CN103923917A - microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 - Google Patents
microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN103923917A CN103923917A CN201310009657.XA CN201310009657A CN103923917A CN 103923917 A CN103923917 A CN 103923917A CN 201310009657 A CN201310009657 A CN 201310009657A CN 103923917 A CN103923917 A CN 103923917A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- sequence
- plant
- encoding gene
- gene
- rice
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Landscapes
- Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
Abstract
本发明公开了一种microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用。本发明提供microRNA444a或其编码基因在调控植物株高中的应用;所述microRNA444a的核苷酸序列为序列表中的序列3或序列4或序列2或序列2自5’末端第49-4425位核苷酸。本发明的实验证明,本发明发现的microRNA444a,将其的编码基因导入水稻中,得到OsmicroRNA444a的超表达株系,该植株与未转入该基因的水稻相比表现出明显的耐盐性的表型,说明该microRNA与水稻耐盐性调控密切相关。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及一种microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用。
背景技术
真核细胞中存在大量的非编码RNA,~22nt的小RNA是其中一类非常重要的调控RNA,主要包括siRNA和miRNA两种类型,二者均由类似RNaseⅢ的核酸内切酶Dicer加工产生,随后进入沉默复合体抑制靶基因表达。miRNA是真核生物基因表达中的一类负调控因子,主要在转录后水平上通过介导靶基因mRNA的切割或抑制翻译以及染色体修饰来调节植物基因的表达,参与调控植物器官的形态建成、生长发育、激素分泌、信号转导以及对外界环境胁迫的应答能力等生物学过程,是一种新的基因调控模式。从2002年证实miRNA在植物中的存在以来,关于植物miRNA的研究进展异常迅速,短短几年内就己发现了200多种。植物在进化过程中为了适应各种环境产生了复杂的适应机制,体现在分子水平上主要通过转录水平和转录后水平调控众多相关基因的表达来抵抗各种环境胁迫。如机械力、干旱、盐碱、低温等非生物胁迫在转录或转录后调控植物特定基因的表达,这些基因的表达反过来又赋予植物抗逆性。可见miRNA在生物生长发育的各个时期都扮演着重要的角色,调控许多重要的生物途径,处于基因调控网络的核心位置。
在植物中,研究发现多个抑制靶基因翻译的miRNAs(Aukerman and Sakai,2003;Gandikota et al.,2007)。一般来说植物中抑制靶基因翻译的miRNA主要结合靶基因的3’-UTR区,有时也作用于5’-UTR区(Sunkar and Zhu,2004)。在拟南芥中,miR172既可以切割靶基因AP2的mRNA,也可以抑制蛋白的表达(Aukerman and Sakai,2003;Chen,2004),主要以抑制翻译的作用为主。miR156/157和miR854也是通过抑制翻译调节靶基因的表达(Arteaga-Vazquez et al.,2006;Gandikota et al.,2007)。切割靶基因是植物中miRNA主要调节方式,而抑制靶基因翻译是动物中主要调节方式。近年来研究发现植物中也存在抑制靶基因翻译这样的调节方式,这两种方式在很多时候共同存在。最近研究发现miRNA可介导靶基因位点和组蛋白的甲基化,进而抑制靶基因的表达。
在植物生长和发育过程中miRNAs起着重要的调节作用,包括生长发育、代谢、信号传导和植物的胁迫响应(Chen,2004;Lauter et al.,2005;Li et al.,2005;Mallory et al.,2005;Wang et al.,2005;Chiou et al.,2006;Sunkar et al.,2006;Gandikota et al.,2007;Jung et al.,2007;Wang et al.,2008b;Wang etal.,2009;Wu et al.,2009;Jiao et al.,2010a)。对已克隆miRNAs进化分析发现仅有一部分miRNAs且相应靶基因编码转录因子是保守的(miR156、miR172和miR399等),而很大一部分miRNAs及靶基因是不保守的(miR444、miR396d,e和miR824等)(Fahlgren et al.,2007)。2005年朱健康课题组在研究水稻中miRNAs时,发现了一个新的miRNA(miR444a),它在单子叶植物中十分保守,比如在水稻、小麦、大麦和玉米中都发现它的存在,拟南芥中没有检测到它的表达。作者通过5’RACE和生物信息学分析方法确定miR444a调节的靶基因为OsMADS57(Sunkar et al.,2005;Kutteret al.,2007;Lu et al.,2008)。组织表达模式显示miR444a在水稻的叶片、茎、根、花序和幼苗都有表达(Sunkar et al.,2005)。生物信息学分析表明miR444a与OsMADS57互补位点在OsMADS57编码区内且它们在序列上高度互补。
miRNA的正常表达是植物正常生长发育所必需的。目前,植物以拟南芥miRNA的研究最为详尽,Palatnik等(2003)发现miR319(或称为miR-JAW)基因在野生型植株的芽顶端组织、花器官和果实中均有表达,通过对jaw-D基因进行突变研究,发现miR319能通过靶向作用于TCP转录因子基因家族成员来调控植物叶片的形态建成。miR319基因过量表达导致植物的叶片偏上生长、果实畸形、叶片边缘锯状化和开花期延迟等一系列异常的多效表型(Pleiotropic phenotype)(Palatnik et al.,2003)。而miR164家族能通过调节具有NAC功能域的转录因子(NAM/ATAF/CUC,NAC)基因家族中的CUPSHAPED COTYLEDON1(CUC1)、CUC2和CUC3来实现对植物的花瓣数量以及花器官边缘细胞与顶端分生组织细胞分化的调控(Rhoades et al.,2002)。miR166通过调节拟南芥Homeobox15蛋白(ATHB15)来调控植物的维管细胞和韧皮部细胞的发育(Kim etal.,2005),一些miRNA还与植物细胞壁的合成及纤维的发育有关。miR172通过调控靶标AP2(APETALA2)和AP2-like基因来调节植物开花的时间和花的形态(Chen etal.,2004)。拟南芥中miR171通过对具有GRAs结构域的SCL(SCARECROE-LIKE)转录因子家族成员的调控,来控制花的发育和根系发育(Liave et al.,2002)。
近年来,人们采用比较基因组学、构建小RNA文库(Sunkar et al.,2004)和表达序列标签(EST)分析等方法,发现miRNA可由逆境胁迫诱导产生。Lu等(2005)从毛果杨(Populustrichocarpa Toor)的木质部中克隆到22种miRNA,大部分克隆的miRNA的表达受拉伸和挤压胁迫的正调控或负调控(Lu et al.,2005)。Sunkar和Zhu(2004)构建了拟南芥幼苗的于旱、盐碱、低温、脱落酸胁迫的小RNA文库,发现大部分与胁迫相关(Sunkar et al.,2004)。
发明内容
本发明的一个目的是提供microRNA444a或其编码基因或表达microRNA444a的重组载体的应用。
本发明提供的microRNA444a或其编码基因或表达microRNA444a的重组载体在调控植物耐盐性中的应用;
所述microRNA444a的核苷酸序列为序列2自5’末端第49-4425位核苷酸或序列2或序列表中的序列3或序列4。
序列表中的序列2所示的RNA或序列2自5’末端第49-4425位核苷酸所示的RNA为序列3或序列4所示RNA的前体。
上述应用中,所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸。
序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸编码序列2所示RNA。
上述应用中,所述表达microRNA444a的重组载体为将所述microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体。在本发明的实施例中,所述表达载体具体为pUN1301载体,上述表达microRNA444a的重组载体具体为将所述microRNA444a的编码基因插入pUN1301载体的BglII和SacI之间得到的载体。pUN1301载体按照实施例1的二的2中的方法制备。
上述应用中,所述调控植物耐盐性为提高植物耐盐性。
上述应用中,所述应用为将所述microRNA444a的编码基因导入目的植物中,得到转基因植物,所述转基因植物的耐盐性高于所述目的植物。
上述应用中,所述目的植物为单子叶植物或双子叶植物,所述单子叶植物具体为水稻。
本发明的另一个目的是提供一种培育转基因植物的方法。
本发明提供的方法,为将microRNA444a的编码基因导入目的植物中,得到转基因植物,所述转基因植物的耐盐性高于所述目的植物;所述microRNA444a的核苷酸序列为序列表中的序列3或序列4或序列2或序列2自5’末端第49-4425位核苷酸。
上述方法中,所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸;所述microRNA444a的编码基因通过重组载体导入目的植物中。
上述方法中,所述重组载体为将所述microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体。上述重组载体具体为将所述microRNA444a的编码基因插入pUN1301载体的BglII和SacI之间得到的载体。
本发明的第三个目的是提供一种重组载体。
本发明提供的重组载体,为将microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体;所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸。
在本发明的实施例中,所述表达载体具体为pUN1301载体,上述重组载体具体为将所述microRNA444a的编码基因插入pUN1301载体的BglII和SacI之间得到的载体。
本发明的实验证明,本发明发现的microRNA444a,将其编码基因导入水稻中,得到OsmicroRNA444a的超表达株系,该植株与未转入该基因的水稻相比表现耐盐的表型,说明该microRNA与水稻盐胁迫密切相关。
附图说明
图1为扩增到OsmicroRNA444a包含前体序列在内的基因组DNA
图2为超表达载体pUN1301-OsmiR444a的部分物理图谱
图3为转基因水稻的Northern以及Real-time-PCR鉴定
图4为OsmicroRNA444a超表达转基因水稻表型观察
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
实施例1、microRNA444a在调控水稻耐盐性中的应用
一、microRNA444a的编码基因OsmicroRNA444a的获得
1、编码基因OsmicroRNA444a的克隆
根据数据库分析的结果设计引物,5′端引物:5′-GAAGATCTGCAATTGGGGGCAGCAAGC-3′(下划线序列为BglI位点),3′端引物:5′-CGAGCTCTGGCAACAGGAGGCAGCAAG-3′(下划线序列为SacI位点),提取粳稻中花十号三叶期幼苗总基因组,采用RT-PCR方法扩增到4392bp全长cDNA。
具体操作过程如下:
1)植物基因DNA的提取:选取0.5g三叶期中花十号水稻(Oryza sativa L.cvZhonghua10;记载在如下文献中:李梅芳,水稻花培品种—中花10号,农业科技通讯,1998年第1期第26页;公众可从中国科学院植物研究所获得,以下简称为野生型水稻。)的幼苗为材料,在液氮中研磨,将液氮中研碎的冻干粉转入到含729μL基因组提取buffer(0.1M Tris-HCl(PH8.0)、50mM EDTA(pH8.0)、0.5M NaCl),再加入18.4μLβ-mercapto ethanol剧烈振荡使其全部悬浮;接着加入52.8μL65°C预热的20%SDS;65°C水浴温育30min,每5min颠倒混匀一次;然后加入250μL冰上预冷的5M乙酸钾,立即颠倒混匀,冰上放置20min;4℃,12,000g离心10min,取上清;加入与上清等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),抽提一次,4℃,12,000g离心10min,用等体积的氯仿/异戊醇(24:1)再抽提一次;收集上清并加入0.6倍体积的异丙醇沉淀DNA,-20℃放置30min;4℃,12,000g离心10min,弃去上清;沉淀用1ml的70%乙醇洗2次;干燥后,溶于20μL ddH2O中,得到基因组DNA。
2)PCR扩增:提取的基因组稀释100倍,用作模板按以下体系进行PCR反应:0.2μl PrimerSTAR HS DNA Polymerase(5U/μl)、10μl2×GC buffer,1.8μl dNTPs,0.5μl5′端引物(10μM),0.5μl3′端引物(10μM),加ddH2O终体积20μl。引物序列5′端引物:5′-GAAGATCTGCAATTGGGGGCAGCAAGC-3′(下划线序列为BglII位点),3′端引物:5′-CGAGCTCTGGCAACAGGAGGCAGCAAG-3′(下划线序列为SacI位点),PCR程序为:94°C预变性30s后进入PCR循环,循环参数为98°C10秒变性→52°C15秒复性→72°C4分钟20秒延伸,35个循环后在72°C继续合成10分钟。
扩增的PCR产物经过0.8%的琼脂糖凝胶电泳分离,结果如图1所示,从图中可以看出,得到分子量大约4.39kb的条带,用AxyPrep DNA凝胶回收试剂盒回收该片段得到20μl回收产物。进行测序分析,测序结果该PCR片段的核苷酸序列为序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸,将该PCR产物的基因为OsmicroRNA444a,其编码的OsmicroRNA444a的核苷酸序列为序列表中的序列2自5’末端第49-4425位核苷酸,OsmicroRNA444a剪切成熟体为microRNA444a,其核苷酸序列为序列表中的序列3或序列4。
二、超表达载体pUN1301-OsmicroRNA444a的构建
1、含有OsmicroRNA444a的载体pTE-OsmiR444a
取3.5μl上述一得到的PCR产物回收产物,加入1μl(3U/μl)T4-DNA连接酶、5μl2×连接酶缓冲液、0.5μl(50mg/ml)pGEM-T Easy载体(Promega)4℃连接过夜,得到连接产物,用连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经含羧苄青霉素的抗性平板筛选得到含有重组质粒的大肠杆菌菌株。采用碱裂解法从菌株中分离提取质粒,以pGEM-T Easy载体上的T7和SP6启动子序列为引物,进行测序分析,该质粒为将序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸插入pGEM-T Easy载体中,将测序正确的质粒命名为pTE-OsmiR444a。
2、pUN1301载体的获得
1)剪取约0.2g玉米(品种名:中作-中单8,北京中农作科技发展有限公司)幼苗,置于液氮中研磨;然后加入800μL新配制的提取缓冲液(含0.1M Tris-HCl pH8.0,50mM EDTA,0.5M NaCl,1%SDS和1%β-巯基乙醇),剧烈振荡使其全部悬浮;65℃水浴30分钟,每5分钟颠倒混匀一次;然后加入250μL预冷的5M乙酸钾水溶液,立即颠倒混匀,冰浴5分钟;加入等量酚/氯仿,抽提一次,12000rpm离心5分钟;收集上清液,加入0.6倍体积的异丙醇沉淀DNA,室温放置40分钟;4℃12000rpm离心15分钟,弃上清;沉淀用70%、100%乙醇各洗一次;干燥后,溶于20μL含100μg/mL RNase的ddH2O中,得到玉米基因组DNA。
2)取上述玉米基因组DNA溶液2μL作为模板,在带有Hind III识别位点的5′引物(GGAAGCTTCTGCAGTGCAGCGTGACCCGG)和带有BamHI识别位点的3′引物(CGGGATCCAAGTAACACCAAACAACAGGG)为引物,进行PCR扩增,PCR反应条件为:先94℃3分钟;再94℃45秒,62℃45秒,72℃2分钟,共35个循环,最后72℃10分钟。反应结束后,对PCR产物进行0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,表明得到长度约为2kb的扩增片段,与预期结果相符,回收该目的片段,得到的片段经测序验证,具有序列表中序列5所示的核苷酸,为玉米泛素启动子(UbiPro)。
(玉米泛素启动子(UbiPro)也可以人工合成获得。)
3)用限制性内切酶Sac I和EcoR I将Noster poly A终止序列(277bp)从质粒载体pBI121(北京拜尔迪生物技术有限公司目录号:MP-091)上切下,连接到载体pUC19(北京百泰克生物技术有限公司目录号:DP7801)的Sac I和EcoR I位点间,得到重组载体,命名为pUC19-Noster。再用限制性内切酶HindIII和BamHI双酶切pUC19-Noster,琼脂糖凝胶电泳检测后,回收线性化的载体大片段,并将该回收片段与2)中经Hind III和BamH I双酶切获得的带有粘性末端的玉米泛素启动子(UbiPro)相连,得到重组载体,命名为pUN19。
4)用限制性内切酶EcoR I部分酶切和HindIII完全酶切(37°C条件下,先加入EcoR I进行部分酶切,酶切时间为半小时,65°C下20分钟使EcoR I酶失活,后加入HindIII完全酶切3小时即可)从3)购建的重组载体pUN19切下包含UbiPro和Noster的长度约为2.3kb的片段,将该片段克隆入质粒载体pCAMBIA1301(Biovector Co.,LTD公司目录号Biovec-11)的EcoR I和HindIII位点处,得到重组载体,命名为pUN1301。
3、pUN1301-OsmicroRNA444a的构建
用限制性内切酶BglII和SacI对2步骤获得的质粒pUN1301进行双酶切,酶切体系为:质粒10μl、10x酶切缓冲液5μl、BglII1 μl(10U/μl)、SacI0.8μl(10U/μl),加ddH2O补充反应体系至50μl,37℃酶切4小时。用琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行分离,回收4392bp线性化的pUN1301大片段,溶于20μl ddH2O中。
用限制性内切酶BglII和SacI对1步骤获得的质粒pTE-OsmiR444a进行双酶切。酶切体系为:质粒10μl,酶切缓冲液5μl、BglII1μl(10U/μl)、加ddH2O补充反应体系至50μl,37℃酶切4个小时。再加入SacI0.2μl(10U/μl),37℃酶切20分钟。用0.8%琼脂糖凝胶电泳对酶切产物进行分离,用AxyPrep公司的DNA凝胶回收试剂盒回收该片断,回收4392bp的OsmicroRNA444a片段。
将10μl回收的4392bp的OsmicroRNA444a溶液、6μl回收的载体pUN1301大片段溶液、2μl(3U/μl)T4DNA连接酶和2μl10x连接酶缓冲液混和,16℃连接16小时,得到的连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经含卡那霉素的抗性平板筛选得到阳性克隆。提取阳性克隆中的重组质粒,进行测序验证,结果该重组质粒为将序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸插入pUN1301的BglII和SacI酶切位点间得到的载体,命名为pUN-OsmiR444a,且pUN-OsmiR444a中启动子、基因和终止子的结构正确(见图2)。在该表达载体中采用玉米泛素启动子(UbiPro)启动目的片段OsmicroRNA444a在植物中超表达。
三、转基因水稻的获得
将上述pUN1301-OsmicroRNA444a质粒用电击法转化农杆菌EHA105(Hiei Y,Ohta S,Komari T,Kumashiro T(1994)Efficient transformation of rice(Oryza sativa L.)mediatedby Agrobacterium and sequence analysis of the boundaries of the T-DNA.Plant J6:271–282,公众可从中国科学院植物研究所获得。),经含卡那霉素的抗性平板筛选得到阳性克隆的超表达工程菌,提取阳性克隆的超表达工程菌的质粒,为pUN1301-OsmicroRNA444a,将该阳性克隆的超表达工程菌命名为EHA105/pUN1301-OsmicroRNA444a。
将EHA105/pUN1301-OsmicroRNA444a侵染中花十号水稻(Oryza sativa L.cvZhonghua10,以下简称为野生型水稻)的愈伤组织,再将导入EHA105/pUN-OsmiR444a的愈伤组织用含300mg/L头孢霉素的无菌水洗涤5遍,无菌滤纸吸干后转至N6D2S1培养基上,筛选一代;两周后,转移至N6D2S2培养基上筛选二代(2周/代);取出经过3代筛选生长旺盛的抗性愈伤组织,转移至分化培养基(1),上,在分化培养箱(12小时光周期,白天28℃,夜晚25℃)中培养7天;然后转移至分化培养基(2),上,在分化培养箱中培养至产生再生苗。再生的植株在生根壮苗培养基上生根壮苗;待小苗长至10厘米左右时,打开容器封口膜,炼苗2-3天,然后将小苗移入人工气候室栽培,获得10个株系共60棵T0代转OsmicroRNA444a水稻。
所用培养基如下表1:
表1所用培养基配方
四、转基因水稻的鉴定
1、GUS组织化学染色
将上述三获得的60棵T0代转OsmicroRNA444a水稻的2-3mm长的根段分别放到GUS染色液中,抽气几分钟,然后置于37℃温育过夜,染色后的组织用70%乙醇脱色。根呈蓝色的植株即为阳性转基因材料。GUS染色液(pH7.0)组分为:100mM Na3PO4(pH7.0),0.1%Triton X-100,10mM EDTA,0.5mM亚铁氰化钾,0.5mM铁氰化钾,1mg/mlX-Gluc。
结果共鉴定出8个株系合计40棵阳性T0代转OsmicroRNA444a水稻。
将阳性T0代转OsmicroRNA444a水稻移至温室栽培,按照不同株系收种,得到T1代转基因种子,在此基础上经过繁种得到纯合T2代种子,在以后的实验中选取编号为5(miROE5)、8(miROE8)、12(miROE12)的T2代转OsmicroRNA444a水稻作为材料。
2、定量PCR鉴定
从编号为5(miROE5)、8(miROE8)、12(miROE12)的T2代转OsmicroRNA444a水稻的幼苗中提取总RNA,经过RNase free DNase I处理2μg总RNA用M-MLV反转录酶进行反转录成cDNA第一条链。将植物总RNA反转录成cDNA,利用Primer Express2.0程序(Applied Biosystems)设计基因特异引物,并以ACTIN1引物为内标参照,引物长为20bp,Tm值为55-60°C,GC含量在40-60%之间,扩出的目的片段长度为100-150bp。将反转录产物稀释50-100倍,取5μl做模板,利用SYBR GREEN PCR试剂盒(Green Realtime PCR Master Mix,Toyobo,Japan)进行反应溶液的配置,在实时定量PCR仪MX3000P(Stratagene,USA)上运行PCR程序,95°C1min;95°C15s,55°C10s,72°C15s;共45循环;95°C20s,55°C20s,95°C30s。根据CT值计算基因的相对表达量。
而miRNA实时荧光定量PCR检测,首先提取水稻的总RNA,接着利用PEG沉淀smallRNA,即在308μl的总RNA溶液中(总RNA的量不要超过21mg)加入70μl30%(W/V)PEG8000溶液;在上述混合液中再加入42μl5M NaCl溶液,混匀;
混合体系:
308μl total RNA
70μl30%(W/V)PEG8000溶液
42μl5M NaCl溶液
共420μl,按照步骤依次加入70μl30%(W/V)PEG8000溶液和42μl5M NaCl溶液。
在冰上放置30min沉淀后,4°C13000rpm离心10min,小心吸取上清转入另一个新RNase free管中;在上清中加入2.5倍体积的无水乙醇,充分混匀;在-20°C沉淀过夜或30min后,4°C最大转速离心15-20min,小心去除上清;得到的沉淀物用70%的乙醇洗涤两次,在室温下干燥(注意不要太干);溶于30μl ddH2O(可以在50°C孵育5分钟)。准备好的small RNA可以利用Poly A加A方法做实时定量PCR,用5.8S rRNA做内参详细方法见。并分别转录获得cDNA(参照实施例1中的方法),以野生型水稻(水稻中花十号)为对照。利用荧光实时定量PCR法,以cDNA为模板,以1μl5′端引物1(10μM)(5′-TTGCTGCCTCAAGCTTGCTG-3′),1μl reverse primer引物1(10μM)(5’-GCTGTCAACGATACGCTACG-3')为引物,对T2代转OsmicroRNA444a中OsmiR444a的表达丰度进行检测。用于定量分析的试剂为SYBR Green Realt ime PCRMaster Mix(TOYOBO)。所用仪器为美国Stratagene公司实时荧光定量PCR仪Mx3000P。吸取1μl第一链cDNA溶液,稀释50倍作为模板,按以下体系进行PCR反应:10lSYBR Green Realtime PCR Master Mix,4μl模板,1μl5′端引物1(10μM),1μl3′端引物1(10μM),加ddH2O终体积20μl。
用5.8S RNA作为内参,5.8S RNA的5′端引物:5’-GAACGACTCTCGGCGGCTA-3',3′端引物为:5’-GCTGTCAACGATACGCTACG-3'。PCR程序为:预变性2分钟,进入PCR循环,循环参数为94℃15秒→58℃10秒→72℃10秒,共40个循环。
结果如图3所示,在5.8sRNA作为内参的情况下,与野生型水稻(ZH10)相比,miROE5、miROE8和miROE12的T2代转OsmicroRNA444a水稻幼苗中OsmiR444a的表达丰度有了不同程度的上调,说明目的基因(OsmiR444a)在转录水平已经成功表达。
采用同样的方法将空载体pUN1301转入野生型水稻中,得到T0代转空载体水稻,按照上述方法鉴定,OsmicroRNA444a基因没有过量表达,说明为阳性,将T0代转空载体水稻播种传代得到T2代转空载体水稻。
五、转基因水稻的表型观察
将编号为miR5(5#)、miR8(8#)和miR12(12#)T2代转OsmicroRNA444a水稻种子、中花十号水稻(WT)种子和T2代转pUN1301水稻种子,均播种在花卉营养土和蛭石的混合物里(两者的混合比例为9:1),30℃萌发后,置于木村B培养液里,在光照培养箱中(光强为10000μmol/m2/s,光照时间为16h/d,温度为30℃)培养至3叶期;再将3叶期幼苗放在含有不同浓度(140mM、160mM和200mM)NaCl的木村B培养液里处理7天,然后转移至木村B培养液中,于光照培养箱内恢复培养9天,照相、统计存活率。每个株系32株,实验重复三次,结果取平均值。
照相结果如图4A所示(6个图片从左到右的株系分别为WT、5#、8#和12#),NaCl胁迫处理前,T2代转OsmicroRNA444a水稻和中花十号野生型无显著差异;NaCl胁迫处理后,与中花十号水稻相比,T2代转OsmicroRNA444a水稻种子对不同浓度的NaCl都具有明显的耐受性;
统计存活率结果如图4B所示,
140mM NaCl处理完又恢复后:miR5(5#)、miR8(8#)和miR12(12#)T2代转OsmicroRNA444a水稻存活率分别为81%、76%、73%,中花十号水稻存活率为46%;160mMNaCl处理完又恢复后:miR5(5#)、miR8(8#)和miR12(12#)T2代转OsmicroRNA444a水稻存活率分别为48%、39%、67%,中花十号水稻存活率为25%;180mM NaCl处理完又恢复后:miR5(5#)、miR8(8#)和miR12(12#)T2代转OsmicroRNA444a水稻存活率分别为40%、23%、57%,中花十号水稻存活率为11%;
中花十号水稻和T2代转pUN1301水稻结果无显著差异。
可以看出,随着盐浓度的增加,野生型和转OsmicroRNA444a水稻存活率都逐渐降低,但转OsmicroRNA444a水稻活率较野生型高,说明转OsmicroRNA444a水稻对高盐具有耐受性。
上述木村B培养液组成如下:
A液母液:1L(200х)
B液母液:1L(200х)
Ca(NO3)2.4H2O 17.235g
EDTA-Fe母液:1L(1000х)
溶解5.57g FeSO4.7H2O于200mL蒸馏水中,溶解7.45g Na2EDTA于200mL蒸馏水中,加热Na2EDTA溶液,加入FeSO4.7H2O溶液,不断搅拌,冷却后定容至1L。
微量元素母液:1L(1000х)
硅酸钠:每L木村B培养液用量100~300mg
1mol/L HCl:8.17mL37%HCl用蒸馏水稀释至1000mL。
用1mol/LHCl调木村B培养液PH值为5.8。
实际应用中,取5mlA液母液、5ml B液母液、1ml EDTA-Fe母液、1ml微量元素母液、100~300mg硅酸钠混合加蒸馏水稀释至1L,用1mol/L HCl调木村B培养液PH值为5.8,得到IL木村B培养液。
Claims (9)
1.microRNA444a或其编码基因或表达microRNA444a的重组载体在调控植物耐盐性中的应用;
所述microRNA444a的核苷酸序列为序列2自5’末端第49-4425位核苷酸或序列2或序列表中的序列3或序列4。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于:
所述表达microRNA444a的重组载体为将所述microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体。
4.根据权利要求1-3中任一所述的应用,其特征在于:所述目的植物为单子叶植物或双子叶植物。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:
所述单子叶植物为水稻。
6.一种培育转基因植物的方法,为将microRNA444a的编码基因导入目的植物中,得到转基因植物,所述转基因植物的耐盐性高于所述目的植物;
所述microRNA444a的核苷酸序列为序列表中的序列3或序列4或序列2或序列2自5’末端第49-4425位核苷酸。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于:所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸;
所述microRNA444a的编码基因通过重组载体导入目的植物中。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述重组载体为将所述microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体。
9.一种重组载体,为将microRNA444a的编码基因插入表达载体中,得到表达microRNA444a的载体;
所述microRNA444a的编码基因的核苷酸序列为序列表中的序列1或序列表中的序列1自5’末端第49-4425位核苷酸。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201310009657.XA CN103923917B (zh) | 2013-01-10 | 2013-01-10 | microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201310009657.XA CN103923917B (zh) | 2013-01-10 | 2013-01-10 | microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN103923917A true CN103923917A (zh) | 2014-07-16 |
CN103923917B CN103923917B (zh) | 2016-05-11 |
Family
ID=51142315
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201310009657.XA Expired - Fee Related CN103923917B (zh) | 2013-01-10 | 2013-01-10 | microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN103923917B (zh) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109777802A (zh) * | 2019-03-29 | 2019-05-21 | 江西师范大学 | 东乡野生稻oru-miR1861c在提高植物耐盐性上的应用 |
CN109880848A (zh) * | 2019-03-29 | 2019-06-14 | 江西师范大学 | 东乡野生稻oru-miR5505在培育耐盐性植物上的应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006105436A2 (en) * | 2005-03-30 | 2006-10-05 | The Regents Of The University Of California | Cloning and characterization of micrornas from rice |
CN102676520A (zh) * | 2012-05-08 | 2012-09-19 | 中国科学院植物研究所 | microRNA444a或其编码基因在调控水稻株高中的应用 |
-
2013
- 2013-01-10 CN CN201310009657.XA patent/CN103923917B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2006105436A2 (en) * | 2005-03-30 | 2006-10-05 | The Regents Of The University Of California | Cloning and characterization of micrornas from rice |
CN102676520A (zh) * | 2012-05-08 | 2012-09-19 | 中国科学院植物研究所 | microRNA444a或其编码基因在调控水稻株高中的应用 |
Non-Patent Citations (3)
Title |
---|
MACOVEI ET AL.: "microRNAs as promising tools for improving stress tolerance in rice", 《PLANT SIGNALING & BEHAVIOR》 * |
PENG T ET AL.: "Accession:MI0001719,MIMAT0020918,MIMAT0005790和MIMAT0001617", 《MIRBASE》 * |
SUNKAR ET AL.: "Identification of novel and candidate miRNAs in rice by high throughput sequencing", 《BMC PLANT BIOLOGY》 * |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN109777802A (zh) * | 2019-03-29 | 2019-05-21 | 江西师范大学 | 东乡野生稻oru-miR1861c在提高植物耐盐性上的应用 |
CN109880848A (zh) * | 2019-03-29 | 2019-06-14 | 江西师范大学 | 东乡野生稻oru-miR5505在培育耐盐性植物上的应用 |
CN109777802B (zh) * | 2019-03-29 | 2023-04-11 | 江西师范大学 | 东乡野生稻oru-miR1861c在提高植物耐盐性上的应用 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN103923917B (zh) | 2016-05-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN105087640B (zh) | 调节植物种子发育的基因及其应用 | |
CN102250949B (zh) | 水稻miR166在提高植物镉胁迫耐受性中的应用 | |
CN102250903A (zh) | 水稻miR166在提高植物干旱胁迫耐受性中的应用 | |
CN117737078A (zh) | MADS-box基因RhAGL6及其在调节月季花器官发育中的应用 | |
CN110106171B (zh) | 长链非编码rna及其在调控植物耐低温中的应用 | |
CN103923917A (zh) | microRNA444a或其编码基因在调节水稻耐盐性中的应用 | |
CN103588867B (zh) | 大豆转录因子GmMYB174a及其编码基因与应用 | |
CN103243108B (zh) | 一种茎瘤芥来源的钙离子结合蛋白及其编码基因与应用 | |
CN102676520B (zh) | microRNA444a或其编码基因在调控水稻株高中的应用 | |
CN113151306B (zh) | 一种提高梅花花瓣抗寒性的基因PmWRKY57及其应用 | |
CN115772212A (zh) | 紫花苜蓿叶绿体MsSAP22基因及在提高植物抗旱性中的应用 | |
CN112094845B (zh) | 一种改良植物农艺性状和抗性的核酸及其应用 | |
CN103789312A (zh) | 玉米胚乳组织特异性启动子及其应用 | |
CN108998454B (zh) | 一种与菊花脑抗蚜性相关的miRNA160a及其应用 | |
CN110106172B (zh) | 一种长链非编码rna及其在调控植物耐低温中的应用 | |
CN104651366A (zh) | 小麦microRNA408及其编码基因与应用 | |
CN104611335A (zh) | 花生特异启动子AhRSP与应用 | |
CN104152454A (zh) | 来源于大豆的干旱诱导启动子GmMYB363P及其应用 | |
CN103255164B (zh) | 构建体及其用途 | |
CN102676521B (zh) | microRNA444a或其编码基因在调控水稻分蘖中的应用 | |
CN105695462B (zh) | 大豆MicroRNA172在培育耐逆植物中的应用 | |
CN113416749B (zh) | 谷子小RNA SimiR396d在调控植物抗旱能力中的应用 | |
CN103387983B (zh) | microRNA396d或其编码基因在调控水稻叶夹角中的应用 | |
CN103387984A (zh) | microRNA396d或其编码基因在调控水稻株高中的应用 | |
CN117363629B (zh) | 一种柑橘CsGATA12基因及其增强柑橘溃疡病抗性的方法 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
C14 | Grant of patent or utility model | ||
GR01 | Patent grant | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20160511 Termination date: 20220110 |