO:1序列。本发明所提供的MVD基因可以用于制备相应的DNA探针;可以用于穿心莲内酯合成途径的改造,提高活性成分合成量;可以转入生物反应器,生产相应的代谢成分。以上发明,对于穿心莲内酯相关产品的开发和利用,促进相关医药产业的可持续发展,具有重要的应用价值。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及植物基因。
技术背景
穿心莲内酯是从爵床科植物穿心莲(Andrographispaniculata(Burm.f.)Nees)中提取的次生代谢产物,被誉为天然、安全的中药抗生素。临床上已经开发出多种针剂,被卫生部及国家中医药管理局列为急诊科必备药品之一。穿心莲的起源中心是印度和斯里兰卡,目前种源严禁出口。我国引种穿心莲的历史较短,遗传基础狭窄,具有较高的遗传脆弱性。在穿心莲内酯的生物合成途径中,甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶(mevalonatedisphosphatedecarboxylase,MVD)可以提供穿心莲内酯合成的前体物质,对产量高低起决定作用。本发明提供了穿心莲MVD基因,本发明所提供的MVD基因可以用于制备相应的DNA探针;可以用于穿心莲内酯合成途径的改造,提高活性成分合成量;可以转入生物反应器,生产相应的代谢成分。以上发明,对于穿心莲内酯相关产品的开发和利用,促进相关医药产业的可持续发展,具有重要的应用价值。
说明书内容
本发明目的在于提供穿心莲甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶基因及其表达的蛋白。
本发明穿心莲甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶基因,其具有如SEQIDNO:1所述序列。
所述基因对应的蛋白质,其序列如SEQIDNO:2。
本发明的有益效果是:提供了穿心莲甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶基因,为后续设计引物、构建载体和遗传转化研究提供了便利,为今后进一步通过途径调控提高植物中穿心莲内酯合成量,或者利用合成生物学方法生产穿心莲内酯,促进相关中医药产业的发展奠定了坚实的基础。
附图说明
图1提取获得的穿心莲总RNA
具体实施方式
实施例1
1材料与方法
所有引物均由苏州泓迅生物科技有限公司合成。总RNA提取所用化学试剂购自生工生物工程(上海)股份有限公司,其他分子生物学试剂购自宝生物工程(大连)有限公司。PCR产物和阳性单克隆测序由北京鼎国昌盛生物技术有限责任公司进行。穿心莲种植在江西中医药大学神农园。
1.1提取总RNA
取穿心莲新鲜的茎和叶约0.5g,加入3ml总RNA提取液[含有2%CTAB,5%PVPK25,100mMTris-HCl(pH8.0),25mMEDTA(pH8.0),2MNaCl,5%β-巯基乙醇。将提取液在65℃水浴30min以上],迅速用研钵研磨粉碎,在65℃水浴10min,再加入3ml氯仿∶异戊醇(24∶1)。10000rpm离心10min后,取上清600μl,加入150μlLiCl,4℃过夜。10000rpm离心20min后,弃上清,再离心1min,吸干上清。在沉淀中加入超纯水50μl,3MNaCl5μl,96%乙醇125μl,颠倒混匀,在-70℃沉淀30min。在4℃温度下10000rpm离心20min后,弃上清,用600μl70%乙醇洗涤两遍,将沉淀溶解在30μl超纯水中。用1%琼脂糖凝胶电泳检测产物。
采用Roche逆转录试剂盒(TranscriptorcDNASynth.Kit2)获得cDNA,每个样品的总体积20μl。首先在12μl总RNA中加入1μlAnchored-oligo(dT)18Primer,轻轻混匀后,在65℃反应10min;然后再加入4μlBuffer,0.5μlRNaseInhibitor,2μldNTPmix,0.5μl反转录酶,轻轻混匀,在55℃放置30min后,转为85℃反应5min,4℃终止反应。
1.2克隆MVD基因
采用Invitrogen公司的PrimeScriptTM1stStrandcDNASynthesisKit合成cDNA第一链。
根据银杏(GinkgobolibaL.)MVD基因(ACCESSIONAY757921)全长序列[庞永珍.银杏黄酮和萜类化合物生物合成途径中重要相关基因的克隆和研究.2005年复旦大学博士学位论文.],搜索穿心莲转录组拼接序列数据库。设计一对引物,ApMVD-F:5'-ATGGCGGCTGAGAAATGGGTG-3'和ApMVD-R:5'-TCACTTGGGAAACCCGGTTTC-3',从穿心莲的cDNA中扩增全长。
以cDNA第一链为模板,采用TaKaRa公司高保真DNA聚合酶扩增目标序列,反应总体积为50.0μl,包括1μlcDNA,0.25μlTakaraPrimeSTARHSDNAPolymerase,5μl10×buffer,4μldNTPMIX(各2.5mM),ApMVD-F和ApMVD-R引物(10μM)各1.5μl,36.75μlddH2O。反应程序为95℃预变性1min;95℃变性30s,57℃退火30s,72℃延伸1min,35个循环;72℃延伸7min终止反应。
扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测割胶回收后,采用Axygen离心柱型PCR产物纯化及胶回收试剂盒回收扩增产物,取2μl,添加2.5μl连接缓冲液(SolutionI)后,与0.5μl克隆载体pMD18-T进行连接,总体积5μl。
在4℃冰箱连接过夜(8~12h)后,转化大肠杆菌DH5а,涂布在LB平板上(含有50mg/L氨苄青霉素),37℃倒置培养6~9h。挑取单克隆到LB液体培养基(含有50mg/L氨苄青霉素Amp)内,待到液体培养基变浑浊(大约2h),以培养大肠杆菌的菌液为模板,用目的片段的上、下游引物进行PCR扩增,挑选阳性克隆,用M13Primers进行DNA测序。由苏州泓迅生物科技有限公司进行测序。
1.3甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶酵母表达质粒的构建
利用引物对pYES2/25Q-MVD-F(5'-TAGGTACCATGGCGGCTGAGAAATG-3')和pYES2/25Q-MVD-R(5'-AGTCTAGATGGCCCATAGGGTTCACT-3'),从阳性单克隆中扩增MVD基因的开放阅读框。上游引物的5′端引入了KpnI(GGTACC)酶切位点,下游引物的5′端引入了XbaI(TCTAGA)酶切位点。PCR扩增条件为94℃3min;94℃30s,67℃30min,72℃2min,33cycles;72℃10min。反应结束后,用1%琼脂糖凝胶电泳检测产物,切胶回收略大于1kb的条带。
用限制性内切酶KpnI和XbaI分别酶切回收的产物和pYES2/25Q酵母表达质粒。用PCR产物清洁试剂盒纯化回收的两种产物,用T4DNA连接酶进行连接。电击法将连接产物转化到酿酒酵母中。
用PCR法鉴定阳性单克隆菌落,获得可表达甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶的酵母菌。
2结果与分析
2.1总RNA提取
利用无液氮法,提取获得了质量较好的穿心莲总RNA(图1)。
2.2全长ORF扩增
在1200bp附近有一条明显的条带。胶回收后,进行TA克隆,测序,获得1条MVD基因的全长开放阅读框,长1260bp,编码由419个残基组成的氨基酸序列。
ATGGCGGCTGAGAAATGGGTGCTCTCCGTGACGGCGCAGACGCCGACCAACATCGCCGTCATCAAGTACTGGGGGAAGCGCGACGAGGACAGGATTCTTCCCATTAACGACAGCATTAGCGTCACTCTCGACCCCGATCACCTCTGCACCACCACCTCCGTCGCAGTTAGCCCCGCTTTCACTCACGATCGTATTTGGCTCAACGGCAAGGAGGTCTCTCTTTCTGGAAGCAGATTTCAGAATTGCTTGAGAGAAATTCGGTCACGTGCTAGTGATGTCGAGGACAAGGAGAAGGGCATTAAGATTGCAAAAGAGGACTGGGAGAAACTGCATGTACATATTGTTTCCTATAACAATTTTCCTACTGCTGCCGGATTGGCGTCATCAGCTGCGGGCTTGGCATGCCTGGTCTTCTCATTGGCTAAGCTAATGAATGTGAAAGAAGACCACAGTCAACTGTCTGCTATTGCAAGGCAAGGCTCAGGGAGTGCATGCCGCAGCCTGTTTGGTGGATTCGTCAAGTGGGTTATGGGAAAAGAGGAAAATGGCAGTGACAGCATTGCTGTCCAACTTGCAGATGAAAAGCACTGGGATGATCTTGTTATCATCATTGCAGTGGTAAGCTCGCGACAGAAGGAGACCAGTAGTACCTCTGGGATGCGTGATTCCGTTGAAACCAGTGCACTTATCAAATATAGAGCAAAGGAAGTAGTACCAAAACGAGTAATAGAGATGGAGGAAGCGATACAAAAGCGTGATTTTCCATCATTTGCCCGGCTGGCATGTGCGGACAGTAATCAGTTTCATGCTGTTTGTCTTGATACCTCACCGCCTATTTCTTACATGAATGATACATCTCATAGGATTATCAGCTGTGTTGAGAAATGGAATCGTCATGAAGGAACTCCTCAGGTTGCCTATACCTTCGATGCCGGCCCAAATGCAGTACTAATTTCGCATAACAGAAGCACCGCTGCTGACCTGCTTAAGAGGCTGCTCTTTTACTTCCCCCCTCAATCAGACACTGATTTGAACAGTTACGTCATCGGAGACAAGACAATATTGAAAGATGCCGGCATCCAGGGAATTAAAGACATTGATGGTTTAGCTCCACCCCCAGAAGTTAAAGAGAATAGTTCGAGCCAAAGGTACAAGGGAGAGGTCAGTTATTTCATCTGCACGAGGCCTGGAAGAGGCCCGGCAGTATTAACAGACGAAAGCCAATCCCTTATCAACCCCGAAACCGGGTTTCCCAAGTGA。
编码相应蛋白的氨基酸序列为:
MAAEKWVLSVTAQTPTNIAVIKYWGKRDEDRILPINDSISVTLDPDHLCTTTSVAVSPAFTHDRIWLNGKEVSLSGSRFQNCLREIRSRASDVEDKEKGIKIAKEDWEKLHVHIVSYNNFPTAAGLASSAAGLACLVFSLAKLMNVKEDHSQLSAIARQGSGSACRSLFGGFVKWVMGKEENGSDSIAVQLADEKHWDDLVIIIAVVSSRQKETSSTSGMRDSVETSALIKYRAKEVVPKRVIEMEEAIQKRDFPSFARLACADSNQFHAVCLDTSPPISYMNDTSHRIISCVEKWNRHEGTPQVAYTFDAGPNAVLISHNRSTAADLLKRLLFYFPPQSDTDLNSYVIGDKTILKDAGIQGIKDIDGLAPPPEVKENSSSQRYKGEVSYFICTRPGRGPAVLTDESQSLINPETGFPK。
2.3酵母表达重组菌的获得
经过电击转化后,获得了可表达MVD蛋白的基因重组酵母工程菌,保存于YPD培养基中。本发明基因编码表达的MVD蛋白氨基酸序列如SEQIDNO:2。
Claims (2)
1.穿心莲甲羟戊酸5-焦磷酸脱羧酶基因,其具有如SEQIDNO:1所述序列。
2.权利要求1所述基因对应的蛋白质,其序列如SEQIDNO:2。
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